*** ***
Output from eigenvector calculation:
STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8)
Build Tirion matrix:
Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model.
Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004.
Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file.
Pdbmat> Coordinate filename = 2602180606493168039.atom
Pdbmat> Distance cutoff = 8.00
Force constant = 10.00
Origin of mass values = CONS
Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09
PRINTing level = 2
Pdbmat> Coordinate file 2602180606493168039.atom to be opened.
Openam> File opened: 2602180606493168039.atom
Pdbmat> Coordinate file in PDB format.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 214
First residue number = 1
Last residue number = 214
Number of atoms found = 1656
Mean number per residue = 7.7
Pdbmat> Coordinate statistics:
= -0.034412 +/- 14.246947 From: -32.579000 To: 26.085000
= 0.024780 +/- 8.412822 From: -20.839000 To: 20.607000
= -0.029804 +/- 10.498114 From: -23.538000 To: 22.889000
Pdbmat> Masses are all set to one.
Openam> File opened: pdbmat.xyzm
Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved.
Openam> File opened: pdbmat.sdijb
Pdbmat> Matrix statistics:
Pdbmat> The matrix is 4.6015 % Filled.
Pdbmat> 567967 non-zero elements.
Pdbmat> 62014 atom-atom interactions.
Pdbmat> Number per atom= 74.90 +/- 19.55
Maximum number = 124
Minimum number = 14
Pdbmat> Matrix trace = 1.240280E+06
Pdbmat> Larger element = 483.832
Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10
Pdbmat> Normal end.
automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1)
214 non-zero elements, NRBL set to 2
Diagonalize Tirion matrix using diagrtb
Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation.
Diagrtb> Version 2.52, November 2004.
Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file.
Diagrtb> Options taken into account:
MATRix filename = pdbmat.sdijb
COORdinates filename = 2602180606493168039.atom
Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb
Nb of VECTors required = 106
EigeNVALues chosen = LOWE
Type of SUBStructuring = NONE
Nb of residues per BLOck = 2
Origin of MASS values = CONS
MATRix FORMat = BINA
Temporary files cleaning = ALL
Output PRINting level = 2
Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb.
Blocpdb> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.xyzm
Blocpdb> Coordinate file 2602180606493168039.atom to be opened.
Openam> file on opening on unit 11:
2602180606493168039.atom
Blocpdb> Coordinate file in PDB format.
Blocpdb> 1656 atoms picked in pdb file.
Blocpdb> All masses set to unity.
Blocpdb> Coordinate file is rewritten.
Blocpdb> Substructuring:
Blocpdb> 2 residue(s) per block.
Blocpdb> 214 residues.
Blocpdb> 19 atoms in block 1
Block first atom: 1
Blocpdb> 16 atoms in block 2
Block first atom: 20
Blocpdb> 16 atoms in block 3
Block first atom: 36
Blocpdb> 9 atoms in block 4
Block first atom: 52
Blocpdb> 11 atoms in block 5
Block first atom: 61
Blocpdb> 9 atoms in block 6
Block first atom: 72
Blocpdb> 13 atoms in block 7
Block first atom: 81
Blocpdb> 16 atoms in block 8
Block first atom: 94
Blocpdb> 14 atoms in block 9
Block first atom: 110
Blocpdb> 19 atoms in block 10
Block first atom: 124
Blocpdb> 17 atoms in block 11
Block first atom: 143
Blocpdb> 21 atoms in block 12
Block first atom: 160
Blocpdb> 12 atoms in block 13
Block first atom: 181
Blocpdb> 16 atoms in block 14
Block first atom: 193
Blocpdb> 14 atoms in block 15
Block first atom: 209
Blocpdb> 11 atoms in block 16
Block first atom: 223
Blocpdb> 16 atoms in block 17
Block first atom: 234
Blocpdb> 19 atoms in block 18
Block first atom: 250
Blocpdb> 10 atoms in block 19
Block first atom: 269
Blocpdb> 16 atoms in block 20
Block first atom: 279
Blocpdb> 10 atoms in block 21
Block first atom: 295
Blocpdb> 15 atoms in block 22
Block first atom: 305
Blocpdb> 12 atoms in block 23
Block first atom: 320
Blocpdb> 18 atoms in block 24
Block first atom: 332
Blocpdb> 14 atoms in block 25
Block first atom: 350
Blocpdb> 16 atoms in block 26
Block first atom: 364
Blocpdb> 16 atoms in block 27
Block first atom: 380
Blocpdb> 9 atoms in block 28
Block first atom: 396
Blocpdb> 17 atoms in block 29
Block first atom: 405
Blocpdb> 14 atoms in block 30
Block first atom: 422
Blocpdb> 17 atoms in block 31
Block first atom: 436
Blocpdb> 15 atoms in block 32
Block first atom: 453
Blocpdb> 13 atoms in block 33
Block first atom: 468
Blocpdb> 15 atoms in block 34
Block first atom: 481
Blocpdb> 18 atoms in block 35
Block first atom: 496
Blocpdb> 19 atoms in block 36
Block first atom: 514
Blocpdb> 14 atoms in block 37
Block first atom: 533
Blocpdb> 17 atoms in block 38
Block first atom: 547
Blocpdb> 17 atoms in block 39
Block first atom: 564
Blocpdb> 12 atoms in block 40
Block first atom: 581
Blocpdb> 19 atoms in block 41
Block first atom: 593
Blocpdb> 16 atoms in block 42
Block first atom: 612
Blocpdb> 15 atoms in block 43
Block first atom: 628
Blocpdb> 18 atoms in block 44
Block first atom: 643
Blocpdb> 15 atoms in block 45
Block first atom: 661
Blocpdb> 16 atoms in block 46
Block first atom: 676
Blocpdb> 13 atoms in block 47
Block first atom: 692
Blocpdb> 13 atoms in block 48
Block first atom: 705
Blocpdb> 18 atoms in block 49
Block first atom: 718
Blocpdb> 9 atoms in block 50
Block first atom: 736
Blocpdb> 16 atoms in block 51
Block first atom: 745
Blocpdb> 15 atoms in block 52
Block first atom: 761
Blocpdb> 19 atoms in block 53
Block first atom: 776
Blocpdb> 17 atoms in block 54
Block first atom: 795
Blocpdb> 19 atoms in block 55
Block first atom: 812
Blocpdb> 14 atoms in block 56
Block first atom: 831
Blocpdb> 17 atoms in block 57
Block first atom: 845
Blocpdb> 16 atoms in block 58
Block first atom: 862
Blocpdb> 15 atoms in block 59
Block first atom: 878
Blocpdb> 19 atoms in block 60
Block first atom: 893
Blocpdb> 11 atoms in block 61
Block first atom: 912
Blocpdb> 22 atoms in block 62
Block first atom: 923
Blocpdb> 17 atoms in block 63
Block first atom: 945
Blocpdb> 12 atoms in block 64
Block first atom: 962
Blocpdb> 10 atoms in block 65
Block first atom: 974
Blocpdb> 18 atoms in block 66
Block first atom: 984
Blocpdb> 22 atoms in block 67
Block first atom: 1002
