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please let us know.
elNémo has been hacked on november 27th.
It has been moved away and runs again.
**Still some additional cleaning from time to time**
Sorry for the inconvenience.


***  L_modelo_8_KELEY  ***

LOGs for ID: 260210212634573822

Output from eigenvector calculation:


STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8) Build Tirion matrix: Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model. Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004. Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file. Pdbmat> Coordinate filename = 260210212634573822.atom Pdbmat> Distance cutoff = 8.00 Force constant = 10.00 Origin of mass values = CONS Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09 PRINTing level = 2 Pdbmat> Coordinate file 260210212634573822.atom to be opened. Openam> File opened: 260210212634573822.atom Pdbmat> Coordinate file in PDB format. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 596 First residue number = 18 Last residue number = 315 Number of atoms found = 4536 Mean number per residue = 7.6 Pdbmat> Coordinate statistics: = 0.736630 +/- 15.131761 From: -37.899000 To: 39.035000 = -0.581701 +/- 14.207342 From: -36.468000 To: 30.073000 = -0.159926 +/- 15.022511 From: -31.386000 To: 37.900000 Pdbmat> Masses are all set to one. Openam> File opened: pdbmat.xyzm Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved. Openam> File opened: pdbmat.sdijb Pdbmat> Matrix statistics: Pdbmat> The matrix is 1.9207 % Filled. Pdbmat> 1778476 non-zero elements. Pdbmat> 194615 atom-atom interactions. Pdbmat> Number per atom= 85.81 +/- 22.85 Maximum number = 131 Minimum number = 19 Pdbmat> Matrix trace = 3.892300E+06 Pdbmat> Larger element = 500.679 Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10 Pdbmat> Normal end. automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1) 596 non-zero elements, NRBL set to 3 Diagonalize Tirion matrix using diagrtb Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation. Diagrtb> Version 2.52, November 2004. Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file. Diagrtb> Options taken into account: MATRix filename = pdbmat.sdijb COORdinates filename = 260210212634573822.atom Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb Nb of VECTors required = 106 EigeNVALues chosen = LOWE Type of SUBStructuring = NONE Nb of residues per BLOck = 3 Origin of MASS values = CONS MATRix FORMat = BINA Temporary files cleaning = ALL Output PRINting level = 2 Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb. Blocpdb> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.xyzm Blocpdb> Coordinate file 260210212634573822.atom to be opened. Openam> file on opening on unit 11: 260210212634573822.atom Blocpdb> Coordinate file in PDB format. Blocpdb> 4536 atoms picked in pdb file. Blocpdb> All masses set to unity. Blocpdb> Coordinate file is rewritten. Blocpdb> Substructuring: Blocpdb> 3 residue(s) per block. Blocpdb> 596 residues. Blocpdb> 22 atoms in block 1 Block first atom: 1 Blocpdb> 25 atoms in block 2 Block first atom: 23 Blocpdb> 22 atoms in block 3 Block first atom: 48 Blocpdb> 25 atoms in block 4 Block first atom: 70 Blocpdb> 23 atoms in block 5 Block first atom: 95 Blocpdb> 29 atoms in block 6 Block first atom: 118 Blocpdb> 25 atoms in block 7 Block first atom: 147 Blocpdb> 25 atoms in block 8 Block first atom: 172 Blocpdb> 25 atoms in block 9 Block first atom: 197 Blocpdb> 27 atoms in block 10 Block first atom: 222 Blocpdb> 27 atoms in block 11 Block first atom: 249 Blocpdb> 20 atoms in block 12 Block first atom: 276 Blocpdb> 19 atoms in block 13 Block first atom: 296 Blocpdb> 23 atoms in block 14 Block first atom: 315 Blocpdb> 31 atoms in block 15 Block first atom: 338 Blocpdb> 19 atoms in block 16 Block first atom: 369 Blocpdb> 17 atoms in block 17 Block first atom: 388 Blocpdb> 21 atoms in block 18 Block first atom: 405 Blocpdb> 20 atoms in block 19 Block first atom: 426 Blocpdb> 28 atoms in block 20 Block first atom: 446 Blocpdb> 13 atoms in block 21 Block first atom: 474 Blocpdb> 29 atoms in block 22 Block first atom: 487 Blocpdb> 19 atoms in block 23 Block first atom: 516 Blocpdb> 24 atoms in block 24 Block first atom: 535 Blocpdb> 18 atoms in block 25 Block first atom: 559 Blocpdb> 24 atoms in block 26 Block first atom: 577 Blocpdb> 29 atoms in block 27 Block first atom: 601 Blocpdb> 16 atoms in block 28 Block first atom: 630 Blocpdb> 28 atoms in block 29 Block first atom: 646 Blocpdb> 19 atoms in block 30 Block first atom: 674 Blocpdb> 25 atoms in block 31 Block first atom: 693 Blocpdb> 22 atoms in block 32 Block first atom: 718 Blocpdb> 31 atoms in block 33 Block first atom: 740 Blocpdb> 24 atoms in block 34 Block first atom: 771 Blocpdb> 21 atoms in block 35 Block first atom: 795 Blocpdb> 29 atoms in block 36 Block first atom: 816 Blocpdb> 18 atoms in block 37 Block first atom: 845 Blocpdb> 21 atoms in block 38 Block first atom: 863 Blocpdb> 19 atoms in block 39 Block first atom: 884 Blocpdb> 26 atoms in block 40 Block first atom: 903 Blocpdb> 22 atoms in block 41 Block first atom: 929 Blocpdb> 20 atoms in block 42 Block first atom: 951 Blocpdb> 20 atoms in block 43 Block first atom: 971 Blocpdb> 18 atoms in block 44 Block first atom: 991 Blocpdb> 17 atoms in block 45 Block first atom: 1009 Blocpdb> 24 atoms in block 46 Block first atom: 1026 Blocpdb> 27 atoms in block 47 Block first atom: 1050 Blocpdb> 19 atoms in block 48 Block first