CNRS Nantes University US2B US2B
home |  start a new run |  job status |  references&downloads |  examples |  help  

Should you encounter any unexpected behaviour,
please let us know.
elNémo has been hacked on november 27th.
It has been moved away and runs again.
**Still some additional cleaning from time to time**
Sorry for the inconvenience.


***  4HW5_noSO4_3  ***

LOGs for ID: 2602132148051654465

Output from eigenvector calculation:


STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8) Build Tirion matrix: Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model. Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004. Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file. Pdbmat> Coordinate filename = 2602132148051654465.atom Pdbmat> Distance cutoff = 8.00 Force constant = 10.00 Origin of mass values = CONS Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09 PRINTing level = 2 Pdbmat> Coordinate file 2602132148051654465.atom to be opened. Openam> File opened: 2602132148051654465.atom Pdbmat> Coordinate file in PDB format. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 154 First residue number = 672 Last residue number = 748 Number of atoms found = 1262 Mean number per residue = 8.2 Pdbmat> Coordinate statistics: = 13.320559 +/- 8.262653 From: -7.070000 To: 35.144000 = 23.055235 +/- 7.214969 From: 1.929000 To: 43.428000 = 1.559563 +/- 15.246930 From: -30.965000 To: 34.097000 Pdbmat> Masses are all set to one. Openam> File opened: pdbmat.xyzm Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved. Openam> File opened: pdbmat.sdijb Pdbmat> Matrix statistics: Pdbmat> The matrix is 5.6842 % Filled. Pdbmat> 407488 non-zero elements. Pdbmat> 44444 atom-atom interactions. Pdbmat> Number per atom= 70.43 +/- 21.22 Maximum number = 123 Minimum number = 16 Pdbmat> Matrix trace = 888880. Pdbmat> Larger element = 467.083 Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10 Pdbmat> Normal end. automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1) 154 non-zero elements, NRBL set to 1 Diagonalize Tirion matrix using diagrtb Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation. Diagrtb> Version 2.52, November 2004. Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file. Diagrtb> Options taken into account: MATRix filename = pdbmat.sdijb COORdinates filename = 2602132148051654465.atom Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb Nb of VECTors required = 106 EigeNVALues chosen = LOWE Type of SUBStructuring = NONE Nb of residues per BLOck = 1 Origin of MASS values = CONS MATRix FORMat = BINA Temporary files cleaning = ALL Output PRINting level = 2 Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb. Blocpdb> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.xyzm Blocpdb> Coordinate file 2602132148051654465.atom to be opened. Openam> file on opening on unit 11: 2602132148051654465.atom Blocpdb> Coordinate file in PDB format. Blocpdb> 1262 atoms picked in pdb file. Blocpdb> All masses set to unity. Blocpdb> Coordinate file is rewritten. Blocpdb> Substructuring: Blocpdb> 1 residue(s) per block. Blocpdb> 154 residues. Blocpdb> 6 atoms in block 1 Block first atom: 1 Blocpdb> 7 atoms in block 2 Block first atom: 7 Blocpdb> 9 atoms in block 3 Block first atom: 14 Blocpdb> 8 atoms in block 4 Block first atom: 23 Blocpdb> 7 atoms in block 5 Block first atom: 31 Blocpdb> 9 atoms in block 6 Block first atom: 38 Blocpdb> 9 atoms in block 7 Block first atom: 47 Blocpdb> 11 atoms in block 8 Block first atom: 56 Blocpdb> 8 atoms in block 9 Block first atom: 67 Blocpdb> 8 atoms in block 10 Block first atom: 75 Blocpdb> 9 atoms in block 11 Block first atom: 83 Blocpdb> 7 atoms in block 12 Block first atom: 92 Blocpdb> 4 atoms in block 13 Block first atom: 99 Blocpdb> 9 atoms in block 14 Block first atom: 103 Blocpdb> 12 atoms in block 15 Block first atom: 112 Blocpdb> 7 atoms in block 16 Block first atom: 124 Blocpdb> 9 atoms in block 17 Block first atom: 131 Blocpdb> 9 atoms in block 18 Block first atom: 140 Blocpdb> 8 atoms in block 19 Block first atom: 149 Blocpdb> 11 atoms in block 20 Block first atom: 157 Blocpdb> 9 atoms in block 21 Block first atom: 168 Blocpdb> 6 atoms in block 22 Block first atom: 177 Blocpdb> 6 atoms in block 23 Block first atom: 183 Blocpdb> 9 atoms in block 24 Block first atom: 189 Blocpdb> 8 atoms in block 25 Block first atom: 198 Blocpdb> 4 atoms in block 26 Block first atom: 206 Blocpdb> 8 atoms in block 27 Block first atom: 210 Blocpdb> 11 atoms in block 28 Block first atom: 218 Blocpdb> 9 atoms in block 29 Block first atom: 229 Blocpdb> 8 atoms in block 30 Block first atom: 238 Blocpdb> 7 atoms in block 31 Block first atom: 246 Blocpdb> 8 atoms in block 32 Block first atom: 253 Blocpdb> 11 atoms in block 33 Block first atom: 261 Blocpdb> 11 atoms in block 34 Block first atom: 272 Blocpdb> 6 atoms in block 35 Block first atom: 283 Blocpdb> 6 atoms in block 36 Block first atom: 289 Blocpdb> 9 atoms in block 37 Block first atom: 295 Blocpdb> 11 atoms in block 38 Block first atom: 304 Blocpdb> 11 atoms in block 39 Block first atom: 315 Blocpdb> 7 atoms in block 40 Block first atom: 326 Blocpdb> 11 atoms in block 41 Block first atom: 333 Blocpdb> 11 atoms in block 42 Block first atom: 344 Blocpdb> 8 atoms in block 43 Block first atom: 355 Blocpdb> 6 atoms in block 44 Block first atom: 363 Blocpdb> 8 atoms in block 45 Block first atom: 369 Blocpdb> 4 atoms in block 46 Block first atom: 377 Blocpdb> 9 atoms in block 47 Block first atom: 381 Blocpdb> 5 atoms in block 48 Block first atom: 390 Blocpdb> 6 atoms in block 49 Block first atom: 395 Blocpdb> 9 atoms in block 50 Block first atom: 401 Blocpdb> 9 atoms in block 51 Block first atom: 410 Blocpdb> 7 atoms in block 52 Block first atom: 419 Blocpdb> 11 atoms in block 53 Block first atom: 426 Blocpdb> 8 atoms in block 54 Block first atom: 437 Blocpdb> 8 atoms in block 55 Block first atom: 445 Blocpdb> 6 atoms in block 56 Block first atom: 453 Blocpdb> 6 atoms in block 57 Block first atom: 459 Blocpdb> 8 atoms in block 58 Block first atom: 465 Blocpdb> 12 atoms in block 59 Block first atom: 473 Blocpdb> 8 atoms in block 60 Block first atom: 485 Blocpdb> 7 atoms in block 61 Block first atom: 493 Blocpdb> 9 atoms in block 62 Block first atom: 500 Blocpdb> 8 atoms in block 63 Block first atom: 509 Blocpdb> 11 atoms in block 64 Block first atom: 517 Blocpdb> 11 atoms in block 65 Block first atom: 528 Blocpdb> 9 atoms in block 66 Block first atom: 539 