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please let us know.
elNémo has been hacked on november 27th.
It has been moved away and runs again.
**Still some additional cleaning from time to time**
Sorry for the inconvenience.


***  L_modelo_11_KELEY  ***

LOGs for ID: 260210212714575026

Output from eigenvector calculation:


STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8) Build Tirion matrix: Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model. Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004. Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file. Pdbmat> Coordinate filename = 260210212714575026.atom Pdbmat> Distance cutoff = 8.00 Force constant = 10.00 Origin of mass values = CONS Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09 PRINTing level = 2 Pdbmat> Coordinate file 260210212714575026.atom to be opened. Openam> File opened: 260210212714575026.atom Pdbmat> Coordinate file in PDB format. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 596 First residue number = 18 Last residue number = 315 Number of atoms found = 4536 Mean number per residue = 7.6 Pdbmat> Coordinate statistics: = 0.002129 +/- 19.472979 From: -40.406000 To: 40.800000 = 1.557581 +/- 9.828169 From: -24.242000 To: 27.086000 = 0.201202 +/- 11.952505 From: -27.737000 To: 30.655000 Pdbmat> Masses are all set to one. Openam> File opened: pdbmat.xyzm Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved. Openam> File opened: pdbmat.sdijb Pdbmat> Matrix statistics: Pdbmat> The matrix is 1.9279 % Filled. Pdbmat> 1785120 non-zero elements. Pdbmat> 195351 atom-atom interactions. Pdbmat> Number per atom= 86.13 +/- 22.63 Maximum number = 132 Minimum number = 16 Pdbmat> Matrix trace = 3.907020E+06 Pdbmat> Larger element = 487.852 Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10 Pdbmat> Normal end. automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1) 596 non-zero elements, NRBL set to 3 Diagonalize Tirion matrix using diagrtb Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation. Diagrtb> Version 2.52, November 2004. Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file. Diagrtb> Options taken into account: MATRix filename = pdbmat.sdijb COORdinates filename = 260210212714575026.atom Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb Nb of VECTors required = 106 EigeNVALues chosen = LOWE Type of SUBStructuring = NONE Nb of residues per BLOck = 3 Origin of MASS values = CONS MATRix FORMat = BINA Temporary files cleaning = ALL Output PRINting level = 2 Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb. Blocpdb> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.xyzm Blocpdb> Coordinate file 260210212714575026.atom to be opened. Openam> file on opening on unit 11: 260210212714575026.atom Blocpdb> Coordinate file in PDB format. Blocpdb> 4536 atoms picked in pdb file. Blocpdb> All masses set to unity. Blocpdb> Coordinate file is rewritten. Blocpdb> Substructuring: Blocpdb> 3 residue(s) per block. Blocpdb> 596 residues. Blocpdb> 22 atoms in block 1 Block first atom: 1 Blocpdb> 25 atoms in block 2 Block first atom: 23 Blocpdb> 22 atoms in block 3 Block first atom: 48 Blocpdb> 25 atoms in block 4 Block first atom: 70 Blocpdb> 23 atoms in block 5 Block first atom: 95 Blocpdb> 29 atoms in block 6 Block first atom: 118 Blocpdb> 25 atoms in block 7 Block first atom: 147 Blocpdb> 25 atoms in block 8 Block first atom: 172 Blocpdb> 25 atoms in block 9 Block first atom: 197 Blocpdb> 27 atoms in block 10 Block first atom: 222 Blocpdb> 27 atoms in block 11 Block first atom: 249 Blocpdb> 20 atoms in block 12 Block first atom: 276 Blocpdb> 19 atoms in block 13 Block first atom: 296 Blocpdb> 23 atoms in block 14 Block first atom: 315 Blocpdb> 31 atoms in block 15 Block first atom: 338 Blocpdb> 19 atoms in block 16 Block first atom: 369 Blocpdb> 17 atoms in block 17 Block first atom: 388 Blocpdb> 21 atoms in block 18 Block first atom: 405 Blocpdb> 20 atoms in block 19 Block first atom: 426 Blocpdb> 28 atoms in block 20 Block first atom: 446 Blocpdb> 13 atoms in block 21 Block first atom: 474 Blocpdb> 29 atoms in block 22 Block first atom: 487 Blocpdb> 19 atoms in block 23 Block first atom: 516 Blocpdb> 24 atoms in block 24 Block first atom: 535 Blocpdb> 18 atoms in block 25 Block first atom: 559 Blocpdb> 24 atoms in block 26 Block first atom: 577 Blocpdb> 29 atoms in block 27 Block first atom: 601 Blocpdb> 16 atoms in block 28 Block first atom: 630 Blocpdb> 28 atoms in block 29 Block first atom: 646 Blocpdb> 19 atoms in block 30 Block first atom: 674 Blocpdb> 25 atoms in block 31 Block first atom: 693 Blocpdb> 22 atoms in block 32 Block first atom: 718 Blocpdb> 31 atoms in block 33 Block first atom: 740 Blocpdb> 24 atoms in block 34 Block first atom: 771 Blocpdb> 21 atoms in block 35 Block first atom: 795 Blocpdb> 29 atoms in block 36 Block first atom: 816 Blocpdb> 18 atoms in block 37 Block first atom: 845 Blocpdb> 21 atoms in block 38 Block first atom: 863 Blocpdb> 19 atoms in block 39 Block first atom: 884 Blocpdb> 26 atoms in block 40 Block first atom: 903 Blocpdb> 22 atoms in block 41 Block first atom: 929 Blocpdb> 20 atoms in block 42 Block first atom: 951 Blocpdb> 20 atoms in block 43 Block first atom: 971 Blocpdb> 18 atoms in block 44 Block first atom: 991 Blocpdb> 17 atoms in block 45 Block first atom: 1009 Blocpdb> 24 atoms in block 46 Block first atom: 1026 Blocpdb> 27 atoms in block 47 