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elNémo has been hacked on november 27th.
It has been moved away and runs again.
**Still some additional cleaning from time to time**
Sorry for the inconvenience.


***  Y_modelo_17_KELEY  ***

LOGs for ID: 260211175643975673

Output from eigenvector calculation:


STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8) Build Tirion matrix: Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model. Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004. Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file. Pdbmat> Coordinate filename = 260211175643975673.atom Pdbmat> Distance cutoff = 8.00 Force constant = 10.00 Origin of mass values = CONS Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09 PRINTing level = 2 Pdbmat> Coordinate file 260211175643975673.atom to be opened. Openam> File opened: 260211175643975673.atom Pdbmat> Coordinate file in PDB format. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 596 First residue number = 18 Last residue number = 315 Number of atoms found = 4512 Mean number per residue = 7.6 Pdbmat> Coordinate statistics: = -0.716958 +/- 16.105970 From: -39.947000 To: 37.626000 = 1.176483 +/- 10.527627 From: -22.322000 To: 26.756000 = 0.006719 +/- 18.894961 From: -40.550000 To: 43.238000 Pdbmat> Masses are all set to one. Openam> File opened: pdbmat.xyzm Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved. Openam> File opened: pdbmat.sdijb Pdbmat> Matrix statistics: Pdbmat> The matrix is 1.8984 % Filled. Pdbmat> 1739309 non-zero elements. Pdbmat> 190278 atom-atom interactions. Pdbmat> Number per atom= 84.34 +/- 22.96 Maximum number = 130 Minimum number = 17 Pdbmat> Matrix trace = 3.805560E+06 Pdbmat> Larger element = 492.494 Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10 Pdbmat> Normal end. automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1) 596 non-zero elements, NRBL set to 3 Diagonalize Tirion matrix using diagrtb Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation. Diagrtb> Version 2.52, November 2004. Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file. Diagrtb> Options taken into account: MATRix filename = pdbmat.sdijb COORdinates filename = 260211175643975673.atom Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb Nb of VECTors required = 106 EigeNVALues chosen = LOWE Type of SUBStructuring = NONE Nb of residues per BLOck = 3 Origin of MASS values = CONS MATRix FORMat = BINA Temporary files cleaning = ALL Output PRINting level = 2 Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb. Blocpdb> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.xyzm Blocpdb> Coordinate file 260211175643975673.atom to be opened. Openam> file on opening on unit 11: 260211175643975673.atom Blocpdb> Coordinate file in PDB format. Blocpdb> 4512 atoms picked in pdb file. Blocpdb> All masses set to unity. Blocpdb> Coordinate file is rewritten. Blocpdb> Substructuring: Blocpdb> 3 residue(s) per block. Blocpdb> 596 residues. Blocpdb> 22 atoms in block 1 Block first atom: 1 Blocpdb> 25 atoms in block 2 Block first atom: 23 Blocpdb> 22 atoms in block 3 Block first atom: 48 Blocpdb> 25 atoms in block 4 Block first atom: 70 Blocpdb> 23 atoms in block 5 Block first atom: 95 Blocpdb> 29 atoms in block 6 Block first atom: 118 Blocpdb> 25 atoms in block 7 Block first atom: 147 Blocpdb> 25 atoms in block 8 Block first atom: 172 Blocpdb> 25 atoms in block 9 Block first atom: 197 Blocpdb> 27 atoms in block 10 Block first atom: 222 Blocpdb> 27 atoms in block 11 Block first atom: 249 Blocpdb> 20 atoms in block 12 Block first atom: 276 Blocpdb> 19 atoms in block 13 Block first atom: 296 Blocpdb> 23 atoms in block 14 Block first atom: 315 Blocpdb> 31 atoms in block 15 Block first atom: 338 Blocpdb> 19 atoms in block 16 Block first atom: 369 Blocpdb> 17 atoms in block 17 Block first atom: 388 Blocpdb> 21 atoms in block 18 Block first atom: 405 Blocpdb> 20 atoms in block 19 Block first atom: 426 Blocpdb> 28 atoms in block 20 Block first atom: 446 Blocpdb> 13 atoms in block 21 Block first atom: 474 Blocpdb> 23 atoms in block 22 Block first atom: 487 Blocpdb> 19 atoms in block 23 Block first atom: 510 Blocpdb> 24 atoms in block 24 Block first atom: 529 Blocpdb> 18 atoms in block 25 Block first atom: 553 Blocpdb> 24 atoms in block 26 Block first atom: 571 Blocpdb> 29 atoms in block 27 Block first atom: 595 Blocpdb> 16 atoms in block 28 Block first atom: 624 Blocpdb> 28 atoms in block 29 Block first atom: 640 Blocpdb> 19 atoms in block 30 Block first atom: 668 Blocpdb> 25 atoms in block 31 Block first atom: 687 Blocpdb> 22 atoms in block 32 Block first atom: 712 Blocpdb> 31 atoms in block 33 Block first atom: 734 Blocpdb> 24 atoms in block 34 Block first atom: 765 Blocpdb> 21 atoms in block 35 Block first atom: 789 Blocpdb> 29 atoms in block 36 Block first atom: 810 Blocpdb> 18 atoms in block 37 Block first atom: 839 Blocpdb> 21 atoms in block 38 Block first atom: 857 Blocpdb> 19 atoms in block 39 Block first atom: 878 Blocpdb> 26 atoms in block 40 Block first atom: 897 Blocpdb> 22 atoms in block 41 Block first atom: 923 Blocpdb> 20 atoms in block 42 Block first atom: 945 Blocpdb> 20 atoms in block 43 Block first atom: 965 Blocpdb> 18 atoms in block 44 Block first atom: 985 Blocpdb> 17 atoms in