***  Y_modelo_23_KELEY  ***
Output from eigenvector calculation:
STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8)
Build Tirion matrix:
Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model.
Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004.
Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file.
Pdbmat> Coordinate filename = 260211175807979148.atom
Pdbmat> Distance cutoff = 8.00
Force constant = 10.00
Origin of mass values = CONS
Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09
PRINTing level = 2
Pdbmat> Coordinate file 260211175807979148.atom to be opened.
Openam> File opened: 260211175807979148.atom
Pdbmat> Coordinate file in PDB format.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 596
First residue number = 18
Last residue number = 315
Number of atoms found = 4512
Mean number per residue = 7.6
Pdbmat> Coordinate statistics:
= 0.927521 +/- 14.808308 From: -30.568000 To: 35.066000
= -1.243893 +/- 16.223293 From: -37.338000 To: 36.370000
= -0.873616 +/- 11.795902 From: -27.036000 To: 26.587000
Pdbmat> Masses are all set to one.
Openam> File opened: pdbmat.xyzm
Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved.
Openam> File opened: pdbmat.sdijb
Pdbmat> Matrix statistics:
Pdbmat> The matrix is 1.9213 % Filled.
Pdbmat> 1760287 non-zero elements.
Pdbmat> 192610 atom-atom interactions.
Pdbmat> Number per atom= 85.38 +/- 22.30
Maximum number = 130
Minimum number = 19
Pdbmat> Matrix trace = 3.852200E+06
Pdbmat> Larger element = 506.323
Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10
Pdbmat> Normal end.
automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1)
596 non-zero elements, NRBL set to 3
Diagonalize Tirion matrix using diagrtb
Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation.
Diagrtb> Version 2.52, November 2004.
Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file.
Diagrtb> Options taken into account:
MATRix filename = pdbmat.sdijb
COORdinates filename = 260211175807979148.atom
Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb
Nb of VECTors required = 106
EigeNVALues chosen = LOWE
Type of SUBStructuring = NONE
Nb of residues per BLOck = 3
Origin of MASS values = CONS
MATRix FORMat = BINA
Temporary files cleaning = ALL
Output PRINting level = 2
Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb.
Blocpdb> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.xyzm
Blocpdb> Coordinate file 260211175807979148.atom to be opened.
Openam> file on opening on unit 11:
260211175807979148.atom
Blocpdb> Coordinate file in PDB format.
Blocpdb> 4512 atoms picked in pdb file.
Blocpdb> All masses set to unity.
Blocpdb> Coordinate file is rewritten.
Blocpdb> Substructuring:
Blocpdb> 3 residue(s) per block.
Blocpdb> 596 residues.
Blocpdb> 22 atoms in block 1
Block first atom: 1
Blocpdb> 25 atoms in block 2
Block first atom: 23
Blocpdb> 22 atoms in block 3
Block first atom: 48
Blocpdb> 25 atoms in block 4
Block first atom: 70
Blocpdb> 23 atoms in block 5
Block first atom: 95
Blocpdb> 29 atoms in block 6
Block first atom: 118
Blocpdb> 25 atoms in block 7
Block first atom: 147
Blocpdb> 25 atoms in block 8
Block first atom: 172
Blocpdb> 25 atoms in block 9
Block first atom: 197
Blocpdb> 27 atoms in block 10
Block first atom: 222
Blocpdb> 27 atoms in block 11
Block first atom: 249
Blocpdb> 20 atoms in block 12
Block first atom: 276
Blocpdb> 19 atoms in block 13
Block first atom: 296
Blocpdb> 23 atoms in block 14
Block first atom: 315
Blocpdb> 31 atoms in block 15
Block first atom: 338
Blocpdb> 19 atoms in block 16
Block first atom: 369
Blocpdb> 17 atoms in block 17
Block first atom: 388
Blocpdb> 21 atoms in block 18
Block first atom: 405
Blocpdb> 20 atoms in block 19
Block first atom: 426
Blocpdb> 28 atoms in block 20
Block first atom: 446
Blocpdb> 13 atoms in block 21
Block first atom: 474
Blocpdb> 23 atoms in block 22
Block first atom: 487
Blocpdb> 19 atoms in block 23
Block first atom: 510
Blocpdb> 24 atoms in block 24
Block first atom: 529
Blocpdb> 18 atoms in block 25
Block first atom: 553
Blocpdb> 24 atoms in block 26
Block first atom: 571
Blocpdb> 29 atoms in block 27
Block first atom: 595
Blocpdb> 16 atoms in block 28
Block first atom: 624
Blocpdb> 28 atoms in block 29
Block first atom: 640
Blocpdb> 19 atoms in block 30
Block first atom: 668
Blocpdb> 25 atoms in block 31
Block first atom: 687
Blocpdb> 22 atoms in block 32
Block first atom: 712
Blocpdb> 31 atoms in block 33
Block first atom: 734
Blocpdb> 24 atoms in block 34
