CNRS Nantes University US2B US2B
home |  start a new run |  job status |  references&downloads |  examples |  help  

Should you encounter any unexpected behaviour,
please let us know.
elNémo has been hacked on november 27th.
It has been moved away and runs again.
**Still some additional cleaning from time to time**
Sorry for the inconvenience.


***  BAK full membrane seul  ***

LOGs for ID: 2602240924421291259

Output from eigenvector calculation:


STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8) Build Tirion matrix: Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model. Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004. Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file. Pdbmat> Coordinate filename = 2602240924421291259.atom Pdbmat> Distance cutoff = 8.00 Force constant = 10.00 Origin of mass values = CONS Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09 PRINTing level = 2 Pdbmat> Coordinate file 2602240924421291259.atom to be opened. Openam> File opened: 2602240924421291259.atom Pdbmat> Coordinate file in PDB format. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 197 First residue number = 1 Last residue number = 197 Number of atoms found = 3085 Mean number per residue = 15.7 Pdbmat> Coordinate statistics: = 64.807583 +/- 9.145250 From: 41.932000 To: 87.588000 = 65.696911 +/- 9.314859 From: 39.904000 To: 94.652000 = 60.326557 +/- 15.917828 From: 35.326000 To: 114.258000 Pdbmat> Masses are all set to one. %Pdbmat-W> residue:'HIE ' is not a well known amino-acid. %Pdbmat-W> residue:'HIE ' is not a well known amino-acid. %Pdbmat-W> residue:'HIE ' is not a well known amino-acid. %Pdbmat-W> residue:'HIE ' is not a well known amino-acid. %Pdbmat-W> residue:'HIE ' is not a well known amino-acid. %Pdbmat-W> residue:'HIE ' is not a well known amino-acid. %Pdbmat-W> 6 residue(s) not known. Openam> File opened: pdbmat.xyzm Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved. Openam> File opened: pdbmat.sdijb Pdbmat> Matrix statistics: Pdbmat> The matrix is 4.8781 % Filled. Pdbmat> 2089410 non-zero elements. Pdbmat> 230135 atom-atom interactions. Pdbmat> Number per atom= 149.20 +/- 51.76 Maximum number = 245 Minimum number = 25 Pdbmat> Matrix trace = 4.602700E+06 Pdbmat> Larger element = 894.855 Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10 Pdbmat> Normal end. automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1) 197 non-zero elements, NRBL set to 1 Diagonalize Tirion matrix using diagrtb Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation. Diagrtb> Version 2.52, November 2004. Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file. Diagrtb> Options taken into account: MATRix filename = pdbmat.sdijb COORdinates filename = 2602240924421291259.atom Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb Nb of VECTors required = 106 EigeNVALues chosen = LOWE Type of SUBStructuring = NONE Nb of residues per BLOck = 1 Origin of MASS values = CONS MATRix FORMat = BINA Temporary files cleaning = ALL Output PRINting level = 2 Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb. Blocpdb> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.xyzm Blocpdb> Coordinate file 2602240924421291259.atom to be opened. Openam> file on opening on unit 11: 2602240924421291259.atom Blocpdb> Coordinate file in PDB format. Blocpdb> 3085 atoms picked in pdb file. Blocpdb> All masses set to unity. Blocpdb> Coordinate file is rewritten. Blocpdb> Substructuring: Blocpdb> 1 residue(s) per block. Blocpdb> 197 residues. Blocpdb> 9 atoms in block 1 Block first atom: 1 Blocpdb> 15 atoms in block 2 Block first atom: 10 Blocpdb> 14 atoms in block 3 Block first atom: 25 Blocpdb> 10 atoms in block 4 Block first atom: 39 Blocpdb> 19 atoms in block 5 Block first atom: 49 Blocpdb> 14 atoms in block 6 Block first atom: 68 Blocpdb> 11 atoms in block 7 Block first atom: 82 Blocpdb> 10 atoms in block 8 Block first atom: 93 Blocpdb> 11 atoms in block 9 Block first atom: 103 Blocpdb> 15 atoms in block 10 Block first atom: 114 Blocpdb> 15 atoms in block 11 Block first atom: 129 Blocpdb> 17 atoms in block 12 Block first atom: 144 Blocpdb> 16 atoms in block 13 Block first atom: 161 Blocpdb> 10 atoms in block 14 Block first atom: 177 Blocpdb> 17 atoms in block 15 Block first atom: 187 Blocpdb> 12 atoms in block 16 Block first atom: 204 Blocpdb> 14 atoms in block 17 Block first atom: 216 Blocpdb> 15 atoms in block 18 Block first atom: 230 Blocpdb> 15 atoms in block 19 Block first atom: 245 Blocpdb> 16 atoms in block 20 Block first atom: 260 Blocpdb> 20 atoms in block 21 Block first atom: 276 Blocpdb> 24 atoms in block 22 Block first atom: 296 Blocpdb> 11 atoms in block 23 Block first atom: 320 Blocpdb> 21 atoms in block 24 Block first atom: 331 Blocpdb> 16 atoms in block 25 Block first atom: 352 Blocpdb> 20 atoms in block 26 Block first atom: 368 Blocpdb> 21 atoms in block 27 Block first atom: 388 Blocpdb> 24 atoms in block 28 Block first atom: 409 Blocpdb> 17 atoms in block 29 Block first atom: 433 Blocpdb> 17 atoms in block 30 Block first atom: 450 Blocpdb> 17 atoms in block 31 Block first atom: 467 Blocpdb> 15 atoms in block 32 Block first atom: 484 Blocpdb> 17 atoms in block 33 Block first atom: 499 Blocpdb> 15 atoms in block 34 Block first atom: 516 Blocpdb> 10 atoms in block 35 Block first atom: 531 Blocpdb> 15 atoms in block 36 Block first atom: 541 Blocpdb> 7 atoms in block 37 Block first atom: 556 Blocpdb> 16 atoms in block 38 Block first atom: 563 Blocpdb> 10 atoms in block 39 Block first atom: 579 Blocpdb> 10 atoms in block 40 Block first atom: 589 Blocpdb> 14 atoms in block 41 Block first atom: 599 Blocpdb> 10 atoms in block 42 Block first atom: 613 Blocpdb> 12 atoms in block 43 Block first atom: 623 Blocpdb> 14 atoms in block 44 Block first atom: 635 Blocpdb> 15 atoms in block 45 Block first atom: 649 Blocpdb> 17 atoms in block 46 Block first atom: 664 Blocpdb> 16 atoms in block 47 Block first atom: 681 Blocpdb> 14 atoms in block 48 Block first atom: 697 Blocpdb> 19 atoms in block 49 Block first atom: 711 Blocpdb> 14 atoms in block 50 Block first atom: 730 Blocpdb> 19 atoms in block 51 Block first atom: 744 Blocpdb> 17 atoms in block 52 Block first atom: 763 Blocpdb> 14 atoms in block 53 Block first atom: 780 Blocpdb> 11 atoms in block 54 Block first atom: 794 Blocpdb> 11 atoms in block 55 Block first atom: 805 Blocpdb> 14 atoms in block 56 Block first atom: 816 Blocpdb> 17 atoms in block 57 Block first atom: 830 Blocpdb> 7 atoms in block 58 Block first atom: 847 Blocpdb> 17 atoms in block 59 Block first atom: 854 Blocpdb> 16 atoms in block 60 Block first atom: 871 Blocpdb> 7 atoms in block 61 Block first atom: 887 Blocpdb> 24 atoms in block 62 Block first atom: 894 Blocpdb> 17 atoms in block 63 Block first atom: 918 Blocpdb> 19 atoms in block 64 Block first atom: 935 Blocpdb> 10 atoms in block 65 Block first atom: 