*** ***
Output from eigenvector calculation:
STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8)
Build Tirion matrix:
Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model.
Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004.
Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file.
Pdbmat> Coordinate filename = 260211153256928911.atom
Pdbmat> Distance cutoff = 8.00
Force constant = 10.00
Origin of mass values = CONS
Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09
PRINTing level = 2
Pdbmat> Coordinate file 260211153256928911.atom to be opened.
Openam> File opened: 260211153256928911.atom
Pdbmat> Coordinate file in PDB format.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 1759
First residue number = 1
Last residue number = 81
Number of atoms found = 15817
Mean number per residue = 9.0
Pdbmat> Coordinate statistics:
= -62.040061 +/- 44.154301 From: -175.836000 To: 16.000000
= 15.223220 +/- 24.602424 From: -38.846000 To: 91.543000
= 62.808019 +/- 30.117750 From: -12.403000 To: 132.975000
Pdbmat> Masses are all set to one.
%Pdbmat-W> residue:'DC ' is not a well known amino-acid.
%Pdbmat-W> residue:'DC ' is not a well known amino-acid.
%Pdbmat-W> residue:'DC ' is not a well known amino-acid.
%Pdbmat-W> residue:'DG ' is not a well known amino-acid.
%Pdbmat-W> residue:'DT ' is not a well known amino-acid.
%Pdbmat-W> residue:'DA ' is not a well known amino-acid.
%Pdbmat-W> residue:'DG ' is not a well known amino-acid.
%Pdbmat-W> residue:'DT ' is not a well known amino-acid.
%Pdbmat-W> residue:'DG ' is not a well known amino-acid.
%Pdbmat-W> ........
%Pdbmat-W> 162 residue(s) not known.
Openam> File opened: pdbmat.xyzm
Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved.
Openam> File opened: pdbmat.sdijb
Pdbmat> Matrix statistics:
Pdbmat> The matrix is -0.5651 % Filled.
Pdbmat> 5773896 non-zero elements.
Pdbmat> 631101 atom-atom interactions.
Pdbmat> Number per atom= 79.80 +/- 22.50
Maximum number = 159
Minimum number = 8
Pdbmat> Matrix trace = 1.262202E+07
Pdbmat> Larger element = 646.746
Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10
Pdbmat> Normal end.
automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1)
1759 non-zero elements, NRBL set to 9
Diagonalize Tirion matrix using diagrtb
Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation.
Diagrtb> Version 2.52, November 2004.
Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file.
Diagrtb> Options taken into account:
MATRix filename = pdbmat.sdijb
COORdinates filename = 260211153256928911.atom
Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb
Nb of VECTors required = 106
EigeNVALues chosen = LOWE
Type of SUBStructuring = NONE
Nb of residues per BLOck = 9
Origin of MASS values = CONS
MATRix FORMat = BINA
Temporary files cleaning = ALL
Output PRINting level = 2
Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb.
Blocpdb> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.xyzm
Blocpdb> Coordinate file 260211153256928911.atom to be opened.
Openam> file on opening on unit 11:
260211153256928911.atom
Blocpdb> Coordinate file in PDB format.
Blocpdb> 15817 atoms picked in pdb file.
Blocpdb> All masses set to unity.
Blocpdb> Coordinate file is rewritten.
Blocpdb> Substructuring:
Blocpdb> 9 residue(s) per block.
Blocpdb> 1759 residues.
Blocpdb> 64 atoms in block 1
Block first atom: 1
Blocpdb> 72 atoms in block 2
Block first atom: 65
Blocpdb> 68 atoms in block 3
Block first atom: 137
Blocpdb> 80 atoms in block 4
Block first atom: 205
Blocpdb> 73 atoms in block 5
Block first atom: 285
Blocpdb> 70 atoms in block 6
Block first atom: 358
Blocpdb> 72 atoms in block 7
Block first atom: 428
Blocpdb> 65 atoms in block 8
Block first atom: 500
Blocpdb> 60 atoms in block 9
Block first atom: 565
Blocpdb> 72 atoms in block 10
Block first atom: 625
Blocpdb> 68 atoms in block 11
Block first atom: 697
Blocpdb> 73 atoms in block 12
Block first atom: 765
Blocpdb> 73 atoms in block 13
Block first atom: 838
Blocpdb> 31 atoms in block 14
Block first atom: 911
Blocpdb> 64 atoms in block 15
Block first atom: 942
Blocpdb> 72 atoms in block 16
Block first atom: 1006
Blocpdb> 68 atoms in block 17
Block first atom: 1078
Blocpdb> 80 atoms in block 18
Block first atom: 1146
Blocpdb> 73 atoms in block 19
Block first atom: 1226
Blocpdb> 70 atoms in block 20
Block first atom: 1299
Blocpdb> 72 atoms in block 21
Block first atom: 1369
Blocpdb> 65 atoms in block 22
Block first atom: 1441
Blocpdb> 60 atoms in block 23
Block first atom: 1506
Blocpdb> 72 atoms in block 24
Block first atom: 1566
Blocpdb> 68 atoms in block 25
Block first atom: 1638
Blocpdb> 73 atoms in block 26
Block first atom: 1706
Blocpdb> 73 atoms in block 27
Block first atom: 1779
