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LOGs for ID: 2602121936031399940

Output from eigenvector calculation:


STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8) Build Tirion matrix: Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model. Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004. Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file. Pdbmat> Coordinate filename = 2602121936031399940.atom Pdbmat> Distance cutoff = 8.00 Force constant = 10.00 Origin of mass values = CONS Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09 PRINTing level = 2 Pdbmat> Coordinate file 2602121936031399940.atom to be opened. Openam> File opened: 2602121936031399940.atom Pdbmat> Coordinate file in PDB format. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 558 First residue number = 1 Last residue number = 279 Number of atoms found = 4418 Mean number per residue = 7.9 Pdbmat> Coordinate statistics: = 142.018565 +/- 34.462160 From: 77.595000 To: 215.483000 = 139.995129 +/- 10.081216 From: 114.518000 To: 179.013000 = 140.887528 +/- 22.289546 From: 77.557000 To: 186.590000 Pdbmat> Masses are all set to one. Openam> File opened: pdbmat.xyzm Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved. Openam> File opened: pdbmat.sdijb Pdbmat> Matrix statistics: Pdbmat> The matrix is 1.5838 % Filled. Pdbmat> 1391239 non-zero elements. Pdbmat> 151659 atom-atom interactions. Pdbmat> Number per atom= 68.66 +/- 21.40 Maximum number = 125 Minimum number = 7 Pdbmat> Matrix trace = 3.033180E+06 Pdbmat> Larger element = 472.896 Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10 Pdbmat> Normal end. automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1) 558 non-zero elements, NRBL set to 3 Diagonalize Tirion matrix using diagrtb Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation. Diagrtb> Version 2.52, November 2004. Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file. Diagrtb> Options taken into account: MATRix filename = pdbmat.sdijb COORdinates filename = 2602121936031399940.atom Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb Nb of VECTors required = 106 EigeNVALues chosen = LOWE Type of SUBStructuring = NONE Nb of residues per BLOck = 3 Origin of MASS values = CONS MATRix FORMat = BINA Temporary files cleaning = ALL Output PRINting level = 2 Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb. Blocpdb> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.xyzm Blocpdb> Coordinate file 2602121936031399940.atom to be opened. Openam> file on opening on unit 11: 2602121936031399940.atom Blocpdb> Coordinate file in PDB format. Blocpdb> 4418 atoms picked in pdb file. Blocpdb> All masses set to unity. Blocpdb> Coordinate file is rewritten. Blocpdb> Substructuring: Blocpdb> 3 residue(s) per block. Blocpdb> 558 residues. Blocpdb> 27 atoms in block 1 Block first atom: 1 Blocpdb> 30 atoms in block 2 Block first atom: 28 Blocpdb> 24 atoms in block 3 Block first atom: 58 Blocpdb> 26 atoms in block 4 Block first atom: 82 Blocpdb> 23 atoms in block 5 Block first atom: 108 Blocpdb> 27 atoms in block 6 Block first atom: 131 Blocpdb> 23 atoms in block 7 Block first atom: 158 Blocpdb> 25 atoms in block 8 Block first atom: 181 Blocpdb> 26 atoms in block 9 Block first atom: 206 Blocpdb> 28 atoms in block 10 Block first atom: 232 Blocpdb> 25 atoms in block 11 Block first atom: 260 Blocpdb> 23 atoms in block 12 Block first atom: 285 Blocpdb> 21 atoms in block 13 Block first atom: 308 Blocpdb> 30 atoms in block 14 Block first atom: 329 Blocpdb> 26 atoms in block 15 Block first atom: 359 Blocpdb> 21 atoms in block 16 Block first atom: 385 Blocpdb> 34 atoms in block 17 Block first atom: 406 Blocpdb> 24 atoms in block 18 Block first atom: 440 Blocpdb> 29 atoms in block 19 Block first atom: 464 Blocpdb> 18 atoms in block 20 Block first atom: 493 Blocpdb> 23 atoms in block 21 Block first atom: 511 Blocpdb> 18 atoms in block 22 Block first atom: 534 Blocpdb> 22 atoms in block 23 Block first atom: 552 Blocpdb> 22 atoms in block 24 Block first atom: 574 Blocpdb> 28 atoms in block 25 Block first atom: 596 Blocpdb> 25 atoms in block 26 Block first atom: 624 Blocpdb> 21 atoms in block 27 Block first atom: 649 Blocpdb> 21 atoms in block 28 Block first atom: 670 Blocpdb> 27 atoms in block 29 Block first atom: 691 Blocpdb> 21 atoms in block 30 Block first atom: 718 Blocpdb> 27 atoms in block 31 Block first atom: 739 Blocpdb> 23 atoms in block 32 Block first atom: 766 Blocpdb> 18 atoms in block 33 Block first atom: 789 Blocpdb> 21 atoms in block 34 Block first atom: 807 Blocpdb> 17 atoms in block 35 Block first atom: 828 Blocpdb> 19 atoms in block 36 Block first atom: 845 Blocpdb> 26 atoms in block 37 Block first atom: 864 Blocpdb> 26 atoms in block 38 Block first atom: 890 Blocpdb> 26 atoms in block 39 Block first atom: 916 Blocpdb> 16 atoms in block 40 Block first atom: 942 Blocpdb> 22 atoms in block 41 Block first atom: 958 Blocpdb> 23 atoms in block 42 Block first atom: 980 Blocpdb> 23 atoms in block 43 Block first atom: 1003 Blocpdb> 21 atoms in block 44 Block first atom: 1026 Blocpdb> 23 atoms in block 45 Block first atom: 1047 Blocpdb> 25 atoms in block 46 Block first atom: 1070 Blocpdb> 23 atoms in block 47 Block first atom: 1095 Blocpdb> 27 atoms in block 48 Block first atom: 1118 Blocpdb> 20 atoms in block 49 Block first atom: 1145 Blocpdb> 22 atoms in block 50 Block first atom: 1165 Blocpdb> 22 atoms in block 51 Block first atom: 1187 Blocpdb> 24 atoms in block 52 Block first atom: 1209 Blocpdb> 21 atoms in block 53 Block first atom: 1233 Blocpdb> 33 atoms in block 54 Block first atom: 1254 Blocpdb> 29 atoms in block 55 Block first atom: 1287 Blocpdb> 26 atoms in block 56 