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please let us know.
elNémo has been hacked on november 27th.
It has been moved away and runs again.
**Still some additional cleaning from time to time**
Sorry for the inconvenience.


***  L_modelo_19_KELEY  ***

LOGs for ID: 260210213440596232

Output from eigenvector calculation:


STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8) Build Tirion matrix: Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model. Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004. Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file. Pdbmat> Coordinate filename = 260210213440596232.atom Pdbmat> Distance cutoff = 8.00 Force constant = 10.00 Origin of mass values = CONS Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09 PRINTing level = 2 Pdbmat> Coordinate file 260210213440596232.atom to be opened. Openam> File opened: 260210213440596232.atom Pdbmat> Coordinate file in PDB format. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 596 First residue number = 18 Last residue number = 315 Number of atoms found = 4536 Mean number per residue = 7.6 Pdbmat> Coordinate statistics: = 1.162110 +/- 11.514474 From: -26.786000 To: 28.956000 = -0.012675 +/- 18.478706 From: -37.700000 To: 37.458000 = -2.080943 +/- 11.751014 From: -27.853000 To: 26.994000 Pdbmat> Masses are all set to one. Openam> File opened: pdbmat.xyzm Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved. Openam> File opened: pdbmat.sdijb Pdbmat> Matrix statistics: Pdbmat> The matrix is 1.9367 % Filled. Pdbmat> 1793336 non-zero elements. Pdbmat> 196265 atom-atom interactions. Pdbmat> Number per atom= 86.54 +/- 22.79 Maximum number = 131 Minimum number = 19 Pdbmat> Matrix trace = 3.925300E+06 Pdbmat> Larger element = 483.773 Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10 Pdbmat> Normal end. automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1) 596 non-zero elements, NRBL set to 3 Diagonalize Tirion matrix using diagrtb Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation. Diagrtb> Version 2.52, November 2004. Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file. Diagrtb> Options taken into account: MATRix filename = pdbmat.sdijb COORdinates filename = 260210213440596232.atom Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb Nb of VECTors required = 106 EigeNVALues chosen = LOWE Type of SUBStructuring = NONE Nb of residues per BLOck = 3 Origin of MASS values = CONS MATRix FORMat = BINA Temporary files cleaning = ALL Output PRINting level = 2 Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb. Blocpdb> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.xyzm Blocpdb> Coordinate file 260210213440596232.atom to be opened. Openam> file on opening on unit 11: 260210213440596232.atom Blocpdb> Coordinate file in PDB format. Blocpdb> 4536 atoms picked in pdb file. Blocpdb> All masses set to unity. Blocpdb> Coordinate file is rewritten. Blocpdb> Substructuring: Blocpdb> 3 residue(s) per block. Blocpdb> 596 residues. Blocpdb> 22 atoms in block 1 Block first atom: 1 Blocpdb> 25 atoms in block 2 Block first atom: 23 Blocpdb> 22 atoms in block 3 Block first atom: 48 Blocpdb> 25 atoms in block 4 Block first atom: 70 Blocpdb> 23 atoms in block 5 Block first atom: 95 Blocpdb> 29 atoms in block 6 Block first atom: 118 Blocpdb> 25 atoms in block 7 Block first atom: 147 Blocpdb> 25 atoms in block 8 Block first atom: 172 Blocpdb> 25 atoms in block 9 Block first atom: 197 Blocpdb> 27 atoms in block 10 Block first atom: 222 Blocpdb> 27 atoms in block 11 Block first atom: 249 Blocpdb> 20 atoms in block 12 Block first atom: 276 Blocpdb> 19 atoms in block 13 Block first atom: 296 Blocpdb> 23 atoms in block 14 Block first atom: 315 Blocpdb> 31 atoms in block 15 Block first atom: 338 Blocpdb> 19 atoms in block 16 Block first atom: 369 Blocpdb> 17 atoms in block 17 Block first atom: 388 Blocpdb> 21 atoms in block 18 Block first atom: 405 Blocpdb> 20 atoms in block 19 Block first atom: 426 Blocpdb> 28 atoms in block 20 Block first atom: 446 Blocpdb> 13 atoms in block 21 Block first atom: 474 Blocpdb> 29 atoms in block 22 Block first atom: 487 Blocpdb> 19 atoms in block 23 Block first atom: 516 Blocpdb> 24 atoms in block 24 Block first atom: 535 Blocpdb> 18 atoms in block 25 Block first atom: 559 Blocpdb> 24 atoms in block 26 Block first atom: 577 Blocpdb> 29 atoms in block 27 Block first atom: 601 Blocpdb> 16 atoms in block 28 Block first atom: 630 Blocpdb> 28 atoms in block 29 Block first atom: 646 Blocpdb> 19 atoms in block 30 Block first atom: 674 Blocpdb> 25 atoms in block 31 Block first atom: 693 Blocpdb> 22 atoms in block 32 Block first atom: 718 Blocpdb> 31 atoms in block 33 Block first atom: 740 Blocpdb> 24 atoms in block 34 Block first atom: 771 Blocpdb> 21 atoms in block 35 Block first atom: 795 Blocpdb> 29 atoms in block 36 Block first atom: 816 Blocpdb> 18 atoms in block 37 Block first atom: 845 Blocpdb> 21 atoms in block 38 Block first atom: 863 Blocpdb> 19 atoms in block 39 Block first atom: 884 Blocpdb> 26 atoms in block 40 Block first atom: 903 Blocpdb> 22 atoms in block 41 Block first atom: 929 Blocpdb> 20 atoms in block 42 Block first atom: 951 Blocpdb> 20 atoms in block 43 Block first atom: 971 Blocpdb> 18 atoms in block 44 Block first atom: 991 Blocpdb> 17 atoms in block 45 Block first atom: 1009 Blocpdb> 24 atoms in block 46 Block first atom: 1026 Blocpdb> 27 atoms in block 47 Block first atom: 1050 Blocpdb> 19 