Blocpdb> 10 atoms in block 67 Block first atom: 548 Blocpdb> 5 atoms in block 68 Block first atom: 558 Blocpdb> 11 atoms in block 69 Block first atom: 563 Blocpdb> 5 atoms in block 70 Block first atom: 574 Blocpdb> 6 atoms in block 71 Block first atom: 579 Blocpdb> 10 atoms in block 72 Block first atom: 585 Blocpdb> 8 atoms in block 73 Block first atom: 595 Blocpdb> 4 atoms in block 74 Block first atom: 603 Blocpdb> 8 atoms in block 75 Block first atom: 607 Blocpdb> 5 atoms in block 76 Block first atom: 615 Blocpdb> 12 atoms in block 77 Block first atom: 620 Blocpdb> 6 atoms in block 78 Block first atom: 632 Blocpdb> 7 atoms in block 79 Block first atom: 638 Blocpdb> 9 atoms in block 80 Block first atom: 645 Blocpdb> 8 atoms in block 81 Block first atom: 654 Blocpdb> 7 atoms in block 82 Block first atom: 662 Blocpdb> 9 atoms in block 83 Block first atom: 669 Blocpdb> 9 atoms in block 84 Block first atom: 678 Blocpdb> 11 atoms in block 85 Block first atom: 687 Blocpdb> 8 atoms in block 86 Block first atom: 698 Blocpdb> 8 atoms in block 87 Block first atom: 706 Blocpdb> 9 atoms in block 88 Block first atom: 714 Blocpdb> 7 atoms in block 89 Block first atom: 723 Blocpdb> 4 atoms in block 90 Block first atom: 730 Blocpdb> 9 atoms in block 91 Block first atom: 734 Blocpdb> 12 atoms in block 92 Block first atom: 743 Blocpdb> 7 atoms in block 93 Block first atom: 755 Blocpdb> 9 atoms in block 94 Block first atom: 762 Blocpdb> 9 atoms in block 95 Block first atom: 771 Blocpdb> 8 atoms in block 96 Block first atom: 780 Blocpdb> 11 atoms in block 97 Block first atom: 788 Blocpdb> 9 atoms in block 98 Block first atom: 799 Blocpdb> 6 atoms in block 99 Block first atom: 808 Blocpdb> 6 atoms in block 100 Block first atom: 814 Blocpdb> 9 atoms in block 101 Block first atom: 820 Blocpdb> 8 atoms in block 102 Block first atom: 829 Blocpdb> 4 atoms in block 103 Block first atom: 837 Blocpdb> 8 atoms in block 104 Block first atom: 841 Blocpdb> 11 atoms in block 105 Block first atom: 849 Blocpdb> 9 atoms in block 106 Block first atom: 860 Blocpdb> 8 atoms in block 107 Block first atom: 869 Blocpdb> 7 atoms in block 108 Block first atom: 877 Blocpdb> 8 atoms in block 109 Block first atom: 884 Blocpdb> 11 atoms in block 110 Block first atom: 892 Blocpdb> 11 atoms in block 111 Block first atom: 903 Blocpdb> 6 atoms in block 112 Block first atom: 914 Blocpdb> 6 atoms in block 113 Block first atom: 920 Blocpdb> 9 atoms in block 114 Block first atom: 926 Blocpdb> 11 atoms in block 115 Block first atom: 935 Blocpdb> 11 atoms in block 116 Block first atom: 946 Blocpdb> 7 atoms in block 117 Block first atom: 957 Blocpdb> 11 atoms in block 118 Block first atom: 964 Blocpdb> 11 atoms in block 119 Block first atom: 975 Blocpdb> 8 atoms in block 120 Block first atom: 986 Blocpdb> 6 atoms in block 121 Block first atom: 994 Blocpdb> 8 atoms in block 122 Block first atom: 1000 Blocpdb> 4 atoms in block 123 Block first atom: 1008 Blocpdb> 9 atoms in block 124 Block first atom: 1012 Blocpdb> 5 atoms in block 125 Block first atom: 1021 Blocpdb> 6 atoms in block 126 Block first atom: 1026 Blocpdb> 9 atoms in block 127 Block first atom: 1032 Blocpdb> 9 atoms in block 128 Block first atom: 1041 Blocpdb> 7 atoms in block 129 Block first atom: 1050 Blocpdb> 11 atoms in block 130 Block first atom: 1057 Blocpdb> 8 atoms in block 131 Block first atom: 1068 Blocpdb> 8 atoms in block 132 Block first atom: 1076 Blocpdb> 6 atoms in block 133 Block first atom: 1084 Blocpdb> 6 atoms in block 134 Block first atom: 1090 Blocpdb> 8 atoms in block 135 Block first atom: 1096 Blocpdb> 12 atoms in block 136 Block first atom: 1104 Blocpdb> 8 atoms in block 137 Block first atom: 1116 Blocpdb> 7 atoms in block 138 Block first atom: 1124 Blocpdb> 9 atoms in block 139 Block first atom: 1131 Blocpdb> 8 atoms in block 140 Block first atom: 1140 Blocpdb> 11 atoms in block 141 Block first atom: 1148 Blocpdb> 11 atoms in block 142 Block first atom: 1159 Blocpdb> 9 atoms in block 143 Block first atom: 1170 Blocpdb> 10 atoms in block 144 Block first atom: 1179 Blocpdb> 5 atoms in block 145 Block first atom: 1189 Blocpdb> 11 atoms in block 146 Block first atom: 1194 Blocpdb> 5 atoms in block 147 Block first atom: 1205 Blocpdb> 6 atoms in block 148 Block first atom: 1210 Blocpdb> 10 atoms in block 149 Block first atom: 1216 Blocpdb> 8 atoms in block 150 Block first atom: 1226 Blocpdb> 4 atoms in block 151 Block first atom: 1234 Blocpdb> 8 atoms in block 152 Block first atom: 1238 Blocpdb> 5 atoms in block 153 Block first atom: 1246 Blocpdb> 12 atoms in block 154 Block first atom: 1250 Blocpdb> 154 blocks. Blocpdb> At most, 12 atoms in each of them. Blocpdb> At least, 4 atoms in each of them. Blocpdb> Normal end of Blocpdb. Diagrtb> Memory allocation for Prepmat. Diagrtb> Memory allocation for RTB. Diagrtb> Memory allocation for Diagstd. Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes. Prepmat> Entering in. Prepmat> Rewriting of the matrix begins. Prepmat> 407642 matrix lines read. Prepmat> Matrix order = 3786 Prepmat> Matrix trace = 888880.0000 Prepmat> Last element read: 3786 3786 130.2930 Prepmat> 11936 lines saved. Prepmat> 10224 empty lines. Prepmat> Number of lines on output is as expected. Prepmat> Normal end of Prepmat. RTB> Entering in. RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 1262 RTB> Total mass = 1262.0000 RTB> Number of atoms found in matrix: 1262 RTB> Number of blocks = 154 RTB> Projection begins. RTB> Projected matrix is being saved. RTB> Projected matrix trace = 195361.9890 RTB> 59286 non-zero elements. RTB> Normal end of RTB. Diagstd> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.sdijb Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb Diagstd> CERFACS matrix format. Diagstd> Projected matrix order = 924 Diagstd> Nb of non-zero elements: 59286 Diagstd> Projected matrix trace = 195361.9890 Openam> file on opening on unit 11: diagrtb_work.eigenfacs Diagstd> Diagonalization. Diagstd> 924 eigenvectors are computed. Diagstd> 106 of them to be saved. Diagstd> Sum of eigenvalues = 195361.9890 Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000 Diagstd> Selected eigenvalues: 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.4593453 1.0978270 1.7809687 2.5349506 3.3199420 3.6426641 4.9782585 5.2314640 6.7634296 7.4016638 8.3087218 8.7406717 9.0024911 9.9571402 10.9453084 11.3384128 11.5903669 11.8124063 13.4023926 14.0867827 14.8940071 16.5864443 17.1892588 18.3791380 