***  DHM  ***
Output from eigenvector calculation:
STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8)
Build Tirion matrix:
Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model.
Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004.
Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file.
Pdbmat> Coordinate filename = 2602160925362526348.atom
Pdbmat> Distance cutoff = 8.00
Force constant = 10.00
Origin of mass values = CONS
Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09
PRINTing level = 2
Pdbmat> Coordinate file 2602160925362526348.atom to be opened.
Openam> File opened: 2602160925362526348.atom
Pdbmat> Coordinate file in PDB format.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 704
First residue number = 1
Last residue number = 704
Number of atoms found = 10888
Mean number per residue = 15.5
Pdbmat> Coordinate statistics:
= 0.016396 +/- 14.051053 From: -58.652000 To: 58.089000
= -0.014878 +/- 16.423880 From: -55.325000 To: 52.191000
= -0.250902 +/- 19.548768 From: -59.921000 To: 40.933000
Pdbmat> Masses are all set to one.
%Pdbmat-W> residue:'HIE ' is not a well known amino-acid.
%Pdbmat-W> residue:'HIE ' is not a well known amino-acid.
%Pdbmat-W> residue:'HID ' is not a well known amino-acid.
%Pdbmat-W> residue:'LYN ' is not a well known amino-acid.
%Pdbmat-W> residue:'HD1 ' is not a well known amino-acid.
%Pdbmat-W> residue:'AP1 ' is not a well known amino-acid.
%Pdbmat-W> residue:'HID ' is not a well known amino-acid.
%Pdbmat-W> residue:'HIE ' is not a well known amino-acid.
%Pdbmat-W> residue:'HD2 ' is not a well known amino-acid.
%Pdbmat-W> ........
%Pdbmat-W> 46 residue(s) not known.
Openam> File opened: pdbmat.xyzm
Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved.
Openam> File opened: pdbmat.sdijb
Pdbmat> Matrix statistics:
Pdbmat> The matrix is 1.4736 % Filled.
Pdbmat> 7861585 non-zero elements.
Pdbmat> 866388 atom-atom interactions.
Pdbmat> Number per atom= 159.15 +/- 46.23
Maximum number = 257
Minimum number = 0
Pdbmat> Matrix trace = 1.732776E+07
Pdbmat> Larger element = 876.843
Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10
Pdbmat> Normal end.
automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1)
704 non-zero elements, NRBL set to 4
Diagonalize Tirion matrix using diagrtb
Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation.
Diagrtb> Version 2.52, November 2004.
Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file.
Diagrtb> Options taken into account:
MATRix filename = pdbmat.sdijb
COORdinates filename = 2602160925362526348.atom
Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb
Nb of VECTors required = 106
EigeNVALues chosen = LOWE
Type of SUBStructuring = NONE
Nb of residues per BLOck = 4
Origin of MASS values = CONS
MATRix FORMat = BINA
Temporary files cleaning = ALL
Output PRINting level = 2
Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb.
Blocpdb> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.xyzm
Blocpdb> Coordinate file 2602160925362526348.atom to be opened.
Openam> file on opening on unit 11:
2602160925362526348.atom
Blocpdb> Coordinate file in PDB format.
Blocpdb> 10888 atoms picked in pdb file.
Blocpdb> All masses set to unity.
Blocpdb> Coordinate file is rewritten.
Blocpdb> Substructuring:
Blocpdb> 4 residue(s) per block.
Blocpdb> 704 residues.
Blocpdb> 59 atoms in block 1
Block first atom: 1
Blocpdb> 64 atoms in block 2
Block first atom: 60
Blocpdb> 56 atoms in block 3
Block first atom: 124
Blocpdb> 48 atoms in block 4
Block first atom: 180
Blocpdb> 61 atoms in block 5
Block first atom: 228
Blocpdb> 77 atoms in block 6
Block first atom: 289
Blocpdb> 70 atoms in block 7
Block first atom: 366
Blocpdb> 59 atoms in block 8
Block first atom: 436
Blocpdb> 56 atoms in block 9
Block first atom: 495
Blocpdb> 65 atoms in block 10
Block first atom: 551
Blocpdb> 71 atoms in block 11
Block first atom: 616
Blocpdb> 54 atoms in block 12
Block first atom: 687
Blocpdb> 59 atoms in block 13
Block first atom: 741
Blocpdb> 72 atoms in block 14
Block first atom: 800
Blocpdb> 53 atoms in block 15
Block first atom: 872
Blocpdb> 71 atoms in block 16
Block first atom: 925
Blocpdb> 74 atoms in block 17
Block first atom: 996
Blocpdb> 71 atoms in block 18
Block first atom: 1070
Blocpdb> 59 atoms in block 19
Block first atom: 1141
Blocpdb> 62 atoms in block 20
