CNRS Nantes University US2B US2B
home |  start a new run |  job status |  references&downloads |  examples |  help  

Should you encounter any unexpected behaviour,
please let us know.
elNémo has been hacked on november 27th.
It has been moved away and runs again.
**Still some additional cleaning from time to time**
Sorry for the inconvenience.


***  L_modelo_22_KELEY  ***

LOGs for ID: 260210213511597619

Output from eigenvector calculation:


STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8) Build Tirion matrix: Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model. Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004. Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file. Pdbmat> Coordinate filename = 260210213511597619.atom Pdbmat> Distance cutoff = 8.00 Force constant = 10.00 Origin of mass values = CONS Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09 PRINTing level = 2 Pdbmat> Coordinate file 260210213511597619.atom to be opened. Openam> File opened: 260210213511597619.atom Pdbmat> Coordinate file in PDB format. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 596 First residue number = 18 Last residue number = 315 Number of atoms found = 4536 Mean number per residue = 7.6 Pdbmat> Coordinate statistics: = 0.931628 +/- 10.161079 From: -25.067000 To: 26.001000 = 0.860192 +/- 11.489385 From: -25.779000 To: 29.334000 = -1.141137 +/- 19.860710 From: -43.080000 To: 39.591000 Pdbmat> Masses are all set to one. Openam> File opened: pdbmat.xyzm Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved. Openam> File opened: pdbmat.sdijb Pdbmat> Matrix statistics: Pdbmat> The matrix is 1.9284 % Filled. Pdbmat> 1785621 non-zero elements. Pdbmat> 195410 atom-atom interactions. Pdbmat> Number per atom= 86.16 +/- 22.85 Maximum number = 132 Minimum number = 17 Pdbmat> Matrix trace = 3.908200E+06 Pdbmat> Larger element = 502.082 Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10 Pdbmat> Normal end. automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1) 596 non-zero elements, NRBL set to 3 Diagonalize Tirion matrix using diagrtb Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation. Diagrtb> Version 2.52, November 2004. Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file. Diagrtb> Options taken into account: MATRix filename = pdbmat.sdijb COORdinates filename = 260210213511597619.atom Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb Nb of VECTors required = 106 EigeNVALues chosen = LOWE Type of SUBStructuring = NONE Nb of residues per BLOck = 3 Origin of MASS values = CONS MATRix FORMat = BINA Temporary files cleaning = ALL Output PRINting level = 2 Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb. Blocpdb> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.xyzm Blocpdb> Coordinate file 260210213511597619.atom to be opened. Openam> file on opening on unit 11: 260210213511597619.atom Blocpdb> Coordinate file in PDB format. Blocpdb> 4536 atoms picked in pdb file. Blocpdb> All masses set to unity. Blocpdb> Coordinate file is rewritten. Blocpdb> Substructuring: Blocpdb> 3 residue(s) per block. Blocpdb> 596 residues. Blocpdb> 22 atoms in block 1 Block first atom: 1 Blocpdb> 25 atoms in block 2 Block first atom: 23 Blocpdb> 22 atoms in block 3 Block first atom: 48 Blocpdb> 25 atoms in block 4 Block first atom: 70 Blocpdb> 23 atoms in block 5 Block first atom: 95 Blocpdb> 29 atoms in block 6 Block first atom: 118 Blocpdb> 25 atoms in block 7 Block first atom: 147 Blocpdb> 25 atoms in block 8 Block first atom: 172 Blocpdb> 25 atoms in block 9 Block first atom: 197 Blocpdb> 27 atoms in block 10 Block first atom: 222 Blocpdb> 27 atoms in block 11 Block first atom: 249 Blocpdb> 20 atoms in block 12 Block first atom: 276 Blocpdb> 19 atoms in block 13 Block first atom: 296 Blocpdb> 23 atoms in block 14 Block first atom: 315 Blocpdb> 31 atoms in block 15 Block first atom: 338 Blocpdb> 19 atoms in block 16 Block first atom: 369 Blocpdb> 17 atoms in block 17 Block first atom: 388 Blocpdb> 21 atoms in block 18 Block first atom: 405 Blocpdb> 20 atoms in block 19 Block first atom: 426 Blocpdb> 28 atoms in block 20 Block first atom: 446 Blocpdb> 13 atoms in block 21 Block first atom: 474 Blocpdb> 29 atoms in block 22 Block first atom: 487 Blocpdb> 19 atoms in block 23 Block first atom: 516 Blocpdb> 24 atoms in block 24 Block first atom: 535 Blocpdb> 18 atoms in block 25 Block first atom: 559 Blocpdb> 24 atoms in block 26 Block first atom: 577 Blocpdb> 29 atoms in block 27 Block first atom: 601 Blocpdb> 16 atoms in block 28 Block first atom: 630 Blocpdb> 28 atoms in block 29 Block first atom: 646 Blocpdb> 19 atoms in block 30 Block first atom: 674 Blocpdb> 25 atoms in block 31 Block first atom: 693 Blocpdb> 22 atoms in block 32 Block first atom: 718 Blocpdb> 31 atoms in block 33 Block first atom: 740 Blocpdb> 24 atoms in block 34 Block first atom: 771 Blocpdb> 21 atoms in block 35 Block first atom: 795 Blocpdb> 29 atoms in block 36 Block first atom: 816 Blocpdb> 18 atoms in block 37 Block first atom: 845 Blocpdb> 21 atoms in block 38 Block first atom: 863 Blocpdb> 19 atoms in block 39 Block first atom: 884 Blocpdb> 26 atoms in block 40 Block first atom: 903 Blocpdb> 22 atoms in block 41 Block first atom: 929 Blocpdb> 20 atoms in block 42 Block first atom: 951 Blocpdb> 20 atoms in block 43 Block first atom: 971 Blocpdb> 18 atoms in block 44 Block first atom: 991 Blocpdb> 17 atoms in block 45 Block first atom: 1009 Blocpdb> 24 atoms in block 46 Block first atom: 1026 Blocpdb> 27 atoms in block 47 Block first atom: 1050 Blocpdb> 19 atoms in block 48 Block first atom: 1077 Blocpdb> 21 atoms in block 49 Block first atom: 1096 Blocpdb> 13 atoms in block 50 Block first atom: 1117 Blocpdb> 19 atoms in block 51 Block first atom: 1130 Blocpdb> 23 atoms in block 52 Block first atom: 1149 Blocpdb> 20 atoms in block 53 Block first atom: 1172 Blocpdb> 20 atoms in block 54 Block first atom: 1192 Blocpdb> 20 atoms in block 55 Block first atom: 1212 Blocpdb> 29 atoms in block 56 Block first atom: 1232 Blocpdb> 24 atoms in block 57 Block first atom: 1261 Blocpdb> 20 atoms in block 58 Block first atom: 1285 Blocpdb> 22 atoms in block 59 Block first atom: 1305 Blocpdb> 20 atoms in block 60 Block first atom: 1327 Blocpdb> 33 atoms in block 61 Block first atom: 1347 Blocpdb> 21 atoms in block 62 Block first atom: 1380 Blocpdb> 27 atoms in block 63 Block first atom: 1401 Blocpdb> 25 atoms in block 64 Block first atom: 1428 Blocpdb> 28 atoms in block 65 Block first atom: 1453 Blocpdb> 28 atoms in block 66 Block first atom: 1481 Blocpdb> 19 atoms in block 67 Block first atom: 1509 Blocpdb> 24 atoms in block 68 Block first atom: 1528 Blocpdb> 26 atoms in block 69 Block first atom: 1552 Blocpdb> 24 atoms