*** doused_J6172_17 ***
Output from eigenvector calculation:
STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8)
Build Tirion matrix:
Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model.
Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004.
Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file.
Pdbmat> Coordinate filename = 2602182336223344808.atom
Pdbmat> Distance cutoff = 8.00
Force constant = 10.00
Origin of mass values = CONS
Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09
PRINTing level = 2
Pdbmat> Coordinate file 2602182336223344808.atom to be opened.
Openam> File opened: 2602182336223344808.atom
Pdbmat> Coordinate file in PDB format.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 2538
First residue number = 5
Last residue number = 271
Number of atoms found = 20024
Mean number per residue = 7.9
Pdbmat> Coordinate statistics:
= 140.244937 +/- 16.956479 From: 91.808000 To: 188.254000
= 142.245027 +/- 18.859412 From: 86.551000 To: 189.865000
= 143.042402 +/- 36.808516 From: 72.767000 To: 226.294000
Pdbmat> Masses are all set to one.
Openam> File opened: pdbmat.xyzm
Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved.
Openam> File opened: pdbmat.sdijb
Pdbmat> Matrix statistics:
Pdbmat> The matrix is -2.3841 % Filled.
Pdbmat> 8180535 non-zero elements.
Pdbmat> 895739 atom-atom interactions.
Pdbmat> Number per atom= 89.47 +/- 19.85
Maximum number = 141
Minimum number = 17
Pdbmat> Matrix trace = 1.791478E+07
Pdbmat> Larger element = 519.596
Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10
Pdbmat> Normal end.
automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1)
2538 non-zero elements, NRBL set to 13
Diagonalize Tirion matrix using diagrtb
Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation.
Diagrtb> Version 2.52, November 2004.
Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file.
Diagrtb> Options taken into account:
MATRix filename = pdbmat.sdijb
COORdinates filename = 2602182336223344808.atom
Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb
Nb of VECTors required = 106
EigeNVALues chosen = LOWE
Type of SUBStructuring = NONE
Nb of residues per BLOck = 13
Origin of MASS values = CONS
MATRix FORMat = BINA
Temporary files cleaning = ALL
Output PRINting level = 2
Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb.
Blocpdb> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.xyzm
Blocpdb> Coordinate file 2602182336223344808.atom to be opened.
Openam> file on opening on unit 11:
2602182336223344808.atom
Blocpdb> Coordinate file in PDB format.
Blocpdb> 20024 atoms picked in pdb file.
Blocpdb> All masses set to unity.
Blocpdb> Coordinate file is rewritten.
Blocpdb> Substructuring:
Blocpdb> 13 residue(s) per block.
Blocpdb> 2538 residues.
Blocpdb> 106 atoms in block 1
Block first atom: 1
Blocpdb> 114 atoms in block 2
Block first atom: 107
Blocpdb> 96 atoms in block 3
Block first atom: 221
Blocpdb> 97 atoms in block 4
Block first atom: 317
Blocpdb> 89 atoms in block 5
Block first atom: 414
Blocpdb> 104 atoms in block 6
Block first atom: 503
Blocpdb> 89 atoms in block 7
Block first atom: 607
Blocpdb> 104 atoms in block 8
Block first atom: 696
Blocpdb> 111 atoms in block 9
Block first atom: 800
Blocpdb> 98 atoms in block 10
Block first atom: 911
Blocpdb> 103 atoms in block 11
Block first atom: 1009
Blocpdb> 90 atoms in block 12
Block first atom: 1112
Blocpdb> 95 atoms in block 13
Block first atom: 1202
Blocpdb> 100 atoms in block 14
Block first atom: 1297
Blocpdb> 96 atoms in block 15
Block first atom: 1397
Blocpdb> 109 atoms in block 16
Block first atom: 1493
Blocpdb> 98 atoms in block 17
Block first atom: 1602
Blocpdb> 95 atoms in block 18
Block first atom: 1700
Blocpdb> 102 atoms in block 19
Block first atom: 1795
Blocpdb> 99 atoms in block 20
Block first atom: 1897
Blocpdb> 109 atoms in block 21
Block first atom: 1996
Blocpdb> 116 atoms in block 22
Block first atom: 2105
Blocpdb> 110 atoms in block 23
Block first atom: 2221
Blocpdb> 101 atoms in block 24
Block first atom: 2331
Blocpdb> 102 atoms in block 25
Block first atom: 2432
Blocpdb> 114 atoms in block 26
Block first atom: 2534
Blocpdb> 113 atoms in block 27
Block first atom: 2648
Blocpdb> 100 atoms in block 28
Block first atom: 2761
Blocpdb> 98 atoms in block 29
Block first atom: 2861
Blocpdb> 111 atoms in block 30
Block first atom: 2959
Blocpdb> 99 atoms in block 31
Block first atom: 3070
Blocpdb> 116 atoms in block 32
Block first atom: 3169
Blocpdb> 105 atoms in block 33
Block first atom: 3285
Blocpdb> 116 atoms in block 34
Block first atom: 3390
Blocpdb> 101 atoms in block 35
Block first atom: 3506
Blocpdb> 106 atoms in block 36
Block first atom: 3607
Blocpdb> 70 atoms in block 37
Block first atom: 3713
Blocpdb> 103 atoms in block 38
Block first atom: 3783
Blocpdb> 112 atoms in block 39
Block first atom: 3886