Blocpdb> 31 atoms in block 28
Block first atom: 1852
Blocpdb> 64 atoms in block 29
Block first atom: 1883
Blocpdb> 72 atoms in block 30
Block first atom: 1947
Blocpdb> 68 atoms in block 31
Block first atom: 2019
Blocpdb> 80 atoms in block 32
Block first atom: 2087
Blocpdb> 73 atoms in block 33
Block first atom: 2167
Blocpdb> 70 atoms in block 34
Block first atom: 2240
Blocpdb> 72 atoms in block 35
Block first atom: 2310
Blocpdb> 65 atoms in block 36
Block first atom: 2382
Blocpdb> 60 atoms in block 37
Block first atom: 2447
Blocpdb> 72 atoms in block 38
Block first atom: 2507
Blocpdb> 68 atoms in block 39
Block first atom: 2579
Blocpdb> 73 atoms in block 40
Block first atom: 2647
Blocpdb> 73 atoms in block 41
Block first atom: 2720
Blocpdb> 31 atoms in block 42
Block first atom: 2793
Blocpdb> 64 atoms in block 43
Block first atom: 2824
Blocpdb> 72 atoms in block 44
Block first atom: 2888
Blocpdb> 68 atoms in block 45
Block first atom: 2960
Blocpdb> 80 atoms in block 46
Block first atom: 3028
Blocpdb> 73 atoms in block 47
Block first atom: 3108
Blocpdb> 70 atoms in block 48
Block first atom: 3181
Blocpdb> 72 atoms in block 49
Block first atom: 3251
Blocpdb> 65 atoms in block 50
Block first atom: 3323
Blocpdb> 60 atoms in block 51
Block first atom: 3388
Blocpdb> 72 atoms in block 52
Block first atom: 3448
Blocpdb> 68 atoms in block 53
Block first atom: 3520
Blocpdb> 73 atoms in block 54
Block first atom: 3588
Blocpdb> 73 atoms in block 55
Block first atom: 3661
Blocpdb> 31 atoms in block 56
Block first atom: 3734
Blocpdb> 64 atoms in block 57
Block first atom: 3765
Blocpdb> 72 atoms in block 58
Block first atom: 3829
Blocpdb> 68 atoms in block 59
Block first atom: 3901
Blocpdb> 80 atoms in block 60
Block first atom: 3969
Blocpdb> 73 atoms in block 61
Block first atom: 4049
Blocpdb> 70 atoms in block 62
Block first atom: 4122
Blocpdb> 72 atoms in block 63
Block first atom: 4192
Blocpdb> 65 atoms in block 64
Block first atom: 4264
Blocpdb> 60 atoms in block 65
Block first atom: 4329
Blocpdb> 72 atoms in block 66
Block first atom: 4389
Blocpdb> 68 atoms in block 67
Block first atom: 4461
Blocpdb> 73 atoms in block 68
Block first atom: 4529
Blocpdb> 73 atoms in block 69
Block first atom: 4602
Blocpdb> 31 atoms in block 70
Block first atom: 4675
Blocpdb> 62 atoms in block 71
Block first atom: 4706
Blocpdb> 77 atoms in block 72
Block first atom: 4768
Blocpdb> 60 atoms in block 73
Block first atom: 4845
Blocpdb> 77 atoms in block 74
Block first atom: 4905
Blocpdb> 62 atoms in block 75
Block first atom: 4982
Blocpdb> 76 atoms in block 76
Block first atom: 5044
Blocpdb> 58 atoms in block 77
Block first atom: 5120
Blocpdb> 70 atoms in block 78
Block first atom: 5178
Blocpdb> 67 atoms in block 79
Block first atom: 5248
Blocpdb> 68 atoms in block 80
Block first atom: 5315
Blocpdb> 73 atoms in block 81
Block first atom: 5383
Blocpdb> 76 atoms in block 82
Block first atom: 5456
Blocpdb> 82 atoms in block 83
Block first atom: 5532
Blocpdb> 86 atoms in block 84
Block first atom: 5614
Blocpdb> 72 atoms in block 85
Block first atom: 5700
Blocpdb> 71 atoms in block 86
Block first atom: 5772
Blocpdb> 76 atoms in block 87
Block first atom: 5843
Blocpdb> 71 atoms in block 88
Block first atom: 5919
Blocpdb> 68 atoms in block 89
Block first atom: 5990
Blocpdb> 80 atoms in block 90
Block first atom: 6058
Blocpdb> 71 atoms in block 91
Block first atom: 6138
Blocpdb> 63 atoms in block 92
Block first atom: 6209
Blocpdb> 63 atoms in block 93
Block first atom: 6272
Blocpdb> 71 atoms in block 94
Block first atom: 6335
Blocpdb> 71 atoms in block 95
Block first atom: 6406
Blocpdb> 76 atoms in block 96
Block first atom: 6477
Blocpdb> 67 atoms in block 97
Block first atom: 6553
Blocpdb> 76 atoms in block 98
Block first atom: 6620
Blocpdb> 72 atoms in block 99
Block first atom: 6696
Blocpdb> 64 atoms in block 100
Block first atom: 6768
Blocpdb> 77 atoms in block 101
Block first atom: 6832
Blocpdb> 79 atoms in block 102
Block first atom: 6909
Blocpdb> 64 atoms in block 103
Block first atom: 6988
Blocpdb> 66 atoms in block 104
Block first atom: 7052
Blocpdb> 63 atoms in block 105
Block first atom: 7118
Blocpdb> 71 atoms in block 106
Block first atom: 7181
Blocpdb> 69 atoms in block 107
Block first atom: 7252
Blocpdb> 69 atoms in block 108
Block first atom: 7321
Blocpdb> 63 atoms in block 109
Block first atom: 7390
Blocpdb> 65 atoms in block 110
Block first atom: 7453
Blocpdb> 86 atoms in block 111
Block first atom: 7518
Blocpdb> 69 atoms in block 112
Block first atom: 7604
Blocpdb> 73 atoms in block 113
Block first atom: 7673
Blocpdb> 71 atoms in block 114
Block first atom: 7746
Blocpdb> 68 atoms in block 115
Block first atom: 7817
Blocpdb> 65 atoms in block 116