in block 70 Block first atom: 1578 Blocpdb> 20 atoms in block 71 Block first atom: 1602 Blocpdb> 20 atoms in block 72 Block first atom: 1622 Blocpdb> 23 atoms in block 73 Block first atom: 1642 Blocpdb> 26 atoms in block 74 Block first atom: 1665 Blocpdb> 19 atoms in block 75 Block first atom: 1691 Blocpdb> 23 atoms in block 76 Block first atom: 1710 Blocpdb> 23 atoms in block 77 Block first atom: 1733 Blocpdb> 25 atoms in block 78 Block first atom: 1756 Blocpdb> 20 atoms in block 79 Block first atom: 1781 Blocpdb> 24 atoms in block 80 Block first atom: 1801 Blocpdb> 17 atoms in block 81 Block first atom: 1825 Blocpdb> 26 atoms in block 82 Block first atom: 1842 Blocpdb> 22 atoms in block 83 Block first atom: 1868 Blocpdb> 22 atoms in block 84 Block first atom: 1890 Blocpdb> 22 atoms in block 85 Block first atom: 1912 Blocpdb> 24 atoms in block 86 Block first atom: 1934 Blocpdb> 23 atoms in block 87 Block first atom: 1958 Blocpdb> 21 atoms in block 88 Block first atom: 1981 Blocpdb> 22 atoms in block 89 Block first atom: 2002 Blocpdb> 24 atoms in block 90 Block first atom: 2024 Blocpdb> 29 atoms in block 91 Block first atom: 2048 Blocpdb> 19 atoms in block 92 Block first atom: 2077 Blocpdb> 19 atoms in block 93 Block first atom: 2096 Blocpdb> 22 atoms in block 94 Block first atom: 2115 Blocpdb> 28 atoms in block 95 Block first atom: 2137 Blocpdb> 23 atoms in block 96 Block first atom: 2165 Blocpdb> 33 atoms in block 97 Block first atom: 2188 Blocpdb> 25 atoms in block 98 Block first atom: 2221 Blocpdb> 19 atoms in block 99 Block first atom: 2246 Blocpdb> 4 atoms in block 100 Block first atom: 2265 Blocpdb> 22 atoms in block 101 Block first atom: 2269 Blocpdb> 25 atoms in block 102 Block first atom: 2291 Blocpdb> 22 atoms in block 103 Block first atom: 2316 Blocpdb> 25 atoms in block 104 Block first atom: 2338 Blocpdb> 23 atoms in block 105 Block first atom: 2363 Blocpdb> 29 atoms in block 106 Block first atom: 2386 Blocpdb> 25 atoms in block 107 Block first atom: 2415 Blocpdb> 25 atoms in block 108 Block first atom: 2440 Blocpdb> 25 atoms in block 109 Block first atom: 2465 Blocpdb> 27 atoms in block 110 Block first atom: 2490 Blocpdb> 27 atoms in block 111 Block first atom: 2517 Blocpdb> 20 atoms in block 112 Block first atom: 2544 Blocpdb> 19 atoms in block 113 Block first atom: 2564 Blocpdb> 23 atoms in block 114 Block first atom: 2583 Blocpdb> 31 atoms in block 115 Block first atom: 2606 Blocpdb> 19 atoms in block 116 Block first atom: 2637 Blocpdb> 17 atoms in block 117 Block first atom: 2656 Blocpdb> 21 atoms in block 118 Block first atom: 2673 Blocpdb> 20 atoms in block 119 Block first atom: 2694 Blocpdb> 28 atoms in block 120 Block first atom: 2714 Blocpdb> 13 atoms in block 121 Block first atom: 2742 Blocpdb> 29 atoms in block 122 Block first atom: 2755 Blocpdb> 19 atoms in block 123 Block first atom: 2784 Blocpdb> 24 atoms in block 124 Block first atom: 2803 Blocpdb> 18 atoms in block 125 Block first atom: 2827 Blocpdb> 24 atoms in block 126 Block first atom: 2845 Blocpdb> 29 atoms in block 127 Block first atom: 2869 Blocpdb> 16 atoms in block 128 Block first atom: 2898 Blocpdb> 28 atoms in block 129 Block first atom: 2914 Blocpdb> 19 atoms in block 130 Block first atom: 2942 Blocpdb> 25 atoms in block 131 Block first atom: 2961 Blocpdb> 22 atoms in block 132 Block first atom: 2986 Blocpdb> 31 atoms in block 133 Block first atom: 3008 Blocpdb> 24 atoms in block 134 Block first atom: 3039 Blocpdb> 21 atoms in block 135 Block first atom: 3063 Blocpdb> 29 atoms in block 136 Block first atom: 3084 Blocpdb> 18 atoms in block 137 Block first atom: 3113 Blocpdb> 21 atoms in block 138 Block first atom: 3131 Blocpdb> 19 atoms in block 139 Block first atom: 3152 Blocpdb> 26 atoms in block 140 Block first atom: 3171 Blocpdb> 22 atoms in block 141 Block first atom: 3197 Blocpdb> 20 atoms in block 142 Block first atom: 3219 Blocpdb> 20 atoms in block 143 Block first atom: 3239 Blocpdb> 18 atoms in block 144 Block first atom: 3259 Blocpdb> 17 atoms in block 145 Block first atom: 3277 Blocpdb> 24 atoms in block 146 Block first atom: 3294 Blocpdb> 27 atoms in block 147 Block first atom: 3318 Blocpdb> 19 atoms in block 148 Block first atom: 3345 Blocpdb> 21 atoms in block 149 Block first atom: 3364 Blocpdb> 13 atoms in block 150 Block first atom: 3385 Blocpdb> 19 atoms in block 151 Block first atom: 3398 Blocpdb> 23 atoms in block 152 Block first atom: 3417 Blocpdb> 20 atoms in block 153 Block first atom: 3440 Blocpdb> 20 atoms in block 154 Block first atom: 3460 Blocpdb> 20 atoms in block 155 Block first atom: 3480 Blocpdb> 29 atoms in block 156 Block first atom: 3500 Blocpdb> 24 atoms in block 157 Block first atom: 3529 Blocpdb> 20 atoms in block 158 Block first atom: 3553 Blocpdb> 22 atoms in block 159 Block first atom: 3573 Blocpdb> 20 atoms in block 160 Block first atom: 3595 Blocpdb> 33 atoms in block 161 Block first atom: 3615 Blocpdb> 21 atoms in block 162 Block first atom: 3648 Blocpdb> 27 atoms in block 163 Block first atom: 3669 Blocpdb> 25 atoms in block 164 Block first atom: 3696 Blocpdb> 28 atoms in block 165 Block first atom: 3721 Blocpdb> 28 atoms in block 166 Block first atom: 3749 Blocpdb> 19 atoms in block 167 Block first atom: 3777 Blocpdb> 24 atoms in block 168 Block first atom: 3796 Blocpdb> 26 atoms in block 169 Block first atom: 3820 Blocpdb> 24 atoms in block 170 Block first atom: 3846 Blocpdb> 20 atoms in block 171 Block first atom: 3870 Blocpdb> 20 atoms in block 172 Block first atom: 3890 Blocpdb> 23 atoms in block 173 Block first atom: 3910 Blocpdb> 26 atoms in block 174 Block first atom: 3933 Blocpdb> 19 atoms in block 175 Block first atom: 3959 Blocpdb> 23 atoms in block 176 Block first atom: 3978 Blocpdb> 23 atoms in block 177 Block first atom: 4001 Blocpdb> 25 atoms in block 178 Block first atom: 4024 Blocpdb> 20 atoms in block 179 Block first atom: 4049 Blocpdb> 24 atoms in block 180 Block first atom: 4069 Blocpdb> 17 atoms in block 181 Block first atom: 4093 Blocpdb> 26 atoms in block 182 Block first atom: 4110 Blocpdb> 22 atoms in block 183 Block first atom: 4136 Blocpdb> 22 atoms in block 184 Block first atom: 4158 Blocpdb> 22 atoms in block 185 Block first atom: 4180 Blocpdb> 24 atoms in block 186 Block first atom: 4202 Blocpdb> 23 atoms in block 187 Block first atom: 4226 Blocpdb> 21 atoms in block 188 Block first atom: 4249 Blocpdb> 22 atoms in block 189 Block first atom: 4270 Blocpdb> 24 atoms in block 190 Block first atom: 4292 Blocpdb> 29 atoms in block 191 Block first atom: 4316 Blocpdb> 19 atoms in block 192 Block first atom: 4345 Blocpdb> 19 atoms in block 193 Block first atom: 4364 Blocpdb> 22 atoms in block 194 Block first atom: 4383 Blocpdb> 28 atoms in block 195 Block first atom: 4405 Blocpdb> 23 atoms in block 196 Block first atom: 4433 Blocpdb> 33 atoms in block 197 Block first atom: 4456 Blocpdb> 25 atoms in block 198 Block first atom: 4489 Blocpdb> 19 atoms in block 199 Block first atom: 4514 Blocpdb> 4 atoms in block 200 Block first atom: 4532 Blocpdb> 200 blocks. Blocpdb> At most, 33 atoms in each of them. Blocpdb> At least, 4 atoms in each of them. Blocpdb> Normal end of Blocpdb. Diagrtb> Memory allocation for Prepmat. Diagrtb> Memory allocation for RTB. Diagrtb> Memory allocation for Diagstd. Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes. Prepmat> Entering in. Prepmat> Rewriting of the matrix begins. Prepmat> 1785821 matrix lines read. Prepmat> Matrix order = 13608 Prepmat> Matrix trace = 3908200.0000 Prepmat> Last element read: 13608 13608 115.1016 Prepmat> 20101 lines saved. Prepmat> 17960 empty lines. Prepmat> Number of lines on output is as expected. Prepmat> Normal end of Prepmat. RTB> Entering in. RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 4536 RTB> Total mass = 4536.0000 RTB> Number of atoms found in matrix: 4536 RTB> Number of blocks = 200 RTB> Projection begins. RTB> Projected matrix is being saved. RTB> Projected matrix trace = 275586.1208 RTB> 74040 non-zero elements. RTB> Normal end of RTB. Diagstd> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.sdijb Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb Diagstd> CERFACS matrix format. Diagstd> Projected matrix order = 1200 Diagstd> Nb of non-zero elements: 74040 Diagstd> Projected matrix trace = 275586.1208 Openam> file on opening on unit 11: diagrtb_work.eigenfacs Diagstd> Diagonalization. Diagstd> 1200 eigenvectors are computed. Diagstd> 106 of them to be saved. Diagstd> Sum of eigenvalues = 275586.1208 Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000 Diagstd> Selected eigenvalues: 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 1.3116204 1.6212179 2.5501754 4.7416394 4.7859190 5.6750153 9.0943229 9.8764143 10.2154333 10.8060088 11.5811405 11.6296036 13.7276494 14.2630085 14.6047509 15.2389326 16.7890392 17.0013520 17.2260013 17.5967991 18.9198197 18.9702667 19.3386122 19.8330819 20.3912838 21.0514887 21.9775805 22.0449031 22.5887111 22.8072656 23.5012350 23.7259554 24.0398109 24.3016329 24.9395002 25.8812136 26.3032529 27.8985338 28.1496621 28.3108121 29.2023986 29.2944144 30.6843521 31.0864104 31.5643839 31.9561156 32.2916814 33.5063939 33.8216662 34.1037353 34.6247823 34.6857013 35.1216975 35.8679976 36.9399917 37.1857163 37.2735737 37.4884805 39.0049879 39.2733712 39.7083745 40.1268045 40.3108097 40.5825402 40.8079965 41.5007721 41.7707150 42.0032249 42.3512533 42.8214785 43.3452241 43.4748276 43.7165414 44.2080875 45.4751500 45.5276172 46.8564587 46.8943506 47.2975760 47.8744582 48.4437465 48.6736520 49.3601838 49.6101934 50.0125957 50.3570409 50.9145202 51.2819180 51.4200157 52.1190745 52.3535987 53.2234223 53.3879477 53.7393350 54.5390756 54.5977257 55.2970585 55.6153525 55.9640871 56.6666670 Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units): 0.0034318 0.0034322 0.0034323 0.0034340 0.0034343 0.0034354 124.3653401 138.2661817 173.4124646 236.4610110 237.5625362 258.6894984 327.4767448 341.2674991 347.0752745 356.9668924 369.5480759 370.3204841 402.3401459 410.1104637 414.9945159 423.9089195 444.9469174 447.7514589 450.6999589 455.5248967 472.3389681 472.9682614 477.5379960 483.6045548 490.3628548 498.2378162 509.0790443 509.8581636 516.1084929 518.5992571 526.4299902 528.9408819 532.4278981 535.3194315 542.2994368 552.4431577 556.9292278 573.5693957 576.1451011 577.7918925 586.8195072 587.7433049 601.5251068 605.4531858 610.0900448 613.8641515 617.0787768 628.5779253 631.5282456 634.1562172 638.9822677 639.5441342 643.5510883 650.3525483 659.9996069 662.1911253 662.9729316 664.8814238 678.1962033 680.5254497 684.2839207 687.8798192 689.4551838 691.7750494 693.6939663 699.5574216 701.8288792 703.7794769 706.6891340 710.6014827 714.9339263 716.0019656 717.9896403 722.0148732 732.2887302 732.7110496 743.3271768 743.6276733 746.8179060 751.3585217 755.8126242 757.6039784 762.9281935 764.8578709 767.9535950 770.5935708 774.8472712 777.6378850 778.6842360 783.9595009 785.7213428 792.2215986 793.4451200 796.0519754 801.9534620 802.3845477 807.5069990 809.8276992 812.3627331 817.4460789 Diagstd> Normal end. Rtb_to_modes> Entering in. Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 4536 Rtb_to_modes> Number of blocs = 200 Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.eigenfacs Openam> file on opening on unit 11: matrix.eigenrtb Rdmodfacs> Entering in. Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Eigenvector number: 1 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9874E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 2 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9898E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 3 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9902E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 4 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0000E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 5 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0002E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 6 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0009E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 7 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.312 Rdmodfacs> Eigenvector number: 8 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.621 Rdmodfacs> Eigenvector number: 9 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.550 Rdmodfacs> Eigenvector number: 10 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.742 Rdmodfacs> Eigenvector number: 11 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.786 Rdmodfacs> Eigenvector number: 12 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.675 Rdmodfacs> Eigenvector number: 13 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.094 Rdmodfacs> Eigenvector number: 14 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.876 Rdmodfacs> Eigenvector number: 15 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.22 Rdmodfacs> Eigenvector number: 16 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.81 Rdmodfacs> Eigenvector number: 17 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.58 Rdmodfacs> Eigenvector number: 18 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.63 Rdmodfacs> Eigenvector number: 19 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.73 Rdmodfacs> Eigenvector number: 20 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.26 Rdmodfacs> Eigenvector number: 21 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.60 Rdmodfacs> Eigenvector number: 