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***  PROTEIN TRANSPORT 21-NOV-13 4CG7  ***

LOGs for ID: 2602160935392533103

Output from eigenvector calculation:


STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8) Build Tirion matrix: Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model. Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004. Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file. Pdbmat> Coordinate filename = 2602160935392533103.atom Pdbmat> Distance cutoff = 8.00 Force constant = 10.00 Origin of mass values = CONS Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09 PRINTing level = 2 Pdbmat> Coordinate file 2602160935392533103.atom to be opened. Openam> File opened: 2602160935392533103.atom Pdbmat> Coordinate file in PDB format. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 550 First residue number = 25 Last residue number = 96 Number of atoms found = 4252 Mean number per residue = 7.7 Pdbmat> Coordinate statistics: = 126.484787 +/- 17.220467 From: 80.462000 To: 158.982000 = -2.628385 +/- 13.133509 From: -33.317000 To: 32.215000 = 20.120651 +/- 13.007746 From: -12.205000 To: 50.888000 Pdbmat> Masses are all set to one. Openam> File opened: pdbmat.xyzm Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved. Openam> File opened: pdbmat.sdijb Pdbmat> Matrix statistics: Pdbmat> The matrix is 1.7833 % Filled. Pdbmat> 1450995 non-zero elements. Pdbmat> 158412 atom-atom interactions. Pdbmat> Number per atom= 74.51 +/- 20.22 Maximum number = 124 Minimum number = 10 Pdbmat> Matrix trace = 3.168240E+06 Pdbmat> Larger element = 473.149 Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10 Pdbmat> Normal end. automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1) 550 non-zero elements, NRBL set to 3 Diagonalize Tirion matrix using diagrtb Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation. Diagrtb> Version 2.52, November 2004. Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file. Diagrtb> Options taken into account: MATRix filename = pdbmat.sdijb COORdinates filename = 2602160935392533103.atom Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb Nb of VECTors required = 106 EigeNVALues chosen = LOWE Type of SUBStructuring = NONE Nb of residues per BLOck = 3 Origin of MASS values = CONS MATRix FORMat = BINA Temporary files cleaning = ALL Output PRINting level = 2 Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb. Blocpdb> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.xyzm Blocpdb> Coordinate file 2602160935392533103.atom to be opened. Openam> file on opening on unit 11: 2602160935392533103.atom Blocpdb> Coordinate file in PDB format. Blocpdb> 4252 atoms picked in pdb file. Blocpdb> All masses set to unity. Blocpdb> Coordinate file is rewritten. Blocpdb> Substructuring: Blocpdb> 3 residue(s) per block. Blocpdb> 550 residues. Blocpdb> 26 atoms in block 1 Block first atom: 1 Blocpdb> 29 atoms in block 2 Block first atom: 27 Blocpdb> 24 atoms in block 3 Block first atom: 56 Blocpdb> 26 atoms in block 4 Block first atom: 80 Blocpdb> 23 atoms in block 5 Block first atom: 106 Blocpdb> 30 atoms in block 6 Block first atom: 129 Blocpdb> 21 atoms in block 7 Block first atom: 159 Blocpdb> 23 atoms in block 8 Block first atom: 180 Blocpdb> 26 atoms in block 9 Block first atom: 203 Blocpdb> 20 atoms in block 10 Block first atom: 229 Blocpdb> 20 atoms in block 11 Block first atom: 249 Blocpdb> 19 atoms in block 12 Block first atom: 269 Blocpdb> 30 atoms in block 13 Block first atom: 288 Blocpdb> 33 atoms in block 14 Block first atom: 318 Blocpdb> 23 atoms in block 15 Block first atom: 351 Blocpdb> 19 atoms in block 16 Block first atom: 374 Blocpdb> 22 atoms in block 17 Block first atom: 393 Blocpdb> 25 atoms in block 18 Block first atom: 415 Blocpdb> 20 atoms in block 19 Block first atom: 440 Blocpdb> 21 atoms in block 20 Block first atom: 460 Blocpdb> 20 atoms in block 21 Block first atom: 481 Blocpdb> 20 atoms in block 22 Block first atom: 501 Blocpdb> 25 atoms in block 23 Block first atom: 521 Blocpdb> 17 atoms in block 24 Block first atom: 546 Blocpdb> 22 atoms in block 25 Block first atom: 563 Blocpdb> 24 atoms in block 26 Block first atom: 585 Blocpdb> 19 atoms in block 27 Block first atom: 609 Blocpdb> 24 atoms in block 28 Block first atom: 628 Blocpdb> 24 atoms in block 29 Block first atom: 652 Blocpdb> 23 atoms in block 30 Block first atom: 676 Blocpdb> 23 atoms in block 31 Block first atom: 699 Blocpdb> 23 atoms in block 32 Block first atom: 722 Blocpdb> 24 atoms in block 33 Block first atom: 745 Blocpdb> 19 atoms in block 34 Block first atom: 769 Blocpdb> 23 atoms in block 35 Block first atom: 788 Blocpdb> 26 atoms in block 36 Block first atom: 811 Blocpdb> 19 atoms in block 37 Block first atom: 837 Blocpdb> 24 atoms in block 38 Block first atom: 856 Blocpdb> 21 atoms in block 39 Block first atom: 880 Blocpdb> 21 atoms in block 40 Block first atom: 901 Blocpdb> 17 atoms in block 41 Block first atom: 922 Blocpdb> 22 atoms in block 42 Block first atom: 939 Blocpdb> 23 atoms in block 43 Block first atom: 961 Blocpdb> 28 atoms in block 44 Block first atom: 984 Blocpdb> 16 atoms in block 45 Block first atom: 1012 Blocpdb> 23 atoms in block 46 Block first atom: 1028 Blocpdb> 24 atoms in block 47 Block first atom: 1051 Blocpdb> 25 atoms in block 48 Block first atom: 1075 Blocpdb> 26 atoms in block 49 Block first atom: 1100 Blocpdb> 20 atoms in block 50 Block first atom: 1126 Blocpdb> 18 atoms in block 51 Block first atom: 1146 Blocpdb> 18 atoms in block 52 Block first atom: 1164 Blocpdb> 27 atoms in block 53 Block first atom: 1182 Blocpdb> 20 atoms in block 54 Block first atom: 1209 Blocpdb> 23 atoms in block 55 Block first atom: 1229 