CNRS Nantes University US2B US2B
home |  start a new run |  job status |  references&downloads |  examples |  help  

Should you encounter any unexpected behaviour,
please let us know.
 elNémo has been hacked on november 27th.
It has been moved away and runs again.
**Still some additional cleaning from time to time**
Sorry for the inconvenience.


***  HYDROLASE 10-FEB-15 4Y4D  ***

CA distance fluctuations for 2602120909361234529

---  normal mode 10  ---

This matrix displays the maximum distance fluctuations between all pairs of CA atoms and between the two extreme conformations that were computed for this mode (DQMIN/DQMAX). Distance increases are plotted in blue and decreases in red for the strongest 10% of the residue pair distance changes. Every pixel corresponds to a single residue. Grey lines are drawn every 10 residues, yellow lines every 100 residues (counting from the upper left corner).

The following table indicates for every residue the two corresponding residues with the strongest CA distance fluctuations.

[HELP on distance fluctuations]

GD ok
largest increasereflargest decrease
GLY 3 0.04 SER 1 -0.27 THR 285
GLY 3 0.04 SER 1 -0.27 THR 285
GLY 3 0.05 THR 2 -0.30 THR 285
THR 2 0.05 GLY 3 -0.33 THR 285
SER 115 0.06 SER 4 -0.38 THR 285
SER 115 0.06 ALA 5 -0.42 THR 285
SER 115 0.07 THR 6 -0.49 THR 285
SER 115 0.09 THR 7 -0.50 THR 285
SER 115 0.10 THR 8 -0.60 THR 285
GLU 118 0.14 PRO 9 -0.65 THR 285
GLU 118 0.16 ILE 10 -0.63 THR 285
GLU 118 0.22 ASP 11 -0.80 THR 285
GLU 118 0.21 SER 12 -1.01 THR 285
GLU 118 0.28 LEU 13 -0.76 THR 285
SER 115 0.27 ASP 14 -0.61 THR 285
SER 115 0.34 ASP 15 -0.60 VAL 248
SER 115 0.26 ALA 16 -0.52 VAL 248
SER 115 0.17 TYR 17 -0.49 THR 285
GLU 118 0.08 ILE 18 -0.46 THR 285
SER 115 0.05 THR 19 -0.43 THR 285
SER 256 0.04 PRO 20 -0.41 THR 285
THR 102 0.04 VAL 21 -0.35 SER 247
THR 102 0.05 GLN 22 -0.32 SER 247
GLY 301 0.04 ILE 23 -0.31 SER 247
ALA 27 0.05 GLY 24 -0.28 SER 247
GLY 301 0.04 THR 25 -0.26 SER 247
GLY 301 0.04 PRO 26 -0.27 SER 247
GLY 24 0.05 ALA 27 -0.29 SER 247
GLY 301 0.05 GLN 28 -0.31 SER 247
SER 256 0.04 THR 29 -0.34 SER 247
GLY 301 0.05 LEU 30 -0.37 SER 247
SER 256 0.05 ASN 31 -0.41 SER 247
SER 256 0.05 LEU 32 -0.42 SER 247
PHE 116 0.10 ASP 33 -0.45 SER 247
