CNRS Nantes University US2B US2B
home |  start a new run |  job status |  references&downloads |  examples |  help  

Should you encounter any unexpected behaviour,
please let us know.
elNémo has been hacked on november 27th.
It has been moved away and runs again.
**Still some additional cleaning from time to time**
Sorry for the inconvenience.


***  Y_modelo_3_KELEY  ***

LOGs for ID: 260211031023738954

Output from eigenvector calculation:


STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8) Build Tirion matrix: Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model. Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004. Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file. Pdbmat> Coordinate filename = 260211031023738954.atom Pdbmat> Distance cutoff = 8.00 Force constant = 10.00 Origin of mass values = CONS Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09 PRINTing level = 2 Pdbmat> Coordinate file 260211031023738954.atom to be opened. Openam> File opened: 260211031023738954.atom Pdbmat> Coordinate file in PDB format. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 596 First residue number = 18 Last residue number = 315 Number of atoms found = 4512 Mean number per residue = 7.6 Pdbmat> Coordinate statistics: = -1.044570 +/- 11.258731 From: -26.102000 To: 26.788000 = 0.714363 +/- 11.718609 From: -27.487000 To: 29.184000 = 0.434917 +/- 19.737711 From: -41.599000 To: 38.982000 Pdbmat> Masses are all set to one. Openam> File opened: pdbmat.xyzm Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved. Openam> File opened: pdbmat.sdijb Pdbmat> Matrix statistics: Pdbmat> The matrix is 1.9237 % Filled. Pdbmat> 1762467 non-zero elements. Pdbmat> 192860 atom-atom interactions. Pdbmat> Number per atom= 85.49 +/- 22.76 Maximum number = 131 Minimum number = 15 Pdbmat> Matrix trace = 3.857200E+06 Pdbmat> Larger element = 502.815 Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10 Pdbmat> Normal end. automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1) 596 non-zero elements, NRBL set to 3 Diagonalize Tirion matrix using diagrtb Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation. Diagrtb> Version 2.52, November 2004. Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file. Diagrtb> Options taken into account: MATRix filename = pdbmat.sdijb COORdinates filename = 260211031023738954.atom Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb Nb of VECTors required = 106 EigeNVALues chosen = LOWE Type of SUBStructuring = NONE Nb of residues per BLOck = 3 Origin of MASS values = CONS MATRix FORMat = BINA Temporary files cleaning = ALL Output PRINting level = 2 Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb. Blocpdb> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.xyzm Blocpdb> Coordinate file 260211031023738954.atom to be opened. Openam> file on opening on unit 11: 260211031023738954.atom Blocpdb> Coordinate file in PDB format. Blocpdb> 4512 atoms picked in pdb file. Blocpdb> All masses set to unity. Blocpdb> Coordinate file is rewritten. Blocpdb> Substructuring: Blocpdb> 3 residue(s) per block. Blocpdb> 596 residues. Blocpdb> 22 atoms in block 1 Block first atom: 1 Blocpdb> 25 atoms in block 2 Block first atom: 23 Blocpdb> 22 atoms in block 3 Block first atom: 48 Blocpdb> 25 atoms in block 4 Block first atom: 70 Blocpdb> 23 atoms in block 5 Block first atom: 95 Blocpdb> 29 atoms in block 6 Block first atom: 118 Blocpdb> 25 atoms in block 7 Block first atom: 147 Blocpdb> 25 atoms in block 8 Block first atom: 172 Blocpdb> 25 atoms in block 9 Block first atom: 197 Blocpdb> 27 atoms in block 10 Block first atom: 222 Blocpdb> 27 atoms in block 11 Block first atom: 249 Blocpdb> 20 atoms in block 12 Block first atom: 276 Blocpdb> 19 atoms in block 13 Block first atom: 296 Blocpdb> 23 atoms in block 14 Block first atom: 315 Blocpdb> 31 atoms in block 15 Block first atom: 338 Blocpdb> 19 atoms in block 16 Block first atom: 369 Blocpdb> 17 atoms in block 17 Block first atom: 388 Blocpdb> 21 atoms in block 18 Block first atom: 405 Blocpdb> 20 atoms in block 19 Block first atom: 426 Blocpdb> 28 atoms in block 20 Block first atom: 446 Blocpdb> 13 atoms in block 21 Block first atom: 474 Blocpdb> 23 atoms in block 22 Block first atom: 487 Blocpdb> 19 atoms in block 23 Block first atom: 510 Blocpdb> 24 atoms in block 24 Block first atom: 529 Blocpdb> 18 atoms in block 25 Block first atom: 553 Blocpdb> 24 atoms in block 26 Block first atom: 571 Blocpdb> 29 atoms in block 27 Block first atom: 595 Blocpdb> 16 atoms in block 28 Block first atom: 624 Blocpdb> 28 atoms in block 29 Block first atom: 640 Blocpdb> 19 atoms in block 30 Block first atom: 668 Blocpdb> 25 atoms in block 31 Block first atom: 687 Blocpdb> 22 atoms in block 32 Block first atom: 712 Blocpdb> 31 atoms in block 33 Block first atom: 734 Blocpdb> 24 atoms in block 34 Block first atom: 765 Blocpdb> 21 atoms in block 35 Block first atom: 789 Blocpdb> 29 atoms in block 36 Block first atom: 810 Blocpdb> 18 atoms in block 37 Block first atom: 839 Blocpdb> 21 atoms in block 38 Block first atom: 857 Blocpdb> 19 atoms in block 39 Block first atom: 878 Blocpdb> 26 atoms in block 40 Block first atom: 897 Blocpdb> 22 atoms in block 41 Block first atom: 923 Blocpdb> 20 atoms in block 42 Block first atom: 945 Blocpdb> 20 atoms in block 43 Block first atom: 965 Blocpdb> 18 atoms in block 44 Block first atom: 985 Blocpdb> 17 atoms in block 45 Block first atom: 1003 Blocpdb> 24 atoms in block 46 Block first atom: 1020 Blocpdb> 27 atoms in block 47 Block first atom: 1044 Blocpdb> 19 atoms in block 48 Block first atom: 1071 Blocpdb> 21 atoms in block 49 Block first atom: 1090 Blocpdb> 13 atoms in block 50 Block first atom: 1111 Blocpdb> 19 atoms in block 51 Block first atom: 1124 Blocpdb> 23 atoms in block 52 Block first atom: 1143 Blocpdb> 20 atoms in block 53 Block first atom: 1166 Blocpdb> 20 atoms in block 54 Block first atom: 1186 Blocpdb> 20 atoms in block 55 Block first atom: 1206 Blocpdb> 29 atoms in block 56 Block first atom: 1226 Blocpdb> 24 atoms in block 57 Block first atom: 1255 Blocpdb> 20 atoms in block 58 Block first atom: 1279 Blocpdb> 22 atoms in block 59 Block first atom: 1299 Blocpdb> 20 atoms in block 60 Block first atom: 1321 Blocpdb> 33 atoms in block 61 Block first atom: 1341 Blocpdb> 21 atoms in block 62 Block first atom: 1374 Blocpdb> 27 atoms in block 63 Block first atom: 1395 Blocpdb> 25 atoms in block 64 Block first atom: 1422 Blocpdb> 22 atoms in block 65 Block first atom: 1447 Blocpdb> 28 atoms in block 66 Block first atom: 1469 Blocpdb> 19 atoms in block 67 Block first atom: 1497 Blocpdb> 24 atoms in block 68 Block first atom: 1516 Blocpdb> 26 atoms in block 69 Block first atom: 1540 Blocpdb> 