Blocpdb> 22 atoms in block 56 Block first atom: 1252 Blocpdb> 28 atoms in block 57 Block first atom: 1274 Blocpdb> 24 atoms in block 58 Block first atom: 1302 Blocpdb> 21 atoms in block 59 Block first atom: 1326 Blocpdb> 19 atoms in block 60 Block first atom: 1347 Blocpdb> 23 atoms in block 61 Block first atom: 1366 Blocpdb> 29 atoms in block 62 Block first atom: 1389 Blocpdb> 17 atoms in block 63 Block first atom: 1418 Blocpdb> 21 atoms in block 64 Block first atom: 1435 Blocpdb> 29 atoms in block 65 Block first atom: 1456 Blocpdb> 20 atoms in block 66 Block first atom: 1485 Blocpdb> 26 atoms in block 67 Block first atom: 1505 Blocpdb> 27 atoms in block 68 Block first atom: 1531 Blocpdb> 24 atoms in block 69 Block first atom: 1558 Blocpdb> 25 atoms in block 70 Block first atom: 1582 Blocpdb> 32 atoms in block 71 Block first atom: 1607 Blocpdb> 23 atoms in block 72 Block first atom: 1639 Blocpdb> 24 atoms in block 73 Block first atom: 1662 Blocpdb> 24 atoms in block 74 Block first atom: 1686 Blocpdb> 20 atoms in block 75 Block first atom: 1710 Blocpdb> 29 atoms in block 76 Block first atom: 1730 Blocpdb> 19 atoms in block 77 Block first atom: 1759 Blocpdb> 31 atoms in block 78 Block first atom: 1778 Blocpdb> 24 atoms in block 79 Block first atom: 1809 Blocpdb> 26 atoms in block 80 Block first atom: 1833 Blocpdb> 23 atoms in block 81 Block first atom: 1859 Blocpdb> 20 atoms in block 82 Block first atom: 1882 Blocpdb> 34 atoms in block 83 Block first atom: 1902 Blocpdb> 25 atoms in block 84 Block first atom: 1936 Blocpdb> 27 atoms in block 85 Block first atom: 1961 Blocpdb> 24 atoms in block 86 Block first atom: 1988 Blocpdb> 31 atoms in block 87 Block first atom: 2012 Blocpdb> 21 atoms in block 88 Block first atom: 2043 Blocpdb> 23 atoms in block 89 Block first atom: 2064 Blocpdb> 25 atoms in block 90 Block first atom: 2087 Blocpdb> 19 atoms in block 91 Block first atom: 2112 Blocpdb> 21 atoms in block 92 Block first atom: 2131 Blocpdb> 27 atoms in block 93 Block first atom: 2152 Blocpdb> 23 atoms in block 94 Block first atom: 2179 Blocpdb> 22 atoms in block 95 Block first atom: 2202 Blocpdb> 27 atoms in block 96 Block first atom: 2224 Blocpdb> 18 atoms in block 97 Block first atom: 2251 Blocpdb> 23 atoms in block 98 Block first atom: 2269 Blocpdb> 22 atoms in block 99 Block first atom: 2292 Blocpdb> 25 atoms in block 100 Block first atom: 2314 Blocpdb> 21 atoms in block 101 Block first atom: 2339 Blocpdb> 16 atoms in block 102 Block first atom: 2360 Blocpdb> 16 atoms in block 103 Block first atom: 2376 Blocpdb> 28 atoms in block 104 Block first atom: 2392 Blocpdb> 18 atoms in block 105 Block first atom: 2420 Blocpdb> 18 atoms in block 106 Block first atom: 2438 Blocpdb> 30 atoms in block 107 Block first atom: 2456 Blocpdb> 20 atoms in block 108 Block first atom: 2486 Blocpdb> 26 atoms in block 109 Block first atom: 2506 Blocpdb> 17 atoms in block 110 Block first atom: 2532 Blocpdb> 25 atoms in block 111 Block first atom: 2549 Blocpdb> 24 atoms in block 112 Block first atom: 2574 Blocpdb> 19 atoms in block 113 Block first atom: 2598 Blocpdb> 27 atoms in block 114 Block first atom: 2617 Blocpdb> 27 atoms in block 115 Block first atom: 2644 Blocpdb> 16 atoms in block 116 Block first atom: 2671 Blocpdb> 27 atoms in block 117 Block first atom: 2687 Blocpdb> 22 atoms in block 118 Block first atom: 2714 Blocpdb> 31 atoms in block 119 Block first atom: 2736 Blocpdb> 17 atoms in block 120 Block first atom: 2767 Blocpdb> 17 atoms in block 121 Block first atom: 2784 Blocpdb> 24 atoms in block 122 Block first atom: 2801 Blocpdb> 23 atoms in block 123 Block first atom: 2825 Blocpdb> 26 atoms in block 124 Block first atom: 2848 Blocpdb> 26 atoms in block 125 Block first atom: 2874 Blocpdb> 26 atoms in block 126 Block first atom: 2900 Blocpdb> 25 atoms in block 127 Block first atom: 2926 Blocpdb> 22 atoms in block 128 Block first atom: 2951 Blocpdb> 25 atoms in block 129 Block first atom: 2973 Blocpdb> 25 atoms in block 130 Block first atom: 2998 Blocpdb> 31 atoms in block 131 Block first atom: 3023 Blocpdb> 19 atoms in block 132 Block first atom: 3054 Blocpdb> 21 atoms in block 133 Block first atom: 3073 Blocpdb> 16 atoms in block 134 Block first atom: 3094 Blocpdb> 18 atoms in block 135 Block first atom: 3110 Blocpdb> 19 atoms in block 136 Block first atom: 3128 Blocpdb> 20 atoms in block 137 Block first atom: 3147 Blocpdb> 27 atoms in block 138 Block first atom: 3167 Blocpdb> 17 atoms in block 139 Block first atom: 3194 Blocpdb> 14 atoms in block 140 Block first atom: 3211 Blocpdb> 19 atoms in block 141 Block first atom: 3225 Blocpdb> 21 atoms in block 142 Block first atom: 3244 Blocpdb> 22 atoms in block 143 Block first atom: 3265 Blocpdb> 29 atoms in block 144 Block first atom: 3287 Blocpdb> 32 atoms in block 145 Block first atom: 3316 Blocpdb> 26 atoms in block 146 Block first atom: 3348 Blocpdb> 27 atoms in block 147 Block first atom: 3374 Blocpdb> 22 atoms in block 148 Block first atom: 3401 Blocpdb> 18 atoms in block 149 Block first atom: 3423 Blocpdb> 17 atoms in block 150 Block first atom: 3441 Blocpdb> 20 atoms in block 151 Block first atom: 3458 Blocpdb> 27 atoms in block 152 Block first atom: 3478 Blocpdb> 24 atoms in block 153 Block first atom: 3505 Blocpdb> 27 atoms in block 154 Block first atom: 3529 Blocpdb> 23 atoms in block 155 Block first atom: 3556 Blocpdb> 27 atoms in block 156 Block first atom: 3579 Blocpdb> 27 atoms in block 157 Block first atom: 3606 Blocpdb> 22 atoms in block 158 Block first atom: 3633 Blocpdb> 26 atoms in block 159 Block first atom: 3655 Blocpdb> 29 atoms in block 160 Block first atom: 3681 Blocpdb> 26 atoms in block 161 Block first atom: 3710 Blocpdb> 18 atoms in