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* TRANSPORT PROTEIN 17-DEC-20 7L2L *

LOGs for ID: 2602200446423711017

Output from eigenvector calculation:


STDOUT:

CUTOFF set to default value (CUTOFF=8)
Build Tirion matrix:
 Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model.
 Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004.    

 Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file.

 Pdbmat> Coordinate filename     = 2602200446423711017.atom

 Pdbmat> Distance cutoff         =       8.00
         Force constant          =      10.00
         Origin of mass values   =       CONS
 Pdbmat> Levelshift              =    1.0E-09
         PRINTing level          =          2

 Pdbmat> Coordinate file 2602200446423711017.atom to be opened.

 Openam> File opened: 2602200446423711017.atom

 Pdbmat> Coordinate file in PDB format.

 Rdatompdb> Reading pdb file.
 Rdatompdb> End of file reached.
 Rdatompdb> Number of I/O errors:      0

 Rdatompdb> Number of residues found =    429
            First residue number     =    283
            Last  residue number     =    746
            Number of atoms found    =   3517
            Mean number per residue  =      8.2

 Pdbmat> Coordinate statistics: 
 =   122.233408 +/-    15.729051 From:    93.014000 To:   164.484000
 =   154.219737 +/-     9.740253 From:   125.376000 To:   176.529000
 =   145.930597 +/-    22.305905 From:   103.921000 To:   192.308000
 Pdbmat> Masses are all set to one.

 Openam> File opened: pdbmat.xyzm
 Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved.

 Openam> File opened: pdbmat.sdijb

 Pdbmat> Matrix statistics:

 Pdbmat> The matrix is   2.2263 % Filled.
 Pdbmat>      1239290  non-zero elements.
 Pdbmat>       135382 atom-atom interactions.

 Pdbmat> Number per atom=     76.99 +/-     21.57
         Maximum number =    130
         Minimum number =     10

 Pdbmat> Matrix trace   = 2.707640E+06
 Pdbmat> Larger element =  510.172    
 Pdbmat>      0 elements larger than +/-  1.0E+10

 Pdbmat> Normal end.
automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1)
429 non-zero elements, NRBL set to 3
Diagonalize Tirion matrix using diagrtb
 Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation.
 Diagrtb> Version 2.52, November 2004. 
 Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file.

 Diagrtb> Options taken into account:

 MATRix filename          = pdbmat.sdijb
 COORdinates filename     = 2602200446423711017.atom
 Eigenvector OUTPut file  = matrix.eigenrtb
 Nb of VECTors required   =        106
 EigeNVALues chosen       =       LOWE
 Type of SUBStructuring   =       NONE
 Nb of residues per BLOck =          3
 Origin of MASS values    =       CONS
 MATRix FORMat            =       BINA
 Temporary files cleaning =       ALL 
 Output PRINting level    =          2

 Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb.

 Blocpdb> Entering in.

 Openam> file on opening on unit     10:
 diagrtb_work.xyzm   

 Blocpdb> Coordinate file 2602200446423711017.atom to be opened.

 Openam> file on opening on unit     11:
 2602200446423711017.atom                                                                                                        

 Blocpdb> Coordinate file in PDB format.

 Blocpdb>  3517 atoms picked in pdb file.
 Blocpdb>   All masses set to unity.
 Blocpdb> Coordinate file is rewritten.

