***  Y_modelo_14_KELEY  ***
Output from eigenvector calculation:
STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8)
Build Tirion matrix:
Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model.
Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004.
Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file.
Pdbmat> Coordinate filename = 260211175543974155.atom
Pdbmat> Distance cutoff = 8.00
Force constant = 10.00
Origin of mass values = CONS
Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09
PRINTing level = 2
Pdbmat> Coordinate file 260211175543974155.atom to be opened.
Openam> File opened: 260211175543974155.atom
Pdbmat> Coordinate file in PDB format.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 596
First residue number = 18
Last residue number = 315
Number of atoms found = 4512
Mean number per residue = 7.6
Pdbmat> Coordinate statistics:
= 0.048792 +/- 11.802780 From: -27.972000 To: 28.317000
= -0.059197 +/- 11.008094 From: -28.002000 To: 26.109000
= 0.035935 +/- 19.294365 From: -40.778000 To: 41.387000
Pdbmat> Masses are all set to one.
Openam> File opened: pdbmat.xyzm
Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved.
Openam> File opened: pdbmat.sdijb
Pdbmat> Matrix statistics:
Pdbmat> The matrix is 1.9223 % Filled.
Pdbmat> 1761166 non-zero elements.
Pdbmat> 192706 atom-atom interactions.
Pdbmat> Number per atom= 85.42 +/- 22.46
Maximum number = 132
Minimum number = 16
Pdbmat> Matrix trace = 3.854120E+06
Pdbmat> Larger element = 498.299
Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10
Pdbmat> Normal end.
automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1)
596 non-zero elements, NRBL set to 3
Diagonalize Tirion matrix using diagrtb
Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation.
Diagrtb> Version 2.52, November 2004.
Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file.
Diagrtb> Options taken into account:
MATRix filename = pdbmat.sdijb
COORdinates filename = 260211175543974155.atom
Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb
Nb of VECTors required = 106
EigeNVALues chosen = LOWE
Type of SUBStructuring = NONE
Nb of residues per BLOck = 3
Origin of MASS values = CONS
MATRix FORMat = BINA
Temporary files cleaning = ALL
Output PRINting level = 2
Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb.
Blocpdb> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.xyzm
Blocpdb> Coordinate file 260211175543974155.atom to be opened.
Openam> file on opening on unit 11:
260211175543974155.atom
Blocpdb> Coordinate file in PDB format.
Blocpdb> 4512 atoms picked in pdb file.
Blocpdb> All masses set to unity.
Blocpdb> Coordinate file is rewritten.
Blocpdb> Substructuring:
Blocpdb> 3 residue(s) per block.
Blocpdb> 596 residues.
Blocpdb> 22 atoms in block 1
Block first atom: 1
Blocpdb> 25 atoms in block 2
Block first atom: 23
Blocpdb> 22 atoms in block 3
Block first atom: 48
Blocpdb> 25 atoms in block 4
Block first atom: 70
Blocpdb> 23 atoms in block 5
Block first atom: 95
Blocpdb> 29 atoms in block 6
Block first atom: 118
Blocpdb> 25 atoms in block 7
Block first atom: 147
Blocpdb> 25 atoms in block 8
Block first atom: 172
Blocpdb> 25 atoms in block 9
Block first atom: 197
Blocpdb> 27 atoms in block 10
Block first atom: 222
Blocpdb> 27 atoms in block 11
Block first atom: 249
Blocpdb> 20 atoms in block 12
Block first atom: 276
Blocpdb> 19 atoms in block 13
Block first atom: 296
Blocpdb> 23 atoms in block 14
Block first atom: 315
Blocpdb> 31 atoms in block 15
Block first atom: 338
Blocpdb> 19 atoms in block 16
Block first atom: 369
Blocpdb> 17 atoms in block 17
Block first atom: 388
Blocpdb> 21 atoms in block 18
Block first atom: 405
Blocpdb> 20 atoms in block 19
Block first atom: 426
Blocpdb> 28 atoms in block 20
Block first atom: 446
Blocpdb> 13 atoms in block 21
Block first atom: 474
Blocpdb> 23 atoms in block 22
Block first atom: 487
Blocpdb> 19 atoms in block 23
Block first atom: 510
Blocpdb> 24 atoms in block 24
Block first atom: 529
Blocpdb> 18 atoms in block 25
Block first atom: 553
Blocpdb> 24 atoms in block 26
Block first atom: 571
Blocpdb> 29 atoms in block 27
Block first atom: 595
Blocpdb> 16 atoms in block 28
Block first atom: 624
Blocpdb> 28 atoms in block 29
Block first atom: 640
Blocpdb> 19 atoms in block 30
Block first atom: 668
Blocpdb> 25 atoms in block 31
Block first atom: 687
Blocpdb> 22 atoms in block 32
Block first atom: 712
Blocpdb> 31 atoms in block 33
Block first atom: 734
Blocpdb> 24 atoms in block 34
