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elNémo has been hacked on november 27th.
It has been moved away and runs again.
**Still some additional cleaning from time to time**
Sorry for the inconvenience.


***  ANS_DFR_DHK  ***

LOGs for ID: 260210142125460832

Output from eigenvector calculation:


STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8) Build Tirion matrix: Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model. Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004. Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file. Pdbmat> Coordinate filename = 260210142125460832.atom Pdbmat> Distance cutoff = 8.00 Force constant = 10.00 Origin of mass values = CONS Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09 PRINTing level = 2 Pdbmat> Coordinate file 260210142125460832.atom to be opened. Openam> File opened: 260210142125460832.atom Pdbmat> Coordinate file in PDB format. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 704 First residue number = 1 Last residue number = 704 Number of atoms found = 10886 Mean number per residue = 15.5 Pdbmat> Coordinate statistics: = 58.056682 +/- 25.176500 From: -0.431000 To: 141.879000 = 64.919096 +/- 10.642874 From: 24.313000 To: 98.172000 = 61.567528 +/- 12.574590 From: 16.634000 To: 94.824000 Pdbmat> Masses are all set to one. %Pdbmat-W> residue:'HIE ' is not a well known amino-acid. %Pdbmat-W> residue:'HIE ' is not a well known amino-acid. %Pdbmat-W> residue:'HID ' is not a well known amino-acid. %Pdbmat-W> residue:'LYN ' is not a well known amino-acid. %Pdbmat-W> residue:'HD1 ' is not a well known amino-acid. %Pdbmat-W> residue:'AP1 ' is not a well known amino-acid. %Pdbmat-W> residue:'HID ' is not a well known amino-acid. %Pdbmat-W> residue:'HIE ' is not a well known amino-acid. %Pdbmat-W> residue:'HD2 ' is not a well known amino-acid. %Pdbmat-W> ........ %Pdbmat-W> 46 residue(s) not known. Openam> File opened: pdbmat.xyzm Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved. Openam> File opened: pdbmat.sdijb Pdbmat> Matrix statistics: Pdbmat> The matrix is 1.4892 % Filled. Pdbmat> 7941701 non-zero elements. Pdbmat> 875298 atom-atom interactions. Pdbmat> Number per atom= 160.81 +/- 47.11 Maximum number = 252 Minimum number = 0 Pdbmat> Matrix trace = 1.750596E+07 Pdbmat> Larger element = 872.457 Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10 Pdbmat> Normal end. automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1) 704 non-zero elements, NRBL set to 4 Diagonalize Tirion matrix using diagrtb Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation. Diagrtb> Version 2.52, November 2004. Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file. Diagrtb> Options taken into account: MATRix filename = pdbmat.sdijb COORdinates filename = 260210142125460832.atom Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb Nb of VECTors required = 106 EigeNVALues chosen = LOWE Type of SUBStructuring = NONE Nb of residues per BLOck = 4 Origin of MASS values = CONS MATRix FORMat = BINA Temporary files cleaning = ALL Output PRINting level = 2 Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb. Blocpdb> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.xyzm Blocpdb> Coordinate file 260210142125460832.atom to be opened. Openam> file on opening on unit 11: 260210142125460832.atom Blocpdb> Coordinate file in PDB format. Blocpdb> 10886 atoms picked in pdb file. Blocpdb> All masses set to unity. Blocpdb> Coordinate file is rewritten. Blocpdb> Substructuring: Blocpdb> 4 residue(s) per block. Blocpdb> 704 residues. Blocpdb> 59 atoms in block 1 Block first atom: 1 Blocpdb> 64 atoms in block 2 Block first atom: 60 Blocpdb> 56 atoms in block 3 Block first atom: 124 Blocpdb> 48 atoms in block 4 Block first atom: 180 Blocpdb> 61 atoms in block 5 Block first atom: 228 Blocpdb> 77 atoms in block 6 Block first atom: 289 Blocpdb> 70 atoms in block 7 Block first atom: 366 Blocpdb> 59 atoms in block 8 Block first atom: 436 Blocpdb> 56 atoms in block 9 Block first atom: 495 Blocpdb> 65 atoms in block 10 Block first atom: 551 Blocpdb> 71 atoms in block 11 Block first atom: 616 Blocpdb> 54 atoms in block 12 Block first atom: 687 Blocpdb> 59 atoms in block 13 Block first atom: 741 Blocpdb> 72 atoms in block 14 Block first atom: 800 Blocpdb> 53 atoms in block 15 Block first atom: 872 Blocpdb> 71 atoms in block 16 Block first atom: 925 Blocpdb> 74 atoms in block 17 Block first atom: 996 Blocpdb> 71 atoms in block 18 Block first atom: 1070 Blocpdb> 59 atoms in block 19 Block first atom: 1141 Blocpdb> 62 atoms in block 20 Block first atom: 1200 Blocpdb> 69 atoms in block 21 Block first atom: 1262 Blocpdb> 57 atoms in block 22 Block first atom: 1331 Blocpdb> 54 atoms in block 23 Block first atom: 1388 Blocpdb> 73 atoms in block 24 Block first atom: 1442 Blocpdb> 55 atoms in block 25 Block first atom: 1515 Blocpdb> 69 atoms in block 26 Block first atom: 1570 Blocpdb> 64 atoms in block 27 Block first atom: 1639 Blocpdb> 67 atoms in block 28 Block first atom: 1703 Blocpdb> 67 atoms in block 29 Block first atom: 1770 Blocpdb> 50 atoms in block 30 Block first atom: 1837 Blocpdb> 58 atoms in block 31 Block first atom: 1887 Blocpdb> 46 atoms in block 32 Block first atom: 1945 Blocpdb> 65 atoms in block 33 Block first atom: 1991 Blocpdb> 42 atoms in block 34 Block first atom: 2056 Blocpdb> 75 atoms in block 35 Block first atom: 2098 Blocpdb> 68 atoms in block 36 Block first atom: 2173 Blocpdb> 75 atoms in block 37 Block first atom: 2241 Blocpdb> 61 atoms in block 38 Block first atom: 2316 Blocpdb> 75 atoms in block 39 Block first atom: 2377 Blocpdb> 71 atoms in block 40 Block first atom: 2452 Blocpdb> 61 atoms in block 41 Block first atom: 2523 Blocpdb> 63 atoms in block 42 Block first atom: 2584 Blocpdb> 50 atoms in block 43 Block first atom: 2647 Blocpdb> 70 atoms in block 44 Block first atom: 2697 Blocpdb> 