24 atoms in block 70 Block first atom: 1566 Blocpdb> 20 atoms in block 71 Block first atom: 1590 Blocpdb> 20 atoms in block 72 Block first atom: 1610 Blocpdb> 23 atoms in block 73 Block first atom: 1630 Blocpdb> 26 atoms in block 74 Block first atom: 1653 Blocpdb> 19 atoms in block 75 Block first atom: 1679 Blocpdb> 23 atoms in block 76 Block first atom: 1698 Blocpdb> 23 atoms in block 77 Block first atom: 1721 Blocpdb> 25 atoms in block 78 Block first atom: 1744 Blocpdb> 20 atoms in block 79 Block first atom: 1769 Blocpdb> 24 atoms in block 80 Block first atom: 1789 Blocpdb> 17 atoms in block 81 Block first atom: 1813 Blocpdb> 26 atoms in block 82 Block first atom: 1830 Blocpdb> 22 atoms in block 83 Block first atom: 1856 Blocpdb> 22 atoms in block 84 Block first atom: 1878 Blocpdb> 22 atoms in block 85 Block first atom: 1900 Blocpdb> 24 atoms in block 86 Block first atom: 1922 Blocpdb> 23 atoms in block 87 Block first atom: 1946 Blocpdb> 21 atoms in block 88 Block first atom: 1969 Blocpdb> 22 atoms in block 89 Block first atom: 1990 Blocpdb> 24 atoms in block 90 Block first atom: 2012 Blocpdb> 29 atoms in block 91 Block first atom: 2036 Blocpdb> 19 atoms in block 92 Block first atom: 2065 Blocpdb> 19 atoms in block 93 Block first atom: 2084 Blocpdb> 22 atoms in block 94 Block first atom: 2103 Blocpdb> 28 atoms in block 95 Block first atom: 2125 Blocpdb> 23 atoms in block 96 Block first atom: 2153 Blocpdb> 33 atoms in block 97 Block first atom: 2176 Blocpdb> 25 atoms in block 98 Block first atom: 2209 Blocpdb> 19 atoms in block 99 Block first atom: 2234 Blocpdb> 4 atoms in block 100 Block first atom: 2253 Blocpdb> 22 atoms in block 101 Block first atom: 2257 Blocpdb> 25 atoms in block 102 Block first atom: 2279 Blocpdb> 22 atoms in block 103 Block first atom: 2304 Blocpdb> 25 atoms in block 104 Block first atom: 2326 Blocpdb> 23 atoms in block 105 Block first atom: 2351 Blocpdb> 29 atoms in block 106 Block first atom: 2374 Blocpdb> 25 atoms in block 107 Block first atom: 2403 Blocpdb> 25 atoms in block 108 Block first atom: 2428 Blocpdb> 25 atoms in block 109 Block first atom: 2453 Blocpdb> 27 atoms in block 110 Block first atom: 2478 Blocpdb> 27 atoms in block 111 Block first atom: 2505 Blocpdb> 20 atoms in block 112 Block first atom: 2532 Blocpdb> 19 atoms in block 113 Block first atom: 2552 Blocpdb> 23 atoms in block 114 Block first atom: 2571 Blocpdb> 31 atoms in block 115 Block first atom: 2594 Blocpdb> 19 atoms in block 116 Block first atom: 2625 Blocpdb> 17 atoms in block 117 Block first atom: 2644 Blocpdb> 21 atoms in block 118 Block first atom: 2661 Blocpdb> 20 atoms in block 119 Block first atom: 2682 Blocpdb> 28 atoms in block 120 Block first atom: 2702 Blocpdb> 13 atoms in block 121 Block first atom: 2730 Blocpdb> 23 atoms in block 122 Block first atom: 2743 Blocpdb> 19 atoms in block 123 Block first atom: 2766 Blocpdb> 24 atoms in block 124 Block first atom: 2785 Blocpdb> 18 atoms in block 125 Block first atom: 2809 Blocpdb> 24 atoms in block 126 Block first atom: 2827 Blocpdb> 29 atoms in block 127 Block first atom: 2851 Blocpdb> 16 atoms in block 128 Block first atom: 2880 Blocpdb> 28 atoms in block 129 Block first atom: 2896 Blocpdb> 19 atoms in block 130 Block first atom: 2924 Blocpdb> 25 atoms in block 131 Block first atom: 2943 Blocpdb> 22 atoms in block 132 Block first atom: 2968 Blocpdb> 31 atoms in block 133 Block first atom: 2990 Blocpdb> 24 atoms in block 134 Block first atom: 3021 Blocpdb> 21 atoms in block 135 Block first atom: 3045 Blocpdb> 29 atoms in block 136 Block first atom: 3066 Blocpdb> 18 atoms in block 137 Block first atom: 3095 Blocpdb> 21 atoms in block 138 Block first atom: 3113 Blocpdb> 19 atoms in block 139 Block first atom: 3134 Blocpdb> 26 atoms in block 140 Block first atom: 3153 Blocpdb> 22 atoms in block 141 Block first atom: 3179 Blocpdb> 20 atoms in block 142 Block first atom: 3201 Blocpdb> 20 atoms in block 143 Block first atom: 3221 Blocpdb> 18 atoms in block 144 Block first atom: 3241 Blocpdb> 17 atoms in block 145 Block first atom: 3259 Blocpdb> 24 atoms in block 146 Block first atom: 3276 Blocpdb> 27 atoms in block 147 Block first atom: 3300 Blocpdb> 19 atoms in block 148 Block first atom: 3327 Blocpdb> 21 atoms in block 149 Block first atom: 3346 Blocpdb> 13 atoms in block 150 Block first atom: 3367 Blocpdb> 19 atoms in block 151 Block first atom: 3380 Blocpdb> 23 atoms in block 152 Block first atom: 3399 Blocpdb> 20 atoms in block 153 Block first atom: 3422 Blocpdb> 20 atoms in block 154 Block first atom: 3442 Blocpdb> 20 atoms in block 155 Block first atom: 3462 Blocpdb> 29 atoms in block 156 Block first atom: 3482 Blocpdb> 24 atoms in block 157 Block first atom: 3511 Blocpdb> 20 atoms in block 158 Block first atom: 3535 Blocpdb> 22 atoms in block 159 Block first atom: 3555 Blocpdb> 20 atoms in block 160 Block first atom: 3577 Blocpdb> 33 atoms in block 161 Block first atom: 3597 Blocpdb> 21 atoms in block 162 Block first atom: 3630 Blocpdb> 27 atoms in block 163 Block first atom: 3651 Blocpdb> 25 atoms in block 164 Block first atom: 3678 Blocpdb> 22 atoms in block 165 Block first atom: 3703 Blocpdb> 28 atoms in block 166 Block first atom: 3725 Blocpdb> 19 atoms in block 167 Block first atom: 3753 Blocpdb> 24 atoms in block 168 Block first atom: 3772 Blocpdb> 26 atoms in block 169 Block first atom: 3796 Blocpdb> 24 atoms in block 170 Block first atom: 3822 Blocpdb> 20 atoms in block 171 Block first atom: 3846 Blocpdb> 20 atoms in block 172 Block first atom: 3866 Blocpdb> 23 atoms in block 173 Block first atom: 3886 Blocpdb> 26 atoms in block 174 Block first atom: 3909 Blocpdb> 19 atoms in block 175 Block first atom: 3935 Blocpdb> 23 atoms in block 176 Block first atom: 3954 Blocpdb> 23 atoms in block 177 Block first atom: 3977 Blocpdb> 25 atoms in block 178 Block first atom: 4000 Blocpdb> 20 atoms in block 179 Block first atom: 4025 Blocpdb> 24 atoms in block 180 Block first atom: 4045 Blocpdb> 17 atoms in block 181 Block first atom: 4069 Blocpdb> 26 atoms in block 182 Block first atom: 4086 Blocpdb> 22 atoms in block 183 Block first atom: 4112 Blocpdb> 22 atoms in block 184 Block first atom: 4134 Blocpdb> 22 atoms in block 185 Block first atom: 4156 Blocpdb> 24 atoms in block 186 Block first atom: 4178 Blocpdb> 23 atoms in block 187 Block first atom: 4202 Blocpdb> 21 atoms in block 188 Block first atom: 4225 Blocpdb> 22 atoms in block 189 Block first atom: 4246 Blocpdb> 24 atoms in block 190 Block first atom: 4268 Blocpdb> 29 atoms in block 191 Block first atom: 4292 Blocpdb> 19 atoms in block 192 Block first atom: 4321 Blocpdb> 19 atoms in block 193 Block first atom: 4340 Blocpdb> 22 atoms in block 194 Block first atom: 4359 Blocpdb> 28 atoms in block 195 Block first atom: 4381 Blocpdb> 23 atoms in block 196 Block first atom: 4409 Blocpdb> 33 atoms in block 197 Block first atom: 4432 Blocpdb> 25 atoms in block 198 Block first atom: 4465 Blocpdb> 19 atoms in block 199 Block first atom: 4490 Blocpdb> 4 atoms in block 200 Block first atom: 4508 Blocpdb> 200 blocks. Blocpdb> At most, 33 atoms in each of them. Blocpdb> At least, 4 atoms in each of them. Blocpdb> Normal end of Blocpdb. Diagrtb> Memory allocation for Prepmat. Diagrtb> Memory allocation for RTB. Diagrtb> Memory allocation for Diagstd. Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes. Prepmat> Entering in. Prepmat> Rewriting of the matrix begins. Prepmat> 1762667 matrix lines read. Prepmat> Matrix order = 13536 Prepmat> Matrix trace = 3857200.0000 Prepmat> Last element read: 13536 13536 49.7835 Prepmat> 20101 lines saved. Prepmat> 17994 empty lines. Prepmat> Number of lines on output is as expected. Prepmat> Normal end of Prepmat. RTB> Entering in. RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 4512 RTB> Total mass = 4512.0000 RTB> Number of atoms found in matrix: 4512 RTB> Number of blocks = 200 RTB> Projection begins. RTB> Projected matrix is being saved. RTB> Projected matrix trace = 272577.3316 RTB> 72816 non-zero elements. RTB> Normal end of RTB. Diagstd> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.sdijb Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb Diagstd> CERFACS matrix format. Diagstd> Projected matrix order = 1200 Diagstd> Nb of non-zero elements: 72816 Diagstd> Projected matrix trace = 272577.3316 Openam> file on opening on unit 11: diagrtb_work.eigenfacs Diagstd> Diagonalization. Diagstd> 1200 eigenvectors are computed. Diagstd> 106 of them to be saved. Diagstd> Sum of eigenvalues = 272577.3316 Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000 Diagstd> Selected eigenvalues: 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.8952460 1.1644029 2.1338893 4.4402765 4.6088622 4.8894387 8.6620437 9.3093428 10.0773038 10.1346333 11.6855694 12.0040021 12.8405984 13.0188871 14.1402054 14.3198894 15.0442973 15.2465784 15.3599270 16.5813031 17.5293142 18.0318332 18.5512241 18.6128654 19.4234663 20.1254895 20.2189553 20.5499120 21.0739379 21.6398014 22.6064832 22.6555170 23.4056197 24.1277391 24.5146436 24.6010917 24.9228653 26.2206212 26.4689965 26.5163348 26.6096603 27.5254261 28.0074851 28.5881809 28.7428639 29.9112389 30.4538651 31.2946634 31.4197785 31.9345605 32.0345731 32.8082295 33.6861918 34.2187570 34.8849668 35.0725426 35.3561484 35.3887291 35.7998169 36.3345806 36.9441025 37.2047124 38.7042061 39.1427650 39.3931171 39.7357763 40.0557620 40.2507751 40.6850121 41.1776385 41.2481035 41.4688732 42.2865012 42.4632181 42.7704552 43.3245939 44.2706194 44.3985966 44.4015135 44.6209107 44.8481191 45.6573212 46.0737885 46.5748904 46.9204887 47.2828994 47.8707936 49.0202621 49.9938213 50.0312406 50.9130386 51.0669991 51.3018764 51.6881820 52.2522849 52.4160546 53.4257056 53.8412926 53.9840059 54.4810262 Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units): 0.0034331 0.0034339 0.0034342 0.0034342 0.0034350 0.0034354 102.7463653 117.1782247 158.6285003 228.8233240 233.1267668 240.1180368 319.5990398 331.3254466 344.7207742 345.6999374 371.2104718 376.2342347 389.1239057 391.8160394 408.3411430 410.9274108 421.1930861 424.0152491 425.5884724 442.1856142 454.6505732 461.1213403 467.7152881 468.4916977 478.5845214 487.1565054 488.2864095 492.2664790 498.5034036 505.1518123 516.3114826 516.8711230 525.3580024 533.4007156 537.6604262 538.6075915 542.1185467 556.0537431 558.6811503 559.1805115 560.1636786 569.7211017 574.6882761 580.6153874 582.1840452 593.8988458 599.2616560 607.4778154 608.6909430 613.6570836 614.6172581 621.9946908 630.2621681 635.2247272 641.3785582 643.1005872 645.6954919 645.9929273 649.7341333 654.5688829 660.0363292 662.3602419 675.5762321 679.3929411 681.5621332 684.5199834 687.2706211 688.9415923 692.6478733 696.8286501 697.4246177 699.2885182 706.1486884 707.6226613 710.1780029 714.7637693 722.5253342 723.5689159 723.5926842 725.3781931 727.2226506 733.7540207 737.0929243 741.0904232 743.8348875 746.7020266 751.3297639 760.2966815 767.8094397 768.0967299 774.8359972 776.0066612 777.7891941 780.7120973 784.9607176 786.1898715 793.7256474 796.8067770 797.8620974 801.5265636 Diagstd> Normal end. Rtb_to_modes> Entering in. Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 4512 Rtb_to_modes> Number of blocs = 200 Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.eigenfacs Openam> file on opening on unit 11: matrix.eigenrtb Rdmodfacs> Entering in. Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Eigenvector number: 1 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9949E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 2 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9994E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 3 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0001E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 4 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0002E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 5 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0006E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 6 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0008E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 7 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.8952 Rdmodfacs> Eigenvector number: 8 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.164 Rdmodfacs> Eigenvector number: 9 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.134 Rdmodfacs> Eigenvector number: 10 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.440 Rdmodfacs> Eigenvector number: 11 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.609 Rdmodfacs> Eigenvector number: 12 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.889 Rdmodfacs> Eigenvector number: 13 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.662 Rdmodfacs> Eigenvector number: 14 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.309 Rdmodfacs> Eigenvector number: 15 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.08 Rdmodfacs> Eigenvector number: 16 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.13 Rdmodfacs> Eigenvector number: 17 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.69 Rdmodfacs> Eigenvector number: 18 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.00 Rdmodfacs> Eigenvector number: 19 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.84 Rdmodfacs> Eigenvector number: 20 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 21 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.14 Rdmodfacs> Eigenvector number: 22 