Block first atom: 765
Blocpdb> 21 atoms in block 35
Block first atom: 789
Blocpdb> 29 atoms in block 36
Block first atom: 810
Blocpdb> 18 atoms in block 37
Block first atom: 839
Blocpdb> 21 atoms in block 38
Block first atom: 857
Blocpdb> 19 atoms in block 39
Block first atom: 878
Blocpdb> 26 atoms in block 40
Block first atom: 897
Blocpdb> 22 atoms in block 41
Block first atom: 923
Blocpdb> 20 atoms in block 42
Block first atom: 945
Blocpdb> 20 atoms in block 43
Block first atom: 965
Blocpdb> 18 atoms in block 44
Block first atom: 985
Blocpdb> 17 atoms in block 45
Block first atom: 1003
Blocpdb> 24 atoms in block 46
Block first atom: 1020
Blocpdb> 27 atoms in block 47
Block first atom: 1044
Blocpdb> 19 atoms in block 48
Block first atom: 1071
Blocpdb> 21 atoms in block 49
Block first atom: 1090
Blocpdb> 13 atoms in block 50
Block first atom: 1111
Blocpdb> 19 atoms in block 51
Block first atom: 1124
Blocpdb> 23 atoms in block 52
Block first atom: 1143
Blocpdb> 20 atoms in block 53
Block first atom: 1166
Blocpdb> 20 atoms in block 54
Block first atom: 1186
Blocpdb> 20 atoms in block 55
Block first atom: 1206
Blocpdb> 29 atoms in block 56
Block first atom: 1226
Blocpdb> 24 atoms in block 57
Block first atom: 1255
Blocpdb> 20 atoms in block 58
Block first atom: 1279
Blocpdb> 22 atoms in block 59
Block first atom: 1299
Blocpdb> 20 atoms in block 60
Block first atom: 1321
Blocpdb> 33 atoms in block 61
Block first atom: 1341
Blocpdb> 21 atoms in block 62
Block first atom: 1374
Blocpdb> 27 atoms in block 63
Block first atom: 1395
Blocpdb> 25 atoms in block 64
Block first atom: 1422
Blocpdb> 22 atoms in block 65
Block first atom: 1447
Blocpdb> 28 atoms in block 66
Block first atom: 1469
Blocpdb> 19 atoms in block 67
Block first atom: 1497
Blocpdb> 24 atoms in block 68
Block first atom: 1516
Blocpdb> 26 atoms in block 69
Block first atom: 1540
Blocpdb> 24 atoms in block 70
Block first atom: 1566
Blocpdb> 20 atoms in block 71
Block first atom: 1590
Blocpdb> 20 atoms in block 72
Block first atom: 1610
Blocpdb> 23 atoms in block 73
Block first atom: 1630
Blocpdb> 26 atoms in block 74
Block first atom: 1653
Blocpdb> 19 atoms in block 75
Block first atom: 1679
Blocpdb> 23 atoms in block 76
Block first atom: 1698
Blocpdb> 23 atoms in block 77
Block first atom: 1721
Blocpdb> 25 atoms in block 78
Block first atom: 1744
Blocpdb> 20 atoms in block 79
Block first atom: 1769
Blocpdb> 24 atoms in block 80
Block first atom: 1789
Blocpdb> 17 atoms in block 81
Block first atom: 1813
Blocpdb> 26 atoms in block 82
Block first atom: 1830
Blocpdb> 22 atoms in block 83
Block first atom: 1856
Blocpdb> 22 atoms in block 84
Block first atom: 1878
Blocpdb> 22 atoms in block 85
Block first atom: 1900
Blocpdb> 24 atoms in block 86
Block first atom: 1922
Blocpdb> 23 atoms in block 87
Block first atom: 1946
Blocpdb> 21 atoms in block 88
Block first atom: 1969
Blocpdb> 22 atoms in block 89
Block first atom: 1990
Blocpdb> 24 atoms in block 90
Block first atom: 2012
Blocpdb> 29 atoms in block 91
Block first atom: 2036
Blocpdb> 19 atoms in block 92
Block first atom: 2065
Blocpdb> 19 atoms in block 93
Block first atom: 2084
Blocpdb> 22 atoms in block 94
Block first atom: 2103
Blocpdb> 28 atoms in block 95
Block first atom: 2125
Blocpdb> 23 atoms in block 96
Block first atom: 2153
Blocpdb> 33 atoms in block 97
Block first atom: 2176
Blocpdb> 25 atoms in block 98
Block first atom: 2209
Blocpdb> 19 atoms in block 99
Block first atom: 2234
Blocpdb> 4 atoms in block 100
Block first atom: 2253
Blocpdb> 22 atoms in block 101
Block first atom: 2257
Blocpdb> 25 atoms in block 102
Block first atom: 2279
Blocpdb> 22 atoms in block 103
Block first atom: 2304
Blocpdb> 25 atoms in block 104
Block first atom: 2326
Blocpdb> 23 atoms in block 105
Block first atom: 2351
Blocpdb> 29 atoms in block 106
Block first atom: 2374
Blocpdb> 25 atoms in block 107
Block first atom: 2403
Blocpdb> 25 atoms in block 108
Block first atom: 2428
Blocpdb> 25 atoms in block 109
Block first atom: 2453
Blocpdb> 27 atoms in block 110
Block first atom: 2478
Blocpdb> 27 atoms in block 111
Block first atom: 2505
Blocpdb> 20 atoms in block 112
Block first atom: 2532
Blocpdb> 19 atoms in block 113
Block first atom: 2552
Blocpdb> 23 atoms in block 114
Block first atom: 2571
Blocpdb> 31 atoms in block 115
Block first atom: 2594
Blocpdb> 19 atoms in block 116
Block first atom: 2625
Blocpdb> 17 atoms in block 117
Block first atom: 2644
Blocpdb> 21 atoms in block 118