block 162 Block first atom: 3736 Blocpdb> 20 atoms in block 163 Block first atom: 3754 Blocpdb> 20 atoms in block 164 Block first atom: 3774 Blocpdb> 20 atoms in block 165 Block first atom: 3794 Blocpdb> 23 atoms in block 166 Block first atom: 3814 Blocpdb> 29 atoms in block 167 Block first atom: 3837 Blocpdb> 25 atoms in block 168 Block first atom: 3866 Blocpdb> 25 atoms in block 169 Block first atom: 3891 Blocpdb> 24 atoms in block 170 Block first atom: 3916 Blocpdb> 23 atoms in block 171 Block first atom: 3940 Blocpdb> 9 atoms in block 172 Block first atom: 3963 Blocpdb> 23 atoms in block 173 Block first atom: 3972 Blocpdb> 19 atoms in block 174 Block first atom: 3995 Blocpdb> 20 atoms in block 175 Block first atom: 4014 Blocpdb> 21 atoms in block 176 Block first atom: 4034 Blocpdb> 22 atoms in block 177 Block first atom: 4055 Blocpdb> 22 atoms in block 178 Block first atom: 4077 Blocpdb> 27 atoms in block 179 Block first atom: 4099 Blocpdb> 18 atoms in block 180 Block first atom: 4126 Blocpdb> 27 atoms in block 181 Block first atom: 4144 Blocpdb> 32 atoms in block 182 Block first atom: 4171 Blocpdb> 25 atoms in block 183 Block first atom: 4203 Blocpdb> 25 atoms in block 184 Block first atom: 4227 Blocpdb> 184 blocks. Blocpdb> At most, 34 atoms in each of them. Blocpdb> At least, 9 atoms in each of them. Blocpdb> Normal end of Blocpdb. Diagrtb> Memory allocation for Prepmat. Diagrtb> Memory allocation for RTB. Diagrtb> Memory allocation for Diagstd. Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes. Prepmat> Entering in. Prepmat> Rewriting of the matrix begins. Prepmat> 1451179 matrix lines read. Prepmat> Matrix order = 12756 Prepmat> Matrix trace = 3168240.0000 Prepmat> Last element read: 12756 12756 120.4270 Prepmat> 17021 lines saved. Prepmat> 15399 empty lines. Prepmat> Number of lines on output is as expected. Prepmat> Normal end of Prepmat. RTB> Entering in. RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 4252 RTB> Total mass = 4252.0000 RTB> Number of atoms found in matrix: 4252 RTB> Number of blocks = 184 RTB> Projection begins. RTB> Projected matrix is being saved. RTB> Projected matrix trace = 210173.1020 RTB> 55596 non-zero elements. RTB> Normal end of RTB. Diagstd> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.sdijb Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb Diagstd> CERFACS matrix format. Diagstd> Projected matrix order = 1104 Diagstd> Nb of non-zero elements: 55596 Diagstd> Projected matrix trace = 210173.1020 Openam> file on opening on unit 11: diagrtb_work.eigenfacs Diagstd> Diagonalization. Diagstd> 1104 eigenvectors are computed. Diagstd> 106 of them to be saved. Diagstd> Sum of eigenvalues = 210173.1020 Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000 Diagstd> Selected eigenvalues: 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.6036465 0.7963423 1.0821480 1.5081213 1.6279358 1.6563665 2.1040239 2.4345285 2.4856532 2.7775500 3.1499968 3.2894599 3.8804102 4.1206998 4.2217739 4.6001518 4.9731275 5.2136186 5.3412410 5.7253808 6.0937671 6.3448937 6.3764914 6.6609722 6.8745004 7.3132517 7.5926040 8.0450685 8.2158395 8.5246552 8.9422605 9.4550532 10.1958615 10.2808473 10.6461418 10.9905607 11.3004783 11.4092622 11.6577234 12.4156026 13.0089702 13.8176688 14.0066215 14.0959640 14.4252777 15.0021706 15.1734838 15.3780685 15.7848082 16.0293470 16.5128692 16.8310135 17.1935771 17.7677198 18.0668648 18.1984514 18.9125510 19.3578362 19.7472045 20.0849057 20.4496218 20.9116635 21.3375922 21.7502492 22.1128863 22.4150479 23.2776786 23.4524996 23.9892787 24.2534204 24.4720814 25.2850800 25.4260490 26.0007519 26.1724659 26.6454740 26.9266299 27.4548846 28.1153518 28.4600981 28.6558487 29.3130559 29.5046279 29.8870123 30.0779207 31.2814782 31.9624571 32.1742039 32.5701389 32.9314129 33.5195790 33.6908757 34.5811962 34.6794988 34.8733822 35.4873133 36.2810365 36.5024973 37.1670787 37.9924132 Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units): 0.0034323 0.0034331 0.0034333 0.0034337 0.0034338 0.0034341 84.3697212 96.9047759 112.9636249 133.3562614 138.5523575 139.7569786 157.5145267 169.4348387 171.2046463 180.9781822 192.7304504 196.9507228 213.9114820 220.4351096 223.1221900 232.9063667 242.1642752 247.9504535 250.9668535 259.8348916 268.0638226 273.5315680 274.2118197 280.2619176 284.7186075 293.6638849 299.2200242 308.0066918 311.2585232 317.0543310 324.7274019 333.9083412 346.7426332 348.1847417 354.3165210 360.0022423 365.0427211 366.7955520 370.7679231 382.6301445 391.6667815 403.6571686 406.4077466 407.7018404 412.4367641 420.6029648 422.9976285 425.8397281 431.4345637 434.7636190 441.2721821 445.5027758 450.2755869 457.7318454 461.5690475 463.2468740 472.2482268 477.7752905 482.5564134 486.6650732 491.0638003 496.5803972 501.6120783 506.4392992 510.6437218 514.1207310 523.9201648 525.8838687 531.8680168 534.7881523 537.1934818 546.0437568 547.5637890 553.7174801 555.5428999 560.5405116 563.4900875 568.9906000 575.7938761 579.3132695 581.3021351 587.9302807 589.8483260 593.6582829 595.5513111 607.3498300 613.9250567 615.9552843 619.7336610 623.1612822 628.7015889 630.3059835 638.5799614 639.4869501 641.2720549 646.8920899 654.0864063 656.0796527 662.0251583 669.3352850 Diagstd> Normal end. Rtb_to_modes> Entering in. Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 4252 Rtb_to_modes> Number of blocs = 184 Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.eigenfacs Openam> file on opening on unit 11: matrix.eigenrtb Rdmodfacs> Entering in. Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Eigenvector number: 1 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9903E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 2 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9948E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 3 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9964E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 4 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9987E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 5 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9988E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 6 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0001E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 7 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.6036 Rdmodfacs> Eigenvector number: 8 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.7963 Rdmodfacs> Eigenvector number: 9 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.082 Rdmodfacs> Eigenvector number: 10 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.508 Rdmodfacs> Eigenvector number: 11 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.628 Rdmodfacs> Eigenvector number: 12 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.656 Rdmodfacs> Eigenvector number: 13 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.104 Rdmodfacs> Eigenvector number: 14 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.435 Rdmodfacs> Eigenvector number: 15 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.486 Rdmodfacs> Eigenvector number: 16 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.778 Rdmodfacs> Eigenvector number: 17 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.150 Rdmodfacs> Eigenvector number: 18 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.289 Rdmodfacs> Eigenvector number: 19 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.880 Rdmodfacs> Eigenvector number: 20 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.121 Rdmodfacs> Eigenvector number: 21 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.222 Rdmodfacs> Eigenvector number: 22 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.600 Rdmodfacs> Eigenvector number: 23 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.973 Rdmodfacs> Eigenvector number: 24 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.214 Rdmodfacs> Eigenvector number: 25 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.341 Rdmodfacs> Eigenvector number: 26 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.725 Rdmodfacs> Eigenvector number: 27 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.094 Rdmodfacs> Eigenvector number: 28 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.345 Rdmodfacs> Eigenvector number: 29 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.376 Rdmodfacs> Eigenvector number: 30 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.661 Rdmodfacs> Eigenvector number: 31 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.875 Rdmodfacs> Eigenvector number: 32 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.313 Rdmodfacs> Eigenvector number: 33 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.593 Rdmodfacs> Eigenvector number: 34 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.045 Rdmodfacs> Eigenvector number: 35 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.216 Rdmodfacs> Eigenvector number: 36 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.525 Rdmodfacs> Eigenvector number: 37 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.942 Rdmodfacs> Eigenvector number: 38 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.455 Rdmodfacs> Eigenvector number: 39 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.20 Rdmodfacs> Eigenvector number: 40 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.28 Rdmodfacs> Eigenvector number: 41 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.65 Rdmodfacs> Eigenvector number: 42 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.99 Rdmodfacs> Eigenvector number: 43 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.30 Rdmodfacs> Eigenvector number: 44 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.41 Rdmodfacs> Eigenvector number: 45 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.66 Rdmodfacs> Eigenvector number: 46 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.42 Rdmodfacs> Eigenvector number: 47 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.01 Rdmodfacs> Eigenvector number: 48 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.82 Rdmodfacs> Eigenvector number: 49 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.01 Rdmodfacs> Eigenvector number: 50 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 51 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.43 Rdmodfacs> Eigenvector number: 52 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.00 Rdmodfacs> Eigenvector number: 53 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.17 Rdmodfacs> Eigenvector number: 54 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.38 Rdmodfacs> Eigenvector number: 55 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.78 Rdmodfacs> Eigenvector number: 56 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.03 Rdmodfacs> Eigenvector number: 57 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.51 Rdmodfacs> Eigenvector number: 58 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.83 Rdmodfacs> Eigenvector number: 59 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.19 Rdmodfacs> Eigenvector number: 60 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.77 Rdmodfacs> Eigenvector number: 61 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.07 Rdmodfacs> Eigenvector number: 62 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.20 Rdmodfacs> Eigenvector number: 63 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.91 