SER 115 0.10 PHE 34 -0.39 SER 247
SER 115 0.15 ASP 35 -0.40 GLY 249
SER 115 0.14 THR 36 -0.35 GLY 249
ALA 218 0.17 GLY 37 -0.37 GLY 249
TRP 195 0.14 SER 38 -0.38 SER 247
ALA 129 0.14 SER 39 -0.35 SER 247
TRP 197 0.10 ASP 40 -0.36 SER 247
GLY 127 0.10 LEU 41 -0.36 SER 247
ILE 302 0.11 TRP 42 -0.37 SER 247
GLY 301 0.12 VAL 43 -0.37 SER 247
GLY 301 0.14 PHE 44 -0.37 SER 247
GLY 301 0.14 SER 45 -0.32 SER 247
GLY 301 0.14 SER 46 -0.29 SER 247
GLY 301 0.17 GLU 47 -0.27 SER 247
GLY 301 0.19 THR 48 -0.30 SER 247
GLY 301 0.22 THR 49 -0.27 SER 247
GLY 281 0.21 ALA 50 -0.26 SER 247
GLY 281 0.27 SER 51 -0.26 SER 247
GLY 281 0.26 GLU 52 -0.33 SER 247
GLY 281 0.21 VAL 53 -0.35 SER 247
GLY 281 0.22 ASP 54 -0.38 SER 247
GLY 281 0.22 ASP 54 -0.38 SER 247
GLY 281 0.14 GLY 55 -0.40 SER 247
GLY 301 0.11 GLN 56 -0.41 SER 247
GLY 301 0.09 THR 57 -0.37 SER 247
GLY 301 0.11 ILE 58 -0.34 SER 247
GLY 301 0.10 TYR 59 -0.32 SER 247
GLY 301 0.11 THR 60 -0.28 SER 247
GLY 301 0.10 PRO 61 -0.27 SER 247
GLY 301 0.10 SER 62 -0.24 SER 247
GLY 301 0.08 LYS 63 -0.25 SER 247
GLY 301 0.07 SER 64 -0.26 SER 247
LYS 68 0.07 THR 65 -0.24 SER 247
ASN 134 0.06 THR 66 -0.24 SER 247
GLY 301 0.07 ALA 67 -0.25 SER 247
GLY 301 0.08 LYS 68 -0.24 SER 247
GLY 301 0.10 LEU 69 -0.24 SER 247
GLY 301 0.09 LEU 70 -0.24 SER 247
GLY 301 0.11 SER 71 -0.22 SER 247
GLY 301 0.13 GLY 72 -0.22 SER 247
GLY 301 0.13 ALA 73 -0.25 SER 247
GLY 301 0.17 THR 74 -0.27 SER 247
GLY 301 0.18 TRP 75 -0.30 SER 247
GLY 301 0.24 SER 76 -0.33 SER 247
GLY 301 0.26 ILE 77 -0.38 SER 247
GLY 301 0.35 SER 78 -0.43 SER 247
GLY 301 0.35 SER 78 -0.43 SER 247
ILE 302 0.33 TYR 79 -0.48 SER 247
ILE 302 0.45 GLY 80 -0.53 SER 246
ILE 300 0.46 ASP 81 -0.62 SER 247
ILE 300 0.45 GLY 82 -0.58 SER 247
ILE 300 0.36 SER 83 -0.54 SER 247
GLY 301 0.31 SER 84 -0.44 SER 247
GLY 301 0.26 SER 85 -0.39 SER 247
GLY 301 0.23 SER 86 -0.33 SER 247
GLY 301 0.20 GLY 87 -0.30 SER 247
GLY 301 0.16 ASP 88 -0.28 SER 247
GLY 301 0.12 VAL 89 -0.28 SER 247
GLY 301 0.09 TYR 90 -0.27 SER 247
ASN 134 0.07 THR 91 -0.27 SER 247
ASN 134 0.05 ASP 92 -0.27 SER 247
ALA 27 0.04 THR 93 -0.28 SER 247
THR 102 0.05 VAL 94 -0.30 SER 247
VAL 21 0.03 SER 95 -0.29 SER 247
THR 100 0.04 VAL 96 -0.33 THR 285
SER 115 0.04 GLY 97 -0.36 THR 285