Block first atom: 1050 Blocpdb> 19 atoms in block 48 Block first atom: 1077 Blocpdb> 21 atoms in block 49 Block first atom: 1096 Blocpdb> 13 atoms in block 50 Block first atom: 1117 Blocpdb> 19 atoms in block 51 Block first atom: 1130 Blocpdb> 23 atoms in block 52 Block first atom: 1149 Blocpdb> 20 atoms in block 53 Block first atom: 1172 Blocpdb> 20 atoms in block 54 Block first atom: 1192 Blocpdb> 20 atoms in block 55 Block first atom: 1212 Blocpdb> 29 atoms in block 56 Block first atom: 1232 Blocpdb> 24 atoms in block 57 Block first atom: 1261 Blocpdb> 20 atoms in block 58 Block first atom: 1285 Blocpdb> 22 atoms in block 59 Block first atom: 1305 Blocpdb> 20 atoms in block 60 Block first atom: 1327 Blocpdb> 33 atoms in block 61 Block first atom: 1347 Blocpdb> 21 atoms in block 62 Block first atom: 1380 Blocpdb> 27 atoms in block 63 Block first atom: 1401 Blocpdb> 25 atoms in block 64 Block first atom: 1428 Blocpdb> 28 atoms in block 65 Block first atom: 1453 Blocpdb> 28 atoms in block 66 Block first atom: 1481 Blocpdb> 19 atoms in block 67 Block first atom: 1509 Blocpdb> 24 atoms in block 68 Block first atom: 1528 Blocpdb> 26 atoms in block 69 Block first atom: 1552 Blocpdb> 24 atoms in block 70 Block first atom: 1578 Blocpdb> 20 atoms in block 71 Block first atom: 1602 Blocpdb> 20 atoms in block 72 Block first atom: 1622 Blocpdb> 23 atoms in block 73 Block first atom: 1642 Blocpdb> 26 atoms in block 74 Block first atom: 1665 Blocpdb> 19 atoms in block 75 Block first atom: 1691 Blocpdb> 23 atoms in block 76 Block first atom: 1710 Blocpdb> 23 atoms in block 77 Block first atom: 1733 Blocpdb> 25 atoms in block 78 Block first atom: 1756 Blocpdb> 20 atoms in block 79 Block first atom: 1781 Blocpdb> 24 atoms in block 80 Block first atom: 1801 Blocpdb> 17 atoms in block 81 Block first atom: 1825 Blocpdb> 26 atoms in block 82 Block first atom: 1842 Blocpdb> 22 atoms in block 83 Block first atom: 1868 Blocpdb> 22 atoms in block 84 Block first atom: 1890 Blocpdb> 22 atoms in block 85 Block first atom: 1912 Blocpdb> 24 atoms in block 86 Block first atom: 1934 Blocpdb> 23 atoms in block 87 Block first atom: 1958 Blocpdb> 21 atoms in block 88 Block first atom: 1981 Blocpdb> 22 atoms in block 89 Block first atom: 2002 Blocpdb> 24 atoms in block 90 Block first atom: 2024 Blocpdb> 29 atoms in block 91 Block first atom: 2048 Blocpdb> 19 atoms in block 92 Block first atom: 2077 Blocpdb> 19 atoms in block 93 Block first atom: 2096 Blocpdb> 22 atoms in block 94 Block first atom: 2115 Blocpdb> 28 atoms in block 95 Block first atom: 2137 Blocpdb> 23 atoms in block 96 Block first atom: 2165 Blocpdb> 33 atoms in block 97 Block first atom: 2188 Blocpdb> 25 atoms in block 98 Block first atom: 2221 Blocpdb> 19 atoms in block 99 Block first atom: 2246 Blocpdb> 4 atoms in block 100 Block first atom: 2265 Blocpdb> 22 atoms in block 101 Block first atom: 2269 Blocpdb> 25 atoms in block 102 Block first atom: 2291 Blocpdb> 22 atoms in block 103 Block first atom: 2316 Blocpdb> 25 atoms in block 104 Block first atom: 2338 Blocpdb> 23 atoms in block 105 Block first atom: 2363 Blocpdb> 29 atoms in block 106 Block first atom: 2386 Blocpdb> 25 atoms in block 107 Block first atom: 2415 Blocpdb> 25 atoms in block 108 Block first atom: 2440 Blocpdb> 25 atoms in block 109 Block first atom: 2465 Blocpdb> 27 atoms in block 110 Block first atom: 2490 Blocpdb> 27 atoms in block 111 Block first atom: 2517 Blocpdb> 20 atoms in block 112 Block first atom: 2544 Blocpdb> 19 atoms in block 113 Block first atom: 2564 Blocpdb> 23 atoms in block 114 Block first atom: 2583 Blocpdb> 31 atoms in block 115 Block first atom: 2606 Blocpdb> 19 atoms in block 116 Block first atom: 2637 Blocpdb> 17 atoms in block 117 Block first atom: 2656 Blocpdb> 21 atoms in block 118 Block first atom: 2673 Blocpdb> 20 atoms in block 119 Block first atom: 2694 Blocpdb> 28 atoms in block 120 Block first atom: 2714 Blocpdb> 13 atoms in block 121 Block first atom: 2742 Blocpdb> 29 atoms in block 122 Block first atom: 2755 Blocpdb> 19 atoms in block 123 Block first atom: 2784 Blocpdb> 24 atoms in block 124 Block first atom: 2803 Blocpdb> 18 atoms in block 125 Block first atom: 2827 Blocpdb> 24 atoms in block 126 Block first atom: 2845 Blocpdb> 29 atoms in block 127 Block first atom: 2869 Blocpdb> 16 atoms in block 128 Block first atom: 2898 Blocpdb> 28 atoms in block 129 Block first atom: 2914 Blocpdb> 19 atoms in block 130 Block first atom: 2942 Blocpdb> 25 atoms in block 131 Block first atom: 2961 Blocpdb> 22 atoms in block 132 Block first atom: 2986 Blocpdb> 31 atoms in block 133 Block first atom: 3008 Blocpdb> 24 atoms in block 134 Block first atom: 3039 Blocpdb> 21 atoms in block 135 Block first atom: 3063 Blocpdb> 29 atoms in block 136 Block first atom: 3084 Blocpdb> 18 atoms in block 137 Block first atom: 3113 Blocpdb> 21 atoms in block 138 Block first atom: 3131 Blocpdb> 19 atoms in block 139 Block first atom: 3152 Blocpdb> 26 atoms in block 140 Block first atom: 3171 Blocpdb> 22 atoms in block 141 Block first atom: 3197 Blocpdb> 20 atoms in block 142 Block first atom: 3219 Blocpdb> 20 atoms in block 143 Block first atom: 3239 Blocpdb> 18 atoms in block 144 Block first atom: 3259 Blocpdb> 17 atoms in block 145 Block first atom: 3277 Blocpdb> 24 atoms in block 146 Block first atom: 3294 Blocpdb> 27 atoms in block 147 Block first atom: 3318 Blocpdb> 19 atoms in block 148 Block first