CNRS Nantes University US2B US2B
home |  start a new run |  job status |  references&downloads |  examples |  help  

Should you encounter any unexpected behaviour,
please let us know.
elNémo has been hacked on november 27th.
It has been moved away and runs again.
**Still some additional cleaning from time to time**
Sorry for the inconvenience.


***  HYDROLASE 10-FEB-15 4Y4D  ***

LOGs for ID: 2602120909361234529

Output from eigenvector calculation:


STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8) Build Tirion matrix: Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model. Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004. Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file. Pdbmat> Coordinate filename = 2602120909361234529.atom Pdbmat> Distance cutoff = 8.00 Force constant = 10.00 Origin of mass values = CONS Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09 PRINTing level = 2 Pdbmat> Coordinate file 2602120909361234529.atom to be opened. Openam> File opened: 2602120909361234529.atom Pdbmat> Coordinate file in PDB format. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 330 First residue number = 1 Last residue number = 330 Number of atoms found = 4795 Mean number per residue = 14.5 Pdbmat> Coordinate statistics: = 4.150161 +/- 10.486159 From: -22.922000 To: 28.173000 = 0.749669 +/- 9.150980 From: -22.622000 To: 22.949000 = 5.666198 +/- 13.626673 From: -23.391000 To: 38.423000 Pdbmat> Masses are all set to one. Openam> File opened: pdbmat.xyzm Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved. Openam> File opened: pdbmat.sdijb Pdbmat> Matrix statistics: Pdbmat> The matrix is 3.5655 % Filled. Pdbmat> 3689268 non-zero elements. Pdbmat> 406792 atom-atom interactions. Pdbmat> Number per atom= 169.67 +/- 50.37 Maximum number = 263 Minimum number = 35 Pdbmat> Matrix trace = 8.135840E+06 Pdbmat> Larger element = 1030.73 Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10 Pdbmat> Normal end. automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1) 330 non-zero elements, NRBL set to 2 Diagonalize Tirion matrix using diagrtb Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation. Diagrtb> Version 2.52, November 2004. Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file. Diagrtb> Options taken into account: MATRix filename = pdbmat.sdijb COORdinates filename = 2602120909361234529.atom Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb Nb of VECTors required = 106 EigeNVALues chosen = LOWE Type of SUBStructuring = NONE Nb of residues per BLOck = 2 Origin of MASS values = CONS MATRix FORMat = BINA Temporary files cleaning = ALL Output PRINting level = 2 Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb. Blocpdb> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.xyzm Blocpdb> Coordinate file 2602120909361234529.atom to be opened. Openam> file on opening on unit 11: 2602120909361234529.atom Blocpdb> Coordinate file in PDB format. Blocpdb> 4795 atoms picked in pdb file. Blocpdb> All masses set to unity. Blocpdb> Coordinate file is rewritten. Blocpdb> Substructuring: Blocpdb> 2 residue(s) per block. Blocpdb> 330 residues. Blocpdb> 37 atoms in block 1 Block first atom: 1 Blocpdb> 18 atoms in block 2 Block first atom: 38 Blocpdb> 24 atoms in block 3 Block first atom: 56 Blocpdb> 28 atoms in block 4 Block first atom: 80 Blocpdb> 33 atoms in block 5 Block first atom: 108 Blocpdb> 23 atoms in block 6 Block first atom: 141 Blocpdb> 31 atoms in block 7 Block first atom: 164 Blocpdb> 22 atoms in block 8 Block first atom: 195 Blocpdb> 40 atoms in block 9 Block first atom: 217 Blocpdb> 28 atoms in block 10 Block first atom: 257 Blocpdb> 33 atoms in block 11 Block first atom: 285 Blocpdb> 26 atoms in block 12 Block first atom: 318 Blocpdb> 28 atoms in block 13 Block first atom: 344 Blocpdb> 27 atoms in block 14 Block first atom: 372 Blocpdb> 33 atoms in block 15 Block first atom: 399 Blocpdb> 33 atoms in block 16 Block first atom: 432 Blocpdb> 32 atoms in block 17 Block first atom: 465 Blocpdb> 26 atoms in block 18 Block first atom: 497 Blocpdb> 18 atoms in block 19 Block first atom: 523 Blocpdb> 23 atoms in block 20 Block first atom: 541 Blocpdb> 43 atoms in block 21 Block first atom: 564 Blocpdb> 36 atoms in block 22 Block first atom: 607 Blocpdb> 22 atoms in block 23 Block first atom: 643 Blocpdb> 29 atoms in block 24 Block first atom: 665 Blocpdb> 24 atoms in block 25 Block first atom: 694 Blocpdb> 26 atoms in block 26 Block first atom: 718 Blocpdb> 37 atoms in block 27 Block first atom: 744 Blocpdb> 24 atoms in block 28 Block first atom: 781 Blocpdb> 33 atoms in block 29 Block first atom: 805 Blocpdb> 35 atoms in block 30 Block first atom: 838 Blocpdb> 25 atoms in block 31 Block first atom: 873 Blocpdb> 24 atoms in block 32 Block first atom: 898 Blocpdb> 28 atoms in block 33 Block first atom: 922 Blocpdb> 20 atoms in block 34 Block first atom: 950 Blocpdb> 38 atoms in block 35 Block first atom: 970 Blocpdb> 18 atoms in block 36 Block first atom: 1008 Blocpdb> 24 atoms in block 37 Block first atom: 1026 Blocpdb> 35 atoms in block 38 Block first atom: 1050 Blocpdb> 38 atoms in block 39 Block first atom: 1085 Blocpdb> 28 atoms in block 40 Block first atom: 1123 Blocpdb> 19 atoms in block 41 Block first atom: 1151 Blocpdb> 22 atoms in block 42 Block first atom: 1170 Blocpdb> 22 atoms in block 43 Block first atom: 1192 Blocpdb> 19 atoms in block 44 Block first atom: 1214 Blocpdb> 37 atoms in block 45 Block first atom: 1233 Blocpdb> 26 atoms in block 46 Block first atom: 1270 Blocpdb> 30 atoms in block 47 Block first atom: 1296 Blocpdb> 27 atoms in block 48 Block first atom: 1326 Blocpdb> 14 atoms in block 49 Block first atom: 1353 Blocpdb> 33 atoms in block 50 Block first atom: 1367 Blocpdb> 30 atoms in block 51 Block first atom: 1400 Blocpdb> 24 atoms in block 52 Block first atom: 1430 Blocpdb> 26 atoms in block 53 Block first atom: 1454 Blocpdb> 26 atoms in block 54 Block first atom: 1480 Blocpdb> 23 atoms in block 55 Block first atom: 1506 Blocpdb> 34 atoms in block 56 Block first atom: 1529 Blocpdb> 22 atoms in block 57 Block first atom: 1563 Blocpdb> 39 atoms in block 58 Block first atom: 1585 Blocpdb> 29 atoms in block 59 Block first atom: 1624 Blocpdb> 23 atoms in block 60 Block first atom: 1653 Blocpdb> 33 atoms in block 61 Block first atom: 1676 Blocpdb> 19 atoms in block 62 Block first atom: 1709 Blocpdb> 38 atoms in block 63 Block first atom: 1728 Blocpdb> 26 atoms in block 64 Block first atom: 1766 Blocpdb> 30 atoms in block 65 Block first atom: 1792 Blocpdb> 25 atoms in block 66 Block first atom: 1822 Blocpdb> 