Block first atom: 1200
Blocpdb> 69 atoms in block 21
Block first atom: 1262
Blocpdb> 57 atoms in block 22
Block first atom: 1331
Blocpdb> 54 atoms in block 23
Block first atom: 1388
Blocpdb> 73 atoms in block 24
Block first atom: 1442
Blocpdb> 55 atoms in block 25
Block first atom: 1515
Blocpdb> 69 atoms in block 26
Block first atom: 1570
Blocpdb> 64 atoms in block 27
Block first atom: 1639
Blocpdb> 67 atoms in block 28
Block first atom: 1703
Blocpdb> 67 atoms in block 29
Block first atom: 1770
Blocpdb> 50 atoms in block 30
Block first atom: 1837
Blocpdb> 58 atoms in block 31
Block first atom: 1887
Blocpdb> 46 atoms in block 32
Block first atom: 1945
Blocpdb> 65 atoms in block 33
Block first atom: 1991
Blocpdb> 42 atoms in block 34
Block first atom: 2056
Blocpdb> 75 atoms in block 35
Block first atom: 2098
Blocpdb> 68 atoms in block 36
Block first atom: 2173
Blocpdb> 75 atoms in block 37
Block first atom: 2241
Blocpdb> 61 atoms in block 38
Block first atom: 2316
Blocpdb> 75 atoms in block 39
Block first atom: 2377
Blocpdb> 71 atoms in block 40
Block first atom: 2452
Blocpdb> 61 atoms in block 41
Block first atom: 2523
Blocpdb> 63 atoms in block 42
Block first atom: 2584
Blocpdb> 50 atoms in block 43
Block first atom: 2647
Blocpdb> 70 atoms in block 44
Block first atom: 2697
Blocpdb> 73 atoms in block 45
Block first atom: 2767
Blocpdb> 65 atoms in block 46
Block first atom: 2840
Blocpdb> 65 atoms in block 47
Block first atom: 2905
Blocpdb> 56 atoms in block 48
Block first atom: 2970
Blocpdb> 56 atoms in block 49
Block first atom: 3026
Blocpdb> 65 atoms in block 50
Block first atom: 3082
Blocpdb> 60 atoms in block 51
Block first atom: 3147
Blocpdb> 54 atoms in block 52
Block first atom: 3207
Blocpdb> 74 atoms in block 53
Block first atom: 3261
Blocpdb> 76 atoms in block 54
Block first atom: 3335
Blocpdb> 78 atoms in block 55
Block first atom: 3411
Blocpdb> 56 atoms in block 56
Block first atom: 3489
Blocpdb> 63 atoms in block 57
Block first atom: 3545
Blocpdb> 48 atoms in block 58
Block first atom: 3608
Blocpdb> 59 atoms in block 59
Block first atom: 3656
Blocpdb> 54 atoms in block 60
Block first atom: 3715
Blocpdb> 75 atoms in block 61
Block first atom: 3769
Blocpdb> 61 atoms in block 62
Block first atom: 3844
Blocpdb> 62 atoms in block 63
Block first atom: 3905
Blocpdb> 63 atoms in block 64
Block first atom: 3967
Blocpdb> 76 atoms in block 65
Block first atom: 4030
Blocpdb> 59 atoms in block 66
Block first atom: 4106
Blocpdb> 58 atoms in block 67
Block first atom: 4165
Blocpdb> 72 atoms in block 68
Block first atom: 4223
Blocpdb> 52 atoms in block 69
Block first atom: 4295
Blocpdb> 64 atoms in block 70
Block first atom: 4347
Blocpdb> 64 atoms in block 71
Block first atom: 4411
Blocpdb> 71 atoms in block 72
Block first atom: 4475
Blocpdb> 67 atoms in block 73
Block first atom: 4546
Blocpdb> 67 atoms in block 74
Block first atom: 4613
Blocpdb> 81 atoms in block 75
Block first atom: 4680
Blocpdb> 61 atoms in block 76
Block first atom: 4761
Blocpdb> 60 atoms in block 77
Block first atom: 4822
Blocpdb> 73 atoms in block 78
Block first atom: 4882
Blocpdb> 79 atoms in block 79
Block first atom: 4955
Blocpdb> 62 atoms in block 80
Block first atom: 5034
Blocpdb> 56 atoms in block 81
Block first atom: 5096
Blocpdb> 57 atoms in block 82
Block first atom: 5152
Blocpdb> 67 atoms in block 83
Block first atom: 5209
Blocpdb> 69 atoms in block 84
Block first atom: 5276
Blocpdb> 70 atoms in block 85
Block first atom: 5345
Blocpdb> 78 atoms in block 86
Block first atom: 5415
Blocpdb> 77 atoms in block 87
Block first atom: 5493
Blocpdb> 64 atoms in block 88
Block first atom: 5570
Blocpdb> 43 atoms in block 89
Block first atom: 5634
Blocpdb> 57 atoms in block 90
Block first atom: 5677
Blocpdb> 35 atoms in block 91
Block first atom: 5734
Blocpdb> 57 atoms in block 92
Block first atom: 5769
Blocpdb> 76 atoms in block 93
Block first atom: 5826
Blocpdb> 77 atoms in block 94
Block first atom: 5902
Blocpdb> 66 atoms in block 95
Block first atom: 5979
Blocpdb> 64 atoms in block 96
Block first atom: 6045
Blocpdb> 66 atoms in block 97
Block first atom: 6109
Blocpdb> 66 atoms in block 98
Block first atom: 6175
Blocpdb> 77 atoms in block 99
Block first atom: 6241
Blocpdb> 69 atoms in block 100
Block first atom: 6318
Blocpdb> 61 atoms in block 101
Block first atom: 6387