954 Blocpdb> 19 atoms in block 66 Block first atom: 964 Blocpdb> 19 atoms in block 67 Block first atom: 983 Blocpdb> 7 atoms in block 68 Block first atom: 1002 Blocpdb> 12 atoms in block 69 Block first atom: 1009 Blocpdb> 12 atoms in block 70 Block first atom: 1021 Blocpdb> 19 atoms in block 71 Block first atom: 1033 Blocpdb> 14 atoms in block 72 Block first atom: 1052 Blocpdb> 24 atoms in block 73 Block first atom: 1066 Blocpdb> 24 atoms in block 74 Block first atom: 1090 Blocpdb> 21 atoms in block 75 Block first atom: 1114 Blocpdb> 12 atoms in block 76 Block first atom: 1135 Blocpdb> 11 atoms in block 77 Block first atom: 1147 Blocpdb> 15 atoms in block 78 Block first atom: 1158 Blocpdb> 20 atoms in block 79 Block first atom: 1173 Blocpdb> 17 atoms in block 80 Block first atom: 1193 Blocpdb> 14 atoms in block 81 Block first atom: 1210 Blocpdb> 17 atoms in block 82 Block first atom: 1224 Blocpdb> 19 atoms in block 83 Block first atom: 1241 Blocpdb> 17 atoms in block 84 Block first atom: 1260 Blocpdb> 17 atoms in block 85 Block first atom: 1277 Blocpdb> 19 atoms in block 86 Block first atom: 1294 Blocpdb> 17 atoms in block 87 Block first atom: 1313 Blocpdb> 14 atoms in block 88 Block first atom: 1330 Blocpdb> 14 atoms in block 89 Block first atom: 1344 Blocpdb> 10 atoms in block 90 Block first atom: 1358 Blocpdb> 15 atoms in block 91 Block first atom: 1368 Blocpdb> 14 atoms in block 92 Block first atom: 1383 Blocpdb> 10 atoms in block 93 Block first atom: 1397 Blocpdb> 21 atoms in block 94 Block first atom: 1407 Blocpdb> 15 atoms in block 95 Block first atom: 1428 Blocpdb> 21 atoms in block 96 Block first atom: 1443 Blocpdb> 20 atoms in block 97 Block first atom: 1464 Blocpdb> 14 atoms in block 98 Block first atom: 1484 Blocpdb> 22 atoms in block 99 Block first atom: 1498 Blocpdb> 19 atoms in block 100 Block first atom: 1520 Blocpdb> 10 atoms in block 101 Block first atom: 1539 Blocpdb> 14 atoms in block 102 Block first atom: 1549 Blocpdb> 11 atoms in block 103 Block first atom: 1563 Blocpdb> 19 atoms in block 104 Block first atom: 1574 Blocpdb> 20 atoms in block 105 Block first atom: 1593 Blocpdb> 15 atoms in block 106 Block first atom: 1613 Blocpdb> 11 atoms in block 107 Block first atom: 1628 Blocpdb> 7 atoms in block 108 Block first atom: 1639 Blocpdb> 19 atoms in block 109 Block first atom: 1646 Blocpdb> 14 atoms in block 110 Block first atom: 1665 Blocpdb> 24 atoms in block 111 Block first atom: 1679 Blocpdb> 7 atoms in block 112 Block first atom: 1703 Blocpdb> 24 atoms in block 113 Block first atom: 1710 Blocpdb> 16 atoms in block 114 Block first atom: 1734 Blocpdb> 16 atoms in block 115 Block first atom: 1750 Blocpdb> 10 atoms in block 116 Block first atom: 1766 Blocpdb> 19 atoms in block 117 Block first atom: 1776 Blocpdb> 19 atoms in block 118 Block first atom: 1795 Blocpdb> 7 atoms in block 119 Block first atom: 1814 Blocpdb> 20 atoms in block 120 Block first atom: 1821 Blocpdb> 7 atoms in block 121 Block first atom: 1841 Blocpdb> 21 atoms in block 122 Block first atom: 1848 Blocpdb> 24 atoms in block 123 Block first atom: 1869 Blocpdb> 19 atoms in block 124 Block first atom: 1893 Blocpdb> 10 atoms in block 125 Block first atom: 1912 Blocpdb> 19 atoms in block 126 Block first atom: 1922 Blocpdb> 17 atoms in block 127 Block first atom: 1941 Blocpdb> 16 atoms in block 128 Block first atom: 1958 Blocpdb> 21 atoms in block 129 Block first atom: 1974 Blocpdb> 17 atoms in block 130 Block first atom: 1995 Blocpdb> 17 atoms in block 131 Block first atom: 2012 Blocpdb> 7 atoms in block 132 Block first atom: 2029 Blocpdb> 19 atoms in block 133 Block first atom: 2036 Blocpdb> 14 atoms in block 134 Block first atom: 2055 Blocpdb> 7 atoms in block 135 Block first atom: 2069 Blocpdb> 20 atoms in block 136 Block first atom: 2076 Blocpdb> 19 atoms in block 137 Block first atom: 2096 Blocpdb> 7 atoms in block 138 Block first atom: 2115 Blocpdb> 17 atoms in block 139 Block first atom: 2122 Blocpdb> 16 atoms in block 140 Block first atom: 2139 Blocpdb> 14 atoms in block 141 Block first atom: 2155 Blocpdb> 24 atoms in block 142 Block first atom: 2169 Blocpdb> 20 atoms in block 143 Block first atom: 2193 Blocpdb> 16 atoms in block 144 Block first atom: 2213 Blocpdb> 16 atoms in block 145 Block first atom: 2229 Blocpdb> 12 atoms in block 146 Block first atom: 2245 Blocpdb> 20 atoms in block 147 Block first atom: 2257 Blocpdb> 17 atoms in block 148 Block first atom: 2277 Blocpdb> 19 atoms in block 149 Block first atom: 2294 Blocpdb> 17 atoms in block 150 Block first atom: 2313 Blocpdb> 17 atoms in block 151 Block first atom: 2330 Blocpdb> 11 atoms in block 152 Block first atom: 2347 Blocpdb> 19 atoms in block 153 Block first atom: 2358 Blocpdb> 10 atoms in block 154 Block first atom: 2377 Blocpdb> 24 atoms in block 155 Block first atom: 2387 Blocpdb> 24 atoms in block 156 Block first atom: 2411 Blocpdb> 19 atoms in block 157 Block first atom: 2435 Blocpdb> 10 atoms in block 158 Block first atom: 2454 Blocpdb> 17 atoms in block 159 Block first atom: 2464 Blocpdb> 24 atoms in block 160 Block first atom: 2481 Blocpdb> 7 atoms in block 161 Block first atom: 2505 Blocpdb> 7 atoms in block 162 Block first atom: 2512 Blocpdb> 24 atoms in block 163 Block first atom: 2519 Blocpdb> 16 atoms in block 164 Block first atom: 2543 Blocpdb> 10 atoms in block 165 Block first atom: 2559 Blocpdb> 10 atoms in block 166 Block first atom: 2569 Blocpdb> 19 atoms in block 167 Block first atom: 2579 Blocpdb> 14 atoms in block 168 Block first atom: 2598 Blocpdb> 19 atoms in block 169 Block first atom: 2612 Blocpdb> 7 atoms in block 170 Block first atom: 2631 Blocpdb> 14 atoms in block 171 Block first atom: 2638 Blocpdb> 7 atoms in block 172 Block first atom: 2652 Blocpdb> 14 atoms in block 173 Block first atom: 2659 Blocpdb> 19 atoms in block 174 Block first atom: 2673 Blocpdb> 19 atoms in block 175 Block first atom: 2692 Blocpdb> 14 atoms in block 176 Block first atom: 2711 Blocpdb> 16 atoms in block 177 Block first atom: 2725 Blocpdb> 19 atoms in block 178 Block first atom: 2741 Blocpdb> 16 atoms in block 179 Block first atom: 2760 Blocpdb> 16 atoms in block 180 Block first atom: 2776 Blocpdb> 19 atoms in block 181 Block first atom: 2792 Blocpdb> 7 atoms in block 182 Block first atom: 2811 Blocpdb> 16 atoms in block 183 Block first atom: 2818 Blocpdb> 16 atoms in block 184 Block first atom: 2834 Blocpdb> 19 atoms in block 185 Block first atom: 2850 Blocpdb> 19 atoms in block 186 Block first atom: 2869 Blocpdb> 7 atoms in block 187 Block first atom: 2888 Blocpdb> 17 atoms in block 188 Block first atom: 2895 Blocpdb> 20 atoms in block 189 Block first atom: 2912 Blocpdb> 16 atoms in block 190 Block first atom: 2932 Blocpdb> 16 atoms in block 191 Block first atom: 2948 Blocpdb> 24 atoms in block 192 Block first atom: 2964 Blocpdb> 24 atoms in block 193 Block first atom: 2988 Blocpdb> 20 atoms in block 194 Block first atom: 3012 Blocpdb> 20 atoms in block 195 Block first atom: 3032 Blocpdb> 22 atoms in block 196 Block first atom: 3052 Blocpdb> 12 atoms in block 197 Block first atom: 3073 Blocpdb> 197 blocks. Blocpdb> At most, 24 atoms in each of them. Blocpdb> At least, 7 atoms in each of them. Blocpdb> Normal end of Blocpdb. Diagrtb> Memory allocation for Prepmat. Diagrtb> Memory allocation for RTB. Diagrtb> Memory allocation for Diagstd. Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes. Prepmat> Entering in. Prepmat> Rewriting of the matrix begins. Prepmat> 2089607 matrix lines read. Prepmat> Matrix order = 9255 Prepmat> Matrix trace = 4602700.0000 Prepmat> Last element read: 9255 9255 343.7204 Prepmat> 19504 lines saved. Prepmat> 16744 empty lines. Prepmat> Number of lines on output is as expected. Prepmat> Normal end of Prepmat. RTB> Entering in. RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 3085 RTB> Total mass = 3085.0000 RTB> Number of atoms found in matrix: 3085 RTB> Number of blocks = 197 RTB> Projection begins. RTB> Projected matrix is being saved. RTB> Projected matrix trace = 527791.0360 RTB> 96369 non-zero elements. RTB> Normal end of RTB. Diagstd> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.sdijb Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb Diagstd> CERFACS matrix format. Diagstd> Projected matrix order = 1182 Diagstd> Nb of non-zero elements: 96369 Diagstd> Projected matrix trace = 527791.0360 Openam> file on opening on unit 11: diagrtb_work.eigenfacs Diagstd> Diagonalization. Diagstd> 1182 eigenvectors are computed. Diagstd> 106 of them to be saved. Diagstd> Sum of eigenvalues = 527791.0360 Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000 Diagstd> Selected eigenvalues: 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.1049111 0.1373654 0.6536681 1.5699495 2.0526879 3.2817753 4.8154577 5.2424226 7.4211084 7.6243031 10.1383314 11.7325823 13.6359430 14.3463324 16.8558285 20.3413305 21.6794340 23.2166400 25.5141565 26.7390155 27.4412080 30.2624719 31.2943796 32.3040679 33.7690159 34.3420697 37.1827235 39.6742733 41.0731453 42.3884792 44.0155348 45.5057146 46.8051349 48.5271115 51.2021368 53.4325846 54.2536976 54.3751877 55.7979018 56.0148541 56.9364250 57.9155106 60.7793014 61.1309201 63.5000500 64.4119702 64.7695668 66.2696914 67.5572615 68.4817693 69.9446983 71.2710816 72.3519510 72.7530252 73.8096202 75.3585495 76.5981425 78.8039770 79.7773933 80.9990356 82.8577233 83.6955067 84.6880441 86.3532043 90.0839670 91.0020549 91.1522323 92.4640955 93.3853021 93.6833224 95.2973640 96.8141005 99.4030997 101.1912150 101.9169937 104.6225566 106.0498148 107.9088843 108.8977663 110.2797718 110.3775402 111.8886008 112.3669396 114.0658994 115.2602020 116.2659934 117.7534515 120.4176343 121.3605808 122.9952286 124.6286018 125.2771476 126.9697730 127.5175962 127.7422925 127.9711092 129.6884978 130.4214883 131.2419224 132.9508719 Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units): 0.0034307 0.0034327 0.0034329 0.0034335 0.0034339 0.0034345 35.1727255 40.2470363 87.7958348 136.0623997 155.5810651 196.7205379 238.2945271 248.6344443 295.8214549 299.8439959 345.7630035 371.9564428 400.9939953 411.3066436 445.8310710 489.7618558 505.6141853 523.2328035 548.5116897 561.5235651 568.8488612 597.3756000 607.4750609 617.1971154 631.0365038 636.3682635 662.1644778 683.9900284 695.9439458 706.9996485 720.4407536 732.5347806 742.9199676 756.4626698 777.0327489 793.7767450 799.8525827 800.7476351 811.1556817 812.7311116 819.3894681 826.4045983 846.5899963 849.0352987 865.3311030 871.5224359 873.9383078 884.0009958 892.5474196 898.6338351 908.1815625 916.7521879 923.6775827 926.2341912 932.9358143 942.6740360 950.3955612 963.9829400 969.9184065 977.3164402 988.4660973 993.4507723 999.3240322 1009.1007036 1030.6685681 1035.9072672 1036.7616749 1044.1955623 1049.3842562 1051.0573713 1060.0728802 1068.4755477 1082.6678583 1092.3622555 1096.2726579 1110.7285740 1118.2791750 1128.0383936 1133.1953039 1140.3632409 1140.8686229 1148.6512823 1151.1039828 1159.7735365 1165.8293065 1170.9049275 1178.3711554 1191.6269749 1196.2834744 1204.3131050 1212.2833535 1215.4335176 1223.6168584 1226.2537232 1227.3336267 1228.4323576 1236.6477457 1240.1375456 1244.0320575 1252.1053616 Diagstd> Normal end. Rtb_to_modes> Entering in. Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 3085 Rtb_to_modes> Number of blocs = 197 Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.eigenfacs Openam> file on opening on unit 11: matrix.eigenrtb Rdmodfacs> Entering in. Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Eigenvector number: 1 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9808E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 2 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9928E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 3 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9938E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 4 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9973E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 5 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9998E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 6 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0003E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 7 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.1049 Rdmodfacs> Eigenvector number: 8 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.1374 Rdmodfacs> Eigenvector number: 9 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.6537 Rdmodfacs> Eigenvector number: 10 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.570 Rdmodfacs> Eigenvector number: 11 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.053 Rdmodfacs> Eigenvector number: 12 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.282 Rdmodfacs> Eigenvector number: 13 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.815 Rdmodfacs> Eigenvector number: 14 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.242 Rdmodfacs> Eigenvector number: 15 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.421 Rdmodfacs> Eigenvector number: 16 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.624 Rdmodfacs> Eigenvector number: 17 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.14 Rdmodfacs> Eigenvector number: 18 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.73 Rdmodfacs> Eigenvector number: 19 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.64 Rdmodfacs> Eigenvector number: 20 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.35 Rdmodfacs> Eigenvector number: 21 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.86 Rdmodfacs> Eigenvector number: 22 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.34 Rdmodfacs> Eigenvector number: 23 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.68 