Should you encounter any unexpected behaviour,
please let us know.
elNémo has been hacked on november 27th.
It has been moved away and runs again.
Still some additional cleaning from time to time
Sorry for the inconvenience.

* CELL INVASION 16-SEP-16 5TCX *

LOGs for ID: 260209051925111772

Output from eigenvector calculation:


STDOUT:

CUTOFF set to default value (CUTOFF=8)
Build Tirion matrix:
 Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model.
 Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004.    

 Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file.

 Pdbmat> Coordinate filename     = 260209051925111772.atom

 Pdbmat> Distance cutoff         =       8.00
         Force constant          =      10.00
         Origin of mass values   =       CONS
 Pdbmat> Levelshift              =    1.0E-09
         PRINTing level          =          2

 Pdbmat> Coordinate file 260209051925111772.atom to be opened.

 Openam> File opened: 260209051925111772.atom

 Pdbmat> Coordinate file in PDB format.

 Rdatompdb> Reading pdb file.
 Rdatompdb> End of file reached.
 Rdatompdb> Number of I/O errors:      0

 Rdatompdb> Number of residues found =    209
            First residue number     =      6
            Last  residue number     =      1
            Number of atoms found    =   1626
            Mean number per residue  =      7.8

 Pdbmat> Coordinate statistics: 
 =     4.670582 +/-     9.250256 From:   -16.361000 To:    26.132000
 =     1.763465 +/-     7.492315 From:   -15.599000 To:    20.817000
 =    11.133502 +/-    17.050483 From:   -28.871000 To:    41.424000
 Pdbmat> Masses are all set to one.
%Pdbmat-W> residue:'YCM ' is not a well known amino-acid.
%Pdbmat-W> residue:'YCM ' is not a well known amino-acid.
%Pdbmat-W> residue:'UNL ' is not a well known amino-acid.

%Pdbmat-W>      3 residue(s) not known.

 Openam> File opened: pdbmat.xyzm
 Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved.

 Openam> File opened: pdbmat.sdijb

 Pdbmat> Matrix statistics:

 Pdbmat> The matrix is   4.6771 % Filled.
 Pdbmat>       556573  non-zero elements.
 Pdbmat>        60773 atom-atom interactions.

 Pdbmat> Number per atom=     74.75 +/-     20.72
         Maximum number =    124
         Minimum number =     18

 Pdbmat> Matrix trace   = 1.215460E+06
 Pdbmat> Larger element =  484.929    
 Pdbmat>      0 elements larger than +/-  1.0E+10

 Pdbmat> Normal end.
automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1)
209 non-zero elements, NRBL set to 2
Diagonalize Tirion matrix using diagrtb
 Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation.
 Diagrtb> Version 2.52, November 2004. 
 Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file.

 Diagrtb> Options taken into account:

 MATRix filename          = pdbmat.sdijb
 COORdinates filename     = 260209051925111772.atom
 Eigenvector OUTPut file  = matrix.eigenrtb
 Nb of VECTors required   =        106
 EigeNVALues chosen       =       LOWE
 Type of SUBStructuring   =       NONE
 Nb of residues per BLOck =          2
 Origin of MASS values    =       CONS
 MATRix FORMat            =       BINA
 Temporary files cleaning =       ALL 
 Output PRINting level    =          2

 Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb.

 Blocpdb> Entering in.

 Openam> file on opening on unit     10:
 diagrtb_work.xyzm   

 Blocpdb> Coordinate file 260209051925111772.atom to be opened.

 Openam> file on opening on unit     11:
 260209051925111772.atom                                                                                                         

 Blocpdb> Coordinate file in PDB format.

 Blocpdb>  1626 atoms picked in pdb file.
 Blocpdb>   All masses set to unity.
 Blocpdb> Coordinate file is rewritten.

