*** ***
Output from eigenvector calculation:
STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8)
Build Tirion matrix:
Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model.
Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004.
Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file.
Pdbmat> Coordinate filename = 2602131226311569449.atom
Pdbmat> Distance cutoff = 8.00
Force constant = 10.00
Origin of mass values = CONS
Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09
PRINTing level = 2
Pdbmat> Coordinate file 2602131226311569449.atom to be opened.
Openam> File opened: 2602131226311569449.atom
Pdbmat> Coordinate file in PDB format.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 289
First residue number = 23
Last residue number = 311
Number of atoms found = 2247
Mean number per residue = 7.8
Pdbmat> Coordinate statistics:
= 164.419787 +/- 9.952790 From: 142.718000 To: 187.469000
= 167.320563 +/- 10.566170 From: 143.707000 To: 193.160000
= 187.523903 +/- 14.756980 From: 150.500000 To: 215.511000
Pdbmat> Masses are all set to one.
Openam> File opened: pdbmat.xyzm
Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved.
Openam> File opened: pdbmat.sdijb
Pdbmat> Matrix statistics:
Pdbmat> The matrix is 3.4311 % Filled.
Pdbmat> 779670 non-zero elements.
Pdbmat> 85147 atom-atom interactions.
Pdbmat> Number per atom= 75.79 +/- 21.32
Maximum number = 125
Minimum number = 11
Pdbmat> Matrix trace = 1.702940E+06
Pdbmat> Larger element = 473.035
Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10
Pdbmat> Normal end.
automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1)
289 non-zero elements, NRBL set to 2
Diagonalize Tirion matrix using diagrtb
Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation.
Diagrtb> Version 2.52, November 2004.
Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file.
Diagrtb> Options taken into account:
MATRix filename = pdbmat.sdijb
COORdinates filename = 2602131226311569449.atom
Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb
Nb of VECTors required = 106
EigeNVALues chosen = LOWE
Type of SUBStructuring = NONE
Nb of residues per BLOck = 2
Origin of MASS values = CONS
MATRix FORMat = BINA
Temporary files cleaning = ALL
Output PRINting level = 2
Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb.
Blocpdb> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.xyzm
Blocpdb> Coordinate file 2602131226311569449.atom to be opened.
Openam> file on opening on unit 11:
2602131226311569449.atom
Blocpdb> Coordinate file in PDB format.
Blocpdb> 2247 atoms picked in pdb file.
Blocpdb> All masses set to unity.
Blocpdb> Coordinate file is rewritten.
Blocpdb> Substructuring:
Blocpdb> 2 residue(s) per block.
Blocpdb> 289 residues.
Blocpdb> 17 atoms in block 1
Block first atom: 1
Blocpdb> 11 atoms in block 2
Block first atom: 18
Blocpdb> 14 atoms in block 3
Block first atom: 29
Blocpdb> 16 atoms in block 4
Block first atom: 43
Blocpdb> 9 atoms in block 5
Block first atom: 59
Blocpdb> 12 atoms in block 6
Block first atom: 68
Blocpdb> 9 atoms in block 7
Block first atom: 80
Blocpdb> 12 atoms in block 8
Block first atom: 89
Blocpdb> 17 atoms in block 9
Block first atom: 101
Blocpdb> 14 atoms in block 10
Block first atom: 118
Blocpdb> 18 atoms in block 11
Block first atom: 132
Blocpdb> 14 atoms in block 12
Block first atom: 150
Blocpdb> 21 atoms in block 13
Block first atom: 164
Blocpdb> 16 atoms in block 14
Block first atom: 185
Blocpdb> 16 atoms in block 15
Block first atom: 201
Blocpdb> 17 atoms in block 16
Block first atom: 217
Blocpdb> 16 atoms in block 17
Block first atom: 234
Blocpdb> 20 atoms in block 18
Block first atom: 250
Blocpdb> 16 atoms in block 19
Block first atom: 270
Blocpdb> 14 atoms in block 20
Block first atom: 286
Blocpdb> 23 atoms in block 21
Block first atom: 300
Blocpdb> 15 atoms in block 22
Block first atom: 323
Blocpdb> 12 atoms in block 23
Block first atom: 338
Blocpdb> 14 atoms in block 24
Block first atom: 350
Blocpdb> 18 atoms in block 25
Block first atom: 364
Blocpdb> 16 atoms in block 26
Block first atom: 382
Blocpdb> 18 atoms in block 27
Block first atom: 398
Blocpdb> 16 atoms in block 28
Block first atom: 416
Blocpdb> 11 atoms in block 29
Block first atom: 432
Blocpdb> 12 atoms in block 30
Block first atom: 443
Blocpdb> 20 atoms in block 31
Block first atom: 455
Blocpdb> 15 atoms in block 32
Block first atom: 475
Blocpdb> 14 atoms in block 33
Block first atom: 490
Blocpdb> 14 atoms in block 34
Block first atom: 504
Blocpdb> 20 atoms in block 35
Block first atom: 518
Blocpdb> 10 atoms in block 36
Block first atom: 538
Blocpdb> 15 atoms in block 37
Block first atom: 548
Blocpdb> 14 atoms in block 38
Block first atom: 563
Blocpdb> 12 atoms in block 39
Block first atom: 577
Blocpdb> 22 atoms in block 40
Block first atom: 589
Blocpdb> 12 atoms in block 41
Block first atom: 611
Blocpdb> 20 atoms in block 42
Block first atom: 623
Blocpdb> 19 atoms in block 43
Block first atom: 643
Blocpdb> 14 atoms in block 44
Block first atom: 662
Blocpdb> 18 atoms in block 45
Block first atom: 676
Blocpdb> 19 atoms in block 46
Block first atom: 694
Blocpdb> 14 atoms in block 47
Block first atom: 713
Blocpdb> 15 atoms in block 48
Block first atom: 727