Block first atom: 1316 Blocpdb> 33 atoms in block 57 Block first atom: 1342 Blocpdb> 27 atoms in block 58 Block first atom: 1375 Blocpdb> 25 atoms in block 59 Block first atom: 1402 Blocpdb> 25 atoms in block 60 Block first atom: 1427 Blocpdb> 22 atoms in block 61 Block first atom: 1452 Blocpdb> 22 atoms in block 62 Block first atom: 1474 Blocpdb> 18 atoms in block 63 Block first atom: 1496 Blocpdb> 21 atoms in block 64 Block first atom: 1514 Blocpdb> 26 atoms in block 65 Block first atom: 1535 Blocpdb> 19 atoms in block 66 Block first atom: 1561 Blocpdb> 23 atoms in block 67 Block first atom: 1580 Blocpdb> 23 atoms in block 68 Block first atom: 1603 Blocpdb> 18 atoms in block 69 Block first atom: 1626 Blocpdb> 26 atoms in block 70 Block first atom: 1644 Blocpdb> 18 atoms in block 71 Block first atom: 1670 Blocpdb> 20 atoms in block 72 Block first atom: 1688 Blocpdb> 25 atoms in block 73 Block first atom: 1708 Blocpdb> 20 atoms in block 74 Block first atom: 1733 Blocpdb> 19 atoms in block 75 Block first atom: 1753 Blocpdb> 25 atoms in block 76 Block first atom: 1772 Blocpdb> 23 atoms in block 77 Block first atom: 1797 Blocpdb> 21 atoms in block 78 Block first atom: 1820 Blocpdb> 25 atoms in block 79 Block first atom: 1841 Blocpdb> 26 atoms in block 80 Block first atom: 1866 Blocpdb> 16 atoms in block 81 Block first atom: 1892 Blocpdb> 24 atoms in block 82 Block first atom: 1908 Blocpdb> 20 atoms in block 83 Block first atom: 1932 Blocpdb> 18 atoms in block 84 Block first atom: 1952 Blocpdb> 27 atoms in block 85 Block first atom: 1970 Blocpdb> 32 atoms in block 86 Block first atom: 1997 Blocpdb> 27 atoms in block 87 Block first atom: 2029 Blocpdb> 31 atoms in block 88 Block first atom: 2056 Blocpdb> 24 atoms in block 89 Block first atom: 2087 Blocpdb> 28 atoms in block 90 Block first atom: 2111 Blocpdb> 28 atoms in block 91 Block first atom: 2139 Blocpdb> 25 atoms in block 92 Block first atom: 2167 Blocpdb> 18 atoms in block 93 Block first atom: 2192 Blocpdb> 27 atoms in block 94 Block first atom: 2210 Blocpdb> 30 atoms in block 95 Block first atom: 2237 Blocpdb> 24 atoms in block 96 Block first atom: 2267 Blocpdb> 26 atoms in block 97 Block first atom: 2291 Blocpdb> 23 atoms in block 98 Block first atom: 2317 Blocpdb> 27 atoms in block 99 Block first atom: 2340 Blocpdb> 23 atoms in block 100 Block first atom: 2367 Blocpdb> 25 atoms in block 101 Block first atom: 2390 Blocpdb> 26 atoms in block 102 Block first atom: 2415 Blocpdb> 28 atoms in block 103 Block first atom: 2441 Blocpdb> 25 atoms in block 104 Block first atom: 2469 Blocpdb> 23 atoms in block 105 Block first atom: 2494 Blocpdb> 21 atoms in block 106 Block first atom: 2517 Blocpdb> 30 atoms in block 107 Block first atom: 2538 Blocpdb> 26 atoms in block 108 Block first atom: 2568 Blocpdb> 21 atoms in block 109 Block first atom: 2594 Blocpdb> 34 atoms in block 110 Block first atom: 2615 Blocpdb> 24 atoms in block 111 Block first atom: 2649 Blocpdb> 29 atoms in block 112 Block first atom: 2673 Blocpdb> 18 atoms in block 113 Block first atom: 2702 Blocpdb> 23 atoms in block 114 Block first atom: 2720 Blocpdb> 18 atoms in block 115 Block first atom: 2743 Blocpdb> 22 atoms in block 116 Block first atom: 2761 Blocpdb> 22 atoms in block 117 Block first atom: 2783 Blocpdb> 28 atoms in block 118 Block first atom: 2805 Blocpdb> 25 atoms in block 119 Block first atom: 2833 Blocpdb> 21 atoms in block 120 Block first atom: 2858 Blocpdb> 21 atoms in block 121 Block first atom: 2879 Blocpdb> 27 atoms in block 122 Block first atom: 2900 Blocpdb> 21 atoms in block 123 Block first atom: 2927 Blocpdb> 27 atoms in block 124 Block first atom: 2948 Blocpdb> 23 atoms in block 125 Block first atom: 2975 Blocpdb> 18 atoms in block 126 Block first atom: 2998 Blocpdb> 21 atoms in block 127 Block first atom: 3016 Blocpdb> 17 atoms in block 128 Block first atom: 3037 Blocpdb> 19 atoms in block 129 Block first atom: 3054 Blocpdb> 26 atoms in block 130 Block first atom: 3073 Blocpdb> 26 atoms in block 131 Block first atom: 3099 Blocpdb> 26 atoms in block 132 Block first atom: 3125 Blocpdb> 16 atoms in block 133 Block first atom: 3151 Blocpdb> 22 atoms in block 134 Block first atom: 3167 Blocpdb> 23 atoms in block 135 Block first atom: 3189 Blocpdb> 23 atoms in block 136 Block first atom: 3212 Blocpdb> 21 atoms in block 137 Block first atom: 3235 Blocpdb> 23 atoms in block 138 Block first atom: 3256 Blocpdb> 25 atoms in block 139 Block first atom: 3279 Blocpdb> 23 atoms in block 140 Block first atom: 3304 Blocpdb> 27 atoms in block 141 Block first atom: 3327 Blocpdb> 20 atoms in block 142 Block first atom: 3354 Blocpdb> 22 atoms in block 143 Block first atom: 3374 Blocpdb> 22 atoms in block 144 Block first atom: 3396 Blocpdb> 24 atoms in block 145 Block first atom: 3418 Blocpdb> 21 atoms in block 146 Block first atom: 3442 Blocpdb> 33 atoms in block 147 Block first atom: 3463 Blocpdb> 29 atoms in block 148 Block first atom: 3496 Blocpdb> 26 atoms in block 149 Block first atom: 3525 Blocpdb> 33 atoms in block 150 Block first atom: 3551 Blocpdb> 27 atoms in block 151 Block first atom: 3584 Blocpdb> 25 atoms in block 152 Block first atom: 3611 Blocpdb> 25 atoms in block 153 Block first atom: 3636 Blocpdb> 22 atoms in block 154 Block first atom: 3661 Blocpdb> 22 atoms in block 155 Block first atom: 3683 Blocpdb> 18 atoms in block 156 Block first atom: 3705 Blocpdb> 21 atoms in block 157 Block first atom: 3723 Blocpdb> 26 atoms in block 158 Block first atom: 3744 Blocpdb> 19 atoms in block 159 Block first atom: 3770 Blocpdb> 23 atoms in block 160 Block first atom: 3789 Blocpdb> 23 atoms in block 161 Block first atom: 3812 Blocpdb> 18 atoms in block 162 Block first atom: 