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***  2btf  ***

LOGs for ID: 260209094051182416

Output from eigenvector calculation:


STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8) Build Tirion matrix: Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model. Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004. Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file. Pdbmat> Coordinate filename = 260209094051182416.atom Pdbmat> Distance cutoff = 8.00 Force constant = 10.00 Origin of mass values = CONS Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09 PRINTing level = 2 Pdbmat> Coordinate file 260209094051182416.atom to be opened. Openam> File opened: 260209094051182416.atom Pdbmat> Coordinate file in PDB format. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 512 First residue number = 2 Last residue number = 139 Number of atoms found = 3951 Mean number per residue = 7.7 Pdbmat> Coordinate statistics: = 31.645920 +/- 9.818093 From: 4.835000 To: 61.313000 = 63.938790 +/- 19.068961 From: 22.845000 To: 107.209000 = 64.941111 +/- 13.627268 From: 25.845000 To: 96.276000 Pdbmat> Masses are all set to one. Openam> File opened: pdbmat.xyzm Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved. Openam> File opened: pdbmat.sdijb Pdbmat> Matrix statistics: Pdbmat> The matrix is 2.1214 % Filled. Pdbmat> 1490344 non-zero elements. Pdbmat> 162992 atom-atom interactions. Pdbmat> Number per atom= 82.51 +/- 22.06 Maximum number = 131 Minimum number = 13 Pdbmat> Matrix trace = 3.259840E+06 Pdbmat> Larger element = 482.409 Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10 Pdbmat> Normal end. automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1) 512 non-zero elements, NRBL set to 3 Diagonalize Tirion matrix using diagrtb Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation. Diagrtb> Version 2.52, November 2004. Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file. Diagrtb> Options taken into account: MATRix filename = pdbmat.sdijb COORdinates filename = 260209094051182416.atom Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb Nb of VECTors required = 106 EigeNVALues chosen = LOWE Type of SUBStructuring = NONE Nb of residues per BLOck = 3 Origin of MASS values = CONS MATRix FORMat = BINA Temporary files cleaning = ALL Output PRINting level = 2 Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb. Blocpdb> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.xyzm Blocpdb> Coordinate file 260209094051182416.atom to be opened. Openam> file on opening on unit 11: 260209094051182416.atom Blocpdb> Coordinate file in PDB format. Blocpdb> 3951 atoms picked in pdb file. Blocpdb> All masses set to unity. Blocpdb> Coordinate file is rewritten. Blocpdb> Substructuring: Blocpdb> 3 residue(s) per block. Blocpdb> 512 residues. Blocpdb> 24 atoms in block 1 Block first atom: 1 Blocpdb> 18 atoms in block 2 Block first atom: 25 Blocpdb> 22 atoms in block 3 Block first atom: 43 Blocpdb> 20 atoms in block 4 Block first atom: 65 Blocpdb> 18 atoms in block 5 Block first atom: 85 Blocpdb> 20 atoms in block 6 Block first atom: 103 Blocpdb> 20 atoms in block 7 Block first atom: 123 Blocpdb> 20 atoms in block 8 Block first atom: 143 Blocpdb> 23 atoms in block 9 Block first atom: 163 Blocpdb> 23 atoms in block 10 Block first atom: 186 Blocpdb> 21 atoms in block 11 Block first atom: 209 Blocpdb> 22 atoms in block 12 Block first atom: 230 Blocpdb> 28 atoms in block 13 Block first atom: 252 Blocpdb> 20 atoms in block 14 Block first atom: 280 Blocpdb> 19 atoms in block 15 Block first atom: 300 Blocpdb> 21 atoms in block 16 Block first atom: 319 Blocpdb> 23 atoms in block 17 Block first atom: 340 Blocpdb> 23 atoms in block 18 Block first atom: 363 Blocpdb> 22 atoms in block 19 Block first atom: 386 Blocpdb> 24 atoms in block 20 Block first atom: 408 Blocpdb> 23 atoms in block 21 Block first atom: 432 Blocpdb> 23 atoms in block 22 Block first atom: 455 Blocpdb> 28 atoms in block 23 Block first atom: 478 Blocpdb> 17 atoms in block 24 Block first atom: 506 Blocpdb> 19 atoms in block 25 Block first atom: 523 Blocpdb> 29 atoms in block 26 Block first atom: 542 Blocpdb> 24 atoms in block 27 Block first atom: 571 Blocpdb> 26 atoms in block 28 Block first atom: 595 Blocpdb> 34 atoms in block 29 Block first atom: 621 Blocpdb> 30 atoms in block 30 Block first atom: 655 Blocpdb> 25 atoms in block 31 Block first atom: 685 Blocpdb> 23 atoms in block 32 Block first atom: 710 Blocpdb> 25 atoms in block 33 Block first atom: 733 Blocpdb> 24 atoms in block 34 Block first atom: 758 Blocpdb> 23 atoms in block 35 Block first atom: 782 Blocpdb> 21 atoms in block 36 Block first atom: 805 Blocpdb> 23 atoms in block 37 Block first atom: 826 Blocpdb> 22 atoms in block 38 Block first atom: 849 Blocpdb> 29 atoms in block 39 Block first atom: 871 Blocpdb> 24 atoms in block 40 Block first atom: 900 Blocpdb> 27 atoms in block 41 Block first atom: 924 Blocpdb> 27 atoms in block 42 Block first atom: 951 Blocpdb> 22 atoms in block 43 Block first atom: 978 Blocpdb> 25 atoms in block 44 Block first atom: 1000 Blocpdb> 20 atoms in block 45 Block first atom: 1025 Blocpdb> 21 atoms in block 46 Block first atom: 1045 Blocpdb> 22 atoms in block 47 Block first atom: 1066 Blocpdb> 23 atoms in block 48 Block first atom: 1088 Blocpdb> 22 atoms in block 49 Block first atom: 1111 