Blocpdb> 16 atoms in block 49
Block first atom: 742
Blocpdb> 13 atoms in block 50
Block first atom: 758
Blocpdb> 15 atoms in block 51
Block first atom: 771
Blocpdb> 16 atoms in block 52
Block first atom: 786
Blocpdb> 10 atoms in block 53
Block first atom: 802
Blocpdb> 12 atoms in block 54
Block first atom: 812
Blocpdb> 9 atoms in block 55
Block first atom: 824
Blocpdb> 12 atoms in block 56
Block first atom: 833
Blocpdb> 14 atoms in block 57
Block first atom: 845
Blocpdb> 14 atoms in block 58
Block first atom: 859
Blocpdb> 14 atoms in block 59
Block first atom: 873
Blocpdb> 13 atoms in block 60
Block first atom: 887
Blocpdb> 17 atoms in block 61
Block first atom: 900
Blocpdb> 15 atoms in block 62
Block first atom: 917
Blocpdb> 16 atoms in block 63
Block first atom: 932
Blocpdb> 20 atoms in block 64
Block first atom: 948
Blocpdb> 18 atoms in block 65
Block first atom: 968
Blocpdb> 17 atoms in block 66
Block first atom: 986
Blocpdb> 13 atoms in block 67
Block first atom: 1003
Blocpdb> 15 atoms in block 68
Block first atom: 1016
Blocpdb> 16 atoms in block 69
Block first atom: 1031
Blocpdb> 23 atoms in block 70
Block first atom: 1047
Blocpdb> 15 atoms in block 71
Block first atom: 1070
Blocpdb> 21 atoms in block 72
Block first atom: 1085
Blocpdb> 11 atoms in block 73
Block first atom: 1106
Blocpdb> 20 atoms in block 74
Block first atom: 1117
Blocpdb> 15 atoms in block 75
Block first atom: 1137
Blocpdb> 20 atoms in block 76
Block first atom: 1152
Blocpdb> 13 atoms in block 77
Block first atom: 1172
Blocpdb> 17 atoms in block 78
Block first atom: 1185
Blocpdb> 11 atoms in block 79
Block first atom: 1202
Blocpdb> 21 atoms in block 80
Block first atom: 1213
Blocpdb> 12 atoms in block 81
Block first atom: 1234
Blocpdb> 12 atoms in block 82
Block first atom: 1246
Blocpdb> 14 atoms in block 83
Block first atom: 1258
Blocpdb> 17 atoms in block 84
Block first atom: 1272
Blocpdb> 13 atoms in block 85
Block first atom: 1289
Blocpdb> 14 atoms in block 86
Block first atom: 1302
Blocpdb> 14 atoms in block 87
Block first atom: 1316
Blocpdb> 19 atoms in block 88
Block first atom: 1330
Blocpdb> 22 atoms in block 89
Block first atom: 1349
Blocpdb> 15 atoms in block 90
Block first atom: 1371
Blocpdb> 13 atoms in block 91
Block first atom: 1386
Blocpdb> 19 atoms in block 92
Block first atom: 1399
Blocpdb> 22 atoms in block 93
Block first atom: 1418
Blocpdb> 23 atoms in block 94
Block first atom: 1440
Blocpdb> 12 atoms in block 95
Block first atom: 1463
Blocpdb> 15 atoms in block 96
Block first atom: 1475
Blocpdb> 17 atoms in block 97
Block first atom: 1490
Blocpdb> 15 atoms in block 98
Block first atom: 1507
Blocpdb> 15 atoms in block 99
Block first atom: 1522
Blocpdb> 16 atoms in block 100
Block first atom: 1537
Blocpdb> 11 atoms in block 101
Block first atom: 1553
Blocpdb> 18 atoms in block 102
Block first atom: 1564
Blocpdb> 9 atoms in block 103
Block first atom: 1582
Blocpdb> 13 atoms in block 104
Block first atom: 1591
Blocpdb> 9 atoms in block 105
Block first atom: 1604
Blocpdb> 11 atoms in block 106
Block first atom: 1613
Blocpdb> 18 atoms in block 107
Block first atom: 1624
Blocpdb> 12 atoms in block 108
Block first atom: 1642
Blocpdb> 14 atoms in block 109
Block first atom: 1654
Blocpdb> 16 atoms in block 110
Block first atom: 1668
Blocpdb> 15 atoms in block 111
Block first atom: 1684
Blocpdb> 16 atoms in block 112
Block first atom: 1699
Blocpdb> 19 atoms in block 113
Block first atom: 1715
Blocpdb> 13 atoms in block 114
Block first atom: 1734
Blocpdb> 17 atoms in block 115
Block first atom: 1747
Blocpdb> 15 atoms in block 116
Block first atom: 1764
Blocpdb> 21 atoms in block 117
Block first atom: 1779
Blocpdb> 19 atoms in block 118
Block first atom: 1800
Blocpdb> 21 atoms in block 119
Block first atom: 1819
Blocpdb> 14 atoms in block 120
Block first atom: 1840
Blocpdb> 12 atoms in block 121
Block first atom: 1854
Blocpdb> 17 atoms in block 122
Block first atom: 1866
Blocpdb> 17 atoms in block 123
Block first atom: 1883
Blocpdb> 18 atoms in block 124
Block first atom: 1900
Blocpdb> 12 atoms in block 125
Block first atom: 1918
Blocpdb> 14 atoms in block 126
Block first atom: 1930
Blocpdb> 23 atoms in block 127
Block first atom: 1944
Blocpdb> 13 atoms in block 128
Block first atom: 1967
Blocpdb> 14 atoms in block 129
Block first atom: 1980
Blocpdb> 18 atoms in block 130
Block first atom: 1994
Blocpdb> 12 atoms in block 131
Block first atom: 2012
Blocpdb> 18 atoms in block 132
Block first atom: 2024
Blocpdb> 14 atoms in block 133
Block first atom: 2042
Blocpdb> 15 atoms in block 134
Block first atom: 2056
Blocpdb> 13 atoms in block 135
Block first atom: 2071
Blocpdb> 18 atoms in block 136
Block first atom: 2084
Blocpdb> 15 atoms in block 137
Block first atom: 2102
Blocpdb> 20 atoms in block 138
Block first atom: 2117
Blocpdb> 16 atoms in block 139
Block first atom: 2137
Blocpdb> 16 atoms in block 140
Block first atom: 2153
Blocpdb> 16 atoms in block 141
Block first atom: 2169
Blocpdb> 17 atoms in block 142
Block first atom: 2185
Blocpdb> 21 atoms in block 143
Block first atom: 2202
Blocpdb> 16 atoms in block 144
Block first atom: 2223
Blocpdb> 9 atoms in block 145
Block first atom: 2238
Blocpdb> 145 blocks.