Blocpdb> 64 atoms in block 102
Block first atom: 6448
Blocpdb> 75 atoms in block 103
Block first atom: 6512
Blocpdb> 53 atoms in block 104
Block first atom: 6587
Blocpdb> 53 atoms in block 105
Block first atom: 6640
Blocpdb> 56 atoms in block 106
Block first atom: 6693
Blocpdb> 54 atoms in block 107
Block first atom: 6749
Blocpdb> 60 atoms in block 108
Block first atom: 6803
Blocpdb> 54 atoms in block 109
Block first atom: 6863
Blocpdb> 64 atoms in block 110
Block first atom: 6917
Blocpdb> 59 atoms in block 111
Block first atom: 6981
Blocpdb> 60 atoms in block 112
Block first atom: 7040
Blocpdb> 69 atoms in block 113
Block first atom: 7100
Blocpdb> 58 atoms in block 114
Block first atom: 7169
Blocpdb> 62 atoms in block 115
Block first atom: 7227
Blocpdb> 54 atoms in block 116
Block first atom: 7289
Blocpdb> 56 atoms in block 117
Block first atom: 7343
Blocpdb> 83 atoms in block 118
Block first atom: 7399
Blocpdb> 61 atoms in block 119
Block first atom: 7482
Blocpdb> 42 atoms in block 120
Block first atom: 7543
Blocpdb> 66 atoms in block 121
Block first atom: 7585
Blocpdb> 68 atoms in block 122
Block first atom: 7651
Blocpdb> 63 atoms in block 123
Block first atom: 7719
Blocpdb> 61 atoms in block 124
Block first atom: 7782
Blocpdb> 55 atoms in block 125
Block first atom: 7843
Blocpdb> 65 atoms in block 126
Block first atom: 7898
Blocpdb> 75 atoms in block 127
Block first atom: 7963
Blocpdb> 72 atoms in block 128
Block first atom: 8038
Blocpdb> 69 atoms in block 129
Block first atom: 8110
Blocpdb> 58 atoms in block 130
Block first atom: 8179
Blocpdb> 61 atoms in block 131
Block first atom: 8237
Blocpdb> 75 atoms in block 132
Block first atom: 8298
Blocpdb> 62 atoms in block 133
Block first atom: 8373
Blocpdb> 65 atoms in block 134
Block first atom: 8435
Blocpdb> 66 atoms in block 135
Block first atom: 8500
Blocpdb> 58 atoms in block 136
Block first atom: 8566
Blocpdb> 70 atoms in block 137
Block first atom: 8624
Blocpdb> 53 atoms in block 138
Block first atom: 8694
Blocpdb> 63 atoms in block 139
Block first atom: 8747
Blocpdb> 54 atoms in block 140
Block first atom: 8810
Blocpdb> 54 atoms in block 141
Block first atom: 8864
Blocpdb> 56 atoms in block 142
Block first atom: 8918
Blocpdb> 70 atoms in block 143
Block first atom: 8974
Blocpdb> 65 atoms in block 144
Block first atom: 9044
Blocpdb> 72 atoms in block 145
Block first atom: 9109
Blocpdb> 54 atoms in block 146
Block first atom: 9181
Blocpdb> 60 atoms in block 147
Block first atom: 9235
Blocpdb> 75 atoms in block 148
Block first atom: 9295
Blocpdb> 60 atoms in block 149
Block first atom: 9370
Blocpdb> 67 atoms in block 150
Block first atom: 9430
Blocpdb> 52 atoms in block 151
Block first atom: 9497
Blocpdb> 59 atoms in block 152
Block first atom: 9549
Blocpdb> 69 atoms in block 153
Block first atom: 9608
Blocpdb> 68 atoms in block 154
Block first atom: 9677
Blocpdb> 82 atoms in block 155
Block first atom: 9745
Blocpdb> 64 atoms in block 156
Block first atom: 9827
Blocpdb> 62 atoms in block 157
Block first atom: 9891
Blocpdb> 65 atoms in block 158
Block first atom: 9953
Blocpdb> 60 atoms in block 159
Block first atom: 10018
Blocpdb> 60 atoms in block 160
Block first atom: 10078
Blocpdb> 64 atoms in block 161
Block first atom: 10138
Blocpdb> 67 atoms in block 162
Block first atom: 10202
Blocpdb> 61 atoms in block 163
Block first atom: 10269
Blocpdb> 74 atoms in block 164
Block first atom: 10330
Blocpdb> 63 atoms in block 165
Block first atom: 10404
Blocpdb> 51 atoms in block 166
Block first atom: 10467
Blocpdb> 53 atoms in block 167
Block first atom: 10518
Blocpdb> 63 atoms in block 168
Block first atom: 10571
Blocpdb> 66 atoms in block 169
Block first atom: 10634
Blocpdb> 118 atoms in block 170
Block first atom: 10700
Blocpdb> 51 atoms in block 171
Block first atom: 10818
Blocpdb> 4 atoms in block 172
Block first atom: 10869
Blocpdb> 4 atoms in block 173
Block first atom: 10873
Blocpdb> 4 atoms in block 174
Block first atom: 10877
Blocpdb> 4 atoms in block 175
Block first atom: 10881
Blocpdb> 4 atoms in block 176
Block first atom: 10884
Blocpdb> 176 blocks.
Blocpdb> At most, 118 atoms in each of them.
Blocpdb> At least, 4 atoms in each of them.
Blocpdb> Normal end of Blocpdb.
Diagrtb> Memory allocation for Prepmat.
Diagrtb> Memory allocation for RTB.
Diagrtb> Memory allocation for Diagstd.
Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes.
Prepmat> Entering in.
Prepmat> Rewriting of the matrix begins.
Prepmat> 7861761 matrix lines read.
Prepmat> Matrix order = 32664
Prepmat> Matrix trace = 17327760.0000
Prepmat> Last element read: 32664 32664 0.0000
Prepmat> 15577 lines saved.
Prepmat> 13666 empty lines.
Prepmat> Number of lines on output is as expected.
Prepmat> Normal end of Prepmat.
RTB> Entering in.
RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 10888
RTB> Total mass = 10888.0000
RTB> Number of atoms found in matrix: 10888
RTB> Number of blocks = 176
RTB> Projection begins.
RTB> Projected matrix is being saved.
RTB> Projected matrix trace = 410134.1159
RTB> 66113 non-zero elements.
RTB> Normal end of RTB.
Diagstd> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.sdijb
Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb
Diagstd> CERFACS matrix format.
Diagstd> Projected matrix order = 1056
Diagstd> Nb of non-zero elements: 66113
Diagstd> Projected matrix trace = 410134.1159
Openam> file on opening on unit 11:
diagrtb_work.eigenfacs
Diagstd> Diagonalization.
Diagstd> 1056 eigenvectors are computed.
Diagstd> 106 of them to be saved.
Diagstd> Sum of eigenvalues = 410134.1159
Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Diagstd> 20 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000
%Diagstd-Wn> Six expected. Parts of the structure interact too little ?
Diagstd> Selected eigenvalues:
0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000
0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000
0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000
0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000
0.2628039 0.2971724 0.7259724 1.1272371 1.3217123
1.8812695 2.5273694 4.1464400 4.3508492 6.1984296
6.5478469 7.5154914 10.2708035 10.9278325 12.5861800
13.5760743 14.2422594 15.5055784 17.9176523 18.6783522
20.0400097 20.7510104 21.9589130 22.0073011 22.2510255
25.1581681 26.5614813 28.4539241 29.8290623 30.1141178
31.5225332 31.9249849 32.3410620 33.7729858 35.4333166
36.0659262 36.6304213 38.7909518 39.5093320 39.9249195
40.7331733 41.2665568 42.0248116 42.8300108 43.3537140
44.2750509 45.3174185 46.2657516 48.2610555 48.4744166
49.1779285 49.9015106 51.5407572 52.3402390 52.5444222
53.6016621 54.1696959 55.9029666 56.4510882 57.3836216
59.2321428 60.4883641 61.3836136 61.7490629 62.7955393
63.5386378 64.0512742 64.8857778 66.1583780 67.9247684
68.1744697 69.1426333 70.3406965 70.6432425 71.4896293
73.1432956 74.0423531 74.4000038 74.8099943 76.3131045
77.4693923 78.7245021 78.9925566 80.0981852 80.8230763
81.9708648
Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units):
0.0034265 0.0034282 0.0034300 0.0034302 0.0034304
0.0034305 0.0034306 0.0034306 0.0034312 0.0034317
0.0034321 0.0034329 0.0034329 0.0034333 0.0034340
0.0034344 0.0034349 0.0034365 0.0034365 0.0034369
55.6687089 59.1969747 92.5241970 115.2929945 124.8428722
148.9432359 172.6353161 221.1225180 226.5073491 270.3560642
277.8718416 297.6966663 348.0146209 358.9734214 385.2496468
400.1127438 409.8120512 427.6015445 459.6590683 469.3151353
486.1208453 494.6692386 508.8627954 509.4231458 512.2362337
544.6716705 559.6563378 579.2504294 593.0824604 595.9095599
609.6854571 613.5650740 617.5504166 631.0735945 646.3997544
652.1444837 657.2282716 676.3328757 682.5667420 686.1472149
693.0577156 697.5806049 703.9602999 710.6722735 715.0039388
722.5614956 731.0176476 738.6268509 754.3861181 756.0518417
761.5183906 767.1002538 779.5979306 785.6210857 787.1519771
795.0316325 799.2331319 811.9190062 815.8896787 822.6010458
835.7454144 844.5613447 850.7882942 853.3171338 860.5174420
865.5939858 869.0788223 874.7219761 883.2582544 894.9718251
896.6153391 902.9594305 910.7488096 912.7053425 918.1566896
928.7151761 934.4055007 936.6595363 939.2367804 948.6256012
955.7853180 963.4967223 965.1356667 971.8665135 976.2543198
983.1618966
Diagstd> Normal end.
Rtb_to_modes> Entering in.
Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 10888
Rtb_to_modes> Number of blocs = 176
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 11:
matrix.eigenrtb
Rdmodfacs> Entering in.
