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elNémo has been hacked on november 27th.
It has been moved away and runs again.
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***  MADHURJA 389 AA truncatula medicago single  ***

LOGs for ID: 260222215516854067

Output from eigenvector calculation:


STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8) Build Tirion matrix: Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model. Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004. Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file. Pdbmat> Coordinate filename = 260222215516854067.atom Pdbmat> Distance cutoff = 8.00 Force constant = 10.00 Origin of mass values = CONS Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09 PRINTing level = 2 Pdbmat> Coordinate file 260222215516854067.atom to be opened. Openam> File opened: 260222215516854067.atom Pdbmat> Coordinate file in PDB format. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 389 First residue number = 1 Last residue number = 389 Number of atoms found = 3017 Mean number per residue = 7.8 Pdbmat> Coordinate statistics: = 1.329149 +/- 13.438197 From: -32.493000 To: 39.083000 = 0.699334 +/- 9.121625 From: -22.667000 To: 26.600000 = 0.292906 +/- 15.332773 From: -35.911000 To: 34.369000 Pdbmat> Masses are all set to one. Openam> File opened: pdbmat.xyzm Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved. Openam> File opened: pdbmat.sdijb Pdbmat> Matrix statistics: Pdbmat> The matrix is 2.7570 % Filled. Pdbmat> 1129408 non-zero elements. Pdbmat> 123494 atom-atom interactions. Pdbmat> Number per atom= 81.87 +/- 24.26 Maximum number = 127 Minimum number = 10 Pdbmat> Matrix trace = 2.469880E+06 Pdbmat> Larger element = 473.977 Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10 Pdbmat> Normal end. automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1) 389 non-zero elements, NRBL set to 2 Diagonalize Tirion matrix using diagrtb Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation. Diagrtb> Version 2.52, November 2004. Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file. Diagrtb> Options taken into account: MATRix filename = pdbmat.sdijb COORdinates filename = 260222215516854067.atom Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb Nb of VECTors required = 106 EigeNVALues chosen = LOWE Type of SUBStructuring = NONE Nb of residues per BLOck = 2 Origin of MASS values = CONS MATRix FORMat = BINA Temporary files cleaning = ALL Output PRINting level = 2 Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb. Blocpdb> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.xyzm Blocpdb> Coordinate file 260222215516854067.atom to be opened. Openam> file on opening on unit 11: 260222215516854067.atom Blocpdb> Coordinate file in PDB format. Blocpdb> 3017 atoms picked in pdb file. Blocpdb> All masses set to unity. Blocpdb> Coordinate file is rewritten. Blocpdb> Substructuring: Blocpdb> 2 residue(s) per block. Blocpdb> 389 residues. Blocpdb> 16 atoms in block 1 Block first atom: 1 Blocpdb> 19 atoms in block 2 Block first atom: 17 Blocpdb> 15 atoms in block 3 Block first atom: 36 Blocpdb> 13 atoms in block 4 Block first atom: 51 Blocpdb> 17 atoms in block 5 Block first atom: 64 Blocpdb> 15 atoms in block 6 Block first atom: 81 Blocpdb> 13 atoms in block 7 Block first atom: 96 Blocpdb> 14 atoms in block 8 Block first atom: 109 Blocpdb> 12 atoms in block 9 Block first atom: 123 Blocpdb> 19 atoms in block 10 Block first atom: 135 Blocpdb> 19 atoms in block 11 Block first atom: 154 Blocpdb> 15 atoms in block 12 Block first atom: 173 Blocpdb> 15 atoms in block 13 Block first atom: 188 Blocpdb> 16 atoms in block 14 Block first atom: 203 Blocpdb> 16 atoms in block 15 Block first atom: 219 Blocpdb> 18 atoms in block 16 Block first atom: 235 Blocpdb> 13 atoms in block 17 Block first atom: 253 Blocpdb> 14 atoms in block 18 Block first atom: 266 Blocpdb> 17 atoms in block 19 Block first atom: 280 Blocpdb> 14 atoms in block 20 Block first atom: 297 Blocpdb> 14 atoms in block 21 Block first atom: 311 Blocpdb> 16 atoms in block 22 Block first atom: 325 Blocpdb> 11 atoms in block 23 Block first atom: 341 Blocpdb> 10 atoms in block 24 Block first atom: 352 Blocpdb> 13 atoms in block 25 Block first atom: 362 Blocpdb> 14 atoms in block 26 Block first atom: 375 Blocpdb> 18 atoms in block 27 Block first atom: 389 Blocpdb> 17 atoms in block 28 Block first atom: 407 Blocpdb> 19 atoms in block 29 Block first atom: 424 Blocpdb> 19 atoms in block 30 Block first atom: 443 Blocpdb> 16 atoms in block 31 Block first atom: 462 Blocpdb> 15 atoms in block 32 Block first atom: 478 Blocpdb> 15 atoms in block 33 Block first atom: 493 Blocpdb> 18 atoms in block 34 Block first atom: 508 Blocpdb> 20 atoms in block 35 Block first atom: 526 Blocpdb> 16 atoms in block 36 Block first atom: 546 Blocpdb> 15 atoms in block 37 Block first atom: 562 Blocpdb> 15 atoms in block 38 Block first atom: 577 Blocpdb> 13 atoms in block 39 Block first atom: 592 Blocpdb> 16 atoms in block 40 Block first atom: 605 Blocpdb> 14 atoms in block 41 Block first atom: 621 Blocpdb> 11 atoms in block 42 Block first atom: 635 Blocpdb> 12 atoms in block 43 Block first atom: 646 Blocpdb> 8 atoms in block 44 Block first atom: 658 Blocpdb> 15 atoms in block 45 Block first atom: 666 Blocpdb> 14 atoms in block 46 Block first atom: 681 Blocpdb> 18 atoms in block 47 Block first atom: 695 Blocpdb> 12 atoms in block 48 Block first atom: 713 Blocpdb> 21 atoms in block 49 Block first atom: 725 Blocpdb> 15 atoms in block 50 Block first atom: 746 Blocpdb> 16 atoms in block 51 Block first atom: 761 Blocpdb> 14 atoms in block 52 Block first atom: 777 Blocpdb> 17 atoms in block 53 Block first atom: 791 Blocpdb> 13 