atom: 3345 Blocpdb> 21 atoms in block 149 Block first atom: 3364 Blocpdb> 13 atoms in block 150 Block first atom: 3385 Blocpdb> 19 atoms in block 151 Block first atom: 3398 Blocpdb> 23 atoms in block 152 Block first atom: 3417 Blocpdb> 20 atoms in block 153 Block first atom: 3440 Blocpdb> 20 atoms in block 154 Block first atom: 3460 Blocpdb> 20 atoms in block 155 Block first atom: 3480 Blocpdb> 29 atoms in block 156 Block first atom: 3500 Blocpdb> 24 atoms in block 157 Block first atom: 3529 Blocpdb> 20 atoms in block 158 Block first atom: 3553 Blocpdb> 22 atoms in block 159 Block first atom: 3573 Blocpdb> 20 atoms in block 160 Block first atom: 3595 Blocpdb> 33 atoms in block 161 Block first atom: 3615 Blocpdb> 21 atoms in block 162 Block first atom: 3648 Blocpdb> 27 atoms in block 163 Block first atom: 3669 Blocpdb> 25 atoms in block 164 Block first atom: 3696 Blocpdb> 28 atoms in block 165 Block first atom: 3721 Blocpdb> 28 atoms in block 166 Block first atom: 3749 Blocpdb> 19 atoms in block 167 Block first atom: 3777 Blocpdb> 24 atoms in block 168 Block first atom: 3796 Blocpdb> 26 atoms in block 169 Block first atom: 3820 Blocpdb> 24 atoms in block 170 Block first atom: 3846 Blocpdb> 20 atoms in block 171 Block first atom: 3870 Blocpdb> 20 atoms in block 172 Block first atom: 3890 Blocpdb> 23 atoms in block 173 Block first atom: 3910 Blocpdb> 26 atoms in block 174 Block first atom: 3933 Blocpdb> 19 atoms in block 175 Block first atom: 3959 Blocpdb> 23 atoms in block 176 Block first atom: 3978 Blocpdb> 23 atoms in block 177 Block first atom: 4001 Blocpdb> 25 atoms in block 178 Block first atom: 4024 Blocpdb> 20 atoms in block 179 Block first atom: 4049 Blocpdb> 24 atoms in block 180 Block first atom: 4069 Blocpdb> 17 atoms in block 181 Block first atom: 4093 Blocpdb> 26 atoms in block 182 Block first atom: 4110 Blocpdb> 22 atoms in block 183 Block first atom: 4136 Blocpdb> 22 atoms in block 184 Block first atom: 4158 Blocpdb> 22 atoms in block 185 Block first atom: 4180 Blocpdb> 24 atoms in block 186 Block first atom: 4202 Blocpdb> 23 atoms in block 187 Block first atom: 4226 Blocpdb> 21 atoms in block 188 Block first atom: 4249 Blocpdb> 22 atoms in block 189 Block first atom: 4270 Blocpdb> 24 atoms in block 190 Block first atom: 4292 Blocpdb> 29 atoms in block 191 Block first atom: 4316 Blocpdb> 19 atoms in block 192 Block first atom: 4345 Blocpdb> 19 atoms in block 193 Block first atom: 4364 Blocpdb> 22 atoms in block 194 Block first atom: 4383 Blocpdb> 28 atoms in block 195 Block first atom: 4405 Blocpdb> 23 atoms in block 196 Block first atom: 4433 Blocpdb> 33 atoms in block 197 Block first atom: 4456 Blocpdb> 25 atoms in block 198 Block first atom: 4489 Blocpdb> 19 atoms in block 199 Block first atom: 4514 Blocpdb> 4 atoms in block 200 Block first atom: 4532 Blocpdb> 200 blocks. Blocpdb> At most, 33 atoms in each of them. Blocpdb> At least, 4 atoms in each of them. Blocpdb> Normal end of Blocpdb. Diagrtb> Memory allocation for Prepmat. Diagrtb> Memory allocation for RTB. Diagrtb> Memory allocation for Diagstd. Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes. Prepmat> Entering in. Prepmat> Rewriting of the matrix begins. Prepmat> 1785320 matrix lines read. Prepmat> Matrix order = 13608 Prepmat> Matrix trace = 3907020.0000 Prepmat> Last element read: 13608 13608 21.0187 Prepmat> 20101 lines saved. Prepmat> 17982 empty lines. Prepmat> Number of lines on output is as expected. Prepmat> Normal end of Prepmat. RTB> Entering in. RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 4536 RTB> Total mass = 4536.0000 RTB> Number of atoms found in matrix: 4536 RTB> Number of blocks = 200 RTB> Projection begins. RTB> Projected matrix is being saved. RTB> Projected matrix trace = 275150.5633 RTB> 73248 non-zero elements. RTB> Normal end of RTB. Diagstd> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.sdijb Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb Diagstd> CERFACS matrix format. Diagstd> Projected matrix order = 1200 Diagstd> Nb of non-zero elements: 73248 Diagstd> Projected matrix trace = 275150.5633 Openam> file on opening on unit 11: diagrtb_work.eigenfacs Diagstd> Diagonalization. Diagstd> 1200 eigenvectors are computed. Diagstd> 106 of them to be saved. Diagstd> Sum of eigenvalues = 275150.5633 Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000 Diagstd> Selected eigenvalues: 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 1.4927444 1.9668188 2.3637278 5.5613772 5.6889677 6.2590140 8.4912846 9.6855457 10.4311945 10.7184876 11.4693812 11.8138439 12.7939655 13.9970382 14.3977981 14.5013247 14.9395200 15.1735181 17.0107926 17.1948275 18.1687812 19.1226985 19.2429451 19.4446706 20.4396545 20.7627492 20.9773436 21.7839696 22.2902702 22.3222793 23.1795740 23.3822176 24.0450760 24.5506966 25.5322273 25.8565239 26.2340652 26.8923447 27.3926586 27.7171090 28.0027091 28.2426091 29.1580031 29.5457560 30.0934152 31.2778607 32.0362008 32.3813793 32.9202354 34.2679032 34.4117447 34.6962184 35.0896696 35.1589556 35.6009591 36.3241854 36.7683762 37.1291458 37.4754320 38.0016753 39.5248203 39.6926864 40.0827257 40.5853545 40.6689360 40.8854042 41.0327329 41.5964617 42.0109705 42.5524739 42.6808023 42.9575487 43.6325429 43.6712109 43.8702002 45.0235770 45.5877311 45.8550476 46.1753070 46.6370210 47.2393143 47.9401133 48.1862177 49.1066389 49.3371841 49.7983672 50.4996421 50.6450796 51.5304733 