33 atoms in block 67 Block first atom: 1847 Blocpdb> 30 atoms in block 68 Block first atom: 1880 Blocpdb> 25 atoms in block 69 Block first atom: 1910 Blocpdb> 31 atoms in block 70 Block first atom: 1935 Blocpdb> 33 atoms in block 71 Block first atom: 1966 Blocpdb> 34 atoms in block 72 Block first atom: 1999 Blocpdb> 41 atoms in block 73 Block first atom: 2033 Blocpdb> 24 atoms in block 74 Block first atom: 2074 Blocpdb> 26 atoms in block 75 Block first atom: 2098 Blocpdb> 38 atoms in block 76 Block first atom: 2124 Blocpdb> 23 atoms in block 77 Block first atom: 2162 Blocpdb> 30 atoms in block 78 Block first atom: 2185 Blocpdb> 34 atoms in block 79 Block first atom: 2215 Blocpdb> 22 atoms in block 80 Block first atom: 2249 Blocpdb> 26 atoms in block 81 Block first atom: 2271 Blocpdb> 37 atoms in block 82 Block first atom: 2297 Blocpdb> 24 atoms in block 83 Block first atom: 2334 Blocpdb> 21 atoms in block 84 Block first atom: 2358 Blocpdb> 35 atoms in block 85 Block first atom: 2379 Blocpdb> 27 atoms in block 86 Block first atom: 2414 Blocpdb> 39 atoms in block 87 Block first atom: 2441 Blocpdb> 26 atoms in block 88 Block first atom: 2480 Blocpdb> 24 atoms in block 89 Block first atom: 2506 Blocpdb> 35 atoms in block 90 Block first atom: 2530 Blocpdb> 29 atoms in block 91 Block first atom: 2565 Blocpdb> 34 atoms in block 92 Block first atom: 2594 Blocpdb> 35 atoms in block 93 Block first atom: 2628 Blocpdb> 26 atoms in block 94 Block first atom: 2663 Blocpdb> 25 atoms in block 95 Block first atom: 2689 Blocpdb> 24 atoms in block 96 Block first atom: 2714 Blocpdb> 27 atoms in block 97 Block first atom: 2738 Blocpdb> 39 atoms in block 98 Block first atom: 2765 Blocpdb> 38 atoms in block 99 Block first atom: 2804 Blocpdb> 25 atoms in block 100 Block first atom: 2842 Blocpdb> 28 atoms in block 101 Block first atom: 2867 Blocpdb> 26 atoms in block 102 Block first atom: 2895 Blocpdb> 26 atoms in block 103 Block first atom: 2921 Blocpdb> 32 atoms in block 104 Block first atom: 2947 Blocpdb> 42 atoms in block 105 Block first atom: 2979 Blocpdb> 25 atoms in block 106 Block first atom: 3021 Blocpdb> 30 atoms in block 107 Block first atom: 3046 Blocpdb> 28 atoms in block 108 Block first atom: 3076 Blocpdb> 29 atoms in block 109 Block first atom: 3104 Blocpdb> 26 atoms in block 110 Block first atom: 3133 Blocpdb> 21 atoms in block 111 Block first atom: 3159 Blocpdb> 33 atoms in block 112 Block first atom: 3180 Blocpdb> 40 atoms in block 113 Block first atom: 3213 Blocpdb> 33 atoms in block 114 Block first atom: 3253 Blocpdb> 24 atoms in block 115 Block first atom: 3286 Blocpdb> 32 atoms in block 116 Block first atom: 3310 Blocpdb> 21 atoms in block 117 Block first atom: 3342 Blocpdb> 45 atoms in block 118 Block first atom: 3363 Blocpdb> 27 atoms in block 119 Block first atom: 3408 Blocpdb> 35 atoms in block 120 Block first atom: 3435 Blocpdb> 17 atoms in block 121 Block first atom: 3470 Blocpdb> 27 atoms in block 122 Block first atom: 3487 Blocpdb> 22 atoms in block 123 Block first atom: 3514 Blocpdb> 27 atoms in block 124 Block first atom: 3536 Blocpdb> 14 atoms in block 125 Block first atom: 3563 Blocpdb> 37 atoms in block 126 Block first atom: 3577 Blocpdb> 34 atoms in block 127 Block first atom: 3614 Blocpdb> 21 atoms in block 128 Block first atom: 3648 Blocpdb> 24 atoms in block 129 Block first atom: 3669 Blocpdb> 33 atoms in block 130 Block first atom: 3693 Blocpdb> 31 atoms in block 131 Block first atom: 3726 Blocpdb> 34 atoms in block 132 Block first atom: 3757 Blocpdb> 23 atoms in block 133 Block first atom: 3791 Blocpdb> 18 atoms in block 134 Block first atom: 3814 Blocpdb> 34 atoms in block 135 Block first atom: 3832 Blocpdb> 35 atoms in block 136 Block first atom: 3866 Blocpdb> 33 atoms in block 137 Block first atom: 3901 Blocpdb> 26 atoms in block 138 Block first atom: 3934 Blocpdb> 40 atoms in block 139 Block first atom: 3960 Blocpdb> 32 atoms in block 140 Block first atom: 4000 Blocpdb> 21 atoms in block 141 Block first atom: 4032 Blocpdb> 30 atoms in block 142 Block first atom: 4053 Blocpdb> 21 atoms in block 143 Block first atom: 4083 Blocpdb> 22 atoms in block 144 Block first atom: 4104 Blocpdb> 29 atoms in block 145 Block first atom: 4126 Blocpdb> 27 atoms in block 146 Block first atom: 4155 Blocpdb> 26 atoms in block 147 Block first atom: 4182 Blocpdb> 28 atoms in block 148 Block first atom: 4208 Blocpdb> 31 atoms in block 149 Block first atom: 4236 Blocpdb> 34 atoms in block 150 Block first atom: 4267 Blocpdb> 26 atoms in block 151 Block first atom: 4301 Blocpdb> 33 atoms in block 152 Block first atom: 4327 Blocpdb> 27 atoms in block 153 Block first atom: 4360 Blocpdb> 28 atoms in block 154 Block first atom: 4387 Blocpdb> 29 atoms in block 155 Block first atom: 4415 Blocpdb> 55 atoms in block 156 Block first atom: 4444 Blocpdb> 30 atoms in block 157 Block first atom: 4499 Blocpdb> 32 atoms in block 158 Block first atom: 4529 Blocpdb> 34 atoms in block 159 Block first atom: 4561 Blocpdb> 17 atoms in block 160 Block first atom: 4595 Blocpdb> 28 atoms in block 161 Block first atom: 4612 Blocpdb> 38 atoms in block 162 Block first atom: 4640 Blocpdb> 42 atoms in block 163 Block first atom: 4678 Blocpdb> 30 atoms in block 164 Block first atom: 4720 Blocpdb> 46 atoms in block 165 Block first atom: 4749 Blocpdb> 165 blocks. Blocpdb> At most, 55 atoms in each of them. Blocpdb> At least, 14 atoms in each of them. Blocpdb> Normal end of Blocpdb. Diagrtb> Memory allocation for Prepmat. Diagrtb> Memory allocation for RTB. Diagrtb> Memory allocation for Diagstd. Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes. Prepmat> Entering in. Prepmat> Rewriting of the matrix begins. Prepmat> 3689433 matrix lines read. Prepmat> Matrix order = 14385 Prepmat> Matrix trace = 8135840.0000 Prepmat> Last element read: 14385 14385 628.2052 Prepmat> 13696 lines saved. Prepmat> 11566 empty lines. Prepmat> Number of lines on output is as expected. Prepmat> Normal end of Prepmat. RTB> Entering in. RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 4795 RTB> Total mass = 4795.0000 RTB> Number of atoms found in matrix: 4795 RTB> Number of blocks = 165 RTB> Projection begins. RTB> Projected matrix is being saved. RTB> Projected matrix trace = 473388.5075 RTB> 74169 non-zero elements. RTB> Normal end of RTB. Diagstd> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.sdijb Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb Diagstd> CERFACS matrix format. Diagstd> Projected matrix order = 990 Diagstd> Nb of non-zero elements: 74169 Diagstd> Projected matrix trace = 473388.5075 