CNRS Nantes University US2B US2B
home |  start a new run |  job status |  references&downloads |  examples |  help  

Should you encounter any unexpected behaviour,
please let us know.
elNémo has been hacked on november 27th.
It has been moved away and runs again.
**Still some additional cleaning from time to time**
Sorry for the inconvenience.


***    ***

LOGs for ID: 2602201457414000032

Output from eigenvector calculation:


STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8) Build Tirion matrix: Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model. Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004. Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file. Pdbmat> Coordinate filename = 2602201457414000032.atom Pdbmat> Distance cutoff = 8.00 Force constant = 10.00 Origin of mass values = CONS Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09 PRINTing level = 2 Pdbmat> Coordinate file 2602201457414000032.atom to be opened. Openam> File opened: 2602201457414000032.atom Pdbmat> Coordinate file in PDB format. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 285 First residue number = 69 Last residue number = 1 Number of atoms found = 4640 Mean number per residue = 16.3 Pdbmat> Coordinate statistics: = 24.783972 +/- 15.668400 From: -4.874000 To: 59.849000 = 0.772695 +/- 8.372532 From: -19.176000 To: 21.247000 = 61.583114 +/- 10.045742 From: 42.331000 To: 88.351000 Pdbmat> Masses are all set to one. %Pdbmat-W> residue:'UNL ' is not a well known amino-acid. %Pdbmat-W> 1 residue(s) not known. Openam> File opened: pdbmat.xyzm Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved. Openam> File opened: pdbmat.sdijb Pdbmat> Matrix statistics: Pdbmat> The matrix is 3.3662 % Filled. Pdbmat> 3261517 non-zero elements. Pdbmat> 359353 atom-atom interactions. Pdbmat> Number per atom= 154.89 +/- 46.05 Maximum number = 246 Minimum number = 25 Pdbmat> Matrix trace = 7.187060E+06 Pdbmat> Larger element = 931.708 Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10 Pdbmat> Normal end. automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1) 285 non-zero elements, NRBL set to 2 Diagonalize Tirion matrix using diagrtb Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation. Diagrtb> Version 2.52, November 2004. Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file. Diagrtb> Options taken into account: MATRix filename = pdbmat.sdijb COORdinates filename = 2602201457414000032.atom Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb Nb of VECTors required = 106 EigeNVALues chosen = LOWE Type of SUBStructuring = NONE Nb of residues per BLOck = 2 Origin of MASS values = CONS MATRix FORMat = BINA Temporary files cleaning = ALL Output PRINting level = 2 Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb. Blocpdb> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.xyzm Blocpdb> Coordinate file 2602201457414000032.atom to be opened. Openam> file on opening on unit 11: 2602201457414000032.atom Blocpdb> Coordinate file in PDB format. Blocpdb> 4640 atoms picked in pdb file. Blocpdb> All masses set to unity. Blocpdb> Coordinate file is rewritten. Blocpdb> Substructuring: Blocpdb> 2 residue(s) per block. Blocpdb> 285 residues. Blocpdb> 31 atoms in block 1 Block first atom: 1 Blocpdb> 36 atoms in block 2 Block first atom: 32 Blocpdb> 37 atoms in block 3 Block first atom: 68 Blocpdb> 38 atoms in block 4 Block first atom: 105 Blocpdb> 21 atoms in block 5 Block first atom: 143 Blocpdb> 38 atoms in block 6 Block first atom: 164 Blocpdb> 24 atoms in block 7 Block first atom: 202 Blocpdb> 32 atoms in block 8 Block first atom: 226 Blocpdb> 38 atoms in block 9 Block first atom: 258 Blocpdb> 33 atoms in block 10 Block first atom: 296 Blocpdb> 29 atoms in block 11 Block first atom: 329 Blocpdb> 21 atoms in block 12 Block first atom: 358 Blocpdb> 38 atoms in block 13 Block first atom: 379 Blocpdb> 35 atoms in block 14 Block first atom: 417 Blocpdb> 27 atoms in block 15 Block first atom: 452 Blocpdb> 27 atoms in block 16 Block first atom: 479 Blocpdb> 34 atoms in block 17 Block first atom: 506 Blocpdb> 44 atoms in block 18 Block first atom: 540 Blocpdb> 36 atoms in block 19 Block first atom: 584 Blocpdb> 24 atoms in block 20 Block first atom: 620 Blocpdb> 28 atoms in block 21 Block first atom: 644 Blocpdb> 41 atoms in block 22 Block first atom: 672 Blocpdb> 36 atoms in block 23 Block first atom: 713 Blocpdb> 30 atoms in block 24 Block first atom: 749 Blocpdb> 29 atoms in block 25 Block first atom: 779 Blocpdb> 22 atoms in block 26 Block first atom: 808 Blocpdb> 36 atoms in block 27 Block first atom: 830 Blocpdb> 26 atoms in block 28 Block first atom: 866 Blocpdb> 39 atoms in block 29 Block first atom: 892 Blocpdb> 33 atoms in block 30 Block first atom: 931 Blocpdb> 30 atoms in block 31 Block first atom: 964 Blocpdb> 28 atoms in block 32 Block first atom: 994 Blocpdb> 33 atoms in block 33 Block first atom: 1022 Blocpdb> 38 atoms in block 34 Block first atom: 1055 Blocpdb> 28 atoms in block 35 Block first atom: 1093 Blocpdb> 45 atoms in block 36 Block first atom: 1121 Blocpdb> 38 atoms in block 37 Block first atom: 1166 Blocpdb> 33 atoms in block 38 Block first atom: 1204 Blocpdb> 33 atoms in block 39 Block first atom: 1237 Blocpdb> 29 atoms in block 40 Block first atom: 1270 Blocpdb> 26 atoms in block 41 Block first atom: 1299 Blocpdb> 43 atoms in block 42 Block first atom: 1325 Blocpdb> 40 atoms in block 43 Block first atom: 1368 Blocpdb> 28 atoms in block 44 Block first atom: 1408 Blocpdb> 39 atoms in block 45 Block first atom: 1436 Blocpdb> 25 atoms in block 46 Block first atom: 1475 Blocpdb> 32 atoms in block 47 Block first atom: 1500 Blocpdb> 43 atoms in block 48 Block first atom: 1532 Blocpdb> 36 atoms in block 49 Block first atom: 1575 Blocpdb> 21 atoms in block 50 Block first atom: 1611 Blocpdb> 30 atoms in block 51 Block first atom: 1632 Blocpdb> 31 atoms in block 52 Block first atom: 1662 Blocpdb> 45 atoms in block 53 Block first atom: 1693 Blocpdb> 26 atoms in block 54 Block first atom: 1738 Blocpdb> 36 atoms in block 55 Block first atom: 1764 Blocpdb> 28 atoms in block 56 Block first atom: 1800 Blocpdb> 37 atoms in block 57 Block first atom: 1828 Blocpdb> 28 atoms in block 58 Block first atom: 1865 Blocpdb> 44 atoms in block 59 Block first atom: 1893 Blocpdb> 25 atoms in block 60 Block first atom: 1937 Blocpdb> 38 atoms in block 61 Block first atom: 1962 Blocpdb> 32 atoms in block 62 Block first atom: 2000 Blocpdb> 39 atoms in block 