73 atoms in block 45 Block first atom: 2767 Blocpdb> 65 atoms in block 46 Block first atom: 2840 Blocpdb> 65 atoms in block 47 Block first atom: 2905 Blocpdb> 56 atoms in block 48 Block first atom: 2970 Blocpdb> 56 atoms in block 49 Block first atom: 3026 Blocpdb> 65 atoms in block 50 Block first atom: 3082 Blocpdb> 60 atoms in block 51 Block first atom: 3147 Blocpdb> 54 atoms in block 52 Block first atom: 3207 Blocpdb> 74 atoms in block 53 Block first atom: 3261 Blocpdb> 76 atoms in block 54 Block first atom: 3335 Blocpdb> 78 atoms in block 55 Block first atom: 3411 Blocpdb> 56 atoms in block 56 Block first atom: 3489 Blocpdb> 63 atoms in block 57 Block first atom: 3545 Blocpdb> 48 atoms in block 58 Block first atom: 3608 Blocpdb> 59 atoms in block 59 Block first atom: 3656 Blocpdb> 54 atoms in block 60 Block first atom: 3715 Blocpdb> 75 atoms in block 61 Block first atom: 3769 Blocpdb> 61 atoms in block 62 Block first atom: 3844 Blocpdb> 62 atoms in block 63 Block first atom: 3905 Blocpdb> 63 atoms in block 64 Block first atom: 3967 Blocpdb> 76 atoms in block 65 Block first atom: 4030 Blocpdb> 59 atoms in block 66 Block first atom: 4106 Blocpdb> 58 atoms in block 67 Block first atom: 4165 Blocpdb> 72 atoms in block 68 Block first atom: 4223 Blocpdb> 52 atoms in block 69 Block first atom: 4295 Blocpdb> 64 atoms in block 70 Block first atom: 4347 Blocpdb> 64 atoms in block 71 Block first atom: 4411 Blocpdb> 71 atoms in block 72 Block first atom: 4475 Blocpdb> 67 atoms in block 73 Block first atom: 4546 Blocpdb> 67 atoms in block 74 Block first atom: 4613 Blocpdb> 81 atoms in block 75 Block first atom: 4680 Blocpdb> 61 atoms in block 76 Block first atom: 4761 Blocpdb> 60 atoms in block 77 Block first atom: 4822 Blocpdb> 73 atoms in block 78 Block first atom: 4882 Blocpdb> 79 atoms in block 79 Block first atom: 4955 Blocpdb> 62 atoms in block 80 Block first atom: 5034 Blocpdb> 56 atoms in block 81 Block first atom: 5096 Blocpdb> 57 atoms in block 82 Block first atom: 5152 Blocpdb> 67 atoms in block 83 Block first atom: 5209 Blocpdb> 69 atoms in block 84 Block first atom: 5276 Blocpdb> 70 atoms in block 85 Block first atom: 5345 Blocpdb> 78 atoms in block 86 Block first atom: 5415 Blocpdb> 77 atoms in block 87 Block first atom: 5493 Blocpdb> 64 atoms in block 88 Block first atom: 5570 %Blocpdb-Wn> 1 atoms in block 89 i.e., less than what is required for a rigid body. %Blocpdb-Wn> Last atom in this block is the 5634th, in residue B 353 %Blocpdb-Wn> It is merged with the previous one. Blocpdb> 65 atoms in block 88 Blocpdb> 58 atoms in block 89 Block first atom: 5635 Blocpdb> 48 atoms in block 90 Block first atom: 5693 Blocpdb> 48 atoms in block 91 Block first atom: 5741 Blocpdb> 61 atoms in block 92 Block first atom: 5789 Blocpdb> 76 atoms in block 93 Block first atom: 5850 Blocpdb> 77 atoms in block 94 Block first atom: 5926 Blocpdb> 58 atoms in block 95 Block first atom: 6003 Blocpdb> 64 atoms in block 96 Block first atom: 6061 Blocpdb> 64 atoms in block 97 Block first atom: 6125 Blocpdb> 74 atoms in block 98 Block first atom: 6189 Blocpdb> 74 atoms in block 99 Block first atom: 6263 Blocpdb> 64 atoms in block 100 Block first atom: 6337 Blocpdb> 61 atoms in block 101 Block first atom: 6401 Blocpdb> 69 atoms in block 102 Block first atom: 6462 Blocpdb> 68 atoms in block 103 Block first atom: 6531 Blocpdb> 56 atoms in block 104 Block first atom: 6599 Blocpdb> 50 atoms in block 105 Block first atom: 6655 Blocpdb> 66 atoms in block 106 Block first atom: 6705 Blocpdb> 39 atoms in block 107 Block first atom: 6771 Blocpdb> 69 atoms in block 108 Block first atom: 6810 Blocpdb> 55 atoms in block 109 Block first atom: 6879 Blocpdb> 58 atoms in block 110 Block first atom: 6934 Blocpdb> 63 atoms in block 111 Block first atom: 6992 Blocpdb> 64 atoms in block 112 Block first atom: 7055 Blocpdb> 69 atoms in block 113 Block first atom: 7119 Blocpdb> 58 atoms in block 114 Block first atom: 7188 Blocpdb> 65 atoms in block 115 Block first atom: 7246 Blocpdb> 42 atoms in block 116 Block first atom: 7311 Blocpdb> 62 atoms in block 117 Block first atom: 7353 Blocpdb> 83 atoms in block 118 Block first atom: 7415 Blocpdb> 56 atoms in block 119 Block first atom: 7498 Blocpdb> 47 atoms in block 120 Block first atom: 7554 Blocpdb> 65 atoms in block 121 Block first atom: 7601 Blocpdb> 67 atoms in block 122 Block first atom: 7666 Blocpdb> 64 atoms in block 123 Block first atom: 7733 Blocpdb> 57 atoms in block 124 Block first atom: 7797 Blocpdb> 64 atoms in block 125 Block first atom: 7854 Blocpdb> 67 atoms in block 126 Block first atom: 7918 Blocpdb> 63 atoms in block 127 Block first atom: 7985 Blocpdb> 82 atoms in block 128 Block first atom: 8048 Blocpdb> 63 atoms in block 129 Block first atom: 8130 Blocpdb> 61 atoms in block 130 Block first atom: 8193 Blocpdb> 66 atoms in block 131 Block first atom: 8254 Blocpdb> 68 atoms in block 132 Block first atom: 8320 Blocpdb> 59 atoms in block 133 Block first atom: 8388 Blocpdb> 72 atoms in block 134 Block first atom: 8447 Blocpdb> 66 atoms in block 135 Block first atom: 8519 Blocpdb> 53 atoms in block 136 Block first atom: 8585 Blocpdb> 67 atoms in block 137 Block first atom: 8638 Blocpdb> 56 atoms in block 138 Block first atom: 8705 Blocpdb> 63 atoms in block 139 Block first atom: 8761 Blocpdb> 54 atoms in block 140 Block first atom: 8824 Blocpdb> 54 atoms in block 141 Block first atom: 8878 Blocpdb> 63 atoms in block 142 Block first atom: 8932 Blocpdb> 73 atoms in block 143 Block first atom: 8995 Blocpdb> 61 atoms in block 144 Block first atom: 9068 Blocpdb> 64 atoms in block 145 Block first atom: 9129 Blocpdb> 56 atoms in block 146 Block first atom: 9193 Blocpdb> 67 atoms in block 147 Block first atom: 9249 Blocpdb> 68 atoms in block 148 Block first atom: 9316 Blocpdb> 61 atoms in block 149 Block first atom: 9384 Blocpdb> 71 atoms in block 150 