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elNémo has been hacked on november 27th.
It has been moved away and runs again.
**Still some additional cleaning from time to time**
Sorry for the inconvenience.


***  Y_modelo_20_KELEY  ***

LOGs for ID: 260211175717977004

Output from eigenvector calculation:


STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8) Build Tirion matrix: Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model. Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004. Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file. Pdbmat> Coordinate filename = 260211175717977004.atom Pdbmat> Distance cutoff = 8.00 Force constant = 10.00 Origin of mass values = CONS Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09 PRINTing level = 2 Pdbmat> Coordinate file 260211175717977004.atom to be opened. Openam> File opened: 260211175717977004.atom Pdbmat> Coordinate file in PDB format. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 596 First residue number = 18 Last residue number = 315 Number of atoms found = 4512 Mean number per residue = 7.6 Pdbmat> Coordinate statistics: = 0.371461 +/- 19.462294 From: -41.117000 To: 40.557000 = -0.604306 +/- 14.896023 From: -33.792000 To: 34.039000 = 0.360531 +/- 10.221622 From: -27.651000 To: 24.983000 Pdbmat> Masses are all set to one. Openam> File opened: pdbmat.xyzm Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved. Openam> File opened: pdbmat.sdijb Pdbmat> Matrix statistics: Pdbmat> The matrix is 1.9093 % Filled. Pdbmat> 1749315 non-zero elements. Pdbmat> 191397 atom-atom interactions. Pdbmat> Number per atom= 84.84 +/- 23.48 Maximum number = 134 Minimum number = 14 Pdbmat> Matrix trace = 3.827940E+06 Pdbmat> Larger element = 497.116 Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10 Pdbmat> Normal end. automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1) 596 non-zero elements, NRBL set to 3 Diagonalize Tirion matrix using diagrtb Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation. Diagrtb> Version 2.52, November 2004. Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file. Diagrtb> Options taken into account: MATRix filename = pdbmat.sdijb COORdinates filename = 260211175717977004.atom Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb Nb of VECTors required = 106 EigeNVALues chosen = LOWE Type of SUBStructuring = NONE Nb of residues per BLOck = 3 Origin of MASS values = CONS MATRix FORMat = BINA Temporary files cleaning = ALL Output PRINting level = 2 Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb. Blocpdb> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.xyzm Blocpdb> Coordinate file 260211175717977004.atom to be opened. Openam> file on opening on unit 11: 260211175717977004.atom Blocpdb> Coordinate file in PDB format. Blocpdb> 4512 atoms picked in pdb file. Blocpdb> All masses set to unity. Blocpdb> Coordinate file is rewritten. Blocpdb> Substructuring: Blocpdb> 3 residue(s) per block. Blocpdb> 596 residues. Blocpdb> 22 atoms in block 1 Block first atom: 1 Blocpdb> 25 atoms in block 2 Block first atom: 23 Blocpdb> 22 atoms in block 3 Block first atom: 48 Blocpdb> 25 atoms in block 4 Block first atom: 70 Blocpdb> 23 atoms in block 5 Block first atom: 95 Blocpdb> 29 atoms in block 6 Block first atom: 118 Blocpdb> 25 atoms in block 7 Block first atom: 147 Blocpdb> 25 atoms in block 8 Block first atom: 172 Blocpdb> 25 atoms in block 9 Block first atom: 197 Blocpdb> 27 atoms in block 10 Block first atom: 222 Blocpdb> 27 atoms in block 11 Block first atom: 249 Blocpdb> 20 atoms in block 12 Block first atom: 276 Blocpdb> 19 atoms in block 13 Block first atom: 296 Blocpdb> 23 atoms in block 14 Block first atom: 315 Blocpdb> 31 atoms in block 15 Block first atom: 338 Blocpdb> 19 atoms in block 16 Block first atom: 369 Blocpdb> 17 atoms in block 17 Block first atom: 388 Blocpdb> 21 atoms in block 18 Block first atom: 405 Blocpdb> 20 atoms in block 19 Block first atom: 426 Blocpdb> 28 atoms in block 20 Block first atom: 446 Blocpdb> 13 atoms in block 21 Block first atom: 474 Blocpdb> 23 atoms in block 22 Block first atom: 487 Blocpdb> 19 atoms in block 23 Block first atom: 510 Blocpdb> 24 atoms in block 24 Block first atom: 529 Blocpdb> 18 atoms in block 25 Block first atom: 553 Blocpdb> 24 atoms in block 26 Block first atom: 571 Blocpdb> 29 atoms in block 27 Block first atom: 595 Blocpdb> 16 atoms in block 28 Block first atom: 624 Blocpdb> 28 atoms in block 29 Block first atom: 640 Blocpdb> 19 atoms in block 30 Block first atom: 668 Blocpdb> 25 atoms in block 31 Block first atom: 687 Blocpdb> 22 atoms in block 32 Block first atom: 712 Blocpdb> 31 atoms in block 33 Block first atom: 734 Blocpdb> 24 atoms in block 34 Block first atom: 765 Blocpdb> 21 atoms in block 35 Block first atom: 789 Blocpdb> 29 atoms in block 36 Block first atom: 810 Blocpdb> 18 atoms in block 37 Block first atom: 839 Blocpdb> 21 atoms in block 38 Block first atom: 857 Blocpdb> 19 atoms in block 39 Block first atom: 878 Blocpdb> 26 atoms in block 40 Block first atom: 897 Blocpdb> 22 atoms in block 41 Block first atom: 923 Blocpdb> 20 atoms in block 42 Block first atom: 945 Blocpdb> 20 atoms in block 43 Block first atom: 965 Blocpdb> 18 atoms in block 44 Block first atom: 985 Blocpdb> 17 atoms in block 45 Block first atom: 1003 Blocpdb> 24 atoms in block 46 Block first atom: 1020 Blocpdb> 27 atoms in block 47 Block first atom: 1044 Blocpdb> 19 atoms in block 48 Block first