Blocpdb> 16 atoms in block 68
Block first atom: 1024
Blocpdb> 19 atoms in block 69
Block first atom: 1040
Blocpdb> 14 atoms in block 70
Block first atom: 1059
Blocpdb> 16 atoms in block 71
Block first atom: 1073
Blocpdb> 13 atoms in block 72
Block first atom: 1089
Blocpdb> 17 atoms in block 73
Block first atom: 1102
Blocpdb> 15 atoms in block 74
Block first atom: 1119
Blocpdb> 11 atoms in block 75
Block first atom: 1134
Blocpdb> 18 atoms in block 76
Block first atom: 1145
Blocpdb> 15 atoms in block 77
Block first atom: 1163
Blocpdb> 18 atoms in block 78
Block first atom: 1178
Blocpdb> 17 atoms in block 79
Block first atom: 1196
Blocpdb> 17 atoms in block 80
Block first atom: 1213
Blocpdb> 18 atoms in block 81
Block first atom: 1230
Blocpdb> 14 atoms in block 82
Block first atom: 1248
Blocpdb> 20 atoms in block 83
Block first atom: 1262
Blocpdb> 19 atoms in block 84
Block first atom: 1282
Blocpdb> 16 atoms in block 85
Block first atom: 1301
Blocpdb> 22 atoms in block 86
Block first atom: 1317
Blocpdb> 17 atoms in block 87
Block first atom: 1339
Blocpdb> 12 atoms in block 88
Block first atom: 1356
Blocpdb> 15 atoms in block 89
Block first atom: 1368
Blocpdb> 12 atoms in block 90
Block first atom: 1383
Blocpdb> 24 atoms in block 91
Block first atom: 1395
Blocpdb> 15 atoms in block 92
Block first atom: 1419
Blocpdb> 14 atoms in block 93
Block first atom: 1434
Blocpdb> 14 atoms in block 94
Block first atom: 1448
Blocpdb> 12 atoms in block 95
Block first atom: 1462
Blocpdb> 16 atoms in block 96
Block first atom: 1474
Blocpdb> 17 atoms in block 97
Block first atom: 1490
Blocpdb> 16 atoms in block 98
Block first atom: 1507
Blocpdb> 12 atoms in block 99
Block first atom: 1523
Blocpdb> 16 atoms in block 100
Block first atom: 1535
Blocpdb> 14 atoms in block 101
Block first atom: 1551
Blocpdb> 14 atoms in block 102
Block first atom: 1565
Blocpdb> 18 atoms in block 103
Block first atom: 1579
Blocpdb> 13 atoms in block 104
Block first atom: 1597
Blocpdb> 17 atoms in block 105
Block first atom: 1610
Blocpdb> 17 atoms in block 106
Block first atom: 1627
Blocpdb> 13 atoms in block 107
Block first atom: 1643
Blocpdb> 107 blocks.
Blocpdb> At most, 24 atoms in each of them.
Blocpdb> At least, 9 atoms in each of them.
Blocpdb> Normal end of Blocpdb.
Diagrtb> Memory allocation for Prepmat.
Diagrtb> Memory allocation for RTB.
Diagrtb> Memory allocation for Diagstd.
Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes.
Prepmat> Entering in.
Prepmat> Rewriting of the matrix begins.
Prepmat> 568074 matrix lines read.
Prepmat> Matrix order = 4968
Prepmat> Matrix trace = 1240280.0000
Prepmat> Last element read: 4968 4968 162.5408
Prepmat> 5779 lines saved.
Prepmat> 4788 empty lines.
Prepmat> Number of lines on output is as expected.
Prepmat> Normal end of Prepmat.
RTB> Entering in.
RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 1656
RTB> Total mass = 1656.0000
RTB> Number of atoms found in matrix: 1656
RTB> Number of blocks = 107
RTB> Projection begins.
RTB> Projected matrix is being saved.
RTB> Projected matrix trace = 132205.3694
RTB> 34035 non-zero elements.
RTB> Normal end of RTB.
Diagstd> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.sdijb
Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb
Diagstd> CERFACS matrix format.
Diagstd> Projected matrix order = 642
Diagstd> Nb of non-zero elements: 34035
Diagstd> Projected matrix trace = 132205.3694
Openam> file on opening on unit 11:
diagrtb_work.eigenfacs
Diagstd> Diagonalization.
Diagstd> 642 eigenvectors are computed.
Diagstd> 106 of them to be saved.
Diagstd> Sum of eigenvalues = 132205.3694
Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000
Diagstd> Selected eigenvalues:
0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000
0.0000000 0.2092890 0.5591227 1.1105656 2.0668288
2.5526653 4.1280909 4.7761257 6.2991301 7.4364505
9.7656739 10.2858097 11.7568218 12.2703862 12.9417862
13.6746431 14.8932537 16.5259989 18.3613424 19.4794351
20.0946235 21.3080909 21.8431422 23.1942845 24.6305602
24.9100783 26.7759118 26.9432102 27.7876119 28.8179820
29.7099374 30.2561050 31.6154360 33.0171193 33.9761390
35.4056470 36.3156280 37.3281870 37.6741057 38.6534396
39.6541229 41.1475473 43.2117448 44.2692232 45.0925772
46.3025363 47.9591316 48.7584834 49.4336247 49.9072151
50.5956689 51.0080475 52.4376792 52.7115952 53.3511230
54.4790389 54.9627169 56.2541553 57.0931956 57.7567711
58.4553940 59.7021720 60.2136969 60.8402802 62.1200777
62.5285325 63.1075751 64.6325284 65.4119684 66.4924346
67.0685167 69.4051240 69.9945582 70.2281656 70.7756371
71.8656432 73.0184154 73.8708226 74.1001609 74.5747102
75.0807170 76.1825532 77.0548608 77.5591145 78.4781297
79.0221743 79.6823242 80.4187994 80.7375287 81.1082174
81.4407712 82.0359374 83.1239895 84.6164676 84.8531571
85.2653647 87.1392700 87.6174376 88.3286085 88.7186166
88.9571797
Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units):
0.0034313 0.0034323 0.0034330 0.0034341 0.0034342
0.0034349 49.6784956 81.1986557 114.4372423 156.1160406
173.4971007 220.6327132 237.3193521 272.5433378 296.1270816
339.3488558 348.2687634 372.3404750 380.3858870 390.6541037
401.5626214 419.0733794 441.4475796 465.3154743 479.2735477
486.7827920 501.2651944 507.5196207 522.9808303 538.9300816
541.9794586 561.9108451 563.6635481 572.4280317 582.9443038
591.8970132 597.3127558 610.5832247 623.9716670 632.9687842
646.1473204 654.3981453 663.4584490 666.5254801 675.1330257
683.8163089 696.5739950 713.8322770 722.5139403 729.2019293
738.9204236 752.0226747 758.2638904 763.4955466 767.1440984
772.4172271 775.5586214 786.3520285 788.4031667 793.1714308
801.5119446 805.0620905 814.4652967 820.5167599 825.2712832
830.2474994 839.0548382 842.6416589 847.0145741 855.8768417
858.6860319 862.6527807 873.0132859 878.2615898 885.4853855
889.3129795 904.6717885 908.5052025 910.0200115 913.5602062
920.5681365 927.9220233 933.3225262 934.7701934 937.7586253
940.9347023 947.8138318 953.2247285 956.3386352 961.9878847
965.3165853 969.3403184 973.8096475 975.7375225 977.9748998
979.9777582 983.5520611 990.0530583 998.9016392 1000.2977295
1002.7244561 1013.6831769 1016.4606121 1020.5774654 1022.8281234
1024.2023857
Diagstd> Normal end.