Block first atom: 765
Blocpdb> 21 atoms in block 35
Block first atom: 789
Blocpdb> 29 atoms in block 36
Block first atom: 810
Blocpdb> 18 atoms in block 37
Block first atom: 839
Blocpdb> 21 atoms in block 38
Block first atom: 857
Blocpdb> 19 atoms in block 39
Block first atom: 878
Blocpdb> 26 atoms in block 40
Block first atom: 897
Blocpdb> 22 atoms in block 41
Block first atom: 923
Blocpdb> 20 atoms in block 42
Block first atom: 945
Blocpdb> 20 atoms in block 43
Block first atom: 965
Blocpdb> 18 atoms in block 44
Block first atom: 985
Blocpdb> 17 atoms in block 45
Block first atom: 1003
Blocpdb> 24 atoms in block 46
Block first atom: 1020
Blocpdb> 27 atoms in block 47
Block first atom: 1044
Blocpdb> 19 atoms in block 48
Block first atom: 1071
Blocpdb> 21 atoms in block 49
Block first atom: 1090
Blocpdb> 13 atoms in block 50
Block first atom: 1111
Blocpdb> 19 atoms in block 51
Block first atom: 1124
Blocpdb> 23 atoms in block 52
Block first atom: 1143
Blocpdb> 20 atoms in block 53
Block first atom: 1166
Blocpdb> 20 atoms in block 54
Block first atom: 1186
Blocpdb> 20 atoms in block 55
Block first atom: 1206
Blocpdb> 29 atoms in block 56
Block first atom: 1226
Blocpdb> 24 atoms in block 57
Block first atom: 1255
Blocpdb> 20 atoms in block 58
Block first atom: 1279
Blocpdb> 22 atoms in block 59
Block first atom: 1299
Blocpdb> 20 atoms in block 60
Block first atom: 1321
Blocpdb> 33 atoms in block 61
Block first atom: 1341
Blocpdb> 21 atoms in block 62
Block first atom: 1374
Blocpdb> 27 atoms in block 63
Block first atom: 1395
Blocpdb> 25 atoms in block 64
Block first atom: 1422
Blocpdb> 22 atoms in block 65
Block first atom: 1447
Blocpdb> 28 atoms in block 66
Block first atom: 1469
Blocpdb> 19 atoms in block 67
Block first atom: 1497
Blocpdb> 24 atoms in block 68
Block first atom: 1516
Blocpdb> 26 atoms in block 69
Block first atom: 1540
Blocpdb> 24 atoms in block 70
Block first atom: 1566
Blocpdb> 20 atoms in block 71
Block first atom: 1590
Blocpdb> 20 atoms in block 72
Block first atom: 1610
Blocpdb> 23 atoms in block 73
Block first atom: 1630
Blocpdb> 26 atoms in block 74
Block first atom: 1653
Blocpdb> 19 atoms in block 75
Block first atom: 1679
Blocpdb> 23 atoms in block 76
Block first atom: 1698
Blocpdb> 23 atoms in block 77
Block first atom: 1721
Blocpdb> 25 atoms in block 78
Block first atom: 1744
Blocpdb> 20 atoms in block 79
Block first atom: 1769
Blocpdb> 24 atoms in block 80
Block first atom: 1789
Blocpdb> 17 atoms in block 81
Block first atom: 1813
Blocpdb> 26 atoms in block 82
Block first atom: 1830
Blocpdb> 22 atoms in block 83
Block first atom: 1856
Blocpdb> 22 atoms in block 84
Block first atom: 1878
Blocpdb> 22 atoms in block 85
Block first atom: 1900
Blocpdb> 24 atoms in block 86
Block first atom: 1922
Blocpdb> 23 atoms in block 87
Block first atom: 1946
Blocpdb> 21 atoms in block 88
Block first atom: 1969
Blocpdb> 22 atoms in block 89
Block first atom: 1990
Blocpdb> 24 atoms in block 90
Block first atom: 2012
Blocpdb> 29 atoms in block 91
Block first atom: 2036
Blocpdb> 19 atoms in block 92
Block first atom: 2065
Blocpdb> 19 atoms in block 93
Block first atom: 2084
Blocpdb> 22 atoms in block 94
Block first atom: 2103
Blocpdb> 28 atoms in block 95
Block first atom: 2125
Blocpdb> 23 atoms in block 96
Block first atom: 2153
Blocpdb> 33 atoms in block 97
Block first atom: 2176
Blocpdb> 25 atoms in block 98
Block first atom: 2209
Blocpdb> 19 atoms in block 99
Block first atom: 2234
Blocpdb> 4 atoms in block 100
Block first atom: 2253
Blocpdb> 22 atoms in block 101
Block first atom: 2257
Blocpdb> 25 atoms in block 102
Block first atom: 2279
Blocpdb> 22 atoms in block 103
Block first atom: 2304
Blocpdb> 25 atoms in block 104
Block first atom: 2326
Blocpdb> 23 atoms in block 105
Block first atom: 2351
Blocpdb> 29 atoms in block 106
Block first atom: 2374
Blocpdb> 25 atoms in block 107
Block first atom: 2403
Blocpdb> 25 atoms in block 108
Block first atom: 2428
Blocpdb> 25 atoms in block 109
Block first atom: 2453
Blocpdb> 27 atoms in block 110
Block first atom: 2478
Blocpdb> 27 atoms in block 111
Block first atom: 2505
Blocpdb> 20 atoms in block 112
Block first atom: 2532
Blocpdb> 19 atoms in block 113
Block first atom: 2552
Blocpdb> 23 atoms in block 114
Block first atom: 2571
Blocpdb> 31 atoms in block 115
Block first atom: 2594
Blocpdb> 19 atoms in block 116
Block first atom: 2625
Blocpdb> 17 atoms in block 117
Block first atom: 2644
Blocpdb> 21 atoms in block 118
