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please let us know.
elNémo has been hacked on november 27th.
It has been moved away and runs again.
Still some additional cleaning from time to time
Sorry for the inconvenience.

* LYASE (OXO-ACID) 04-MAR-94 1CRM *

LOGs for ID: 260221185340572269

Output from eigenvector calculation:


STDOUT:

CUTOFF set to default value (CUTOFF=8)
Build Tirion matrix:
 Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model.
 Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004.    

 Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file.

 Pdbmat> Coordinate filename     = 260221185340572269.atom

 Pdbmat> Distance cutoff         =       8.00
         Force constant          =      10.00
         Origin of mass values   =       CONS
 Pdbmat> Levelshift              =    1.0E-09
         PRINTing level          =          2

 Pdbmat> Coordinate file 260221185340572269.atom to be opened.

 Openam> File opened: 260221185340572269.atom

 Pdbmat> Coordinate file in PDB format.

 Rdatompdb> Reading pdb file.
 Rdatompdb> End of file reached.
 Rdatompdb> Number of I/O errors:      0

 Rdatompdb> Number of residues found =    256
            First residue number     =      5
            Last  residue number     =    260
            Number of atoms found    =   2009
            Mean number per residue  =      7.8

 Pdbmat> Coordinate statistics: 
 =    36.555262 +/-    10.949067 From:    13.213000 To:    60.864000
 =    14.595027 +/-     9.809918 From:    -8.791000 To:    38.018000
 =   -12.803367 +/-     9.267463 From:   -33.204000 To:     8.014000
 Pdbmat> Masses are all set to one.

 Openam> File opened: pdbmat.xyzm
 Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved.

 Openam> File opened: pdbmat.sdijb

 Pdbmat> Matrix statistics:

 Pdbmat> The matrix is   4.1837 % Filled.
 Pdbmat>       759979  non-zero elements.
 Pdbmat>        83120 atom-atom interactions.

 Pdbmat> Number per atom=     82.75 +/-     23.45
         Maximum number =    132
         Minimum number =     19

 Pdbmat> Matrix trace   = 1.662400E+06
 Pdbmat> Larger element =  500.694    
 Pdbmat>      0 elements larger than +/-  1.0E+10

 Pdbmat> Normal end.
automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1)
256 non-zero elements, NRBL set to 2
Diagonalize Tirion matrix using diagrtb
 Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation.
 Diagrtb> Version 2.52, November 2004. 
 Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file.

 Diagrtb> Options taken into account:

 MATRix filename          = pdbmat.sdijb
 COORdinates filename     = 260221185340572269.atom
 Eigenvector OUTPut file  = matrix.eigenrtb
 Nb of VECTors required   =        106
 EigeNVALues chosen       =       LOWE
 Type of SUBStructuring   =       NONE
 Nb of residues per BLOck =          2
 Origin of MASS values    =       CONS
 MATRix FORMat            =       BINA
 Temporary files cleaning =       ALL 
 Output PRINting level    =          2

 Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb.

 Blocpdb> Entering in.

 Openam> file on opening on unit     10:
 diagrtb_work.xyzm   

 Blocpdb> Coordinate file 260221185340572269.atom to be opened.

 Openam> file on opening on unit     11:
 260221185340572269.atom                                                                                                         

 Blocpdb> Coordinate file in PDB format.

 Blocpdb>  2009 atoms picked in pdb file.
 Blocpdb>   All masses set to unity.
 Blocpdb> Coordinate file is rewritten.

