***  4HW5_noSO4_3  ***
Output from eigenvector calculation:
STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8)
Build Tirion matrix:
Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model.
Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004.
Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file.
Pdbmat> Coordinate filename = 2602132148051654465.atom
Pdbmat> Distance cutoff = 8.00
Force constant = 10.00
Origin of mass values = CONS
Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09
PRINTing level = 2
Pdbmat> Coordinate file 2602132148051654465.atom to be opened.
Openam> File opened: 2602132148051654465.atom
Pdbmat> Coordinate file in PDB format.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 154
First residue number = 672
Last residue number = 748
Number of atoms found = 1262
Mean number per residue = 8.2
Pdbmat> Coordinate statistics:
= 13.320559 +/- 8.262653 From: -7.070000 To: 35.144000
= 23.055235 +/- 7.214969 From: 1.929000 To: 43.428000
= 1.559563 +/- 15.246930 From: -30.965000 To: 34.097000
Pdbmat> Masses are all set to one.
Openam> File opened: pdbmat.xyzm
Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved.
Openam> File opened: pdbmat.sdijb
Pdbmat> Matrix statistics:
Pdbmat> The matrix is 5.6842 % Filled.
Pdbmat> 407488 non-zero elements.
Pdbmat> 44444 atom-atom interactions.
Pdbmat> Number per atom= 70.43 +/- 21.22
Maximum number = 123
Minimum number = 16
Pdbmat> Matrix trace = 888880.
Pdbmat> Larger element = 467.083
Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10
Pdbmat> Normal end.
automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1)
154 non-zero elements, NRBL set to 1
Diagonalize Tirion matrix using diagrtb
Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation.
Diagrtb> Version 2.52, November 2004.
Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file.
Diagrtb> Options taken into account:
MATRix filename = pdbmat.sdijb
COORdinates filename = 2602132148051654465.atom
Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb
Nb of VECTors required = 106
EigeNVALues chosen = LOWE
Type of SUBStructuring = NONE
Nb of residues per BLOck = 1
Origin of MASS values = CONS
MATRix FORMat = BINA
Temporary files cleaning = ALL
Output PRINting level = 2
Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb.
Blocpdb> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.xyzm
Blocpdb> Coordinate file 2602132148051654465.atom to be opened.
Openam> file on opening on unit 11:
2602132148051654465.atom
Blocpdb> Coordinate file in PDB format.
Blocpdb> 1262 atoms picked in pdb file.
Blocpdb> All masses set to unity.
Blocpdb> Coordinate file is rewritten.
Blocpdb> Substructuring:
Blocpdb> 1 residue(s) per block.
Blocpdb> 154 residues.
Blocpdb> 6 atoms in block 1
Block first atom: 1
Blocpdb> 7 atoms in block 2
Block first atom: 7
Blocpdb> 9 atoms in block 3
Block first atom: 14
Blocpdb> 8 atoms in block 4
Block first atom: 23
Blocpdb> 7 atoms in block 5
Block first atom: 31
Blocpdb> 9 atoms in block 6
Block first atom: 38
Blocpdb> 9 atoms in block 7
Block first atom: 47
Blocpdb> 11 atoms in block 8
Block first atom: 56
Blocpdb> 8 atoms in block 9
Block first atom: 67
Blocpdb> 8 atoms in block 10
Block first atom: 75
Blocpdb> 9 atoms in block 11
Block first atom: 83
Blocpdb> 7 atoms in block 12
Block first atom: 92
Blocpdb> 4 atoms in block 13
Block first atom: 99
Blocpdb> 9 atoms in block 14
Block first atom: 103
Blocpdb> 12 atoms in block 15
Block first atom: 112
Blocpdb> 7 atoms in block 16
Block first atom: 124
Blocpdb> 9 atoms in block 17
Block first atom: 131