Block first atom: 2661
Blocpdb> 20 atoms in block 119
Block first atom: 2682
Blocpdb> 28 atoms in block 120
Block first atom: 2702
Blocpdb> 13 atoms in block 121
Block first atom: 2730
Blocpdb> 23 atoms in block 122
Block first atom: 2743
Blocpdb> 19 atoms in block 123
Block first atom: 2766
Blocpdb> 24 atoms in block 124
Block first atom: 2785
Blocpdb> 18 atoms in block 125
Block first atom: 2809
Blocpdb> 24 atoms in block 126
Block first atom: 2827
Blocpdb> 29 atoms in block 127
Block first atom: 2851
Blocpdb> 16 atoms in block 128
Block first atom: 2880
Blocpdb> 28 atoms in block 129
Block first atom: 2896
Blocpdb> 19 atoms in block 130
Block first atom: 2924
Blocpdb> 25 atoms in block 131
Block first atom: 2943
Blocpdb> 22 atoms in block 132
Block first atom: 2968
Blocpdb> 31 atoms in block 133
Block first atom: 2990
Blocpdb> 24 atoms in block 134
Block first atom: 3021
Blocpdb> 21 atoms in block 135
Block first atom: 3045
Blocpdb> 29 atoms in block 136
Block first atom: 3066
Blocpdb> 18 atoms in block 137
Block first atom: 3095
Blocpdb> 21 atoms in block 138
Block first atom: 3113
Blocpdb> 19 atoms in block 139
Block first atom: 3134
Blocpdb> 26 atoms in block 140
Block first atom: 3153
Blocpdb> 22 atoms in block 141
Block first atom: 3179
Blocpdb> 20 atoms in block 142
Block first atom: 3201
Blocpdb> 20 atoms in block 143
Block first atom: 3221
Blocpdb> 18 atoms in block 144
Block first atom: 3241
Blocpdb> 17 atoms in block 145
Block first atom: 3259
Blocpdb> 24 atoms in block 146
Block first atom: 3276
Blocpdb> 27 atoms in block 147
Block first atom: 3300
Blocpdb> 19 atoms in block 148
Block first atom: 3327
Blocpdb> 21 atoms in block 149
Block first atom: 3346
Blocpdb> 13 atoms in block 150
Block first atom: 3367
Blocpdb> 19 atoms in block 151
Block first atom: 3380
Blocpdb> 23 atoms in block 152
Block first atom: 3399
Blocpdb> 20 atoms in block 153
Block first atom: 3422
Blocpdb> 20 atoms in block 154
Block first atom: 3442
Blocpdb> 20 atoms in block 155
Block first atom: 3462
Blocpdb> 29 atoms in block 156
Block first atom: 3482
Blocpdb> 24 atoms in block 157
Block first atom: 3511
Blocpdb> 20 atoms in block 158
Block first atom: 3535
Blocpdb> 22 atoms in block 159
Block first atom: 3555
Blocpdb> 20 atoms in block 160
Block first atom: 3577
Blocpdb> 33 atoms in block 161
Block first atom: 3597
Blocpdb> 21 atoms in block 162
Block first atom: 3630
Blocpdb> 27 atoms in block 163
Block first atom: 3651
Blocpdb> 25 atoms in block 164
Block first atom: 3678
Blocpdb> 22 atoms in block 165
Block first atom: 3703
Blocpdb> 28 atoms in block 166
Block first atom: 3725
Blocpdb> 19 atoms in block 167
Block first atom: 3753
Blocpdb> 24 atoms in block 168
Block first atom: 3772
Blocpdb> 26 atoms in block 169
Block first atom: 3796
Blocpdb> 24 atoms in block 170
Block first atom: 3822
Blocpdb> 20 atoms in block 171
Block first atom: 3846
Blocpdb> 20 atoms in block 172
Block first atom: 3866
Blocpdb> 23 atoms in block 173
Block first atom: 3886
Blocpdb> 26 atoms in block 174
Block first atom: 3909
Blocpdb> 19 atoms in block 175
Block first atom: 3935
Blocpdb> 23 atoms in block 176
Block first atom: 3954
Blocpdb> 23 atoms in block 177
Block first atom: 3977
Blocpdb> 25 atoms in block 178
Block first atom: 4000
Blocpdb> 20 atoms in block 179
Block first atom: 4025
Blocpdb> 24 atoms in block 180
Block first atom: 4045
Blocpdb> 17 atoms in block 181
Block first atom: 4069
Blocpdb> 26 atoms in block 182
Block first atom: 4086
Blocpdb> 22 atoms in block 183
Block first atom: 4112
Blocpdb> 22 atoms in block 184
Block first atom: 4134
Blocpdb> 22 atoms in block 185
Block first atom: 4156
Blocpdb> 24 atoms in block 186
Block first atom: 4178
Blocpdb> 23 atoms in block 187
Block first atom: 4202
Blocpdb> 21 atoms in block 188
Block first atom: 4225
Blocpdb> 22 atoms in block 189
Block first atom: 4246
Blocpdb> 24 atoms in block 190
Block first atom: 4268
Blocpdb> 29 atoms in block 191
Block first atom: 4292
Blocpdb> 19 atoms in block 192
Block first atom: 4321
Blocpdb> 19 atoms in block 193
Block first atom: 4340
Blocpdb> 22 atoms in block 194
Block first atom: 4359
Blocpdb> 28 atoms in block 195
Block first atom: 4381
Blocpdb> 23 atoms in block 196
Block first atom: 4409
Blocpdb> 33 atoms in block 197
Block first atom: 4432
Blocpdb> 25 atoms in block 198
Block first atom: 4465
Blocpdb> 19 atoms in block 199
Block first atom: 4490
Blocpdb> 4 atoms in block 200
Block first atom: 4508
Blocpdb> 200 blocks.