3835 Blocpdb> 26 atoms in block 163 Block first atom: 3853 Blocpdb> 18 atoms in block 164 Block first atom: 3879 Blocpdb> 20 atoms in block 165 Block first atom: 3897 Blocpdb> 25 atoms in block 166 Block first atom: 3917 Blocpdb> 20 atoms in block 167 Block first atom: 3942 Blocpdb> 19 atoms in block 168 Block first atom: 3962 Blocpdb> 25 atoms in block 169 Block first atom: 3981 Blocpdb> 23 atoms in block 170 Block first atom: 4006 Blocpdb> 21 atoms in block 171 Block first atom: 4029 Blocpdb> 25 atoms in block 172 Block first atom: 4050 Blocpdb> 26 atoms in block 173 Block first atom: 4075 Blocpdb> 16 atoms in block 174 Block first atom: 4101 Blocpdb> 24 atoms in block 175 Block first atom: 4117 Blocpdb> 20 atoms in block 176 Block first atom: 4141 Blocpdb> 18 atoms in block 177 Block first atom: 4161 Blocpdb> 27 atoms in block 178 Block first atom: 4179 Blocpdb> 32 atoms in block 179 Block first atom: 4206 Blocpdb> 27 atoms in block 180 Block first atom: 4238 Blocpdb> 31 atoms in block 181 Block first atom: 4265 Blocpdb> 24 atoms in block 182 Block first atom: 4296 Blocpdb> 28 atoms in block 183 Block first atom: 4320 Blocpdb> 28 atoms in block 184 Block first atom: 4348 Blocpdb> 25 atoms in block 185 Block first atom: 4376 Blocpdb> 18 atoms in block 186 Block first atom: 4400 Blocpdb> 186 blocks. Blocpdb> At most, 34 atoms in each of them. Blocpdb> At least, 16 atoms in each of them. Blocpdb> Normal end of Blocpdb. Diagrtb> Memory allocation for Prepmat. Diagrtb> Memory allocation for RTB. Diagrtb> Memory allocation for Diagstd. Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes. Prepmat> Entering in. Prepmat> Rewriting of the matrix begins. Prepmat> 1391425 matrix lines read. Prepmat> Matrix order = 13254 Prepmat> Matrix trace = 3033180.0000 Prepmat> Last element read: 13254 13254 57.8854 Prepmat> 17392 lines saved. Prepmat> 16006 empty lines. Prepmat> Number of lines on output is as expected. Prepmat> Normal end of Prepmat. RTB> Entering in. RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 4418 RTB> Total mass = 4418.0000 RTB> Number of atoms found in matrix: 4418 RTB> Number of blocks = 186 RTB> Projection begins. RTB> Projected matrix is being saved. RTB> Projected matrix trace = 186782.9583 RTB> 47070 non-zero elements. RTB> Normal end of RTB. Diagstd> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.sdijb Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb Diagstd> CERFACS matrix format. Diagstd> Projected matrix order = 1116 Diagstd> Nb of non-zero elements: 47070 Diagstd> Projected matrix trace = 186782.9583 Openam> file on opening on unit 11: diagrtb_work.eigenfacs Diagstd> Diagonalization. Diagstd> 1116 eigenvectors are computed. Diagstd> 106 of them to be saved. Diagstd> Sum of eigenvalues = 186782.9583 Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000 Diagstd> Selected eigenvalues: 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0092888 0.0222858 0.0237859 0.0358549 0.0581149 0.0851787 0.1079055 0.2096166 0.2836925 0.3026615 0.3090946 0.3232902 0.4162170 0.4620189 0.5794363 0.6941445 0.7081507 0.8647612 0.8884991 0.9363555 0.9428559 0.9980471 1.1179598 1.2869890 1.4475592 1.5305848 1.8318729 1.9489553 2.1204840 2.2262582 2.3691532 2.4868576 2.5447018 2.6135281 3.2674962 3.4745427 3.6584763 4.0247309 4.1725782 4.2131633 4.3425456 4.6306707 4.6889107 5.0359039 5.3203861 6.2458905 6.4675925 6.6457346 6.7851845 6.8857141 6.9829275 7.2978678 7.3586523 7.5156873 7.8511278 7.9492287 8.6380193 8.9247425 9.0746732 9.1052294 9.5379691 9.6592902 9.8147209 9.9327953 10.4258444 10.9051809 11.0516900 11.4336623 11.5198324 11.6671188 11.7947703 11.9317348 12.1385961 12.3855227 12.5405420 13.0233979 13.2578534 13.5266194 14.1659318 14.2946710 14.4825140 14.6432678 15.1025256 15.2957791 15.3587805 15.6332015 15.7200243 15.8757953 15.9707403 16.0301599 16.4365285 16.7896624 17.0494846 17.2653189 17.5691023 18.1315185 18.2328859 18.7376335 18.9326857 19.2813634 Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units): 0.0034325 0.0034331 0.0034334 0.0034342 0.0034344 0.0034355 10.4658451 16.2109851 16.7476840 20.5621858 26.1781624 31.6928128 35.6711447 49.7173724 57.8387863 59.7411930 60.3727528 61.7435396 70.0575930 73.8116933 82.6605220 90.4732559 91.3814649 100.9818627 102.3584655 105.0789366 105.4430459 108.4852752 114.8175767 123.1920535 130.6512127 134.3457625 146.9748239 151.5989594 158.1294563 162.0253798 167.1444072 171.2461179 173.2262584 175.5532468 196.2921027 202.4156599 207.7042602 217.8530799 221.8183762 222.8945384 226.2911001 233.6776796 235.1425705 243.6879190 250.4764251 271.3891401 276.1637083 279.9411718 282.8629793 284.9507290 286.9551661 293.3548529 294.5740062 297.7005460 304.2715191 306.1665745 319.1555232 324.4091743 327.1227719 327.6730527 335.3692479 337.4954221 340.1999591 342.2402011 350.6314761 358.6011833 361.0020169 367.1875614 368.5686232 370.9173005 372.9409084 375.1000099 378.3376049 382.1663544 384.5505475 391.8839124 395.3956495 399.3833132 408.7124370 410.5654143 413.2541831 415.5413851 422.0074044 424.6988469 425.5725889 429.3576877 430.5483086 432.6762185 433.9680971 434.7746440 440.2509773 444.9551751 448.3848270 451.2140167 455.1662652 462.3941909 463.6849367 470.0593009 472.4995437 476.8306357 Diagstd> Normal end. Rtb_to_modes> Entering in. Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 4418 Rtb_to_modes> Number of blocs = 186 Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.eigenfacs Openam> file on opening on unit 11: matrix.eigenrtb Rdmodfacs> Entering in. Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Eigenvector number: 1 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9916E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 2 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9948E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 3 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9970E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 4 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0001E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 5 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0003E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 6 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0009E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 7 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.2888E-03 Rdmodfacs> Eigenvector number: 8 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.2286E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 9 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.3786E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 10 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.5855E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 11 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.8115E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 12 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.5179E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 13 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.1079 Rdmodfacs> Eigenvector number: 14 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.2096 Rdmodfacs> Eigenvector number: 15 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.2837 Rdmodfacs> Eigenvector number: 16 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.3027 Rdmodfacs> Eigenvector number: 17 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.3091 Rdmodfacs> Eigenvector number: 18 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.3233 Rdmodfacs> Eigenvector number: 19 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.4162 Rdmodfacs> Eigenvector number: 20 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.4620 Rdmodfacs> Eigenvector number: 21 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.5794 Rdmodfacs> Eigenvector number: 22 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.6941 Rdmodfacs> Eigenvector number: 23 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.7082 Rdmodfacs> Eigenvector number: 24 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.8648 Rdmodfacs> Eigenvector number: 25 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.8885 Rdmodfacs> Eigenvector number: 26 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.9364 Rdmodfacs> Eigenvector number: 27 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.9429 Rdmodfacs> Eigenvector number: 28 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.9980 Rdmodfacs> Eigenvector number: 29 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.118 Rdmodfacs> Eigenvector number: 30 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.287 Rdmodfacs> Eigenvector number: 31 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.448 Rdmodfacs> Eigenvector number: 32 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.531 Rdmodfacs> Eigenvector number: 33 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.832 Rdmodfacs> Eigenvector number: 34 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.949 Rdmodfacs> Eigenvector number: 35 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.120 Rdmodfacs> Eigenvector number: 36 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.226 Rdmodfacs> Eigenvector number: 37 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.369 Rdmodfacs> Eigenvector number: 38 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.487 Rdmodfacs> Eigenvector number: 39 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.545 Rdmodfacs> Eigenvector number: 40 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.614 Rdmodfacs> Eigenvector number: 41 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.267 Rdmodfacs> Eigenvector number: 42 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.475 Rdmodfacs> Eigenvector number: 43 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.658 Rdmodfacs> Eigenvector number: 44 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.025 Rdmodfacs> Eigenvector number: 45 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.173 Rdmodfacs> Eigenvector number: 46 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.213 Rdmodfacs> Eigenvector number: 47 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.343 Rdmodfacs> Eigenvector number: 48 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.631 Rdmodfacs> Eigenvector number: 49 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.689 Rdmodfacs> Eigenvector number: 50 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.036 Rdmodfacs> Eigenvector number: 51 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.320 Rdmodfacs> Eigenvector number: 52 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.246 Rdmodfacs> Eigenvector number: 53 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.468 Rdmodfacs> Eigenvector number: 54 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.646 Rdmodfacs> Eigenvector number: 55 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.785 Rdmodfacs> Eigenvector number: 56 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.886 Rdmodfacs> Eigenvector number: 57 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.983 Rdmodfacs> Eigenvector number: 58 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.298 Rdmodfacs> Eigenvector number: 59 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.359 Rdmodfacs> Eigenvector number: 60 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.516 