 Blocpdb> Substructuring:
 Blocpdb>     2 residue(s) per block.
 Blocpdb>   256 residues.
 Blocpdb>    18 atoms in block      1
 Block first atom:      1
 Blocpdb>    20 atoms in block      2
 Block first atom:     19
 Blocpdb>    17 atoms in block      3
 Block first atom:     39
 Blocpdb>    12 atoms in block      4
 Block first atom:     56
 Blocpdb>    16 atoms in block      5
 Block first atom:     68
 Blocpdb>    23 atoms in block      6
 Block first atom:     84
 Blocpdb>    15 atoms in block      7
 Block first atom:    107
 Blocpdb>    20 atoms in block      8
 Block first atom:    122
 Blocpdb>    15 atoms in block      9
 Block first atom:    142
 Blocpdb>    13 atoms in block     10
 Block first atom:    157
 Blocpdb>    12 atoms in block     11
 Block first atom:    170
 Blocpdb>    17 atoms in block     12
 Block first atom:    182
 Blocpdb>    13 atoms in block     13
 Block first atom:    199
 Blocpdb>    15 atoms in block     14
 Block first atom:    212
 Blocpdb>    17 atoms in block     15
 Block first atom:    227
 Blocpdb>    13 atoms in block     16
 Block first atom:    244
 Blocpdb>    16 atoms in block     17
 Block first atom:    257
 Blocpdb>    19 atoms in block     18
 Block first atom:    273
 Blocpdb>    15 atoms in block     19
 Block first atom:    292
 Blocpdb>    14 atoms in block     20
 Block first atom:    307
 Blocpdb>    16 atoms in block     21
 Block first atom:    321
 Blocpdb>    14 atoms in block     22
 Block first atom:    337
 Blocpdb>    13 atoms in block     23
 Block first atom:    351
 Blocpdb>    20 atoms in block     24
 Block first atom:    364
 Blocpdb>    12 atoms in block     25
 Block first atom:    384
 Blocpdb>    12 atoms in block     26
 Block first atom:    396
 Blocpdb>    18 atoms in block     27
 Block first atom:    408
 Blocpdb>    16 atoms in block     28
 Block first atom:    426
 Blocpdb>    15 atoms in block     29
 Block first atom:    442
 Blocpdb>    14 atoms in block     30
 Block first atom:    457
 Blocpdb>    17 atoms in block     31
 Block first atom:    471
 Blocpdb>    17 atoms in block     32
 Block first atom:    488
 Blocpdb>    19 atoms in block     33
 Block first atom:    505
 Blocpdb>    17 atoms in block     34
 Block first atom:    524
 Blocpdb>    17 atoms in block     35
 Block first atom:    541
 Blocpdb>    19 atoms in block     36
 Block first atom:    558
 Blocpdb>    13 atoms in block     37
 Block first atom:    577
 Blocpdb>    17 atoms in block     38
 Block first atom:    590
 Blocpdb>     8 atoms in block     39
 Block first atom:    607
 Blocpdb>    18 atoms in block     40
 Block first atom:    615
 Blocpdb>    14 atoms in block     41
 Block first atom:    633
 Blocpdb>    18 atoms in block     42
 Block first atom:    647
 Blocpdb>    19 atoms in block     43
 Block first atom:    665
 Blocpdb>    20 atoms in block     44
 Block first atom:    684
 Blocpdb>    21 atoms in block     45
 Block first atom:    704
 Blocpdb>    21 atoms in block     46
 Block first atom:    725
 Blocpdb>    18 atoms in block     47
 Block first atom:    746
 Blocpdb>    13 atoms in block     48
 Block first atom:    764
 Blocpdb>    17 atoms in block     49
 Block first atom:    777
 Blocpdb>    14 atoms in block     50
 Block first atom:    794
 Blocpdb>    15 atoms in block     51
 Block first atom:    808
 Blocpdb>    17 atoms in block     52
 Block first atom:    823
 Blocpdb>    15 atoms in block     53
 Block first atom:    840
 Blocpdb>    11 atoms in block     54
 Block first atom:    855
 Blocpdb>    21 atoms in block     55
 Block first atom:    866
 Blocpdb>    11 atoms in block     56
 Block first atom:    887
 Blocpdb>    17 atoms in block     57
 Block first atom:    898
 Blocpdb>    17 atoms in block     58
 Block first atom:    915
 Blocpdb>    15 atoms in block     59
 Block first atom:    932
 Blocpdb>    22 atoms in block     60
 Block first atom:    947
 Blocpdb>    11 atoms in block     61
 Block first atom:    969
 Blocpdb>    21 atoms in block     62
 Block first atom:    980
 Blocpdb>    12 atoms in block     63
 Block first atom:   1001
 Blocpdb>    13 atoms in block     64
