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please let us know.
elNémo has been hacked on november 27th.
It has been moved away and runs again.
Still some additional cleaning from time to time
Sorry for the inconvenience.

* Amanda Kang *

LOGs for ID: 2602190048483367751

Output from eigenvector calculation:


STDOUT:

CUTOFF set to default value (CUTOFF=8)
Build Tirion matrix:
 Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model.
 Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004.    

 Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file.

 Pdbmat> Coordinate filename     = 2602190048483367751.atom

 Pdbmat> Distance cutoff         =       8.00
         Force constant          =      10.00
         Origin of mass values   =       CONS
 Pdbmat> Levelshift              =    1.0E-09
         PRINTing level          =          2

 Pdbmat> Coordinate file 2602190048483367751.atom to be opened.

 Openam> File opened: 2602190048483367751.atom

 Pdbmat> Coordinate file in PDB format.

 Rdatompdb> Reading pdb file.
 Rdatompdb> End of file reached.
 Rdatompdb> Number of I/O errors:      0

 Rdatompdb> Number of residues found =    303
            First residue number     =     -4
            Last  residue number     =    298
            Number of atoms found    =   2371
            Mean number per residue  =      7.8

 Pdbmat> Coordinate statistics: 
 =    29.825103 +/-    12.332402 From:    -4.469000 To:    54.277000
 =    29.793426 +/-    21.219449 From:   -12.376000 To:    69.054000
 =    84.387732 +/-    16.335886 From:    44.662000 To:   126.140000
 Pdbmat> Masses are all set to one.

 Openam> File opened: pdbmat.xyzm
 Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved.

 Openam> File opened: pdbmat.sdijb

 Pdbmat> Matrix statistics:

 Pdbmat> The matrix is   3.3726 % Filled.
 Pdbmat>       853311  non-zero elements.
 Pdbmat>        93245 atom-atom interactions.

 Pdbmat> Number per atom=     78.65 +/-     21.54
         Maximum number =    132
         Minimum number =      8

 Pdbmat> Matrix trace   = 1.864900E+06
 Pdbmat> Larger element =  502.922    
 Pdbmat>      0 elements larger than +/-  1.0E+10

 Pdbmat> Normal end.
automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1)
303 non-zero elements, NRBL set to 2
Diagonalize Tirion matrix using diagrtb
 Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation.
 Diagrtb> Version 2.52, November 2004. 
 Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file.

 Diagrtb> Options taken into account:

 MATRix filename          = pdbmat.sdijb
 COORdinates filename     = 2602190048483367751.atom
 Eigenvector OUTPut file  = matrix.eigenrtb
 Nb of VECTors required   =        106
 EigeNVALues chosen       =       LOWE
 Type of SUBStructuring   =       NONE
 Nb of residues per BLOck =          2
 Origin of MASS values    =       CONS
 MATRix FORMat            =       BINA
 Temporary files cleaning =       ALL 
 Output PRINting level    =          2

 Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb.

 Blocpdb> Entering in.

 Openam> file on opening on unit     10:
 diagrtb_work.xyzm   

 Blocpdb> Coordinate file 2602190048483367751.atom to be opened.

 Openam> file on opening on unit     11:
 2602190048483367751.atom                                                                                                        

 Blocpdb> Coordinate file in PDB format.

 Blocpdb>  2371 atoms picked in pdb file.
 Blocpdb>   All masses set to unity.
 Blocpdb> Coordinate file is rewritten.

