***  TRANSFERASE 18-AUG-21 7PHT  ***
Output from eigenvector calculation:
STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8)
Build Tirion matrix:
Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model.
Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004.
Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file.
Pdbmat> Coordinate filename = 260210202843550410.atom
Pdbmat> Distance cutoff = 8.00
Force constant = 10.00
Origin of mass values = CONS
Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09
PRINTing level = 2
Pdbmat> Coordinate file 260210202843550410.atom to be opened.
Openam> File opened: 260210202843550410.atom
Pdbmat> Coordinate file in PDB format.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 601
First residue number = 953
Last residue number = 1
Number of atoms found = 10509
Mean number per residue = 17.5
Pdbmat> Coordinate statistics:
= 22.568353 +/- 8.448879 From: 2.261000 To: 43.479000
= -17.953203 +/- 11.293881 From: -44.623000 To: 3.977000
= -3.555713 +/- 3.128534 From: -12.429000 To: 4.946000
Pdbmat> Masses are all set to one.
%Pdbmat-W> residue:'UNL ' is not a well known amino-acid.
%Pdbmat-W> 1 residue(s) not known.
Openam> File opened: pdbmat.xyzm
Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved.
Openam> File opened: pdbmat.sdijb
Pdbmat> Matrix statistics:
Pdbmat> The matrix is 19.7590 % Filled.
Pdbmat> 98200715 non-zero elements.
Pdbmat> 10906176 atom-atom interactions.
Pdbmat> Number per atom= 2075.59 +/- 615.73
Maximum number = 3203
Minimum number = 143
Pdbmat> Matrix trace = 2.181235E+08
Pdbmat> Larger element = 13504.9
Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10
Pdbmat> Normal end.
automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1)
601 non-zero elements, NRBL set to 4
Diagonalize Tirion matrix using diagrtb
Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation.
Diagrtb> Version 2.52, November 2004.
Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file.
Diagrtb> Options taken into account:
MATRix filename = pdbmat.sdijb
COORdinates filename = 260210202843550410.atom
Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb
Nb of VECTors required = 106
EigeNVALues chosen = LOWE
Type of SUBStructuring = NONE
Nb of residues per BLOck = 4
Origin of MASS values = CONS
MATRix FORMat = BINA
Temporary files cleaning = ALL
Output PRINting level = 2
Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb.
Blocpdb> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.xyzm
Blocpdb> Coordinate file 260210202843550410.atom to be opened.
Openam> file on opening on unit 11:
260210202843550410.atom
Blocpdb> Coordinate file in PDB format.
Blocpdb> 10509 atoms picked in pdb file.
Blocpdb> All masses set to unity.
Blocpdb> Coordinate file is rewritten.
Blocpdb> Substructuring:
Blocpdb> 4 residue(s) per block.
Blocpdb> 601 residues.
Blocpdb> 65 atoms in block 1
Block first atom: 1
Blocpdb> 64 atoms in block 2
Block first atom: 66
Blocpdb> 72 atoms in block 3
Block first atom: 130
Blocpdb> 75 atoms in block 4
Block first atom: 202
Blocpdb> 62 atoms in block 5
Block first atom: 277
Blocpdb> 58 atoms in block 6
Block first atom: 339
Blocpdb> 82 atoms in block 7
Block first atom: 397
Blocpdb> 46 atoms in block 8
Block first atom: 479
Blocpdb> 65 atoms in block 9
Block first atom: 525
Blocpdb> 64 atoms in block 10
Block first atom: 590
Blocpdb> 72 atoms in block 11
Block first atom: 654
Blocpdb> 75 atoms in block 12
Block first atom: 726
Blocpdb> 62 atoms in block 13
Block first atom: 801
Blocpdb> 58 atoms in block 14
Block first atom: 863
Blocpdb> 82 atoms in block 15
Block first atom: 921
Blocpdb> 46 atoms in block 16
Block first atom: 1003
Blocpdb> 65 atoms in block 17
Block first atom: 1049
Blocpdb> 64 atoms in block 18
Block first atom: 1114
Blocpdb> 72 atoms in block 19
Block first atom: 1178
Blocpdb> 75 atoms in block 20
Block first atom: 1250
Blocpdb> 62 atoms in block 21
Block first atom: 1325
Blocpdb> 58 atoms in block 22
Block first atom: 1387
Blocpdb> 82 atoms in block 23
Block first atom: 1445
Blocpdb> 46 atoms in block 24
Block first atom: 1527
Blocpdb> 65 atoms in block 25
Block first atom: 1573
Blocpdb> 64 atoms in block 26
Block first atom: 1638
Blocpdb> 72 atoms in block 27
Block first atom: 1702
Blocpdb> 75 atoms in block 28
