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please let us know.
elNémo has been hacked on november 27th.
It has been moved away and runs again.
**Still some additional cleaning from time to time**
Sorry for the inconvenience.


***  L_modelo_21_KELEY  ***

LOGs for ID: 260210213459596985

Output from eigenvector calculation:


STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8) Build Tirion matrix: Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model. Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004. Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file. Pdbmat> Coordinate filename = 260210213459596985.atom Pdbmat> Distance cutoff = 8.00 Force constant = 10.00 Origin of mass values = CONS Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09 PRINTing level = 2 Pdbmat> Coordinate file 260210213459596985.atom to be opened. Openam> File opened: 260210213459596985.atom Pdbmat> Coordinate file in PDB format. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 596 First residue number = 18 Last residue number = 315 Number of atoms found = 4536 Mean number per residue = 7.6 Pdbmat> Coordinate statistics: = 0.963116 +/- 10.810949 From: -26.516000 To: 25.796000 = -0.333411 +/- 11.863145 From: -26.836000 To: 33.161000 = -2.503470 +/- 21.015698 From: -44.407000 To: 39.837000 Pdbmat> Masses are all set to one. Openam> File opened: pdbmat.xyzm Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved. Openam> File opened: pdbmat.sdijb Pdbmat> Matrix statistics: Pdbmat> The matrix is 1.9203 % Filled. Pdbmat> 1778069 non-zero elements. Pdbmat> 194572 atom-atom interactions. Pdbmat> Number per atom= 85.79 +/- 22.89 Maximum number = 131 Minimum number = 17 Pdbmat> Matrix trace = 3.891440E+06 Pdbmat> Larger element = 503.544 Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10 Pdbmat> Normal end. automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1) 596 non-zero elements, NRBL set to 3 Diagonalize Tirion matrix using diagrtb Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation. Diagrtb> Version 2.52, November 2004. Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file. Diagrtb> Options taken into account: MATRix filename = pdbmat.sdijb COORdinates filename = 260210213459596985.atom Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb Nb of VECTors required = 106 EigeNVALues chosen = LOWE Type of SUBStructuring = NONE Nb of residues per BLOck = 3 Origin of MASS values = CONS MATRix FORMat = BINA Temporary files cleaning = ALL Output PRINting level = 2 Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb. Blocpdb> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.xyzm Blocpdb> Coordinate file 260210213459596985.atom to be opened. Openam> file on opening on unit 11: 260210213459596985.atom Blocpdb> Coordinate file in PDB format. Blocpdb> 4536 atoms picked in pdb file. Blocpdb> All masses set to unity. Blocpdb> Coordinate file is rewritten. Blocpdb> Substructuring: Blocpdb> 3 residue(s) per block. Blocpdb> 596 residues. Blocpdb> 22 atoms in block 1 Block first atom: 1 Blocpdb> 25 atoms in block 2 Block first atom: 23 Blocpdb> 22 atoms in block 3 Block first atom: 48 Blocpdb> 25 atoms in block 4 Block first atom: 70 Blocpdb> 23 atoms in block 5 Block first atom: 95 Blocpdb> 29 atoms in block 6 Block first atom: 118 Blocpdb> 25 atoms in block 7 Block first atom: 147 Blocpdb> 25 atoms in block 8 Block first atom: 172 Blocpdb> 25 atoms in block 9 Block first atom: 197 Blocpdb> 27 atoms in block 10 Block first atom: 222 Blocpdb> 27 atoms in block 11 Block first atom: 249 Blocpdb> 20 atoms in block 12 Block first atom: 276 Blocpdb> 19 atoms in block 13 Block first atom: 296 Blocpdb> 23 atoms in block 14 Block first atom: 315 Blocpdb> 31 atoms in block 15 Block first atom: 338 Blocpdb> 19 atoms in block 16 Block first atom: 369 Blocpdb> 17 atoms in block 17 Block first atom: 388 Blocpdb> 21 atoms in block 18 Block first atom: 405 Blocpdb> 20 atoms in block 19 Block first atom: 426 Blocpdb> 28 atoms in block 20 Block first atom: 446 Blocpdb> 13 atoms in block 21 Block first atom: 474 Blocpdb> 29 atoms in block 22 Block first atom: 487 Blocpdb> 19 atoms in block 23 Block first atom: 516 Blocpdb> 24 atoms in block 24 Block first atom: 535 Blocpdb> 18 atoms in block 25 Block first atom: 559 Blocpdb> 24 atoms in block 26 Block first atom: 577 Blocpdb> 29 atoms in block 27 Block first atom: 601 Blocpdb> 16 atoms in block 28 Block first atom: 630 Blocpdb> 28 atoms in block 29 Block first atom: 646 Blocpdb> 19 atoms in block 30 Block first atom: 674 Blocpdb> 25 atoms in block 31 Block first atom: 693 Blocpdb> 22 atoms in block 32 Block first atom: 718 Blocpdb> 31 atoms in block 33 Block first atom: 740 Blocpdb> 24 atoms in block 34 Block first atom: 771 Blocpdb> 21 atoms in block 35 Block first atom: 795 Blocpdb> 29 atoms in block 36 Block first atom: 816 Blocpdb> 18 atoms in block 37 Block first atom: 845 Blocpdb> 21 atoms in block 38 Block first atom: 863 Blocpdb> 19 atoms in block 39 Block first atom: 884 Blocpdb> 26 atoms in block 40 Block first atom: 903 Blocpdb> 22 atoms in block 41 Block first atom: 929 Blocpdb> 20 atoms in block 42 Block first atom: 951 Blocpdb> 20 atoms in block 43 Block first atom: 971 Blocpdb> 18 atoms in block 44 Block first atom: 991 Blocpdb> 17 atoms in block 45 Block first atom: 1009 Blocpdb> 24 atoms in block 46 Block first atom: 1026 Blocpdb> 27 atoms in block 47 