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.32 Rdmodfacs> Eigenvector number: 23 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.04 Rdmodfacs> Eigenvector number: 24 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.25 Rdmodfacs> Eigenvector number: 25 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.36 Rdmodfacs> Eigenvector number: 26 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.58 Rdmodfacs> Eigenvector number: 27 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.53 Rdmodfacs> Eigenvector number: 28 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.03 Rdmodfacs> Eigenvector number: 29 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.55 Rdmodfacs> Eigenvector number: 30 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.61 Rdmodfacs> Eigenvector number: 31 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.42 Rdmodfacs> Eigenvector number: 32 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.13 Rdmodfacs> Eigenvector number: 33 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.22 Rdmodfacs> Eigenvector number: 34 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.55 Rdmodfacs> Eigenvector number: 35 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.07 Rdmodfacs> Eigenvector number: 36 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.64 Rdmodfacs> Eigenvector number: 37 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.61 Rdmodfacs> Eigenvector number: 38 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.66 Rdmodfacs> Eigenvector number: 39 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.41 Rdmodfacs> Eigenvector number: 40 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.13 Rdmodfacs> Eigenvector number: 41 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.51 Rdmodfacs> Eigenvector number: 42 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.60 Rdmodfacs> Eigenvector number: 43 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.92 Rdmodfacs> Eigenvector number: 44 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.22 Rdmodfacs> Eigenvector number: 45 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.47 Rdmodfacs> Eigenvector number: 46 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.52 Rdmodfacs> Eigenvector number: 47 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.61 Rdmodfacs> Eigenvector number: 48 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.53 Rdmodfacs> Eigenvector number: 49 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.01 Rdmodfacs> Eigenvector number: 50 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.59 Rdmodfacs> Eigenvector number: 51 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.74 Rdmodfacs> Eigenvector number: 52 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.91 Rdmodfacs> Eigenvector number: 53 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.45 Rdmodfacs> Eigenvector number: 54 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.29 Rdmodfacs> Eigenvector number: 55 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.42 Rdmodfacs> Eigenvector number: 56 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.93 Rdmodfacs> Eigenvector number: 57 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.03 Rdmodfacs> Eigenvector number: 58 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.81 Rdmodfacs> Eigenvector number: 59 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.69 Rdmodfacs> Eigenvector number: 60 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.22 Rdmodfacs> Eigenvector number: 61 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.88 Rdmodfacs> Eigenvector number: 62 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.07 Rdmodfacs> Eigenvector number: 63 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.36 Rdmodfacs> Eigenvector number: 64 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.39 Rdmodfacs> Eigenvector number: 65 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.80 Rdmodfacs> Eigenvector number: 66 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.33 Rdmodfacs> Eigenvector number: 67 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.94 Rdmodfacs> Eigenvector number: 68 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.20 Rdmodfacs> Eigenvector number: 69 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.70 Rdmodfacs> Eigenvector number: 70 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.14 Rdmodfacs> Eigenvector number: 71 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.39 Rdmodfacs> Eigenvector number: 72 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.74 Rdmodfacs> Eigenvector number: 73 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.06 Rdmodfacs> Eigenvector number: 74 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.25 Rdmodfacs> Eigenvector number: 75 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.69 Rdmodfacs> Eigenvector number: 76 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.18 Rdmodfacs> Eigenvector number: 77 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.25 Rdmodfacs> Eigenvector number: 78 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.47 Rdmodfacs> Eigenvector number: 79 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.29 Rdmodfacs> Eigenvector number: 80 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.46 Rdmodfacs> Eigenvector number: 81 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.77 Rdmodfacs> Eigenvector number: 82 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.32 Rdmodfacs> Eigenvector number: 83 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.27 Rdmodfacs> Eigenvector number: 84 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.40 Rdmodfacs> Eigenvector number: 85 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.40 Rdmodfacs> Eigenvector number: 86 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.62 Rdmodfacs> Eigenvector number: 87 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.85 Rdmodfacs> Eigenvector number: 88 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.66 Rdmodfacs> Eigenvector number: 89 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.07 Rdmodfacs> Eigenvector number: 90 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.57 Rdmodfacs> Eigenvector number: 91 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.92 Rdmodfacs> Eigenvector number: 92 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 47.28 Rdmodfacs> Eigenvector number: 93 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 47.87 Rdmodfacs> Eigenvector number: 94 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 49.02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 95 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 