Blocpdb> At most, 33 atoms in each of them.
Blocpdb> At least, 4 atoms in each of them.
Blocpdb> Normal end of Blocpdb.
Diagrtb> Memory allocation for Prepmat.
Diagrtb> Memory allocation for RTB.
Diagrtb> Memory allocation for Diagstd.
Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes.
Prepmat> Entering in.
Prepmat> Rewriting of the matrix begins.
Prepmat> 1761366 matrix lines read.
Prepmat> Matrix order = 13536
Prepmat> Matrix trace = 3854120.0000
Prepmat> Last element read: 13536 13536 93.0045
Prepmat> 20101 lines saved.
Prepmat> 17974 empty lines.
Prepmat> Number of lines on output is as expected.
Prepmat> Normal end of Prepmat.
RTB> Entering in.
RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 4512
RTB> Total mass = 4512.0000
RTB> Number of atoms found in matrix: 4512
RTB> Number of blocks = 200
RTB> Projection begins.
RTB> Projected matrix is being saved.
RTB> Projected matrix trace = 272439.7057
RTB> 73536 non-zero elements.
RTB> Normal end of RTB.
Diagstd> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.sdijb
Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb
Diagstd> CERFACS matrix format.
Diagstd> Projected matrix order = 1200
Diagstd> Nb of non-zero elements: 73536
Diagstd> Projected matrix trace = 272439.7057
Openam> file on opening on unit 11:
diagrtb_work.eigenfacs
Diagstd> Diagonalization.
Diagstd> 1200 eigenvectors are computed.
Diagstd> 106 of them to be saved.
Diagstd> Sum of eigenvalues = 272439.7057
Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000
Diagstd> Selected eigenvalues:
0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000
0.0000000 1.0621736 1.5027099 2.0764077 4.5554958
5.4208323 5.4512470 9.1002528 9.1043745 10.0447528
10.4502233 11.7672160 11.8871227 12.8739561 13.9695144
14.3303831 15.0238685 15.1530939 15.3395478 16.2398188
17.2040004 18.2100159 18.3831305 18.8331477 19.2632395
19.8125570 20.6874443 20.9078098 21.0522888 22.1866574
22.1975568 22.7781732 23.1519938 23.7131427 23.9731088
24.0590879 24.5192431 25.0627960 25.3463957 26.7895545
27.3642243 27.6938319 28.0890819 28.1443300 29.4963305
29.7075005 29.9208742 30.2736967 31.4006375 32.2971139
32.6783294 33.3648039 34.1280349 34.4710642 34.9360532
35.2129749 35.5128740 35.9894426 37.1095685 37.1953861
38.2372164 38.7245746 39.0617218 39.1484684 40.1421281
40.1657920 40.3867505 40.6172149 40.8440075 41.1008852
41.4305700 41.6354489 42.7230391 42.8830427 44.1906575
44.4460273 44.7171477 44.7450157 45.9642840 46.2076373
46.5619943 47.5919507 47.7883837 47.9460823 48.5585296
48.9867996 49.6588807 50.0715129 50.8976426 51.4389836
52.5153535 52.6258688 53.4606506 53.5828852 53.7617852
54.3366397 55.1664240 55.4265269 55.4899722 55.8159938
56.6408401
Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units):
0.0034305 0.0034333 0.0034337 0.0034350 0.0034356
0.0034359 111.9162183 133.1167970 156.4773893 231.7731413
252.8298026 253.5380868 327.5834924 327.6576684 344.1635776
351.0411801 372.5050317 374.3981139 389.6290172 405.8690497
411.0779481 420.9070186 422.7133251 425.3060478 437.6086218
450.4120517 463.3940385 465.5914697 471.2558301 476.6064793
483.3542535 493.9110026 496.5346387 498.2472836 511.4947958
511.6204183 518.2683957 522.5038309 528.7980408 531.6887344
532.6413273 537.7108632 543.6382930 546.7054275 562.0539783
568.0503755 571.4612757 575.5248132 576.0905314 589.7653802
591.8727386 593.9944940 597.4863780 608.5055068 617.1306807
620.7621138 627.2484096 634.3821020 637.5622955 641.8480115
644.3868047 647.1250189 651.4526277 661.5127700 662.2772177
671.4882458 675.7539736 678.6892521 679.4424359 688.0111499
688.2139127 690.1043041 692.0705210 693.9999733 696.1789184
698.9654913 700.6915921 709.7842359 711.1121134 721.8725236
723.9553046 726.1600081 726.3862462 736.2164720 738.1628111
740.9878162 749.1383556 750.6827761 751.9203582 756.7075098
760.0371377 765.2330933 768.4058051 774.7188339 778.8278440
786.9342123 787.7618040 793.9851871 794.8923690 796.2182374
800.4637494 806.5526020 808.4517646 808.9143392 811.2871763
817.2597745
Diagstd> Normal end.
