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LOGs for ID: 2602160941562536281

Output from eigenvector calculation:


STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8) Build Tirion matrix: Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model. Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004. Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file. Pdbmat> Coordinate filename = 2602160941562536281.atom Pdbmat> Distance cutoff = 8.00 Force constant = 10.00 Origin of mass values = CONS Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09 PRINTing level = 2 Pdbmat> Coordinate file 2602160941562536281.atom to be opened. Openam> File opened: 2602160941562536281.atom Pdbmat> Coordinate file in PDB format. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 681 First residue number = 1 Last residue number = 681 Number of atoms found = 10831 Mean number per residue = 15.9 Pdbmat> Coordinate statistics: = -0.139371 +/- 23.029093 From: -48.890000 To: 43.403000 = -0.016977 +/- 13.334468 From: -32.347000 To: 32.139000 = -0.122215 +/- 12.393311 From: -32.802000 To: 35.193000 Pdbmat> Masses are all set to one. %Pdbmat-W> residue:'HIE ' is not a well known amino-acid. %Pdbmat-W> residue:'HIE ' is not a well known amino-acid. %Pdbmat-W> residue:'HID ' is not a well known amino-acid. %Pdbmat-W> residue:'LYN ' is not a well known amino-acid. %Pdbmat-W> residue:'HD1 ' is not a well known amino-acid. %Pdbmat-W> residue:'AP1 ' is not a well known amino-acid. %Pdbmat-W> residue:'HID ' is not a well known amino-acid. %Pdbmat-W> residue:'HIE ' is not a well known amino-acid. %Pdbmat-W> residue:'HD2 ' is not a well known amino-acid. %Pdbmat-W> ........ %Pdbmat-W> 23 residue(s) not known. Openam> File opened: pdbmat.xyzm Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved. Openam> File opened: pdbmat.sdijb Pdbmat> Matrix statistics: Pdbmat> The matrix is 1.4816 % Filled. Pdbmat> 7821319 non-zero elements. Pdbmat> 861957 atom-atom interactions. Pdbmat> Number per atom= 159.16 +/- 45.84 Maximum number = 244 Minimum number = 21 Pdbmat> Matrix trace = 1.723914E+07 Pdbmat> Larger element = 861.763 Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10 Pdbmat> Normal end. automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1) 681 non-zero elements, NRBL set to 4 Diagonalize Tirion matrix using diagrtb Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation. Diagrtb> Version 2.52, November 2004. Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file. Diagrtb> Options taken into account: MATRix filename = pdbmat.sdijb COORdinates filename = 2602160941562536281.atom Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb Nb of VECTors required = 106 EigeNVALues chosen = LOWE Type of SUBStructuring = NONE Nb of residues per BLOck = 4 Origin of MASS values = CONS MATRix FORMat = BINA Temporary files cleaning = ALL Output PRINting level = 2 Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb. Blocpdb> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.xyzm Blocpdb> Coordinate file 2602160941562536281.atom to be opened. Openam> file on opening on unit 11: 2602160941562536281.atom Blocpdb> Coordinate file in PDB format. Blocpdb> 10831 atoms picked in pdb file. Blocpdb> All masses set to unity. Blocpdb> Coordinate file is rewritten. Blocpdb> Substructuring: Blocpdb> 4 residue(s) per block. Blocpdb> 681 residues. Blocpdb> 59 atoms in block 1 Block first atom: 1 Blocpdb> 64 atoms in block 2 Block first atom: 60 Blocpdb> 56 atoms in block 3 Block first atom: 124 Blocpdb> 48 atoms in block 4 Block first atom: 180 Blocpdb> 61 atoms in block 5 Block first atom: 228 Blocpdb> 77 atoms in block 6 Block first atom: 289 Blocpdb> 70 atoms in block 7 Block first atom: 366 Blocpdb> 59 atoms in block 8 Block first atom: 436 Blocpdb> 56 atoms in block 9 Block first atom: 495 Blocpdb> 65 atoms in block 10 Block first atom: 551 Blocpdb> 71 atoms in block 11 Block first atom: 616 Blocpdb> 54 atoms in block 12 Block first atom: 687 Blocpdb> 59 atoms in block 13 Block first atom: 741 Blocpdb> 72 atoms in block 14 Block first atom: 800 Blocpdb> 53 atoms in block 15 Block first atom: 872 Blocpdb> 71 atoms in block 16 Block first atom: 925 Blocpdb> 74 atoms in block 17 Block first atom: 996 Blocpdb> 71 atoms in block 18 Block first atom: 1070 Blocpdb> 59 atoms in block 19 Block first atom: 1141 Blocpdb> 62 atoms in block 20 Block first atom: 1200 Blocpdb> 69 atoms in block 21 Block first atom: 1262 Blocpdb> 57 atoms in block 22 Block first atom: 1331 Blocpdb> 54 atoms in block 23 Block first atom: 1388 Blocpdb> 73 atoms in block 24 Block first atom: 1442 Blocpdb> 55 atoms in block 25 Block first atom: 1515 Blocpdb> 69 atoms in block 26 Block first atom: 1570 Blocpdb> 64 atoms in block 27 Block first atom: 1639 Blocpdb> 67 atoms in block 28 Block first atom: 1703 Blocpdb> 67 atoms in block 29 Block first atom: 1770 Blocpdb> 50 atoms in block 30 Block first atom: 1837 Blocpdb> 58 atoms in block 31 Block first atom: 1887 Blocpdb> 46 atoms in block 32 Block first atom: 1945 Blocpdb> 65 atoms in block 33 Block first atom: 1991 Blocpdb> 42 atoms in block 34 Block first atom: 2056 Blocpdb> 75 atoms in block 35 Block first atom: 2098 Blocpdb> 68 atoms in block 36 Block first atom: 2173 Blocpdb> 75 atoms in block 37 Block first atom: 2241 Blocpdb> 61 atoms in block 38 Block first atom: 2316 Blocpdb> 75 atoms in block 39 Block first atom: 2377 Blocpdb> 71 atoms in block 40 Block first atom: 2452 Blocpdb> 61 atoms in block 41 Block first atom: 2523 Blocpdb> 63 atoms in block 42 Block first atom: 2584 Blocpdb> 50 atoms in block 43 Block