Rdmodfacs> Eigenvector number: 61 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.851 Rdmodfacs> Eigenvector number: 62 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.949 Rdmodfacs> Eigenvector number: 63 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.638 Rdmodfacs> Eigenvector number: 64 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.925 Rdmodfacs> Eigenvector number: 65 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.075 Rdmodfacs> Eigenvector number: 66 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.105 Rdmodfacs> Eigenvector number: 67 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.538 Rdmodfacs> Eigenvector number: 68 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.659 Rdmodfacs> Eigenvector number: 69 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.815 Rdmodfacs> Eigenvector number: 70 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.933 Rdmodfacs> Eigenvector number: 71 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.43 Rdmodfacs> Eigenvector number: 72 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.91 Rdmodfacs> Eigenvector number: 73 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.05 Rdmodfacs> Eigenvector number: 74 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.43 Rdmodfacs> Eigenvector number: 75 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.52 Rdmodfacs> Eigenvector number: 76 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.67 Rdmodfacs> Eigenvector number: 77 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.79 Rdmodfacs> Eigenvector number: 78 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.93 Rdmodfacs> Eigenvector number: 79 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.14 Rdmodfacs> Eigenvector number: 80 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.39 Rdmodfacs> Eigenvector number: 81 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.54 Rdmodfacs> Eigenvector number: 82 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 83 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.26 Rdmodfacs> Eigenvector number: 84 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.53 Rdmodfacs> Eigenvector number: 85 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.17 Rdmodfacs> Eigenvector number: 86 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.29 Rdmodfacs> Eigenvector number: 87 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.48 Rdmodfacs> Eigenvector number: 88 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.64 Rdmodfacs> Eigenvector number: 89 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 90 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.30 Rdmodfacs> Eigenvector number: 91 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.36 Rdmodfacs> Eigenvector number: 92 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.63 Rdmodfacs> Eigenvector number: 93 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.72 Rdmodfacs> Eigenvector number: 94 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.88 Rdmodfacs> Eigenvector number: 95 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.97 Rdmodfacs> Eigenvector number: 96 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.03 Rdmodfacs> Eigenvector number: 97 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.44 Rdmodfacs> Eigenvector number: 98 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.79 Rdmodfacs> Eigenvector number: 99 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.05 Rdmodfacs> Eigenvector number: 100 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.27 Rdmodfacs> Eigenvector number: 101 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.57 Rdmodfacs> Eigenvector number: 102 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.13 Rdmodfacs> Eigenvector number: 103 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.23 Rdmodfacs> Eigenvector number: 104 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.74 Rdmodfacs> Eigenvector number: 105 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.93 Rdmodfacs> Eigenvector number: 106 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.28 Rtb_to_modes> 106 vectors, with 1116 coordinates in vector file. Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected): 0.99999 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 0.99999 1.00003 0.99999 0.99999 0.99998 0.99999 1.00001 1.00000 1.00002 1.00003 1.00002 0.99996 1.00001 1.00001 1.00004 0.99997 0.99999 0.99999 1.00000 1.00000 1.00002 0.99998 0.99998 1.00003 1.00002 1.00001 1.00000 1.00001 0.99999 0.99998 1.00003 1.00001 1.00005 1.00003 1.00002 0.99998 1.00003 1.00000 0.99999 0.99997 1.00001 1.00001 0.99999 0.99998 0.99999 0.99999 0.99999 0.99998 1.00002 0.99997 1.00003 1.00003 1.00001 1.00001 1.00001 1.00003 1.00000 1.00002 1.00001 1.00000 1.00000 1.00000 1.00001 1.00000 0.99999 1.00000 0.99996 1.00000 1.00000 1.00000 0.99997 1.00000 0.99998 0.99999 0.99999 1.00001 1.00001 0.99997 1.00000 1.00000 1.00000 0.99999 0.99999 1.00000 1.00000 0.99999 1.00001 0.99998 1.00000 1.00002 1.00004 1.00000 1.00000 1.00001 1.00001 0.99999 1.00002 1.00002 1.00002 1.00000 1.00001 Rtb_to_modes> RTB block-file is being read. Rtb_to_modes> 79524 lines found in RTB file. Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected): 0.99999 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 0.99999 1.00003 0.99999 0.99999 0.99998 0.99999 1.00001 1.00000 1.00002 1.00003 1.00002 0.99996 1.00001 1.00001 1.00004 0.99997 0.99999 0.99999 1.00000 1.00000 1.00002 0.99998 0.99998 1.00003 1.00002 1.00001 1.00000 1.00001 0.99999 0.99998 1.00003 1.00001 1.00005 1.00003 1.00002 0.99998 1.00003 1.00000 0.99999 0.99997 1.00001 1.00001 0.99999 0.99998 0.99999 0.99999 0.99999 0.99998 1.00002 0.99997 1.00003 1.00003 1.00001 1.00001 1.00001 1.00003 1.00000 1.00002 1.00001 1.00000 1.00000 1.00000 1.00001 1.00000 0.99999 1.00000 0.99996 1.00000 1.00000 1.00000 0.99997 1.00000 0.99998 0.99999 0.99999 1.00001 1.00001 0.99997 1.00000 1.00000 1.00000 0.99999 0.99999 1.00000 1.00000 0.99999 1.00001 0.99998 1.00000 1.00002 1.00004 1.00000 1.00000 1.00001 1.00001 0.99999 1.00002 1.00002 1.00002 1.00000 1.00001 Orthogonality of first eigenvectors (zero expected): Vector 2: 0.000 Vector 3: 0.000 0.000 Vector 4:-0.000-0.000-0.000 Vector 5: 0.000 0.000 0.000-0.000 Vector 6: 0.000 0.000 0.000-0.000 0.000 Vector 7:-0.000 0.000-0.000-0.000 0.000-0.000 Vector 8:-0.000-0.000-0.000-0.000 0.000-0.000-0.000 Vector 9:-0.000 0.000 0.000 0.000-0.000-0.000 0.000-0.000 Vector 10:-0.000 0.000-0.000-0.000 0.000-0.000 0.000-0.000-0.000 Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved. Rtb_to_modes> Normal end. Diagrtb> Normal end. B-factor analysis Bfactors> Version 1.22, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 2602121936031399940.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 2602121936031399940.eigenfacs Getnam> Corresponding pdb filename ? Getnam> 2602121936031399940.atom Openam> file on opening on unit 11: 2602121936031399940.atom Getnum> Number of skipped eigenvectors ? Getnum> 0 Getnum> Number of usefull eigenvectors ? Getnum> 10000 %Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 558 First residue number = 1 Last residue number = 279 Number of atoms found = 4418 Mean number per residue = 7.9 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9916E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9948E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9970E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0001E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0003E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0009E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.2888E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.2286E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.3786E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.5855E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.8115E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.5179E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.1079 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.2096 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.2837 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.3027 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.3091 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.3233 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.4162 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.4620 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.5794 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.6941 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.7082 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.8648 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.8885 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.9364 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.9429 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.9980 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.118 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.287 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.448 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.531 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.832 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.949 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.120 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.226 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.369 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.487 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.545 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.614 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.267 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.475 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.658 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.025 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.173 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.213 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.343 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.631 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.689 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.036 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.320 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.246 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.468 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.646 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.785 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.886 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.983 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.298 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.359 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.516 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.851 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.949 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.638 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.925 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.075 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.105 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.538 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.659 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.815 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.933 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.43 