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* ENDOCYTOSIS 29-JUN-09 3I2W *

CA distance fluctuations for 2602230445411017275

--- normal mode 9 ---

This matrix displays the maximum distance fluctuations between all pairs of CA atoms and between the two extreme conformations that were computed for this mode (DQMIN/DQMAX). Distance increases are plotted in blue and decreases in red for the strongest 10% of the residue pair distance changes. Every pixel corresponds to a single residue. Grey lines are drawn every 10 residues, yellow lines every 100 residues (counting from the upper left corner).

The following table indicates for every residue the two corresponding residues with the strongest CA distance fluctuations.

[HELP on distance fluctuations]

GD ok

largest increase ref largest decrease
LYS 130 0.01 SER 14 -0.12 HIS 158

ASN 291 0.01 ASP 15 -0.10 HIS 158

ASN 291 0.01 SER 16 -0.08 HIS 158

ASP 15 0.01 PHE 17 -0.06 HIS 158

ALA 293 0.01 TRP 18 -0.06 HIS 158

LYS 130 0.01 GLU 19 -0.07 HIS 158

LYS 130 0.01 PRO 20 -0.05 HIS 158

LYS 130 0.02 GLY 21 -0.05 HIS 158

LYS 130 0.01 ASN 22 -0.06 HIS 158

LYS 130 0.01 TYR 23 -0.05 HIS 158

LYS 130 0.01 LYS 24 -0.04 HIS 158

ASN 291 0.01 ARG 25 -0.06 ARG 165

SER 285 0.01 THR 26 -0.05 ARG 165

GLN 259 0.01 THR 27 -0.04 ARG 165

ASN 287 0.01 LYS 28 -0.05 ARG 165

TRP 284 0.01 ARG 29 -0.05 ARG 165

GLN 259 0.01 ILE 30 -0.04 ARG 165

GLN 259 0.01 GLU 31 -0.04 ARG 165

GLN 259 0.01 ASP 32 -0.05 ARG 165

GLN 259 0.01 GLY 33 -0.04 ARG 165

GLN 259 0.01 TYR 34 -0.04 ARG 165

SER 260 0.01 LYS 35 -0.05 ARG 165

SER 260 0.01 LEU 36 -0.05 ARG 165

SER 260 0.01 CYS 37 -0.04 ARG 165

SER 260 0.01 ASN 38 -0.04 ARG 165

LYS 71 0.01 ASP 39 -0.06 ARG 165

SER 260 0.01 LEU 40 -0.05 ARG 165

SER 260 0.01 GLN 41 -0.05 ARG 165

SER 260 0.01 GLN 42 -0.05 ARG 165

SER 260 0.01 LEU 43 -0.06 ARG 165

SER 260 0.01 ILE 44 -0.05 ARG 165

SER 260 0.01 GLN 45 -0.05 ARG 165

ASP 94 0.01 GLU 46 -0.06 ARG 165

SER 260 0.01 ARG 47 -0.06 ARG 165

ASP 94 0.01 ALA 48 -0.05 ARG 165

ASP 94 0.01 ASP 49 -0.05 ARG 165

ASP 94 0.01 ILE 50 -0.06 ARG 165

THR 113 0.01 GLU 51 -0.06 ARG 165

ASP 94 0.01 LYS 52 -0.05 ARG 165

SER 57 0.01 GLY 53 -0.06 ARG 165

THR 113 0.01 TYR 54 -0.06 ARG 165

THR 113 0.01 ALA 55 -0.05 ARG 165

SER 57 0.01 LYS 56 -0.05 ARG 165

GLY 53 0.01 SER 57 -0.06 ARG 165

THR 113 0.01 LEU 58 -0.06 ARG 165

HIS 120 0.01 ARG 59 -0.05 ARG 165

HIS 120 0.01 THR 60 -0.05 ARG 165

THR 113 0.01 TRP 61 -0.06 ARG 165