atoms in block 54 Block first atom: 808 Blocpdb> 20 atoms in block 55 Block first atom: 821 Blocpdb> 17 atoms in block 56 Block first atom: 841 Blocpdb> 13 atoms in block 57 Block first atom: 858 Blocpdb> 17 atoms in block 58 Block first atom: 871 Blocpdb> 20 atoms in block 59 Block first atom: 888 Blocpdb> 10 atoms in block 60 Block first atom: 908 Blocpdb> 14 atoms in block 61 Block first atom: 918 Blocpdb> 13 atoms in block 62 Block first atom: 932 Blocpdb> 19 atoms in block 63 Block first atom: 945 Blocpdb> 17 atoms in block 64 Block first atom: 964 Blocpdb> 14 atoms in block 65 Block first atom: 981 Blocpdb> 16 atoms in block 66 Block first atom: 995 Blocpdb> 14 atoms in block 67 Block first atom: 1011 Blocpdb> 17 atoms in block 68 Block first atom: 1025 Blocpdb> 15 atoms in block 69 Block first atom: 1042 Blocpdb> 20 atoms in block 70 Block first atom: 1057 Blocpdb> 14 atoms in block 71 Block first atom: 1077 Blocpdb> 18 atoms in block 72 Block first atom: 1091 Blocpdb> 15 atoms in block 73 Block first atom: 1109 Blocpdb> 12 atoms in block 74 Block first atom: 1124 Blocpdb> 17 atoms in block 75 Block first atom: 1136 Blocpdb> 17 atoms in block 76 Block first atom: 1153 Blocpdb> 15 atoms in block 77 Block first atom: 1170 Blocpdb> 12 atoms in block 78 Block first atom: 1185 Blocpdb> 13 atoms in block 79 Block first atom: 1197 Blocpdb> 16 atoms in block 80 Block first atom: 1210 Blocpdb> 12 atoms in block 81 Block first atom: 1226 Blocpdb> 19 atoms in block 82 Block first atom: 1238 Blocpdb> 19 atoms in block 83 Block first atom: 1257 Blocpdb> 13 atoms in block 84 Block first atom: 1276 Blocpdb> 13 atoms in block 85 Block first atom: 1289 Blocpdb> 23 atoms in block 86 Block first atom: 1302 Blocpdb> 13 atoms in block 87 Block first atom: 1325 Blocpdb> 19 atoms in block 88 Block first atom: 1338 Blocpdb> 16 atoms in block 89 Block first atom: 1357 Blocpdb> 20 atoms in block 90 Block first atom: 1373 Blocpdb> 13 atoms in block 91 Block first atom: 1393 Blocpdb> 15 atoms in block 92 Block first atom: 1406 Blocpdb> 16 atoms in block 93 Block first atom: 1421 Blocpdb> 20 atoms in block 94 Block first atom: 1437 Blocpdb> 20 atoms in block 95 Block first atom: 1457 Blocpdb> 18 atoms in block 96 Block first atom: 1477 Blocpdb> 16 atoms in block 97 Block first atom: 1495 Blocpdb> 10 atoms in block 98 Block first atom: 1511 Blocpdb> 14 atoms in block 99 Block first atom: 1521 Blocpdb> 16 atoms in block 100 Block first atom: 1535 Blocpdb> 18 atoms in block 101 Block first atom: 1551 Blocpdb> 15 atoms in block 102 Block first atom: 1569 Blocpdb> 15 atoms in block 103 Block first atom: 1584 Blocpdb> 18 atoms in block 104 Block first atom: 1599 Blocpdb> 20 atoms in block 105 Block first atom: 1617 Blocpdb> 19 atoms in block 106 Block first atom: 1637 Blocpdb> 16 atoms in block 107 Block first atom: 1656 Blocpdb> 12 atoms in block 108 Block first atom: 1672 Blocpdb> 20 atoms in block 109 Block first atom: 1684 Blocpdb> 15 atoms in block 110 Block first atom: 1704 Blocpdb> 12 atoms in block 111 Block first atom: 1719 Blocpdb> 19 atoms in block 112 Block first atom: 1731 Blocpdb> 18 atoms in block 113 Block first atom: 1750 Blocpdb> 13 atoms in block 114 Block first atom: 1768 Blocpdb> 17 atoms in block 115 Block first atom: 1781 Blocpdb> 20 atoms in block 116 Block first atom: 1798 Blocpdb> 18 atoms in block 117 Block first atom: 1818 Blocpdb> 20 atoms in block 118 Block first atom: 1836 Blocpdb> 22 atoms in block 119 Block first atom: 1856 Blocpdb> 15 atoms in block 120 Block first atom: 1878 Blocpdb> 13 atoms in block 121 Block first atom: 1893 Blocpdb> 17 atoms in block 122 Block first atom: 1906 Blocpdb> 12 atoms in block 123 Block first atom: 1923 Blocpdb> 10 atoms in block 124 Block first atom: 1935 Blocpdb> 15 atoms in block 125 Block first atom: 1945 Blocpdb> 18 atoms in block 126 Block first atom: 1960 Blocpdb> 12 atoms in block 127 Block first atom: 1978 Blocpdb> 15 atoms in block 128 Block first atom: 1990 Blocpdb> 15 atoms in block 129 Block first atom: 2005 Blocpdb> 16 atoms in block 130 Block first atom: 2020 Blocpdb> 19 atoms in block 131 Block first atom: 2036 Blocpdb> 17 atoms in block 132 Block first atom: 2055 Blocpdb> 18 atoms in block 133 Block first atom: 2072 Blocpdb> 13 atoms in block 134 Block first atom: 2090 Blocpdb> 16 atoms in block 135 Block first atom: 2103 Blocpdb> 11 atoms in block 136 Block first atom: 2119 Blocpdb> 19 atoms in block 137 Block first atom: 2130 Blocpdb> 19 atoms in block 138 Block first atom: 2149 Blocpdb> 16 atoms in block 139 Block first atom: 2168 Blocpdb> 19 atoms in block 140 Block first atom: 2184 Blocpdb> 14 atoms in block 141 Block first atom: 2203 Blocpdb> 15 atoms in block 142 Block first atom: 2217 Blocpdb> 17 atoms in block 143 Block first atom: 2232 Blocpdb> 13 atoms in block 144 Block first atom: 2249 Blocpdb> 16 atoms in block 145 Block first atom: 2262 Blocpdb> 17 atoms in block 146 Block first atom: 2278 Blocpdb> 17 atoms in block 147 Block first atom: 2295 Blocpdb> 11 atoms in block 148 Block first atom: 2312 Blocpdb> 15 atoms in block 149 Block first atom: 2323 Blocpdb> 18 atoms in block 150 Block first atom: 2338 Blocpdb> 10 atoms in block 151 Block first atom: 2356 Blocpdb> 8 atoms in block 152 Block first atom: 2366 Blocpdb> 15 atoms in block 153 Block first atom: 2374 Blocpdb> 17 atoms in block 154 Block first atom: 2389 Blocpdb> 15 atoms in block 155 Block first atom: 2406 Blocpdb> 12 atoms in block 156 Block first atom: 2421 Blocpdb> 13 atoms in block 157 Block first atom: 2433 Blocpdb> 17 atoms in block 158 Block first atom: 2446 Blocpdb> 14 atoms in block 159 Block first atom: 2463 Blocpdb> 13 atoms in block 160 Block first atom: 2477 Blocpdb> 16 atoms in block 