Rtb_to_modes> Entering in.
Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 1656
Rtb_to_modes> Number of blocs = 107
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 11:
matrix.eigenrtb
Rdmodfacs> Entering in.
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Eigenvector number: 1
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9845E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 2
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9901E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 3
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9945E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 4
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0001E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 5
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0002E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 6
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0005E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 7
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.2093
Rdmodfacs> Eigenvector number: 8
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.5591
Rdmodfacs> Eigenvector number: 9
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.111
Rdmodfacs> Eigenvector number: 10
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.067
Rdmodfacs> Eigenvector number: 11
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.553
Rdmodfacs> Eigenvector number: 12
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.128
Rdmodfacs> Eigenvector number: 13
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.776
Rdmodfacs> Eigenvector number: 14
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.299
Rdmodfacs> Eigenvector number: 15
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.436
Rdmodfacs> Eigenvector number: 16
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.766
Rdmodfacs> Eigenvector number: 17
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.29
Rdmodfacs> Eigenvector number: 18
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.76
Rdmodfacs> Eigenvector number: 19
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.27
Rdmodfacs> Eigenvector number: 20
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.94
Rdmodfacs> Eigenvector number: 21
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.67
Rdmodfacs> Eigenvector number: 22
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.89
Rdmodfacs> Eigenvector number: 23
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.53
Rdmodfacs> Eigenvector number: 24
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.36
Rdmodfacs> Eigenvector number: 25
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.48
Rdmodfacs> Eigenvector number: 26
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 27
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.31
Rdmodfacs> Eigenvector number: 28
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.84
Rdmodfacs> Eigenvector number: 29
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.19
Rdmodfacs> Eigenvector number: 30
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.63
Rdmodfacs> Eigenvector number: 31
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.91
Rdmodfacs> Eigenvector number: 32
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.78
Rdmodfacs> Eigenvector number: 33
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.94
Rdmodfacs> Eigenvector number: 34
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.79
Rdmodfacs> Eigenvector number: 35
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.82
Rdmodfacs> Eigenvector number: 36
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.71
Rdmodfacs> Eigenvector number: 37
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.26
Rdmodfacs> Eigenvector number: 38
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.62
Rdmodfacs> Eigenvector number: 39
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.02
Rdmodfacs> Eigenvector number: 40
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.98
Rdmodfacs> Eigenvector number: 41
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.41
Rdmodfacs> Eigenvector number: 42
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.32
Rdmodfacs> Eigenvector number: 43
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.33
Rdmodfacs> Eigenvector number: 44
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.67
Rdmodfacs> Eigenvector number: 45
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.65
Rdmodfacs> Eigenvector number: 46
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.65
Rdmodfacs> Eigenvector number: 47
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.15
Rdmodfacs> Eigenvector number: 48
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.21
Rdmodfacs> Eigenvector number: 49
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.27
Rdmodfacs> Eigenvector number: 50
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 51
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.30
Rdmodfacs> Eigenvector number: 52
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 47.96
Rdmodfacs> Eigenvector number: 53
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 48.76
Rdmodfacs> Eigenvector number: 54
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 49.43
Rdmodfacs> Eigenvector number: 55
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 49.91
Rdmodfacs> Eigenvector number: 56
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 50.60
Rdmodfacs> Eigenvector number: 57
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 51.01
Rdmodfacs> Eigenvector number: 58
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 52.44
Rdmodfacs> Eigenvector number: 59
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 52.71
Rdmodfacs> Eigenvector number: 60
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 53.35
Rdmodfacs> Eigenvector number: 61
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 54.48
Rdmodfacs> Eigenvector number: 62
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 54.96
Rdmodfacs> Eigenvector number: 63
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 56.25
Rdmodfacs> Eigenvector number: 64
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 57.09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 65
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 57.76
Rdmodfacs> Eigenvector number: 66
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 58.46
Rdmodfacs> Eigenvector number: 67
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 59.70
Rdmodfacs> Eigenvector number: 68
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 60.21
Rdmodfacs> Eigenvector number: 69
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 60.84
Rdmodfacs> Eigenvector number: 70
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 62.12
Rdmodfacs> Eigenvector number: 71
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 62.53
Rdmodfacs> Eigenvector number: 72
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 63.11
Rdmodfacs> Eigenvector number: 73
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 64.63
Rdmodfacs> Eigenvector number: 74
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 65.41
Rdmodfacs> Eigenvector number: 75
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 66.49
Rdmodfacs> Eigenvector number: 76
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 67.07
Rdmodfacs> Eigenvector number: 77
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 69.41
Rdmodfacs> Eigenvector number: 78
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 69.99
Rdmodfacs> Eigenvector number: 79
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 70.23
Rdmodfacs> Eigenvector number: 80
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 70.78
Rdmodfacs> Eigenvector number: 81
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 71.87
Rdmodfacs> Eigenvector number: 82
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 73.02
Rdmodfacs> Eigenvector number: 83
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 73.87
Rdmodfacs> Eigenvector number: 84
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 74.10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 85
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 74.57
Rdmodfacs> Eigenvector number: 86
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 75.08
Rdmodfacs> Eigenvector number: 87
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 76.18
Rdmodfacs> Eigenvector number: 88
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 77.05
Rdmodfacs> Eigenvector number: 89
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 77.56
Rdmodfacs> Eigenvector number: 90
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 78.48
Rdmodfacs> Eigenvector number: 91
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 79.02
Rdmodfacs> Eigenvector number: 92
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 79.68
Rdmodfacs> Eigenvector number: 93
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 80.42
Rdmodfacs> Eigenvector number: 94
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 80.74
Rdmodfacs> Eigenvector number: 95
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 81.11
Rdmodfacs> Eigenvector number: 96
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 81.44
Rdmodfacs> Eigenvector number: 97
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 82.04
Rdmodfacs> Eigenvector number: 98
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 83.12
Rdmodfacs> Eigenvector number: 99
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 84.62
Rdmodfacs> Eigenvector number: 100
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 84.85
Rdmodfacs> Eigenvector number: 101
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 85.27
Rdmodfacs> Eigenvector number: 102
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 87.14
Rdmodfacs> Eigenvector number: 103
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 87.62
Rdmodfacs> Eigenvector number: 104
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 88.33
Rdmodfacs> Eigenvector number: 105
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 88.72
Rdmodfacs> Eigenvector number: 106
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 88.96
Rtb_to_modes> 106 vectors, with 642 coordinates in vector file.
Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected):
1.00004 0.99999 0.99999 0.99999 1.00002
1.00000 1.00003 1.00006 1.00002 0.99999
0.99997 0.99998 1.00004 1.00000 1.00001
0.99999 0.99997 1.00001 0.99999 0.99997
0.99998 1.00002 0.99999 0.99998 0.99999
1.00001 1.00003 1.00003 1.00000 0.99999
0.99996 0.99999 1.00002 1.00001 1.00000
1.00001 0.99997 0.99997 1.00000 1.00000
1.00001 1.00000 0.99999 1.00001 1.00003
0.99998 1.00000 1.00000 1.00001 1.00001
1.00003 0.99997 1.00000 1.00001 0.99997
0.99996 1.00002 1.00002 1.00002 1.00001
1.00002 1.00002 0.99999 1.00000 1.00001
1.00000 0.99996 0.99998 1.00001 0.99999
1.00000 1.00002 0.99999 1.00001 1.00005
1.00001 1.00001 1.00000 0.99998 1.00002
1.00000 1.00001 1.00000 0.99998 0.99999
1.00001 1.00003 1.00000 1.00001 1.00003
1.00001 1.00002 1.00000 0.99998 1.00001
1.00001 1.00001 0.99999 0.99999 1.00000
1.00002 1.00002 1.00001 1.00002 0.99999
1.00002
Rtb_to_modes> RTB block-file is being read.
Rtb_to_modes> 29808 lines found in RTB file.
Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected):
1.00004 0.99999 0.99999 0.99999 1.00002
1.00000 1.00003 1.00006 1.00002 0.99999
0.99997 0.99998 1.00004 1.00000 1.00001
0.99999 0.99997 1.00001 0.99999 0.99997
0.99998 1.00002 0.99999 0.99998 0.99999
1.00001 1.00003 1.00003 1.00000 0.99999
0.99996 0.99999 1.00002 1.00001 1.00000
1.00001 0.99997 0.99997 1.00000 1.00000
1.00001 1.00000 0.99999 1.00001 1.00003
0.99998 1.00000 1.00000 1.00001 1.00001
1.00003 0.99997 1.00000 1.00001 0.99997
0.99996 1.00002 1.00002 1.00002 1.00001
1.00002 1.00002 0.99999 1.00000 1.00001
1.00000 0.99996 0.99998 1.00001 0.99999
1.00000 1.00002 0.99999 1.00001 1.00005
1.00001 1.00001 1.00000 0.99998 1.00002
1.00000 1.00001 1.00000 0.99998 0.99999
1.00001 1.00003 1.00000 1.00001 1.00003
1.00001 1.00002 1.00000 0.99998 1.00001
1.00001 1.00001 0.99999 0.99999 1.00000
1.00002 1.00002 1.00001 1.00002 0.99999
1.00002
Orthogonality of first eigenvectors (zero expected):
Vector 2: 0.000
Vector 3:-0.000 0.000
Vector 4:-0.000-0.000 0.000
Vector 5: 0.000-0.000 0.000 0.000
Vector 6:-0.000-0.000-0.000-0.000-0.000
Vector 7:-0.000-0.000 0.000 0.000-0.000 0.000
Vector 8:-0.000-0.000-0.000 0.000 0.000-0.000 0.000
Vector 9: 0.000-0.000-0.000-0.000 0.000-0.000 0.000 0.000
Vector 10:-0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved.
Rtb_to_modes> Normal end.
Diagrtb> Normal end.
B-factor analysis
Bfactors> Version 1.22, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 2602180606493168039.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
2602180606493168039.eigenfacs
Getnam> Corresponding pdb filename ?
Getnam> 2602180606493168039.atom
Openam> file on opening on unit 11:
2602180606493168039.atom
Getnum> Number of skipped eigenvectors ?
Getnum> 0
Getnum> Number of usefull eigenvectors ?
Getnum> 10000
%Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 214
First residue number = 1
Last residue number = 214
Number of atoms found = 1656
Mean number per residue = 7.7
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9845E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9901E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9945E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0001E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0002E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0005E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.2093
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.5591
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.111
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.067
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.553
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.128
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.776
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.299
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.436
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.766
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.29
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.76
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.27
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.94
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.67
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.89
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.53
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.36
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.48
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.31
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.84
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.19
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.63
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.91
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.78
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.94
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.79
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.82
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.71
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.26
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.62
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.02
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.98
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.41
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.32
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.33
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.67
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.65
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.65
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.15
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.21
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.27
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.30
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.96
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.76
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.43
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.91
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 50.60
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 51.01
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 52.44
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 52.71
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 53.35
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 54.48
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 54.96
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 56.25
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 57.09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 57.76
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 58.46
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 59.70
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 60.21
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 60.84
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 62.12
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 62.53
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 63.11
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 64.63
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 65.41
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 66.49
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 67.07
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 69.41
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 69.99
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 70.23
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 70.78
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 71.87
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 73.02
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 73.87
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 74.10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 74.57
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 75.08
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 76.18
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 77.05
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 77.56
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 78.48
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 79.02
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 79.68
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 80.42
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 80.74
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 81.11
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 81.44
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 82.04
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 83.12
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 84.62
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 84.85
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 85.27
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 87.14
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 87.62
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 88.33
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 88.72
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 88.96
Bfactors> 106 vectors, 4968 coordinates in file.
Openam> file on opening on unit 12:
bfactors.pred
Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000
Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 0.209300
Bfactors> 100 eigenvectors will be considered.
Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped.
Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed.
(CHARMM units assumed for eigenvalues)
Bfactors> Correlation= 0.794 for 214 C-alpha atoms.
Bfactors> = 0.102 +/- 0.11
Bfactors> = 38.071 +/- 19.20
Bfactors> Shiftng-fct= 37.969
Bfactors> Scaling-fct= 178.954
Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved.