THR 113 0.01 SER 62 -0.05 ARG 165

HIS 120 0.01 LYS 63 -0.05 ARG 165

HIS 120 0.01 LYS 64 -0.05 ARG 165

THR 113 0.01 TRP 65 -0.06 ARG 165

THR 113 0.01 GLY 66 -0.05 ARG 165

HIS 120 0.01 GLU 67 -0.05 THR 303

GLU 117 0.01 LEU 68 -0.05 SER 166

THR 113 0.01 ILE 69 -0.05 ARG 165

TYR 75 0.01 GLU 70 -0.06 THR 303

TRP 283 0.01 LYS 71 -0.05 THR 303

TRP 283 0.01 GLY 72 -0.06 SER 166

GLU 117 0.01 PRO 73 -0.06 SER 166

THR 113 0.01 GLU 74 -0.06 THR 168

THR 113 0.01 TYR 75 -0.06 THR 303

ASP 280 0.01 GLY 76 -0.06 THR 303

THR 113 0.01 THR 77 -0.06 THR 303

THR 113 0.01 THR 78 -0.06 THR 168

THR 113 0.01 GLU 79 -0.06 THR 303

THR 113 0.01 ALA 80 -0.06 THR 303

THR 113 0.01 ALA 81 -0.06 ARG 165

THR 113 0.01 TRP 82 -0.06 ARG 165

THR 113 0.01 LYS 83 -0.05 THR 303

THR 113 0.01 GLY 84 -0.06 ARG 165

THR 113 0.01 VAL 85 -0.06 ARG 165

THR 113 0.01 LEU 86 -0.05 ARG 165

THR 113 0.01 THR 87 -0.05 THR 303

LYS 98 0.01 GLU 88 -0.06 ARG 165

THR 113 0.01 SER 89 -0.06 ARG 165

THR 113 0.01 GLU 90 -0.05 THR 303

LYS 98 0.02 ARG 91 -0.05 THR 303

LYS 98 0.02 ILE 92 -0.06 ARG 165

ASP 101 0.01 SER 93 -0.05 ARG 165

ASP 101 0.02 ASP 94 -0.05 THR 303

LYS 98 0.02 VAL 95 -0.05 ARG 165

THR 113 0.01 HIS 96 -0.05 ARG 165

SER 260 0.03 LYS 98 -0.05 ALA 176

SER 260 0.02 ILE 99 -0.05 ARG 165

ASP 94 0.02 LYS 100 -0.05 ARG 165

SER 260 0.03 ASP 101 -0.04 ALA 176

SER 260 0.03 ASN 102 -0.04 ALA 176

SER 260 0.02 LEU 103 -0.05 ARG 165

SER 260 0.02 CYS 104 -0.04 ALA 176

SER 260 0.03 ASN 105 -0.05 ALA 176

SER 260 0.03 ASP 106 -0.04 ALA 176

GLN 259 0.02 VAL 107 -0.04 ALA 176

SER 260 0.02 ASN 108 -0.04 ALA 176

SER 260 0.02 SER 109 -0.04 ALA 176

GLN 259 0.03 GLN 110 -0.04 ALA 176

GLN 259 0.02 ILE 111 -0.04 ALA 176

SER 260 0.02 LYS 112 -0.04 ALA 176

GLN 259 0.03 THR 113 -0.04 ALA 176

GLN 259 0.02 TRP 114 -0.04 ALA 176

GLN 259 0.02 GLN 115 -0.04 ALA 176

SER 260 0.02 LYS 116 -0.04 ALA 176

GLN 259 0.02 GLU 117 -0.04 ALA 176

LEU 135 0.03 ASN 118 -0.04 ALA 176

ASP 131 0.02 TYR 119 -0.03 ALA 176

ASP 190 0.02 HIS 120 -0.03 ALA 176

ASP 190 0.03 HIS 121 -0.03 ALA 176

ASP 190 0.03 THR 122 -0.03 ALA 176

ASP 190 0.03 LEU 123 -0.03 ALA 176

ASP 190 0.02 GLN 125 -0.03 ALA 176

ASP 190 0.02 ILE 126 -0.03 ALA 176

ASP 190 0.03 LYS 127 -0.03 ALA 176

ASP 131 0.02 GLU 128 -0.03 ALA 176

ASP 190 0.02 ARG 129 -0.03 ALA 176

ASP 190 0.03 LYS 130 -0.03 ALA 176

ASP 190 0.03 ASP 131 -0.03 ALA 176

ASN 118 0.02 LEU 132 -0.03 ALA 176

ASP 190 0.02 GLU 133 -0.03 ALA 176

