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please let us know.
elNémo has been hacked on november 27th.
It has been moved away and runs again.
**Still some additional cleaning from time to time**
Sorry for the inconvenience.


***  Y_modelo_4_KELEY  ***

LOGs for ID: 260211175339972872

Output from eigenvector calculation:


STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8) Build Tirion matrix: Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model. Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004. Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file. Pdbmat> Coordinate filename = 260211175339972872.atom Pdbmat> Distance cutoff = 8.00 Force constant = 10.00 Origin of mass values = CONS Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09 PRINTing level = 2 Pdbmat> Coordinate file 260211175339972872.atom to be opened. Openam> File opened: 260211175339972872.atom Pdbmat> Coordinate file in PDB format. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 596 First residue number = 18 Last residue number = 315 Number of atoms found = 4512 Mean number per residue = 7.6 Pdbmat> Coordinate statistics: = -0.523643 +/- 21.233265 From: -42.188000 To: 39.543000 = 0.067841 +/- 11.379933 From: -27.799000 To: 28.848000 = -1.064219 +/- 11.530732 From: -31.031000 To: 27.813000 Pdbmat> Masses are all set to one. Openam> File opened: pdbmat.xyzm Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved. Openam> File opened: pdbmat.sdijb Pdbmat> Matrix statistics: Pdbmat> The matrix is 1.8869 % Filled. Pdbmat> 1728751 non-zero elements. Pdbmat> 189101 atom-atom interactions. Pdbmat> Number per atom= 83.82 +/- 23.22 Maximum number = 130 Minimum number = 18 Pdbmat> Matrix trace = 3.782020E+06 Pdbmat> Larger element = 498.781 Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10 Pdbmat> Normal end. automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1) 596 non-zero elements, NRBL set to 3 Diagonalize Tirion matrix using diagrtb Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation. Diagrtb> Version 2.52, November 2004. Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file. Diagrtb> Options taken into account: MATRix filename = pdbmat.sdijb COORdinates filename = 260211175339972872.atom Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb Nb of VECTors required = 106 EigeNVALues chosen = LOWE Type of SUBStructuring = NONE Nb of residues per BLOck = 3 Origin of MASS values = CONS MATRix FORMat = BINA Temporary files cleaning = ALL Output PRINting level = 2 Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb. Blocpdb> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.xyzm Blocpdb> Coordinate file 260211175339972872.atom to be opened. Openam> file on opening on unit 11: 260211175339972872.atom Blocpdb> Coordinate file in PDB format. Blocpdb> 4512 atoms picked in pdb file. Blocpdb> All masses set to unity. Blocpdb> Coordinate file is rewritten. Blocpdb> Substructuring: Blocpdb> 3 residue(s) per block. Blocpdb> 596 residues. Blocpdb> 22 atoms in block 1 Block first atom: 1 Blocpdb> 25 atoms in block 2 Block first atom: 23 Blocpdb> 22 atoms in block 3 Block first atom: 48 Blocpdb> 25 atoms in block 4 Block first atom: 70 Blocpdb> 23 atoms in block 5 Block first atom: 95 Blocpdb> 29 atoms in block 6 Block first atom: 118 Blocpdb> 25 atoms in block 7 Block first atom: 147 Blocpdb> 25 atoms in block 8 Block first atom: 172 Blocpdb> 25 atoms in block 9 Block first atom: 197 Blocpdb> 27 atoms in block 10 Block first atom: 222 Blocpdb> 27 atoms in block 11 Block first atom: 249 Blocpdb> 20 atoms in block 12 Block first atom: 276 Blocpdb> 19 atoms in block 13 Block first atom: 296 Blocpdb> 23 atoms in block 14 Block first atom: 315 Blocpdb> 31 atoms in block 15 Block first atom: 338 Blocpdb> 19 atoms in block 16 Block first atom: 369 Blocpdb> 17 atoms in block 17 Block first atom: 388 Blocpdb> 21 atoms in block 18 Block first atom: 405 Blocpdb> 20 atoms in block 19 Block first atom: 426 Blocpdb> 28 atoms in block 20 Block first atom: 446 Blocpdb> 13 atoms in block 21 Block first atom: 474 Blocpdb> 23 atoms in block 22 Block first atom: 487 Blocpdb> 19 atoms in block 23 Block first atom: 510 Blocpdb> 24 atoms in block 24 Block first atom: 529 Blocpdb> 18 atoms in block 25 Block first atom: 553 Blocpdb> 24 atoms in block 26 Block first atom: 571 Blocpdb> 29 atoms in block 27 Block first atom: 595 Blocpdb> 16 atoms in block 28 Block first atom: 624 Blocpdb> 28 atoms in block 29 Block first atom: 640 Blocpdb> 19 atoms in block 30 Block first atom: 668 Blocpdb> 25 atoms in block 31 Block first atom: 687 Blocpdb> 22 atoms in block 32 Block first atom: 712 Blocpdb> 31 atoms in block 33 Block first atom: 734 Blocpdb> 24 atoms in block 34 Block first atom: 765 Blocpdb> 21 atoms in block 35 Block first atom: 789 Blocpdb> 29 atoms in block 36 Block first atom: 810 Blocpdb> 18 atoms in block 37 Block first atom: 839 Blocpdb> 21 atoms in block 38 Block first atom: 857 Blocpdb> 19 atoms in block 39 Block first atom: 878 Blocpdb> 26 atoms in block 40 Block first atom: 897 Blocpdb> 22 atoms in block 41 Block first atom: 923 Blocpdb> 20 atoms in block 42 Block first atom: 945 Blocpdb> 20 atoms in block 43 Block first atom: 965 Blocpdb> 18 atoms in block 44 Block first atom: 985 Blocpdb> 17 atoms in block 45 Block first atom: 1003 Blocpdb> 24 atoms in block 46 Block first atom: 1020 Blocpdb> 27 atoms in block 47 Block first atom: 1044 Blocpdb> 19 atoms in block 48 Block first atom: 1071 Blocpdb> 21 atoms in block 49 Block first atom: 1090 Blocpdb> 13 atoms in block 50 Block first atom: 1111 Blocpdb> 19 atoms in block 51 Block first atom: 1124 Blocpdb> 23 atoms in block 52 Block