block 45 Block first atom: 1003 Blocpdb> 24 atoms in block 46 Block first atom: 1020 Blocpdb> 27 atoms in block 47 Block first atom: 1044 Blocpdb> 19 atoms in block 48 Block first atom: 1071 Blocpdb> 21 atoms in block 49 Block first atom: 1090 Blocpdb> 13 atoms in block 50 Block first atom: 1111 Blocpdb> 19 atoms in block 51 Block first atom: 1124 Blocpdb> 23 atoms in block 52 Block first atom: 1143 Blocpdb> 20 atoms in block 53 Block first atom: 1166 Blocpdb> 20 atoms in block 54 Block first atom: 1186 Blocpdb> 20 atoms in block 55 Block first atom: 1206 Blocpdb> 29 atoms in block 56 Block first atom: 1226 Blocpdb> 24 atoms in block 57 Block first atom: 1255 Blocpdb> 20 atoms in block 58 Block first atom: 1279 Blocpdb> 22 atoms in block 59 Block first atom: 1299 Blocpdb> 20 atoms in block 60 Block first atom: 1321 Blocpdb> 33 atoms in block 61 Block first atom: 1341 Blocpdb> 21 atoms in block 62 Block first atom: 1374 Blocpdb> 27 atoms in block 63 Block first atom: 1395 Blocpdb> 25 atoms in block 64 Block first atom: 1422 Blocpdb> 22 atoms in block 65 Block first atom: 1447 Blocpdb> 28 atoms in block 66 Block first atom: 1469 Blocpdb> 19 atoms in block 67 Block first atom: 1497 Blocpdb> 24 atoms in block 68 Block first atom: 1516 Blocpdb> 26 atoms in block 69 Block first atom: 1540 Blocpdb> 24 atoms in block 70 Block first atom: 1566 Blocpdb> 20 atoms in block 71 Block first atom: 1590 Blocpdb> 20 atoms in block 72 Block first atom: 1610 Blocpdb> 23 atoms in block 73 Block first atom: 1630 Blocpdb> 26 atoms in block 74 Block first atom: 1653 Blocpdb> 19 atoms in block 75 Block first atom: 1679 Blocpdb> 23 atoms in block 76 Block first atom: 1698 Blocpdb> 23 atoms in block 77 Block first atom: 1721 Blocpdb> 25 atoms in block 78 Block first atom: 1744 Blocpdb> 20 atoms in block 79 Block first atom: 1769 Blocpdb> 24 atoms in block 80 Block first atom: 1789 Blocpdb> 17 atoms in block 81 Block first atom: 1813 Blocpdb> 26 atoms in block 82 Block first atom: 1830 Blocpdb> 22 atoms in block 83 Block first atom: 1856 Blocpdb> 22 atoms in block 84 Block first atom: 1878 Blocpdb> 22 atoms in block 85 Block first atom: 1900 Blocpdb> 24 atoms in block 86 Block first atom: 1922 Blocpdb> 23 atoms in block 87 Block first atom: 1946 Blocpdb> 21 atoms in block 88 Block first atom: 1969 Blocpdb> 22 atoms in block 89 Block first atom: 1990 Blocpdb> 24 atoms in block 90 Block first atom: 2012 Blocpdb> 29 atoms in block 91 Block first atom: 2036 Blocpdb> 19 atoms in block 92 Block first atom: 2065 Blocpdb> 19 atoms in block 93 Block first atom: 2084 Blocpdb> 22 atoms in block 94 Block first atom: 2103 Blocpdb> 28 atoms in block 95 Block first atom: 2125 Blocpdb> 23 atoms in block 96 Block first atom: 2153 Blocpdb> 33 atoms in block 97 Block first atom: 2176 Blocpdb> 25 atoms in block 98 Block first atom: 2209 Blocpdb> 19 atoms in block 99 Block first atom: 2234 Blocpdb> 4 atoms in block 100 Block first atom: 2253 Blocpdb> 22 atoms in block 101 Block first atom: 2257 Blocpdb> 25 atoms in block 102 Block first atom: 2279 Blocpdb> 22 atoms in block 103 Block first atom: 2304 Blocpdb> 25 atoms in block 104 Block first atom: 2326 Blocpdb> 23 atoms in block 105 Block first atom: 2351 Blocpdb> 29 atoms in block 106 Block first atom: 2374 Blocpdb> 25 atoms in block 107 Block first atom: 2403 Blocpdb> 25 atoms in block 108 Block first atom: 2428 Blocpdb> 25 atoms in block 109 Block first atom: 2453 Blocpdb> 27 atoms in block 110 Block first atom: 2478 Blocpdb> 27 atoms in block 111 Block first atom: 2505 Blocpdb> 20 atoms in block 112 Block first atom: 2532 Blocpdb> 19 atoms in block 113 Block first atom: 2552 Blocpdb> 23 atoms in block 114 Block first atom: 2571 Blocpdb> 31 atoms in block 115 Block first atom: 2594 Blocpdb> 19 atoms in block 116 Block first atom: 2625 Blocpdb> 17 atoms in block 117 Block first atom: 2644 Blocpdb> 21 atoms in block 118 Block first atom: 2661 Blocpdb> 20 atoms in block 119 Block first atom: 2682 Blocpdb> 28 atoms in block 120 Block first atom: 2702 Blocpdb> 13 atoms in block 121 Block first atom: 2730 Blocpdb> 23 atoms in block 122 Block first atom: 2743 Blocpdb> 19 atoms in block 123 Block first atom: 2766 Blocpdb> 24 atoms in block 124 Block first atom: 2785 Blocpdb> 18 atoms in block 125 Block first atom: 2809 Blocpdb> 24 atoms in block 126 Block first atom: 2827 Blocpdb> 29 atoms in block 127 Block first atom: 2851 Blocpdb> 16 atoms in block 128 Block first atom: 2880 Blocpdb> 28 atoms in block 129 Block first atom: 2896 Blocpdb> 19 atoms in block 130 Block first atom: 2924 Blocpdb> 25 atoms in block 131 Block first atom: 2943 Blocpdb> 22 atoms in block 132 Block first atom: 2968 Blocpdb> 31 atoms in block 133 Block first atom: 2990 Blocpdb> 24 atoms in block 134 Block first atom: 3021 Blocpdb> 21 atoms in block 135 Block first atom: 3045 Blocpdb> 29 atoms in block 136 Block first atom: 3066 Blocpdb> 18 atoms in block 137 Block first atom: 3095 Blocpdb> 21 atoms in block 138 Block first atom: 3113 Blocpdb> 19 atoms in block 139 Block first atom: 3134 Blocpdb> 26 atoms in block 140 Block first atom: 3153 Blocpdb> 22 atoms in block 141 Block first atom: 3179 Blocpdb> 20 atoms in block 142 Block first atom: 3201 Blocpdb> 20 atoms in block 143 Block first atom: 3221 Blocpdb> 18 atoms