22 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.24 Rdmodfacs> Eigenvector number: 23 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.79 Rdmodfacs> Eigenvector number: 24 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.00 Rdmodfacs> Eigenvector number: 25 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.23 Rdmodfacs> Eigenvector number: 26 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.60 Rdmodfacs> Eigenvector number: 27 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.92 Rdmodfacs> Eigenvector number: 28 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.97 Rdmodfacs> Eigenvector number: 29 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.34 Rdmodfacs> Eigenvector number: 30 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.83 Rdmodfacs> Eigenvector number: 31 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.39 Rdmodfacs> Eigenvector number: 32 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.05 Rdmodfacs> Eigenvector number: 33 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.98 Rdmodfacs> Eigenvector number: 34 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.04 Rdmodfacs> Eigenvector number: 35 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.59 Rdmodfacs> Eigenvector number: 36 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.81 Rdmodfacs> Eigenvector number: 37 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.50 Rdmodfacs> Eigenvector number: 38 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.73 Rdmodfacs> Eigenvector number: 39 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.04 Rdmodfacs> Eigenvector number: 40 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.30 Rdmodfacs> Eigenvector number: 41 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.94 Rdmodfacs> Eigenvector number: 42 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.88 Rdmodfacs> Eigenvector number: 43 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.30 Rdmodfacs> Eigenvector number: 44 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.90 Rdmodfacs> Eigenvector number: 45 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.15 Rdmodfacs> Eigenvector number: 46 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.31 Rdmodfacs> Eigenvector number: 47 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.20 Rdmodfacs> Eigenvector number: 48 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.29 Rdmodfacs> Eigenvector number: 49 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.68 Rdmodfacs> Eigenvector number: 50 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 51 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.56 Rdmodfacs> Eigenvector number: 52 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.96 Rdmodfacs> Eigenvector number: 53 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.29 Rdmodfacs> Eigenvector number: 54 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.51 Rdmodfacs> Eigenvector number: 55 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.82 Rdmodfacs> Eigenvector number: 56 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 57 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.62 Rdmodfacs> Eigenvector number: 58 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.69 Rdmodfacs> Eigenvector number: 59 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.12 Rdmodfacs> Eigenvector number: 60 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.87 Rdmodfacs> Eigenvector number: 61 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.94 Rdmodfacs> Eigenvector number: 62 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.19 Rdmodfacs> Eigenvector number: 63 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.27 Rdmodfacs> Eigenvector number: 64 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.49 Rdmodfacs> Eigenvector number: 65 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.00 Rdmodfacs> Eigenvector number: 66 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.27 Rdmodfacs> Eigenvector number: 67 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.71 Rdmodfacs> Eigenvector number: 68 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.13 Rdmodfacs> Eigenvector number: 69 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.31 Rdmodfacs> Eigenvector number: 70 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.58 Rdmodfacs> Eigenvector number: 71 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.81 Rdmodfacs> Eigenvector number: 72 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.50 Rdmodfacs> Eigenvector number: 73 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.77 Rdmodfacs> Eigenvector number: 74 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.00 Rdmodfacs> Eigenvector number: 75 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.35 Rdmodfacs> Eigenvector number: 76 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.82 Rdmodfacs> Eigenvector number: 77 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.35 Rdmodfacs> Eigenvector number: 78 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.47 Rdmodfacs> Eigenvector number: 79 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.72 Rdmodfacs> Eigenvector number: 80 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.21 Rdmodfacs> Eigenvector number: 81 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.48 Rdmodfacs> Eigenvector number: 82 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.53 Rdmodfacs> Eigenvector number: 83 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.86 Rdmodfacs> Eigenvector number: 84 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.89 Rdmodfacs> Eigenvector number: 85 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 47.30 Rdmodfacs> Eigenvector number: 86 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 47.87 Rdmodfacs> Eigenvector number: 87 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 48.44 Rdmodfacs> Eigenvector number: 88 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 48.67 Rdmodfacs> Eigenvector number: 89 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 49.36 Rdmodfacs> Eigenvector number: 90 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 49.61 Rdmodfacs> Eigenvector number: 91 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 50.01 Rdmodfacs> Eigenvector number: 92 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 50.36 Rdmodfacs> Eigenvector number: 93 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 50.91 Rdmodfacs> Eigenvector number: 94 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 51.28 Rdmodfacs> Eigenvector number: 95 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 51.42 Rdmodfacs> Eigenvector number: 96 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 