63 Block first atom: 2032 Blocpdb> 41 atoms in block 64 Block first atom: 2071 Blocpdb> 29 atoms in block 65 Block first atom: 2112 Blocpdb> 40 atoms in block 66 Block first atom: 2141 Blocpdb> 33 atoms in block 67 Block first atom: 2181 Blocpdb> 27 atoms in block 68 Block first atom: 2214 Blocpdb> 26 atoms in block 69 Block first atom: 2241 Blocpdb> 28 atoms in block 70 Block first atom: 2267 Blocpdb> 33 atoms in block 71 Block first atom: 2295 Blocpdb> 30 atoms in block 72 Block first atom: 2328 Blocpdb> 27 atoms in block 73 Block first atom: 2358 Blocpdb> 36 atoms in block 74 Block first atom: 2385 Blocpdb> 24 atoms in block 75 Block first atom: 2421 Blocpdb> 33 atoms in block 76 Block first atom: 2445 Blocpdb> 36 atoms in block 77 Block first atom: 2478 Blocpdb> 37 atoms in block 78 Block first atom: 2514 Blocpdb> 18 atoms in block 79 Block first atom: 2551 Blocpdb> 29 atoms in block 80 Block first atom: 2569 Blocpdb> 29 atoms in block 81 Block first atom: 2598 Blocpdb> 24 atoms in block 82 Block first atom: 2627 Blocpdb> 34 atoms in block 83 Block first atom: 2651 Blocpdb> 35 atoms in block 84 Block first atom: 2685 Blocpdb> 26 atoms in block 85 Block first atom: 2720 Blocpdb> 31 atoms in block 86 Block first atom: 2746 Blocpdb> 27 atoms in block 87 Block first atom: 2777 Blocpdb> 40 atoms in block 88 Block first atom: 2804 Blocpdb> 33 atoms in block 89 Block first atom: 2844 Blocpdb> 33 atoms in block 90 Block first atom: 2877 Blocpdb> 36 atoms in block 91 Block first atom: 2910 Blocpdb> 35 atoms in block 92 Block first atom: 2946 Blocpdb> 35 atoms in block 93 Block first atom: 2981 Blocpdb> 39 atoms in block 94 Block first atom: 3016 Blocpdb> 33 atoms in block 95 Block first atom: 3055 Blocpdb> 33 atoms in block 96 Block first atom: 3088 Blocpdb> 36 atoms in block 97 Block first atom: 3121 Blocpdb> 37 atoms in block 98 Block first atom: 3157 Blocpdb> 10 atoms in block 99 Block first atom: 3194 Blocpdb> 28 atoms in block 100 Block first atom: 3204 Blocpdb> 30 atoms in block 101 Block first atom: 3232 Blocpdb> 29 atoms in block 102 Block first atom: 3262 Blocpdb> 39 atoms in block 103 Block first atom: 3291 Blocpdb> 21 atoms in block 104 Block first atom: 3330 Blocpdb> 38 atoms in block 105 Block first atom: 3351 Blocpdb> 26 atoms in block 106 Block first atom: 3389 Blocpdb> 35 atoms in block 107 Block first atom: 3415 Blocpdb> 40 atoms in block 108 Block first atom: 3450 Blocpdb> 39 atoms in block 109 Block first atom: 3490 Blocpdb> 32 atoms in block 110 Block first atom: 3529 Blocpdb> 41 atoms in block 111 Block first atom: 3561 Blocpdb> 25 atoms in block 112 Block first atom: 3602 Blocpdb> 40 atoms in block 113 Block first atom: 3627 Blocpdb> 33 atoms in block 114 Block first atom: 3667 Blocpdb> 33 atoms in block 115 Block first atom: 3700 Blocpdb> 27 atoms in block 116 Block first atom: 3733 Blocpdb> 35 atoms in block 117 Block first atom: 3760 Blocpdb> 32 atoms in block 118 Block first atom: 3795 Blocpdb> 26 atoms in block 119 Block first atom: 3827 Blocpdb> 24 atoms in block 120 Block first atom: 3853 Blocpdb> 27 atoms in block 121 Block first atom: 3877 Blocpdb> 35 atoms in block 122 Block first atom: 3904 Blocpdb> 17 atoms in block 123 Block first atom: 3939 Blocpdb> 38 atoms in block 124 Block first atom: 3956 Blocpdb> 30 atoms in block 125 Block first atom: 3994 Blocpdb> 36 atoms in block 126 Block first atom: 4024 Blocpdb> 43 atoms in block 127 Block first atom: 4060 Blocpdb> 28 atoms in block 128 Block first atom: 4103 Blocpdb> 30 atoms in block 129 Block first atom: 4131 Blocpdb> 21 atoms in block 130 Block first atom: 4161 Blocpdb> 30 atoms in block 131 Block first atom: 4182 Blocpdb> 33 atoms in block 132 Block first atom: 4212 Blocpdb> 37 atoms in block 133 Block first atom: 4245 Blocpdb> 33 atoms in block 134 Block first atom: 4282 Blocpdb> 34 atoms in block 135 Block first atom: 4315 Blocpdb> 36 atoms in block 136 Block first atom: 4349 Blocpdb> 45 atoms in block 137 Block first atom: 4385 Blocpdb> 21 atoms in block 138 Block first atom: 4430 Blocpdb> 31 atoms in block 139 Block first atom: 4451 Blocpdb> 45 atoms in block 140 Block first atom: 4482 Blocpdb> 36 atoms in block 141 Block first atom: 4527 Blocpdb> 28 atoms in block 142 Block first atom: 4563 Blocpdb> 21 atoms in block 143 Block first atom: 4591 Blocpdb> 29 atoms in block 144 Block first atom: 4611 Blocpdb> 144 blocks. Blocpdb> At most, 45 atoms in each of them. Blocpdb> At least, 10 atoms in each of them. Blocpdb> Normal end of Blocpdb. Diagrtb> Memory allocation for Prepmat. Diagrtb> Memory allocation for RTB. Diagrtb> Memory allocation for Diagstd. Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes. Prepmat> Entering in. Prepmat> Rewriting of the matrix begins. Prepmat> 3261661 matrix lines read. Prepmat> Matrix order = 13920 Prepmat> Matrix trace = 7187060.0000 Prepmat> Last element read: 13920 13920 224.0389 Prepmat> 10441 lines saved. Prepmat> 8762 empty lines. Prepmat> Number of lines on output is as expected. Prepmat> Normal end of Prepmat. RTB> Entering in. RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 4640 RTB> Total mass = 4640.0000 RTB> Number of atoms found in matrix: 4640 RTB> Number of blocks = 144 RTB> Projection begins. RTB> Projected matrix is being saved. RTB> Projected matrix trace = 373345.4648 RTB> 58248 non-zero elements. RTB> Normal end of RTB. Diagstd> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.sdijb Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb Diagstd> CERFACS matrix format. Diagstd> Projected matrix order = 864 Diagstd> Nb of non-zero elements: 58248 Diagstd> Projected matrix trace = 373345.4648 Openam> file on opening on unit 11: diagrtb_work.eigenfacs Diagstd> Diagonalization. Diagstd> 864 eigenvectors are computed. Diagstd> 106 of them to be saved. Diagstd> Sum of eigenvalues = 373345.4648 Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000 Diagstd> Selected eigenvalues: 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 3.2867124 4.3922852 5.6344821 6.5524376 7.7659868 9.5993595 10.4671339 12.9169666 14.3367600 15.7147550 16.1285273 16.8415770 18.0400114 20.2063919 20.9053540 22.2561053 24.0662134 26.0480966 27.7343012 28.6274895 28.9660539 31.1734431 33.8077104 36.0236129 37.5103564 40.0041500 40.6883821 42.4788952 43.1599846 45.2970908 46.3929481 48.0451185 49.0409072 50.4648224 51.2054360 52.1972024 54.1567276 55.9191282 57.4359231 58.0944776 59.6413409 59.9568647 61.6648313 63.1026876 