49.99 Rdmodfacs> Eigenvector number: 96 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 50.03 Rdmodfacs> Eigenvector number: 97 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 50.91 Rdmodfacs> Eigenvector number: 98 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 51.07 Rdmodfacs> Eigenvector number: 99 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 51.30 Rdmodfacs> Eigenvector number: 100 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 51.69 Rdmodfacs> Eigenvector number: 101 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 52.25 Rdmodfacs> Eigenvector number: 102 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 52.42 Rdmodfacs> Eigenvector number: 103 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 53.43 Rdmodfacs> Eigenvector number: 104 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 53.84 Rdmodfacs> Eigenvector number: 105 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 53.98 Rdmodfacs> Eigenvector number: 106 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 54.48 Rtb_to_modes> 106 vectors, with 1200 coordinates in vector file. Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected): 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 0.99998 0.99999 1.00002 0.99998 1.00000 1.00001 0.99998 1.00001 1.00001 1.00002 1.00006 1.00001 1.00000 0.99998 1.00000 1.00003 1.00001 0.99999 1.00000 1.00000 1.00000 1.00002 0.99998 1.00001 1.00000 1.00001 1.00000 0.99999 1.00000 1.00001 1.00001 0.99999 1.00000 0.99999 1.00001 1.00000 0.99998 1.00001 1.00000 1.00000 1.00000 0.99998 0.99999 1.00000 0.99998 1.00000 0.99998 1.00001 1.00003 1.00002 1.00002 0.99999 1.00001 0.99998 1.00001 1.00001 0.99998 1.00001 1.00000 1.00001 1.00001 0.99998 1.00002 0.99999 0.99999 1.00003 1.00001 1.00000 1.00001 0.99999 0.99998 1.00001 1.00002 1.00001 1.00003 1.00000 1.00002 0.99999 1.00000 0.99997 0.99999 0.99998 1.00001 0.99999 1.00001 1.00000 1.00000 1.00003 1.00001 0.99999 1.00002 1.00000 1.00002 1.00001 1.00003 1.00000 Rtb_to_modes> RTB block-file is being read. Rtb_to_modes> 81216 lines found in RTB file. Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected): 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 0.99998 0.99999 1.00002 0.99998 1.00000 1.00001 0.99998 1.00001 1.00001 1.00002 1.00006 1.00001 1.00000 0.99998 1.00000 1.00003 1.00001 0.99999 1.00000 1.00000 1.00000 1.00002 0.99998 1.00001 1.00000 1.00001 1.00000 0.99999 1.00000 1.00001 1.00001 0.99999 1.00000 0.99999 1.00001 1.00000 0.99998 1.00001 1.00000 1.00000 1.00000 0.99998 0.99999 1.00000 0.99998 1.00000 0.99998 1.00001 1.00003 1.00002 1.00002 0.99999 1.00001 0.99998 1.00001 1.00001 0.99998 1.00001 1.00000 1.00001 1.00001 0.99998 1.00002 0.99999 0.99999 1.00003 1.00001 1.00000 1.00001 0.99999 0.99998 1.00001 1.00002 1.00001 1.00003 1.00000 1.00002 0.99999 1.00000 0.99997 0.99999 0.99998 1.00001 0.99999 1.00001 1.00000 1.00000 1.00003 1.00001 0.99999 1.00002 1.00000 1.00002 1.00001 1.00003 1.00000 Orthogonality of first eigenvectors (zero expected): Vector 2:-0.000 Vector 3: 0.000 0.000 Vector 4: 0.000 0.000 0.000 Vector 5: 0.000 0.000-0.000-0.000 Vector 6: 0.000-0.000 0.000-0.000-0.000 Vector 7: 0.000 0.000-0.000 0.000-0.000-0.000 Vector 8: 0.000 0.000 0.000-0.000 0.000 0.000-0.000 Vector 9: 0.000 0.000-0.000 0.000 0.000-0.000 0.000-0.000 Vector 10:-0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000-0.000-0.000 Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved. Rtb_to_modes> Normal end. Diagrtb> Normal end. B-factor analysis Bfactors> Version 1.22, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 260211031023738954.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 260211031023738954.eigenfacs Getnam> Corresponding pdb filename ? Getnam> 260211031023738954.atom Openam> file on opening on unit 11: 260211031023738954.atom Getnum> Number of skipped eigenvectors ? Getnum> 0 Getnum> Number of usefull eigenvectors ? Getnum> 10000 %Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 596 First residue number = 18 Last residue number = 315 Number of atoms found = 4512 Mean number per residue = 7.6 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9949E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9994E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0001E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0002E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0006E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0008E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.8952 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.164 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.134 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.440 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.609 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.889 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.662 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.309 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.08 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.13 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.69 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.00 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.84 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.14 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.32 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.04 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.25 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.36 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.58 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.53 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.55 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.61 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.42 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.13 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.22 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.55 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.07 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.64 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.61 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.66 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.41 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.13 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.51 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.60 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.92 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.22 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.47 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.52 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.61 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.53 