Rtb_to_modes> Entering in.
Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 4512
Rtb_to_modes> Number of blocs = 200
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 11:
matrix.eigenrtb
Rdmodfacs> Entering in.
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Eigenvector number: 1
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9799E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 2
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9962E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 3
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9982E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 4
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0006E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 5
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0010E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 6
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0012E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 7
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.062
Rdmodfacs> Eigenvector number: 8
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.503
Rdmodfacs> Eigenvector number: 9
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.076
Rdmodfacs> Eigenvector number: 10
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.555
Rdmodfacs> Eigenvector number: 11
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.421
Rdmodfacs> Eigenvector number: 12
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.451
Rdmodfacs> Eigenvector number: 13
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.100
Rdmodfacs> Eigenvector number: 14
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.104
Rdmodfacs> Eigenvector number: 15
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.04
Rdmodfacs> Eigenvector number: 16
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.45
Rdmodfacs> Eigenvector number: 17
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.77
Rdmodfacs> Eigenvector number: 18
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.89
Rdmodfacs> Eigenvector number: 19
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.87
Rdmodfacs> Eigenvector number: 20
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.97
Rdmodfacs> Eigenvector number: 21
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.33
Rdmodfacs> Eigenvector number: 22
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.02
Rdmodfacs> Eigenvector number: 23
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.15
Rdmodfacs> Eigenvector number: 24
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.34
Rdmodfacs> Eigenvector number: 25
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.24
Rdmodfacs> Eigenvector number: 26
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.20
Rdmodfacs> Eigenvector number: 27
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.21
Rdmodfacs> Eigenvector number: 28
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.38
Rdmodfacs> Eigenvector number: 29
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.83
Rdmodfacs> Eigenvector number: 30
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.26
Rdmodfacs> Eigenvector number: 31
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.81
Rdmodfacs> Eigenvector number: 32
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.69
Rdmodfacs> Eigenvector number: 33
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.91
Rdmodfacs> Eigenvector number: 34
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.05
Rdmodfacs> Eigenvector number: 35
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.19
Rdmodfacs> Eigenvector number: 36
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.20
Rdmodfacs> Eigenvector number: 37
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.78
Rdmodfacs> Eigenvector number: 38
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.15
Rdmodfacs> Eigenvector number: 39
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.71
Rdmodfacs> Eigenvector number: 40
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.97
Rdmodfacs> Eigenvector number: 41
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.06
Rdmodfacs> Eigenvector number: 42
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.52
Rdmodfacs> Eigenvector number: 43
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.06
Rdmodfacs> Eigenvector number: 44
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.35
Rdmodfacs> Eigenvector number: 45
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.79
Rdmodfacs> Eigenvector number: 46
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.36
Rdmodfacs> Eigenvector number: 47
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.69
Rdmodfacs> Eigenvector number: 48
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 49
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.14
Rdmodfacs> Eigenvector number: 50
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.50
Rdmodfacs> Eigenvector number: 51
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.71
Rdmodfacs> Eigenvector number: 52
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.92
Rdmodfacs> Eigenvector number: 53
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.27
Rdmodfacs> Eigenvector number: 54
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.40
Rdmodfacs> Eigenvector number: 55
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.30
Rdmodfacs> Eigenvector number: 56
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.68
Rdmodfacs> Eigenvector number: 57
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.36
Rdmodfacs> Eigenvector number: 58
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.13
Rdmodfacs> Eigenvector number: 59
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.47
Rdmodfacs> Eigenvector number: 60
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.94
Rdmodfacs> Eigenvector number: 61
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.21
Rdmodfacs> Eigenvector number: 62
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.51
Rdmodfacs> Eigenvector number: 63
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.99
Rdmodfacs> Eigenvector number: 64
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.11
Rdmodfacs> Eigenvector number: 65
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.20
Rdmodfacs> Eigenvector number: 66
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.24
Rdmodfacs> Eigenvector number: 67
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.72
Rdmodfacs> Eigenvector number: 68
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.06
Rdmodfacs> Eigenvector number: 69
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.15
Rdmodfacs> Eigenvector number: 70
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.14
Rdmodfacs> Eigenvector number: 71
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.17
Rdmodfacs> Eigenvector number: 72
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.39
Rdmodfacs> Eigenvector number: 73
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.62
Rdmodfacs> Eigenvector number: 74
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.84
Rdmodfacs> Eigenvector number: 75
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 76
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.43
Rdmodfacs> Eigenvector number: 77
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.64
Rdmodfacs> Eigenvector number: 78
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.72
Rdmodfacs> Eigenvector number: 79
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.88
Rdmodfacs> Eigenvector number: 80
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.19
Rdmodfacs> Eigenvector number: 81
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.45
Rdmodfacs> Eigenvector number: 82
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.72
Rdmodfacs> Eigenvector number: 83
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.75
Rdmodfacs> Eigenvector number: 84
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.96
Rdmodfacs> Eigenvector number: 85
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.21
Rdmodfacs> Eigenvector number: 86
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.56
Rdmodfacs> Eigenvector number: 87
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 47.59
Rdmodfacs> Eigenvector number: 88
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 47.79
Rdmodfacs> Eigenvector number: 89
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 47.95
Rdmodfacs> Eigenvector number: 90
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 48.56
Rdmodfacs> Eigenvector number: 91
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 48.99
Rdmodfacs> Eigenvector number: 92
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 49.66
Rdmodfacs> Eigenvector number: 93
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 50.07
Rdmodfacs> Eigenvector number: 94
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 50.90
Rdmodfacs> Eigenvector number: 95
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 51.44
Rdmodfacs> Eigenvector number: 96
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 52.52
Rdmodfacs> Eigenvector number: 97
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 52.63
Rdmodfacs> Eigenvector number: 98
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 53.46
Rdmodfacs> Eigenvector number: 99
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 53.58
Rdmodfacs> Eigenvector number: 100
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 53.76
Rdmodfacs> Eigenvector number: 101
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 54.34
Rdmodfacs> Eigenvector number: 102
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 55.17
Rdmodfacs> Eigenvector number: 103
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 55.43
Rdmodfacs> Eigenvector number: 104
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 55.49
Rdmodfacs> Eigenvector number: 105
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 55.82
Rdmodfacs> Eigenvector number: 106
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 56.64
Rtb_to_modes> 106 vectors, with 1200 coordinates in vector file.
Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected):
1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000
1.00000 1.00000 0.99999 1.00000 0.99999
1.00000 1.00001 0.99997 1.00000 1.00002
1.00000 1.00002 0.99997 1.00000 1.00000
1.00002 1.00003 1.00001 1.00002 1.00000
1.00000 0.99998 0.99997 1.00001 1.00002
1.00000 1.00001 1.00001 0.99998 1.00001
0.99998 1.00001 1.00001 0.99999 0.99999
1.00001 1.00000 1.00001 1.00002 1.00000
0.99998 1.00000 0.99999 1.00000 1.00000
1.00003 1.00001 1.00001 1.00001 1.00000
1.00000 1.00000 1.00000 1.00001 1.00000
1.00002 1.00001 1.00000 0.99998 1.00000
0.99999 1.00000 0.99998 0.99998 1.00003
0.99999 1.00001 1.00000 0.99999 1.00001
1.00002 1.00001 1.00001 1.00000 0.99999
1.00000 1.00001 1.00001 0.99997 1.00000
1.00001 1.00001 0.99999 1.00000 1.00000
1.00001 0.99999 1.00002 1.00001 1.00001
1.00001 1.00000 0.99997 0.99999 1.00000
1.00000 1.00002 1.00000 1.00000 1.00000
1.00001
Rtb_to_modes> RTB block-file is being read.
Rtb_to_modes> 81216 lines found in RTB file.
Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected):
1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000
1.00000 1.00000 0.99999 1.00000 0.99999
1.00000 1.00001 0.99997 1.00000 1.00002
1.00000 1.00002 0.99997 1.00000 1.00000
1.00002 1.00003 1.00001 1.00002 1.00000
1.00000 0.99998 0.99997 1.00001 1.00002
1.00000 1.00001 1.00001 0.99998 1.00001
0.99998 1.00001 1.00001 0.99999 0.99999
1.00001 1.00000 1.00001 1.00002 1.00000
0.99998 1.00000 0.99999 1.00000 1.00000
1.00003 1.00001 1.00001 1.00001 1.00000
1.00000 1.00000 1.00000 1.00001 1.00000
1.00002 1.00001 1.00000 0.99998 1.00000
0.99999 1.00000 0.99998 0.99998 1.00003
0.99999 1.00001 1.00000 0.99999 1.00001
1.00002 1.00001 1.00001 1.00000 0.99999
1.00000 1.00001 1.00001 0.99997 1.00000
1.00001 1.00001 0.99999 1.00000 1.00000
1.00001 0.99999 1.00002 1.00001 1.00001
1.00001 1.00000 0.99997 0.99999 1.00000
1.00000 1.00002 1.00000 1.00000 1.00000
1.00001
Orthogonality of first eigenvectors (zero expected):
Vector 2: 0.000
Vector 3: 0.000 0.000
Vector 4:-0.000 0.000-0.000
Vector 5: 0.000-0.000-0.000 0.000
Vector 6: 0.000 0.000 0.000-0.000-0.000
Vector 7: 0.000-0.000 0.000-0.000-0.000 0.000
Vector 8:-0.000-0.000-0.000 0.000 0.000-0.000-0.000
Vector 9:-0.000-0.000 0.000 0.000 0.000-0.000-0.000 0.000
Vector 10:-0.000 0.000 0.000-0.000 0.000-0.000 0.000-0.000 0.000
Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved.
Rtb_to_modes> Normal end.
Diagrtb> Normal end.
B-factor analysis
Bfactors> Version 1.22, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 260211175543974155.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
260211175543974155.eigenfacs
Getnam> Corresponding pdb filename ?
Getnam> 260211175543974155.atom
Openam> file on opening on unit 11:
260211175543974155.atom
Getnum> Number of skipped eigenvectors ?
Getnum> 0
Getnum> Number of usefull eigenvectors ?