 Blocpdb> Substructuring:
 Blocpdb>     2 residue(s) per block.
 Blocpdb>   209 residues.
 Blocpdb>    13 atoms in block      1
 Block first atom:      1
 Blocpdb>    15 atoms in block      2
 Block first atom:     14
 Blocpdb>    17 atoms in block      3
 Block first atom:     29
 Blocpdb>    20 atoms in block      4
 Block first atom:     46
 Blocpdb>    19 atoms in block      5
 Block first atom:     66
 Blocpdb>    18 atoms in block      6
 Block first atom:     85
 Blocpdb>    19 atoms in block      7
 Block first atom:    103
 Blocpdb>    18 atoms in block      8
 Block first atom:    122
 Blocpdb>    22 atoms in block      9
 Block first atom:    140
 Blocpdb>     9 atoms in block     10
 Block first atom:    162
 Blocpdb>    11 atoms in block     11
 Block first atom:    171
 Blocpdb>    16 atoms in block     12
 Block first atom:    182
 Blocpdb>    11 atoms in block     13
 Block first atom:    198
 Blocpdb>    13 atoms in block     14
 Block first atom:    209
 Blocpdb>    22 atoms in block     15
 Block first atom:    222
 Blocpdb>    18 atoms in block     16
 Block first atom:    244
 Blocpdb>    15 atoms in block     17
 Block first atom:    262
 Blocpdb>    18 atoms in block     18
 Block first atom:    277
 Blocpdb>    19 atoms in block     19
 Block first atom:    295
 Blocpdb>    12 atoms in block     20
 Block first atom:    314
 Blocpdb>    20 atoms in block     21
 Block first atom:    326
 Blocpdb>    16 atoms in block     22
 Block first atom:    346
 Blocpdb>    12 atoms in block     23
 Block first atom:    362
 Blocpdb>     9 atoms in block     24
 Block first atom:    374
 Blocpdb>    15 atoms in block     25
 Block first atom:    383
 Blocpdb>    19 atoms in block     26
 Block first atom:    398
 Blocpdb>    11 atoms in block     27
 Block first atom:    417
 Blocpdb>    19 atoms in block     28
 Block first atom:    428
 Blocpdb>    14 atoms in block     29
 Block first atom:    447
 Blocpdb>    16 atoms in block     30
 Block first atom:    461
 Blocpdb>    13 atoms in block     31
 Block first atom:    477
 Blocpdb>     9 atoms in block     32
 Block first atom:    490
 Blocpdb>    19 atoms in block     33
 Block first atom:    499
 Blocpdb>    16 atoms in block     34
 Block first atom:    518
 Blocpdb>    11 atoms in block     35
 Block first atom:    534
 Blocpdb>    22 atoms in block     36
 Block first atom:    545
 Blocpdb>    13 atoms in block     37
 Block first atom:    567
 Blocpdb>    15 atoms in block     38
 Block first atom:    580
 Blocpdb>    16 atoms in block     39
 Block first atom:    595
 Blocpdb>    16 atoms in block     40
 Block first atom:    611
 Blocpdb>    15 atoms in block     41
 Block first atom:    627
 Blocpdb>    12 atoms in block     42
 Block first atom:    642
 Blocpdb>     9 atoms in block     43
 Block first atom:    654
 Blocpdb>    22 atoms in block     44
 Block first atom:    663
 Blocpdb>    15 atoms in block     45
 Block first atom:    685
 Blocpdb>    15 atoms in block     46
 Block first atom:    700
 Blocpdb>    17 atoms in block     47
 Block first atom:    715
 Blocpdb>    17 atoms in block     48
 Block first atom:    732
 Blocpdb>    14 atoms in block     49
 Block first atom:    749
 Blocpdb>    15 atoms in block     50
 Block first atom:    763
 Blocpdb>    18 atoms in block     51
 Block first atom:    778
 Blocpdb>    23 atoms in block     52
 Block first atom:    796
 Blocpdb>    17 atoms in block     53
 Block first atom:    819
 Blocpdb>    13 atoms in block     54
 Block first atom:    836
 Blocpdb>    18 atoms in block     55
 Block first atom:    849
 Blocpdb>    12 atoms in block     56
 Block first atom:    867
 Blocpdb>    15 atoms in block     57
 Block first atom:    879
 Blocpdb>    16 atoms in block     58
 Block first atom:    894
 Blocpdb>    13 atoms in block     59
 Block first atom:    910
 Blocpdb>    13 atoms in block     60
 Block first atom:    923
 Blocpdb>    14 atoms in block     61
 Block first atom:    936
 Blocpdb>    14 atoms in block     62
 Block first atom:    950
 Blocpdb>    16 atoms in block     63
 Block first atom:    964
 Blocpdb>    21 atoms in block     64
 Block first atom:    980
 Blocpdb>    16 atoms in block     65
 Block first atom:   1001
 Blocpdb>    16 atoms in block     66
 Block first atom:   1017
 Blocpdb>    12 atoms in block     67
 Block first atom:   1033
 Blocpdb>    10 atoms in block     68
 Block first atom:   1045
 Blocpdb>    13 atoms in block     69
 Block first atom:   1055
 Blocpdb>    15 atoms in block     70
 Block first atom:   1068
 Blocpdb>    13 atoms in block     71
 Block first atom:   1083
 Blocpdb>    14 atoms in block     72
 Block first atom:   1096
 Blocpdb>    13 atoms in block     73
 Block first atom:   1110
 Blocpdb>    17 atoms in block     74
 Block first atom:   1123
 Blocpdb>    16 atoms in block     75
 Block first atom:   1140
 Blocpdb>    14 atoms in block     76
 Block first atom:   1156
 Blocpdb>    13 atoms in block     77
 Block first atom:   1170
 Blocpdb>    10 atoms in block     78
 Block first atom:   1183
 Blocpdb>    16 atoms in block     79
 Block first atom:   1193
 Blocpdb>    14 atoms in block     80
 Block first atom:   1209
 Blocpdb>    16 atoms in block     81
 Block first atom:   1223
 Blocpdb>    20 atoms in block     82
 Block first atom:   1239
 Blocpdb>    17 atoms in block     83
 Block first atom:   1259
 Blocpdb>    16 atoms in block     84
 Block first atom:   1276
 Blocpdb>    18 atoms in block     85
 Block first atom:   1292
 Blocpdb>    16 atoms in block     86
 Block first atom:   1310
 Blocpdb>    16 atoms in block     87
 Block first atom:   1326
 Blocpdb>    17 atoms in block     88
 Block first atom:   1342
 Blocpdb>    13 atoms in block     89
 Block first atom:   1359
 Blocpdb>    20 atoms in block     90
 Block first atom:   1372
 Blocpdb>    16 atoms in block     91
 Block first atom:   1392
 Blocpdb>    12 atoms in block     92
 Block first atom:   1408
 Blocpdb>    10 atoms in block     93
 Block first atom:   1420
 Blocpdb>    15 atoms in block     94
 Block first atom:   1430
 Blocpdb>    12 atoms in block     95
 Block first atom:   1445
 Blocpdb>    15 atoms in block     96
 Block first atom:   1457
 Blocpdb>    16 atoms in block     97
 Block first atom:   1472
 Blocpdb>    20 atoms in block     98
 Block first atom:   1488
 Blocpdb>    16 atoms in block     99
 Block first atom:   1508
 Blocpdb>    14 atoms in block    100
 Block first atom:   1524
 Blocpdb>    15 atoms in block    101
 Block first atom:   1538
 Blocpdb>    14 atoms in block    102
 Block first atom:   1553
 Blocpdb>    10 atoms in block    103
 Block first atom:   1567
 Blocpdb>    16 atoms in block    104
 Block first atom:   1577
 Blocpdb>     5 atoms in block    105
 Block first atom:   1593
 Blocpdb>    29 atoms in block    106
 Block first atom:   1597