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.91 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.05 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.43 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.52 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.67 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.79 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.93 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.14 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.39 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.54 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.26 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.53 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.17 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.29 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.48 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.64 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.30 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.36 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.63 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.72 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.88 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.97 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.44 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.79 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.05 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.27 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.57 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.13 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.23 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.74 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.93 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.28 Bfactors> 106 vectors, 13254 coordinates in file. Openam> file on opening on unit 12: bfactors.pred Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000 Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 0.009289 Bfactors> 100 eigenvectors will be considered. Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped. Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed. (CHARMM units assumed for eigenvalues) Bfactors> Correlation= -0.332 for 558 C-alpha atoms. Bfactors> = 0.959 +/- 2.69 Bfactors> = 76.000 +/- 12.52 Bfactors> Shiftng-fct= 75.041 Bfactors> Scaling-fct= 4.650 Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved. Bfactors> Normal end. check_modes Chkmod> Version 1.00, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 2602121936031399940.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 2602121936031399940.eigenfacs Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4324E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4329E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4333E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4340E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4343E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4354E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 10.47 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 16.21 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 16.75 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 20.56 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 26.18 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 31.69 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 35.67 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 49.71 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 57.84 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 59.74 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 60.37 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 61.74 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 70.05 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 73.81 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 82.65 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 90.47 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 91.38 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 101.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 102.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 105.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 105.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 108.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 114.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 123.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 130.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 134.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 147.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 151.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 158.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 162.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 167.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 171.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 173.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 175.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 196.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 202.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 207.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 217.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 221.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 222.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 226.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 233.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 235.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 243.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 250.