52.1610367 52.4369319 52.7711774 53.3968257 53.9632693 54.2220619 54.9521410 55.7794830 56.3777781 56.6214380 56.8148535 Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units): 0.0034310 0.0034328 0.0034331 0.0034339 0.0034354 0.0034356 132.6746684 152.2921273 166.9529165 256.0863661 259.0073054 271.6741039 316.4331527 337.9537954 350.7214295 355.5183616 367.7606626 373.2423322 388.4166761 406.2686904 412.0437400 413.5224750 419.7238065 422.9981072 447.8757562 450.2919592 462.8690879 474.8646812 476.3553535 478.8456816 490.9441111 494.8091355 497.3596241 506.8317244 512.6877574 513.0557381 522.8149590 525.0952976 532.4862007 538.0556422 548.7059019 552.1795901 556.1962765 563.1312325 568.3454308 571.7013863 574.6392738 577.0954997 586.3732759 590.2592933 595.7046892 607.3147104 614.6328719 617.9352242 623.0555176 635.6807290 637.0134853 639.6410859 643.2575911 643.8923465 647.9270762 654.4752414 658.4647124 661.6872393 664.7657016 669.4168679 682.7005178 684.1487328 687.5019010 691.7990358 692.5110145 694.3515803 695.6014874 700.3634530 703.8443644 708.3659661 709.4332960 711.7295963 717.2995238 717.6172960 719.2503609 728.6438070 733.1946194 735.3411242 737.9045294 741.5845635 746.3577950 751.8735517 753.8009833 760.9662322 762.7504275 766.3070690 771.6838839 772.7942988 779.5201499 784.2750288 786.3464249 788.8486241 793.5110891 797.7088433 799.6193488 804.9846315 811.0217899 815.3597302 817.1197878 818.5142147 Diagstd> Normal end. Rtb_to_modes> Entering in. Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 4536 Rtb_to_modes> Number of blocs = 200 Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.eigenfacs Openam> file on opening on unit 11: matrix.eigenrtb Rdmodfacs> Entering in. Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Eigenvector number: 1 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9827E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 2 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9932E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 3 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9947E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 4 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9998E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 5 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0008E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 6 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0009E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 7 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.493 Rdmodfacs> Eigenvector number: 8 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.967 Rdmodfacs> Eigenvector number: 9 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.364 Rdmodfacs> Eigenvector number: 10 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.561 Rdmodfacs> Eigenvector number: 11 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.689 Rdmodfacs> Eigenvector number: 12 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.259 Rdmodfacs> Eigenvector number: 13 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.491 Rdmodfacs> Eigenvector number: 14 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.686 Rdmodfacs> Eigenvector number: 15 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.43 Rdmodfacs> Eigenvector number: 16 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.72 Rdmodfacs> Eigenvector number: 17 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.47 Rdmodfacs> Eigenvector number: 18 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.81 Rdmodfacs> Eigenvector number: 19 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.79 Rdmodfacs> Eigenvector number: 20 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.00 Rdmodfacs> Eigenvector number: 21 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.40 Rdmodfacs> Eigenvector number: 22 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.50 Rdmodfacs> Eigenvector number: 23 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.94 Rdmodfacs> Eigenvector number: 24 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.17 Rdmodfacs> Eigenvector number: 25 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.01 Rdmodfacs> Eigenvector number: 26 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.19 Rdmodfacs> Eigenvector number: 27 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.17 Rdmodfacs> Eigenvector number: 28 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.12 Rdmodfacs> Eigenvector number: 29 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.24 Rdmodfacs> Eigenvector number: 30 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.44 Rdmodfacs> Eigenvector number: 31 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.44 Rdmodfacs> Eigenvector number: 32 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.76 Rdmodfacs> Eigenvector number: 33 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.98 Rdmodfacs> Eigenvector number: 34 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.78 Rdmodfacs> Eigenvector number: 35 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.29 Rdmodfacs> Eigenvector number: 36 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.32 Rdmodfacs> Eigenvector number: 37 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.18 Rdmodfacs> Eigenvector number: 38 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.38 Rdmodfacs> Eigenvector number: 39 