 Blocpdb> Substructuring:
 Blocpdb>     2 residue(s) per block.
 Blocpdb>   303 residues.
 Blocpdb>    12 atoms in block      1
 Block first atom:      1
 Blocpdb>    16 atoms in block      2
 Block first atom:     13
 Blocpdb>    14 atoms in block      3
 Block first atom:     29
 Blocpdb>    14 atoms in block      4
 Block first atom:     43
 Blocpdb>    15 atoms in block      5
 Block first atom:     57
 Blocpdb>    13 atoms in block      6
 Block first atom:     72
 Blocpdb>    16 atoms in block      7
 Block first atom:     85
 Blocpdb>    16 atoms in block      8
 Block first atom:    101
 Blocpdb>    14 atoms in block      9
 Block first atom:    117
 Blocpdb>    17 atoms in block     10
 Block first atom:    131
 Blocpdb>    13 atoms in block     11
 Block first atom:    148
 Blocpdb>    16 atoms in block     12
 Block first atom:    161
 Blocpdb>    13 atoms in block     13
 Block first atom:    177
 Blocpdb>     9 atoms in block     14
 Block first atom:    190
 Blocpdb>    16 atoms in block     15
 Block first atom:    199
 Blocpdb>    20 atoms in block     16
 Block first atom:    215
 Blocpdb>    17 atoms in block     17
 Block first atom:    235
 Blocpdb>    20 atoms in block     18
 Block first atom:    252
 Blocpdb>    17 atoms in block     19
 Block first atom:    272
 Blocpdb>    15 atoms in block     20
 Block first atom:    289
 Blocpdb>    21 atoms in block     21
 Block first atom:    304
 Blocpdb>    16 atoms in block     22
 Block first atom:    325
 Blocpdb>    19 atoms in block     23
 Block first atom:    341
 Blocpdb>    16 atoms in block     24
 Block first atom:    360
 Blocpdb>    17 atoms in block     25
 Block first atom:    376
 Blocpdb>    17 atoms in block     26
 Block first atom:    393
 Blocpdb>    17 atoms in block     27
 Block first atom:    410
 Blocpdb>    20 atoms in block     28
 Block first atom:    427
 Blocpdb>    18 atoms in block     29
 Block first atom:    447
 Blocpdb>    18 atoms in block     30
 Block first atom:    465
 Blocpdb>    14 atoms in block     31
 Block first atom:    483
 Blocpdb>    11 atoms in block     32
 Block first atom:    497
 Blocpdb>    15 atoms in block     33
 Block first atom:    508
 Blocpdb>    11 atoms in block     34
 Block first atom:    523
 Blocpdb>    16 atoms in block     35
 Block first atom:    534
 Blocpdb>    16 atoms in block     36
 Block first atom:    550
 Blocpdb>    16 atoms in block     37
 Block first atom:    566
 Blocpdb>    16 atoms in block     38
 Block first atom:    582
 Blocpdb>    15 atoms in block     39
 Block first atom:    598
 Blocpdb>    17 atoms in block     40
 Block first atom:    613
 Blocpdb>    23 atoms in block     41
 Block first atom:    630
 Blocpdb>    14 atoms in block     42
 Block first atom:    653
 Blocpdb>    16 atoms in block     43
 Block first atom:    667
 Blocpdb>    14 atoms in block     44
 Block first atom:    683
 Blocpdb>    21 atoms in block     45
 Block first atom:    697
 Blocpdb>    20 atoms in block     46
 Block first atom:    718
 Blocpdb>    11 atoms in block     47
 Block first atom:    738
 Blocpdb>    12 atoms in block     48
 Block first atom:    749
 Blocpdb>    17 atoms in block     49
 Block first atom:    761
 Blocpdb>    13 atoms in block     50
 Block first atom:    778
 Blocpdb>    17 atoms in block     51
 Block first atom:    791
 Blocpdb>    16 atoms in block     52
 Block first atom:    808
 Blocpdb>    19 atoms in block     53
 Block first atom:    824
 Blocpdb>    17 atoms in block     54
 Block first atom:    843
 Blocpdb>    20 atoms in block     55
 Block first atom:    860
 Blocpdb>    18 atoms in block     56
 Block first atom:    880
 Blocpdb>    14 atoms in block     57
 Block first atom:    898
 Blocpdb>    11 atoms in block     58
 Block first atom:    912
 Blocpdb>    18 atoms in block     59
 Block first atom:    923
 Blocpdb>    16 atoms in block     60
 Block first atom:    941
 Blocpdb>    16 atoms in block     61
 Block first atom:    957
 Blocpdb>    16 atoms in block     62
 Block first atom:    973
 Blocpdb>    16 atoms in block     63
 Block first atom:    989
 Blocpdb>    12 atoms in block     64
 Block first atom:   1005
 Blocpdb>    15 atoms in block     65
 Block first atom:   1017
 Blocpdb>    17 atoms in block     66
 Block first atom:   1032
 Blocpdb>    17 atoms in block     67
 Block first atom:   1049
 Blocpdb>    14 atoms in block     68
 Block first atom:   1066
 Blocpdb>    15 atoms in block     69
 Block first atom:   1080
 Blocpdb>    16 atoms in block     70
 Block first atom:   1095
 Blocpdb>    13 atoms in block     71
 Block first atom:   1111
 Blocpdb>    15 atoms in block     72
 Block first atom:   1124
 Blocpdb>    17 atoms in block     73
 Block first atom:   1139
 Blocpdb>    16 atoms in block     74
 Block first atom:   1156
 Blocpdb>    11 atoms in block     75
 Block first atom:   1172
 Blocpdb>    13 atoms in block     76