atoms in block 48 Block first atom: 1077 Blocpdb> 21 atoms in block 49 Block first atom: 1096 Blocpdb> 13 atoms in block 50 Block first atom: 1117 Blocpdb> 19 atoms in block 51 Block first atom: 1130 Blocpdb> 23 atoms in block 52 Block first atom: 1149 Blocpdb> 20 atoms in block 53 Block first atom: 1172 Blocpdb> 20 atoms in block 54 Block first atom: 1192 Blocpdb> 20 atoms in block 55 Block first atom: 1212 Blocpdb> 29 atoms in block 56 Block first atom: 1232 Blocpdb> 24 atoms in block 57 Block first atom: 1261 Blocpdb> 20 atoms in block 58 Block first atom: 1285 Blocpdb> 22 atoms in block 59 Block first atom: 1305 Blocpdb> 20 atoms in block 60 Block first atom: 1327 Blocpdb> 33 atoms in block 61 Block first atom: 1347 Blocpdb> 21 atoms in block 62 Block first atom: 1380 Blocpdb> 27 atoms in block 63 Block first atom: 1401 Blocpdb> 25 atoms in block 64 Block first atom: 1428 Blocpdb> 28 atoms in block 65 Block first atom: 1453 Blocpdb> 28 atoms in block 66 Block first atom: 1481 Blocpdb> 19 atoms in block 67 Block first atom: 1509 Blocpdb> 24 atoms in block 68 Block first atom: 1528 Blocpdb> 26 atoms in block 69 Block first atom: 1552 Blocpdb> 24 atoms in block 70 Block first atom: 1578 Blocpdb> 20 atoms in block 71 Block first atom: 1602 Blocpdb> 20 atoms in block 72 Block first atom: 1622 Blocpdb> 23 atoms in block 73 Block first atom: 1642 Blocpdb> 26 atoms in block 74 Block first atom: 1665 Blocpdb> 19 atoms in block 75 Block first atom: 1691 Blocpdb> 23 atoms in block 76 Block first atom: 1710 Blocpdb> 23 atoms in block 77 Block first atom: 1733 Blocpdb> 25 atoms in block 78 Block first atom: 1756 Blocpdb> 20 atoms in block 79 Block first atom: 1781 Blocpdb> 24 atoms in block 80 Block first atom: 1801 Blocpdb> 17 atoms in block 81 Block first atom: 1825 Blocpdb> 26 atoms in block 82 Block first atom: 1842 Blocpdb> 22 atoms in block 83 Block first atom: 1868 Blocpdb> 22 atoms in block 84 Block first atom: 1890 Blocpdb> 22 atoms in block 85 Block first atom: 1912 Blocpdb> 24 atoms in block 86 Block first atom: 1934 Blocpdb> 23 atoms in block 87 Block first atom: 1958 Blocpdb> 21 atoms in block 88 Block first atom: 1981 Blocpdb> 22 atoms in block 89 Block first atom: 2002 Blocpdb> 24 atoms in block 90 Block first atom: 2024 Blocpdb> 29 atoms in block 91 Block first atom: 2048 Blocpdb> 19 atoms in block 92 Block first atom: 2077 Blocpdb> 19 atoms in block 93 Block first atom: 2096 Blocpdb> 22 atoms in block 94 Block first atom: 2115 Blocpdb> 28 atoms in block 95 Block first atom: 2137 Blocpdb> 23 atoms in block 96 Block first atom: 2165 Blocpdb> 33 atoms in block 97 Block first atom: 2188 Blocpdb> 25 atoms in block 98 Block first atom: 2221 Blocpdb> 19 atoms in block 99 Block first atom: 2246 Blocpdb> 4 atoms in block 100 Block first atom: 2265 Blocpdb> 22 atoms in block 101 Block first atom: 2269 Blocpdb> 25 atoms in block 102 Block first atom: 2291 Blocpdb> 22 atoms in block 103 Block first atom: 2316 Blocpdb> 25 atoms in block 104 Block first atom: 2338 Blocpdb> 23 atoms in block 105 Block first atom: 2363 Blocpdb> 29 atoms in block 106 Block first atom: 2386 Blocpdb> 25 atoms in block 107 Block first atom: 2415 Blocpdb> 25 atoms in block 108 Block first atom: 2440 Blocpdb> 25 atoms in block 109 Block first atom: 2465 Blocpdb> 27 atoms in block 110 Block first atom: 2490 Blocpdb> 27 atoms in block 111 Block first atom: 2517 Blocpdb> 20 atoms in block 112 Block first atom: 2544 Blocpdb> 19 atoms in block 113 Block first atom: 2564 Blocpdb> 23 atoms in block 114 Block first atom: 2583 Blocpdb> 31 atoms in block 115 Block first atom: 2606 Blocpdb> 19 atoms in block 116 Block first atom: 2637 Blocpdb> 17 atoms in block 117 Block first atom: 2656 Blocpdb> 21 atoms in block 118 Block first atom: 2673 Blocpdb> 20 atoms in block 119 Block first atom: 2694 Blocpdb> 28 atoms in block 120 Block first atom: 2714 Blocpdb> 13 atoms in block 121 Block first atom: 2742 Blocpdb> 29 atoms in block 122 Block first atom: 2755 Blocpdb> 19 atoms in block 123 Block first atom: 2784 Blocpdb> 24 atoms in block 124 Block first atom: 2803 Blocpdb> 18 atoms in block 125 Block first atom: 2827 Blocpdb> 24 atoms in block 126 Block first atom: 2845 Blocpdb> 29 atoms in block 127 Block first atom: 2869 Blocpdb> 16 atoms in block 128 Block first atom: 2898 Blocpdb> 28 atoms in block 129 Block first atom: 2914 Blocpdb> 19 atoms in block 130 Block first atom: 2942 Blocpdb> 25 atoms in block 131 Block first atom: 2961 Blocpdb> 22 atoms in block 132 Block first atom: 2986 Blocpdb> 31 atoms in block 133 Block first atom: 3008 Blocpdb> 24 atoms in block 134 Block first atom: 3039 Blocpdb> 21 atoms in block 135 Block first atom: 3063 Blocpdb> 29 atoms in block 136 Block first atom: 3084 Blocpdb> 18 atoms in block 137 Block first atom: 3113 Blocpdb> 21 atoms in block 138 Block first atom: 3131 Blocpdb> 19 atoms in block 139 Block first atom: 3152 Blocpdb> 26 atoms in block 140 Block first atom: 3171 Blocpdb> 22 atoms in block 141 Block first atom: 3197 Blocpdb> 20 atoms in block 142 Block first atom: 3219 Blocpdb> 20 atoms in block 143 Block first atom: 3239 Blocpdb> 18 atoms in block 144 Block first atom: 3259 Blocpdb> 17 atoms in block 145 Block first atom: 3277 Blocpdb> 24 atoms in block 146 Block first atom: 3294 Blocpdb> 27 atoms in block 147 Block first atom: 3318 Blocpdb> 19 atoms in block 148 Block first atom: 3345 Blocpdb> 21 atoms in block 149 Block first atom: 3364 Blocpdb> 