161 Block first atom: 2490 Blocpdb> 21 atoms in block 162 Block first atom: 2506 Blocpdb> 15 atoms in block 163 Block first atom: 2527 Blocpdb> 19 atoms in block 164 Block first atom: 2542 Blocpdb> 16 atoms in block 165 Block first atom: 2561 Blocpdb> 17 atoms in block 166 Block first atom: 2577 Blocpdb> 13 atoms in block 167 Block first atom: 2594 Blocpdb> 16 atoms in block 168 Block first atom: 2607 Blocpdb> 10 atoms in block 169 Block first atom: 2623 Blocpdb> 10 atoms in block 170 Block first atom: 2633 Blocpdb> 12 atoms in block 171 Block first atom: 2643 Blocpdb> 12 atoms in block 172 Block first atom: 2655 Blocpdb> 16 atoms in block 173 Block first atom: 2667 Blocpdb> 19 atoms in block 174 Block first atom: 2683 Blocpdb> 11 atoms in block 175 Block first atom: 2702 Blocpdb> 14 atoms in block 176 Block first atom: 2713 Blocpdb> 15 atoms in block 177 Block first atom: 2727 Blocpdb> 18 atoms in block 178 Block first atom: 2742 Blocpdb> 16 atoms in block 179 Block first atom: 2760 Blocpdb> 18 atoms in block 180 Block first atom: 2776 Blocpdb> 13 atoms in block 181 Block first atom: 2794 Blocpdb> 17 atoms in block 182 Block first atom: 2807 Blocpdb> 19 atoms in block 183 Block first atom: 2824 Blocpdb> 19 atoms in block 184 Block first atom: 2843 Blocpdb> 19 atoms in block 185 Block first atom: 2862 Blocpdb> 17 atoms in block 186 Block first atom: 2881 Blocpdb> 15 atoms in block 187 Block first atom: 2898 Blocpdb> 11 atoms in block 188 Block first atom: 2913 Blocpdb> 16 atoms in block 189 Block first atom: 2924 Blocpdb> 18 atoms in block 190 Block first atom: 2940 Blocpdb> 12 atoms in block 191 Block first atom: 2958 Blocpdb> 15 atoms in block 192 Block first atom: 2970 Blocpdb> 15 atoms in block 193 Block first atom: 2985 Blocpdb> 13 atoms in block 194 Block first atom: 3000 Blocpdb> 5 atoms in block 195 Block first atom: 3012 Blocpdb> 195 blocks. Blocpdb> At most, 23 atoms in each of them. Blocpdb> At least, 5 atoms in each of them. Blocpdb> Normal end of Blocpdb. Diagrtb> Memory allocation for Prepmat. Diagrtb> Memory allocation for RTB. Diagrtb> Memory allocation for Diagstd. Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes. Prepmat> Entering in. Prepmat> Rewriting of the matrix begins. Prepmat> 1129603 matrix lines read. Prepmat> Matrix order = 9051 Prepmat> Matrix trace = 2469880.0000 Prepmat> Last element read: 9051 9051 226.0983 Prepmat> 19111 lines saved. Prepmat> 16922 empty lines. Prepmat> Number of lines on output is as expected. Prepmat> Normal end of Prepmat. RTB> Entering in. RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 3017 RTB> Total mass = 3017.0000 RTB> Number of atoms found in matrix: 3017 RTB> Number of blocks = 195 RTB> Projection begins. RTB> Projected matrix is being saved. RTB> Projected matrix trace = 267646.8130 RTB> 75843 non-zero elements. RTB> Normal end of RTB. Diagstd> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.sdijb Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb Diagstd> CERFACS matrix format. Diagstd> Projected matrix order = 1170 Diagstd> Nb of non-zero elements: 75843 Diagstd> Projected matrix trace = 267646.8130 Openam> file on opening on unit 11: diagrtb_work.eigenfacs Diagstd> Diagonalization. Diagstd> 1170 eigenvectors are computed. Diagstd> 106 of them to be saved. Diagstd> Sum of eigenvalues = 267646.8130 Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000 Diagstd> Selected eigenvalues: 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.1073626 0.4032175 0.5639047 1.0827456 1.7458249 2.1911187 2.3789675 2.5999054 3.0874037 3.8818596 4.1171461 5.7378672 7.3115158 7.8716053 8.3359647 8.8560639 9.4287492 10.0812311 10.8621057 11.8662206 12.3624196 13.3218683 13.6568082 14.2860616 14.4267473 14.9149014 15.2171522 16.0933678 16.4824047 16.8881829 17.4398584 18.2777531 18.7006681 19.1948688 19.8239500 19.9825763 20.6749288 21.5950319 22.1751148 22.3647712 23.1704938 23.5656163 24.5970579 24.9546862 25.3512750 25.9827189 26.5920128 27.1047441 27.9282689 28.3970762 29.5390569 30.2016436 30.5419162 30.8733991 31.1478907 31.8776505 32.1374162 32.5070384 33.3768643 33.5862399 33.7460765 34.3181807 34.7809280 35.3534674 36.3593466 36.6086077 37.0638236 37.4260665 38.0776103 38.8979366 39.6272891 39.9057560 40.4136379 41.3529811 42.1334170 42.4487286 43.0704757 43.6173454 43.8620285 44.5625077 45.2849381 45.4800865 45.9893490 46.3244401 47.0077319 47.2978514 48.1032102 48.9409188 49.3585947 49.7110405 50.1073803 50.3890245 50.9421185 51.5544012 52.1088165 52.5727426 53.3449452 53.6124348 53.9180947 54.6592000 Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units): 0.0034331 0.0034335 0.0034335 0.0034338 0.0034344 0.0034353 35.5813046 68.9548775 81.5451472 112.9948070 143.4814068 160.7415787 167.4902502 175.0951242 190.8059837 213.9514294 220.3400372 260.1180714 293.6290317 304.6680650 313.5257497 323.1585502 333.4435510 344.7879394 357.8922481 374.0688021 381.8097558 396.3490743 401.3006700 410.4417583 412.4577733 419.3778346 423.6058731 435.6309713 440.8649439 446.2587478 453.4889998 464.2551001 469.5954085 475.7599222 483.4932076 485.4237490 493.7615776 504.6290006 511.3617250 513.5438228 522.7125471 527.1505712 538.5634318 542.4645185 546.7580468 553.5254295 559.9778973 565.3507021 573.8749782 578.6715004 590.1923728 596.7749289 600.1273513 603.3752672 606.0515991 613.1100465 615.6030439 619.1330427 627.3617652 629.3264325 630.8221342 636.1468900 640.4214402 645.6710103 654.7919252 657.0325513 661.1049219 664.3277171 670.0853497 677.2648906 683.5849019 685.9825234 690.3339837 698.3106919 704.8693409 707.5019217 712.6644812 717.1745925 719.1833706 724.9033241 730.7556290 732.3284757 736.4171791 739.0951798 744.5261037 746.8200800 753.1514392 759.6811311 762.9159130 765.6348744 768.6809690 770.8382477 775.0572463 779.7011122 783.8823481 787.3640782 793.1255069 795.1115204 797.3748784 802.8361433 Diagstd> Normal end. Rtb_to_modes> Entering in. Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 3017 Rtb_to_modes> Number of blocs = 195 Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.eigenfacs Openam> file on opening on unit 11: matrix.eigenrtb Rdmodfacs> Entering in. Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Eigenvector number: 1 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9950E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 2 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9974E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 3 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9975E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 4 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9989E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 5 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0002E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 6 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0008E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 7 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.1074 Rdmodfacs> Eigenvector number: 8 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.4032 Rdmodfacs> Eigenvector number: 9 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.5639 Rdmodfacs> Eigenvector number: 10 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.083 Rdmodfacs> Eigenvector number: 11 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.746 Rdmodfacs> Eigenvector number: 12 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.191 Rdmodfacs> Eigenvector number: 13 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.379 Rdmodfacs> Eigenvector number: 14 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.600 Rdmodfacs> Eigenvector number: 15 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.087 Rdmodfacs> Eigenvector number: 16 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.882 Rdmodfacs> Eigenvector number: 17 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.117 Rdmodfacs> Eigenvector number: 18 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.738 Rdmodfacs> Eigenvector number: 19 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.312 Rdmodfacs> Eigenvector number: 20 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.872 Rdmodfacs> Eigenvector number: 21 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.336 Rdmodfacs> Eigenvector number: 22 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.856 Rdmodfacs> Eigenvector number: 23 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.429 Rdmodfacs> Eigenvector number: 24 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.08 Rdmodfacs> Eigenvector number: 25 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.86 Rdmodfacs> Eigenvector number: 26 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.87 Rdmodfacs> Eigenvector number: 27 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.36 Rdmodfacs> Eigenvector number: 28 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.32 Rdmodfacs> Eigenvector number: 29 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.66 Rdmodfacs> Eigenvector number: 30 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.29 Rdmodfacs> Eigenvector number: 31 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.43 Rdmodfacs> Eigenvector number: 32 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.91 Rdmodfacs> Eigenvector number: 33 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.22 Rdmodfacs> Eigenvector number: 34 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 35 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.48 Rdmodfacs> Eigenvector number: 36 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.89 Rdmodfacs> Eigenvector number: 37 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.44 Rdmodfacs> Eigenvector number: 38 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.28 Rdmodfacs> Eigenvector number: 39 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.70 Rdmodfacs> Eigenvector number: 40 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.19 Rdmodfacs> Eigenvector number: 41 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.82 Rdmodfacs> Eigenvector number: 42 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.98 Rdmodfacs> Eigenvector number: 43 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.67 Rdmodfacs> Eigenvector number: 44 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.60 Rdmodfacs> Eigenvector number: 45 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.18 Rdmodfacs> Eigenvector number: 46 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.36 Rdmodfacs> Eigenvector number: 47 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.17 Rdmodfacs> Eigenvector number: 48 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.57 Rdmodfacs> Eigenvector number: 49 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.60 Rdmodfacs> Eigenvector number: 50 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.95 Rdmodfacs> Eigenvector number: 51 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.35 Rdmodfacs> Eigenvector number: 52 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.98 Rdmodfacs> Eigenvector number: 53 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.59 Rdmodfacs> Eigenvector number: 54 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 55 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.93 Rdmodfacs> Eigenvector number: 56 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.40 Rdmodfacs> Eigenvector number: 57 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.54 