first atom: 2647 Blocpdb> 70 atoms in block 44 Block first atom: 2697 Blocpdb> 73 atoms in block 45 Block first atom: 2767 Blocpdb> 65 atoms in block 46 Block first atom: 2840 Blocpdb> 65 atoms in block 47 Block first atom: 2905 Blocpdb> 56 atoms in block 48 Block first atom: 2970 Blocpdb> 56 atoms in block 49 Block first atom: 3026 Blocpdb> 65 atoms in block 50 Block first atom: 3082 Blocpdb> 60 atoms in block 51 Block first atom: 3147 Blocpdb> 54 atoms in block 52 Block first atom: 3207 Blocpdb> 74 atoms in block 53 Block first atom: 3261 Blocpdb> 76 atoms in block 54 Block first atom: 3335 Blocpdb> 78 atoms in block 55 Block first atom: 3411 Blocpdb> 56 atoms in block 56 Block first atom: 3489 Blocpdb> 63 atoms in block 57 Block first atom: 3545 Blocpdb> 48 atoms in block 58 Block first atom: 3608 Blocpdb> 59 atoms in block 59 Block first atom: 3656 Blocpdb> 54 atoms in block 60 Block first atom: 3715 Blocpdb> 75 atoms in block 61 Block first atom: 3769 Blocpdb> 61 atoms in block 62 Block first atom: 3844 Blocpdb> 62 atoms in block 63 Block first atom: 3905 Blocpdb> 63 atoms in block 64 Block first atom: 3967 Blocpdb> 76 atoms in block 65 Block first atom: 4030 Blocpdb> 59 atoms in block 66 Block first atom: 4106 Blocpdb> 58 atoms in block 67 Block first atom: 4165 Blocpdb> 72 atoms in block 68 Block first atom: 4223 Blocpdb> 52 atoms in block 69 Block first atom: 4295 Blocpdb> 64 atoms in block 70 Block first atom: 4347 Blocpdb> 64 atoms in block 71 Block first atom: 4411 Blocpdb> 71 atoms in block 72 Block first atom: 4475 Blocpdb> 67 atoms in block 73 Block first atom: 4546 Blocpdb> 67 atoms in block 74 Block first atom: 4613 Blocpdb> 81 atoms in block 75 Block first atom: 4680 Blocpdb> 61 atoms in block 76 Block first atom: 4761 Blocpdb> 60 atoms in block 77 Block first atom: 4822 Blocpdb> 73 atoms in block 78 Block first atom: 4882 Blocpdb> 79 atoms in block 79 Block first atom: 4955 Blocpdb> 62 atoms in block 80 Block first atom: 5034 Blocpdb> 56 atoms in block 81 Block first atom: 5096 Blocpdb> 57 atoms in block 82 Block first atom: 5152 Blocpdb> 67 atoms in block 83 Block first atom: 5209 Blocpdb> 69 atoms in block 84 Block first atom: 5276 Blocpdb> 70 atoms in block 85 Block first atom: 5345 Blocpdb> 78 atoms in block 86 Block first atom: 5415 Blocpdb> 77 atoms in block 87 Block first atom: 5493 Blocpdb> 64 atoms in block 88 Block first atom: 5570 Blocpdb> 43 atoms in block 89 Block first atom: 5634 Blocpdb> 57 atoms in block 90 Block first atom: 5677 Blocpdb> 35 atoms in block 91 Block first atom: 5734 Blocpdb> 57 atoms in block 92 Block first atom: 5769 Blocpdb> 76 atoms in block 93 Block first atom: 5826 Blocpdb> 77 atoms in block 94 Block first atom: 5902 Blocpdb> 66 atoms in block 95 Block first atom: 5979 Blocpdb> 64 atoms in block 96 Block first atom: 6045 Blocpdb> 66 atoms in block 97 Block first atom: 6109 Blocpdb> 66 atoms in block 98 Block first atom: 6175 Blocpdb> 77 atoms in block 99 Block first atom: 6241 Blocpdb> 69 atoms in block 100 Block first atom: 6318 Blocpdb> 61 atoms in block 101 Block first atom: 6387 Blocpdb> 64 atoms in block 102 Block first atom: 6448 Blocpdb> 75 atoms in block 103 Block first atom: 6512 Blocpdb> 53 atoms in block 104 Block first atom: 6587 Blocpdb> 53 atoms in block 105 Block first atom: 6640 Blocpdb> 56 atoms in block 106 Block first atom: 6693 Blocpdb> 54 atoms in block 107 Block first atom: 6749 Blocpdb> 60 atoms in block 108 Block first atom: 6803 Blocpdb> 54 atoms in block 109 Block first atom: 6863 Blocpdb> 64 atoms in block 110 Block first atom: 6917 Blocpdb> 59 atoms in block 111 Block first atom: 6981 Blocpdb> 60 atoms in block 112 Block first atom: 7040 Blocpdb> 69 atoms in block 113 Block first atom: 7100 Blocpdb> 58 atoms in block 114 Block first atom: 7169 Blocpdb> 62 atoms in block 115 Block first atom: 7227 Blocpdb> 54 atoms in block 116 Block first atom: 7289 Blocpdb> 56 atoms in block 117 Block first atom: 7343 Blocpdb> 83 atoms in block 118 Block first atom: 7399 Blocpdb> 61 atoms in block 119 Block first atom: 7482 Blocpdb> 42 atoms in block 120 Block first atom: 7543 Blocpdb> 66 atoms in block 121 Block first atom: 7585 Blocpdb> 68 atoms in block 122 Block first atom: 7651 Blocpdb> 63 atoms in block 123 Block first atom: 7719 Blocpdb> 61 atoms in block 124 Block first atom: 7782 Blocpdb> 55 atoms in block 125 Block first atom: 7843 Blocpdb> 65 atoms in block 126 Block first atom: 7898 Blocpdb> 75 atoms in block 127 Block first atom: 7963 Blocpdb> 72 atoms in block 128 Block first atom: 8038 Blocpdb> 69 atoms in block 129 Block first atom: 8110 Blocpdb> 58 atoms in block 130 Block first atom: 8179 Blocpdb> 61 atoms in block 131 Block first atom: 8237 Blocpdb> 75 atoms in block 132 Block first atom: 8298 Blocpdb> 62 atoms in block 133 Block first atom: 8373 Blocpdb> 65 atoms in block 134 Block first atom: 8435 Blocpdb> 66 atoms in block 135 Block first atom: 8500 Blocpdb> 58 atoms in block 136 Block first atom: 8566 Blocpdb> 70 atoms in block 137 Block first atom: 8624 Blocpdb> 53 atoms in block 138 Block first atom: 8694 Blocpdb> 63 atoms in block 139 Block first atom: 8747 Blocpdb> 54 atoms in block 140 Block first atom: 8810 Blocpdb> 54 atoms in block 141 Block first atom: 8864 Blocpdb> 56 atoms in block 142 Block first atom: 8918 Blocpdb> 70 atoms in block 143 Block first atom: 8974 Blocpdb> 65 atoms in block 144 Block first atom: 9044 Blocpdb> 72 atoms in block 145 Block first atom: 9109 Blocpdb> 54 atoms in block 146 Block first atom: 9181 Blocpdb> 60 atoms in block 147 Block first atom: 9235 Blocpdb> 75 atoms in block 148 