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***  ENDOCYTOSIS 29-JUN-09 3I2W  ***

LOGs for ID: 2602230445411017275

Output from eigenvector calculation:


STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8) Build Tirion matrix: Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model. Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004. Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file. Pdbmat> Coordinate filename = 2602230445411017275.atom Pdbmat> Distance cutoff = 8.00 Force constant = 10.00 Origin of mass values = CONS Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09 PRINTing level = 2 Pdbmat> Coordinate file 2602230445411017275.atom to be opened. Openam> File opened: 2602230445411017275.atom Pdbmat> Coordinate file in PDB format. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 544 First residue number = 14 Last residue number = 298 Number of atoms found = 4524 Mean number per residue = 8.3 Pdbmat> Coordinate statistics: = -7.455601 +/- 10.443807 From: -41.983000 To: 15.647000 = -25.756405 +/- 40.630814 From: -99.463000 To: 58.889000 = 15.098103 +/- 23.993930 From: -39.377000 To: 84.918000 Pdbmat> Masses are all set to one. Openam> File opened: pdbmat.xyzm Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved. Openam> File opened: pdbmat.sdijb Pdbmat> Matrix statistics: Pdbmat> The matrix is 1.8018 % Filled. Pdbmat> 1659589 non-zero elements. Pdbmat> 181415 atom-atom interactions. Pdbmat> Number per atom= 80.20 +/- 21.72 Maximum number = 131 Minimum number = 16 Pdbmat> Matrix trace = 3.628300E+06 Pdbmat> Larger element = 512.964 Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10 Pdbmat> Normal end. automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1) 544 non-zero elements, NRBL set to 3 Diagonalize Tirion matrix using diagrtb Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation. Diagrtb> Version 2.52, November 2004. Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file. Diagrtb> Options taken into account: MATRix filename = pdbmat.sdijb COORdinates filename = 2602230445411017275.atom Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb Nb of VECTors required = 106 EigeNVALues chosen = LOWE Type of SUBStructuring = NONE Nb of residues per BLOck = 3 Origin of MASS values = CONS MATRix FORMat = BINA Temporary files cleaning = ALL Output PRINting level = 2 Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb. Blocpdb> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.xyzm Blocpdb> Coordinate file 2602230445411017275.atom to be opened. Openam> file on opening on unit 11: 2602230445411017275.atom Blocpdb> Coordinate file in PDB format. Blocpdb> 4524 atoms picked in pdb file. Blocpdb> All masses set to unity. Blocpdb> Coordinate file is rewritten. Blocpdb> Substructuring: Blocpdb> 3 residue(s) per block. Blocpdb> 544 residues. Blocpdb> 20 atoms in block 1 Block first atom: 1 Blocpdb> 34 atoms in block 2 Block first atom: 21 Blocpdb> 19 atoms in block 3 Block first atom: 55 Blocpdb> 32 atoms in block 4 Block first atom: 74 Blocpdb> 23 atoms in block 5 Block first atom: 106 Blocpdb> 28 atoms in block 6 Block first atom: 129 Blocpdb> 24 atoms in block 7 Block first atom: 157 Blocpdb> 23 atoms in block 8 Block first atom: 181 Blocpdb> 24 atoms in block 9 Block first atom: 204 Blocpdb> 26 atoms in block 10 Block first atom: 228 Blocpdb> 26 atoms in block 11 Block first atom: 254 Blocpdb> 24 atoms in block 12 Block first atom: 280 Blocpdb> 26 atoms in block 13 Block first atom: 304 Blocpdb> 21 atoms in block 14 Block first atom: 330 Blocpdb> 23 atoms in block 15 Block first atom: 351 Blocpdb> 32 atoms in block 16 Block first atom: 374 Blocpdb> 24 atoms in block 17 Block first atom: 406 Blocpdb> 27 atoms in block 18 Block first atom: 430 Blocpdb> 25 atoms in block 19 Block first atom: 457 Blocpdb> 20 atoms in block 20 Block first atom: 482 Blocpdb> 25 atoms in block 21 Block first atom: 502 Blocpdb> 23 atoms in block 22 Block first atom: 527 Blocpdb> 24 atoms in block 23 Block first atom: 550 Blocpdb> 20 atoms in block 24 Block first atom: 574 Blocpdb> 24 atoms in block 25 Block first atom: 594 Blocpdb> 26 atoms in block 26 Block first atom: 618 Blocpdb> 22 atoms in block 27 Block first atom: 644 Blocpdb> 17 atoms in block 28 Block first atom: 666 Blocpdb> 26 atoms in block 29 Block first atom: 683 Blocpdb> 24 atoms in block 30 Block first atom: 709 Blocpdb> 22 atoms in block 31 Block first atom: 733 Blocpdb> 21 atoms in block 32 Block first atom: 755 Blocpdb> 26 atoms in block 33 Block first atom: 776 Blocpdb> 30 atoms in block 34 Block first atom: 802 Blocpdb> 26 atoms in block 35 Block first atom: 832 Blocpdb> 32 atoms in block 36 Block first atom: 858 Blocpdb> 15 atoms in block 37 Block first atom: 890 Blocpdb> 26 atoms in block 38 Block first atom: 905 Blocpdb> 29 atoms in block 39 Block first atom: 931 Blocpdb> 25 atoms in block 40 Block first atom: 960 Blocpdb> 27 atoms in block 41 Block first atom: 985 Blocpdb> 23 atoms in block 42 Block first atom: 1012 Blocpdb> 25 atoms in block 43 Block first atom: 1035 Blocpdb> 28 atoms in block 44 Block first atom: 1060 Blocpdb> 21 atoms in block 45 Block first atom: 1088 Blocpdb> 25 atoms in block 46 Block first atom: 1109 Blocpdb> 23 atoms in block 47 Block first atom: 1134 Blocpdb> 25 atoms in block 48 Block first atom: 1157 Blocpdb> 21 atoms in block 49 Block first atom: 1182 Blocpdb> 22 atoms in block 50 Block first atom: 1203 Blocpdb> 26 atoms in block 51 Block first atom: 1225 Blocpdb> 12 atoms in block 52 Block first atom: 1251 Blocpdb> 29 atoms in block 53 Block first atom: 1263 Blocpdb> 25 atoms in block 54 Block first atom: 1292 Blocpdb> 24 atoms in block 55 Block first atom: 1317 