Blocpdb> At most, 23 atoms in each of them.
Blocpdb> At least, 9 atoms in each of them.
Blocpdb> Normal end of Blocpdb.
Diagrtb> Memory allocation for Prepmat.
Diagrtb> Memory allocation for RTB.
Diagrtb> Memory allocation for Diagstd.
Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes.
Prepmat> Entering in.
Prepmat> Rewriting of the matrix begins.
Prepmat> 779815 matrix lines read.
Prepmat> Matrix order = 6741
Prepmat> Matrix trace = 1702940.0000
Prepmat> Last element read: 6741 6741 116.3411
Prepmat> 10586 lines saved.
Prepmat> 9154 empty lines.
Prepmat> Number of lines on output is as expected.
Prepmat> Normal end of Prepmat.
RTB> Entering in.
RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 2247
RTB> Total mass = 2247.0000
RTB> Number of atoms found in matrix: 2247
RTB> Number of blocks = 145
RTB> Projection begins.
RTB> Projected matrix is being saved.
RTB> Projected matrix trace = 184851.4578
RTB> 49341 non-zero elements.
RTB> Normal end of RTB.
Diagstd> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.sdijb
Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb
Diagstd> CERFACS matrix format.
Diagstd> Projected matrix order = 870
Diagstd> Nb of non-zero elements: 49341
Diagstd> Projected matrix trace = 184851.4578
Openam> file on opening on unit 11:
diagrtb_work.eigenfacs
Diagstd> Diagonalization.
Diagstd> 870 eigenvectors are computed.
Diagstd> 106 of them to be saved.
Diagstd> Sum of eigenvalues = 184851.4578
Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000
Diagstd> Selected eigenvalues:
0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000
0.0000000 0.5503444 1.0806640 1.2963063 1.7195618
2.1505352 2.9748794 3.1886761 4.2061778 4.7650366
5.9863762 6.2391454 6.8522672 7.5130116 7.9612605
8.3860211 8.9893100 9.2430532 9.7916822 10.3826813
10.5871361 10.9905114 11.4535347 12.3971625 13.2759186
14.3036281 14.7133215 15.0943072 16.3846827 16.6111449
17.8988552 19.5219974 20.0832054 20.3088338 20.8499040
21.6825276 22.1102352 22.3433509 22.3963692 23.1273318
24.0638395 24.7377407 25.2008180 25.8112714 26.0869147
26.8263419 27.3231568 27.8273389 29.0440076 30.2041830
30.7513949 31.8666344 32.5724205 32.9089235 34.0522810
34.3707207 35.3690701 36.6270976 37.2605891 38.1469529
38.7029271 39.2859462 39.7832055 40.8893871 41.3658050
42.0489811 42.3609132 42.6929698 43.2059506 44.3239518
44.8316114 45.7861518 46.3427014 46.9289896 47.5748721
47.9348016 48.3127128 49.5705357 50.0494827 51.1311663
51.5843388 52.3215324 53.7297039 54.2359115 54.6767627
54.8193146 55.5445725 56.0066355 56.4454269 57.2724337
57.7008088 58.5797277 59.2464622 59.3986935 59.8524531
60.7672816 61.5012686 62.2540372 62.8966033 63.5700584
64.1054499
Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units):
0.0034323 0.0034333 0.0034335 0.0034339 0.0034341
0.0034344 80.5587225 112.8861376 123.6371830 142.3980926
159.2460100 187.2966294 193.9101243 222.7096805 237.0436915
265.6912684 271.2425595 284.2578227 297.6475483 306.3981920
314.4656817 325.5805543 330.1436943 339.8004381 349.9049138
353.3332666 360.0014334 367.5065205 382.3458907 395.6649422
410.6940257 416.5341788 421.8925654 439.5560859 442.5833423
459.4178947 479.7968650 486.6444726 489.3704858 495.8465658
505.6502589 510.6131104 513.2978365 513.9064744 522.2254661
532.6939217 540.1013923 545.1331582 551.6961829 554.6341916
562.4397517 567.6239581 572.8370752 585.2259173 596.8000165
602.1818904 613.0040998 619.7553678 622.9484622 633.6776427
636.6336644 645.8134732 657.1984541 662.8574455 670.6952135
675.5650699 680.6343907 684.9283881 694.3853998 698.4189596
704.1627033 706.7697236 709.5344118 713.7844174 722.9604130
727.0888000 734.7885022 739.2408422 743.9022669 749.0039273
751.8318972 754.7897475 764.5521018 768.2367465 776.4940457
779.9274655 785.4806810 795.9806384 799.7214634 802.9651130
804.0111670 809.3122133 812.6714863 815.8487662 821.8037135
824.8713709 831.1299924 835.8464290 836.9195764 840.1102001
846.5062809 851.6032638 856.7991770 861.2096280 865.8079821
869.4462856
Diagstd> Normal end.
Rtb_to_modes> Entering in.
Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 2247
Rtb_to_modes> Number of blocs = 145
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 11:
matrix.eigenrtb
Rdmodfacs> Entering in.
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Eigenvector number: 1
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9901E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 2
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9963E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 3
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9972E-10
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Rdmodfacs> Eigenvector number: 106
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 64.11
Rtb_to_modes> 106 vectors, with 870 coordinates in vector file.
Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected):
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0.99998 0.99999 1.00000 1.00001 0.99997
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0.99999 1.00001 1.00003 0.99998 0.99998
1.00003 1.00000 0.99999 0.99999 0.99998
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1.00001
Rtb_to_modes> RTB block-file is being read.
Rtb_to_modes> 40446 lines found in RTB file.
Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected):
0.99999 1.00001 0.99999 1.00002 1.00000
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1.00000 1.00002 0.99999 1.00000 1.00001
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1.00001 1.00000 0.99997 1.00001 1.00000
0.99999 1.00001 1.00003 0.99998 0.99998
1.00003 1.00000 0.99999 0.99999 0.99998
0.99999 0.99999 1.00001 1.00000 0.99999
0.99997 1.00000 0.99997 0.99998 1.00005
1.00000 1.00000 0.99998 1.00001 1.00000
1.00000 1.00000 0.99997 1.00002 1.00000
0.99999 1.00000 0.99999 0.99999 0.99999
1.00002 1.00005 0.99999 0.99999 1.00001
1.00001
Orthogonality of first eigenvectors (zero expected):
Vector 2: 0.000
Vector 3:-0.000 0.000
Vector 4: 0.000-0.000-0.000
Vector 5:-0.000 0.000-0.000-0.000
Vector 6:-0.000 0.000-0.000-0.000-0.000
Vector 7: 0.000 0.000 0.000-0.000-0.000-0.000
Vector 8:-0.000-0.000 0.000-0.000-0.000 0.000 0.000
Vector 9:-0.000-0.000-0.000 0.000-0.000 0.000-0.000-0.000
Vector 10:-0.000-0.000 0.000 0.000-0.000 0.000 0.000-0.000-0.000
Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved.
Rtb_to_modes> Normal end.
Diagrtb> Normal end.
B-factor analysis
Bfactors> Version 1.22, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 2602131226311569449.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
2602131226311569449.eigenfacs
Getnam> Corresponding pdb filename ?
Getnam> 2602131226311569449.atom
Openam> file on opening on unit 11:
2602131226311569449.atom
Getnum> Number of skipped eigenvectors ?
Getnum> 0
Getnum> Number of usefull eigenvectors ?
Getnum> 10000
%Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 289
First residue number = 23
Last residue number = 311
Number of atoms found = 2247
Mean number per residue = 7.8
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9901E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9972E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9997E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0001E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0002E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.5503
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.081
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.296
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.720
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.151
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.975
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.189
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.206
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.765
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.239
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.852
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.513
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.961
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
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Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.989
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.243
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.792
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.59
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.99
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.45
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.40
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.28
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.30
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.71
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.38
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.61
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.90
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.52
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.08
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.31
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.85
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.68
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.11
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.34
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.40
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.13
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.06
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.74
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.20
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.81
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.83
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.32
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.83
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.04
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.20
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.75
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.87
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.57
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.91
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.05
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.37
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 59.40
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 59.85
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 60.77
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 61.50
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 62.25
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 62.90
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 63.57
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 64.11
Bfactors> 106 vectors, 6741 coordinates in file.
Openam> file on opening on unit 12:
bfactors.pred
Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000
Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 0.550300
Bfactors> 100 eigenvectors will be considered.
Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped.
Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed.
(CHARMM units assumed for eigenvalues)
Bfactors> Correlation= 0.700 for 289 C-alpha atoms.
Bfactors> = 0.057 +/- 0.08
Bfactors> = 32.032 +/- 22.88
Bfactors> Shiftng-fct= 31.976
Bfactors> Scaling-fct= 270.110
Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved.
Bfactors> Normal end.
check_modes
Chkmod> Version 1.00, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 2602131226311569449.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
2602131226311569449.eigenfacs
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4321E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4332E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4333E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4338E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4340E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4342E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 80.55
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 112.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 123.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 142.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 159.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 187.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 193.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 222.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 237.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 265.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 271.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 284.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 297.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 306.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 314.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 325.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 330.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 339.8
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Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 349.8
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Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 353.4
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 439.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 442.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 479.8
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Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 486.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 489.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 495.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 505.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 510.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 513.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 513.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 522.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 532.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 540.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 545.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 551.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 554.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 562.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 567.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 572.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 585.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 596.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 602.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 613.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 619.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 622.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 633.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 636.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 645.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 657.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 662.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 670.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 675.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 680.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 684.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 694.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 698.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 704.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 706.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 709.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 713.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 722.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 727.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 734.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 739.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 743.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 748.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 751.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 754.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 764.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 768.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 776.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 779.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 785.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
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Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 799.7
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Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 803.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 804.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 809.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 812.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 821.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 824.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 831.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 835.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 836.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 840.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 846.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 851.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 856.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 861.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 865.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 869.4
Chkmod> 106 vectors, 6741 coordinates in file.
Chkmod> That is: 2247 cartesian points.
Openam> file on opening on unit 11:
Chkmod.res
Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file.
%Chkmod-Wn> Norm of vector 50 is: 1.0001 (instead of 1.0000).
%Chkmod-Wn> Norm of vector 85 is: 1.0001 (instead of 1.0000).
Chkmod> Normal end.
0.0034 0.7971
0.0034 0.7393
0.0034 0.7731
0.0034 0.9443
0.0034 0.8477
0.0034 0.8834
80.5520 0.1653
112.8988 0.2573
123.6173 0.1618
142.4101 0.2274
159.2564 0.3739
187.2924 0.3736
193.9116 0.4883
222.6954 0.2719
237.0326 0.2683
265.6715 0.2778
271.2278 0.2211
284.2401 0.4892
297.6345 0.2321
306.3800 0.5369
314.4518 0.3728
325.5610 0.4339
330.1286 0.4496
339.7914 0.4809
349.8447 0.2724
353.3659 0.4151
359.9776 0.4563
367.4340 0.4292
382.3732 0.3145
395.7088 0.2647
410.6243 0.3743
416.4693 0.4274
421.8143 0.4259
439.4744 0.3426
442.5491 0.2342
459.4129 0.4283
479.7517 0.2103
486.5847 0.4695
489.3635 0.4454
495.8264 0.3881
505.5991 0.3403
510.5885 0.2643
513.2373 0.4083
513.9261 0.3050
522.2332 0.1616
532.6286 0.4030
540.1029 0.4013
545.1009 0.2358
551.6589 0.3939
554.6432 0.0286
562.4540 0.4021
567.5668 0.5564
572.8399 0.6089
585.1604 0.3859
596.7331 0.5233
602.1424 0.5930
613.0102 0.5890
619.7057 0.4681
622.9319 0.5047
633.6292 0.4726
636.5997 0.4399
645.7942 0.3155
657.1963 0.4892
662.8238 0.3314
670.6932 0.3890
675.5105 0.3678
680.6403 0.4016
684.8714 0.3567
694.3608 0.1090
698.4244 0.3349
704.1410 0.1690
706.7318 0.3599
709.4793 0.4119
713.7872 0.3661
722.8971 0.4729
727.0445 0.4046
734.7878 0.3065
739.1876 0.2517
743.8783 0.5025
748.9334 0.4131
751.7620 0.2951
754.7362 0.4267
764.5152 0.3725
768.2077 0.4571
776.4519 0.3026
779.8612 0.4650
785.4355 0.5105
795.9487 0.5803
799.7173 0.4778
802.9544 0.4029
803.9817 0.4895
809.2442 0.4817
812.6610 0.4629
815.8468 0.5715
821.7510 0.4523
824.8302 0.5763
831.0962 0.4680
835.8355 0.4877
836.8929 0.4937
840.0569 0.5585
846.4889 0.5193
851.5579 0.3958
856.7346 0.3172
861.1959 0.3129
865.7704 0.4575
869.4398 0.3231
Project conformational change on normal modes:
Projmod> Version 1.36, April 2003.