Rdmodfacs> Eigenvector number: 64 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.36 Rdmodfacs> Eigenvector number: 65 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.75 Rdmodfacs> Eigenvector number: 66 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.08 Rdmodfacs> Eigenvector number: 67 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.45 Rdmodfacs> Eigenvector number: 68 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.91 Rdmodfacs> Eigenvector number: 69 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.34 Rdmodfacs> Eigenvector number: 70 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.75 Rdmodfacs> Eigenvector number: 71 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.11 Rdmodfacs> Eigenvector number: 72 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.42 Rdmodfacs> Eigenvector number: 73 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.28 Rdmodfacs> Eigenvector number: 74 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.45 Rdmodfacs> Eigenvector number: 75 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.99 Rdmodfacs> Eigenvector number: 76 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.25 Rdmodfacs> Eigenvector number: 77 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.47 Rdmodfacs> Eigenvector number: 78 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.29 Rdmodfacs> Eigenvector number: 79 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.43 Rdmodfacs> Eigenvector number: 80 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.00 Rdmodfacs> Eigenvector number: 81 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.17 Rdmodfacs> Eigenvector number: 82 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.65 Rdmodfacs> Eigenvector number: 83 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.93 Rdmodfacs> Eigenvector number: 84 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.45 Rdmodfacs> Eigenvector number: 85 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.12 Rdmodfacs> Eigenvector number: 86 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.46 Rdmodfacs> Eigenvector number: 87 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.66 Rdmodfacs> Eigenvector number: 88 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.31 Rdmodfacs> Eigenvector number: 89 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.50 Rdmodfacs> Eigenvector number: 90 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.89 Rdmodfacs> Eigenvector number: 91 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.08 Rdmodfacs> Eigenvector number: 92 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.28 Rdmodfacs> Eigenvector number: 93 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.96 Rdmodfacs> Eigenvector number: 94 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.17 Rdmodfacs> Eigenvector number: 95 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.57 Rdmodfacs> Eigenvector number: 96 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.93 Rdmodfacs> Eigenvector number: 97 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.52 Rdmodfacs> Eigenvector number: 98 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.69 Rdmodfacs> Eigenvector number: 99 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.58 Rdmodfacs> Eigenvector number: 100 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.68 Rdmodfacs> Eigenvector number: 101 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.87 Rdmodfacs> Eigenvector number: 102 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.49 Rdmodfacs> Eigenvector number: 103 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.28 Rdmodfacs> Eigenvector number: 104 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.50 Rdmodfacs> Eigenvector number: 105 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.17 Rdmodfacs> Eigenvector number: 106 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.99 Rtb_to_modes> 106 vectors, with 1104 coordinates in vector file. Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected): 0.99999 1.00000 1.00000 0.99999 1.00000 0.99998 1.00000 0.99999 1.00000 1.00003 1.00001 1.00003 1.00000 1.00001 1.00002 0.99997 0.99998 0.99996 1.00002 0.99999 1.00000 1.00000 0.99999 1.00001 0.99999 1.00004 1.00002 0.99999 1.00000 0.99997 1.00001 1.00003 0.99999 1.00000 1.00000 0.99999 1.00001 1.00001 1.00000 1.00001 0.99998 1.00000 1.00000 1.00001 0.99997 1.00001 0.99999 1.00000 1.00001 1.00003 0.99999 1.00001 1.00000 0.99998 1.00001 0.99998 1.00003 1.00000 0.99999 1.00001 1.00001 0.99997 1.00001 0.99999 0.99996 1.00000 0.99998 0.99999 1.00002 1.00000 1.00000 1.00002 0.99999 1.00002 0.99998 1.00000 1.00002 1.00001 0.99999 1.00001 0.99999 0.99998 1.00000 0.99999 0.99999 0.99999 0.99998 1.00000 0.99999 1.00000 0.99999 1.00000 1.00000 1.00002 1.00004 1.00000 1.00002 1.00000 0.99999 1.00003 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00002 Rtb_to_modes> RTB block-file is being read. Rtb_to_modes> 76536 lines found in RTB file. Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected): 0.99999 1.00000 1.00000 0.99999 1.00000 0.99998 1.00000 0.99999 1.00000 1.00003 1.00001 1.00003 1.00000 1.00001 1.00002 0.99997 0.99998 0.99996 1.00002 0.99999 1.00000 1.00000 0.99999 1.00001 0.99999 1.00004 1.00002 0.99999 1.00000 0.99997 1.00001 1.00003 0.99999 1.00000 1.00000 0.99999 1.00001 1.00001 1.00000 1.00001 0.99998 1.00000 1.00000 1.00001 0.99997 1.00001 0.99999 1.00000 1.00001 1.00003 0.99999 1.00001 1.00000 0.99998 1.00001 0.99998 1.00003 1.00000 0.99999 1.00001 1.00001 0.99997 1.00001 0.99999 0.99996 1.00000 0.99998 0.99999 1.00002 1.00000 1.00000 1.00002 0.99999 1.00002 0.99998 1.00000 1.00002 1.00001 0.99999 1.00001 0.99999 0.99998 1.00000 0.99999 0.99999 0.99999 0.99998 1.00000 0.99999 1.00000 0.99999 1.00000 1.00000 1.00002 1.00004 1.00000 1.00002 1.00000 0.99999 1.00003 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00002 Orthogonality of first eigenvectors (zero expected): Vector 2: 0.000 Vector 3: 0.000-0.000 Vector 4:-0.000 0.000-0.000 Vector 5:-0.000-0.000 0.000-0.000 Vector 6:-0.000-0.000 0.000 0.000-0.000 Vector 7:-0.000-0.000-0.000 0.000-0.000-0.000 Vector 8:-0.000 0.000-0.000-0.000 0.000 0.000-0.000 Vector 9:-0.000 0.000-0.000-0.000 0.000 0.000 0.000-0.000 Vector 10: 0.000-0.000-0.000-0.000-0.000-0.000 0.000 0.000-0.000 Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved. Rtb_to_modes> Normal end. Diagrtb> Normal end. B-factor analysis Bfactors> Version 1.22, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 2602160935392533103.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 2602160935392533103.eigenfacs Getnam> Corresponding pdb filename ? Getnam> 2602160935392533103.atom Openam> file on opening on unit 11: 2602160935392533103.atom Getnum> Number of skipped eigenvectors ? Getnum> 0 Getnum> Number of usefull eigenvectors ? Getnum> 10000 %Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 550 First residue number = 25 Last residue number = 96 Number of atoms found = 4252 Mean number per residue = 7.7 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9903E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9948E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9964E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9987E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9988E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0001E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.6036 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.7963 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.082 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.508 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.628 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.656 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.104 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.435 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.486 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.778 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.150 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.289 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.880 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.121 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.222 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.600 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.973 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.214 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.341 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.725 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.094 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.345 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.376 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.661 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.875 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.313 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.593 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.045 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.216 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.525 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.942 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.455 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.20 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.28 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.65 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.99 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.30 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.41 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.66 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.42 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.01 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.82 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.01 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.43 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.00 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.17 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.38 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.78 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.51 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.83 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.19 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.77 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.07 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.20 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.91 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.36 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.75 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.08 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.45 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.91 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.34 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.75 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.11 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.42 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.28 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.45 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.99 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.25 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.47 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.29 