13 atoms in block 150 Block first atom: 3385 Blocpdb> 19 atoms in block 151 Block first atom: 3398 Blocpdb> 23 atoms in block 152 Block first atom: 3417 Blocpdb> 20 atoms in block 153 Block first atom: 3440 Blocpdb> 20 atoms in block 154 Block first atom: 3460 Blocpdb> 20 atoms in block 155 Block first atom: 3480 Blocpdb> 29 atoms in block 156 Block first atom: 3500 Blocpdb> 24 atoms in block 157 Block first atom: 3529 Blocpdb> 20 atoms in block 158 Block first atom: 3553 Blocpdb> 22 atoms in block 159 Block first atom: 3573 Blocpdb> 20 atoms in block 160 Block first atom: 3595 Blocpdb> 33 atoms in block 161 Block first atom: 3615 Blocpdb> 21 atoms in block 162 Block first atom: 3648 Blocpdb> 27 atoms in block 163 Block first atom: 3669 Blocpdb> 25 atoms in block 164 Block first atom: 3696 Blocpdb> 28 atoms in block 165 Block first atom: 3721 Blocpdb> 28 atoms in block 166 Block first atom: 3749 Blocpdb> 19 atoms in block 167 Block first atom: 3777 Blocpdb> 24 atoms in block 168 Block first atom: 3796 Blocpdb> 26 atoms in block 169 Block first atom: 3820 Blocpdb> 24 atoms in block 170 Block first atom: 3846 Blocpdb> 20 atoms in block 171 Block first atom: 3870 Blocpdb> 20 atoms in block 172 Block first atom: 3890 Blocpdb> 23 atoms in block 173 Block first atom: 3910 Blocpdb> 26 atoms in block 174 Block first atom: 3933 Blocpdb> 19 atoms in block 175 Block first atom: 3959 Blocpdb> 23 atoms in block 176 Block first atom: 3978 Blocpdb> 23 atoms in block 177 Block first atom: 4001 Blocpdb> 25 atoms in block 178 Block first atom: 4024 Blocpdb> 20 atoms in block 179 Block first atom: 4049 Blocpdb> 24 atoms in block 180 Block first atom: 4069 Blocpdb> 17 atoms in block 181 Block first atom: 4093 Blocpdb> 26 atoms in block 182 Block first atom: 4110 Blocpdb> 22 atoms in block 183 Block first atom: 4136 Blocpdb> 22 atoms in block 184 Block first atom: 4158 Blocpdb> 22 atoms in block 185 Block first atom: 4180 Blocpdb> 24 atoms in block 186 Block first atom: 4202 Blocpdb> 23 atoms in block 187 Block first atom: 4226 Blocpdb> 21 atoms in block 188 Block first atom: 4249 Blocpdb> 22 atoms in block 189 Block first atom: 4270 Blocpdb> 24 atoms in block 190 Block first atom: 4292 Blocpdb> 29 atoms in block 191 Block first atom: 4316 Blocpdb> 19 atoms in block 192 Block first atom: 4345 Blocpdb> 19 atoms in block 193 Block first atom: 4364 Blocpdb> 22 atoms in block 194 Block first atom: 4383 Blocpdb> 28 atoms in block 195 Block first atom: 4405 Blocpdb> 23 atoms in block 196 Block first atom: 4433 Blocpdb> 33 atoms in block 197 Block first atom: 4456 Blocpdb> 25 atoms in block 198 Block first atom: 4489 Blocpdb> 19 atoms in block 199 Block first atom: 4514 Blocpdb> 4 atoms in block 200 Block first atom: 4532 Blocpdb> 200 blocks. Blocpdb> At most, 33 atoms in each of them. Blocpdb> At least, 4 atoms in each of them. Blocpdb> Normal end of Blocpdb. Diagrtb> Memory allocation for Prepmat. Diagrtb> Memory allocation for RTB. Diagrtb> Memory allocation for Diagstd. Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes. Prepmat> Entering in. Prepmat> Rewriting of the matrix begins. Prepmat> 1793536 matrix lines read. Prepmat> Matrix order = 13608 Prepmat> Matrix trace = 3925300.0000 Prepmat> Last element read: 13608 13608 20.2942 Prepmat> 20101 lines saved. Prepmat> 17963 empty lines. Prepmat> Number of lines on output is as expected. Prepmat> Normal end of Prepmat. RTB> Entering in. RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 4536 RTB> Total mass = 4536.0000 RTB> Number of atoms found in matrix: 4536 RTB> Number of blocks = 200 RTB> Projection begins. RTB> Projected matrix is being saved. RTB> Projected matrix trace = 276702.5436 RTB> 73932 non-zero elements. RTB> Normal end of RTB. Diagstd> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.sdijb Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb Diagstd> CERFACS matrix format. Diagstd> Projected matrix order = 1200 Diagstd> Nb of non-zero elements: 73932 Diagstd> Projected matrix trace = 276702.5436 Openam> file on opening on unit 11: diagrtb_work.eigenfacs Diagstd> Diagonalization. Diagstd> 1200 eigenvectors are computed. Diagstd> 106 of them to be saved. Diagstd> Sum of eigenvalues = 276702.5436 Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000 Diagstd> Selected eigenvalues: 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 1.6089127 2.0298042 2.4821495 5.7730162 6.0438235 6.4983821 8.7428062 9.9723912 10.5927808 10.7053970 11.5943423 12.0443799 13.5108427 14.2829968 14.4154746 14.8316883 15.4499813 15.6765457 17.4381062 17.7196478 18.5369667 19.5550350 19.6699873 19.7538232 20.6336607 21.2631330 21.4090852 21.7599876 22.5366615 22.8417708 22.9563746 23.3878252 24.4529364 25.3274060 26.3315603 26.6254565 26.7918077 27.7187746 28.0155136 28.8683921 28.8890241 29.3346876 29.4577044 30.3503687 30.5713479 30.8015608 31.1624079 32.9742647 33.2373856 34.8223390 35.0405971 35.5528661 36.2322529 36.3792742 36.7183244 36.9619523 37.6313361 38.3777047 39.1902941 40.2491125 40.2690418 40.4491465 40.5302570 40.8470157 40.8908503 41.2540598 42.0177844 42.5028994 43.0023439 43.2792493 43.7872788 44.2083146 44.7702094 45.2015116 46.0962508 46.6397076 47.0546238 47.4123052 47.6491158 48.0812490 48.8988784 49.3936474 50.4663748 50.7136578 50.9999117 51.2333125 51.8686734 52.1356342 52.4409203 52.9097960 52.9866655 54.0086961 54.4764335 54.6391637 55.5390778 55.6642794 56.3353881 56.6564084 56.9174033 