atom: 1077 Blocpdb> 21 atoms in block 49 Block first atom: 1096 Blocpdb> 13 atoms in block 50 Block first atom: 1117 Blocpdb> 19 atoms in block 51 Block first atom: 1130 Blocpdb> 23 atoms in block 52 Block first atom: 1149 Blocpdb> 20 atoms in block 53 Block first atom: 1172 Blocpdb> 20 atoms in block 54 Block first atom: 1192 Blocpdb> 20 atoms in block 55 Block first atom: 1212 Blocpdb> 29 atoms in block 56 Block first atom: 1232 Blocpdb> 24 atoms in block 57 Block first atom: 1261 Blocpdb> 20 atoms in block 58 Block first atom: 1285 Blocpdb> 22 atoms in block 59 Block first atom: 1305 Blocpdb> 20 atoms in block 60 Block first atom: 1327 Blocpdb> 33 atoms in block 61 Block first atom: 1347 Blocpdb> 21 atoms in block 62 Block first atom: 1380 Blocpdb> 27 atoms in block 63 Block first atom: 1401 Blocpdb> 25 atoms in block 64 Block first atom: 1428 Blocpdb> 28 atoms in block 65 Block first atom: 1453 Blocpdb> 28 atoms in block 66 Block first atom: 1481 Blocpdb> 19 atoms in block 67 Block first atom: 1509 Blocpdb> 24 atoms in block 68 Block first atom: 1528 Blocpdb> 26 atoms in block 69 Block first atom: 1552 Blocpdb> 24 atoms in block 70 Block first atom: 1578 Blocpdb> 20 atoms in block 71 Block first atom: 1602 Blocpdb> 20 atoms in block 72 Block first atom: 1622 Blocpdb> 23 atoms in block 73 Block first atom: 1642 Blocpdb> 26 atoms in block 74 Block first atom: 1665 Blocpdb> 19 atoms in block 75 Block first atom: 1691 Blocpdb> 23 atoms in block 76 Block first atom: 1710 Blocpdb> 23 atoms in block 77 Block first atom: 1733 Blocpdb> 25 atoms in block 78 Block first atom: 1756 Blocpdb> 20 atoms in block 79 Block first atom: 1781 Blocpdb> 24 atoms in block 80 Block first atom: 1801 Blocpdb> 17 atoms in block 81 Block first atom: 1825 Blocpdb> 26 atoms in block 82 Block first atom: 1842 Blocpdb> 22 atoms in block 83 Block first atom: 1868 Blocpdb> 22 atoms in block 84 Block first atom: 1890 Blocpdb> 22 atoms in block 85 Block first atom: 1912 Blocpdb> 24 atoms in block 86 Block first atom: 1934 Blocpdb> 23 atoms in block 87 Block first atom: 1958 Blocpdb> 21 atoms in block 88 Block first atom: 1981 Blocpdb> 22 atoms in block 89 Block first atom: 2002 Blocpdb> 24 atoms in block 90 Block first atom: 2024 Blocpdb> 29 atoms in block 91 Block first atom: 2048 Blocpdb> 19 atoms in block 92 Block first atom: 2077 Blocpdb> 19 atoms in block 93 Block first atom: 2096 Blocpdb> 22 atoms in block 94 Block first atom: 2115 Blocpdb> 28 atoms in block 95 Block first atom: 2137 Blocpdb> 23 atoms in block 96 Block first atom: 2165 Blocpdb> 33 atoms in block 97 Block first atom: 2188 Blocpdb> 25 atoms in block 98 Block first atom: 2221 Blocpdb> 19 atoms in block 99 Block first atom: 2246 Blocpdb> 4 atoms in block 100 Block first atom: 2265 Blocpdb> 22 atoms in block 101 Block first atom: 2269 Blocpdb> 25 atoms in block 102 Block first atom: 2291 Blocpdb> 22 atoms in block 103 Block first atom: 2316 Blocpdb> 25 atoms in block 104 Block first atom: 2338 Blocpdb> 23 atoms in block 105 Block first atom: 2363 Blocpdb> 29 atoms in block 106 Block first atom: 2386 Blocpdb> 25 atoms in block 107 Block first atom: 2415 Blocpdb> 25 atoms in block 108 Block first atom: 2440 Blocpdb> 25 atoms in block 109 Block first atom: 2465 Blocpdb> 27 atoms in block 110 Block first atom: 2490 Blocpdb> 27 atoms in block 111 Block first atom: 2517 Blocpdb> 20 atoms in block 112 Block first atom: 2544 Blocpdb> 19 atoms in block 113 Block first atom: 2564 Blocpdb> 23 atoms in block 114 Block first atom: 2583 Blocpdb> 31 atoms in block 115 Block first atom: 2606 Blocpdb> 19 atoms in block 116 Block first atom: 2637 Blocpdb> 17 atoms in block 117 Block first atom: 2656 Blocpdb> 21 atoms in block 118 Block first atom: 2673 Blocpdb> 20 atoms in block 119 Block first atom: 2694 Blocpdb> 28 atoms in block 120 Block first atom: 2714 Blocpdb> 13 atoms in block 121 Block first atom: 2742 Blocpdb> 29 atoms in block 122 Block first atom: 2755 Blocpdb> 19 atoms in block 123 Block first atom: 2784 Blocpdb> 24 atoms in block 124 Block first atom: 2803 Blocpdb> 18 atoms in block 125 Block first atom: 2827 Blocpdb> 24 atoms in block 126 Block first atom: 2845 Blocpdb> 29 atoms in block 127 Block first atom: 2869 Blocpdb> 16 atoms in block 128 Block first atom: 2898 Blocpdb> 28 atoms in block 129 Block first atom: 2914 Blocpdb> 19 atoms in block 130 Block first atom: 2942 Blocpdb> 25 atoms in block 131 Block first atom: 2961 Blocpdb> 22 atoms in block 132 Block first atom: 2986 Blocpdb> 31 atoms in block 133 Block first atom: 3008 Blocpdb> 24 atoms in block 134 Block first atom: 3039 Blocpdb> 21 atoms in block 135 Block first atom: 3063 Blocpdb> 29 atoms in block 136 Block first atom: 3084 Blocpdb> 18 atoms in block 137 Block first atom: 3113 Blocpdb> 21 atoms in block 138 Block first atom: 3131 Blocpdb> 19 atoms in block 139 Block first atom: 3152 Blocpdb> 26 atoms in block 140 Block first atom: 3171 Blocpdb> 22 atoms in block 141 Block first atom: 3197 Blocpdb> 20 atoms in block 142 Block first atom: 3219 Blocpdb> 20 atoms in block 143 Block first atom: 3239 Blocpdb> 18 atoms in block 144 Block first atom: 3259 Blocpdb> 17 atoms in block 145 Block first atom: 3277 Blocpdb> 24 atoms in block 146 Block first atom: 3294 Blocpdb> 27 atoms in block 147 Block first atom: 3318 Blocpdb> 19 atoms in block 148 Block first atom: 3345 Blocpdb> 21 atoms in block 149 Block first atom: 3364 Blocpdb> 13 atoms in block 150 Block first atom: 3385 Blocpdb> 