 Blocpdb> Substructuring:
 Blocpdb>     3 residue(s) per block.
 Blocpdb>   429 residues.
 Blocpdb>    19 atoms in block      1
 Block first atom:      1
 Blocpdb>    22 atoms in block      2
 Block first atom:     20
 Blocpdb>    23 atoms in block      3
 Block first atom:     42
 Blocpdb>    23 atoms in block      4
 Block first atom:     65
 Blocpdb>    21 atoms in block      5
 Block first atom:     88
 Blocpdb>    22 atoms in block      6
 Block first atom:    109
 Blocpdb>    24 atoms in block      7
 Block first atom:    131
 Blocpdb>    25 atoms in block      8
 Block first atom:    155
 Blocpdb>    26 atoms in block      9
 Block first atom:    180
 Blocpdb>    25 atoms in block     10
 Block first atom:    206
 Blocpdb>    24 atoms in block     11
 Block first atom:    231
 Blocpdb>    18 atoms in block     12
 Block first atom:    255
 Blocpdb>    25 atoms in block     13
 Block first atom:    273
 Blocpdb>    24 atoms in block     14
 Block first atom:    298
 Blocpdb>    26 atoms in block     15
 Block first atom:    322
 Blocpdb>    23 atoms in block     16
 Block first atom:    348
 Blocpdb>    24 atoms in block     17
 Block first atom:    371
 Blocpdb>    22 atoms in block     18
 Block first atom:    395
 Blocpdb>    21 atoms in block     19
 Block first atom:    417
 Blocpdb>    16 atoms in block     20
 Block first atom:    438
 Blocpdb>    19 atoms in block     21
 Block first atom:    454
 Blocpdb>    19 atoms in block     22
 Block first atom:    473
 Blocpdb>    25 atoms in block     23
 Block first atom:    492
 Blocpdb>    25 atoms in block     24
 Block first atom:    517
 Blocpdb>    28 atoms in block     25
 Block first atom:    542
 Blocpdb>    26 atoms in block     26
 Block first atom:    570
 Blocpdb>    26 atoms in block     27
 Block first atom:    596
 Blocpdb>    24 atoms in block     28
 Block first atom:    622
 Blocpdb>    31 atoms in block     29
 Block first atom:    646
 Blocpdb>    30 atoms in block     30
 Block first atom:    677
 Blocpdb>    21 atoms in block     31
 Block first atom:    707
 Blocpdb>    24 atoms in block     32
 Block first atom:    728
 Blocpdb>    20 atoms in block     33
 Block first atom:    752
 Blocpdb>    28 atoms in block     34
 Block first atom:    772
 Blocpdb>    20 atoms in block     35
 Block first atom:    800
 Blocpdb>    21 atoms in block     36
 Block first atom:    820
 Blocpdb>    26 atoms in block     37
 Block first atom:    841
 Blocpdb>    21 atoms in block     38
 Block first atom:    867
 Blocpdb>    24 atoms in block     39
 Block first atom:    888
 Blocpdb>    23 atoms in block     40
 Block first atom:    912
 Blocpdb>    21 atoms in block     41
 Block first atom:    935
 Blocpdb>    22 atoms in block     42
 Block first atom:    956
 Blocpdb>    29 atoms in block     43
 Block first atom:    978
 Blocpdb>    24 atoms in block     44
 Block first atom:   1007
 Blocpdb>    23 atoms in block     45
 Block first atom:   1031
 Blocpdb>    27 atoms in block     46
 Block first atom:   1054
 Blocpdb>    25 atoms in block     47
 Block first atom:   1081
 Blocpdb>    31 atoms in block     48
 Block first atom:   1106
 Blocpdb>    30 atoms in block     49
 Block first atom:   1137
 Blocpdb>    27 atoms in block     50
 Block first atom:   1167
 Blocpdb>    31 atoms in block     51
 Block first atom:   1194
 Blocpdb>    30 atoms in block     52
 Block first atom:   1225
 Blocpdb>    30 atoms in block     53
 Block first atom:   1255
 Blocpdb>    26 atoms in block     54
 Block first atom:   1285
 Blocpdb>    24 atoms in block     55
 Block first atom:   1311
 Blocpdb>    23 atoms in block     56
 Block first atom:   1335
 Blocpdb>    22 atoms in block     57
 Block first atom:   1358
 Blocpdb>    30 atoms in block     58
 Block first atom:   1380
 Blocpdb>    20 atoms in block     59
 Block first atom:   1410
 Blocpdb>    22 atoms in block     60
 Block first atom:   1430
 Blocpdb>    29 atoms in block     61
 Block first atom:   1452
 Blocpdb>    24 atoms in block     62
 Block first atom:   1481
 Blocpdb>    19 atoms in block     63
 Block first atom:   1505
 Blocpdb>    34 atoms in block     64
 Block first atom:   1524
 Blocpdb>    18 atoms in block     65
 Block first atom:   1558
 Blocpdb>    25 atoms in block     66
 Block first atom:   1576
 Blocpdb>    19 atoms in block     67
 Block first atom:   1601
 Blocpdb>    15 atoms in block     68
 Block first atom:   1620
 Blocpdb>    34 atoms in block     69
 Block first atom:   1635
 Blocpdb>    26 atoms in block     70
 Block first atom:   1669
 Blocpdb>    29 atoms in block     71
 Block first atom:   1695
 Blocpdb>    28 atoms in block     72