19.6160819 20.0110875 20.4704897 21.2327988 23.5670028 24.0205915 24.3680156 24.9230622 25.8788980 26.8832884 27.4909911 28.5142522 29.7789541 30.1196498 30.4470236 30.6777169 32.7996037 33.6102738 33.8811655 33.9551680 34.9225560 35.6549346 36.2707806 36.9468742 37.7178681 38.1968656 38.8805972 39.7324888 41.6816113 42.0451049 44.0711818 44.5207019 44.9476885 45.5822100 46.5748148 47.5363857 47.7054371 48.5513791 49.3282876 49.7094008 50.3544210 51.2781152 51.9925031 53.3708955 54.1196091 54.8401120 55.1187752 55.7877045 56.7421391 58.4754340 59.4679603 59.6474959 60.4953731 60.6991070 61.3581467 62.5207266 63.3146932 63.5219208 63.5540769 63.6963430 65.0891857 66.0244185 66.7410525 67.1006030 67.9030196 68.3414410 68.9337643 69.4327438 70.1321263 70.2464930 71.0544007 71.4129686 72.5553428 72.6936758 73.1120951 73.8166419 Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units): 0.0034330 0.0034335 0.0034340 0.0034343 0.0034349 0.0034360 73.5978135 113.7790315 144.9183642 172.8940440 197.8611485 207.2549182 242.2891695 248.3744394 282.4091523 295.4336484 313.0130107 321.0463110 325.8191673 342.6593540 359.2603449 365.6549129 369.6952511 373.2196224 397.5451402 407.5690413 419.0839790 442.2541608 450.2190374 465.5409077 480.9516432 485.7699272 491.3142903 500.3788018 527.1660786 532.2150229 536.0500767 542.1206882 552.4184432 563.0364042 569.3646228 579.8641688 592.5841084 595.9642922 599.1943401 601.4600663 621.9129194 629.5515614 632.0834959 632.7734110 641.7240141 648.4180597 653.9939510 660.0610886 666.9124866 671.1338491 677.1139231 684.4916663 701.0799222 704.1302466 720.8960212 724.5632146 728.0294734 733.1502200 741.0898213 748.7009073 750.0310107 756.6517930 762.6816543 765.6222468 770.5735245 777.6090516 783.0069980 793.3183959 798.8635497 804.1636661 806.2042060 811.0815570 817.9902600 830.3898025 837.4074144 838.6705406 844.6102742 846.0313010 850.6117881 858.6324319 864.0672280 865.4801091 865.6991432 866.6675378 876.0919691 882.3635770 887.1392737 889.5256830 894.8285333 897.7126526 901.5945498 904.8517779 909.3975575 910.1387471 915.3575559 917.6642725 924.9749669 925.8563191 928.5170759 932.9801898 Diagstd> Normal end. Rtb_to_modes> Entering in. Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 1262 Rtb_to_modes> Number of blocs = 154 Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.eigenfacs Openam> file on opening on unit 11: matrix.eigenrtb Rdmodfacs> Entering in. Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Eigenvector number: 1 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9946E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 2 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9974E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 3 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0000E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 4 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0002E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 5 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0006E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 6 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0012E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 7 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.4593 Rdmodfacs> Eigenvector number: 8 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.098 Rdmodfacs> Eigenvector number: 9 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.781 Rdmodfacs> Eigenvector number: 10 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.535 Rdmodfacs> Eigenvector number: 11 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.320 Rdmodfacs> Eigenvector number: 12 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.643 Rdmodfacs> Eigenvector number: 13 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.978 Rdmodfacs> Eigenvector number: 14 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.231 Rdmodfacs> Eigenvector number: 15 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.763 Rdmodfacs> Eigenvector number: 16 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.402 Rdmodfacs> Eigenvector number: 17 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.309 Rdmodfacs> Eigenvector number: 18 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.741 Rdmodfacs> Eigenvector number: 19 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.002 Rdmodfacs> Eigenvector number: 20 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.957 Rdmodfacs> Eigenvector number: 21 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.95 Rdmodfacs> Eigenvector number: 22 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.34 Rdmodfacs> Eigenvector number: 23 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.59 Rdmodfacs> Eigenvector number: 24 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.81 Rdmodfacs> Eigenvector number: 25 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.40 Rdmodfacs> Eigenvector number: 26 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 27 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.89 Rdmodfacs> Eigenvector number: 28 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.59 Rdmodfacs> Eigenvector number: 29 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.19 Rdmodfacs> Eigenvector number: 30 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.38 Rdmodfacs> Eigenvector number: 31 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.62 Rdmodfacs> Eigenvector number: 32 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.01 Rdmodfacs> Eigenvector number: 33 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.47 Rdmodfacs> Eigenvector number: 34 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.23 Rdmodfacs> Eigenvector number: 35 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.57 Rdmodfacs> Eigenvector number: 36 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 37 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.37 Rdmodfacs> Eigenvector number: 38 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.92 Rdmodfacs> Eigenvector number: 39 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.88 Rdmodfacs> Eigenvector number: 40 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.88 Rdmodfacs> Eigenvector number: 41 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.49 Rdmodfacs> Eigenvector number: 42 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.51 Rdmodfacs> Eigenvector number: 43 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.78 