Blocpdb> 25 atoms in block 56 Block first atom: 1341 Blocpdb> 26 atoms in block 57 Block first atom: 1366 Blocpdb> 30 atoms in block 58 Block first atom: 1392 Blocpdb> 23 atoms in block 59 Block first atom: 1422 Blocpdb> 22 atoms in block 60 Block first atom: 1445 Blocpdb> 24 atoms in block 61 Block first atom: 1467 Blocpdb> 26 atoms in block 62 Block first atom: 1491 Blocpdb> 27 atoms in block 63 Block first atom: 1517 Blocpdb> 17 atoms in block 64 Block first atom: 1544 Blocpdb> 20 atoms in block 65 Block first atom: 1561 Blocpdb> 29 atoms in block 66 Block first atom: 1581 Blocpdb> 22 atoms in block 67 Block first atom: 1610 Blocpdb> 29 atoms in block 68 Block first atom: 1632 Blocpdb> 26 atoms in block 69 Block first atom: 1661 Blocpdb> 31 atoms in block 70 Block first atom: 1687 Blocpdb> 26 atoms in block 71 Block first atom: 1718 Blocpdb> 27 atoms in block 72 Block first atom: 1744 Blocpdb> 23 atoms in block 73 Block first atom: 1771 Blocpdb> 22 atoms in block 74 Block first atom: 1794 Blocpdb> 24 atoms in block 75 Block first atom: 1816 Blocpdb> 22 atoms in block 76 Block first atom: 1840 Blocpdb> 24 atoms in block 77 Block first atom: 1862 Blocpdb> 29 atoms in block 78 Block first atom: 1886 Blocpdb> 26 atoms in block 79 Block first atom: 1915 Blocpdb> 25 atoms in block 80 Block first atom: 1941 Blocpdb> 21 atoms in block 81 Block first atom: 1966 Blocpdb> 26 atoms in block 82 Block first atom: 1987 Blocpdb> 25 atoms in block 83 Block first atom: 2013 Blocpdb> 37 atoms in block 84 Block first atom: 2038 Blocpdb> 22 atoms in block 85 Block first atom: 2075 Blocpdb> 22 atoms in block 86 Block first atom: 2097 Blocpdb> 8 atoms in block 87 Block first atom: 2119 Blocpdb> 5 atoms in block 88 Block first atom: 2127 Blocpdb> 29 atoms in block 89 Block first atom: 2132 Blocpdb> 24 atoms in block 90 Block first atom: 2161 Blocpdb> 28 atoms in block 91 Block first atom: 2185 Blocpdb> 20 atoms in block 92 Block first atom: 2213 Blocpdb> 34 atoms in block 93 Block first atom: 2233 Blocpdb> 19 atoms in block 94 Block first atom: 2267 Blocpdb> 32 atoms in block 95 Block first atom: 2286 Blocpdb> 23 atoms in block 96 Block first atom: 2318 Blocpdb> 28 atoms in block 97 Block first atom: 2341 Blocpdb> 24 atoms in block 98 Block first atom: 2369 Blocpdb> 23 atoms in block 99 Block first atom: 2393 Blocpdb> 24 atoms in block 100 Block first atom: 2416 Blocpdb> 26 atoms in block 101 Block first atom: 2440 Blocpdb> 26 atoms in block 102 Block first atom: 2466 Blocpdb> 24 atoms in block 103 Block first atom: 2492 Blocpdb> 26 atoms in block 104 Block first atom: 2516 Blocpdb> 21 atoms in block 105 Block first atom: 2542 Blocpdb> 23 atoms in block 106 Block first atom: 2563 Blocpdb> 32 atoms in block 107 Block first atom: 2586 Blocpdb> 24 atoms in block 108 Block first atom: 2618 Blocpdb> 27 atoms in block 109 Block first atom: 2642 Blocpdb> 25 atoms in block 110 Block first atom: 2669 Blocpdb> 20 atoms in block 111 Block first atom: 2694 Blocpdb> 25 atoms in block 112 Block first atom: 2714 Blocpdb> 23 atoms in block 113 Block first atom: 2739 Blocpdb> 24 atoms in block 114 Block first atom: 2762 Blocpdb> 20 atoms in block 115 Block first atom: 2786 Blocpdb> 24 atoms in block 116 Block first atom: 2806 Blocpdb> 26 atoms in block 117 Block first atom: 2830 Blocpdb> 22 atoms in block 118 Block first atom: 2856 Blocpdb> 17 atoms in block 119 Block first atom: 2878 Blocpdb> 26 atoms in block 120 Block first atom: 2895 Blocpdb> 24 atoms in block 121 Block first atom: 2921 Blocpdb> 22 atoms in block 122 Block first atom: 2945 Blocpdb> 21 atoms in block 123 Block first atom: 2967 Blocpdb> 26 atoms in block 124 Block first atom: 2988 Blocpdb> 30 atoms in block 125 Block first atom: 3014 Blocpdb> 26 atoms in block 126 Block first atom: 3044 Blocpdb> 32 atoms in block 127 Block first atom: 3070 Blocpdb> 15 atoms in block 128 Block first atom: 3102 Blocpdb> 26 atoms in block 129 Block first atom: 3117 Blocpdb> 29 atoms in block 130 Block first atom: 3143 Blocpdb> 25 atoms in block 131 Block first atom: 3172 Blocpdb> 27 atoms in block 132 Block first atom: 3197 Blocpdb> 23 atoms in block 133 Block first atom: 3224 Blocpdb> 25 atoms in block 134 Block first atom: 3247 Blocpdb> 28 atoms in block 135 Block first atom: 3272 Blocpdb> 21 atoms in block 136 Block first atom: 3300 Blocpdb> 25 atoms in block 137 Block first atom: 3321 Blocpdb> 23 atoms in block 138 Block first atom: 3346 Blocpdb> 25 atoms in block 139 Block first atom: 3369 Blocpdb> 21 atoms in block 140 Block first atom: 3394 Blocpdb> 22 atoms in block 141 Block first atom: 3415 Blocpdb> 26 atoms in block 142 Block first atom: 3437 Blocpdb> 20 atoms in block 143 Block first atom: 3463 Blocpdb> 29 atoms in block 144 Block first atom: 3483 Blocpdb> 21 atoms in block 145 Block first atom: 3512 Blocpdb> 19 atoms in block 146 Block first atom: 3533 Blocpdb> 20 atoms in block 147 Block first atom: 3552 Blocpdb> 24 atoms in block 148 Block first atom: 3572 Blocpdb> 25 atoms in block 149 Block first atom: 3596 Blocpdb> 29 atoms in block 150 Block first atom: 3621 Blocpdb> 25 atoms in block 151 Block first atom: 3650 Blocpdb> 24 atoms in block 152 Block first atom: 3675 Blocpdb> 25 atoms in block 153 Block first atom: 3699 Blocpdb> 26 atoms in block 154 Block first atom: 3724 Blocpdb> 30 atoms in block 155 Block first atom: 3750 Blocpdb> 23 atoms in block 156 Block first atom: 3780 Blocpdb> 22 atoms in block 157 Block first atom: 3803 Blocpdb> 24 atoms in block 158 Block first atom: 3825 Blocpdb> 26 atoms in block 159 Block first atom: 3849 Blocpdb> 27 atoms in block 160 Block first atom: 3875 Blocpdb> 17 atoms in block 161 Block first atom: 3902 Blocpdb> 20 atoms in