Block first atom: 7885
Blocpdb> 71 atoms in block 117
Block first atom: 7950
Blocpdb> 74 atoms in block 118
Block first atom: 8021
Blocpdb> 29 atoms in block 119
Block first atom: 8095
Blocpdb> 64 atoms in block 120
Block first atom: 8124
Blocpdb> 72 atoms in block 121
Block first atom: 8188
Blocpdb> 68 atoms in block 122
Block first atom: 8260
Blocpdb> 80 atoms in block 123
Block first atom: 8328
Blocpdb> 73 atoms in block 124
Block first atom: 8408
Blocpdb> 70 atoms in block 125
Block first atom: 8481
Blocpdb> 72 atoms in block 126
Block first atom: 8551
Blocpdb> 65 atoms in block 127
Block first atom: 8623
Blocpdb> 60 atoms in block 128
Block first atom: 8688
Blocpdb> 72 atoms in block 129
Block first atom: 8748
Blocpdb> 68 atoms in block 130
Block first atom: 8820
Blocpdb> 73 atoms in block 131
Block first atom: 8888
Blocpdb> 73 atoms in block 132
Block first atom: 8961
Blocpdb> 31 atoms in block 133
Block first atom: 9034
Blocpdb> 64 atoms in block 134
Block first atom: 9065
Blocpdb> 72 atoms in block 135
Block first atom: 9129
Blocpdb> 68 atoms in block 136
Block first atom: 9201
Blocpdb> 80 atoms in block 137
Block first atom: 9269
Blocpdb> 73 atoms in block 138
Block first atom: 9349
Blocpdb> 70 atoms in block 139
Block first atom: 9422
Blocpdb> 72 atoms in block 140
Block first atom: 9492
Blocpdb> 65 atoms in block 141
Block first atom: 9564
Blocpdb> 60 atoms in block 142
Block first atom: 9629
Blocpdb> 72 atoms in block 143
Block first atom: 9689
Blocpdb> 68 atoms in block 144
Block first atom: 9761
Blocpdb> 73 atoms in block 145
Block first atom: 9829
Blocpdb> 73 atoms in block 146
Block first atom: 9902
Blocpdb> 31 atoms in block 147
Block first atom: 9975
Blocpdb> 64 atoms in block 148
Block first atom: 10006
Blocpdb> 72 atoms in block 149
Block first atom: 10070
Blocpdb> 68 atoms in block 150
Block first atom: 10142
Blocpdb> 80 atoms in block 151
Block first atom: 10210
Blocpdb> 73 atoms in block 152
Block first atom: 10290
Blocpdb> 70 atoms in block 153
Block first atom: 10363
Blocpdb> 72 atoms in block 154
Block first atom: 10433
Blocpdb> 65 atoms in block 155
Block first atom: 10505
Blocpdb> 60 atoms in block 156
Block first atom: 10570
Blocpdb> 72 atoms in block 157
Block first atom: 10630
Blocpdb> 68 atoms in block 158
Block first atom: 10702
Blocpdb> 73 atoms in block 159
Block first atom: 10770
Blocpdb> 73 atoms in block 160
Block first atom: 10843
Blocpdb> 31 atoms in block 161
Block first atom: 10916
Blocpdb> 65 atoms in block 162
Block first atom: 10947
Blocpdb> 77 atoms in block 163
Block first atom: 11012
Blocpdb> 72 atoms in block 164
Block first atom: 11089
Blocpdb> 87 atoms in block 165
Block first atom: 11161
Blocpdb> 68 atoms in block 166
Block first atom: 11248
Blocpdb> 68 atoms in block 167
Block first atom: 11316
Blocpdb> 78 atoms in block 168
Block first atom: 11384
Blocpdb> 67 atoms in block 169
Block first atom: 11462
Blocpdb> 74 atoms in block 170
Block first atom: 11529
Blocpdb> 74 atoms in block 171
Block first atom: 11603
Blocpdb> 69 atoms in block 172
Block first atom: 11677
Blocpdb> 75 atoms in block 173
Block first atom: 11746
Blocpdb> 69 atoms in block 174
Block first atom: 11821
Blocpdb> 66 atoms in block 175
Block first atom: 11890
Blocpdb> 70 atoms in block 176
Block first atom: 11956
Blocpdb> 71 atoms in block 177
Block first atom: 12026
Blocpdb> 71 atoms in block 178
Block first atom: 12097
Blocpdb> 76 atoms in block 179
Block first atom: 12168
Blocpdb> 68 atoms in block 180
Block first atom: 12244
Blocpdb> 78 atoms in block 181
Block first atom: 12312
Blocpdb> 72 atoms in block 182
Block first atom: 12390
Blocpdb> 33 atoms in block 183
Block first atom: 12462
Blocpdb> 185 atoms in block 184
Block first atom: 12495
Blocpdb> 185 atoms in block 185
Block first atom: 12680
Blocpdb> 185 atoms in block 186
Block first atom: 12865
Blocpdb> 181 atoms in block 187
Block first atom: 13050
Blocpdb> 190 atoms in block 188
Block first atom: 13231
Blocpdb> 186 atoms in block 189
Block first atom: 13421
Blocpdb> 186 atoms in block 190
Block first atom: 13607
Blocpdb> 186 atoms in block 191
Block first atom: 13793
Blocpdb> 184 atoms in block 192
Block first atom: 13979
Blocpdb> 186 atoms in block 193
Block first atom: 14163
Blocpdb> 183 atoms in block 194
Block first atom: 14349
Blocpdb> 183 atoms in block 195
Block first atom: 14532
Blocpdb> 183 atoms in block 196
Block first atom: 14715
Blocpdb> 179 atoms in block 197
Block first atom: 14898
Blocpdb> 188 atoms in block 198
Block first atom: 15077
Blocpdb> 184 atoms in block 199
Block first atom: 15265
Blocpdb> 184 atoms in block 200
Block first atom: 15449
Blocpdb> 185 atoms in block 201
Block first atom: 15632
Blocpdb> 201 blocks.