19 atoms in block 151 Block first atom: 3398 Blocpdb> 23 atoms in block 152 Block first atom: 3417 Blocpdb> 20 atoms in block 153 Block first atom: 3440 Blocpdb> 20 atoms in block 154 Block first atom: 3460 Blocpdb> 20 atoms in block 155 Block first atom: 3480 Blocpdb> 29 atoms in block 156 Block first atom: 3500 Blocpdb> 24 atoms in block 157 Block first atom: 3529 Blocpdb> 20 atoms in block 158 Block first atom: 3553 Blocpdb> 22 atoms in block 159 Block first atom: 3573 Blocpdb> 20 atoms in block 160 Block first atom: 3595 Blocpdb> 33 atoms in block 161 Block first atom: 3615 Blocpdb> 21 atoms in block 162 Block first atom: 3648 Blocpdb> 27 atoms in block 163 Block first atom: 3669 Blocpdb> 25 atoms in block 164 Block first atom: 3696 Blocpdb> 28 atoms in block 165 Block first atom: 3721 Blocpdb> 28 atoms in block 166 Block first atom: 3749 Blocpdb> 19 atoms in block 167 Block first atom: 3777 Blocpdb> 24 atoms in block 168 Block first atom: 3796 Blocpdb> 26 atoms in block 169 Block first atom: 3820 Blocpdb> 24 atoms in block 170 Block first atom: 3846 Blocpdb> 20 atoms in block 171 Block first atom: 3870 Blocpdb> 20 atoms in block 172 Block first atom: 3890 Blocpdb> 23 atoms in block 173 Block first atom: 3910 Blocpdb> 26 atoms in block 174 Block first atom: 3933 Blocpdb> 19 atoms in block 175 Block first atom: 3959 Blocpdb> 23 atoms in block 176 Block first atom: 3978 Blocpdb> 23 atoms in block 177 Block first atom: 4001 Blocpdb> 25 atoms in block 178 Block first atom: 4024 Blocpdb> 20 atoms in block 179 Block first atom: 4049 Blocpdb> 24 atoms in block 180 Block first atom: 4069 Blocpdb> 17 atoms in block 181 Block first atom: 4093 Blocpdb> 26 atoms in block 182 Block first atom: 4110 Blocpdb> 22 atoms in block 183 Block first atom: 4136 Blocpdb> 22 atoms in block 184 Block first atom: 4158 Blocpdb> 22 atoms in block 185 Block first atom: 4180 Blocpdb> 24 atoms in block 186 Block first atom: 4202 Blocpdb> 23 atoms in block 187 Block first atom: 4226 Blocpdb> 21 atoms in block 188 Block first atom: 4249 Blocpdb> 22 atoms in block 189 Block first atom: 4270 Blocpdb> 24 atoms in block 190 Block first atom: 4292 Blocpdb> 29 atoms in block 191 Block first atom: 4316 Blocpdb> 19 atoms in block 192 Block first atom: 4345 Blocpdb> 19 atoms in block 193 Block first atom: 4364 Blocpdb> 22 atoms in block 194 Block first atom: 4383 Blocpdb> 28 atoms in block 195 Block first atom: 4405 Blocpdb> 23 atoms in block 196 Block first atom: 4433 Blocpdb> 33 atoms in block 197 Block first atom: 4456 Blocpdb> 25 atoms in block 198 Block first atom: 4489 Blocpdb> 19 atoms in block 199 Block first atom: 4514 Blocpdb> 4 atoms in block 200 Block first atom: 4532 Blocpdb> 200 blocks. Blocpdb> At most, 33 atoms in each of them. Blocpdb> At least, 4 atoms in each of them. Blocpdb> Normal end of Blocpdb. Diagrtb> Memory allocation for Prepmat. Diagrtb> Memory allocation for RTB. Diagrtb> Memory allocation for Diagstd. Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes. Prepmat> Entering in. Prepmat> Rewriting of the matrix begins. Prepmat> 1778676 matrix lines read. Prepmat> Matrix order = 13608 Prepmat> Matrix trace = 3892300.0000 Prepmat> Last element read: 13608 13608 73.7232 Prepmat> 20101 lines saved. Prepmat> 17999 empty lines. Prepmat> Number of lines on output is as expected. Prepmat> Normal end of Prepmat. RTB> Entering in. RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 4536 RTB> Total mass = 4536.0000 RTB> Number of atoms found in matrix: 4536 RTB> Number of blocks = 200 RTB> Projection begins. RTB> Projected matrix is being saved. RTB> Projected matrix trace = 273580.1597 RTB> 72636 non-zero elements. RTB> Normal end of RTB. Diagstd> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.sdijb Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb Diagstd> CERFACS matrix format. Diagstd> Projected matrix order = 1200 Diagstd> Nb of non-zero elements: 72636 Diagstd> Projected matrix trace = 273580.1597 Openam> file on opening on unit 11: diagrtb_work.eigenfacs Diagstd> Diagonalization. Diagstd> 1200 eigenvectors are computed. Diagstd> 106 of them to be saved. Diagstd> Sum of eigenvalues = 273580.1597 Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000 Diagstd> Selected eigenvalues: 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.8737469 1.1076438 2.0251657 4.3865238 4.8203669 4.9112032 8.7878244 9.1822646 10.0417740 10.1905396 11.6168092 11.8039369 12.8019426 13.2386394 13.4299858 13.5252954 14.7091578 14.7846533 15.7334506 16.3431578 17.7443428 17.9486577 18.3477135 18.4692337 18.8818124 19.5056690 20.2015162 20.6054294 21.1650202 21.9116083 22.8522065 22.9153203 23.6073306 23.6320216 24.4223320 25.0003946 25.6019944 26.4072449 26.9716558 27.4559418 27.6605028 27.8648463 28.0267175 28.9541618 29.4221004 30.4612077 31.0620545 31.3896423 31.9082042 32.1716433 32.7241854 33.4196366 34.2360831 34.4674207 35.1197725 35.9415092 36.2192076 37.0431438 37.5895710 37.6937215 38.5170254 38.9999439 39.0603799 39.4545809 40.4039837 40.5729152 40.7769097 41.0645619 41.4990178 41.5789372 41.9394263 42.1335243 42.7808278 43.7455662 43.9304003 44.1064798 44.9074845 45.0060633 45.0731691 45.7812902 46.6507583 47.3679900 47.4792425 48.3175868 48.3713925 49.3222649 49.8552627 50.3250675 50.5993486 50.6636388 51.5036746 51.6707581 52.0265447 52.7002212 53.0340389 53.6515623 53.9675243 54.6092022 55.6884799 55.7884103 Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units): 0.0034329 