52.12 Rdmodfacs> Eigenvector number: 97 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 52.35 Rdmodfacs> Eigenvector number: 98 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 53.22 Rdmodfacs> Eigenvector number: 99 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 53.39 Rdmodfacs> Eigenvector number: 100 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 53.74 Rdmodfacs> Eigenvector number: 101 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 54.54 Rdmodfacs> Eigenvector number: 102 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 54.60 Rdmodfacs> Eigenvector number: 103 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 55.30 Rdmodfacs> Eigenvector number: 104 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 55.62 Rdmodfacs> Eigenvector number: 105 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 55.96 Rdmodfacs> Eigenvector number: 106 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 56.67 Rtb_to_modes> 106 vectors, with 1200 coordinates in vector file. Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected): 1.00000 1.00000 1.00000 0.99999 1.00001 1.00000 1.00001 1.00000 1.00000 0.99999 1.00000 1.00001 1.00002 1.00000 1.00001 1.00000 1.00001 0.99999 1.00002 1.00002 1.00000 0.99999 1.00000 1.00000 1.00000 1.00001 0.99998 1.00000 0.99999 1.00002 0.99999 1.00002 1.00001 1.00001 1.00000 0.99999 1.00001 1.00000 1.00001 1.00002 1.00003 1.00001 0.99998 0.99999 1.00002 1.00002 1.00000 1.00001 1.00000 0.99998 0.99998 0.99999 0.99999 0.99999 1.00001 0.99997 1.00000 0.99999 1.00000 1.00001 1.00001 0.99999 1.00001 1.00001 0.99997 1.00004 0.99999 0.99997 1.00001 1.00000 0.99999 1.00000 0.99999 1.00001 1.00001 1.00002 0.99999 1.00000 0.99998 0.99999 0.99999 0.99997 0.99999 0.99998 1.00000 0.99998 1.00001 1.00000 1.00001 1.00002 0.99999 1.00000 0.99997 0.99999 0.99998 1.00000 1.00001 1.00000 0.99998 1.00001 0.99999 1.00000 0.99998 1.00001 1.00000 1.00001 Rtb_to_modes> RTB block-file is being read. Rtb_to_modes> 81648 lines found in RTB file. Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected): 1.00000 1.00000 1.00000 0.99999 1.00001 1.00000 1.00001 1.00000 1.00000 0.99999 1.00000 1.00001 1.00002 1.00000 1.00001 1.00000 1.00001 0.99999 1.00002 1.00002 1.00000 0.99999 1.00000 1.00000 1.00000 1.00001 0.99998 1.00000 0.99999 1.00002 0.99999 1.00002 1.00001 1.00001 1.00000 0.99999 1.00001 1.00000 1.00001 1.00002 1.00003 1.00001 0.99998 0.99999 1.00002 1.00002 1.00000 1.00001 1.00000 0.99998 0.99998 0.99999 0.99999 0.99999 1.00001 0.99997 1.00000 0.99999 1.00000 1.00001 1.00001 0.99999 1.00001 1.00001 0.99997 1.00004 0.99999 0.99997 1.00001 1.00000 0.99999 1.00000 0.99999 1.00001 1.00001 1.00002 0.99999 1.00000 0.99998 0.99999 0.99999 0.99997 0.99999 0.99998 1.00000 0.99998 1.00001 1.00000 1.00001 1.00002 0.99999 1.00000 0.99997 0.99999 0.99998 1.00000 1.00001 1.00000 0.99998 1.00001 0.99999 1.00000 0.99998 1.00001 1.00000 1.00001 Orthogonality of first eigenvectors (zero expected): Vector 2:-0.000 Vector 3:-0.000-0.000 Vector 4: 0.000-0.000-0.000 Vector 5: 0.000 0.000 0.000-0.000 Vector 6:-0.000-0.000 0.000 0.000-0.000 Vector 7: 0.000-0.000 0.000 0.000-0.000-0.000 Vector 8:-0.000 0.000-0.000 0.000-0.000-0.000-0.000 Vector 9:-0.000 0.000-0.000 0.000-0.000 0.000-0.000-0.000 Vector 10: 0.000 0.000-0.000 0.000 0.000 0.000-0.000 0.000-0.000 Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved. Rtb_to_modes> Normal end. Diagrtb> Normal end. B-factor analysis Bfactors> Version 1.22, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 260210213511597619.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 260210213511597619.eigenfacs Getnam> Corresponding pdb filename ? Getnam> 260210213511597619.atom Openam> file on opening on unit 11: 260210213511597619.atom Getnum> Number of skipped eigenvectors ? Getnum> 0 Getnum> Number of usefull eigenvectors ? Getnum> 10000 %Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 596 First residue number = 18 Last residue number = 315 Number of atoms found = 4536 Mean number per residue = 7.6 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9874E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9898E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9902E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0000E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0002E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0009E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.312 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.621 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.550 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.742 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.786 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.675 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.094 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.876 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.22 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.81 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.58 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.63 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.73 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.26 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.60 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.24 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.79 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.00 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.23 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.60 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.92 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.97 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.34 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.83 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.39 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.05 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.98 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.04 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.59 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.81 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.50 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.73 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.04 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.30 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.94 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.88 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.30 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.90 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.15 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.31 