block 162 Block first atom: 3919 Blocpdb> 29 atoms in block 163 Block first atom: 3939 Blocpdb> 22 atoms in block 164 Block first atom: 3968 Blocpdb> 29 atoms in block 165 Block first atom: 3990 Blocpdb> 26 atoms in block 166 Block first atom: 4019 Blocpdb> 31 atoms in block 167 Block first atom: 4045 Blocpdb> 26 atoms in block 168 Block first atom: 4076 Blocpdb> 27 atoms in block 169 Block first atom: 4102 Blocpdb> 23 atoms in block 170 Block first atom: 4129 Blocpdb> 22 atoms in block 171 Block first atom: 4152 Blocpdb> 24 atoms in block 172 Block first atom: 4174 Blocpdb> 22 atoms in block 173 Block first atom: 4198 Blocpdb> 24 atoms in block 174 Block first atom: 4220 Blocpdb> 29 atoms in block 175 Block first atom: 4244 Blocpdb> 26 atoms in block 176 Block first atom: 4273 Blocpdb> 25 atoms in block 177 Block first atom: 4299 Blocpdb> 21 atoms in block 178 Block first atom: 4324 Blocpdb> 26 atoms in block 179 Block first atom: 4345 Blocpdb> 25 atoms in block 180 Block first atom: 4371 Blocpdb> 37 atoms in block 181 Block first atom: 4396 Blocpdb> 22 atoms in block 182 Block first atom: 4433 Blocpdb> 22 atoms in block 183 Block first atom: 4455 Blocpdb> 8 atoms in block 184 Block first atom: 4477 Blocpdb> 5 atoms in block 185 Block first atom: 4485 Blocpdb> 29 atoms in block 186 Block first atom: 4490 Blocpdb> 6 atoms in block 187 Block first atom: 4518 Blocpdb> 187 blocks. Blocpdb> At most, 37 atoms in each of them. Blocpdb> At least, 5 atoms in each of them. Blocpdb> Normal end of Blocpdb. Diagrtb> Memory allocation for Prepmat. Diagrtb> Memory allocation for RTB. Diagrtb> Memory allocation for Diagstd. Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes. Prepmat> Entering in. Prepmat> Rewriting of the matrix begins. Prepmat> 1659776 matrix lines read. Prepmat> Matrix order = 13572 Prepmat> Matrix trace = 3628300.0000 Prepmat> Last element read: 13572 13572 157.1532 Prepmat> 17579 lines saved. Prepmat> 15955 empty lines. Prepmat> Number of lines on output is as expected. Prepmat> Normal end of Prepmat. RTB> Entering in. RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 4524 RTB> Total mass = 4524.0000 RTB> Number of atoms found in matrix: 4524 RTB> Number of blocks = 187 RTB> Projection begins. RTB> Projected matrix is being saved. RTB> Projected matrix trace = 226184.3187 RTB> 55623 non-zero elements. RTB> Normal end of RTB. Diagstd> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.sdijb Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb Diagstd> CERFACS matrix format. Diagstd> Projected matrix order = 1122 Diagstd> Nb of non-zero elements: 55623 Diagstd> Projected matrix trace = 226184.3187 Openam> file on opening on unit 11: diagrtb_work.eigenfacs Diagstd> Diagonalization. Diagstd> 1122 eigenvectors are computed. Diagstd> 106 of them to be saved. Diagstd> Sum of eigenvalues = 226184.3187 Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000 Diagstd> Selected eigenvalues: 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0358150 0.0598485 0.1082208 0.1811888 0.3261864 0.3594760 0.4956263 0.7314215 0.8471717 0.9637556 1.2197864 1.5133565 1.6384003 1.8870028 2.5350696 2.9115240 3.1136906 3.6384509 4.0033292 4.2817472 4.8380426 5.6818299 5.8907515 6.6561490 7.1123126 7.8010599 8.2448591 8.7805559 10.3242350 10.7898507 10.9215673 11.5545474 12.5531235 12.7978272 13.5528339 14.8798127 15.2225947 15.9438203 16.5246007 17.8495160 18.1661336 18.4361416 19.2930933 19.6480141 20.3569248 21.1188118 21.6090029 22.3743814 23.2912974 23.3533687 24.4344822 24.7182132 25.7478269 26.2452513 26.6938710 26.9233235 27.6360988 27.9686494 28.2618369 29.7372075 30.3683768 31.0144792 31.0693343 31.3551978 31.9667026 32.3609750 32.5409713 32.9676510 33.5887431 34.1990743 34.5904225 34.9570301 35.7315302 36.0033202 36.2327623 36.7045241 36.9343740 37.1560420 37.6092534 37.9711419 38.4869374 39.1744407 39.5178194 40.5945567 40.6583672 41.2517463 41.6782768 42.0445697 42.3167533 42.6624312 43.0377180 43.4522866 43.8736409 44.0863542 44.3219431 45.2204545 45.4118664 45.8405173 45.9983725 46.4430560 Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units): 0.0034328 0.0034331 0.0034334 0.0034341 0.0034348 0.0034351 20.5507484 26.5657403 35.7232196 46.2233057 62.0194945 65.1073784 76.4491100 92.8707890 99.9495854 106.6052865 119.9325803 133.5875247 138.9969564 149.1700196 172.8981003 185.2914877 191.6165475 207.1350251 217.2730849 224.7014065 238.8526841 258.8447691 263.5606866 280.1604326 289.6014285 303.2997744 311.8077452 321.7779541 348.9186793 356.6999088 358.8705036 369.1235470 384.7434014 388.4752916 399.7701263 418.8842323 423.6816189 433.6021992 441.4289042 458.7842526 462.8353610 466.2622963 476.9756543 481.3429448 489.9495540 499.0338668 504.7922102 513.6541465 524.0734045 524.7712670 536.7806478 539.8881772 551.0177271 556.3148439 561.0493442 563.4554901 570.8653039 574.2897008 577.2919124 592.1685961 598.4199591 604.7522966 605.2868714 608.0650652 613.9658286 617.7405057 619.4561028 623.5040548 629.3498846 635.0420096 638.6651425 642.0406774 649.1141668 651.5782166 653.6511098 657.8927177 659.9494202 661.9268573 665.9515532 669.1478844 673.6773674 679.6677801 682.6400531 691.8774594 692.4210259 697.4554129 701.0518786 704.1257656 706.4012355 709.2805993 712.3934174 715.8163240 719.2785655 721.0201020 722.9440305 730.2351629 731.7790227 735.2246091 736.4894216 740.0408183 Diagstd> Normal end. Rtb_to_modes> Entering in. Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 4524 Rtb_to_modes> Number of blocs = 187 Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.eigenfacs Openam> file on opening on unit 11: matrix.eigenrtb Rdmodfacs> Entering in. Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Eigenvector number: 1 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9933E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 2 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9951E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 3 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9970E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 4 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0001E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 5 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0005E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 6 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0007E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 7 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.5815E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 8 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.9849E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 9 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.1082 Rdmodfacs> Eigenvector number: 10 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.1812 Rdmodfacs> Eigenvector number: 11 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.3262 Rdmodfacs> Eigenvector number: 12 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.3595 Rdmodfacs> Eigenvector number: 13 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.4956 Rdmodfacs> Eigenvector number: 14 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.7314 Rdmodfacs> Eigenvector number: 15 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.8472 Rdmodfacs> Eigenvector number: 16 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.9638 Rdmodfacs> Eigenvector number: 17 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.220 Rdmodfacs> Eigenvector number: 18 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.513 Rdmodfacs> Eigenvector number: 19 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.638 Rdmodfacs> Eigenvector number: 20 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.887 Rdmodfacs> Eigenvector number: 21 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.535 Rdmodfacs> Eigenvector number: 22 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.912 Rdmodfacs> Eigenvector number: 23 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.114 Rdmodfacs> Eigenvector number: 24 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.638 Rdmodfacs> Eigenvector number: 25 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.003 Rdmodfacs> Eigenvector number: 26 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.282 Rdmodfacs> Eigenvector number: 27 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.838 Rdmodfacs> Eigenvector number: 28 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.682 Rdmodfacs> Eigenvector number: 29 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.891 Rdmodfacs> Eigenvector number: 30 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.656 Rdmodfacs> Eigenvector number: 31 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.112 Rdmodfacs> Eigenvector number: 32 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.801 Rdmodfacs> Eigenvector number: 33 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.245 Rdmodfacs> Eigenvector number: 34 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.781 Rdmodfacs> Eigenvector number: 35 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.32 Rdmodfacs> Eigenvector number: 36 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.79 Rdmodfacs> Eigenvector number: 37 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.92 Rdmodfacs> Eigenvector number: 38 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.55 Rdmodfacs> Eigenvector number: 39 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.55 Rdmodfacs> Eigenvector number: 40 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.80 Rdmodfacs> Eigenvector number: 41 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.55 Rdmodfacs> Eigenvector number: 42 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.88 Rdmodfacs> Eigenvector number: 43 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.22 Rdmodfacs> Eigenvector number: 44 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.94 Rdmodfacs> Eigenvector number: 45 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.52 Rdmodfacs> Eigenvector number: 46 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.85 Rdmodfacs> Eigenvector number: 47 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.17 Rdmodfacs> Eigenvector number: 48 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.44 Rdmodfacs> Eigenvector number: 49 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.29 Rdmodfacs> Eigenvector number: 50 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.65 Rdmodfacs> Eigenvector number: 51 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.36 Rdmodfacs> Eigenvector number: 52 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.12 Rdmodfacs> Eigenvector number: 53 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.61 Rdmodfacs> Eigenvector number: 54 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.37 Rdmodfacs> Eigenvector number: 55 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.29 Rdmodfacs> Eigenvector number: 56 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.35 Rdmodfacs> Eigenvector number: 57 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.43 Rdmodfacs> Eigenvector number: 58 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.72 Rdmodfacs> Eigenvector number: 59 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.75 Rdmodfacs> Eigenvector number: 60 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.25 Rdmodfacs> Eigenvector