 Block first atom:   1013
 Blocpdb>    14 atoms in block     65
 Block first atom:   1026
 Blocpdb>    11 atoms in block     66
 Block first atom:   1040
 Blocpdb>    14 atoms in block     67
 Block first atom:   1051
 Blocpdb>    12 atoms in block     68
 Block first atom:   1065
 Blocpdb>    13 atoms in block     69
 Block first atom:   1077
 Blocpdb>    15 atoms in block     70
 Block first atom:   1090
 Blocpdb>    11 atoms in block     71
 Block first atom:   1105
 Blocpdb>    16 atoms in block     72
 Block first atom:   1116
 Blocpdb>    16 atoms in block     73
 Block first atom:   1132
 Blocpdb>    13 atoms in block     74
 Block first atom:   1148
 Blocpdb>    13 atoms in block     75
 Block first atom:   1161
 Blocpdb>    16 atoms in block     76
 Block first atom:   1174
 Blocpdb>    17 atoms in block     77
 Block first atom:   1190
 Blocpdb>    16 atoms in block     78
 Block first atom:   1207
 Blocpdb>    16 atoms in block     79
 Block first atom:   1223
 Blocpdb>    13 atoms in block     80
 Block first atom:   1239
 Blocpdb>    14 atoms in block     81
 Block first atom:   1252
 Blocpdb>    17 atoms in block     82
 Block first atom:   1266
 Blocpdb>    16 atoms in block     83
 Block first atom:   1283
 Blocpdb>    13 atoms in block     84
 Block first atom:   1299
 Blocpdb>    16 atoms in block     85
 Block first atom:   1312
 Blocpdb>    18 atoms in block     86
 Block first atom:   1328
 Blocpdb>    15 atoms in block     87
 Block first atom:   1346
 Blocpdb>    19 atoms in block     88
 Block first atom:   1361
 Blocpdb>    13 atoms in block     89
 Block first atom:   1380
 Blocpdb>    15 atoms in block     90
 Block first atom:   1393
 Blocpdb>    15 atoms in block     91
 Block first atom:   1408
 Blocpdb>    12 atoms in block     92
 Block first atom:   1423
 Blocpdb>    16 atoms in block     93
 Block first atom:   1435
 Blocpdb>    25 atoms in block     94
 Block first atom:   1451
 Blocpdb>    19 atoms in block     95
 Block first atom:   1476
 Blocpdb>    11 atoms in block     96
 Block first atom:   1495
 Blocpdb>    14 atoms in block     97
 Block first atom:   1506
 Blocpdb>    17 atoms in block     98
 Block first atom:   1520
 Blocpdb>    14 atoms in block     99
 Block first atom:   1537
 Blocpdb>    20 atoms in block    100
 Block first atom:   1551
 Blocpdb>    15 atoms in block    101
 Block first atom:   1571
 Blocpdb>    14 atoms in block    102
 Block first atom:   1586
 Blocpdb>    22 atoms in block    103
 Block first atom:   1600
 Blocpdb>    14 atoms in block    104
 Block first atom:   1622
 Blocpdb>    18 atoms in block    105
 Block first atom:   1636
 Blocpdb>    14 atoms in block    106
 Block first atom:   1654
 Blocpdb>    13 atoms in block    107
 Block first atom:   1668
 Blocpdb>    12 atoms in block    108
 Block first atom:   1681
 Blocpdb>    18 atoms in block    109
 Block first atom:   1693
 Blocpdb>    13 atoms in block    110
 Block first atom:   1711
 Blocpdb>    20 atoms in block    111
 Block first atom:   1724
 Blocpdb>    17 atoms in block    112
 Block first atom:   1744
 Blocpdb>    16 atoms in block    113
 Block first atom:   1761
 Blocpdb>    14 atoms in block    114
 Block first atom:   1777
 Blocpdb>    16 atoms in block    115
 Block first atom:   1791
 Blocpdb>    12 atoms in block    116
 Block first atom:   1807
 Blocpdb>    13 atoms in block    117
 Block first atom:   1819
 Blocpdb>    14 atoms in block    118
 Block first atom:   1832
 Blocpdb>    17 atoms in block    119
 Block first atom:   1846
 Blocpdb>    18 atoms in block    120
 Block first atom:   1863
 Blocpdb>    19 atoms in block    121
 Block first atom:   1881
 Blocpdb>    14 atoms in block    122
 Block first atom:   1900
 Blocpdb>    16 atoms in block    123
 Block first atom:   1914
 Blocpdb>    17 atoms in block    124
 Block first atom:   1930
 Blocpdb>    15 atoms in block    125
 Block first atom:   1947
 Blocpdb>    14 atoms in block    126
 Block first atom:   1962
 Blocpdb>    16 atoms in block    127
 Block first atom:   1976
 Blocpdb>    18 atoms in block    128
 Block first atom:   1991

