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elNémo has been hacked on november 27th.
It has been moved away and runs again.
**Still some additional cleaning from time to time**
Sorry for the inconvenience.


***  Y_modelo_21_KELEY  ***

LOGs for ID: 260211175729977404

Output from eigenvector calculation:


STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8) Build Tirion matrix: Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model. Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004. Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file. Pdbmat> Coordinate filename = 260211175729977404.atom Pdbmat> Distance cutoff = 8.00 Force constant = 10.00 Origin of mass values = CONS Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09 PRINTing level = 2 Pdbmat> Coordinate file 260211175729977404.atom to be opened. Openam> File opened: 260211175729977404.atom Pdbmat> Coordinate file in PDB format. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 596 First residue number = 18 Last residue number = 315 Number of atoms found = 4512 Mean number per residue = 7.6 Pdbmat> Coordinate statistics: = -1.576445 +/- 14.488979 From: -39.230000 To: 30.245000 = 0.199017 +/- 16.442820 From: -39.270000 To: 37.881000 = 0.179451 +/- 15.207454 From: -36.931000 To: 32.537000 Pdbmat> Masses are all set to one. Openam> File opened: pdbmat.xyzm Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved. Openam> File opened: pdbmat.sdijb Pdbmat> Matrix statistics: Pdbmat> The matrix is 1.9049 % Filled. Pdbmat> 1745238 non-zero elements. Pdbmat> 190934 atom-atom interactions. Pdbmat> Number per atom= 84.63 +/- 22.79 Maximum number = 130 Minimum number = 16 Pdbmat> Matrix trace = 3.818680E+06 Pdbmat> Larger element = 487.150 Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10 Pdbmat> Normal end. automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1) 596 non-zero elements, NRBL set to 3 Diagonalize Tirion matrix using diagrtb Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation. Diagrtb> Version 2.52, November 2004. Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file. Diagrtb> Options taken into account: MATRix filename = pdbmat.sdijb COORdinates filename = 260211175729977404.atom Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb Nb of VECTors required = 106 EigeNVALues chosen = LOWE Type of SUBStructuring = NONE Nb of residues per BLOck = 3 Origin of MASS values = CONS MATRix FORMat = BINA Temporary files cleaning = ALL Output PRINting level = 2 Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb. Blocpdb> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.xyzm Blocpdb> Coordinate file 260211175729977404.atom to be opened. Openam> file on opening on unit 11: 260211175729977404.atom Blocpdb> Coordinate file in PDB format. Blocpdb> 4512 atoms picked in pdb file. Blocpdb> All masses set to unity. Blocpdb> Coordinate file is rewritten. Blocpdb> Substructuring: Blocpdb> 3 residue(s) per block. Blocpdb> 596 residues. Blocpdb> 22 atoms in block 1 Block first atom: 1 Blocpdb> 25 atoms in block 2 Block first atom: 23 Blocpdb> 22 atoms in block 3 Block first atom: 48 Blocpdb> 25 atoms in block 4 Block first atom: 70 Blocpdb> 23 atoms in block 5 Block first atom: 95 Blocpdb> 29 atoms in block 6 Block first atom: 118 Blocpdb> 25 atoms in block 7 Block first atom: 147 Blocpdb> 25 atoms in block 8 Block first atom: 172 Blocpdb> 25 atoms in block 9 Block first atom: 197 Blocpdb> 27 atoms in block 10 Block first atom: 222 Blocpdb> 27 atoms in block 11 Block first atom: 249 Blocpdb> 20 atoms in block 12 Block first atom: 276 Blocpdb> 19 atoms in block 13 Block first atom: 296 Blocpdb> 23 atoms in block 14 Block first atom: 315 Blocpdb> 31 atoms in block 15 Block first atom: 338 Blocpdb> 19 atoms in block 16 Block first atom: 369 Blocpdb> 17 atoms in block 17 Block first atom: 388 Blocpdb> 21 atoms in block 18 Block first atom: 405 Blocpdb> 20 atoms in block 19 Block first atom: 426 Blocpdb> 28 atoms in block 20 Block first atom: 446 Blocpdb> 13 atoms in block 21 Block first atom: 474 Blocpdb> 23 atoms in block 22 Block first atom: 487 Blocpdb> 19 atoms in block 23 Block first atom: 510 Blocpdb> 24 atoms in block 24 Block first atom: 529 Blocpdb> 18 atoms in block 25 Block first atom: 553 Blocpdb> 24 atoms in block 26 Block first atom: 571 Blocpdb> 29 atoms in block 27 Block first atom: 595 Blocpdb> 16 atoms in block 28 Block first atom: 624 Blocpdb> 28 atoms in block 29 Block first atom: 640 Blocpdb> 19 atoms in block 30 Block first atom: 668 Blocpdb> 25 atoms in block 31 Block first atom: 687 Blocpdb> 22 atoms in block 32 Block first atom: 712 Blocpdb> 31 atoms in block 33 Block first atom: 734 Blocpdb> 24 atoms in block 34 Block first atom: 765 Blocpdb> 21 atoms in block 35 Block first atom: 789 Blocpdb> 29 atoms in block 36 Block first atom: 810 Blocpdb> 18 atoms in block 37 Block first atom: 839 Blocpdb> 21 atoms in block 38 Block first atom: 857 Blocpdb> 19 atoms in block 39 Block first atom: 878 Blocpdb> 26 atoms in block 40 Block first atom: 897 Blocpdb> 22 atoms in block 41 Block first atom: 923 Blocpdb> 20 atoms in block 42 Block first atom: 945 Blocpdb> 20 atoms in block 43 Block first atom: 965 Blocpdb> 18 atoms in block 44 Block first atom: 985 Blocpdb> 17 atoms in block 45 Block first atom: 1003 Blocpdb> 24 atoms in block 46 Block first atom: 1020 Blocpdb> 27 atoms in block 47 Block first atom: 1044 Blocpdb> 19 