Block first atom: 1774
Blocpdb> 62 atoms in block 29
Block first atom: 1849
Blocpdb> 58 atoms in block 30
Block first atom: 1911
Blocpdb> 82 atoms in block 31
Block first atom: 1969
Blocpdb> 46 atoms in block 32
Block first atom: 2051
Blocpdb> 65 atoms in block 33
Block first atom: 2097
Blocpdb> 64 atoms in block 34
Block first atom: 2162
Blocpdb> 72 atoms in block 35
Block first atom: 2226
Blocpdb> 75 atoms in block 36
Block first atom: 2298
Blocpdb> 62 atoms in block 37
Block first atom: 2373
Blocpdb> 58 atoms in block 38
Block first atom: 2435
Blocpdb> 82 atoms in block 39
Block first atom: 2493
Blocpdb> 46 atoms in block 40
Block first atom: 2575
Blocpdb> 65 atoms in block 41
Block first atom: 2621
Blocpdb> 64 atoms in block 42
Block first atom: 2686
Blocpdb> 72 atoms in block 43
Block first atom: 2750
Blocpdb> 75 atoms in block 44
Block first atom: 2822
Blocpdb> 62 atoms in block 45
Block first atom: 2897
Blocpdb> 58 atoms in block 46
Block first atom: 2959
Blocpdb> 82 atoms in block 47
Block first atom: 3017
Blocpdb> 46 atoms in block 48
Block first atom: 3099
Blocpdb> 65 atoms in block 49
Block first atom: 3145
Blocpdb> 64 atoms in block 50
Block first atom: 3210
Blocpdb> 72 atoms in block 51
Block first atom: 3274
Blocpdb> 75 atoms in block 52
Block first atom: 3346
Blocpdb> 62 atoms in block 53
Block first atom: 3421
Blocpdb> 58 atoms in block 54
Block first atom: 3483
Blocpdb> 82 atoms in block 55
Block first atom: 3541
Blocpdb> 46 atoms in block 56
Block first atom: 3623
Blocpdb> 65 atoms in block 57
Block first atom: 3669
Blocpdb> 64 atoms in block 58
Block first atom: 3734
Blocpdb> 72 atoms in block 59
Block first atom: 3798
Blocpdb> 75 atoms in block 60
Block first atom: 3870
Blocpdb> 62 atoms in block 61
Block first atom: 3945
Blocpdb> 58 atoms in block 62
Block first atom: 4007
Blocpdb> 82 atoms in block 63
Block first atom: 4065
Blocpdb> 46 atoms in block 64
Block first atom: 4147
Blocpdb> 65 atoms in block 65
Block first atom: 4193
Blocpdb> 64 atoms in block 66
Block first atom: 4258
Blocpdb> 72 atoms in block 67
Block first atom: 4322
Blocpdb> 75 atoms in block 68
Block first atom: 4394
Blocpdb> 62 atoms in block 69
Block first atom: 4469
Blocpdb> 58 atoms in block 70
Block first atom: 4531
Blocpdb> 82 atoms in block 71
Block first atom: 4589
Blocpdb> 46 atoms in block 72
Block first atom: 4671
Blocpdb> 65 atoms in block 73
Block first atom: 4717
Blocpdb> 64 atoms in block 74
Block first atom: 4782
Blocpdb> 72 atoms in block 75
Block first atom: 4846
Blocpdb> 75 atoms in block 76
Block first atom: 4918
Blocpdb> 62 atoms in block 77
Block first atom: 4993
Blocpdb> 58 atoms in block 78
Block first atom: 5055
Blocpdb> 82 atoms in block 79
Block first atom: 5113
Blocpdb> 46 atoms in block 80
Block first atom: 5195
Blocpdb> 65 atoms in block 81
Block first atom: 5241
Blocpdb> 64 atoms in block 82
Block first atom: 5306
Blocpdb> 72 atoms in block 83
Block first atom: 5370
Blocpdb> 75 atoms in block 84
Block first atom: 5442
Blocpdb> 62 atoms in block 85
Block first atom: 5517
Blocpdb> 58 atoms in block 86
Block first atom: 5579
Blocpdb> 82 atoms in block 87
Block first atom: 5637
Blocpdb> 46 atoms in block 88
Block first atom: 5719
Blocpdb> 65 atoms in block 89
Block first atom: 5765
Blocpdb> 64 atoms in block 90
Block first atom: 5830
Blocpdb> 72 atoms in block 91
Block first atom: 5894
Blocpdb> 75 atoms in block 92
Block first atom: 5966
Blocpdb> 62 atoms in block 93
Block first atom: 6041
Blocpdb> 58 atoms in block 94
Block first atom: 6103
Blocpdb> 82 atoms in block 95
Block first atom: 6161
Blocpdb> 46 atoms in block 96
Block first atom: 6243
Blocpdb> 65 atoms in block 97
Block first atom: 6289
Blocpdb> 64 atoms in block 98
Block first atom: 6354
Blocpdb> 72 atoms in block 99
Block first atom: 6418
Blocpdb> 75 atoms in block 100
Block first atom: 6490
Blocpdb> 62 atoms in block 101
Block first atom: 6565
Blocpdb> 58 atoms in block 102
Block first atom: 6627
Blocpdb> 82 atoms in block 103
Block first atom: 6685
Blocpdb> 46 atoms in block 104
Block first atom: 6767
Blocpdb> 65 atoms in block 105
Block first atom: 6813
Blocpdb> 64 atoms in block 106
Block first atom: 6878
Blocpdb> 72 atoms in block 107
Block first atom: 6942
Blocpdb> 75 atoms in block 108
Block first atom: 7014