 Blocpdb>   128 blocks.

 Blocpdb> At most,     25 atoms in each of them.
 Blocpdb> At least,     8 atoms in each of them.

 Blocpdb> Normal end of Blocpdb.

 Diagrtb> Memory allocation for Prepmat.
 Diagrtb> Memory allocation for RTB.
 Diagrtb> Memory allocation for Diagstd.
 Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes.

 Prepmat> Entering in.
 Prepmat> Rewriting of the matrix begins.

 Prepmat>       760107 matrix lines read.

 Prepmat> Matrix order    =       6027

 Prepmat> Matrix trace    =    1662400.0000
 Prepmat> Last element read:    6027   6027       214.0866
 Prepmat>         8257 lines saved.
 Prepmat>         6868 empty lines.
 Prepmat> Number of lines on output is as expected.
 Prepmat> Normal end of Prepmat.

 RTB> Entering in.
 RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file:  2009
 RTB> Total mass =        2009.0000
 RTB> Number of atoms found in matrix:  2009
 RTB> Number of blocks =   128
 RTB> Projection begins.
 RTB> Projected matrix is being saved.
 RTB> Projected matrix trace =  178327.6430
 RTB>     48048 non-zero elements.
 RTB> Normal end of RTB.

 Diagstd> Entering in.

 Openam> file on opening on unit     10:
 diagrtb_work.sdijb                      
 Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb                      
 Diagstd> CERFACS matrix format.
 Diagstd> Projected matrix order =      768
 Diagstd> Nb of non-zero elements:    48048
 Diagstd> Projected matrix trace =  178327.6430

 Openam> file on opening on unit     11:
 diagrtb_work.eigenfacs                  
 Diagstd> Diagonalization.

 Diagstd>    768 eigenvectors are computed. 
 Diagstd>    106 of them to be saved. 

 Diagstd> Sum of eigenvalues = 178327.6430
 Diagstd> Best zero-eigenvalue found  :     0.000000

 Diagstd>      6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to:    0.0000000

 Diagstd> Selected eigenvalues: 
      0.0000000      0.0000000      0.0000000      0.0000000      0.0000000
      0.0000000      4.2951731      5.3052031      6.8987216      9.7701658
      9.9618773     10.9572664     12.0956750     12.8715907     14.0715029
     14.9388994     15.9814721     17.0828858     17.2768433     18.8414116
     19.3454379     20.9460977     21.4663180     23.0078951     23.2399581
     25.5839794     26.4464663     27.0167336     27.9247205     29.4669745
     29.9551608     31.0490023     31.7890134     33.1084135     33.7911965
     34.9416334     35.4040796     35.5203507     36.6717006     37.4583952
     39.7385538     39.9932814     40.1396356     41.4227858     42.3850929
     43.4218591     43.9138921     44.3940515     45.2365216     46.7251336
     48.0823316     48.2579010     49.4027982     51.4801170     52.9664562
     53.4616540     54.0727814     55.0679823     55.5677995     56.4460366
     57.7935035     59.7008079     60.2190693     60.2530415     61.7336098
     62.5156852     63.4822694     63.7963395     64.7656855     65.7612144
     66.2367967     66.5997608     67.5528712     68.5360446     68.8159839
     69.5546710     70.5498932     71.5587618     71.8799147     72.4971873
     73.1675380     73.3159119     74.7700841     75.2535137     76.2801784
     77.3078914     78.4318236     78.7092186     80.2165401     80.6124146
     81.5721912     82.7326513     83.6727194     84.4541242     85.2967726
     85.7178749     86.1963481     86.9210110     87.3598902     87.9969009
     88.6563426     89.9592609     90.6184585     90.6931654     91.9163269
     92.3267193

 Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units):
      0.0034332      0.0034337      0.0034338      0.0034340      0.0034343
      0.0034346    225.0534185    250.1187722    285.2197471    339.4268909
    342.7408537    359.4565414    377.6681277    389.5932205    407.3479376
    419.7150883    434.1138791    448.8238213    451.3645818    471.3592112
    477.6222632    496.9890756    503.1228704    520.8752537    523.4954977
    549.2617146    558.4433266    564.4320944    573.8385195    589.4718280
    594.3347279    605.0887868    612.2570643    624.8337300    631.2437120
    641.8992695    646.1330183    647.1931360    657.5984869    664.6145795
    684.5439072    686.7343955    687.9897898    698.8998249    706.9714078
    715.5656540    719.6084354    723.5318788    730.3648802    742.2847806
    752.9879735    754.3614635    763.2574545    779.1391779    790.3068365
    793.9926385    798.5178617    805.8326545    809.4814108    815.8531726
    825.5336714    839.0452522    842.6792495    842.9169123    853.2103528
    858.5978136    865.2099440    867.3475591    873.9121221    880.6030650
    883.7815702    886.1997332    892.5184168    898.9898707    900.8239871
    905.6459109    912.1021104    918.6005243    920.6595378    924.6041939
    928.8690688    929.8104024    938.9862112    942.0168508    948.4209314
    954.7885323    961.7040319    963.4031916    972.5842748    974.9812082
    980.7681289    987.7197808    993.3155227    997.9429436   1002.9091180
   1005.3817052   1008.1837969   1012.4128873   1014.9655932   1018.6593338
   1022.4690855   1029.9549273   1033.7216579   1034.1476762   1041.0979968
   1043.4195801

 Diagstd> Normal end.

 Rtb_to_modes> Entering in.

 Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file =   2009
 Rtb_to_modes> Number of blocs =    128

 Openam> file on opening on unit     10:
 diagrtb_work.eigenfacs                  

 Openam> file on opening on unit     11:
 matrix.eigenrtb                         

 Rdmodfacs> Entering in.

 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     1
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  9.9953E-10

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     2
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  9.9984E-10

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     3
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  9.9993E-10

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     4
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  1.0000E-09

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     5
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  1.0002E-09

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     6
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  1.0004E-09