Blocpdb> 19 atoms in block 50 Block first atom: 1133 Blocpdb> 23 atoms in block 51 Block first atom: 1152 Blocpdb> 18 atoms in block 52 Block first atom: 1175 Blocpdb> 18 atoms in block 53 Block first atom: 1193 Blocpdb> 24 atoms in block 54 Block first atom: 1211 Blocpdb> 27 atoms in block 55 Block first atom: 1235 Blocpdb> 25 atoms in block 56 Block first atom: 1262 Blocpdb> 20 atoms in block 57 Block first atom: 1287 Blocpdb> 23 atoms in block 58 Block first atom: 1307 Blocpdb> 27 atoms in block 59 Block first atom: 1330 Blocpdb> 21 atoms in block 60 Block first atom: 1357 Blocpdb> 23 atoms in block 61 Block first atom: 1378 Blocpdb> 23 atoms in block 62 Block first atom: 1401 Blocpdb> 28 atoms in block 63 Block first atom: 1424 Blocpdb> 25 atoms in block 64 Block first atom: 1452 Blocpdb> 27 atoms in block 65 Block first atom: 1477 Blocpdb> 22 atoms in block 66 Block first atom: 1504 Blocpdb> 25 atoms in block 67 Block first atom: 1526 Blocpdb> 21 atoms in block 68 Block first atom: 1551 Blocpdb> 28 atoms in block 69 Block first atom: 1572 Blocpdb> 26 atoms in block 70 Block first atom: 1600 Blocpdb> 26 atoms in block 71 Block first atom: 1626 Blocpdb> 23 atoms in block 72 Block first atom: 1652 Blocpdb> 24 atoms in block 73 Block first atom: 1675 Blocpdb> 27 atoms in block 74 Block first atom: 1699 Blocpdb> 27 atoms in block 75 Block first atom: 1726 Blocpdb> 20 atoms in block 76 Block first atom: 1753 Blocpdb> 16 atoms in block 77 Block first atom: 1773 Blocpdb> 18 atoms in block 78 Block first atom: 1789 Blocpdb> 26 atoms in block 79 Block first atom: 1807 Blocpdb> 27 atoms in block 80 Block first atom: 1833 Blocpdb> 23 atoms in block 81 Block first atom: 1860 Blocpdb> 20 atoms in block 82 Block first atom: 1883 Blocpdb> 23 atoms in block 83 Block first atom: 1903 Blocpdb> 21 atoms in block 84 Block first atom: 1926 Blocpdb> 33 atoms in block 85 Block first atom: 1947 Blocpdb> 22 atoms in block 86 Block first atom: 1980 Blocpdb> 24 atoms in block 87 Block first atom: 2002 Blocpdb> 22 atoms in block 88 Block first atom: 2026 Blocpdb> 23 atoms in block 89 Block first atom: 2048 Blocpdb> 23 atoms in block 90 Block first atom: 2071 Blocpdb> 18 atoms in block 91 Block first atom: 2094 Blocpdb> 26 atoms in block 92 Block first atom: 2112 Blocpdb> 26 atoms in block 93 Block first atom: 2138 Blocpdb> 22 atoms in block 94 Block first atom: 2164 Blocpdb> 23 atoms in block 95 Block first atom: 2186 Blocpdb> 23 atoms in block 96 Block first atom: 2209 Blocpdb> 28 atoms in block 97 Block first atom: 2232 Blocpdb> 25 atoms in block 98 Block first atom: 2260 Blocpdb> 22 atoms in block 99 Block first atom: 2285 Blocpdb> 18 atoms in block 100 Block first atom: 2307 Blocpdb> 18 atoms in block 101 Block first atom: 2325 Blocpdb> 27 atoms in block 102 Block first atom: 2343 Blocpdb> 17 atoms in block 103 Block first atom: 2370 Blocpdb> 27 atoms in block 104 Block first atom: 2387 Blocpdb> 27 atoms in block 105 Block first atom: 2414 Blocpdb> 20 atoms in block 106 Block first atom: 2441 Blocpdb> 20 atoms in block 107 Block first atom: 2461 Blocpdb> 21 atoms in block 108 Block first atom: 2481 Blocpdb> 26 atoms in block 109 Block first atom: 2502 Blocpdb> 21 atoms in block 110 Block first atom: 2528 Blocpdb> 23 atoms in block 111 Block first atom: 2549 Blocpdb> 32 atoms in block 112 Block first atom: 2572 Blocpdb> 27 atoms in block 113 Block first atom: 2604 Blocpdb> 16 atoms in block 114 Block first atom: 2631 Blocpdb> 22 atoms in block 115 Block first atom: 2647 Blocpdb> 19 atoms in block 116 Block first atom: 2669 Blocpdb> 24 atoms in block 117 Block first atom: 2688 Blocpdb> 26 atoms in block 118 Block first atom: 2712 Blocpdb> 28 atoms in block 119 Block first atom: 2738 Blocpdb> 27 atoms in block 120 Block first atom: 2766 Blocpdb> 29 atoms in block 121 Block first atom: 2793 Blocpdb> 17 atoms in block 122 Block first atom: 2822 Blocpdb> 21 atoms in block 123 Block first atom: 2839 Blocpdb> 30 atoms in block 124 Block first atom: 2860 Blocpdb> 18 atoms in block 125 Block first atom: 2890 Blocpdb> 23 atoms in block 126 Block first atom: 2908 Blocpdb> 25 atoms in block 127 Block first atom: 2931 Blocpdb> 24 atoms in block 128 Block first atom: 2956 Blocpdb> 21 atoms in block 129 Block first atom: 2980 Blocpdb> 19 atoms in block 130 Block first atom: 3001 Blocpdb> 23 atoms in block 131 Block first atom: 3020 Blocpdb> 18 atoms in block 132 Block first atom: 3043 Blocpdb> 23 atoms in block 133 Block first atom: 3061 Blocpdb> 23 atoms in block 134 Block first atom: 3084 Blocpdb> 20 atoms in block 135 Block first atom: 3107 Blocpdb> 24 atoms in block 136 Block first atom: 3127 Blocpdb> 18 atoms in block 137 Block first atom: 3151 Blocpdb> 27 atoms in block 138 Block first atom: 3169 Blocpdb> 23 atoms in block 139 Block first atom: 3196 Blocpdb> 19 atoms in block 140 Block first atom: 3219 Blocpdb> 20 atoms in block 141 Block first atom: 3238 Blocpdb> 23 atoms in block 142 Block first atom: 3258 Blocpdb> 21 atoms in block 143 Block first atom: 3281 Blocpdb> 23 atoms in block 144 Block first atom: 3302 Blocpdb> 29 atoms in block 145 Block first atom: 3325 Blocpdb> 20 atoms in block 146 Block first atom: 3354 Blocpdb> 19 atoms in block 147 Block first atom: 3374 Blocpdb> 22 atoms in block 148 Block first atom: 3393 Blocpdb> 19 atoms in block 149 Block first atom: 