first atom: 1143 Blocpdb> 20 atoms in block 53 Block first atom: 1166 Blocpdb> 20 atoms in block 54 Block first atom: 1186 Blocpdb> 20 atoms in block 55 Block first atom: 1206 Blocpdb> 29 atoms in block 56 Block first atom: 1226 Blocpdb> 24 atoms in block 57 Block first atom: 1255 Blocpdb> 20 atoms in block 58 Block first atom: 1279 Blocpdb> 22 atoms in block 59 Block first atom: 1299 Blocpdb> 20 atoms in block 60 Block first atom: 1321 Blocpdb> 33 atoms in block 61 Block first atom: 1341 Blocpdb> 21 atoms in block 62 Block first atom: 1374 Blocpdb> 27 atoms in block 63 Block first atom: 1395 Blocpdb> 25 atoms in block 64 Block first atom: 1422 Blocpdb> 22 atoms in block 65 Block first atom: 1447 Blocpdb> 28 atoms in block 66 Block first atom: 1469 Blocpdb> 19 atoms in block 67 Block first atom: 1497 Blocpdb> 24 atoms in block 68 Block first atom: 1516 Blocpdb> 26 atoms in block 69 Block first atom: 1540 Blocpdb> 24 atoms in block 70 Block first atom: 1566 Blocpdb> 20 atoms in block 71 Block first atom: 1590 Blocpdb> 20 atoms in block 72 Block first atom: 1610 Blocpdb> 23 atoms in block 73 Block first atom: 1630 Blocpdb> 26 atoms in block 74 Block first atom: 1653 Blocpdb> 19 atoms in block 75 Block first atom: 1679 Blocpdb> 23 atoms in block 76 Block first atom: 1698 Blocpdb> 23 atoms in block 77 Block first atom: 1721 Blocpdb> 25 atoms in block 78 Block first atom: 1744 Blocpdb> 20 atoms in block 79 Block first atom: 1769 Blocpdb> 24 atoms in block 80 Block first atom: 1789 Blocpdb> 17 atoms in block 81 Block first atom: 1813 Blocpdb> 26 atoms in block 82 Block first atom: 1830 Blocpdb> 22 atoms in block 83 Block first atom: 1856 Blocpdb> 22 atoms in block 84 Block first atom: 1878 Blocpdb> 22 atoms in block 85 Block first atom: 1900 Blocpdb> 24 atoms in block 86 Block first atom: 1922 Blocpdb> 23 atoms in block 87 Block first atom: 1946 Blocpdb> 21 atoms in block 88 Block first atom: 1969 Blocpdb> 22 atoms in block 89 Block first atom: 1990 Blocpdb> 24 atoms in block 90 Block first atom: 2012 Blocpdb> 29 atoms in block 91 Block first atom: 2036 Blocpdb> 19 atoms in block 92 Block first atom: 2065 Blocpdb> 19 atoms in block 93 Block first atom: 2084 Blocpdb> 22 atoms in block 94 Block first atom: 2103 Blocpdb> 28 atoms in block 95 Block first atom: 2125 Blocpdb> 23 atoms in block 96 Block first atom: 2153 Blocpdb> 33 atoms in block 97 Block first atom: 2176 Blocpdb> 25 atoms in block 98 Block first atom: 2209 Blocpdb> 19 atoms in block 99 Block first atom: 2234 Blocpdb> 4 atoms in block 100 Block first atom: 2253 Blocpdb> 22 atoms in block 101 Block first atom: 2257 Blocpdb> 25 atoms in block 102 Block first atom: 2279 Blocpdb> 22 atoms in block 103 Block first atom: 2304 Blocpdb> 25 atoms in block 104 Block first atom: 2326 Blocpdb> 23 atoms in block 105 Block first atom: 2351 Blocpdb> 29 atoms in block 106 Block first atom: 2374 Blocpdb> 25 atoms in block 107 Block first atom: 2403 Blocpdb> 25 atoms in block 108 Block first atom: 2428 Blocpdb> 25 atoms in block 109 Block first atom: 2453 Blocpdb> 27 atoms in block 110 Block first atom: 2478 Blocpdb> 27 atoms in block 111 Block first atom: 2505 Blocpdb> 20 atoms in block 112 Block first atom: 2532 Blocpdb> 19 atoms in block 113 Block first atom: 2552 Blocpdb> 23 atoms in block 114 Block first atom: 2571 Blocpdb> 31 atoms in block 115 Block first atom: 2594 Blocpdb> 19 atoms in block 116 Block first atom: 2625 Blocpdb> 17 atoms in block 117 Block first atom: 2644 Blocpdb> 21 atoms in block 118 Block first atom: 2661 Blocpdb> 20 atoms in block 119 Block first atom: 2682 Blocpdb> 28 atoms in block 120 Block first atom: 2702 Blocpdb> 13 atoms in block 121 Block first atom: 2730 Blocpdb> 23 atoms in block 122 Block first atom: 2743 Blocpdb> 19 atoms in block 123 Block first atom: 2766 Blocpdb> 24 atoms in block 124 Block first atom: 2785 Blocpdb> 18 atoms in block 125 Block first atom: 2809 Blocpdb> 24 atoms in block 126 Block first atom: 2827 Blocpdb> 29 atoms in block 127 Block first atom: 2851 Blocpdb> 16 atoms in block 128 Block first atom: 2880 Blocpdb> 28 atoms in block 129 Block first atom: 2896 Blocpdb> 19 atoms in block 130 Block first atom: 2924 Blocpdb> 25 atoms in block 131 Block first atom: 2943 Blocpdb> 22 atoms in block 132 Block first atom: 2968 Blocpdb> 31 atoms in block 133 Block first atom: 2990 Blocpdb> 24 atoms in block 134 Block first atom: 3021 Blocpdb> 21 atoms in block 135 Block first atom: 3045 Blocpdb> 29 atoms in block 136 Block first atom: 3066 Blocpdb> 18 atoms in block 137 Block first atom: 3095 Blocpdb> 21 atoms in block 138 Block first atom: 3113 Blocpdb> 19 atoms in block 139 Block first atom: 3134 Blocpdb> 26 atoms in block 140 Block first atom: 3153 Blocpdb> 22 atoms in block 141 Block first atom: 3179 Blocpdb> 20 atoms in block 142 Block first atom: 3201 Blocpdb> 20 atoms in block 143 Block first atom: 3221 Blocpdb> 18 atoms in block 144 Block first atom: 3241 Blocpdb> 17 atoms in block 145 Block first atom: 3259 Blocpdb> 24 atoms in block 146 Block first atom: 3276 Blocpdb> 27 atoms in block 147 Block first atom: 3300 Blocpdb> 19 atoms in block 148 Block first atom: 3327 Blocpdb> 21 atoms in block 149 Block first atom: 3346 Blocpdb> 13 atoms in block 150 Block first atom: 3367 Blocpdb> 19 atoms in block 151 Block first atom: 3380 Blocpdb> 23 atoms in block 152 Block first atom: 3399 Blocpdb> 20 atoms in block 153 Block first atom: 3422 Blocpdb> 20 atoms in block 154 Block first atom: 3442 Blocpdb> 20 atoms in block 155 Block first atom: 3462 Blocpdb> 29 atoms in block 156 Block first atom: 3482 Blocpdb> 24 atoms in block 157 Block first atom: 3511 Blocpdb> 20 atoms in block 158 Block first