Blocpdb> At most, 190 atoms in each of them.
Blocpdb> At least, 29 atoms in each of them.
Blocpdb> Normal end of Blocpdb.
Diagrtb> Memory allocation for Prepmat.
Diagrtb> Memory allocation for RTB.
Diagrtb> Memory allocation for Diagstd.
Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes.
Prepmat> Entering in.
Prepmat> Rewriting of the matrix begins.
Prepmat> 5774097 matrix lines read.
Prepmat> Matrix order = 47451
Prepmat> Matrix trace = 12622020.0000
Prepmat> Last element read: 47451 47451 68.2775
Prepmat> 20302 lines saved.
Prepmat> 18830 empty lines.
Prepmat> Number of lines on output is as expected.
Prepmat> Normal end of Prepmat.
RTB> Entering in.
RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 15817
RTB> Total mass = 15817.0000
RTB> Number of atoms found in matrix: 15817
RTB> Number of blocks = 201
RTB> Projection begins.
RTB> Projected matrix is being saved.
RTB> Projected matrix trace = 176852.5004
RTB> 49941 non-zero elements.
RTB> Normal end of RTB.
Diagstd> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.sdijb
Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb
Diagstd> CERFACS matrix format.
Diagstd> Projected matrix order = 1206
Diagstd> Nb of non-zero elements: 49941
Diagstd> Projected matrix trace = 176852.5004
Openam> file on opening on unit 11:
diagrtb_work.eigenfacs
Diagstd> Diagonalization.
Diagstd> 1206 eigenvectors are computed.
Diagstd> 106 of them to be saved.
Diagstd> Sum of eigenvalues = 176852.5004
Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000
Diagstd> Selected eigenvalues:
0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000
0.0000000 0.0254624 0.0413902 0.0635843 0.1013195
0.2053101 0.3217068 0.4344741 0.5214859 0.6879565
0.7704403 0.9389838 1.0336180 1.1789138 1.2449492
1.4416263 1.6495929 1.8529799 1.9325998 2.1948890
2.5107068 2.5294403 2.7608489 3.0861696 3.2328062
3.5526941 3.6294978 4.0059729 4.1138509 4.2402694
4.2830642 4.6794873 4.7830033 4.9920581 5.0999604
5.3201186 5.3574948 5.8026646 5.8961550 6.3051789
6.4513663 6.7025957 6.7792542 6.8809161 7.2595947
7.5159201 7.8153720 8.3405914 8.5612034 8.8310956
9.0117613 9.4593894 9.6743342 9.9230905 10.2790606
10.6153879 10.9487335 11.0988500 11.4265955 11.6237269
11.7010707 11.9631915 12.3616130 12.6408720 12.9892017
13.3818862 13.3934617 13.4994363 14.1655052 14.4523505
14.8510899 14.9975280 15.3089117 15.5288482 15.8706247
16.3329600 16.5619807 16.8658585 16.9111025 16.9843274
17.3300388 17.4149099 17.7209817 17.9394583 18.6013347
18.6357245 18.9114263 19.1064088 19.3420262 19.4523483
19.7362913 20.1175774 20.3742888 20.5795753 20.8619320
21.0726574 21.5069401 21.6722586 22.1401000 22.2654507
22.6850504
Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units):
0.0034319 0.0034321 0.0034328 0.0034333 0.0034344
0.0034351 17.3278717 22.0924524 27.3823117 34.5654179
49.2039986 61.5921519 71.5776156 78.4181477 90.0690906
95.3157716 105.2263095 110.4015856 117.9061078 121.1633003
130.3831994 139.4709207 147.8191288 150.9615142 160.8798159
172.0652948 172.7060287 180.4332605 190.7678457 195.2473344
204.6794256 206.8800191 217.3448156 220.2518443 223.6104045
224.7359603 234.9061668 237.4901611 242.6247463 245.2328715
250.4701272 251.3484208 261.5826982 263.6815407 272.6741619
275.8170644 281.1362140 282.7393388 284.8514350 292.5846026
297.7051578 303.5778690 313.6127453 317.7332663 322.7026805
325.9868788 333.9848993 337.7581396 342.0729680 348.1544847
353.8043881 359.3165516 361.7714337 367.0740706 370.2269067
371.4566018 375.5941399 381.7972986 386.0857713 391.3690800
397.2408907 397.4126624 398.9818107 408.7062825 412.8236057
418.4797462 420.5378798 424.8811261 427.9222833 432.6057540
438.8617486 441.9278962 445.9636959 446.5614627 447.5272208
452.0589249 453.1645162 457.1294166 459.9386893 468.3465595
468.7792942 472.2341846 474.6623807 477.5801455 478.9402080
482.4230536 487.0607361 490.1584675 492.6216380 495.9895690
498.4882589 503.5986916 505.5305057 510.9578423 512.4022468
517.2079051
Diagstd> Normal end.
Rtb_to_modes> Entering in.
Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 15817
Rtb_to_modes> Number of blocs = 201
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 11:
matrix.eigenrtb
Rdmodfacs> Entering in.