 Blocpdb>   106 blocks.

 Blocpdb> At most,     29 atoms in each of them.
 Blocpdb> At least,     5 atoms in each of them.

 Blocpdb> Normal end of Blocpdb.

 Diagrtb> Memory allocation for Prepmat.
 Diagrtb> Memory allocation for RTB.
 Diagrtb> Memory allocation for Diagstd.
 Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes.

 Prepmat> Entering in.
 Prepmat> Rewriting of the matrix begins.

 Prepmat>       556679 matrix lines read.

 Prepmat> Matrix order    =       4878

 Prepmat> Matrix trace    =    1215460.0000
 Prepmat> Last element read:    4878   4878       368.5772
 Prepmat>         5672 lines saved.
 Prepmat>         4705 empty lines.
 Prepmat> Number of lines on output is as expected.
 Prepmat> Normal end of Prepmat.

 RTB> Entering in.
 RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file:  1626
 RTB> Total mass =        1626.0000
 RTB> Number of atoms found in matrix:  1626
 RTB> Number of blocks =   106
 RTB> Projection begins.
 RTB> Projected matrix is being saved.
 RTB> Projected matrix trace =  131941.4321
 RTB>     33186 non-zero elements.
 RTB> Normal end of RTB.

 Diagstd> Entering in.

 Openam> file on opening on unit     10:
 diagrtb_work.sdijb                      
 Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb                      
 Diagstd> CERFACS matrix format.
 Diagstd> Projected matrix order =      636
 Diagstd> Nb of non-zero elements:    33186
 Diagstd> Projected matrix trace =  131941.4321

 Openam> file on opening on unit     11:
 diagrtb_work.eigenfacs                  
 Diagstd> Diagonalization.

 Diagstd>    636 eigenvectors are computed. 
 Diagstd>    106 of them to be saved. 

 Diagstd> Sum of eigenvalues = 131941.4321
 Diagstd> Best zero-eigenvalue found  :     0.000000

 Diagstd>      6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to:    0.0000000

 Diagstd> Selected eigenvalues: 
      0.0000000      0.0000000      0.0000000      0.0000000      0.0000000
      0.0000000      0.5493050      1.0394974      2.3043707      2.4625937
      3.5953552      4.2182812      4.8112940      6.1441427      7.8417292
      8.3598065      8.8291902      9.7957903     10.5142857     11.3941665
     12.2179901     12.3273247     14.0260827     15.2331424     15.8624299
     17.0173333     17.5703595     18.5201120     19.7479898     19.9824277
     20.5397756     21.7215063     21.9882157     22.5301840     24.3956105
     25.7635913     26.6956913     29.1264731     29.4487021     30.4386758
     30.5479927     31.5356042     32.5975174     33.1917436     34.5094440
     35.3758468     35.4344316     36.9046007     37.3472526     38.4643119
     39.3714827     40.6220015     42.0807811     42.7705641     43.6943406
     44.2671292     44.2914346     45.7755805     46.8050528     48.1718058
     48.7708952     49.8350394     50.5065722     51.3106434     51.6918399
     53.0751428     53.1511026     53.8457784     54.4994004     55.6729305
     55.9867608     57.1551441     57.4691953     58.6577898     60.3036575
     61.0607636     61.2518987     62.6146070     62.9902227     64.0171072
     64.1950374     65.1348759     65.7273686     66.1997638     67.1146688
     68.5606509     68.9990506     69.9716559     70.9301223     71.7308881
     71.8804489     72.9089558     73.8242456     74.3482497     75.2038647
     76.7946978     77.0587865     77.6119342     78.2554148     79.3329018
     79.8329749     81.2350121     81.6282352     82.2989319     82.8973745
     83.6285534

 Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units):
      0.0034325      0.0034332      0.0034336      0.0034342      0.0034347
      0.0034355     80.4826141    110.7151336    164.8433561    170.4086593
    205.9046633    223.0298766    238.1914821    269.1695483    304.0893423
    313.9737880    322.6678663    339.8717122    352.1155203    366.5528171
    379.5728714    381.2674224    406.6899853    423.8283778    432.4940509
    447.9618531    455.1825492    467.3229228    482.5660085    485.4219440
    492.1450574    506.1045591    509.2022037    515.4394439    536.3535085
    551.1863840    561.0684737    586.0561526    589.2890340    599.1121925
    600.1870481    609.8118485    619.9940806    625.6195533    637.9171256
    645.8753390    646.4099244    659.6833693    663.6278598    673.4793193
    681.3749536    692.1112986    704.4289187    710.1789075    717.8073070
    722.4968522    722.6951725    734.7036721    742.9193155    753.6882483
    758.3603947    766.5891767    771.7368316    777.8556499    780.7397216
    791.1172711    791.6831823    796.8399692    801.6617133    810.2467945
    812.5272796    820.9617862    823.2141719    831.6835811    843.2708868
    848.5479642    849.8750073    859.2768467    861.8503299    868.8469943
    870.0536002    876.3994076    880.3764222    883.5344753    889.6189103
    899.1512371    902.0213932    908.3565580    914.5566975    919.7046539
    920.6629591    927.2262531    933.0282410    936.3337002    941.7060489
    951.6141653    953.2490103    956.6642252    960.6218909    967.2126103
    970.2562231    978.7390249    981.1049885    985.1273572    988.7025819
    993.0533312

 Diagstd> Normal end.

 Rtb_to_modes> Entering in.

 Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file =   1626
 Rtb_to_modes> Number of blocs =    106

 Openam> file on opening on unit     10:
 diagrtb_work.eigenfacs                  

 Openam> file on opening on unit     11:
 matrix.eigenrtb                         

 Rdmodfacs> Entering in.

 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     1
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  9.9913E-10

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     2
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  9.9959E-10

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     3
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  9.9980E-10

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     4
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  1.0001E-09

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     5
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  1.0004E-09

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     6
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  1.0009E-09

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     7
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  0.5493    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     8
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   1.039    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     9
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   2.304    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    10
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   2.463    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    11
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   3.595    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    12
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   4.218    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    13
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   4.811    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    14
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   6.144    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    15
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   7.842    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    16
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   8.360    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    17
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   8.829    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    18
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   9.796    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    19
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   10.51    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    20
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   11.39    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    21
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   12.22    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    22
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   12.33    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    23
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   14.03    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    24
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   15.23    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    25
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   15.86    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    26
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   17.02    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    27
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   17.57    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    28
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   18.52    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    29
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   19.75    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    30
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   19.98    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    31
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   20.54    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    32
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   21.72    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    33
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   21.99    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    34
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   22.53    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    35
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   24.40    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    36
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   25.76    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    37
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   26.70    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    38
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   29.13    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    39
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   29.45    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    40
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   30.44    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    41
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   30.55    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    42
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   31.54    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    43
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   32.60    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    44
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   33.19    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    45
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   34.51    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    46
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   35.38    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    47
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   35.43    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    48
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   36.90    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    49
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   37.35    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    50
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   38.46    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    51
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   39.37    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    52
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   40.62    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    53
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   42.08    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    54
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   42.77    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    55
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   43.69    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    56
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   44.27    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    57
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   44.29    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    58
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   45.78    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    59
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   46.81    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    60
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   48.17    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    61
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   48.77    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    62
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   49.84    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    63
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   50.51    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    64
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   51.31    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    65
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   51.69    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    66
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   53.08    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    67
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   53.15    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    68
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   53.85    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    69
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   54.50    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    70
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   55.67    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    71
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   55.99    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    72
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   57.16    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    73
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   57.47    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    74
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   58.66    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    75
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   60.30    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    76
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   61.06    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    77
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   61.25    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    78
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   62.61    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    79
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   62.99    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    80
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   64.02    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    81
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   64.20    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    82
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   65.13    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    83
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   65.73    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    84
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   66.20    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    85
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   67.11    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    86
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   68.56    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    87
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   69.00    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    88
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   69.97    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    89
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   70.93    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    90
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   71.73    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    91
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   71.88    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    92
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   72.91    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    93
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   73.82    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    94
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   74.35    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    95
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   75.20    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    96
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   76.79    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    97
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   77.06    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    98
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   77.61    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    99
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   78.26    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   100
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   79.33    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   101
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   79.83    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   102
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   81.24    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   103
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   81.63    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   104
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   82.30    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   105
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   82.90    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   106
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   83.63    

 Rtb_to_modes>  106 vectors, with    636 coordinates in vector file.

 Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected):
 1.00004 1.00000 0.99997 1.00000 1.00004
 1.00000 1.00003 0.99998 1.00001 1.00001
 0.99997 1.00001 0.99999 0.99997 0.99998
 0.99998 0.99999 0.99995 1.00004 0.99999
 1.00003 1.00001 0.99999 0.99999 1.00002
 1.00001 1.00002 1.00001 1.00001 1.00000
 1.00002 0.99998 0.99995 0.99999 1.00000
 1.00004 0.99999 1.00005 0.99996 0.99996
 1.00001 0.99999 0.99999 1.00003 0.99999
 1.00002 1.00002 0.99999 1.00004 1.00000
 1.00004 1.00001 1.00001 1.00001 1.00000
 0.99998 1.00001 1.00000 0.99999 0.99998
 0.99999 1.00000 1.00001 1.00000 0.99999
 1.00002 0.99999 1.00001 1.00002 0.99999
 1.00001 1.00001 1.00003 1.00001 1.00003
 1.00001 1.00000 1.00003 1.00001 0.99999
 0.99999 1.00001 0.99999 1.00002 1.00000
 1.00002 1.00001 0.99999 1.00000 1.00000
 1.00000 1.00001 0.99996 1.00001 1.00000
 1.00000 0.99998 1.00000 0.99999 0.99998
 1.00001 1.00003 1.00001 1.00000 0.99999
 0.99999

 Rtb_to_modes> RTB block-file is being read.
 Rtb_to_modes>    29268 lines found in RTB file.

 Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected):
 1.00004 1.00000 0.99997 1.00000 1.00004
 1.00000 1.00003 0.99998 1.00001 1.00001
 0.99997 1.00001 0.99999 0.99997 0.99998
 0.99998 0.99999 0.99995 1.00004 0.99999
 1.00003 1.00001 0.99999 0.99999 1.00002
 1.00001 1.00002 1.00001 1.00001 1.00000
 1.00002 0.99998 0.99995 0.99999 1.00000
 1.00004 0.99999 1.00005 0.99996 0.99996
 1.00001 0.99999 0.99999 1.00003 0.99999
 1.00002 1.00002 0.99999 1.00004 1.00000
 1.00004 1.00001 1.00001 1.00001 1.00000
 0.99998 1.00001 1.00000 0.99999 0.99998
 0.99999 1.00000 1.00001 1.00000 0.99999
 1.00002 0.99999 1.00001 1.00002 0.99999
 1.00001 1.00001 1.00003 1.00001 1.00003
 1.00001 1.00000 1.00003 1.00001 0.99999
 0.99999 1.00001 0.99999 1.00002 1.00000
 1.00002 1.00001 0.99999 1.00000 1.00000
 1.00000 1.00001 0.99996 1.00001 1.00000
 1.00000 0.99998 1.00000 0.99999 0.99998
 1.00001 1.00003 1.00001 1.00000 0.99999
 0.99999

 Orthogonality of first eigenvectors (zero expected):
 Vector   2: 0.000
 Vector   3: 0.000-0.000
 Vector   4: 0.000-0.000-0.000
 Vector   5: 0.000-0.000-0.000 0.000
 Vector   6:-0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
 Vector   7:-0.000 0.000-0.000-0.000-0.000-0.000
 Vector   8:-0.000 0.000-0.000-0.000 0.000 0.000 0.000
 Vector   9: 0.000-0.000-0.000 0.000-0.000 0.000-0.000-0.000
 Vector  10: 0.000-0.000 0.000 0.000 0.000-0.000 0.000-0.000 0.000

 Rtb_to_modes>   106 eigenvectors saved.

 Rtb_to_modes> Normal end.

 Diagrtb> Normal end.
B-factor analysis
 Bfactors> Version 1.22, Bordeaux.                
 Getnam> Eigenvector filename ?
 Getnam> 260209051925111772.eigenfacs

 Openam> file on opening on unit     10:
 260209051925111772.eigenfacs                                    
 Getnam> Corresponding pdb filename ?
 Getnam> 260209051925111772.atom

 Openam> file on opening on unit     11:
 260209051925111772.atom                                         
 Getnum> Number of skipped eigenvectors ?
 Getnum>            0
 Getnum> Number of usefull eigenvectors ?
 Getnum>        10000
%Getnum-Err: number larger than    106 This is not allowed. Sorry.

 Rdatompdb> Reading pdb file.
 Rdatompdb> End of file reached.
 Rdatompdb> Number of I/O errors:            0

 Rdatompdb> Number of residues found =    209
            First residue number     =      6
            Last  residue number     =      1
            Number of atoms found    =   1626
            Mean number per residue  =      7.8

 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     1
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  9.9913E-10

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     2
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  9.9959E-10

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     3
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  9.9980E-10

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     4
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  1.0001E-09

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     5
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  1.0004E-09

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     6
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  1.0009E-09