atom: 3535 Blocpdb> 22 atoms in block 159 Block first atom: 3555 Blocpdb> 20 atoms in block 160 Block first atom: 3577 Blocpdb> 33 atoms in block 161 Block first atom: 3597 Blocpdb> 21 atoms in block 162 Block first atom: 3630 Blocpdb> 27 atoms in block 163 Block first atom: 3651 Blocpdb> 25 atoms in block 164 Block first atom: 3678 Blocpdb> 22 atoms in block 165 Block first atom: 3703 Blocpdb> 28 atoms in block 166 Block first atom: 3725 Blocpdb> 19 atoms in block 167 Block first atom: 3753 Blocpdb> 24 atoms in block 168 Block first atom: 3772 Blocpdb> 26 atoms in block 169 Block first atom: 3796 Blocpdb> 24 atoms in block 170 Block first atom: 3822 Blocpdb> 20 atoms in block 171 Block first atom: 3846 Blocpdb> 20 atoms in block 172 Block first atom: 3866 Blocpdb> 23 atoms in block 173 Block first atom: 3886 Blocpdb> 26 atoms in block 174 Block first atom: 3909 Blocpdb> 19 atoms in block 175 Block first atom: 3935 Blocpdb> 23 atoms in block 176 Block first atom: 3954 Blocpdb> 23 atoms in block 177 Block first atom: 3977 Blocpdb> 25 atoms in block 178 Block first atom: 4000 Blocpdb> 20 atoms in block 179 Block first atom: 4025 Blocpdb> 24 atoms in block 180 Block first atom: 4045 Blocpdb> 17 atoms in block 181 Block first atom: 4069 Blocpdb> 26 atoms in block 182 Block first atom: 4086 Blocpdb> 22 atoms in block 183 Block first atom: 4112 Blocpdb> 22 atoms in block 184 Block first atom: 4134 Blocpdb> 22 atoms in block 185 Block first atom: 4156 Blocpdb> 24 atoms in block 186 Block first atom: 4178 Blocpdb> 23 atoms in block 187 Block first atom: 4202 Blocpdb> 21 atoms in block 188 Block first atom: 4225 Blocpdb> 22 atoms in block 189 Block first atom: 4246 Blocpdb> 24 atoms in block 190 Block first atom: 4268 Blocpdb> 29 atoms in block 191 Block first atom: 4292 Blocpdb> 19 atoms in block 192 Block first atom: 4321 Blocpdb> 19 atoms in block 193 Block first atom: 4340 Blocpdb> 22 atoms in block 194 Block first atom: 4359 Blocpdb> 28 atoms in block 195 Block first atom: 4381 Blocpdb> 23 atoms in block 196 Block first atom: 4409 Blocpdb> 33 atoms in block 197 Block first atom: 4432 Blocpdb> 25 atoms in block 198 Block first atom: 4465 Blocpdb> 19 atoms in block 199 Block first atom: 4490 Blocpdb> 4 atoms in block 200 Block first atom: 4508 Blocpdb> 200 blocks. Blocpdb> At most, 33 atoms in each of them. Blocpdb> At least, 4 atoms in each of them. Blocpdb> Normal end of Blocpdb. Diagrtb> Memory allocation for Prepmat. Diagrtb> Memory allocation for RTB. Diagrtb> Memory allocation for Diagstd. Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes. Prepmat> Entering in. Prepmat> Rewriting of the matrix begins. Prepmat> 1728951 matrix lines read. Prepmat> Matrix order = 13536 Prepmat> Matrix trace = 3782020.0000 Prepmat> Last element read: 13536 13536 22.8194 Prepmat> 20101 lines saved. Prepmat> 18056 empty lines. Prepmat> Number of lines on output is as expected. Prepmat> Normal end of Prepmat. RTB> Entering in. RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 4512 RTB> Total mass = 4512.0000 RTB> Number of atoms found in matrix: 4512 RTB> Number of blocks = 200 RTB> Projection begins. RTB> Projected matrix is being saved. RTB> Projected matrix trace = 265782.6927 RTB> 70584 non-zero elements. RTB> Normal end of RTB. Diagstd> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.sdijb Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb Diagstd> CERFACS matrix format. Diagstd> Projected matrix order = 1200 Diagstd> Nb of non-zero elements: 70584 Diagstd> Projected matrix trace = 265782.6927 Openam> file on opening on unit 11: diagrtb_work.eigenfacs Diagstd> Diagonalization. Diagstd> 1200 eigenvectors are computed. Diagstd> 106 of them to be saved. Diagstd> Sum of eigenvalues = 265782.6927 Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000 Diagstd> Selected eigenvalues: 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.2318639 0.4131547 0.6788055 1.8407668 1.8691336 2.4765332 6.7600502 7.2158902 7.5001667 7.6974751 9.1221774 9.2736294 11.2429882 11.3974446 12.2114228 12.3408315 13.5105257 13.7101474 14.5814392 14.9166491 15.1473284 15.2316126 16.1915992 16.9987462 17.0135334 17.3570500 17.7777917 18.0252212 19.1589131 19.2223490 20.5652689 20.9906847 21.6748030 21.7917277 21.8844386 22.1065803 23.0353075 23.5354330 23.7434319 24.6598263 24.8031291 25.2961117 26.7100742 26.9407048 27.4759150 27.5582426 27.6699901 28.0088693 28.2694836 28.5349003 29.5888900 30.5776858 30.9219311 31.1675684 31.7091586 31.8099092 32.8170558 33.2288668 33.9191657 34.0931962 34.6657269 35.1624728 35.5049308 35.7146988 36.4045986 36.4155710 37.0466622 37.3169877 37.7643143 38.0398456 38.5567896 38.8960737 39.5095525 39.6887595 40.0495085 40.0737093 40.3454642 40.5522931 40.9296563 41.0294173 41.5150590 41.7144822 42.6828919 42.8975669 43.3090532 43.6392509 44.6359454 44.8260727 45.7384002 46.0624935 46.6264980 46.6470411 47.3414845 47.7661663 48.3410278 48.7056776 49.1529077 49.2731450 49.7229395 50.0526505 Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units): 0.0034314 0.0034333 0.0034334 0.0034340 0.0034351 0.0034358 52.2891816 69.7993903 89.4680484 147.3311784 148.4620510 170.8902798 282.3385888 291.7025581 297.3929975 301.2793928 327.9778673 330.6893035 364.1129767 366.6055410 379.4708443 381.4762379 399.1456533 402.0835844 414.6631824 419.4024058 422.6328987 423.8070949 436.9584612 447.7171444 447.9118363 452.4110857 457.8615634 461.0367889 475.3141179 476.1003591 492.4503800 497.5177531 505.5601800 506.9219676 507.9991500 510.5709058 521.1854557 526.8128700 529.1356548 539.2501647 540.8147363 546.1628620 561.2195965 563.6373398 569.2084813 570.0606189 571.2152355 574.7024765 577.3700044 580.0740806 590.6899976 600.4786727 603.8493236 606.2430050 611.4875786 612.4582579 622.0783518 625.9693166 632.4378606 634.0582231 639.3599614 643.9245529 647.0526430 648.9612658 655.1992683 655.2980000 660.9518503 663.3589151 667.3229823 669.7529778 674.2884385 677.2486724 682.5686469 684.1148897 687.2169701 687.4245719 689.7514759 691.5172036 694.7272420 695.5733831 699.6778250 701.3563105 709.4506621 711.2325277 714.6355638 717.3546599 725.5003885 727.0438850 734.4052376 737.0025698 741.5008940 741.6642245 747.1644783 750.5082550 755.0108979 757.8531763 761.3246430 762.2552461 765.7265014 768.2610584 Diagstd> Normal end. Rtb_to_modes> Entering in. Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 4512 Rtb_to_modes> Number of blocs = 200 Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.eigenfacs Openam> file on opening on unit 11: matrix.eigenrtb Rdmodfacs> Entering in. Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Eigenvector number: 1 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9852E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 2 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9961E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 3 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9965E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 4 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0000E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 5 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0007E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 6 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0010E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 7 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.2319 Rdmodfacs> Eigenvector number: 8 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.4132 Rdmodfacs> Eigenvector number: 9 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.6788 Rdmodfacs> Eigenvector number: 10 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.841 Rdmodfacs> Eigenvector number: 11 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.869 Rdmodfacs> Eigenvector number: 12 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.477 Rdmodfacs> Eigenvector number: 13 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.760 Rdmodfacs> Eigenvector number: 14 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.216 Rdmodfacs> Eigenvector number: 15 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.500 Rdmodfacs> Eigenvector number: 16 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.697 Rdmodfacs> Eigenvector number: 17 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.122 Rdmodfacs> Eigenvector number: 18 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.274 Rdmodfacs> Eigenvector number: 19 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.24 Rdmodfacs> Eigenvector number: 20 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.40 Rdmodfacs> Eigenvector number: 21 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.21 Rdmodfacs> Eigenvector number: 22 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.34 Rdmodfacs> Eigenvector number: 23 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.51 Rdmodfacs> Eigenvector number: 24 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.71 Rdmodfacs> Eigenvector number: 25 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.58 Rdmodfacs> Eigenvector number: 26 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.92 Rdmodfacs> Eigenvector number: 27 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.15 Rdmodfacs> Eigenvector number: 28 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.23 Rdmodfacs> Eigenvector number: 29 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.19 Rdmodfacs> Eigenvector number: 30 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.00 Rdmodfacs> Eigenvector number: 31 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.01 Rdmodfacs> Eigenvector number: 32 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.36 Rdmodfacs> Eigenvector number: 33 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.78 Rdmodfacs> Eigenvector number: 34 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.03 Rdmodfacs> Eigenvector number: 35 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.16 Rdmodfacs> Eigenvector number: 36 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.22 Rdmodfacs> Eigenvector number: 37 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.57 Rdmodfacs> Eigenvector number: 38 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.99 Rdmodfacs> Eigenvector number: 39 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.67 Rdmodfacs> Eigenvector number: 40 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.79 Rdmodfacs> Eigenvector number: 41 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.88 Rdmodfacs> Eigenvector number: 42 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.11 Rdmodfacs> Eigenvector number: 43 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.04 Rdmodfacs> Eigenvector number: 44 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.54 Rdmodfacs> Eigenvector number: 45 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.74 Rdmodfacs> Eigenvector number: 46 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.66 Rdmodfacs> Eigenvector number: 47 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.80 Rdmodfacs> Eigenvector number: 48 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.30 Rdmodfacs> Eigenvector number: 49 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.71 Rdmodfacs> Eigenvector number: 50 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.94 Rdmodfacs> Eigenvector number: 51 