Blocpdb> 9 atoms in block 18
Block first atom: 140
Blocpdb> 8 atoms in block 19
Block first atom: 149
Blocpdb> 11 atoms in block 20
Block first atom: 157
Blocpdb> 9 atoms in block 21
Block first atom: 168
Blocpdb> 6 atoms in block 22
Block first atom: 177
Blocpdb> 6 atoms in block 23
Block first atom: 183
Blocpdb> 9 atoms in block 24
Block first atom: 189
Blocpdb> 8 atoms in block 25
Block first atom: 198
Blocpdb> 4 atoms in block 26
Block first atom: 206
Blocpdb> 8 atoms in block 27
Block first atom: 210
Blocpdb> 11 atoms in block 28
Block first atom: 218
Blocpdb> 9 atoms in block 29
Block first atom: 229
Blocpdb> 8 atoms in block 30
Block first atom: 238
Blocpdb> 7 atoms in block 31
Block first atom: 246
Blocpdb> 8 atoms in block 32
Block first atom: 253
Blocpdb> 11 atoms in block 33
Block first atom: 261
Blocpdb> 11 atoms in block 34
Block first atom: 272
Blocpdb> 6 atoms in block 35
Block first atom: 283
Blocpdb> 6 atoms in block 36
Block first atom: 289
Blocpdb> 9 atoms in block 37
Block first atom: 295
Blocpdb> 11 atoms in block 38
Block first atom: 304
Blocpdb> 11 atoms in block 39
Block first atom: 315
Blocpdb> 7 atoms in block 40
Block first atom: 326
Blocpdb> 11 atoms in block 41
Block first atom: 333
Blocpdb> 11 atoms in block 42
Block first atom: 344
Blocpdb> 8 atoms in block 43
Block first atom: 355
Blocpdb> 6 atoms in block 44
Block first atom: 363
Blocpdb> 8 atoms in block 45
Block first atom: 369
Blocpdb> 4 atoms in block 46
Block first atom: 377
Blocpdb> 9 atoms in block 47
Block first atom: 381
Blocpdb> 5 atoms in block 48
Block first atom: 390
Blocpdb> 6 atoms in block 49
Block first atom: 395
Blocpdb> 9 atoms in block 50
Block first atom: 401
Blocpdb> 9 atoms in block 51
Block first atom: 410
Blocpdb> 7 atoms in block 52
Block first atom: 419
Blocpdb> 11 atoms in block 53
Block first atom: 426
Blocpdb> 8 atoms in block 54
Block first atom: 437
Blocpdb> 8 atoms in block 55
Block first atom: 445
Blocpdb> 6 atoms in block 56
Block first atom: 453
Blocpdb> 6 atoms in block 57
Block first atom: 459
Blocpdb> 8 atoms in block 58
Block first atom: 465
Blocpdb> 12 atoms in block 59
Block first atom: 473
Blocpdb> 8 atoms in block 60
Block first atom: 485
Blocpdb> 7 atoms in block 61
Block first atom: 493
Blocpdb> 9 atoms in block 62
Block first atom: 500
Blocpdb> 8 atoms in block 63
Block first atom: 509
Blocpdb> 11 atoms in block 64
Block first atom: 517
Blocpdb> 11 atoms in block 65
Block first atom: 528
Blocpdb> 9 atoms in block 66
Block first atom: 539
Blocpdb> 10 atoms in block 67
Block first atom: 548
Blocpdb> 5 atoms in block 68
Block first atom: 558
Blocpdb> 11 atoms in block 69
Block first atom: 563
Blocpdb> 5 atoms in block 70
Block first atom: 574
Blocpdb> 6 atoms in block 71
Block first atom: 579
Blocpdb> 10 atoms in block 72
Block first atom: 585
Blocpdb> 8 atoms in block 73
Block first atom: 595
Blocpdb> 4 atoms in block 74
Block first atom: 603
Blocpdb> 8 atoms in block 75
Block first atom: 607
Blocpdb> 5 atoms in block 76
Block first atom: 615
Blocpdb> 12 atoms in block 77
Block first atom: 620
Blocpdb> 6 atoms in block 78
Block first atom: 632
Blocpdb> 7 atoms in block 79
Block first atom: 638
Blocpdb> 9 atoms in block 80
Block first atom: 645
Blocpdb> 8 atoms in block 81
Block first atom: 654
Blocpdb> 7 atoms in block 82
Block first atom: 662
Blocpdb> 9 atoms in block 83
Block first atom: 669
Blocpdb> 9 atoms in block 84
Block first atom: 678
Blocpdb> 11 atoms in block 85
Block first atom: 687
Blocpdb> 8 atoms in block 86
Block first atom: 698
Blocpdb> 8 atoms in block 87