Block first atom: 2661
Blocpdb> 20 atoms in block 119
Block first atom: 2682
Blocpdb> 28 atoms in block 120
Block first atom: 2702
Blocpdb> 13 atoms in block 121
Block first atom: 2730
Blocpdb> 23 atoms in block 122
Block first atom: 2743
Blocpdb> 19 atoms in block 123
Block first atom: 2766
Blocpdb> 24 atoms in block 124
Block first atom: 2785
Blocpdb> 18 atoms in block 125
Block first atom: 2809
Blocpdb> 24 atoms in block 126
Block first atom: 2827
Blocpdb> 29 atoms in block 127
Block first atom: 2851
Blocpdb> 16 atoms in block 128
Block first atom: 2880
Blocpdb> 28 atoms in block 129
Block first atom: 2896
Blocpdb> 19 atoms in block 130
Block first atom: 2924
Blocpdb> 25 atoms in block 131
Block first atom: 2943
Blocpdb> 22 atoms in block 132
Block first atom: 2968
Blocpdb> 31 atoms in block 133
Block first atom: 2990
Blocpdb> 24 atoms in block 134
Block first atom: 3021
Blocpdb> 21 atoms in block 135
Block first atom: 3045
Blocpdb> 29 atoms in block 136
Block first atom: 3066
Blocpdb> 18 atoms in block 137
Block first atom: 3095
Blocpdb> 21 atoms in block 138
Block first atom: 3113
Blocpdb> 19 atoms in block 139
Block first atom: 3134
Blocpdb> 26 atoms in block 140
Block first atom: 3153
Blocpdb> 22 atoms in block 141
Block first atom: 3179
Blocpdb> 20 atoms in block 142
Block first atom: 3201
Blocpdb> 20 atoms in block 143
Block first atom: 3221
Blocpdb> 18 atoms in block 144
Block first atom: 3241
Blocpdb> 17 atoms in block 145
Block first atom: 3259
Blocpdb> 24 atoms in block 146
Block first atom: 3276
Blocpdb> 27 atoms in block 147
Block first atom: 3300
Blocpdb> 19 atoms in block 148
Block first atom: 3327
Blocpdb> 21 atoms in block 149
Block first atom: 3346
Blocpdb> 13 atoms in block 150
Block first atom: 3367
Blocpdb> 19 atoms in block 151
Block first atom: 3380
Blocpdb> 23 atoms in block 152
Block first atom: 3399
Blocpdb> 20 atoms in block 153
Block first atom: 3422
Blocpdb> 20 atoms in block 154
Block first atom: 3442
Blocpdb> 20 atoms in block 155
Block first atom: 3462
Blocpdb> 29 atoms in block 156
Block first atom: 3482
Blocpdb> 24 atoms in block 157
Block first atom: 3511
Blocpdb> 20 atoms in block 158
Block first atom: 3535
Blocpdb> 22 atoms in block 159
Block first atom: 3555
Blocpdb> 20 atoms in block 160
Block first atom: 3577
Blocpdb> 33 atoms in block 161
Block first atom: 3597
Blocpdb> 21 atoms in block 162
Block first atom: 3630
Blocpdb> 27 atoms in block 163
Block first atom: 3651
Blocpdb> 25 atoms in block 164
Block first atom: 3678
Blocpdb> 22 atoms in block 165
Block first atom: 3703
Blocpdb> 28 atoms in block 166
Block first atom: 3725
Blocpdb> 19 atoms in block 167
Block first atom: 3753
Blocpdb> 24 atoms in block 168
Block first atom: 3772
Blocpdb> 26 atoms in block 169
Block first atom: 3796
Blocpdb> 24 atoms in block 170
Block first atom: 3822
Blocpdb> 20 atoms in block 171
Block first atom: 3846
Blocpdb> 20 atoms in block 172
Block first atom: 3866
Blocpdb> 23 atoms in block 173
Block first atom: 3886
Blocpdb> 26 atoms in block 174
Block first atom: 3909
Blocpdb> 19 atoms in block 175
Block first atom: 3935
Blocpdb> 23 atoms in block 176
Block first atom: 3954
Blocpdb> 23 atoms in block 177
Block first atom: 3977
Blocpdb> 25 atoms in block 178
Block first atom: 4000
Blocpdb> 20 atoms in block 179
Block first atom: 4025
Blocpdb> 24 atoms in block 180
Block first atom: 4045
Blocpdb> 17 atoms in block 181
Block first atom: 4069
Blocpdb> 26 atoms in block 182
Block first atom: 4086
Blocpdb> 22 atoms in block 183
Block first atom: 4112
Blocpdb> 22 atoms in block 184
Block first atom: 4134
Blocpdb> 22 atoms in block 185
Block first atom: 4156
Blocpdb> 24 atoms in block 186
Block first atom: 4178
Blocpdb> 23 atoms in block 187
Block first atom: 4202
Blocpdb> 21 atoms in block 188
Block first atom: 4225
Blocpdb> 22 atoms in block 189
Block first atom: 4246
Blocpdb> 24 atoms in block 190
Block first atom: 4268
Blocpdb> 29 atoms in block 191
Block first atom: 4292
Blocpdb> 19 atoms in block 192
Block first atom: 4321
Blocpdb> 19 atoms in block 193
Block first atom: 4340
Blocpdb> 22 atoms in block 194
Block first atom: 4359
Blocpdb> 28 atoms in block 195
Block first atom: 4381
Blocpdb> 23 atoms in block 196
Block first atom: 4409
Blocpdb> 33 atoms in block 197
Block first atom: 4432
Blocpdb> 25 atoms in block 198
Block first atom: 4465
Blocpdb> 19 atoms in block 199
Block first atom: 4490
Blocpdb> 4 atoms in block 200
Block first atom: 4508
Blocpdb> 200 blocks.