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.48 Rdmodfacs> Eigenvector number: 52 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.56 Rdmodfacs> Eigenvector number: 53 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.67 Rdmodfacs> Eigenvector number: 54 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.01 Rdmodfacs> Eigenvector number: 55 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.27 Rdmodfacs> Eigenvector number: 56 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.53 Rdmodfacs> Eigenvector number: 57 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.59 Rdmodfacs> Eigenvector number: 58 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.58 Rdmodfacs> Eigenvector number: 59 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.92 Rdmodfacs> Eigenvector number: 60 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.17 Rdmodfacs> Eigenvector number: 61 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.71 Rdmodfacs> Eigenvector number: 62 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.81 Rdmodfacs> Eigenvector number: 63 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.82 Rdmodfacs> Eigenvector number: 64 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.23 Rdmodfacs> Eigenvector number: 65 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.92 Rdmodfacs> Eigenvector number: 66 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 67 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.67 Rdmodfacs> Eigenvector number: 68 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.16 Rdmodfacs> Eigenvector number: 69 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.50 Rdmodfacs> Eigenvector number: 70 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.71 Rdmodfacs> Eigenvector number: 71 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.40 Rdmodfacs> Eigenvector number: 72 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.42 Rdmodfacs> Eigenvector number: 73 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.05 Rdmodfacs> Eigenvector number: 74 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.32 Rdmodfacs> Eigenvector number: 75 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.76 Rdmodfacs> Eigenvector number: 76 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.04 Rdmodfacs> Eigenvector number: 77 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.56 Rdmodfacs> Eigenvector number: 78 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.90 Rdmodfacs> Eigenvector number: 79 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.51 Rdmodfacs> Eigenvector number: 80 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.69 Rdmodfacs> Eigenvector number: 81 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.05 Rdmodfacs> Eigenvector number: 82 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.07 Rdmodfacs> Eigenvector number: 83 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.35 Rdmodfacs> Eigenvector number: 84 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.55 Rdmodfacs> Eigenvector number: 85 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.93 Rdmodfacs> Eigenvector number: 86 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.03 Rdmodfacs> Eigenvector number: 87 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.52 Rdmodfacs> Eigenvector number: 88 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.71 Rdmodfacs> Eigenvector number: 89 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.68 Rdmodfacs> Eigenvector number: 90 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.90 Rdmodfacs> Eigenvector number: 91 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.31 Rdmodfacs> Eigenvector number: 92 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.64 Rdmodfacs> Eigenvector number: 93 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.64 Rdmodfacs> Eigenvector number: 94 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.83 Rdmodfacs> Eigenvector number: 95 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.74 Rdmodfacs> Eigenvector number: 96 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.06 Rdmodfacs> Eigenvector number: 97 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.63 Rdmodfacs> Eigenvector number: 98 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.65 Rdmodfacs> Eigenvector number: 99 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 47.34 Rdmodfacs> Eigenvector number: 100 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 47.77 Rdmodfacs> Eigenvector number: 101 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 48.34 Rdmodfacs> Eigenvector number: 102 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 48.71 Rdmodfacs> Eigenvector number: 103 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 49.15 Rdmodfacs> Eigenvector number: 104 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 49.27 Rdmodfacs> Eigenvector number: 105 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 49.72 Rdmodfacs> Eigenvector number: 106 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 50.05 Rtb_to_modes> 106 vectors, with 1200 coordinates in vector file. Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected): 0.99999 1.00001 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00001 1.00000 0.99999 1.00000 1.00000 0.99999 1.00002 1.00002 0.99999 1.00001 1.00001 0.99999 1.00001 1.00000 0.99998 0.99996 0.99998 1.00001 1.00002 1.00002 1.00000 1.00000 1.00003 0.99999 1.00005 1.00002 1.00000 1.00000 0.99998 1.00000 1.00001 1.00001 1.00001 1.00001 0.99999 1.00000 1.00001 1.00000 0.99999 0.99997 0.99998 0.99997 1.00000 0.99999 1.00000 1.00000 1.00002 1.00000 1.00003 1.00002 1.00000 1.00000 0.99999 1.00002 1.00000 0.99999 1.00001 0.99999 1.00001 1.00000 1.00000 1.00000 1.00002 0.99998 1.00000 1.00001 1.00002 1.00001 0.99998 0.99999 1.00001 0.99999 1.00001 0.99998 1.00001 1.00000 0.99999 1.00000 0.99997 1.00001 1.00003 1.00000 1.00001 0.99999 1.00000 0.99999 0.99999 1.00000 1.00000 1.00000 1.00001 1.00001 0.99998 1.00002 1.00000 0.99999 0.99999 1.00002 1.00002 Rtb_to_modes> RTB block-file is being read. Rtb_to_modes> 81216 lines found in RTB file. Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected): 0.99999 1.00001 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00001 1.00000 0.99999 1.00000 1.00000 0.99999 1.00002 1.00002 0.99999 1.00001 1.00001 0.99999 1.00001 1.00000 0.99998 0.99996 0.99998 1.00001 1.00002 1.00002 1.00000 1.00000 1.00003 0.99999 1.00005 1.00002 1.00000 1.00000 0.99998 1.00000 1.00001 1.00001 1.00001 1.00001 0.99999 1.00000 1.00001 1.00000 0.99999 0.99997 0.99998 0.99997 1.00000 0.99999 1.00000 1.00000 1.00002 1.00000 1.00003 1.00002 1.00000 1.00000 0.99999 1.00002 1.00000 0.99999 1.00001 0.99999 1.00001 1.00000 1.00000 1.00000 1.00002 0.99998 1.00000 1.00001 1.00002 1.00001 0.99998 0.99999 1.00001 0.99999 1.00001 0.99998 1.00001 1.00000 0.99999 1.00000 0.99997 1.00001 1.00003 1.00000 1.00001 0.99999 1.00000 0.99999 0.99999 1.00000 1.00000 1.00000 1.00001 1.00001 0.99998 1.00002 1.00000 0.99999 0.99999 1.00002 1.00002 Orthogonality of first eigenvectors (zero expected): Vector 2: 0.000 Vector 3:-0.000 0.000 Vector 4: 0.000-0.000 0.000 Vector 5:-0.000 0.000-0.000 0.000 Vector 6: 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 Vector 7:-0.000-0.000 0.000-0.000 0.000 0.000 Vector 8:-0.000 0.000 0.000 0.000-0.000 0.000-0.000 Vector 9: 0.000-0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 Vector 10: 0.000 0.000-0.000-0.000-0.000-0.000-0.000 0.000 0.000 Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved. Rtb_to_modes> Normal end. Diagrtb> Normal end. B-factor analysis Bfactors> Version 1.22, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 260211175339972872.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 260211175339972872.eigenfacs Getnam> Corresponding pdb filename ? Getnam> 260211175339972872.atom Openam> file on opening on unit 11: 260211175339972872.atom Getnum> Number of skipped eigenvectors ? Getnum> 0 Getnum> Number of usefull eigenvectors ? Getnum> 10000 %Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 596 First residue number = 18 Last residue number = 315 Number of atoms found = 4512 Mean number per residue = 7.6 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9852E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9961E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9965E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0000E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0007E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0010E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.2319 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.4132 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.6788 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.841 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.869 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.477 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.760 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.216 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.500 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.697 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.122 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.274 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.24 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.40 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.21 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.34 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.51 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.71 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.58 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.92 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.15 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.23 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.19 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.00 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.01 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.36 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.78 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.16 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.22 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.57 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.99 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.67 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.79 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.88 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.11 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.04 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.54 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.74 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.66 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.80 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.30 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.71 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.94 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.48 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.56 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.67 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.01 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.27 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.53 