Getnum> 10000
%Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 596
First residue number = 18
Last residue number = 315
Number of atoms found = 4512
Mean number per residue = 7.6
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9799E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9962E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9982E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0006E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0010E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0012E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.062
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.503
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.076
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.555
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.421
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.451
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.100
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.104
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.04
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.45
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.77
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.89
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.87
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.97
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.33
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.02
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.15
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.34
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.24
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.20
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.21
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.38
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.83
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.26
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.81
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.69
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.91
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.05
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.19
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.20
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.78
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.15
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.71
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.97
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.06
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.52
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.06
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.35
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.79
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.36
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.69
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.14
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.50
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.71
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.92
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.27
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.40
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.30
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.68
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.36
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.13
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.47
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.94
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.21
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.51
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.99
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.11
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.20
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.24
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.72
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.06
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.15
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.14
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.17
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.39
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.62
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.84
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.43
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.64
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.72
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.88
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.19
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.45
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.72
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.75
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.96
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.21
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.56
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.59
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.79
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.95
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.56
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.99
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.66
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 50.07
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 50.90
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 51.44
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 52.52
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 52.63
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 53.46
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 53.58
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 53.76
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 54.34
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 55.17
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 55.43
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 55.49
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 55.82
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 56.64
Bfactors> 106 vectors, 13536 coordinates in file.
Openam> file on opening on unit 12:
bfactors.pred
Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000
Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 1.062000
Bfactors> 100 eigenvectors will be considered.
Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped.
Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed.
(CHARMM units assumed for eigenvalues)
Bfactors> Correlation= -0.333 for 596 C-alpha atoms.
Bfactors> = 0.020 +/- 0.02
Bfactors> = 89.830 +/- 6.27
Bfactors> Shiftng-fct= 89.809
Bfactors> Scaling-fct= 316.588
Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved.
Bfactors> Normal end.
check_modes
Chkmod> Version 1.00, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 260211175543974155.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
260211175543974155.eigenfacs
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4304E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4332E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4335E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4348E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4355E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4359E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 111.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 133.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 156.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 231.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 252.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 253.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 327.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 327.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 344.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 351.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 372.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 374.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 389.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 405.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 411.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 420.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 422.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 425.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 437.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 450.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 463.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 465.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 471.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 476.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 483.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 493.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 496.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 498.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 511.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 511.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 518.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 522.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 528.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 531.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 532.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 537.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 543.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 546.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 562.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 568.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 571.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 575.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 576.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 589.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 591.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 594.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 597.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 608.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 617.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 620.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 627.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 634.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 637.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 641.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 644.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 647.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 651.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 661.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 662.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 671.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 675.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 678.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 679.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 688.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 688.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 690.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 692.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 693.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 696.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 698.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 700.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 709.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 711.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 721.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 724.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 726.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 726.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 736.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 738.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 740.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 749.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 750.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 751.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 756.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 760.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 765.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 768.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 774.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 778.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 786.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 787.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 793.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 794.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 796.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 800.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 806.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 808.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 808.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 811.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 817.2