Block first atom: 9295 Blocpdb> 60 atoms in block 149 Block first atom: 9370 Blocpdb> 67 atoms in block 150 Block first atom: 9430 Blocpdb> 52 atoms in block 151 Block first atom: 9497 Blocpdb> 59 atoms in block 152 Block first atom: 9549 Blocpdb> 69 atoms in block 153 Block first atom: 9608 Blocpdb> 68 atoms in block 154 Block first atom: 9677 Blocpdb> 82 atoms in block 155 Block first atom: 9745 Blocpdb> 64 atoms in block 156 Block first atom: 9827 Blocpdb> 62 atoms in block 157 Block first atom: 9891 Blocpdb> 65 atoms in block 158 Block first atom: 9953 Blocpdb> 60 atoms in block 159 Block first atom: 10018 Blocpdb> 60 atoms in block 160 Block first atom: 10078 Blocpdb> 64 atoms in block 161 Block first atom: 10138 Blocpdb> 67 atoms in block 162 Block first atom: 10202 Blocpdb> 61 atoms in block 163 Block first atom: 10269 Blocpdb> 74 atoms in block 164 Block first atom: 10330 Blocpdb> 63 atoms in block 165 Block first atom: 10404 Blocpdb> 51 atoms in block 166 Block first atom: 10467 Blocpdb> 53 atoms in block 167 Block first atom: 10518 Blocpdb> 63 atoms in block 168 Block first atom: 10571 Blocpdb> 66 atoms in block 169 Block first atom: 10634 Blocpdb> 118 atoms in block 170 Block first atom: 10700 Blocpdb> 14 atoms in block 171 Block first atom: 10817 Blocpdb> 171 blocks. Blocpdb> At most, 118 atoms in each of them. Blocpdb> At least, 14 atoms in each of them. Blocpdb> Normal end of Blocpdb. Diagrtb> Memory allocation for Prepmat. Diagrtb> Memory allocation for RTB. Diagrtb> Memory allocation for Diagstd. Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes. Prepmat> Entering in. Prepmat> Rewriting of the matrix begins. Prepmat> 7821490 matrix lines read. Prepmat> Matrix order = 32493 Prepmat> Matrix trace = 17239140.0000 Prepmat> Last element read: 32493 32493 657.4059 Prepmat> 14707 lines saved. Prepmat> 12863 empty lines. Prepmat> Number of lines on output is as expected. Prepmat> Normal end of Prepmat. RTB> Entering in. RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 10831 RTB> Total mass = 10831.0000 RTB> Number of atoms found in matrix: 10831 RTB> Number of blocks = 171 RTB> Projection begins. RTB> Projected matrix is being saved. RTB> Projected matrix trace = 408986.4013 RTB> 63783 non-zero elements. RTB> Normal end of RTB. Diagstd> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.sdijb Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb Diagstd> CERFACS matrix format. Diagstd> Projected matrix order = 1026 Diagstd> Nb of non-zero elements: 63783 Diagstd> Projected matrix trace = 408986.4013 Openam> file on opening on unit 11: diagrtb_work.eigenfacs Diagstd> Diagonalization. Diagstd> 1026 eigenvectors are computed. Diagstd> 106 of them to be saved. Diagstd> Sum of eigenvalues = 408986.4013 Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000 Diagstd> Selected eigenvalues: 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.9788315 1.2093979 1.6440912 4.2208233 5.4616294 6.8951619 8.6289817 9.9286245 10.2311863 10.9625765 12.1075919 14.6674091 16.2591245 17.2249095 18.5239003 19.5126516 21.8102521 23.2126798 24.6913106 25.5696437 27.2926309 28.2592331 29.8223381 31.0433611 31.8455680 32.3869236 32.5236378 34.5876377 35.3411975 36.3195271 37.7399355 38.5846124 39.1666127 40.1996429 41.4170964 42.0930171 43.6213126 45.0895115 45.9304857 46.9288061 47.6683053 49.0188724 50.3396892 51.0487389 52.5610964 53.5206193 53.7199585 54.7218514 57.3063570 57.8935276 58.0862569 59.4124388 61.0132123 61.5839389 62.7938100 64.2110033 65.0556085 66.2156948 66.8817387 67.6712478 68.9623679 70.2770040 70.9761485 71.5046741 72.9831762 74.2929767 74.8480438 76.9947156 77.9089827 78.9357438 79.1969178 79.6115020 80.4228868 81.2604938 82.8227883 83.7124492 84.3888678 85.3408387 86.5847867 87.1372238 87.9044420 89.0737126 89.8256821 92.7276043 93.5148827 95.4839233 96.8722138 97.8373277 98.2298857 100.2130910 101.0923749 102.3303605 102.7318382 103.0024366 103.4621631 104.7436584 105.5255891 106.1357212 107.7123702 108.3783580 Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units): 0.0034291 0.0034312 0.0034319 0.0034337 0.0034347 0.0034353 107.4358545 119.4207737 139.2381448 223.0970698 253.7794170 285.1461503 318.9885197 342.1683403 347.3427801 359.5436302 377.8541250 415.8837800 437.8686566 450.6856753 467.3707163 479.6820043 507.1373802 523.1881760 539.5942981 549.1078074 567.3067893 577.2653186 593.0156093 605.0338162 612.8014443 617.9881231 619.2910996 638.6394332 645.5589566 654.4332746 667.1075516 674.5316796 679.5998700 688.5038577 698.8518264 704.5313258 717.2072069 729.1771411 735.9457459 743.9008123 749.7390581 760.2859038 770.4607962 775.8679092 787.2768630 794.4303831 795.9084482 803.2961243 822.0470606 826.2477441 827.6219035 837.0164052 848.2174948 852.1754367 860.5055933 870.1617888 875.8659679 883.6407804 888.0737997 893.3000792 901.7815859 910.3363818 914.8533749 918.2532963 927.6980854 935.9855846 939.4756049 952.8526359 958.4932239 964.7885334 966.3833085 968.9094443 973.8343946 978.8925173 988.2576937 993.5513198 997.5573212 1003.1681463 1010.4529032 1013.6712752 1018.1240372 1024.8730126 1029.1899629 1045.6824042 1050.1120622 1061.1100015 1068.7961792 1074.1070602 1076.2597520 1087.0699964 1091.8286344 1098.4936033 1100.6463809 1102.0949933 1104.5517227 1111.3712289 1115.5118107 1118.7320183 1127.0107838 1130.4895802 Diagstd> Normal end. Rtb_to_modes> Entering in. Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 10831 Rtb_to_modes> Number of blocs = 171 Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.eigenfacs Openam> file on opening on unit 11: matrix.eigenrtb Rdmodfacs> Entering in. Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Eigenvector number: 1 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9714E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 2 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9839E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 3 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9881E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 4 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9986E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 5 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0005E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 6 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0008E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 7 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.9788 Rdmodfacs> Eigenvector number: 8 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.209 Rdmodfacs> Eigenvector number: 9 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.644 Rdmodfacs> Eigenvector number: 10 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.221 Rdmodfacs> Eigenvector number: 11 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.462 Rdmodfacs> Eigenvector number: 12 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.895 Rdmodfacs> Eigenvector number: 13 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.629 Rdmodfacs> Eigenvector number: 14 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.929 Rdmodfacs> Eigenvector number: 15 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.23 Rdmodfacs> Eigenvector number: 16 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.96 Rdmodfacs> Eigenvector number: 17 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.11 Rdmodfacs> Eigenvector number: 18 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.67 Rdmodfacs> Eigenvector number: 19 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.26 Rdmodfacs> Eigenvector number: 20 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.22 Rdmodfacs> Eigenvector number: 21 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.52 Rdmodfacs> Eigenvector number: 22 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.51 Rdmodfacs> Eigenvector number: 23 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.81 Rdmodfacs> Eigenvector number: 24 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.21 Rdmodfacs> Eigenvector number: 25 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.69 Rdmodfacs> Eigenvector number: 26 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.57 Rdmodfacs> Eigenvector number: 27 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.29 Rdmodfacs> Eigenvector number: 28 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.26 Rdmodfacs> Eigenvector number: 29 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.82 Rdmodfacs> Eigenvector number: 30 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.04 Rdmodfacs> Eigenvector number: 31 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.85 Rdmodfacs> Eigenvector number: 32 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.39 Rdmodfacs> Eigenvector number: 33 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.52 Rdmodfacs> Eigenvector number: 34 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.59 Rdmodfacs> Eigenvector number: 35 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.34 Rdmodfacs> Eigenvector number: 36 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.32 Rdmodfacs> Eigenvector number: 37 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.74 Rdmodfacs> Eigenvector number: 38 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.58 Rdmodfacs> Eigenvector number: 39 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.17 Rdmodfacs> Eigenvector number: 40 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.20 Rdmodfacs> Eigenvector number: 41 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.42 Rdmodfacs> Eigenvector number: 42 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 43 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.62 Rdmodfacs> Eigenvector number: 44 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 45 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.93 Rdmodfacs> Eigenvector number: 46 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.93 Rdmodfacs> Eigenvector number: 47 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 47.67 Rdmodfacs> Eigenvector number: 48 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 49.02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 49 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 50.34 Rdmodfacs> Eigenvector number: 50 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 51.05 Rdmodfacs> Eigenvector number: 51 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 52.56 Rdmodfacs> Eigenvector number: 52 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 53.52 Rdmodfacs> Eigenvector number: 53 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 53.72 Rdmodfacs> Eigenvector number: 54 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 54.72 Rdmodfacs> Eigenvector number: 55 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 57.31 Rdmodfacs> Eigenvector number: 56 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 57.89 Rdmodfacs> Eigenvector number: 57 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 58.09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 58 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 59.41 Rdmodfacs> Eigenvector number: 59 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 61.01 Rdmodfacs> Eigenvector