3415 Blocpdb> 27 atoms in block 150 Block first atom: 3434 Blocpdb> 22 atoms in block 151 Block first atom: 3461 Blocpdb> 21 atoms in block 152 Block first atom: 3483 Blocpdb> 27 atoms in block 153 Block first atom: 3504 Blocpdb> 24 atoms in block 154 Block first atom: 3531 Blocpdb> 27 atoms in block 155 Block first atom: 3555 Blocpdb> 17 atoms in block 156 Block first atom: 3582 Blocpdb> 16 atoms in block 157 Block first atom: 3599 Blocpdb> 26 atoms in block 158 Block first atom: 3615 Blocpdb> 22 atoms in block 159 Block first atom: 3641 Blocpdb> 22 atoms in block 160 Block first atom: 3663 Blocpdb> 21 atoms in block 161 Block first atom: 3685 Blocpdb> 23 atoms in block 162 Block first atom: 3706 Blocpdb> 20 atoms in block 163 Block first atom: 3729 Blocpdb> 22 atoms in block 164 Block first atom: 3749 Blocpdb> 21 atoms in block 165 Block first atom: 3771 Blocpdb> 20 atoms in block 166 Block first atom: 3792 Blocpdb> 26 atoms in block 167 Block first atom: 3812 Blocpdb> 27 atoms in block 168 Block first atom: 3838 Blocpdb> 19 atoms in block 169 Block first atom: 3865 Blocpdb> 29 atoms in block 170 Block first atom: 3884 Blocpdb> 26 atoms in block 171 Block first atom: 3913 Blocpdb> 13 atoms in block 172 Block first atom: 3938 Blocpdb> 172 blocks. Blocpdb> At most, 34 atoms in each of them. Blocpdb> At least, 13 atoms in each of them. Blocpdb> Normal end of Blocpdb. Diagrtb> Memory allocation for Prepmat. Diagrtb> Memory allocation for RTB. Diagrtb> Memory allocation for Diagstd. Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes. Prepmat> Entering in. Prepmat> Rewriting of the matrix begins. Prepmat> 1490516 matrix lines read. Prepmat> Matrix order = 11853 Prepmat> Matrix trace = 3259840.0000 Prepmat> Last element read: 11853 11853 344.5308 Prepmat> 14879 lines saved. Prepmat> 13151 empty lines. Prepmat> Number of lines on output is as expected. Prepmat> Normal end of Prepmat. RTB> Entering in. RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 3951 RTB> Total mass = 3951.0000 RTB> Number of atoms found in matrix: 3951 RTB> Number of blocks = 172 RTB> Projection begins. RTB> Projected matrix is being saved. RTB> Projected matrix trace = 224284.7130 RTB> 59592 non-zero elements. RTB> Normal end of RTB. Diagstd> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.sdijb Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb Diagstd> CERFACS matrix format. Diagstd> Projected matrix order = 1032 Diagstd> Nb of non-zero elements: 59592 Diagstd> Projected matrix trace = 224284.7130 Openam> file on opening on unit 11: diagrtb_work.eigenfacs Diagstd> Diagonalization. Diagstd> 1032 eigenvectors are computed. Diagstd> 106 of them to be saved. Diagstd> Sum of eigenvalues = 224284.7130 Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000 Diagstd> Selected eigenvalues: 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.8990863 1.5115685 2.1694685 2.3925872 3.1173213 3.5276893 4.2282467 4.7361065 5.2928238 5.5078909 5.8223839 7.1525039 7.2827928 8.2807577 8.9994037 10.1321415 11.2069334 12.3166134 13.3974219 13.7215364 14.0255140 14.4767646 15.2750031 15.5599648 16.0611308 16.2798703 16.4570374 17.6923143 18.3150338 18.4786488 19.6306700 20.1035185 20.1141517 21.2846839 21.9183314 22.9440818 23.5646574 24.7692824 25.1018461 25.6800637 26.5073056 26.8126263 26.9972742 27.7934450 28.5918706 29.2629732 29.4622128 29.9292242 30.7430837 30.8655403 31.1787612 31.7499588 32.4948776 33.2162367 33.9029034 34.2128234 34.2567402 35.1430330 35.6080652 35.9997056 36.5741851 37.6703360 37.7388890 38.1562261 38.9437220 39.3826805 39.7671045 40.1866335 40.6308492 41.2932576 41.3487355 42.4331508 42.7714566 43.1855887 43.6489478 44.3291152 44.8567782 45.6913080 45.9193194 46.4617301 47.0035875 47.2656189 47.5002736 47.7900097 48.7627683 49.1681654 50.1877865 50.6284994 51.2220016 51.2487511 51.8033993 52.1928454 52.7271625 53.4784326 53.9031541 54.7163476 55.1060170 55.4000744 56.4234394 57.0257955 Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units): 0.0034317 0.0034334 0.0034338 0.0034339 0.0034346 0.0034358 102.9665057 133.5085847 159.9454742 167.9690125 191.7282289 203.9578588 223.2931698 236.3230109 249.8267847 254.8519416 262.0267907 290.4185368 293.0517092 312.4858225 325.7632932 345.6574358 363.5286764 381.1017439 397.4714116 402.2505545 406.6817400 413.1721469 424.4103184 428.3508031 435.1944409 438.1479156 440.5255566 456.7595148 464.7283236 466.7995038 481.1304479 486.8905180 487.0192649 500.9897989 508.3923704 520.1524174 527.1398459 540.4456088 544.0616468 550.2921636 559.0852993 562.2959536 564.2287854 572.4881094 580.6528538 587.4278130 589.4241985 594.0773706 602.1005086 603.2984670 606.3518520 611.8808531 619.0172237 625.8503411 632.2862342 635.1696499 635.5771821 643.7465293 647.9917382 651.5455079 656.7235787 666.4921326 667.0983030 670.7767284 677.6633657 681.4718428 684.7897727 688.3924418 692.1866674 697.8062469 698.2748441 707.3720905 710.1863171 713.6162034 717.4343557 723.0025215 727.2928518 734.0270687 735.8562814 740.1895839 744.4932822 746.5655657 748.4164694 750.6955468 758.2972075 761.4427962 769.2974643 772.6677890 777.1834665 777.3863728 781.5817494 784.5141247 788.5195778 794.1172230 797.2643954 803.2557266 806.1108956 808.2588231 815.6898503 820.0322950 Diagstd> Normal end. Rtb_to_modes> Entering in. Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 3951 Rtb_to_modes> Number of blocs = 172 Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.eigenfacs Openam> file on opening on unit 11: matrix.eigenrtb Rdmodfacs> Entering in. Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Eigenvector number: 1 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9870E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 2 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9966E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 3 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9991E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 4 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9997E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 5 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0004E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 6 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0011E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 7 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.8991 Rdmodfacs> Eigenvector number: 8 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.512 Rdmodfacs> Eigenvector number: 9 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.169 Rdmodfacs> Eigenvector number: 10 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.393 Rdmodfacs> Eigenvector number: 11 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.117 Rdmodfacs> Eigenvector number: 12 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.528 Rdmodfacs> Eigenvector number: 13 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.228 Rdmodfacs> Eigenvector number: 14 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.736 Rdmodfacs> Eigenvector number: 15 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.293 Rdmodfacs> Eigenvector number: 16 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.508 Rdmodfacs> Eigenvector number: 17 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.822 Rdmodfacs> Eigenvector number: 18 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.153 Rdmodfacs> Eigenvector number: 19 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.283 Rdmodfacs> Eigenvector number: 20 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.281 Rdmodfacs> Eigenvector number: 21 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.999 Rdmodfacs> Eigenvector number: 22 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.13 Rdmodfacs> Eigenvector number: 23 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.21 Rdmodfacs> Eigenvector number: 24 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.32 Rdmodfacs> Eigenvector number: 25 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.40 Rdmodfacs> Eigenvector number: 26 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.72 Rdmodfacs> Eigenvector number: 27 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.03 Rdmodfacs> Eigenvector number: 28 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.48 Rdmodfacs> Eigenvector number: 29 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.28 Rdmodfacs> Eigenvector number: 30 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.56 Rdmodfacs> Eigenvector number: 31 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.06 Rdmodfacs> Eigenvector number: 32 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.28 Rdmodfacs> Eigenvector number: 33 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.46 Rdmodfacs> Eigenvector number: 34 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.69 Rdmodfacs> Eigenvector number: 35 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.32 Rdmodfacs> Eigenvector number: 36 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.48 Rdmodfacs> Eigenvector number: 37 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.63 Rdmodfacs> Eigenvector number: 38 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 39 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.11 Rdmodfacs> Eigenvector number: 40 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.28 Rdmodfacs> Eigenvector number: 41 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.92 Rdmodfacs> Eigenvector number: 42 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.94 Rdmodfacs> Eigenvector number: 43 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.56 Rdmodfacs> Eigenvector number: 44 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.77 Rdmodfacs> Eigenvector number: 45 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 46 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.68 Rdmodfacs> Eigenvector number: 47 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.51 Rdmodfacs> Eigenvector number: 48 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.81 Rdmodfacs> Eigenvector number: 49 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.00 Rdmodfacs> Eigenvector number: 50 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.79 Rdmodfacs> Eigenvector number: 51 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.59 Rdmodfacs> Eigenvector number: 52 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.26 Rdmodfacs> Eigenvector number: 53 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.46 Rdmodfacs> Eigenvector number: 54 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.93 Rdmodfacs> Eigenvector number: 55 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.74 