Blocpdb> 114 atoms in block 40
Block first atom: 3998
Blocpdb> 124 atoms in block 41
Block first atom: 4112
Blocpdb> 107 atoms in block 42
Block first atom: 4236
Blocpdb> 84 atoms in block 43
Block first atom: 4343
Blocpdb> 102 atoms in block 44
Block first atom: 4427
Blocpdb> 113 atoms in block 45
Block first atom: 4529
Blocpdb> 102 atoms in block 46
Block first atom: 4642
Blocpdb> 94 atoms in block 47
Block first atom: 4744
Blocpdb> 101 atoms in block 48
Block first atom: 4838
Blocpdb> 91 atoms in block 49
Block first atom: 4939
Blocpdb> 99 atoms in block 50
Block first atom: 5030
Blocpdb> 108 atoms in block 51
Block first atom: 5129
Blocpdb> 91 atoms in block 52
Block first atom: 5237
Blocpdb> 116 atoms in block 53
Block first atom: 5328
Blocpdb> 97 atoms in block 54
Block first atom: 5444
Blocpdb> 102 atoms in block 55
Block first atom: 5541
Blocpdb> 108 atoms in block 56
Block first atom: 5643
Blocpdb> 99 atoms in block 57
Block first atom: 5751
Blocpdb> 99 atoms in block 58
Block first atom: 5850
Blocpdb> 95 atoms in block 59
Block first atom: 5949
Blocpdb> 112 atoms in block 60
Block first atom: 6044
Blocpdb> 112 atoms in block 61
Block first atom: 6156
Blocpdb> 104 atoms in block 62
Block first atom: 6268
Blocpdb> 101 atoms in block 63
Block first atom: 6372
Blocpdb> 100 atoms in block 64
Block first atom: 6473
Blocpdb> 107 atoms in block 65
Block first atom: 6573
Blocpdb> 106 atoms in block 66
Block first atom: 6680
Blocpdb> 101 atoms in block 67
Block first atom: 6786
Blocpdb> 114 atoms in block 68
Block first atom: 6887
Blocpdb> 89 atoms in block 69
Block first atom: 7001
Blocpdb> 108 atoms in block 70
Block first atom: 7090
Blocpdb> 109 atoms in block 71
Block first atom: 7198
Blocpdb> 105 atoms in block 72
Block first atom: 7307
Blocpdb> 110 atoms in block 73
Block first atom: 7412
Blocpdb> 115 atoms in block 74
Block first atom: 7522
Blocpdb> 96 atoms in block 75
Block first atom: 7637
Blocpdb> 106 atoms in block 76
Block first atom: 7733
Blocpdb> 105 atoms in block 77
Block first atom: 7839
Blocpdb> 19 atoms in block 78
Block first atom: 7944
Blocpdb> 106 atoms in block 79
Block first atom: 7963
Blocpdb> 114 atoms in block 80
Block first atom: 8069
Blocpdb> 96 atoms in block 81
Block first atom: 8183
Blocpdb> 97 atoms in block 82
Block first atom: 8279
Blocpdb> 89 atoms in block 83
Block first atom: 8376
Blocpdb> 104 atoms in block 84
Block first atom: 8465
Blocpdb> 89 atoms in block 85
Block first atom: 8569
Blocpdb> 104 atoms in block 86
Block first atom: 8658
Blocpdb> 111 atoms in block 87
Block first atom: 8762
Blocpdb> 98 atoms in block 88
Block first atom: 8873
Blocpdb> 103 atoms in block 89
Block first atom: 8971
Blocpdb> 90 atoms in block 90
Block first atom: 9074
Blocpdb> 95 atoms in block 91
Block first atom: 9164
Blocpdb> 100 atoms in block 92
Block first atom: 9259
Blocpdb> 96 atoms in block 93
Block first atom: 9359
Blocpdb> 109 atoms in block 94
Block first atom: 9455
Blocpdb> 98 atoms in block 95
Block first atom: 9564
Blocpdb> 95 atoms in block 96
Block first atom: 9662
Blocpdb> 102 atoms in block 97
Block first atom: 9757
Blocpdb> 99 atoms in block 98
Block first atom: 9859
Blocpdb> 109 atoms in block 99
Block first atom: 9958
Blocpdb> 116 atoms in block 100
Block first atom: 10067
Blocpdb> 110 atoms in block 101
Block first atom: 10183
Blocpdb> 101 atoms in block 102
Block first atom: 10293
Blocpdb> 102 atoms in block 103
Block first atom: 10394
Blocpdb> 114 atoms in block 104
Block first atom: 10496
Blocpdb> 113 atoms in block 105
Block first atom: 10610
Blocpdb> 100 atoms in block 106
Block first atom: 10723
Blocpdb> 98 atoms in block 107
Block first atom: 10823
Blocpdb> 111 atoms in block 108
Block first atom: 10921
Blocpdb> 99 atoms in block 109
Block first atom: 11032
Blocpdb> 116 atoms in block 110
Block first atom: 11131
Blocpdb> 105 atoms in block 111
Block first atom: 11247
Blocpdb> 116 atoms in block 112
Block first atom: 11352
Blocpdb> 101 atoms in block 113
Block first atom: 11468
Blocpdb> 106 atoms in block 114
Block first atom: 11569
Blocpdb> 70 atoms in block 115
Block first atom: 11675
Blocpdb> 103 atoms in block 116
Block first atom: 11745
Blocpdb> 112 atoms in block 117
Block first atom: 11848
Blocpdb> 114 atoms in block 118
Block first atom: 11960
Blocpdb> 118 atoms in block 119
Block first atom: 12074
Blocpdb> 107 atoms in block 120
Block first atom: 12192
Blocpdb> 84 atoms in block 121
Block first atom: 12299
Blocpdb> 102 atoms in block 122
Block first atom: 12383
Blocpdb> 113 atoms in block 123
Block first atom: 12485
Blocpdb> 102 atoms in block 124
Block first atom: 12598
Blocpdb> 94 atoms in block 125
Block first atom: 12700
Blocpdb> 101 atoms in block 126
Block first atom: 12794
Blocpdb> 91 atoms in block 127
Block first atom: 12895
Blocpdb> 99 atoms in block 128