Openam> file on opening on unit 11: diagrtb_work.eigenfacs Diagstd> Diagonalization. Diagstd> 990 eigenvectors are computed. Diagstd> 106 of them to be saved. Diagstd> Sum of eigenvalues = 473388.5075 Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000 Diagstd> Selected eigenvalues: 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 4.0672826 5.2569952 7.7613425 14.0353522 14.4253278 16.9596775 21.8700184 22.7175977 24.7861670 27.2564714 29.9610632 30.1645463 31.9447847 35.4430943 37.5711020 38.9902487 39.4712381 41.0197004 43.9296346 44.9920188 47.0333423 47.8288631 50.8009277 50.9458857 52.3032720 54.0278871 56.7087842 58.3458890 59.8791671 60.4072757 61.9511995 63.4397944 64.9518947 67.0759645 69.3784395 69.7168358 70.8705704 72.1553545 72.7502178 76.8103489 77.7948318 80.7482792 83.2979313 83.7879446 86.2001569 86.8054872 89.3169461 90.7406814 91.2996882 92.8861365 94.4392616 95.5489935 96.7475514 98.4763706 100.5001745 101.4256317 103.0255082 103.5789501 106.6053346 107.1532480 108.6045238 109.0887194 111.1955772 113.4104978 114.2206858 116.4054223 118.1900399 118.7248547 119.6891910 120.7984867 122.4779648 123.0830820 123.5778210 125.7966683 128.3958673 129.4006906 132.3524110 133.0682256 133.7106513 135.3262377 136.1132794 136.9413638 138.4909497 139.5797566 142.6305700 143.4551992 144.3231593 145.8052185 147.7200370 149.4670301 150.9501617 152.4462448 153.0346970 154.3754383 155.6917034 157.2846268 157.8533084 159.9278859 160.4225467 162.0748824 Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units): 0.0034272 0.0034322 0.0034346 0.0034347 0.0034352 0.0034357 219.0016844 248.9797762 302.5266954 406.8243485 412.4374806 447.2023486 507.8317558 517.5788039 540.6297811 566.9308578 594.3932793 596.4083002 613.7553105 646.4889336 665.6136922 678.0680525 682.2376060 695.4910123 719.7374080 728.3883999 744.7288896 751.0006439 773.9824296 775.0859038 785.3436012 798.1863053 817.7498034 829.4694802 840.2976632 843.9950613 854.7126666 864.9204465 875.1675222 889.3623562 904.4978604 906.7010408 914.1726930 922.4218092 926.2163201 951.7111318 957.7907829 975.8024819 991.0883892 993.9992315 1008.2060714 1011.7398818 1026.2713684 1034.4185460 1037.5999147 1046.5759004 1055.2893901 1061.4715015 1068.1082544 1077.6092169 1088.6259639 1093.6267912 1102.2184162 1105.1749497 1121.2042857 1124.0818880 1131.6685275 1134.1884024 1145.0884574 1156.4368141 1160.5601707 1171.6068055 1180.5536273 1183.2216393 1188.0172481 1193.5099037 1201.7780315 1204.7431383 1207.1619746 1217.9510940 1230.4693574 1235.2747874 1249.2840889 1252.6578468 1255.6779917 1263.2412077 1266.9093145 1270.7572750 1277.9267972 1282.9404511 1296.8853645 1300.6289806 1304.5577041 1311.2388685 1319.8208476 1327.6022595 1334.1727669 1340.7680294 1343.3532619 1349.2250074 1354.9648075 1361.8786715 1364.3384686 1373.2745715 1375.3967173 1382.4617937 Diagstd> Normal end. Rtb_to_modes> Entering in. Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 4795 Rtb_to_modes> Number of blocs = 165 Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.eigenfacs Openam> file on opening on unit 11: matrix.eigenrtb Rdmodfacs> Entering in. Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Eigenvector number: 1 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9605E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 2 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9898E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 3 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0004E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 4 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0004E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 5 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0007E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 6 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0010E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 7 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.067 Rdmodfacs> Eigenvector number: 8 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.257 Rdmodfacs> Eigenvector number: 9 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.761 Rdmodfacs> Eigenvector number: 10 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.04 Rdmodfacs> Eigenvector number: 11 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.43 Rdmodfacs> Eigenvector number: 12 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.96 Rdmodfacs> Eigenvector number: 13 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.87 Rdmodfacs> Eigenvector number: 14 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.72 Rdmodfacs> Eigenvector number: 15 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.79 Rdmodfacs> Eigenvector number: 16 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.26 Rdmodfacs> Eigenvector number: 17 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.96 Rdmodfacs> Eigenvector number: 18 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.16 Rdmodfacs> Eigenvector number: 19 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.94 Rdmodfacs> Eigenvector number: 20 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.44 Rdmodfacs> Eigenvector number: 21 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.57 Rdmodfacs> Eigenvector number: 22 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.99 Rdmodfacs> Eigenvector number: 23 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.47 Rdmodfacs> Eigenvector number: 24 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 25 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.93 Rdmodfacs> Eigenvector number: 26 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.99 Rdmodfacs> Eigenvector number: 27 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 47.03 Rdmodfacs> Eigenvector number: 28 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 47.83 Rdmodfacs> Eigenvector number: 29 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 50.80 Rdmodfacs> Eigenvector number: 30 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 50.95 Rdmodfacs> Eigenvector number: 31 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 52.30 Rdmodfacs> Eigenvector number: 32 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 54.03 Rdmodfacs> Eigenvector number: 33 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 56.71 Rdmodfacs> Eigenvector number: 34 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 58.35 Rdmodfacs> Eigenvector number: 35 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 59.88 Rdmodfacs> Eigenvector number: 36 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 