ASP 190 0.03 ASP 134 -0.03 ALA 176

LYS 194 0.03 LEU 135 -0.03 ALA 176

GLN 140 0.02 PHE 136 -0.03 ALA 176

LYS 194 0.03 LYS 137 -0.03 LYS 71

LYS 194 0.04 LYS 138 -0.02 ALA 176

LYS 194 0.03 ALA 139 -0.02 ALA 176

PHE 136 0.02 GLN 140 -0.03 LYS 71

LYS 194 0.03 LYS 141 -0.03 LYS 71

LYS 194 0.04 PRO 142 -0.03 LYS 71

LYS 194 0.02 TRP 143 -0.03 LYS 71

LYS 194 0.02 ALA 144 -0.04 LYS 71

LYS 194 0.04 LYS 145 -0.03 LYS 71

LYS 205 0.03 LEU 146 -0.03 LYS 71

SER 298 0.03 LEU 147 -0.04 LYS 71

SER 298 0.03 ALA 148 -0.05 LYS 71

ALA 153 0.03 LYS 149 -0.05 SER 14

SER 298 0.03 VAL 150 -0.06 SER 14

SER 298 0.03 GLU 151 -0.08 SER 14

LYS 145 0.02 LYS 152 -0.07 SER 14

LYS 149 0.03 ALA 153 -0.07 SER 14

LYS 149 0.01 LYS 154 -0.10 SER 14

LYS 152 0.02 ALA 155 -0.10 SER 14

LYS 149 0.03 ASP 156 -0.08 SER 14

LYS 149 0.02 TYR 157 -0.09 SER 14

TYR 157 0.01 HIS 158 -0.12 SER 14

LYS 149 0.02 SER 159 -0.10 SER 14

LYS 149 0.02 ALA 160 -0.09 SER 14

ALA 160 0.01 CYS 161 -0.11 SER 14

LYS 149 0.01 LYS 162 -0.11 SER 14

LYS 145 0.02 THR 163 -0.09 SER 14

PRO 142 0.02 GLU 164 -0.09 SER 14

LYS 149 0.01 ARG 165 -0.11 SER 14

LYS 149 0.01 SER 166 -0.10 SER 14

PRO 142 0.02 ALA 167 -0.09 SER 14

LYS 149 0.01 THR 168 -0.09 SER 14

PRO 142 0.03 HIS 189 -0.07 ASN 105

PRO 142 0.04 ASP 190 -0.06 ASN 105

PRO 142 0.04 ARG 191 -0.07 ASN 105

PRO 142 0.03 VAL 192 -0.07 SER 14

PRO 142 0.03 GLN 193 -0.07 SER 14

PRO 142 0.04 LYS 194 -0.06 SER 14

PRO 142 0.03 THR 195 -0.07 SER 14

PRO 142 0.02 LYS 196 -0.07 SER 14

PRO 142 0.04 ASP 197 -0.06 SER 14

PRO 142 0.04 GLN 198 -0.06 SER 14

PRO 142 0.02 VAL 199 -0.08 SER 14

PRO 142 0.03 GLN 200 -0.06 SER 14

PRO 142 0.04 LYS 201 -0.05 SER 14

PRO 142 0.03 CYS 202 -0.07 SER 14

PRO 142 0.02 ARG 203 -0.07 SER 14

PRO 142 0.03 GLU 204 -0.05 SER 14

PRO 142 0.04 LYS 205 -0.05 SER 14

PRO 142 0.02 TYR 206 -0.06 SER 14

TYR 206 0.02 GLU 207 -0.06 PRO 297

GLU 212 0.03 GLN 208 -0.04 SER 14

GLU 212 0.03 ALA 209 -0.04 SER 14

PRO 142 0.01 ILE 210 -0.04 LYS 71

LYS 205 0.02 ALA 211 -0.03 LYS 71

LYS 205 0.03 GLU 212 -0.03 LYS 71

ALA 209 0.02 ILE 213 -0.03 LYS 71

GLU 117 0.01 THR 214 -0.03 LYS 71

LYS 205 0.02 LYS 215 -0.02 ALA 176

GLU 212 0.03 TYR 216 -0.02 ALA 176

ALA 293 0.01 ASN 217 -0.02 ARG 165

ALA 293 0.02 SER 218 -0.02 ALA 176

LYS 205 0.03 VAL 219 -0.02 ALA 176

LYS 205 0.02 TYR 220 -0.02 ALA 176

ALA 293 0.02 ILE 221 -0.03 ARG 165

GLU 212 0.02 GLU 222 -0.02 ALA 176

SER 226 0.02 ASP 223 -0.03 ALA 176