Rdmodfacs> Eigenvector number: 44 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.12 Rdmodfacs> Eigenvector number: 45 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.45 Rdmodfacs> Eigenvector number: 46 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.68 Rdmodfacs> Eigenvector number: 47 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.80 Rdmodfacs> Eigenvector number: 48 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.61 Rdmodfacs> Eigenvector number: 49 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.88 Rdmodfacs> Eigenvector number: 50 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.96 Rdmodfacs> Eigenvector number: 51 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.92 Rdmodfacs> Eigenvector number: 52 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.65 Rdmodfacs> Eigenvector number: 53 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.27 Rdmodfacs> Eigenvector number: 54 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.95 Rdmodfacs> Eigenvector number: 55 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.72 Rdmodfacs> Eigenvector number: 56 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.20 Rdmodfacs> Eigenvector number: 57 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.88 Rdmodfacs> Eigenvector number: 58 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.73 Rdmodfacs> Eigenvector number: 59 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.68 Rdmodfacs> Eigenvector number: 60 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.05 Rdmodfacs> Eigenvector number: 61 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.07 Rdmodfacs> Eigenvector number: 62 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.52 Rdmodfacs> Eigenvector number: 63 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.95 Rdmodfacs> Eigenvector number: 64 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.58 Rdmodfacs> Eigenvector number: 65 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.57 Rdmodfacs> Eigenvector number: 66 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 47.54 Rdmodfacs> Eigenvector number: 67 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 47.71 Rdmodfacs> Eigenvector number: 68 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 48.55 Rdmodfacs> Eigenvector number: 69 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 49.33 Rdmodfacs> Eigenvector number: 70 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 49.71 Rdmodfacs> Eigenvector number: 71 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 50.35 Rdmodfacs> Eigenvector number: 72 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 51.28 Rdmodfacs> Eigenvector number: 73 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 51.99 Rdmodfacs> Eigenvector number: 74 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 53.37 Rdmodfacs> Eigenvector number: 75 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 54.12 Rdmodfacs> Eigenvector number: 76 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 54.84 Rdmodfacs> Eigenvector number: 77 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 55.12 Rdmodfacs> Eigenvector number: 78 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 55.79 Rdmodfacs> Eigenvector number: 79 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 56.74 Rdmodfacs> Eigenvector number: 80 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 58.48 Rdmodfacs> Eigenvector number: 81 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 59.47 Rdmodfacs> Eigenvector number: 82 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 59.65 Rdmodfacs> Eigenvector number: 83 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 60.50 Rdmodfacs> Eigenvector number: 84 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 60.70 Rdmodfacs> Eigenvector number: 85 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 61.36 Rdmodfacs> Eigenvector number: 86 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 62.52 Rdmodfacs> Eigenvector number: 87 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 63.31 Rdmodfacs> Eigenvector number: 88 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 63.52 Rdmodfacs> Eigenvector number: 89 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 63.55 Rdmodfacs> Eigenvector number: 90 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 63.70 Rdmodfacs> Eigenvector number: 91 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 65.09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 92 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 66.02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 93 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 66.74 Rdmodfacs> Eigenvector number: 94 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 67.10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 95 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 67.90 Rdmodfacs> Eigenvector number: 96 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 68.34 Rdmodfacs> Eigenvector number: 97 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 68.93 Rdmodfacs> Eigenvector number: 98 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 69.43 Rdmodfacs> Eigenvector number: 99 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 70.13 Rdmodfacs> Eigenvector number: 100 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 70.25 Rdmodfacs> Eigenvector number: 101 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 71.05 Rdmodfacs> Eigenvector number: 102 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 71.41 Rdmodfacs> Eigenvector number: 103 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 72.56 Rdmodfacs> Eigenvector number: 104 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 72.69 Rdmodfacs> Eigenvector number: 105 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 73.11 Rdmodfacs> Eigenvector number: 106 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 73.82 Rtb_to_modes> 106 vectors, with 924 coordinates in vector file. Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected): 0.99996 1.00001 1.00000 1.00000 1.00000 0.99999 1.00000 0.99999 1.00001 1.00000 0.99999 1.00001 1.00002 1.00000 0.99999 1.00001 0.99998 1.00000 0.99999 1.00001 1.00003 0.99999 1.00000 0.99999 1.00002 0.99998 1.00001 1.00000 1.00000 0.99999 1.00001 1.00002 1.00000 0.99998 0.99996 0.99998 0.99998 1.00001 1.00000 0.99999 0.99998 0.99999 1.00002 0.99999 0.99998 0.99999 1.00000 1.00000 1.00001 1.00001 1.00002 0.99998 1.00000 1.00000 0.99998 0.99998 0.99999 1.00000 1.00002 1.00003 1.00002 0.99997 0.99999 1.00002 1.00003 0.99997 1.00000 1.00003 1.00000 1.00001 1.00004 1.00001 0.99998 0.99999 1.00001 0.99999 0.99997 0.99999 0.99999 0.99997 1.00004 1.00001 1.00000 1.00000 0.99999 1.00000 1.00001 1.00000 0.99998 0.99999 0.99999 1.00002 1.00000 1.00001 0.99999 1.00000 1.00004 1.00000 1.00001 1.00000 1.00000 1.00001 0.99998 1.00002 1.00002 0.99996 Rtb_to_modes> RTB block-file is being read. Rtb_to_modes> 22716 lines found in RTB file. Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected): 0.99996 1.00001 1.00000 1.00000 1.00000 0.99999 1.00000 0.99999 1.00001 1.00000 0.99999 1.00001 1.00002 1.00000 0.99999 1.00001 0.99998 1.00000 0.99999 1.00001 1.00003 0.99999 1.00000 0.99999 1.00002 0.99998 1.00001 1.00000 1.00000 0.99999 1.00001 1.00002 1.00000 0.99998 0.99996 0.99998 0.99998 1.00001 1.00000 0.99999 0.99998 0.99999 1.00002 0.99999 0.99998 0.99999 1.00000 1.00000 1.00001 1.00001 1.00002 0.99998 1.00000 1.00000 0.99998 0.99998 0.99999 1.00000 1.00002 1.00003 1.00002 0.99997 0.99999 1.00002 1.00003 0.99997 1.00000 1.00003 1.00000 1.00001 1.00004 1.00001 0.99998 0.99999 1.00001 0.99999 0.99997 0.99999 0.99999 0.99997 1.00004 1.00001 1.00000 1.00000 0.99999 1.00000 1.00001 1.00000 0.99998 0.99999 0.99999 1.00002 1.00000 1.00001 0.99999 1.00000 1.00004 1.00000 1.00001 1.00000 1.00000 1.00001 0.99998 1.00002 1.00002 0.99996 Orthogonality of first eigenvectors (zero expected): Vector 2:-0.000 Vector 3: 0.000-0.000 Vector 4: 0.000-0.000 0.000 Vector 5: 0.000-0.000-0.000-0.000 Vector 6:-0.000 0.000-0.000 0.000-0.000 Vector 7: 0.000 0.000-0.000-0.000 0.000 0.000 Vector 8: 0.000-0.000-0.000-0.000 0.000-0.000-0.000 Vector 9: 0.000 0.000-0.000-0.000 0.000-0.000 0.000-0.000 Vector 10:-0.000 0.000 0.000-0.000-0.000-0.000-0.000-0.000-0.000 Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved. Rtb_to_modes> Normal end. Diagrtb> Normal end. B-factor analysis Bfactors> Version 1.22, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 2602132148051654465.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 2602132148051654465.eigenfacs Getnam> Corresponding pdb filename ? Getnam> 2602132148051654465.atom Openam> file on opening on unit 11: 2602132148051654465.atom Getnum> Number of skipped eigenvectors ? Getnum> 0 Getnum> Number of usefull eigenvectors ? Getnum> 10000 %Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 154 First residue number = 672 Last residue number = 748 Number of atoms found = 1262 Mean number per residue = 8.2 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9946E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9974E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0000E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0002E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0006E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0012E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.4593 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.098 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.781 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.535 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.320 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.643 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.978 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.231 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.763 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.402 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.309 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.741 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.002 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.957 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.95 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.34 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.59 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.81 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.40 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.89 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.59 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.19 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.38 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.62 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.01 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.47 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.23 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.57 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.37 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.92 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.88 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.88 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.49 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.51 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.78 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.12 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.45 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.68 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.80 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.61 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.88 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.96 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.92 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.65 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.27 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.95 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.72 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.20 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.88 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.73 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.68 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.05 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.07 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.52 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.95 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.58 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.57 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.54 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.71 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.55 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.33 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.71 