Blocpdb> At most, 33 atoms in each of them.
Blocpdb> At least, 4 atoms in each of them.
Blocpdb> Normal end of Blocpdb.
Diagrtb> Memory allocation for Prepmat.
Diagrtb> Memory allocation for RTB.
Diagrtb> Memory allocation for Diagstd.
Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes.
Prepmat> Entering in.
Prepmat> Rewriting of the matrix begins.
Prepmat> 1760487 matrix lines read.
Prepmat> Matrix order = 13536
Prepmat> Matrix trace = 3852200.0000
Prepmat> Last element read: 13536 13536 50.3268
Prepmat> 20101 lines saved.
Prepmat> 17980 empty lines.
Prepmat> Number of lines on output is as expected.
Prepmat> Normal end of Prepmat.
RTB> Entering in.
RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 4512
RTB> Total mass = 4512.0000
RTB> Number of atoms found in matrix: 4512
RTB> Number of blocks = 200
RTB> Projection begins.
RTB> Projected matrix is being saved.
RTB> Projected matrix trace = 272289.7786
RTB> 73320 non-zero elements.
RTB> Normal end of RTB.
Diagstd> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.sdijb
Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb
Diagstd> CERFACS matrix format.
Diagstd> Projected matrix order = 1200
Diagstd> Nb of non-zero elements: 73320
Diagstd> Projected matrix trace = 272289.7786
Openam> file on opening on unit 11:
diagrtb_work.eigenfacs
Diagstd> Diagonalization.
Diagstd> 1200 eigenvectors are computed.
Diagstd> 106 of them to be saved.
Diagstd> Sum of eigenvalues = 272289.7786
Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000
Diagstd> Selected eigenvalues:
0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000
0.0000000 1.4779482 1.9900498 2.3451260 5.4369076
5.6173447 6.0591721 8.3838720 9.6577155 9.9556351
10.3740294 11.1990713 11.6122045 12.8778861 13.8984383
14.3708124 14.6238109 15.1363437 15.5066469 16.5033559
16.9371331 17.9044996 18.0657328 18.3322954 19.1655328
19.9518119 20.6020267 20.6393619 21.2006195 22.0473587
22.0746982 23.0355015 23.0916950 23.4953456 23.8231784
25.1041469 25.6633879 25.9111611 26.5984773 27.5143287
27.7215194 28.1505456 28.7083314 28.7874989 29.1263418
29.6874783 30.5805979 30.9652621 31.5948684 32.3860387
33.0036964 33.8459213 33.9028307 34.3733436 35.0005229
35.3810792 35.9385757 36.3542986 36.5697753 37.7988437
38.6779609 39.2027092 39.3838075 39.5756987 39.6436295
39.8648098 40.6560764 40.7666990 40.8419955 41.3540060
41.7949697 42.0315854 42.3885946 43.3917109 43.8615014
44.0504990 44.2926729 45.0834627 45.8603628 45.8905710
46.1480743 46.5332298 47.2528175 47.3934564 47.7728319
48.1846025 49.0285780 49.3618741 49.9674301 50.6337562
51.1881099 51.3347524 52.5262728 52.7501264 52.9786540
53.2667431 54.3201631 54.7749946 55.1773261 56.0914531
56.3214812
Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units):
0.0034326 0.0034331 0.0034333 0.0034334 0.0034344
0.0034345 132.0154862 153.1888860 166.2946874 253.2044050
257.3717152 267.3018252 314.4253846 337.4679125 342.6334552
349.7590953 363.4011392 370.0433615 389.6884831 404.8352137
411.6574123 415.2652229 422.4796260 427.6162779 441.1450531
446.9050179 459.4903281 461.5545872 464.9472720 475.3962251
485.0499353 492.8902791 493.3366876 499.9994836 509.8865590
510.2025999 521.1876497 521.8229634 526.3640253 530.0235078
544.0865796 550.1134637 552.7626844 560.0459588 569.6062437
571.7468697 576.1541420 581.8342143 582.6359093 586.0548326
591.6732506 600.5072658 604.2722633 610.3845829 617.9796802
623.8448180 631.7546544 632.2855558 636.6579548 642.4399602
645.9231027 650.9920892 654.7464692 656.6839866 667.6279929
675.3471402 679.9129623 681.4815940 683.1397800 683.7258257
685.6304993 692.4015190 693.3428698 693.9828802 698.3193452
702.0326131 704.0170319 707.0006106 715.3171996 719.1790491
720.7268414 722.7052754 729.1282289 735.3837405 735.6258991
737.6869010 740.7589016 746.4644589 747.5744875 750.5606184
753.7883491 760.3611675 762.9412563 767.6067535 772.7079020
776.9263068 778.0383716 787.0160201 788.6912683 790.3978319
792.5439447 800.3423771 803.6860904 806.6322945 813.2866168
814.9525334
Diagstd> Normal end.