Chkmod> 106 vectors, 13536 coordinates in file.
Chkmod> That is: 4512 cartesian points.
Openam> file on opening on unit 11:
Chkmod.res
Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file.
%Chkmod-Wn> Norm of vector 18 is: 0.9999 (instead of 1.0000).
Chkmod> Normal end.
0.0034 0.9492
0.0034 0.9349
0.0034 0.8141
0.0034 0.7375
0.0034 0.7774
0.0034 0.7452
111.9023 0.7185
133.1239 0.6813
156.4553 0.7402
231.7506 0.7581
252.8229 0.7643
253.5215 0.7781
327.5649 0.3067
327.6369 0.3334
344.0674 0.3468
351.0224 0.3464
372.5331 0.3132
374.4273 0.2219
389.5524 0.3745
405.8587 0.3359
411.0548 0.4432
420.8348 0.3341
422.6520 0.1179
425.2941 0.1010
437.5923 0.3086
450.3403 0.2079
463.3739 0.4184
465.5318 0.2514
471.1962 0.5703
476.5459 0.5935
483.3023 0.3429
493.9203 0.5410
496.5393 0.5305
498.1988 0.5647
511.5114 0.4701
511.6266 0.4122
518.2669 0.4359
522.4589 0.3264
528.7403 0.4647
531.6314 0.4781
532.6286 0.4347
537.6961 0.6102
543.5846 0.5097
546.7208 0.4489
562.0345 0.3825
567.9821 0.4410
571.3972 0.4101
575.5095 0.3382
576.0215 0.3394
589.7767 0.5101
591.8722 0.2273
593.9603 0.2558
597.4243 0.4045
608.4732 0.4009
617.1318 0.4283
620.7513 0.4393
627.1763 0.6086
634.3731 0.4572
637.5251 0.3154
641.8567 0.4142
644.3319 0.4309
647.0711 0.2720
651.4297 0.3263
661.4882 0.3644
662.2899 0.3467
671.4839 0.5720
675.6851 0.4955
678.6452 0.2597
679.4266 0.2601
687.9634 0.3427
688.2204 0.2854
690.1024 0.2886
692.0645 0.2028
693.9361 0.5033
696.1415 0.3925
698.9307 0.3190
700.6998 0.2848
709.7285 0.4213
711.0564 0.4701
721.8362 0.4476
723.9566 0.3955
726.1520 0.4636
726.3955 0.5090
736.1506 0.4850
738.1500 0.5900
740.9401 0.5714
749.0908 0.5689
750.6632 0.5248
751.9188 0.5103
756.6865 0.5337
760.0293 0.4695
765.2089 0.5354
768.3612 0.5182
774.7035 0.5736
778.8021 0.4335
786.9352 0.5286
787.7589 0.5009
793.9463 0.2081
794.8368 0.5652
796.1708 0.4205
800.4541 0.5020
806.5441 0.2437
808.4424 0.5809
808.8798 0.4546
811.2815 0.3747
817.2186 0.5213
getting mode 7
running: ../../bin/get_modes.sh 260211175543974155 7 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 7
calculating perturbed structure for DQ=-100
260211175543974155.eigenfacs
260211175543974155.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
260211175543974155.eigenfacs
260211175543974155.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
260211175543974155.eigenfacs
260211175543974155.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
260211175543974155.eigenfacs
260211175543974155.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
260211175543974155.eigenfacs
260211175543974155.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
260211175543974155.eigenfacs
260211175543974155.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
260211175543974155.eigenfacs
260211175543974155.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
260211175543974155.eigenfacs
260211175543974155.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
260211175543974155.eigenfacs
260211175543974155.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
260211175543974155.eigenfacs
260211175543974155.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
260211175543974155.eigenfacs
260211175543974155.atom
making animated gifs
11 models are in 260211175543974155.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 260211175543974155.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 260211175543974155.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 8
running: ../../bin/get_modes.sh 260211175543974155 8 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 8
calculating perturbed structure for DQ=-100
260211175543974155.eigenfacs
260211175543974155.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
260211175543974155.eigenfacs
260211175543974155.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
260211175543974155.eigenfacs
260211175543974155.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
260211175543974155.eigenfacs
260211175543974155.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
260211175543974155.eigenfacs
260211175543974155.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
260211175543974155.eigenfacs
260211175543974155.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
260211175543974155.eigenfacs
260211175543974155.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
260211175543974155.eigenfacs
260211175543974155.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
260211175543974155.eigenfacs
260211175543974155.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
260211175543974155.eigenfacs
260211175543974155.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
260211175543974155.eigenfacs
260211175543974155.atom
making animated gifs
11 models are in 260211175543974155.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 260211175543974155.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 260211175543974155.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 9
running: ../../bin/get_modes.sh 260211175543974155 9 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 9
calculating perturbed structure for DQ=-100
260211175543974155.eigenfacs
260211175543974155.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
260211175543974155.eigenfacs
260211175543974155.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
260211175543974155.eigenfacs
260211175543974155.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
260211175543974155.eigenfacs
260211175543974155.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
260211175543974155.eigenfacs
260211175543974155.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
260211175543974155.eigenfacs
260211175543974155.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
260211175543974155.eigenfacs
260211175543974155.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
260211175543974155.eigenfacs
260211175543974155.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
260211175543974155.eigenfacs
260211175543974155.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
260211175543974155.eigenfacs
260211175543974155.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
260211175543974155.eigenfacs
260211175543974155.atom
making animated gifs
11 models are in 260211175543974155.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 260211175543974155.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 260211175543974155.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 10
running: ../../bin/get_modes.sh 260211175543974155 10 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 10
calculating perturbed structure for DQ=-100
260211175543974155.eigenfacs
260211175543974155.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
260211175543974155.eigenfacs
260211175543974155.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
260211175543974155.eigenfacs
260211175543974155.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
260211175543974155.eigenfacs
260211175543974155.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
260211175543974155.eigenfacs
260211175543974155.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
260211175543974155.eigenfacs
260211175543974155.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
260211175543974155.eigenfacs
260211175543974155.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
260211175543974155.eigenfacs
260211175543974155.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
260211175543974155.eigenfacs
260211175543974155.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
260211175543974155.eigenfacs
260211175543974155.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
260211175543974155.eigenfacs
260211175543974155.atom
making animated gifs
11 models are in 260211175543974155.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 260211175543974155.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 260211175543974155.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 11
running: ../../bin/get_modes.sh 260211175543974155 11 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 11
calculating perturbed structure for DQ=-100
260211175543974155.eigenfacs
260211175543974155.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
260211175543974155.eigenfacs
260211175543974155.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
260211175543974155.eigenfacs
260211175543974155.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
260211175543974155.eigenfacs
260211175543974155.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
260211175543974155.eigenfacs
260211175543974155.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
260211175543974155.eigenfacs
260211175543974155.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
260211175543974155.eigenfacs
260211175543974155.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
260211175543974155.eigenfacs
260211175543974155.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
260211175543974155.eigenfacs
260211175543974155.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
260211175543974155.eigenfacs
260211175543974155.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
260211175543974155.eigenfacs
260211175543974155.atom
making animated gifs
11 models are in 260211175543974155.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 260211175543974155.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 260211175543974155.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
260211175543974155.10.pdb
260211175543974155.11.pdb
260211175543974155.7.pdb
260211175543974155.8.pdb
260211175543974155.9.pdb
STDERR:
Note: The following floating-point exceptions are signalling: IEEE_DENORMAL
real 0m33.128s
user 0m32.941s
sys 0m0.157s
rm: cannot remove '260211175543974155.sdijf': No such file or directory
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
If you find results from this site helpful for your research, please cite one of our papers:
elNémo
is maintained by Yves-Henri Sanejouand.
It was developed
by Karsten Suhre.
Between 2003 and 2014, it was hosted by IGS (Marseille).
Between 2015 and 2025, it was hosted by US2B (Nantes).
Last modification: december 26th, 2025.
|