CNRS Nantes University US2B US2B
home |  start a new run |  job status |  references&downloads |  examples |  help  

Should you encounter any unexpected behaviour,
please let us know.
elNémo has been hacked on november 27th.
It has been moved away and runs again.
**Still some additional cleaning from time to time**
Sorry for the inconvenience.


***  TRANSFERASE 18-AUG-21 7PHT  ***

LOGs for ID: 260210202843550410

Output from eigenvector calculation:


STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8) Build Tirion matrix: Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model. Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004. Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file. Pdbmat> Coordinate filename = 260210202843550410.atom Pdbmat> Distance cutoff = 8.00 Force constant = 10.00 Origin of mass values = CONS Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09 PRINTing level = 2 Pdbmat> Coordinate file 260210202843550410.atom to be opened. Openam> File opened: 260210202843550410.atom Pdbmat> Coordinate file in PDB format. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 601 First residue number = 953 Last residue number = 1 Number of atoms found = 10509 Mean number per residue = 17.5 Pdbmat> Coordinate statistics: = 22.568353 +/- 8.448879 From: 2.261000 To: 43.479000 = -17.953203 +/- 11.293881 From: -44.623000 To: 3.977000 = -3.555713 +/- 3.128534 From: -12.429000 To: 4.946000 Pdbmat> Masses are all set to one. %Pdbmat-W> residue:'UNL ' is not a well known amino-acid. %Pdbmat-W> 1 residue(s) not known. Openam> File opened: pdbmat.xyzm Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved. Openam> File opened: pdbmat.sdijb Pdbmat> Matrix statistics: Pdbmat> The matrix is 19.7590 % Filled. Pdbmat> 98200715 non-zero elements. Pdbmat> 10906176 atom-atom interactions. Pdbmat> Number per atom= 2075.59 +/- 615.73 Maximum number = 3203 Minimum number = 143 Pdbmat> Matrix trace = 2.181235E+08 Pdbmat> Larger element = 13504.9 Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10 Pdbmat> Normal end. automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1) 601 non-zero elements, NRBL set to 4 Diagonalize Tirion matrix using diagrtb Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation. Diagrtb> Version 2.52, November 2004. Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file. Diagrtb> Options taken into account: MATRix filename = pdbmat.sdijb COORdinates filename = 260210202843550410.atom Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb Nb of VECTors required = 106 EigeNVALues chosen = LOWE Type of SUBStructuring = NONE Nb of residues per BLOck = 4 Origin of MASS values = CONS MATRix FORMat = BINA Temporary files cleaning = ALL Output PRINting level = 2 Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb. Blocpdb> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.xyzm Blocpdb> Coordinate file 260210202843550410.atom to be opened. Openam> file on opening on unit 11: 260210202843550410.atom Blocpdb> Coordinate file in PDB format. Blocpdb> 10509 atoms picked in pdb file. Blocpdb> All masses set to unity. Blocpdb> Coordinate file is rewritten. Blocpdb> Substructuring: Blocpdb> 4 residue(s) per block. Blocpdb> 601 residues. Blocpdb> 65 atoms in block 1 Block first atom: 1 Blocpdb> 64 atoms in block 2 Block first atom: 66 Blocpdb> 72 atoms in block 3 Block first atom: 130 Blocpdb> 75 atoms in block 4 Block first atom: 202 Blocpdb> 62 atoms in block 5 Block first atom: 277 Blocpdb> 58 atoms in block 6 Block first atom: 339 Blocpdb> 82 atoms in block 7 Block first atom: 397 Blocpdb> 46 atoms in block 8 Block first atom: 479 Blocpdb> 65 atoms in block 9 Block first atom: 525 Blocpdb> 64 atoms in block 10 Block first atom: 590 Blocpdb> 72 atoms in block 11 Block first atom: 654 Blocpdb> 75 atoms in block 12 Block first atom: 726 Blocpdb> 62 atoms in block 13 Block first atom: 801 Blocpdb> 58 atoms in block 14 Block first atom: 863 Blocpdb> 82 atoms in block 15 Block first atom: 921 Blocpdb> 46 atoms in block 16 Block first atom: 1003 Blocpdb> 65 atoms in block 17 Block first atom: 1049 Blocpdb> 64 atoms in block 18 Block first atom: 1114 Blocpdb> 72 atoms in block 19 Block first atom: 1178 Blocpdb> 75 atoms in block 20 Block first atom: 1250 Blocpdb> 62 atoms in block 21 Block first atom: 1325 Blocpdb> 58 atoms in block 22 Block first atom: 1387 Blocpdb> 82 atoms in block 23 Block first atom: 1445 Blocpdb> 46 atoms in block 24 Block first atom: 1527 Blocpdb> 65 atoms in block 25 Block first atom: 1573 Blocpdb> 64 atoms in block 26 Block first atom: 1638 Blocpdb> 72 atoms in block 27 Block first atom: 1702 Blocpdb> 75 atoms in block 28 Block first atom: 1774 Blocpdb> 62 atoms in block 29 Block first atom: 1849 Blocpdb> 58 atoms in block 30 Block first atom: 1911 Blocpdb> 82 atoms in block 31 Block first atom: 1969 Blocpdb> 46 atoms in block 32 Block first atom: 2051 Blocpdb> 65 atoms in block 33 Block first atom: 2097 Blocpdb> 64 atoms in block 34 Block first atom: 2162 Blocpdb> 72 atoms in block 35 Block first atom: 2226 Blocpdb> 75 atoms in block 36 Block first atom: 2298 Blocpdb> 62 atoms in block 37 Block first atom: 2373 Blocpdb> 58 atoms in block 38 Block first atom: 2435 Blocpdb> 82 atoms in block 39 Block first atom: 2493 Blocpdb> 46 atoms in block 40 Block first atom: 2575 Blocpdb> 65 atoms in block 41 Block first atom: 2621 Blocpdb> 64 atoms in block 42 Block first atom: 2686 Blocpdb> 72 atoms in block 43 Block first atom: 2750 Blocpdb> 75 atoms in block 44 Block first atom: 2822 Blocpdb> 62 atoms in block 45 Block first atom: 2897 Blocpdb> 58 atoms in block 46 Block first atom: 2959 Blocpdb> 82 atoms in block 47 Block first atom: 3017 Blocpdb> 46 atoms in block 48 Block first atom: 3099 Blocpdb> 65 atoms in block 49 Block first atom: 3145 Blocpdb> 64 atoms in block 50 Block first atom: 3210 Blocpdb> 72 atoms in block 51 Block first atom: 3274 Blocpdb> 75 atoms in block 52 Block first atom: 3346 Blocpdb> 62 atoms in block 53 Block first atom: 3421 Blocpdb> 58 atoms in block 54 Block first atom: 3483 Blocpdb> 82 atoms in block 55 Block first atom: 3541 Blocpdb> 46 atoms in block 56 Block first atom: 3623 Blocpdb> 65 atoms in block 57 Block first atom: 3669 Blocpdb> 64 atoms in block 58 Block first atom: 3734 Blocpdb> 72 atoms in block 59 Block first atom: 3798 Blocpdb> 75 atoms in block 60 Block first atom: 3870 Blocpdb> 62 atoms in block 61 Block first atom: 3945 Blocpdb> 58 atoms in block 62 Block first atom: 4007 Blocpdb> 82 atoms in block 63 Block first atom: 4065 Blocpdb> 46 atoms in block 64 Block first atom: 4147 Blocpdb> 65 atoms in block 65 Block