number: 60 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 61.58 Rdmodfacs> Eigenvector number: 61 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 62.79 Rdmodfacs> Eigenvector number: 62 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 64.21 Rdmodfacs> Eigenvector number: 63 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 65.06 Rdmodfacs> Eigenvector number: 64 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 66.22 Rdmodfacs> Eigenvector number: 65 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 66.88 Rdmodfacs> Eigenvector number: 66 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 67.67 Rdmodfacs> Eigenvector number: 67 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 68.96 Rdmodfacs> Eigenvector number: 68 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 70.28 Rdmodfacs> Eigenvector number: 69 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 70.98 Rdmodfacs> Eigenvector number: 70 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 71.50 Rdmodfacs> Eigenvector number: 71 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 72.98 Rdmodfacs> Eigenvector number: 72 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 74.29 Rdmodfacs> Eigenvector number: 73 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 74.85 Rdmodfacs> Eigenvector number: 74 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 76.99 Rdmodfacs> Eigenvector number: 75 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 77.91 Rdmodfacs> Eigenvector number: 76 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 78.94 Rdmodfacs> Eigenvector number: 77 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 79.20 Rdmodfacs> Eigenvector number: 78 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 79.61 Rdmodfacs> Eigenvector number: 79 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 80.42 Rdmodfacs> Eigenvector number: 80 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 81.26 Rdmodfacs> Eigenvector number: 81 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 82.82 Rdmodfacs> Eigenvector number: 82 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 83.71 Rdmodfacs> Eigenvector number: 83 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 84.39 Rdmodfacs> Eigenvector number: 84 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 85.34 Rdmodfacs> Eigenvector number: 85 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 86.58 Rdmodfacs> Eigenvector number: 86 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 87.14 Rdmodfacs> Eigenvector number: 87 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 87.90 Rdmodfacs> Eigenvector number: 88 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 89.07 Rdmodfacs> Eigenvector number: 89 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 89.83 Rdmodfacs> Eigenvector number: 90 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 92.73 Rdmodfacs> Eigenvector number: 91 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 93.51 Rdmodfacs> Eigenvector number: 92 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 95.48 Rdmodfacs> Eigenvector number: 93 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 96.87 Rdmodfacs> Eigenvector number: 94 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 97.84 Rdmodfacs> Eigenvector number: 95 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 98.23 Rdmodfacs> Eigenvector number: 96 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 100.2 Rdmodfacs> Eigenvector number: 97 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 101.1 Rdmodfacs> Eigenvector number: 98 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 102.3 Rdmodfacs> Eigenvector number: 99 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 102.7 Rdmodfacs> Eigenvector number: 100 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 103.0 Rdmodfacs> Eigenvector number: 101 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 103.5 Rdmodfacs> Eigenvector number: 102 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 104.7 Rdmodfacs> Eigenvector number: 103 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 105.5 Rdmodfacs> Eigenvector number: 104 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 106.1 Rdmodfacs> Eigenvector number: 105 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 107.7 Rdmodfacs> Eigenvector number: 106 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 108.4 Rtb_to_modes> 106 vectors, with 1026 coordinates in vector file. Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected): 1.00000 1.00000 1.00002 1.00001 1.00000 1.00001 1.00000 0.99998 1.00000 1.00001 1.00000 1.00001 1.00001 1.00000 1.00004 1.00000 0.99998 1.00001 1.00000 1.00002 0.99998 1.00001 1.00001 0.99997 0.99997 1.00000 1.00002 1.00002 1.00001 0.99998 1.00000 1.00002 1.00001 1.00000 1.00000 1.00000 1.00001 0.99999 0.99998 1.00000 0.99999 0.99998 1.00000 0.99999 1.00000 1.00001 1.00000 0.99997 1.00000 1.00002 0.99998 1.00001 1.00001 1.00001 1.00001 1.00001 1.00001 1.00002 1.00001 1.00000 1.00001 0.99997 1.00002 0.99999 1.00002 1.00001 1.00000 1.00000 1.00001 1.00000 0.99997 1.00000 1.00001 1.00000 0.99998 1.00001 1.00001 1.00002 1.00000 0.99999 1.00000 1.00000 0.99997 1.00003 1.00001 1.00000 1.00001 1.00000 0.99999 0.99999 1.00000 0.99998 1.00000 1.00000 0.99999 1.00000 1.00002 1.00001 1.00001 1.00000 1.00001 0.99998 0.99999 1.00000 1.00000 1.00000 Rtb_to_modes> RTB block-file is being read. Rtb_to_modes> 194958 lines found in RTB file. Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected): 1.00000 1.00000 1.00002 1.00001 1.00000 1.00001 1.00000 0.99998 1.00000 1.00001 1.00000 1.00001 1.00001 1.00000 1.00004 1.00000 0.99998 1.00001 1.00000 1.00002 0.99998 1.00001 1.00001 0.99997 0.99997 1.00000 1.00002 1.00002 1.00001 0.99998 1.00000 1.00002 1.00001 1.00000 1.00000 1.00000 1.00001 0.99999 0.99998 1.00000 0.99999 0.99998 1.00000 0.99999 1.00000 1.00001 1.00000 0.99997 1.00000 1.00002 0.99998 1.00001 1.00001 1.00001 1.00001 1.00001 1.00001 1.00002 1.00001 1.00000 1.00001 0.99997 1.00002 0.99999 1.00002 1.00001 1.00000 1.00000 1.00001 1.00000 0.99997 1.00000 1.00001 1.00000 0.99998 1.00001 1.00001 1.00002 1.00000 0.99999 1.00000 1.00000 0.99997 1.00003 1.00001 1.00000 1.00001 1.00000 0.99999 0.99999 1.00000 0.99998 1.00000 1.00000 0.99999 1.00000 1.00002 1.00001 1.00001 1.00000 1.00001 0.99998 0.99999 1.00000 1.00000 1.00000 Orthogonality of first eigenvectors (zero expected): Vector 2: 0.000 Vector 3:-0.000-0.000 Vector 4: 0.000-0.000 0.000 Vector 5:-0.000 0.000 0.000 0.000 Vector 6: 0.000-0.000 0.000 0.000 0.000 Vector 7: 0.000 0.000-0.000 0.000 0.000-0.000 Vector 8:-0.000-0.000 0.000 0.000-0.000 0.000 0.000 Vector 9:-0.000 0.000-0.000 0.000-0.000-0.000-0.000-0.000 Vector 10: 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000-0.000 0.000 0.000 Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved. Rtb_to_modes> Normal end. Diagrtb> Normal end. B-factor analysis Bfactors> Version 1.22, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 2602160941562536281.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 2602160941562536281.eigenfacs Getnam> Corresponding pdb filename ? Getnam> 2602160941562536281.atom Openam> file on opening on unit 11: 2602160941562536281.atom Getnum> Number of skipped eigenvectors ? Getnum> 0 Getnum> Number of usefull eigenvectors ? Getnum> 10000 %Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 681 First residue number = 1 Last residue number = 681 Number of atoms found = 10831 Mean number per residue = 15.9 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9714E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9839E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9881E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9986E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0005E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0008E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.9788 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.209 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.644 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.221 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.462 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.895 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.629 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.929 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.23 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.96 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.11 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.67 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.26 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.22 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.52 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.51 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.81 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.21 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.69 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.57 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.29 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.26 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.82 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.04 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.85 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.39 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.52 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.59 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.34 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.32 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.74 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.58 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.17 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.20 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.42 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.62 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.93 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.93 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.67 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 50.34 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 51.05 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 52.56 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 53.52 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 53.72 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 54.72 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 57.31 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 57.89 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 58.09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 59.41 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 61.01 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 61.58 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 62.79 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 64.21 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 65.06 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 66.22 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 66.88 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 67.67 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 