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.59 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.58 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.92 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.17 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.71 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.81 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.82 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.23 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.92 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.67 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.16 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.50 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.71 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.40 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.42 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.05 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.32 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.76 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.04 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.56 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.90 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.51 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.69 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.05 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.07 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.35 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.55 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.93 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.52 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.71 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.68 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.90 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.31 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.64 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.64 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.83 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.74 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.06 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.63 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.65 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.34 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.77 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.34 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.71 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.15 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.27 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.72 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 50.05 Bfactors> 106 vectors, 13536 coordinates in file. Openam> file on opening on unit 12: bfactors.pred Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000 Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 0.231900 Bfactors> 100 eigenvectors will be considered. Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped. Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed. (CHARMM units assumed for eigenvalues) Bfactors> Correlation= -0.455 for 596 C-alpha atoms. Bfactors> = 0.046 +/- 0.03 Bfactors> = 90.069 +/- 6.38 Bfactors> Shiftng-fct= 90.023 Bfactors> Scaling-fct= 195.773 Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved. Bfactors> Normal end. check_modes Chkmod> Version 1.00, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 260211175339972872.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 260211175339972872.eigenfacs Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4313E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4331E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4332E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4338E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4350E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4355E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 52.29 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 69.80 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 89.46 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 147.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 148.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 170.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 282.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 291.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 297.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 301.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 328.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 330.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 364.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 366.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 379.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 381.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 399.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 402.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 414.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 419.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 422.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 423.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 436.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 447.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 447.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 452.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 457.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 461.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 475.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 476.