Block first atom: 706
Blocpdb> 9 atoms in block 88
Block first atom: 714
Blocpdb> 7 atoms in block 89
Block first atom: 723
Blocpdb> 4 atoms in block 90
Block first atom: 730
Blocpdb> 9 atoms in block 91
Block first atom: 734
Blocpdb> 12 atoms in block 92
Block first atom: 743
Blocpdb> 7 atoms in block 93
Block first atom: 755
Blocpdb> 9 atoms in block 94
Block first atom: 762
Blocpdb> 9 atoms in block 95
Block first atom: 771
Blocpdb> 8 atoms in block 96
Block first atom: 780
Blocpdb> 11 atoms in block 97
Block first atom: 788
Blocpdb> 9 atoms in block 98
Block first atom: 799
Blocpdb> 6 atoms in block 99
Block first atom: 808
Blocpdb> 6 atoms in block 100
Block first atom: 814
Blocpdb> 9 atoms in block 101
Block first atom: 820
Blocpdb> 8 atoms in block 102
Block first atom: 829
Blocpdb> 4 atoms in block 103
Block first atom: 837
Blocpdb> 8 atoms in block 104
Block first atom: 841
Blocpdb> 11 atoms in block 105
Block first atom: 849
Blocpdb> 9 atoms in block 106
Block first atom: 860
Blocpdb> 8 atoms in block 107
Block first atom: 869
Blocpdb> 7 atoms in block 108
Block first atom: 877
Blocpdb> 8 atoms in block 109
Block first atom: 884
Blocpdb> 11 atoms in block 110
Block first atom: 892
Blocpdb> 11 atoms in block 111
Block first atom: 903
Blocpdb> 6 atoms in block 112
Block first atom: 914
Blocpdb> 6 atoms in block 113
Block first atom: 920
Blocpdb> 9 atoms in block 114
Block first atom: 926
Blocpdb> 11 atoms in block 115
Block first atom: 935
Blocpdb> 11 atoms in block 116
Block first atom: 946
Blocpdb> 7 atoms in block 117
Block first atom: 957
Blocpdb> 11 atoms in block 118
Block first atom: 964
Blocpdb> 11 atoms in block 119
Block first atom: 975
Blocpdb> 8 atoms in block 120
Block first atom: 986
Blocpdb> 6 atoms in block 121
Block first atom: 994
Blocpdb> 8 atoms in block 122
Block first atom: 1000
Blocpdb> 4 atoms in block 123
Block first atom: 1008
Blocpdb> 9 atoms in block 124
Block first atom: 1012
Blocpdb> 5 atoms in block 125
Block first atom: 1021
Blocpdb> 6 atoms in block 126
Block first atom: 1026
Blocpdb> 9 atoms in block 127
Block first atom: 1032
Blocpdb> 9 atoms in block 128
Block first atom: 1041
Blocpdb> 7 atoms in block 129
Block first atom: 1050
Blocpdb> 11 atoms in block 130
Block first atom: 1057
Blocpdb> 8 atoms in block 131
Block first atom: 1068
Blocpdb> 8 atoms in block 132
Block first atom: 1076
Blocpdb> 6 atoms in block 133
Block first atom: 1084
Blocpdb> 6 atoms in block 134
Block first atom: 1090
Blocpdb> 8 atoms in block 135
Block first atom: 1096
Blocpdb> 12 atoms in block 136
Block first atom: 1104
Blocpdb> 8 atoms in block 137
Block first atom: 1116
Blocpdb> 7 atoms in block 138
Block first atom: 1124
Blocpdb> 9 atoms in block 139
Block first atom: 1131
Blocpdb> 8 atoms in block 140
Block first atom: 1140
Blocpdb> 11 atoms in block 141
Block first atom: 1148
Blocpdb> 11 atoms in block 142
Block first atom: 1159
Blocpdb> 9 atoms in block 143
Block first atom: 1170
Blocpdb> 10 atoms in block 144
Block first atom: 1179
Blocpdb> 5 atoms in block 145
Block first atom: 1189
Blocpdb> 11 atoms in block 146
Block first atom: 1194
Blocpdb> 5 atoms in block 147
Block first atom: 1205
Blocpdb> 6 atoms in block 148
Block first atom: 1210
Blocpdb> 10 atoms in block 149
Block first atom: 1216
Blocpdb> 8 atoms in block 150
Block first atom: 1226
Blocpdb> 4 atoms in block 151
Block first atom: 1234
Blocpdb> 8 atoms in block 152
Block first atom: 1238
Blocpdb> 5 atoms in block 153
Block first atom: 1246
Blocpdb> 12 atoms in block 154
Block first atom: 1250
Blocpdb> 154 blocks.