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 50.35 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 51.28 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 51.99 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 53.37 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 54.12 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 54.84 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 55.12 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 55.79 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 56.74 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 58.48 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 59.47 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 59.65 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 60.50 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 60.70 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 61.36 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 62.52 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 63.31 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 63.52 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 63.55 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 63.70 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 65.09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 66.02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 66.74 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 67.10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 67.90 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 68.34 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 68.93 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 69.43 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 70.13 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 70.25 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 71.05 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 71.41 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 72.56 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 72.69 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 73.11 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 73.82 Bfactors> 106 vectors, 3786 coordinates in file. Openam> file on opening on unit 12: bfactors.pred Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000 Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 0.459300 Bfactors> 100 eigenvectors will be considered. Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped. Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed. (CHARMM units assumed for eigenvalues) Bfactors> Correlation= 0.416 for 154 C-alpha atoms. Bfactors> = 0.086 +/- 0.06 Bfactors> = 59.578 +/- 25.94 Bfactors> Shiftng-fct= 59.492 Bfactors> Scaling-fct= 444.129 Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved. Bfactors> Normal end. check_modes Chkmod> Version 1.00, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 2602132148051654465.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 2602132148051654465.eigenfacs Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4329E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4334E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4338E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4342E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4348E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4359E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 73.59 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 113.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 144.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 172.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 197.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 207.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 242.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 248.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 282.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 295.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 313.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 321.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 325.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 342.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 359.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 365.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 369.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 373.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 397.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 407.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 419.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 442.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 450.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 465.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 481.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 485.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 491.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 500.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 527.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 532.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 536.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 542.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 552.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 563.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 569.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 579.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 592.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 595.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 599.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 601.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 621.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 629.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 632.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 632.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 641.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 648.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 654.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 660.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 666.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 671.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 677.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 684.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 701.