THR 237 0.01 THR 225 -0.03 ARG 165

ASP 223 0.02 SER 226 -0.03 ALA 176

ALA 139 0.02 VAL 227 -0.03 ALA 176

ALA 139 0.01 PHE 228 -0.03 ARG 165

ASP 223 0.02 GLU 229 -0.03 ARG 165

PHE 234 0.02 LYS 230 -0.03 ALA 176

ALA 139 0.02 CYS 231 -0.03 ARG 165

ALA 139 0.01 GLN 232 -0.04 ARG 165

LYS 230 0.02 THR 233 -0.03 ARG 165

LYS 230 0.02 PHE 234 -0.03 ALA 176

ALA 139 0.01 GLU 235 -0.04 ARG 165

LYS 230 0.02 LYS 236 -0.04 ARG 165

LYS 230 0.02 THR 237 -0.03 ARG 165

LEU 135 0.01 ARG 238 -0.04 ARG 165

LYS 230 0.01 LEU 239 -0.05 ARG 165

LYS 230 0.02 GLN 240 -0.04 ARG 165

LYS 230 0.02 PHE 241 -0.04 ARG 165

LYS 230 0.01 PHE 242 -0.05 ARG 165

LYS 230 0.01 LYS 243 -0.05 ARG 165

LYS 230 0.02 GLU 244 -0.05 ARG 165

GLN 259 0.02 ILE 245 -0.05 ARG 165

LYS 230 0.01 LEU 246 -0.06 ARG 165

LYS 230 0.01 PHE 247 -0.05 ARG 165

GLN 259 0.02 ASN 248 -0.05 ARG 165

VAL 258 0.01 VAL 249 -0.05 ARG 165

LYS 230 0.01 HIS 250 -0.06 ARG 165

VAL 258 0.02 SER 251 -0.05 ARG 165

VAL 258 0.02 CYS 252 -0.05 ARG 165

THR 256 0.01 LEU 253 -0.06 ARG 165

THR 256 0.01 ASP 254 -0.06 ARG 165

THR 256 0.02 LEU 255 -0.06 ARG 165

THR 256 0.02 THR 256 -0.06 ARG 165

THR 256 0.02 LYS 257 -0.05 ARG 165

ASP 106 0.02 VAL 258 -0.05 ARG 165

ASP 106 0.03 GLN 259 -0.05 THR 303

LYS 98 0.03 SER 260 -0.05 THR 303

LYS 98 0.02 LEU 261 -0.05 ARG 165

ASP 106 0.02 PRO 262 -0.06 ARG 165

ASP 106 0.02 GLN 263 -0.05 THR 303

LYS 98 0.02 ILE 264 -0.05 THR 303

LYS 98 0.02 TYR 265 -0.06 ARG 165

THR 113 0.02 GLU 266 -0.06 ARG 165

THR 113 0.02 GLU 267 -0.06 THR 303

LYS 98 0.02 PHE 268 -0.06 ARG 165

THR 113 0.01 SER 269 -0.06 ARG 165

THR 113 0.02 HIS 270 -0.06 THR 303

THR 113 0.02 THR 271 -0.06 THR 303

THR 113 0.01 ILE 272 -0.06 THR 168

THR 113 0.01 ASN 273 -0.06 THR 168

THR 113 0.02 ASN 274 -0.06 THR 303

THR 113 0.01 ALA 275 -0.06 THR 168

THR 113 0.01 ASP 276 -0.06 THR 168

LYS 230 0.01 GLN 277 -0.06 THR 168

GLU 229 0.02 GLN 278 -0.06 THR 168

THR 113 0.01 LYS 279 -0.06 THR 303

THR 113 0.01 ASP 280 -0.06 THR 303

GLU 229 0.01 LEU 281 -0.06 THR 168

GLU 222 0.01 LYS 282 -0.06 THR 303

GLU 117 0.01 TRP 283 -0.07 THR 303

GLU 117 0.01 TRP 284 -0.06 THR 303

GLU 222 0.01 SER 285 -0.06 THR 303

GLU 222 0.01 ASN 286 -0.08 THR 303

GLU 117 0.01 ASN 287 -0.08 THR 303

GLU 117 0.01 HIS 288 -0.06 THR 303

GLU 222 0.01 GLY 289 -0.06 THR 303

GLU 222 0.01 ILE 290 -0.06 THR 303

GLU 222 0.01 ASN 291 -0.07 THR 303

SER 218 0.02 ALA 293 -0.08 THR 303