Block first atom: 1050 Blocpdb> 19 atoms in block 48 Block first atom: 1077 Blocpdb> 21 atoms in block 49 Block first atom: 1096 Blocpdb> 13 atoms in block 50 Block first atom: 1117 Blocpdb> 19 atoms in block 51 Block first atom: 1130 Blocpdb> 23 atoms in block 52 Block first atom: 1149 Blocpdb> 20 atoms in block 53 Block first atom: 1172 Blocpdb> 20 atoms in block 54 Block first atom: 1192 Blocpdb> 20 atoms in block 55 Block first atom: 1212 Blocpdb> 29 atoms in block 56 Block first atom: 1232 Blocpdb> 24 atoms in block 57 Block first atom: 1261 Blocpdb> 20 atoms in block 58 Block first atom: 1285 Blocpdb> 22 atoms in block 59 Block first atom: 1305 Blocpdb> 20 atoms in block 60 Block first atom: 1327 Blocpdb> 33 atoms in block 61 Block first atom: 1347 Blocpdb> 21 atoms in block 62 Block first atom: 1380 Blocpdb> 27 atoms in block 63 Block first atom: 1401 Blocpdb> 25 atoms in block 64 Block first atom: 1428 Blocpdb> 28 atoms in block 65 Block first atom: 1453 Blocpdb> 28 atoms in block 66 Block first atom: 1481 Blocpdb> 19 atoms in block 67 Block first atom: 1509 Blocpdb> 24 atoms in block 68 Block first atom: 1528 Blocpdb> 26 atoms in block 69 Block first atom: 1552 Blocpdb> 24 atoms in block 70 Block first atom: 1578 Blocpdb> 20 atoms in block 71 Block first atom: 1602 Blocpdb> 20 atoms in block 72 Block first atom: 1622 Blocpdb> 23 atoms in block 73 Block first atom: 1642 Blocpdb> 26 atoms in block 74 Block first atom: 1665 Blocpdb> 19 atoms in block 75 Block first atom: 1691 Blocpdb> 23 atoms in block 76 Block first atom: 1710 Blocpdb> 23 atoms in block 77 Block first atom: 1733 Blocpdb> 25 atoms in block 78 Block first atom: 1756 Blocpdb> 20 atoms in block 79 Block first atom: 1781 Blocpdb> 24 atoms in block 80 Block first atom: 1801 Blocpdb> 17 atoms in block 81 Block first atom: 1825 Blocpdb> 26 atoms in block 82 Block first atom: 1842 Blocpdb> 22 atoms in block 83 Block first atom: 1868 Blocpdb> 22 atoms in block 84 Block first atom: 1890 Blocpdb> 22 atoms in block 85 Block first atom: 1912 Blocpdb> 24 atoms in block 86 Block first atom: 1934 Blocpdb> 23 atoms in block 87 Block first atom: 1958 Blocpdb> 21 atoms in block 88 Block first atom: 1981 Blocpdb> 22 atoms in block 89 Block first atom: 2002 Blocpdb> 24 atoms in block 90 Block first atom: 2024 Blocpdb> 29 atoms in block 91 Block first atom: 2048 Blocpdb> 19 atoms in block 92 Block first atom: 2077 Blocpdb> 19 atoms in block 93 Block first atom: 2096 Blocpdb> 22 atoms in block 94 Block first atom: 2115 Blocpdb> 28 atoms in block 95 Block first atom: 2137 Blocpdb> 23 atoms in block 96 Block first atom: 2165 Blocpdb> 33 atoms in block 97 Block first atom: 2188 Blocpdb> 25 atoms in block 98 Block first atom: 2221 Blocpdb> 19 atoms in block 99 Block first atom: 2246 Blocpdb> 4 atoms in block 100 Block first atom: 2265 Blocpdb> 22 atoms in block 101 Block first atom: 2269 Blocpdb> 25 atoms in block 102 Block first atom: 2291 Blocpdb> 22 atoms in block 103 Block first atom: 2316 Blocpdb> 25 atoms in block 104 Block first atom: 2338 Blocpdb> 23 atoms in block 105 Block first atom: 2363 Blocpdb> 29 atoms in block 106 Block first atom: 2386 Blocpdb> 25 atoms in block 107 Block first atom: 2415 Blocpdb> 25 atoms in block 108 Block first atom: 2440 Blocpdb> 25 atoms in block 109 Block first atom: 2465 Blocpdb> 27 atoms in block 110 Block first atom: 2490 Blocpdb> 27 atoms in block 111 Block first atom: 2517 Blocpdb> 20 atoms in block 112 Block first atom: 2544 Blocpdb> 19 atoms in block 113 Block first atom: 2564 Blocpdb> 23 atoms in block 114 Block first atom: 2583 Blocpdb> 31 atoms in block 115 Block first atom: 2606 Blocpdb> 19 atoms in block 116 Block first atom: 2637 Blocpdb> 17 atoms in block 117 Block first atom: 2656 Blocpdb> 21 atoms in block 118 Block first atom: 2673 Blocpdb> 20 atoms in block 119 Block first atom: 2694 Blocpdb> 28 atoms in block 120 Block first atom: 2714 Blocpdb> 13 atoms in block 121 Block first atom: 2742 Blocpdb> 29 atoms in block 122 Block first atom: 2755 Blocpdb> 19 atoms in block 123 Block first atom: 2784 Blocpdb> 24 atoms in block 124 Block first atom: 2803 Blocpdb> 18 atoms in block 125 Block first atom: 2827 Blocpdb> 24 atoms in block 126 Block first atom: 2845 Blocpdb> 29 atoms in block 127 Block first atom: 2869 Blocpdb> 16 atoms in block 128 Block first atom: 2898 Blocpdb> 28 atoms in block 129 Block first atom: 2914 Blocpdb> 19 atoms in block 130 Block first atom: 2942 Blocpdb> 25 atoms in block 131 Block first atom: 2961 Blocpdb> 22 atoms in block 132 Block first atom: 2986 Blocpdb> 31 atoms in block 133 Block first atom: 3008 Blocpdb> 24 atoms in block 134 Block first atom: 3039 Blocpdb> 21 atoms in block 135 Block first atom: 3063 Blocpdb> 29 atoms in block 136 Block first atom: 3084 Blocpdb> 18 atoms in block 137 Block first atom: 3113 Blocpdb> 21 atoms in block 138 Block first atom: 3131 Blocpdb> 19 atoms in block 139 Block first atom: 3152 Blocpdb> 26 atoms in block 140 Block first atom: 3171 Blocpdb> 22 atoms in block 141 Block first atom: 3197 Blocpdb> 20 atoms in block 142 Block first atom: 3219 Blocpdb> 20 atoms in block 143 Block first atom: 3239 Blocpdb> 18 atoms in block 144 Block first atom: 3259 Blocpdb> 17 atoms in block 145 Block first atom: 3277 Blocpdb> 24 atoms in block 146 Block first atom: 3294 Blocpdb> 27 atoms in block 147 Block first atom: 3318 Blocpdb> 19 atoms in block 148 Block first