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 492.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 497.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 505.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 506.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 507.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 510.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 521.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 526.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 529.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 539.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 540.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 546.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 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CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 603.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 606.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 611.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 612.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 622.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 626.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 632.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 634.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 639.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 643.9 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CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 741.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 747.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 750.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 755.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 757.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 761.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 762.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 765.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 768.2 Chkmod> 106 vectors, 13536 coordinates in file. Chkmod> That is: 4512 cartesian points. Openam> file on opening on unit 11: Chkmod.res Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file. %Chkmod-Wn> Norm of vector 23 is: 0.9999 (instead of 1.0000). Chkmod> Normal end. 0.0034 0.7808 0.0034 0.7435 0.0034 0.8740 0.0034 0.9078 0.0034 0.7675 0.0034 0.9485 52.2910 0.7441 69.8002 0.7145 89.4638 0.7413 147.3342 0.7638 148.4504 0.7676 170.8990 0.7970 282.3254 0.4838 291.6923 0.5121 297.3769 0.3885 301.2572 0.4654 327.9606 0.2317 330.6817 0.2324 364.0490 0.1731 366.6309 0.1889 379.4324 0.3046 381.4470 0.2189 399.1208 0.0317 402.0642 0.0352 414.6249 0.3112 419.4315 0.3612 422.6520 0.2328 423.7665 0.2016 436.9181 0.4197 447.7144 0.3346 447.8461 0.4567 452.4301 0.4796 457.8703 0.4151 461.0781 0.4182 475.3072 0.4228 476.0508 0.4123 492.4859 0.4277 497.4883 0.5552 505.4825 0.4211 506.8801 0.4227 507.9258 0.4062 510.5885 0.5167 521.2162 0.4337 526.8414 0.6571 529.0747 0.6177 539.2289 0.5067 540.7574 0.4472 546.1814 0.3819 561.1947 0.1607 563.6058 0.1998 569.2264 0.2527 570.0543 0.1771 571.1908 0.3008 574.6894 0.1529 577.3505 0.5578 579.9994 0.4292 590.6757 0.5104 600.4756 0.2102 603.8045 0.3190 606.2406 0.3887 611.4694 0.4002 612.4328 0.4210 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MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 260211175339972872.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 260211175339972872.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 8 running: ../../bin/get_modes.sh 260211175339972872 8 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 8 calculating perturbed structure for DQ=-100 260211175339972872.eigenfacs 260211175339972872.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 260211175339972872.eigenfacs 260211175339972872.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 260211175339972872.eigenfacs 260211175339972872.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 260211175339972872.eigenfacs 260211175339972872.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 260211175339972872.eigenfacs 260211175339972872.atom calculating perturbed structure for DQ=0 260211175339972872.eigenfacs 260211175339972872.atom calculating perturbed structure for DQ=20 260211175339972872.eigenfacs 260211175339972872.atom calculating perturbed structure for DQ=40 260211175339972872.eigenfacs 260211175339972872.atom calculating perturbed structure for DQ=60 260211175339972872.eigenfacs 260211175339972872.atom calculating perturbed structure for DQ=80 260211175339972872.eigenfacs 260211175339972872.atom calculating perturbed structure for DQ=100 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../../bin/get_modes.sh 260211175339972872 9 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 9 calculating perturbed structure for DQ=-100 260211175339972872.eigenfacs 260211175339972872.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 260211175339972872.eigenfacs 260211175339972872.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 260211175339972872.eigenfacs 260211175339972872.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 260211175339972872.eigenfacs 260211175339972872.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 260211175339972872.eigenfacs 260211175339972872.atom calculating perturbed structure for DQ=0 260211175339972872.eigenfacs 260211175339972872.atom calculating perturbed structure for DQ=20 260211175339972872.eigenfacs 260211175339972872.atom calculating perturbed structure for DQ=40 260211175339972872.eigenfacs 260211175339972872.atom calculating perturbed structure for DQ=60 260211175339972872.eigenfacs 260211175339972872.atom 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