atom: 1071 Blocpdb> 21 atoms in block 49 Block first atom: 1090 Blocpdb> 13 atoms in block 50 Block first atom: 1111 Blocpdb> 19 atoms in block 51 Block first atom: 1124 Blocpdb> 23 atoms in block 52 Block first atom: 1143 Blocpdb> 20 atoms in block 53 Block first atom: 1166 Blocpdb> 20 atoms in block 54 Block first atom: 1186 Blocpdb> 20 atoms in block 55 Block first atom: 1206 Blocpdb> 29 atoms in block 56 Block first atom: 1226 Blocpdb> 24 atoms in block 57 Block first atom: 1255 Blocpdb> 20 atoms in block 58 Block first atom: 1279 Blocpdb> 22 atoms in block 59 Block first atom: 1299 Blocpdb> 20 atoms in block 60 Block first atom: 1321 Blocpdb> 33 atoms in block 61 Block first atom: 1341 Blocpdb> 21 atoms in block 62 Block first atom: 1374 Blocpdb> 27 atoms in block 63 Block first atom: 1395 Blocpdb> 25 atoms in block 64 Block first atom: 1422 Blocpdb> 22 atoms in block 65 Block first atom: 1447 Blocpdb> 28 atoms in block 66 Block first atom: 1469 Blocpdb> 19 atoms in block 67 Block first atom: 1497 Blocpdb> 24 atoms in block 68 Block first atom: 1516 Blocpdb> 26 atoms in block 69 Block first atom: 1540 Blocpdb> 24 atoms in block 70 Block first atom: 1566 Blocpdb> 20 atoms in block 71 Block first atom: 1590 Blocpdb> 20 atoms in block 72 Block first atom: 1610 Blocpdb> 23 atoms in block 73 Block first atom: 1630 Blocpdb> 26 atoms in block 74 Block first atom: 1653 Blocpdb> 19 atoms in block 75 Block first atom: 1679 Blocpdb> 23 atoms in block 76 Block first atom: 1698 Blocpdb> 23 atoms in block 77 Block first atom: 1721 Blocpdb> 25 atoms in block 78 Block first atom: 1744 Blocpdb> 20 atoms in block 79 Block first atom: 1769 Blocpdb> 24 atoms in block 80 Block first atom: 1789 Blocpdb> 17 atoms in block 81 Block first atom: 1813 Blocpdb> 26 atoms in block 82 Block first atom: 1830 Blocpdb> 22 atoms in block 83 Block first atom: 1856 Blocpdb> 22 atoms in block 84 Block first atom: 1878 Blocpdb> 22 atoms in block 85 Block first atom: 1900 Blocpdb> 24 atoms in block 86 Block first atom: 1922 Blocpdb> 23 atoms in block 87 Block first atom: 1946 Blocpdb> 21 atoms in block 88 Block first atom: 1969 Blocpdb> 22 atoms in block 89 Block first atom: 1990 Blocpdb> 24 atoms in block 90 Block first atom: 2012 Blocpdb> 29 atoms in block 91 Block first atom: 2036 Blocpdb> 19 atoms in block 92 Block first atom: 2065 Blocpdb> 19 atoms in block 93 Block first atom: 2084 Blocpdb> 22 atoms in block 94 Block first atom: 2103 Blocpdb> 28 atoms in block 95 Block first atom: 2125 Blocpdb> 23 atoms in block 96 Block first atom: 2153 Blocpdb> 33 atoms in block 97 Block first atom: 2176 Blocpdb> 25 atoms in block 98 Block first atom: 2209 Blocpdb> 19 atoms in block 99 Block first atom: 2234 Blocpdb> 4 atoms in block 100 Block first atom: 2253 Blocpdb> 22 atoms in block 101 Block first atom: 2257 Blocpdb> 25 atoms in block 102 Block first atom: 2279 Blocpdb> 22 atoms in block 103 Block first atom: 2304 Blocpdb> 25 atoms in block 104 Block first atom: 2326 Blocpdb> 23 atoms in block 105 Block first atom: 2351 Blocpdb> 29 atoms in block 106 Block first atom: 2374 Blocpdb> 25 atoms in block 107 Block first atom: 2403 Blocpdb> 25 atoms in block 108 Block first atom: 2428 Blocpdb> 25 atoms in block 109 Block first atom: 2453 Blocpdb> 27 atoms in block 110 Block first atom: 2478 Blocpdb> 27 atoms in block 111 Block first atom: 2505 Blocpdb> 20 atoms in block 112 Block first atom: 2532 Blocpdb> 19 atoms in block 113 Block first atom: 2552 Blocpdb> 23 atoms in block 114 Block first atom: 2571 Blocpdb> 31 atoms in block 115 Block first atom: 2594 Blocpdb> 19 atoms in block 116 Block first atom: 2625 Blocpdb> 17 atoms in block 117 Block first atom: 2644 Blocpdb> 21 atoms in block 118 Block first atom: 2661 Blocpdb> 20 atoms in block 119 Block first atom: 2682 Blocpdb> 28 atoms in block 120 Block first atom: 2702 Blocpdb> 13 atoms in block 121 Block first atom: 2730 Blocpdb> 23 atoms in block 122 Block first atom: 2743 Blocpdb> 19 atoms in block 123 Block first atom: 2766 Blocpdb> 24 atoms in block 124 Block first atom: 2785 Blocpdb> 18 atoms in block 125 Block first atom: 2809 Blocpdb> 24 atoms in block 126 Block first atom: 2827 Blocpdb> 29 atoms in block 127 Block first atom: 2851 Blocpdb> 16 atoms in block 128 Block first atom: 2880 Blocpdb> 28 atoms in block 129 Block first atom: 2896 Blocpdb> 19 atoms in block 130 Block first atom: 2924 Blocpdb> 25 atoms in block 131 Block first atom: 2943 Blocpdb> 22 atoms in block 132 Block first atom: 2968 Blocpdb> 31 atoms in block 133 Block first atom: 2990 Blocpdb> 24 atoms in block 134 Block first atom: 3021 Blocpdb> 21 atoms in block 135 Block first atom: 3045 Blocpdb> 29 atoms in block 136 Block first atom: 3066 Blocpdb> 18 atoms in block 137 Block first atom: 3095 Blocpdb> 21 atoms in block 138 Block first atom: 3113 Blocpdb> 19 atoms in block 139 Block first atom: 3134 Blocpdb> 26 atoms in block 140 Block first atom: 3153 Blocpdb> 22 atoms in block 141 Block first atom: 3179 Blocpdb> 20 atoms in block 142 Block first atom: 3201 Blocpdb> 20 atoms in block 143 Block first atom: 3221 Blocpdb> 18 atoms in block 144 Block first atom: 3241 Blocpdb> 17 atoms in block 145 Block first atom: 3259 Blocpdb> 24 atoms in block 146 Block first atom: 3276 Blocpdb> 27 atoms in block 147 Block first atom: 3300 Blocpdb> 19 atoms in block 148 Block first atom: 3327 Blocpdb> 21 atoms in block 149 Block first atom: 3346 Blocpdb> 13 atoms in block 150 Block first atom: 