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     7
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   4.295    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     8
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   5.305    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     9
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   6.899    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    10
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   9.770    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    11
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   9.962    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    12
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   10.96    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    13
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   12.10    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    14
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   12.87    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    15
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   14.07    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    16
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   14.94    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    17
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   15.98    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    18
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   17.08    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    19
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   17.28    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    20
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   18.84    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    21
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   19.35    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    22
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   20.95    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    23
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   21.47    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    24
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   23.01    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    25
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   23.24    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    26
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   25.58    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    27
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   26.45    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    28
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   27.02    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    29
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   27.92    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    30
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   29.47    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    31
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   29.96    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    32
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   31.05    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    33
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   31.79    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    34
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   33.11    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    35
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   33.79    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    36
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   34.94    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    37
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   35.40    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    38
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   35.52    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    39
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   36.67    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    40
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   37.46    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    41
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   39.74    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    42
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   39.99    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    43
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   40.14    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    44
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   41.42    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    45
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   42.39    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    46
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   43.42    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    47
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   43.91    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    48
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   44.39    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    49
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   45.24    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    50
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   46.73    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    51
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   48.08    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    52
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   48.26    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    53
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   49.40    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    54
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   51.48    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    55
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   52.97    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    56
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   53.46    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    57
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   54.07    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    58
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   55.07    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    59
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   55.57    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    60
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   56.45    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    61
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   57.79    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    62
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   59.70    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    63
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   60.22    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    64
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   60.25    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    65
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   61.73    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    66
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   62.52    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    67
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   63.48    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    68
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   63.80    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    69
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   64.77    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    70
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   65.76    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    71
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   66.24    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    72
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   66.60    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    73
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   67.55    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    74
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   68.54    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    75
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   68.82    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    76
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   69.55    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    77
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   70.55    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    78
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   71.56    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    79
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   71.88    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    80
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   72.50    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    81
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   73.17    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    82
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   73.32    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    83
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   74.77    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    84
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   75.25    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    85
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   76.28    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    86
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   77.31    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    87
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   78.43    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    88
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   78.71    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    89
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   80.22    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    90
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   80.61    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    91
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   81.57    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    92
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   82.73    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    93
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   83.67    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    94
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   84.45    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    95
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   85.30    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    96
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   85.72    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    97
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   86.20    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    98
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   86.92    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    99
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   87.36    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   100
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   88.00    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   101
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   88.66    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   102
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   89.96    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   103
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   90.62    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   104
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   90.69    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   105
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   91.92    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   106
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   92.33    

 Rtb_to_modes>  106 vectors, with    768 coordinates in vector file.

 Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected):
 0.99999 1.00000 1.00000 1.00002 1.00003
 1.00000 1.00001 1.00000 0.99999 0.99999
 1.00001 1.00000 1.00001 1.00000 0.99999
 0.99999 1.00000 1.00000 1.00001 1.00001
 1.00000 1.00000 1.00001 1.00001 1.00001
 1.00000 1.00001 1.00000 1.00001 1.00000
 1.00001 1.00004 1.00000 0.99999 1.00003
 1.00000 1.00000 1.00000 1.00001 1.00000
 1.00003 1.00000 0.99999 1.00004 1.00000
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 0.99999 0.99998 1.00001 1.00000 0.99999
 0.99999 1.00002 1.00000 0.99998 1.00002
 1.00000 0.99997 1.00002 0.99999 1.00000
 1.00000 0.99999 1.00002 1.00002 0.99998
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 1.00001 0.99998 1.00000 1.00002 1.00000
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 1.00001 1.00001 0.99997 0.99999 0.99999
 0.99998

 Rtb_to_modes> RTB block-file is being read.
 Rtb_to_modes>    36162 lines found in RTB file.

 Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected):
 0.99999 1.00000 1.00000 1.00002 1.00003
 1.00000 1.00001 1.00000 0.99999 0.99999
 1.00001 1.00000 1.00001 1.00000 0.99999
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 1.00000 1.00000 1.00001 1.00001 1.00001
 1.00000 1.00001 1.00000 1.00001 1.00000
 1.00001 1.00004 1.00000 0.99999 1.00003
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 1.00003 1.00000 0.99999 1.00004 1.00000
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 0.99999 0.99998 1.00001 1.00000 0.99999
 0.99999 1.00002 1.00000 0.99998 1.00002
 1.00000 0.99997 1.00002 0.99999 1.00000
 1.00000 0.99999 1.00002 1.00002 0.99998
 0.99999 0.99999 1.00001 0.99999 1.00000
 1.00001 0.99998 1.00000 1.00002 1.00000
 0.99999 0.99999 0.99998 1.00000 1.00001
 0.99999 1.00000 1.00002 0.99999 1.00000
 0.99999 1.00001 1.00000 1.00000 1.00001
 1.00001 1.00001 0.99997 0.99999 0.99999
 0.99998