57.9183439 Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units): 0.0034312 0.0034320 0.0034330 0.0034330 0.0034337 0.0034358 137.7404572 154.7114140 171.0839412 260.9135704 266.9630563 276.8202795 321.0855093 342.9216734 353.4274457 355.3011962 369.7586475 376.8664726 399.1503353 410.3977302 412.2965994 418.2063038 426.8342490 429.9524889 453.4662179 457.1122111 467.5355246 480.2026790 481.6120230 482.6372763 493.2685459 500.7361069 502.4517182 506.5526617 515.5135331 518.9914042 520.2917404 525.1582596 536.9833124 546.5005917 557.2288297 560.3299184 562.0776141 571.7185636 574.7706382 583.4539414 583.6623991 588.1471734 589.3790981 598.2425049 600.4164388 602.6728708 606.1928150 623.5665932 626.0495504 640.8025771 642.8076389 647.4892892 653.6465147 654.9713380 658.0163843 660.1957609 666.1470350 672.7206801 679.8052932 688.9273633 689.0979024 690.6371911 691.3292932 694.0255303 694.3978235 697.4749702 703.9014412 707.9532159 712.1005877 714.3896271 718.5702928 722.0167275 726.5907143 730.0821992 737.2725796 741.6059230 744.8973565 747.7231312 749.5881347 752.9794964 759.3547763 763.1867627 771.4296634 773.3173397 775.4967685 777.2692708 782.0740044 784.0840339 786.3763297 789.8840128 790.4575925 798.0445323 801.4927788 802.6889822 809.2721823 810.1838390 815.0531413 817.3720826 819.2525829 826.4248126 Diagstd> Normal end. Rtb_to_modes> Entering in. Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 4536 Rtb_to_modes> Number of blocs = 200 Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.eigenfacs Openam> file on opening on unit 11: matrix.eigenrtb Rdmodfacs> Entering in. Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Eigenvector number: 1 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9839E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 2 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9883E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 3 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9943E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 4 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9944E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 5 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9984E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 6 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0011E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 7 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.609 Rdmodfacs> Eigenvector number: 8 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.030 Rdmodfacs> Eigenvector number: 9 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.482 Rdmodfacs> Eigenvector number: 10 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.773 Rdmodfacs> Eigenvector number: 11 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.044 Rdmodfacs> Eigenvector number: 12 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.498 Rdmodfacs> Eigenvector number: 13 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.743 Rdmodfacs> Eigenvector number: 14 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.972 Rdmodfacs> Eigenvector number: 15 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.59 Rdmodfacs> Eigenvector number: 16 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.71 Rdmodfacs> Eigenvector number: 17 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.59 Rdmodfacs> Eigenvector number: 18 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.04 Rdmodfacs> Eigenvector number: 19 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.51 Rdmodfacs> Eigenvector number: 20 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.28 Rdmodfacs> Eigenvector number: 21 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.42 Rdmodfacs> Eigenvector number: 22 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.83 Rdmodfacs> Eigenvector number: 23 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.45 Rdmodfacs> Eigenvector number: 24 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.68 Rdmodfacs> Eigenvector number: 25 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.44 Rdmodfacs> Eigenvector number: 26 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.72 Rdmodfacs> Eigenvector number: 27 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.54 Rdmodfacs> Eigenvector number: 28 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.56 Rdmodfacs> Eigenvector number: 29 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.67 Rdmodfacs> Eigenvector number: 30 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.75 Rdmodfacs> Eigenvector number: 31 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.63 Rdmodfacs> Eigenvector number: 32 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.26 Rdmodfacs> Eigenvector number: 33 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.41 Rdmodfacs> Eigenvector number: 34 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.76 Rdmodfacs> Eigenvector number: 35 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.54 Rdmodfacs> Eigenvector number: 36 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.84 Rdmodfacs> Eigenvector number: 37 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.96 Rdmodfacs> Eigenvector number: 38 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.39 Rdmodfacs> Eigenvector number: 39 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.45 Rdmodfacs> Eigenvector number: 40 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.33 Rdmodfacs> Eigenvector