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     7
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  0.5493    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     8
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   1.039    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     9
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   2.304    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    10
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   2.463    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    11
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   3.595    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    12
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   4.218    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    13
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   4.811    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    14
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   6.144    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    15
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   7.842    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    16
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   8.360    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    17
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   8.829    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    18
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   9.796    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    19
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   10.51    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    20
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   11.39    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    21
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   12.22    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    22
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   12.33    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    23
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   14.03    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    24
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   15.23    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    25
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   15.86    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    26
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   17.02    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    27
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   17.57    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    28
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   18.52    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    29
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   19.75    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    30
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   19.98    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    31
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   20.54    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    32
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   21.72    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    33
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   21.99    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    34
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   22.53    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    35
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   24.40    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    36
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   25.76    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    37
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   26.70    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    38
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   29.13    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    39
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   29.45    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    40
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   30.44    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    41
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   30.55    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    42
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   31.54    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    43
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   32.60    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    44
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   33.19    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    45
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   34.51    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    46
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   35.38    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    47
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   35.43    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    48
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   36.90    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    49
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   37.35    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    50
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   38.46    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    51
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   39.37    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    52
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   40.62    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    53
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   42.08    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    54
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   42.77    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    55
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   43.69    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    56
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   44.27    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    57
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   44.29    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    58
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   45.78    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    59
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   46.81    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    60
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   48.17    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    61
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   48.77    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    62
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   49.84    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    63
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   50.51    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    64
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   51.31    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    65
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   51.69    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    66
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   53.08    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    67
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   53.15    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    68
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   53.85    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    69
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   54.50    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    70
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   55.67    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    71
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   55.99    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    72
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   57.16    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    73
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   57.47    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    74
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   58.66    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    75
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   60.30    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    76
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   61.06    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    77
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   61.25    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    78
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   62.61    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    79
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   62.99    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    80
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   64.02    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    81
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   64.20    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    82
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   65.13    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    83
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   65.73    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    84
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   66.20    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    85
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   67.11    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    86
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   68.56    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    87
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   69.00    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    88
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   69.97    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    89
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   70.93    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    90
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   71.73    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    91
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   71.88    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    92
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   72.91    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    93
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   73.82    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    94
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   74.35    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    95
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   75.20    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    96
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   76.79    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    97
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   77.06    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    98
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   77.61    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    99
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   78.26    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   100
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   79.33    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   101
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   79.83    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   102
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   81.24    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   103
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   81.63    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   104
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   82.30    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   105
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   82.90    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   106
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   83.63    

 Bfactors>  106 vectors,   4878 coordinates in file.

 Openam> file on opening on unit     12:
 bfactors.pred                                                   

 Bfactors> Best zero-eigenvalue found  :     0.000000
 Bfactors>     6 eigenvalues less than :     0.000000
 Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue  :     0.549300
 Bfactors>   100 eigenvectors will be considered.
 Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped.

 Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed.
          (CHARMM units assumed for eigenvalues)

 Bfactors> Correlation=      0.382 for    208 C-alpha atoms.
 Bfactors> =      0.064 +/-   0.06
 Bfactors> =     61.001 +/-  17.24
 Bfactors> Shiftng-fct=     60.937
 Bfactors> Scaling-fct=    300.833

 Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved.

 Bfactors> Normal end.
check_modes
 Chkmod> Version 1.00, Bordeaux.                
 Getnam> Eigenvector filename ?
 Getnam> 260209051925111772.eigenfacs

 Openam> file on opening on unit     10:
 260209051925111772.eigenfacs                                    

 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     1
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:  3.4323E-03

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     2
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:  3.4331E-03

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     3
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:  3.4335E-03

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     4
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:  3.4340E-03

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     5
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:  3.4345E-03

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     6
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:  3.4354E-03

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     7
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   80.48    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     8
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   110.7    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     9
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   164.8    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    10
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   170.4    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    11
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   205.9    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    12
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   223.0    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    13
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   238.2    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    14
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   269.2    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    15
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   304.1    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    16
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   314.0    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    17
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   322.7    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    18
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   339.9    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    19
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   352.0    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    20
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   366.5    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    21
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   379.6    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    22
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   381.3    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    23
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   406.7    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    24
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   423.8    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    25
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   432.4    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    26
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   448.0    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    27
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   455.2    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    28
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   467.3    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    29
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   482.6    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    30
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   485.4    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    31
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   492.1    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    32
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   506.1    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    33
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   509.2    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    34
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   515.4    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    35
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   536.4    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    36
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   551.1    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    37
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   561.1    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    38
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   586.1    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    39
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   589.3    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    40
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   599.1    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    41
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   600.2    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    42
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   609.8    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    43
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   620.0    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    44
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   625.6    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    45
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   637.9    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    46
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   645.9    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    47
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   646.3    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    48
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   659.6    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    49
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   663.6    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    50
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   673.4    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    51
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   681.3    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    52
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   692.1    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    53
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   704.4    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    54
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   710.1    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    55
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   717.7    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    56
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   722.5    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    57
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   722.7    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    58
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   734.7    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    59
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   742.9    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    60
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   753.6    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    61
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   758.3    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    62
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   766.6    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    63
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   771.7    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    64
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   777.8    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    65
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   780.7    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    66
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   791.1    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    67
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   791.6    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    68
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   796.8    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    69
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   801.6    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    70
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   810.2    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    71
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   812.5    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    72
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   821.0    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    73
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   823.2    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    74
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   831.7    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    75
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   843.2    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    76
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   848.5    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    77
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   849.8    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    78
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   859.2    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    79
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   861.8    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    80
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   868.8    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    81
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   870.0    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    82
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   876.3    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    83
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   880.4    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    84
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   883.5    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    85
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   889.5    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    86
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   899.1    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    87
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   902.0    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    88
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   908.3    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    89
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   914.5    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    90
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   919.7    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    91
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   920.6    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    92
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   927.2    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    93
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   933.0    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    94
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   936.3    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    95
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   941.6    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    96
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   951.5    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    97
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   953.2    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    98
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   956.6    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    99
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   960.6    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   100
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   967.2    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   101
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   970.2    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   102
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   978.7    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   103
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   981.1    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   104
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   985.1    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   105
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   988.7    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   106
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   993.0    