Blocpdb> 62 atoms in block 109
Block first atom: 7089
Blocpdb> 58 atoms in block 110
Block first atom: 7151
Blocpdb> 82 atoms in block 111
Block first atom: 7209
Blocpdb> 46 atoms in block 112
Block first atom: 7291
Blocpdb> 65 atoms in block 113
Block first atom: 7337
Blocpdb> 64 atoms in block 114
Block first atom: 7402
Blocpdb> 72 atoms in block 115
Block first atom: 7466
Blocpdb> 75 atoms in block 116
Block first atom: 7538
Blocpdb> 62 atoms in block 117
Block first atom: 7613
Blocpdb> 58 atoms in block 118
Block first atom: 7675
Blocpdb> 82 atoms in block 119
Block first atom: 7733
Blocpdb> 46 atoms in block 120
Block first atom: 7815
Blocpdb> 65 atoms in block 121
Block first atom: 7861
Blocpdb> 64 atoms in block 122
Block first atom: 7926
Blocpdb> 72 atoms in block 123
Block first atom: 7990
Blocpdb> 75 atoms in block 124
Block first atom: 8062
Blocpdb> 62 atoms in block 125
Block first atom: 8137
Blocpdb> 58 atoms in block 126
Block first atom: 8199
Blocpdb> 82 atoms in block 127
Block first atom: 8257
Blocpdb> 46 atoms in block 128
Block first atom: 8339
Blocpdb> 65 atoms in block 129
Block first atom: 8385
Blocpdb> 64 atoms in block 130
Block first atom: 8450
Blocpdb> 72 atoms in block 131
Block first atom: 8514
Blocpdb> 75 atoms in block 132
Block first atom: 8586
Blocpdb> 62 atoms in block 133
Block first atom: 8661
Blocpdb> 58 atoms in block 134
Block first atom: 8723
Blocpdb> 82 atoms in block 135
Block first atom: 8781
Blocpdb> 46 atoms in block 136
Block first atom: 8863
Blocpdb> 65 atoms in block 137
Block first atom: 8909
Blocpdb> 64 atoms in block 138
Block first atom: 8974
Blocpdb> 72 atoms in block 139
Block first atom: 9038
Blocpdb> 75 atoms in block 140
Block first atom: 9110
Blocpdb> 62 atoms in block 141
Block first atom: 9185
Blocpdb> 58 atoms in block 142
Block first atom: 9247
Blocpdb> 82 atoms in block 143
Block first atom: 9305
Blocpdb> 46 atoms in block 144
Block first atom: 9387
Blocpdb> 65 atoms in block 145
Block first atom: 9433
Blocpdb> 64 atoms in block 146
Block first atom: 9498
Blocpdb> 72 atoms in block 147
Block first atom: 9562
Blocpdb> 75 atoms in block 148
Block first atom: 9634
Blocpdb> 62 atoms in block 149
Block first atom: 9709
Blocpdb> 58 atoms in block 150
Block first atom: 9771
Blocpdb> 82 atoms in block 151
Block first atom: 9829
Blocpdb> 46 atoms in block 152
Block first atom: 9911
Blocpdb> 65 atoms in block 153
Block first atom: 9957
Blocpdb> 64 atoms in block 154
Block first atom: 10022
Blocpdb> 72 atoms in block 155
Block first atom: 10086
Blocpdb> 75 atoms in block 156
Block first atom: 10158
Blocpdb> 62 atoms in block 157
Block first atom: 10233
Blocpdb> 58 atoms in block 158
Block first atom: 10295
Blocpdb> 82 atoms in block 159
Block first atom: 10353
Blocpdb> 46 atoms in block 160
Block first atom: 10435
Blocpdb> 29 atoms in block 161
Block first atom: 10480
Blocpdb> 161 blocks.
Blocpdb> At most, 82 atoms in each of them.
Blocpdb> At least, 29 atoms in each of them.
Blocpdb> Normal end of Blocpdb.
Diagrtb> Memory allocation for Prepmat.
Diagrtb> Memory allocation for RTB.
Diagrtb> Memory allocation for Diagstd.
Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes.
Prepmat> Entering in.
Prepmat> Rewriting of the matrix begins.
Prepmat> 98200876 matrix lines read.
Prepmat> Matrix order = 31527
Prepmat> Matrix trace = 218123520.0000
Prepmat> Last element read: 31527 31527 1789.4369
Prepmat> 13042 lines saved.
Prepmat> 6087 empty lines.
Prepmat> Number of lines on output is as expected.
Prepmat> Normal end of Prepmat.
RTB> Entering in.
RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 10509
RTB> Total mass = 10509.0000
RTB> Number of atoms found in matrix: 10509
RTB> Number of blocks = 161
RTB> Projection begins.
RTB> Projected matrix is being saved.
RTB> Projected matrix trace = 5752083.9629
RTB> 247929 non-zero elements.
RTB> Normal end of RTB.
Diagstd> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.sdijb
Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb
Diagstd> CERFACS matrix format.
Diagstd> Projected matrix order = 966
Diagstd> Nb of non-zero elements: 247929
Diagstd> Projected matrix trace = 5752083.9629
Openam> file on opening on unit 11:
diagrtb_work.eigenfacs
Diagstd> Diagonalization.
Diagstd> 966 eigenvectors are computed.