number: 61 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.69 Rdmodfacs> Eigenvector number: 62 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.92 Rdmodfacs> Eigenvector number: 63 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.64 Rdmodfacs> Eigenvector number: 64 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.97 Rdmodfacs> Eigenvector number: 65 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.26 Rdmodfacs> Eigenvector number: 66 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.74 Rdmodfacs> Eigenvector number: 67 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.37 Rdmodfacs> Eigenvector number: 68 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.01 Rdmodfacs> Eigenvector number: 69 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.07 Rdmodfacs> Eigenvector number: 70 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.36 Rdmodfacs> Eigenvector number: 71 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.97 Rdmodfacs> Eigenvector number: 72 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.36 Rdmodfacs> Eigenvector number: 73 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.54 Rdmodfacs> Eigenvector number: 74 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.97 Rdmodfacs> Eigenvector number: 75 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.59 Rdmodfacs> Eigenvector number: 76 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.20 Rdmodfacs> Eigenvector number: 77 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.59 Rdmodfacs> Eigenvector number: 78 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.96 Rdmodfacs> Eigenvector number: 79 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.73 Rdmodfacs> Eigenvector number: 80 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.00 Rdmodfacs> Eigenvector number: 81 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.23 Rdmodfacs> Eigenvector number: 82 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.70 Rdmodfacs> Eigenvector number: 83 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.93 Rdmodfacs> Eigenvector number: 84 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.16 Rdmodfacs> Eigenvector number: 85 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.61 Rdmodfacs> Eigenvector number: 86 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.97 Rdmodfacs> Eigenvector number: 87 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.49 Rdmodfacs> Eigenvector number: 88 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.17 Rdmodfacs> Eigenvector number: 89 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.52 Rdmodfacs> Eigenvector number: 90 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.59 Rdmodfacs> Eigenvector number: 91 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.66 Rdmodfacs> Eigenvector number: 92 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.25 Rdmodfacs> Eigenvector number: 93 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.68 Rdmodfacs> Eigenvector number: 94 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.04 Rdmodfacs> Eigenvector number: 95 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.32 Rdmodfacs> Eigenvector number: 96 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.66 Rdmodfacs> Eigenvector number: 97 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.04 Rdmodfacs> Eigenvector number: 98 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.45 Rdmodfacs> Eigenvector number: 99 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.87 Rdmodfacs> Eigenvector number: 100 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 101 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.32 Rdmodfacs> Eigenvector number: 102 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.22 Rdmodfacs> Eigenvector number: 103 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.41 Rdmodfacs> Eigenvector number: 104 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.84 Rdmodfacs> Eigenvector number: 105 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.00 Rdmodfacs> Eigenvector number: 106 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.44 Rtb_to_modes> 106 vectors, with 1122 coordinates in vector file. Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected): 1.00000 1.00000 0.99999 1.00000 1.00000 0.99999 1.00000 1.00003 1.00002 0.99998 1.00001 1.00001 0.99999 0.99999 1.00000 0.99999 0.99999 1.00000 1.00002 1.00003 1.00001 1.00002 1.00002 0.99999 1.00001 1.00001 1.00001 1.00001 0.99998 1.00000 1.00001 1.00000 1.00001 1.00001 0.99999 0.99996 1.00000 0.99998 1.00001 1.00001 0.99999 1.00000 0.99999 1.00000 1.00000 0.99999 1.00000 1.00000 0.99998 0.99999 1.00001 1.00000 1.00000 1.00001 0.99999 0.99999 1.00000 1.00002 1.00000 0.99998 0.99999 1.00000 1.00000 1.00001 1.00002 1.00000 0.99999 1.00000 0.99999 0.99999 1.00001 0.99999 0.99999 1.00000 1.00002 1.00001 0.99999 0.99999 1.00002 0.99999 1.00001 1.00000 0.99999 1.00000 1.00002 0.99997 0.99999 0.99998 1.00001 1.00000 1.00000 1.00001 1.00000 1.00000 1.00001 0.99999 1.00000 1.00000 0.99999 1.00000 1.00000 0.99998 1.00000 1.00002 1.00002 0.99999 Rtb_to_modes> RTB block-file is being read. Rtb_to_modes> 81432 lines found in RTB file. Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected): 1.00000 1.00000 0.99999 1.00000 1.00000 0.99999 1.00000 1.00003 1.00002 0.99998 1.00001 1.00001 0.99999 0.99999 1.00000 0.99999 0.99999 1.00000 1.00002 1.00003 1.00001 1.00002 1.00002 0.99999 1.00001 1.00001 1.00001 1.00001 0.99998 1.00000 1.00001 1.00000 1.00001 1.00001 0.99999 0.99996 1.00000 0.99998 1.00001 1.00001 0.99999 1.00000 0.99999 1.00000 1.00000 0.99999 1.00000 1.00000 0.99998 0.99999 1.00001 1.00000 1.00000 1.00001 0.99999 0.99999 1.00000 1.00002 1.00000 0.99998 0.99999 1.00000 1.00000 1.00001 1.00002 1.00000 0.99999 1.00000 0.99999 0.99999 1.00001 0.99999 0.99999 1.00000 1.00002 1.00001 0.99999 0.99999 1.00002 0.99999 1.00001 1.00000 0.99999 1.00000 1.00002 0.99997 0.99999 0.99998 1.00001 1.00000 1.00000 1.00001 1.00000 1.00000 1.00001 0.99999 1.00000 1.00000 0.99999 1.00000 1.00000 0.99998 1.00000 1.00002 1.00002 0.99999 Orthogonality of first eigenvectors (zero expected): Vector 2:-0.000 Vector 3:-0.000 0.000 Vector 4:-0.000 0.000-0.000 Vector 5: 0.000-0.000-0.000 0.000 Vector 6: 0.000-0.000 0.000-0.000 0.000 Vector 7:-0.000 0.000-0.000 0.000-0.000 0.000 Vector 8:-0.000 0.000 0.000 0.000 0.000-0.000-0.000 Vector 9:-0.000-0.000-0.000 0.000 0.000 0.000-0.000 0.000 Vector 10:-0.000 0.000 0.000 0.000 0.000-0.000-0.000 0.000-0.000 Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved. Rtb_to_modes> Normal end. Diagrtb> Normal end. B-factor analysis Bfactors> Version 1.22, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 2602230445411017275.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 2602230445411017275.eigenfacs Getnam> Corresponding pdb filename ? Getnam> 2602230445411017275.atom Openam> file on opening on unit 11: 2602230445411017275.atom Getnum> Number of skipped eigenvectors ? Getnum> 0 Getnum> Number of usefull eigenvectors ? Getnum> 10000 %Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 544 First residue number = 14 Last residue number = 298 Number of atoms found = 4524 Mean number per residue = 8.3 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9933E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9951E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9970E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0001E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0005E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0007E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.5815E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.9849E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.1082 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.1812 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.3262 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.3595 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.4956 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.7314 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.8472 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.9638 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.220 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.513 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.638 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.887 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.535 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.912 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.114 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.638 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.003 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.282 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.838 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.682 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.891 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.656 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.112 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.801 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.245 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.781 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.32 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.79 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.92 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.55 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.55 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.80 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.55 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.88 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.22 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.94 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.52 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.85 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.17 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.44 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.29 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.65 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.36 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.12 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.61 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.37 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.29 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.35 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.43 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.72 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.75 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.25 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.69 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.92 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.64 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.97 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.26 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.74 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.37 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.01 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.07 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.36 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.97 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.36 