Blocpdb> At most, 12 atoms in each of them.
Blocpdb> At least, 4 atoms in each of them.
Blocpdb> Normal end of Blocpdb.
Diagrtb> Memory allocation for Prepmat.
Diagrtb> Memory allocation for RTB.
Diagrtb> Memory allocation for Diagstd.
Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes.
Prepmat> Entering in.
Prepmat> Rewriting of the matrix begins.
Prepmat> 407642 matrix lines read.
Prepmat> Matrix order = 3786
Prepmat> Matrix trace = 888880.0000
Prepmat> Last element read: 3786 3786 130.2930
Prepmat> 11936 lines saved.
Prepmat> 10224 empty lines.
Prepmat> Number of lines on output is as expected.
Prepmat> Normal end of Prepmat.
RTB> Entering in.
RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 1262
RTB> Total mass = 1262.0000
RTB> Number of atoms found in matrix: 1262
RTB> Number of blocks = 154
RTB> Projection begins.
RTB> Projected matrix is being saved.
RTB> Projected matrix trace = 195361.9890
RTB> 59286 non-zero elements.
RTB> Normal end of RTB.
Diagstd> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.sdijb
Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb
Diagstd> CERFACS matrix format.
Diagstd> Projected matrix order = 924
Diagstd> Nb of non-zero elements: 59286
Diagstd> Projected matrix trace = 195361.9890
Openam> file on opening on unit 11:
diagrtb_work.eigenfacs
Diagstd> Diagonalization.
Diagstd> 924 eigenvectors are computed.
Diagstd> 106 of them to be saved.
Diagstd> Sum of eigenvalues = 195361.9890
Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000
Diagstd> Selected eigenvalues:
0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000
0.0000000 0.4593453 1.0978270 1.7809687 2.5349506
3.3199420 3.6426641 4.9782585 5.2314640 6.7634296
7.4016638 8.3087218 8.7406717 9.0024911 9.9571402
10.9453084 11.3384128 11.5903669 11.8124063 13.4023926
14.0867827 14.8940071 16.5864443 17.1892588 18.3791380
19.6160819 20.0110875 20.4704897 21.2327988 23.5670028
24.0205915 24.3680156 24.9230622 25.8788980 26.8832884
27.4909911 28.5142522 29.7789541 30.1196498 30.4470236
30.6777169 32.7996037 33.6102738 33.8811655 33.9551680
34.9225560 35.6549346 36.2707806 36.9468742 37.7178681
38.1968656 38.8805972 39.7324888 41.6816113 42.0451049
44.0711818 44.5207019 44.9476885 45.5822100 46.5748148
47.5363857 47.7054371 48.5513791 49.3282876 49.7094008
50.3544210 51.2781152 51.9925031 53.3708955 54.1196091
54.8401120 55.1187752 55.7877045 56.7421391 58.4754340
59.4679603 59.6474959 60.4953731 60.6991070 61.3581467
62.5207266 63.3146932 63.5219208 63.5540769 63.6963430
65.0891857 66.0244185 66.7410525 67.1006030 67.9030196
68.3414410 68.9337643 69.4327438 70.1321263 70.2464930
71.0544007 71.4129686 72.5553428 72.6936758 73.1120951
73.8166419
Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units):
0.0034330 0.0034335 0.0034340 0.0034343 0.0034349
0.0034360 73.5978135 113.7790315 144.9183642 172.8940440
197.8611485 207.2549182 242.2891695 248.3744394 282.4091523
295.4336484 313.0130107 321.0463110 325.8191673 342.6593540
359.2603449 365.6549129 369.6952511 373.2196224 397.5451402
407.5690413 419.0839790 442.2541608 450.2190374 465.5409077
480.9516432 485.7699272 491.3142903 500.3788018 527.1660786
532.2150229 536.0500767 542.1206882 552.4184432 563.0364042
569.3646228 579.8641688 592.5841084 595.9642922 599.1943401
601.4600663 621.9129194 629.5515614 632.0834959 632.7734110
641.7240141 648.4180597 653.9939510 660.0610886 666.9124866
671.1338491 677.1139231 684.4916663 701.0799222 704.1302466
720.8960212 724.5632146 728.0294734 733.1502200 741.0898213
748.7009073 750.0310107 756.6517930 762.6816543 765.6222468
770.5735245 777.6090516 783.0069980 793.3183959 798.8635497
804.1636661 806.2042060 811.0815570 817.9902600 830.3898025
837.4074144 838.6705406 844.6102742 846.0313010 850.6117881
858.6324319 864.0672280 865.4801091 865.6991432 866.6675378
876.0919691 882.3635770 887.1392737 889.5256830 894.8285333
897.7126526 901.5945498 904.8517779 909.3975575 910.1387471
915.3575559 917.6642725 924.9749669 925.8563191 928.5170759
932.9801898
Diagstd> Normal end.