3367 Blocpdb> 19 atoms in block 151 Block first atom: 3380 Blocpdb> 23 atoms in block 152 Block first atom: 3399 Blocpdb> 20 atoms in block 153 Block first atom: 3422 Blocpdb> 20 atoms in block 154 Block first atom: 3442 Blocpdb> 20 atoms in block 155 Block first atom: 3462 Blocpdb> 29 atoms in block 156 Block first atom: 3482 Blocpdb> 24 atoms in block 157 Block first atom: 3511 Blocpdb> 20 atoms in block 158 Block first atom: 3535 Blocpdb> 22 atoms in block 159 Block first atom: 3555 Blocpdb> 20 atoms in block 160 Block first atom: 3577 Blocpdb> 33 atoms in block 161 Block first atom: 3597 Blocpdb> 21 atoms in block 162 Block first atom: 3630 Blocpdb> 27 atoms in block 163 Block first atom: 3651 Blocpdb> 25 atoms in block 164 Block first atom: 3678 Blocpdb> 22 atoms in block 165 Block first atom: 3703 Blocpdb> 28 atoms in block 166 Block first atom: 3725 Blocpdb> 19 atoms in block 167 Block first atom: 3753 Blocpdb> 24 atoms in block 168 Block first atom: 3772 Blocpdb> 26 atoms in block 169 Block first atom: 3796 Blocpdb> 24 atoms in block 170 Block first atom: 3822 Blocpdb> 20 atoms in block 171 Block first atom: 3846 Blocpdb> 20 atoms in block 172 Block first atom: 3866 Blocpdb> 23 atoms in block 173 Block first atom: 3886 Blocpdb> 26 atoms in block 174 Block first atom: 3909 Blocpdb> 19 atoms in block 175 Block first atom: 3935 Blocpdb> 23 atoms in block 176 Block first atom: 3954 Blocpdb> 23 atoms in block 177 Block first atom: 3977 Blocpdb> 25 atoms in block 178 Block first atom: 4000 Blocpdb> 20 atoms in block 179 Block first atom: 4025 Blocpdb> 24 atoms in block 180 Block first atom: 4045 Blocpdb> 17 atoms in block 181 Block first atom: 4069 Blocpdb> 26 atoms in block 182 Block first atom: 4086 Blocpdb> 22 atoms in block 183 Block first atom: 4112 Blocpdb> 22 atoms in block 184 Block first atom: 4134 Blocpdb> 22 atoms in block 185 Block first atom: 4156 Blocpdb> 24 atoms in block 186 Block first atom: 4178 Blocpdb> 23 atoms in block 187 Block first atom: 4202 Blocpdb> 21 atoms in block 188 Block first atom: 4225 Blocpdb> 22 atoms in block 189 Block first atom: 4246 Blocpdb> 24 atoms in block 190 Block first atom: 4268 Blocpdb> 29 atoms in block 191 Block first atom: 4292 Blocpdb> 19 atoms in block 192 Block first atom: 4321 Blocpdb> 19 atoms in block 193 Block first atom: 4340 Blocpdb> 22 atoms in block 194 Block first atom: 4359 Blocpdb> 28 atoms in block 195 Block first atom: 4381 Blocpdb> 23 atoms in block 196 Block first atom: 4409 Blocpdb> 33 atoms in block 197 Block first atom: 4432 Blocpdb> 25 atoms in block 198 Block first atom: 4465 Blocpdb> 19 atoms in block 199 Block first atom: 4490 Blocpdb> 4 atoms in block 200 Block first atom: 4508 Blocpdb> 200 blocks. Blocpdb> At most, 33 atoms in each of them. Blocpdb> At least, 4 atoms in each of them. Blocpdb> Normal end of Blocpdb. Diagrtb> Memory allocation for Prepmat. Diagrtb> Memory allocation for RTB. Diagrtb> Memory allocation for Diagstd. Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes. Prepmat> Entering in. Prepmat> Rewriting of the matrix begins. Prepmat> 1749515 matrix lines read. Prepmat> Matrix order = 13536 Prepmat> Matrix trace = 3827940.0000 Prepmat> Last element read: 13536 13536 44.9394 Prepmat> 20101 lines saved. Prepmat> 18001 empty lines. Prepmat> Number of lines on output is as expected. Prepmat> Normal end of Prepmat. RTB> Entering in. RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 4512 RTB> Total mass = 4512.0000 RTB> Number of atoms found in matrix: 4512 RTB> Number of blocks = 200 RTB> Projection begins. RTB> Projected matrix is being saved. RTB> Projected matrix trace = 269918.9792 RTB> 72564 non-zero elements. RTB> Normal end of RTB. Diagstd> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.sdijb Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb Diagstd> CERFACS matrix format. Diagstd> Projected matrix order = 1200 Diagstd> Nb of non-zero elements: 72564 Diagstd> Projected matrix trace = 269918.9792 Openam> file on opening on unit 11: diagrtb_work.eigenfacs Diagstd> Diagonalization. Diagstd> 1200 eigenvectors are computed. Diagstd> 106 of them to be saved. Diagstd> Sum of eigenvalues = 269918.9792 Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000 Diagstd> Selected eigenvalues: 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.4962951 0.6147449 1.0534688 3.2152120 3.3191365 4.4327278 7.0783449 7.1819201 8.0177939 8.2248000 9.6401391 10.3130539 11.6377942 11.6742247 11.9113167 12.3134041 13.2616191 13.7176190 13.8830124 14.2454139 14.6721795 15.1427935 16.0590400 16.1340955 16.7246451 16.8238081 17.7914822 18.1155123 18.8345101 19.0433613 19.7764578 19.8042881 21.0545757 21.3692968 22.0413235 22.3028157 24.0568747 24.1456033 24.3089785 24.5944297 25.5660725 25.8141003 26.8136699 27.3176564 27.4931340 27.7148860 28.4565580 28.6595019 28.9551395 29.6985071 30.3414598 30.7193690 31.5770055 31.8386829 32.5402350 33.3407342 33.4766821 33.6659784 33.8120688 35.0982770 35.2476005 35.4240603 35.5392110 35.9162876 36.9223423 37.3523350 37.4892755 38.3140698 38.5646796 38.6395132 38.7921472 39.2107191 39.7450914 39.9770985 40.3077001 41.3037333 41.4676092 41.8403315 41.9533947 42.1738666 42.9397409 43.1566184 43.4117537 43.7058199 43.9402335 44.2606897 44.3049384 45.1753316 46.0490101 47.0046202 47.1126025 47.7535103 47.8150881 49.2217749 50.4902145 50.6651835 51.2762897 51.7508530 51.8866924 52.5439787 Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units): 