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.01 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.59 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.74 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.91 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.45 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.29 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.42 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.93 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.81 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.69 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.22 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.88 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.07 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.36 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.39 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.80 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.33 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.94 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.20 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.70 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.14 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.39 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.74 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.06 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.25 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.69 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.18 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.25 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.47 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.29 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.46 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.77 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.32 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.27 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.40 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.40 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.62 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.85 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.66 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.07 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.57 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.92 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.28 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.87 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.99 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 50.03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 50.91 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 51.07 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 51.30 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 51.69 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 52.25 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 52.42 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 53.43 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 53.84 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 53.98 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 54.48 Bfactors> 106 vectors, 13536 coordinates in file. Openam> file on opening on unit 12: bfactors.pred Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000 Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 0.895200 Bfactors> 100 eigenvectors will be considered. Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped. Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed. (CHARMM units assumed for eigenvalues) Bfactors> Correlation= -0.384 for 596 C-alpha atoms. Bfactors> = 0.022 +/- 0.02 Bfactors> = 90.216 +/- 6.13 Bfactors> Shiftng-fct= 90.194 Bfactors> Scaling-fct= 302.284 Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved. Bfactors> Normal end. check_modes Chkmod> Version 1.00, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 260211031023738954.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 260211031023738954.eigenfacs Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4329E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4337E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4340E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4342E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4348E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4352E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 102.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 117.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 158.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 228.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 233.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 240.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 319.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 331.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 344.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 345.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 371.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 376.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 389.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 391.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 408.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 410.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 421.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 424.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 425.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 442.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 454.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 461.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 467.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 468.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 478.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 487.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 488.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 492.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 498.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 505.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 516.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 516.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 525.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 533.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 537.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 538.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 542.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 556.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 558.