Bfactors> Normal end.
check_modes
Chkmod> Version 1.00, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 2602180606493168039.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
2602180606493168039.eigenfacs
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4312E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4321E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4329E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4340E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4342E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4347E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 49.68
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 81.19
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 114.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 156.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 173.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 220.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 237.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 272.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 296.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 339.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 348.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 372.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 380.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 390.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 401.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 419.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 441.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 465.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 479.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 486.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 501.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 507.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 522.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 538.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 542.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 561.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 563.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 572.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 582.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 591.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 597.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 610.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 624.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 633.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 646.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 654.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 663.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 666.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 675.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 683.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 696.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 713.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 722.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 729.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 738.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 752.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 758.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 763.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 767.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 772.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 775.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 786.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 788.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 793.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 801.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 805.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 814.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 820.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 825.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 830.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 839.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 842.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 847.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 855.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 858.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 862.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 873.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 878.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 885.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 889.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 904.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 908.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 910.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 913.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 920.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 927.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 933.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 934.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 937.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 940.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 947.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 953.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 956.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 962.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 965.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 969.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 973.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 975.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 977.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 979.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 983.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 990.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 998.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1000.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1003.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1014.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1016.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1021.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1023.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1024.
Chkmod> 106 vectors, 4968 coordinates in file.
Chkmod> That is: 1656 cartesian points.
Openam> file on opening on unit 11:
Chkmod.res
Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file.
%Chkmod-Wn> Norm of vector 8 is: 1.0001 (instead of 1.0000).
Chkmod> Normal end.
0.0034 0.7898
0.0034 0.8083
0.0034 0.8503
0.0034 0.8945
0.0034 0.7042
0.0034 0.8123
49.6777 0.4817
81.1935 0.5358
114.4547 0.4091
156.1158 0.4934
173.5010 0.4909
220.6208 0.6116
237.3060 0.2684
272.5288 0.7326
296.1054 0.5876
339.3400 0.4697
348.3247 0.4246
372.3748 0.4667
380.3636 0.5966
390.6104 0.4410
401.4772 0.3301
419.0096 0.6641
441.4821 0.5359
465.2785 0.5242
479.2599 0.6513
486.7059 0.6345
501.2661 0.5640
507.4613 0.2748
522.9101 0.3268
538.9008 0.6112
541.9553 0.3232
561.9296 0.4264
563.6058 0.4071
572.4281 0.3349
582.9397 0.5057
591.8722 0.5426
597.3256 0.2596
610.6011 0.4913
623.9721 0.3818
632.9776 0.3834
646.1593 0.5627
654.4094 0.5185
663.4461 0.3438
666.4605 0.3320
675.0740 0.4320
683.7514 0.5376
696.5649 0.5130
713.7872 0.3774
722.4893 0.3208
729.1498 0.6346
738.8685 0.4677
751.9972 0.4764
758.2431 0.5376
763.4348 0.4501
767.1326 0.4415
772.4171 0.4957
775.5402 0.6369
786.3357 0.3581
788.3574 0.4265
793.1290 0.4096
801.4846 0.3737
805.0076 0.3413
814.4003 0.5428
820.4586 0.4231
825.2589 0.3537
830.2446 0.4279
839.0036 0.4941
842.5796 0.5738
846.9763 0.5768
855.8396 0.5524
858.6592 0.3325
862.6323 0.4091
872.9587 0.4173
878.2107 0.4058
885.4312 0.3986
889.2846 0.4798
904.6647 0.5864
908.4366 0.4110
909.9928 0.3103
913.5491 0.5421
920.5565 0.3985
927.8923 0.5419
933.2773 0.4763
934.7291 0.4940
937.6888 0.5285
940.8898 0.3990
947.7573 0.4942
953.1537 0.4667
956.3030 0.4599
961.9581 0.4017
965.2619 0.5243
969.2846 0.2952
973.7751 0.3402
975.7106 0.4717
977.9437 0.5317
979.9311 0.4500
983.5342 0.4764
989.9868 0.2831
998.8796 0.6291
1000.2362 0.4001
1002.7087 0.5406
1013.6439 0.3680
1016.4318 0.5597
1020.5417 0.4526
1022.7922 0.5261
1024.1747 0.4879
Project conformational change on normal modes:
Projmod> Version 1.36, April 2003.
Projmod> Projection of a difference vector on a set of eigenvectors.
Getnam> CERFACS file with the eigenvectors ?
Getnam> 2602180606493168039.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
2602180606493168039.eigenfacs
Getnam> Pdb file with the reference structure ?
Getnam> 2602180606493168039.atom
Openam> file on opening on unit 11:
2602180606493168039.atom
Getnam> Pdb file with the other conformer ?
Getnam> 2602180606493168039.atom2
Openam> file on opening on unit 12:
2602180606493168039.atom2
Getrep> Are the masses given in the pdb file ? (y/n)
Getrep> F
Projmod> All masses will all be assumed to be of 1.
Getrep> Displacement along one mode ? (y/n)
Getrep> F
Openam> file on opening on unit 13:
projmod.res
Openam> file on opening on unit 14:
dr.res
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4312E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4321E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4329E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4340E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4342E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4347E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 49.68
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 81.19
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 114.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 156.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 173.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 220.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 237.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 272.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 296.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 339.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 348.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 372.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 380.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 390.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 401.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 419.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 441.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 465.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 479.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 486.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 501.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 507.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 522.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 538.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 542.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 561.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 563.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 572.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 582.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 591.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 597.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 610.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 624.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 633.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 646.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 654.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 663.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 666.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 675.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 683.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 696.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 713.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 722.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 729.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 738.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 752.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 758.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 763.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 767.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 772.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 775.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 786.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 788.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 793.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 801.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 805.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 814.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 820.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 825.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 830.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 839.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 842.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 847.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 855.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 858.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 862.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 873.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 878.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 885.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 889.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 904.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 908.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 910.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 913.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 920.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 927.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 933.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 934.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 937.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 940.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 947.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 953.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 956.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 962.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 965.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 969.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 973.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 975.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 977.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 979.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 983.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 990.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 998.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1000.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1003.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1014.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1016.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1021.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1023.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1024.
Projmod> 106 vectors, 4968 coordinates in file.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 214
First residue number = 1
Last residue number = 214
Number of atoms found = 1656
Mean number per residue = 7.7
Projmod> Cartesian (eigen)vectors will be studied.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 214
First residue number = 1
Last residue number = 214
Number of atoms found = 1656
Mean number per residue = 7.7
Projmod> File dr.res: displacement=f(atom number).
Projmod> 1656 atoms are considered.
Projmod> Atomic r.m.s. displacements= 7.19
Projmod> Atomic average masses = 1.00 +/- 0.00
Projmod> File projmod.res: dr.vector=f(fqcy), and cumulative square sum.