Block first atom: 12986
Blocpdb> 108 atoms in block 129
Block first atom: 13085
Blocpdb> 91 atoms in block 130
Block first atom: 13193
Blocpdb> 116 atoms in block 131
Block first atom: 13284
Blocpdb> 97 atoms in block 132
Block first atom: 13400
Blocpdb> 102 atoms in block 133
Block first atom: 13497
Blocpdb> 108 atoms in block 134
Block first atom: 13599
Blocpdb> 99 atoms in block 135
Block first atom: 13707
Blocpdb> 99 atoms in block 136
Block first atom: 13806
Blocpdb> 95 atoms in block 137
Block first atom: 13905
Blocpdb> 112 atoms in block 138
Block first atom: 14000
Blocpdb> 112 atoms in block 139
Block first atom: 14112
Blocpdb> 104 atoms in block 140
Block first atom: 14224
Blocpdb> 101 atoms in block 141
Block first atom: 14328
Blocpdb> 100 atoms in block 142
Block first atom: 14429
Blocpdb> 107 atoms in block 143
Block first atom: 14529
Blocpdb> 106 atoms in block 144
Block first atom: 14636
Blocpdb> 101 atoms in block 145
Block first atom: 14742
Blocpdb> 114 atoms in block 146
Block first atom: 14843
Blocpdb> 89 atoms in block 147
Block first atom: 14957
Blocpdb> 108 atoms in block 148
Block first atom: 15046
Blocpdb> 109 atoms in block 149
Block first atom: 15154
Blocpdb> 105 atoms in block 150
Block first atom: 15263
Blocpdb> 110 atoms in block 151
Block first atom: 15368
Blocpdb> 115 atoms in block 152
Block first atom: 15478
Blocpdb> 96 atoms in block 153
Block first atom: 15593
Blocpdb> 106 atoms in block 154
Block first atom: 15689
Blocpdb> 105 atoms in block 155
Block first atom: 15795
Blocpdb> 19 atoms in block 156
Block first atom: 15900
Blocpdb> 93 atoms in block 157
Block first atom: 15919
Blocpdb> 90 atoms in block 158
Block first atom: 16012
Blocpdb> 92 atoms in block 159
Block first atom: 16102
Blocpdb> 102 atoms in block 160
Block first atom: 16194
Blocpdb> 90 atoms in block 161
Block first atom: 16296
Blocpdb> 102 atoms in block 162
Block first atom: 16386
Blocpdb> 83 atoms in block 163
Block first atom: 16488
Blocpdb> 83 atoms in block 164
Block first atom: 16571
Blocpdb> 105 atoms in block 165
Block first atom: 16654
Blocpdb> 107 atoms in block 166
Block first atom: 16759
Blocpdb> 97 atoms in block 167
Block first atom: 16866
Blocpdb> 99 atoms in block 168
Block first atom: 16963
Blocpdb> 93 atoms in block 169
Block first atom: 17062
Blocpdb> 92 atoms in block 170
Block first atom: 17155
Blocpdb> 107 atoms in block 171
Block first atom: 17247
Blocpdb> 95 atoms in block 172
Block first atom: 17354
Blocpdb> 110 atoms in block 173
Block first atom: 17449
Blocpdb> 110 atoms in block 174
Block first atom: 17559
Blocpdb> 108 atoms in block 175
Block first atom: 17669
Blocpdb> 100 atoms in block 176
Block first atom: 17777
Blocpdb> 95 atoms in block 177
Block first atom: 17877
Blocpdb> 93 atoms in block 178
Block first atom: 17972
Blocpdb> 90 atoms in block 179
Block first atom: 18065
Blocpdb> 92 atoms in block 180
Block first atom: 18155
Blocpdb> 102 atoms in block 181
Block first atom: 18247
Blocpdb> 90 atoms in block 182
Block first atom: 18349
Blocpdb> 102 atoms in block 183
Block first atom: 18439
Blocpdb> 83 atoms in block 184
Block first atom: 18541
Blocpdb> 83 atoms in block 185
Block first atom: 18624
Blocpdb> 105 atoms in block 186
Block first atom: 18707
Blocpdb> 107 atoms in block 187
Block first atom: 18812
Blocpdb> 97 atoms in block 188
Block first atom: 18919
Blocpdb> 99 atoms in block 189
Block first atom: 19016
Blocpdb> 93 atoms in block 190
Block first atom: 19115
Blocpdb> 92 atoms in block 191
Block first atom: 19208
Blocpdb> 107 atoms in block 192
Block first atom: 19300
Blocpdb> 95 atoms in block 193
Block first atom: 19407
Blocpdb> 110 atoms in block 194
Block first atom: 19502
Blocpdb> 110 atoms in block 195
Block first atom: 19612
Blocpdb> 108 atoms in block 196
Block first atom: 19722
Blocpdb> 100 atoms in block 197
Block first atom: 19830
Blocpdb> 95 atoms in block 198
Block first atom: 19929
Blocpdb> 198 blocks.
Blocpdb> At most, 124 atoms in each of them.
Blocpdb> At least, 19 atoms in each of them.
Blocpdb> Normal end of Blocpdb.
Diagrtb> Memory allocation for Prepmat.
Diagrtb> Memory allocation for RTB.
Diagrtb> Memory allocation for Diagstd.
Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes.
Prepmat> Entering in.
Prepmat> Rewriting of the matrix begins.
Prepmat> 8180733 matrix lines read.
Prepmat> Matrix order = 60072
Prepmat> Matrix trace = 17914780.0001
Prepmat> Last element read: 60072 60072 253.0200
Prepmat> 19702 lines saved.
Prepmat> 17877 empty lines.
Prepmat> Number of lines on output is as expected.
Prepmat> Normal end of Prepmat.
RTB> Entering in.
RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 20024
RTB> Total mass = 20024.0000
RTB> Number of atoms found in matrix: 20024
RTB> Number of blocks = 198
RTB> Projection begins.
RTB> Projected matrix is being saved.