Rdmodfacs> Eigenvector number: 24 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.22 Rdmodfacs> Eigenvector number: 25 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.51 Rdmodfacs> Eigenvector number: 26 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.74 Rdmodfacs> Eigenvector number: 27 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.44 Rdmodfacs> Eigenvector number: 28 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.26 Rdmodfacs> Eigenvector number: 29 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.29 Rdmodfacs> Eigenvector number: 30 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.30 Rdmodfacs> Eigenvector number: 31 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.77 Rdmodfacs> Eigenvector number: 32 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.34 Rdmodfacs> Eigenvector number: 33 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.18 Rdmodfacs> Eigenvector number: 34 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.67 Rdmodfacs> Eigenvector number: 35 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.07 Rdmodfacs> Eigenvector number: 36 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.39 Rdmodfacs> Eigenvector number: 37 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 38 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.51 Rdmodfacs> Eigenvector number: 39 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.81 Rdmodfacs> Eigenvector number: 40 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 48.53 Rdmodfacs> Eigenvector number: 41 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 51.20 Rdmodfacs> Eigenvector number: 42 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 53.43 Rdmodfacs> Eigenvector number: 43 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 54.25 Rdmodfacs> Eigenvector number: 44 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 54.38 Rdmodfacs> Eigenvector number: 45 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 55.80 Rdmodfacs> Eigenvector number: 46 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 56.01 Rdmodfacs> Eigenvector number: 47 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 56.94 Rdmodfacs> Eigenvector number: 48 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 57.92 Rdmodfacs> Eigenvector number: 49 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 60.78 Rdmodfacs> Eigenvector number: 50 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 61.13 Rdmodfacs> Eigenvector number: 51 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 63.50 Rdmodfacs> Eigenvector number: 52 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 64.41 Rdmodfacs> Eigenvector number: 53 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 64.77 Rdmodfacs> Eigenvector number: 54 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 66.27 Rdmodfacs> Eigenvector number: 55 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 67.56 Rdmodfacs> Eigenvector number: 56 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 68.48 Rdmodfacs> Eigenvector number: 57 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 69.94 Rdmodfacs> Eigenvector number: 58 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 71.27 Rdmodfacs> Eigenvector number: 59 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 72.35 Rdmodfacs> Eigenvector number: 60 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 72.75 Rdmodfacs> Eigenvector number: 61 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 73.81 Rdmodfacs> Eigenvector number: 62 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 75.36 Rdmodfacs> Eigenvector number: 63 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 76.60 Rdmodfacs> Eigenvector number: 64 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 78.80 Rdmodfacs> Eigenvector number: 65 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 79.78 Rdmodfacs> Eigenvector number: 66 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 81.00 Rdmodfacs> Eigenvector number: 67 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 82.86 Rdmodfacs> Eigenvector number: 68 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 83.70 Rdmodfacs> Eigenvector number: 69 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 84.69 Rdmodfacs> Eigenvector number: 70 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 86.35 Rdmodfacs> Eigenvector number: 71 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 90.08 Rdmodfacs> Eigenvector number: 72 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 91.00 Rdmodfacs> Eigenvector number: 73 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 91.15 Rdmodfacs> Eigenvector number: 74 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 92.46 Rdmodfacs> Eigenvector number: 75 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 93.39 Rdmodfacs> Eigenvector number: 76 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 93.68 Rdmodfacs> Eigenvector number: 77 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 95.30 Rdmodfacs> Eigenvector number: 78 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 96.81 Rdmodfacs> Eigenvector number: 79 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 99.40 Rdmodfacs> Eigenvector number: 80 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 101.2 Rdmodfacs> Eigenvector number: 81 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 101.9 Rdmodfacs> Eigenvector number: 82 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 104.6 Rdmodfacs> Eigenvector number: 83 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 106.0 Rdmodfacs> Eigenvector number: 84 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 107.9 Rdmodfacs> Eigenvector number: 85 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 108.9 Rdmodfacs> Eigenvector number: 86 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 110.3 Rdmodfacs> Eigenvector number: 87 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 110.4 Rdmodfacs> Eigenvector number: 88 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 111.9 Rdmodfacs> Eigenvector number: 89 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 112.4 Rdmodfacs> Eigenvector number: 90 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 114.1 Rdmodfacs> Eigenvector number: 91 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 115.3 Rdmodfacs> Eigenvector number: 92 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 116.3 Rdmodfacs> Eigenvector number: 93 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 117.8 Rdmodfacs> Eigenvector number: 94 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 120.4 Rdmodfacs> Eigenvector number: 95 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 121.4 Rdmodfacs> Eigenvector number: 96 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 123.0 Rdmodfacs> Eigenvector number: 97 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 124.6 Rdmodfacs> Eigenvector number: 98 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 125.3 Rdmodfacs> Eigenvector number: 99 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 127.0 Rdmodfacs> Eigenvector number: 100 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 127.5 Rdmodfacs> Eigenvector number: 101 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 127.7 Rdmodfacs> Eigenvector number: 102 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 128.0 Rdmodfacs> Eigenvector number: 103 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 129.7 Rdmodfacs> Eigenvector number: 104 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 130.4 Rdmodfacs> Eigenvector number: 105 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 131.2 Rdmodfacs> Eigenvector number: 106 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 133.0 Rtb_to_modes> 106 vectors, with 1182 coordinates in vector file. Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected): 1.00000 1.00000 0.99999 0.99998 1.00001 0.99998 1.00001 1.00000 1.00001 0.99996 0.99999 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00001 0.99998 0.99998 0.99999 1.00000 1.00000 1.00001 0.99998 1.00000 0.99995 0.99998 1.00002 0.99999 0.99999 0.99998 1.00000 1.00003 0.99998 0.99998 1.00000 1.00002 0.99997 1.00005 1.00000 0.99999 0.99999 1.00001 1.00000 1.00000 1.00003 0.99996 1.00003 1.00001 0.99998 1.00000 1.00001 1.00003 1.00003 1.00001 0.99999 1.00000 0.99999 1.00000 1.00002 0.99999 1.00000 1.00001 0.99999 1.00000 0.99999 1.00001 1.00001 0.99999 1.00000 1.00000 0.99999 1.00001 1.00000 0.99998 1.00001 1.00000 0.99997 0.99999 1.00000 0.99997 1.00003 1.00002 0.99998 1.00002 0.99999 1.00001 1.00000 0.99999 1.00000 1.00000 0.99998 0.99998 1.00002 0.99999 1.00000 1.00001 1.00000 1.00001 1.00002 1.00000 1.00001 1.00004 1.00003 1.00000 0.99999 0.99999 Rtb_to_modes> RTB block-file is being read. Rtb_to_modes> 55530 lines found in RTB file. Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected): 1.00000 1.00000 0.99999 0.99998 1.00001 0.99998 1.00001 1.00000 1.00001 0.99996 0.99999 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00001 0.99998 0.99998 0.99999 1.00000 1.00000 1.00001 0.99998 1.00000 0.99995 0.99998 1.00002 0.99999 0.99999 0.99998 1.00000 1.00003 0.99998 0.99998 1.00000 1.00002 0.99997 1.00005 1.00000 0.99999 0.99999 1.00001 1.00000 1.00000 1.00003 0.99996 1.00003 1.00001 0.99998 1.00000 1.00001 1.00003 1.00003 1.00001 0.99999 1.00000 0.99999 1.00000 1.00002 0.99999 1.00000 1.00001 0.99999 1.00000 0.99999 1.00001 1.00001 0.99999 1.00000 1.00000 0.99999 1.00001 1.00000 0.99998 1.00001 1.00000 0.99997 0.99999 1.00000 0.99997 1.00003 1.00002 0.99998 1.00002 0.99999 1.00001 1.00000 0.99999 1.00000 1.00000 0.99998 0.99998 1.00002 0.99999 1.00000 1.00001 1.00000 1.00001 1.00002 1.00000 1.00001 1.00004 1.00003 1.00000 0.99999 0.99999 Orthogonality of first eigenvectors (zero expected): Vector 2: 0.000 Vector 3: 0.000 0.000 Vector 4:-0.000 0.000 0.000 Vector 5:-0.000 0.000 0.000-0.000 Vector 6:-0.000-0.000-0.000-0.000-0.000 Vector 7: 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000-0.000 Vector 8:-0.000-0.000-0.000 0.000 0.000 0.000-0.000 Vector 9: 0.000 0.000-0.000 0.000-0.000 0.000 0.000-0.000 Vector 10:-0.000 0.000 0.000-0.000 0.000 0.000-0.000-0.000 0.000 Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved. Rtb_to_modes> Normal end. Diagrtb> Normal end. B-factor analysis Bfactors> Version 1.22, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 2602240924421291259.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 2602240924421291259.eigenfacs Getnam> Corresponding pdb filename ? Getnam> 2602240924421291259.atom Openam> file on opening on unit 11: 2602240924421291259.atom Getnum> Number of skipped eigenvectors ? Getnum> 0 Getnum> Number of usefull eigenvectors ? Getnum> 10000 %Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 197 First residue number = 1 Last residue number = 197 Number of atoms found = 3085 Mean number per residue = 15.7 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9808E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9928E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9938E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9973E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9998E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0003E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.1049 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.1374 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.6537 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.570 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.053 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.282 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.815 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.242 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.421 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.624 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.14 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.73 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.64 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.35 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.86 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.34 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.68 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.22 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.51 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.74 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.44 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.26 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.29 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.30 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.77 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.34 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.18 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.67 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.07 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.39 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.51 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.81 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.53 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 51.20 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 53.43 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 54.25 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 54.38 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 55.80 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 56.01 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 56.94 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 57.92 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 60.78 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 