 Block first atom:   1183
 Blocpdb>    16 atoms in block     77
 Block first atom:   1196
 Blocpdb>    13 atoms in block     78
 Block first atom:   1212
 Blocpdb>    14 atoms in block     79
 Block first atom:   1225
 Blocpdb>    17 atoms in block     80
 Block first atom:   1239
 Blocpdb>    15 atoms in block     81
 Block first atom:   1256
 Blocpdb>    19 atoms in block     82
 Block first atom:   1271
 Blocpdb>    15 atoms in block     83
 Block first atom:   1290
 Blocpdb>    15 atoms in block     84
 Block first atom:   1305
 Blocpdb>    18 atoms in block     85
 Block first atom:   1320
 Blocpdb>    20 atoms in block     86
 Block first atom:   1338
 Blocpdb>    15 atoms in block     87
 Block first atom:   1358
 Blocpdb>    15 atoms in block     88
 Block first atom:   1373
 Blocpdb>    17 atoms in block     89
 Block first atom:   1388
 Blocpdb>    20 atoms in block     90
 Block first atom:   1405
 Blocpdb>    14 atoms in block     91
 Block first atom:   1425
 Blocpdb>    17 atoms in block     92
 Block first atom:   1439
 Blocpdb>     9 atoms in block     93
 Block first atom:   1456
 Blocpdb>    10 atoms in block     94
 Block first atom:   1465
 Blocpdb>    11 atoms in block     95
 Block first atom:   1475
 Blocpdb>    14 atoms in block     96
 Block first atom:   1486
 Blocpdb>    11 atoms in block     97
 Block first atom:   1500
 Blocpdb>    15 atoms in block     98
 Block first atom:   1511
 Blocpdb>    16 atoms in block     99
 Block first atom:   1526
 Blocpdb>    14 atoms in block    100
 Block first atom:   1542
 Blocpdb>    18 atoms in block    101
 Block first atom:   1556
 Blocpdb>    13 atoms in block    102
 Block first atom:   1574
 Blocpdb>     9 atoms in block    103
 Block first atom:   1587
 Blocpdb>    14 atoms in block    104
 Block first atom:   1596
 Blocpdb>    13 atoms in block    105
 Block first atom:   1610
 Blocpdb>    17 atoms in block    106
 Block first atom:   1623
 Blocpdb>    15 atoms in block    107
 Block first atom:   1640
 Blocpdb>    17 atoms in block    108
 Block first atom:   1655
 Blocpdb>    17 atoms in block    109
 Block first atom:   1672
 Blocpdb>    17 atoms in block    110
 Block first atom:   1689
 Blocpdb>    15 atoms in block    111
 Block first atom:   1706
 Blocpdb>    16 atoms in block    112
 Block first atom:   1721
 Blocpdb>    19 atoms in block    113
 Block first atom:   1737
 Blocpdb>    18 atoms in block    114
 Block first atom:   1756
 Blocpdb>    15 atoms in block    115
 Block first atom:   1774
 Blocpdb>    14 atoms in block    116
 Block first atom:   1789
 Blocpdb>    14 atoms in block    117
 Block first atom:   1803
 Blocpdb>    18 atoms in block    118
 Block first atom:   1817
 Blocpdb>    13 atoms in block    119
 Block first atom:   1835
 Blocpdb>    17 atoms in block    120
 Block first atom:   1848
 Blocpdb>    16 atoms in block    121
 Block first atom:   1865
 Blocpdb>    10 atoms in block    122
 Block first atom:   1881
 Blocpdb>    17 atoms in block    123
 Block first atom:   1891
 Blocpdb>    17 atoms in block    124
 Block first atom:   1908
 Blocpdb>    14 atoms in block    125
 Block first atom:   1925
 Blocpdb>    17 atoms in block    126
 Block first atom:   1939
 Blocpdb>    10 atoms in block    127
 Block first atom:   1956
 Blocpdb>    12 atoms in block    128
 Block first atom:   1966
 Blocpdb>    17 atoms in block    129
 Block first atom:   1978
 Blocpdb>    16 atoms in block    130
 Block first atom:   1995
 Blocpdb>    16 atoms in block    131
 Block first atom:   2011
 Blocpdb>    16 atoms in block    132
 Block first atom:   2027
 Blocpdb>    18 atoms in block    133
 Block first atom:   2043
 Blocpdb>    23 atoms in block    134
 Block first atom:   2061
 Blocpdb>    15 atoms in block    135
 Block first atom:   2084
 Blocpdb>    20 atoms in block    136
 Block first atom:   2099
 Blocpdb>    16 atoms in block    137
 Block first atom:   2119
 Blocpdb>    16 atoms in block    138
 Block first atom:   2135
 Blocpdb>    14 atoms in block    139
 Block first atom:   2151
 Blocpdb>    17 atoms in block    140
 Block first atom:   2165
 Blocpdb>    14 atoms in block    141
 Block first atom:   2182
 Blocpdb>    14 atoms in block    142
 Block first atom:   2196
 Blocpdb>    17 atoms in block    143
 Block first atom:   2210
 Blocpdb>    16 atoms in block    144
 Block first atom:   2227
 Blocpdb>    13 atoms in block    145
 Block first atom:   2243
 Blocpdb>    17 atoms in block    146
 Block first atom:   2256
 Blocpdb>    21 atoms in block    147
 Block first atom:   2273
 Blocpdb>    20 atoms in block    148
 Block first atom:   2294
 Blocpdb>    14 atoms in block    149
 Block first atom:   2314
 Blocpdb>    18 atoms in block    150
 Block first atom:   2328
 Blocpdb>    15 atoms in block    151
 Block first atom:   2346
 Blocpdb>    11 atoms in block    152
 Block first atom:   2360