Rdmodfacs> Eigenvector number: 56 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.87 Rdmodfacs> Eigenvector number: 57 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.18 Rdmodfacs> Eigenvector number: 58 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.75 Rdmodfacs> Eigenvector number: 59 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.49 Rdmodfacs> Eigenvector number: 60 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.22 Rdmodfacs> Eigenvector number: 61 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.90 Rdmodfacs> Eigenvector number: 62 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.21 Rdmodfacs> Eigenvector number: 63 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.26 Rdmodfacs> Eigenvector number: 64 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.14 Rdmodfacs> Eigenvector number: 65 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.61 Rdmodfacs> Eigenvector number: 66 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.00 Rdmodfacs> Eigenvector number: 67 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.57 Rdmodfacs> Eigenvector number: 68 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.67 Rdmodfacs> Eigenvector number: 69 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.74 Rdmodfacs> Eigenvector number: 70 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.16 Rdmodfacs> Eigenvector number: 71 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.94 Rdmodfacs> Eigenvector number: 72 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.38 Rdmodfacs> Eigenvector number: 73 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.77 Rdmodfacs> Eigenvector number: 74 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.19 Rdmodfacs> Eigenvector number: 75 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.63 Rdmodfacs> Eigenvector number: 76 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.29 Rdmodfacs> Eigenvector number: 77 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.35 Rdmodfacs> Eigenvector number: 78 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.43 Rdmodfacs> Eigenvector number: 79 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.77 Rdmodfacs> Eigenvector number: 80 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.19 Rdmodfacs> Eigenvector number: 81 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.65 Rdmodfacs> Eigenvector number: 82 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.33 Rdmodfacs> Eigenvector number: 83 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.86 Rdmodfacs> Eigenvector number: 84 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.69 Rdmodfacs> Eigenvector number: 85 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.92 Rdmodfacs> Eigenvector number: 86 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.46 Rdmodfacs> Eigenvector number: 87 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 47.00 Rdmodfacs> Eigenvector number: 88 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 47.27 Rdmodfacs> Eigenvector number: 89 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 47.50 Rdmodfacs> Eigenvector number: 90 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 47.79 Rdmodfacs> Eigenvector number: 91 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 48.76 Rdmodfacs> Eigenvector number: 92 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 49.17 Rdmodfacs> Eigenvector number: 93 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 50.19 Rdmodfacs> Eigenvector number: 94 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 50.63 Rdmodfacs> Eigenvector number: 95 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 51.22 Rdmodfacs> Eigenvector number: 96 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 51.25 Rdmodfacs> Eigenvector number: 97 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 51.80 Rdmodfacs> Eigenvector number: 98 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 52.19 Rdmodfacs> Eigenvector number: 99 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 52.73 Rdmodfacs> Eigenvector number: 100 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 53.48 Rdmodfacs> Eigenvector number: 101 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 53.90 Rdmodfacs> Eigenvector number: 102 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 54.72 Rdmodfacs> Eigenvector number: 103 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 55.11 Rdmodfacs> Eigenvector number: 104 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 55.40 Rdmodfacs> Eigenvector number: 105 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 56.42 Rdmodfacs> Eigenvector number: 106 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 57.03 Rtb_to_modes> 106 vectors, with 1032 coordinates in vector file. Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected): 1.00001 0.99999 1.00000 0.99998 0.99999 1.00000 1.00001 1.00000 1.00000 0.99998 1.00000 1.00002 0.99999 1.00003 0.99999 1.00006 1.00000 1.00000 1.00000 1.00002 0.99997 1.00000 1.00003 1.00000 1.00000 1.00002 1.00000 1.00000 1.00001 0.99998 1.00002 1.00001 1.00002 1.00004 0.99997 1.00003 0.99998 0.99999 1.00001 0.99999 1.00001 0.99999 1.00001 0.99999 1.00001 1.00000 1.00002 1.00001 1.00000 1.00001 1.00000 1.00000 1.00002 0.99999 0.99997 0.99999 0.99998 1.00001 0.99999 1.00002 1.00001 1.00000 1.00002 0.99999 1.00002 0.99998 0.99999 0.99999 0.99998 0.99999 1.00001 1.00000 1.00001 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 0.99998 1.00001 0.99999 1.00000 1.00001 1.00001 0.99999 0.99999 0.99998 1.00002 0.99999 1.00003 0.99999 1.00002 1.00000 0.99998 0.99998 0.99997 1.00001 0.99998 1.00002 0.99999 1.00000 0.99999 1.00000 1.00001 1.00002 1.00000 1.00000 Rtb_to_modes> RTB block-file is being read. Rtb_to_modes> 71118 lines found in RTB file. Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected): 1.00001 0.99999 1.00000 0.99998 0.99999 1.00000 1.00001 1.00000 1.00000 0.99998 1.00000 1.00002 0.99999 1.00003 0.99999 1.00006 1.00000 1.00000 1.00000 1.00002 0.99997 1.00000 1.00003 1.00000 1.00000 1.00002 1.00000 1.00000 1.00001 0.99998 1.00002 1.00001 1.00002 1.00004 0.99997 1.00003 0.99998 0.99999 1.00001 0.99999 1.00001 0.99999 1.00001 0.99999 1.00001 1.00000 1.00002 1.00001 1.00000 1.00001 1.00000 1.00000 1.00002 0.99999 0.99997 0.99999 0.99998 1.00001 0.99999 1.00002 1.00001 1.00000 1.00002 0.99999 1.00002 0.99998 0.99999 0.99999 0.99998 0.99999 1.00001 1.00000 1.00001 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 0.99998 1.00001 0.99999 1.00000 1.00001 1.00001 0.99999 0.99999 0.99998 1.00002 0.99999 1.00003 0.99999 1.00002 1.00000 0.99998 0.99998 0.99997 1.00001 0.99998 1.00002 0.99999 1.00000 0.99999 1.00000 1.00001 1.00002 1.00000 1.00000 Orthogonality of first eigenvectors (zero expected): Vector 2: 0.000 Vector 3: 0.000 0.000 Vector 4:-0.000 0.000 0.000 Vector 5: 0.000 0.000-0.000-0.000 Vector 6: 0.000-0.000-0.000-0.000-0.000 Vector 7:-0.000-0.000-0.000 0.000-0.000-0.000 Vector 8:-0.000 0.000 0.000 0.000 0.000-0.000-0.000 Vector 9:-0.000-0.000-0.000-0.000 0.000 0.000 0.000-0.000 Vector 10: 0.000-0.000 0.000 0.000-0.000-0.000 0.000 0.000-0.000 Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved. Rtb_to_modes> Normal end. Diagrtb> Normal end. B-factor analysis Bfactors> Version 1.22, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 260209094051182416.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 260209094051182416.eigenfacs Getnam> Corresponding pdb filename ? Getnam> 260209094051182416.atom Openam> file on opening on unit 11: 260209094051182416.atom Getnum> Number of skipped eigenvectors ? Getnum> 0 Getnum> Number of usefull eigenvectors ? Getnum> 10000 %Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 512 First residue number = 2 Last residue number = 139 Number of atoms found = 3951 Mean number per residue = 7.7 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9870E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9966E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9991E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9997E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0004E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0011E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.8991 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.512 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.169 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.393 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.117 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.528 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.228 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.736 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.293 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.508 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.822 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.153 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.283 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.281 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.999 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.13 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.21 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.32 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.40 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.72 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.48 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.28 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.56 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.06 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.28 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.46 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.69 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.32 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.48 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.63 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.11 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.28 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.92 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.94 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.56 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.77 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.68 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.51 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.81 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.00 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.79 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.59 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.26 