63.7209308 67.2025909 67.5022052 68.5030349 70.1333109 71.2385050 72.1713101 76.1798099 77.4491662 78.4448527 80.1379889 81.4170607 83.1523213 85.6667748 88.5756285 90.3225407 91.1825186 91.9849249 92.6197792 94.0242008 94.9747818 95.6028992 97.2290690 99.0943990 100.3571600 101.5208155 102.7371235 105.0667816 106.7606042 107.5840857 107.9323437 108.7066865 108.9244101 112.3133849 114.3598233 115.0391529 117.4132311 119.0052508 119.3726719 120.5006583 122.4499131 122.9338542 124.0289990 125.5650330 126.1160973 129.3334516 130.2775615 131.7086025 133.6652751 134.7432613 136.8120652 137.8500302 138.3789949 140.1348966 141.8033814 143.0036106 Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units): 0.0034333 0.0034334 0.0034341 0.0034347 0.0034358 0.0034362 196.8684548 227.5833822 257.7640125 277.9692325 302.6171965 336.4468050 351.3250927 390.2793282 411.1694012 430.4761423 436.1065782 445.6425578 461.2258966 488.1346823 496.5054763 512.2947018 532.7201966 554.2213827 571.8786648 581.0144211 584.4400210 606.3001378 631.3979388 651.7618163 665.0753865 686.8277025 692.6765595 707.7532739 713.4046256 730.8536753 739.6414918 752.6965314 760.4567655 771.4177981 777.0577826 784.5468690 799.1374572 812.0363610 822.9758343 827.6804660 838.6272687 840.8426599 852.7349322 862.6193751 866.8347955 890.2014322 892.1836509 898.7733501 909.4052375 916.5426495 922.5237905 947.7967662 955.6605389 961.7839072 972.1079615 979.8350935 990.2217678 1005.0819845 1022.0035435 1032.0324500 1036.9338982 1041.4864146 1045.0742590 1052.9678363 1058.2771826 1061.7708833 1070.7629708 1080.9854148 1087.8511162 1094.1398327 1100.6746932 1113.0841406 1122.0204997 1126.3394535 1128.1610049 1132.2006745 1133.3339236 1150.8296388 1161.2668218 1164.7108410 1176.6676131 1184.6180407 1186.4453473 1192.0376978 1201.6403992 1204.0125925 1209.3636186 1216.8292419 1219.4964536 1234.9538099 1239.4530790 1246.2419073 1255.4649093 1260.5172915 1270.1572154 1274.9663219 1277.4101605 1285.4891903 1293.1192410 1298.5802149 Diagstd> Normal end. Rtb_to_modes> Entering in. Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 4640 Rtb_to_modes> Number of blocs = 144 Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.eigenfacs Openam> file on opening on unit 11: matrix.eigenrtb Rdmodfacs> Entering in. Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Eigenvector number: 1 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9960E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 2 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9970E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 3 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0001E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 4 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0004E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 5 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0011E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 6 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0013E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 7 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.287 Rdmodfacs> Eigenvector number: 8 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.392 Rdmodfacs> Eigenvector number: 9 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.634 Rdmodfacs> Eigenvector number: 10 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.552 Rdmodfacs> Eigenvector number: 11 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.766 Rdmodfacs> Eigenvector number: 12 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.599 Rdmodfacs> Eigenvector number: 13 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.47 Rdmodfacs> Eigenvector number: 14 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.92 Rdmodfacs> Eigenvector number: 15 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.34 Rdmodfacs> Eigenvector number: 16 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.71 Rdmodfacs> Eigenvector number: 17 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.13 Rdmodfacs> Eigenvector number: 18 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.84 Rdmodfacs> Eigenvector number: 19 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.04 Rdmodfacs> Eigenvector number: 20 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.21 Rdmodfacs> Eigenvector number: 21 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.91 Rdmodfacs> Eigenvector number: 22 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.26 Rdmodfacs> Eigenvector number: 23 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.07 Rdmodfacs> Eigenvector number: 24 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.05 Rdmodfacs> Eigenvector number: 25 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.73 Rdmodfacs> Eigenvector number: 26 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.63 Rdmodfacs> Eigenvector number: 27 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.97 Rdmodfacs> Eigenvector number: 28 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.17 Rdmodfacs> Eigenvector number: 29 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.81 Rdmodfacs> Eigenvector number: 30 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 31 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.51 Rdmodfacs> Eigenvector number: 32 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.00 Rdmodfacs> Eigenvector number: 33 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.69 Rdmodfacs> Eigenvector number: 34 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.48 Rdmodfacs> Eigenvector number: 35 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.16 Rdmodfacs> Eigenvector number: 36 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.30 Rdmodfacs> Eigenvector number: 37 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.39 Rdmodfacs> Eigenvector number: 38 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 48.05 Rdmodfacs> Eigenvector number: 39 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 49.04 Rdmodfacs> Eigenvector number: 40 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 50.46 Rdmodfacs> Eigenvector number: 41 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 51.21 Rdmodfacs> Eigenvector number: 42 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 52.20 Rdmodfacs> Eigenvector number: 43 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 54.16 Rdmodfacs> Eigenvector number: 44 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 55.92 