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Eigenvector number: 1
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9567E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 2
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Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9803E-10
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Rdmodfacs> Eigenvector number: 10
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9870E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 11
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Rdmodfacs> Eigenvector number: 12
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Rdmodfacs> Eigenvector number: 52
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Rdmodfacs> Eigenvector number: 59
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Rdmodfacs> Eigenvector number: 60
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.92
Rdmodfacs> Eigenvector number: 61
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Rdmodfacs> Eigenvector number: 62
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.27
Rdmodfacs> Eigenvector number: 63
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Rdmodfacs> Eigenvector number: 64
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Rdmodfacs> Eigenvector number: 65
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.35
Rdmodfacs> Eigenvector number: 66
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Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.32
Rdmodfacs> Eigenvector number: 68
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Rdmodfacs> Eigenvector number: 70
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 48.47
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Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 49.18
Rdmodfacs> Eigenvector number: 72
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 49.90
Rdmodfacs> Eigenvector number: 73
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Rdmodfacs> Eigenvector number: 74
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Rdmodfacs> Eigenvector number: 75
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 52.54
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Rdmodfacs> Eigenvector number: 78
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Rdmodfacs> Eigenvector number: 79
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Rdmodfacs> Eigenvector number: 81
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Rdmodfacs> Eigenvector number: 83
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 61.38
Rdmodfacs> Eigenvector number: 84
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 61.75
Rdmodfacs> Eigenvector number: 85
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 62.80
Rdmodfacs> Eigenvector number: 86
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 63.54
Rdmodfacs> Eigenvector number: 87
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 64.05
Rdmodfacs> Eigenvector number: 88
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Rdmodfacs> Eigenvector number: 89
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Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 67.92
Rdmodfacs> Eigenvector number: 91
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Rdmodfacs> Eigenvector number: 92
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Rdmodfacs> Eigenvector number: 96
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 73.14
Rdmodfacs> Eigenvector number: 97
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 74.04
Rdmodfacs> Eigenvector number: 98
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 74.40
Rdmodfacs> Eigenvector number: 99
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 74.81
Rdmodfacs> Eigenvector number: 100
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 76.31
Rdmodfacs> Eigenvector number: 101
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 77.47
Rdmodfacs> Eigenvector number: 102
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 78.72
Rdmodfacs> Eigenvector number: 103
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 78.99
Rdmodfacs> Eigenvector number: 104
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Rdmodfacs> Eigenvector number: 106
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 81.97
Rtb_to_modes> 106 vectors, with 1056 coordinates in vector file.
Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected):
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1.00001 0.99998 1.00003 0.99997 0.99996
1.00003 1.00001 1.00004 1.00000 1.00000
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1.00001 0.99999 0.99999 1.00002 1.00002
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1.00001 1.00002 1.00001 0.99998 1.00000
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1.00002 0.99998 1.00002 0.99998 1.00001
1.00001 0.99999 1.00001 1.00002 0.99998
1.00000 1.00002 1.00000 0.99997 1.00001
0.99999 0.99999 0.99999 0.99999 0.99998
1.00002 1.00001 1.00000 1.00000 1.00001
0.99997 1.00001 1.00000 0.99999 1.00000
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1.00001 0.99999 1.00001 0.99998 1.00002
1.00000
Rtb_to_modes> RTB block-file is being read.
Rtb_to_modes> 195984 lines found in RTB file.
Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected):
0.99996 1.00000 1.00000 0.99999 0.99998
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1.00001 0.99998 1.00003 0.99997 0.99996
1.00003 1.00001 1.00004 1.00000 1.00000
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1.00001 1.00001 0.99992 1.00000 1.00001
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0.99998 1.00002 0.99998 0.99998 1.00002
1.00001 1.00002 1.00001 0.99998 1.00000
0.99999 0.99997 1.00000 1.00000 0.99999
1.00002 0.99998 1.00002 0.99998 1.00001
1.00001 0.99999 1.00001 1.00002 0.99998
1.00000 1.00002 1.00000 0.99997 1.00001
0.99999 0.99999 0.99999 0.99999 0.99998
1.00002 1.00001 1.00000 1.00000 1.00001
0.99997 1.00001 1.00000 0.99999 1.00000
1.00002 1.00001 1.00003 1.00002 1.00000
1.00001 0.99999 1.00001 0.99998 1.00002
1.00000
Orthogonality of first eigenvectors (zero expected):
Vector 2:-0.000
Vector 3:-0.000 0.000
Vector 4: 0.000-0.000-0.000
Vector 5: 0.000-0.000 0.000-0.000
Vector 6:-0.000 0.000 0.000-0.000 0.000
Vector 7:-0.000 0.000 0.000-0.000-0.000 0.000
Vector 8:-0.000 0.000 0.000-0.000 0.000-0.000-0.000
Vector 9: 0.000-0.000 0.000-0.000 0.000-0.000 0.000-0.000
Vector 10: 0.000 0.000 0.000-0.000 0.000 0.000 0.000 0.000-0.000
Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved.
Rtb_to_modes> Normal end.
Diagrtb> Normal end.
B-factor analysis
Bfactors> Version 1.22, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 2602160925362526348.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
2602160925362526348.eigenfacs
Getnam> Corresponding pdb filename ?
Getnam> 2602160925362526348.atom
Openam> file on opening on unit 11:
2602160925362526348.atom
Getnum> Number of skipped eigenvectors ?
Getnum> 0
Getnum> Number of usefull eigenvectors ?
Getnum> 10000
%Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 704
First residue number = 1
Last residue number = 704
Number of atoms found = 10888
Mean number per residue = 15.5
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9567E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9664E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9771E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9782E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9795E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9798E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9803E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9803E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9837E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9870E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9893E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9939E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9941E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9960E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0002E-09
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0015E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0015E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0017E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.2628
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Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.2972
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.7260
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.127
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.322
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.881
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.527
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.146
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.351
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.198
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
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Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.27
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.58
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.92
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.35
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.27
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
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Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.47
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.18
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.90
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 51.54
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 52.34
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 52.54
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 53.60
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 54.17
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 55.90
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 56.45
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 57.38
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 59.23
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 60.49
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 61.38
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 61.75
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 62.80
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 63.54
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 64.05
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 64.89
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 66.16
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 67.92
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 68.17
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 69.14
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 70.34
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 70.64
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 71.49
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 73.14
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 74.04
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 74.40
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 74.81
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 76.31
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 77.47
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 78.72
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 78.99
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 80.10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 80.82
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 81.97
Bfactors> 106 vectors, 32664 coordinates in file.