first atom: 4193 Blocpdb> 64 atoms in block 66 Block first atom: 4258 Blocpdb> 72 atoms in block 67 Block first atom: 4322 Blocpdb> 75 atoms in block 68 Block first atom: 4394 Blocpdb> 62 atoms in block 69 Block first atom: 4469 Blocpdb> 58 atoms in block 70 Block first atom: 4531 Blocpdb> 82 atoms in block 71 Block first atom: 4589 Blocpdb> 46 atoms in block 72 Block first atom: 4671 Blocpdb> 65 atoms in block 73 Block first atom: 4717 Blocpdb> 64 atoms in block 74 Block first atom: 4782 Blocpdb> 72 atoms in block 75 Block first atom: 4846 Blocpdb> 75 atoms in block 76 Block first atom: 4918 Blocpdb> 62 atoms in block 77 Block first atom: 4993 Blocpdb> 58 atoms in block 78 Block first atom: 5055 Blocpdb> 82 atoms in block 79 Block first atom: 5113 Blocpdb> 46 atoms in block 80 Block first atom: 5195 Blocpdb> 65 atoms in block 81 Block first atom: 5241 Blocpdb> 64 atoms in block 82 Block first atom: 5306 Blocpdb> 72 atoms in block 83 Block first atom: 5370 Blocpdb> 75 atoms in block 84 Block first atom: 5442 Blocpdb> 62 atoms in block 85 Block first atom: 5517 Blocpdb> 58 atoms in block 86 Block first atom: 5579 Blocpdb> 82 atoms in block 87 Block first atom: 5637 Blocpdb> 46 atoms in block 88 Block first atom: 5719 Blocpdb> 65 atoms in block 89 Block first atom: 5765 Blocpdb> 64 atoms in block 90 Block first atom: 5830 Blocpdb> 72 atoms in block 91 Block first atom: 5894 Blocpdb> 75 atoms in block 92 Block first atom: 5966 Blocpdb> 62 atoms in block 93 Block first atom: 6041 Blocpdb> 58 atoms in block 94 Block first atom: 6103 Blocpdb> 82 atoms in block 95 Block first atom: 6161 Blocpdb> 46 atoms in block 96 Block first atom: 6243 Blocpdb> 65 atoms in block 97 Block first atom: 6289 Blocpdb> 64 atoms in block 98 Block first atom: 6354 Blocpdb> 72 atoms in block 99 Block first atom: 6418 Blocpdb> 75 atoms in block 100 Block first atom: 6490 Blocpdb> 62 atoms in block 101 Block first atom: 6565 Blocpdb> 58 atoms in block 102 Block first atom: 6627 Blocpdb> 82 atoms in block 103 Block first atom: 6685 Blocpdb> 46 atoms in block 104 Block first atom: 6767 Blocpdb> 65 atoms in block 105 Block first atom: 6813 Blocpdb> 64 atoms in block 106 Block first atom: 6878 Blocpdb> 72 atoms in block 107 Block first atom: 6942 Blocpdb> 75 atoms in block 108 Block first atom: 7014 Blocpdb> 62 atoms in block 109 Block first atom: 7089 Blocpdb> 58 atoms in block 110 Block first atom: 7151 Blocpdb> 82 atoms in block 111 Block first atom: 7209 Blocpdb> 46 atoms in block 112 Block first atom: 7291 Blocpdb> 65 atoms in block 113 Block first atom: 7337 Blocpdb> 64 atoms in block 114 Block first atom: 7402 Blocpdb> 72 atoms in block 115 Block first atom: 7466 Blocpdb> 75 atoms in block 116 Block first atom: 7538 Blocpdb> 62 atoms in block 117 Block first atom: 7613 Blocpdb> 58 atoms in block 118 Block first atom: 7675 Blocpdb> 82 atoms in block 119 Block first atom: 7733 Blocpdb> 46 atoms in block 120 Block first atom: 7815 Blocpdb> 65 atoms in block 121 Block first atom: 7861 Blocpdb> 64 atoms in block 122 Block first atom: 7926 Blocpdb> 72 atoms in block 123 Block first atom: 7990 Blocpdb> 75 atoms in block 124 Block first atom: 8062 Blocpdb> 62 atoms in block 125 Block first atom: 8137 Blocpdb> 58 atoms in block 126 Block first atom: 8199 Blocpdb> 82 atoms in block 127 Block first atom: 8257 Blocpdb> 46 atoms in block 128 Block first atom: 8339 Blocpdb> 65 atoms in block 129 Block first atom: 8385 Blocpdb> 64 atoms in block 130 Block first atom: 8450 Blocpdb> 72 atoms in block 131 Block first atom: 8514 Blocpdb> 75 atoms in block 132 Block first atom: 8586 Blocpdb> 62 atoms in block 133 Block first atom: 8661 Blocpdb> 58 atoms in block 134 Block first atom: 8723 Blocpdb> 82 atoms in block 135 Block first atom: 8781 Blocpdb> 46 atoms in block 136 Block first atom: 8863 Blocpdb> 65 atoms in block 137 Block first atom: 8909 Blocpdb> 64 atoms in block 138 Block first atom: 8974 Blocpdb> 72 atoms in block 139 Block first atom: 9038 Blocpdb> 75 atoms in block 140 Block first atom: 9110 Blocpdb> 62 atoms in block 141 Block first atom: 9185 Blocpdb> 58 atoms in block 142 Block first atom: 9247 Blocpdb> 82 atoms in block 143 Block first atom: 9305 Blocpdb> 46 atoms in block 144 Block first atom: 9387 Blocpdb> 65 atoms in block 145 Block first atom: 9433 Blocpdb> 64 atoms in block 146 Block first atom: 9498 Blocpdb> 72 atoms in block 147 Block first atom: 9562 Blocpdb> 75 atoms in block 148 Block first atom: 9634 Blocpdb> 62 atoms in block 149 Block first atom: 9709 Blocpdb> 58 atoms in block 150 Block first atom: 9771 Blocpdb> 82 atoms in block 151 Block first atom: 9829 Blocpdb> 46 atoms in block 152 Block first atom: 9911 Blocpdb> 65 atoms in block 153 Block first atom: 9957 Blocpdb> 64 atoms in block 154 Block first atom: 10022 Blocpdb> 72 atoms in block 155 Block first atom: 10086 Blocpdb> 75 atoms in block 156 Block first atom: 10158 Blocpdb> 62 atoms in block 157 Block first atom: 10233 Blocpdb> 58 atoms in block 158 Block first atom: 10295 Blocpdb> 82 atoms in block 159 Block first atom: 10353 Blocpdb> 46 atoms in block 160 Block first atom: 10435 Blocpdb> 29 atoms in block 161 Block first atom: 10480 Blocpdb> 161 blocks. Blocpdb> At most, 82 atoms in each of them. Blocpdb> At least, 29 atoms in each of them. Blocpdb> Normal end of Blocpdb. Diagrtb> Memory allocation for Prepmat. Diagrtb> Memory allocation for RTB. Diagrtb> Memory allocation for Diagstd. Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes. Prepmat> Entering in. Prepmat> Rewriting of the matrix begins. Prepmat> 98200876 matrix lines read. Prepmat> Matrix order = 31527 Prepmat> Matrix trace = 218123520.0000 Prepmat> Last element read: 31527 31527 1789.4369 Prepmat> 13042 lines saved. Prepmat> 6087 empty lines. Prepmat> Number of lines on output is as expected. Prepmat> Normal end of Prepmat. RTB> Entering in. RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 10509 RTB> Total mass = 10509.0000 RTB> Number of atoms found in matrix: 10509 RTB> Number of blocks = 161 RTB> Projection begins. RTB> Projected matrix is being saved. RTB> Projected matrix trace = 5752083.9629 RTB> 247929 non-zero elements. RTB> Normal end of RTB. Diagstd> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.sdijb Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb Diagstd> CERFACS matrix format. Diagstd> Projected matrix order = 966 Diagstd> Nb of non-zero elements: 247929 Diagstd> Projected matrix trace = 5752083.9629 Openam> file on opening on unit 11: diagrtb_work.eigenfacs Diagstd> Diagonalization. Diagstd> 966 eigenvectors are computed. Diagstd> 106 of them to be saved. Diagstd> Sum