Rdmodfacs> Eigenvector number: 45 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 57.44 Rdmodfacs> Eigenvector number: 46 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 58.09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 47 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 59.64 Rdmodfacs> Eigenvector number: 48 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 59.96 Rdmodfacs> Eigenvector number: 49 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 61.66 Rdmodfacs> Eigenvector number: 50 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 63.10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 51 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 63.72 Rdmodfacs> Eigenvector number: 52 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 67.20 Rdmodfacs> Eigenvector number: 53 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 67.50 Rdmodfacs> Eigenvector number: 54 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 68.50 Rdmodfacs> Eigenvector number: 55 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 70.13 Rdmodfacs> Eigenvector number: 56 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 71.24 Rdmodfacs> Eigenvector number: 57 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 72.17 Rdmodfacs> Eigenvector number: 58 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 76.18 Rdmodfacs> Eigenvector number: 59 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 77.45 Rdmodfacs> Eigenvector number: 60 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 78.44 Rdmodfacs> Eigenvector number: 61 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 80.14 Rdmodfacs> Eigenvector number: 62 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 81.42 Rdmodfacs> Eigenvector number: 63 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 83.15 Rdmodfacs> Eigenvector number: 64 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 85.67 Rdmodfacs> Eigenvector number: 65 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 88.58 Rdmodfacs> Eigenvector number: 66 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 90.32 Rdmodfacs> Eigenvector number: 67 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 91.18 Rdmodfacs> Eigenvector number: 68 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 91.98 Rdmodfacs> Eigenvector number: 69 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 92.62 Rdmodfacs> Eigenvector number: 70 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 94.02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 71 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 94.97 Rdmodfacs> Eigenvector number: 72 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 95.60 Rdmodfacs> Eigenvector number: 73 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 97.23 Rdmodfacs> Eigenvector number: 74 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 99.09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 75 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 100.4 Rdmodfacs> Eigenvector number: 76 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 101.5 Rdmodfacs> Eigenvector number: 77 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 102.7 Rdmodfacs> Eigenvector number: 78 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 105.1 Rdmodfacs> Eigenvector number: 79 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 106.8 Rdmodfacs> Eigenvector number: 80 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 107.6 Rdmodfacs> Eigenvector number: 81 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 107.9 Rdmodfacs> Eigenvector number: 82 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 108.7 Rdmodfacs> Eigenvector number: 83 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 108.9 Rdmodfacs> Eigenvector number: 84 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 112.3 Rdmodfacs> Eigenvector number: 85 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 114.4 Rdmodfacs> Eigenvector number: 86 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 115.0 Rdmodfacs> Eigenvector number: 87 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 117.4 Rdmodfacs> Eigenvector number: 88 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 119.0 Rdmodfacs> Eigenvector number: 89 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 119.4 Rdmodfacs> Eigenvector number: 90 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 120.5 Rdmodfacs> Eigenvector number: 91 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 122.4 Rdmodfacs> Eigenvector number: 92 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 122.9 Rdmodfacs> Eigenvector number: 93 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 124.0 Rdmodfacs> Eigenvector number: 94 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 125.6 Rdmodfacs> Eigenvector number: 95 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 126.1 Rdmodfacs> Eigenvector number: 96 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 129.3 Rdmodfacs> Eigenvector number: 97 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 130.3 Rdmodfacs> Eigenvector number: 98 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 131.7 Rdmodfacs> Eigenvector number: 99 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 133.7 Rdmodfacs> Eigenvector number: 100 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 134.7 Rdmodfacs> Eigenvector number: 101 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 136.8 Rdmodfacs> Eigenvector number: 102 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 137.9 Rdmodfacs> Eigenvector number: 103 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 138.4 Rdmodfacs> Eigenvector number: 104 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 140.1 Rdmodfacs> Eigenvector number: 105 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 141.8 Rdmodfacs> Eigenvector number: 106 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 143.0 Rtb_to_modes> 106 vectors, with 864 coordinates in vector file. Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected): 1.00001 0.99999 1.00001 0.99998 1.00000 0.99998 1.00003 1.00001 1.00002 1.00000 1.00000 1.00003 0.99999 0.99998 0.99999 0.99997 0.99999 1.00001 1.00001 1.00000 1.00001 1.00002 0.99998 0.99999 1.00002 1.00000 1.00000 0.99999 0.99999 0.99998 1.00001 1.00000 1.00002 1.00002 1.00000 0.99997 1.00000 0.99997 1.00001 1.00000 0.99998 1.00000 1.00000 1.00000 1.00001 1.00001 0.99998 1.00003 1.00002 1.00000 1.00001 1.00000 1.00000 1.00001 1.00000 0.99999 0.99998 0.99997 0.99998 0.99999 0.99997 0.99999 0.99999 1.00002 1.00000 0.99998 1.00000 1.00000 0.99998 1.00001 0.99997 0.99999 1.00001 1.00001 0.99999 1.00001 1.00000 0.99999 1.00002 1.00001 0.99997 1.00000 0.99998 1.00002 1.00001 1.00000 1.00001 0.99999 1.00000 0.99999 0.99999 1.00000 0.99999 1.00001 1.00001 1.00000 1.00000 1.00000 0.99997 1.00001 0.99999 0.99999 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 Rtb_to_modes> RTB block-file is being read. Rtb_to_modes> 83520 lines found in RTB file. Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected): 1.00001 0.99999 1.00001 0.99998 1.00000 0.99998 1.00003 1.00001 1.00002 1.00000 1.00000 1.00003 0.99999 0.99998 0.99999 0.99997 0.99999 1.00001 1.00001 1.00000 1.00001 1.00002 0.99998 0.99999 1.00002 1.00000 1.00000 0.99999 0.99999 0.99998 1.00001 1.00000 1.00002 1.00002 1.00000 0.99997 1.00000 0.99997 1.00001 1.00000 0.99998 1.00000 1.00000 1.00000 1.00001 1.00001 0.99998 1.00003 1.00002 1.00000 1.00001 1.00000 1.00000 1.00001 1.00000 0.99999 0.99998 0.99997 0.99998 0.99999 0.99997 0.99999 0.99999 1.00002 1.00000 0.99998 1.00000 1.00000 0.99998 1.00001 0.99997 0.99999 1.00001 1.00001 0.99999 1.00001 1.00000 0.99999 1.00002 1.00001 0.99997 1.00000 0.99998 1.00002 1.00001 1.00000 1.00001 0.99999 1.00000 0.99999 0.99999 1.00000 0.99999 1.00001 1.00001 1.00000 1.00000 1.00000 0.99997 1.00001 0.99999 0.99999 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 Orthogonality of first eigenvectors (zero expected): Vector 2:-0.000 Vector 3: 0.000 0.000 Vector 4:-0.000-0.000-0.000 Vector 5: 0.000 0.000 0.000-0.000 Vector 6: 0.000-0.000-0.000-0.000 0.000 Vector 7:-0.000-0.000-0.000-0.000-0.000-0.000 Vector 8: 0.000 0.000-0.000 0.000-0.000-0.000 0.000 Vector 9:-0.000-0.000 0.000 0.000 0.000 0.000-0.000 0.000 Vector 10:-0.000-0.000-0.000 0.000 0.000 0.000-0.000 0.000-0.000 Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved. Rtb_to_modes> Normal end. Diagrtb> Normal end. B-factor analysis Bfactors> Version 1.22, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 2602201457414000032.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 2602201457414000032.eigenfacs Getnam> Corresponding pdb filename ? Getnam> 2602201457414000032.atom Openam> file on opening on unit 11: 2602201457414000032.atom Getnum> Number of skipped eigenvectors ? Getnum> 0 Getnum> Number of usefull eigenvectors ? Getnum> 10000 %Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 285 First residue number = 69 Last residue number = 1 Number of atoms found = 4640 Mean number per residue = 16.3 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9960E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9970E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0001E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0004E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0011E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0013E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.287 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.392 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.634 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.552 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.766 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.599 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.47 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.92 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.34 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.71 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.13 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.84 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.04 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.21 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.91 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.26 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.07 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.05 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.73 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.63 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.97 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.17 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.81 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.51 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.00 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.69 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.48 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.16 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.30 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.39 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.05 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.04 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 50.46 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 51.21 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 52.20 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 54.16 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 55.92 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 57.44 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 58.09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 59.64 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 59.96 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 61.66 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 63.10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 63.72 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 67.20 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 67.50 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 68.50 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 70.13 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 71.24 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 72.17 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 76.18 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 77.45 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 78.44 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 80.14 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 81.42 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 83.15 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 85.67 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 88.58 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 90.32 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 91.18 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 91.98 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 92.62 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 94.02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 94.97 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 95.60 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 97.23 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 99.09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 100.