0.0034312 0.0034328 0.0034337 0.0034340 0.0034347 0.0034348 76.5006745 85.1417827 111.4566852 194.7153028 197.8371450 228.6287347 288.9090471 291.0151283 307.4841438 311.4282124 337.1606865 348.7296898 370.4508687 371.0302374 374.7789293 381.0520893 395.4517994 402.1931310 404.6104878 409.8574339 415.9514050 422.5696289 435.1661142 436.1818516 444.0928041 445.4074056 458.0378273 462.1900483 471.2728760 473.8785854 482.9137079 483.2533770 498.2743452 501.9846016 509.8167669 512.8320140 532.6168271 533.5981443 535.4003310 538.5346590 549.0694598 551.7264147 562.3068959 567.5668212 569.3868126 571.6784595 579.2772390 581.3391871 584.3299022 591.7831420 598.1546951 601.8682386 610.2120112 612.7351960 619.4490945 627.0221173 628.2991679 630.0730445 631.4386366 643.3364804 644.7035457 646.3153183 647.3649337 650.7901943 659.8419192 663.6730126 664.8884731 672.1627230 674.3574252 675.0113939 676.3432964 679.9824181 684.6002139 686.5954414 689.4285904 697.8947546 699.2778606 702.4134816 703.3618914 705.2076098 711.5820592 713.3768040 715.4823841 717.9015914 719.8242283 722.4442996 722.8053342 729.8707424 736.8946943 744.5014610 745.3561307 750.4088220 750.8924893 761.8577946 771.6118489 772.9476665 777.5952098 781.1852536 782.2098374 787.1486553 Diagstd> Normal end. Rtb_to_modes> Entering in. Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 4512 Rtb_to_modes> Number of blocs = 200 Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.eigenfacs Openam> file on opening on unit 11: matrix.eigenrtb Rdmodfacs> Entering in. Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Eigenvector number: 1 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9841E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 2 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9932E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 3 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9983E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 4 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0000E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 5 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0004E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 6 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0005E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 7 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.4963 Rdmodfacs> Eigenvector number: 8 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.6147 Rdmodfacs> Eigenvector number: 9 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.053 Rdmodfacs> Eigenvector number: 10 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.215 Rdmodfacs> Eigenvector number: 11 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.319 Rdmodfacs> Eigenvector number: 12 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.433 Rdmodfacs> Eigenvector number: 13 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.078 Rdmodfacs> Eigenvector number: 14 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.182 Rdmodfacs> Eigenvector number: 15 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.018 Rdmodfacs> Eigenvector number: 16 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.225 Rdmodfacs> Eigenvector number: 17 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.640 Rdmodfacs> Eigenvector number: 18 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.31 Rdmodfacs> Eigenvector number: 19 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.64 Rdmodfacs> Eigenvector number: 20 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.67 Rdmodfacs> Eigenvector number: 21 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.91 Rdmodfacs> Eigenvector number: 22 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.31 Rdmodfacs> Eigenvector number: 23 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.26 Rdmodfacs> Eigenvector number: 24 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.72 Rdmodfacs> Eigenvector number: 25 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.88 Rdmodfacs> Eigenvector number: 26 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.25 Rdmodfacs> Eigenvector number: 27 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.67 Rdmodfacs> Eigenvector number: 28 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.14 Rdmodfacs> Eigenvector number: 29 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.06 Rdmodfacs> Eigenvector number: 30 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.13 Rdmodfacs> Eigenvector number: 31 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.72 Rdmodfacs> Eigenvector number: 32 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.82 Rdmodfacs> Eigenvector number: 33 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.79 Rdmodfacs> Eigenvector number: 34 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.12 Rdmodfacs> Eigenvector number: 35 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.83 Rdmodfacs> Eigenvector number: 36 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.04 Rdmodfacs> Eigenvector number: 37 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.78 Rdmodfacs> Eigenvector number: 38 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.80 Rdmodfacs> Eigenvector number: 39 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.05 Rdmodfacs> Eigenvector number: 40 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.37 Rdmodfacs> Eigenvector number: 41 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.04 