of eigenvalues =5752083.9629 Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000 Diagstd> Selected eigenvalues: 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 39.8521212 57.2301790 100.5717432 239.4651198 293.4784907 409.8856095 430.0147466 708.2632898 713.9495549 787.4821481 901.1603053 1018.1172534 1061.6698476 1111.6389912 1184.5408228 1208.9435557 1240.1224503 1265.8955965 1312.5327377 1339.6381316 1364.9105815 1394.5347115 1415.1602318 1435.1377584 1459.5243169 1477.5746683 1517.5624435 1532.3542322 1550.6896034 1556.8523686 1594.9729965 1645.3149230 1655.4995722 1693.4394700 1704.2258464 1741.8576641 1798.8630112 1829.1992547 1877.6488830 1916.9347797 1941.7129843 1961.3685042 1993.3768434 2011.9228494 2019.1765389 2048.8568427 2066.5800527 2072.4807355 2088.6402762 2107.0582870 2122.4580240 2163.8104757 2182.2419108 2186.5342824 2198.6321304 2208.4550190 2211.8618094 2221.0707061 2231.1852220 2241.0539699 2246.0818183 2252.5948944 2300.8614016 2308.0105738 2337.5184313 2343.7856061 2395.0914292 2401.2127671 2412.6507394 2429.8060360 2464.5381674 2479.8624826 2498.3728245 2528.6081197 2557.0391957 2561.1769253 2573.2544851 2583.4401183 2590.8545912 2629.1479909 2638.5236559 2652.2046995 2696.9883261 2706.4387460 2724.7925230 2735.5986369 2751.4149527 2774.0551823 2802.1560218 2865.5534731 2895.3700207 2899.5350925 2910.8764896 2912.0786819 2920.5725416 2955.2865726 2975.3469050 2983.9481374 2999.2383845 3004.7898351 Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units): 0.0034257 0.0034328 0.0034359 0.0034380 0.0034402 0.0034582 685.5213763 821.5005009 1089.0135139 1680.4144678 1860.3018534 2198.5007384 2251.8370213 2889.9654215 2901.5432192 3047.3029979 3259.8401691 3464.9277154 3538.2622737 3620.5718129 3737.4061548 3775.7070649 3824.0852476 3863.6183925 3934.1449091 3974.5597548 4011.8748852 4055.1782107 4085.0566932 4113.7895980 4148.5941234 4174.1687146 4230.2746552 4250.8410546 4276.1971316 4284.6859572 4336.8254973 4404.7351357 4418.3469594 4468.6888806 4482.8979653 4532.1222091 4605.6860026 4644.3590604 4705.4641816 4754.4353771 4785.0645160 4809.2225943 4848.3055786 4870.8072270 4879.5798136 4915.3119729 4936.5256375 4943.5682169 4962.8037817 4984.6372089 5002.8195145 5051.3200924 5072.7881588 5077.7746810 5091.8026816 5103.1643982 5107.0989841 5117.7194253 5129.3589596 5140.6902688 5146.4536576 5153.9099710 5208.8339091 5216.9200042 5250.1631843 5257.1966402 5314.4255648 5321.2124946 5333.8710091 5352.8008219 5390.9220776 5407.6562814 5427.8008404 5460.5456779 5491.1584145 5495.5994384 5508.5418022 5519.4331800 5527.3478916 5568.0457699 5577.9648910 5592.4073831 5639.4248484 5649.2966611 5668.4197131 5679.6486375 5696.0438875 5719.4310430 5748.3266185 5812.9895043 5843.1537896 5847.3550503 5858.7797186 5859.9894320 5868.5293259 5903.3030767 5923.3048493 5931.8603146 5947.0388152 5952.5401166 Diagstd> Normal end. Rtb_to_modes> Entering in. Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 10509 Rtb_to_modes> Number of blocs = 161 Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.eigenfacs Openam> file on opening on unit 11: matrix.eigenrtb Rdmodfacs> Entering in. Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Eigenvector number: 1 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9522E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 2 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9932E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 3 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0012E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 4 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0024E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 5 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0036E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 6 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0142E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 7 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.85 Rdmodfacs> Eigenvector number: 8 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 57.23 Rdmodfacs> Eigenvector number: 9 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 100.6 Rdmodfacs> Eigenvector number: 10 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 239.5 Rdmodfacs> Eigenvector number: 11 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 293.5 Rdmodfacs> Eigenvector number: 12 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 409.9 Rdmodfacs> Eigenvector number: 13 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 430.0 Rdmodfacs> Eigenvector number: 14 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 708.3 Rdmodfacs> Eigenvector number: 15 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 713.9 Rdmodfacs> Eigenvector number: 16 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 787.5 Rdmodfacs> Eigenvector number: 17 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 901.2 Rdmodfacs> Eigenvector number: 18 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1018. Rdmodfacs> Eigenvector number: 19 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1062. Rdmodfacs> Eigenvector number: 20 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1112. Rdmodfacs> Eigenvector number: 21 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1185. Rdmodfacs> Eigenvector number: 22 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1209. Rdmodfacs> Eigenvector number: 23 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1240. Rdmodfacs> Eigenvector number: 24 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1266. Rdmodfacs> Eigenvector number: 25 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1313. Rdmodfacs> Eigenvector number: 26 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1340. Rdmodfacs> Eigenvector number: 27 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1365. Rdmodfacs> Eigenvector number: 28 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1395. Rdmodfacs> Eigenvector number: 29 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1415. Rdmodfacs> Eigenvector number: 30 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1435. Rdmodfacs> Eigenvector number: 31 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1460. Rdmodfacs> Eigenvector number: 32 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1478. Rdmodfacs> Eigenvector number: 33 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1518. Rdmodfacs> Eigenvector number: 34 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1532. Rdmodfacs> Eigenvector number: 35 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1551. Rdmodfacs> Eigenvector number: 36 