*** ***
Output from eigenvector calculation:
STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8)
Build Tirion matrix:
Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model.
Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004.
Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file.
Pdbmat> Coordinate filename = 2602241516421496742.atom
Pdbmat> Distance cutoff = 8.00
Force constant = 10.00
Origin of mass values = CONS
Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09
PRINTing level = 2
Pdbmat> Coordinate file 2602241516421496742.atom to be opened.
Openam> File opened: 2602241516421496742.atom
Pdbmat> Coordinate file in PDB format.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 285
First residue number = 69
Last residue number = 400
Number of atoms found = 4640
Mean number per residue = 16.3
Pdbmat> Coordinate statistics:
= 24.771025 +/- 15.662100 From: -4.874000 To: 59.849000
= 0.790525 +/- 8.347071 From: -19.176000 To: 21.247000
= 61.666162 +/- 10.063946 From: 42.331000 To: 88.351000
Pdbmat> Masses are all set to one.
%Pdbmat-W> residue:'UNL ' is not a well known amino-acid.
%Pdbmat-W> 1 residue(s) not known.
Openam> File opened: pdbmat.xyzm
Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved.
Openam> File opened: pdbmat.sdijb
Pdbmat> Matrix statistics:
Pdbmat> The matrix is 3.3626 % Filled.
Pdbmat> 3257984 non-zero elements.
Pdbmat> 358961 atom-atom interactions.
Pdbmat> Number per atom= 154.72 +/- 46.13
Maximum number = 246
Minimum number = 25
Pdbmat> Matrix trace = 7.179220E+06
Pdbmat> Larger element = 931.708
Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10
Pdbmat> Normal end.
automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1)
285 non-zero elements, NRBL set to 2
Diagonalize Tirion matrix using diagrtb
Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation.
Diagrtb> Version 2.52, November 2004.
Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file.
Diagrtb> Options taken into account:
MATRix filename = pdbmat.sdijb
COORdinates filename = 2602241516421496742.atom
Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb
Nb of VECTors required = 106
EigeNVALues chosen = LOWE
Type of SUBStructuring = NONE
Nb of residues per BLOck = 2
Origin of MASS values = CONS
MATRix FORMat = BINA
Temporary files cleaning = ALL
Output PRINting level = 2
Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb.
Blocpdb> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.xyzm
Blocpdb> Coordinate file 2602241516421496742.atom to be opened.
Openam> file on opening on unit 11:
2602241516421496742.atom
Blocpdb> Coordinate file in PDB format.
Blocpdb> 4640 atoms picked in pdb file.
Blocpdb> All masses set to unity.
Blocpdb> Coordinate file is rewritten.
Blocpdb> Substructuring:
Blocpdb> 2 residue(s) per block.
Blocpdb> 285 residues.
Blocpdb> 31 atoms in block 1
Block first atom: 1
Blocpdb> 36 atoms in block 2
Block first atom: 32
Blocpdb> 37 atoms in block 3
Block first atom: 68
Blocpdb> 38 atoms in block 4
Block first atom: 105
Blocpdb> 21 atoms in block 5
Block first atom: 143
Blocpdb> 38 atoms in block 6
Block first atom: 164
Blocpdb> 24 atoms in block 7
Block first atom: 202
Blocpdb> 32 atoms in block 8
Block first atom: 226
Blocpdb> 38 atoms in block 9
Block first atom: 258
Blocpdb> 33 atoms in block 10
Block first atom: 296
Blocpdb> 29 atoms in block 11
Block first atom: 329
Blocpdb> 21 atoms in block 12
Block first atom: 358
Blocpdb> 38 atoms in block 13
Block first atom: 379