in block 144 Block first atom: 3241 Blocpdb> 17 atoms in block 145 Block first atom: 3259 Blocpdb> 24 atoms in block 146 Block first atom: 3276 Blocpdb> 27 atoms in block 147 Block first atom: 3300 Blocpdb> 19 atoms in block 148 Block first atom: 3327 Blocpdb> 21 atoms in block 149 Block first atom: 3346 Blocpdb> 13 atoms in block 150 Block first atom: 3367 Blocpdb> 19 atoms in block 151 Block first atom: 3380 Blocpdb> 23 atoms in block 152 Block first atom: 3399 Blocpdb> 20 atoms in block 153 Block first atom: 3422 Blocpdb> 20 atoms in block 154 Block first atom: 3442 Blocpdb> 20 atoms in block 155 Block first atom: 3462 Blocpdb> 29 atoms in block 156 Block first atom: 3482 Blocpdb> 24 atoms in block 157 Block first atom: 3511 Blocpdb> 20 atoms in block 158 Block first atom: 3535 Blocpdb> 22 atoms in block 159 Block first atom: 3555 Blocpdb> 20 atoms in block 160 Block first atom: 3577 Blocpdb> 33 atoms in block 161 Block first atom: 3597 Blocpdb> 21 atoms in block 162 Block first atom: 3630 Blocpdb> 27 atoms in block 163 Block first atom: 3651 Blocpdb> 25 atoms in block 164 Block first atom: 3678 Blocpdb> 22 atoms in block 165 Block first atom: 3703 Blocpdb> 28 atoms in block 166 Block first atom: 3725 Blocpdb> 19 atoms in block 167 Block first atom: 3753 Blocpdb> 24 atoms in block 168 Block first atom: 3772 Blocpdb> 26 atoms in block 169 Block first atom: 3796 Blocpdb> 24 atoms in block 170 Block first atom: 3822 Blocpdb> 20 atoms in block 171 Block first atom: 3846 Blocpdb> 20 atoms in block 172 Block first atom: 3866 Blocpdb> 23 atoms in block 173 Block first atom: 3886 Blocpdb> 26 atoms in block 174 Block first atom: 3909 Blocpdb> 19 atoms in block 175 Block first atom: 3935 Blocpdb> 23 atoms in block 176 Block first atom: 3954 Blocpdb> 23 atoms in block 177 Block first atom: 3977 Blocpdb> 25 atoms in block 178 Block first atom: 4000 Blocpdb> 20 atoms in block 179 Block first atom: 4025 Blocpdb> 24 atoms in block 180 Block first atom: 4045 Blocpdb> 17 atoms in block 181 Block first atom: 4069 Blocpdb> 26 atoms in block 182 Block first atom: 4086 Blocpdb> 22 atoms in block 183 Block first atom: 4112 Blocpdb> 22 atoms in block 184 Block first atom: 4134 Blocpdb> 22 atoms in block 185 Block first atom: 4156 Blocpdb> 24 atoms in block 186 Block first atom: 4178 Blocpdb> 23 atoms in block 187 Block first atom: 4202 Blocpdb> 21 atoms in block 188 Block first atom: 4225 Blocpdb> 22 atoms in block 189 Block first atom: 4246 Blocpdb> 24 atoms in block 190 Block first atom: 4268 Blocpdb> 29 atoms in block 191 Block first atom: 4292 Blocpdb> 19 atoms in block 192 Block first atom: 4321 Blocpdb> 19 atoms in block 193 Block first atom: 4340 Blocpdb> 22 atoms in block 194 Block first atom: 4359 Blocpdb> 28 atoms in block 195 Block first atom: 4381 Blocpdb> 23 atoms in block 196 Block first atom: 4409 Blocpdb> 33 atoms in block 197 Block first atom: 4432 Blocpdb> 25 atoms in block 198 Block first atom: 4465 Blocpdb> 19 atoms in block 199 Block first atom: 4490 Blocpdb> 4 atoms in block 200 Block first atom: 4508 Blocpdb> 200 blocks. Blocpdb> At most, 33 atoms in each of them. Blocpdb> At least, 4 atoms in each of them. Blocpdb> Normal end of Blocpdb. Diagrtb> Memory allocation for Prepmat. Diagrtb> Memory allocation for RTB. Diagrtb> Memory allocation for Diagstd. Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes. Prepmat> Entering in. Prepmat> Rewriting of the matrix begins. Prepmat> 1739509 matrix lines read. Prepmat> Matrix order = 13536 Prepmat> Matrix trace = 3805560.0000 Prepmat> Last element read: 13536 13536 65.3940 Prepmat> 20101 lines saved. Prepmat> 18044 empty lines. Prepmat> Number of lines on output is as expected. Prepmat> Normal end of Prepmat. RTB> Entering in. RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 4512 RTB> Total mass = 4512.0000 RTB> Number of atoms found in matrix: 4512 RTB> Number of blocks = 200 RTB> Projection begins. RTB> Projected matrix is being saved. RTB> Projected matrix trace = 267658.6918 RTB> 71016 non-zero elements. RTB> Normal end of RTB. Diagstd> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.sdijb Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb Diagstd> CERFACS matrix format. Diagstd> Projected matrix order = 1200 Diagstd> Nb of non-zero elements: 71016 Diagstd> Projected matrix trace = 267658.6918 Openam> file on opening on unit 11: diagrtb_work.eigenfacs Diagstd> Diagonalization. Diagstd> 1200 eigenvectors are computed. Diagstd> 106 of them to be saved. Diagstd> Sum of eigenvalues = 267658.6918 Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000 Diagstd> Selected eigenvalues: 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.5722725 0.6710357 0.7329554 2.3812071 2.4880391 3.2862486 7.4059978 8.4511156 8.8474387 8.9237178 11.0992522 11.1757930 11.5699721 12.4501067 13.0138986 13.7198708 13.7966530 14.2980981 14.6738688 15.1163783 16.3640462 16.5921423 17.1283766 17.8651982 18.0265658 18.3652591 19.0368936 19.1062239 19.3247053 20.3387738 21.1126540 21.7350458 21.8619921 22.1681354 22.7215500 22.8593284 23.3499314 24.0819514 24.9966514 25.3728488 25.8224977 25.9622786 27.2181267 27.6777557 28.4440707 28.5778905 28.8582400 29.4534523 30.3890335 31.0277068 31.6305438 31.9420647 32.1072120 32.8631495 32.9113972 