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 101.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 102.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 105.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 106.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 107.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 107.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 108.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 108.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 112.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 114.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 115.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 117.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 119.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 119.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 120.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 122.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 122.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 124.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 125.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 126.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 129.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 130.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 131.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 133.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 134.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 136.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 137.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 138.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 140.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 141.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 143.0 Bfactors> 106 vectors, 13920 coordinates in file. Openam> file on opening on unit 12: bfactors.pred Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000 Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 3.287000 Bfactors> 100 eigenvectors will be considered. Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped. Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed. (CHARMM units assumed for eigenvalues) Bfactors> Correlation= 0.283 for 284 C-alpha atoms. Bfactors> = 0.008 +/- 0.01 Bfactors> = 72.605 +/- 32.17 Bfactors> Shiftng-fct= 72.597 Bfactors> Scaling-fct= 2975.698 Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved. Bfactors> Normal end. check_modes Chkmod> Version 1.00, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 2602201457414000032.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 2602201457414000032.eigenfacs Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4331E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4333E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4340E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4345E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4357E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4360E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 196.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 227.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 257.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 277.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 302.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 336.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 351.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 390.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 411.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 430.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 436.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 445.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 461.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 488.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 496.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 512.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 532.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 554.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 571.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 581.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 584.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 606.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 631.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 651.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 665.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 686.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 692.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 707.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 713.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 730.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 739.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 752.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 760.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 771.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 777.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 784.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 799.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 812.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 823.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 827.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 838.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 840.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 852.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 862.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 866.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 890.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 892.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 898.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 909.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 916.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 922.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 947.