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1557. Rdmodfacs> Eigenvector number: 37 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1595. Rdmodfacs> Eigenvector number: 38 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1645. Rdmodfacs> Eigenvector number: 39 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1655. Rdmodfacs> Eigenvector number: 40 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1693. Rdmodfacs> Eigenvector number: 41 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1704. Rdmodfacs> Eigenvector number: 42 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1742. Rdmodfacs> Eigenvector number: 43 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1799. Rdmodfacs> Eigenvector number: 44 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1829. Rdmodfacs> Eigenvector number: 45 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1878. Rdmodfacs> Eigenvector number: 46 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1917. Rdmodfacs> Eigenvector number: 47 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1942. Rdmodfacs> Eigenvector number: 48 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1961. Rdmodfacs> Eigenvector number: 49 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1993. Rdmodfacs> Eigenvector number: 50 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2012. Rdmodfacs> Eigenvector number: 51 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2019. Rdmodfacs> Eigenvector number: 52 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2049. Rdmodfacs> Eigenvector number: 53 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2067. Rdmodfacs> Eigenvector number: 54 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2072. Rdmodfacs> Eigenvector number: 55 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2089. Rdmodfacs> Eigenvector number: 56 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2107. Rdmodfacs> Eigenvector number: 57 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2122. Rdmodfacs> Eigenvector number: 58 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2164. Rdmodfacs> Eigenvector number: 59 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2182. Rdmodfacs> Eigenvector number: 60 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2187. Rdmodfacs> Eigenvector number: 61 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2199. Rdmodfacs> Eigenvector number: 62 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2208. Rdmodfacs> Eigenvector number: 63 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2212. Rdmodfacs> Eigenvector number: 64 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2221. Rdmodfacs> Eigenvector number: 65 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2231. Rdmodfacs> Eigenvector number: 66 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2241. Rdmodfacs> Eigenvector number: 67 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2246. Rdmodfacs> Eigenvector number: 68 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2253. Rdmodfacs> Eigenvector number: 69 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2301. Rdmodfacs> Eigenvector number: 70 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2308. Rdmodfacs> Eigenvector number: 71 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2338. Rdmodfacs> Eigenvector number: 72 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2344. Rdmodfacs> Eigenvector number: 73 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2395. Rdmodfacs> Eigenvector number: 74 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2401. Rdmodfacs> Eigenvector number: 75 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2413. Rdmodfacs> Eigenvector number: 76 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2430. Rdmodfacs> Eigenvector number: 77 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2465. Rdmodfacs> Eigenvector number: 78 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2480. Rdmodfacs> Eigenvector number: 79 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2498. Rdmodfacs> Eigenvector number: 80 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2529. Rdmodfacs> Eigenvector number: 81 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2557. Rdmodfacs> Eigenvector number: 82 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2561. Rdmodfacs> Eigenvector number: 83 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2573. Rdmodfacs> Eigenvector number: 84 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2583. Rdmodfacs> Eigenvector number: 85 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2591. Rdmodfacs> Eigenvector number: 86 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2629. Rdmodfacs> Eigenvector number: 87 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2639. Rdmodfacs> Eigenvector number: 88 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2652. Rdmodfacs> Eigenvector number: 89 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2697. Rdmodfacs> Eigenvector number: 90 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2706. Rdmodfacs> Eigenvector number: 91 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2725. Rdmodfacs> Eigenvector number: 92 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2736. Rdmodfacs> Eigenvector number: 93 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2751. Rdmodfacs> Eigenvector number: 94 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2774. Rdmodfacs> Eigenvector number: 95 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2802. Rdmodfacs> Eigenvector number: 96 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2866. Rdmodfacs> Eigenvector number: 97 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2895. Rdmodfacs> Eigenvector number: 98 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2900. Rdmodfacs> Eigenvector number: 99 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2911. Rdmodfacs> Eigenvector number: 100 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2912. Rdmodfacs> Eigenvector number: 101 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2921. Rdmodfacs> Eigenvector number: 102 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2955. Rdmodfacs> Eigenvector number: 103 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2975. Rdmodfacs> Eigenvector number: 104 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2984. Rdmodfacs> Eigenvector number: 105 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2999. Rdmodfacs> Eigenvector number: 106 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3005. Rtb_to_modes> 106 vectors, with 966 coordinates in vector file. Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected): 1.00002 0.99999 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 0.99999 1.00002 1.00000 1.00000 1.00005 0.99999 1.00000 0.99996 0.99999 1.00004 1.00001 1.00000 1.00007 1.00000 1.00000 0.99997 0.99998 0.99999 1.00002 0.99996 0.99995 0.99999 1.00002 1.00002 1.00001 0.99999 0.99995 0.99999 0.99998 0.99999 0.99998 1.00001 0.99997 0.99999 0.99999 1.00003 0.99999 1.00000 0.99999 0.99999 1.00000 1.00000 1.00007 0.99998 0.99998 1.00001 0.99997 1.00001 0.99996 0.99999 1.00002 1.00001 1.00001 1.00003 1.00000 1.00001 0.99995 0.99998 1.00002 1.00001 1.00002 1.00001 1.00004 0.99995 1.00002 0.99998 1.00001 1.00001 1.00002 1.00002 1.00003 1.00005 0.99996 1.00003 1.00001 0.99995 0.99999 1.00001 0.99998 0.99997 0.99999 1.00000 1.00000 0.99998 1.00004 1.00002 0.99998 1.00002 1.00004 1.00002 0.99997 1.00002 0.99997 1.00002 Rtb_to_modes> RTB block-file is being read. Rtb_to_modes> 189162 lines found in RTB file. Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected): 1.00002 0.99999 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 0.99999 1.00002 1.00000 1.00000 1.00005 0.99999 1.00000 0.99996 0.99999 1.00004 1.00001 1.00000 1.00007 1.00000 1.00000 0.99997 0.99998 0.99999 1.00002 0.99996 0.99995 0.99999 1.00002 1.00002 1.00001 0.99999 0.99995 0.99999 0.99998 0.99999 0.99998 1.00001 0.99997 0.99999 0.99999 1.00003 0.99999 1.00000 0.99999 0.99999 1.00000 1.00000 1.00007 0.99998 0.99998 1.00001 0.99997 1.00001 0.99996 0.99999 1.00002 1.00001 1.00001 1.00003 1.00000 1.00001 0.99995 0.99998 1.00002 1.00001 1.00002 1.00001 1.00004 0.99995 1.00002 0.99998 1.00001 1.00001 1.00002 1.00002 1.00003 1.00005 0.99996 1.00003 1.00001 0.99995 0.99999 1.00001 0.99998 0.99997 0.99999 1.00000 1.00000 0.99998 1.00004 1.00002 0.99998 1.00002 1.00004 1.00002 0.99997 1.00002 0.99997 1.00002 Orthogonality of first eigenvectors (zero expected): Vector 2:-0.000 Vector 3:-0.000-0.000 Vector 4:-0.000-0.000 0.000 Vector 5:-0.000-0.000 0.000 0.000 Vector 6:-0.000 0.000 0.000 0.000-0.000 Vector 7: 0.000-0.000 0.000-0.000-0.000-0.000 Vector 8:-0.000 0.000-0.000 0.000 0.000 0.000-0.000 Vector 9:-0.000 0.000-0.000-0.000-0.000 0.000 0.000-0.000 Vector 10: 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000-0.000-0.000 Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved. Rtb_to_modes> Normal end. Diagrtb> Normal end. B-factor analysis Bfactors> Version 1.22, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 260210202843550410.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 260210202843550410.eigenfacs Getnam> Corresponding pdb filename ? Getnam> 260210202843550410.atom Openam> file on opening on unit 11: 260210202843550410.atom Getnum> Number of skipped eigenvectors ? Getnum> 0 Getnum> Number of usefull eigenvectors ? Getnum> 10000 %Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 601 First residue number = 953 Last residue number = 1 Number of atoms found = 10509 Mean number per residue = 17.5 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9522E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9932E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0012E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0024E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0036E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0142E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.85 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 57.23 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 100.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 239.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 293.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 409.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 430.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 708.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 713.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 787.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 901.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1018. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1062. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1112. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1185. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1209. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1240. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1266. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1313. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1340. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1365. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1395. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1415. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1435. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1460. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1478. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1518. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1532. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1551. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1557. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1595. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1645. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1655. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1693. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1704. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1742. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1799. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1829. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1878. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1917. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1942. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1961. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1993. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2012. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2019. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2049. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2067. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2072. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2089. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2107. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2122. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2164. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2182. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2187. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2199. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2208. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2212. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2221. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2231. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2241. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2246. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2253. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2301. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2308. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2338. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2344. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2395. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2401. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2413. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2430. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2465. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2480. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2498. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2529. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2557. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2561. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2573. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2583. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2591. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2629. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2639. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2652. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2697. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2706. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2725. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2736. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2751. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2774. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2802. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2866. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2895. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2900. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2911. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2912. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2921. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2955. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2975. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2984. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2999. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3005. Bfactors> 106 vectors, 31527 coordinates in file. Openam> file on opening on unit 12: bfactors.pred Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000 Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 39.850000 Bfactors> 100 eigenvectors will be considered. Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped. Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed. (CHARMM units assumed for eigenvalues) %Bfactors-Wn> Experimental B-factors are nearly constant ! Bfactors> = 0.000 +/- 0.00 Bfactors> = 0.000 +/- 0.00 Bfactors> Shiftng-fct= -0.000 Bfactors> Scaling-fct= 0.000 Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved. Bfactors> Normal end. check_modes Chkmod> Version 1.00, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 260210202843550410.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 260210202843550410.eigenfacs Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4256E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4326E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4359E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4379E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4400E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4581E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 685.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 821.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1089. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1680. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1860. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 2198. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 2252. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 2890. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 2901. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3047. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3260. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3465. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3539. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3621. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3738. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3776. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3824. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3864. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3935. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3975. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 4012. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 4056. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 4085. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 4113. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 4149. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 4175. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 4231. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 4250. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 4276. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 4285. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 4337. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 4404. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 4417. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 4468. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 4482. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 4532. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 4606. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 4644. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 4706. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 4754. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 4785. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 4809. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 4848. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 4871. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 4879. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 4915. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 4937. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 4943. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 4963. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 4984. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 5002. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 5051. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 5072. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 5078. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 5092. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 5102. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 5107. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 5117. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 5129. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 5140. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 5146. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 5154. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 5209. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 5217. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 5250. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 5257. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 5314. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 5321. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 5334. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 5353. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 5391. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 5408. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 5427. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 5461. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 5491. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 5495. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 5508. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 5519. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 5527. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 5568. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 5578. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 5592. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 5639. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 5649. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 5668. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 5680. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 5695. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 5719. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 5748. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 5813. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 5843. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 5848. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 5859. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 5860. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 5869. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 5903. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 5923. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 5932. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 5947. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 5952. Chkmod> 106 vectors, 31527 coordinates in file. Chkmod> That is: 10509 cartesian points. Openam> file on opening on unit 11: Chkmod.res Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file. %Chkmod-Wn> Norm of vector 20 is: 0.9999 (instead of 1.0000). %Chkmod-Wn> Norm of vector 25 is: 1.0001 (instead of 1.0000). %Chkmod-Wn> Norm of vector 39 is: 0.9998 (instead of 1.0000). %Chkmod-Wn> Norm of vector 55 is: 1.0001 (instead of 1.0000). %Chkmod-Wn> Norm of vector 76 is: 0.9999 (instead of 1.0000). Chkmod> Normal end. 0.0034 0.6113 0.0034 0.7003 0.0034 0.8162 0.0034 0.8855 0.0034 0.7439 0.0035 0.9592 685.4737 0.6546 821.4640 0.5844 1089.1197 0.5605 1680.4647 0.6237 1860.2902 0.6454 2198.4450 0.5089 2251.7017 0.5946 2889.9163 0.0700 2901.3180 0.5392 3047.2067 0.3832 3259.7720 0.0308 3464.5795 0.6356 3538.6605 0.0075 3621.0042 0.0063 3737.9700 0.0586 3775.6331 0.0290 3823.7323 0.2355 3863.6119 0.0080 3934.6762 0.0090 3974.9259 0.0486 4011.8341 0.0081 4055.6806 0.0330 4084.6501 0.0301 4113.4156 0.0143 4149.0920 0.1234 4174.5902 0.0391 4230.7028 0.0189 4250.1672 0.0124 4276.4415 0.0184 4284.7052 0.0243 4336.6760 0.0119 4404.1245 0.0196 4417.4906 0.0103 4467.9172 0.0183 4482.4085 0.0166 4532.1128 0.0180 4605.6636 0.0922 4643.9067 0.0500 4705.7021 0.2376 4754.3122 0.0170 4785.2127 0.0086 4808.5644 0.0163 4847.6392 0.0173 4870.6915 0.0549 4879.1570 0.0298 4915.2727 0.0455 4936.8153 0.1114 4942.7826 0.0369 4963.0181 0.0202 4984.3543 0.0592 5002.0649 0.0477 5051.3245 0.0655 5072.2892 0.0463 5078.0974 0.0193 5092.0100 0.0371 5102.4196 0.0277 5107.0393 0.0111 5117.4183 0.0202 5128.9259 0.0337 5140.4077 0.0866 5146.1390 0.0429 5154.1521 0.0202 5208.7672 0.0228 5216.6841 0.0233 5250.4786 0.0090 5257.2114 0.1758 5314.0960 0.0074 5320.7483 0.0121 5334.0281 0.0551 5352.7847 0.0309 5391.1957 0.0166 5407.5741 0.0572 5427.1629 0.0182 5460.7344 0.1137 5490.8806 0.0849 5495.1737 0.0342 5508.0330 0.0348 5518.7261 0.0195 5527.2657 0.0367 5567.6500 0.0477 5578.2289 0.0235 5591.9515 0.0284 5639.1950 0.0203 5648.5962 0.0361 5668.3922 0.0249 5679.8214 0.0393 5695.3699 0.0486 5719.1286 0.0368 5747.9198 0.0304 5813.1928 0.0152 5842.5296 0.0266 5847.5728 0.0089 5858.6525 0.0115 5859.6587 0.0353 5868.7068 0.0490 5902.7634 0.0278 5922.7053 0.0836 5931.6572 0.0447 5946.5472 0.0426 5952.4927 0.0204 getting mode 7 running: ../../bin/get_modes.sh 260210202843550410 7 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 7 calculating perturbed structure for DQ=-100 260210202843550410.eigenfacs 260210202843550410.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 260210202843550410.eigenfacs 260210202843550410.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 260210202843550410.eigenfacs 260210202843550410.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 260210202843550410.eigenfacs 260210202843550410.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 260210202843550410.eigenfacs 260210202843550410.atom calculating perturbed structure for DQ=0 260210202843550410.eigenfacs 260210202843550410.atom calculating perturbed structure for DQ=20 260210202843550410.eigenfacs 260210202843550410.atom calculating perturbed structure for DQ=40 260210202843550410.eigenfacs 260210202843550410.atom calculating perturbed structure for DQ=60 260210202843550410.eigenfacs 260210202843550410.atom calculating perturbed structure for DQ=80 260210202843550410.eigenfacs 260210202843550410.atom calculating perturbed structure for DQ=100 260210202843550410.eigenfacs 260210202843550410.atom making animated gifs 11 models are in 260210202843550410.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 260210202843550410.