Blocpdb> 35 atoms in block 14
Block first atom: 417
Blocpdb> 27 atoms in block 15
Block first atom: 452
Blocpdb> 27 atoms in block 16
Block first atom: 479
Blocpdb> 34 atoms in block 17
Block first atom: 506
Blocpdb> 44 atoms in block 18
Block first atom: 540
Blocpdb> 36 atoms in block 19
Block first atom: 584
Blocpdb> 24 atoms in block 20
Block first atom: 620
Blocpdb> 28 atoms in block 21
Block first atom: 644
Blocpdb> 41 atoms in block 22
Block first atom: 672
Blocpdb> 36 atoms in block 23
Block first atom: 713
Blocpdb> 30 atoms in block 24
Block first atom: 749
Blocpdb> 29 atoms in block 25
Block first atom: 779
Blocpdb> 22 atoms in block 26
Block first atom: 808
Blocpdb> 36 atoms in block 27
Block first atom: 830
Blocpdb> 26 atoms in block 28
Block first atom: 866
Blocpdb> 39 atoms in block 29
Block first atom: 892
Blocpdb> 33 atoms in block 30
Block first atom: 931
Blocpdb> 30 atoms in block 31
Block first atom: 964
Blocpdb> 28 atoms in block 32
Block first atom: 994
Blocpdb> 33 atoms in block 33
Block first atom: 1022
Blocpdb> 38 atoms in block 34
Block first atom: 1055
Blocpdb> 28 atoms in block 35
Block first atom: 1093
Blocpdb> 45 atoms in block 36
Block first atom: 1121
Blocpdb> 38 atoms in block 37
Block first atom: 1166
Blocpdb> 33 atoms in block 38
Block first atom: 1204
Blocpdb> 33 atoms in block 39
Block first atom: 1237
Blocpdb> 29 atoms in block 40
Block first atom: 1270
Blocpdb> 26 atoms in block 41
Block first atom: 1299
Blocpdb> 43 atoms in block 42
Block first atom: 1325
Blocpdb> 40 atoms in block 43
Block first atom: 1368
Blocpdb> 28 atoms in block 44
Block first atom: 1408
Blocpdb> 39 atoms in block 45
Block first atom: 1436
Blocpdb> 25 atoms in block 46
Block first atom: 1475
Blocpdb> 32 atoms in block 47
Block first atom: 1500
Blocpdb> 43 atoms in block 48
Block first atom: 1532
Blocpdb> 36 atoms in block 49
Block first atom: 1575
Blocpdb> 21 atoms in block 50
Block first atom: 1611
Blocpdb> 30 atoms in block 51
Block first atom: 1632
Blocpdb> 31 atoms in block 52
Block first atom: 1662
Blocpdb> 45 atoms in block 53
Block first atom: 1693
Blocpdb> 26 atoms in block 54
Block first atom: 1738
Blocpdb> 36 atoms in block 55
Block first atom: 1764
Blocpdb> 28 atoms in block 56
Block first atom: 1800
Blocpdb> 37 atoms in block 57
Block first atom: 1828
Blocpdb> 28 atoms in block 58
Block first atom: 1865
Blocpdb> 44 atoms in block 59
Block first atom: 1893
Blocpdb> 25 atoms in block 60
Block first atom: 1937
Blocpdb> 38 atoms in block 61
Block first atom: 1962
Blocpdb> 32 atoms in block 62
Block first atom: 2000
Blocpdb> 39 atoms in block 63
Block first atom: 2032
Blocpdb> 41 atoms in block 64
Block first atom: 2071
Blocpdb> 29 atoms in block 65
Block first atom: 2112
Blocpdb> 40 atoms in block 66
Block first atom: 2141
Blocpdb> 33 atoms in block 67
Block first atom: 2181
Blocpdb> 27 atoms in block 68
Block first atom: 2214
Blocpdb> 26 atoms in block 69
Block first atom: 2241
Blocpdb> 28 atoms in block 70
Block first atom: 2267
Blocpdb> 33 atoms in block 71
Block first atom: 2295
Blocpdb> 30 atoms in block 72
Block first atom: 2328
Blocpdb> 27 atoms in block 73
Block first atom: 2358
Blocpdb> 36 atoms in block 74
Block first atom: 2385
Blocpdb> 24 atoms in block 75
Block first atom: 2421
Blocpdb> 33 atoms in block 76
Block first atom: 2445
Blocpdb> 36 atoms in block 77
Block first atom: 2478
Blocpdb> 37 atoms in block 78
Block first atom: 2514
Blocpdb> 18 atoms in block 79