Diagstd> 106 of them to be saved.
Diagstd> Sum of eigenvalues =5752083.9629
Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000
Diagstd> Selected eigenvalues:
0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000
0.0000000 39.8521212 57.2301790 100.5717432 239.4651198
293.4784907 409.8856095 430.0147466 708.2632898 713.9495549
787.4821481 901.1603053 1018.1172534 1061.6698476 1111.6389912
1184.5408228 1208.9435557 1240.1224503 1265.8955965 1312.5327377
1339.6381316 1364.9105815 1394.5347115 1415.1602318 1435.1377584
1459.5243169 1477.5746683 1517.5624435 1532.3542322 1550.6896034
1556.8523686 1594.9729965 1645.3149230 1655.4995722 1693.4394700
1704.2258464 1741.8576641 1798.8630112 1829.1992547 1877.6488830
1916.9347797 1941.7129843 1961.3685042 1993.3768434 2011.9228494
2019.1765389 2048.8568427 2066.5800527 2072.4807355 2088.6402762
2107.0582870 2122.4580240 2163.8104757 2182.2419108 2186.5342824
2198.6321304 2208.4550190 2211.8618094 2221.0707061 2231.1852220
2241.0539699 2246.0818183 2252.5948944 2300.8614016 2308.0105738
2337.5184313 2343.7856061 2395.0914292 2401.2127671 2412.6507394
2429.8060360 2464.5381674 2479.8624826 2498.3728245 2528.6081197
2557.0391957 2561.1769253 2573.2544851 2583.4401183 2590.8545912
2629.1479909 2638.5236559 2652.2046995 2696.9883261 2706.4387460
2724.7925230 2735.5986369 2751.4149527 2774.0551823 2802.1560218
2865.5534731 2895.3700207 2899.5350925 2910.8764896 2912.0786819
2920.5725416 2955.2865726 2975.3469050 2983.9481374 2999.2383845
3004.7898351
Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units):
0.0034257 0.0034328 0.0034359 0.0034380 0.0034402
0.0034582 685.5213763 821.5005009 1089.0135139 1680.4144678
1860.3018534 2198.5007384 2251.8370213 2889.9654215 2901.5432192
3047.3029979 3259.8401691 3464.9277154 3538.2622737 3620.5718129
3737.4061548 3775.7070649 3824.0852476 3863.6183925 3934.1449091
3974.5597548 4011.8748852 4055.1782107 4085.0566932 4113.7895980
4148.5941234 4174.1687146 4230.2746552 4250.8410546 4276.1971316
4284.6859572 4336.8254973 4404.7351357 4418.3469594 4468.6888806
4482.8979653 4532.1222091 4605.6860026 4644.3590604 4705.4641816
4754.4353771 4785.0645160 4809.2225943 4848.3055786 4870.8072270
4879.5798136 4915.3119729 4936.5256375 4943.5682169 4962.8037817
4984.6372089 5002.8195145 5051.3200924 5072.7881588 5077.7746810
5091.8026816 5103.1643982 5107.0989841 5117.7194253 5129.3589596
5140.6902688 5146.4536576 5153.9099710 5208.8339091 5216.9200042
5250.1631843 5257.1966402 5314.4255648 5321.2124946 5333.8710091
5352.8008219 5390.9220776 5407.6562814 5427.8008404 5460.5456779
5491.1584145 5495.5994384 5508.5418022 5519.4331800 5527.3478916
5568.0457699 5577.9648910 5592.4073831 5639.4248484 5649.2966611
5668.4197131 5679.6486375 5696.0438875 5719.4310430 5748.3266185
5812.9895043 5843.1537896 5847.3550503 5858.7797186 5859.9894320
5868.5293259 5903.3030767 5923.3048493 5931.8603146 5947.0388152
5952.5401166
Diagstd> Normal end.
Rtb_to_modes> Entering in.
Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 10509
Rtb_to_modes> Number of blocs = 161
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 11:
matrix.eigenrtb
Rdmodfacs> Entering in.
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Eigenvector number: 1
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9522E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 2
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9932E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 3
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0012E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 4
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0024E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 5
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0036E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 6
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0142E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 7
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.85
Rdmodfacs> Eigenvector number: 8
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 57.23
Rdmodfacs> Eigenvector number: 9
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 100.6
Rdmodfacs> Eigenvector number: 10
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 239.5
Rdmodfacs> Eigenvector number: 11
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 293.5
Rdmodfacs> Eigenvector number: 12
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 409.9
Rdmodfacs> Eigenvector number: 13
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 430.0
Rdmodfacs> Eigenvector number: 14
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 708.3
Rdmodfacs> Eigenvector number: 15
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 713.9
Rdmodfacs> Eigenvector number: 16
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 787.5
Rdmodfacs> Eigenvector number: 17
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 901.2
Rdmodfacs> Eigenvector number: 18
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1018.
Rdmodfacs> Eigenvector number: 19
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1062.
Rdmodfacs> Eigenvector number: 20
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1112.
Rdmodfacs> Eigenvector number: 21
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1185.
Rdmodfacs> Eigenvector number: 22
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1209.
Rdmodfacs> Eigenvector number: 23
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1240.
Rdmodfacs> Eigenvector number: 24
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1266.