atoms in block 48 Block first atom: 1071 Blocpdb> 21 atoms in block 49 Block first atom: 1090 Blocpdb> 13 atoms in block 50 Block first atom: 1111 Blocpdb> 19 atoms in block 51 Block first atom: 1124 Blocpdb> 23 atoms in block 52 Block first atom: 1143 Blocpdb> 20 atoms in block 53 Block first atom: 1166 Blocpdb> 20 atoms in block 54 Block first atom: 1186 Blocpdb> 20 atoms in block 55 Block first atom: 1206 Blocpdb> 29 atoms in block 56 Block first atom: 1226 Blocpdb> 24 atoms in block 57 Block first atom: 1255 Blocpdb> 20 atoms in block 58 Block first atom: 1279 Blocpdb> 22 atoms in block 59 Block first atom: 1299 Blocpdb> 20 atoms in block 60 Block first atom: 1321 Blocpdb> 33 atoms in block 61 Block first atom: 1341 Blocpdb> 21 atoms in block 62 Block first atom: 1374 Blocpdb> 27 atoms in block 63 Block first atom: 1395 Blocpdb> 25 atoms in block 64 Block first atom: 1422 Blocpdb> 22 atoms in block 65 Block first atom: 1447 Blocpdb> 28 atoms in block 66 Block first atom: 1469 Blocpdb> 19 atoms in block 67 Block first atom: 1497 Blocpdb> 24 atoms in block 68 Block first atom: 1516 Blocpdb> 26 atoms in block 69 Block first atom: 1540 Blocpdb> 24 atoms in block 70 Block first atom: 1566 Blocpdb> 20 atoms in block 71 Block first atom: 1590 Blocpdb> 20 atoms in block 72 Block first atom: 1610 Blocpdb> 23 atoms in block 73 Block first atom: 1630 Blocpdb> 26 atoms in block 74 Block first atom: 1653 Blocpdb> 19 atoms in block 75 Block first atom: 1679 Blocpdb> 23 atoms in block 76 Block first atom: 1698 Blocpdb> 23 atoms in block 77 Block first atom: 1721 Blocpdb> 25 atoms in block 78 Block first atom: 1744 Blocpdb> 20 atoms in block 79 Block first atom: 1769 Blocpdb> 24 atoms in block 80 Block first atom: 1789 Blocpdb> 17 atoms in block 81 Block first atom: 1813 Blocpdb> 26 atoms in block 82 Block first atom: 1830 Blocpdb> 22 atoms in block 83 Block first atom: 1856 Blocpdb> 22 atoms in block 84 Block first atom: 1878 Blocpdb> 22 atoms in block 85 Block first atom: 1900 Blocpdb> 24 atoms in block 86 Block first atom: 1922 Blocpdb> 23 atoms in block 87 Block first atom: 1946 Blocpdb> 21 atoms in block 88 Block first atom: 1969 Blocpdb> 22 atoms in block 89 Block first atom: 1990 Blocpdb> 24 atoms in block 90 Block first atom: 2012 Blocpdb> 29 atoms in block 91 Block first atom: 2036 Blocpdb> 19 atoms in block 92 Block first atom: 2065 Blocpdb> 19 atoms in block 93 Block first atom: 2084 Blocpdb> 22 atoms in block 94 Block first atom: 2103 Blocpdb> 28 atoms in block 95 Block first atom: 2125 Blocpdb> 23 atoms in block 96 Block first atom: 2153 Blocpdb> 33 atoms in block 97 Block first atom: 2176 Blocpdb> 25 atoms in block 98 Block first atom: 2209 Blocpdb> 19 atoms in block 99 Block first atom: 2234 Blocpdb> 4 atoms in block 100 Block first atom: 2253 Blocpdb> 22 atoms in block 101 Block first atom: 2257 Blocpdb> 25 atoms in block 102 Block first atom: 2279 Blocpdb> 22 atoms in block 103 Block first atom: 2304 Blocpdb> 25 atoms in block 104 Block first atom: 2326 Blocpdb> 23 atoms in block 105 Block first atom: 2351 Blocpdb> 29 atoms in block 106 Block first atom: 2374 Blocpdb> 25 atoms in block 107 Block first atom: 2403 Blocpdb> 25 atoms in block 108 Block first atom: 2428 Blocpdb> 25 atoms in block 109 Block first atom: 2453 Blocpdb> 27 atoms in block 110 Block first atom: 2478 Blocpdb> 27 atoms in block 111 Block first atom: 2505 Blocpdb> 20 atoms in block 112 Block first atom: 2532 Blocpdb> 19 atoms in block 113 Block first atom: 2552 Blocpdb> 23 atoms in block 114 Block first atom: 2571 Blocpdb> 31 atoms in block 115 Block first atom: 2594 Blocpdb> 19 atoms in block 116 Block first atom: 2625 Blocpdb> 17 atoms in block 117 Block first atom: 2644 Blocpdb> 21 atoms in block 118 Block first atom: 2661 Blocpdb> 20 atoms in block 119 Block first atom: 2682 Blocpdb> 28 atoms in block 120 Block first atom: 2702 Blocpdb> 13 atoms in block 121 Block first atom: 2730 Blocpdb> 23 atoms in block 122 Block first atom: 2743 Blocpdb> 19 atoms in block 123 Block first atom: 2766 Blocpdb> 24 atoms in block 124 Block first atom: 2785 Blocpdb> 18 atoms in block 125 Block first atom: 2809 Blocpdb> 24 atoms in block 126 Block first atom: 2827 Blocpdb> 29 atoms in block 127 Block first atom: 2851 Blocpdb> 16 atoms in block 128 Block first atom: 2880 Blocpdb> 28 atoms in block 129 Block first atom: 2896 Blocpdb> 19 atoms in block 130 Block first atom: 2924 Blocpdb> 25 atoms in block 131 Block first atom: 2943 Blocpdb> 22 atoms in block 132 Block first atom: 2968 Blocpdb> 31 atoms in block 133 Block first atom: 2990 Blocpdb> 24 atoms in block 134 Block first atom: 3021 Blocpdb> 21 atoms in block 135 Block first atom: 3045 Blocpdb> 29 atoms in block 136 Block first atom: 3066 Blocpdb> 18 atoms in block 137 Block first atom: 3095 Blocpdb> 21 atoms in block 138 Block first atom: 3113 Blocpdb> 19 atoms in block 139 Block first atom: 3134 Blocpdb> 26 atoms in block 140 Block first atom: 3153 Blocpdb> 22 atoms in block 141 Block first atom: 3179 Blocpdb> 20 atoms in block 142 Block first atom: 3201 Blocpdb> 20 atoms in block 143 Block first atom: 3221 Blocpdb> 18 atoms in block 144 Block first atom: 3241 Blocpdb> 17 atoms in block 145 Block first atom: 3259 Blocpdb> 24 atoms in block 146 Block first atom: 3276 Blocpdb> 27 atoms in block 147 Block first atom: 3300 Blocpdb> 19 atoms in block 148 Block first atom: 3327 Blocpdb> 21 atoms in block 149 Block first