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.46 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.93 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.74 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.87 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.18 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.75 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.49 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.22 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.90 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.21 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.26 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.14 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.61 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.00 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.57 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.67 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.74 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.16 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.94 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.38 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.77 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.19 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.63 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.29 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.35 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.43 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.77 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.19 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.65 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.33 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.86 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.69 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.92 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.46 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.00 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.27 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.50 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.79 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.76 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.17 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 50.19 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 50.63 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 51.22 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 51.25 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 51.80 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 52.19 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 52.73 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 53.48 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 53.90 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 54.72 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 55.11 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 55.40 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 56.42 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 57.03 Bfactors> 106 vectors, 11853 coordinates in file. Openam> file on opening on unit 12: bfactors.pred Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000 Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 0.899100 Bfactors> 100 eigenvectors will be considered. Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped. Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed. (CHARMM units assumed for eigenvalues) Bfactors> Correlation= 0.602 for 512 C-alpha atoms. Bfactors> = 0.030 +/- 0.04 Bfactors> = 19.740 +/- 5.71 Bfactors> Shiftng-fct= 19.710 Bfactors> Scaling-fct= 140.113 Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved. Bfactors> Normal end. check_modes Chkmod> Version 1.00, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 260209094051182416.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 260209094051182416.eigenfacs Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4316E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4332E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4337E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4338E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4345E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4357E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 103.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 133.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 159.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 168.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 191.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 204.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 223.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 236.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 249.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 254.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 262.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 290.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 293.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 312.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 325.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 345.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 363.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 381.