Rtb_to_modes> Entering in.
Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 1262
Rtb_to_modes> Number of blocs = 154
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 11:
matrix.eigenrtb
Rdmodfacs> Entering in.
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Eigenvector number: 1
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9946E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 2
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Rdmodfacs> Eigenvector number: 106
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 73.82
Rtb_to_modes> 106 vectors, with 924 coordinates in vector file.
Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected):
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1.00001 1.00002 1.00000 0.99998 0.99996
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0.99998 0.99999 1.00002 0.99999 0.99998
0.99999 1.00000 1.00000 1.00001 1.00001
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1.00000 1.00001 0.99998 1.00002 1.00002
0.99996
Rtb_to_modes> RTB block-file is being read.
Rtb_to_modes> 22716 lines found in RTB file.
Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected):
0.99996 1.00001 1.00000 1.00000 1.00000
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1.00002 0.99998 1.00000 1.00000 0.99998
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1.00002 0.99997 0.99999 1.00002 1.00003
0.99997 1.00000 1.00003 1.00000 1.00001
1.00004 1.00001 0.99998 0.99999 1.00001
0.99999 0.99997 0.99999 0.99999 0.99997
1.00004 1.00001 1.00000 1.00000 0.99999
1.00000 1.00001 1.00000 0.99998 0.99999
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1.00000 1.00004 1.00000 1.00001 1.00000
1.00000 1.00001 0.99998 1.00002 1.00002
0.99996
Orthogonality of first eigenvectors (zero expected):
Vector 2:-0.000
Vector 3: 0.000-0.000
Vector 4: 0.000-0.000 0.000
Vector 5: 0.000-0.000-0.000-0.000
Vector 6:-0.000 0.000-0.000 0.000-0.000
Vector 7: 0.000 0.000-0.000-0.000 0.000 0.000
Vector 8: 0.000-0.000-0.000-0.000 0.000-0.000-0.000
Vector 9: 0.000 0.000-0.000-0.000 0.000-0.000 0.000-0.000
Vector 10:-0.000 0.000 0.000-0.000-0.000-0.000-0.000-0.000-0.000
Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved.
Rtb_to_modes> Normal end.
Diagrtb> Normal end.
B-factor analysis
Bfactors> Version 1.22, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 2602132148051654465.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
2602132148051654465.eigenfacs
Getnam> Corresponding pdb filename ?
Getnam> 2602132148051654465.atom
Openam> file on opening on unit 11:
2602132148051654465.atom
Getnum> Number of skipped eigenvectors ?
Getnum> 0
Getnum> Number of usefull eigenvectors ?
Getnum> 10000
%Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 154
First residue number = 672
Last residue number = 748
Number of atoms found = 1262
Mean number per residue = 8.2
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9946E-10
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Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9974E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0000E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0002E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0006E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0012E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.4593
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.098
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.781
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.535
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.320
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.643
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.978
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.231
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
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Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.89
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Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.59
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Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.19
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.38
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Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.62
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Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.01
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
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Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.57
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.02
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.37
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.92
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.88
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.88
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.49
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.51
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.78
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.45
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.68
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.80
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.61
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.88
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.96
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.92
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.65
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.27
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.95
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.72
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.20
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.88
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.73
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.68
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 69.43
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 70.13
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 70.25
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 71.05
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 71.41
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 72.56
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 72.69
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 73.11
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 73.82
Bfactors> 106 vectors, 3786 coordinates in file.
Openam> file on opening on unit 12:
bfactors.pred
Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000
Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 0.459300
Bfactors> 100 eigenvectors will be considered.
Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped.
Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed.