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.05 Rdmodfacs> Eigenvector number: 40 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.55 Rdmodfacs> Eigenvector number: 41 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.53 Rdmodfacs> Eigenvector number: 42 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.86 Rdmodfacs> Eigenvector number: 43 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.23 Rdmodfacs> Eigenvector number: 44 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.89 Rdmodfacs> Eigenvector number: 45 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.39 Rdmodfacs> Eigenvector number: 46 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.72 Rdmodfacs> Eigenvector number: 47 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.00 Rdmodfacs> Eigenvector number: 48 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.24 Rdmodfacs> Eigenvector number: 49 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.16 Rdmodfacs> Eigenvector number: 50 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.55 Rdmodfacs> Eigenvector number: 51 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 52 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.28 Rdmodfacs> Eigenvector number: 53 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.04 Rdmodfacs> Eigenvector number: 54 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.38 Rdmodfacs> Eigenvector number: 55 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.92 Rdmodfacs> Eigenvector number: 56 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.27 Rdmodfacs> Eigenvector number: 57 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.41 Rdmodfacs> Eigenvector number: 58 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.70 Rdmodfacs> Eigenvector number: 59 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 60 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.16 Rdmodfacs> Eigenvector number: 61 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.60 Rdmodfacs> Eigenvector number: 62 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.32 Rdmodfacs> Eigenvector number: 63 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.77 Rdmodfacs> Eigenvector number: 64 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.13 Rdmodfacs> Eigenvector number: 65 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.48 Rdmodfacs> Eigenvector number: 66 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.00 Rdmodfacs> Eigenvector number: 67 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.52 Rdmodfacs> Eigenvector number: 68 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.69 Rdmodfacs> Eigenvector number: 69 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.08 Rdmodfacs> Eigenvector number: 70 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.59 Rdmodfacs> Eigenvector number: 71 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.67 Rdmodfacs> Eigenvector number: 72 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.89 Rdmodfacs> Eigenvector number: 73 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.03 Rdmodfacs> Eigenvector number: 74 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.60 Rdmodfacs> Eigenvector number: 75 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.01 Rdmodfacs> Eigenvector number: 76 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.55 Rdmodfacs> Eigenvector number: 77 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.68 Rdmodfacs> Eigenvector number: 78 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.96 Rdmodfacs> Eigenvector number: 79 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.63 Rdmodfacs> Eigenvector number: 80 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.67 Rdmodfacs> Eigenvector number: 81 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.87 Rdmodfacs> Eigenvector number: 82 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 83 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.59 Rdmodfacs> Eigenvector number: 84 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.86 Rdmodfacs> Eigenvector number: 85 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.18 Rdmodfacs> Eigenvector number: 86 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.64 Rdmodfacs> Eigenvector number: 87 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 47.24 Rdmodfacs> Eigenvector number: 88 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 47.94 Rdmodfacs> Eigenvector number: 89 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 48.19 Rdmodfacs> Eigenvector number: 90 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 49.11 Rdmodfacs> Eigenvector number: 91 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 49.34 Rdmodfacs> Eigenvector number: 92 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 49.80 Rdmodfacs> Eigenvector number: 93 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 50.50 Rdmodfacs> Eigenvector number: 94 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 50.65 Rdmodfacs> Eigenvector number: 95 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 51.53 Rdmodfacs> Eigenvector number: 96 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 52.16 Rdmodfacs> Eigenvector number: 97 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 52.44 Rdmodfacs> Eigenvector number: 98 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 52.77 Rdmodfacs> Eigenvector number: 99 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 53.40 Rdmodfacs> Eigenvector number: 100 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 53.96 Rdmodfacs> Eigenvector number: 101 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 54.22 Rdmodfacs> Eigenvector number: 102 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 54.95 Rdmodfacs> Eigenvector number: 103 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 55.78 Rdmodfacs> Eigenvector number: 104 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 56.38 Rdmodfacs> Eigenvector number: 105 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 56.62 Rdmodfacs> Eigenvector number: 106 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 56.81 Rtb_to_modes> 106 vectors, with 1200 coordinates in vector file. Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected): 1.00000 1.00000 1.00002 1.00000 0.99999 0.99999 1.00000 1.00001 1.00000 1.00001 0.99999 1.00001 1.00000 0.99998 0.99998 1.00001 1.00001 1.00001 0.99999 1.00003 0.99999 1.00002 1.00000 1.00000 1.00000 0.99998 1.00001 1.00000 1.00003 0.99999 1.00000 1.00000 1.00000 1.00001 1.00000 0.99999 0.99999 1.00001 1.00001 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 0.99997 1.00001 0.99999 1.00000 0.99998 1.00000 1.00001 1.00001 1.00000 1.00000 0.99999 0.99997 1.00000 1.00001 1.00003 1.00000 1.00000 0.99999 1.00002 1.00001 1.00001 0.99999 1.00001 1.00000 0.99998 1.00000 1.00000 0.99999 1.00000 1.00001 0.99999 1.00000 1.00000 1.00000 1.00001 0.99999 0.99999 1.00002 0.99999 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 0.99999 1.00003 0.99997 1.00002 1.00000 0.99998 1.00000 1.00000 1.00002 1.00001 0.99998 1.00000 1.00000 1.00000 0.99999 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 Rtb_to_modes> RTB block-file is being read. Rtb_to_modes> 81648 lines found in RTB file. Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected): 1.00000 1.00000 1.00002 1.00000 0.99999 0.99999 1.00000 1.00001 1.00000 1.00001 0.99999 1.00001 1.00000 0.99998 0.99998 1.00001 1.00001 1.00001 0.99999 1.00003 0.99999 1.00002 1.00000 1.00000 1.00000 0.99998 1.00001 1.00000 1.00003 0.99999 1.00000 1.00000 1.00000 1.00001 1.00000 0.99999 0.99999 1.00001 1.00001 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 0.99997 1.00001 0.99999 1.00000 0.99998 1.00000 1.00001 1.00001 1.00000 1.00000 0.99999 0.99997 1.00000 1.00001 1.00003 1.00000 1.00000 0.99999 1.00002 1.00001 1.00001 0.99999 1.00001 1.00000 0.99998 1.00000 1.00000 0.99999 1.00000 1.00001 0.99999 1.00000 1.00000 1.00000 1.00001 0.99999 0.99999 1.00002 0.99999 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 0.99999 1.00003 0.99997 1.00002 1.00000 0.99998 1.00000 1.00000 1.00002 1.00001 0.99998 1.00000 1.00000 1.00000 0.99999 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 Orthogonality of first eigenvectors (zero expected): Vector 2: 0.000 Vector 3: 0.000-0.000 Vector 4:-0.000 0.000 0.000 Vector 5: 0.000-0.000-0.000 0.000 Vector 6: 0.000 0.000 0.000 0.000-0.000 Vector 7:-0.000 0.000 0.000-0.000 0.000 0.000 Vector 8: 0.000 0.000-0.000 0.000 0.000-0.000-0.000 Vector 9:-0.000-0.000 0.000-0.000 0.000-0.000 0.000 0.000 Vector 10:-0.000-0.000-0.000 0.000-0.000 0.000-0.000 0.000 0.000 Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved. Rtb_to_modes> Normal end. Diagrtb> Normal end. B-factor analysis Bfactors> Version 1.22, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 260210212714575026.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 260210212714575026.eigenfacs Getnam> Corresponding pdb filename ? Getnam> 260210212714575026.atom Openam> file on opening on unit 11: 260210212714575026.atom Getnum> Number of skipped eigenvectors ? Getnum> 0 Getnum> Number of usefull eigenvectors ? Getnum> 10000 %Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 596 First residue number = 18 Last residue number = 315 Number of atoms found = 4536 Mean number per residue = 7.6 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9827E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9932E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9947E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9998E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0008E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0009E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.493 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.967 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.364 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.561 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.689 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.259 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.491 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.686 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.43 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.72 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.47 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.81 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.79 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.00 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.40 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.50 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.94 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.17 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.01 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.19 