Projmod> Projection of a difference vector on a set of eigenvectors.
Getnam> CERFACS file with the eigenvectors ?
Getnam> 2602131226311569449.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
2602131226311569449.eigenfacs
Getnam> Pdb file with the reference structure ?
Getnam> 2602131226311569449.atom
Openam> file on opening on unit 11:
2602131226311569449.atom
Getnam> Pdb file with the other conformer ?
Getnam> 2602131226311569449.atom2
Openam> file on opening on unit 12:
2602131226311569449.atom2
Getrep> Are the masses given in the pdb file ? (y/n)
Getrep> F
Projmod> All masses will all be assumed to be of 1.
Getrep> Displacement along one mode ? (y/n)
Getrep> F
Openam> file on opening on unit 13:
projmod.res
Openam> file on opening on unit 14:
dr.res
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4321E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4332E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4333E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4338E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4340E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4342E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 80.55
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 112.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 123.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 142.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 159.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 187.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 193.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 222.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 237.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 265.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 271.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 284.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 297.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 306.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 314.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 325.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 330.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 339.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 349.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 353.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 360.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 367.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 382.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 395.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 410.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 416.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 421.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 439.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 442.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 459.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 479.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 486.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 489.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 495.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 505.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 510.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 513.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 513.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 522.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 532.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 540.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 545.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 551.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 554.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 562.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 567.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 572.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 585.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 596.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 602.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 613.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 619.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 622.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 633.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 636.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 645.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 657.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 662.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 670.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 675.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 680.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 684.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 694.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 698.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 704.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 706.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 709.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 713.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 722.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 727.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 734.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 739.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 743.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 748.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 751.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 754.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 764.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 768.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 776.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 779.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 785.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 795.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 799.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 803.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 804.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 809.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 812.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 815.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 821.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 824.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 831.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 835.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 836.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 840.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 846.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 851.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 856.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 861.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 865.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 869.4