atom: 3346 Blocpdb> 13 atoms in block 150 Block first atom: 3367 Blocpdb> 19 atoms in block 151 Block first atom: 3380 Blocpdb> 23 atoms in block 152 Block first atom: 3399 Blocpdb> 20 atoms in block 153 Block first atom: 3422 Blocpdb> 20 atoms in block 154 Block first atom: 3442 Blocpdb> 20 atoms in block 155 Block first atom: 3462 Blocpdb> 29 atoms in block 156 Block first atom: 3482 Blocpdb> 24 atoms in block 157 Block first atom: 3511 Blocpdb> 20 atoms in block 158 Block first atom: 3535 Blocpdb> 22 atoms in block 159 Block first atom: 3555 Blocpdb> 20 atoms in block 160 Block first atom: 3577 Blocpdb> 33 atoms in block 161 Block first atom: 3597 Blocpdb> 21 atoms in block 162 Block first atom: 3630 Blocpdb> 27 atoms in block 163 Block first atom: 3651 Blocpdb> 25 atoms in block 164 Block first atom: 3678 Blocpdb> 22 atoms in block 165 Block first atom: 3703 Blocpdb> 28 atoms in block 166 Block first atom: 3725 Blocpdb> 19 atoms in block 167 Block first atom: 3753 Blocpdb> 24 atoms in block 168 Block first atom: 3772 Blocpdb> 26 atoms in block 169 Block first atom: 3796 Blocpdb> 24 atoms in block 170 Block first atom: 3822 Blocpdb> 20 atoms in block 171 Block first atom: 3846 Blocpdb> 20 atoms in block 172 Block first atom: 3866 Blocpdb> 23 atoms in block 173 Block first atom: 3886 Blocpdb> 26 atoms in block 174 Block first atom: 3909 Blocpdb> 19 atoms in block 175 Block first atom: 3935 Blocpdb> 23 atoms in block 176 Block first atom: 3954 Blocpdb> 23 atoms in block 177 Block first atom: 3977 Blocpdb> 25 atoms in block 178 Block first atom: 4000 Blocpdb> 20 atoms in block 179 Block first atom: 4025 Blocpdb> 24 atoms in block 180 Block first atom: 4045 Blocpdb> 17 atoms in block 181 Block first atom: 4069 Blocpdb> 26 atoms in block 182 Block first atom: 4086 Blocpdb> 22 atoms in block 183 Block first atom: 4112 Blocpdb> 22 atoms in block 184 Block first atom: 4134 Blocpdb> 22 atoms in block 185 Block first atom: 4156 Blocpdb> 24 atoms in block 186 Block first atom: 4178 Blocpdb> 23 atoms in block 187 Block first atom: 4202 Blocpdb> 21 atoms in block 188 Block first atom: 4225 Blocpdb> 22 atoms in block 189 Block first atom: 4246 Blocpdb> 24 atoms in block 190 Block first atom: 4268 Blocpdb> 29 atoms in block 191 Block first atom: 4292 Blocpdb> 19 atoms in block 192 Block first atom: 4321 Blocpdb> 19 atoms in block 193 Block first atom: 4340 Blocpdb> 22 atoms in block 194 Block first atom: 4359 Blocpdb> 28 atoms in block 195 Block first atom: 4381 Blocpdb> 23 atoms in block 196 Block first atom: 4409 Blocpdb> 33 atoms in block 197 Block first atom: 4432 Blocpdb> 25 atoms in block 198 Block first atom: 4465 Blocpdb> 19 atoms in block 199 Block first atom: 4490 Blocpdb> 4 atoms in block 200 Block first atom: 4508 Blocpdb> 200 blocks. Blocpdb> At most, 33 atoms in each of them. Blocpdb> At least, 4 atoms in each of them. Blocpdb> Normal end of Blocpdb. Diagrtb> Memory allocation for Prepmat. Diagrtb> Memory allocation for RTB. Diagrtb> Memory allocation for Diagstd. Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes. Prepmat> Entering in. Prepmat> Rewriting of the matrix begins. Prepmat> 1745438 matrix lines read. Prepmat> Matrix order = 13536 Prepmat> Matrix trace = 3818680.0000 Prepmat> Last element read: 13536 13536 45.3876 Prepmat> 20101 lines saved. Prepmat> 18031 empty lines. Prepmat> Number of lines on output is as expected. Prepmat> Normal end of Prepmat. RTB> Entering in. RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 4512 RTB> Total mass = 4512.0000 RTB> Number of atoms found in matrix: 4512 RTB> Number of blocks = 200 RTB> Projection begins. RTB> Projected matrix is being saved. RTB> Projected matrix trace = 268977.2519 RTB> 71484 non-zero elements. RTB> Normal end of RTB. Diagstd> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.sdijb Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb Diagstd> CERFACS matrix format. Diagstd> Projected matrix order = 1200 Diagstd> Nb of non-zero elements: 71484 Diagstd> Projected matrix trace = 268977.2519 Openam> file on opening on unit 11: diagrtb_work.eigenfacs Diagstd> Diagonalization. Diagstd> 1200 eigenvectors are computed. Diagstd> 106 of them to be saved. Diagstd> Sum of eigenvalues = 268977.2519 Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000 Diagstd> Selected eigenvalues: 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.5752656 0.8342419 1.6233881 3.4494692 3.5660449 4.2641594 7.9031149 8.1659746 8.9523423 9.6795436 10.8772141 11.5711385 12.2689720 12.8003930 13.2674746 13.5979045 13.8292245 14.0042654 15.3874101 15.8460044 16.4306649 16.5737027 17.1345396 18.1667652 18.3280157 18.7286829 19.4003633 19.5517772 21.2317816 21.5135389 21.5654893 22.1568302 22.2549378 22.5436970 23.3667772 23.6861606 24.1137752 24.7533206 25.2650114 25.7423426 26.2323300 27.3978113 27.6958950 28.4379528 28.5807552 28.8790215 29.4759383 30.5594410 31.1375416 31.1538421 31.6909819 31.9965301 32.3273059 32.7354936 33.0973567 33.5661821 34.6253720 35.0017800 35.7003760 36.1132300 36.5872688 36.8782200 37.3172914 38.2770942 38.5657606 38.8805593 38.9400194 39.1285151 39.5355703 40.3748926 40.5481966 40.8319002 41.0865897 41.1343322 41.7658015 41.9500379 43.1707147 43.3090186 43.5096901 44.4313895 45.0897171 45.5844976 46.0659654 46.3668598 46.6269074 47.3960403 47.8850996 48.2861485 48.7706876 49.2564176 49.2885327 49.9831665 50.5171787 50.9763074 51.8298068 51.9978972 