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.54 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.97 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.59 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.20 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.59 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.96 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.73 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.00 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.23 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.70 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.93 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.16 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.61 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.97 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.49 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.17 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.52 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.59 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.66 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.25 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.68 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.04 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.32 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.66 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.04 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.45 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.87 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.32 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.22 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.41 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.84 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.00 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.44 Bfactors> 106 vectors, 13572 coordinates in file. Openam> file on opening on unit 12: bfactors.pred Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000 Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 0.035815 Bfactors> 100 eigenvectors will be considered. Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped. Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed. (CHARMM units assumed for eigenvalues) Bfactors> Correlation= 0.583 for 544 C-alpha atoms. Bfactors> = 0.272 +/- 0.42 Bfactors> = 42.238 +/- 29.51 Bfactors> Shiftng-fct= 41.966 Bfactors> Scaling-fct= 70.347 Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved. Bfactors> Normal end. check_modes Chkmod> Version 1.00, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 2602230445411017275.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 2602230445411017275.eigenfacs Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4327E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4330E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4333E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4340E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4347E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4350E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 20.55 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 26.56 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 35.72 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 46.22 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 62.02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 65.11 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 76.44 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 92.87 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 99.95 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 106.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 119.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 133.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 139.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 149.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 172.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 185.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 191.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 207.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 217.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 224.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 238.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 258.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 263.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 280.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 289.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 303.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 311.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 321.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 348.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 356.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 358.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 369.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 384.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 388.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 399.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 418.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 423.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 433.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 441.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 458.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 462.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 466.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 476.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 481.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 490.