Projmod> 106 vectors, 6741 coordinates in file.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 289
First residue number = 23
Last residue number = 311
Number of atoms found = 2247
Mean number per residue = 7.8
Projmod> Cartesian (eigen)vectors will be studied.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 290
First residue number = 22
Last residue number = 311
Number of atoms found = 2255
Mean number per residue = 7.8
%Projmod-Wn> Different number of atoms for the other conformer.
%Projmod-Wn> Different number of residues for the other conformer.
Projmod> All atoms of first conformer were found in second one.
Projmod> File dr.res: displacement=f(atom number).
Projmod> 2247 atoms are considered.
Projmod> Atomic r.m.s. displacements= 4.99
Projmod> Atomic average masses = 1.00 +/- 0.00
Projmod> File projmod.res: dr.vector=f(fqcy), and cumulative square sum.
Vector: 1 F= 0.00 Cos= 0.009 Sum= 0.000 q= 2.0664
Vector: 2 F= 0.00 Cos= -0.018 Sum= 0.000 q= -4.3747
Vector: 3 F= 0.00 Cos= 0.047 Sum= 0.003 q= 11.1734
Vector: 4 F= 0.00 Cos= -0.013 Sum= 0.003 q= -3.1880
Vector: 5 F= 0.00 Cos= 0.048 Sum= 0.005 q= 11.3058
Vector: 6 F= 0.00 Cos= -0.037 Sum= 0.006 q= -8.7425
Vector: 7 F= 80.55 Cos= -0.416 Sum= 0.180 q= -98.4113
Vector: 8 F= 112.90 Cos= 0.013 Sum= 0.180 q= 3.0924
Vector: 9 F= 123.62 Cos= -0.378 Sum= 0.323 q= -89.3590
Vector: 10 F= 142.41 Cos= 0.173 Sum= 0.353 q= 40.9285
Vector: 11 F= 159.26 Cos= -0.101 Sum= 0.363 q= -23.9970
Vector: 12 F= 187.29 Cos= -0.074 Sum= 0.368 q= -17.3903
Vector: 13 F= 193.91 Cos= 0.071 Sum= 0.373 q= 16.8572
Vector: 14 F= 222.70 Cos= 0.061 Sum= 0.377 q= 14.4439
Vector: 15 F= 237.03 Cos= -0.124 Sum= 0.393 q= -29.4350
Vector: 16 F= 265.67 Cos= -0.069 Sum= 0.397 q= -16.2142
Vector: 17 F= 271.23 Cos= 0.016 Sum= 0.398 q= 3.8945
Vector: 18 F= 284.24 Cos= 0.052 Sum= 0.400 q= 12.2307
Vector: 19 F= 297.63 Cos= 0.030 Sum= 0.401 q= 7.1756
Vector: 20 F= 306.38 Cos= 0.061 Sum= 0.405 q= 14.4085
Vector: 21 F= 314.45 Cos= -0.014 Sum= 0.405 q= -3.3168
Vector: 22 F= 325.56 Cos= -0.101 Sum= 0.415 q= -23.8490
Vector: 23 F= 330.13 Cos= 0.146 Sum= 0.436 q= 34.5249
Vector: 24 F= 339.79 Cos= 0.023 Sum= 0.437 q= 5.4417
Vector: 25 F= 349.84 Cos= 0.179 Sum= 0.469 q= 42.2946
Vector: 26 F= 353.37 Cos= 0.217 Sum= 0.516 q= 51.3824
Vector: 27 F= 359.98 Cos= -0.082 Sum= 0.523 q= -19.3694
Vector: 28 F= 367.43 Cos= -0.084 Sum= 0.530 q= -19.9032
Vector: 29 F= 382.37 Cos= -0.064 Sum= 0.534 q= -15.1237
Vector: 30 F= 395.71 Cos= 0.008 Sum= 0.534 q= 1.9405
Vector: 31 F= 410.62 Cos= -0.235 Sum= 0.589 q= -55.6203
Vector: 32 F= 416.47 Cos= -0.015 Sum= 0.590 q= -3.4614
Vector: 33 F= 421.81 Cos= 0.074 Sum= 0.595 q= 17.5444
Vector: 34 F= 439.47 Cos= -0.005 Sum= 0.595 q= -1.1302
Vector: 35 F= 442.55 Cos= -0.068 Sum= 0.600 q= -16.0886
Vector: 36 F= 459.41 Cos= 0.166 Sum= 0.627 q= 39.2058
Vector: 37 F= 479.75 Cos= -0.040 Sum= 0.629 q= -9.3626
Vector: 38 F= 486.58 Cos= -0.005 Sum= 0.629 q= -1.2844
Vector: 39 F= 489.36 Cos= 0.004 Sum= 0.629 q= 0.8415
Vector: 40 F= 495.83 Cos= -0.112 Sum= 0.642 q= -26.5419
Vector: 41 F= 505.60 Cos= 0.055 Sum= 0.645 q= 13.0684
Vector: 42 F= 510.59 Cos= 0.034 Sum= 0.646 q= 8.1495
Vector: 43 F= 513.24 Cos= 0.111 Sum= 0.658 q= 26.3481
Vector: 44 F= 513.93 Cos= -0.138 Sum= 0.677 q= -32.6808
Vector: 45 F= 522.23 Cos= 0.061 Sum= 0.681 q= 14.4210
Vector: 46 F= 532.63 Cos= -0.053 Sum= 0.684 q= -12.4590
Vector: 47 F= 540.10 Cos= 0.191 Sum= 0.720 q= 45.1935
Vector: 48 F= 545.10 Cos= -0.017 Sum= 0.721 q= -4.0049
Vector: 49 F= 551.66 Cos= 0.030 Sum= 0.721 q= 7.0601
%Projmod-Wn> Eigenvector 50 Norm= 1.0001
Vector: 50 F= 554.64 Cos= 0.045 Sum= 0.723 q= 10.5653
Vector: 51 F= 562.45 Cos= 0.030 Sum= 0.724 q= 7.1501
Vector: 52 F= 567.57 Cos= 0.032 Sum= 0.725 q= 7.6527
Vector: 53 F= 572.84 Cos= 0.030 Sum= 0.726 q= 6.9917
Vector: 54 F= 585.16 Cos= -0.050 Sum= 0.729 q= -11.9247
Vector: 55 F= 596.73 Cos= 0.026 Sum= 0.730 q= 6.2663
Vector: 56 F= 602.14 Cos= 0.076 Sum= 0.735 q= 17.9866
Vector: 57 F= 613.01 Cos= -0.137 Sum= 0.754 q= -32.3810
Vector: 58 F= 619.71 Cos= 0.019 Sum= 0.754 q= 4.4858
Vector: 59 F= 622.93 Cos= 0.011 Sum= 0.755 q= 2.4833
Vector: 60 F= 633.63 Cos= 0.016 Sum= 0.755 q= 3.6875
Vector: 61 F= 636.60 Cos= 0.010 Sum= 0.755 q= 2.3413
Vector: 62 F= 645.79 Cos= 0.007 Sum= 0.755 q= 1.5577
Vector: 63 F= 657.20 Cos= 0.076 Sum= 0.761 q= 18.0718
Vector: 64 F= 662.82 Cos= 0.025 Sum= 0.761 q= 5.9171
Vector: 65 F= 670.69 Cos= 0.076 Sum= 0.767 q= 18.0132
Vector: 66 F= 675.51 Cos= -0.018 Sum= 0.768 q= -4.3413
Vector: 67 F= 680.64 Cos= -0.046 Sum= 0.770 q= -10.8153
Vector: 68 F= 684.87 Cos= 0.039 Sum= 0.771 q= 9.1193
Vector: 69 F= 694.36 Cos= 0.009 Sum= 0.771 q= 2.2153
Vector: 70 F= 698.42 Cos= -0.018 Sum= 0.772 q= -4.3652
Vector: 71 F= 704.14 Cos= 0.015 Sum= 0.772 q= 3.5402
Vector: 72 F= 706.73 Cos= -0.088 Sum= 0.779 q= -20.7673
Vector: 73 F= 709.48 Cos= -0.001 Sum= 0.779 q= -0.2365
Vector: 74 F= 713.79 Cos= -0.027 Sum= 0.780 q= -6.2746
Vector: 75 F= 722.90 Cos= -0.012 Sum= 0.780 q= -2.8155
Vector: 76 F= 727.04 Cos= 0.020 Sum= 0.781 q= 4.6671
Vector: 77 F= 734.79 Cos= 0.012 Sum= 0.781 q= 2.7940
Vector: 78 F= 739.19 Cos= -0.043 Sum= 0.783 q= -10.0823
Vector: 79 F= 743.88 Cos= 0.002 Sum= 0.783 q= 0.5385
Vector: 80 F= 748.93 Cos= 0.006 Sum= 0.783 q= 1.4202
Vector: 81 F= 751.76 Cos= -0.025 Sum= 0.783 q= -5.8436
Vector: 82 F= 754.74 Cos= 0.015 Sum= 0.784 q= 3.4624