Rdmodfacs> Eigenvector number: 42 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.30 Rdmodfacs> Eigenvector number: 43 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.06 Rdmodfacs> Eigenvector number: 44 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.15 Rdmodfacs> Eigenvector number: 45 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.31 Rdmodfacs> Eigenvector number: 46 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.59 Rdmodfacs> Eigenvector number: 47 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.57 Rdmodfacs> Eigenvector number: 48 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.81 Rdmodfacs> Eigenvector number: 49 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.81 Rdmodfacs> Eigenvector number: 50 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.32 Rdmodfacs> Eigenvector number: 51 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.49 Rdmodfacs> Eigenvector number: 52 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.71 Rdmodfacs> Eigenvector number: 53 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.46 Rdmodfacs> Eigenvector number: 54 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.66 Rdmodfacs> Eigenvector number: 55 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.96 Rdmodfacs> Eigenvector number: 56 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.70 Rdmodfacs> Eigenvector number: 57 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.34 Rdmodfacs> Eigenvector number: 58 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.72 Rdmodfacs> Eigenvector number: 59 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.58 Rdmodfacs> Eigenvector number: 60 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.84 Rdmodfacs> Eigenvector number: 61 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.54 Rdmodfacs> Eigenvector number: 62 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.34 Rdmodfacs> Eigenvector number: 63 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.48 Rdmodfacs> Eigenvector number: 64 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.67 Rdmodfacs> Eigenvector number: 65 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.81 Rdmodfacs> Eigenvector number: 66 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 67 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.25 Rdmodfacs> Eigenvector number: 68 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.42 Rdmodfacs> Eigenvector number: 69 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.54 Rdmodfacs> Eigenvector number: 70 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.92 Rdmodfacs> Eigenvector number: 71 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.92 Rdmodfacs> Eigenvector number: 72 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.35 Rdmodfacs> Eigenvector number: 73 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.49 Rdmodfacs> Eigenvector number: 74 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.31 Rdmodfacs> Eigenvector number: 75 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.56 Rdmodfacs> Eigenvector number: 76 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.64 Rdmodfacs> Eigenvector number: 77 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.79 Rdmodfacs> Eigenvector number: 78 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.21 Rdmodfacs> Eigenvector number: 79 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.75 Rdmodfacs> Eigenvector number: 80 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.98 Rdmodfacs> Eigenvector number: 81 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.31 Rdmodfacs> Eigenvector number: 82 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.30 Rdmodfacs> Eigenvector number: 83 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.47 Rdmodfacs> Eigenvector number: 84 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.84 Rdmodfacs> Eigenvector number: 85 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.95 Rdmodfacs> Eigenvector number: 86 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.17 Rdmodfacs> Eigenvector number: 87 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.94 Rdmodfacs> Eigenvector number: 88 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.16 Rdmodfacs> Eigenvector number: 89 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.41 Rdmodfacs> Eigenvector number: 90 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.71 Rdmodfacs> Eigenvector number: 91 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.94 Rdmodfacs> Eigenvector number: 92 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.26 Rdmodfacs> Eigenvector number: 93 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.30 Rdmodfacs> Eigenvector number: 94 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.18 Rdmodfacs> Eigenvector number: 95 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.05 Rdmodfacs> Eigenvector number: 96 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 47.00 Rdmodfacs> Eigenvector number: 97 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 47.11 Rdmodfacs> Eigenvector number: 98 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 47.75 Rdmodfacs> Eigenvector number: 99 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 47.82 Rdmodfacs> Eigenvector number: 100 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 49.22 Rdmodfacs> Eigenvector number: 101 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 50.49 Rdmodfacs> Eigenvector number: 102 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 50.67 Rdmodfacs> Eigenvector number: 103 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 51.28 Rdmodfacs> Eigenvector number: 104 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 51.75 Rdmodfacs> Eigenvector number: 105 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 51.89 Rdmodfacs> Eigenvector number: 106 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 52.54 Rtb_to_modes> 106 vectors, with 1200 coordinates in vector file. Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected): 0.99998 1.00000 1.00000 1.00000 1.00002 1.00000 1.00001 1.00000 1.00001 1.00000 1.00000 0.99999 1.00004 1.00001 1.00001 1.00002 0.99999 1.00003 0.99998 1.00000 0.99999 1.00000 1.00002 1.00002 0.99995 1.00001 1.00000 0.99998 1.00000 1.00001 0.99999 1.00002 0.99999 1.00001 1.00001 1.00002 0.99999 1.00001 0.99999 1.00000 0.99999 1.00002 0.99996 1.00001 1.00000 0.99999 0.99999 0.99999 1.00001 1.00000 1.00002 0.99999 0.99999 1.00002 1.00000 1.00001 1.00000 1.00000 1.00000 0.99999 1.00001 1.00001 0.99998 0.99999 0.99998 1.00000 0.99998 0.99997 0.99999 0.99997 0.99999 0.99999 0.99998 1.00000 1.00002 1.00000 0.99998 1.00000 0.99999 0.99998 1.00000 1.00001 0.99998 1.00003 1.00001 1.00001 1.00000 1.00003 0.99999 1.00001 1.00000 1.00000 1.00002 1.00002 0.99999 1.00003 1.00001 0.99999 0.99998 1.00001 0.99999 1.00000 1.00000 0.99999 1.00000 1.00001 Rtb_to_modes> RTB block-file is being read. Rtb_to_modes> 81216 lines found in RTB file. Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected): 0.99998 1.00000 1.00000 1.00000 1.00002 1.00000 1.00001 1.00000 1.00001 1.00000 1.00000 0.99999 1.00004 1.00001 1.00001 1.00002 0.99999 1.00003 0.99998 1.00000 0.99999 1.00000 1.00002 1.00002 0.99995 1.00001 1.00000 0.99998 1.00000 1.00001 0.99999 1.00002 0.99999 1.00001 1.00001 1.00002 0.99999 1.00001 0.99999 1.00000 0.99999 1.00002 0.99996 1.00001 1.00000 0.99999 0.99999 0.99999 1.00001 1.00000 1.00002 0.99999 0.99999 1.00002 1.00000 1.00001 1.00000 1.00000 1.00000 0.99999 1.00001 1.00001 0.99998 0.99999 0.99998 1.00000 0.99998 0.99997 0.99999 0.99997 0.99999 0.99999 0.99998 1.00000 1.00002 1.00000 0.99998 1.00000 0.99999 0.99998 1.00000 1.00001 0.99998 1.00003 1.00001 1.00001 1.00000 1.00003 0.99999 1.00001 1.00000 1.00000 1.00002 1.00002 0.99999 1.00003 1.00001 0.99999 0.99998 1.00001 0.99999 1.00000 1.00000 0.99999 1.00000 1.00001 Orthogonality of first eigenvectors (zero expected): Vector 2:-0.000 Vector 3: 0.000-0.000 Vector 4: 0.000-0.000 0.000 Vector 5:-0.000 0.000-0.000 0.000 Vector 6: 0.000-0.000-0.000 0.000-0.000 Vector 7:-0.000-0.000 0.000-0.000 0.000 0.000 Vector 8: 0.000 0.000 0.000 0.000-0.000-0.000-0.000 Vector 9: 0.000 0.000 0.000 0.000-0.000-0.000 0.000-0.000 Vector 10: 0.000 0.000-0.000 0.000 0.000-0.000 0.000 0.000 0.000 Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved. Rtb_to_modes> Normal end. Diagrtb> Normal end. B-factor analysis Bfactors> Version 1.22, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 260211175717977004.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 260211175717977004.eigenfacs Getnam> Corresponding pdb filename ? Getnam> 260211175717977004.atom Openam> file on opening on unit 11: 260211175717977004.atom Getnum> Number of skipped eigenvectors ? Getnum> 0 Getnum> Number of usefull eigenvectors ? Getnum> 10000 %Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 596 First residue number = 18 Last residue number = 315 Number of atoms found = 4512 Mean number per residue = 7.6 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9841E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9932E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9983E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0000E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0004E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0005E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.4963 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.6147 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.053 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.215 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.319 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.433 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.078 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.182 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.018 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.225 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.640 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.31 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.64 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.67 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.91 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.31 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.26 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.72 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.88 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.25 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.67 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.14 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.06 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.13 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.72 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.82 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.79 