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.43 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.00 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.17 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.65 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.93 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.45 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.12 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.46 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.66 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.31 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.50 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.89 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.08 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.28 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.96 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.17 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.57 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.93 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.52 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.69 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.58 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.68 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.87 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.49 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.28 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.50 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.17 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.99 Bfactors> 106 vectors, 12756 coordinates in file. Openam> file on opening on unit 12: bfactors.pred Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000 Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 0.603600 Bfactors> 100 eigenvectors will be considered. Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped. Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed. (CHARMM units assumed for eigenvalues) %Bfactors-Wn> Experimental B-factors are nearly constant ! Bfactors> = 0.049 +/- 0.06 Bfactors> = 0.000 +/- 0.00 Bfactors> Shiftng-fct= -0.049 Bfactors> Scaling-fct= 0.000 Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved. Bfactors> Normal end. check_modes Chkmod> Version 1.00, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 2602160935392533103.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 2602160935392533103.eigenfacs Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4321E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4329E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4332E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4336E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4336E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4340E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 84.36 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 96.90 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 113.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 133.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 138.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 139.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 157.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 169.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 171.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 181.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 192.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 196.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 213.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 220.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 223.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 232.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 242.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 247.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 251.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 259.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 268.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 273.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 274.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 280.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 284.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 293.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 299.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 308.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 311.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 317.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 324.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 333.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 346.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 348.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 354.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 360.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 365.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 366.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 370.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 382.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 391.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 403.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 406.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 407.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 412.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 420.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 422.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 425.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 431.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 434.