Vector: 1 F= 0.00 Cos= 0.000 Sum= 0.000 q= 0.0077
Vector: 2 F= 0.00 Cos= -0.000 Sum= 0.000 q= -0.0010
Vector: 3 F= 0.00 Cos= -0.000 Sum= 0.000 q= -0.0006
Vector: 4 F= 0.00 Cos= -0.000 Sum= 0.000 q= -0.0007
Vector: 5 F= 0.00 Cos= 0.000 Sum= 0.000 q= 0.0044
Vector: 6 F= 0.00 Cos= -0.000 Sum= 0.000 q= -0.0018
Vector: 7 F= 49.68 Cos= -0.830 Sum= 0.689 q= -242.9716
%Projmod-Wn> Eigenvector 8 Norm= 1.0001
Vector: 8 F= 81.19 Cos= -0.255 Sum= 0.754 q= -74.5527
Vector: 9 F= 114.45 Cos= 0.147 Sum= 0.775 q= 42.9528
Vector: 10 F= 156.12 Cos= 0.069 Sum= 0.780 q= 20.1765
Vector: 11 F= 173.50 Cos= -0.317 Sum= 0.881 q= -92.8731
Vector: 12 F= 220.62 Cos= -0.061 Sum= 0.884 q= -17.7888
Vector: 13 F= 237.31 Cos= 0.037 Sum= 0.886 q= 10.6874
Vector: 14 F= 272.53 Cos= 0.018 Sum= 0.886 q= 5.2720
Vector: 15 F= 296.11 Cos= -0.184 Sum= 0.920 q= -53.9543
Vector: 16 F= 339.34 Cos= 0.004 Sum= 0.920 q= 1.2051
Vector: 17 F= 348.32 Cos= 0.012 Sum= 0.920 q= 3.4417
Vector: 18 F= 372.37 Cos= 0.034 Sum= 0.921 q= 9.9107
Vector: 19 F= 380.36 Cos= -0.015 Sum= 0.922 q= -4.5295
Vector: 20 F= 390.61 Cos= -0.068 Sum= 0.926 q= -19.9724
Vector: 21 F= 401.48 Cos= 0.039 Sum= 0.928 q= 11.4083
Vector: 22 F= 419.01 Cos= -0.012 Sum= 0.928 q= -3.5303
Vector: 23 F= 441.48 Cos= -0.015 Sum= 0.928 q= -4.5371
Vector: 24 F= 465.28 Cos= 0.003 Sum= 0.928 q= 0.9952
Vector: 25 F= 479.26 Cos= 0.008 Sum= 0.928 q= 2.3403
Vector: 26 F= 486.71 Cos= -0.052 Sum= 0.931 q= -15.1848
Vector: 27 F= 501.27 Cos= -0.008 Sum= 0.931 q= -2.2604
Vector: 28 F= 507.46 Cos= -0.003 Sum= 0.931 q= -0.9866
Vector: 29 F= 522.91 Cos= 0.002 Sum= 0.931 q= 0.4537
Vector: 30 F= 538.90 Cos= 0.021 Sum= 0.931 q= 6.1101
Vector: 31 F= 541.96 Cos= 0.043 Sum= 0.933 q= 12.5945
Vector: 32 F= 561.93 Cos= 0.003 Sum= 0.933 q= 0.9321
Vector: 33 F= 563.61 Cos= -0.001 Sum= 0.933 q= -0.2312
Vector: 34 F= 572.43 Cos= 0.002 Sum= 0.933 q= 0.6201
Vector: 35 F= 582.94 Cos= -0.030 Sum= 0.934 q= -8.7965
Vector: 36 F= 591.87 Cos= -0.043 Sum= 0.936 q= -12.5730
Vector: 37 F= 597.33 Cos= -0.024 Sum= 0.937 q= -7.0631
Vector: 38 F= 610.60 Cos= 0.059 Sum= 0.940 q= 17.3763
Vector: 39 F= 623.97 Cos= -0.003 Sum= 0.940 q= -0.8682
Vector: 40 F= 632.98 Cos= 0.013 Sum= 0.940 q= 3.7250
Vector: 41 F= 646.16 Cos= -0.014 Sum= 0.940 q= -4.0530
Vector: 42 F= 654.41 Cos= 0.018 Sum= 0.941 q= 5.4055
Vector: 43 F= 663.45 Cos= 0.013 Sum= 0.941 q= 3.7689
Vector: 44 F= 666.46 Cos= 0.040 Sum= 0.943 q= 11.6603
Vector: 45 F= 675.07 Cos= 0.019 Sum= 0.943 q= 5.6119
Vector: 46 F= 683.75 Cos= 0.008 Sum= 0.943 q= 2.4842
Vector: 47 F= 696.56 Cos= -0.007 Sum= 0.943 q= -2.1829
Vector: 48 F= 713.79 Cos= -0.019 Sum= 0.943 q= -5.5774
Vector: 49 F= 722.49 Cos= -0.006 Sum= 0.943 q= -1.7410
Vector: 50 F= 729.15 Cos= -0.002 Sum= 0.943 q= -0.4837
Vector: 51 F= 738.87 Cos= -0.007 Sum= 0.943 q= -1.9962
Vector: 52 F= 752.00 Cos= -0.007 Sum= 0.944 q= -1.9484
Vector: 53 F= 758.24 Cos= -0.017 Sum= 0.944 q= -5.0859
Vector: 54 F= 763.43 Cos= 0.011 Sum= 0.944 q= 3.3297
Vector: 55 F= 767.13 Cos= -0.015 Sum= 0.944 q= -4.4164
Vector: 56 F= 772.42 Cos= -0.014 Sum= 0.944 q= -3.9589
Vector: 57 F= 775.54 Cos= 0.017 Sum= 0.945 q= 4.9421
Vector: 58 F= 786.34 Cos= 0.017 Sum= 0.945 q= 4.9273
Vector: 59 F= 788.36 Cos= 0.008 Sum= 0.945 q= 2.3757
Vector: 60 F= 793.13 Cos= 0.006 Sum= 0.945 q= 1.9011
Vector: 61 F= 801.48 Cos= 0.015 Sum= 0.945 q= 4.4118
Vector: 62 F= 805.01 Cos= 0.003 Sum= 0.945 q= 1.0244
Vector: 63 F= 814.40 Cos= -0.027 Sum= 0.946 q= -8.0292
Vector: 64 F= 820.46 Cos= 0.009 Sum= 0.946 q= 2.5278
Vector: 65 F= 825.26 Cos= 0.011 Sum= 0.946 q= 3.0747
Vector: 66 F= 830.24 Cos= -0.008 Sum= 0.946 q= -2.3522
Vector: 67 F= 839.00 Cos= -0.037 Sum= 0.948 q= -10.6901
Vector: 68 F= 842.58 Cos= -0.015 Sum= 0.948 q= -4.5075
Vector: 69 F= 846.98 Cos= -0.018 Sum= 0.948 q= -5.3649
Vector: 70 F= 855.84 Cos= -0.020 Sum= 0.949 q= -5.8173
Vector: 71 F= 858.66 Cos= -0.009 Sum= 0.949 q= -2.5191
Vector: 72 F= 862.63 Cos= 0.024 Sum= 0.949 q= 7.1170
Vector: 73 F= 872.96 Cos= -0.005 Sum= 0.949 q= -1.5909
Vector: 74 F= 878.21 Cos= 0.012 Sum= 0.949 q= 3.5268
Vector: 75 F= 885.43 Cos= -0.008 Sum= 0.949 q= -2.2449
Vector: 76 F= 889.28 Cos= -0.028 Sum= 0.950 q= -8.1041
Vector: 77 F= 904.66 Cos= 0.002 Sum= 0.950 q= 0.6865
Vector: 78 F= 908.44 Cos= -0.009 Sum= 0.950 q= -2.5676
Vector: 79 F= 909.99 Cos= -0.013 Sum= 0.951 q= -3.8900
Vector: 80 F= 913.55 Cos= -0.013 Sum= 0.951 q= -3.9102
Vector: 81 F= 920.56 Cos= 0.025 Sum= 0.951 q= 7.1829
Vector: 82 F= 927.89 Cos= -0.011 Sum= 0.951 q= -3.1727
Vector: 83 F= 933.28 Cos= 0.005 Sum= 0.951 q= 1.3715
Vector: 84 F= 934.73 Cos= -0.003 Sum= 0.951 q= -0.7328
Vector: 85 F= 937.69 Cos= -0.002 Sum= 0.951 q= -0.5904
Vector: 86 F= 940.89 Cos= -0.009 Sum= 0.952 q= -2.5838
Vector: 87 F= 947.76 Cos= -0.022 Sum= 0.952 q= -6.4314
Vector: 88 F= 953.15 Cos= -0.005 Sum= 0.952 q= -1.4664
Vector: 89 F= 956.30 Cos= 0.009 Sum= 0.952 q= 2.4894
Vector: 90 F= 961.96 Cos= 0.011 Sum= 0.952 q= 3.2280
Vector: 91 F= 965.26 Cos= -0.002 Sum= 0.952 q= -0.5130
Vector: 92 F= 969.28 Cos= 0.030 Sum= 0.953 q= 8.8415
Vector: 93 F= 973.78 Cos= 0.014 Sum= 0.953 q= 4.0778
Vector: 94 F= 975.71 Cos= 0.024 Sum= 0.954 q= 6.8844
Vector: 95 F= 977.94 Cos= 0.004 Sum= 0.954 q= 1.0663
Vector: 96 F= 979.93 Cos= 0.010 Sum= 0.954 q= 2.8731
Vector: 97 F= 983.53 Cos= -0.021 Sum= 0.954 q= -6.2754
Vector: 98 F= 989.99 Cos= 0.023 Sum= 0.955 q= 6.8218
Vector: 99 F= 998.88 Cos= 0.004 Sum= 0.955 q= 1.1638
Vector: 100 F= 1000.24 Cos= -0.001 Sum= 0.955 q= -0.1744
Vector: 101 F= 1002.71 Cos= 0.008 Sum= 0.955 q= 2.4660
Vector: 102 F= 1013.64 Cos= 0.002 Sum= 0.955 q= 0.6970
Vector: 103 F= 1016.43 Cos= 0.010 Sum= 0.955 q= 2.8610
Vector: 104 F= 1020.54 Cos= -0.010 Sum= 0.955 q= -2.8190
