CNRS Nantes University US2B US2B
home |  start a new run |  job status |  references&downloads |  examples |  help  

Should you encounter any unexpected behaviour,
please let us know.
elNémo has been hacked on november 27th.
It has been moved away and runs again.
**Still some additional cleaning from time to time**
Sorry for the inconvenience.


***  MADHURJA truncatula medicago single  ***

LOGs for ID: 260222211152815844

Output from eigenvector calculation:


STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8) Build Tirion matrix: Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model. Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004. Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file. Pdbmat> Coordinate filename = 260222211152815844.atom Pdbmat> Distance cutoff = 8.00 Force constant = 10.00 Origin of mass values = CONS Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09 PRINTing level = 2 Pdbmat> Coordinate file 260222211152815844.atom to be opened. Openam> File opened: 260222211152815844.atom Pdbmat> Coordinate file in PDB format. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 192 First residue number = 1 Last residue number = 192 Number of atoms found = 1489 Mean number per residue = 7.8 Pdbmat> Coordinate statistics: = 0.408857 +/- 12.015464 From: -25.278000 To: 27.643000 = 0.439692 +/- 9.406022 From: -21.322000 To: 20.223000 = 0.630294 +/- 11.590543 From: -31.922000 To: 25.827000 Pdbmat> Masses are all set to one. Openam> File opened: pdbmat.xyzm Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved. Openam> File opened: pdbmat.sdijb Pdbmat> Matrix statistics: Pdbmat> The matrix is 4.7783 % Filled. Pdbmat> 476843 non-zero elements. Pdbmat> 51996 atom-atom interactions. Pdbmat> Number per atom= 69.84 +/- 22.98 Maximum number = 125 Minimum number = 11 Pdbmat> Matrix trace = 1.039920E+06 Pdbmat> Larger element = 488.432 Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10 Pdbmat> Normal end. automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1) 192 non-zero elements, NRBL set to 1 Diagonalize Tirion matrix using diagrtb Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation. Diagrtb> Version 2.52, November 2004. Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file. Diagrtb> Options taken into account: MATRix filename = pdbmat.sdijb COORdinates filename = 260222211152815844.atom Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb Nb of VECTors required = 106 EigeNVALues chosen = LOWE Type of SUBStructuring = NONE Nb of residues per BLOck = 1 Origin of MASS values = CONS MATRix FORMat = BINA Temporary files cleaning = ALL Output PRINting level = 2 Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb. Blocpdb> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.xyzm Blocpdb> Coordinate file 260222211152815844.atom to be opened. Openam> file on opening on unit 11: 260222211152815844.atom Blocpdb> Coordinate file in PDB format. Blocpdb> 1489 atoms picked in pdb file. Blocpdb> All masses set to unity. Blocpdb> Coordinate file is rewritten. Blocpdb> Substructuring: Blocpdb> 1 residue(s) per block. Blocpdb> 192 residues. Blocpdb> 8 atoms in block 1 Block first atom: 1 Blocpdb> 8 atoms in block 2 Block first atom: 9 Blocpdb> 8 atoms in block 3 Block first atom: 17 Blocpdb> 11 atoms in block 4 Block first atom: 25 Blocpdb> 9 atoms in block 5 Block first atom: 36 Blocpdb> 6 atoms in block 6 Block first atom: 45 Blocpdb> 8 atoms in block 7 Block first atom: 51 Blocpdb> 5 atoms in block 8 Block first atom: 59 Blocpdb> 8 atoms in block 9 Block first atom: 64 Blocpdb> 9 atoms in block 10 Block first atom: 72 Blocpdb> 7 atoms in block 11 Block first atom: 81 Blocpdb> 8 atoms in block 12 Block first atom: 88 Blocpdb> 7 atoms in block 13 Block first atom: 96 Blocpdb> 6 atoms in block 14 Block first atom: 103 Blocpdb> 8 atoms in block 15 Block first atom: 109 Blocpdb> 6 atoms in block 16 Block first atom: 117 Blocpdb> 7 atoms in block 17 Block first atom: 123 Blocpdb> 5 atoms in block 18 Block first atom: 130 Blocpdb> 9 atoms in block 19 Block first atom: 135 Blocpdb> 10 atoms in block 20 Block first atom: 144 Blocpdb> 8 atoms in block 21 Block first atom: 154 Blocpdb> 11 atoms in block 22 Block first atom: 162 Blocpdb> 6 atoms in block 23 Block first atom: 173 Blocpdb> 9 atoms in block 24 Block first atom: 179 Blocpdb> 9 atoms in block 25 Block first atom: 188 Blocpdb> 6 atoms in block 26 Block first atom: 197 Blocpdb> 8 atoms in block 27 Block first atom: 203 Blocpdb> 8 atoms in block 28 Block first atom: 211 Blocpdb> 8 atoms in block 29 Block first atom: 219 Blocpdb> 8 atoms in block 30 Block first atom: 227 Blocpdb> 7 atoms in block 31 Block first atom: 235 Blocpdb> 11 atoms in block 32 Block first atom: 242 Blocpdb> 6 atoms in block 33 Block first atom: 253 Blocpdb> 7 atoms in block 34 Block first atom: 259 Blocpdb> 8 atoms in block 35 Block first atom: 266 Blocpdb> 6 atoms in block 36 Block first atom: 274 Blocpdb> 8 atoms in block 37 Block first atom: 280 Blocpdb> 9 atoms in block 38 Block first atom: 288 Blocpdb> 7 atoms in block 39 Block first atom: 297 Blocpdb> 7 atoms in block 40 Block first atom: 304 Blocpdb> 8 atoms in block 41 Block first atom: 311 Blocpdb> 6 atoms in block 42 Block first atom: 319 Blocpdb> 8 atoms in block 43 Block first atom: 325 Blocpdb> 8 atoms in block 44 Block first atom: 333 Blocpdb> 5 atoms in block 45 Block first atom: 341 Blocpdb> 6 atoms in block 46 Block first atom: 346 Blocpdb> 4 atoms in block 47 Block first atom: 352 Blocpdb> 6 atoms in block 48 Block first atom: 356 Blocpdb> 9 atoms in block 49 Block first atom: 362 Blocpdb> 4 atoms in block 50 Block first atom: 371 Blocpdb> 7 atoms in block 51 Block first atom: 375 Blocpdb> 7 atoms in block 52 Block first atom: 382 Blocpdb> 9 atoms in block 53 Block first atom: 389 Blocpdb> 9 atoms in block 54 Block first atom: 398 Blocpdb> 9 atoms in block 55 Block first atom: 407 Blocpdb> 8 atoms in block 56 Block first atom: 416 Blocpdb> 11 atoms in block 57 Block first atom: 424 Blocpdb> 8 atoms in block 58 Block first atom: 435 Blocpdb> 11 atoms in block 59 Block first atom: 443 Blocpdb> 8 atoms in block 60 Block first atom: 454 Blocpdb> 9 atoms in block 61 Block first atom: 462 Blocpdb> 6 atoms in block 62 Block first atom: 471 Blocpdb> 9 atoms in block 63 Block first atom: 477 Blocpdb> 6 atoms in block 64 Block first atom: 486 Blocpdb> 7 atoms in block 65 Block first atom: 492 Blocpdb> 8 atoms in block 66 Block first atom: 499 Blocpdb> 10 atoms in block 67 Block first atom: 507 Blocpdb> 8 atoms in block 68 Block first atom: 517 Blocpdb> 8 atoms in block 69 Block first atom: 525 Blocpdb> 12 atoms in block 70 Block