 Blocpdb>   152 blocks.

 Blocpdb> At most,     23 atoms in each of them.
 Blocpdb> At least,     9 atoms in each of them.

 Blocpdb> Normal end of Blocpdb.

 Diagrtb> Memory allocation for Prepmat.
 Diagrtb> Memory allocation for RTB.
 Diagrtb> Memory allocation for Diagstd.
 Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes.

 Prepmat> Entering in.
 Prepmat> Rewriting of the matrix begins.

 Prepmat>       853463 matrix lines read.

 Prepmat> Matrix order    =       7113

 Prepmat> Matrix trace    =    1864900.0000
 Prepmat> Last element read:    7113   7113       240.2939
 Prepmat>        11629 lines saved.
 Prepmat>        10091 empty lines.
 Prepmat> Number of lines on output is as expected.
 Prepmat> Normal end of Prepmat.

 RTB> Entering in.
 RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file:  2371
 RTB> Total mass =        2371.0000
 RTB> Number of atoms found in matrix:  2371
 RTB> Number of blocks =   152
 RTB> Projection begins.
 RTB> Projected matrix is being saved.
 RTB> Projected matrix trace =  199586.9383
 RTB>     53052 non-zero elements.
 RTB> Normal end of RTB.

 Diagstd> Entering in.

 Openam> file on opening on unit     10:
 diagrtb_work.sdijb                      
 Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb                      
 Diagstd> CERFACS matrix format.
 Diagstd> Projected matrix order =      912
 Diagstd> Nb of non-zero elements:    53052
 Diagstd> Projected matrix trace =  199586.9383

 Openam> file on opening on unit     11:
 diagrtb_work.eigenfacs                  
 Diagstd> Diagonalization.

 Diagstd>    912 eigenvectors are computed. 
 Diagstd>    106 of them to be saved. 

 Diagstd> Sum of eigenvalues = 199586.9383
 Diagstd> Best zero-eigenvalue found  :     0.000000

 Diagstd>      6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to:    0.0000000

 Diagstd> Selected eigenvalues: 
      0.0000000      0.0000000      0.0000000      0.0000000      0.0000000
      0.0000000      0.2868335      0.3655615      0.7624666      1.3473794
      1.5211993      2.1639316      2.4118036      3.5012381      3.6365225
      4.6010020      5.3500948      5.8740084      7.3489984      8.9466942
      9.2928500     11.1841560     11.5073982     12.8787894     14.0945624
     14.8441580     15.8825473     16.5694025     17.7581936     18.3140010
     19.2224335     20.0885956     20.7796745     21.9215197     22.6663527
     24.3370055     24.8118308     25.7346280     26.4784728     27.4279212
     27.9283691     29.5625986     29.9079992     30.2407315     31.3527804
     32.1325105     32.6952904     33.2074557     33.5561370     34.3863730
     35.0598153     35.1832647     36.1310791     36.5688948     37.2377149
     38.2480306     38.6336548     39.8949084     40.2457973     40.8931144
     40.9770867     41.3774297     42.6116566     43.0624945     43.4962885
     43.6473233     44.5472036     44.9708623     45.2257264     45.9937979
     46.7261632     47.4023690     48.4754704     49.0024455     49.1928948
     50.6062132     50.9937510     51.0741966     51.6640566     52.6221031
     53.0490260     53.6472259     54.9178799     55.1582103     55.3892596
     55.5980134     56.5783507     56.8180284     57.7762771     57.9041699
     59.0588360     59.2230747     59.8118312     60.8845515     61.1850919
     63.0020676     63.3627099     63.5686934     63.8227132     64.6622201
     65.5348478     65.9371897     66.6707957     67.7389155     68.4293242
     68.4415911

 Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units):
      0.0034311      0.0034335      0.0034336      0.0034347      0.0034352
      0.0034358     58.1580974     65.6561659     94.8212523    126.0492392
    133.9332300    159.7412385    168.6421961    203.1917655    207.0801243
    232.9278897    251.1747723    263.1858665    294.3807163    324.8078953
    331.0318220    363.1590641    368.3696580    389.7021494    407.6815704
    418.3820701    432.7682181    442.0269044    457.6091227    464.7152203
    476.1014059    486.7097753    495.0107722    508.4293460    516.9947128
    535.7088866    540.9095958    550.8764763    558.7811491    568.7111285
    573.8760071    590.4275085    593.8666822    597.1609856    608.0416242
    615.5560576    620.9231894    625.7676118    629.0443412    636.7786083
    642.9838909    644.1149037    652.7332661    656.6760812    662.6539503
    671.5831938    674.9602201    685.8892821    688.8989897    694.4170475
    695.1296598    698.5170884    708.8583987    712.5984483    716.1786668
    717.4210047    724.7788370    728.2171250    730.2777284    736.4527977
    742.2929590    747.6447770    756.0600599    760.1585021    761.6342581
    772.4977102    775.4499275    776.0613455    780.5298777    787.7336191
    790.9226041    795.3694668    804.7336497    806.4925565    808.1799284
    809.7014506    816.8088264    818.5370842    825.4106296    826.3236831
    834.5218685    835.6814378    839.8250602    847.3226889    849.4114066
    861.9313585    864.3948125    865.7986866    867.5268233    873.2137910
    879.0861300    881.7805128    886.6722151    893.7465945    898.2896709
    898.3701826

 Diagstd> Normal end.

 Rtb_to_modes> Entering in.

 Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file =   2371
 Rtb_to_modes> Number of blocs =    152

 Openam> file on opening on unit     10:
 diagrtb_work.eigenfacs                  

 Openam> file on opening on unit     11:
 matrix.eigenrtb                         

 Rdmodfacs> Entering in.

 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     1
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  9.9835E-10

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     2
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  9.9975E-10

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     3
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  9.9978E-10

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     4
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  1.0004E-09

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     5
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  1.0007E-09

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     6
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  1.0011E-09

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     7
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  0.2868    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     8
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  0.3656    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     9
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  0.7625    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    10
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   1.347    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    11
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   1.521    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    12
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   2.164    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    13
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   2.412    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    14
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   3.501    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    15
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   3.637    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    16
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   4.601    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    17
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   5.350    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    18
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   5.874    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    19
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   7.349    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    20
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   8.947    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    21
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   9.293    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    22
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   11.18    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    23
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   11.51    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    24
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   12.88    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    25
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   14.09    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    26
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   14.84    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    27
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   15.88    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    28
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   16.57    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    29
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   17.76    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    30
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   18.31    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    31
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   19.22    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    32
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   20.09    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    33
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   20.78    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    34
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   21.92    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    35
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   22.67    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    36
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   24.34    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    37
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   24.81    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    38
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   25.73    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    39
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   26.48    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    40
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   27.43    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    41
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   27.93    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    42
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   29.56    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    43
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   29.91    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    44
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   30.24    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    45
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   31.35    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    46
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   32.13    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    47
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   32.70    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    48
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   33.21    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    49
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   33.56    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    50
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   34.39    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    51
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   35.06    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    52
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   35.18    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    53
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   36.13    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    54
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   36.57    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    55
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   37.24    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    56
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   38.25    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    57
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   38.63    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    58
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   39.89    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    59
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   40.25    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    60
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   40.89    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    61
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   40.98    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    62
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   41.38    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    63
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   42.61    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    64
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   43.06    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    65
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   43.50    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    66
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   43.65    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    67
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   44.55    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    68
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   44.97    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    69
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   45.23    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    70
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   45.99    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    71
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   46.73    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    72
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   47.40    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    73
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   48.48    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    74
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   49.00    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    75
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   49.19    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    76
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   50.61    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    77
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   50.99    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    78
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   51.07    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    79
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   51.66    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    80
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   52.62    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    81
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   53.05    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    82
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   53.65    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    83
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   54.92    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    84
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   55.16    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    85
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   55.39    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    86
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   55.60    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    87
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   56.58    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    88
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   56.82    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    89
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   57.78    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    90
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   57.90    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    91
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   59.06    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    92
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   59.22    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    93
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   59.81    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    94
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   60.88    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    95
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   61.19    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    96
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   63.00    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    97
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   63.36    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    98
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   63.57    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    99
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   63.82    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   100
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   64.66    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   101
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   65.53    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   102
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   65.94    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   103
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   66.67    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   104
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   67.74    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   105
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   68.43    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   106
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   68.44    

 Rtb_to_modes>  106 vectors, with    912 coordinates in vector file.

 Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected):
 1.00000 1.00000 1.00000 0.99998 0.99999
 1.00000 0.99999 0.99999 0.99997 0.99998
 0.99999 1.00000 1.00000 1.00002 0.99999
 1.00000 1.00002 0.99999 1.00001 0.99999
 0.99999 0.99999 0.99999 1.00000 0.99999
 1.00001 1.00001 0.99999 1.00004 1.00000
 1.00000 1.00001 1.00000 0.99998 1.00000
 1.00003 1.00002 0.99998 0.99996 0.99999
 1.00002 0.99999 1.00001 1.00001 1.00002
 1.00001 1.00002 1.00001 1.00000 1.00001
 1.00000 0.99998 0.99999 1.00002 0.99999
 0.99999 1.00000 1.00000 1.00001 1.00000
 0.99999 1.00000 0.99999 1.00000 1.00003
 0.99999 1.00001 0.99999 1.00001 0.99997
 1.00001 1.00002 0.99997 0.99998 1.00000
 1.00001 0.99996 1.00000 1.00001 0.99999
 1.00001 1.00000 1.00001 0.99999 0.99998
 0.99998 1.00001 0.99998 1.00001 1.00000
 0.99999 1.00000 0.99998 0.99999 0.99999
 1.00000 1.00001 1.00000 1.00000 0.99998
 0.99999 1.00000 1.00002 1.00001 1.00002
 1.00001

 Rtb_to_modes> RTB block-file is being read.
 Rtb_to_modes>    42678 lines found in RTB file.

 Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected):
 1.00000 1.00000 1.00000 0.99998 0.99999
 1.00000 0.99999 0.99999 0.99997 0.99998
 0.99999 1.00000 1.00000 1.00002 0.99999
 1.00000 1.00002 0.99999 1.00001 0.99999
 0.99999 0.99999 0.99999 1.00000 0.99999
 1.00001 1.00001 0.99999 1.00004 1.00000
 1.00000 1.00001 1.00000 0.99998 1.00000
 1.00003 1.00002 0.99998 0.99996 0.99999
 1.00002 0.99999 1.00001 1.00001 1.00002
 1.00001 1.00002 1.00001 1.00000 1.00001
 1.00000 0.99998 0.99999 1.00002 0.99999
 0.99999 1.00000 1.00000 1.00001 1.00000
 0.99999 1.00000 0.99999 1.00000 1.00003
 0.99999 1.00001 0.99999 1.00001 0.99997
 1.00001 1.00002 0.99997 0.99998 1.00000
 1.00001 0.99996 1.00000 1.00001 0.99999
 1.00001 1.00000 1.00001 0.99999 0.99998
 0.99998 1.00001 0.99998 1.00001 1.00000
 0.99999 1.00000 0.99998 0.99999 0.99999
 1.00000 1.00001 1.00000 1.00000 0.99998
 0.99999 1.00000 1.00002 1.00001 1.00002
 1.00001

 Orthogonality of first eigenvectors (zero expected):
 Vector   2:-0.000
 Vector   3:-0.000 0.000
 Vector   4:-0.000 0.000-0.000
 Vector   5: 0.000-0.000 0.000 0.000
 Vector   6:-0.000-0.000-0.000 0.000-0.000
 Vector   7:-0.000-0.000 0.000 0.000-0.000-0.000
 Vector   8: 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000-0.000
 Vector   9:-0.000-0.000 0.000 0.000-0.000 0.000 0.000-0.000
 Vector  10: 0.000 0.000 0.000 0.000-0.000-0.000 0.000 0.000-0.000

 Rtb_to_modes>   106 eigenvectors saved.

 Rtb_to_modes> Normal end.

 Diagrtb> Normal end.
B-factor analysis
 Bfactors> Version 1.22, Bordeaux.                
 Getnam> Eigenvector filename ?
 Getnam> 2602190048483367751.eigenfacs

 Openam> file on opening on unit     10:
 2602190048483367751.eigenfacs                                   
 Getnam> Corresponding pdb filename ?
 Getnam> 2602190048483367751.atom

 Openam> file on opening on unit     11:
 2602190048483367751.atom                                        
 Getnum> Number of skipped eigenvectors ?
 Getnum>            0
 Getnum> Number of usefull eigenvectors ?
 Getnum>        10000
%Getnum-Err: number larger than    106 This is not allowed. Sorry.