Openam> file on opening on unit 12:
bfactors.pred
Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Bfactors> 20 eigenvalues less than : 0.000000
Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 0.262800
Bfactors> 86 eigenvectors will be considered.
Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped.
Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed.
(CHARMM units assumed for eigenvalues)
%Bfactors-Wn> Experimental B-factors are nearly constant !
Bfactors> = 0.005 +/- 0.00
Bfactors> = 0.000 +/- 0.00
Bfactors> Shiftng-fct= -0.005
Bfactors> Scaling-fct= 0.000
Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved.
Bfactors> Normal end.
check_modes
Chkmod> Version 1.00, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 2602160925362526348.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
2602160925362526348.eigenfacs
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4264E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4280E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4299E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4301E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4303E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4303E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4304E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4304E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4310E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4316E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4320E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4328E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4328E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4331E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4338E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4342E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4347E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4364E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4364E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4367E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 55.67
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 59.20
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 92.52
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 115.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 124.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 148.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 172.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 221.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 226.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 270.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 277.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 297.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 348.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 359.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 385.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 400.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 409.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 427.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 459.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 469.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 486.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 494.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 508.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 509.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 512.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 544.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 559.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 579.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 593.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 595.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 609.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 613.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 617.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 631.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 646.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 652.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 657.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 676.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 682.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 686.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 693.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 697.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 703.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 710.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 714.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 722.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 731.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 738.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 754.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 756.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 761.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 767.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 779.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 785.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 787.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 795.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 799.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 811.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 815.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 822.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 835.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 844.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 850.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 853.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 860.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 865.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 869.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 874.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 883.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 894.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 896.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 902.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 910.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 912.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 918.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 928.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 934.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 936.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 939.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 948.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 955.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 963.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 965.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 971.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 976.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 983.1
Chkmod> 106 vectors, 32664 coordinates in file.
Chkmod> That is: 10888 cartesian points.
Openam> file on opening on unit 11:
Chkmod.res
Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file.
%Chkmod-Wn> Norm of vector 6 is: 1.0001 (instead of 1.0000).
%Chkmod-Wn> Norm of vector 15 is: 0.9999 (instead of 1.0000).
%Chkmod-Wn> Norm of vector 28 is: 0.9999 (instead of 1.0000).
%Chkmod-Wn> Norm of vector 40 is: 1.0001 (instead of 1.0000).
%Chkmod-Wn> Norm of vector 43 is: 0.9999 (instead of 1.0000).
Chkmod> Normal end.
0.0034 0.0004
0.0034 0.0044
0.0034 0.0055
0.0034 0.0010
0.0034 0.0024
0.0034 0.0046
0.0034 0.0014
0.0034 0.2378
0.0034 0.0007
0.0034 0.0436
0.0034 0.0624
0.0034 0.0100
0.0034 0.0153
0.0034 0.1482
0.0034 0.0421
0.0034 0.0038
0.0034 0.0174
0.0034 0.0130
0.0034 0.0108
0.0034 0.0227
55.6659 0.0003
59.1972 0.0002
92.5220 0.0004
115.2759 0.0004
124.8511 0.6764
148.9262 0.6750
172.6153 0.7173
221.1013 0.0003
226.5015 0.0003
270.3351 0.6119
277.8632 0.6361
297.6742 0.7347
347.9861 0.0992
358.9936 0.1731
385.2916 0.4747
400.1534 0.3999
409.7620 0.5028
427.6442 0.0793
459.6694 0.4737
469.3157 0.0005
486.0999 0.2797
494.6360 0.1466
508.8535 0.0021
509.4325 0.0012
512.2024 0.0084
544.6681 0.4091
559.6167 0.4681
579.1856 0.3613
593.0663 0.5987
595.8432 0.3341
609.6348 0.4177
613.4908 0.3030
617.5138 0.4148
631.0186 0.4864
646.3418 0.3944
652.1533 0.3217
657.1963 0.1390
676.2955 0.4322
682.5432 0.4358
686.0755 0.3255
693.0010 0.3510
697.5798 0.3115
703.8898 0.4358
710.6417 0.2932
714.9426 0.3028
722.5709 0.4790
731.0071 0.3380
738.6291 0.4013
754.3455 0.1553
755.9849 0.0201
761.5017 0.1857
767.0557 0.1395
779.5587 0.0210
785.5856 0.4243
787.0851 0.3343
794.9852 0.4000
799.2011 0.1373
811.8626 0.1775
815.8468 0.3235
822.5398 0.3401
835.6944 0.5597
844.5365 0.1179
850.7267 0.4785
853.2870 0.3161
860.5111 0.3144
865.5661 0.4111
869.0329 0.3904
874.7129 0.2998
883.2312 0.3813
894.9020 0.3723
896.5475 0.4738
902.9035 0.3498
910.7052 0.4409
912.6452 0.3678
918.1197 0.5166
928.6544 0.1862
934.3505 0.4596
936.6193 0.3360
939.1965 0.4618
948.5656 0.3892
955.7480 0.3326
963.4278 0.4846
965.0786 0.3407
971.8358 0.3773
976.1938 0.3960
983.1145 0.3494
Project conformational change on normal modes:
Projmod> Version 1.36, April 2003.