52.2323531 52.9372213 53.1748955 53.5495813 Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units): 0.0034320 0.0034326 0.0034330 0.0034332 0.0034335 0.0034346 82.3624909 99.1839198 138.3586941 201.6839849 205.0636497 224.2394370 305.2772408 310.3125153 324.9104062 337.8490649 358.1410640 369.3884620 380.3639660 388.5142313 395.5390923 400.4343026 403.8259220 406.3735632 425.9690494 432.2700700 440.1724430 442.0842597 449.5018675 462.8434073 464.8929967 469.9470187 478.2998131 480.1626779 500.3668149 503.6759427 504.2837093 511.1508587 512.2812639 515.5939941 524.9218959 528.4971077 533.2463412 540.2714443 545.8270183 550.9590398 556.1778817 568.3988829 571.4825614 579.0878395 580.5399753 583.5613462 589.5614791 600.2995025 605.9509079 606.1094948 611.3122908 614.2522022 617.4190661 621.3048263 624.7293875 629.1384871 638.9877081 642.4514973 648.8311257 652.5720177 656.8410338 659.4475446 663.3616146 671.8383033 674.3668768 677.1135929 677.6311505 679.2692641 682.7933522 690.0029859 691.4822747 693.8971058 696.0578376 696.4621285 701.7876003 703.3337520 713.4933001 714.6352784 716.2889891 723.8360816 729.1788030 733.1686163 737.0303445 739.4335001 741.5041496 747.5948661 751.4420220 754.5822118 758.3587808 762.1258485 762.3742606 767.7276161 771.8178604 775.3172858 781.7809352 783.0476145 784.8109902 790.0887010 791.8603596 794.6453018 Diagstd> Normal end. Rtb_to_modes> Entering in. Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 4512 Rtb_to_modes> Number of blocs = 200 Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.eigenfacs Openam> file on opening on unit 11: matrix.eigenrtb Rdmodfacs> Entering in. Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Eigenvector number: 1 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9887E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 2 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9922E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 3 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9944E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 4 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9958E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 5 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9972E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 6 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0004E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 7 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.5753 Rdmodfacs> Eigenvector number: 8 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.8342 Rdmodfacs> Eigenvector number: 9 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.623 Rdmodfacs> Eigenvector number: 10 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.449 Rdmodfacs> Eigenvector number: 11 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.566 Rdmodfacs> Eigenvector number: 12 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.264 Rdmodfacs> Eigenvector number: 13 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.903 Rdmodfacs> Eigenvector number: 14 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.166 Rdmodfacs> Eigenvector number: 15 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.952 Rdmodfacs> Eigenvector number: 16 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.680 Rdmodfacs> Eigenvector number: 17 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.88 Rdmodfacs> Eigenvector number: 18 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.57 Rdmodfacs> Eigenvector number: 19 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.27 Rdmodfacs> Eigenvector number: 20 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.80 Rdmodfacs> Eigenvector number: 21 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.27 Rdmodfacs> Eigenvector number: 22 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.60 Rdmodfacs> Eigenvector number: 23 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.83 Rdmodfacs> Eigenvector number: 24 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.00 Rdmodfacs> Eigenvector number: 25 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.39 Rdmodfacs> Eigenvector number: 26 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.85 Rdmodfacs> Eigenvector number: 27 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.43 Rdmodfacs> Eigenvector number: 28 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.57 Rdmodfacs> Eigenvector number: 29 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.13 Rdmodfacs> Eigenvector number: 30 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.17 Rdmodfacs> Eigenvector number: 31 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.33 Rdmodfacs> Eigenvector number: 32 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.73 Rdmodfacs> Eigenvector number: 33 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.40 Rdmodfacs> Eigenvector number: 34 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.55 Rdmodfacs> Eigenvector number: 35 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.23 Rdmodfacs> Eigenvector number: 36 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.51 Rdmodfacs> Eigenvector number: 37 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.57 Rdmodfacs> Eigenvector number: 38 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.16 Rdmodfacs> Eigenvector number: 39 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.25 Rdmodfacs> Eigenvector number: 40 