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.17 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.12 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.24 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.44 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.44 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.76 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.98 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.78 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.29 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.32 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.18 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.38 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.05 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.55 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.53 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.86 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.23 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.89 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.39 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.72 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.00 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.24 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.16 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.55 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.28 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.04 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.38 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.92 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.27 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.41 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.70 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.16 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.60 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.32 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.77 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.13 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.48 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.00 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.52 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.69 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.08 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.59 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.67 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.89 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.60 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.01 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.55 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.68 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.96 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.63 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.67 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.87 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.59 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.86 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.18 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.64 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.24 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.94 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.19 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.11 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.34 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.80 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 50.50 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 50.65 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 51.53 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 52.16 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 52.44 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 52.77 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 53.40 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 53.96 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 54.22 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 54.95 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 55.78 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 56.38 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 56.62 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 56.81 Bfactors> 106 vectors, 13608 coordinates in file. Openam> file on opening on unit 12: bfactors.pred Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000 Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 1.493000 Bfactors> 100 eigenvectors will be considered. Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped. Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed. (CHARMM units assumed for eigenvalues) Bfactors> Correlation= -0.324 for 596 C-alpha atoms. Bfactors> = 0.018 +/- 0.02 Bfactors> = 89.997 +/- 6.66 Bfactors> Shiftng-fct= 89.979 Bfactors> Scaling-fct= 337.824 Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved. Bfactors> Normal end. check_modes Chkmod> Version 1.00, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 260210212714575026.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 260210212714575026.eigenfacs Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4308E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4326E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4329E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4338E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4352E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4354E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 132.