0.0034329 0.0034333 0.0034341 0.0034343 0.0034366 101.5051582 114.2866067 154.5345401 227.4340716 238.4159614 240.6518652 321.9111106 329.0562791 344.1125417 346.6521275 370.1167232 373.0857995 388.5377468 395.1090317 397.9541668 399.3637671 416.4752369 417.5426596 430.7321321 438.9987338 457.4306280 460.0566027 465.1427495 466.6805693 471.8642987 479.5961695 488.0757876 492.9309809 499.5795167 508.3143940 519.1099458 519.8262978 527.6169285 527.8927746 536.6471728 542.9610948 549.4550632 558.0290738 563.9610170 569.0015552 571.1172992 573.2229981 574.8855579 584.3200363 589.0228153 599.3338939 605.2159557 608.3989611 613.4037993 615.9307730 621.1975047 627.7636167 635.3855238 637.5286008 643.5334518 651.0186573 653.5288321 660.9204637 665.7772711 666.6989771 673.9406469 678.1523504 678.6775940 682.0936362 690.2515239 691.6930098 693.4296941 695.8712229 699.5426361 700.2159066 703.2447896 704.8702386 710.2641136 718.2279492 719.7436809 721.1846580 727.7038033 728.5020760 729.0449861 734.7494912 741.6937752 747.3736096 748.2507677 754.8278199 755.2479851 762.6350939 766.7447040 770.3488942 772.4453144 772.9358828 779.3174267 780.5804983 783.2632889 788.3181020 790.8108724 795.4016115 797.7402927 802.4688739 810.3599366 811.0866878 Diagstd> Normal end. Rtb_to_modes> Entering in. Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 4536 Rtb_to_modes> Number of blocs = 200 Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.eigenfacs Openam> file on opening on unit 11: matrix.eigenrtb Rdmodfacs> Entering in. Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Eigenvector number: 1 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9936E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 2 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9938E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 3 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9964E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 4 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0001E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 5 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0002E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 6 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0015E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 7 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.8737 Rdmodfacs> Eigenvector number: 8 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.108 Rdmodfacs> Eigenvector number: 9 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.025 Rdmodfacs> Eigenvector number: 10 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.387 Rdmodfacs> Eigenvector number: 11 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.820 Rdmodfacs> Eigenvector number: 12 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.911 Rdmodfacs> Eigenvector number: 13 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.788 Rdmodfacs> Eigenvector number: 14 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.182 Rdmodfacs> Eigenvector number: 15 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.04 Rdmodfacs> Eigenvector number: 16 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.19 Rdmodfacs> Eigenvector number: 17 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.62 Rdmodfacs> Eigenvector number: 18 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.80 Rdmodfacs> Eigenvector number: 19 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.80 Rdmodfacs> Eigenvector number: 20 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.24 Rdmodfacs> Eigenvector number: 21 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.43 Rdmodfacs> Eigenvector number: 22 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.53 Rdmodfacs> Eigenvector number: 23 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.71 Rdmodfacs> Eigenvector number: 24 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.78 Rdmodfacs> Eigenvector number: 25 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.73 Rdmodfacs> Eigenvector number: 26 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.34 Rdmodfacs> Eigenvector number: 27 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.74 Rdmodfacs> Eigenvector number: 28 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.95 Rdmodfacs> Eigenvector number: 29 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.35 Rdmodfacs> Eigenvector number: 30 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.47 Rdmodfacs> Eigenvector number: 31 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.88 Rdmodfacs> Eigenvector number: 32 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.51 Rdmodfacs> Eigenvector number: 33 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.20 Rdmodfacs> Eigenvector number: 34 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.61 Rdmodfacs> Eigenvector number: 35 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.17 Rdmodfacs> Eigenvector number: 36 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.91 Rdmodfacs> Eigenvector number: 37 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.85 Rdmodfacs> Eigenvector number: 38 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.92 Rdmodfacs> Eigenvector number: 39 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.61 Rdmodfacs> Eigenvector number: 40 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.63 Rdmodfacs> Eigenvector number: 41 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.42 Rdmodfacs> Eigenvector number: 42 