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.20 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.29 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.68 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.56 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.96 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.29 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.51 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.82 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.62 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.69 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.12 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.87 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.94 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.19 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.27 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.49 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.00 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.27 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.71 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.13 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.31 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.58 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.81 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.50 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.77 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.00 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.35 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.82 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.35 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.47 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.72 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.21 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.48 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.53 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.86 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.89 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.30 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.87 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.44 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.67 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.36 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.61 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 50.01 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 50.36 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 50.91 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 51.28 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 51.42 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 52.12 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 52.35 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 53.22 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 53.39 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 53.74 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 54.54 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 54.60 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 55.30 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 55.62 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 55.96 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 56.67 Bfactors> 106 vectors, 13608 coordinates in file. Openam> file on opening on unit 12: bfactors.pred Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000 Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 1.312000 Bfactors> 100 eigenvectors will be considered. Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped. Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed. (CHARMM units assumed for eigenvalues) Bfactors> Correlation= -0.373 for 596 C-alpha atoms. Bfactors> = 0.019 +/- 0.02 Bfactors> = 90.380 +/- 6.22 Bfactors> Shiftng-fct= 90.361 Bfactors> Scaling-fct= 310.170 Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved. Bfactors> Normal end. check_modes Chkmod> Version 1.00, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 260210213511597619.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 260210213511597619.eigenfacs Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4316E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4321E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4321E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4338E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4342E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4354E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 124.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 138.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 173.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 236.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 237.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 258.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 327.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 341.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 347.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 357.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 369.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 370.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 402.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 410.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 414.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 423.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 444.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 447.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 450.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 455.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 472.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 472.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 477.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 483.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 490.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 498.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 509.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 509.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 516.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 518.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 526.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 529.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 532.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 535.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 542.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 552.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 556.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 573.