Block first atom: 9445 Blocpdb> 50 atoms in block 151 Block first atom: 9516 Blocpdb> 61 atoms in block 152 Block first atom: 9566 Blocpdb> 60 atoms in block 153 Block first atom: 9627 Blocpdb> 82 atoms in block 154 Block first atom: 9687 Blocpdb> 72 atoms in block 155 Block first atom: 9769 Blocpdb> 69 atoms in block 156 Block first atom: 9841 Blocpdb> 63 atoms in block 157 Block first atom: 9910 Blocpdb> 57 atoms in block 158 Block first atom: 9973 Blocpdb> 70 atoms in block 159 Block first atom: 10030 Blocpdb> 58 atoms in block 160 Block first atom: 10100 Blocpdb> 66 atoms in block 161 Block first atom: 10158 Blocpdb> 64 atoms in block 162 Block first atom: 10224 Blocpdb> 62 atoms in block 163 Block first atom: 10288 Blocpdb> 73 atoms in block 164 Block first atom: 10350 Blocpdb> 64 atoms in block 165 Block first atom: 10423 Blocpdb> 47 atoms in block 166 Block first atom: 10487 Blocpdb> 61 atoms in block 167 Block first atom: 10534 Blocpdb> 58 atoms in block 168 Block first atom: 10595 Blocpdb> 58 atoms in block 169 Block first atom: 10653 Blocpdb> 33 atoms in block 170 Block first atom: 10711 Blocpdb> 74 atoms in block 171 Block first atom: 10744 Blocpdb> 14 atoms in block 172 Block first atom: 10818 Blocpdb> 33 atoms in block 173 Block first atom: 10832 Blocpdb> 4 atoms in block 174 Block first atom: 10865 Blocpdb> 4 atoms in block 175 Block first atom: 10869 Blocpdb> 4 atoms in block 176 Block first atom: 10873 Blocpdb> 4 atoms in block 177 Block first atom: 10877 Blocpdb> 4 atoms in block 178 Block first atom: 10881 %Blocpdb-Wn> 2 atoms in block 179 i.e., less than what is required for a rigid body. %Blocpdb-Wn> Last atom in this block is the 10886th, in residue G 704 %Blocpdb-Wn> It is merged with last block. Blocpdb> 178 blocks. Blocpdb> At most, 83 atoms in each of them. Blocpdb> At least, 4 atoms in each of them. Blocpdb> Normal end of Blocpdb. Diagrtb> Memory allocation for Prepmat. Diagrtb> Memory allocation for RTB. Diagrtb> Memory allocation for Diagstd. Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes. Prepmat> Entering in. Prepmat> Rewriting of the matrix begins. Prepmat> 7941879 matrix lines read. Prepmat> Matrix order = 32658 Prepmat> Matrix trace = 17505960.0000 Prepmat> Last element read: 32658 32658 0.0000 Prepmat> 15932 lines saved. Prepmat> 13929 empty lines. Prepmat> Number of lines on output is as expected. Prepmat> Normal end of Prepmat. RTB> Entering in. RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 10886 RTB> Total mass = 10886.0000 RTB> Number of atoms found in matrix: 10886 RTB> Number of blocks = 178 RTB> Projection begins. RTB> Projected matrix is being saved. RTB> Projected matrix trace = 422868.8436 RTB> 69402 non-zero elements. RTB> Normal end of RTB. Diagstd> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.sdijb Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb Diagstd> CERFACS matrix format. Diagstd> Projected matrix order = 1068 Diagstd> Nb of non-zero elements: 69402 Diagstd> Projected matrix trace = 422868.8436 Openam> file on opening on unit 11: diagrtb_work.eigenfacs Diagstd> Diagonalization. Diagstd> 1068 eigenvectors are computed. Diagstd> 106 of them to be saved. Diagstd> Sum of eigenvalues = 422868.8436 Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Diagstd> 10 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000 %Diagstd-Wn> Six expected. Parts of the structure interact too little ? Diagstd> Selected eigenvalues: 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 1.0216168 1.4062931 2.0790578 3.1586004 4.8792776 5.1467816 5.6786240 7.7295675 8.2261044 10.0242267 10.8594718 12.7448633 14.6329763 15.4666747 16.0609541 16.5590743 17.9779011 19.4882620 20.8989241 21.7673029 24.1549068 25.2929754 25.6640508 27.0943805 28.5071021 28.9680777 29.4528743 30.5237943 31.1188809 32.5418038 33.8974701 35.0122344 36.2456615 36.6635452 37.3390868 37.8154870 38.8240673 39.8091087 40.1861551 41.4426010 41.9074336 42.4185750 43.5125307 44.3753676 44.7256144 46.7236479 47.7075804 48.4976544 49.0153859 49.6988367 50.9457294 51.8521352 53.1711870 53.7556780 54.4626694 55.7573646 56.9471651 57.5304444 58.0464738 60.2211576 60.4006963 62.7016268 62.9173822 63.1625002 64.0145943 66.6927634 68.2619963 69.3649386 70.0021029 71.6733223 72.5552091 72.8216293 73.2630728 74.4064554 75.0706399 75.8926789 76.5559278 77.4033921 77.7976772 78.1138462 79.9330037 80.8203320 81.7919936 82.6506262 83.0561917 83.1845516 84.4648204 84.6119141 86.0875720 87.1211375 88.2386110 88.5508422 89.1675975 90.0642843 90.7265083 91.7945778 Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units): 0.0034277 0.0034309 0.0034315 0.0034320 0.0034320 0.0034321 0.0034327 0.0034355 0.0034355 0.0034367 109.7587869 128.7754858 156.5772137 192.9934746 239.8684024 246.3560037 258.7717347 301.9067886 311.4529060 343.8117549 357.8488547 387.6706044 415.3953350 427.0647796 435.1920471 441.8891186 460.4312313 479.3821242 496.4291147 506.6378021 533.7009347 546.1290036 550.1205683 565.2426096 579.7914618 584.4604373 589.3307774 599.9492844 605.7693076 619.4640269 632.2355663 642.5474349 653.7674518 657.5253619 663.5553058 667.7749589 676.6215031 685.1513339 688.3883445 699.0669699 702.9765097 707.2505884 716.3123710 723.3796081 726.2287499 742.2729799 750.0478588 756.2330394 760.2588657 765.5408888 775.0847147 781.9493133 791.8327464 796.1730118 801.3915193 810.8609754 819.4667463 823.6527345 827.3384367 842.6938607 843.9490970 859.8737376 861.3518734 863.0281000 868.8299412 886.8182800 897.1907197 904.4098494 908.5541652 919.3355372 924.9741147 926.6707950 929.4752825 936.7001466 940.8715559 946.0088988 950.1336349 955.3780897 957.8082984 959.7525872 970.8638863 976.2377458 982.0886169 987.2300232 989.6492209 990.4136568 998.0061365 998.8747621 1007.5474540 1013.5777042 1020.0574024 1021.8605390 1025.4129857 1030.5559650 1034.3377579 1040.4082675 Diagstd> Normal end. Rtb_to_modes> Entering in. Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 10886 Rtb_to_modes> Number of blocs = 178 Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.eigenfacs Openam> file on opening on unit 11: matrix.eigenrtb Rdmodfacs> Entering in. Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Eigenvector number: 1 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9637E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 2 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9820E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 3 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9859E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 4 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9886E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 5 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9888E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 6 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9893E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 7 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9926E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 8 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0009E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 9 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0009E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 10 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0016E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 11 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.022 Rdmodfacs> Eigenvector number: 12 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.406 Rdmodfacs> Eigenvector number: 13 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.079 Rdmodfacs> Eigenvector number: 14 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.159 Rdmodfacs> Eigenvector number: 15 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.879 Rdmodfacs> Eigenvector number: 16 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.147 Rdmodfacs> Eigenvector number: 17 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.679 Rdmodfacs> Eigenvector number: 18 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.730 Rdmodfacs> Eigenvector number: 19 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.226 Rdmodfacs> Eigenvector number: 20 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 21 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.86 Rdmodfacs> Eigenvector number: 22 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.74 Rdmodfacs> Eigenvector number: 23 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.63 Rdmodfacs> Eigenvector number: 24 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.47 Rdmodfacs> Eigenvector number: 25 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.06 Rdmodfacs> Eigenvector number: 26 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.56 Rdmodfacs> Eigenvector number: 27 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.98 Rdmodfacs> Eigenvector number: 28 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.49 Rdmodfacs> Eigenvector number: 29 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.90 Rdmodfacs> Eigenvector number: 30 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.77 Rdmodfacs> Eigenvector number: 31 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.15 Rdmodfacs> Eigenvector number: 32 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.29 Rdmodfacs> Eigenvector number: 33 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.66 Rdmodfacs> Eigenvector number: 34 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 35 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.51 Rdmodfacs> Eigenvector number: 36 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.97 Rdmodfacs> Eigenvector number: 37 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.45 Rdmodfacs> Eigenvector number: 38 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.52 Rdmodfacs> Eigenvector number: 39 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.12 Rdmodfacs> Eigenvector number: 40 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.54 Rdmodfacs> Eigenvector number: 41 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.90 Rdmodfacs> Eigenvector number: 42 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.01 Rdmodfacs> Eigenvector number: 43 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.25 Rdmodfacs> Eigenvector number: 44 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.66 Rdmodfacs> Eigenvector number: 45 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.34 Rdmodfacs> Eigenvector number: 46 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.82 Rdmodfacs> Eigenvector number: 47 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.82 Rdmodfacs> Eigenvector number: 48 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.81 Rdmodfacs> Eigenvector number: 49 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.19 Rdmodfacs> Eigenvector number: 50 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.44 Rdmodfacs> Eigenvector number: 51 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.91 Rdmodfacs> Eigenvector number: 52 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.42 Rdmodfacs> Eigenvector number: 53 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.51 Rdmodfacs> Eigenvector number: 54 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.38 Rdmodfacs> Eigenvector number: 55 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.73 Rdmodfacs> Eigenvector number: 56 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.72 Rdmodfacs> Eigenvector number: 57 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 47.71 Rdmodfacs> Eigenvector number: 58 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 48.50 Rdmodfacs> Eigenvector number: 59 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 