61.13 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 63.50 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 64.41 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 64.77 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 66.27 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 67.56 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 68.48 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 69.94 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 71.27 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 72.35 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 72.75 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 73.81 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 75.36 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 76.60 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 78.80 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 79.78 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 81.00 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 82.86 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 83.70 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 84.69 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 86.35 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 90.08 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 91.00 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 91.15 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 92.46 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 93.39 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 93.68 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 95.30 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 96.81 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 99.40 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 101.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 101.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 104.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 106.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 107.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 108.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 110.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 110.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 111.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 112.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 114.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 115.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 116.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 117.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 120.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 121.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 123.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 124.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 125.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 127.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 127.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 127.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 128.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 129.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 130.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 131.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 133.0 Bfactors> 106 vectors, 9255 coordinates in file. Openam> file on opening on unit 12: bfactors.pred Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000 Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 0.104900 Bfactors> 100 eigenvectors will be considered. Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped. Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed. (CHARMM units assumed for eigenvalues) %Bfactors-Wn> Experimental B-factors are nearly constant ! Bfactors> = 0.098 +/- 0.17 Bfactors> = 0.000 +/- 0.00 Bfactors> Shiftng-fct= -0.098 Bfactors> Scaling-fct= 0.000 Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved. Bfactors> Normal end. check_modes Chkmod> Version 1.00, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 2602240924421291259.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 2602240924421291259.eigenfacs Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4305E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4326E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4327E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4333E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4338E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4343E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 35.17 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 40.25 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 87.79 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 136.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 155.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 196.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 238.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 248.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 295.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 299.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 345.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 371.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 401.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 411.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 445.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 489.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 505.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 523.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 548.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 561.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 568.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 597.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 607.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 617.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 631.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 636.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 662.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 683.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 695.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 707.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 720.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 732.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 742.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 756.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 777.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 793.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 799.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 800.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 811.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 812.