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.54 Rdmodfacs> Eigenvector number: 41 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.37 Rdmodfacs> Eigenvector number: 42 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.69 Rdmodfacs> Eigenvector number: 43 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.11 Rdmodfacs> Eigenvector number: 44 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.75 Rdmodfacs> Eigenvector number: 45 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.27 Rdmodfacs> Eigenvector number: 46 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.74 Rdmodfacs> Eigenvector number: 47 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.23 Rdmodfacs> Eigenvector number: 48 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.40 Rdmodfacs> Eigenvector number: 49 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.70 Rdmodfacs> Eigenvector number: 50 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.44 Rdmodfacs> Eigenvector number: 51 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.58 Rdmodfacs> Eigenvector number: 52 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.88 Rdmodfacs> Eigenvector number: 53 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.48 Rdmodfacs> Eigenvector number: 54 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.56 Rdmodfacs> Eigenvector number: 55 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.14 Rdmodfacs> Eigenvector number: 56 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.15 Rdmodfacs> Eigenvector number: 57 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.69 Rdmodfacs> Eigenvector number: 58 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.00 Rdmodfacs> Eigenvector number: 59 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.33 Rdmodfacs> Eigenvector number: 60 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.74 Rdmodfacs> Eigenvector number: 61 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 62 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.57 Rdmodfacs> Eigenvector number: 63 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.63 Rdmodfacs> Eigenvector number: 64 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.00 Rdmodfacs> Eigenvector number: 65 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.70 Rdmodfacs> Eigenvector number: 66 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.11 Rdmodfacs> Eigenvector number: 67 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.59 Rdmodfacs> Eigenvector number: 68 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.88 Rdmodfacs> Eigenvector number: 69 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.32 Rdmodfacs> Eigenvector number: 70 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.28 Rdmodfacs> Eigenvector number: 71 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.57 Rdmodfacs> Eigenvector number: 72 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.88 Rdmodfacs> Eigenvector number: 73 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.94 Rdmodfacs> Eigenvector number: 74 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.13 Rdmodfacs> Eigenvector number: 75 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.54 Rdmodfacs> Eigenvector number: 76 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.37 Rdmodfacs> Eigenvector number: 77 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.55 Rdmodfacs> Eigenvector number: 78 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.83 Rdmodfacs> Eigenvector number: 79 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 80 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.13 Rdmodfacs> Eigenvector number: 81 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.77 Rdmodfacs> Eigenvector number: 82 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.95 Rdmodfacs> Eigenvector number: 83 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.17 Rdmodfacs> Eigenvector number: 84 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.31 Rdmodfacs> Eigenvector number: 85 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.51 Rdmodfacs> Eigenvector number: 86 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.43 Rdmodfacs> Eigenvector number: 87 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 88 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.58 Rdmodfacs> Eigenvector number: 89 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.07 Rdmodfacs> Eigenvector number: 90 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.37 Rdmodfacs> Eigenvector number: 91 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.63 Rdmodfacs> Eigenvector number: 92 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 47.40 Rdmodfacs> Eigenvector number: 93 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 47.89 Rdmodfacs> Eigenvector number: 94 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 48.29 Rdmodfacs> Eigenvector number: 95 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 48.77 Rdmodfacs> Eigenvector number: 96 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 49.26 Rdmodfacs> Eigenvector number: 97 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 49.29 Rdmodfacs> Eigenvector number: 98 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 49.98 Rdmodfacs> Eigenvector number: 99 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 50.52 Rdmodfacs> Eigenvector number: 100 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 50.98 Rdmodfacs> Eigenvector number: 101 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 51.83 Rdmodfacs> Eigenvector number: 102 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 52.00 Rdmodfacs> Eigenvector number: 103 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 52.23 Rdmodfacs> Eigenvector number: 104 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 52.94 Rdmodfacs> Eigenvector number: 105 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 53.17 Rdmodfacs> Eigenvector number: 106 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 53.55 Rtb_to_modes> 106 vectors, with 1200 coordinates in vector file. Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected): 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 0.99999 0.99998 0.99999 0.99995 0.99997 1.00001 1.00001 1.00001 1.00000 1.00001 0.99998 1.00002 1.00000 0.99999 1.00000 0.99998 1.00001 1.00001 1.00000 0.99996 1.00002 0.99998 0.99999 1.00001 0.99999 1.00000 1.00001 1.00002 1.00002 1.00000 1.00001 1.00001 1.00000 1.00002 0.99999 0.99999 1.00001 0.99999 0.99998 1.00000 0.99998 0.99997 1.00000 0.99998 1.00001 0.99999 1.00001 0.99999 0.99998 0.99998 1.00000 0.99999 1.00001 1.00001 1.00001 0.99999 0.99998 1.00001 0.99999 0.99998 0.99997 1.00001 1.00001 0.99999 1.00002 1.00003 0.99998 1.00001 1.00000 1.00002 1.00001 1.00000 1.00001 0.99999 0.99998 1.00001 1.00002 1.00000 1.00002 1.00000 1.00002 0.99999 1.00000 0.99999 0.99998 1.00000 1.00000 1.00001 1.00001 0.99999 0.99999 1.00001 0.99999 1.00000 Rtb_to_modes> RTB block-file is being read. Rtb_to_modes> 81216 lines found in RTB file. Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected): 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 0.99999 0.99998 0.99999 0.99995 0.99997 1.00001 1.00001 1.00001 1.00000 1.00001 0.99998 1.00002 1.00000 0.99999 1.00000 0.99998 1.00001 1.00001 1.00000 0.99996 1.00002 0.99998 0.99999 1.00001 0.99999 1.00000 1.00001 1.00002 1.00002 1.00000 1.00001 1.00001 1.00000 1.00002 0.99999 0.99999 1.00001 0.99999 0.99998 1.00000 0.99998 0.99997 1.00000 0.99998 1.00001 0.99999 1.00001 0.99999 0.99998 0.99998 1.00000 0.99999 1.00001 1.00001 1.00001 0.99999 0.99998 1.00001 0.99999 0.99998 0.99997 1.00001 1.00001 0.99999 1.00002 1.00003 0.99998 1.00001 1.00000 1.00002 1.00001 1.00000 1.00001 0.99999 0.99998 1.00001 1.00002 1.00000 1.00002 1.00000 1.00002 0.99999 1.00000 0.99999 0.99998 1.00000 1.00000 1.00001 1.00001 0.99999 0.99999 1.00001 0.99999 1.00000 Orthogonality of first eigenvectors (zero expected): Vector 2: 0.000 Vector 3:-0.000 0.000 Vector 4: 0.000-0.000-0.000 Vector 5:-0.000 0.000 0.000-0.000 Vector 6:-0.000-0.000 0.000 0.000 0.000 Vector 7: 0.000 0.000 0.000-0.000 0.000 0.000 Vector 8: 0.000-0.000-0.000 0.000 0.000 0.000-0.000 Vector 9: 0.000-0.000-0.000-0.000 0.000 0.000-0.000-0.000 Vector 10:-0.000 0.000 0.000-0.000 0.000-0.000-0.000 0.000 0.000 Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved. Rtb_to_modes> Normal end. Diagrtb> Normal end. B-factor analysis Bfactors> Version 1.22, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 260211175729977404.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 260211175729977404.eigenfacs Getnam> Corresponding pdb filename ? Getnam> 260211175729977404.atom Openam> file on opening on unit 11: 260211175729977404.atom Getnum> Number of skipped eigenvectors ? Getnum> 0 Getnum> Number of usefull eigenvectors ? Getnum> 10000 %Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 596 First residue number = 18 Last residue number = 315 Number of atoms found = 4512 Mean number per residue = 7.6 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9887E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9922E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9944E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9958E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9972E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0004E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.5753 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.8342 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.623 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.449 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.566 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.264 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.903 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.166 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.952 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.680 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.88 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.57 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.27 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.80 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.27 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.60 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.83 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.00 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.39 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.85 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.43 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.57 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.13 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.17 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.33 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.73 