Vector: 83 F= 764.52 Cos= 0.048 Sum= 0.786 q= 11.4067
Vector: 84 F= 768.21 Cos= -0.031 Sum= 0.787 q= -7.2980
%Projmod-Wn> Eigenvector 85 Norm= 1.0001
Vector: 85 F= 776.45 Cos= 0.006 Sum= 0.787 q= 1.5007
Vector: 86 F= 779.86 Cos= 0.012 Sum= 0.787 q= 2.7918
Vector: 87 F= 785.44 Cos= -0.012 Sum= 0.787 q= -2.7773
Vector: 88 F= 795.95 Cos= -0.023 Sum= 0.788 q= -5.4973
Vector: 89 F= 799.72 Cos= 0.013 Sum= 0.788 q= 3.0771
Vector: 90 F= 802.95 Cos= -0.040 Sum= 0.789 q= -9.5762
Vector: 91 F= 803.98 Cos= 0.013 Sum= 0.790 q= 2.9691
Vector: 92 F= 809.24 Cos= -0.012 Sum= 0.790 q= -2.9240
Vector: 93 F= 812.66 Cos= -0.039 Sum= 0.791 q= -9.3359
Vector: 94 F= 815.85 Cos= -0.059 Sum= 0.795 q= -13.8400
Vector: 95 F= 821.75 Cos= 0.000 Sum= 0.795 q= 0.0360
Vector: 96 F= 824.83 Cos= 0.042 Sum= 0.797 q= 9.9750
Vector: 97 F= 831.10 Cos= 0.036 Sum= 0.798 q= 8.4634
Vector: 98 F= 835.84 Cos= -0.029 Sum= 0.799 q= -6.9650
Vector: 99 F= 836.89 Cos= -0.019 Sum= 0.799 q= -4.5953
Vector: 100 F= 840.06 Cos= 0.032 Sum= 0.800 q= 7.5615
Vector: 101 F= 846.49 Cos= -0.066 Sum= 0.805 q= -15.7177
Vector: 102 F= 851.56 Cos= -0.026 Sum= 0.805 q= -6.1375
Vector: 103 F= 856.73 Cos= -0.062 Sum= 0.809 q= -14.5760
Vector: 104 F= 861.20 Cos= 0.022 Sum= 0.810 q= 5.3056
Vector: 105 F= 865.77 Cos= 0.026 Sum= 0.810 q= 6.1214
Vector: 106 F= 869.44 Cos= 0.000 Sum= 0.810 q= 0.1042
Projmod> Best zero-frequency found : 0.003432
Projmod> 6 frequencies less than: 0.003434
Projmod> Lowest non-zero frequency : 80.552012
Projmod> Best overlap with diff.vect. = -0.42 for mode 7 with F= 80.55 cm-1.
Projmod> 1-3-6-9-12-all-best contrb. = 0.173 0.371 0.487 0.566 0.619 0.810
Projmod> Normal end.
getting mode 7
running: ../../bin/get_modes.sh 2602131226311569449 7 -100 100 20 on on
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 7
calculating perturbed structure for DQ=-100
2602131226311569449.eigenfacs
2602131226311569449.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2602131226311569449.eigenfacs
2602131226311569449.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2602131226311569449.eigenfacs
2602131226311569449.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2602131226311569449.eigenfacs
2602131226311569449.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2602131226311569449.eigenfacs
2602131226311569449.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2602131226311569449.eigenfacs
2602131226311569449.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2602131226311569449.eigenfacs
2602131226311569449.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2602131226311569449.eigenfacs
2602131226311569449.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2602131226311569449.eigenfacs
2602131226311569449.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2602131226311569449.eigenfacs
2602131226311569449.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2602131226311569449.eigenfacs
2602131226311569449.atom
making animated gifs
11 models are in 2602131226311569449.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2602131226311569449.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2602131226311569449.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
compute RMSD to second conformer
MODEL 1 MODE=7 DQ=-100 289 4.119 152 1.928
MODEL 2 MODE=7 DQ=-80 289 4.131 134 2.040
MODEL 3 MODE=7 DQ=-60 289 4.183 131 2.017
MODEL 4 MODE=7 DQ=-40 289 4.272 132 2.033
MODEL 5 MODE=7 DQ=-20 289 4.397 130 2.015
MODEL 6 MODE=7 DQ=0 289 4.555 128 2.003
MODEL 7 MODE=7 DQ=20 289 4.742 126 1.944
MODEL 8 MODE=7 DQ=40 289 4.955 126 1.944
MODEL 9 MODE=7 DQ=60 289 5.191 128 1.937
MODEL 10 MODE=7 DQ=80 289 5.447 117 1.944
MODEL 11 MODE=7 DQ=100 289 5.721 124 1.892
getting mode 8
running: ../../bin/get_modes.sh 2602131226311569449 8 -100 100 20 on on
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 8
calculating perturbed structure for DQ=-100
2602131226311569449.eigenfacs
2602131226311569449.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2602131226311569449.eigenfacs
2602131226311569449.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2602131226311569449.eigenfacs
2602131226311569449.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2602131226311569449.eigenfacs
2602131226311569449.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2602131226311569449.eigenfacs
2602131226311569449.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2602131226311569449.eigenfacs
2602131226311569449.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2602131226311569449.eigenfacs
2602131226311569449.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2602131226311569449.eigenfacs
2602131226311569449.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2602131226311569449.eigenfacs
2602131226311569449.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2602131226311569449.eigenfacs
2602131226311569449.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2602131226311569449.eigenfacs
2602131226311569449.atom
making animated gifs
11 models are in 2602131226311569449.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2602131226311569449.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2602131226311569449.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
compute RMSD to second conformer
MODEL 1 MODE=8 DQ=-100 289 5.005 127 1.845
MODEL 2 MODE=8 DQ=-80 289 4.853 128 1.870
MODEL 3 MODE=8 DQ=-60 289 4.730 122 1.897
MODEL 4 MODE=8 DQ=-40 289 4.638 122 1.929
MODEL 5 MODE=8 DQ=-20 289 4.579 124 1.956
MODEL 6 MODE=8 DQ=0 289 4.555 128 2.003
MODEL 7 MODE=8 DQ=20 289 4.566 127 2.022
MODEL 8 MODE=8 DQ=40 289 4.611 131 2.066
MODEL 9 MODE=8 DQ=60 289 4.690 130 2.053
MODEL 10 MODE=8 DQ=80 289 4.802 133 2.054
MODEL 11 MODE=8 DQ=100 289 4.943 136 2.077
getting mode 9
running: ../../bin/get_modes.sh 2602131226311569449 9 -100 100 20 on on
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 9
calculating perturbed structure for DQ=-100
2602131226311569449.eigenfacs
2602131226311569449.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2602131226311569449.eigenfacs
2602131226311569449.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2602131226311569449.eigenfacs