atom: 3345 Blocpdb> 21 atoms in block 149 Block first atom: 3364 Blocpdb> 13 atoms in block 150 Block first atom: 3385 Blocpdb> 19 atoms in block 151 Block first atom: 3398 Blocpdb> 23 atoms in block 152 Block first atom: 3417 Blocpdb> 20 atoms in block 153 Block first atom: 3440 Blocpdb> 20 atoms in block 154 Block first atom: 3460 Blocpdb> 20 atoms in block 155 Block first atom: 3480 Blocpdb> 29 atoms in block 156 Block first atom: 3500 Blocpdb> 24 atoms in block 157 Block first atom: 3529 Blocpdb> 20 atoms in block 158 Block first atom: 3553 Blocpdb> 22 atoms in block 159 Block first atom: 3573 Blocpdb> 20 atoms in block 160 Block first atom: 3595 Blocpdb> 33 atoms in block 161 Block first atom: 3615 Blocpdb> 21 atoms in block 162 Block first atom: 3648 Blocpdb> 27 atoms in block 163 Block first atom: 3669 Blocpdb> 25 atoms in block 164 Block first atom: 3696 Blocpdb> 28 atoms in block 165 Block first atom: 3721 Blocpdb> 28 atoms in block 166 Block first atom: 3749 Blocpdb> 19 atoms in block 167 Block first atom: 3777 Blocpdb> 24 atoms in block 168 Block first atom: 3796 Blocpdb> 26 atoms in block 169 Block first atom: 3820 Blocpdb> 24 atoms in block 170 Block first atom: 3846 Blocpdb> 20 atoms in block 171 Block first atom: 3870 Blocpdb> 20 atoms in block 172 Block first atom: 3890 Blocpdb> 23 atoms in block 173 Block first atom: 3910 Blocpdb> 26 atoms in block 174 Block first atom: 3933 Blocpdb> 19 atoms in block 175 Block first atom: 3959 Blocpdb> 23 atoms in block 176 Block first atom: 3978 Blocpdb> 23 atoms in block 177 Block first atom: 4001 Blocpdb> 25 atoms in block 178 Block first atom: 4024 Blocpdb> 20 atoms in block 179 Block first atom: 4049 Blocpdb> 24 atoms in block 180 Block first atom: 4069 Blocpdb> 17 atoms in block 181 Block first atom: 4093 Blocpdb> 26 atoms in block 182 Block first atom: 4110 Blocpdb> 22 atoms in block 183 Block first atom: 4136 Blocpdb> 22 atoms in block 184 Block first atom: 4158 Blocpdb> 22 atoms in block 185 Block first atom: 4180 Blocpdb> 24 atoms in block 186 Block first atom: 4202 Blocpdb> 23 atoms in block 187 Block first atom: 4226 Blocpdb> 21 atoms in block 188 Block first atom: 4249 Blocpdb> 22 atoms in block 189 Block first atom: 4270 Blocpdb> 24 atoms in block 190 Block first atom: 4292 Blocpdb> 29 atoms in block 191 Block first atom: 4316 Blocpdb> 19 atoms in block 192 Block first atom: 4345 Blocpdb> 19 atoms in block 193 Block first atom: 4364 Blocpdb> 22 atoms in block 194 Block first atom: 4383 Blocpdb> 28 atoms in block 195 Block first atom: 4405 Blocpdb> 23 atoms in block 196 Block first atom: 4433 Blocpdb> 33 atoms in block 197 Block first atom: 4456 Blocpdb> 25 atoms in block 198 Block first atom: 4489 Blocpdb> 19 atoms in block 199 Block first atom: 4514 Blocpdb> 4 atoms in block 200 Block first atom: 4532 Blocpdb> 200 blocks. Blocpdb> At most, 33 atoms in each of them. Blocpdb> At least, 4 atoms in each of them. Blocpdb> Normal end of Blocpdb. Diagrtb> Memory allocation for Prepmat. Diagrtb> Memory allocation for RTB. Diagrtb> Memory allocation for Diagstd. Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes. Prepmat> Entering in. Prepmat> Rewriting of the matrix begins. Prepmat> 1778269 matrix lines read. Prepmat> Matrix order = 13608 Prepmat> Matrix trace = 3891440.0000 Prepmat> Last element read: 13608 13608 148.7497 Prepmat> 20101 lines saved. Prepmat> 17991 empty lines. Prepmat> Number of lines on output is as expected. Prepmat> Normal end of Prepmat. RTB> Entering in. RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 4536 RTB> Total mass = 4536.0000 RTB> Number of atoms found in matrix: 4536 RTB> Number of blocks = 200 RTB> Projection begins. RTB> Projected matrix is being saved. RTB> Projected matrix trace = 273682.8985 RTB> 72924 non-zero elements. RTB> Normal end of RTB. Diagstd> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.sdijb Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb Diagstd> CERFACS matrix format. Diagstd> Projected matrix order = 1200 Diagstd> Nb of non-zero elements: 72924 Diagstd> Projected matrix trace = 273682.8985 Openam> file on opening on unit 11: diagrtb_work.eigenfacs Diagstd> Diagonalization. Diagstd> 1200 eigenvectors are computed. Diagstd> 106 of them to be saved. Diagstd> Sum of eigenvalues = 273682.8985 Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000 Diagstd> Selected eigenvalues: 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.8736849 0.9274256 1.8531218 3.6914093 4.3332683 4.9961616 8.5176606 8.7030309 9.7822382 10.0437504 11.4892508 12.2443831 13.2157956 13.5090514 14.1927061 14.2175113 15.2860651 15.3581740 16.6078870 16.9256026 17.8716271 18.1610894 18.2052781 18.6950416 19.1467562 20.5093955 20.5402323 21.4032829 22.3816192 22.5588142 22.7328261 23.0286069 23.2651990 23.4857665 25.0737440 25.6223737 26.2144105 26.9865557 27.7929663 27.9930431 28.5123330 29.1095621 29.1642465 30.3334204 30.8771611 31.6516578 31.8857075 32.0061721 32.6163483 33.0213016 33.6713718 33.8599582 34.0630120 34.8572758 35.2286002 35.7075923 36.6966571 36.9199355 37.6167941 38.1107578 38.1597488 38.6641437 39.2489665 39.9040983 40.0888696 40.5771098 41.1807861 41.4281116 41.5462060 41.8827190 42.0849102 42.6403311 42.8545318 43.4403903 43.7817747 44.1980352 45.4821924 45.5815279 45.7332140 46.4293214 47.2238372 47.9801107 48.1603290 48.6174994 48.9754169 49.1938476 49.8082902 50.4075065 50.5940347 