68.96 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 70.28 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 70.98 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 71.50 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 72.98 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 74.29 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 74.85 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 76.99 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 77.91 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 78.94 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 79.20 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 79.61 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 80.42 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 81.26 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 82.82 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 83.71 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 84.39 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 85.34 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 86.58 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 87.14 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 87.90 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 89.07 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 89.83 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 92.73 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 93.51 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 95.48 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 96.87 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 97.84 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 98.23 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 100.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 101.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 102.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 102.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 103.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 103.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 104.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 105.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 106.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 107.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 108.4 Bfactors> 106 vectors, 32493 coordinates in file. Openam> file on opening on unit 12: bfactors.pred Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000 Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 0.978800 Bfactors> 100 eigenvectors will be considered. Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped. Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed. (CHARMM units assumed for eigenvalues) %Bfactors-Wn> Experimental B-factors are nearly constant ! Bfactors> = 0.007 +/- 0.01 Bfactors> = 0.000 +/- 0.00 Bfactors> Shiftng-fct= -0.007 Bfactors> Scaling-fct= 0.000 Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved. Bfactors> Normal end. check_modes Chkmod> Version 1.00, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 2602160941562536281.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 2602160941562536281.eigenfacs Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4289E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4310E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4318E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4336E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4347E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4352E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 107.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 119.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 139.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 223.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 253.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 285.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 319.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 342.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 347.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 359.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 377.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 415.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 437.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 450.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 467.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 479.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 507.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 523.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 539.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 549.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 567.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 577.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 593.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 605.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 612.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 618.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 619.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 638.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 645.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 654.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 667.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 674.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 679.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 688.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 698.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 704.