RTB> Projected matrix trace = 206845.6877
RTB> 62694 non-zero elements.
RTB> Normal end of RTB.
Diagstd> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.sdijb
Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb
Diagstd> CERFACS matrix format.
Diagstd> Projected matrix order = 1188
Diagstd> Nb of non-zero elements: 62694
Diagstd> Projected matrix trace = 206845.6877
Openam> file on opening on unit 11:
diagrtb_work.eigenfacs
Diagstd> Diagonalization.
Diagstd> 1188 eigenvectors are computed.
Diagstd> 106 of them to be saved.
Diagstd> Sum of eigenvalues = 206845.6877
Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000
Diagstd> Selected eigenvalues:
0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000
0.0000000 0.4569220 0.4918883 0.6756721 1.2657821
1.7562077 2.1292137 2.5447962 3.1348610 4.1129507
4.8965998 5.3727157 6.2184010 6.8314924 7.2937550
7.5071264 8.4481847 8.9951769 9.4588006 10.1440925
10.6027473 10.7078045 11.5637831 11.8568291 12.0746222
12.4870163 13.1941875 13.2863292 13.6735823 14.0768243
14.3371812 14.6833500 15.5517395 15.7719264 16.3937977
16.6330746 17.2927921 17.5150908 17.7719523 18.7262806
18.9978113 19.1993742 19.5668671 19.8897927 20.0567219
20.3618000 20.7830940 21.2489078 21.5887544 22.1912437
22.3495151 23.1439186 23.4784011 23.9313998 24.1626062
24.6462156 24.9030911 25.4247695 25.6770941 26.2924482
26.8348935 26.9808670 27.3604682 27.4707157 27.8713554
28.4580282 28.8336972 29.1419007 29.8508633 30.0713094
30.3535302 30.6413550 31.2124750 31.5828753 32.1211052
32.4093493 32.9251336 33.1183599 33.3349770 33.4659871
33.7131506 34.2144162 34.5143943 34.6733944 35.6360744
35.9777967 36.7190655 36.9661556 37.1784031 37.4582689
37.7626532 38.1183126 38.5378360 38.9934075 39.3331181
39.4179104 39.5915474 39.9837632 40.1965914 40.3741773
41.2819327
Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units):
0.0034314 0.0034330 0.0034337 0.0034338 0.0034338
0.0034345 73.4034212 76.1602764 89.2613106 122.1728625
143.9074304 158.4546198 173.2294726 192.2668559 220.2277456
240.2938109 251.7052130 270.7912602 283.8265879 293.2721785
297.5309473 315.6290597 325.6867827 333.9745060 345.8612285
353.5936739 355.3411438 369.2710400 373.9207455 377.3393140
383.7289985 394.4451371 395.8200462 401.5470449 407.4249539
411.1754409 416.1097146 428.2375712 431.2584834 439.6783351
442.8753908 451.5728686 454.4660829 457.7863609 469.9168779
473.3115097 475.8157536 480.3479353 484.2954721 486.3235012
490.0082187 495.0515006 500.5685802 504.5556490 511.5476592
513.3686362 522.4127004 526.1741880 531.2260105 533.7859871
539.1013278 541.9034411 547.5500114 550.2603456 556.8148301
562.5293904 564.0573087 568.0113874 569.1546226 573.2899448
579.2922026 583.1032302 586.2113421 593.2991530 595.4858552
598.2736618 601.1035097 606.6795896 610.2687241 615.4468030
618.2020433 623.1018684 624.9275790 626.9679779 628.1987964
630.5143141 635.1844349 637.9628775 639.4306650 648.2465422
651.3472167 658.0230246 660.2332983 662.1260067 664.6134587
667.3083061 670.4433909 674.1226862 678.0955187 681.0428981
681.7765814 683.2765540 686.6526709 688.4777254 689.9968743
697.7105515
Diagstd> Normal end.
Rtb_to_modes> Entering in.
Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 20024
Rtb_to_modes> Number of blocs = 198
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 11:
matrix.eigenrtb
Rdmodfacs> Entering in.
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Eigenvector number: 1
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9850E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 2
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9945E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 3
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9986E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 4
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9991E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 5
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9993E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 6
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0003E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 7
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.4569
Rdmodfacs> Eigenvector number: 8
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.4919
Rdmodfacs> Eigenvector number: 9
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.6757
Rdmodfacs> Eigenvector number: 10
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.266
Rdmodfacs> Eigenvector number: 11
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.756
Rdmodfacs> Eigenvector number: 12
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.129
Rdmodfacs> Eigenvector number: 13
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.545
Rdmodfacs> Eigenvector number: 14
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.135
Rdmodfacs> Eigenvector number: 15
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.113
Rdmodfacs> Eigenvector number: 16
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.897
Rdmodfacs> Eigenvector number: 17
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.373
Rdmodfacs> Eigenvector number: 18
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.218
Rdmodfacs> Eigenvector number: 19
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.831
Rdmodfacs> Eigenvector number: 20
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.294
Rdmodfacs> Eigenvector number: 21
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.507
Rdmodfacs> Eigenvector number: 22
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.448
Rdmodfacs> Eigenvector number: 23
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.995
Rdmodfacs> Eigenvector number: 24
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.459
Rdmodfacs> Eigenvector number: 25
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.14
Rdmodfacs> Eigenvector number: 26
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.60
Rdmodfacs> Eigenvector number: 27
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.71
Rdmodfacs> Eigenvector number: 28
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.56
Rdmodfacs> Eigenvector number: 29
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.86
Rdmodfacs> Eigenvector number: 30
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.07
Rdmodfacs> Eigenvector number: 31
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.49
Rdmodfacs> Eigenvector number: 32
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.19
Rdmodfacs> Eigenvector number: 33
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.29
Rdmodfacs> Eigenvector number: 34
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.67
Rdmodfacs> Eigenvector number: 35
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.08
Rdmodfacs> Eigenvector number: 36
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.34
Rdmodfacs> Eigenvector number: 37
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.68
Rdmodfacs> Eigenvector number: 38
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.55
Rdmodfacs> Eigenvector number: 39
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.77
Rdmodfacs> Eigenvector number: 40