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 955.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 961.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 972.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 979.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 990.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1005. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1022. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1032. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1037. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1041. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1045. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1053. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1058. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1062. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1071. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1081. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1088. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1094. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1100. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1113. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1122. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1126. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1128. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1132. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1133. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1151. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1161. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1164. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1177. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1185. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1187. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1192. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1201. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1204. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1209. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1217. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1219. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1235. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1240. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1246. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1256. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1260. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1270. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1275. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1277. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1285. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1293. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1299. Chkmod> 106 vectors, 13920 coordinates in file. Chkmod> That is: 4640 cartesian points. Openam> file on opening on unit 11: Chkmod.res Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file. Chkmod> Normal end. 0.0034 0.7353 0.0034 0.8444 0.0034 0.9433 0.0034 0.7359 0.0034 0.8397 0.0034 0.7260 196.8686 0.1332 227.5662 0.0722 257.7419 0.3335 277.9480 0.6005 302.6045 0.3578 336.4261 0.2244 351.3581 0.2528 390.3084 0.2721 411.1982 0.2546 430.3925 0.2821 436.1078 0.2028 445.6026 0.3730 461.2060 0.1727 488.1573 0.3491 496.5393 0.3109 512.3175 0.4214 532.7392 0.3648 554.2178 0.3270 571.8098 0.5357 581.0150 0.2904 584.4547 0.5319 606.2406 0.2980 631.3922 0.3716 651.7012 0.4485 665.0437 0.5973 686.7626 0.4562 692.6606 0.3016 707.7321 0.5673 713.3741 0.5043 730.8458 0.3253 739.5862 0.5333 752.7025 0.3538 760.4171 0.4347 771.3478 0.4460 777.0591 0.0606 784.5342 0.2200 799.1273 0.4137 812.0078 0.4730 822.9697 0.4122 827.6130 0.4613 838.5818 0.4840 840.8285 0.4308 852.6649 0.1996 862.5640 0.3149 866.7913 0.3754 890.1461 0.3064 892.1308 0.3941 898.7149 0.3218 909.3447 0.3011 916.5129 0.4580 922.4758 0.4459 947.7573 0.2233 955.6247 0.3658 961.7129 0.5032 972.0784 0.4355 979.8107 0.4260 990.1654 0.3882 1005.0578 0.3825 1021.9849 0.4669 1031.9736 0.2315 1036.8751 0.2238 1041.4138 0.3824 1045.0306 0.4890 1052.8991 0.4183 1058.2051 0.4974 1061.7092 0.3978 1070.7221 0.3500 1080.9150 0.4324 1088.0366 0.4903 1093.9807 0.4402 1100.4286 0.4200 1113.2123 0.4583 1122.1793 0.3831 1126.3744 0.2586 1127.9435 0.3450 1132.1173 0.5086 1133.1583 0.4329 1150.7117 0.4264 1161.4209 0.4736 1164.4626 0.2776 1176.5508 0.4889 1184.5411 0.3961 1186.5302 0.5019 1191.9833 0.4839 1201.3439 0.4393 1203.7951 0.3745 1209.1703 0.3776 1216.9464 0.4653 1219.3663 0.4733 1234.7411 0.3625 1239.5066 0.5073 1246.1477 0.4009 1255.5741 0.3088 1260.2608 0.4182 1270.0467 0.2865 1275.1426 0.4691 1277.4523 0.5657 1285.2739 0.4454 1293.0483 0.5558 1298.5081 0.4458 getting mode 7 running: ../../bin/get_modes.sh 2602201457414000032 7 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 7 calculating perturbed structure for DQ=-100 2602201457414000032.eigenfacs 2602201457414000032.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2602201457414000032.eigenfacs 2602201457414000032.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2602201457414000032.eigenfacs 2602201457414000032.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2602201457414000032.eigenfacs 2602201457414000032.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2602201457414000032.eigenfacs 2602201457414000032.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2602201457414000032.eigenfacs 2602201457414000032.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2602201457414000032.eigenfacs 2602201457414000032.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2602201457414000032.eigenfacs 2602201457414000032.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2602201457414000032.eigenfacs 2602201457414000032.atom calculating perturbed structure for DQ=80 2602201457414000032.eigenfacs 2602201457414000032.atom calculating perturbed structure for DQ=100 2602201457414000032.eigenfacs 2602201457414000032.atom making animated gifs 11 models are in 2602201457414000032.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2602201457414000032.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2602201457414000032.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 8 running: ../../bin/get_modes.sh 2602201457414000032 8 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 8 calculating perturbed structure for DQ=-100 2602201457414000032.eigenfacs 2602201457414000032.