49.02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 60 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 49.70 Rdmodfacs> Eigenvector number: 61 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 50.95 Rdmodfacs> Eigenvector number: 62 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 51.85 Rdmodfacs> Eigenvector number: 63 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 53.17 Rdmodfacs> Eigenvector number: 64 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 53.76 Rdmodfacs> Eigenvector number: 65 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 54.46 Rdmodfacs> Eigenvector number: 66 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 55.76 Rdmodfacs> Eigenvector number: 67 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 56.95 Rdmodfacs> Eigenvector number: 68 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 57.53 Rdmodfacs> Eigenvector number: 69 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 58.05 Rdmodfacs> Eigenvector number: 70 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 60.22 Rdmodfacs> Eigenvector number: 71 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 60.40 Rdmodfacs> Eigenvector number: 72 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 62.70 Rdmodfacs> Eigenvector number: 73 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 62.92 Rdmodfacs> Eigenvector number: 74 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 63.16 Rdmodfacs> Eigenvector number: 75 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 64.01 Rdmodfacs> Eigenvector number: 76 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 66.69 Rdmodfacs> Eigenvector number: 77 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 68.26 Rdmodfacs> Eigenvector number: 78 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 69.36 Rdmodfacs> Eigenvector number: 79 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 70.00 Rdmodfacs> Eigenvector number: 80 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 71.67 Rdmodfacs> Eigenvector number: 81 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 72.56 Rdmodfacs> Eigenvector number: 82 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 72.82 Rdmodfacs> Eigenvector number: 83 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 73.26 Rdmodfacs> Eigenvector number: 84 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 74.41 Rdmodfacs> Eigenvector number: 85 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 75.07 Rdmodfacs> Eigenvector number: 86 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 75.89 Rdmodfacs> Eigenvector number: 87 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 76.56 Rdmodfacs> Eigenvector number: 88 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 77.40 Rdmodfacs> Eigenvector number: 89 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 77.80 Rdmodfacs> Eigenvector number: 90 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 78.11 Rdmodfacs> Eigenvector number: 91 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 79.93 Rdmodfacs> Eigenvector number: 92 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 80.82 Rdmodfacs> Eigenvector number: 93 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 81.79 Rdmodfacs> Eigenvector number: 94 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 82.65 Rdmodfacs> Eigenvector number: 95 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 83.06 Rdmodfacs> Eigenvector number: 96 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 83.18 Rdmodfacs> Eigenvector number: 97 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 84.46 Rdmodfacs> Eigenvector number: 98 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 84.61 Rdmodfacs> Eigenvector number: 99 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 86.09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 100 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 87.12 Rdmodfacs> Eigenvector number: 101 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 88.24 Rdmodfacs> Eigenvector number: 102 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 88.55 Rdmodfacs> Eigenvector number: 103 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 89.17 Rdmodfacs> Eigenvector number: 104 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 90.06 Rdmodfacs> Eigenvector number: 105 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 90.73 Rdmodfacs> Eigenvector number: 106 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 91.79 Rtb_to_modes> 106 vectors, with 1068 coordinates in vector file. Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected): 0.99997 1.00000 0.99999 1.00000 0.99996 1.00002 0.99999 0.99998 1.00003 1.00000 1.00001 0.99999 1.00002 1.00000 1.00000 0.99998 1.00002 1.00002 1.00000 1.00002 1.00003 1.00001 1.00003 1.00001 0.99999 0.99998 0.99995 1.00003 1.00001 1.00002 0.99999 0.99998 1.00001 1.00000 0.99999 0.99999 0.99998 0.99999 0.99999 1.00001 1.00000 1.00000 1.00001 1.00000 1.00000 0.99999 0.99998 0.99999 1.00002 1.00001 0.99999 0.99997 0.99999 1.00003 1.00000 1.00002 1.00001 0.99999 0.99999 0.99998 1.00000 0.99998 1.00000 1.00000 1.00001 1.00000 0.99999 1.00000 0.99999 1.00000 1.00001 0.99999 1.00001 0.99997 0.99999 1.00001 1.00002 0.99998 0.99997 1.00002 1.00001 0.99995 1.00001 1.00000 1.00002 1.00000 1.00002 1.00001 1.00001 1.00002 1.00001 0.99996 1.00000 1.00000 0.99999 1.00001 1.00001 1.00002 0.99999 1.00000 0.99999 1.00001 1.00002 1.00000 1.00000 0.99999 Rtb_to_modes> RTB block-file is being read. Rtb_to_modes> 195948 lines found in RTB file. Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected): 0.99997 1.00000 0.99999 1.00000 0.99996 1.00002 0.99999 0.99998 1.00003 1.00000 1.00001 0.99999 1.00002 1.00000 1.00000 0.99998 1.00002 1.00002 1.00000 1.00002 1.00003 1.00001 1.00003 1.00001 0.99999 0.99998 0.99995 1.00003 1.00001 1.00002 0.99999 0.99998 1.00001 1.00000 0.99999 0.99999 0.99998 0.99999 0.99999 1.00001 1.00000 1.00000 1.00001 1.00000 1.00000 0.99999 0.99998 0.99999 1.00002 1.00001 0.99999 0.99997 0.99999 1.00003 1.00000 1.00002 1.00001 0.99999 0.99999 0.99998 1.00000 0.99998 1.00000 1.00000 1.00001 1.00000 0.99999 1.00000 0.99999 1.00000 1.00001 0.99999 1.00001 0.99997 0.99999 1.00001 1.00002 0.99998 0.99997 1.00002 1.00001 0.99995 1.00001 1.00000 1.00002 1.00000 1.00002 1.00001 1.00001 1.00002 1.00001 0.99996 1.00000 1.00000 0.99999 1.00001 1.00001 1.00002 0.99999 1.00000 0.99999 1.00001 1.00002 1.00000 1.00000 0.99999 Orthogonality of first eigenvectors (zero expected): Vector 2:-0.000 Vector 3:-0.000 0.000 Vector 4: 0.000 0.000-0.000 Vector 5:-0.000-0.000-0.000-0.000 Vector 6:-0.000-0.000 0.000 0.000 0.000 Vector 7:-0.000-0.000-0.000-0.000-0.000-0.000 Vector 8:-0.000-0.000 0.000 0.000 0.000 0.000-0.000 Vector 9:-0.000-0.000-0.000-0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 Vector 10: 0.000-0.000 0.000-0.000 0.000 0.000 0.000-0.000 0.000 Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved. Rtb_to_modes> Normal end. Diagrtb> Normal end. B-factor analysis Bfactors> Version 1.22, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 260210142125460832.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 260210142125460832.eigenfacs Getnam> Corresponding pdb filename ? Getnam> 260210142125460832.atom Openam> file on opening on unit 11: 260210142125460832.atom Getnum> Number of skipped eigenvectors ? Getnum> 0 Getnum> Number of usefull eigenvectors ? Getnum> 10000 %Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 704 First residue number = 1 Last residue number = 704 Number of atoms found = 10886 Mean number per residue = 15.5 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9637E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9820E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9859E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9886E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9888E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9893E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9926E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0009E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0009E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0016E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.022 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.406 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.079 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.159 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.879 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.147 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.679 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.730 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.226 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.86 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.74 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.63 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.47 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.06 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.56 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.98 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.49 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.90 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.77 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.15 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.29 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.66 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.51 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.97 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.45 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.52 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.12 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.54 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.90 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.01 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.25 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.66 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.34 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.82 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.82 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.81 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.19 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.44 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.91 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.42 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.51 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.38 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.73 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.72 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.71 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.50 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.70 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 50.95 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 51.85 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 53.17 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 53.76 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 54.46 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 55.76 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 56.95 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 57.53 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 58.05 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 60.22 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 60.40 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 62.70 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 62.92 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 63.16 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 