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 499.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 504.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 513.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 524.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 524.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 536.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 539.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 551.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 556.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 561.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 563.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 570.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 574.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 577.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 592.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 598.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 604.7 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Chkmod> That is: 4524 cartesian points. Openam> file on opening on unit 11: Chkmod.res Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file. 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perturbations for mode 8 calculating perturbed structure for DQ=-100 2602230445411017275.eigenfacs 2602230445411017275.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2602230445411017275.eigenfacs 2602230445411017275.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2602230445411017275.eigenfacs 2602230445411017275.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2602230445411017275.eigenfacs 2602230445411017275.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2602230445411017275.eigenfacs 2602230445411017275.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2602230445411017275.eigenfacs 2602230445411017275.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2602230445411017275.eigenfacs 2602230445411017275.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2602230445411017275.eigenfacs 2602230445411017275.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2602230445411017275.eigenfacs 2602230445411017275.atom calculating perturbed structure for DQ=80 2602230445411017275.eigenfacs 2602230445411017275.atom 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animated gif 300x300 getting mode 9 running: ../../bin/get_modes.sh 2602230445411017275 9 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 9 calculating perturbed structure for DQ=-100 2602230445411017275.eigenfacs 2602230445411017275.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2602230445411017275.eigenfacs 2602230445411017275.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2602230445411017275.eigenfacs 2602230445411017275.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2602230445411017275.eigenfacs 2602230445411017275.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2602230445411017275.eigenfacs 2602230445411017275.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2602230445411017275.eigenfacs 2602230445411017275.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2602230445411017275.eigenfacs 2602230445411017275.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2602230445411017275.eigenfacs 2602230445411017275.atom calculating perturbed structure for DQ=60 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will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 10 running: ../../bin/get_modes.sh 2602230445411017275 10 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 10 calculating perturbed structure for DQ=-100 2602230445411017275.eigenfacs 2602230445411017275.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2602230445411017275.eigenfacs 2602230445411017275.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2602230445411017275.eigenfacs 2602230445411017275.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2602230445411017275.eigenfacs 2602230445411017275.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2602230445411017275.eigenfacs 2602230445411017275.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2602230445411017275.eigenfacs 2602230445411017275.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2602230445411017275.eigenfacs 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gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2602230445411017275.10.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 11 running: ../../bin/get_modes.sh 2602230445411017275 11 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 11 calculating perturbed structure for DQ=-100 2602230445411017275.eigenfacs 2602230445411017275.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2602230445411017275.eigenfacs 2602230445411017275.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2602230445411017275.eigenfacs 2602230445411017275.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2602230445411017275.eigenfacs 2602230445411017275.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2602230445411017275.eigenfacs 2602230445411017275.atom 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MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2602230445411017275.11.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 2602230445411017275.10.pdb 2602230445411017275.11.pdb 2602230445411017275.7.pdb 2602230445411017275.8.pdb 2602230445411017275.9.pdb STDERR: Note: The following floating-point exceptions are signalling: IEEE_DENORMAL real 0m25.946s user 0m25.786s sys 0m0.145s rm: cannot remove '2602230445411017275.sdijf': No such file or directory pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format 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