first atom: 533 Blocpdb> 11 atoms in block 71 Block first atom: 545 Blocpdb> 5 atoms in block 72 Block first atom: 556 Blocpdb> 6 atoms in block 73 Block first atom: 561 Blocpdb> 9 atoms in block 74 Block first atom: 567 Blocpdb> 8 atoms in block 75 Block first atom: 576 Blocpdb> 7 atoms in block 76 Block first atom: 584 Blocpdb> 6 atoms in block 77 Block first atom: 591 Blocpdb> 7 atoms in block 78 Block first atom: 597 Blocpdb> 8 atoms in block 79 Block first atom: 604 Blocpdb> 8 atoms in block 80 Block first atom: 612 Blocpdb> 6 atoms in block 81 Block first atom: 620 Blocpdb> 8 atoms in block 82 Block first atom: 626 Blocpdb> 5 atoms in block 83 Block first atom: 634 Blocpdb> 6 atoms in block 84 Block first atom: 639 Blocpdb> 7 atoms in block 85 Block first atom: 645 Blocpdb> 5 atoms in block 86 Block first atom: 652 Blocpdb> 4 atoms in block 87 Block first atom: 657 Blocpdb> 4 atoms in block 88 Block first atom: 661 Blocpdb> 7 atoms in block 89 Block first atom: 665 Blocpdb> 8 atoms in block 90 Block first atom: 672 Blocpdb> 8 atoms in block 91 Block first atom: 680 Blocpdb> 6 atoms in block 92 Block first atom: 688 Blocpdb> 11 atoms in block 93 Block first atom: 694 Blocpdb> 7 atoms in block 94 Block first atom: 705 Blocpdb> 8 atoms in block 95 Block first atom: 712 Blocpdb> 4 atoms in block 96 Block first atom: 720 Blocpdb> 7 atoms in block 97 Block first atom: 724 Blocpdb> 14 atoms in block 98 Block first atom: 731 Blocpdb> 7 atoms in block 99 Block first atom: 745 Blocpdb> 8 atoms in block 100 Block first atom: 752 Blocpdb> 9 atoms in block 101 Block first atom: 760 Blocpdb> 7 atoms in block 102 Block first atom: 769 Blocpdb> 8 atoms in block 103 Block first atom: 776 Blocpdb> 6 atoms in block 104 Block first atom: 784 Blocpdb> 8 atoms in block 105 Block first atom: 790 Blocpdb> 9 atoms in block 106 Block first atom: 798 Blocpdb> 7 atoms in block 107 Block first atom: 807 Blocpdb> 6 atoms in block 108 Block first atom: 814 Blocpdb> 11 atoms in block 109 Block first atom: 820 Blocpdb> 9 atoms in block 110 Block first atom: 831 Blocpdb> 9 atoms in block 111 Block first atom: 840 Blocpdb> 8 atoms in block 112 Block first atom: 849 Blocpdb> 7 atoms in block 113 Block first atom: 857 Blocpdb> 6 atoms in block 114 Block first atom: 864 Blocpdb> 7 atoms in block 115 Block first atom: 870 Blocpdb> 10 atoms in block 116 Block first atom: 877 Blocpdb> 11 atoms in block 117 Block first atom: 887 Blocpdb> 9 atoms in block 118 Block first atom: 898 Blocpdb> 5 atoms in block 119 Block first atom: 907 Blocpdb> 5 atoms in block 120 Block first atom: 912 Blocpdb> 8 atoms in block 121 Block first atom: 917 Blocpdb> 6 atoms in block 122 Block first atom: 925 Blocpdb> 6 atoms in block 123 Block first atom: 931 Blocpdb> 7 atoms in block 124 Block first atom: 937 Blocpdb> 8 atoms in block 125 Block first atom: 944 Blocpdb> 11 atoms in block 126 Block first atom: 952 Blocpdb> 9 atoms in block 127 Block first atom: 963 Blocpdb> 8 atoms in block 128 Block first atom: 972 Blocpdb> 9 atoms in block 129 Block first atom: 980 Blocpdb> 5 atoms in block 130 Block first atom: 989 Blocpdb> 7 atoms in block 131 Block first atom: 994 Blocpdb> 9 atoms in block 132 Block first atom: 1001 Blocpdb> 7 atoms in block 133 Block first atom: 1010 Blocpdb> 7 atoms in block 134 Block first atom: 1017 Blocpdb> 8 atoms in block 135 Block first atom: 1024 Blocpdb> 9 atoms in block 136 Block first atom: 1032 Blocpdb> 7 atoms in block 137 Block first atom: 1041 Blocpdb> 8 atoms in block 138 Block first atom: 1048 Blocpdb> 6 atoms in block 139 Block first atom: 1056 Blocpdb> 14 atoms in block 140 Block first atom: 1062 Blocpdb> 5 atoms in block 141 Block first atom: 1076 Blocpdb> 9 atoms in block 142 Block first atom: 1081 Blocpdb> 9 atoms in block 143 Block first atom: 1090 Blocpdb> 9 atoms in block 144 Block first atom: 1099 Blocpdb> 7 atoms in block 145 Block first atom: 1108 Blocpdb> 8 atoms in block 146 Block first atom: 1115 Blocpdb> 4 atoms in block 147 Block first atom: 1123 Blocpdb> 8 atoms in block 148 Block first atom: 1127 Blocpdb> 8 atoms in block 149 Block first atom: 1135 Blocpdb> 9 atoms in block 150 Block first atom: 1143 Blocpdb> 9 atoms in block 151 Block first atom: 1152 Blocpdb> 8 atoms in block 152 Block first atom: 1161 Blocpdb> 8 atoms in block 153 Block first atom: 1169 Blocpdb> 7 atoms in block 154 Block first atom: 1177 Blocpdb> 8 atoms in block 155 Block first atom: 1184 Blocpdb> 4 atoms in block 156 Block first atom: 1192 Blocpdb> 6 atoms in block 157 Block first atom: 1196 Blocpdb> 7 atoms in block 158 Block first atom: 1202 Blocpdb> 8 atoms in block 159 Block first atom: 1209 Blocpdb> 8 atoms in block 160 Block first atom: 1217 Blocpdb> 5 atoms in block 161 Block first atom: 1225 Blocpdb> 7 atoms in block 162 Block first atom: 1230 Blocpdb> 11 atoms in block 163 Block first atom: 1237 Blocpdb> 8 atoms in block 164 Block first atom: 1248 Blocpdb> 8 atoms in block 165 Block first atom: 1256 Blocpdb> 11 atoms in block 166 Block first atom: 1264 Blocpdb> 5 atoms in block 167 Block first atom: 1275 Blocpdb> 8 atoms in block 168 Block first atom: 1280 Blocpdb> 5 atoms in block 169 Block first atom: 1288 Blocpdb> 8 atoms in block 170 Block first atom: 1293 Blocpdb> 12 atoms in block 171 Block first atom: 1301 Blocpdb> 11 atoms in block 172 Block first atom: 1313 Blocpdb> 9 atoms in block 173 Block first atom: 1324 Blocpdb> 4 atoms in block 174 Block first atom: 1333 Blocpdb> 5 atoms in block 175 Block first atom: 1337 Blocpdb> 14 atoms in block 176 Block first atom: 1342 Blocpdb> 8 atoms in block 177 Block first atom: 1356 Blocpdb> 8 atoms in block 178 Block first atom: 1364 Blocpdb> 9 atoms in block 179 Block first atom: 1372 Blocpdb> 11 atoms in block 180 Block first atom: 1381 Blocpdb> 8 atoms in block 181 Block first atom: 1392 Blocpdb> 5 atoms in block 182 Block first atom: 1400 Blocpdb> 6 atoms in block 183 Block first atom: 1405 Blocpdb> 9 atoms in block 184 Block first atom: 1411 Blocpdb> 11 atoms in block 185 Block first atom: 1420 Blocpdb> 9 atoms in block 186 Block first atom: 1431 Blocpdb> 7 atoms in block 187 Block first atom: 1440 Blocpdb> 7 atoms in block 188 Block first atom: 1447 Blocpdb> 6 atoms in block 189 Block first atom: 1454 Blocpdb> 11 atoms in block 190 Block first atom: 1460 Blocpdb> 7 atoms in block 191 Block first atom: 1471 Blocpdb> 12 atoms in block 192 Block first atom: 1477 Blocpdb> 192 blocks. Blocpdb> At most, 14 atoms in each of them. Blocpdb> At least, 4 atoms in each of them. Blocpdb> Normal end of Blocpdb. Diagrtb> Memory allocation for Prepmat. Diagrtb> Memory allocation for RTB. Diagrtb> Memory allocation for Diagstd. Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes. Prepmat> Entering in. Prepmat> Rewriting of the matrix begins. Prepmat> 477035 matrix lines read. Prepmat> Matrix order = 4467 Prepmat> Matrix trace = 1039920.0000 Prepmat> Last element read: 4467 4467 144.7275 Prepmat> 18529 lines saved. Prepmat> 16446 empty lines. Prepmat> Number of lines on output is as expected. Prepmat> Normal end of Prepmat. RTB> Entering in. RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 1489 RTB> Total mass = 1489.0000 RTB> Number of atoms found in matrix: 1489 RTB> Number of blocks = 192 RTB> Projection begins. RTB> Projected matrix is being saved. RTB> Projected matrix trace = 242228.3503 RTB> 72072 non-zero elements. RTB> Normal end of RTB. Diagstd> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.sdijb Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb Diagstd> CERFACS matrix format. Diagstd> Projected matrix order = 1152 Diagstd> Nb of non-zero elements: 72072 Diagstd> Projected matrix trace = 242228.3503 Openam> file on opening on unit 11: diagrtb_work.eigenfacs Diagstd> Diagonalization. Diagstd> 1152 eigenvectors are computed. Diagstd> 106 of them to be saved. Diagstd> Sum of eigenvalues = 242228.3503 Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000 Diagstd> Selected eigenvalues: 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0493691 0.1311790 0.2467050 0.3043483 0.4825621 0.6128564 0.9682944 1.0621270 1.2222356 1.8350321 2.0367096 2.7756020 3.0334830 3.2133036 3.8890174 4.0964161 4.6792754 5.0191670 5.5166101 6.7185525 7.3245714 8.0849547 8.4750717 8.7703372 9.4980474 10.1686943 10.3692464 10.5694481 11.1943595 11.5846181 12.5556239 12.7517969 13.0275328 13.3219146 14.0441405 14.4893500 14.8025952 15.3251662 16.8022707 16.9549230 17.4065623 18.1800183 18.3944685 19.2395051 19.8866130 20.1273164 21.3005212 21.5707879 21.8704816 22.6432474 23.2824193 23.8649031 24.2589162 25.2108586 25.6145352 25.8568700 26.1531669 27.0235276 27.2627387 27.8285508 27.9948519 29.1504318 29.6558928 30.2226389 30.9340598 31.6423249 31.7558203 32.7448847 33.7330859 34.5591177 34.9146142 35.1619460 35.2845664 36.2993138 36.4257472 37.7361803 37.8790317 38.1253824 38.6349082 39.1111934 39.7347807 40.0362431 40.7105395 41.2468576 41.8809662 42.5459560 43.4034585 44.3077644 45.5696319 46.3529793 46.4448415 46.8599380 47.7078648 48.3545814 48.8895792 49.5466734 49.5675954 49.9243502 50.7286016 51.0864189 Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units): 0.0034331 0.0034332 0.0034334 0.0034335 0.0034335 0.0034342 24.1280829 39.3303155 53.9366897 59.9074316 75.4348227 85.0109043 106.8560211 111.9137645 120.0529245 147.1015056 154.9743555 180.9147075 189.1324554 194.6575097 214.1485920 219.7846271 234.9008479 243.2826306 255.0535820 281.4706642 293.8910685 308.7692741 316.1309174 321.5906601 334.6666570 346.2803733 349.6784582 353.0379845 363.3246852 369.6035565 384.7817172 387.7760426 391.9461181 396.3497631 406.9516968 413.3517039 417.7959368 425.1066289 445.1222148 447.1396594 453.0558934 463.0122045 465.7350280 476.3127733 484.2567595 487.1786163 501.1761493 504.3456557 507.8371339 516.7311418 523.9735126 530.4874550 534.8487408 545.2417441 549.5896179 552.1832857 555.3380397 564.5030603 566.9960332 572.8495494 574.5586496 586.2971411 591.3584159 596.9823227 603.9677383 610.8428197 611.9373309 621.3939391 630.7007047 638.3760766 641.6510424 643.9197289 645.0415240 654.2511400 655.3895533 667.0743617 668.3357840 670.5055616 674.9711694 679.1188950 684.5114078 687.1031493 692.8651363 697.4140849 702.7544860 708.3117134 715.4140230 722.8283854 733.0490591 739.3228124 740.0550436 743.3547743 750.0500950 755.1167335 759.2825693 764.3680589 764.5294263 767.2757827 773.4312676 776.1541974 Diagstd> Normal end. Rtb_to_modes> Entering in. Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 1489 Rtb_to_modes> Number of blocs = 192 Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.eigenfacs Openam> file on opening on unit 11: matrix.eigenrtb Rdmodfacs> Entering in. Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Eigenvector number: 1 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9952E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 2 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9953E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 3 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9966E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 4 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9973E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 5 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9976E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 6 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0001E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 7 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.9369E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 8 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.1312 Rdmodfacs> Eigenvector number: 9 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.2467 Rdmodfacs> Eigenvector number: 10 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.3043 Rdmodfacs> Eigenvector number: 11 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.4826 Rdmodfacs> Eigenvector number: 12 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.6129 Rdmodfacs> Eigenvector number: 13 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.9683 Rdmodfacs> Eigenvector number: 14 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.062 Rdmodfacs> Eigenvector number: 15 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.222 Rdmodfacs> Eigenvector number: 16 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.835 Rdmodfacs> Eigenvector number: 17 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.037 Rdmodfacs> Eigenvector number: 18 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.776 Rdmodfacs> Eigenvector number: 19 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.033 Rdmodfacs> Eigenvector number: 20 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.213 Rdmodfacs> Eigenvector number: 21 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.889 Rdmodfacs> Eigenvector number: 22 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.096 Rdmodfacs> Eigenvector number: 23 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.679 Rdmodfacs> Eigenvector number: 24 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.019 Rdmodfacs> Eigenvector number: 25 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.517 Rdmodfacs> Eigenvector number: 26 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.719 Rdmodfacs> Eigenvector number: 27 