Rdmodfacs> Eigenvector number: 25
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1313.
Rdmodfacs> Eigenvector number: 26
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1340.
Rdmodfacs> Eigenvector number: 27
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1365.
Rdmodfacs> Eigenvector number: 28
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1395.
Rdmodfacs> Eigenvector number: 29
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1415.
Rdmodfacs> Eigenvector number: 30
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1435.
Rdmodfacs> Eigenvector number: 31
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1460.
Rdmodfacs> Eigenvector number: 32
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1478.
Rdmodfacs> Eigenvector number: 33
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1518.
Rdmodfacs> Eigenvector number: 34
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1532.
Rdmodfacs> Eigenvector number: 35
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1551.
Rdmodfacs> Eigenvector number: 36
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1557.
Rdmodfacs> Eigenvector number: 37
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1595.
Rdmodfacs> Eigenvector number: 38
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1645.
Rdmodfacs> Eigenvector number: 39
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1655.
Rdmodfacs> Eigenvector number: 40
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1693.
Rdmodfacs> Eigenvector number: 41
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1704.
Rdmodfacs> Eigenvector number: 42
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1742.
Rdmodfacs> Eigenvector number: 43
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1799.
Rdmodfacs> Eigenvector number: 44
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1829.
Rdmodfacs> Eigenvector number: 45
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1878.
Rdmodfacs> Eigenvector number: 46
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1917.
Rdmodfacs> Eigenvector number: 47
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1942.
Rdmodfacs> Eigenvector number: 48
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1961.
Rdmodfacs> Eigenvector number: 49
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1993.
Rdmodfacs> Eigenvector number: 50
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2012.
Rdmodfacs> Eigenvector number: 51
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2019.
Rdmodfacs> Eigenvector number: 52
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2049.
Rdmodfacs> Eigenvector number: 53
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2067.
Rdmodfacs> Eigenvector number: 54
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2072.
Rdmodfacs> Eigenvector number: 55
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2089.
Rdmodfacs> Eigenvector number: 56
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2107.
Rdmodfacs> Eigenvector number: 57
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2122.
Rdmodfacs> Eigenvector number: 58
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2164.
Rdmodfacs> Eigenvector number: 59
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2182.
Rdmodfacs> Eigenvector number: 60
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2187.
Rdmodfacs> Eigenvector number: 61
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2199.
Rdmodfacs> Eigenvector number: 62
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2208.
Rdmodfacs> Eigenvector number: 63
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2212.
Rdmodfacs> Eigenvector number: 64
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2221.
Rdmodfacs> Eigenvector number: 65
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2231.
Rdmodfacs> Eigenvector number: 66
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2241.
Rdmodfacs> Eigenvector number: 67
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2246.
Rdmodfacs> Eigenvector number: 68
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2253.
Rdmodfacs> Eigenvector number: 69
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2301.
Rdmodfacs> Eigenvector number: 70
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2308.
Rdmodfacs> Eigenvector number: 71
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2338.
Rdmodfacs> Eigenvector number: 72
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2344.
Rdmodfacs> Eigenvector number: 73
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2395.
Rdmodfacs> Eigenvector number: 74
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2401.
Rdmodfacs> Eigenvector number: 75
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2413.
Rdmodfacs> Eigenvector number: 76
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2430.
Rdmodfacs> Eigenvector number: 77
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2465.
Rdmodfacs> Eigenvector number: 78
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2480.
Rdmodfacs> Eigenvector number: 79
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2498.
Rdmodfacs> Eigenvector number: 80
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2529.
Rdmodfacs> Eigenvector number: 81
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2557.
Rdmodfacs> Eigenvector number: 82
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2561.
Rdmodfacs> Eigenvector number: 83
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2573.
Rdmodfacs> Eigenvector number: 84
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2583.
Rdmodfacs> Eigenvector number: 85
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2591.
Rdmodfacs> Eigenvector number: 86
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2629.
Rdmodfacs> Eigenvector number: 87
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2639.
Rdmodfacs> Eigenvector number: 88
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2652.
Rdmodfacs> Eigenvector number: 89
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2697.
Rdmodfacs> Eigenvector number: 90
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2706.
Rdmodfacs> Eigenvector number: 91
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2725.
Rdmodfacs> Eigenvector number: 92
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2736.
Rdmodfacs> Eigenvector number: 93
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2751.
Rdmodfacs> Eigenvector number: 94
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2774.
Rdmodfacs> Eigenvector number: 95
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2802.
Rdmodfacs> Eigenvector number: 96
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2866.
Rdmodfacs> Eigenvector number: 97
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2895.
Rdmodfacs> Eigenvector number: 98
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2900.
Rdmodfacs> Eigenvector number: 99
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2911.
Rdmodfacs> Eigenvector number: 100
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2912.
Rdmodfacs> Eigenvector number: 101
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2921.
Rdmodfacs> Eigenvector number: 102
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2955.
Rdmodfacs> Eigenvector number: 103
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2975.
Rdmodfacs> Eigenvector number: 104
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2984.
Rdmodfacs> Eigenvector number: 105
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2999.
Rdmodfacs> Eigenvector number: 106
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3005.
Rtb_to_modes> 106 vectors, with 966 coordinates in vector file.
Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected):
1.00002 0.99999 1.00000 1.00000 1.00000
1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000
1.00000 1.00000 0.99999 1.00002 1.00000
1.00000 1.00005 0.99999 1.00000 0.99996
0.99999 1.00004 1.00001 1.00000 1.00007
1.00000 1.00000 0.99997 0.99998 0.99999
1.00002 0.99996 0.99995 0.99999 1.00002
1.00002 1.00001 0.99999 0.99995 0.99999
0.99998 0.99999 0.99998 1.00001 0.99997
0.99999 0.99999 1.00003 0.99999 1.00000
0.99999 0.99999 1.00000 1.00000 1.00007
0.99998 0.99998 1.00001 0.99997 1.00001
0.99996 0.99999 1.00002 1.00001 1.00001
1.00003 1.00000 1.00001 0.99995 0.99998
1.00002 1.00001 1.00002 1.00001 1.00004
0.99995 1.00002 0.99998 1.00001 1.00001
1.00002 1.00002 1.00003 1.00005 0.99996
1.00003 1.00001 0.99995 0.99999 1.00001
0.99998 0.99997 0.99999 1.00000 1.00000
0.99998 1.00004 1.00002 0.99998 1.00002
1.00004 1.00002 0.99997 1.00002 0.99997
1.00002
Rtb_to_modes> RTB block-file is being read.
Rtb_to_modes> 189162 lines found in RTB file.
Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected):
1.00002 0.99999 1.00000 1.00000 1.00000
1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000
1.00000 1.00000 0.99999 1.00002 1.00000
1.00000 1.00005 0.99999 1.00000 0.99996
0.99999 1.00004 1.00001 1.00000 1.00007
1.00000 1.00000 0.99997 0.99998 0.99999
1.00002 0.99996 0.99995 0.99999 1.00002
1.00002 1.00001 0.99999 0.99995 0.99999
0.99998 0.99999 0.99998 1.00001 0.99997
0.99999 0.99999 1.00003 0.99999 1.00000
0.99999 0.99999 1.00000 1.00000 1.00007
0.99998 0.99998 1.00001 0.99997 1.00001
0.99996 0.99999 1.00002 1.00001 1.00001
1.00003 1.00000 1.00001 0.99995 0.99998
1.00002 1.00001 1.00002 1.00001 1.00004
0.99995 1.00002 0.99998 1.00001 1.00001
1.00002 1.00002 1.00003 1.00005 0.99996
1.00003 1.00001 0.99995 0.99999 1.00001
0.99998 0.99997 0.99999 1.00000 1.00000
0.99998 1.00004 1.00002 0.99998 1.00002
1.00004 1.00002 0.99997 1.00002 0.99997
1.00002
Orthogonality of first eigenvectors (zero expected):
Vector 2:-0.000
Vector 3:-0.000-0.000
Vector 4:-0.000-0.000 0.000
Vector 5:-0.000-0.000 0.000 0.000
Vector 6:-0.000 0.000 0.000 0.000-0.000
Vector 7: 0.000-0.000 0.000-0.000-0.000-0.000
Vector 8:-0.000 0.000-0.000 0.000 0.000 0.000-0.000
Vector 9:-0.000 0.000-0.000-0.000-0.000 0.000 0.000-0.000
Vector 10: 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000-0.000-0.000
Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved.
Rtb_to_modes> Normal end.
Diagrtb> Normal end.
B-factor analysis
Bfactors> Version 1.22, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 260210202843550410.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
260210202843550410.eigenfacs
Getnam> Corresponding pdb filename ?
Getnam> 260210202843550410.atom
Openam> file on opening on unit 11:
260210202843550410.atom
Getnum> Number of skipped eigenvectors ?
Getnum> 0
Getnum> Number of usefull eigenvectors ?
Getnum> 10000
%Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 601
First residue number = 953
Last residue number = 1
Number of atoms found = 10509
Mean number per residue = 17.5
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9522E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9932E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0012E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0024E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0036E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0142E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.85
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 57.23
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 100.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 239.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 293.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 409.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 430.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 708.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 713.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 787.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 901.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1018.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1062.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1112.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1185.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1209.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1240.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1266.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1313.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1340.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1365.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1395.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1415.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1435.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1460.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1478.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1518.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1532.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1551.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1557.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1595.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1645.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1655.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1693.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1704.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1742.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1799.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1829.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1878.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1917.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1942.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1961.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1993.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2012.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2019.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2049.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2067.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2072.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2089.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2107.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2122.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2164.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2182.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2187.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2199.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2208.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2212.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2221.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2231.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2241.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2246.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2253.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2301.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2308.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2338.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2344.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2395.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2401.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2413.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2430.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2465.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2480.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2498.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2529.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2557.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2561.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2573.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2583.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2591.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2629.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2639.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2652.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2697.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2706.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2725.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2736.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2751.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2774.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2802.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2866.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2895.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2900.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2911.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2912.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2921.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2955.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2975.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2984.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2999.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3005.
Bfactors> 106 vectors, 31527 coordinates in file.
Openam> file on opening on unit 12:
bfactors.pred
Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000
Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 39.850000
Bfactors> 100 eigenvectors will be considered.
Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped.
Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed.
(CHARMM units assumed for eigenvalues)
%Bfactors-Wn> Experimental B-factors are nearly constant !
Bfactors> = 0.000 +/- 0.00
Bfactors> = 0.000 +/- 0.00
Bfactors> Shiftng-fct= -0.000
Bfactors> Scaling-fct= 0.000
Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved.
Bfactors> Normal end.
check_modes
Chkmod> Version 1.00, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 260210202843550410.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
260210202843550410.eigenfacs
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4256E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4326E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4359E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4379E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4400E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4581E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 685.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 821.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1089.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1680.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1860.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 2198.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 2252.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 2890.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 2901.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3047.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3260.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3465.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3539.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3621.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3738.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3776.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3824.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3864.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3935.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3975.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 4012.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 4056.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 4085.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 4113.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 4149.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 4175.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 4231.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 4250.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 4276.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 4285.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 4337.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 4404.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 4417.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 4468.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 4482.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 4532.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 4606.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 4644.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 4706.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 4754.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 4785.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 4809.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 4848.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 4871.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 4879.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 4915.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 4937.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 4943.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 4963.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 4984.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 5002.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 5051.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 5072.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 5078.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 5092.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 5102.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 5107.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 5117.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 5129.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 5140.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 5146.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 5154.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 5209.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 5217.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 5250.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 5257.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 5314.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 5321.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 5334.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 5353.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 5391.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 5408.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 5427.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 5461.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 5491.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 5495.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 5508.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 5519.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 5527.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 5568.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 5578.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 5592.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 5639.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 5649.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 5668.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 5680.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 5695.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 5719.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 5748.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 5813.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 5843.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 5848.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 5859.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 5860.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 5869.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 5903.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 5923.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 5932.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 5947.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 5952.
Chkmod> 106 vectors, 31527 coordinates in file.
Chkmod> That is: 10509 cartesian points.
Openam> file on opening on unit 11:
Chkmod.res
Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file.
%Chkmod-Wn> Norm of vector 20 is: 0.9999 (instead of 1.0000).
%Chkmod-Wn> Norm of vector 25 is: 1.0001 (instead of 1.0000).
%Chkmod-Wn> Norm of vector 39 is: 0.9998 (instead of 1.0000).
%Chkmod-Wn> Norm of vector 55 is: 1.0001 (instead of 1.0000).
%Chkmod-Wn> Norm of vector 76 is: 0.9999 (instead of 1.0000).
Chkmod> Normal end.
0.0034 0.6113
0.0034 0.7003
0.0034 0.8162
0.0034 0.8855
0.0034 0.7439
0.0035 0.9592
685.4737 0.6546
821.4640 0.5844
1089.1197 0.5605
1680.4647 0.6237
1860.2902 0.6454
2198.4450 0.5089
2251.7017 0.5946
2889.9163 0.0700
2901.3180 0.5392
3047.2067 0.3832
3259.7720 0.0308
3464.5795 0.6356
3538.6605 0.0075
3621.0042 0.0063
3737.9700 0.0586
3775.6331 0.0290
3823.7323 0.2355
3863.6119 0.0080
3934.6762 0.0090
3974.9259 0.0486
4011.8341 0.0081
4055.6806 0.0330
4084.6501 0.0301
4113.4156 0.0143
4149.0920 0.1234
4174.5902 0.0391
4230.7028 0.0189
4250.1672 0.0124
4276.4415 0.0184
4284.7052 0.0243
4336.6760 0.0119
4404.1245 0.0196
4417.4906 0.0103
4467.9172 0.0183
4482.4085 0.0166
4532.1128 0.0180
4605.6636 0.0922
4643.9067 0.0500
4705.7021 0.2376
4754.3122 0.0170
4785.2127 0.0086
4808.5644 0.0163
4847.6392 0.0173
4870.6915 0.0549
4879.1570 0.0298
4915.2727 0.0455
4936.8153 0.1114
4942.7826 0.0369
4963.0181 0.0202
4984.3543 0.0592
5002.0649 0.0477
5051.3245 0.0655
5072.2892 0.0463
5078.0974 0.0193
5092.0100 0.0371
5102.4196 0.0277
5107.0393 0.0111
5117.4183 0.0202
5128.9259 0.0337
5140.4077 0.0866
5146.1390 0.0429
5154.1521 0.0202
5208.7672 0.0228
5216.6841 0.0233
5250.4786 0.0090
5257.2114 0.1758
5314.0960 0.0074
5320.7483 0.0121
5334.0281 0.0551
5352.7847 0.0309
5391.1957 0.0166