 Orthogonality of first eigenvectors (zero expected):
 Vector   2:-0.000
 Vector   3: 0.000-0.000
 Vector   4:-0.000 0.000-0.000
 Vector   5: 0.000 0.000 0.000-0.000
 Vector   6:-0.000-0.000-0.000 0.000 0.000
 Vector   7:-0.000 0.000 0.000 0.000-0.000 0.000
 Vector   8: 0.000-0.000 0.000 0.000 0.000-0.000-0.000
 Vector   9:-0.000 0.000 0.000-0.000 0.000 0.000-0.000 0.000
 Vector  10: 0.000-0.000 0.000-0.000-0.000 0.000-0.000 0.000 0.000

 Rtb_to_modes>   106 eigenvectors saved.

 Rtb_to_modes> Normal end.

 Diagrtb> Normal end.
B-factor analysis
 Bfactors> Version 1.22, Bordeaux.                
 Getnam> Eigenvector filename ?
 Getnam> 260221185340572269.eigenfacs

 Openam> file on opening on unit     10:
 260221185340572269.eigenfacs                                    
 Getnam> Corresponding pdb filename ?
 Getnam> 260221185340572269.atom

 Openam> file on opening on unit     11:
 260221185340572269.atom                                         
 Getnum> Number of skipped eigenvectors ?
 Getnum>            0
 Getnum> Number of usefull eigenvectors ?
 Getnum>        10000
%Getnum-Err: number larger than    106 This is not allowed. Sorry.

 Rdatompdb> Reading pdb file.
 Rdatompdb> End of file reached.
 Rdatompdb> Number of I/O errors:            0

 Rdatompdb> Number of residues found =    256
            First residue number     =      5
            Last  residue number     =    260
            Number of atoms found    =   2009
            Mean number per residue  =      7.8

 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     1
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  9.9953E-10

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     2
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  9.9984E-10

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     3
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  9.9993E-10

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     4
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  1.0000E-09

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     5
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  1.0002E-09

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     6
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  1.0004E-09

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     7
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   4.295    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     8
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   5.305    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     9
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   6.899    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    10
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   9.770    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    11
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   9.962    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    12
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   10.96    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    13
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   12.10    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    14
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   12.87    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    15
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   14.07    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    16
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   14.94    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    17
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   15.98    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    18
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   17.08    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    19
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   17.28    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    20
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   18.84    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    21
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   19.35    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    22
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   20.95    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    23
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   21.47    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    24
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   23.01    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    25
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   23.24    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    26
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   25.58    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    27
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   26.45    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    28
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   27.02    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    29
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   27.92    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    30
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   29.47    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    31
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   29.96    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    32
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   31.05    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    33
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   31.79    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    34
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   33.11    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    35
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   33.79    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    36
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   34.94    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    37
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   35.40    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    38
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   35.52    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    39
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   36.67    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    40
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   37.46    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    41
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   39.74    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    42
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   39.99    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    43
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   40.14    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    44
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   41.42    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    45
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   42.39    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    46
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   43.42    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    47
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   43.91    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    48
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   44.39    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    49
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   45.24    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    50
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   46.73    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    51
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   48.08    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    52
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   48.26    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    53
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   49.40    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    54
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   51.48    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    55
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   52.97    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    56
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   53.46    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    57
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   54.07    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    58
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   55.07    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    59
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   55.57    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    60
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   56.45    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    61
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   57.79    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    62
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   59.70    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    63
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   60.22    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    64
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   60.25    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    65
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   61.73    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    66
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   62.52    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    67
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   63.48    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    68
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   63.80    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    69
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   64.77    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    70
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   65.76    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    71
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   66.24    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    72
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   66.60    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    73
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   67.55    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    74
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   68.54    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    75
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   68.82    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    76
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   69.55    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    77
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   70.55    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    78
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   71.56    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    79
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   71.88    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    80
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   72.50    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    81
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   73.17    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    82
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   73.32    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    83
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   74.77    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    84
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   75.25    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    85
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   76.28    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    86
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   77.31    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    87
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   78.43    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    88
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   78.71    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    89
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   80.22    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    90
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   80.61    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    91
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   81.57    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    92
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   82.73    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    93
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   83.67    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    94
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   84.45    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    95
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   85.30    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    96
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   85.72    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    97
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   86.20    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    98
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   86.92    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    99
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   87.36    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   100
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   88.00    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   101
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   88.66    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   102
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   89.96    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   103
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   90.62    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   104
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   90.69    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   105
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   91.92    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   106
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   92.33    

 Bfactors>  106 vectors,   6027 coordinates in file.