33.3590480 34.4109453 34.8717739 35.2255095 36.1115888 36.8725177 37.0334536 37.4667741 37.5653623 38.1329433 38.6806890 39.1196935 39.1894739 39.6954054 39.9935352 40.2372813 40.6896970 40.8414126 41.3242463 41.4970396 42.1115537 42.3915701 42.5908621 42.8532908 43.1558782 43.3163838 44.3189617 44.5250871 44.8261870 45.5180454 45.9470982 46.1852199 47.0842243 47.1426194 48.6503813 48.9608035 49.4399426 49.5179193 50.2067273 50.9218611 51.2441912 51.5554188 52.6146849 52.6575526 53.5297024 Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units): 0.0034316 0.0034321 0.0034322 0.0034328 0.0034331 0.0034336 82.1479496 88.9545344 92.9681209 167.5690720 171.2867942 196.8545630 295.5201300 315.6838044 323.0011456 324.3905494 361.7779884 363.0232615 369.3698438 383.1614581 391.7409651 402.2261399 403.3500831 410.6146278 415.9753499 422.2009014 439.2791895 442.3301192 449.4210209 458.9857475 461.0539839 465.3650999 473.7981074 474.6600840 477.3662603 489.7310758 498.9611086 506.2622677 507.7385593 511.2812460 517.6238246 519.1908305 524.7326467 532.8943525 542.9204457 546.9906410 551.8161464 553.3076603 566.5319349 571.2953859 579.1501258 580.5108807 583.3513416 589.3365598 598.6234482 604.8812457 610.7290942 613.7291802 615.3136908 622.5150729 622.9718749 627.1943026 637.0060860 641.2572681 644.5014844 652.5571890 659.3965592 660.8340124 664.6889076 665.5628476 670.5720448 675.3709573 679.1926884 679.7981790 684.1721648 686.7365745 688.8261005 692.6877518 693.9779272 698.0680333 699.5259624 704.6864372 707.0254248 708.6854160 710.8653889 713.3706868 714.6960415 722.9197156 724.5988977 727.0448112 732.6340220 736.0788251 737.9837312 745.1316146 745.5935378 757.4228525 759.8354449 763.5443349 764.1462286 769.4426166 774.9031288 777.3517880 779.7088072 787.6780935 787.9989075 794.4977922 Diagstd> Normal end. Rtb_to_modes> Entering in. Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 4512 Rtb_to_modes> Number of blocs = 200 Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.eigenfacs Openam> file on opening on unit 11: matrix.eigenrtb Rdmodfacs> Entering in. Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Eigenvector number: 1 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9860E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 2 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9893E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 3 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9898E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 4 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9934E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 5 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9953E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 6 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9979E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 7 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.5723 Rdmodfacs> Eigenvector number: 8 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.6710 Rdmodfacs> Eigenvector number: 9 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.7330 Rdmodfacs> Eigenvector number: 10 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.381 Rdmodfacs> Eigenvector number: 11 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.488 Rdmodfacs> Eigenvector number: 12 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.286 Rdmodfacs> Eigenvector number: 13 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.406 Rdmodfacs> Eigenvector number: 14 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.451 Rdmodfacs> Eigenvector number: 15 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.847 Rdmodfacs> Eigenvector number: 16 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.924 Rdmodfacs> Eigenvector number: 17 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 18 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.18 Rdmodfacs> Eigenvector number: 19 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.57 Rdmodfacs> Eigenvector number: 20 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.45 Rdmodfacs> Eigenvector number: 21 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.01 Rdmodfacs> Eigenvector number: 22 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.72 Rdmodfacs> Eigenvector number: 23 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.80 Rdmodfacs> Eigenvector number: 24 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.30 Rdmodfacs> Eigenvector number: 25 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.67 Rdmodfacs> Eigenvector number: 26 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.12 Rdmodfacs> Eigenvector number: 27 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.36 Rdmodfacs> Eigenvector number: 28 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.59 Rdmodfacs> Eigenvector number: 29 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.13 Rdmodfacs> Eigenvector number: 30 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.87 Rdmodfacs> Eigenvector number: 31 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.03 Rdmodfacs> Eigenvector number: 32 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.37 Rdmodfacs> Eigenvector number: 33 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.04 Rdmodfacs> Eigenvector number: 