 Block first atom:   1724
 Blocpdb>    29 atoms in block     73
 Block first atom:   1752
 Blocpdb>    23 atoms in block     74
 Block first atom:   1781
 Blocpdb>    25 atoms in block     75
 Block first atom:   1804
 Blocpdb>    21 atoms in block     76
 Block first atom:   1829
 Blocpdb>    27 atoms in block     77
 Block first atom:   1850
 Blocpdb>    27 atoms in block     78
 Block first atom:   1877
 Blocpdb>    27 atoms in block     79
 Block first atom:   1904
 Blocpdb>    25 atoms in block     80
 Block first atom:   1931
 Blocpdb>    23 atoms in block     81
 Block first atom:   1956
 Blocpdb>    20 atoms in block     82
 Block first atom:   1979
 Blocpdb>    31 atoms in block     83
 Block first atom:   1999
 Blocpdb>    26 atoms in block     84
 Block first atom:   2030
 Blocpdb>    30 atoms in block     85
 Block first atom:   2056
 Blocpdb>    18 atoms in block     86
 Block first atom:   2086
 Blocpdb>    26 atoms in block     87
 Block first atom:   2104
 Blocpdb>    19 atoms in block     88
 Block first atom:   2130
 Blocpdb>    26 atoms in block     89
 Block first atom:   2149
 Blocpdb>    23 atoms in block     90
 Block first atom:   2175
 Blocpdb>    32 atoms in block     91
 Block first atom:   2198
 Blocpdb>    22 atoms in block     92
 Block first atom:   2230
 Blocpdb>    29 atoms in block     93
 Block first atom:   2252
 Blocpdb>    20 atoms in block     94
 Block first atom:   2281
 Blocpdb>    24 atoms in block     95
 Block first atom:   2301
 Blocpdb>    25 atoms in block     96
 Block first atom:   2325
 Blocpdb>    25 atoms in block     97
 Block first atom:   2350
 Blocpdb>    27 atoms in block     98
 Block first atom:   2375
 Blocpdb>    25 atoms in block     99
 Block first atom:   2402
 Blocpdb>    30 atoms in block    100
 Block first atom:   2427
 Blocpdb>    27 atoms in block    101
 Block first atom:   2457
 Blocpdb>    26 atoms in block    102
 Block first atom:   2484
 Blocpdb>    26 atoms in block    103
 Block first atom:   2510
 Blocpdb>    18 atoms in block    104
 Block first atom:   2536
 Blocpdb>    21 atoms in block    105
 Block first atom:   2554
 Blocpdb>    25 atoms in block    106
 Block first atom:   2575
 Blocpdb>     8 atoms in block    107
 Block first atom:   2600
 Blocpdb>    26 atoms in block    108
 Block first atom:   2608
 Blocpdb>    26 atoms in block    109
 Block first atom:   2634
 Blocpdb>    19 atoms in block    110
 Block first atom:   2660
 Blocpdb>    25 atoms in block    111
 Block first atom:   2679
 Blocpdb>    31 atoms in block    112
 Block first atom:   2704
 Blocpdb>    19 atoms in block    113
 Block first atom:   2735
 Blocpdb>    20 atoms in block    114
 Block first atom:   2754
 Blocpdb>    28 atoms in block    115
 Block first atom:   2774
 Blocpdb>    24 atoms in block    116
 Block first atom:   2802
 Blocpdb>    31 atoms in block    117
 Block first atom:   2826
 Blocpdb>    21 atoms in block    118
 Block first atom:   2857
 Blocpdb>    27 atoms in block    119
 Block first atom:   2878
 Blocpdb>    24 atoms in block    120
 Block first atom:   2905
 Blocpdb>    24 atoms in block    121
 Block first atom:   2929
 Blocpdb>    23 atoms in block    122
 Block first atom:   2953
 Blocpdb>    28 atoms in block    123
 Block first atom:   2976
 Blocpdb>    24 atoms in block    124
 Block first atom:   3004
 Blocpdb>    24 atoms in block    125
 Block first atom:   3028
 Blocpdb>    21 atoms in block    126
 Block first atom:   3052
 Blocpdb>    20 atoms in block    127
 Block first atom:   3073
 Blocpdb>    24 atoms in block    128
 Block first atom:   3093
 Blocpdb>    22 atoms in block    129
 Block first atom:   3117
 Blocpdb>    24 atoms in block    130
 Block first atom:   3139
 Blocpdb>    30 atoms in block    131
 Block first atom:   3163
 Blocpdb>    26 atoms in block    132
 Block first atom:   3193
 Blocpdb>    24 atoms in block    133
 Block first atom:   3219
 Blocpdb>    23 atoms in block    134
 Block first atom:   3243
 Blocpdb>    24 atoms in block    135
 Block first atom:   3266
 Blocpdb>    26 atoms in block    136
 Block first atom:   3290
 Blocpdb>    23 atoms in block    137
 Block first atom:   3316
 Blocpdb>    28 atoms in block    138
 Block first atom:   3339
 Blocpdb>    27 atoms in block    139
 Block first atom:   3367
 Blocpdb>    19 atoms in block    140
 Block first atom:   3394
 Blocpdb>    16 atoms in block    141
 Block first atom:   3413
 Blocpdb>    37 atoms in block    142
 Block first atom:   3429
 Blocpdb>    28 atoms in block    143
 Block first atom:   3466
 Blocpdb>    24 atoms in block    144
 Block first atom:   3493