Block first atom: 2551
Blocpdb> 29 atoms in block 80
Block first atom: 2569
Blocpdb> 29 atoms in block 81
Block first atom: 2598
Blocpdb> 24 atoms in block 82
Block first atom: 2627
Blocpdb> 34 atoms in block 83
Block first atom: 2651
Blocpdb> 35 atoms in block 84
Block first atom: 2685
Blocpdb> 26 atoms in block 85
Block first atom: 2720
Blocpdb> 31 atoms in block 86
Block first atom: 2746
Blocpdb> 27 atoms in block 87
Block first atom: 2777
Blocpdb> 40 atoms in block 88
Block first atom: 2804
Blocpdb> 33 atoms in block 89
Block first atom: 2844
Blocpdb> 33 atoms in block 90
Block first atom: 2877
Blocpdb> 36 atoms in block 91
Block first atom: 2910
Blocpdb> 35 atoms in block 92
Block first atom: 2946
Blocpdb> 35 atoms in block 93
Block first atom: 2981
Blocpdb> 39 atoms in block 94
Block first atom: 3016
Blocpdb> 33 atoms in block 95
Block first atom: 3055
Blocpdb> 33 atoms in block 96
Block first atom: 3088
Blocpdb> 36 atoms in block 97
Block first atom: 3121
Blocpdb> 37 atoms in block 98
Block first atom: 3157
Blocpdb> 10 atoms in block 99
Block first atom: 3194
Blocpdb> 28 atoms in block 100
Block first atom: 3204
Blocpdb> 30 atoms in block 101
Block first atom: 3232
Blocpdb> 29 atoms in block 102
Block first atom: 3262
Blocpdb> 39 atoms in block 103
Block first atom: 3291
Blocpdb> 21 atoms in block 104
Block first atom: 3330
Blocpdb> 38 atoms in block 105
Block first atom: 3351
Blocpdb> 26 atoms in block 106
Block first atom: 3389
Blocpdb> 35 atoms in block 107
Block first atom: 3415
Blocpdb> 40 atoms in block 108
Block first atom: 3450
Blocpdb> 39 atoms in block 109
Block first atom: 3490
Blocpdb> 32 atoms in block 110
Block first atom: 3529
Blocpdb> 41 atoms in block 111
Block first atom: 3561
Blocpdb> 25 atoms in block 112
Block first atom: 3602
Blocpdb> 40 atoms in block 113
Block first atom: 3627
Blocpdb> 33 atoms in block 114
Block first atom: 3667
Blocpdb> 33 atoms in block 115
Block first atom: 3700
Blocpdb> 27 atoms in block 116
Block first atom: 3733
Blocpdb> 35 atoms in block 117
Block first atom: 3760
Blocpdb> 32 atoms in block 118
Block first atom: 3795
Blocpdb> 26 atoms in block 119
Block first atom: 3827
Blocpdb> 24 atoms in block 120
Block first atom: 3853
Blocpdb> 27 atoms in block 121
Block first atom: 3877
Blocpdb> 35 atoms in block 122
Block first atom: 3904
Blocpdb> 17 atoms in block 123
Block first atom: 3939
Blocpdb> 38 atoms in block 124
Block first atom: 3956
Blocpdb> 30 atoms in block 125
Block first atom: 3994
Blocpdb> 36 atoms in block 126
Block first atom: 4024
Blocpdb> 43 atoms in block 127
Block first atom: 4060
Blocpdb> 28 atoms in block 128
Block first atom: 4103
Blocpdb> 30 atoms in block 129
Block first atom: 4131
Blocpdb> 21 atoms in block 130
Block first atom: 4161
Blocpdb> 30 atoms in block 131
Block first atom: 4182
Blocpdb> 33 atoms in block 132
Block first atom: 4212
Blocpdb> 37 atoms in block 133
Block first atom: 4245
Blocpdb> 33 atoms in block 134
Block first atom: 4282
Blocpdb> 34 atoms in block 135
Block first atom: 4315
Blocpdb> 36 atoms in block 136
Block first atom: 4349
Blocpdb> 45 atoms in block 137
Block first atom: 4385
Blocpdb> 21 atoms in block 138
Block first atom: 4430
Blocpdb> 31 atoms in block 139
Block first atom: 4451
Blocpdb> 45 atoms in block 140
Block first atom: 4482
Blocpdb> 36 atoms in block 141
Block first atom: 4527
Blocpdb> 28 atoms in block 142
Block first atom: 4563
Blocpdb> 50 atoms in block 143
Block first atom: 4590
Blocpdb> 143 blocks.