Vector: 105 F= 1022.79 Cos= -0.000 Sum= 0.955 q= -0.1443
Vector: 106 F= 1024.17 Cos= 0.002 Sum= 0.955 q= 0.6812
Projmod> Best zero-frequency found : 0.003431
Projmod> 6 frequencies less than: 0.003435
Projmod> Lowest non-zero frequency : 49.677674
Projmod> Best overlap with diff.vect. = -0.83 for mode 7 with F= 49.68 cm-1.
Projmod> 1-3-6-9-12-all-best contrb. = 0.689 0.854 0.915 0.927 0.933 0.955
Projmod> Normal end.
getting mode 7
running: ../../bin/get_modes.sh 2602180606493168039 7 -100 100 20 on on
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 7
calculating perturbed structure for DQ=-100
2602180606493168039.eigenfacs
2602180606493168039.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2602180606493168039.eigenfacs
2602180606493168039.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2602180606493168039.eigenfacs
2602180606493168039.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2602180606493168039.eigenfacs
2602180606493168039.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2602180606493168039.eigenfacs
2602180606493168039.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2602180606493168039.eigenfacs
2602180606493168039.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2602180606493168039.eigenfacs
2602180606493168039.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2602180606493168039.eigenfacs
2602180606493168039.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2602180606493168039.eigenfacs
2602180606493168039.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2602180606493168039.eigenfacs
2602180606493168039.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2602180606493168039.eigenfacs
2602180606493168039.atom
making animated gifs
11 models are in 2602180606493168039.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2602180606493168039.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2602180606493168039.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
compute RMSD to second conformer
MODEL 1 MODE=7 DQ=-100 214 5.231 142 1.460
MODEL 2 MODE=7 DQ=-80 214 5.577 137 1.422
MODEL 3 MODE=7 DQ=-60 214 5.943 135 1.421
MODEL 4 MODE=7 DQ=-40 214 6.326 133 1.408
MODEL 5 MODE=7 DQ=-20 214 6.722 130 1.383
MODEL 6 MODE=7 DQ=0 214 7.131 128 1.353
MODEL 7 MODE=7 DQ=20 214 7.548 128 1.373
MODEL 8 MODE=7 DQ=40 214 7.974 126 1.353
MODEL 9 MODE=7 DQ=60 214 8.407 126 1.380
MODEL 10 MODE=7 DQ=80 214 8.846 125 1.397
MODEL 11 MODE=7 DQ=100 214 9.290 123 1.375
getting mode 8
running: ../../bin/get_modes.sh 2602180606493168039 8 -100 100 20 on on
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 8
calculating perturbed structure for DQ=-100
2602180606493168039.eigenfacs
2602180606493168039.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2602180606493168039.eigenfacs
2602180606493168039.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2602180606493168039.eigenfacs
2602180606493168039.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2602180606493168039.eigenfacs
2602180606493168039.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2602180606493168039.eigenfacs
2602180606493168039.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2602180606493168039.eigenfacs
2602180606493168039.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2602180606493168039.eigenfacs
2602180606493168039.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2602180606493168039.eigenfacs
2602180606493168039.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2602180606493168039.eigenfacs
2602180606493168039.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2602180606493168039.eigenfacs
2602180606493168039.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2602180606493168039.eigenfacs
2602180606493168039.atom
making animated gifs
11 models are in 2602180606493168039.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2602180606493168039.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2602180606493168039.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
compute RMSD to second conformer
MODEL 1 MODE=8 DQ=-100 214 6.940 130 1.387
MODEL 2 MODE=8 DQ=-80 214 6.914 129 1.352
MODEL 3 MODE=8 DQ=-60 214 6.920 127 1.311
MODEL 4 MODE=8 DQ=-40 214 6.959 128 1.329
MODEL 5 MODE=8 DQ=-20 214 7.030 126 1.301
MODEL 6 MODE=8 DQ=0 214 7.131 128 1.353
MODEL 7 MODE=8 DQ=20 214 7.261 128 1.370
MODEL 8 MODE=8 DQ=40 214 7.420 131 1.450
MODEL 9 MODE=8 DQ=60 214 7.604 130 1.433
MODEL 10 MODE=8 DQ=80 214 7.813 131 1.512
MODEL 11 MODE=8 DQ=100 214 8.043 131 1.470
getting mode 9
running: ../../bin/get_modes.sh 2602180606493168039 9 -100 100 20 on on
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 9
calculating perturbed structure for DQ=-100
2602180606493168039.eigenfacs
2602180606493168039.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2602180606493168039.eigenfacs
2602180606493168039.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2602180606493168039.eigenfacs
2602180606493168039.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2602180606493168039.eigenfacs
2602180606493168039.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2602180606493168039.eigenfacs
2602180606493168039.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2602180606493168039.eigenfacs
2602180606493168039.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2602180606493168039.eigenfacs
2602180606493168039.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2602180606493168039.eigenfacs
2602180606493168039.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2602180606493168039.eigenfacs
2602180606493168039.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2602180606493168039.eigenfacs