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 559.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 560.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 569.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 574.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 580.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 582.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 593.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 599.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 607.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 608.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 613.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 614.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 622.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 630.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 635.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 641.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 643.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 645.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 646.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 649.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 654.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 660.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 662.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 675.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 679.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 681.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 684.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 687.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 688.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 692.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 696.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 697.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 699.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 706.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 707.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 710.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 714.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 722.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 723.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 723.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 725.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 727.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 733.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 737.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 741.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 743.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 746.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 751.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 760.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 767.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 768.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 774.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 776.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 777.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 780.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 784.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 786.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 793.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 796.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 797.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 801.5 Chkmod> 106 vectors, 13536 coordinates in file. Chkmod> That is: 4512 cartesian points. Openam> file on opening on unit 11: Chkmod.res Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file. %Chkmod-Wn> Norm of vector 21 is: 1.0001 (instead of 1.0000). Chkmod> Normal end. 0.0034 0.7686 0.0034 0.9274 0.0034 0.7777 0.0034 0.7740 0.0034 0.9332 0.0034 0.9125 102.7393 0.7273 117.1529 0.7291 158.6258 0.7461 228.8064 0.7504 233.1202 0.7533 240.0970 0.8393 319.5845 0.4041 331.3051 0.4472 344.7521 0.4161 345.6061 0.3866 371.2649 0.4143 376.1554 0.1978 389.0981 0.2087 391.8160 0.3837 408.3206 0.0160 410.9114 0.0152 421.1148 0.3864 424.0446 0.4171 425.5712 0.5214 442.1493 0.5530 454.6399 0.4251 461.0781 0.3045 467.6798 0.3439 468.4355 0.2441 478.5213 0.2195 487.1902 0.4622 488.2781 0.4755 492.2464 0.5313 498.4354 0.4137 505.1324 0.5806 516.3295 0.3454 516.9001 0.4818 525.3846 0.6076 533.4028 0.2844 537.5864 0.5088 538.5725 0.5281 542.0641 0.4427 556.0233 0.6909 558.6678 0.3832 559.1952 0.4122 560.1432 0.2168 569.7440 0.3457 574.6894 0.2622 580.6089 0.5405 582.1301 0.2879 593.8611 0.3121 599.1979 0.4367 607.4065 0.4416 608.6670 0.4619 613.5869 0.4099 614.5470 0.3158 621.9848 0.3647 630.2707 0.2708 635.2090 0.5185 641.3054 0.3865 643.0497 0.4579 645.7029 0.3857 645.9768 0.3668 649.7079 0.4274 654.4995 0.3650 659.9713 0.4143 662.2899 0.3836 675.5105 0.3121 679.3398 0.3906 681.5059 0.4480 684.5270 0.4406 687.2775 0.2256 688.9054 0.2567 692.6606 0.2494 696.8187 0.1445 697.4107 0.1281 699.2680 0.3709 706.1476 0.3009 707.5655 0.2841 710.1437 0.5389 714.6952 0.3625 722.4893 0.4632 723.5493 0.3884 723.5493 0.4343 725.3397 0.4906 727.2067 0.3763 733.7440 0.3598 737.0310 0.3777 741.0197 0.2927 743.7991 0.5495 746.6471 0.4418 751.2913 0.3148 760.2620 0.5864 767.7471 0.5948 768.0542 0.5884 774.7796 0.2969 775.9961 0.3913 777.7416 0.3710 780.6923 0.4465 784.9099 0.4665 786.1857 0.5173 793.7235 0.3102 796.7630 0.4203 797.7982 0.2505 801.4846 0.3297 getting mode 7 running: ../../bin/get_modes.sh 260211031023738954 7 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 7 calculating perturbed structure for DQ=-100 260211031023738954.eigenfacs 260211031023738954.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 260211031023738954.eigenfacs 260211031023738954.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 260211031023738954.eigenfacs 260211031023738954.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 260211031023738954.eigenfacs 260211031023738954.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 260211031023738954.eigenfacs 260211031023738954.atom calculating perturbed structure for DQ=0 260211031023738954.eigenfacs 260211031023738954.atom calculating perturbed structure for DQ=20 260211031023738954.eigenfacs 260211031023738954.atom calculating perturbed structure for DQ=40 260211031023738954.eigenfacs 260211031023738954.atom calculating perturbed structure for DQ=60 260211031023738954.eigenfacs 260211031023738954.atom calculating perturbed structure for DQ=80 260211031023738954.eigenfacs 260211031023738954.atom calculating perturbed structure for DQ=100 260211031023738954.eigenfacs 260211031023738954.atom making animated gifs 11 models are in 260211031023738954.