Projmod> Projection of a difference vector on a set of eigenvectors.
Getnam> CERFACS file with the eigenvectors ?
Getnam> 2602160925362526348.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
2602160925362526348.eigenfacs
Getnam> Pdb file with the reference structure ?
Getnam> 2602160925362526348.atom
Openam> file on opening on unit 11:
2602160925362526348.atom
Getnam> Pdb file with the other conformer ?
Getnam> 2602160925362526348.atom2
Openam> file on opening on unit 12:
2602160925362526348.atom2
Getrep> Are the masses given in the pdb file ? (y/n)
Getrep> F
Projmod> All masses will all be assumed to be of 1.
Getrep> Displacement along one mode ? (y/n)
Getrep> F
Openam> file on opening on unit 13:
projmod.res
Openam> file on opening on unit 14:
dr.res
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4264E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4280E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4299E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4301E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4303E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4303E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4304E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4304E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4310E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4316E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4320E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4328E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4328E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4331E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4338E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4342E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4347E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4364E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4364E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4367E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 55.67
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 59.20
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 92.52
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 115.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 124.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 148.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 172.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 221.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 226.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 270.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 277.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 297.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 348.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 359.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 385.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 400.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 409.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 427.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 459.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 469.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 486.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 494.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 508.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 509.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 512.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 544.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 559.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 579.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 593.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 595.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 609.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 613.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 617.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 631.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 646.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 652.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 657.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 676.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 682.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 686.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 693.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 697.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 703.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 710.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 714.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 722.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 731.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 738.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 754.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 756.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 761.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 767.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 779.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 785.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 787.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 795.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 799.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 811.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 815.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 822.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 835.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 844.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 850.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 853.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 860.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 865.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 869.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 874.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 883.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 894.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 896.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 902.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 910.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 912.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 918.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 928.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 934.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 936.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 939.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 948.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 955.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 963.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 965.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 971.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 976.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 983.1
Projmod> 106 vectors, 32664 coordinates in file.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 704
First residue number = 1
Last residue number = 704
Number of atoms found = 10888
Mean number per residue = 15.5
Projmod> Cartesian (eigen)vectors will be studied.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 703
First residue number = 1
Last residue number = 703
Number of atoms found = 10853
Mean number per residue = 15.4
%Projmod-Wn> Different number of atoms for the other conformer.
%Projmod-Wn> Different number of residues for the other conformer.
%Projmod-Er> Not enough of them.
getting mode 7
running: ../../bin/get_modes.sh 2602160925362526348 7 -100 100 20 on on
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 7
calculating perturbed structure for DQ=-100
2602160925362526348.eigenfacs
2602160925362526348.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2602160925362526348.eigenfacs
2602160925362526348.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2602160925362526348.eigenfacs
2602160925362526348.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2602160925362526348.eigenfacs