 Rdatompdb> Reading pdb file.
 Rdatompdb> End of file reached.
 Rdatompdb> Number of I/O errors:            0

 Rdatompdb> Number of residues found =    303
            First residue number     =     -4
            Last  residue number     =    298
            Number of atoms found    =   2371
            Mean number per residue  =      7.8

 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     1
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  9.9835E-10

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     2
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  9.9975E-10

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     3
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  9.9978E-10

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     4
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  1.0004E-09

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     5
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  1.0007E-09

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     6
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  1.0011E-09

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     7
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  0.2868    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     8
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  0.3656    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     9
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  0.7625    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    10
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   1.347    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    11
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   1.521    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    12
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   2.164    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    13
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   2.412    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    14
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   3.501    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    15
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   3.637    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    16
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   4.601    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    17
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   5.350    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    18
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   5.874    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    19
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   7.349    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    20
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   8.947    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    21
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   9.293    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    22
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   11.18    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    23
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   11.51    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    24
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   12.88    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    25
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   14.09    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    26
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   14.84    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    27
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   15.88    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    28
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   16.57    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    29
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   17.76    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    30
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   18.31    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    31
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   19.22    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    32
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   20.09    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    33
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   20.78    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    34
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   21.92    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    35
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   22.67    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    36
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   24.34    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    37
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   24.81    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    38
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   25.73    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    39
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   26.48    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    40
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   27.43    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    41
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   27.93    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    42
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   29.56    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    43
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   29.91    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    44
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   30.24    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    45
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   31.35    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    46
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   32.13    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    47
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   32.70    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    48
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   33.21    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    49
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   33.56    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    50
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   34.39    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    51
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   35.06    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    52
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   35.18    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    53
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   36.13    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    54
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   36.57    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    55
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   37.24    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    56
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   38.25    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    57
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   38.63    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    58
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   39.89    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    59
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   40.25    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    60
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   40.89    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    61
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   40.98    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    62
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   41.38    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    63
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   42.61    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    64
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   43.06    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    65
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   43.50    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    66
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   43.65    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    67
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   44.55    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    68
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   44.97    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    69
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   45.23    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    70
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   45.99    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    71
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   46.73    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    72
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   47.40    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    73
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   48.48    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    74
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   49.00    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    75
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   49.19    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    76
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   50.61    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    77
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   50.99    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    78
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   51.07    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    79
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   51.66    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    80
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   52.62    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    81
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   53.05    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    82
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   53.65    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    83
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   54.92    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    84
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   55.16    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    85
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   55.39    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    86
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   55.60    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    87
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   56.58    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    88
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   56.82    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    89
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   57.78    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    90
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   57.90    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    91
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   59.06    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    92
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   59.22    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    93
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   59.81    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    94
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   60.88    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    95
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   61.19    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    96
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   63.00    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    97
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   63.36    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    98
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   63.57    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    99
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   63.82    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   100
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   64.66    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   101
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   65.53    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   102
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   65.94    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   103
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   66.67    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   104
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   67.74    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   105
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   68.43    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   106
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   68.44    

 Bfactors>  106 vectors,   7113 coordinates in file.

 Openam> file on opening on unit     12:
 bfactors.pred                                                   

 Bfactors> Best zero-eigenvalue found  :     0.000000
 Bfactors>     6 eigenvalues less than :     0.000000
 Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue  :     0.286800
 Bfactors>   100 eigenvectors will be considered.
 Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped.

 Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed.
          (CHARMM units assumed for eigenvalues)

 Bfactors> Correlation=      0.268 for    303 C-alpha atoms.
 Bfactors> =      0.087 +/-   0.11
 Bfactors> =     24.560 +/-   5.99
 Bfactors> Shiftng-fct=     24.474
 Bfactors> Scaling-fct=     53.864

 Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved.

 Bfactors> Normal end.
check_modes
 Chkmod> Version 1.00, Bordeaux.                
 Getnam> Eigenvector filename ?
 Getnam> 2602190048483367751.eigenfacs

 Openam> file on opening on unit     10:
 2602190048483367751.eigenfacs                                   

 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     1
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:  3.4310E-03

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     2
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:  3.4334E-03

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     3
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:  3.4334E-03

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     4
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:  3.4345E-03

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     5
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:  3.4350E-03

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     6
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:  3.4357E-03

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     7
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   58.15    

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 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   656.7    

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 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    57
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   674.9    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    58
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   685.8    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    59
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   688.9    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    60
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   694.4    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    61
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   695.1    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    62
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   698.5    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    63
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   708.8    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    64
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   712.5    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    65
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   716.2    

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 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   717.4    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    67
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   724.8    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    68
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   728.2    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    69
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   730.3    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    70
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   736.4    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    71
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 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    72
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   747.6    

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 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   756.1    

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 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   760.1    

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 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    76
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 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   775.4    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    78
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   776.0    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    79
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   780.5    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    80
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   787.7    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    81
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   790.9    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    82
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   795.4    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    83
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   804.7    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    84
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   806.5    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    85
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   808.2    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    86
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   809.7    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    87
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   816.8    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    88
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   818.5    

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 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   825.4    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    90
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   826.3    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    91
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   834.5    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    92
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   835.6    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    93
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   839.8    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    94
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   847.3    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    95
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   849.4    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    96
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   861.9    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    97
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   864.3    

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 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   867.5    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   100
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   873.2    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   101
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   879.0    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   102
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   881.8    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   103
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   886.6    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   104
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   893.7    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   105
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   898.3    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   106
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   898.3    

 Chkmod>  106 vectors,   7113 coordinates in file.
 Chkmod>      That is:   2371 cartesian points.