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 441.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 445.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 450.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 457.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 461.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 463.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 472.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 477.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 482.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 486.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 491.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 496.5 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Chkmod> That is: 4252 cartesian points. Openam> file on opening on unit 11: Chkmod.res Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file. Chkmod> Normal end. 0.0034 0.7445 0.0034 0.9630 0.0034 0.8525 0.0034 0.7496 0.0034 0.9959 0.0034 0.7228 84.3629 0.3116 96.8980 0.2803 112.9510 0.4423 133.3452 0.4312 138.5491 0.3324 139.7355 0.1305 157.5069 0.0807 169.4440 0.3208 171.2092 0.3424 180.9851 0.2212 192.7223 0.3938 196.9285 0.1115 213.8910 0.3739 220.4337 0.3537 223.1186 0.1096 232.8925 0.4369 242.1508 0.2262 247.9489 0.1955 250.9504 0.4658 259.8151 0.5048 268.0574 0.4828 273.5221 0.5161 274.1895 0.2447 280.2505 0.3534 284.7167 0.3610 293.6462 0.3989 299.2150 0.1939 307.9922 0.5972 311.2482 0.2020 317.0471 0.2927 324.7087 0.5442 333.8931 0.4041 346.7981 0.5197 348.1554 0.3685 354.3655 0.4722 359.9776 0.2825 365.0193 0.5414 366.7917 0.5021 370.7882 0.1245 382.6815 0.4057 391.6655 0.5024 403.6739 0.2346 406.4393 0.3853 407.7427 0.2488 412.4866 0.4842 420.5545 0.4533 422.9309 0.4550 425.8482 0.4233 431.3503 0.3716 434.7538 0.4586 441.2149 0.2447 445.4702 0.3730 450.2094 0.4903 457.7416 0.3543 461.5893 0.4148 463.2467 0.5033 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animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 9 running: ../../bin/get_modes.sh 2602160935392533103 9 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 9 calculating perturbed structure for DQ=-100 2602160935392533103.eigenfacs 2602160935392533103.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2602160935392533103.eigenfacs 2602160935392533103.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2602160935392533103.eigenfacs 2602160935392533103.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2602160935392533103.eigenfacs 2602160935392533103.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2602160935392533103.eigenfacs 2602160935392533103.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2602160935392533103.eigenfacs 2602160935392533103.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2602160935392533103.eigenfacs 2602160935392533103.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2602160935392533103.eigenfacs 2602160935392533103.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2602160935392533103.eigenfacs 2602160935392533103.atom calculating perturbed structure for DQ=80 2602160935392533103.eigenfacs 2602160935392533103.atom calculating perturbed structure for DQ=100 2602160935392533103.eigenfacs 2602160935392533103.atom making animated gifs 11 models are in 2602160935392533103.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2602160935392533103.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2602160935392533103.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 10 running: ../../bin/get_modes.sh 2602160935392533103 10 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 10 calculating perturbed structure for DQ=-100 2602160935392533103.eigenfacs 2602160935392533103.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2602160935392533103.eigenfacs 2602160935392533103.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2602160935392533103.eigenfacs 2602160935392533103.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2602160935392533103.eigenfacs 2602160935392533103.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2602160935392533103.eigenfacs 2602160935392533103.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2602160935392533103.eigenfacs 2602160935392533103.atom calculating perturbed structure for DQ=20 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100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2602160935392533103.10.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 11 running: ../../bin/get_modes.sh 2602160935392533103 11 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 11 calculating perturbed structure for DQ=-100 2602160935392533103.eigenfacs 2602160935392533103.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2602160935392533103.eigenfacs 2602160935392533103.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2602160935392533103.eigenfacs 2602160935392533103.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2602160935392533103.eigenfacs 2602160935392533103.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2602160935392533103.eigenfacs 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MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2602160935392533103.11.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 2602160935392533103.10.pdb 2602160935392533103.11.pdb 2602160935392533103.7.pdb 2602160935392533103.8.pdb 2602160935392533103.9.pdb STDERR: Note: The following floating-point exceptions are signalling: IEEE_DENORMAL real 0m23.060s user 0m22.918s sys 0m0.132s rm: cannot remove '2602160935392533103.sdijf': No such file or directory pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: 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