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.39
Rdmodfacs> Eigenvector number: 41
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.63
Rdmodfacs> Eigenvector number: 42
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.29
Rdmodfacs> Eigenvector number: 43
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.52
Rdmodfacs> Eigenvector number: 44
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.77
Rdmodfacs> Eigenvector number: 45
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.73
Rdmodfacs> Eigenvector number: 46
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.00
Rdmodfacs> Eigenvector number: 47
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.20
Rdmodfacs> Eigenvector number: 48
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.57
Rdmodfacs> Eigenvector number: 49
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.89
Rdmodfacs> Eigenvector number: 50
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.06
Rdmodfacs> Eigenvector number: 51
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.36
Rdmodfacs> Eigenvector number: 52
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.78
Rdmodfacs> Eigenvector number: 53
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.25
Rdmodfacs> Eigenvector number: 54
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.59
Rdmodfacs> Eigenvector number: 55
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.19
Rdmodfacs> Eigenvector number: 56
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.35
Rdmodfacs> Eigenvector number: 57
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.14
Rdmodfacs> Eigenvector number: 58
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.48
Rdmodfacs> Eigenvector number: 59
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.93
Rdmodfacs> Eigenvector number: 60
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.16
Rdmodfacs> Eigenvector number: 61
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.65
Rdmodfacs> Eigenvector number: 62
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.90
Rdmodfacs> Eigenvector number: 63
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.42
Rdmodfacs> Eigenvector number: 64
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.68
Rdmodfacs> Eigenvector number: 65
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.29
Rdmodfacs> Eigenvector number: 66
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.83
Rdmodfacs> Eigenvector number: 67
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.98
Rdmodfacs> Eigenvector number: 68
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.36
Rdmodfacs> Eigenvector number: 69
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.47
Rdmodfacs> Eigenvector number: 70
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.87
Rdmodfacs> Eigenvector number: 71
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.46
Rdmodfacs> Eigenvector number: 72
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.83
Rdmodfacs> Eigenvector number: 73
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.14
Rdmodfacs> Eigenvector number: 74
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.85
Rdmodfacs> Eigenvector number: 75
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.07
Rdmodfacs> Eigenvector number: 76
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.35
Rdmodfacs> Eigenvector number: 77
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.64
Rdmodfacs> Eigenvector number: 78
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.21
Rdmodfacs> Eigenvector number: 79
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.58
Rdmodfacs> Eigenvector number: 80
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.12
Rdmodfacs> Eigenvector number: 81
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.41
Rdmodfacs> Eigenvector number: 82
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.93
Rdmodfacs> Eigenvector number: 83
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.12
Rdmodfacs> Eigenvector number: 84
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.33
Rdmodfacs> Eigenvector number: 85
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.47
Rdmodfacs> Eigenvector number: 86
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.71
Rdmodfacs> Eigenvector number: 87
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.21
Rdmodfacs> Eigenvector number: 88
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.51
Rdmodfacs> Eigenvector number: 89
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.67
Rdmodfacs> Eigenvector number: 90
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.64
Rdmodfacs> Eigenvector number: 91
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.98
Rdmodfacs> Eigenvector number: 92
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.72
Rdmodfacs> Eigenvector number: 93
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.97
Rdmodfacs> Eigenvector number: 94
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.18
Rdmodfacs> Eigenvector number: 95
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.46
Rdmodfacs> Eigenvector number: 96
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.76
Rdmodfacs> Eigenvector number: 97
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.12
Rdmodfacs> Eigenvector number: 98
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.54
Rdmodfacs> Eigenvector number: 99
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.99
Rdmodfacs> Eigenvector number: 100
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.33
Rdmodfacs> Eigenvector number: 101
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.42
Rdmodfacs> Eigenvector number: 102
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.59
Rdmodfacs> Eigenvector number: 103
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.98
Rdmodfacs> Eigenvector number: 104
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.20
Rdmodfacs> Eigenvector number: 105
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.37
Rdmodfacs> Eigenvector number: 106
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.28
Rtb_to_modes> 106 vectors, with 1188 coordinates in vector file.
Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected):
1.00001 1.00000 1.00000 1.00000 1.00001
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1.00002 1.00001 0.99999 0.99998 0.99999
1.00001 0.99997 1.00001 0.99998 1.00000
1.00000 0.99998 1.00003 1.00001 1.00000
1.00000 1.00000 1.00001 0.99999 1.00002
0.99999 1.00001 1.00001 0.99999 1.00001
1.00001 1.00002 1.00001 1.00001 1.00001
1.00002 1.00001 0.99997 1.00000 1.00000
1.00001 1.00001 0.99999 1.00000 1.00000
1.00000 0.99998 1.00002 1.00001 1.00002
0.99999 0.99999 1.00001 0.99998 1.00002
1.00000 0.99999 0.99999 0.99999 0.99999
1.00001 1.00000 0.99999 0.99999 1.00000
1.00000 0.99998 1.00001 1.00001 1.00002
1.00001 0.99999 0.99999 0.99997 1.00001
1.00000 0.99999 1.00000 1.00000 0.99999
1.00000 1.00000 0.99999 0.99999 0.99999
0.99999 1.00001 0.99999 0.99999 1.00000
0.99999 0.99999 0.99999 1.00001 1.00000
1.00001 0.99999 1.00000 1.00000 1.00000
1.00001
Rtb_to_modes> RTB block-file is being read.
Rtb_to_modes> 360432 lines found in RTB file.
Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected):
1.00001 1.00000 1.00000 1.00000 1.00001
1.00000 1.00000 0.99999 0.99999 1.00000
1.00002 1.00001 0.99999 0.99998 0.99999
1.00001 0.99997 1.00001 0.99998 1.00000
1.00000 0.99998 1.00003 1.00001 1.00000
1.00000 1.00000 1.00001 0.99999 1.00002
0.99999 1.00001 1.00001 0.99999 1.00001
1.00001 1.00002 1.00001 1.00001 1.00001
1.00002 1.00001 0.99997 1.00000 1.00000
1.00001 1.00001 0.99999 1.00000 1.00000
1.00000 0.99998 1.00002 1.00001 1.00002
0.99999 0.99999 1.00001 0.99998 1.00002
1.00000 0.99999 0.99999 0.99999 0.99999
1.00001 1.00000 0.99999 0.99999 1.00000
1.00000 0.99998 1.00001 1.00001 1.00002
1.00001 0.99999 0.99999 0.99997 1.00001
1.00000 0.99999 1.00000 1.00000 0.99999
1.00000 1.00000 0.99999 0.99999 0.99999
0.99999 1.00001 0.99999 0.99999 1.00000
0.99999 0.99999 0.99999 1.00001 1.00000
1.00001 0.99999 1.00000 1.00000 1.00000
1.00001
Orthogonality of first eigenvectors (zero expected):
Vector 2:-0.000
Vector 3:-0.000 0.000
Vector 4: 0.000-0.000-0.000
Vector 5:-0.000-0.000-0.000-0.000
Vector 6:-0.000-0.000-0.000-0.000 0.000
Vector 7:-0.000-0.000-0.000 0.000-0.000-0.000
Vector 8:-0.000 0.000-0.000-0.000 0.000 0.000-0.000
Vector 9: 0.000 0.000-0.000-0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
Vector 10:-0.000-0.000-0.000 0.000 0.000-0.000 0.000-0.000 0.000
Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved.
Rtb_to_modes> Normal end.
Diagrtb> Normal end.
B-factor analysis
Bfactors> Version 1.22, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 2602182336223344808.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
2602182336223344808.eigenfacs
Getnam> Corresponding pdb filename ?
Getnam> 2602182336223344808.atom
Openam> file on opening on unit 11:
2602182336223344808.atom
Getnum> Number of skipped eigenvectors ?
Getnum> 0
Getnum> Number of usefull eigenvectors ?
Getnum> 10000
%Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 2538
First residue number = 5
Last residue number = 271
Number of atoms found = 20024
Mean number per residue = 7.9
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9850E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9945E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9986E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9991E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9993E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0003E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.4569
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.4919
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.6757
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.266
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.756
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.129
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.545
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.135
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Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.28
Bfactors> 106 vectors, 60072 coordinates in file.
Openam> file on opening on unit 12:
bfactors.pred
Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000
Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 0.456900
Bfactors> 100 eigenvectors will be considered.
Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped.
Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed.
(CHARMM units assumed for eigenvalues)
Bfactors> Correlation= 0.716 for 2539 C-alpha atoms.
Bfactors> = 0.010 +/- 0.01
Bfactors> = 71.804 +/- 37.06
Bfactors> Shiftng-fct= 71.794
Bfactors> Scaling-fct= 5485.623
Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved.
Bfactors> Normal end.
check_modes
Chkmod> Version 1.00, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 2602182336223344808.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
2602182336223344808.eigenfacs
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
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Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 688.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 689.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 697.7
Chkmod> 106 vectors, 60072 coordinates in file.
Chkmod> That is: 20024 cartesian points.
Openam> file on opening on unit 11:
Chkmod.res
Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file.
Chkmod> Normal end.
0.0034 0.7488
0.0034 0.8751
0.0034 0.9465
0.0034 0.8552
0.0034 0.8456
0.0034 0.9047
73.3985 0.6245
76.1579 0.7005
89.2593 0.5437
122.1781 0.5975
143.8927 0.6866
158.4399 0.6649
173.2290 0.6377
192.2629 0.5811
220.2196 0.5929
240.2933 0.4948
251.7011 0.5987
270.7709 0.4611
283.8042 0.6053
293.2645 0.5352
297.5157 0.5260
315.6121 0.4245
325.6696 0.1975
333.9637 0.4325
345.7766 0.4773
353.5327 0.4339
355.3623 0.4722
369.1948 0.5463
373.9547 0.5912
377.2509 0.2617
383.7584 0.4261
394.3656 0.5739
395.8577 0.4799
401.4772 0.4732
407.4534 0.5067
411.1982 0.6226
416.0444 0.5424
428.1952 0.3839
431.2136 0.5140
439.6085 0.5308
442.8154 0.4638
451.5170 0.5936
454.5103 0.4283
457.7416 0.5830
469.9434 0.5614
473.3185 0.6599
475.8031 0.4387
480.3658 0.5596
484.2772 0.4352
486.3424 0.3732
489.9655 0.4861
494.9934 0.5161
500.5600 0.5624
504.5485 0.4507
511.5114 0.5222
513.3522 0.4492
522.3460 0.3837
526.1695 0.4302
531.1877 0.5730
533.7343 0.4625
539.1196 0.5251
541.8465 0.5792
547.4751 0.5759
550.2679 0.5595
556.7650 0.4762
562.4540 0.4268
564.0240 0.5716
567.9821 0.5164
569.1228 0.2126
573.2514 0.4499
579.2874 0.4285
583.0408 0.4768
586.1671 0.4734
593.2651 0.4587
595.4473 0.4485
598.2132 0.4879
601.0644 0.5658
606.6295 0.5202
610.2147 0.4398
615.4098 0.4145
618.1817 0.5240
623.1212 0.4777
624.9162 0.5102
626.8943 0.4987
628.2095 0.4806
630.4578 0.5108
635.1162 0.4893
637.8949 0.4038
639.3719 0.3475
648.2544 0.5325
651.3392 0.4805
658.0032 0.5261
660.2393 0.5238
662.1118 0.5188
664.6003 0.5306
667.2562 0.4806
670.4294 0.4775
674.1127 0.3824
678.0368 0.4020
680.9867 0.4215
681.7654 0.4996
683.2339 0.4697
686.5909 0.4413
688.4774 0.4865
689.9316 0.5689
697.6643 0.4707
Project conformational change on normal modes:
Projmod> Version 1.36, April 2003.