LEU 99 0.04 GLY 98 -0.33 THR 285
GLY 98 0.04 LEU 99 -0.30 THR 285
PHE 144 0.04 THR 100 -0.26 SER 247
SER 256 0.02 VAL 101 -0.27 SER 247
VAL 94 0.05 THR 102 -0.26 SER 247
ALA 27 0.04 GLY 103 -0.26 SER 247
ASN 134 0.04 GLN 104 -0.29 SER 247
ASN 134 0.06 ALA 105 -0.30 SER 247
GLY 301 0.08 VAL 106 -0.31 SER 247
GLY 301 0.12 GLU 107 -0.32 SER 247
GLY 301 0.14 SER 108 -0.32 SER 247
GLY 301 0.18 ALA 109 -0.33 SER 247
GLY 301 0.21 LYS 110 -0.29 SER 247
GLY 301 0.25 LYS 111 -0.32 SER 247
GLY 301 0.26 VAL 112 -0.39 SER 247
ILE 300 0.31 SER 113 -0.42 SER 247
GLY 281 0.37 SER 114 -0.45 SER 247
THR 223 0.40 SER 115 -0.58 SER 247
THR 223 0.40 SER 115 -0.58 SER 247
THR 222 0.30 PHE 116 -0.52 SER 247
GLY 281 0.28 THR 117 -0.45 SER 247
GLY 281 0.35 GLU 118 -0.52 SER 247
ASP 15 0.26 ASP 119 -0.57 SER 247
ASP 15 0.16 SER 120 -0.49 SER 247
THR 57 0.08 THR 121 -0.50 SER 247
THR 222 0.09 ILE 122 -0.50 SER 247
THR 222 0.10 ASP 123 -0.43 SER 247
GLY 221 0.12 GLY 124 -0.43 SER 247
ASP 35 0.11 LEU 125 -0.43 SER 247
TRP 197 0.06 LEU 126 -0.38 SER 247
LEU 41 0.10 GLY 127 -0.37 SER 247
SER 115 0.08 LEU 128 -0.32 SER 247
SER 39 0.14 ALA 129 -0.30 GLY 249
SER 39 0.11 PHE 130 -0.27 SER 247
TRP 197 0.07 SER 131 -0.29 SER 247
THR 190 0.11 THR 132 -0.27 SER 246
THR 135 0.18 LEU 133 -0.31 SER 246
VAL 136 0.13 ASN 134 -0.32 SER 247
GLN 192 0.19 THR 135 -0.31 SER 247
GLN 192 0.14 VAL 136 -0.29 SER 247
GLN 192 0.16 SER 137 -0.26 SER 247
GLN 192 0.14 PRO 138 -0.24 SER 247
GLN 192 0.08 THR 139 -0.25 SER 247
GLN 192 0.08 GLN 140 -0.27 SER 247
TRP 197 0.06 GLN 141 -0.28 SER 247
TRP 197 0.04 LYS 142 -0.29 SER 247
TRP 197 0.04 THR 143 -0.31 SER 247
THR 100 0.04 PHE 144 -0.30 SER 247
SER 115 0.04 PHE 145 -0.28 SER 247
THR 100 0.03 ASP 146 -0.26 SER 247
SER 115 0.03 ASP 146 -0.26 SER 247
THR 100 0.04 ASN 147 -0.26 SER 247
THR 100 0.03 ALA 148 -0.26 SER 247
SER 115 0.04 LYS 149 -0.23 SER 247
SER 115 0.02 ALA 150 -0.22 SER 247
GLY 3 0.03 SER 151 -0.23 THR 285
GLY 3 0.03 SER 151 -0.23 THR 285
SER 115 0.04 LEU 152 -0.25 THR 285
SER 115 0.05 ASP 153 -0.26 THR 285
SER 115 0.06 SER 154 -0.25 THR 285
SER 115 0.06 PRO 155 -0.23 THR 285
SER 115 0.08 VAL 156 -0.26 THR 285
SER 115 0.09 PHE 157 -0.29 THR 285
SER 115 0.11 THR 158 -0.33 THR 285