Blocpdb> At most, 50 atoms in each of them.
Blocpdb> At least, 10 atoms in each of them.
Blocpdb> Normal end of Blocpdb.
Diagrtb> Memory allocation for Prepmat.
Diagrtb> Memory allocation for RTB.
Diagrtb> Memory allocation for Diagstd.
Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes.
Prepmat> Entering in.
Prepmat> Rewriting of the matrix begins.
Prepmat> 3258127 matrix lines read.
Prepmat> Matrix order = 13920
Prepmat> Matrix trace = 7179220.0000
Prepmat> Last element read: 13920 13920 466.1910
Prepmat> 10297 lines saved.
Prepmat> 8619 empty lines.
Prepmat> Number of lines on output is as expected.
Prepmat> Normal end of Prepmat.
RTB> Entering in.
RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 4640
RTB> Total mass = 4640.0000
RTB> Number of atoms found in matrix: 4640
RTB> Number of blocks = 143
RTB> Projection begins.
RTB> Projected matrix is being saved.
RTB> Projected matrix trace = 371115.6550
RTB> 58227 non-zero elements.
RTB> Normal end of RTB.
Diagstd> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.sdijb
Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb
Diagstd> CERFACS matrix format.
Diagstd> Projected matrix order = 858
Diagstd> Nb of non-zero elements: 58227
Diagstd> Projected matrix trace = 371115.6550
Openam> file on opening on unit 11:
diagrtb_work.eigenfacs
Diagstd> Diagonalization.
Diagstd> 858 eigenvectors are computed.
Diagstd> 106 of them to be saved.
Diagstd> Sum of eigenvalues = 371115.6550
Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000
Diagstd> Selected eigenvalues:
0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000
0.0000000 3.2798635 4.3649646 5.4402695 6.5997953
8.1642026 10.1372793 10.5899730 12.8091168 15.1511921
15.7878780 16.2352045 17.1451141 19.0276276 20.4989628
21.2136212 22.4822171 23.8843787 26.4629309 28.4202864
29.3132393 30.5873090 31.4374975 33.7327487 36.4220119
36.9991232 39.1857807 41.9527956 42.6204846 44.0243233
45.9055636 47.2579145 49.2279606 49.9040377 50.3716727
51.9449771 53.2137242 54.4986690 55.6654394 57.5664200
58.5327173 60.3532935 60.6352493 62.0094355 63.5056903
64.2924314 66.9889106 67.5060140 68.3150243 70.3436703
71.0534544 72.4902397 76.3494441 77.6439759 78.8932019
80.7172965 80.9894888 82.7067410 84.9022057 87.8009115
89.8983621 90.3431176 91.6203266 92.9754781 94.0271519
95.7016726 96.1744359 97.4914230 98.9263032 100.4238552
102.2377827 103.0420399 105.2831732 106.1017826 107.5120855
107.7166506 109.4397321 110.2895304 113.9230283 115.1355616
115.8755684 116.4303908 118.1091648 118.7999398 121.0745254
122.4920027 123.0343842 124.9844337 125.5600988 126.9473511
128.7903014 129.4737000 132.3818772 132.5544453 134.0821422
137.0321816 137.9843982 138.5502211 139.5311117 141.4809871
142.7272494
Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units):
0.0034312 0.0034313 0.0034321 0.0034344 0.0034347
0.0034359 196.6632285 226.8744772 253.2826760 278.9719348
310.2788455 345.7450630 353.3806019 388.6465997 422.6867972
431.4765133 437.5464478 449.6405495 473.6827848 491.6558643
500.1527774 514.8904644 530.7038698 558.6171329 578.9079393
587.9321199 600.5731546 608.8625530 630.6975529 655.3559496
660.5276416 679.7661460 703.3568690 708.9318233 720.5126743
735.7460549 746.5047175 761.9056642 767.1196775 770.7055145
782.6490453 792.1494177 801.6563338 810.1922804 823.9102220
830.7964333 843.6178638 845.5861558 855.1143000 865.3695328
870.7133544 888.7850437 892.2088214 897.5391349 910.7680616
915.3514604 924.5598890 948.8514377 956.8616816 964.5285147
975.6152582 977.2588434 987.5651010 1000.5867944 1017.5243069
1029.6062491 1032.1500000 1039.4203086 1047.0790987 1052.9843607
1062.3192328 1064.9399125 1072.2066216 1080.0681770 1088.2125373
1097.9965898 1102.3068446 1114.2297839 1118.5531378 1125.9624915
1127.0331769 1136.0116650 1140.4136949 1159.0469825 1165.1987825
1168.9373059 1171.7324510 1180.1496432 1183.5957321 1194.8727804
1201.8469009 1204.5047868 1214.0127382 1216.8053335 1223.5088131
1232.3579185 1235.6232166 1249.4231481 1250.2372335 1257.4211188
1271.1785803 1275.5875510 1278.2002313 1282.7168727 1291.6484313
1297.3248241
Diagstd> Normal end.
Rtb_to_modes> Entering in.
Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 4640
Rtb_to_modes> Number of blocs = 143
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 11:
matrix.eigenrtb
Rdmodfacs> Entering in.
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Eigenvector number: 1
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9838E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 2
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9848E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 3
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9891E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 4