Rdmodfacs> Eigenvector number: 58 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.20 Rdmodfacs> Eigenvector number: 59 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.54 Rdmodfacs> Eigenvector number: 60 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.87 Rdmodfacs> Eigenvector number: 61 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.15 Rdmodfacs> Eigenvector number: 62 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.88 Rdmodfacs> Eigenvector number: 63 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.14 Rdmodfacs> Eigenvector number: 64 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.51 Rdmodfacs> Eigenvector number: 65 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.38 Rdmodfacs> Eigenvector number: 66 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.59 Rdmodfacs> Eigenvector number: 67 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.75 Rdmodfacs> Eigenvector number: 68 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.32 Rdmodfacs> Eigenvector number: 69 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.78 Rdmodfacs> Eigenvector number: 70 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.35 Rdmodfacs> Eigenvector number: 71 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.36 Rdmodfacs> Eigenvector number: 72 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.61 Rdmodfacs> Eigenvector number: 73 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.06 Rdmodfacs> Eigenvector number: 74 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.43 Rdmodfacs> Eigenvector number: 75 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.08 Rdmodfacs> Eigenvector number: 76 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.90 Rdmodfacs> Eigenvector number: 77 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.63 Rdmodfacs> Eigenvector number: 78 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.91 Rdmodfacs> Eigenvector number: 79 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.41 Rdmodfacs> Eigenvector number: 80 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.35 Rdmodfacs> Eigenvector number: 81 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.13 Rdmodfacs> Eigenvector number: 82 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.45 Rdmodfacs> Eigenvector number: 83 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.07 Rdmodfacs> Eigenvector number: 84 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.62 Rdmodfacs> Eigenvector number: 85 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.86 Rdmodfacs> Eigenvector number: 86 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.56 Rdmodfacs> Eigenvector number: 87 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.28 Rdmodfacs> Eigenvector number: 88 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.48 Rdmodfacs> Eigenvector number: 89 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.99 Rdmodfacs> Eigenvector number: 90 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.32 Rdmodfacs> Eigenvector number: 91 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 47.01 Rdmodfacs> Eigenvector number: 92 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 47.30 Rdmodfacs> Eigenvector number: 93 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 48.10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 94 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 48.94 Rdmodfacs> Eigenvector number: 95 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 49.36 Rdmodfacs> Eigenvector number: 96 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 49.71 Rdmodfacs> Eigenvector number: 97 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 50.11 Rdmodfacs> Eigenvector number: 98 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 50.39 Rdmodfacs> Eigenvector number: 99 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 50.94 Rdmodfacs> Eigenvector number: 100 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 51.55 Rdmodfacs> Eigenvector number: 101 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 52.11 Rdmodfacs> Eigenvector number: 102 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 52.57 Rdmodfacs> Eigenvector number: 103 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 53.34 Rdmodfacs> Eigenvector number: 104 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 53.61 Rdmodfacs> Eigenvector number: 105 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 53.92 Rdmodfacs> Eigenvector number: 106 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 54.66 Rtb_to_modes> 106 vectors, with 1170 coordinates in vector file. Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected): 1.00000 1.00000 1.00000 1.00001 1.00000 1.00000 1.00001 1.00000 0.99998 0.99998 1.00002 1.00002 0.99997 0.99998 1.00000 0.99999 0.99999 1.00004 1.00001 1.00001 0.99997 1.00001 0.99999 1.00002 0.99999 1.00001 0.99999 1.00003 0.99997 0.99995 1.00000 0.99999 0.99998 1.00000 1.00000 1.00000 1.00001 1.00001 1.00001 0.99999 1.00000 1.00003 0.99999 0.99998 0.99998 0.99999 1.00000 1.00000 1.00000 0.99999 0.99999 0.99998 0.99997 1.00002 1.00001 1.00000 1.00001 1.00000 1.00001 0.99999 1.00001 1.00000 1.00000 1.00001 0.99999 0.99995 0.99997 1.00000 1.00000 0.99999 0.99997 0.99999 1.00000 1.00002 1.00000 1.00002 0.99999 1.00001 1.00000 1.00002 0.99999 1.00001 1.00000 0.99998 0.99999 1.00001 1.00000 0.99999 1.00000 1.00001 0.99999 1.00001 1.00000 0.99998 1.00000 0.99999 0.99997 1.00003 1.00000 1.00002 1.00000 0.99996 1.00002 0.99998 1.00001 0.99998 Rtb_to_modes> RTB block-file is being read. Rtb_to_modes> 54306 lines found in RTB file. Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected): 1.00000 1.00000 1.00000 1.00001 1.00000 1.00000 1.00001 1.00000 0.99998 0.99998 1.00002 1.00002 0.99997 0.99998 1.00000 0.99999 0.99999 1.00004 1.00001 1.00001 0.99997 1.00001 0.99999 1.00002 0.99999 1.00001 0.99999 1.00003 0.99997 0.99995 1.00000 0.99999 0.99998 1.00000 1.00000 1.00000 1.00001 1.00001 1.00001 0.99999 1.00000 1.00003 0.99999 0.99998 0.99998 0.99999 1.00000 1.00000 1.00000 0.99999 0.99999 0.99998 0.99997 1.00002 1.00001 1.00000 1.00001 1.00000 1.00001 0.99999 1.00001 1.00000 1.00000 1.00001 0.99999 0.99995 0.99997 1.00000 1.00000 0.99999 0.99997 0.99999 1.00000 1.00002 1.00000 1.00002 0.99999 1.00001 1.00000 1.00002 0.99999 1.00001 1.00000 0.99998 0.99999 1.00001 1.00000 0.99999 1.00000 1.00001 0.99999 1.00001 1.00000 0.99998 1.00000 0.99999 0.99997 1.00003 1.00000 1.00002 1.00000 0.99996 1.00002 0.99998 1.00001 0.99998 Orthogonality of first eigenvectors (zero expected): Vector 2: 0.000 Vector 3: 0.000-0.000 Vector 4: 0.000 0.000 0.000 Vector 5: 0.000-0.000 0.000-0.000 Vector 6:-0.000-0.000-0.000-0.000-0.000 Vector 7:-0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 Vector 8: 0.000 0.000-0.000-0.000-0.000 0.000-0.000 Vector 9: 0.000-0.000-0.000-0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 Vector 10: 0.000-0.000-0.000 0.000-0.000 0.000 0.000-0.000 0.000 Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved. Rtb_to_modes> Normal end. Diagrtb> Normal end. B-factor analysis Bfactors> Version 1.22, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 260222215516854067.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 260222215516854067.eigenfacs Getnam> Corresponding pdb filename ? Getnam> 260222215516854067.atom Openam> file on opening on unit 11: 260222215516854067.atom Getnum> Number of skipped eigenvectors ? Getnum> 0 Getnum> Number of usefull eigenvectors ? Getnum> 10000 %Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 389 First residue number = 1 Last residue number = 389 Number of atoms found = 3017 Mean number per residue = 7.8 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9950E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9974E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9975E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9989E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0002E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0008E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.1074 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.4032 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.5639 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.083 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.746 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.191 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.379 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.600 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.087 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.882 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.117 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.738 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.312 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.872 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.336 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.856 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.429 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.08 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.86 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.87 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.36 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.32 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.66 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.29 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.43 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.91 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.22 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.48 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.89 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.44 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.28 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.70 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.19 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.82 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.98 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.67 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.60 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.18 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.36 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.17 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.57 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.60 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.95 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.35 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.98 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.59 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.93 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.40 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.54 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.20 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.54 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.87 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.15 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.88 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.14 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.51 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.38 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.59 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.75 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.32 