2602160925362526348.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2602160925362526348.eigenfacs
2602160925362526348.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2602160925362526348.eigenfacs
2602160925362526348.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2602160925362526348.eigenfacs
2602160925362526348.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2602160925362526348.eigenfacs
2602160925362526348.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2602160925362526348.eigenfacs
2602160925362526348.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2602160925362526348.eigenfacs
2602160925362526348.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2602160925362526348.eigenfacs
2602160925362526348.atom
making animated gifs
11 models are in 2602160925362526348.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2602160925362526348.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2602160925362526348.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
compute RMSD to second conformer
MODEL 1 MODE=7 DQ=-100 678 8.375 327 1.223
MODEL 2 MODE=7 DQ=-80 678 8.375 327 1.223
MODEL 3 MODE=7 DQ=-60 678 8.375 327 1.223
MODEL 4 MODE=7 DQ=-40 678 8.375 327 1.223
MODEL 5 MODE=7 DQ=-20 678 8.375 327 1.223
MODEL 6 MODE=7 DQ=0 678 8.375 327 1.223
MODEL 7 MODE=7 DQ=20 678 8.375 327 1.223
MODEL 8 MODE=7 DQ=40 678 8.375 327 1.223
MODEL 9 MODE=7 DQ=60 678 8.375 327 1.223
MODEL 10 MODE=7 DQ=80 678 8.375 327 1.223
MODEL 11 MODE=7 DQ=100 678 8.375 327 1.223
getting mode 8
running: ../../bin/get_modes.sh 2602160925362526348 8 -100 100 20 on on
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 8
calculating perturbed structure for DQ=-100
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2602160925362526348.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
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calculating perturbed structure for DQ=-60
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calculating perturbed structure for DQ=-40
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making animated gifs
11 models are in 2602160925362526348.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2602160925362526348.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2602160925362526348.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
compute RMSD to second conformer
MODEL 1 MODE=8 DQ=-100 678 8.375 327 1.224
MODEL 2 MODE=8 DQ=-80 678 8.375 327 1.224
MODEL 3 MODE=8 DQ=-60 678 8.375 327 1.223
MODEL 4 MODE=8 DQ=-40 678 8.375 327 1.223
MODEL 5 MODE=8 DQ=-20 678 8.375 327 1.223
MODEL 6 MODE=8 DQ=0 678 8.375 327 1.223
MODEL 7 MODE=8 DQ=20 678 8.375 327 1.223
MODEL 8 MODE=8 DQ=40 678 8.375 327 1.223
MODEL 9 MODE=8 DQ=60 678 8.375 327 1.223
MODEL 10 MODE=8 DQ=80 678 8.375 327 1.223
MODEL 11 MODE=8 DQ=100 678 8.375 327 1.224
getting mode 9
running: ../../bin/get_modes.sh 2602160925362526348 9 -100 100 20 on on
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 9
calculating perturbed structure for DQ=-100
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calculating perturbed structure for DQ=20
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calculating perturbed structure for DQ=40
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making animated gifs
11 models are in 2602160925362526348.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2602160925362526348.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2602160925362526348.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
compute RMSD to second conformer
MODEL 1 MODE=9 DQ=-100 678 8.375 327 1.223
MODEL 2 MODE=9 DQ=-80 678 8.375 327 1.223
MODEL 3 MODE=9 DQ=-60 678 8.375 327 1.223
MODEL 4 MODE=9 DQ=-40 678 8.375 327 1.223
MODEL 5 MODE=9 DQ=-20 678 8.375 327 1.223
MODEL 6 MODE=9 DQ=0 678 8.375 327 1.223
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MODEL 8 MODE=9 DQ=40 678 8.375 327 1.223
MODEL 9 MODE=9 DQ=60 678 8.375 327 1.223
MODEL 10 MODE=9 DQ=80 678 8.375 327 1.223
MODEL 11 MODE=9 DQ=100 678 8.375 327 1.223
getting mode 10
running: ../../bin/get_modes.sh 2602160925362526348 10 -100 100 20 on on
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 10
calculating perturbed structure for DQ=-100
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calculating perturbed structure for DQ=-40
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calculating perturbed structure for DQ=-20
2602160925362526348.eigenfacs
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calculating perturbed structure for DQ=0
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calculating perturbed structure for DQ=20
2602160925362526348.eigenfacs
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calculating perturbed structure for DQ=40
2602160925362526348.eigenfacs
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calculating perturbed structure for DQ=60
2602160925362526348.eigenfacs
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calculating perturbed structure for DQ=100
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making animated gifs
11 models are in 2602160925362526348.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2602160925362526348.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2602160925362526348.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
compute RMSD to second conformer
MODEL 1 MODE=10 DQ=-100 678 8.376 327 1.224
MODEL 2 MODE=10 DQ=-80 678 8.375 327 1.224
MODEL 3 MODE=10 DQ=-60 678 8.375 327 1.223
MODEL 4 MODE=10 DQ=-40 678 8.375 327 1.223
MODEL 5 MODE=10 DQ=-20 678 8.375 327 1.223
MODEL 6 MODE=10 DQ=0 678 8.375 327 1.223
MODEL 7 MODE=10 DQ=20 678 8.375 327 1.223
MODEL 8 MODE=10 DQ=40 678 8.375 327 1.223
MODEL 9 MODE=10 DQ=60 678 8.375 327 1.224
MODEL 10 MODE=10 DQ=80 678 8.375 327 1.224
MODEL 11 MODE=10 DQ=100 678 8.376 327 1.224
getting mode 11
running: ../../bin/get_modes.sh 2602160925362526348 11 -100 100 20 on on
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 11
calculating perturbed structure for DQ=-100
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2602160925362526348.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
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2602160925362526348.eigenfacs
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2602160925362526348.eigenfacs
2602160925362526348.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2602160925362526348.eigenfacs
2602160925362526348.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2602160925362526348.eigenfacs
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2602160925362526348.eigenfacs
2602160925362526348.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2602160925362526348.eigenfacs
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calculating perturbed structure for DQ=100
2602160925362526348.eigenfacs
2602160925362526348.atom
making animated gifs
11 models are in 2602160925362526348.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2602160925362526348.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2602160925362526348.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
compute RMSD to second conformer
MODEL 1 MODE=11 DQ=-100 678 8.376 327 1.222
MODEL 2 MODE=11 DQ=-80 678 8.375 327 1.223
MODEL 3 MODE=11 DQ=-60 678 8.375 327 1.223
MODEL 4 MODE=11 DQ=-40 678 8.375 327 1.223
MODEL 5 MODE=11 DQ=-20 678 8.375 327 1.223
MODEL 6 MODE=11 DQ=0 678 8.375 327 1.223
MODEL 7 MODE=11 DQ=20 678 8.375 327 1.223
MODEL 8 MODE=11 DQ=40 678 8.375 327 1.223
MODEL 9 MODE=11 DQ=60 678 8.375 327 1.223
MODEL 10 MODE=11 DQ=80 678 8.375 327 1.223
MODEL 11 MODE=11 DQ=100 678 8.376 327 1.222
2602160925362526348.10.pdb
2602160925362526348.11.pdb
2602160925362526348.7.pdb
2602160925362526348.8.pdb
2602160925362526348.9.pdb
STDERR:
Note: The following floating-point exceptions are signalling: IEEE_DENORMAL
real 1m5.051s
user 1m4.510s
sys 0m0.484s
rm: cannot remove '2602160925362526348.sdijf': No such file or directory
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