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Eigenvector number: 1
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9881E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 2
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9894E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 3
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9931E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 4
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9963E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 5
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0003E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 6
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0006E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 7
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.5462E-02
Rdmodfacs> Eigenvector number: 8
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.1390E-02
Rdmodfacs> Eigenvector number: 9
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.3584E-02
Rdmodfacs> Eigenvector number: 10
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.1013
Rdmodfacs> Eigenvector number: 11
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.2053
Rdmodfacs> Eigenvector number: 12
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.3217
Rdmodfacs> Eigenvector number: 13
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.4345
Rdmodfacs> Eigenvector number: 14
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.5215
Rdmodfacs> Eigenvector number: 15
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.6880
Rdmodfacs> Eigenvector number: 16
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.7704
Rdmodfacs> Eigenvector number: 17
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.9390
Rdmodfacs> Eigenvector number: 18
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.034
Rdmodfacs> Eigenvector number: 19
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.179
Rdmodfacs> Eigenvector number: 20
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.245
Rdmodfacs> Eigenvector number: 21
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.442
Rdmodfacs> Eigenvector number: 22
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.650
Rdmodfacs> Eigenvector number: 23
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.853
Rdmodfacs> Eigenvector number: 24
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.933
Rdmodfacs> Eigenvector number: 25
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.195
Rdmodfacs> Eigenvector number: 26
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.511
Rdmodfacs> Eigenvector number: 27
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.529
Rdmodfacs> Eigenvector number: 28
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.761
Rdmodfacs> Eigenvector number: 29
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.086
Rdmodfacs> Eigenvector number: 30
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.233
Rdmodfacs> Eigenvector number: 31
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.553
Rdmodfacs> Eigenvector number: 32
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.629
Rdmodfacs> Eigenvector number: 33
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.006
Rdmodfacs> Eigenvector number: 34
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.114
Rdmodfacs> Eigenvector number: 35
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.240
Rdmodfacs> Eigenvector number: 36
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.283
Rdmodfacs> Eigenvector number: 37
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.679
Rdmodfacs> Eigenvector number: 38
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.783
Rdmodfacs> Eigenvector number: 39
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.992
Rdmodfacs> Eigenvector number: 40
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.100
Rdmodfacs> Eigenvector number: 41
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.320
Rdmodfacs> Eigenvector number: 42
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.357
Rdmodfacs> Eigenvector number: 43
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.803
Rdmodfacs> Eigenvector number: 44
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.896
Rdmodfacs> Eigenvector number: 45
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.305
Rdmodfacs> Eigenvector number: 46
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.451
Rdmodfacs> Eigenvector number: 47
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.703
Rdmodfacs> Eigenvector number: 48
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.779
Rdmodfacs> Eigenvector number: 49
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.881
Rdmodfacs> Eigenvector number: 50
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.260
Rdmodfacs> Eigenvector number: 51
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.516
Rdmodfacs> Eigenvector number: 52
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.815
Rdmodfacs> Eigenvector number: 53
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.341
Rdmodfacs> Eigenvector number: 54
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.561
Rdmodfacs> Eigenvector number: 55
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.831
Rdmodfacs> Eigenvector number: 56
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.012
Rdmodfacs> Eigenvector number: 57
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.459
Rdmodfacs> Eigenvector number: 58
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.674
Rdmodfacs> Eigenvector number: 59
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.923
Rdmodfacs> Eigenvector number: 60
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.28
Rdmodfacs> Eigenvector number: 61
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.62
Rdmodfacs> Eigenvector number: 62
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.95
Rdmodfacs> Eigenvector number: 63
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 64
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.43
Rdmodfacs> Eigenvector number: 65
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.62
Rdmodfacs> Eigenvector number: 66
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.70
Rdmodfacs> Eigenvector number: 67
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.96
Rdmodfacs> Eigenvector number: 68
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.36
Rdmodfacs> Eigenvector number: 69
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.64
Rdmodfacs> Eigenvector number: 70
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.99
Rdmodfacs> Eigenvector number: 71
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.38
Rdmodfacs> Eigenvector number: 72
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.39
Rdmodfacs> Eigenvector number: 73
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.50
Rdmodfacs> Eigenvector number: 74
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.17
Rdmodfacs> Eigenvector number: 75
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.45
Rdmodfacs> Eigenvector number: 76
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.85
Rdmodfacs> Eigenvector number: 77
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.00
Rdmodfacs> Eigenvector number: 78
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.31
Rdmodfacs> Eigenvector number: 79
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.53
Rdmodfacs> Eigenvector number: 80
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.87
Rdmodfacs> Eigenvector number: 81
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.33
Rdmodfacs> Eigenvector number: 82
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.56
Rdmodfacs> Eigenvector number: 83
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.87
Rdmodfacs> Eigenvector number: 84
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.91
Rdmodfacs> Eigenvector number: 85
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.98
Rdmodfacs> Eigenvector number: 86
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.33
Rdmodfacs> Eigenvector number: 87
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.41
Rdmodfacs> Eigenvector number: 88
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.72
Rdmodfacs> Eigenvector number: 89
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.94
Rdmodfacs> Eigenvector number: 90
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.60
Rdmodfacs> Eigenvector number: 91
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.64
Rdmodfacs> Eigenvector number: 92
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.91
Rdmodfacs> Eigenvector number: 93
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.11
Rdmodfacs> Eigenvector number: 94
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.34
Rdmodfacs> Eigenvector number: 95
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.45
Rdmodfacs> Eigenvector number: 96
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.74
Rdmodfacs> Eigenvector number: 97
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.12
Rdmodfacs> Eigenvector number: 98
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.37
Rdmodfacs> Eigenvector number: 99
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.58
Rdmodfacs> Eigenvector number: 100
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.86
Rdmodfacs> Eigenvector number: 101
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.07
Rdmodfacs> Eigenvector number: 102
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.51
Rdmodfacs> Eigenvector number: 103
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.67
Rdmodfacs> Eigenvector number: 104
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.14
Rdmodfacs> Eigenvector number: 105
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.27
Rdmodfacs> Eigenvector number: 106
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.69
Rtb_to_modes> 106 vectors, with 1206 coordinates in vector file.
Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected):
1.00000 1.00003 1.00000 1.00003 0.99999
1.00000 1.00000 1.00001 1.00000 1.00001
1.00000 0.99998 1.00000 0.99997 1.00000
0.99999 0.99998 1.00002 1.00001 0.99999
1.00000 1.00003 1.00000 1.00001 1.00000
0.99999 0.99998 1.00001 1.00002 0.99999
1.00002 1.00001 0.99998 0.99998 0.99999
1.00000 1.00002 1.00001 1.00001 1.00002
0.99999 1.00001 1.00000 1.00000 1.00004
1.00000 1.00000 0.99998 1.00001 1.00000
1.00000 0.99999 1.00000 1.00000 1.00000
0.99999 1.00002 0.99998 0.99997 0.99996
1.00001 1.00002 1.00001 0.99999 1.00002
0.99998 1.00003 1.00002 0.99999 1.00001
1.00001 0.99997 1.00001 0.99998 1.00001
1.00000 1.00000 0.99998 0.99999 1.00002
1.00000 1.00001 0.99999 1.00000 1.00000
0.99997 1.00001 1.00000 0.99998 0.99999
0.99999 1.00001 1.00001 1.00000 1.00000
0.99999 1.00001 1.00001 1.00000 1.00000
0.99998 0.99998 0.99998 1.00000 0.99999
1.00002
Rtb_to_modes> RTB block-file is being read.
Rtb_to_modes> 284706 lines found in RTB file.
Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected):
1.00000 1.00003 1.00000 1.00003 0.99999
1.00000 1.00000 1.00001 1.00000 1.00001
1.00000 0.99998 1.00000 0.99997 1.00000
0.99999 0.99998 1.00002 1.00001 0.99999
1.00000 1.00003 1.00000 1.00001 1.00000
0.99999 0.99998 1.00001 1.00002 0.99999
1.00002 1.00001 0.99998 0.99998 0.99999
1.00000 1.00002 1.00001 1.00001 1.00002
0.99999 1.00001 1.00000 1.00000 1.00004
1.00000 1.00000 0.99998 1.00001 1.00000
1.00000 0.99999 1.00000 1.00000 1.00000
0.99999 1.00002 0.99998 0.99997 0.99996
1.00001 1.00002 1.00001 0.99999 1.00002
0.99998 1.00003 1.00002 0.99999 1.00001
1.00001 0.99997 1.00001 0.99998 1.00001
1.00000 1.00000 0.99998 0.99999 1.00002
1.00000 1.00001 0.99999 1.00000 1.00000
0.99997 1.00001 1.00000 0.99998 0.99999
0.99999 1.00001 1.00001 1.00000 1.00000
0.99999 1.00001 1.00001 1.00000 1.00000
0.99998 0.99998 0.99998 1.00000 0.99999
1.00002
Orthogonality of first eigenvectors (zero expected):
Vector 2: 0.000
Vector 3:-0.000 0.000
Vector 4:-0.000-0.000-0.000
Vector 5: 0.000 0.000-0.000-0.000
Vector 6: 0.000 0.000-0.000-0.000 0.000
Vector 7:-0.000-0.000 0.000 0.000-0.000 0.000
Vector 8:-0.000 0.000 0.000-0.000 0.000 0.000 0.000
Vector 9: 0.000 0.000-0.000-0.000 0.000-0.000-0.000 0.000
Vector 10: 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000-0.000-0.000 0.000 0.000
Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved.
Rtb_to_modes> Normal end.
Diagrtb> Normal end.
B-factor analysis
Bfactors> Version 1.22, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 260211153256928911.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
260211153256928911.eigenfacs
Getnam> Corresponding pdb filename ?
Getnam> 260211153256928911.atom
Openam> file on opening on unit 11:
260211153256928911.atom
Getnum> Number of skipped eigenvectors ?
Getnum> 0
Getnum> Number of usefull eigenvectors ?
Getnum> 10000
%Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 1759
First residue number = 1
Last residue number = 81
Number of atoms found = 15817
Mean number per residue = 9.0
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9881E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9894E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9931E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9963E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0003E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0006E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.5462E-02
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.1390E-02
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.3584E-02
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.1013
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.2053
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.3217
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.4345
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.5215
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.6880
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.7704
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.9390
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.034
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.179
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.245
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.442
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.650
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.853
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.933
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.195
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.511
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.529
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.761
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.086
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.233
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.553
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.629
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.006
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.114
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.240
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.283
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.679
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.783
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.992
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.100
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.320
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.357
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.803
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.896
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.305
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.451
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.703
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.779
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.881
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.260
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.516
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.815
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.341
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.561
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.831
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.012
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.459
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.674
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.923
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.28
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.62
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.95
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.43
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.62
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.70
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.96
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.36
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.64
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.99
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.38
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.39
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.50
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.17
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.45
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.85
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.00
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.31
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.53
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.87
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.33
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.56
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.87
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.91
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.98
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.33
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.41
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.72
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.94
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.60
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.64
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.91
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.11
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.34
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.45
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.74
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.12
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.37
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.58
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.86
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.07
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.51
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.67
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.14
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.27
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.69
Bfactors> 106 vectors, 47451 coordinates in file.
Openam> file on opening on unit 12:
bfactors.pred
Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000
Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 0.025462
Bfactors> 100 eigenvectors will be considered.
Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped.
Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed.
(CHARMM units assumed for eigenvalues)
Bfactors> Correlation= 0.116 for 1597 C-alpha atoms.
Bfactors> = 0.110 +/- 0.13
Bfactors> = 69.194 +/- 19.36
Bfactors> Shiftng-fct= 69.084
Bfactors> Scaling-fct= 150.650
Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved.
Bfactors> Normal end.
check_modes
Chkmod> Version 1.00, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 260211153256928911.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
260211153256928911.eigenfacs
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4318E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4320E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4326E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4332E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4343E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4348E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 17.33
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 22.09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 27.38
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 34.56
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 49.20
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 61.59
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 71.58
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 78.42
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 90.07
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 95.31
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 105.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 110.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 117.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 121.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 130.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 139.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 147.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 151.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 160.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 172.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 172.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 180.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 190.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 195.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 204.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 206.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 217.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 220.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 223.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 224.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 234.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 237.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 242.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 245.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 250.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 251.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 261.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 263.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 272.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 275.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 281.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 282.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 284.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 292.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 297.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 303.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 313.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 317.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 322.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 326.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 334.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 337.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 342.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 348.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 353.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 359.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 361.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 367.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 370.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 371.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 375.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 381.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 386.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 391.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 397.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 397.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 399.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 408.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 412.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 418.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 420.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 424.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 427.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 432.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 438.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 441.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 446.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 446.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 447.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 452.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 453.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 457.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 459.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 468.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 468.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 472.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 474.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 477.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 478.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 482.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 487.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 490.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 492.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 495.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 498.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 503.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 505.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 510.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 512.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 517.2
Chkmod> 106 vectors, 47451 coordinates in file.
Chkmod> That is: 15817 cartesian points.
Openam> file on opening on unit 11:
Chkmod.res
Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file.
Chkmod> Normal end.
0.0034 0.6920
0.0034 0.7554
0.0034 0.8333
0.0034 0.7690
0.0034 0.9079
0.0034 0.9671
17.3270 0.6316
22.0915 0.6370
27.3811 0.5959
34.5606 0.5001
49.2007 0.6185
61.5889 0.2865
71.5767 0.3933
78.4158 0.4171
90.0681 0.5088
95.3092 0.1599
105.2227 0.1642
110.4172 0.5918
117.9054 0.3944
121.1606 0.4195
130.3945 0.5347
139.4821 0.4100
147.8136 0.5000
150.9707 0.4683
160.8770 0.5608
172.0680 0.4832
172.6836 0.2328
180.4305 0.4190
190.7544 0.5373
195.2448 0.6500
204.6794 0.4023
206.8570 0.5073
217.3362 0.2254
220.2464 0.4593
223.5937 0.5430
224.7246 0.5837
234.8839 0.4891
237.4799 0.5808
242.6129 0.3969
245.2233 0.3163
250.4566 0.4999
251.3260 0.1802
261.5790 0.2855
263.6668 0.4394
272.6586 0.1112
275.7974 0.3521
281.1326 0.3077
282.7219 0.3762
284.8409 0.4435
292.5802 0.3586
297.6940 0.3029
303.5576 0.6109
313.6070 0.3435
317.7159 0.5217
322.6871 0.5663
325.9772 0.4347
333.9637 0.3604
337.7378 0.3185
342.0567 0.3420
348.1554 0.2042
353.8660 0.5618
359.3219 0.2654
361.7746 0.5621
367.1130 0.4649
370.1517 0.4520
371.4237 0.4066
375.5279 0.2194
381.7560 0.3809
386.0559 0.4589
391.3643 0.2090
397.1958 0.4238
397.3442 0.4465
398.9730 0.5931
408.7536 0.6105
412.7723 0.5701
418.4464 0.3999
420.5545 0.5700
424.8780 0.4394
427.9198 0.5566
432.5787 0.4820
438.8031 0.3338
441.8825 0.5346
445.9993 0.3895
446.5277 0.4715
447.4510 0.3441
452.0390 0.4455
453.0812 0.3941