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.00 Rdmodfacs> Eigenvector number: 43 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.60 Rdmodfacs> Eigenvector number: 44 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.41 Rdmodfacs> Eigenvector number: 45 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.97 Rdmodfacs> Eigenvector number: 46 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.46 Rdmodfacs> Eigenvector number: 47 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.66 Rdmodfacs> Eigenvector number: 48 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.86 Rdmodfacs> Eigenvector number: 49 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.03 Rdmodfacs> Eigenvector number: 50 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.95 Rdmodfacs> Eigenvector number: 51 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.42 Rdmodfacs> Eigenvector number: 52 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.46 Rdmodfacs> Eigenvector number: 53 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.06 Rdmodfacs> Eigenvector number: 54 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.39 Rdmodfacs> Eigenvector number: 55 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.91 Rdmodfacs> Eigenvector number: 56 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.17 Rdmodfacs> Eigenvector number: 57 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.72 Rdmodfacs> Eigenvector number: 58 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.42 Rdmodfacs> Eigenvector number: 59 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.24 Rdmodfacs> Eigenvector number: 60 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.47 Rdmodfacs> Eigenvector number: 61 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.12 Rdmodfacs> Eigenvector number: 62 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.94 Rdmodfacs> Eigenvector number: 63 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.22 Rdmodfacs> Eigenvector number: 64 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.04 Rdmodfacs> Eigenvector number: 65 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.59 Rdmodfacs> Eigenvector number: 66 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.69 Rdmodfacs> Eigenvector number: 67 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.52 Rdmodfacs> Eigenvector number: 68 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.00 Rdmodfacs> Eigenvector number: 69 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.06 Rdmodfacs> Eigenvector number: 70 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.45 Rdmodfacs> Eigenvector number: 71 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.40 Rdmodfacs> Eigenvector number: 72 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.57 Rdmodfacs> Eigenvector number: 73 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.78 Rdmodfacs> Eigenvector number: 74 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.06 Rdmodfacs> Eigenvector number: 75 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.50 Rdmodfacs> Eigenvector number: 76 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.58 Rdmodfacs> Eigenvector number: 77 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.94 Rdmodfacs> Eigenvector number: 78 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.13 Rdmodfacs> Eigenvector number: 79 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.78 Rdmodfacs> Eigenvector number: 80 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.75 Rdmodfacs> Eigenvector number: 81 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.93 Rdmodfacs> Eigenvector number: 82 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.11 Rdmodfacs> Eigenvector number: 83 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.91 Rdmodfacs> Eigenvector number: 84 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.01 Rdmodfacs> Eigenvector number: 85 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.07 Rdmodfacs> Eigenvector number: 86 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.78 Rdmodfacs> Eigenvector number: 87 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.65 Rdmodfacs> Eigenvector number: 88 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 47.37 Rdmodfacs> Eigenvector number: 89 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 47.48 Rdmodfacs> Eigenvector number: 90 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 48.32 Rdmodfacs> Eigenvector number: 91 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 48.37 Rdmodfacs> Eigenvector number: 92 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 49.32 Rdmodfacs> Eigenvector number: 93 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 49.86 Rdmodfacs> Eigenvector number: 94 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 50.33 Rdmodfacs> Eigenvector number: 95 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 50.60 Rdmodfacs> Eigenvector number: 96 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 50.66 Rdmodfacs> Eigenvector number: 97 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 51.50 Rdmodfacs> Eigenvector number: 98 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 51.67 Rdmodfacs> Eigenvector number: 99 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 52.03 Rdmodfacs> Eigenvector number: 100 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 52.70 Rdmodfacs> Eigenvector number: 101 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 53.03 Rdmodfacs> Eigenvector number: 102 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 53.65 Rdmodfacs> Eigenvector number: 103 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 53.97 Rdmodfacs> Eigenvector number: 104 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 54.61 Rdmodfacs> Eigenvector number: 105 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 55.69 Rdmodfacs> Eigenvector number: 106 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 55.79 Rtb_to_modes> 106 vectors, with 1200 coordinates in vector file. Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected): 1.00002 0.99999 1.00000 1.00000 0.99998 1.00000 1.00000 0.99998 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00001 1.00000 1.00001 0.99998 1.00000 1.00001 1.00002 1.00001 1.00003 1.00000 1.00002 0.99999 1.00001 1.00001 1.00000 1.00003 1.00000 1.00002 0.99998 1.00000 0.99999 1.00000 1.00000 0.99999 1.00001 1.00000 1.00003 1.00000 1.00001 0.99999 1.00001 1.00001 0.99999 0.99998 0.99999 1.00001 0.99998 1.00000 1.00000 0.99999 1.00001 1.00000 0.99998 1.00002 0.99998 1.00000 0.99999 1.00000 1.00000 0.99999 0.99999 1.00000 1.00000 1.00000 0.99999 0.99998 0.99998 0.99999 0.99998 0.99998 1.00000 0.99999 1.00000 1.00001 1.00000 1.00000 0.99999 0.99999 1.00002 0.99999 1.00000 0.99998 0.99998 0.99998 1.00001 1.00001 1.00000 1.00000 0.99999 1.00001 1.00001 0.99999 1.00001 1.00001 1.00000 1.00001 1.00000 1.00002 0.99998 1.00000 1.00003 0.99998 1.00001 0.99999 Rtb_to_modes> RTB block-file is being read. Rtb_to_modes> 81648 lines found in RTB file. Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected): 1.00002 0.99999 1.00000 1.00000 0.99998 1.00000 1.00000 0.99998 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00001 1.00000 1.00001 0.99998 1.00000 1.00001 1.00002 1.00001 1.00003 1.00000 1.00002 0.99999 1.00001 1.00001 1.00000 1.00003 1.00000 1.00002 0.99998 1.00000 0.99999 1.00000 1.00000 0.99999 1.00001 1.00000 1.00003 1.00000 1.00001 0.99999 1.00001 1.00001 0.99999 0.99998 0.99999 1.00001 0.99998 1.00000 1.00000 0.99999 1.00001 1.00000 0.99998 1.00002 0.99998 1.00000 0.99999 1.00000 1.00000 0.99999 0.99999 1.00000 1.00000 1.00000 0.99999 0.99998 0.99998 0.99999 0.99998 0.99998 1.00000 0.99999 1.00000 1.00001 1.00000 1.00000 0.99999 0.99999 1.00002 0.99999 1.00000 0.99998 0.99998 0.99998 1.00001 1.00001 1.00000 1.00000 0.99999 1.00001 1.00001 0.99999 1.00001 1.00001 1.00000 1.00001 1.00000 1.00002 0.99998 1.00000 1.00003 0.99998 1.00001 0.99999 Orthogonality of first eigenvectors (zero expected): Vector 2:-0.000 Vector 3: 0.000-0.000 Vector 4: 0.000-0.000 0.000 Vector 5: 0.000-0.000 0.000-0.000 Vector 6: 0.000-0.000 0.000-0.000 0.000 Vector 7:-0.000-0.000 0.000 0.000-0.000 0.000 Vector 8:-0.000-0.000 0.000-0.000 0.000 0.000 0.000 Vector 9: 0.000 0.000-0.000-0.000 0.000-0.000-0.000-0.000 Vector 10: 0.000-0.000-0.000-0.000 0.000-0.000 0.000-0.000-0.000 Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved. Rtb_to_modes> Normal end. Diagrtb> Normal end. B-factor analysis Bfactors> Version 1.22, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 260210212634573822.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 260210212634573822.eigenfacs Getnam> Corresponding pdb filename ? Getnam> 260210212634573822.atom Openam> file on opening on unit 11: 260210212634573822.atom Getnum> Number of skipped eigenvectors ? Getnum> 0 Getnum> Number of usefull eigenvectors ? Getnum> 10000 %Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 596 First residue number = 18 Last residue number = 315 Number of atoms found = 4536 Mean number per residue = 7.6 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9936E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9938E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9964E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0001E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0002E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0015E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.8737 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.108 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.025 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.387 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.820 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.911 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.788 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.182 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.04 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.19 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.62 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.80 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.80 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.24 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.43 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.53 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.71 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.78 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.73 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.34 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.74 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.95 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.35 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.47 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.88 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.51 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.20 