50.9350245 51.1904907 52.2292040 52.6450581 52.9362019 53.8241630 54.7693602 54.8342464 55.1762381 55.2423922 55.7364810 Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units): 0.0034319 0.0034322 0.0034343 0.0034345 0.0034348 0.0034361 101.5015544 104.5766735 147.8247886 208.6370259 226.0492500 242.7244471 316.9242316 320.3542892 339.6365319 344.1464041 368.0790807 379.9826210 394.7679951 399.1238752 409.0984977 409.4558414 424.5639678 425.5641854 442.5399386 446.7528684 459.0683240 462.7710983 463.3337533 469.5247583 475.1632933 491.7809604 492.1505290 502.3836264 513.7372199 515.7668365 517.7522501 521.1096480 523.7797044 526.2567136 543.7570160 549.6737039 555.9878850 564.1167687 572.4831788 574.5400878 579.8446541 585.8859946 586.4360506 598.0754457 603.4120273 610.9328970 613.1875229 614.3447458 620.1731341 624.0111854 630.1235125 631.8856444 633.7774814 641.1239513 644.5297585 648.8966981 657.8222091 659.8204131 666.0183123 670.3769490 670.8076915 675.2265002 680.3139763 685.9682758 687.5545898 691.7287643 696.8552827 698.9447528 699.9402450 702.7691918 704.4634782 709.0968632 710.8756816 715.7183296 718.5251284 721.9327799 732.3454301 733.1447343 734.3636000 739.9313845 746.2355192 752.1871385 753.5984610 757.1668453 759.9488306 761.6416340 766.3834139 770.9796012 772.4047528 775.0032792 776.9443746 784.7873317 787.9054146 790.0810938 796.6800152 803.6447542 804.1206590 806.6243422 807.1077525 810.7091097 Diagstd> Normal end. Rtb_to_modes> Entering in. Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 4536 Rtb_to_modes> Number of blocs = 200 Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.eigenfacs Openam> file on opening on unit 11: matrix.eigenrtb Rdmodfacs> Entering in. Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Eigenvector number: 1 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9881E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 2 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9898E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 3 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0002E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 4 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0003E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 5 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0005E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 6 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0013E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 7 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.8737 Rdmodfacs> Eigenvector number: 8 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.9274 Rdmodfacs> Eigenvector number: 9 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.853 Rdmodfacs> Eigenvector number: 10 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.691 Rdmodfacs> Eigenvector number: 11 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.333 Rdmodfacs> Eigenvector number: 12 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.996 Rdmodfacs> Eigenvector number: 13 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.518 Rdmodfacs> Eigenvector number: 14 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.703 Rdmodfacs> Eigenvector number: 15 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.782 Rdmodfacs> Eigenvector number: 16 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.04 Rdmodfacs> Eigenvector number: 17 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.49 Rdmodfacs> Eigenvector number: 18 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.24 Rdmodfacs> Eigenvector number: 19 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.22 Rdmodfacs> Eigenvector number: 20 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.51 Rdmodfacs> Eigenvector number: 21 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.19 Rdmodfacs> Eigenvector number: 22 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.22 Rdmodfacs> Eigenvector number: 23 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.29 Rdmodfacs> Eigenvector number: 24 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.36 Rdmodfacs> Eigenvector number: 25 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.61 Rdmodfacs> Eigenvector number: 26 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.93 Rdmodfacs> Eigenvector number: 27 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.87 Rdmodfacs> Eigenvector number: 28 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.16 Rdmodfacs> Eigenvector number: 29 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.21 Rdmodfacs> Eigenvector number: 30 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.70 Rdmodfacs> Eigenvector number: 31 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.15 Rdmodfacs> Eigenvector number: 32 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.51 Rdmodfacs> Eigenvector number: 33 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.54 Rdmodfacs> Eigenvector number: 34 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.40 Rdmodfacs> Eigenvector number: 35 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.38 Rdmodfacs> Eigenvector number: 36 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.56 Rdmodfacs> Eigenvector number: 37 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.73 Rdmodfacs> Eigenvector number: 38 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.03 Rdmodfacs> Eigenvector number: 39 