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.325 Rdmodfacs> Eigenvector number: 28 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.085 Rdmodfacs> Eigenvector number: 29 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.475 Rdmodfacs> Eigenvector number: 30 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.770 Rdmodfacs> Eigenvector number: 31 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.498 Rdmodfacs> Eigenvector number: 32 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.17 Rdmodfacs> Eigenvector number: 33 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.37 Rdmodfacs> Eigenvector number: 34 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.57 Rdmodfacs> Eigenvector number: 35 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.19 Rdmodfacs> Eigenvector number: 36 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.58 Rdmodfacs> Eigenvector number: 37 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.56 Rdmodfacs> Eigenvector number: 38 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.75 Rdmodfacs> Eigenvector number: 39 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.03 Rdmodfacs> Eigenvector number: 40 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.32 Rdmodfacs> Eigenvector number: 41 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.04 Rdmodfacs> Eigenvector number: 42 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.49 Rdmodfacs> Eigenvector number: 43 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.80 Rdmodfacs> Eigenvector number: 44 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.33 Rdmodfacs> Eigenvector number: 45 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.80 Rdmodfacs> Eigenvector number: 46 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.95 Rdmodfacs> Eigenvector number: 47 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.41 Rdmodfacs> Eigenvector number: 48 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.18 Rdmodfacs> Eigenvector number: 49 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.39 Rdmodfacs> Eigenvector number: 50 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.24 Rdmodfacs> Eigenvector number: 51 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.89 Rdmodfacs> Eigenvector number: 52 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.13 Rdmodfacs> Eigenvector number: 53 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.30 Rdmodfacs> Eigenvector number: 54 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.57 Rdmodfacs> Eigenvector number: 55 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.87 Rdmodfacs> Eigenvector number: 56 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.64 Rdmodfacs> Eigenvector number: 57 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.28 Rdmodfacs> Eigenvector number: 58 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.86 Rdmodfacs> Eigenvector number: 59 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.26 Rdmodfacs> Eigenvector number: 60 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.21 Rdmodfacs> Eigenvector number: 61 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.61 Rdmodfacs> Eigenvector number: 62 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.86 Rdmodfacs> Eigenvector number: 63 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.15 Rdmodfacs> Eigenvector number: 64 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 65 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.26 Rdmodfacs> Eigenvector number: 66 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.83 Rdmodfacs> Eigenvector number: 67 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.99 Rdmodfacs> Eigenvector number: 68 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.15 Rdmodfacs> Eigenvector number: 69 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.66 Rdmodfacs> Eigenvector number: 70 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.22 Rdmodfacs> Eigenvector number: 71 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.93 Rdmodfacs> Eigenvector number: 72 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.64 Rdmodfacs> Eigenvector number: 73 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.76 Rdmodfacs> Eigenvector number: 74 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.74 Rdmodfacs> Eigenvector number: 75 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.73 Rdmodfacs> Eigenvector number: 76 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.56 Rdmodfacs> Eigenvector number: 77 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.91 Rdmodfacs> Eigenvector number: 78 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.16 Rdmodfacs> Eigenvector number: 79 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.28 Rdmodfacs> Eigenvector number: 80 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.30 Rdmodfacs> Eigenvector number: 81 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.43 Rdmodfacs> Eigenvector number: 82 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.74 Rdmodfacs> Eigenvector number: 83 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.88 Rdmodfacs> Eigenvector number: 84 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.13 Rdmodfacs> Eigenvector number: 85 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.63 Rdmodfacs> Eigenvector number: 86 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.11 Rdmodfacs> Eigenvector number: 87 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.73 Rdmodfacs> Eigenvector number: 88 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.04 Rdmodfacs> Eigenvector number: 89 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.71 Rdmodfacs> Eigenvector number: 90 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.25 Rdmodfacs> Eigenvector number: 91 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.88 Rdmodfacs> Eigenvector number: 92 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.55 Rdmodfacs> Eigenvector number: 93 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.40 Rdmodfacs> Eigenvector number: 94 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.31 Rdmodfacs> Eigenvector number: 95 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.57 Rdmodfacs> Eigenvector number: 96 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.35 Rdmodfacs> Eigenvector number: 97 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.44 Rdmodfacs> Eigenvector number: 98 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.86 Rdmodfacs> Eigenvector number: 99 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 47.71 Rdmodfacs> Eigenvector number: 100 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 48.35 Rdmodfacs> Eigenvector number: 101 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 48.89 Rdmodfacs> Eigenvector number: 102 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 49.55 Rdmodfacs> Eigenvector number: 103 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 49.57 Rdmodfacs> Eigenvector number: 104 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 49.92 Rdmodfacs> Eigenvector number: 105 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 50.73 Rdmodfacs> Eigenvector number: 106 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 51.09 Rtb_to_modes> 106 vectors, with 1152 coordinates in vector file. Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected): 1.00000 1.00000 1.00000 0.99999 1.00001 0.99997 0.99997 1.00000 0.99999 1.00000 0.99997 0.99999 0.99999 0.99996 1.00001 1.00001 1.00000 1.00002 1.00001 1.00001 1.00002 1.00002 0.99996 0.99999 1.00000 1.00002 1.00001 1.00003 1.00006 1.00002 1.00000 0.99999 0.99998 1.00002 1.00000 1.00002 0.99998 0.99999 1.00000 1.00003 1.00002 1.00002 0.99997 0.99999 0.99998 0.99995 0.99997 0.99999 1.00000 1.00000 0.99999 1.00002 1.00000 1.00002 0.99999 1.00001 1.00000 1.00000 1.00002 1.00003 1.00002 1.00002 0.99997 1.00000 1.00000 1.00000 0.99999 0.99999 1.00001 1.00000 0.99999 1.00002 1.00003 0.99999 1.00003 0.99999 1.00002 0.99998 0.99998 1.00002 1.00000 0.99998 1.00002 0.99999 0.99999 1.00001 1.00000 0.99999 1.00002 1.00002 0.99999 1.00001 1.00000 1.00000 0.99999 1.00003 1.00005 0.99999 1.00003 1.00003 0.99999 1.00000 1.00002 1.00000 0.99999 0.99997 Rtb_to_modes> RTB block-file is being read. Rtb_to_modes> 26802 lines found in RTB file. Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected): 1.00000 1.00000 1.00000 0.99999 1.00001 0.99997 0.99997 1.00000 0.99999 1.00000 0.99997 0.99999 0.99999 0.99996 1.00001 1.00001 1.00000 1.00002 1.00001 1.00001 1.00002 1.00002 0.99996 0.99999 1.00000 1.00002 1.00001 1.00003 1.00006 1.00002 1.00000 0.99999 0.99998 1.00002 1.00000 1.00002 0.99998 0.99999 1.00000 1.00003 1.00002 1.00002 0.99997 0.99999 0.99998 0.99995 0.99997 0.99999 1.00000 1.00000 0.99999 1.00002 1.00000 1.00002 0.99999 1.00001 1.00000 1.00000 1.00002 1.00003 1.00002 1.00002 0.99997 1.00000 1.00000 1.00000 0.99999 0.99999 1.00001 1.00000 0.99999 1.00002 1.00003 0.99999 1.00003 0.99999 1.00002 0.99998 0.99998 1.00002 1.00000 0.99998 1.00002 0.99999 0.99999 1.00001 1.00000 0.99999 1.00002 1.00002 0.99999 1.00001 1.00000 1.00000 0.99999 1.00003 1.00005 0.99999 1.00003 1.00003 0.99999 1.00000 1.00002 1.00000 0.99999 0.99997 Orthogonality of first eigenvectors (zero expected): Vector 2:-0.000 Vector 3:-0.000 0.000 Vector 4:-0.000-0.000-0.000 Vector 5:-0.000-0.000 0.000-0.000 Vector 6: 0.000-0.000-0.000 0.000-0.000 Vector 7: 0.000 0.000 0.000 0.000-0.000 0.000 Vector 8: 0.000 0.000-0.000-0.000 0.000-0.000-0.000 Vector 9:-0.000-0.000 0.000 0.000 0.000-0.000 0.000 0.000 Vector 10:-0.000-0.000 0.000 0.000-0.000 0.000 0.000-0.000 0.000 Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved. Rtb_to_modes> Normal end. Diagrtb> Normal end. B-factor analysis Bfactors> Version 1.22, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 260222211152815844.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 260222211152815844.eigenfacs Getnam> Corresponding pdb filename ? Getnam> 260222211152815844.atom Openam> file on opening on unit 11: 260222211152815844.atom Getnum> Number of skipped eigenvectors ? Getnum> 0 Getnum> Number of usefull eigenvectors ? Getnum> 10000 %Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 192 First residue number = 1 Last residue number = 192 Number of atoms found = 1489 Mean number per residue = 7.8 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9952E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9953E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9966E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9973E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9976E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0001E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.9369E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.1312 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.2467 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.3043 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.4826 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.6129 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.9683 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.062 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.222 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.835 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.037 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.776 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.033 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.213 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.889 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.096 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.679 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.019 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.517 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.719 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.325 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.085 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.475 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.770 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.498 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.17 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.37 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.57 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.19 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.58 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.56 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.75 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.32 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.04 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.49 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.80 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.33 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.80 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.95 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.41 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.18 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.39 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.24 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.89 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.13 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.30 