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 576.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 577.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 586.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 587.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 601.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 605.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 610.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 613.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 617.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 628.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 631.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 634.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 638.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 639.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 643.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 650.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 660.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 662.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 662.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 664.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 678.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 680.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 684.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 687.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 689.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 691.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 693.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 699.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 701.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 703.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 706.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 710.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 714.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 715.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 718.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 722.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 732.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 732.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 743.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 743.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 746.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 751.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 755.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 757.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 762.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 764.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 767.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 770.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 774.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 777.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 778.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 783.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 785.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 792.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 793.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 796.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 801.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 802.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 807.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 809.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 812.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 817.4 Chkmod> 106 vectors, 13608 coordinates in file. Chkmod> That is: 4536 cartesian points. Openam> file on opening on unit 11: Chkmod.res Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file. Chkmod> Normal end. 0.0034 0.8499 0.0034 0.9829 0.0034 0.9224 0.0034 0.8476 0.0034 0.7836 0.0034 0.7547 124.3780 0.7308 138.2510 0.6993 173.3991 0.7099 236.4599 0.7264 237.5543 0.7197 258.6780 0.7613 327.4569 0.2374 341.2457 0.3037 347.1379 0.4093 357.0175 0.4037 369.5140 0.3712 370.3109 0.3000 402.3573 0.3579 410.0496 0.5578 414.9092 0.4096 423.9056 0.2938 444.9405 0.2978 447.7144 0.4447 450.7329 0.2007 455.5468 0.3390 472.3209 0.3600 472.9446 0.2374 477.5346 0.3710 483.5462 0.4287 490.3264 0.4567 498.1988 0.4854 509.0852 0.5983 509.7796 0.4728 516.1011 0.5908 518.6081 0.3506 526.3936 0.3459 528.9633 0.4992 532.4071 0.5033 535.2785 0.6413 542.2816 0.4859 552.4065 0.5120 556.8709 0.5037 573.5598 0.5959 576.1238 0.4061 577.7588 0.4112 586.7702 0.4856 587.6738 0.5720 601.4566 0.4948 605.4621 0.4692 610.0215 0.3717 613.8751 0.3390 617.0362 0.4263 628.5848 0.3777 631.4856 0.4300 634.0943 0.3441 638.9107 0.4202 639.5563 0.3886 643.5079 0.4396 650.3428 0.4542 659.9713 0.4161 662.2008 0.3555 662.9127 0.4091 664.8664 0.4496 678.1237 0.2529 680.4670 0.2934 684.2686 0.3627 687.8777 0.2889 689.4187 0.5550 691.7237 0.3256 693.6812 0.3297 699.5209 0.4768 701.7927 0.2559 703.7222 0.2568 706.6483 0.4520 710.5587 0.3591 714.9426 0.3169 715.9315 0.4244 717.9872 0.5034 721.9995 0.4952 732.2963 0.3968 732.6988 0.4235 743.3234 0.4279 743.5613 0.4424 746.8050 0.3273 751.2913 0.3209 755.7510 0.2749 757.5430 0.3866 762.8940 0.4870 764.8235 0.3272 767.9007 0.2506 770.5831 0.3451 774.7796 0.2805 777.5900 0.1603 778.6507 0.4774 783.9328 0.4319 785.6606 0.4341 792.1621 0.2805 793.4263 0.2533 796.0227 0.4282 801.9258 0.3916 802.3668 0.2817 807.4938 0.4563 809.8268 0.5093 812.2982 0.4057 817.4350 0.5506 getting mode 7 running: ../../bin/get_modes.sh 260210213511597619 7 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 7 calculating perturbed structure for DQ=-100 260210213511597619.eigenfacs 260210213511597619.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 260210213511597619.eigenfacs 260210213511597619.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 260210213511597619.eigenfacs 260210213511597619.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 260210213511597619.eigenfacs 260210213511597619.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 260210213511597619.eigenfacs 260210213511597619.atom calculating perturbed structure for DQ=0 260210213511597619.eigenfacs 260210213511597619.atom calculating perturbed structure for DQ=20 260210213511597619.eigenfacs 260210213511597619.atom calculating perturbed structure for DQ=40 260210213511597619.eigenfacs 260210213511597619.atom calculating perturbed structure for DQ=60 260210213511597619.eigenfacs 260210213511597619.atom calculating perturbed structure for DQ=80 260210213511597619.eigenfacs 260210213511597619.atom calculating perturbed structure for DQ=100 260210213511597619.eigenfacs 260210213511597619.atom making animated gifs 11 models are in 260210213511597619.