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 704.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 720.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 724.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 728.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 733.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 741.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 748.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 750.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 756.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 762.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 765.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 770.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 777.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 783.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 793.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 798.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 804.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 806.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 811.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 817.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 830.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 837.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 838.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 844.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 846.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 850.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 858.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 864.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 865.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 865.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 866.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 876.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 882.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 887.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 889.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 894.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 897.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 901.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 904.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 909.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 910.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 915.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 917.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 925.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 925.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 928.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 933.0 Chkmod> 106 vectors, 3786 coordinates in file. Chkmod> That is: 1262 cartesian points. Openam> file on opening on unit 11: Chkmod.res Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file. %Chkmod-Wn> Norm of vector 81 is: 1.0001 (instead of 1.0000). %Chkmod-Wn> Norm of vector 97 is: 1.0001 (instead of 1.0000). Chkmod> Normal end. 0.0034 0.6780 0.0034 0.8462 0.0034 0.8257 0.0034 0.9017 0.0034 0.9547 0.0034 0.7524 73.5910 0.6995 113.7831 0.5903 144.9134 0.6181 172.8883 0.4943 197.8544 0.4316 207.2556 0.6136 242.2725 0.5647 248.3528 0.8504 282.3881 0.4518 295.4277 0.4841 313.0048 0.2012 321.0386 0.2557 325.7963 0.4383 342.6422 0.5548 359.3219 0.2483 365.6648 0.2328 369.6735 0.2463 373.1656 0.1580 397.4926 0.4360 407.5981 0.4743 419.0096 0.4007 442.2826 0.4258 450.2094 0.5279 465.5318 0.4734 480.9790 0.3940 485.7359 0.3408 491.2873 0.4118 500.3243 0.3814 527.1770 0.3715 532.1856 0.3747 536.0489 0.1741 542.0641 0.0731 552.4065 0.2163 562.9778 0.2846 569.3299 0.2780 579.7960 0.3969 592.5691 0.3665 595.9422 0.3779 599.1979 0.3694 601.4566 0.4983 621.8900 0.4840 629.5220 0.3403 632.0455 0.5245 632.7913 0.4633 641.6730 0.5411 648.3454 0.4801 653.9588 0.3884 660.0607 0.4800 666.9027 0.2185 671.1326 0.2577 677.0797 0.4279 684.4408 0.2813 701.0363 0.4532 704.1410 0.3168 720.8554 0.2179 724.5264 0.1911 728.0169 0.3053 733.1010 0.2713 741.0197 0.3427 748.6972 0.2197 750.0347 0.2831 756.6086 0.3481 762.6622 0.3267 765.5940 0.4065 770.5066 0.3493 777.5900 0.4796 782.9545 0.4084 793.2777 0.4924 798.8321 0.4268 804.1283 0.5243 806.1786 0.4572 811.0634 0.4680 817.9397 0.3986 830.3866 0.2623 837.3858 0.1490 838.6521 0.1486 844.6063 0.4399 846.0012 0.3183 850.5881 0.3664 858.5906 0.3723 863.9981 0.3509 865.4299 0.4143 865.6342 0.4167 866.6552 0.4259 876.0598 0.4935 882.2962 0.4826 887.0942 0.2862 889.4835 0.4102 894.7702 0.3802 897.6647 0.3308 901.5312 0.3348 904.7951 0.4802 909.3447 0.4287 910.1224 0.3809 915.2899 0.2965 917.6058 0.4293 924.9649 0.3007 925.7932 0.2961 928.4639 0.2854 932.9614 0.2764 getting mode 7 running: ../../bin/get_modes.sh 2602132148051654465 7 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 7 calculating perturbed structure for DQ=-100 2602132148051654465.eigenfacs 2602132148051654465.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2602132148051654465.eigenfacs 2602132148051654465.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2602132148051654465.eigenfacs 2602132148051654465.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2602132148051654465.eigenfacs 2602132148051654465.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2602132148051654465.eigenfacs 2602132148051654465.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2602132148051654465.eigenfacs 2602132148051654465.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2602132148051654465.eigenfacs 2602132148051654465.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2602132148051654465.eigenfacs 2602132148051654465.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2602132148051654465.eigenfacs 2602132148051654465.atom calculating perturbed structure for DQ=80 2602132148051654465.eigenfacs 2602132148051654465.atom calculating perturbed structure for DQ=100 2602132148051654465.eigenfacs 2602132148051654465.atom making animated gifs 11 models are in 2602132148051654465.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2602132148051654465.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2602132148051654465.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 8 running: ../../bin/get_modes.sh 2602132148051654465 8 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 8 calculating perturbed structure for DQ=-100 2602132148051654465.eigenfacs 2602132148051654465.