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 819.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 826.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 846.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 849.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 865.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 871.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 873.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 884.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 892.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 898.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 908.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 916.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 923.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 926.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 932.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 942.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 950.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 963.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 969.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 977.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 988.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 993.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 999.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1009. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1031. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1036. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1037. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1044. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1049. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1051. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1060. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1068. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1083. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1092. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1096. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1111. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1118. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1128. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1133. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1140. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1141. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1149. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1151. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1160. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1166. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1171. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1179. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1191. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1196. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1204. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1212. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1215. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1224. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1226. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1227. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1229. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1237. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1240. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1244. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1252. Chkmod> 106 vectors, 9255 coordinates in file. Chkmod> That is: 3085 cartesian points. Openam> file on opening on unit 11: Chkmod.res Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file. %Chkmod-Wn> Norm of vector 25 is: 0.9999 (instead of 1.0000). %Chkmod-Wn> Norm of vector 38 is: 1.0001 (instead of 1.0000). Chkmod> Normal end. 0.0034 0.9417 0.0034 0.9824 0.0034 0.6593 0.0034 0.7473 0.0034 0.7248 0.0034 0.6057 35.1694 0.4486 40.2504 0.4817 87.7942 0.0988 136.0587 0.1943 155.5862 0.1969 196.7188 0.0312 238.2730 0.0170 248.6138 0.2755 295.8066 0.0200 299.8252 0.1142 345.7766 0.1394 371.8995 0.3011 401.0364 0.3180 411.3416 0.1650 445.8671 0.1045 489.7248 0.2088 505.5991 0.2962 523.2482 0.0606 548.4435 0.1357 561.5098 0.4320 568.8119 0.1026 597.3256 0.3722 607.4065 0.4615 617.1318 0.2604 631.0186 0.0586 636.3218 0.0212 662.1118 0.2160 683.9238 0.3428 695.8874 0.2157 706.9820 0.4523 720.4464 0.4997 732.5378 0.1975 742.9267 0.2497 756.4527 0.3880 776.9832 0.5857 793.7235 0.2331 799.7910 0.2315 800.7487 0.2639 811.1361 0.1210 812.6610 0.2674 819.3800 0.1909 826.4012 0.2224 846.5585 0.4777 848.9925 0.3291 865.2936 0.2575 871.4717 0.1511 873.9037 0.2985 883.9651 0.0992 892.5272 0.3067 898.5837 0.2550 908.1121 0.4085 916.7059 0.2561 923.6255 0.2001 926.1752 0.1980 932.8982 0.1153 942.6426 0.2179 950.3663 0.3704 963.9172 0.3148 969.8926 0.2966 977.2803 0.4662 988.4372 0.3093 993.4348 0.3139 999.2927 0.2286 1009.0387 0.3057 1030.6016 0.2211 1035.8511 0.2388 1036.7045 0.2236 1044.1276 0.2084 1049.3656 0.3178 1050.9936 0.2982 1060.0420 0.1925 1068.4071 0.3849 1082.6045 0.3200 1092.3628 0.2888 1096.1342 0.3421 1110.5612 0.2573 1117.9685 0.3340 1127.9435 0.2186 1133.1583 0.2739 1140.4189 0.3425 1140.9357 0.5053 1148.6605 0.3554 1151.2239 0.3901 1159.8971 0.3560 1165.9805 0.1441 1171.0259 0.2920 1178.5534 0.1652 1191.4886 0.3912 1196.4264 0.4554 1204.2848 0.3712 1212.0922 0.3770 1215.4922 0.2026 1223.7100 0.2716 1226.1165 0.1622 1227.0778 0.2250 1228.5183 0.1989 1236.6495 0.2531 1239.9821 0.3269 1243.7800 0.2493 1252.2829 0.4307 getting mode 7 running: ../../bin/get_modes.sh 2602240924421291259 7 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 7 calculating perturbed structure for DQ=-100 2602240924421291259.eigenfacs 2602240924421291259.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2602240924421291259.eigenfacs 2602240924421291259.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2602240924421291259.eigenfacs 2602240924421291259.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2602240924421291259.eigenfacs 2602240924421291259.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2602240924421291259.eigenfacs 2602240924421291259.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2602240924421291259.eigenfacs 2602240924421291259.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2602240924421291259.eigenfacs 2602240924421291259.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2602240924421291259.eigenfacs 2602240924421291259.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2602240924421291259.eigenfacs 2602240924421291259.atom calculating perturbed structure for DQ=80 2602240924421291259.eigenfacs 2602240924421291259.atom calculating perturbed structure for DQ=100 2602240924421291259.eigenfacs 2602240924421291259.atom making animated gifs 11 models are in 2602240924421291259.