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.27 Rdmodfacs> Eigenvector number: 40 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.49 Rdmodfacs> Eigenvector number: 41 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.07 Rdmodfacs> Eigenvector number: 42 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.62 Rdmodfacs> Eigenvector number: 43 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.21 Rdmodfacs> Eigenvector number: 44 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.99 Rdmodfacs> Eigenvector number: 45 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.79 Rdmodfacs> Eigenvector number: 46 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.99 Rdmodfacs> Eigenvector number: 47 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.51 Rdmodfacs> Eigenvector number: 48 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.11 Rdmodfacs> Eigenvector number: 49 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.16 Rdmodfacs> Eigenvector number: 50 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.33 Rdmodfacs> Eigenvector number: 51 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.88 Rdmodfacs> Eigenvector number: 52 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.65 Rdmodfacs> Eigenvector number: 53 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.89 Rdmodfacs> Eigenvector number: 54 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.01 Rdmodfacs> Eigenvector number: 55 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.62 Rdmodfacs> Eigenvector number: 56 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 57 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.67 Rdmodfacs> Eigenvector number: 58 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.86 Rdmodfacs> Eigenvector number: 59 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.06 Rdmodfacs> Eigenvector number: 60 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.86 Rdmodfacs> Eigenvector number: 61 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.23 Rdmodfacs> Eigenvector number: 62 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.71 Rdmodfacs> Eigenvector number: 63 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.70 Rdmodfacs> Eigenvector number: 64 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.92 Rdmodfacs> Eigenvector number: 65 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.62 Rdmodfacs> Eigenvector number: 66 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.11 Rdmodfacs> Eigenvector number: 67 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.16 Rdmodfacs> Eigenvector number: 68 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.66 Rdmodfacs> Eigenvector number: 69 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.25 Rdmodfacs> Eigenvector number: 70 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.90 Rdmodfacs> Eigenvector number: 71 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 72 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.58 Rdmodfacs> Eigenvector number: 73 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.18 Rdmodfacs> Eigenvector number: 74 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.43 Rdmodfacs> Eigenvector number: 75 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.55 Rdmodfacs> Eigenvector number: 76 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.88 Rdmodfacs> Eigenvector number: 77 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.08 Rdmodfacs> Eigenvector number: 78 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.64 Rdmodfacs> Eigenvector number: 79 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.85 Rdmodfacs> Eigenvector number: 80 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.44 Rdmodfacs> Eigenvector number: 81 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.78 Rdmodfacs> Eigenvector number: 82 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.20 Rdmodfacs> Eigenvector number: 83 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.48 Rdmodfacs> Eigenvector number: 84 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.58 Rdmodfacs> Eigenvector number: 85 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.73 Rdmodfacs> Eigenvector number: 86 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.43 Rdmodfacs> Eigenvector number: 87 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 47.22 Rdmodfacs> Eigenvector number: 88 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 47.98 Rdmodfacs> Eigenvector number: 89 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 48.16 Rdmodfacs> Eigenvector number: 90 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 48.62 Rdmodfacs> Eigenvector number: 91 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 48.98 Rdmodfacs> Eigenvector number: 92 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 49.19 Rdmodfacs> Eigenvector number: 93 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 49.81 Rdmodfacs> Eigenvector number: 94 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 50.41 Rdmodfacs> Eigenvector number: 95 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 50.59 Rdmodfacs> Eigenvector number: 96 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 50.94 Rdmodfacs> Eigenvector number: 97 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 51.19 Rdmodfacs> Eigenvector number: 98 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 52.23 Rdmodfacs> Eigenvector number: 99 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 52.65 Rdmodfacs> Eigenvector number: 100 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 52.94 Rdmodfacs> Eigenvector number: 101 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 53.82 Rdmodfacs> Eigenvector number: 102 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 54.77 Rdmodfacs> Eigenvector number: 103 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 54.83 Rdmodfacs> Eigenvector number: 104 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 55.18 Rdmodfacs> Eigenvector number: 105 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 55.24 Rdmodfacs> Eigenvector number: 106 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 55.74 Rtb_to_modes> 106 vectors, with 1200 coordinates in vector file. Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected): 0.99998 1.00000 1.00000 0.99999 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00001 0.99998 0.99998 0.99999 1.00000 0.99997 1.00002 1.00002 1.00000 1.00000 1.00000 1.00001 1.00000 1.00003 1.00000 1.00003 0.99998 1.00001 1.00000 1.00002 1.00000 1.00001 1.00002 1.00000 1.00001 1.00001 0.99999 1.00001 0.99999 0.99999 1.00001 1.00000 0.99999 1.00000 1.00001 1.00002 0.99999 1.00000 1.00001 1.00001 1.00000 1.00001 1.00000 1.00003 1.00002 1.00000 0.99998 0.99999 1.00000 1.00002 0.99999 0.99996 0.99997 1.00000 1.00000 1.00000 1.00001 0.99998 0.99999 1.00003 1.00001 1.00001 1.00000 0.99999 1.00000 1.00001 1.00004 1.00001 0.99997 1.00001 0.99998 1.00000 1.00002 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00001 1.00000 1.00000 1.00001 1.00000 0.99999 1.00001 1.00002 0.99998 0.99998 1.00001 1.00000 1.00001 1.00001 1.00001 1.00003 0.99998 0.99999 Rtb_to_modes> RTB block-file is being read. Rtb_to_modes> 81648 lines found in RTB file. Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected): 0.99998 1.00000 1.00000 0.99999 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00001 0.99998 0.99998 0.99999 1.00000 0.99997 1.00002 1.00002 1.00000 1.00000 1.00000 1.00001 1.00000 1.00003 1.00000 1.00003 0.99998 1.00001 1.00000 1.00002 1.00000 1.00001 1.00002 1.00000 1.00001 1.00001 0.99999 1.00001 0.99999 0.99999 1.00001 1.00000 0.99999 1.00000 1.00001 1.00002 0.99999 1.00000 1.00001 1.00001 1.00000 1.00001 1.00000 1.00003 1.00002 1.00000 0.99998 0.99999 1.00000 1.00002 0.99999 0.99996 0.99997 1.00000 1.00000 1.00000 1.00001 0.99998 0.99999 1.00003 1.00001 1.00001 1.00000 0.99999 1.00000 1.00001 1.00004 1.00001 0.99997 1.00001 0.99998 1.00000 1.00002 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00001 1.00000 1.00000 1.00001 1.00000 0.99999 1.00001 1.00002 0.99998 0.99998 1.00001 1.00000 1.00001 1.00001 1.00001 1.00003 0.99998 0.99999 Orthogonality of first eigenvectors (zero expected): Vector 2:-0.000 Vector 3: 0.000 0.000 Vector 4:-0.000-0.000 0.000 Vector 5:-0.000-0.000 0.000 0.000 Vector 6:-0.000-0.000 0.000-0.000 0.000 Vector 7:-0.000-0.000 0.000 0.000-0.000-0.000 Vector 8: 0.000-0.000 0.000 0.000-0.000-0.000 0.000 Vector 9: 0.000 0.000-0.000 0.000-0.000 0.000-0.000-0.000 Vector 10: 0.000-0.000 0.000 0.000 0.000-0.000-0.000-0.000 0.000 Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved. Rtb_to_modes> Normal end. Diagrtb> Normal end. B-factor analysis Bfactors> Version 1.22, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 260210213459596985.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 260210213459596985.eigenfacs Getnam> Corresponding pdb filename ? Getnam> 260210213459596985.atom Openam> file on opening on unit 11: 260210213459596985.atom Getnum> Number of skipped eigenvectors ? Getnum> 0 Getnum> Number of usefull eigenvectors ? Getnum> 10000 %Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 596 First residue number = 18 Last residue number = 315 Number of atoms found = 4536 Mean number per residue = 7.6 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9881E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9898E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0002E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0003E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0005E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0013E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.8737 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.9274 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.853 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.691 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.333 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.996 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.518 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.703 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.782 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.04 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.49 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.24 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.22 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.51 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.19 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.22 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.29 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.36 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.61 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.93 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.87 