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.57 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.87 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.64 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.28 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.86 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.26 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.21 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.61 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.86 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.15 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.26 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.83 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.99 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.15 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.66 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.22 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.93 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.64 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.76 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.74 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.73 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.56 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.91 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.16 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.28 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.30 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.43 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.74 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.88 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.13 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.63 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.11 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.73 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.04 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.71 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.25 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.88 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.55 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.40 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.31 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.57 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.35 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.44 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.86 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.71 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.35 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.89 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.55 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.57 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.92 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 50.73 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 51.09 Bfactors> 106 vectors, 4467 coordinates in file. Openam> file on opening on unit 12: bfactors.pred Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000 Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 0.049369 Bfactors> 100 eigenvectors will be considered. Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped. Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed. (CHARMM units assumed for eigenvalues) Bfactors> Correlation= -0.170 for 192 C-alpha atoms. Bfactors> = 0.451 +/- 0.98 Bfactors> = 93.808 +/- 4.52 Bfactors> Shiftng-fct= 93.357 Bfactors> Scaling-fct= 4.632 Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved. Bfactors> Normal end. check_modes Chkmod> Version 1.00, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 260222211152815844.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 260222211152815844.eigenfacs Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4330E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4330E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4332E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4333E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4334E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4340E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 24.13 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 39.33 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 53.93 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 59.90 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 75.43 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 85.01 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 106.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 111.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 120.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 147.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 155.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 180.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 189.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 194.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 214.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 219.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 234.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 243.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 255.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 281.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 293.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 308.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 316.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 321.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 334.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 346.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 349.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 353.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 363.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 369.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 384.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 387.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 392.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 396.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 406.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 413.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 417.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 425.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 445.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 447.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 453.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 463.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 465.