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.40 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.55 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.23 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.51 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.57 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.16 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.25 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.54 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.37 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.69 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.11 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.75 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.27 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.74 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.23 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.40 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.70 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.44 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.58 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.88 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.48 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.56 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.14 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.15 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.69 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.00 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.33 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.74 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.57 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.63 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.00 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.70 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.11 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.59 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.88 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.32 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.28 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.57 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.88 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.94 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.13 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.54 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.37 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.55 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.83 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.13 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.77 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.95 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.17 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.31 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.51 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.43 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.58 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.07 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.37 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.63 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.40 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.89 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.29 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.77 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.26 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.29 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.98 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 50.52 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 50.98 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 51.83 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 52.00 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 52.23 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 52.94 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 53.17 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 53.55 Bfactors> 106 vectors, 13536 coordinates in file. Openam> file on opening on unit 12: bfactors.pred Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000 Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 0.575300 Bfactors> 100 eigenvectors will be considered. Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped. Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed. (CHARMM units assumed for eigenvalues) Bfactors> Correlation= -0.416 for 596 C-alpha atoms. Bfactors> = 0.027 +/- 0.02 Bfactors> = 90.140 +/- 6.15 Bfactors> Shiftng-fct= 90.113 Bfactors> Scaling-fct= 264.262 Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved. Bfactors> Normal end. check_modes Chkmod> Version 1.00, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 260211175729977404.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 260211175729977404.eigenfacs Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4319E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4325E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4329E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4331E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4333E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4345E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 82.36 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 99.18 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 138.