2602131226311569449.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2602131226311569449.eigenfacs
2602131226311569449.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2602131226311569449.eigenfacs
2602131226311569449.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2602131226311569449.eigenfacs
2602131226311569449.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2602131226311569449.eigenfacs
2602131226311569449.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2602131226311569449.eigenfacs
2602131226311569449.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2602131226311569449.eigenfacs
2602131226311569449.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2602131226311569449.eigenfacs
2602131226311569449.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2602131226311569449.eigenfacs
2602131226311569449.atom
making animated gifs
11 models are in 2602131226311569449.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2602131226311569449.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2602131226311569449.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
compute RMSD to second conformer
MODEL 1 MODE=9 DQ=-100 289 4.145 134 2.046
MODEL 2 MODE=9 DQ=-80 289 4.152 118 1.966
MODEL 3 MODE=9 DQ=-60 289 4.197 125 1.976
MODEL 4 MODE=9 DQ=-40 289 4.281 127 1.995
MODEL 5 MODE=9 DQ=-20 289 4.402 126 1.994
MODEL 6 MODE=9 DQ=0 289 4.555 128 2.003
MODEL 7 MODE=9 DQ=20 289 4.738 127 1.997
MODEL 8 MODE=9 DQ=40 289 4.948 127 1.985
MODEL 9 MODE=9 DQ=60 289 5.182 128 1.845
MODEL 10 MODE=9 DQ=80 289 5.436 126 1.938
MODEL 11 MODE=9 DQ=100 289 5.707 132 1.826
getting mode 10
running: ../../bin/get_modes.sh 2602131226311569449 10 -100 100 20 on on
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 10
calculating perturbed structure for DQ=-100
2602131226311569449.eigenfacs
2602131226311569449.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2602131226311569449.eigenfacs
2602131226311569449.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2602131226311569449.eigenfacs
2602131226311569449.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2602131226311569449.eigenfacs
2602131226311569449.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2602131226311569449.eigenfacs
2602131226311569449.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2602131226311569449.eigenfacs
2602131226311569449.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2602131226311569449.eigenfacs
2602131226311569449.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2602131226311569449.eigenfacs
2602131226311569449.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2602131226311569449.eigenfacs
2602131226311569449.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2602131226311569449.eigenfacs
2602131226311569449.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2602131226311569449.eigenfacs
2602131226311569449.atom
making animated gifs
11 models are in 2602131226311569449.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2602131226311569449.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2602131226311569449.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
compute RMSD to second conformer
MODEL 1 MODE=10 DQ=-100 289 5.277 126 2.025
MODEL 2 MODE=10 DQ=-80 289 5.079 119 1.967
MODEL 3 MODE=10 DQ=-60 289 4.905 120 2.010
MODEL 4 MODE=10 DQ=-40 289 4.757 125 2.005
MODEL 5 MODE=10 DQ=-20 289 4.640 128 2.008
MODEL 6 MODE=10 DQ=0 289 4.555 128 2.003
MODEL 7 MODE=10 DQ=20 289 4.503 127 1.958
MODEL 8 MODE=10 DQ=40 289 4.487 131 1.954
MODEL 9 MODE=10 DQ=60 289 4.506 139 1.874
MODEL 10 MODE=10 DQ=80 289 4.560 138 1.884
MODEL 11 MODE=10 DQ=100 289 4.648 143 1.727
getting mode 11
running: ../../bin/get_modes.sh 2602131226311569449 11 -100 100 20 on on
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 11
calculating perturbed structure for DQ=-100
2602131226311569449.eigenfacs
2602131226311569449.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2602131226311569449.eigenfacs
2602131226311569449.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2602131226311569449.eigenfacs
2602131226311569449.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2602131226311569449.eigenfacs
2602131226311569449.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2602131226311569449.eigenfacs
2602131226311569449.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2602131226311569449.eigenfacs
2602131226311569449.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2602131226311569449.eigenfacs
2602131226311569449.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2602131226311569449.eigenfacs
2602131226311569449.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2602131226311569449.eigenfacs
2602131226311569449.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2602131226311569449.eigenfacs
2602131226311569449.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2602131226311569449.eigenfacs
2602131226311569449.atom
making animated gifs
11 models are in 2602131226311569449.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
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MODEL 1 will be plotted
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making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
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compute RMSD to second conformer
MODEL 1 MODE=11 DQ=-100 289 4.788 132 1.877
MODEL 2 MODE=11 DQ=-80 289 4.677 134 1.888
MODEL 3 MODE=11 DQ=-60 289 4.597 139 1.910
MODEL 4 MODE=11 DQ=-40 289 4.549 137 1.952
MODEL 5 MODE=11 DQ=-20 289 4.535 129 1.936
MODEL 6 MODE=11 DQ=0 289 4.555 128 2.003
MODEL 7 MODE=11 DQ=20 289 4.608 127 2.013
MODEL 8 MODE=11 DQ=40 289 4.693 127 1.981
MODEL 9 MODE=11 DQ=60 289 4.809 124 2.014
MODEL 10 MODE=11 DQ=80 289 4.953 118 1.961
MODEL 11 MODE=11 DQ=100 289 5.123 120 1.979
2602131226311569449.10.pdb
2602131226311569449.11.pdb
2602131226311569449.7.pdb
2602131226311569449.8.pdb
2602131226311569449.9.pdb
STDERR:
Note: The following floating-point exceptions are signalling: IEEE_DENORMAL
real 0m9.914s
user 0m9.857s
sys 0m0.052s
rm: cannot remove '2602131226311569449.sdijf': No such file or directory
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