 Chkmod>  106 vectors,   4878 coordinates in file.
 Chkmod>      That is:   1626 cartesian points.

 Openam> file on opening on unit     11:
 Chkmod.res                                                      
 Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file.
%Chkmod-Wn> Norm of vector    18 is:   0.9999 (instead of 1.0000). 
%Chkmod-Wn> Norm of vector    33 is:   0.9999 (instead of 1.0000). 

 Chkmod> Normal end.
      0.0034      0.7517
      0.0034      0.9895
      0.0034      0.7534
      0.0034      0.8837
      0.0034      0.7224
      0.0034      0.9498
     80.4788      0.6192
    110.6839      0.6816
    164.8230      0.5946
    170.4154      0.6292
    205.8857      0.6843
    223.0129      0.3034
    238.1740      0.7368
    269.1549      0.0384
    304.0815      0.4118
    313.9639      0.3049
    322.6505      0.5068
    339.8608      0.2038
    352.0286      0.1878
    366.4701      0.5259
    379.5878      0.5648
    381.2924      0.3892
    406.7293      0.5318
    423.7665      0.3440
    432.4424      0.2807
    447.9777      0.5034
    455.1584      0.4271
    467.3014      0.3965
    482.5699      0.4164
    485.3716      0.2856
    492.1266      0.0569
    506.0653      0.3264
    509.2010      0.2073
    515.4152      0.3554
    536.3787      0.5342
    551.1243      0.4587
    561.0897      0.3838
    586.0665      0.3095
    589.2767      0.4307
    599.0995      0.3661
    600.1810      0.5446
    609.8282      0.5279
    619.9911      0.4729
    625.5763      0.5327
    637.8949      0.3539
    645.8855      0.4589
    646.3418      0.4166
    659.6139      0.3906
    663.6238      0.4715
    673.4127      0.3113
    681.3329      0.5438
    692.0645      0.4301
    704.3921      0.4960
    710.1437      0.5557
    717.7408      0.4769
    722.4893      0.5616
    722.6524      0.5703
    734.7076      0.0693
    742.9267      0.5205
    753.6418      0.5230
    758.3209      0.4716
    766.5944      0.3887
    771.7299      0.4166
    777.8174      0.2850
    780.6923      0.4658
    791.1195      0.5461
    791.6410      0.3762
    796.8370      0.3990
    801.6317      0.3015
    810.1907      0.3659
    812.5159      0.1429
    820.9614      0.4436
    823.1846      0.4306
    831.6635      0.3174
    843.2091      0.5058
    848.5062      0.3997
    849.8254      0.4657
    859.2083      0.4340
    861.8118      0.5796
    868.8293      0.4661
    870.0499      0.5211
    876.3290      0.5079
    880.3563      0.5040
    883.4981      0.4964
    889.5498      0.5638
    899.1084      0.3975
    901.9889      0.5263
    908.3068      0.4627
    914.5166      0.3838
    919.6595      0.5275
    920.6206      0.2988
    927.1931      0.4678
    932.9614      0.5806
    936.3045      0.4704
    941.6414      0.5150
    951.5442      0.5226
    953.2156      0.4311
    956.6112      0.5732
    960.6088      0.3992
    967.1534      0.4273
    970.1965      0.4965
    978.7271      0.4023
    981.0735      0.5272
    985.0915      0.4680
    988.6758      0.5522
    993.0193      0.3648
getting mode 7
running: ../../bin/get_modes.sh 260209051925111772 7 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 7
calculating perturbed structure for DQ=-100
260209051925111772.eigenfacs
260209051925111772.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
260209051925111772.eigenfacs
260209051925111772.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
260209051925111772.eigenfacs
260209051925111772.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
260209051925111772.eigenfacs
260209051925111772.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
260209051925111772.eigenfacs
260209051925111772.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
260209051925111772.eigenfacs
260209051925111772.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
260209051925111772.eigenfacs
260209051925111772.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
260209051925111772.eigenfacs
260209051925111772.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
260209051925111772.eigenfacs
260209051925111772.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
260209051925111772.eigenfacs
260209051925111772.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
260209051925111772.eigenfacs
260209051925111772.atom
making animated gifs
11 models are in 260209051925111772.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 260209051925111772.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 260209051925111772.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 8
running: ../../bin/get_modes.sh 260209051925111772 8 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 8
calculating perturbed structure for DQ=-100
260209051925111772.eigenfacs
260209051925111772.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
260209051925111772.eigenfacs
260209051925111772.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
260209051925111772.eigenfacs
260209051925111772.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
260209051925111772.eigenfacs
260209051925111772.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
260209051925111772.eigenfacs
260209051925111772.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
260209051925111772.eigenfacs
260209051925111772.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
260209051925111772.eigenfacs
260209051925111772.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
260209051925111772.eigenfacs
260209051925111772.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
260209051925111772.eigenfacs
260209051925111772.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
260209051925111772.eigenfacs
260209051925111772.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
260209051925111772.eigenfacs
260209051925111772.atom
making animated gifs
11 models are in 260209051925111772.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 260209051925111772.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 260209051925111772.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 9
running: ../../bin/get_modes.sh 260209051925111772 9 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 9
calculating perturbed structure for DQ=-100
260209051925111772.eigenfacs
260209051925111772.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
260209051925111772.eigenfacs
260209051925111772.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
260209051925111772.eigenfacs
260209051925111772.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
260209051925111772.eigenfacs
260209051925111772.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
260209051925111772.eigenfacs
260209051925111772.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
260209051925111772.eigenfacs
260209051925111772.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
260209051925111772.eigenfacs
260209051925111772.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
260209051925111772.eigenfacs
260209051925111772.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
260209051925111772.eigenfacs
260209051925111772.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
260209051925111772.eigenfacs
260209051925111772.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
260209051925111772.eigenfacs
260209051925111772.atom
making animated gifs
11 models are in 260209051925111772.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 260209051925111772.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 260209051925111772.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 10
running: ../../bin/get_modes.sh 260209051925111772 10 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 10
calculating perturbed structure for DQ=-100
260209051925111772.eigenfacs
260209051925111772.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
260209051925111772.eigenfacs
260209051925111772.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
260209051925111772.eigenfacs
260209051925111772.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
260209051925111772.eigenfacs
260209051925111772.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
260209051925111772.eigenfacs
260209051925111772.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
260209051925111772.eigenfacs
260209051925111772.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
260209051925111772.eigenfacs
260209051925111772.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
260209051925111772.eigenfacs
260209051925111772.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
260209051925111772.eigenfacs
260209051925111772.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
260209051925111772.eigenfacs
260209051925111772.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
260209051925111772.eigenfacs
260209051925111772.atom
making animated gifs
11 models are in 260209051925111772.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 260209051925111772.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 260209051925111772.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 11
running: ../../bin/get_modes.sh 260209051925111772 11 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 11
calculating perturbed structure for DQ=-100
260209051925111772.eigenfacs
260209051925111772.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
260209051925111772.eigenfacs
260209051925111772.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
260209051925111772.eigenfacs
260209051925111772.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
260209051925111772.eigenfacs
260209051925111772.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
260209051925111772.eigenfacs
260209051925111772.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
260209051925111772.eigenfacs
260209051925111772.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
260209051925111772.eigenfacs
260209051925111772.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
260209051925111772.eigenfacs
260209051925111772.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
260209051925111772.eigenfacs
260209051925111772.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
260209051925111772.eigenfacs
260209051925111772.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
260209051925111772.eigenfacs
260209051925111772.atom
making animated gifs
11 models are in 260209051925111772.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 260209051925111772.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 260209051925111772.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
260209051925111772.10.pdb
260209051925111772.11.pdb
260209051925111772.7.pdb
260209051925111772.8.pdb
260209051925111772.9.pdb