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 152.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 167.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 256.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 259.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 271.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 316.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 337.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 350.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 355.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 367.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 373.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 388.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 406.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 412.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 413.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 419.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 422.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 447.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 450.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 462.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 474.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 476.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 478.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 490.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 494.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 497.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 506.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 512.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 513.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 522.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 525.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Frequence du 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Chkmod> That is: 4536 cartesian points. Openam> file on opening on unit 11: Chkmod.res Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file. Chkmod> Normal end. 0.0034 0.9249 0.0034 0.9256 0.0034 0.7659 0.0034 0.8361 0.0034 0.7963 0.0034 0.8722 132.6803 0.7198 152.2926 0.7157 166.9554 0.7464 256.0667 0.7880 258.9969 0.8214 271.6621 0.7732 316.4143 0.3527 337.9472 0.2112 350.6863 0.5631 355.5282 0.2807 367.7548 0.4278 373.1656 0.2069 388.3398 0.2677 406.2942 0.5046 412.0576 0.0643 413.4858 0.1069 419.7125 0.2786 422.9309 0.1980 447.8461 0.5263 450.2094 0.3529 462.8647 0.4135 474.8108 0.3926 476.2985 0.3651 478.7676 0.2705 490.9272 0.4667 494.7551 0.5076 497.3698 0.5536 506.7638 0.3822 512.6626 0.6330 513.0075 0.5200 522.7973 0.4054 525.0479 0.4160 532.5179 0.6117 538.0249 0.6340 548.6584 0.3494 552.1930 0.3186 556.1293 0.7036 563.0825 0.4117 568.2935 0.3048 571.7067 0.1117 574.5868 0.3083 577.0441 0.4289 586.3682 0.3808 590.2763 0.5136 595.6453 0.3663 607.3094 0.4845 614.6429 0.3167 617.8955 0.4048 623.0265 0.3899 635.6729 0.3287 636.9700 0.2603 639.6485 0.4234 643.2330 0.3794 643.8743 0.5590 647.8905 0.3332 654.4094 0.4934 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perturbed structure for DQ=-100 260210212714575026.eigenfacs 260210212714575026.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 260210212714575026.eigenfacs 260210212714575026.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 260210212714575026.eigenfacs 260210212714575026.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 260210212714575026.eigenfacs 260210212714575026.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 260210212714575026.eigenfacs 260210212714575026.atom calculating perturbed structure for DQ=0 260210212714575026.eigenfacs 260210212714575026.atom calculating perturbed structure for DQ=20 260210212714575026.eigenfacs 260210212714575026.atom calculating perturbed structure for DQ=40 260210212714575026.eigenfacs 260210212714575026.atom calculating perturbed structure for DQ=60 260210212714575026.eigenfacs 260210212714575026.atom calculating perturbed structure for DQ=80 260210212714575026.eigenfacs 260210212714575026.atom calculating perturbed structure for DQ=100 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../../bin/get_modes.sh 260210212714575026 9 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 9 calculating perturbed structure for DQ=-100 260210212714575026.eigenfacs 260210212714575026.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 260210212714575026.eigenfacs 260210212714575026.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 260210212714575026.eigenfacs 260210212714575026.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 260210212714575026.eigenfacs 260210212714575026.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 260210212714575026.eigenfacs 260210212714575026.atom calculating perturbed structure for DQ=0 260210212714575026.eigenfacs 260210212714575026.atom calculating perturbed structure for DQ=20 260210212714575026.eigenfacs 260210212714575026.atom calculating perturbed structure for DQ=40 260210212714575026.eigenfacs 260210212714575026.atom calculating perturbed structure for DQ=60 260210212714575026.eigenfacs 260210212714575026.atom 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