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 260210213511597619.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 260210213511597619.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 8 running: ../../bin/get_modes.sh 260210213511597619 8 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 8 calculating perturbed structure for DQ=-100 260210213511597619.eigenfacs 260210213511597619.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 260210213511597619.eigenfacs 260210213511597619.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 260210213511597619.eigenfacs 260210213511597619.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 260210213511597619.eigenfacs 260210213511597619.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 260210213511597619.eigenfacs 260210213511597619.atom calculating perturbed structure for DQ=0 260210213511597619.eigenfacs 260210213511597619.atom calculating perturbed structure for DQ=20 260210213511597619.eigenfacs 260210213511597619.atom calculating perturbed structure for DQ=40 260210213511597619.eigenfacs 260210213511597619.atom calculating perturbed structure for DQ=60 260210213511597619.eigenfacs 260210213511597619.atom calculating perturbed structure for DQ=80 260210213511597619.eigenfacs 260210213511597619.atom calculating perturbed structure for DQ=100 260210213511597619.eigenfacs 260210213511597619.atom making animated gifs 11 models are in 260210213511597619.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 260210213511597619.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 260210213511597619.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 9 running: ../../bin/get_modes.sh 260210213511597619 9 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 9 calculating perturbed structure for DQ=-100 260210213511597619.eigenfacs 260210213511597619.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 260210213511597619.eigenfacs 260210213511597619.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 260210213511597619.eigenfacs 260210213511597619.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 260210213511597619.eigenfacs 260210213511597619.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 260210213511597619.eigenfacs 260210213511597619.atom calculating perturbed structure for DQ=0 260210213511597619.eigenfacs 260210213511597619.atom calculating perturbed structure for DQ=20 260210213511597619.eigenfacs 260210213511597619.atom calculating perturbed structure for DQ=40 260210213511597619.eigenfacs 260210213511597619.atom calculating perturbed structure for DQ=60 260210213511597619.eigenfacs 260210213511597619.atom calculating perturbed structure for DQ=80 260210213511597619.eigenfacs 260210213511597619.atom calculating perturbed structure for DQ=100 260210213511597619.eigenfacs 260210213511597619.atom making animated gifs 11 models are in 260210213511597619.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 260210213511597619.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 260210213511597619.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 10 running: ../../bin/get_modes.sh 260210213511597619 10 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 10 calculating perturbed structure for DQ=-100 260210213511597619.eigenfacs 260210213511597619.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 260210213511597619.eigenfacs 260210213511597619.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 260210213511597619.eigenfacs 260210213511597619.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 260210213511597619.eigenfacs 260210213511597619.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 260210213511597619.eigenfacs 260210213511597619.atom calculating perturbed structure for DQ=0 260210213511597619.eigenfacs 260210213511597619.atom calculating perturbed structure for DQ=20 260210213511597619.eigenfacs 260210213511597619.atom calculating perturbed structure for DQ=40 260210213511597619.eigenfacs 260210213511597619.atom calculating perturbed structure for DQ=60 260210213511597619.eigenfacs 260210213511597619.atom calculating perturbed structure for DQ=80 260210213511597619.eigenfacs 260210213511597619.atom calculating perturbed structure for DQ=100 260210213511597619.eigenfacs 260210213511597619.atom making animated gifs 11 models are in 260210213511597619.10.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 260210213511597619.10.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 260210213511597619.10.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 11 running: ../../bin/get_modes.sh 260210213511597619 11 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 11 calculating perturbed structure for DQ=-100 260210213511597619.eigenfacs 260210213511597619.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 260210213511597619.eigenfacs 260210213511597619.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 260210213511597619.eigenfacs 260210213511597619.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 260210213511597619.eigenfacs 260210213511597619.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 260210213511597619.eigenfacs 260210213511597619.atom calculating perturbed structure for DQ=0 260210213511597619.eigenfacs 260210213511597619.atom calculating perturbed structure for DQ=20 260210213511597619.eigenfacs 260210213511597619.atom calculating perturbed structure for DQ=40 260210213511597619.eigenfacs 260210213511597619.atom calculating perturbed structure for DQ=60 260210213511597619.eigenfacs 260210213511597619.atom calculating perturbed structure for DQ=80 260210213511597619.eigenfacs 260210213511597619.atom calculating perturbed structure for DQ=100 260210213511597619.eigenfacs 260210213511597619.atom making animated gifs 11 models are in 260210213511597619.11.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 260210213511597619.11.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 260210213511597619.11.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 260210213511597619.10.pdb 260210213511597619.11.pdb 260210213511597619.7.pdb 260210213511597619.8.pdb 260210213511597619.9.pdb STDERR: Note: The following floating-point exceptions are signalling: IEEE_DENORMAL real 0m25.692s user 0m25.570s sys 0m0.112s rm: cannot remove '260210213511597619.sdijf': No such file or directory pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format




If you find results from this site helpful for your research, please cite one of our papers:

elNémo is maintained by Yves-Henri Sanejouand.
It was developed by Karsten Suhre.
Between 2003 and 2014, it was hosted by IGS (Marseille).
Between 2015 and 2025, it was hosted by US2B (Nantes).
Last modification: december 26th, 2025.