SER 115 0.14 ALA 159 -0.36 THR 285
SER 115 0.14 ASP 160 -0.42 THR 285
SER 115 0.17 LEU 161 -0.47 THR 285
SER 115 0.16 GLY 162 -0.56 THR 285
SER 115 0.20 TYR 163 -0.61 THR 285
SER 115 0.18 HIS 164 -0.76 THR 285
SER 115 0.13 ALA 165 -0.71 THR 285
SER 115 0.11 PRO 166 -0.62 THR 285
SER 115 0.11 GLY 167 -0.53 THR 285
SER 115 0.10 THR 168 -0.46 THR 285
SER 115 0.09 TYR 169 -0.39 THR 285
SER 115 0.07 ASN 170 -0.36 THR 285
SER 115 0.06 PHE 171 -0.31 THR 285
SER 115 0.06 GLY 172 -0.29 THR 285
SER 115 0.07 PHE 173 -0.30 THR 285
SER 115 0.09 ILE 174 -0.32 THR 285
SER 115 0.08 ASP 175 -0.35 THR 285
SER 115 0.09 THR 176 -0.34 THR 285
SER 115 0.08 THR 177 -0.38 THR 285
SER 115 0.10 ALA 178 -0.40 THR 285
SER 115 0.12 TYR 179 -0.38 THR 285
SER 115 0.12 THR 180 -0.35 THR 285
SER 206 0.13 GLY 181 -0.30 THR 285
SER 115 0.12 SER 182 -0.28 THR 285
SER 115 0.12 SER 182 -0.28 THR 285
SER 115 0.13 ILE 183 -0.27 THR 285
SER 115 0.14 THR 184 -0.23 THR 285
SER 115 0.13 TYR 185 -0.21 THR 285
SER 78 0.15 THR 186 -0.18 THR 285
SER 78 0.15 ALA 187 -0.15 THR 285
SER 78 0.16 VAL 188 -0.15 GLY 249
SER 78 0.17 SER 189 -0.14 GLY 249
SER 78 0.15 THR 190 -0.19 SER 246
SER 78 0.17 LYS 191 -0.17 SER 246
SER 78 0.22 GLN 192 -0.22 SER 246
THR 135 0.18 GLY 193 -0.25 SER 246
SER 78 0.21 PHE 194 -0.25 GLY 249
SER 78 0.19 TRP 195 -0.23 GLY 249
SER 78 0.22 GLU 196 -0.18 GLY 249
SER 78 0.22 TRP 197 -0.13 THR 285
GLY 80 0.22 THR 198 -0.10 THR 285
GLY 80 0.22 SER 199 -0.13 THR 285
GLY 80 0.20 THR 200 -0.12 THR 285
ASP 81 0.21 GLY 201 -0.11 THR 285
SER 115 0.19 TYR 202 -0.13 THR 285
SER 115 0.18 ALA 203 -0.15 THR 285
LYS 243 0.19 VAL 204 -0.15 THR 285
LYS 243 0.17 GLY 205 -0.22 THR 285
LYS 243 0.17 SER 206 -0.22 THR 285
LYS 243 0.17 SER 206 -0.22 THR 285
LYS 243 0.25 GLY 207 -0.13 THR 285
ALA 234 0.27 THR 208 -0.12 THR 285
ALA 234 0.27 THR 208 -0.11 THR 285
LYS 243 0.19 PHE 209 -0.13 THR 285
SER 246 0.20 LYS 210 -0.08 GLY 281
ASP 81 0.19 SER 211 -0.08 THR 285
ASP 81 0.21 THR 212 -0.05 GLY 281
GLY 80 0.22 SER 213 -0.06 THR 285
GLY 80 0.26 ILE 214 -0.05 THR 285
GLY 80 0.28 ASP 215 -0.06 ALA 187
GLY 80 0.28 ASP 215 -0.06 ALA 187
GLY 80 0.32 GLY 216 -0.12 GLY 249
GLY 80 0.28 ILE 217 -0.21 GLY 249
SER 83 0.22 ALA 218 -0.25 GLY 249
SER 115 0.24 ASP 219 -0.35 GLY 249