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.16 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.21 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.70 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.15 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.51 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.54 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.40 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.38 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.56 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.73 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.27 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.49 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.07 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.62 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.21 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.99 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.79 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.99 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.51 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.11 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.16 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.33 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.88 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.65 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.89 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.01 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.62 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.67 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.86 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.06 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.86 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.23 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.71 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.70 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.92 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.62 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.11 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.16 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.66 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.25 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.90 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.58 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.18 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.43 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.55 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.88 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.08 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.64 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.85 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.44 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.78 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.20 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.48 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.58 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.73 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.43 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.22 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.98 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.16 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.62 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.98 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.19 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.81 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 50.41 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 50.59 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 50.94 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 51.19 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 52.23 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 52.65 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 52.94 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 53.82 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 54.77 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 54.83 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 55.18 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 55.24 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 55.74 Bfactors> 106 vectors, 13608 coordinates in file. Openam> file on opening on unit 12: bfactors.pred Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000 Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 0.873700 Bfactors> 100 eigenvectors will be considered. Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped. Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed. (CHARMM units assumed for eigenvalues) Bfactors> Correlation= -0.344 for 596 C-alpha atoms. Bfactors> = 0.023 +/- 0.02 Bfactors> = 89.811 +/- 6.87 Bfactors> Shiftng-fct= 89.788 Bfactors> Scaling-fct= 320.683 Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved. Bfactors> Normal end. check_modes Chkmod> Version 1.00, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 260210213459596985.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 260210213459596985.eigenfacs Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4318E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4321E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4342E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4343E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4347E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4360E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 101.