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2602201457414000032.eigenfacs 2602201457414000032.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2602201457414000032.eigenfacs 2602201457414000032.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2602201457414000032.eigenfacs 2602201457414000032.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2602201457414000032.eigenfacs 2602201457414000032.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2602201457414000032.eigenfacs 2602201457414000032.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2602201457414000032.eigenfacs 2602201457414000032.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2602201457414000032.eigenfacs 2602201457414000032.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2602201457414000032.eigenfacs 2602201457414000032.atom calculating perturbed structure for DQ=80 2602201457414000032.eigenfacs 2602201457414000032.atom calculating perturbed structure for DQ=100 2602201457414000032.eigenfacs 2602201457414000032.atom making animated gifs 11 models are in 2602201457414000032.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2602201457414000032.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2602201457414000032.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 9 running: ../../bin/get_modes.sh 2602201457414000032 9 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 9 calculating perturbed structure for DQ=-100 2602201457414000032.eigenfacs 2602201457414000032.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2602201457414000032.eigenfacs 2602201457414000032.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2602201457414000032.eigenfacs 2602201457414000032.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2602201457414000032.eigenfacs 2602201457414000032.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2602201457414000032.eigenfacs 2602201457414000032.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2602201457414000032.eigenfacs 2602201457414000032.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2602201457414000032.eigenfacs 2602201457414000032.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2602201457414000032.eigenfacs 2602201457414000032.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2602201457414000032.eigenfacs 2602201457414000032.atom calculating perturbed structure for DQ=80 2602201457414000032.eigenfacs 2602201457414000032.atom calculating perturbed structure for DQ=100 2602201457414000032.eigenfacs 2602201457414000032.atom making animated gifs 11 models are in 2602201457414000032.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2602201457414000032.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2602201457414000032.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 10 running: ../../bin/get_modes.sh 2602201457414000032 10 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 10 calculating perturbed structure for DQ=-100 2602201457414000032.eigenfacs 2602201457414000032.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2602201457414000032.eigenfacs 2602201457414000032.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2602201457414000032.eigenfacs 2602201457414000032.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2602201457414000032.eigenfacs 2602201457414000032.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2602201457414000032.eigenfacs 2602201457414000032.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2602201457414000032.eigenfacs 2602201457414000032.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2602201457414000032.eigenfacs 2602201457414000032.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2602201457414000032.eigenfacs 2602201457414000032.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2602201457414000032.eigenfacs 2602201457414000032.atom calculating perturbed structure for DQ=80 2602201457414000032.eigenfacs 2602201457414000032.atom calculating perturbed structure for DQ=100 2602201457414000032.eigenfacs 2602201457414000032.atom making animated gifs 11 models are in 2602201457414000032.10.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2602201457414000032.10.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2602201457414000032.10.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 11 running: ../../bin/get_modes.sh 2602201457414000032 11 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 11 calculating perturbed structure for DQ=-100 2602201457414000032.eigenfacs 2602201457414000032.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2602201457414000032.eigenfacs 2602201457414000032.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2602201457414000032.eigenfacs 2602201457414000032.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2602201457414000032.eigenfacs 2602201457414000032.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2602201457414000032.eigenfacs 2602201457414000032.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2602201457414000032.eigenfacs 2602201457414000032.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2602201457414000032.eigenfacs 2602201457414000032.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2602201457414000032.eigenfacs 2602201457414000032.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2602201457414000032.eigenfacs 2602201457414000032.atom calculating perturbed structure for DQ=80 2602201457414000032.eigenfacs 2602201457414000032.atom calculating perturbed structure for DQ=100 2602201457414000032.eigenfacs 2602201457414000032.atom making animated gifs 11 models are in 2602201457414000032.11.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2602201457414000032.11.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2602201457414000032.11.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 2602201457414000032.10.pdb 2602201457414000032.11.pdb 2602201457414000032.7.pdb 2602201457414000032.8.pdb 2602201457414000032.9.pdb STDERR: Note: The following floating-point exceptions are signalling: IEEE_DENORMAL real 0m17.697s user 0m17.541s sys 0m0.141s rm: cannot remove '2602201457414000032.sdijf': No such file or directory pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format




If you find results from this site helpful for your research, please cite one of our papers:

elNémo is maintained by Yves-Henri Sanejouand.
It was developed by Karsten Suhre.
Between 2003 and 2014, it was hosted by IGS (Marseille).
Between 2015 and 2025, it was hosted by US2B (Nantes).
Last modification: december 26th, 2025.