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.61 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.17 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.91 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.85 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.92 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.61 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.63 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.42 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.00 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.60 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.41 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.97 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.46 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.66 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.86 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.95 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.42 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.46 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.06 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.39 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.91 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.17 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.72 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.42 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.24 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.47 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.12 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.94 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.22 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.04 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.59 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.69 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.52 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.00 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.06 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.45 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.40 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.57 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.78 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.06 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.50 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.58 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.94 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.13 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.78 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.75 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.93 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.11 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.91 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.01 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.07 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.78 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.65 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.37 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.48 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.32 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.37 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.32 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.86 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 50.33 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 50.60 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 50.66 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 51.50 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 51.67 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 52.03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 52.70 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 53.03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 53.65 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 53.97 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 54.61 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 55.69 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 55.79 Bfactors> 106 vectors, 13608 coordinates in file. Openam> file on opening on unit 12: bfactors.pred Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000 Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 0.873700 Bfactors> 100 eigenvectors will be considered. Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped. Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed. (CHARMM units assumed for eigenvalues) Bfactors> Correlation= -0.404 for 596 C-alpha atoms. Bfactors> = 0.022 +/- 0.02 Bfactors> = 90.678 +/- 5.96 Bfactors> Shiftng-fct= 90.656 Bfactors> Scaling-fct= 273.153 Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved. Bfactors> Normal end. check_modes Chkmod> Version 1.00, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 260210212634573822.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 260210212634573822.eigenfacs Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4327E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4327E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4332E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4340E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4342E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4364E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 101.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 114.