Rtb_to_modes> Entering in.
Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 4512
Rtb_to_modes> Number of blocs = 200
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 11:
matrix.eigenrtb
Rdmodfacs> Entering in.
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Eigenvector number: 1
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9922E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 2
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9951E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 3
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9962E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 4
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9966E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 5
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0002E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 6
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0003E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 7
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.478
Rdmodfacs> Eigenvector number: 8
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.990
Rdmodfacs> Eigenvector number: 9
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.345
Rdmodfacs> Eigenvector number: 10
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.437
Rdmodfacs> Eigenvector number: 11
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.617
Rdmodfacs> Eigenvector number: 12
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.059
Rdmodfacs> Eigenvector number: 13
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.384
Rdmodfacs> Eigenvector number: 14
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.658
Rdmodfacs> Eigenvector number: 15
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.956
Rdmodfacs> Eigenvector number: 16
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.37
Rdmodfacs> Eigenvector number: 17
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.20
Rdmodfacs> Eigenvector number: 18
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.61
Rdmodfacs> Eigenvector number: 19
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.88
Rdmodfacs> Eigenvector number: 20
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.90
Rdmodfacs> Eigenvector number: 21
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.37
Rdmodfacs> Eigenvector number: 22
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.62
Rdmodfacs> Eigenvector number: 23
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.14
Rdmodfacs> Eigenvector number: 24
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.51
Rdmodfacs> Eigenvector number: 25
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.50
Rdmodfacs> Eigenvector number: 26
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.94
Rdmodfacs> Eigenvector number: 27
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.90
Rdmodfacs> Eigenvector number: 28
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.07
Rdmodfacs> Eigenvector number: 29
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.33
Rdmodfacs> Eigenvector number: 30
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.17
Rdmodfacs> Eigenvector number: 31
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.95
Rdmodfacs> Eigenvector number: 32
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.60
Rdmodfacs> Eigenvector number: 33
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.64
Rdmodfacs> Eigenvector number: 34
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.20
Rdmodfacs> Eigenvector number: 35
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.05
Rdmodfacs> Eigenvector number: 36
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.07
Rdmodfacs> Eigenvector number: 37
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.04
Rdmodfacs> Eigenvector number: 38
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 39
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.50
Rdmodfacs> Eigenvector number: 40
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.82
Rdmodfacs> Eigenvector number: 41
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 42
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.66
Rdmodfacs> Eigenvector number: 43
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.91
Rdmodfacs> Eigenvector number: 44
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.60
Rdmodfacs> Eigenvector number: 45
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.51
Rdmodfacs> Eigenvector number: 46
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.72
Rdmodfacs> Eigenvector number: 47
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.15
Rdmodfacs> Eigenvector number: 48
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.71
Rdmodfacs> Eigenvector number: 49
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.79
Rdmodfacs> Eigenvector number: 50
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.13
Rdmodfacs> Eigenvector number: 51
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.69
Rdmodfacs> Eigenvector number: 52
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.58
Rdmodfacs> Eigenvector number: 53
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.97
Rdmodfacs> Eigenvector number: 54
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.59
Rdmodfacs> Eigenvector number: 55
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.39
Rdmodfacs> Eigenvector number: 56
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.00
Rdmodfacs> Eigenvector number: 57
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.85
Rdmodfacs> Eigenvector number: 58
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.90
Rdmodfacs> Eigenvector number: 59
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.37
Rdmodfacs> Eigenvector number: 60
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.00
Rdmodfacs> Eigenvector number: 61
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.38
Rdmodfacs> Eigenvector number: 62
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.94
Rdmodfacs> Eigenvector number: 63
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.35
Rdmodfacs> Eigenvector number: 64
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.57
Rdmodfacs> Eigenvector number: 65
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.80
Rdmodfacs> Eigenvector number: 66
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.68
Rdmodfacs> Eigenvector number: 67
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.20
Rdmodfacs> Eigenvector number: 68
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.38
Rdmodfacs> Eigenvector number: 69
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.58
Rdmodfacs> Eigenvector number: 70
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.64
Rdmodfacs> Eigenvector number: 71
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.86
Rdmodfacs> Eigenvector number: 72
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.66
Rdmodfacs> Eigenvector number: 73
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.77
Rdmodfacs> Eigenvector number: 74
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.84
Rdmodfacs> Eigenvector number: 75
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.35
Rdmodfacs> Eigenvector number: 76
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.79
Rdmodfacs> Eigenvector number: 77
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.03
Rdmodfacs> Eigenvector number: 78
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.39
Rdmodfacs> Eigenvector number: 79
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.39
Rdmodfacs> Eigenvector number: 80
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.86
Rdmodfacs> Eigenvector number: 81
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.05
Rdmodfacs> Eigenvector number: 82
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.29
Rdmodfacs> Eigenvector number: 83
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.08
Rdmodfacs> Eigenvector number: 84
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.86
Rdmodfacs> Eigenvector number: 85
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.89
Rdmodfacs> Eigenvector number: 86
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.15
Rdmodfacs> Eigenvector number: 87
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.53
Rdmodfacs> Eigenvector number: 88
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 47.25
Rdmodfacs> Eigenvector number: 89
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 47.39
Rdmodfacs> Eigenvector number: 90
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 47.77
Rdmodfacs> Eigenvector number: 91
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 48.18
Rdmodfacs> Eigenvector number: 92
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 49.03
Rdmodfacs> Eigenvector number: 93
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 49.36
Rdmodfacs> Eigenvector number: 94
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 49.97
Rdmodfacs> Eigenvector number: 95
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 50.63
Rdmodfacs> Eigenvector number: 96
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 51.19
Rdmodfacs> Eigenvector number: 97
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 51.33
Rdmodfacs> Eigenvector number: 98
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 52.53
Rdmodfacs> Eigenvector number: 99
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 52.75
Rdmodfacs> Eigenvector number: 100
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 52.98
Rdmodfacs> Eigenvector number: 101
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 53.27
Rdmodfacs> Eigenvector number: 102
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 54.32
Rdmodfacs> Eigenvector number: 103
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 54.77
Rdmodfacs> Eigenvector number: 104
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 55.18
Rdmodfacs> Eigenvector number: 105
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 56.09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 106
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 56.32
Rtb_to_modes> 106 vectors, with 1200 coordinates in vector file.
Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected):
1.00001 1.00000 0.99999 1.00000 1.00000
0.99999 1.00000 1.00001 1.00001 1.00001
1.00000 0.99999 0.99999 1.00005 1.00000
1.00000 1.00000 1.00002 0.99999 1.00001
1.00000 1.00001 1.00000 1.00002 0.99999
1.00001 1.00002 1.00002 1.00000 1.00001
0.99999 1.00001 1.00000 0.99998 1.00001
0.99999 1.00000 0.99999 1.00000 1.00001
1.00001 0.99998 1.00001 0.99999 1.00000
1.00001 1.00001 0.99997 0.99999 1.00000
0.99999 1.00001 1.00001 0.99999 1.00003
1.00001 0.99997 0.99999 1.00000 1.00000
1.00000 0.99997 0.99999 1.00000 1.00000
1.00000 0.99999 1.00000 1.00001 1.00000
1.00000 1.00001 1.00002 1.00000 0.99998
0.99999 1.00001 1.00000 1.00003 1.00001
1.00003 0.99999 1.00001 0.99999 0.99999
1.00000 1.00000 1.00003 1.00002 1.00000
1.00000 1.00000 1.00001 1.00000 1.00000
1.00001 1.00002 1.00000 1.00000 0.99999
0.99999 0.99999 1.00001 0.99999 0.99999
0.99999
Rtb_to_modes> RTB block-file is being read.
Rtb_to_modes> 81216 lines found in RTB file.
Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected):
1.00001 1.00000 0.99999 1.00000 1.00000
0.99999 1.00000 1.00001 1.00001 1.00001
1.00000 0.99999 0.99999 1.00005 1.00000
1.00000 1.00000 1.00002 0.99999 1.00001
1.00000 1.00001 1.00000 1.00002 0.99999
1.00001 1.00002 1.00002 1.00000 1.00001
0.99999 1.00001 1.00000 0.99998 1.00001
0.99999 1.00000 0.99999 1.00000 1.00001
1.00001 0.99998 1.00001 0.99999 1.00000
1.00001 1.00001 0.99997 0.99999 1.00000
0.99999 1.00001 1.00001 0.99999 1.00003
1.00001 0.99997 0.99999 1.00000 1.00000
1.00000 0.99997 0.99999 1.00000 1.00000
1.00000 0.99999 1.00000 1.00001 1.00000
1.00000 1.00001 1.00002 1.00000 0.99998
0.99999 1.00001 1.00000 1.00003 1.00001
1.00003 0.99999 1.00001 0.99999 0.99999
1.00000 1.00000 1.00003 1.00002 1.00000
1.00000 1.00000 1.00001 1.00000 1.00000
1.00001 1.00002 1.00000 1.00000 0.99999
0.99999 0.99999 1.00001 0.99999 0.99999
0.99999
Orthogonality of first eigenvectors (zero expected):
Vector 2:-0.000
Vector 3: 0.000-0.000
Vector 4: 0.000-0.000 0.000
Vector 5:-0.000-0.000-0.000-0.000
Vector 6: 0.000-0.000-0.000-0.000 0.000
Vector 7: 0.000-0.000-0.000 0.000 0.000-0.000
Vector 8:-0.000 0.000-0.000 0.000 0.000-0.000 0.000
Vector 9:-0.000 0.000 0.000-0.000-0.000-0.000 0.000 0.000
Vector 10: 0.000 0.000-0.000 0.000-0.000-0.000 0.000 0.000 0.000
Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved.
Rtb_to_modes> Normal end.
Diagrtb> Normal end.
B-factor analysis
Bfactors> Version 1.22, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 260211175807979148.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
260211175807979148.eigenfacs
Getnam> Corresponding pdb filename ?
Getnam> 260211175807979148.atom
Openam> file on opening on unit 11:
260211175807979148.atom
Getnum> Number of skipped eigenvectors ?
Getnum> 0
Getnum> Number of usefull eigenvectors ?