34 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.11 Rdmodfacs> Eigenvector number: 35 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.32 Rdmodfacs> Eigenvector number: 36 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.34 Rdmodfacs> Eigenvector number: 37 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.11 Rdmodfacs> Eigenvector number: 38 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.74 Rdmodfacs> Eigenvector number: 39 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.86 Rdmodfacs> Eigenvector number: 40 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.17 Rdmodfacs> Eigenvector number: 41 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.72 Rdmodfacs> Eigenvector number: 42 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.86 Rdmodfacs> Eigenvector number: 43 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.35 Rdmodfacs> Eigenvector number: 44 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.08 Rdmodfacs> Eigenvector number: 45 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.00 Rdmodfacs> Eigenvector number: 46 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.37 Rdmodfacs> Eigenvector number: 47 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.82 Rdmodfacs> Eigenvector number: 48 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.96 Rdmodfacs> Eigenvector number: 49 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.22 Rdmodfacs> Eigenvector number: 50 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.68 Rdmodfacs> Eigenvector number: 51 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.44 Rdmodfacs> Eigenvector number: 52 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.58 Rdmodfacs> Eigenvector number: 53 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.86 Rdmodfacs> Eigenvector number: 54 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.45 Rdmodfacs> Eigenvector number: 55 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.39 Rdmodfacs> Eigenvector number: 56 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.03 Rdmodfacs> Eigenvector number: 57 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.63 Rdmodfacs> Eigenvector number: 58 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.94 Rdmodfacs> Eigenvector number: 59 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.11 Rdmodfacs> Eigenvector number: 60 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.86 Rdmodfacs> Eigenvector number: 61 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.91 Rdmodfacs> Eigenvector number: 62 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.36 Rdmodfacs> Eigenvector number: 63 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.41 Rdmodfacs> Eigenvector number: 64 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.87 Rdmodfacs> Eigenvector number: 65 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.23 Rdmodfacs> Eigenvector number: 66 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.11 Rdmodfacs> Eigenvector number: 67 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.87 Rdmodfacs> Eigenvector number: 68 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.03 Rdmodfacs> Eigenvector number: 69 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.47 Rdmodfacs> Eigenvector number: 70 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.57 Rdmodfacs> Eigenvector number: 71 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.13 Rdmodfacs> Eigenvector number: 72 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.68 Rdmodfacs> Eigenvector number: 73 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.12 Rdmodfacs> Eigenvector number: 74 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.19 Rdmodfacs> Eigenvector number: 75 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.70 Rdmodfacs> Eigenvector number: 76 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.99 Rdmodfacs> Eigenvector number: 77 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.24 Rdmodfacs> Eigenvector number: 78 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.69 Rdmodfacs> Eigenvector number: 79 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.84 Rdmodfacs> Eigenvector number: 80 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.32 Rdmodfacs> Eigenvector number: 81 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.50 Rdmodfacs> Eigenvector number: 82 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.11 Rdmodfacs> Eigenvector number: 83 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.39 Rdmodfacs> Eigenvector number: 84 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.59 Rdmodfacs> Eigenvector number: 85 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.85 Rdmodfacs> Eigenvector number: 86 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.16 Rdmodfacs> Eigenvector number: 87 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.32 Rdmodfacs> Eigenvector number: 88 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.32 Rdmodfacs> Eigenvector number: 89 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.53 Rdmodfacs> Eigenvector number: 90 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.83 Rdmodfacs> Eigenvector number: 91 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.52 Rdmodfacs> Eigenvector number: 92 