number: 41 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.33 Rdmodfacs> Eigenvector number: 42 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.63 Rdmodfacs> Eigenvector number: 43 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.79 Rdmodfacs> Eigenvector number: 44 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.72 Rdmodfacs> Eigenvector number: 45 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 46 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.87 Rdmodfacs> Eigenvector number: 47 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.89 Rdmodfacs> Eigenvector number: 48 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.33 Rdmodfacs> Eigenvector number: 49 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.46 Rdmodfacs> Eigenvector number: 50 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.35 Rdmodfacs> Eigenvector number: 51 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.57 Rdmodfacs> Eigenvector number: 52 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.80 Rdmodfacs> Eigenvector number: 53 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.16 Rdmodfacs> Eigenvector number: 54 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.97 Rdmodfacs> Eigenvector number: 55 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.24 Rdmodfacs> Eigenvector number: 56 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.82 Rdmodfacs> Eigenvector number: 57 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.04 Rdmodfacs> Eigenvector number: 58 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.55 Rdmodfacs> Eigenvector number: 59 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.23 Rdmodfacs> Eigenvector number: 60 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.38 Rdmodfacs> Eigenvector number: 61 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.72 Rdmodfacs> Eigenvector number: 62 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.96 Rdmodfacs> Eigenvector number: 63 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.63 Rdmodfacs> Eigenvector number: 64 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.38 Rdmodfacs> Eigenvector number: 65 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.19 Rdmodfacs> Eigenvector number: 66 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.25 Rdmodfacs> Eigenvector number: 67 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.27 Rdmodfacs> Eigenvector number: 68 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.45 Rdmodfacs> Eigenvector number: 69 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.53 Rdmodfacs> Eigenvector number: 70 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.85 Rdmodfacs> Eigenvector number: 71 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.89 Rdmodfacs> Eigenvector number: 72 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.25 Rdmodfacs> Eigenvector number: 73 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 74 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.50 Rdmodfacs> Eigenvector number: 75 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.00 Rdmodfacs> Eigenvector number: 76 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.28 Rdmodfacs> Eigenvector number: 77 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.79 Rdmodfacs> Eigenvector number: 78 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.21 Rdmodfacs> Eigenvector number: 79 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.77 Rdmodfacs> Eigenvector number: 80 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.20 Rdmodfacs> Eigenvector number: 81 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 82 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.64 Rdmodfacs> Eigenvector number: 83 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 47.05 Rdmodfacs> Eigenvector number: 84 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 47.41 Rdmodfacs> Eigenvector number: 85 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 47.65 Rdmodfacs> Eigenvector number: 86 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 48.08 Rdmodfacs> Eigenvector number: 87 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 48.90 Rdmodfacs> Eigenvector number: 88 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 49.39 Rdmodfacs> Eigenvector number: 89 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 50.47 Rdmodfacs> Eigenvector number: 90 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 50.71 Rdmodfacs> Eigenvector number: 91 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 51.00 Rdmodfacs> Eigenvector number: 92 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 51.23 Rdmodfacs> Eigenvector number: 93 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 51.87 Rdmodfacs> Eigenvector number: 94 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 52.14 Rdmodfacs> Eigenvector number: 95 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 52.44 Rdmodfacs> Eigenvector number: 96 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 52.91 Rdmodfacs> Eigenvector number: 97 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 52.99 Rdmodfacs> Eigenvector number: 98 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 54.01 Rdmodfacs> Eigenvector number: 99 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 54.48 Rdmodfacs> Eigenvector number: 100 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 54.64 Rdmodfacs> Eigenvector number: 101 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 55.54 Rdmodfacs> Eigenvector number: 102 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 55.66 Rdmodfacs> Eigenvector number: 103 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 56.34 Rdmodfacs> Eigenvector number: 104 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 56.66 Rdmodfacs> Eigenvector number: 105 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 56.92 Rdmodfacs> Eigenvector number: 106 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 57.92 Rtb_to_modes> 106 vectors, with 1200 coordinates in vector file. Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected): 1.00000 0.99999 1.00000 0.99999 1.00000 1.00000 1.00000 1.00001 0.99999 1.00001 1.00001 0.99999 1.00004 1.00000 1.00000 1.00002 0.99999 1.00001 0.99999 1.00003 1.00000 0.99998 0.99999 0.99998 0.99997 1.00002 1.00002 1.00000 0.99998 1.00000 0.99999 1.00000 1.00000 1.00002 1.00001 1.00002 0.99999 0.99999 0.99998 1.00000 1.00000 1.00001 0.99999 1.00000 1.00004 0.99999 1.00002 1.00001 0.99999 1.00000 0.99998 0.99997 1.00001 1.00000 0.99998 1.00000 1.00001 1.00000 0.99999 1.00000 0.99999 1.00001 0.99997 0.99998 0.99999 0.99999 1.00001 0.99999 1.00000 0.99997 1.00002 1.00000 1.00000 1.00001 0.99999 1.00001 1.00002 1.00001 0.99998 1.00001 1.00000 0.99999 0.99999 1.00000 1.00003 1.00001 0.99999 1.00002 0.99999 1.00000 0.99999 0.99999 1.00002 1.00003 1.00002 1.00001 0.99999 0.99998 0.99999 1.00001 1.00002 1.00000 1.00000 1.00001 1.00000 1.00001 Rtb_to_modes> RTB block-file is being read. Rtb_to_modes> 81648 lines found in RTB file. Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected): 1.00000 0.99999 1.00000 0.99999 1.00000 1.00000 1.00000 1.00001 0.99999 1.00001 1.00001 0.99999 1.00004 1.00000 1.00000 1.00002 0.99999 1.00001 0.99999 1.00003 1.00000 0.99998 0.99999 0.99998 0.99997 1.00002 1.00002 1.00000 0.99998 1.00000 0.99999 1.00000 1.00000 1.00002 1.00001 1.00002 0.99999 0.99999 0.99998 1.00000 1.00000 1.00001 0.99999 1.00000 1.00004 0.99999 1.00002 1.00001 0.99999 1.00000 0.99998 0.99997 1.00001 1.00000 0.99998 1.00000 1.00001 1.00000 0.99999 1.00000 0.99999 1.00001 0.99997 0.99998 0.99999 0.99999 1.00001 0.99999 1.00000 0.99997 1.00002 1.00000 1.00000 1.00001 0.99999 1.00001 1.00002 1.00001 0.99998 1.00001 1.00000 0.99999 0.99999 1.00000 1.00003 1.00001 0.99999 1.00002 0.99999 1.00000 0.99999 0.99999 1.00002 1.00003 1.00002 1.00001 0.99999 0.99998 0.99999 1.00001 1.00002 1.00000 1.00000 1.00001 1.00000 1.00001 Orthogonality of first eigenvectors (zero expected): Vector 2: 0.000 Vector 3:-0.000 0.000 Vector 4:-0.000-0.000 0.000 Vector 5:-0.000-0.000 0.000 0.000 Vector 6:-0.000-0.000 0.000 0.000 0.000 Vector 7:-0.000-0.000-0.000-0.000 0.000 0.000 Vector 8:-0.000-0.000 0.000 0.000 0.000-0.000-0.000 Vector 9:-0.000-0.000-0.000 0.000 0.000 0.000-0.000 0.000 Vector 10:-0.000 0.000 0.000 0.000-0.000 0.000-0.000-0.000-0.000 Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved. Rtb_to_modes> Normal end. Diagrtb> Normal end. B-factor analysis Bfactors> Version 1.22, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 260210213440596232.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 260210213440596232.eigenfacs Getnam> Corresponding pdb filename ? Getnam> 260210213440596232.atom Openam> file on opening on unit 11: 260210213440596232.atom Getnum> Number of skipped eigenvectors ? Getnum> 0 Getnum> Number of usefull eigenvectors ? Getnum> 10000 %Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 596 First residue number = 18 Last residue number = 315 Number of atoms found = 4536 Mean number per residue = 7.6 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9839E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9883E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9943E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9944E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9984E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0011E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.609 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.030 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.482 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.773 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.044 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.498 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.743 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.972 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.59 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.71 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.59 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.04 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.51 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.28 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.42 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.83 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.45 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.68 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.44 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.72 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.54 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.56 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.67 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.75 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.63 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.26 