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 104.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 147.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 208.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 226.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 242.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 316.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 320.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 339.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 344.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 368.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 379.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 394.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 399.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 409.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 409.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 424.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 425.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 442.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 446.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 459.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 462.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 463.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 469.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 475.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 491.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 492.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 502.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 513.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 515.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 517.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 521.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Frequence du 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Chkmod> That is: 4536 cartesian points. Openam> file on opening on unit 11: Chkmod.res Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file. Chkmod> Normal end. 0.0034 0.7740 0.0034 0.7688 0.0034 0.9858 0.0034 0.7641 0.0034 0.8581 0.0034 0.8646 101.4981 0.7654 104.5707 0.7367 147.8136 0.7518 208.6165 0.7272 226.0325 0.8276 242.7101 0.7985 316.9169 0.3474 320.3400 0.4578 339.6178 0.4673 344.0674 0.1767 368.0753 0.2803 379.8983 0.3754 394.8138 0.3536 399.1208 0.2684 409.0419 0.4226 409.4741 0.3507 424.6004 0.1368 425.5712 0.1256 442.5491 0.3253 446.7917 0.2042 459.0277 0.4357 462.7374 0.2644 463.3739 0.4692 469.5669 0.2887 475.1831 0.3334 491.7671 0.4346 492.1266 0.3242 502.3235 0.4301 513.6966 0.4705 515.7583 0.5202 517.6978 0.4621 521.1030 0.6633 523.8113 0.5453 526.2815 0.7568 543.6931 0.4447 549.6246 0.4802 555.9172 0.6036 564.1285 0.3438 572.4281 0.3729 574.4842 0.4177 579.7960 0.4132 585.8653 0.5592 586.3682 0.5881 598.0161 0.2677 603.4139 0.1905 610.8907 0.3018 613.2025 0.4572 614.3551 0.3123 620.1812 0.3146 623.9721 0.2722 630.0836 0.4116 631.8589 0.4383 633.7223 0.2755 641.1215 0.4138 644.5149 0.4646 648.8907 0.4224 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perturbed structure for DQ=-100 260210213459596985.eigenfacs 260210213459596985.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 260210213459596985.eigenfacs 260210213459596985.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 260210213459596985.eigenfacs 260210213459596985.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 260210213459596985.eigenfacs 260210213459596985.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 260210213459596985.eigenfacs 260210213459596985.atom calculating perturbed structure for DQ=0 260210213459596985.eigenfacs 260210213459596985.atom calculating perturbed structure for DQ=20 260210213459596985.eigenfacs 260210213459596985.atom calculating perturbed structure for DQ=40 260210213459596985.eigenfacs 260210213459596985.atom calculating perturbed structure for DQ=60 260210213459596985.eigenfacs 260210213459596985.atom calculating perturbed structure for DQ=80 260210213459596985.eigenfacs 260210213459596985.atom calculating perturbed structure for DQ=100 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../../bin/get_modes.sh 260210213459596985 9 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 9 calculating perturbed structure for DQ=-100 260210213459596985.eigenfacs 260210213459596985.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 260210213459596985.eigenfacs 260210213459596985.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 260210213459596985.eigenfacs 260210213459596985.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 260210213459596985.eigenfacs 260210213459596985.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 260210213459596985.eigenfacs 260210213459596985.atom calculating perturbed structure for DQ=0 260210213459596985.eigenfacs 260210213459596985.atom calculating perturbed structure for DQ=20 260210213459596985.eigenfacs 260210213459596985.atom calculating perturbed structure for DQ=40 260210213459596985.eigenfacs 260210213459596985.atom calculating perturbed structure for DQ=60 260210213459596985.eigenfacs 260210213459596985.atom 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