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.95 Rdmodfacs> Eigenvector number: 93 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.19 Rdmodfacs> Eigenvector number: 94 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 47.08 Rdmodfacs> Eigenvector number: 95 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 47.14 Rdmodfacs> Eigenvector number: 96 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 48.65 Rdmodfacs> Eigenvector number: 97 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 48.96 Rdmodfacs> Eigenvector number: 98 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 49.44 Rdmodfacs> Eigenvector number: 99 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 49.52 Rdmodfacs> Eigenvector number: 100 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 50.21 Rdmodfacs> Eigenvector number: 101 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 50.92 Rdmodfacs> Eigenvector number: 102 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 51.24 Rdmodfacs> Eigenvector number: 103 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 51.56 Rdmodfacs> Eigenvector number: 104 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 52.61 Rdmodfacs> Eigenvector number: 105 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 52.66 Rdmodfacs> Eigenvector number: 106 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 53.53 Rtb_to_modes> 106 vectors, with 1200 coordinates in vector file. Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected): 1.00000 1.00002 1.00000 1.00000 0.99998 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 0.99999 1.00000 0.99997 0.99999 1.00000 0.99999 1.00001 0.99999 0.99998 1.00002 0.99998 1.00000 1.00000 0.99998 1.00004 0.99997 0.99998 1.00000 1.00001 1.00003 1.00000 0.99999 1.00000 0.99998 1.00001 0.99998 1.00001 1.00000 1.00001 1.00001 1.00000 0.99999 1.00001 0.99999 1.00002 1.00000 1.00001 0.99998 1.00001 0.99999 0.99999 1.00000 1.00000 0.99999 0.99998 1.00000 0.99999 1.00000 1.00000 0.99999 0.99999 0.99999 1.00000 0.99998 1.00001 1.00000 0.99999 1.00002 1.00000 1.00002 1.00001 1.00002 0.99997 1.00001 0.99999 1.00000 1.00002 1.00001 0.99999 1.00000 1.00002 0.99998 1.00000 1.00001 1.00000 1.00000 1.00000 1.00002 0.99999 1.00002 1.00002 1.00002 1.00001 1.00000 1.00001 0.99998 1.00001 1.00000 1.00000 0.99999 1.00001 0.99999 0.99998 0.99999 0.99999 1.00000 Rtb_to_modes> RTB block-file is being read. Rtb_to_modes> 81216 lines found in RTB file. Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected): 1.00000 1.00002 1.00000 1.00000 0.99998 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 0.99999 1.00000 0.99997 0.99999 1.00000 0.99999 1.00001 0.99999 0.99998 1.00002 0.99998 1.00000 1.00000 0.99998 1.00004 0.99997 0.99998 1.00000 1.00001 1.00003 1.00000 0.99999 1.00000 0.99998 1.00001 0.99998 1.00001 1.00000 1.00001 1.00001 1.00000 0.99999 1.00001 0.99999 1.00002 1.00000 1.00001 0.99998 1.00001 0.99999 0.99999 1.00000 1.00000 0.99999 0.99998 1.00000 0.99999 1.00000 1.00000 0.99999 0.99999 0.99999 1.00000 0.99998 1.00001 1.00000 0.99999 1.00002 1.00000 1.00002 1.00001 1.00002 0.99997 1.00001 0.99999 1.00000 1.00002 1.00001 0.99999 1.00000 1.00002 0.99998 1.00000 1.00001 1.00000 1.00000 1.00000 1.00002 0.99999 1.00002 1.00002 1.00002 1.00001 1.00000 1.00001 0.99998 1.00001 1.00000 1.00000 0.99999 1.00001 0.99999 0.99998 0.99999 0.99999 1.00000 Orthogonality of first eigenvectors (zero expected): Vector 2:-0.000 Vector 3: 0.000-0.000 Vector 4: 0.000 0.000-0.000 Vector 5: 0.000 0.000-0.000 0.000 Vector 6: 0.000 0.000 0.000 0.000-0.000 Vector 7: 0.000-0.000 0.000-0.000-0.000-0.000 Vector 8: 0.000-0.000 0.000 0.000 0.000-0.000 0.000 Vector 9: 0.000-0.000-0.000-0.000-0.000 0.000 0.000 0.000 Vector 10:-0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000-0.000-0.000 Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved. Rtb_to_modes> Normal end. Diagrtb> Normal end. B-factor analysis Bfactors> Version 1.22, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 260211175643975673.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 260211175643975673.eigenfacs Getnam> Corresponding pdb filename ? Getnam> 260211175643975673.atom Openam> file on opening on unit 11: 260211175643975673.atom Getnum> Number of skipped eigenvectors ? Getnum> 0 Getnum> Number of usefull eigenvectors ? Getnum> 10000 %Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 596 First residue number = 18 Last residue number = 315 Number of atoms found = 4512 Mean number per residue = 7.6 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9860E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9893E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9898E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9934E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9953E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9979E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.5723 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.6710 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.7330 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.381 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.488 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.286 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.406 