(CHARMM units assumed for eigenvalues)
Bfactors> Correlation= 0.416 for 154 C-alpha atoms.
Bfactors> = 0.086 +/- 0.06
Bfactors> = 59.578 +/- 25.94
Bfactors> Shiftng-fct= 59.492
Bfactors> Scaling-fct= 444.129
Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved.
Bfactors> Normal end.
check_modes
Chkmod> Version 1.00, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 2602132148051654465.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
2602132148051654465.eigenfacs
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4329E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4334E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4338E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4342E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4348E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4359E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 73.59
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 113.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 144.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 172.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 197.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 207.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 242.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 248.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 282.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 295.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 313.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 321.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 325.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 342.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 359.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 365.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 369.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 373.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 397.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 407.6
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Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 465.5
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 485.7
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Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 491.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 500.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 527.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
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Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 542.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 552.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 563.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 569.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 579.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 592.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 595.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 599.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 601.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 621.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 629.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 632.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 632.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 641.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 648.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 654.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 660.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 666.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 671.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 677.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 684.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 701.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 704.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 720.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 724.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 728.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 733.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 741.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 748.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 750.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 756.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 762.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 765.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 770.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 777.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 783.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 793.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 798.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 804.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 806.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 811.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 817.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 830.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 837.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 838.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 844.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 846.0
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Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 850.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 858.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 864.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 865.4
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Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 865.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 866.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 876.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 882.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 887.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 889.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 894.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 897.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 901.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 904.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 909.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 910.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 915.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 917.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 925.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 925.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 928.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 933.0
Chkmod> 106 vectors, 3786 coordinates in file.
Chkmod> That is: 1262 cartesian points.
Openam> file on opening on unit 11:
Chkmod.res
Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file.
%Chkmod-Wn> Norm of vector 81 is: 1.0001 (instead of 1.0000).
%Chkmod-Wn> Norm of vector 97 is: 1.0001 (instead of 1.0000).
Chkmod> Normal end.
0.0034 0.6780
0.0034 0.8462
0.0034 0.8257
0.0034 0.9017
0.0034 0.9547
0.0034 0.7524
73.5910 0.6995
113.7831 0.5903
144.9134 0.6181
172.8883 0.4943
197.8544 0.4316
207.2556 0.6136
242.2725 0.5647
248.3528 0.8504
282.3881 0.4518
295.4277 0.4841
313.0048 0.2012
321.0386 0.2557
325.7963 0.4383
342.6422 0.5548
359.3219 0.2483
365.6648 0.2328
369.6735 0.2463
373.1656 0.1580
397.4926 0.4360
407.5981 0.4743
419.0096 0.4007
442.2826 0.4258
450.2094 0.5279
465.5318 0.4734
480.9790 0.3940
485.7359 0.3408
491.2873 0.4118
500.3243 0.3814
527.1770 0.3715
532.1856 0.3747
536.0489 0.1741
542.0641 0.0731
552.4065 0.2163
562.9778 0.2846
569.3299 0.2780
579.7960 0.3969
592.5691 0.3665
595.9422 0.3779
599.1979 0.3694
601.4566 0.4983
621.8900 0.4840
629.5220 0.3403
632.0455 0.5245
632.7913 0.4633
641.6730 0.5411
648.3454 0.4801
653.9588 0.3884
660.0607 0.4800
666.9027 0.2185
671.1326 0.2577
677.0797 0.4279
684.4408 0.2813
701.0363 0.4532
704.1410 0.3168
720.8554 0.2179
724.5264 0.1911
728.0169 0.3053
733.1010 0.2713
741.0197 0.3427
748.6972 0.2197
750.0347 0.2831
756.6086 0.3481
762.6622 0.3267
765.5940 0.4065
770.5066 0.3493
777.5900 0.4796
782.9545 0.4084
793.2777 0.4924
798.8321 0.4268
804.1283 0.5243
806.1786 0.4572
811.0634 0.4680
817.9397 0.3986
830.3866 0.2623
837.3858 0.1490
838.6521 0.1486
844.6063 0.4399
846.0012 0.3183
850.5881 0.3664
858.5906 0.3723
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getting mode 11
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MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
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making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
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MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
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MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
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STDERR:
Note: The following floating-point exceptions are signalling: IEEE_DENORMAL
real 0m9.209s
user 0m9.116s
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rm: cannot remove '2602132148051654465.sdijf': No such file or directory
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