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 260211031023738954.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 260211031023738954.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 8 running: ../../bin/get_modes.sh 260211031023738954 8 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 8 calculating perturbed structure for DQ=-100 260211031023738954.eigenfacs 260211031023738954.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 260211031023738954.eigenfacs 260211031023738954.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 260211031023738954.eigenfacs 260211031023738954.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 260211031023738954.eigenfacs 260211031023738954.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 260211031023738954.eigenfacs 260211031023738954.atom calculating perturbed structure for DQ=0 260211031023738954.eigenfacs 260211031023738954.atom calculating perturbed structure for DQ=20 260211031023738954.eigenfacs 260211031023738954.atom calculating perturbed structure for DQ=40 260211031023738954.eigenfacs 260211031023738954.atom calculating perturbed structure for DQ=60 260211031023738954.eigenfacs 260211031023738954.atom calculating perturbed structure for DQ=80 260211031023738954.eigenfacs 260211031023738954.atom calculating perturbed structure for DQ=100 260211031023738954.eigenfacs 260211031023738954.atom making animated gifs 11 models are in 260211031023738954.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 260211031023738954.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 260211031023738954.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 9 running: ../../bin/get_modes.sh 260211031023738954 9 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 9 calculating perturbed structure for DQ=-100 260211031023738954.eigenfacs 260211031023738954.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 260211031023738954.eigenfacs 260211031023738954.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 260211031023738954.eigenfacs 260211031023738954.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 260211031023738954.eigenfacs 260211031023738954.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 260211031023738954.eigenfacs 260211031023738954.atom calculating perturbed structure for DQ=0 260211031023738954.eigenfacs 260211031023738954.atom calculating perturbed structure for DQ=20 260211031023738954.eigenfacs 260211031023738954.atom calculating perturbed structure for DQ=40 260211031023738954.eigenfacs 260211031023738954.atom calculating perturbed structure for DQ=60 260211031023738954.eigenfacs 260211031023738954.atom calculating perturbed structure for DQ=80 260211031023738954.eigenfacs 260211031023738954.atom calculating perturbed structure for DQ=100 260211031023738954.eigenfacs 260211031023738954.atom making animated gifs 11 models are in 260211031023738954.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 260211031023738954.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 260211031023738954.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 10 running: ../../bin/get_modes.sh 260211031023738954 10 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 10 calculating perturbed structure for DQ=-100 260211031023738954.eigenfacs 260211031023738954.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 260211031023738954.eigenfacs 260211031023738954.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 260211031023738954.eigenfacs 260211031023738954.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 260211031023738954.eigenfacs 260211031023738954.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 260211031023738954.eigenfacs 260211031023738954.atom calculating perturbed structure for DQ=0 260211031023738954.eigenfacs 260211031023738954.atom calculating perturbed structure for DQ=20 260211031023738954.eigenfacs 260211031023738954.atom calculating perturbed structure for DQ=40 260211031023738954.eigenfacs 260211031023738954.atom calculating perturbed structure for DQ=60 260211031023738954.eigenfacs 260211031023738954.atom calculating perturbed structure for DQ=80 260211031023738954.eigenfacs 260211031023738954.atom calculating perturbed structure for DQ=100 260211031023738954.eigenfacs 260211031023738954.atom making animated gifs 11 models are in 260211031023738954.10.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 260211031023738954.10.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 260211031023738954.10.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 11 running: ../../bin/get_modes.sh 260211031023738954 11 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 11 calculating perturbed structure for DQ=-100 260211031023738954.eigenfacs 260211031023738954.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 260211031023738954.eigenfacs 260211031023738954.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 260211031023738954.eigenfacs 260211031023738954.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 260211031023738954.eigenfacs 260211031023738954.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 260211031023738954.eigenfacs 260211031023738954.atom calculating perturbed structure for DQ=0 260211031023738954.eigenfacs 260211031023738954.atom calculating perturbed structure for DQ=20 260211031023738954.eigenfacs 260211031023738954.atom calculating perturbed structure for DQ=40 260211031023738954.eigenfacs 260211031023738954.atom calculating perturbed structure for DQ=60 260211031023738954.eigenfacs 260211031023738954.atom calculating perturbed structure for DQ=80 260211031023738954.eigenfacs 260211031023738954.atom calculating perturbed structure for DQ=100 260211031023738954.eigenfacs 260211031023738954.atom making animated gifs 11 models are in 260211031023738954.11.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 260211031023738954.11.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 260211031023738954.11.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 260211031023738954.10.pdb 260211031023738954.11.pdb 260211031023738954.7.pdb 260211031023738954.8.pdb 260211031023738954.9.pdb STDERR: Note: The following floating-point exceptions are signalling: IEEE_DENORMAL real 0m26.883s user 0m26.739s sys 0m0.128s rm: cannot remove '260211031023738954.sdijf': No such file or directory pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format




If you find results from this site helpful for your research, please cite one of our papers:

elNémo is maintained by Yves-Henri Sanejouand.
It was developed by Karsten Suhre.
Between 2003 and 2014, it was hosted by IGS (Marseille).
Between 2015 and 2025, it was hosted by US2B (Nantes).
Last modification: december 26th, 2025.