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.78 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.35 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.36 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.61 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.06 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.43 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.08 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.90 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.63 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.91 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.41 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.35 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.13 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.45 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.07 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.62 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.86 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.56 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.28 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.48 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.99 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.32 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.01 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.30 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.94 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.36 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.71 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 50.11 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 50.39 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 50.94 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 51.55 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 52.11 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 52.57 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 53.34 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 53.61 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 53.92 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 54.66 Bfactors> 106 vectors, 9051 coordinates in file. Openam> file on opening on unit 12: bfactors.pred Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000 Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 0.107400 Bfactors> 100 eigenvectors will be considered. Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped. Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed. (CHARMM units assumed for eigenvalues) Bfactors> Correlation= -0.672 for 389 C-alpha atoms. Bfactors> = 0.103 +/- 0.43 Bfactors> = 88.243 +/- 14.40 Bfactors> Shiftng-fct= 88.140 Bfactors> Scaling-fct= 33.834 Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved. Bfactors> Normal end. check_modes Chkmod> Version 1.00, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 260222215516854067.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 260222215516854067.eigenfacs Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4330E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4334E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4334E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4336E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4342E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4352E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 35.59 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 68.95 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 81.54 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 113.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 143.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 160.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 167.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 175.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 190.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 213.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 220.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 260.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 293.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 304.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 313.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 323.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 333.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 344.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 357.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 374.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 381.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 396.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 401.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 410.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 412.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 419.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 423.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 435.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 440.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 446.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 453.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 464.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 469.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 475.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 483.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 485.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 493.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 504.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 511.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 513.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 522.