SER 115 0.23 THR 220 -0.39 GLY 249
SER 115 0.27 GLY 221 -0.47 GLY 249
SER 115 0.37 THR 222 -0.52 GLY 249
SER 115 0.40 THR 223 -0.50 GLY 249
SER 115 0.36 LEU 224 -0.39 GLY 249
SER 115 0.31 LEU 225 -0.23 GLY 249
ASP 81 0.36 TYR 226 -0.15 SER 244
ASP 81 0.31 LEU 227 -0.08 SER 240
ASP 81 0.27 PRO 228 -0.10 SER 240
GLY 249 0.28 ALA 229 -0.14 SER 240
SER 246 0.33 THR 230 -0.13 ALA 234
SER 246 0.21 VAL 231 -0.09 TYR 235
GLY 250 0.21 VAL 232 -0.11 TYR 235
SER 244 0.35 SER 233 -0.16 SER 240
SER 244 0.28 ALA 234 -0.13 THR 230
SER 244 0.20 TYR 235 -0.11 VAL 232
LYS 243 0.30 TRP 236 -0.13 VAL 239
LYS 243 0.42 ALA 237 -0.14 VAL 239
LYS 243 0.30 GLN 238 -0.14 SER 256
LYS 243 0.18 VAL 239 -0.14 ALA 237
GLY 207 0.15 SER 240 -0.16 SER 233
GLY 207 0.15 SER 240 -0.16 SER 233
THR 208 0.16 GLY 241 -0.16 GLY 299
SER 245 0.17 ALA 242 -0.16 GLY 299
ALA 237 0.42 LYS 243 -0.22 GLY 299
ALA 237 0.35 SER 244 -0.27 THR 222
ALA 237 0.33 SER 245 -0.38 ASP 81
SER 233 0.33 SER 246 -0.62 ASP 81
SER 233 0.27 SER 247 -0.62 ASP 81
ALA 229 0.25 VAL 248 -0.60 ASP 15
ALA 229 0.28 GLY 249 -0.57 ASP 15
ALA 229 0.27 GLY 250 -0.36 THR 222
GLY 250 0.20 TYR 251 -0.22 ASP 15
ALA 237 0.15 VAL 252 -0.23 ASP 15
SER 114 0.11 PHE 253 -0.12 ASP 15
SER 114 0.11 PRO 254 -0.10 PRO 282
SER 114 0.20 CYS 255 -0.17 THR 258
SER 114 0.19 SER 256 -0.14 THR 285
SER 114 0.16 ALA 257 -0.18 THR 285
SER 114 0.17 THR 258 -0.28 THR 285
SER 114 0.18 LEU 259 -0.28 GLY 281
SER 115 0.18 PRO 260 -0.24 THR 285
SER 115 0.19 SER 261 -0.28 THR 285
SER 115 0.21 PHE 262 -0.22 THR 285
SER 115 0.19 THR 263 -0.22 THR 285
SER 115 0.20 PHE 264 -0.19 THR 285
SER 115 0.19 GLY 265 -0.18 THR 285
SER 115 0.17 VAL 266 -0.19 THR 285
GLY 80 0.16 GLY 267 -0.16 THR 285
SER 115 0.15 SER 268 -0.18 THR 285
SER 115 0.15 ALA 269 -0.22 THR 285
SER 115 0.17 ARG 270 -0.23 THR 285
SER 115 0.18 ILE 271 -0.27 THR 285
SER 115 0.19 VAL 272 -0.30 THR 285
SER 115 0.22 ILE 273 -0.33 THR 285
SER 115 0.20 PRO 274 -0.38 THR 285
SER 115 0.21 GLY 275 -0.35 THR 285
SER 115 0.22 ASP 276 -0.48 THR 285
SER 115 0.22 ASP 276 -0.48 THR 285
SER 115 0.24 TYR 277 -0.46 THR 285
SER 115 0.26 ILE 278 -0.33 THR 285
SER 115 0.26 ASP 279 -0.46 GLY 281
SER 115 0.31 PHE 280 -0.48 ILE 283
SER 114 0.37 GLY 281 -0.46 ASP 279
SER 114 0.30 PRO 282 -0.39 SER 12