60.41 Rdmodfacs> Eigenvector number: 37 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 61.95 Rdmodfacs> Eigenvector number: 38 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 63.44 Rdmodfacs> Eigenvector number: 39 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 64.95 Rdmodfacs> Eigenvector number: 40 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 67.08 Rdmodfacs> Eigenvector number: 41 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 69.38 Rdmodfacs> Eigenvector number: 42 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 69.72 Rdmodfacs> Eigenvector number: 43 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 70.87 Rdmodfacs> Eigenvector number: 44 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 72.16 Rdmodfacs> Eigenvector number: 45 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 72.75 Rdmodfacs> Eigenvector number: 46 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 76.81 Rdmodfacs> Eigenvector number: 47 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 77.79 Rdmodfacs> Eigenvector number: 48 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 80.75 Rdmodfacs> Eigenvector number: 49 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 83.30 Rdmodfacs> Eigenvector number: 50 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 83.79 Rdmodfacs> Eigenvector number: 51 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 86.20 Rdmodfacs> Eigenvector number: 52 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 86.81 Rdmodfacs> Eigenvector number: 53 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 89.32 Rdmodfacs> Eigenvector number: 54 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 90.74 Rdmodfacs> Eigenvector number: 55 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 91.30 Rdmodfacs> Eigenvector number: 56 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 92.89 Rdmodfacs> Eigenvector number: 57 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 94.44 Rdmodfacs> Eigenvector number: 58 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 95.55 Rdmodfacs> Eigenvector number: 59 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 96.75 Rdmodfacs> Eigenvector number: 60 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 98.48 Rdmodfacs> Eigenvector number: 61 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 100.5 Rdmodfacs> Eigenvector number: 62 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 101.4 Rdmodfacs> Eigenvector number: 63 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 103.0 Rdmodfacs> Eigenvector number: 64 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 103.6 Rdmodfacs> Eigenvector number: 65 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 106.6 Rdmodfacs> Eigenvector number: 66 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 107.2 Rdmodfacs> Eigenvector number: 67 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 108.6 Rdmodfacs> Eigenvector number: 68 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 109.1 Rdmodfacs> Eigenvector number: 69 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 111.2 Rdmodfacs> Eigenvector number: 70 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 113.4 Rdmodfacs> Eigenvector number: 71 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 114.2 Rdmodfacs> Eigenvector number: 72 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 116.4 Rdmodfacs> Eigenvector number: 73 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 118.2 Rdmodfacs> Eigenvector number: 74 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 118.7 Rdmodfacs> Eigenvector number: 75 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 119.7 Rdmodfacs> Eigenvector number: 76 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 120.8 Rdmodfacs> Eigenvector number: 77 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 122.5 Rdmodfacs> Eigenvector number: 78 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 123.1 Rdmodfacs> Eigenvector number: 79 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 123.6 Rdmodfacs> Eigenvector number: 80 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 125.8 Rdmodfacs> Eigenvector number: 81 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 128.4 Rdmodfacs> Eigenvector number: 82 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 129.4 Rdmodfacs> Eigenvector number: 83 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 132.4 Rdmodfacs> Eigenvector number: 84 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 133.1 Rdmodfacs> Eigenvector number: 85 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 133.7 Rdmodfacs> Eigenvector number: 86 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 135.3 Rdmodfacs> Eigenvector number: 87 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 136.1 Rdmodfacs> Eigenvector number: 88 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 136.9 Rdmodfacs> Eigenvector number: 89 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 138.5 Rdmodfacs> Eigenvector number: 90 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 139.6 Rdmodfacs> Eigenvector number: 91 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 142.6 Rdmodfacs> Eigenvector number: 92 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 143.5 Rdmodfacs> Eigenvector number: 93 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 144.3 Rdmodfacs> Eigenvector number: 94 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 145.8 Rdmodfacs> Eigenvector number: 95 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 147.7 Rdmodfacs> Eigenvector number: 96 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 149.5 Rdmodfacs> Eigenvector number: 97 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 151.0 Rdmodfacs> Eigenvector number: 98 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 152.4 Rdmodfacs> Eigenvector number: 99 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 153.0 Rdmodfacs> Eigenvector number: 100 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 154.4 Rdmodfacs> Eigenvector number: 101 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 155.7 Rdmodfacs> Eigenvector number: 102 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 157.3 Rdmodfacs> Eigenvector number: 103 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 157.9 Rdmodfacs> Eigenvector number: 104 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 159.9 Rdmodfacs> Eigenvector number: 105 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 160.4 Rdmodfacs> Eigenvector number: 106 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 162.1 Rtb_to_modes> 106 vectors, with 990 coordinates in vector file. Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected): 0.99999 1.00001 0.99999 0.99999 1.00000 0.99999 1.00001 1.00001 1.00001 0.99999 0.99999 1.00002 1.00000 1.00000 1.00002 0.99996 1.00000 0.99999 0.99996 0.99998 0.99997 1.00002 1.00003 1.00002 0.99998 1.00002 1.00000 0.99999 1.00000 1.00003 1.00000 1.00000 1.00001 1.00001 0.99998 1.00000 0.99999 0.99997 1.00001 1.00000 1.00000 1.00000 1.00001 0.99998 0.99998 0.99998 1.00000 1.00000 1.00001 1.00005 1.00001 1.00000 0.99999 0.99999 1.00001 0.99999 0.99999 0.99997 1.00001 0.99999 1.00000 1.00001 1.00000 1.00002 0.99998 1.00000 1.00000 1.00002 1.00001 0.99999 0.99999 1.00000 0.99997 1.00000 1.00002 1.00001 1.00000 0.99998 0.99998 1.00002 1.00003 1.00001 1.00002 0.99999 1.00000 1.00001 0.99998 1.00003 1.00000 0.99999 0.99999 0.99999 1.00001 1.00000 1.00000 0.99998 1.00001 0.99999 0.99998 1.00000 1.00001 0.99998 0.99999 1.00000 1.00000 1.00000 Rtb_to_modes> RTB block-file is being read. Rtb_to_modes> 86310 lines found in RTB file. Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected): 0.99999 1.00001 0.99999 0.99999 1.00000 0.99999 1.00001 1.00001 1.00001 0.99999 0.99999 1.00002 1.00000 1.00000 1.00002 0.99996 1.00000 0.99999 0.99996 0.99998 0.99997 1.00002 1.00003 1.00002 0.99998 1.00002 1.00000 0.99999 1.00000 1.00003 1.00000 1.00000 1.00001 1.00001 0.99998 1.00000 0.99999 0.99997 1.00001 1.00000 1.00000 1.00000 1.00001 0.99998 0.99998 0.99998 1.00000 1.00000 1.00001 1.00005 1.00001 1.00000 0.99999 0.99999 1.00001 0.99999 0.99999 0.99997 1.00001 0.99999 1.00000 1.00001 1.00000 1.00002 0.99998 1.00000 1.00000 1.00002 1.00001 0.99999 0.99999 1.00000 0.99997 1.00000 1.00002 1.00001 1.00000 0.99998 0.99998 1.00002 1.00003 1.00001 1.00002 0.99999 1.00000 1.00001 0.99998 1.00003 1.00000 0.99999 0.99999 0.99999 1.00001 1.00000 1.00000 0.99998 1.00001 0.99999 0.99998 1.00000 1.00001 0.99998 0.99999 1.00000 1.00000 1.00000 Orthogonality of first eigenvectors (zero expected): Vector 2: 0.000 Vector 3: 0.000 0.000 Vector 4:-0.000 0.000 0.000 Vector 5:-0.000-0.000 0.000 0.000 Vector 6: 0.000-0.000 0.000 0.000-0.000 Vector 7: 0.000 0.000-0.000 0.000 0.000 0.000 Vector 8: 0.000-0.000-0.000-0.000 0.000 0.000-0.000 Vector 9: 0.000 0.000 0.000 0.000-0.000 0.000 0.000 0.000 Vector 10: 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000-0.000-0.000 Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved. Rtb_to_modes> Normal end. Diagrtb> Normal end. B-factor analysis Bfactors> Version 1.22, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 2602120909361234529.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 2602120909361234529.eigenfacs Getnam> Corresponding pdb filename ? Getnam> 2602120909361234529.atom Openam> file on opening on unit 11: 2602120909361234529.atom Getnum> Number of skipped eigenvectors ? Getnum> 0 Getnum> Number of usefull eigenvectors ? Getnum> 10000 %Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 330 First residue number = 1 Last residue number = 330 Number of atoms found = 4795 Mean number per residue = 14.5 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9605E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9898E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0004E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0004E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0007E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0010E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.067 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.257 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.761 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.04 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.43 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.96 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.87 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.72 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.79 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.26 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.96 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.16 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.94 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.44 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.57 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.99 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.47 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.93 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.99 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.83 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 50.80 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 50.95 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 52.30 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 54.03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 56.71 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 58.35 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 59.88 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 60.41 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 61.95 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 63.44 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 64.95 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 67.08 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 69.38 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 69.72 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 70.87 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 72.16 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 72.75 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 76.81 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 77.79 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 80.75 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 83.30 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 83.79 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 86.20 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 86.81 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 89.32 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 90.74 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 91.30 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 92.89 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 94.44 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 95.55 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 96.75 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 98.48 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 100.