 Openam> file on opening on unit     12:
 bfactors.pred                                                   

 Bfactors> Best zero-eigenvalue found  :     0.000000
 Bfactors>     6 eigenvalues less than :     0.000000
 Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue  :     4.295000
 Bfactors>   100 eigenvectors will be considered.
 Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped.

 Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed.
          (CHARMM units assumed for eigenvalues)

 Bfactors> Correlation=      0.484 for    256 C-alpha atoms.
 Bfactors> =      0.021 +/-   0.02
 Bfactors> =     13.711 +/-   5.53
 Bfactors> Shiftng-fct=     13.690
 Bfactors> Scaling-fct=    241.716

 Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved.

 Bfactors> Normal end.
check_modes
 Chkmod> Version 1.00, Bordeaux.                
 Getnam> Eigenvector filename ?
 Getnam> 260221185340572269.eigenfacs

 Openam> file on opening on unit     10:
 260221185340572269.eigenfacs                                    

 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     1
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:  3.4330E-03

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     2
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:  3.4335E-03

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     3
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:  3.4337E-03

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     4
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:  3.4338E-03

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     5
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:  3.4342E-03

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     6
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:  3.4345E-03

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     7
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   225.0    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     8
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   250.1    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     9
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   285.2    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    10
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   339.4    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    11
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   342.7    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    12
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   359.5    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    13
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   377.7    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    14
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   389.6    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    15
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   407.3    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    16
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   419.7    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    17
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   434.1    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    18
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   448.8    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    19
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   451.4    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    20
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   471.3    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    21
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   477.7    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    22
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   497.0    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    23
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   503.1    

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 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   102
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1030.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   103
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1034.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   104
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1034.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   105
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1041.    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   106
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   1043.    

 Chkmod>  106 vectors,   6027 coordinates in file.
 Chkmod>      That is:   2009 cartesian points.

 Openam> file on opening on unit     11:
 Chkmod.res                                                      
 Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file.

 Chkmod> Normal end.
      0.0034      0.7982
      0.0034      0.9681
      0.0034      0.7498
      0.0034      0.8140
      0.0034      0.7945
      0.0034      0.9041
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    250.1032      0.4216
    285.2133      0.3390
    339.4094      0.4671
    342.7283      0.4180
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   1043.3933      0.3732
getting mode 7
running: ../../bin/get_modes.sh 260221185340572269 7 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 7
calculating perturbed structure for DQ=-100
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calculating perturbed structure for DQ=-80
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calculating perturbed structure for DQ=-60
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260221185340572269.atom
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calculating perturbed structure for DQ=0
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calculating perturbed structure for DQ=20
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calculating perturbed structure for DQ=40
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calculating perturbed structure for DQ=60
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calculating perturbed structure for DQ=80
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making animated gifs
11 models are in 260221185340572269.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 260221185340572269.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 260221185340572269.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 8
running: ../../bin/get_modes.sh 260221185340572269 8 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 8
calculating perturbed structure for DQ=-100
260221185340572269.eigenfacs
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making thumbnail 100x100
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STDERR:
Note: The following floating-point exceptions are signalling: IEEE_DENORMAL

real	0m9.336s
user	0m9.242s
sys	0m0.073s
rm: cannot remove '260221185340572269.sdijf': No such file or directory
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K. Suhre & Y.H. Sanejouand, ElNemo: a normal mode web-server for protein movement analysis and the generation of templates for molecular replacement. Nucleic Acids Research, 32, W610-W614, 2004.
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