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 527.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 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CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 600.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 603.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 606.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 613.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 615.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 619.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 627.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 629.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 630.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 636.1 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vecteur en lecture: 686.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 690.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 698.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 704.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 707.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 712.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 717.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 719.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 724.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 730.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 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CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 770.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 775.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 779.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 783.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 787.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 793.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 795.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 797.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 802.8 Chkmod> 106 vectors, 9051 coordinates in file. Chkmod> That is: 3017 cartesian points. Openam> file on opening on unit 11: Chkmod.res Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file. %Chkmod-Wn> Norm of vector 18 is: 1.0001 (instead of 1.0000). Chkmod> Normal end. 0.0034 0.8901 0.0034 0.9509 0.0034 0.8963 0.0034 0.7583 0.0034 0.7580 0.0034 0.7386 35.5860 0.0481 68.9504 0.0538 81.5413 0.0458 113.0032 0.0413 143.4824 0.0661 160.7303 0.1381 167.4842 0.0289 175.0908 0.5529 190.7853 0.5969 213.9461 0.2691 220.3267 0.1283 260.1099 0.0421 293.6261 0.3324 304.6626 0.4490 313.5130 0.1387 323.1435 0.6522 333.4337 0.4878 344.7521 0.3852 357.8422 0.0364 374.1123 0.0563 381.7560 0.4871 396.3043 0.3834 401.3303 0.1408 410.4807 0.1717 412.4866 0.3214 419.2909 0.2461 423.6273 0.2414 435.5667 0.2623 440.8139 0.2729 446.2636 0.2429 453.4714 0.3541 464.2637 0.5041 469.5669 0.3967 475.6792 0.0899 483.4243 0.2390 485.3716 0.0675 493.6815 0.4999 504.6654 0.4227 511.3961 0.3456 513.4670 0.0224 522.6845 0.4353 527.1770 0.3465 538.5725 0.5466 542.3903 0.3733 546.7208 0.3956 553.4727 0.3823 559.9327 0.3454 565.2770 0.3670 573.8681 0.3286 578.6764 0.5075 590.1765 0.1984 596.7331 0.4587 600.0828 0.2880 603.3162 0.3572 606.0461 0.3719 613.1063 0.4127 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MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 260222215516854067.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 260222215516854067.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 8 running: ../../bin/get_modes.sh 260222215516854067 8 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 8 calculating perturbed structure for DQ=-100 260222215516854067.eigenfacs 260222215516854067.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 260222215516854067.eigenfacs 260222215516854067.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 260222215516854067.eigenfacs 260222215516854067.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 260222215516854067.eigenfacs 260222215516854067.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 260222215516854067.eigenfacs 260222215516854067.atom calculating perturbed structure for DQ=0 260222215516854067.eigenfacs 260222215516854067.atom calculating perturbed structure for DQ=20 260222215516854067.eigenfacs 260222215516854067.atom calculating perturbed structure for DQ=40 260222215516854067.eigenfacs 260222215516854067.atom calculating perturbed structure for DQ=60 260222215516854067.eigenfacs 260222215516854067.atom calculating perturbed structure for DQ=80 260222215516854067.eigenfacs 260222215516854067.atom calculating perturbed structure for DQ=100 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../../bin/get_modes.sh 260222215516854067 9 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 9 calculating perturbed structure for DQ=-100 260222215516854067.eigenfacs 260222215516854067.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 260222215516854067.eigenfacs 260222215516854067.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 260222215516854067.eigenfacs 260222215516854067.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 260222215516854067.eigenfacs 260222215516854067.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 260222215516854067.eigenfacs 260222215516854067.atom calculating perturbed structure for DQ=0 260222215516854067.eigenfacs 260222215516854067.atom calculating perturbed structure for DQ=20 260222215516854067.eigenfacs 260222215516854067.atom calculating perturbed structure for DQ=40 260222215516854067.eigenfacs 260222215516854067.atom calculating perturbed structure for DQ=60 260222215516854067.eigenfacs 260222215516854067.atom 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