457.0971 0.1801
459.9259 0.2891
468.3097 0.4279
468.8129 0.3420
472.1961 0.4452
474.6866 0.3610
477.5346 0.2750
478.8907 0.4912
482.4477 0.2539
487.0692 0.2386
490.0858 0.3621
492.6056 0.3278
495.9453 0.3808
498.4354 0.4332
503.6129 0.4110
505.4825 0.3687
510.9348 0.5343
512.4326 0.2140
517.2421 0.4496
getting mode 7
running: ../../bin/get_modes.sh 260211153256928911 7 -500 500 100 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 7
calculating perturbed structure for DQ=-500
260211153256928911.eigenfacs
260211153256928911.atom
calculating perturbed structure for DQ=-400
260211153256928911.eigenfacs
260211153256928911.atom
calculating perturbed structure for DQ=-300
260211153256928911.eigenfacs
260211153256928911.atom
calculating perturbed structure for DQ=-200
260211153256928911.eigenfacs
260211153256928911.atom
calculating perturbed structure for DQ=-100
260211153256928911.eigenfacs
260211153256928911.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
260211153256928911.eigenfacs
260211153256928911.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
260211153256928911.eigenfacs
260211153256928911.atom
calculating perturbed structure for DQ=200
260211153256928911.eigenfacs
260211153256928911.atom
calculating perturbed structure for DQ=300
260211153256928911.eigenfacs
260211153256928911.atom
calculating perturbed structure for DQ=400
260211153256928911.eigenfacs
260211153256928911.atom
calculating perturbed structure for DQ=500
260211153256928911.eigenfacs
260211153256928911.atom
making animated gifs
11 models are in 260211153256928911.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 260211153256928911.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 260211153256928911.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 8
running: ../../bin/get_modes.sh 260211153256928911 8 -500 500 100 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 8
calculating perturbed structure for DQ=-500
260211153256928911.eigenfacs
260211153256928911.atom
calculating perturbed structure for DQ=-400
260211153256928911.eigenfacs
260211153256928911.atom
calculating perturbed structure for DQ=-300
260211153256928911.eigenfacs
260211153256928911.atom
calculating perturbed structure for DQ=-200
260211153256928911.eigenfacs
260211153256928911.atom
calculating perturbed structure for DQ=-100
260211153256928911.eigenfacs
260211153256928911.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
260211153256928911.eigenfacs
260211153256928911.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
260211153256928911.eigenfacs
260211153256928911.atom
calculating perturbed structure for DQ=200
260211153256928911.eigenfacs
260211153256928911.atom
calculating perturbed structure for DQ=300
260211153256928911.eigenfacs
260211153256928911.atom
calculating perturbed structure for DQ=400
260211153256928911.eigenfacs
260211153256928911.atom
calculating perturbed structure for DQ=500
260211153256928911.eigenfacs
260211153256928911.atom
making animated gifs
11 models are in 260211153256928911.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 260211153256928911.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 260211153256928911.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 9
running: ../../bin/get_modes.sh 260211153256928911 9 -500 500 100 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 9
calculating perturbed structure for DQ=-500
260211153256928911.eigenfacs
260211153256928911.atom
calculating perturbed structure for DQ=-400
260211153256928911.eigenfacs
260211153256928911.atom
calculating perturbed structure for DQ=-300
260211153256928911.eigenfacs
260211153256928911.atom
calculating perturbed structure for DQ=-200
260211153256928911.eigenfacs
260211153256928911.atom
calculating perturbed structure for DQ=-100
260211153256928911.eigenfacs
260211153256928911.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
260211153256928911.eigenfacs
260211153256928911.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
260211153256928911.eigenfacs
260211153256928911.atom
calculating perturbed structure for DQ=200
260211153256928911.eigenfacs
260211153256928911.atom
calculating perturbed structure for DQ=300
260211153256928911.eigenfacs
260211153256928911.atom
calculating perturbed structure for DQ=400
260211153256928911.eigenfacs
260211153256928911.atom
calculating perturbed structure for DQ=500
260211153256928911.eigenfacs
260211153256928911.atom
making animated gifs
11 models are in 260211153256928911.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 260211153256928911.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 260211153256928911.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 10
running: ../../bin/get_modes.sh 260211153256928911 10 -500 500 100 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 10
calculating perturbed structure for DQ=-500
260211153256928911.eigenfacs
260211153256928911.atom
calculating perturbed structure for DQ=-400
260211153256928911.eigenfacs
260211153256928911.atom
calculating perturbed structure for DQ=-300
260211153256928911.eigenfacs
260211153256928911.atom
calculating perturbed structure for DQ=-200
260211153256928911.eigenfacs
260211153256928911.atom
calculating perturbed structure for DQ=-100
260211153256928911.eigenfacs
260211153256928911.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
260211153256928911.eigenfacs
260211153256928911.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
260211153256928911.eigenfacs
260211153256928911.atom
calculating perturbed structure for DQ=200
260211153256928911.eigenfacs
260211153256928911.atom
calculating perturbed structure for DQ=300
260211153256928911.eigenfacs
260211153256928911.atom
calculating perturbed structure for DQ=400
260211153256928911.eigenfacs
260211153256928911.atom
calculating perturbed structure for DQ=500
260211153256928911.eigenfacs
260211153256928911.atom
making animated gifs
11 models are in 260211153256928911.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 260211153256928911.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 260211153256928911.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 11
running: ../../bin/get_modes.sh 260211153256928911 11 -500 500 100 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 11
calculating perturbed structure for DQ=-500
260211153256928911.eigenfacs
260211153256928911.atom
calculating perturbed structure for DQ=-400
260211153256928911.eigenfacs
260211153256928911.atom
calculating perturbed structure for DQ=-300
260211153256928911.eigenfacs
260211153256928911.atom
calculating perturbed structure for DQ=-200
260211153256928911.eigenfacs
260211153256928911.atom
calculating perturbed structure for DQ=-100
260211153256928911.eigenfacs
260211153256928911.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
260211153256928911.eigenfacs
260211153256928911.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
260211153256928911.eigenfacs
260211153256928911.atom
calculating perturbed structure for DQ=200
260211153256928911.eigenfacs
260211153256928911.atom
calculating perturbed structure for DQ=300
260211153256928911.eigenfacs
260211153256928911.atom
calculating perturbed structure for DQ=400
260211153256928911.eigenfacs
260211153256928911.atom
calculating perturbed structure for DQ=500
260211153256928911.eigenfacs
260211153256928911.atom
making animated gifs
11 models are in 260211153256928911.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 260211153256928911.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 260211153256928911.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
260211153256928911.10.pdb
260211153256928911.11.pdb
260211153256928911.7.pdb
260211153256928911.8.pdb
260211153256928911.9.pdb
STDERR:
Note: The following floating-point exceptions are signalling: IEEE_DENORMAL
real 2m18.458s
user 2m17.517s
sys 0m0.858s
rm: cannot remove '260211153256928911.sdijf': No such file or directory
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
If you find results from this site helpful for your research, please cite one of our papers:
elNémo
is maintained by Yves-Henri Sanejouand.
It was developed
by Karsten Suhre.
Between 2003 and 2014, it was hosted by IGS (Marseille).
Between 2015 and 2025, it was hosted by US2B (Nantes).
Last modification: december 26th, 2025.
|