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.451 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.847 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.924 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.18 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.57 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.45 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.01 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.72 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.80 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.30 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.67 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.12 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.36 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.59 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.13 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.87 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.37 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.04 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.11 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.32 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.34 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.11 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.74 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.86 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.17 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.72 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.86 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.35 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.08 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.00 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.37 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.82 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.96 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.22 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.68 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.44 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.58 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.86 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.45 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.39 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.63 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.94 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.11 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.86 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.91 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.36 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.41 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.87 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.23 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.11 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.87 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.47 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.57 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.13 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.68 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.12 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.19 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.70 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.99 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.24 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.69 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.84 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.32 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.50 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.11 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.39 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.59 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.85 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.16 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.32 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.32 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.53 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.83 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.52 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.95 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.19 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.08 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.14 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.65 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.96 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.44 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.52 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 50.21 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 50.92 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 51.24 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 51.56 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 52.61 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 52.66 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 53.53 Bfactors> 106 vectors, 13536 coordinates in file. Openam> file on opening on unit 12: bfactors.pred Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000 Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 0.572300 Bfactors> 100 eigenvectors will be considered. Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped. Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed. (CHARMM units assumed for eigenvalues) Bfactors> Correlation= -0.427 for 596 C-alpha atoms. Bfactors> = 0.032 +/- 0.02 Bfactors> = 89.412 +/- 6.54 Bfactors> Shiftng-fct= 89.380 Bfactors> Scaling-fct= 265.799 Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved. Bfactors> Normal end. check_modes Chkmod> Version 1.00, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 260211175643975673.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 260211175643975673.eigenfacs Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4314E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4320E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4321E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4327E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4330E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4335E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 82.15 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 88.95 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 92.97 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 167.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 171.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 196.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 295.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 315.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 323.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 324.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 361.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 363.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 369.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 383.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 391.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 402.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 403.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 410.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 415.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 422.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 439.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 442.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 449.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 459.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 461.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 465.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 473.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 474.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 477.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 489.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 498.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 506.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Frequence du 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Chkmod> That is: 4512 cartesian points. Openam> file on opening on unit 11: Chkmod.res Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file. 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perturbed structure for DQ=-100 260211175643975673.eigenfacs 260211175643975673.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 260211175643975673.eigenfacs 260211175643975673.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 260211175643975673.eigenfacs 260211175643975673.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 260211175643975673.eigenfacs 260211175643975673.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 260211175643975673.eigenfacs 260211175643975673.atom calculating perturbed structure for DQ=0 260211175643975673.eigenfacs 260211175643975673.atom calculating perturbed structure for DQ=20 260211175643975673.eigenfacs 260211175643975673.atom calculating perturbed structure for DQ=40 260211175643975673.eigenfacs 260211175643975673.atom calculating perturbed structure for DQ=60 260211175643975673.eigenfacs 260211175643975673.atom calculating perturbed structure for DQ=80 260211175643975673.eigenfacs 260211175643975673.atom calculating perturbed structure for DQ=100 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../../bin/get_modes.sh 260211175643975673 9 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 9 calculating perturbed structure for DQ=-100 260211175643975673.eigenfacs 260211175643975673.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 260211175643975673.eigenfacs 260211175643975673.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 260211175643975673.eigenfacs 260211175643975673.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 260211175643975673.eigenfacs 260211175643975673.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 260211175643975673.eigenfacs 260211175643975673.atom calculating perturbed structure for DQ=0 260211175643975673.eigenfacs 260211175643975673.atom calculating perturbed structure for DQ=20 260211175643975673.eigenfacs 260211175643975673.atom calculating perturbed structure for DQ=40 260211175643975673.eigenfacs 260211175643975673.atom calculating perturbed structure for DQ=60 260211175643975673.eigenfacs 260211175643975673.atom 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