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 260210202843550410.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 8 running: ../../bin/get_modes.sh 260210202843550410 8 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 8 calculating perturbed structure for DQ=-100 260210202843550410.eigenfacs 260210202843550410.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 260210202843550410.eigenfacs 260210202843550410.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 260210202843550410.eigenfacs 260210202843550410.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 260210202843550410.eigenfacs 260210202843550410.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 260210202843550410.eigenfacs 260210202843550410.atom calculating perturbed structure for DQ=0 260210202843550410.eigenfacs 260210202843550410.atom calculating perturbed structure for DQ=20 260210202843550410.eigenfacs 260210202843550410.atom calculating perturbed structure for DQ=40 260210202843550410.eigenfacs 260210202843550410.atom calculating perturbed structure for DQ=60 260210202843550410.eigenfacs 260210202843550410.atom calculating perturbed structure for DQ=80 260210202843550410.eigenfacs 260210202843550410.atom calculating perturbed structure for DQ=100 260210202843550410.eigenfacs 260210202843550410.atom making animated gifs 11 models are in 260210202843550410.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 260210202843550410.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 260210202843550410.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 9 running: ../../bin/get_modes.sh 260210202843550410 9 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 9 calculating perturbed structure for DQ=-100 260210202843550410.eigenfacs 260210202843550410.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 260210202843550410.eigenfacs 260210202843550410.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 260210202843550410.eigenfacs 260210202843550410.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 260210202843550410.eigenfacs 260210202843550410.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 260210202843550410.eigenfacs 260210202843550410.atom calculating perturbed structure for DQ=0 260210202843550410.eigenfacs 260210202843550410.atom calculating perturbed structure for DQ=20 260210202843550410.eigenfacs 260210202843550410.atom calculating perturbed structure for DQ=40 260210202843550410.eigenfacs 260210202843550410.atom calculating perturbed structure for DQ=60 260210202843550410.eigenfacs 260210202843550410.atom calculating perturbed structure for DQ=80 260210202843550410.eigenfacs 260210202843550410.atom calculating perturbed structure for DQ=100 260210202843550410.eigenfacs 260210202843550410.atom making animated gifs 11 models are in 260210202843550410.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 260210202843550410.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 260210202843550410.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 10 running: ../../bin/get_modes.sh 260210202843550410 10 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 10 calculating perturbed structure for DQ=-100 260210202843550410.eigenfacs 260210202843550410.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 260210202843550410.eigenfacs 260210202843550410.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 260210202843550410.eigenfacs 260210202843550410.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 260210202843550410.eigenfacs 260210202843550410.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 260210202843550410.eigenfacs 260210202843550410.atom calculating perturbed structure for DQ=0 260210202843550410.eigenfacs 260210202843550410.atom calculating perturbed structure for DQ=20 260210202843550410.eigenfacs 260210202843550410.atom calculating perturbed structure for DQ=40 260210202843550410.eigenfacs 260210202843550410.atom calculating perturbed structure for DQ=60 260210202843550410.eigenfacs 260210202843550410.atom calculating perturbed structure for DQ=80 260210202843550410.eigenfacs 260210202843550410.atom calculating perturbed structure for DQ=100 260210202843550410.eigenfacs 260210202843550410.atom making animated gifs 11 models are in 260210202843550410.10.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 260210202843550410.10.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 260210202843550410.10.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 11 running: ../../bin/get_modes.sh 260210202843550410 11 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 11 calculating perturbed structure for DQ=-100 260210202843550410.eigenfacs 260210202843550410.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 260210202843550410.eigenfacs 260210202843550410.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 260210202843550410.eigenfacs 260210202843550410.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 260210202843550410.eigenfacs 260210202843550410.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 260210202843550410.eigenfacs 260210202843550410.atom calculating perturbed structure for DQ=0 260210202843550410.eigenfacs 260210202843550410.atom calculating perturbed structure for DQ=20 260210202843550410.eigenfacs 260210202843550410.atom calculating perturbed structure for DQ=40 260210202843550410.eigenfacs 260210202843550410.atom calculating perturbed structure for DQ=60 260210202843550410.eigenfacs 260210202843550410.atom calculating perturbed structure for DQ=80 260210202843550410.eigenfacs 260210202843550410.atom calculating perturbed structure for DQ=100 260210202843550410.eigenfacs 260210202843550410.atom making animated gifs 11 models are in 260210202843550410.11.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 260210202843550410.11.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 260210202843550410.11.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 260210202843550410.10.pdb 260210202843550410.11.pdb 260210202843550410.7.pdb 260210202843550410.8.pdb 260210202843550410.9.pdb STDERR: Note: The following floating-point exceptions are signalling: IEEE_DENORMAL real 1m38.613s user 1m31.707s sys 0m5.321s rm: cannot remove '260210202843550410.sdijf': No such file or directory pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format




If you find results from this site helpful for your research, please cite one of our papers:

elNémo is maintained by Yves-Henri Sanejouand.
It was developed by Karsten Suhre.
Between 2003 and 2014, it was hosted by IGS (Marseille).
Between 2015 and 2025, it was hosted by US2B (Nantes).
Last modification: december 26th, 2025.