GLY 299 0.19 ILE 283 -0.63 LEU 13
THR 285 0.23 SER 284 -0.82 SER 12
SER 284 0.23 THR 285 -1.01 SER 12
SER 114 0.17 GLY 286 -0.60 SER 12
GLY 286 0.16 SER 287 -0.41 SER 12
SER 114 0.11 SER 288 -0.17 SER 12
ALA 242 0.10 SER 289 -0.22 ASP 11
ALA 242 0.10 SER 289 -0.22 ASP 11
SER 114 0.19 CYS 290 -0.21 PHE 280
SER 114 0.21 PHE 291 -0.28 PHE 280
SER 114 0.24 GLY 292 -0.13 TYR 251
SER 115 0.29 GLY 293 -0.22 GLY 249
SER 115 0.27 ILE 294 -0.10 THR 285
SER 114 0.26 GLN 295 -0.16 SER 244
SER 114 0.26 SER 296 -0.16 ALA 242
ASP 81 0.38 SER 297 -0.17 SER 244
ASP 81 0.31 ALA 298 -0.16 LYS 243
ASP 81 0.31 ALA 298 -0.16 LYS 243
GLY 82 0.37 GLY 299 -0.22 SER 244
GLY 82 0.38 GLY 299 -0.26 SER 244
ASP 81 0.46 ILE 300 -0.26 SER 246
GLY 82 0.41 GLY 301 -0.16 SER 244
GLY 80 0.45 ILE 302 -0.15 SER 246
GLY 80 0.38 ASN 303 -0.12 SER 246
GLY 80 0.37 ILE 304 -0.23 GLY 249
ASP 81 0.28 PHE 305 -0.22 GLY 249
SER 115 0.31 GLY 306 -0.34 GLY 249
SER 115 0.30 ASP 307 -0.35 GLY 249
SER 115 0.29 VAL 308 -0.33 THR 285
SER 115 0.25 ALA 309 -0.29 THR 285
SER 115 0.23 LEU 310 -0.33 THR 285
SER 115 0.22 LYS 311 -0.42 THR 285
SER 115 0.22 LYS 311 -0.42 THR 285
SER 115 0.20 ALA 312 -0.39 THR 285
SER 115 0.18 ALA 313 -0.36 THR 285
SER 115 0.15 PHE 314 -0.36 THR 285
SER 115 0.15 VAL 315 -0.31 THR 285
SER 115 0.13 VAL 316 -0.28 THR 285
SER 115 0.12 PHE 317 -0.25 THR 285
SER 115 0.10 ASN 318 -0.23 THR 285
SER 115 0.08 GLY 319 -0.21 THR 285
SER 115 0.07 ALA 320 -0.19 THR 285
SER 78 0.06 THR 321 -0.17 GLY 249
SER 78 0.09 THR 322 -0.16 THR 285
SER 78 0.11 PRO 323 -0.27 PRO 323
SER 78 0.11 PRO 323 -0.27 PRO 323
SER 78 0.12 THR 324 -0.19 THR 285
SER 115 0.14 LEU 325 -0.22 THR 285
SER 115 0.14 LEU 325 -0.21 THR 285
SER 115 0.14 GLY 326 -0.25 THR 285
SER 115 0.16 PHE 327 -0.27 THR 285
SER 115 0.15 ALA 328 -0.31 THR 285
SER 115 0.15 SER 329 -0.34 THR 285
SER 115 0.15 SER 329 -0.34 THR 285
SER 115 0.14 LYS 330 -0.40 THR 285

If you find results from this site helpful for your research, please cite one of our papers:

elNémo is maintained by Yves-Henri Sanejouand.
It was developed by Karsten Suhre.
Between 2003 and 2014, it was hosted by IGS (Marseille).
Between 2015 and 2025, it was hosted by US2B (Nantes).
Last modification: december 26th, 2025.