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 101.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 103.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 103.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 106.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 107.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 108.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 109.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 111.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 113.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 114.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 116.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 118.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 118.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 119.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 120.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 122.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 123.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 123.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 125.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 128.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 129.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 132.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 133.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 133.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 135.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 136.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 136.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 138.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 139.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 142.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 143.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 144.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 145.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 147.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 149.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 151.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 152.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 153.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 154.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 155.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 157.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 157.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 159.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 160.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 162.1 Bfactors> 106 vectors, 14385 coordinates in file. Openam> file on opening on unit 12: bfactors.pred Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000 Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 4.067000 Bfactors> 100 eigenvectors will be considered. Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped. Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed. (CHARMM units assumed for eigenvalues) Bfactors> Correlation= 0.589 for 349 C-alpha atoms. Bfactors> = 0.007 +/- 0.01 Bfactors> = 10.973 +/- 3.40 Bfactors> Shiftng-fct= 10.967 Bfactors> Scaling-fct= 417.348 Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved. Bfactors> Normal end. check_modes Chkmod> Version 1.00, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 2602120909361234529.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 2602120909361234529.eigenfacs Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4270E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4321E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4345E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4345E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4350E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4355E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 219.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 249.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 302.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 406.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 412.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 447.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 507.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 517.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 540.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 566.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 594.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 596.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 613.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 646.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 665.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 678.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 682.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 695.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 719.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 728.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 744.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 751.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 773.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 775.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 785.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 798.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 817.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 829.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 840.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 844.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 854.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 864.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 875.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 889.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 904.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 906.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 914.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 922.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 926.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 951.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 957.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 975.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 991.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 994.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1008. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1012. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1026. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1034. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1038. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1047. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1055. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1061. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1068. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1078. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1089. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1093. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1102. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1105. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1121. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1124. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1132. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1134. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1145. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1156. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1160. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1172. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1181. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1183. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1188. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1193. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1202. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1205. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1207. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1218. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1230. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1235. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1249. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1253. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1256. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1263. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1267. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1271. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1278. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1283. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1297. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1301. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1304. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1311. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1320. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1328. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1334. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1341. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1343. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1349. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1355. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1362. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1364. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1373. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1375. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1383. Chkmod> 106 vectors, 14385 coordinates in file. Chkmod> That is: 4795 cartesian points. Openam> file on opening on unit 11: Chkmod.res Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file. Chkmod> Normal end. 0.0034 0.7989 0.0034 0.9008 0.0034 0.7496 0.0034 0.6843 0.0034 0.9537 0.0034 0.7467 218.9847 0.4190 248.9692 0.4519 302.5070 0.5012 406.8742 0.2972 412.4866 0.2258 447.1874 0.4909 507.8097 0.1908 517.5839 0.3074 540.6484 0.4497 566.9432 0.4006 594.3572 0.2511 596.3378 0.2069 613.6830 0.4002 646.4330 0.4182 665.5754 0.1990 678.0368 0.1916 682.1976 0.1952 695.4637 0.1931 719.7095 0.3733 728.3408 0.5110 744.6705 0.2594 750.9773 0.3904 773.9421 0.2698 775.0839 0.1944 785.2853 0.3061 798.1676 0.3642 817.7235 0.3956 829.4631 0.5578 840.2674 0.3922 843.9779 0.3573 854.6677 0.3084 864.8847 0.1823 875.1172 0.3877 889.3509 0.3092 904.4692 0.3512 906.6827 0.1936 914.1298 0.3603 922.4119 0.3526 926.1752 0.3911 951.6681 0.4104 957.7199 0.4468 975.7710 0.5055 991.0582 0.3526 993.9688 0.2656 1008.1619 0.4741 1011.7227 0.3754 1026.2449 0.4567 1034.3703 0.3116 1037.5571 0.4801 1046.5527 0.3964 1055.2482 0.4571 1061.4315 0.2041 1068.0759 0.3959 1077.5828 0.2494 1088.5783 0.5163 1093.4417 0.3092 1102.0346 0.4050 1105.2398 0.3861 1121.1281 0.4017 1124.2788 0.4629 1131.5964 0.4221 1134.1984 0.3348 1145.0621 0.4072 1156.3336 0.4544 1160.4053 0.5129 1171.5292 0.4034 1180.5527 0.4905 1183.0470 0.3931 1188.0199 0.3306 1193.4661 0.5102 1201.8345 0.2979 1204.7742 0.3028 1207.2185 0.3553 1217.9149 0.2692 1230.4363 0.5414 1235.2185 0.3404 1249.4550 0.3591 1252.7536 0.4419 1255.5741 0.3033 1263.0645 0.4792 1266.7931 0.4510 1270.5108 0.2987 1277.9137 0.2445 1282.9784 0.3928 1296.6907 0.4299 1300.7762 0.2778 1304.3970 0.1976 1311.1591 0.2885 1319.6747 0.3532 1327.6917 0.3459 1334.3357 0.4049 1340.5071 0.3245 1343.1433 0.1860 1349.2744 0.3786 1354.9427 0.4687 1361.8868 0.3698 1364.4817 0.4670 1373.0959 0.4233 1375.2410 0.4064 1382.5096 0.4065 getting mode 7 running: ../../bin/get_modes.sh 2602120909361234529 7 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 7 calculating perturbed structure for DQ=-100 2602120909361234529.eigenfacs 2602120909361234529.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2602120909361234529.eigenfacs 2602120909361234529.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2602120909361234529.eigenfacs 2602120909361234529.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2602120909361234529.eigenfacs 2602120909361234529.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2602120909361234529.eigenfacs 2602120909361234529.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2602120909361234529.eigenfacs 2602120909361234529.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2602120909361234529.eigenfacs 2602120909361234529.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2602120909361234529.eigenfacs 2602120909361234529.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2602120909361234529.eigenfacs 2602120909361234529.atom calculating perturbed structure for DQ=80 2602120909361234529.eigenfacs 2602120909361234529.atom calculating perturbed structure for DQ=100 2602120909361234529.eigenfacs 2602120909361234529.atom making animated gifs 11 models are in 2602120909361234529.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2602120909361234529.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2602120909361234529.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 8 running: ../../bin/get_modes.sh 2602120909361234529 8 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 8 calculating perturbed structure for DQ=-100 2602120909361234529.eigenfacs 2602120909361234529.