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0003E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 5
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0005E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 6
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0012E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 7
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.280
Rdmodfacs> Eigenvector number: 8
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.365
Rdmodfacs> Eigenvector number: 9
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.440
Rdmodfacs> Eigenvector number: 10
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.600
Rdmodfacs> Eigenvector number: 11
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.164
Rdmodfacs> Eigenvector number: 12
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.14
Rdmodfacs> Eigenvector number: 13
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.59
Rdmodfacs> Eigenvector number: 14
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.81
Rdmodfacs> Eigenvector number: 15
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.15
Rdmodfacs> Eigenvector number: 16
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.79
Rdmodfacs> Eigenvector number: 17
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.24
Rdmodfacs> Eigenvector number: 18
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.15
Rdmodfacs> Eigenvector number: 19
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.03
Rdmodfacs> Eigenvector number: 20
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.50
Rdmodfacs> Eigenvector number: 21
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.21
Rdmodfacs> Eigenvector number: 22
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.48
Rdmodfacs> Eigenvector number: 23
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.88
Rdmodfacs> Eigenvector number: 24
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.46
Rdmodfacs> Eigenvector number: 25
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.42
Rdmodfacs> Eigenvector number: 26
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.31
Rdmodfacs> Eigenvector number: 27
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.59
Rdmodfacs> Eigenvector number: 28
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.44
Rdmodfacs> Eigenvector number: 29
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.73
Rdmodfacs> Eigenvector number: 30
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.42
Rdmodfacs> Eigenvector number: 31
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.00
Rdmodfacs> Eigenvector number: 32
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.19
Rdmodfacs> Eigenvector number: 33
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.95
Rdmodfacs> Eigenvector number: 34
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.62
Rdmodfacs> Eigenvector number: 35
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.02
Rdmodfacs> Eigenvector number: 36
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.91
Rdmodfacs> Eigenvector number: 37
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 47.26
Rdmodfacs> Eigenvector number: 38
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 49.23
Rdmodfacs> Eigenvector number: 39
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 49.90
Rdmodfacs> Eigenvector number: 40
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 50.37
Rdmodfacs> Eigenvector number: 41
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 51.94
Rdmodfacs> Eigenvector number: 42
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 53.21
Rdmodfacs> Eigenvector number: 43
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 54.50
Rdmodfacs> Eigenvector number: 44
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 55.67
Rdmodfacs> Eigenvector number: 45
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 57.57
Rdmodfacs> Eigenvector number: 46
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 58.53
Rdmodfacs> Eigenvector number: 47
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 60.35
Rdmodfacs> Eigenvector number: 48
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 60.64
Rdmodfacs> Eigenvector number: 49
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 62.01
Rdmodfacs> Eigenvector number: 50
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 63.51
Rdmodfacs> Eigenvector number: 51
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 64.29
Rdmodfacs> Eigenvector number: 52
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 66.99
Rdmodfacs> Eigenvector number: 53
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 67.51
Rdmodfacs> Eigenvector number: 54
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 68.32
Rdmodfacs> Eigenvector number: 55
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 70.34
Rdmodfacs> Eigenvector number: 56