Getnum> 10000
%Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 596
First residue number = 18
Last residue number = 315
Number of atoms found = 4512
Mean number per residue = 7.6
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9922E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9951E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9962E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9966E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0002E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0003E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.478
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.990
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.345
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.437
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.617
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.059
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.384
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.658
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.956
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.37
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.20
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.61
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.88
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.90
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.37
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.62
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.14
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.51
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.50
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.94
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.90
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.07
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.33
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.17
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.95
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.60
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.64
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.20
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.05
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.07
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.04
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.50
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.82
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.66
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.91
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.60
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.51
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.72
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.15
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.71
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.79
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.13
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.69
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.58
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.97
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.59
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.39
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.00
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.85
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.90
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.37
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.00
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.38
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.94
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.35
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.57
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.80
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.68
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.20
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.38
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.58
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.64
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.86
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.66
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.77
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.84
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.35
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.79
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.39
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.39
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.86
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.05
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.29
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.08
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.86
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.89
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.15
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.53
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.25
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.39
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.77
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.18
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.36
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.97
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 50.63
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 51.19
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 51.33
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 52.53
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 52.75
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 52.98
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 53.27
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 54.32
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 54.77
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 55.18
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 56.09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 56.32
Bfactors> 106 vectors, 13536 coordinates in file.
Openam> file on opening on unit 12:
bfactors.pred
Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000
Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 1.478000
Bfactors> 100 eigenvectors will be considered.
Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped.
Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed.
(CHARMM units assumed for eigenvalues)
Bfactors> Correlation= -0.306 for 596 C-alpha atoms.
Bfactors> = 0.019 +/- 0.02
Bfactors> = 90.058 +/- 6.48
Bfactors> Shiftng-fct= 90.039
Bfactors> Scaling-fct= 335.288
Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved.
Bfactors> Normal end.
check_modes
Chkmod> Version 1.00, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 260211175807979148.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
260211175807979148.eigenfacs
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4325E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4330E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4332E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4332E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4342E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4343E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 132.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 153.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 166.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 253.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 257.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 267.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 314.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 337.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 342.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 349.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 363.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 370.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 389.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 404.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 411.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 415.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 422.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 427.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 441.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 446.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 459.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 461.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 464.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 475.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 485.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 492.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 493.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 500.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 509.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 510.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 521.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 521.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 526.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 530.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 544.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 550.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 552.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 560.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 569.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 571.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 576.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 581.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 582.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 586.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 591.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 600.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 604.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 610.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 618.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 623.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 631.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 632.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 636.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 642.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 645.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 651.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 654.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 656.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 667.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 675.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 679.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 681.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 683.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 683.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 685.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 692.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 693.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 693.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 698.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 702.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 704.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 707.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 715.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 719.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 720.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 722.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 729.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 735.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 735.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 737.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 740.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 746.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 747.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 750.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 753.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 760.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 762.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 767.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 772.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 776.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 778.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 787.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 788.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 790.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 792.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 800.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 803.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 806.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 813.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 814.9