 Openam> file on opening on unit     11:
 Chkmod.res                                                      
 Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file.

 Chkmod> Normal end.
      0.0034      0.7278
      0.0034      0.8827
      0.0034      0.6872
      0.0034      0.9024
      0.0034      0.9679
      0.0034      0.8241
     58.1522      0.6045
     65.6568      0.6283
     94.8193      0.5466
    126.0261      0.2352
    133.9187      0.2402
    159.7369      0.4912
    168.6418      0.3908
    203.1761      0.6323
    207.0848      0.7858
    232.9178      0.4718
    251.1618      0.0941
    263.1744      0.4413
    294.3681      0.6138
    324.7995      0.6673
    331.0203      0.2145
    363.0760      0.5305
    368.3955      0.3877
    389.7037      0.3750
    407.5981      0.3509
    418.3055      0.1587
    432.7149      0.3518
    442.0159      0.5272
    457.6128      0.5111
    464.6445      0.5558
    476.0508      0.3316
    486.7059      0.1138
    494.9934      0.3818
    508.3899      0.3184
    517.0141      0.4748
    535.7188      0.3429
    540.8664      0.2824
    550.8033      0.2367
    558.7733      0.3142
    568.7083      0.3757
    573.8681      0.2557
    590.3762      0.2559
    593.8611      0.3596
    597.1281      0.5368
    607.9886      0.4828
    615.5056      0.3347
    620.9413      0.3356
    625.7647      0.2487
    629.0535      0.4230
    636.7849      0.1522
    642.9580      0.3748
    644.0574      0.3725
    652.6955      0.2903
    656.6578      0.5109
    662.6458      0.4530
    671.5717      0.3160
    674.8993      0.4332
    685.8176      0.2977
    688.9054      0.3353
    694.3608      0.1889
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    736.3908      0.4359
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    756.0629      0.2463
    760.1069      0.3709
    761.5792      0.4156
    772.4934      0.4860
    775.3881      0.3062
    775.9961      0.5762
    780.4657      0.4029
    787.6841      0.3598
    790.8959      0.4465
    795.3559      0.4932
    804.7146      0.4697
    806.4710      0.3862
    808.1506      0.5872
    809.6812      0.4294
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    818.5161      0.4427
    825.4018      0.4663
    826.2585      0.3304
    834.4943      0.4141
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    839.7762      0.2866
    847.2546      0.4731
    849.4090      0.4421
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    893.7154      0.4970
    898.2555      0.4085
    898.3212      0.3124
getting mode 7
running: ../../bin/get_modes.sh 2602190048483367751 7 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 7
calculating perturbed structure for DQ=-100
2602190048483367751.eigenfacs
2602190048483367751.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2602190048483367751.eigenfacs
2602190048483367751.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2602190048483367751.eigenfacs
2602190048483367751.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2602190048483367751.eigenfacs
2602190048483367751.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2602190048483367751.eigenfacs
2602190048483367751.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2602190048483367751.eigenfacs
2602190048483367751.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
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MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
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making thumbnail 100x100
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MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
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making thumbnail 100x100
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MODEL 1 will be plotted
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making thumbnail 100x100
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getting mode 8
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MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
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making thumbnail 100x100
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making thumbnail 100x100
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making thumbnail 100x100
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making animated gif 300x300
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MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
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making animated gif 300x300
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MODEL 7 will be plotted
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making thumbnail 100x100
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getting mode 10
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MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
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making thumbnail 100x100
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making animated gif 300x300
11 models are in 2602190048483367751.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2602190048483367751.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 11
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MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
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MODEL 1 will be plotted
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MODEL 7 will be plotted
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MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
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2602190048483367751.9.pdb



STDERR:
Note: The following floating-point exceptions are signalling: IEEE_DENORMAL

real	0m10.607s
user	0m10.532s
sys	0m0.068s
rm: cannot remove '2602190048483367751.sdijf': No such file or directory
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pstopnm: Writing ppmraw format
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pstopnm: Writing ppmraw format
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pstopnm: Writing ppmraw format
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K. Suhre & Y.H. Sanejouand, ElNemo: a normal mode web-server for protein movement analysis and the generation of templates for molecular replacement. Nucleic Acids Research, 32, W610-W614, 2004.
K. Suhre & Y.H. Sanejouand, On the potential of normal mode analysis for solving difficult molecular replacement problems. Acta Cryst. D vol.60, p796-799, 2004 © International Union of Crystallography.
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*** Amanda Kang ***

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* Amanda Kang *