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.12 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.83 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.04 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.78 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.80 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.05 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.37 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.04 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.30 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.06 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.15 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.31 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.59 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.57 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.81 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.81 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.32 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.49 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.71 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.46 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.66 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.96 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.70 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.34 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.72 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.58 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.84 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.54 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.34 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.48 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.67 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.81 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.25 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.42 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.54 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.92 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.92 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.35 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.49 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.31 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.56 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.64 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.79 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.21 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.75 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.98 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.31 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.30 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.47 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.84 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.95 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.17 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.94 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.16 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.41 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.71 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.94 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.26 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.30 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.18 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.05 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.00 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.11 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.75 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.82 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.22 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 50.49 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 50.67 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 51.28 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 51.75 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 51.89 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 52.54 Bfactors> 106 vectors, 13536 coordinates in file. Openam> file on opening on unit 12: bfactors.pred Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000 Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 0.496300 Bfactors> 100 eigenvectors will be considered. Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped. Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed. (CHARMM units assumed for eigenvalues) Bfactors> Correlation= -0.572 for 596 C-alpha atoms. Bfactors> = 0.032 +/- 0.03 Bfactors> = 90.362 +/- 6.16 Bfactors> Shiftng-fct= 90.330 Bfactors> Scaling-fct= 232.890 Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved. Bfactors> Normal end. check_modes Chkmod> Version 1.00, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 260211175717977004.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 260211175717977004.eigenfacs Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4311E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4326E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4335E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4338E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4345E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4347E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 76.50 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 85.14 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 111.