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 717.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 729.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 735.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 743.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 749.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 760.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 770.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 775.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 787.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 794.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 795.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 803.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 822.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 826.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 827.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 837.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 848.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 852.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 860.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 870.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 875.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 883.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 888.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 893.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 901.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 910.3 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perturbed structure for DQ=-80 2602160941562536281.eigenfacs 2602160941562536281.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2602160941562536281.eigenfacs 2602160941562536281.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2602160941562536281.eigenfacs 2602160941562536281.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2602160941562536281.eigenfacs 2602160941562536281.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2602160941562536281.eigenfacs 2602160941562536281.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2602160941562536281.eigenfacs 2602160941562536281.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2602160941562536281.eigenfacs 2602160941562536281.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2602160941562536281.eigenfacs 2602160941562536281.atom calculating perturbed structure for DQ=80 2602160941562536281.eigenfacs 2602160941562536281.atom calculating perturbed structure for DQ=100 2602160941562536281.eigenfacs 2602160941562536281.atom making animated gifs 11 models are in 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animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 9 running: ../../bin/get_modes.sh 2602160941562536281 9 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 9 calculating perturbed structure for DQ=-100 2602160941562536281.eigenfacs 2602160941562536281.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2602160941562536281.eigenfacs 2602160941562536281.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2602160941562536281.eigenfacs 2602160941562536281.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2602160941562536281.eigenfacs 2602160941562536281.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2602160941562536281.eigenfacs 2602160941562536281.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2602160941562536281.eigenfacs 2602160941562536281.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2602160941562536281.eigenfacs 2602160941562536281.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2602160941562536281.eigenfacs 2602160941562536281.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2602160941562536281.eigenfacs 2602160941562536281.atom calculating perturbed structure for DQ=80 2602160941562536281.eigenfacs 2602160941562536281.atom calculating perturbed structure for DQ=100 2602160941562536281.eigenfacs 2602160941562536281.atom making animated gifs 11 models are in 2602160941562536281.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2602160941562536281.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2602160941562536281.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 10 running: ../../bin/get_modes.sh 2602160941562536281 10 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 10 calculating perturbed structure for DQ=-100 2602160941562536281.eigenfacs 2602160941562536281.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2602160941562536281.eigenfacs 2602160941562536281.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2602160941562536281.eigenfacs 2602160941562536281.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2602160941562536281.eigenfacs 2602160941562536281.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2602160941562536281.eigenfacs 2602160941562536281.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2602160941562536281.eigenfacs 2602160941562536281.atom calculating perturbed structure for DQ=20 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MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2602160941562536281.11.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 2602160941562536281.10.pdb 2602160941562536281.11.pdb 2602160941562536281.7.pdb 2602160941562536281.8.pdb 2602160941562536281.9.pdb STDERR: Note: The following floating-point exceptions are signalling: IEEE_DENORMAL real 1m3.885s user 1m3.408s sys 0m0.446s rm: cannot remove '2602160941562536281.sdijf': No such file or directory pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: 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