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 271.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 276.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 279.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 282.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 284.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 286.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 293.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 294.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 297.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 304.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 306.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 319.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 324.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 327.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 327.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 335.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 337.5 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Chkmod> That is: 4418 cartesian points. Openam> file on opening on unit 11: Chkmod.res Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file. 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perturbations for mode 8 calculating perturbed structure for DQ=-100 2602121936031399940.eigenfacs 2602121936031399940.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2602121936031399940.eigenfacs 2602121936031399940.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2602121936031399940.eigenfacs 2602121936031399940.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2602121936031399940.eigenfacs 2602121936031399940.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2602121936031399940.eigenfacs 2602121936031399940.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2602121936031399940.eigenfacs 2602121936031399940.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2602121936031399940.eigenfacs 2602121936031399940.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2602121936031399940.eigenfacs 2602121936031399940.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2602121936031399940.eigenfacs 2602121936031399940.atom calculating perturbed structure for DQ=80 2602121936031399940.eigenfacs 2602121936031399940.atom 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animated gif 300x300 getting mode 9 running: ../../bin/get_modes.sh 2602121936031399940 9 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 9 calculating perturbed structure for DQ=-100 2602121936031399940.eigenfacs 2602121936031399940.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2602121936031399940.eigenfacs 2602121936031399940.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2602121936031399940.eigenfacs 2602121936031399940.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2602121936031399940.eigenfacs 2602121936031399940.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2602121936031399940.eigenfacs 2602121936031399940.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2602121936031399940.eigenfacs 2602121936031399940.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2602121936031399940.eigenfacs 2602121936031399940.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2602121936031399940.eigenfacs 2602121936031399940.atom calculating perturbed structure for DQ=60 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will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 10 running: ../../bin/get_modes.sh 2602121936031399940 10 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 10 calculating perturbed structure for DQ=-100 2602121936031399940.eigenfacs 2602121936031399940.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2602121936031399940.eigenfacs 2602121936031399940.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2602121936031399940.eigenfacs 2602121936031399940.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2602121936031399940.eigenfacs 2602121936031399940.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2602121936031399940.eigenfacs 2602121936031399940.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2602121936031399940.eigenfacs 2602121936031399940.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2602121936031399940.eigenfacs 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gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2602121936031399940.10.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 11 running: ../../bin/get_modes.sh 2602121936031399940 11 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 11 calculating perturbed structure for DQ=-100 2602121936031399940.eigenfacs 2602121936031399940.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2602121936031399940.eigenfacs 2602121936031399940.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2602121936031399940.eigenfacs 2602121936031399940.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2602121936031399940.eigenfacs 2602121936031399940.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2602121936031399940.eigenfacs 2602121936031399940.atom 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MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2602121936031399940.11.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 2602121936031399940.10.pdb 2602121936031399940.11.pdb 2602121936031399940.7.pdb 2602121936031399940.8.pdb 2602121936031399940.9.pdb STDERR: Note: The following floating-point exceptions are signalling: IEEE_DENORMAL real 0m30.762s user 0m30.608s sys 0m0.135s rm: cannot remove '2602121936031399940.sdijf': No such file or directory pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format 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