THR 214 0.01 ASN 295 -0.07 THR 303

THR 214 0.01 TRP 296 -0.06 SER 298

LEU 123 0.01 PRO 297 -0.05 VAL 300

GLU 151 0.03 SER 298 -0.06 TRP 296

GLU 151 0.02 PHE 299 -0.05 ALA 293

GLU 151 0.02 VAL 300 -0.07 ASN 295

LEU 123 0.01 GLU 301 -0.07 ALA 293

LEU 123 0.02 TYR 302 -0.07 SER 14

LEU 123 0.01 THR 303 -0.08 SER 14

LEU 123 0.01 SER 14 -0.08 THR 303

LEU 123 0.01 ASP 15 -0.07 THR 303

SER 218 0.01 SER 16 -0.07 THR 303

ASP 15 0.01 PHE 17 -0.05 THR 303

SER 218 0.01 TRP 18 -0.05 THR 168

LEU 123 0.01 GLU 19 -0.05 THR 168

ASP 183 0.02 PRO 20 -0.05 THR 168

ASP 183 0.02 GLY 21 -0.06 THR 168

LEU 123 0.01 ASN 22 -0.05 THR 168

ASP 183 0.01 TYR 23 -0.06 THR 168

ASP 183 0.02 LYS 24 -0.06 SER 166

GLN 125 0.01 ARG 25 -0.06 THR 168

ASP 183 0.01 THR 26 -0.06 THR 168

ASP 183 0.02 THR 27 -0.06 SER 166

ASP 183 0.01 LYS 28 -0.06 SER 166

ASP 183 0.01 ARG 29 -0.06 SER 166

ASP 183 0.02 ILE 30 -0.07 SER 166

ASP 183 0.02 GLU 31 -0.07 SER 166

ASP 183 0.01 ASP 32 -0.06 SER 166

ASP 183 0.01 GLY 33 -0.07 SER 166

ASP 183 0.02 TYR 34 -0.07 SER 166

ASP 183 0.01 LYS 35 -0.07 SER 166

ASP 183 0.01 LEU 36 -0.07 SER 166

ASP 183 0.01 CYS 37 -0.07 SER 166

ASP 183 0.01 ASN 38 -0.07 SER 166

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ASP 183 0.03 ASP 223 -0.06 THR 168

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ASN 102 0.02 GLN 259 -0.08 ARG 165

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THR 77 0.01 ASP 276 -0.06 ARG 165

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LYS 28 0.01 TRP 283 -0.08 ARG 165

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ASN 291 0.01 HIS 288 -0.07 ARG 165

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ASP 15 0.01 ILE 290 -0.06 ARG 165

ASP 15 0.01 ASN 291 -0.07 ARG 165

SER 218 0.02 ALA 293 -0.08 ARG 165

PRO 20 0.01 ASN 295 -0.07 CYS 161

ALA 144 0.01 TRP 296 -0.06 CYS 161

LEU 147 0.01 PRO 297 -0.06 CYS 161

VAL 150 0.03 SER 298 -0.06 ARG 203

If you find results from this site helpful for your research, please cite one of our papers:

K. Suhre & Y.H. Sanejouand, ElNemo: a normal mode web-server for protein movement analysis and the generation of templates for molecular replacement. Nucleic Acids Research, 32, W610-W614, 2004.
K. Suhre & Y.H. Sanejouand, On the potential of normal mode analysis for solving difficult molecular replacement problems. Acta Cryst. D vol.60, p796-799, 2004 © International Union of Crystallography.

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