 Blocpdb>   144 blocks.

 Blocpdb> At most,     37 atoms in each of them.
 Blocpdb> At least,     8 atoms in each of them.

 Blocpdb> Normal end of Blocpdb.

 Diagrtb> Memory allocation for Prepmat.
 Diagrtb> Memory allocation for RTB.
 Diagrtb> Memory allocation for Diagstd.
 Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes.

 Prepmat> Entering in.
 Prepmat> Rewriting of the matrix begins.

 Prepmat>      1239434 matrix lines read.

 Prepmat> Matrix order    =      10551

 Prepmat> Matrix trace    =    2707640.0000
 Prepmat> Last element read:   10551  10551       104.1232
 Prepmat>        10441 lines saved.
 Prepmat>         9196 empty lines.
 Prepmat> Number of lines on output is as expected.
 Prepmat> Normal end of Prepmat.

 RTB> Entering in.
 RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file:  3517
 RTB> Total mass =        3517.0000
 RTB> Number of atoms found in matrix:  3517
 RTB> Number of blocks =   144
 RTB> Projection begins.
 RTB> Projected matrix is being saved.
 RTB> Projected matrix trace =  167629.9819
 RTB>     42624 non-zero elements.
 RTB> Normal end of RTB.

 Diagstd> Entering in.

 Openam> file on opening on unit     10:
 diagrtb_work.sdijb                      
 Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb                      
 Diagstd> CERFACS matrix format.
 Diagstd> Projected matrix order =      864
 Diagstd> Nb of non-zero elements:    42624
 Diagstd> Projected matrix trace =  167629.9819

 Openam> file on opening on unit     11:
 diagrtb_work.eigenfacs                  
 Diagstd> Diagonalization.

 Diagstd>    864 eigenvectors are computed. 
 Diagstd>    106 of them to be saved. 

 Diagstd> Sum of eigenvalues = 167629.9819
 Diagstd> Best zero-eigenvalue found  :     0.000000

 Diagstd>      6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to:    0.0000000

 Diagstd> Selected eigenvalues: 
      0.0000000      0.0000000      0.0000000      0.0000000      0.0000000
      0.0000000      0.0441505      0.1316648      0.2928696      0.5777914
      0.6602822      0.8478202      1.2809586      1.7471513      2.7147312
      2.7700357      3.3247968      3.7839148      4.2399358      4.6573068
      5.3433425      5.7533753      7.2275012      7.5962231      8.0054461
      8.6515629      9.2946734      9.7039429     10.0462119     10.5924761
     10.6851075     10.8807813     10.9614170     11.9091853     12.6781703
     13.2075324     13.4876807     14.1035079     14.3333478     14.9533907
     15.3305210     15.6486378     16.0216201     17.0727774     17.4479004
     18.0322510     19.0120983     19.5774613     19.8340006     20.2519626
     20.5946791     21.0559373     21.6871141     21.9118225     22.3146285
     22.8525238     23.2804844     24.0789432     24.3553513     25.1367973
     25.4087555     25.8358606     26.1671005     26.9679475     27.0631973
     27.6642840     27.7824262     28.0370797     28.4147850     29.5416487
     30.5643897     31.2302042     31.9237131     32.0353296     32.5797178
     33.4454912     34.0035795     34.3846414     34.7004921     35.0214942
     35.8775266     36.3005750     36.6292701     37.5108974     38.1042688
     38.4666812     38.9851613     39.3342165     39.6546248     40.1785667
     40.7484186     42.0947780     42.9055169     43.0824277     43.3658925
     44.0667092     44.4192136     44.6114190     44.8113918     45.2776011
     45.4986073     45.6267557     46.5048017     47.3338535     48.1467234
     48.4142022

 Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units):
      0.0034335      0.0034338      0.0034339      0.0034342      0.0034346
      0.0034360     22.8172393     39.4030750     58.7668476     82.5431100
     88.2388969     99.9878319    122.9030989    143.5359008    178.9199211
    180.7332103    198.0057635    211.2350377    223.6016060    234.3487830
    251.0162196    260.4693533    291.9371513    299.2913295    307.2472816
    319.4056287    331.0642974    338.2746056    344.1885725    353.4223627
    354.9643428    358.1997851    359.5246144    374.7453967    386.6549463
    394.6445624    398.8080525    407.8109227    411.1204684    419.9186079
    425.1808906    429.5696104    434.6588184    448.6910106    453.5935467
    461.1266823    473.4894488    480.4779555    483.6157553    488.6848082
    492.8023778    498.2904571    505.7037368    508.3168791    512.9678074
    519.1135505    523.9517397    532.8610686    535.9107626    544.4402838
    547.3775446    551.9589076    555.4859539    563.9222457    564.9172444
    571.1563339    572.3746162    574.9918227    578.8519061    590.2182652
    600.3481059    606.8518669    613.5528529    614.6245151    619.8247859
    628.0063999    633.2243384    636.7625741    639.6804785    642.6323973
    650.4389314    654.2625056    657.2179443    665.0801824    670.3198751
    673.5000612    678.0238146    681.0524075    683.8206361    688.3233465
    693.1873994    704.5460624    711.2984289    712.7633566    715.1043579
    720.8594397    723.7368951    725.3010384    726.9248186    730.6964289
    732.4775726    733.5083718    740.5325946    747.1042575    753.4920051
    755.5821160

 Diagstd> Normal end.

 Rtb_to_modes> Entering in.

 Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file =   3517
 Rtb_to_modes> Number of blocs =    144

 Openam> file on opening on unit     10:
 diagrtb_work.eigenfacs                  

 Openam> file on opening on unit     11:
 matrix.eigenrtb                         

 Rdmodfacs> Entering in.

 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     1
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  9.9970E-10

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     2
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  9.9991E-10

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     3
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  9.9994E-10

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     4
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  1.0001E-09

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     5
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  1.0004E-09

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     6
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  1.0012E-09

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     7
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  4.4151E-02

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     8
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  0.1317    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     9
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  0.2929    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    10
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  0.5778    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    11
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  0.6603    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    12
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  0.8478    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    13
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   1.281    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    14
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   1.747    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    15
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   2.715    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    16
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   2.770    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    17
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   3.325    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    18
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   3.784    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    19
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   4.240    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    20
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   4.657    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    21
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   5.343    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    22
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   5.753    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    23
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   7.228    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    24
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   7.596    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    25
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   8.005    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    26
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   8.652    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    27
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   9.295    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    28
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   9.704    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    29
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   10.05    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    30
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   10.59    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    31
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   10.69    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    32
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   10.88    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    33
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   10.96    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    34
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   11.91    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    35
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   12.68    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    36
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   13.21    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    37
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   13.49    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    38
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   14.10    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    39
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   14.33    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    40
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   14.95    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    41
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   15.33    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    42
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   15.65    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    43
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   16.02    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    44
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   17.07    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    45
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   17.45    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    46
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   18.03    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    47
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   19.01    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    48
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   19.58    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    49
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   19.83    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    50
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   20.25    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    51
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   20.59    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    52
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   21.06    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    53
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   21.69    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    54
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   21.91    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    55
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   22.31    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    56
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   22.85    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    57
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   23.28    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    58
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   24.08    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    59
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   24.36    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    60
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   25.14    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    61
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   25.41    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    62
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   25.84    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    63
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   26.17    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    64
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   26.97    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    65
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   27.06    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    66
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   27.66    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    67
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   27.78    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    68
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   28.04    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    69
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   28.41    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    70
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   29.54    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    71
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   30.56    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    72
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   31.23    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    73
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   31.92    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    74
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   32.04    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    75
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   32.58    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    76
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   33.45    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    77
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   34.00    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    78
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   34.38    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    79
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   34.70    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    80
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   35.02    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    81
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   35.88    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    82
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   36.30    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    83
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   36.63    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    84
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   37.51    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    85
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   38.10    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    86
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   38.47    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    87
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   38.99    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    88
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   39.33    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    89
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   39.65    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    90
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   40.18    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    91
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   40.75    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    92
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   42.09    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    93
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   42.91    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    94
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   43.08    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    95
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   43.37    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    96
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   44.07    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    97
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   44.42    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    98
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   44.61    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    99
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   44.81    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   100
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   45.28    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   101
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   45.50    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   102
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   45.63    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   103
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   46.50    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   104
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   47.33    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   105
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   48.15    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   106
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   48.41    

 Rtb_to_modes>  106 vectors, with    864 coordinates in vector file.

 Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected):
 1.00000 1.00000 1.00000 1.00003 0.99999
 1.00000 0.99998 1.00000 1.00001 0.99998
 1.00001 0.99998 1.00001 0.99998 1.00002
 1.00002 1.00000 0.99999 0.99999 0.99998
 1.00001 1.00000 1.00001 1.00003 0.99997
 1.00000 1.00001 1.00001 1.00001 1.00001
 1.00001 0.99996 1.00002 0.99999 1.00003
 1.00002 0.99999 1.00000 0.99996 1.00000
 0.99998 1.00001 0.99999 1.00001 1.00001
 1.00001 1.00002 0.99999 1.00001 1.00001
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 0.99999 1.00000 1.00003 1.00003 1.00000
 0.99997 0.99998 1.00000 1.00000 0.99999
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 1.00000 1.00000 1.00002 1.00003 1.00002
 1.00001 1.00000 1.00002 1.00001 1.00000
 0.99997

 Rtb_to_modes> RTB block-file is being read.
 Rtb_to_modes>    63306 lines found in RTB file.

 Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected):
 1.00000 1.00000 1.00000 1.00003 0.99999
 1.00000 0.99998 1.00000 1.00001 0.99998
 1.00001 0.99998 1.00001 0.99998 1.00002
 1.00002 1.00000 0.99999 0.99999 0.99998
 1.00001 1.00000 1.00001 1.00003 0.99997
 1.00000 1.00001 1.00001 1.00001 1.00001
 1.00001 0.99996 1.00002 0.99999 1.00003
 1.00002 0.99999 1.00000 0.99996 1.00000
 0.99998 1.00001 0.99999 1.00001 1.00001
 1.00001 1.00002 0.99999 1.00001 1.00001
 0.99998 0.99998 0.99999 0.99999 1.00000
 1.00003 1.00003 0.99998 1.00002 1.00002
 1.00000 1.00003 1.00002 1.00001 1.00000
 1.00002 0.99999 1.00002 1.00002 1.00001
 1.00003 1.00000 0.99997 1.00001 1.00001
 0.99999 1.00000 1.00003 1.00003 1.00000
 0.99997 0.99998 1.00000 1.00000 0.99999
 1.00000 1.00001 0.99997 1.00000 0.99998
 1.00000 0.99998 1.00000 1.00001 1.00001
 1.00000 1.00000 1.00002 1.00003 1.00002
 1.00001 1.00000 1.00002 1.00001 1.00000
 0.99997

 Orthogonality of first eigenvectors (zero expected):
 Vector   2: 0.000
 Vector   3:-0.000-0.000
 Vector   4:-0.000-0.000 0.000
 Vector   5:-0.000 0.000 0.000 0.000
 Vector   6: 0.000-0.000 0.000-0.000 0.000
 Vector   7:-0.000 0.000-0.000-0.000-0.000-0.000
 Vector   8:-0.000 0.000-0.000 0.000-0.000-0.000-0.000
 Vector   9: 0.000-0.000-0.000 0.000 0.000-0.000 0.000-0.000
 Vector  10:-0.000-0.000 0.000 0.000-0.000-0.000-0.000-0.000 0.000

 Rtb_to_modes>   106 eigenvectors saved.

 Rtb_to_modes> Normal end.

 Diagrtb> Normal end.
B-factor analysis
 Bfactors> Version 1.22, Bordeaux.                
 Getnam> Eigenvector filename ?
 Getnam> 2602200446423711017.eigenfacs

 Openam> file on opening on unit     10:
 2602200446423711017.eigenfacs                                   
 Getnam> Corresponding pdb filename ?
 Getnam> 2602200446423711017.atom

 Openam> file on opening on unit     11:
 2602200446423711017.atom                                        
 Getnum> Number of skipped eigenvectors ?
 Getnum>            0
 Getnum> Number of usefull eigenvectors ?
 Getnum>        10000
%Getnum-Err: number larger than    106 This is not allowed. Sorry.

 Rdatompdb> Reading pdb file.
 Rdatompdb> End of file reached.
 Rdatompdb> Number of I/O errors:            0

 Rdatompdb> Number of residues found =    429
            First residue number     =    283
            Last  residue number     =    746
            Number of atoms found    =   3517
            Mean number per residue  =      8.2

 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     1
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  9.9970E-10

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     2
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  9.9991E-10

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     3
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  9.9994E-10

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     4
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  1.0001E-09

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     5
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  1.0004E-09

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     6
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  1.0012E-09

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     7
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  4.4151E-02