64.01 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 66.69 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 68.26 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 69.36 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 70.00 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 71.67 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 72.56 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 72.82 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 73.26 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 74.41 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 75.07 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 75.89 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 76.56 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 77.40 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 77.80 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 78.11 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 79.93 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 80.82 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 81.79 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 82.65 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 83.06 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 83.18 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 84.46 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 84.61 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 86.09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 87.12 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 88.24 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 88.55 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 89.17 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 90.06 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 90.73 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 91.79 Bfactors> 106 vectors, 32658 coordinates in file. Openam> file on opening on unit 12: bfactors.pred Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Bfactors> 10 eigenvalues less than : 0.000000 Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 1.022000 Bfactors> 96 eigenvectors will be considered. Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped. Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed. (CHARMM units assumed for eigenvalues) %Bfactors-Wn> Experimental B-factors are nearly constant ! Bfactors> = 0.006 +/- 0.01 Bfactors> = 0.000 +/- 0.00 Bfactors> Shiftng-fct= -0.006 Bfactors> Scaling-fct= 0.000 Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved. Bfactors> Normal end. check_modes Chkmod> Version 1.00, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 260210142125460832.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 260210142125460832.eigenfacs Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4276E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4307E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4314E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4319E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4319E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4320E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4325E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4354E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4354E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4366E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 109.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 128.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 156.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 193.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 239.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 246.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 258.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 301.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 311.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 343.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 357.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 387.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 415.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 427.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 435.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 441.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 460.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 479.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 496.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 506.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 533.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 546.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 550.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 565.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 579.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 584.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 589.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 599.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 605.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 619.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 632.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 642.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 653.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 657.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 663.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 667.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 676.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 685.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 688.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 699.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 703.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 707.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 716.