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.41 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.76 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.54 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.84 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.96 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.39 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.45 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.33 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.33 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.63 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.79 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.72 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.87 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.89 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.33 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.46 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.35 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.57 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.80 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.16 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.97 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.24 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.82 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.04 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.55 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.23 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.38 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.72 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.96 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.63 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.38 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.19 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.25 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.27 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.45 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.53 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.85 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.89 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.25 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.50 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.00 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.28 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.79 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.21 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.77 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.20 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.64 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.05 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.41 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.65 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.08 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.90 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.39 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 50.47 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 50.71 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 51.00 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 51.23 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 51.87 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 52.14 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 52.44 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 52.91 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 52.99 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 54.01 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 54.48 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 54.64 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 55.54 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 55.66 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 56.34 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 56.66 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 56.92 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 57.92 Bfactors> 106 vectors, 13608 coordinates in file. Openam> file on opening on unit 12: bfactors.pred Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000 Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 1.609000 Bfactors> 100 eigenvectors will be considered. Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped. Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed. (CHARMM units assumed for eigenvalues) Bfactors> Correlation= -0.296 for 596 C-alpha atoms. Bfactors> = 0.018 +/- 0.02 Bfactors> = 89.802 +/- 7.19 Bfactors> Shiftng-fct= 89.784 Bfactors> Scaling-fct= 369.573 Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved. Bfactors> Normal end. check_modes Chkmod> Version 1.00, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 260210213440596232.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 260210213440596232.eigenfacs Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4310E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4318E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4328E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4329E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4335E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4357E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 137.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 154.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 171.