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2602120909361234529.eigenfacs 2602120909361234529.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2602120909361234529.eigenfacs 2602120909361234529.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2602120909361234529.eigenfacs 2602120909361234529.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2602120909361234529.eigenfacs 2602120909361234529.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2602120909361234529.eigenfacs 2602120909361234529.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2602120909361234529.eigenfacs 2602120909361234529.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2602120909361234529.eigenfacs 2602120909361234529.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2602120909361234529.eigenfacs 2602120909361234529.atom calculating perturbed structure for DQ=80 2602120909361234529.eigenfacs 2602120909361234529.atom calculating perturbed structure for DQ=100 2602120909361234529.eigenfacs 2602120909361234529.atom making animated gifs 11 models are in 2602120909361234529.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2602120909361234529.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2602120909361234529.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 9 running: ../../bin/get_modes.sh 2602120909361234529 9 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 9 calculating perturbed structure for DQ=-100 2602120909361234529.eigenfacs 2602120909361234529.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2602120909361234529.eigenfacs 2602120909361234529.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2602120909361234529.eigenfacs 2602120909361234529.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2602120909361234529.eigenfacs 2602120909361234529.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2602120909361234529.eigenfacs 2602120909361234529.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2602120909361234529.eigenfacs 2602120909361234529.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2602120909361234529.eigenfacs 2602120909361234529.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2602120909361234529.eigenfacs 2602120909361234529.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2602120909361234529.eigenfacs 2602120909361234529.atom calculating perturbed structure for DQ=80 2602120909361234529.eigenfacs 2602120909361234529.atom calculating perturbed structure for DQ=100 2602120909361234529.eigenfacs 2602120909361234529.atom making animated gifs 11 models are in 2602120909361234529.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2602120909361234529.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2602120909361234529.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 10 running: ../../bin/get_modes.sh 2602120909361234529 10 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 10 calculating perturbed structure for DQ=-100 2602120909361234529.eigenfacs 2602120909361234529.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2602120909361234529.eigenfacs 2602120909361234529.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2602120909361234529.eigenfacs 2602120909361234529.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2602120909361234529.eigenfacs 2602120909361234529.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2602120909361234529.eigenfacs 2602120909361234529.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2602120909361234529.eigenfacs 2602120909361234529.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2602120909361234529.eigenfacs 2602120909361234529.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2602120909361234529.eigenfacs 2602120909361234529.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2602120909361234529.eigenfacs 2602120909361234529.atom calculating perturbed structure for DQ=80 2602120909361234529.eigenfacs 2602120909361234529.atom calculating perturbed structure for DQ=100 2602120909361234529.eigenfacs 2602120909361234529.atom making animated gifs 11 models are in 2602120909361234529.10.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2602120909361234529.10.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2602120909361234529.10.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 11 running: ../../bin/get_modes.sh 2602120909361234529 11 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 11 calculating perturbed structure for DQ=-100 2602120909361234529.eigenfacs 2602120909361234529.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2602120909361234529.eigenfacs 2602120909361234529.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2602120909361234529.eigenfacs 2602120909361234529.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2602120909361234529.eigenfacs 2602120909361234529.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2602120909361234529.eigenfacs 2602120909361234529.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2602120909361234529.eigenfacs 2602120909361234529.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2602120909361234529.eigenfacs 2602120909361234529.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2602120909361234529.eigenfacs 2602120909361234529.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2602120909361234529.eigenfacs 2602120909361234529.atom calculating perturbed structure for DQ=80 2602120909361234529.eigenfacs 2602120909361234529.atom calculating perturbed structure for DQ=100 2602120909361234529.eigenfacs 2602120909361234529.atom making animated gifs 11 models are in 2602120909361234529.11.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2602120909361234529.11.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2602120909361234529.11.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 2602120909361234529.10.pdb 2602120909361234529.11.pdb 2602120909361234529.7.pdb 2602120909361234529.8.pdb 2602120909361234529.9.pdb STDERR: Note: The following floating-point exceptions are signalling: IEEE_DENORMAL real 0m20.312s user 0m20.106s sys 0m0.200s rm: cannot remove '2602120909361234529.sdijf': No such file or directory pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format




If you find results from this site helpful for your research, please cite one of our papers:

elNémo is maintained by Yves-Henri Sanejouand.
It was developed by Karsten Suhre.
Between 2003 and 2014, it was hosted by IGS (Marseille).
Between 2015 and 2025, it was hosted by US2B (Nantes).
Last modification: december 26th, 2025.