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2602132148051654465.eigenfacs 2602132148051654465.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2602132148051654465.eigenfacs 2602132148051654465.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2602132148051654465.eigenfacs 2602132148051654465.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2602132148051654465.eigenfacs 2602132148051654465.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2602132148051654465.eigenfacs 2602132148051654465.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2602132148051654465.eigenfacs 2602132148051654465.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2602132148051654465.eigenfacs 2602132148051654465.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2602132148051654465.eigenfacs 2602132148051654465.atom calculating perturbed structure for DQ=80 2602132148051654465.eigenfacs 2602132148051654465.atom calculating perturbed structure for DQ=100 2602132148051654465.eigenfacs 2602132148051654465.atom making animated gifs 11 models are in 2602132148051654465.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2602132148051654465.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2602132148051654465.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 9 running: ../../bin/get_modes.sh 2602132148051654465 9 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 9 calculating perturbed structure for DQ=-100 2602132148051654465.eigenfacs 2602132148051654465.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2602132148051654465.eigenfacs 2602132148051654465.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2602132148051654465.eigenfacs 2602132148051654465.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2602132148051654465.eigenfacs 2602132148051654465.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2602132148051654465.eigenfacs 2602132148051654465.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2602132148051654465.eigenfacs 2602132148051654465.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2602132148051654465.eigenfacs 2602132148051654465.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2602132148051654465.eigenfacs 2602132148051654465.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2602132148051654465.eigenfacs 2602132148051654465.atom calculating perturbed structure for DQ=80 2602132148051654465.eigenfacs 2602132148051654465.atom calculating perturbed structure for DQ=100 2602132148051654465.eigenfacs 2602132148051654465.atom making animated gifs 11 models are in 2602132148051654465.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2602132148051654465.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2602132148051654465.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 10 running: ../../bin/get_modes.sh 2602132148051654465 10 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 10 calculating perturbed structure for DQ=-100 2602132148051654465.eigenfacs 2602132148051654465.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2602132148051654465.eigenfacs 2602132148051654465.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2602132148051654465.eigenfacs 2602132148051654465.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2602132148051654465.eigenfacs 2602132148051654465.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2602132148051654465.eigenfacs 2602132148051654465.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2602132148051654465.eigenfacs 2602132148051654465.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2602132148051654465.eigenfacs 2602132148051654465.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2602132148051654465.eigenfacs 2602132148051654465.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2602132148051654465.eigenfacs 2602132148051654465.atom calculating perturbed structure for DQ=80 2602132148051654465.eigenfacs 2602132148051654465.atom calculating perturbed structure for DQ=100 2602132148051654465.eigenfacs 2602132148051654465.atom making animated gifs 11 models are in 2602132148051654465.10.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2602132148051654465.10.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2602132148051654465.10.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 11 running: ../../bin/get_modes.sh 2602132148051654465 11 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 11 calculating perturbed structure for DQ=-100 2602132148051654465.eigenfacs 2602132148051654465.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2602132148051654465.eigenfacs 2602132148051654465.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2602132148051654465.eigenfacs 2602132148051654465.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2602132148051654465.eigenfacs 2602132148051654465.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2602132148051654465.eigenfacs 2602132148051654465.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2602132148051654465.eigenfacs 2602132148051654465.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2602132148051654465.eigenfacs 2602132148051654465.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2602132148051654465.eigenfacs 2602132148051654465.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2602132148051654465.eigenfacs 2602132148051654465.atom calculating perturbed structure for DQ=80 2602132148051654465.eigenfacs 2602132148051654465.atom calculating perturbed structure for DQ=100 2602132148051654465.eigenfacs 2602132148051654465.atom making animated gifs 11 models are in 2602132148051654465.11.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2602132148051654465.11.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2602132148051654465.11.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 2602132148051654465.10.pdb 2602132148051654465.11.pdb 2602132148051654465.7.pdb 2602132148051654465.8.pdb 2602132148051654465.9.pdb STDERR: Note: The following floating-point exceptions are signalling: IEEE_DENORMAL real 0m9.209s user 0m9.116s sys 0m0.080s rm: cannot remove '2602132148051654465.sdijf': No such file or directory pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format




If you find results from this site helpful for your research, please cite one of our papers:

elNémo is maintained by Yves-Henri Sanejouand.
It was developed by Karsten Suhre.
Between 2003 and 2014, it was hosted by IGS (Marseille).
Between 2015 and 2025, it was hosted by US2B (Nantes).
Last modification: december 26th, 2025.