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 194.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 197.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 228.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 288.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 291.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 307.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 311.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 337.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 348.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 370.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 370.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 374.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 381.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 395.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 402.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 404.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 409.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 415.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 422.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 435.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 436.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 444.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 445.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 458.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 462.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 471.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 473.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 482.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 483.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Frequence du 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Chkmod> That is: 4512 cartesian points. Openam> file on opening on unit 11: Chkmod.res Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file. Chkmod> Normal end. 0.0034 0.7892 0.0034 0.7608 0.0034 0.9910 0.0034 0.7886 0.0034 0.6677 0.0034 0.8849 76.4978 0.7525 85.1350 0.7390 111.4271 0.7767 194.7005 0.8279 197.8246 0.7502 228.6259 0.7788 288.8896 0.4383 291.0043 0.3689 307.4749 0.2672 311.4186 0.4354 337.1438 0.2544 348.6631 0.2442 370.4701 0.2941 370.9472 0.2531 374.7421 0.4673 380.9831 0.3843 395.4107 0.2208 402.2108 0.1510 404.5492 0.2239 409.9058 0.3171 415.9027 0.1017 422.5125 0.0557 435.1604 0.2540 436.1078 0.2391 444.0121 0.2474 445.3379 0.3481 457.9991 0.2106 462.2275 0.2142 471.1962 0.2572 473.8164 0.2622 482.9362 0.4438 483.1803 0.5253 498.1988 0.5355 501.9713 0.4946 509.7796 0.4907 512.7776 0.6799 532.6286 0.5091 533.6238 0.4649 535.3886 0.5438 538.4630 0.4902 549.0881 0.3911 551.6589 0.4823 562.2443 0.2813 567.5668 0.2574 569.3299 0.1816 571.6035 0.2572 579.2874 0.2916 581.3193 0.1599 584.3539 0.3787 591.7726 0.4045 598.1146 0.2803 601.8486 0.4452 610.2147 0.4674 612.7216 0.4444 619.4203 0.3547 626.9883 0.3376 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MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 260211175717977004.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 260211175717977004.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 8 running: ../../bin/get_modes.sh 260211175717977004 8 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 8 calculating perturbed structure for DQ=-100 260211175717977004.eigenfacs 260211175717977004.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 260211175717977004.eigenfacs 260211175717977004.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 260211175717977004.eigenfacs 260211175717977004.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 260211175717977004.eigenfacs 260211175717977004.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 260211175717977004.eigenfacs 260211175717977004.atom calculating perturbed structure for DQ=0 260211175717977004.eigenfacs 260211175717977004.atom calculating perturbed structure for DQ=20 260211175717977004.eigenfacs 260211175717977004.atom calculating perturbed structure for DQ=40 260211175717977004.eigenfacs 260211175717977004.atom calculating perturbed structure for DQ=60 260211175717977004.eigenfacs 260211175717977004.atom calculating perturbed structure for DQ=80 260211175717977004.eigenfacs 260211175717977004.atom calculating perturbed structure for DQ=100 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../../bin/get_modes.sh 260211175717977004 9 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 9 calculating perturbed structure for DQ=-100 260211175717977004.eigenfacs 260211175717977004.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 260211175717977004.eigenfacs 260211175717977004.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 260211175717977004.eigenfacs 260211175717977004.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 260211175717977004.eigenfacs 260211175717977004.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 260211175717977004.eigenfacs 260211175717977004.atom calculating perturbed structure for DQ=0 260211175717977004.eigenfacs 260211175717977004.atom calculating perturbed structure for DQ=20 260211175717977004.eigenfacs 260211175717977004.atom calculating perturbed structure for DQ=40 260211175717977004.eigenfacs 260211175717977004.atom calculating perturbed structure for DQ=60 260211175717977004.eigenfacs 260211175717977004.atom 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