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 154.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 227.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 238.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 240.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 321.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 329.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 344.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 346.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 370.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 373.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 388.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 395.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 397.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 399.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 416.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 417.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 430.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 438.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 457.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 460.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 465.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 466.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 471.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 479.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 488.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 493.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 499.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 508.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 519.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 519.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Frequence du 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Chkmod> That is: 4536 cartesian points. Openam> file on opening on unit 11: Chkmod.res Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file. Chkmod> Normal end. 0.0034 0.7340 0.0034 0.8373 0.0034 0.9422 0.0034 0.8631 0.0034 0.7573 0.0034 0.9009 101.4981 0.7303 114.3001 0.7110 154.5216 0.7435 227.4367 0.7294 238.3967 0.8147 240.6366 0.9028 321.9005 0.3320 329.0374 0.3857 344.0674 0.2699 346.6281 0.3526 370.1517 0.4123 373.0076 0.1647 388.4916 0.2032 395.1124 0.3330 397.9373 0.0501 399.4161 0.0284 416.4693 0.3183 417.4590 0.3035 430.6664 0.4551 438.9375 0.4614 457.3550 0.1921 460.0541 0.2148 465.1518 0.3752 466.6702 0.3370 471.8214 0.3035 479.6288 0.3280 488.0365 0.5571 492.9645 0.5008 499.6168 0.5212 508.2739 0.6196 519.0626 0.5006 519.8571 0.6978 527.6241 0.5772 527.8475 0.4067 536.5985 0.3928 542.9335 0.4316 549.4101 0.6373 558.0342 0.6222 563.9195 0.2846 569.0192 0.1787 571.0876 0.2735 573.1485 0.3568 574.8945 0.3791 584.2530 0.6955 588.9765 0.4332 599.2963 0.3319 605.1700 0.3897 608.3763 0.3681 613.3947 0.4705 615.8886 0.3792 621.1311 0.2022 627.7401 0.4762 635.3946 0.5854 637.5251 0.3523 643.5079 0.4870 650.9770 0.4145 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MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 260210212634573822.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 260210212634573822.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 8 running: ../../bin/get_modes.sh 260210212634573822 8 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 8 calculating perturbed structure for DQ=-100 260210212634573822.eigenfacs 260210212634573822.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 260210212634573822.eigenfacs 260210212634573822.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 260210212634573822.eigenfacs 260210212634573822.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 260210212634573822.eigenfacs 260210212634573822.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 260210212634573822.eigenfacs 260210212634573822.atom calculating perturbed structure for DQ=0 260210212634573822.eigenfacs 260210212634573822.atom calculating perturbed structure for DQ=20 260210212634573822.eigenfacs 260210212634573822.atom calculating perturbed structure for DQ=40 260210212634573822.eigenfacs 260210212634573822.atom calculating perturbed structure for DQ=60 260210212634573822.eigenfacs 260210212634573822.atom calculating perturbed structure for DQ=80 260210212634573822.eigenfacs 260210212634573822.atom calculating perturbed structure for DQ=100 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../../bin/get_modes.sh 260210212634573822 9 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 9 calculating perturbed structure for DQ=-100 260210212634573822.eigenfacs 260210212634573822.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 260210212634573822.eigenfacs 260210212634573822.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 260210212634573822.eigenfacs 260210212634573822.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 260210212634573822.eigenfacs 260210212634573822.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 260210212634573822.eigenfacs 260210212634573822.atom calculating perturbed structure for DQ=0 260210212634573822.eigenfacs 260210212634573822.atom calculating perturbed structure for DQ=20 260210212634573822.eigenfacs 260210212634573822.atom calculating perturbed structure for DQ=40 260210212634573822.eigenfacs 260210212634573822.atom calculating perturbed structure for DQ=60 260210212634573822.eigenfacs 260210212634573822.atom 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