5407.5741 0.0572
5427.1629 0.0182
5460.7344 0.1137
5490.8806 0.0849
5495.1737 0.0342
5508.0330 0.0348
5518.7261 0.0195
5527.2657 0.0367
5567.6500 0.0477
5578.2289 0.0235
5591.9515 0.0284
5639.1950 0.0203
5648.5962 0.0361
5668.3922 0.0249
5679.8214 0.0393
5695.3699 0.0486
5719.1286 0.0368
5747.9198 0.0304
5813.1928 0.0152
5842.5296 0.0266
5847.5728 0.0089
5858.6525 0.0115
5859.6587 0.0353
5868.7068 0.0490
5902.7634 0.0278
5922.7053 0.0836
5931.6572 0.0447
5946.5472 0.0426
5952.4927 0.0204
getting mode 7
running: ../../bin/get_modes.sh 260210202843550410 7 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 7
calculating perturbed structure for DQ=-100
260210202843550410.eigenfacs
260210202843550410.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
260210202843550410.eigenfacs
260210202843550410.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
260210202843550410.eigenfacs
260210202843550410.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
260210202843550410.eigenfacs
260210202843550410.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
260210202843550410.eigenfacs
260210202843550410.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
260210202843550410.eigenfacs
260210202843550410.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
260210202843550410.eigenfacs
260210202843550410.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
260210202843550410.eigenfacs
260210202843550410.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
260210202843550410.eigenfacs
260210202843550410.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
260210202843550410.eigenfacs
260210202843550410.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
260210202843550410.eigenfacs
260210202843550410.atom
making animated gifs
11 models are in 260210202843550410.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 260210202843550410.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 260210202843550410.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 8
running: ../../bin/get_modes.sh 260210202843550410 8 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 8
calculating perturbed structure for DQ=-100
260210202843550410.eigenfacs
260210202843550410.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
260210202843550410.eigenfacs
260210202843550410.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
260210202843550410.eigenfacs
260210202843550410.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
260210202843550410.eigenfacs
260210202843550410.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
260210202843550410.eigenfacs
260210202843550410.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
260210202843550410.eigenfacs
260210202843550410.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
260210202843550410.eigenfacs
260210202843550410.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
260210202843550410.eigenfacs
260210202843550410.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
260210202843550410.eigenfacs
260210202843550410.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
260210202843550410.eigenfacs
260210202843550410.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
260210202843550410.eigenfacs
260210202843550410.atom
making animated gifs
11 models are in 260210202843550410.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 260210202843550410.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 260210202843550410.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 9
running: ../../bin/get_modes.sh 260210202843550410 9 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 9
calculating perturbed structure for DQ=-100
260210202843550410.eigenfacs
260210202843550410.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
260210202843550410.eigenfacs
260210202843550410.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
260210202843550410.eigenfacs
260210202843550410.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
260210202843550410.eigenfacs
260210202843550410.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
260210202843550410.eigenfacs
260210202843550410.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
260210202843550410.eigenfacs
260210202843550410.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
260210202843550410.eigenfacs
260210202843550410.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
260210202843550410.eigenfacs
260210202843550410.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
260210202843550410.eigenfacs
260210202843550410.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
260210202843550410.eigenfacs
260210202843550410.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
260210202843550410.eigenfacs
260210202843550410.atom
making animated gifs
11 models are in 260210202843550410.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 260210202843550410.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 260210202843550410.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 10
running: ../../bin/get_modes.sh 260210202843550410 10 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 10
calculating perturbed structure for DQ=-100
260210202843550410.eigenfacs
260210202843550410.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
260210202843550410.eigenfacs
260210202843550410.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
260210202843550410.eigenfacs
260210202843550410.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
260210202843550410.eigenfacs
260210202843550410.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
260210202843550410.eigenfacs
260210202843550410.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
260210202843550410.eigenfacs
260210202843550410.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
260210202843550410.eigenfacs
260210202843550410.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
260210202843550410.eigenfacs
260210202843550410.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
260210202843550410.eigenfacs
260210202843550410.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
260210202843550410.eigenfacs
260210202843550410.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
260210202843550410.eigenfacs
260210202843550410.atom
making animated gifs
11 models are in 260210202843550410.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 260210202843550410.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 260210202843550410.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 11
running: ../../bin/get_modes.sh 260210202843550410 11 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 11
calculating perturbed structure for DQ=-100
260210202843550410.eigenfacs
260210202843550410.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
260210202843550410.eigenfacs
260210202843550410.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
260210202843550410.eigenfacs
260210202843550410.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
260210202843550410.eigenfacs
260210202843550410.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
260210202843550410.eigenfacs
260210202843550410.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
260210202843550410.eigenfacs
260210202843550410.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
260210202843550410.eigenfacs
260210202843550410.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
260210202843550410.eigenfacs
260210202843550410.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
260210202843550410.eigenfacs
260210202843550410.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
260210202843550410.eigenfacs
260210202843550410.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
260210202843550410.eigenfacs
260210202843550410.atom
making animated gifs
11 models are in 260210202843550410.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 260210202843550410.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 260210202843550410.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
260210202843550410.10.pdb
260210202843550410.11.pdb
260210202843550410.7.pdb
260210202843550410.8.pdb
260210202843550410.9.pdb
STDERR:
Note: The following floating-point exceptions are signalling: IEEE_DENORMAL
real 1m38.613s
user 1m31.707s
sys 0m5.321s
rm: cannot remove '260210202843550410.sdijf': No such file or directory
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
If you find results from this site helpful for your research, please cite one of our papers:
elNémo
is maintained by Yves-Henri Sanejouand.
It was developed
by Karsten Suhre.
Between 2003 and 2014, it was hosted by IGS (Marseille).
Between 2015 and 2025, it was hosted by US2B (Nantes).
Last modification: december 26th, 2025.
|