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     8
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  0.1317    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     9
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  0.2929    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    10
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  0.5778    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    11
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  0.6603    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    12
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  0.8478    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    13
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   1.281    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    14
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   1.747    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    15
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   2.715    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    16
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   2.770    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    17
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   3.325    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    18
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   3.784    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    19
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   4.240    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    20
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   4.657    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    21
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   5.343    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    22
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   5.753    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    23
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   7.228    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    24
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   7.596    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    25
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   8.005    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    26
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   8.652    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    27
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   9.295    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    28
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   9.704    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    29
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   10.05    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    30
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   10.59    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    31
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   10.69    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    32
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   10.88    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    33
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   10.96    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    34
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   11.91    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    35
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   12.68    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    36
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   13.21    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    37
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   13.49    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    38
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   14.10    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    39
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   14.33    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    40
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   14.95    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    41
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   15.33    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    42
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   15.65    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    43
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   16.02    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    44
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   17.07    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    45
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   17.45    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    46
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   18.03    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    47
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   19.01    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    48
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   19.58    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    49
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   19.83    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    50
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   20.25    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    51
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   20.59    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    52
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   21.06    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    53
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   21.69    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    54
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   21.91    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    55
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   22.31    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    56
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   22.85    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    57
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   23.28    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    58
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   24.08    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    59
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   24.36    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    60
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   25.14    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    61
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   25.41    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    62
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   25.84    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    63
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   26.17    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    64
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   26.97    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    65
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   27.06    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    66
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   27.66    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    67
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   27.78    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    68
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   28.04    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    69
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   28.41    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    70
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   29.54    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    71
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   30.56    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    72
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   31.23    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    73
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   31.92    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    74
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   32.04    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    75
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   32.58    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    76
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   33.45    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    77
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   34.00    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    78
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   34.38    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    79
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   34.70    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    80
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   35.02    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    81
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   35.88    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    82
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   36.30    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    83
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   36.63    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    84
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   37.51    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    85
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   38.10    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    86
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   38.47    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    87
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   38.99    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    88
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   39.33    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    89
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   39.65    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    90
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   40.18    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    91
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   40.75    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    92
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   42.09    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    93
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   42.91    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    94
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   43.08    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    95
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   43.37    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    96
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   44.07    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    97
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   44.42    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    98
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   44.61    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    99
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   44.81    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   100
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   45.28    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   101
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   45.50    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   102
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   45.63    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   103
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   46.50    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   104
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   47.33    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   105
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   48.15    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   106
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   48.41    

 Bfactors>  106 vectors,  10551 coordinates in file.

 Openam> file on opening on unit     12:
 bfactors.pred                                                   

 Bfactors> Best zero-eigenvalue found  :     0.000000
 Bfactors>     6 eigenvalues less than :     0.000000
 Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue  :     0.044151
 Bfactors>   100 eigenvectors will be considered.
 Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped.

 Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed.
          (CHARMM units assumed for eigenvalues)

 Bfactors> Correlation=     -0.395 for    429 C-alpha atoms.
 Bfactors> =      0.191 +/-   0.23
 Bfactors> =     98.575 +/-  31.64
 Bfactors> Shiftng-fct=     98.384
 Bfactors> Scaling-fct=    139.931

 Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved.

 Bfactors> Normal end.
check_modes
 Chkmod> Version 1.00, Bordeaux.                
 Getnam> Eigenvector filename ?
 Getnam> 2602200446423711017.eigenfacs

 Openam> file on opening on unit     10:
 2602200446423711017.eigenfacs                                   

 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     1
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:  3.4333E-03

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     2
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:  3.4337E-03

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     3
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:  3.4337E-03

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     4
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:  3.4340E-03

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     5
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:  3.4345E-03

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     6
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:  3.4359E-03

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     7
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   22.82    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     8
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   39.41    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     9
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   58.77    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    10
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   82.54    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    11
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   88.24    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    12
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   99.98    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    13
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 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   519.1    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    57
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   523.9    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    58
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   532.8    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    59
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   535.9    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    60
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   544.5    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    61
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   547.4    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    62
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   552.0    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    63
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   555.5    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    64
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   563.9    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    65
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   564.9    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    66
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   571.1    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    67
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   572.3    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    68
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   575.0    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    69
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   578.8    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    70
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   590.2    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    71
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   600.3    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    72
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   606.8    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    73
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   613.5    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    74
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   614.6    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    75
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   619.8    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    76
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   628.0    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    77
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   633.2    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    78
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   636.7    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    79
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   639.6    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    80
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   642.6    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    81
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   650.4    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    82
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   654.2    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    83
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   657.2    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    84
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   665.0    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    85
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   670.3    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    86
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   673.5    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    87
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   678.0    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    88
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   681.0    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    89
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   683.8    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    90
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   688.3    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    91
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   693.2    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    92
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   704.5    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    93
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   711.3    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    94
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   712.7    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    95
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   715.1    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    96
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   720.9    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    97
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   723.7    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    98
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   725.3    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    99
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   726.9    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   100
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   730.7    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   101
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   732.5    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   102
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   733.5    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   103
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   740.5    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   104
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   747.0    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   105
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   753.5    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   106
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   755.5    

 Chkmod>  106 vectors,  10551 coordinates in file.
 Chkmod>      That is:   3517 cartesian points.