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 201.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 205.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 224.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 305.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 310.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 324.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 337.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 358.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 369.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 380.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 388.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 395.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 400.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 403.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 406.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 426.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 432.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 440.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 442.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 449.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 462.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 464.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 469.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 478.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 480.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 500.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 503.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 504.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 511.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Frequence du 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Chkmod> That is: 4512 cartesian points. Openam> file on opening on unit 11: Chkmod.res Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file. Chkmod> Normal end. 0.0034 0.7361 0.0034 0.7699 0.0034 0.9031 0.0034 0.8270 0.0034 0.8175 0.0034 0.9667 82.3614 0.7717 99.1772 0.7361 138.3362 0.7500 201.6616 0.7980 205.0536 0.8109 224.2256 0.7965 305.2619 0.3976 310.2997 0.4236 324.8902 0.4905 337.8425 0.1869 358.1715 0.2398 369.3544 0.3952 380.3636 0.2974 388.4916 0.2957 395.5598 0.2891 400.4480 0.0827 403.8199 0.3618 406.2942 0.0724 425.9866 0.3211 432.3060 0.2779 440.1446 0.3564 442.0159 0.2373 449.4230 0.4150 462.8647 0.3764 464.8982 0.2520 469.9434 0.2684 478.2748 0.4792 480.1202 0.4263 500.3243 0.5744 503.6129 0.4542 504.3148 0.6164 511.1655 0.6046 512.2024 0.4779 515.5296 0.5569 524.9356 0.2596 528.5173 0.3277 533.1817 0.6381 540.2120 0.2855 545.8575 0.3928 550.9103 0.3196 556.1293 0.2625 568.3972 0.3611 571.5004 0.4008 579.0838 0.4797 580.5074 0.3040 583.5462 0.5085 589.5768 0.2517 600.2792 0.4038 605.9488 0.3485 606.0461 0.3981 611.2766 0.3656 614.2591 0.3830 617.4183 0.3338 621.3209 0.2861 624.7275 0.3885 629.1473 0.4718 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MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 260211175729977404.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 260211175729977404.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 8 running: ../../bin/get_modes.sh 260211175729977404 8 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 8 calculating perturbed structure for DQ=-100 260211175729977404.eigenfacs 260211175729977404.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 260211175729977404.eigenfacs 260211175729977404.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 260211175729977404.eigenfacs 260211175729977404.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 260211175729977404.eigenfacs 260211175729977404.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 260211175729977404.eigenfacs 260211175729977404.atom calculating perturbed structure for DQ=0 260211175729977404.eigenfacs 260211175729977404.atom calculating perturbed structure for DQ=20 260211175729977404.eigenfacs 260211175729977404.atom calculating perturbed structure for DQ=40 260211175729977404.eigenfacs 260211175729977404.atom calculating perturbed structure for DQ=60 260211175729977404.eigenfacs 260211175729977404.atom calculating perturbed structure for DQ=80 260211175729977404.eigenfacs 260211175729977404.atom calculating perturbed structure for DQ=100 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../../bin/get_modes.sh 260211175729977404 9 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 9 calculating perturbed structure for DQ=-100 260211175729977404.eigenfacs 260211175729977404.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 260211175729977404.eigenfacs 260211175729977404.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 260211175729977404.eigenfacs 260211175729977404.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 260211175729977404.eigenfacs 260211175729977404.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 260211175729977404.eigenfacs 260211175729977404.atom calculating perturbed structure for DQ=0 260211175729977404.eigenfacs 260211175729977404.atom calculating perturbed structure for DQ=20 260211175729977404.eigenfacs 260211175729977404.atom calculating perturbed structure for DQ=40 260211175729977404.eigenfacs 260211175729977404.atom calculating perturbed structure for DQ=60 260211175729977404.eigenfacs 260211175729977404.atom 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