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 476.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 484.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 487.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 501.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 504.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 507.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 516.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 523.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 530.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 534.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 545.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 549.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 552.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 555.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 564.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 566.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 572.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 574.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 586.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 591.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 596.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 603.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 610.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 612.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 621.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 630.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 638.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 641.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 643.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 645.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 654.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 655.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 667.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 668.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 670.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 674.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 679.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 684.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 687.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 692.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 697.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 702.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 708.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 715.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 722.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 733.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 739.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 740.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 743.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 750.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 755.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 759.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 764.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 764.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 767.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 773.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 776.1 Chkmod> 106 vectors, 4467 coordinates in file. Chkmod> That is: 1489 cartesian points. Openam> file on opening on unit 11: Chkmod.res Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file. %Chkmod-Wn> Norm of vector 29 is: 1.0001 (instead of 1.0000). %Chkmod-Wn> Norm of vector 46 is: 0.9999 (instead of 1.0000). %Chkmod-Wn> Norm of vector 97 is: 1.0001 (instead of 1.0000). Chkmod> Normal end. 0.0034 0.7796 0.0034 0.8804 0.0034 0.7782 0.0034 0.7513 0.0034 0.7226 0.0034 0.7706 24.1270 0.2536 39.3318 0.1195 53.9338 0.3016 59.9001 0.2662 75.4345 0.1942 85.0103 0.1918 106.8517 0.3703 111.9023 0.0888 120.0362 0.2235 147.0939 0.3379 154.9787 0.5462 180.9199 0.5100 189.1093 0.1212 194.6400 0.4468 214.1389 0.3355 219.7640 0.2826 234.8839 0.1443 243.2681 0.2253 255.0516 0.2959 281.4680 0.2874 293.8871 0.1745 308.7569 0.1548 316.1160 0.1531 321.5707 0.3790 334.6515 0.3051 346.2877 0.1814 349.6762 0.2756 353.0320 0.4574 363.2383 0.3601 369.5140 0.2741 384.8322 0.2217 387.7321 0.3708 391.9664 0.1726 396.3043 0.1992 406.8742 0.2944 413.3432 0.4466 417.7414 0.1437 425.1554 0.4279 445.0730 0.3849 447.0555 0.1758 453.0812 0.3384 462.9921 0.3115 465.6585 0.3197 476.2985 0.4329 484.2772 0.3872 487.1902 0.1907 501.1485 0.4069 504.3148 0.3323 507.8097 0.1214 516.6719 0.2783 523.9238 0.4423 530.4102 0.3806 534.8377 0.4037 545.2091 0.1431 549.5174 0.4133 552.1930 0.1506 555.2806 0.2828 564.4420 0.2883 566.9432 0.4362 572.8399 0.1647 574.4842 0.4413 586.2676 0.3545 591.3740 0.2855 596.9306 0.1892 603.9022 0.3923 610.7942 0.3237 611.9513 0.1236 621.3209 0.4699 630.6448 0.3831 638.3568 0.2746 641.5811 0.1635 643.8743 0.2180 644.9721 0.1501 654.2292 0.2507 655.3997 0.2437 667.0795 0.4285 668.3156 0.2172 670.5174 0.2586 674.8993 0.3716 679.0794 0.3933 684.4408 0.1593 687.1059 0.3143 692.8308 0.3752 697.4107 0.3919 702.7162 0.4474 708.3150 0.1494 715.3548 0.3427 722.8156 0.2940 733.0206 0.4490 739.2673 0.2032 739.9847 0.0625 743.3234 0.3979 750.0347 0.0386 755.0485 0.2545 759.2532 0.1095 764.3609 0.3847 764.5152 0.4144 767.2094 0.3570 773.4087 0.4456 776.1481 0.1270 getting mode 7 running: ../../bin/get_modes.sh 260222211152815844 7 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 7 calculating perturbed structure for DQ=-100 260222211152815844.eigenfacs 260222211152815844.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 260222211152815844.eigenfacs 260222211152815844.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 260222211152815844.eigenfacs 260222211152815844.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 260222211152815844.eigenfacs 260222211152815844.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 260222211152815844.eigenfacs 260222211152815844.atom calculating perturbed structure for DQ=0 260222211152815844.eigenfacs 260222211152815844.atom calculating perturbed structure for DQ=20 260222211152815844.eigenfacs 260222211152815844.atom calculating perturbed structure for DQ=40 260222211152815844.eigenfacs 260222211152815844.atom calculating perturbed structure for DQ=60 260222211152815844.eigenfacs 260222211152815844.atom calculating perturbed structure for DQ=80 260222211152815844.eigenfacs 260222211152815844.atom calculating perturbed structure for DQ=100 260222211152815844.eigenfacs 260222211152815844.atom making animated gifs 11 models are in 260222211152815844.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 260222211152815844.