Projmod> Projection of a difference vector on a set of eigenvectors.
Getnam> CERFACS file with the eigenvectors ?
Getnam> 2602182336223344808.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
2602182336223344808.eigenfacs
Getnam> Pdb file with the reference structure ?
Getnam> 2602182336223344808.atom
Openam> file on opening on unit 11:
2602182336223344808.atom
Getnam> Pdb file with the other conformer ?
Getnam> 2602182336223344808.atom2
Openam> file on opening on unit 12:
2602182336223344808.atom2
Getrep> Are the masses given in the pdb file ? (y/n)
Getrep> F
Projmod> All masses will all be assumed to be of 1.
Getrep> Displacement along one mode ? (y/n)
Getrep> F
Openam> file on opening on unit 13:
projmod.res
Openam> file on opening on unit 14:
dr.res
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4312E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4329E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4336E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4337E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4337E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4343E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 73.40
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 76.16
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 89.26
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 122.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 143.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 158.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 173.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 192.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 220.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 240.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 251.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 270.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 283.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 293.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 297.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 315.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 325.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 334.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 345.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 353.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 355.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 369.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 374.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 377.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 383.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 394.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 395.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 401.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 407.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 411.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 416.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 428.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 431.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 439.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 442.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 451.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 454.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 457.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 469.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 473.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 475.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 480.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 484.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 486.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 490.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 495.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 500.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 504.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 511.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 513.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 522.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 526.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 531.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 533.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 539.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 541.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 547.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 550.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 556.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 562.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 564.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 568.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 569.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 573.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 579.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 583.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 586.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 593.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 595.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 598.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 601.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 606.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 610.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 615.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 618.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 623.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 624.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 626.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 628.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 630.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 635.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 637.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 639.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 648.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 651.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 658.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 660.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 662.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 664.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 667.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 670.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 674.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 678.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 681.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 681.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 683.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 686.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 688.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 689.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 697.7
Projmod> 106 vectors, 60072 coordinates in file.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 2538
First residue number = 5
Last residue number = 271
Number of atoms found = 20024
Mean number per residue = 7.9
Projmod> Cartesian (eigen)vectors will be studied.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 1998
First residue number = 4
Last residue number = 523
Number of atoms found = 15931
Mean number per residue = 8.0
%Projmod-Wn> Different number of atoms for the other conformer.
%Projmod-Wn> Different number of residues for the other conformer.
%Projmod-Er> Not enough of them.
getting mode 7
running: ../../bin/get_modes.sh 2602182336223344808 7 -100 100 20 on on
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 7
calculating perturbed structure for DQ=-100
2602182336223344808.eigenfacs
2602182336223344808.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2602182336223344808.eigenfacs
2602182336223344808.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2602182336223344808.eigenfacs
2602182336223344808.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2602182336223344808.eigenfacs
2602182336223344808.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2602182336223344808.eigenfacs
2602182336223344808.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2602182336223344808.eigenfacs
2602182336223344808.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2602182336223344808.eigenfacs
2602182336223344808.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2602182336223344808.eigenfacs
2602182336223344808.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2602182336223344808.eigenfacs