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 397.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 402.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 406.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 413.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 424.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 428.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 435.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 438.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 440.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 456.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 464.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 466.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 481.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 486.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 486.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 500.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 508.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 520.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 527.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 540.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 544.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 550.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 559.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 562.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 564.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 572.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 580.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 587.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 589.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 594.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 602.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 603.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 606.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 611.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 618.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 625.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 632.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 635.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 635.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 643.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 648.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 651.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 656.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 666.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 667.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 670.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 677.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 681.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 684.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 688.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 692.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 697.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 698.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 707.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 710.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 713.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 717.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 723.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 727.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 734.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 735.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 740.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 744.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 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Chkmod> That is: 3951 cartesian points. Openam> file on opening on unit 11: Chkmod.res Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file. %Chkmod-Wn> Norm of vector 16 is: 1.0001 (instead of 1.0000). 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skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 260209094051182416.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 260209094051182416.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 8 running: ../../bin/get_modes.sh 260209094051182416 8 -200 200 40 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 8 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MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 10 running: ../../bin/get_modes.sh 260209094051182416 10 -200 200 40 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 10 calculating perturbed structure for DQ=-200 260209094051182416.eigenfacs 260209094051182416.atom calculating perturbed structure for DQ=-160 260209094051182416.eigenfacs 260209094051182416.atom calculating perturbed structure for DQ=-120 260209094051182416.eigenfacs 260209094051182416.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 260209094051182416.eigenfacs 260209094051182416.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 260209094051182416.eigenfacs 260209094051182416.atom calculating perturbed structure for DQ=0 260209094051182416.eigenfacs 260209094051182416.atom calculating perturbed structure for DQ=40 260209094051182416.eigenfacs 260209094051182416.atom calculating perturbed structure 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