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 71.05
Rdmodfacs> Eigenvector number: 57
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 72.49
Rdmodfacs> Eigenvector number: 58
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 76.35
Rdmodfacs> Eigenvector number: 59
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 77.64
Rdmodfacs> Eigenvector number: 60
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 78.89
Rdmodfacs> Eigenvector number: 61
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 80.72
Rdmodfacs> Eigenvector number: 62
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 80.99
Rdmodfacs> Eigenvector number: 63
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 82.71
Rdmodfacs> Eigenvector number: 64
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 84.90
Rdmodfacs> Eigenvector number: 65
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 87.80
Rdmodfacs> Eigenvector number: 66
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 89.90
Rdmodfacs> Eigenvector number: 67
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 90.34
Rdmodfacs> Eigenvector number: 68
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 91.62
Rdmodfacs> Eigenvector number: 69
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 92.98
Rdmodfacs> Eigenvector number: 70
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 94.03
Rdmodfacs> Eigenvector number: 71
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 95.70
Rdmodfacs> Eigenvector number: 72
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 96.17
Rdmodfacs> Eigenvector number: 73
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 97.49
Rdmodfacs> Eigenvector number: 74
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 98.93
Rdmodfacs> Eigenvector number: 75
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 100.4
Rdmodfacs> Eigenvector number: 76
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 102.2
Rdmodfacs> Eigenvector number: 77
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 103.0
Rdmodfacs> Eigenvector number: 78
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 105.3
Rdmodfacs> Eigenvector number: 79
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 106.1
Rdmodfacs> Eigenvector number: 80
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 107.5
Rdmodfacs> Eigenvector number: 81
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 107.7
Rdmodfacs> Eigenvector number: 82
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 109.4
Rdmodfacs> Eigenvector number: 83
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 110.3
Rdmodfacs> Eigenvector number: 84
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 113.9
Rdmodfacs> Eigenvector number: 85
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 115.1
Rdmodfacs> Eigenvector number: 86
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 115.9
Rdmodfacs> Eigenvector number: 87
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 116.4
Rdmodfacs> Eigenvector number: 88
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 118.1
Rdmodfacs> Eigenvector number: 89
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 118.8
Rdmodfacs> Eigenvector number: 90
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 121.1
Rdmodfacs> Eigenvector number: 91
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 122.5
Rdmodfacs> Eigenvector number: 92
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 123.0
Rdmodfacs> Eigenvector number: 93
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 125.0
Rdmodfacs> Eigenvector number: 94
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 125.6
Rdmodfacs> Eigenvector number: 95
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 126.9
Rdmodfacs> Eigenvector number: 96
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 128.8
Rdmodfacs> Eigenvector number: 97
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 129.5
Rdmodfacs> Eigenvector number: 98
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 132.4
Rdmodfacs> Eigenvector number: 99
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 132.6
Rdmodfacs> Eigenvector number: 100
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 134.1
Rdmodfacs> Eigenvector number: 101
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 137.0
Rdmodfacs> Eigenvector number: 102
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 138.0
Rdmodfacs> Eigenvector number: 103
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 138.6
Rdmodfacs> Eigenvector number: 104
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 139.5
Rdmodfacs> Eigenvector number: 105
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 141.5
Rdmodfacs> Eigenvector number: 106
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 142.7
Rtb_to_modes> 106 vectors, with 858 coordinates in vector file.
Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected):
1.00000 1.00000 0.99999 1.00001 1.00002
1.00001 1.00001 0.99999 1.00000 1.00000
1.00000 1.00002 1.00001 1.00001 0.99999
1.00004 0.99998 0.99999 0.99999 0.99996
1.00000 1.00001 1.00002 1.00001 1.00001
0.99999 1.00001 1.00001 0.99997 1.00000
1.00001 0.99998 1.00001 1.00000 1.00001
1.00001 0.99999 1.00001 1.00000 0.99999
1.00001 0.99998 1.00001 1.00000 0.99998
1.00002 1.00001 1.00000 1.00001 1.00001
0.99998 1.00002 0.99999 0.99998 0.99998
1.00000 0.99998 0.99998 1.00001 1.00001
1.00000 0.99998 0.99999 1.00000 1.00002
0.99998 1.00004 1.00000 0.99998 1.00003
0.99999 1.00000 1.00000 0.99999 0.99999
1.00000 0.99995 1.00000 0.99996 0.99997
1.00001 0.99998 0.99999 1.00002 1.00000
0.99999 1.00001 1.00002 0.99999 1.00001
0.99999 0.99999 0.99997 1.00001 0.99999
1.00002 1.00000 1.00000 0.99998 1.00001
0.99999 1.00002 1.00001 1.00000 0.99999
1.00002
Rtb_to_modes> RTB block-file is being read.
Rtb_to_modes> 83520 lines found in RTB file.
Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected):
1.00000 1.00000 0.99999 1.00001 1.00002
1.00001 1.00001 0.99999 1.00000 1.00000
1.00000 1.00002 1.00001 1.00001 0.99999
1.00004 0.99998 0.99999 0.99999 0.99996
1.00000 1.00001 1.00002 1.00001 1.00001
0.99999 1.00001 1.00001 0.99997 1.00000
1.00001 0.99998 1.00001 1.00000 1.00001
1.00001 0.99999 1.00001 1.00000 0.99999
1.00001 0.99998 1.00001 1.00000 0.99998
1.00002 1.00001 1.00000 1.00001 1.00001
0.99998 1.00002 0.99999 0.99998 0.99998
1.00000 0.99998 0.99998 1.00001 1.00001
1.00000 0.99998 0.99999 1.00000 1.00002
0.99998 1.00004 1.00000 0.99998 1.00003
0.99999 1.00000 1.00000 0.99999 0.99999
1.00000 0.99995 1.00000 0.99996 0.99997
1.00001 0.99998 0.99999 1.00002 1.00000
0.99999 1.00001 1.00002 0.99999 1.00001
0.99999 0.99999 0.99997 1.00001 0.99999
1.00002 1.00000 1.00000 0.99998 1.00001
0.99999 1.00002 1.00001 1.00000 0.99999
1.00002
Orthogonality of first eigenvectors (zero expected):
Vector 2:-0.000
Vector 3:-0.000-0.000
Vector 4: 0.000 0.000-0.000
Vector 5:-0.000 0.000-0.000-0.000
Vector 6:-0.000 0.000-0.000-0.000-0.000
Vector 7:-0.000 0.000-0.000-0.000 0.000 0.000
Vector 8: 0.000-0.000 0.000-0.000-0.000-0.000 0.000
Vector 9: 0.000-0.000-0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
Vector 10: 0.000 0.000-0.000-0.000 0.000 0.000-0.000-0.000-0.000
Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved.
Rtb_to_modes> Normal end.
Diagrtb> Normal end.
B-factor analysis
Bfactors> Version 1.22, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 2602241516421496742.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
2602241516421496742.eigenfacs
Getnam> Corresponding pdb filename ?
Getnam> 2602241516421496742.atom
Openam> file on opening on unit 11:
2602241516421496742.atom
Getnum> Number of skipped eigenvectors ?
Getnum> 0
Getnum> Number of usefull eigenvectors ?