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 723.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 726.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 742.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 750.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 756.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 760.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 765.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 775.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 781.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 791.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 796.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 801.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 810.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 819.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 823.6 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vecteur en lecture: 904.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 908.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 919.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 925.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 926.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 929.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 936.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 940.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 946.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 950.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 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CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 998.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1008. 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Openam> file on opening on unit 11: Chkmod.res Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file. %Chkmod-Wn> Norm of vector 6 is: 1.0001 (instead of 1.0000). %Chkmod-Wn> Norm of vector 27 is: 0.9998 (instead of 1.0000). %Chkmod-Wn> Norm of vector 37 is: 1.0001 (instead of 1.0000). Chkmod> Normal end. 0.0034 0.0005 0.0034 0.0666 0.0034 0.4584 0.0034 0.1519 0.0034 0.0142 0.0034 0.0808 0.0034 0.4699 0.0034 0.2587 0.0034 0.0124 0.0034 0.1123 109.7747 0.6621 128.7565 0.6748 156.5683 0.6234 192.9974 0.0002 239.8513 0.5713 246.3507 0.0006 258.7692 0.6044 301.9023 0.0034 311.4376 0.2812 343.7245 0.4969 357.8422 0.3633 387.5800 0.2720 415.3353 0.3011 427.0924 0.0022 435.1604 0.3641 441.8825 0.4749 460.4383 0.0002 479.3829 0.3017 496.4206 0.0275 506.6474 0.0153 533.6238 0.3401 546.0734 0.1462 550.0535 0.1872 565.1727 0.0997 579.7960 0.0878 584.4547 0.2060 589.2767 0.0006 599.8862 0.3044 605.7542 0.4296 619.4203 0.3976 632.2320 0.5082 642.4993 0.4152 653.7785 0.1177 657.4653 0.1042 663.5349 0.3936 667.7861 0.2725 676.5570 0.1962 685.1296 0.2942 688.3917 0.0552 699.0150 0.0336 702.9679 0.0855 707.2321 0.0500 716.2608 0.0505 723.3863 0.2627 726.2332 0.3538 742.2121 0.4164 750.0347 0.3707 756.2189 0.2240 760.2620 0.4533 765.5170 0.2655 775.0839 0.4016 781.8996 0.0029 791.7899 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MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 260210142125460832.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 260210142125460832.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 8 running: ../../bin/get_modes.sh 260210142125460832 8 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 8 calculating perturbed structure for DQ=-100 260210142125460832.eigenfacs 260210142125460832.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 260210142125460832.eigenfacs 260210142125460832.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 260210142125460832.eigenfacs 260210142125460832.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 260210142125460832.eigenfacs 260210142125460832.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 260210142125460832.eigenfacs 260210142125460832.atom calculating perturbed structure for DQ=0 260210142125460832.eigenfacs 260210142125460832.atom calculating perturbed structure for DQ=20 260210142125460832.eigenfacs 260210142125460832.atom calculating perturbed structure for DQ=40 260210142125460832.eigenfacs 260210142125460832.atom calculating perturbed structure for DQ=60 260210142125460832.eigenfacs 260210142125460832.atom calculating perturbed structure for DQ=80 260210142125460832.eigenfacs 260210142125460832.atom calculating perturbed structure for DQ=100 260210142125460832.eigenfacs 260210142125460832.atom making animated gifs 11 models are in 260210142125460832.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 260210142125460832.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 260210142125460832.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 9 running: 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calculating perturbed structure for DQ=80 260210142125460832.eigenfacs 260210142125460832.atom calculating perturbed structure for DQ=100 260210142125460832.eigenfacs 260210142125460832.atom making animated gifs 11 models are in 260210142125460832.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 260210142125460832.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 260210142125460832.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted 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be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 260210142125460832.11.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 260210142125460832.10.pdb 260210142125460832.11.pdb 260210142125460832.7.pdb 260210142125460832.8.pdb 260210142125460832.9.pdb STDERR: Note: The following floating-point exceptions are signalling: IEEE_DENORMAL real 1m5.046s user 1m4.553s sys 0m0.450s rm: cannot remove '260210142125460832.sdijf': No such file or directory pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format 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