Chkmod> 106 vectors, 13536 coordinates in file.
Chkmod> That is: 4512 cartesian points.
Openam> file on opening on unit 11:
Chkmod.res
Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file.
%Chkmod-Wn> Norm of vector 14 is: 1.0001 (instead of 1.0000).
Chkmod> Normal end.
0.0034 0.7364
0.0034 0.9789
0.0034 0.7558
0.0034 0.9902
0.0034 0.8904
0.0034 0.8072
132.0121 0.7162
153.1804 0.7158
166.2831 0.7518
253.1957 0.7727
257.3528 0.8318
267.2866 0.7771
314.4143 0.3688
337.4584 0.2106
342.6250 0.5620
349.6762 0.3421
363.4006 0.3506
369.9924 0.2135
389.7037 0.2794
404.8406 0.4293
411.6281 0.3823
415.1933 0.2695
422.5125 0.0994
427.6442 0.1240
441.0813 0.4237
446.9237 0.3056
459.4129 0.4635
461.5893 0.2935
464.8982 0.2954
475.4312 0.2784
485.0071 0.5712
492.8449 0.4222
493.3231 0.5102
499.9707 0.4042
509.8952 0.5517
510.1264 0.5960
521.2162 0.4574
521.7814 0.4549
526.3936 0.5595
529.9654 0.6870
544.0183 0.5839
550.0535 0.4855
552.7266 0.4339
560.0379 0.4087
569.5370 0.4715
571.7067 0.2542
576.1238 0.4193
581.8261 0.3549
582.6362 0.3330
586.0665 0.3902
591.6730 0.2827
600.4756 0.4111
604.2925 0.3636
610.3114 0.4521
617.9909 0.3087
623.7831 0.4282
631.7656 0.3824
632.2320 0.3887
636.5997 0.4248
642.4076 0.5767
645.8855 0.3602
650.9770 0.3576
654.6797 0.2510
656.6578 0.4246
667.6095 0.2949
675.3360 0.2135
679.8603 0.5239
681.4194 0.4041
683.1476 0.2222
683.6652 0.4789
685.5597 0.5259
692.4052 0.3375
693.3412 0.4058
693.9361 0.2468
698.2555 0.3699
701.9607 0.3965
703.9735 0.4606
706.9820 0.3586
715.2724 0.3744
719.1359 0.5846
720.6918 0.3681
722.6524 0.3124
729.0689 0.5350
735.3493 0.4546
735.5897 0.4388
737.6706 0.5036
740.7014 0.3864
746.4102 0.3792
747.5151 0.3313
750.5062 0.4324
753.7200 0.5364
760.3396 0.5431
762.8940 0.5698
767.5935 0.4444
772.6461 0.3153
776.9073 0.2786
777.9690 0.4611
787.0102 0.4915
788.6565 0.4776
790.3739 0.5001
792.5342 0.5535
800.3068 0.4108
803.6149 0.4488
806.6172 0.4167
813.2412 0.5526
814.9068 0.4061
getting mode 7
running: ../../bin/get_modes.sh 260211175807979148 7 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 7
calculating perturbed structure for DQ=-100
260211175807979148.eigenfacs
260211175807979148.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
260211175807979148.eigenfacs
260211175807979148.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
260211175807979148.eigenfacs
260211175807979148.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
260211175807979148.eigenfacs
260211175807979148.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
260211175807979148.eigenfacs
260211175807979148.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
260211175807979148.eigenfacs
260211175807979148.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
260211175807979148.eigenfacs
260211175807979148.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
260211175807979148.eigenfacs
260211175807979148.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
260211175807979148.eigenfacs
260211175807979148.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
260211175807979148.eigenfacs
260211175807979148.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
260211175807979148.eigenfacs
260211175807979148.atom
making animated gifs
11 models are in 260211175807979148.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 260211175807979148.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 260211175807979148.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 8
running: ../../bin/get_modes.sh 260211175807979148 8 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 8
calculating perturbed structure for DQ=-100
260211175807979148.eigenfacs
260211175807979148.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
260211175807979148.eigenfacs
260211175807979148.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
260211175807979148.eigenfacs
260211175807979148.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
260211175807979148.eigenfacs
260211175807979148.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
260211175807979148.eigenfacs
260211175807979148.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
260211175807979148.eigenfacs
260211175807979148.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
260211175807979148.eigenfacs
260211175807979148.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
260211175807979148.eigenfacs
260211175807979148.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
260211175807979148.eigenfacs
260211175807979148.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
260211175807979148.eigenfacs
260211175807979148.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
260211175807979148.eigenfacs
260211175807979148.atom
making animated gifs
11 models are in 260211175807979148.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 260211175807979148.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 260211175807979148.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 9
running: ../../bin/get_modes.sh 260211175807979148 9 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 9
calculating perturbed structure for DQ=-100
260211175807979148.eigenfacs
260211175807979148.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
260211175807979148.eigenfacs
260211175807979148.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
260211175807979148.eigenfacs
260211175807979148.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
260211175807979148.eigenfacs
260211175807979148.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
260211175807979148.eigenfacs
260211175807979148.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
260211175807979148.eigenfacs
260211175807979148.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
260211175807979148.eigenfacs
260211175807979148.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
260211175807979148.eigenfacs
260211175807979148.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
260211175807979148.eigenfacs
260211175807979148.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
260211175807979148.eigenfacs
260211175807979148.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
260211175807979148.eigenfacs
260211175807979148.atom
making animated gifs
11 models are in 260211175807979148.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 260211175807979148.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 260211175807979148.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 10
running: ../../bin/get_modes.sh 260211175807979148 10 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 10
calculating perturbed structure for DQ=-100
260211175807979148.eigenfacs
260211175807979148.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
260211175807979148.eigenfacs
260211175807979148.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
260211175807979148.eigenfacs
260211175807979148.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
260211175807979148.eigenfacs
260211175807979148.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
260211175807979148.eigenfacs
260211175807979148.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
260211175807979148.eigenfacs
260211175807979148.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
260211175807979148.eigenfacs
260211175807979148.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
260211175807979148.eigenfacs
260211175807979148.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
260211175807979148.eigenfacs
260211175807979148.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
260211175807979148.eigenfacs
260211175807979148.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
260211175807979148.eigenfacs
260211175807979148.atom
making animated gifs
11 models are in 260211175807979148.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 260211175807979148.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 260211175807979148.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 11
running: ../../bin/get_modes.sh 260211175807979148 11 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 11
calculating perturbed structure for DQ=-100
260211175807979148.eigenfacs
260211175807979148.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
260211175807979148.eigenfacs
260211175807979148.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
260211175807979148.eigenfacs
260211175807979148.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
260211175807979148.eigenfacs
260211175807979148.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
260211175807979148.eigenfacs
260211175807979148.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
260211175807979148.eigenfacs
260211175807979148.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
260211175807979148.eigenfacs
260211175807979148.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
260211175807979148.eigenfacs
260211175807979148.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
260211175807979148.eigenfacs
260211175807979148.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
260211175807979148.eigenfacs
260211175807979148.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
260211175807979148.eigenfacs
260211175807979148.atom
making animated gifs
11 models are in 260211175807979148.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 260211175807979148.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 260211175807979148.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
260211175807979148.10.pdb
260211175807979148.11.pdb
260211175807979148.7.pdb
260211175807979148.8.pdb
260211175807979148.9.pdb
STDERR:
Note: The following floating-point exceptions are signalling: IEEE_DENORMAL
real 0m31.439s
user 0m31.303s
sys 0m0.110s
rm: cannot remove '260211175807979148.sdijf': No such file or directory
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
If you find results from this site helpful for your research, please cite one of our papers:
elNémo
is maintained by Yves-Henri Sanejouand.
It was developed
by Karsten Suhre.
Between 2003 and 2014, it was hosted by IGS (Marseille).
Between 2015 and 2025, it was hosted by US2B (Nantes).
Last modification: december 26th, 2025.
|