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2602240924421291259.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2602240924421291259.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 8 running: ../../bin/get_modes.sh 2602240924421291259 8 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 8 calculating perturbed structure for DQ=-100 2602240924421291259.eigenfacs 2602240924421291259.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2602240924421291259.eigenfacs 2602240924421291259.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2602240924421291259.eigenfacs 2602240924421291259.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2602240924421291259.eigenfacs 2602240924421291259.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2602240924421291259.eigenfacs 2602240924421291259.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2602240924421291259.eigenfacs 2602240924421291259.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2602240924421291259.eigenfacs 2602240924421291259.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2602240924421291259.eigenfacs 2602240924421291259.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2602240924421291259.eigenfacs 2602240924421291259.atom calculating perturbed structure for DQ=80 2602240924421291259.eigenfacs 2602240924421291259.atom calculating perturbed structure for DQ=100 2602240924421291259.eigenfacs 2602240924421291259.atom making animated gifs 11 models are in 2602240924421291259.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2602240924421291259.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2602240924421291259.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 9 running: ../../bin/get_modes.sh 2602240924421291259 9 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 9 calculating perturbed structure for DQ=-100 2602240924421291259.eigenfacs 2602240924421291259.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2602240924421291259.eigenfacs 2602240924421291259.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2602240924421291259.eigenfacs 2602240924421291259.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2602240924421291259.eigenfacs 2602240924421291259.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2602240924421291259.eigenfacs 2602240924421291259.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2602240924421291259.eigenfacs 2602240924421291259.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2602240924421291259.eigenfacs 2602240924421291259.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2602240924421291259.eigenfacs 2602240924421291259.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2602240924421291259.eigenfacs 2602240924421291259.atom calculating perturbed structure for DQ=80 2602240924421291259.eigenfacs 2602240924421291259.atom calculating perturbed structure for DQ=100 2602240924421291259.eigenfacs 2602240924421291259.atom making animated gifs 11 models are in 2602240924421291259.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2602240924421291259.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2602240924421291259.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 10 running: ../../bin/get_modes.sh 2602240924421291259 10 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 10 calculating perturbed structure for DQ=-100 2602240924421291259.eigenfacs 2602240924421291259.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2602240924421291259.eigenfacs 2602240924421291259.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2602240924421291259.eigenfacs 2602240924421291259.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2602240924421291259.eigenfacs 2602240924421291259.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2602240924421291259.eigenfacs 2602240924421291259.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2602240924421291259.eigenfacs 2602240924421291259.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2602240924421291259.eigenfacs 2602240924421291259.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2602240924421291259.eigenfacs 2602240924421291259.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2602240924421291259.eigenfacs 2602240924421291259.atom calculating perturbed structure for DQ=80 2602240924421291259.eigenfacs 2602240924421291259.atom calculating perturbed structure for DQ=100 2602240924421291259.eigenfacs 2602240924421291259.atom making animated gifs 11 models are in 2602240924421291259.10.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2602240924421291259.10.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2602240924421291259.10.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 11 running: ../../bin/get_modes.sh 2602240924421291259 11 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 11 calculating perturbed structure for DQ=-100 2602240924421291259.eigenfacs 2602240924421291259.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2602240924421291259.eigenfacs 2602240924421291259.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2602240924421291259.eigenfacs 2602240924421291259.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2602240924421291259.eigenfacs 2602240924421291259.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2602240924421291259.eigenfacs 2602240924421291259.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2602240924421291259.eigenfacs 2602240924421291259.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2602240924421291259.eigenfacs 2602240924421291259.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2602240924421291259.eigenfacs 2602240924421291259.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2602240924421291259.eigenfacs 2602240924421291259.atom calculating perturbed structure for DQ=80 2602240924421291259.eigenfacs 2602240924421291259.atom calculating perturbed structure for DQ=100 2602240924421291259.eigenfacs 2602240924421291259.atom making animated gifs 11 models are in 2602240924421291259.11.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2602240924421291259.11.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2602240924421291259.11.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 2602240924421291259.10.pdb 2602240924421291259.11.pdb 2602240924421291259.7.pdb 2602240924421291259.8.pdb 2602240924421291259.9.pdb STDERR: Note: The following floating-point exceptions are signalling: IEEE_DENORMAL real 0m26.157s user 0m25.973s sys 0m0.169s rm: cannot remove '2602240924421291259.sdijf': No such file or directory pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format




If you find results from this site helpful for your research, please cite one of our papers:

elNémo is maintained by Yves-Henri Sanejouand.
It was developed by Karsten Suhre.
Between 2003 and 2014, it was hosted by IGS (Marseille).
Between 2015 and 2025, it was hosted by US2B (Nantes).
Last modification: december 26th, 2025.