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 260222211152815844.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 8 running: ../../bin/get_modes.sh 260222211152815844 8 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 8 calculating perturbed structure for DQ=-100 260222211152815844.eigenfacs 260222211152815844.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 260222211152815844.eigenfacs 260222211152815844.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 260222211152815844.eigenfacs 260222211152815844.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 260222211152815844.eigenfacs 260222211152815844.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 260222211152815844.eigenfacs 260222211152815844.atom calculating perturbed structure for DQ=0 260222211152815844.eigenfacs 260222211152815844.atom calculating perturbed structure for DQ=20 260222211152815844.eigenfacs 260222211152815844.atom calculating perturbed structure for DQ=40 260222211152815844.eigenfacs 260222211152815844.atom calculating perturbed structure for DQ=60 260222211152815844.eigenfacs 260222211152815844.atom calculating perturbed structure for DQ=80 260222211152815844.eigenfacs 260222211152815844.atom calculating perturbed structure for DQ=100 260222211152815844.eigenfacs 260222211152815844.atom making animated gifs 11 models are in 260222211152815844.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 260222211152815844.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 260222211152815844.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 9 running: ../../bin/get_modes.sh 260222211152815844 9 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 9 calculating perturbed structure for DQ=-100 260222211152815844.eigenfacs 260222211152815844.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 260222211152815844.eigenfacs 260222211152815844.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 260222211152815844.eigenfacs 260222211152815844.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 260222211152815844.eigenfacs 260222211152815844.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 260222211152815844.eigenfacs 260222211152815844.atom calculating perturbed structure for DQ=0 260222211152815844.eigenfacs 260222211152815844.atom calculating perturbed structure for DQ=20 260222211152815844.eigenfacs 260222211152815844.atom calculating perturbed structure for DQ=40 260222211152815844.eigenfacs 260222211152815844.atom calculating perturbed structure for DQ=60 260222211152815844.eigenfacs 260222211152815844.atom calculating perturbed structure for DQ=80 260222211152815844.eigenfacs 260222211152815844.atom calculating perturbed structure for DQ=100 260222211152815844.eigenfacs 260222211152815844.atom making animated gifs 11 models are in 260222211152815844.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 260222211152815844.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 260222211152815844.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 10 running: ../../bin/get_modes.sh 260222211152815844 10 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 10 calculating perturbed structure for DQ=-100 260222211152815844.eigenfacs 260222211152815844.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 260222211152815844.eigenfacs 260222211152815844.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 260222211152815844.eigenfacs 260222211152815844.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 260222211152815844.eigenfacs 260222211152815844.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 260222211152815844.eigenfacs 260222211152815844.atom calculating perturbed structure for DQ=0 260222211152815844.eigenfacs 260222211152815844.atom calculating perturbed structure for DQ=20 260222211152815844.eigenfacs 260222211152815844.atom calculating perturbed structure for DQ=40 260222211152815844.eigenfacs 260222211152815844.atom calculating perturbed structure for DQ=60 260222211152815844.eigenfacs 260222211152815844.atom calculating perturbed structure for DQ=80 260222211152815844.eigenfacs 260222211152815844.atom calculating perturbed structure for DQ=100 260222211152815844.eigenfacs 260222211152815844.atom making animated gifs 11 models are in 260222211152815844.10.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 260222211152815844.10.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 260222211152815844.10.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 11 running: ../../bin/get_modes.sh 260222211152815844 11 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 11 calculating perturbed structure for DQ=-100 260222211152815844.eigenfacs 260222211152815844.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 260222211152815844.eigenfacs 260222211152815844.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 260222211152815844.eigenfacs 260222211152815844.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 260222211152815844.eigenfacs 260222211152815844.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 260222211152815844.eigenfacs 260222211152815844.atom calculating perturbed structure for DQ=0 260222211152815844.eigenfacs 260222211152815844.atom calculating perturbed structure for DQ=20 260222211152815844.eigenfacs 260222211152815844.atom calculating perturbed structure for DQ=40 260222211152815844.eigenfacs 260222211152815844.atom calculating perturbed structure for DQ=60 260222211152815844.eigenfacs 260222211152815844.atom calculating perturbed structure for DQ=80 260222211152815844.eigenfacs 260222211152815844.atom calculating perturbed structure for DQ=100 260222211152815844.eigenfacs 260222211152815844.atom making animated gifs 11 models are in 260222211152815844.11.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 260222211152815844.11.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 260222211152815844.11.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 260222211152815844.10.pdb 260222211152815844.11.pdb 260222211152815844.7.pdb 260222211152815844.8.pdb 260222211152815844.9.pdb STDERR: Note: The following floating-point exceptions are signalling: IEEE_DENORMAL real 0m25.703s user 0m25.587s sys 0m0.107s rm: cannot remove '260222211152815844.sdijf': No such file or directory pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format




If you find results from this site helpful for your research, please cite one of our papers:

elNémo is maintained by Yves-Henri Sanejouand.
It was developed by Karsten Suhre.
Between 2003 and 2014, it was hosted by IGS (Marseille).
Between 2015 and 2025, it was hosted by US2B (Nantes).
Last modification: december 26th, 2025.