2602180606493168039.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2602180606493168039.eigenfacs
2602180606493168039.atom
making animated gifs
11 models are in 2602180606493168039.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2602180606493168039.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2602180606493168039.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
compute RMSD to second conformer
MODEL 1 MODE=9 DQ=-100 214 7.861 114 1.358
MODEL 2 MODE=9 DQ=-80 214 7.662 119 1.366
MODEL 3 MODE=9 DQ=-60 214 7.488 121 1.362
MODEL 4 MODE=9 DQ=-40 214 7.340 122 1.332
MODEL 5 MODE=9 DQ=-20 214 7.221 125 1.347
MODEL 6 MODE=9 DQ=0 214 7.131 128 1.353
MODEL 7 MODE=9 DQ=20 214 7.071 133 1.389
MODEL 8 MODE=9 DQ=40 214 7.043 136 1.383
MODEL 9 MODE=9 DQ=60 214 7.047 139 1.373
MODEL 10 MODE=9 DQ=80 214 7.083 143 1.404
MODEL 11 MODE=9 DQ=100 214 7.150 148 1.453
getting mode 10
running: ../../bin/get_modes.sh 2602180606493168039 10 -100 100 20 on on
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 10
calculating perturbed structure for DQ=-100
2602180606493168039.eigenfacs
2602180606493168039.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2602180606493168039.eigenfacs
2602180606493168039.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2602180606493168039.eigenfacs
2602180606493168039.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2602180606493168039.eigenfacs
2602180606493168039.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2602180606493168039.eigenfacs
2602180606493168039.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2602180606493168039.eigenfacs
2602180606493168039.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2602180606493168039.eigenfacs
2602180606493168039.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2602180606493168039.eigenfacs
2602180606493168039.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2602180606493168039.eigenfacs
2602180606493168039.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2602180606493168039.eigenfacs
2602180606493168039.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2602180606493168039.eigenfacs
2602180606493168039.atom
making animated gifs
11 models are in 2602180606493168039.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2602180606493168039.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2602180606493168039.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
compute RMSD to second conformer
MODEL 1 MODE=10 DQ=-100 214 7.717 120 1.388
MODEL 2 MODE=10 DQ=-80 214 7.544 122 1.387
MODEL 3 MODE=10 DQ=-60 214 7.398 126 1.423
MODEL 4 MODE=10 DQ=-40 214 7.279 128 1.438
MODEL 5 MODE=10 DQ=-20 214 7.190 128 1.385
MODEL 6 MODE=10 DQ=0 214 7.131 128 1.353
MODEL 7 MODE=10 DQ=20 214 7.103 130 1.388
MODEL 8 MODE=10 DQ=40 214 7.107 133 1.424
MODEL 9 MODE=10 DQ=60 214 7.142 133 1.433
MODEL 10 MODE=10 DQ=80 214 7.208 134 1.483
MODEL 11 MODE=10 DQ=100 214 7.305 136 1.555
getting mode 11
running: ../../bin/get_modes.sh 2602180606493168039 11 -100 100 20 on on
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 11
calculating perturbed structure for DQ=-100
2602180606493168039.eigenfacs
2602180606493168039.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2602180606493168039.eigenfacs
2602180606493168039.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2602180606493168039.eigenfacs
2602180606493168039.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2602180606493168039.eigenfacs
2602180606493168039.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2602180606493168039.eigenfacs
2602180606493168039.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2602180606493168039.eigenfacs
2602180606493168039.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2602180606493168039.eigenfacs
2602180606493168039.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2602180606493168039.eigenfacs
2602180606493168039.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2602180606493168039.eigenfacs
2602180606493168039.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2602180606493168039.eigenfacs
2602180606493168039.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2602180606493168039.eigenfacs
2602180606493168039.atom
making animated gifs
11 models are in 2602180606493168039.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2602180606493168039.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2602180606493168039.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
compute RMSD to second conformer
MODEL 1 MODE=11 DQ=-100 214 6.723 136 1.261
MODEL 2 MODE=11 DQ=-80 214 6.736 136 1.276
MODEL 3 MODE=11 DQ=-60 214 6.785 136 1.321
MODEL 4 MODE=11 DQ=-40 214 6.868 134 1.360
MODEL 5 MODE=11 DQ=-20 214 6.984 131 1.361
MODEL 6 MODE=11 DQ=0 214 7.131 128 1.353
MODEL 7 MODE=11 DQ=20 214 7.307 127 1.393
MODEL 8 MODE=11 DQ=40 214 7.511 128 1.433
MODEL 9 MODE=11 DQ=60 214 7.741 127 1.477
MODEL 10 MODE=11 DQ=80 214 7.993 131 1.566
MODEL 11 MODE=11 DQ=100 214 8.267 134 1.662
2602180606493168039.10.pdb
2602180606493168039.11.pdb
2602180606493168039.7.pdb
2602180606493168039.8.pdb
2602180606493168039.9.pdb
STDERR:
Note: The following floating-point exceptions are signalling: IEEE_DENORMAL
real 0m3.951s
user 0m3.909s
sys 0m0.041s
rm: cannot remove '2602180606493168039.sdijf': No such file or directory
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
If you find results from this site helpful for your research, please cite one of our papers:
elNémo
is maintained by Yves-Henri Sanejouand.
It was developed
by Karsten Suhre.
Between 2003 and 2014, it was hosted by IGS (Marseille).
Between 2015 and 2025, it was hosted by US2B (Nantes).
Last modification: december 26th, 2025.
|