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 260.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 267.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 276.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 321.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 342.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 353.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 355.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 369.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 376.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 399.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 410.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 412.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 418.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 426.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 430.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 453.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 457.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 467.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 480.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 481.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 482.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 493.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 500.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 502.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 506.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 515.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 518.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 520.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 525.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Frequence du 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Chkmod> That is: 4536 cartesian points. Openam> file on opening on unit 11: Chkmod.res Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file. Chkmod> Normal end. 0.0034 0.8210 0.0034 0.7675 0.0034 0.9864 0.0034 0.7361 0.0034 0.8699 0.0034 0.9565 137.7383 0.7146 154.7122 0.7103 171.0714 0.7439 260.9020 0.7808 266.9555 0.8175 276.8003 0.7829 321.0753 0.3693 342.9002 0.2397 353.3659 0.5254 355.3623 0.3147 369.6735 0.3699 376.7818 0.2079 399.1208 0.2841 410.3371 0.0463 412.3436 0.0636 418.1645 0.3786 426.8162 0.3983 429.9814 0.3140 453.4714 0.3233 457.0971 0.5409 467.5537 0.4712 480.2430 0.4240 481.5915 0.2593 482.5699 0.3605 493.2036 0.4879 500.6777 0.4630 502.4409 0.4770 506.5311 0.3639 515.5296 0.6565 518.9490 0.3160 520.3105 0.5993 525.1601 0.4649 536.9280 0.6110 546.5051 0.7334 557.1884 0.4146 560.3537 0.5181 562.0345 0.4260 571.7067 0.3875 574.7920 0.3858 583.4451 0.3775 583.6472 0.3678 588.0749 0.1340 589.3768 0.5457 598.2132 0.4831 600.3774 0.2887 602.6317 0.4088 606.1434 0.4317 623.4995 0.5502 626.0473 0.4118 640.7535 0.3359 642.7746 0.3720 647.4354 0.6449 653.5981 0.4037 654.9498 0.4913 658.0032 0.5279 660.1500 0.4300 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MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 260210213440596232.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 260210213440596232.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 8 running: ../../bin/get_modes.sh 260210213440596232 8 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 8 calculating perturbed structure for DQ=-100 260210213440596232.eigenfacs 260210213440596232.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 260210213440596232.eigenfacs 260210213440596232.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 260210213440596232.eigenfacs 260210213440596232.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 260210213440596232.eigenfacs 260210213440596232.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 260210213440596232.eigenfacs 260210213440596232.atom calculating perturbed structure for DQ=0 260210213440596232.eigenfacs 260210213440596232.atom calculating perturbed structure for DQ=20 260210213440596232.eigenfacs 260210213440596232.atom calculating perturbed structure for DQ=40 260210213440596232.eigenfacs 260210213440596232.atom calculating perturbed structure for DQ=60 260210213440596232.eigenfacs 260210213440596232.atom calculating perturbed structure for DQ=80 260210213440596232.eigenfacs 260210213440596232.atom calculating perturbed structure for DQ=100 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../../bin/get_modes.sh 260210213440596232 9 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 9 calculating perturbed structure for DQ=-100 260210213440596232.eigenfacs 260210213440596232.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 260210213440596232.eigenfacs 260210213440596232.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 260210213440596232.eigenfacs 260210213440596232.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 260210213440596232.eigenfacs 260210213440596232.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 260210213440596232.eigenfacs 260210213440596232.atom calculating perturbed structure for DQ=0 260210213440596232.eigenfacs 260210213440596232.atom calculating perturbed structure for DQ=20 260210213440596232.eigenfacs 260210213440596232.atom calculating perturbed structure for DQ=40 260210213440596232.eigenfacs 260210213440596232.atom calculating perturbed structure for DQ=60 260210213440596232.eigenfacs 260210213440596232.atom 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