 Openam> file on opening on unit     11:
 Chkmod.res                                                      
 Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file.

 Chkmod> Normal end.
      0.0034      0.7243
      0.0034      0.8970
      0.0034      0.7227
      0.0034      0.8265
      0.0034      0.9466
      0.0034      0.9246
     22.8164      0.4878
     39.4067      0.4448
     58.7674      0.3231
     82.5402      0.6084
     88.2363      0.6164
     99.9824      0.6336
    122.8998      0.5594
    143.5235      0.4107
    178.9211      0.5308
    180.7243      0.4124
    198.0033      0.5697
    211.2283      0.6021
    223.5937      0.3505
    234.3310      0.5109
    250.9974      0.1940
    260.4497      0.4743
    291.9347      0.1985
    299.2741      0.2478
    307.2255      0.2048
    319.4000      0.4757
    331.0559      0.1257
    338.2611      0.3125
    344.2387      0.2075
    353.3659      0.3131
    355.0304      0.4673
    358.1715      0.1971
    359.4859      0.3608
    374.7421      0.1901
    386.6662      0.4328
    394.6645      0.2023
    398.8252      0.3196
    407.7427      0.1633
    411.0548      0.2511
    419.8530      0.2796
    425.1554      0.4728
    429.5699      0.3201
    434.6182      0.4006
    448.6353      0.5190
    453.6014      0.5613
    461.0781      0.4090
    473.4430      0.4489
    480.4885      0.4119
    483.5462      0.4348
    488.6402      0.5213
    492.7252      0.4919
    498.3171      0.4165
    505.7157      0.4961
    508.2739      0.4124
    512.8926      0.1392
    519.0626      0.4356
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    532.8499      0.2167
    535.9389      0.2318
    544.4516      0.5258
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    654.2292      0.1956
    657.1963      0.4051
    665.0437      0.4467
    670.2536      0.4068
    673.5002      0.5067
    678.0368      0.4386
    680.9867      0.4050
    683.7514      0.4354
    688.3061      0.4291
    693.1711      0.3785
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    711.3051      0.4275
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    747.0418      0.3692
    753.4853      0.3511
    755.5169      0.4810
getting mode 7
running: ../../bin/get_modes.sh 2602200446423711017 7 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 7
calculating perturbed structure for DQ=-100
2602200446423711017.eigenfacs
2602200446423711017.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2602200446423711017.eigenfacs
2602200446423711017.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2602200446423711017.eigenfacs
2602200446423711017.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2602200446423711017.eigenfacs
2602200446423711017.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2602200446423711017.eigenfacs
2602200446423711017.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2602200446423711017.eigenfacs
2602200446423711017.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2602200446423711017.eigenfacs
2602200446423711017.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2602200446423711017.eigenfacs
2602200446423711017.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2602200446423711017.eigenfacs
2602200446423711017.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2602200446423711017.eigenfacs
2602200446423711017.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2602200446423711017.eigenfacs
2602200446423711017.atom
making animated gifs
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getting mode 8
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normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 8
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getting mode 9
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normal mode computation
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MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
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making thumbnail 100x100
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getting mode 10
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calculating perturbed structure for DQ=60
2602200446423711017.eigenfacs
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MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
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making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
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11 models are in 2602200446423711017.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2602200446423711017.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
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getting mode 11
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normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 11
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calculating perturbed structure for DQ=-60
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making small animated gif 100x100
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11 models are in 2602200446423711017.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
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MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
2602200446423711017.10.pdb
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2602200446423711017.7.pdb
2602200446423711017.8.pdb
2602200446423711017.9.pdb



STDERR:
Note: The following floating-point exceptions are signalling: IEEE_DENORMAL

real	0m13.271s
user	0m13.156s
sys	0m0.107s
rm: cannot remove '2602200446423711017.sdijf': No such file or directory
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pstopnm: Writing ppmraw format
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pstopnm: Writing ppmraw format
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K. Suhre & Y.H. Sanejouand, ElNemo: a normal mode web-server for protein movement analysis and the generation of templates for molecular replacement. Nucleic Acids Research, 32, W610-W614, 2004.
K. Suhre & Y.H. Sanejouand, On the potential of normal mode analysis for solving difficult molecular replacement problems. Acta Cryst. D vol.60, p796-799, 2004 © International Union of Crystallography.
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*** TRANSPORT PROTEIN 17-DEC-20 7L2L ***

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Should you encounter any unexpected behaviour,
please let us know.
elNémo has been hacked on november 27th.
It has been moved away and runs again.
Still some additional cleaning from time to time
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* TRANSPORT PROTEIN 17-DEC-20 7L2L *