2602182336223344808.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2602182336223344808.eigenfacs
2602182336223344808.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2602182336223344808.eigenfacs
2602182336223344808.atom
making animated gifs
11 models are in 2602182336223344808.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2602182336223344808.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2602182336223344808.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
compute RMSD to second conformer
MODEL 1 MODE=7 DQ=-100 477 19.499 37 2.105
MODEL 2 MODE=7 DQ=-80 477 19.504 37 2.103
MODEL 3 MODE=7 DQ=-60 477 19.508 37 2.102
MODEL 4 MODE=7 DQ=-40 477 19.513 37 2.100
MODEL 5 MODE=7 DQ=-20 477 19.518 37 2.098
MODEL 6 MODE=7 DQ=0 477 19.523 37 2.097
MODEL 7 MODE=7 DQ=20 477 19.528 37 2.095
MODEL 8 MODE=7 DQ=40 477 19.533 37 2.094
MODEL 9 MODE=7 DQ=60 477 19.538 37 2.108
MODEL 10 MODE=7 DQ=80 477 19.543 37 2.099
MODEL 11 MODE=7 DQ=100 477 19.548 37 2.097
getting mode 8
running: ../../bin/get_modes.sh 2602182336223344808 8 -100 100 20 on on
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 8
calculating perturbed structure for DQ=-100
2602182336223344808.eigenfacs
2602182336223344808.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
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2602182336223344808.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2602182336223344808.eigenfacs
2602182336223344808.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2602182336223344808.eigenfacs
2602182336223344808.atom
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2602182336223344808.eigenfacs
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calculating perturbed structure for DQ=0
2602182336223344808.eigenfacs
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2602182336223344808.atom
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MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2602182336223344808.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2602182336223344808.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
compute RMSD to second conformer
MODEL 1 MODE=8 DQ=-100 477 19.517 37 2.078
MODEL 2 MODE=8 DQ=-80 477 19.518 37 2.095
MODEL 3 MODE=8 DQ=-60 477 19.520 37 2.099
MODEL 4 MODE=8 DQ=-40 477 19.521 37 2.088
MODEL 5 MODE=8 DQ=-20 477 19.522 37 2.109
MODEL 6 MODE=8 DQ=0 477 19.523 37 2.097
MODEL 7 MODE=8 DQ=20 477 19.524 37 2.102
MODEL 8 MODE=8 DQ=40 477 19.525 37 2.106
MODEL 9 MODE=8 DQ=60 477 19.527 36 2.084
MODEL 10 MODE=8 DQ=80 477 19.528 36 2.089
MODEL 11 MODE=8 DQ=100 477 19.529 36 2.094
getting mode 9
running: ../../bin/get_modes.sh 2602182336223344808 9 -100 100 20 on on
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 9
calculating perturbed structure for DQ=-100
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calculating perturbed structure for DQ=-80
2602182336223344808.eigenfacs
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calculating perturbed structure for DQ=-60
2602182336223344808.eigenfacs
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2602182336223344808.eigenfacs
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calculating perturbed structure for DQ=0
2602182336223344808.eigenfacs
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calculating perturbed structure for DQ=20
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2602182336223344808.eigenfacs
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making animated gifs
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MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2602182336223344808.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2602182336223344808.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
compute RMSD to second conformer
MODEL 1 MODE=9 DQ=-100 477 19.546 37 2.111
MODEL 2 MODE=9 DQ=-80 477 19.542 30 1.924
MODEL 3 MODE=9 DQ=-60 477 19.537 30 1.926
MODEL 4 MODE=9 DQ=-40 477 19.532 30 1.928
MODEL 5 MODE=9 DQ=-20 477 19.528 37 2.099
MODEL 6 MODE=9 DQ=0 477 19.523 37 2.097
MODEL 7 MODE=9 DQ=20 477 19.519 37 2.112
MODEL 8 MODE=9 DQ=40 477 19.514 37 2.094
MODEL 9 MODE=9 DQ=60 477 19.510 37 2.092
MODEL 10 MODE=9 DQ=80 477 19.505 37 2.091
MODEL 11 MODE=9 DQ=100 477 19.501 37 2.090
getting mode 10
running: ../../bin/get_modes.sh 2602182336223344808 10 -100 100 20 on on
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 10
calculating perturbed structure for DQ=-100
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2602182336223344808.atom
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calculating perturbed structure for DQ=-60
2602182336223344808.eigenfacs
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2602182336223344808.eigenfacs
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calculating perturbed structure for DQ=-20
2602182336223344808.eigenfacs
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calculating perturbed structure for DQ=0
2602182336223344808.eigenfacs
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calculating perturbed structure for DQ=20
2602182336223344808.eigenfacs
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calculating perturbed structure for DQ=40
2602182336223344808.eigenfacs
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2602182336223344808.eigenfacs
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2602182336223344808.eigenfacs
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making animated gifs
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MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2602182336223344808.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2602182336223344808.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
compute RMSD to second conformer
MODEL 1 MODE=10 DQ=-100 477 19.495 37 2.116
MODEL 2 MODE=10 DQ=-80 477 19.500 37 2.112
MODEL 3 MODE=10 DQ=-60 477 19.505 37 2.108
MODEL 4 MODE=10 DQ=-40 477 19.511 37 2.104
MODEL 5 MODE=10 DQ=-20 477 19.517 37 2.101
MODEL 6 MODE=10 DQ=0 477 19.523 37 2.097
MODEL 7 MODE=10 DQ=20 477 19.529 37 2.093
MODEL 8 MODE=10 DQ=40 477 19.536 37 2.090
MODEL 9 MODE=10 DQ=60 477 19.542 37 2.086
MODEL 10 MODE=10 DQ=80 477 19.549 37 2.083
MODEL 11 MODE=10 DQ=100 477 19.556 37 2.093
getting mode 11
running: ../../bin/get_modes.sh 2602182336223344808 11 -100 100 20 on on
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 11
calculating perturbed structure for DQ=-100
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calculating perturbed structure for DQ=-80
2602182336223344808.eigenfacs
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calculating perturbed structure for DQ=-60
2602182336223344808.eigenfacs
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calculating perturbed structure for DQ=-40
2602182336223344808.eigenfacs
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calculating perturbed structure for DQ=-20
2602182336223344808.eigenfacs
2602182336223344808.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2602182336223344808.eigenfacs
2602182336223344808.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2602182336223344808.eigenfacs
2602182336223344808.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2602182336223344808.eigenfacs
2602182336223344808.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2602182336223344808.eigenfacs
2602182336223344808.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2602182336223344808.eigenfacs
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2602182336223344808.eigenfacs
2602182336223344808.atom
making animated gifs
11 models are in 2602182336223344808.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2602182336223344808.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2602182336223344808.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
compute RMSD to second conformer
MODEL 1 MODE=11 DQ=-100 477 19.535 37 2.109
MODEL 2 MODE=11 DQ=-80 477 19.532 37 2.106
MODEL 3 MODE=11 DQ=-60 477 19.529 37 2.103
MODEL 4 MODE=11 DQ=-40 477 19.527 37 2.101
MODEL 5 MODE=11 DQ=-20 477 19.525 37 2.099
MODEL 6 MODE=11 DQ=0 477 19.523 37 2.097
MODEL 7 MODE=11 DQ=20 477 19.521 37 2.095
MODEL 8 MODE=11 DQ=40 477 19.520 37 2.109
MODEL 9 MODE=11 DQ=60 477 19.519 37 2.107
MODEL 10 MODE=11 DQ=80 477 19.518 37 2.095
MODEL 11 MODE=11 DQ=100 477 19.518 37 2.094
2602182336223344808.10.pdb
2602182336223344808.11.pdb
2602182336223344808.7.pdb
2602182336223344808.8.pdb
2602182336223344808.9.pdb
STDERR:
Note: The following floating-point exceptions are signalling: IEEE_DENORMAL
real 2m55.988s
user 2m55.077s
sys 0m0.809s
rm: cannot remove '2602182336223344808.sdijf': No such file or directory
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