STDERR:
Note: The following floating-point exceptions are signalling: IEEE_DENORMAL

real	0m3.942s
user	0m3.897s
sys	0m0.044s
rm: cannot remove '260209051925111772.sdijf': No such file or directory
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
If you find results from this site helpful for your research, please cite one of our papers:
K. Suhre & Y.H. Sanejouand, ElNemo: a normal mode web-server for protein movement analysis and the generation of templates for molecular replacement. Nucleic Acids Research, 32, W610-W614, 2004.
K. Suhre & Y.H. Sanejouand, On the potential of normal mode analysis for solving difficult molecular replacement problems. Acta Cryst. D vol.60, p796-799, 2004 © International Union of Crystallography.
elNémo is maintained by Yves-Henri Sanejouand.
It was developed by Karsten Suhre.
Between 2003 and 2014, it was hosted by IGS (Marseille).
Between 2015 and 2025, it was hosted by US2B (Nantes).
Last modification: december 26th, 2025.
Should you encounter any unexpected behaviour, please let us know. elNémo has been hacked on november 27th. It has been moved away and runs again. **Still some additional cleaning from time to time** Sorry for the inconvenience.

*** CELL INVASION 16-SEP-16 5TCX ***

LOGs for ID: 260209051925111772

Output from eigenvector calculation:

Should you encounter any unexpected behaviour,
please let us know.
elNémo has been hacked on november 27th.
It has been moved away and runs again.
Still some additional cleaning from time to time
Sorry for the inconvenience.

* CELL INVASION 16-SEP-16 5TCX *