Getnum> 10000
%Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 285
First residue number = 69
Last residue number = 400
Number of atoms found = 4640
Mean number per residue = 16.3
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9838E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9848E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9891E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0003E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0005E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0012E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.280
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.365
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.440
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.600
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.164
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.14
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.59
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.81
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.15
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.79
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.24
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.15
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.50
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.21
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.48
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.88
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.46
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.42
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.31
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.59
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.44
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.73
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.42
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.00
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.19
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.95
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.62
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.02
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.91
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.26
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.23
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.90
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 50.37
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 51.94
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 53.21
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 54.50
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 55.67
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 57.57
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 58.53
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 60.35
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 60.64
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 62.01
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 63.51
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 64.29
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 66.99
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 67.51
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 68.32
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 70.34
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 71.05
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 72.49
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 76.35
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 77.64
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 78.89
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 80.72
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 80.99
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 82.71
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 84.90
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 87.80
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 89.90
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 90.34
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 91.62
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 92.98
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 94.03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 95.70
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 96.17
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 97.49
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 98.93
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 100.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 102.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 103.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 105.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 106.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 107.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 107.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 109.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 110.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 113.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 115.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 115.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 116.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 118.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 118.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 121.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 122.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 123.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 125.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 125.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 126.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 128.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 129.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 132.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 132.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 134.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 137.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 138.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 138.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 139.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 141.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 142.7
Bfactors> 106 vectors, 13920 coordinates in file.
Openam> file on opening on unit 12:
bfactors.pred
Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000
Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 3.280000
Bfactors> 100 eigenvectors will be considered.
Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped.
Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed.
(CHARMM units assumed for eigenvalues)
Bfactors> Correlation= 0.258 for 284 C-alpha atoms.
Bfactors> = 0.008 +/- 0.01
Bfactors> = 72.605 +/- 32.17
Bfactors> Shiftng-fct= 72.598
Bfactors> Scaling-fct= 3004.574
Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved.
Bfactors> Normal end.
check_modes
Chkmod> Version 1.00, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 2602241516421496742.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
2602241516421496742.eigenfacs
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4310E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4312E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4319E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4343E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4347E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4359E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 196.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 226.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 253.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 279.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 310.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 345.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 353.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 388.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 422.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 431.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 437.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 449.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 473.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 491.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 500.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 514.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 530.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 558.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 578.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 587.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 600.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 608.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 630.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 655.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 660.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 679.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 703.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 708.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 720.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 735.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 746.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 761.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 767.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 770.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 782.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 792.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 801.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 810.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 823.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 830.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 843.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 845.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 855.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 865.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 870.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 888.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 892.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 897.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 910.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 915.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 924.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 948.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 956.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 964.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 975.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 977.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 987.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1001.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1017.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1030.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1032.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1039.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1047.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1053.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1062.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1065.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1072.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1080.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1088.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1098.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1102.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1114.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1118.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1126.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1127.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1136.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1140.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1159.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1165.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1169.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1172.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1180.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1184.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1195.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1202.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1204.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1214.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1217.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1223.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1232.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1236.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1249.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1250.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1257.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1271.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1276.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1278.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1283.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1292.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1297.
Chkmod> 106 vectors, 13920 coordinates in file.
Chkmod> That is: 4640 cartesian points.
Openam> file on opening on unit 11:
Chkmod.res
Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file.
Chkmod> Normal end.
0.0034 0.9488
0.0034 0.7503
0.0034 0.7819
0.0034 0.9378
0.0034 0.6978
0.0034 0.7820
196.6589 0.1354
226.8657 0.0715
253.2655 0.3452
278.9643 0.5924
310.2617 0.3757
345.7766 0.2781
353.3659 0.3749
388.6433 0.2691
422.6520 0.2820
431.4870 0.2668
437.5923 0.1983
449.6853 0.3517
473.6920 0.2034
491.6472 0.3374
500.0886 0.3554
514.8430 0.4453
530.6324 0.3418
558.5622 0.3939
578.8802 0.3957
587.8744 0.4619
600.5738 0.5061
608.8606 0.4080
630.6448 0.4489
655.3097 0.3836
660.5071 0.6226
679.7736 0.3908
703.3032 0.5669
708.8974 0.4141
720.4464 0.2777
735.7500 0.5032
746.4891 0.4500
761.8887 0.5093
767.0557 0.2371
770.6596 0.2488
782.5780 0.2252
792.0877 0.3756
801.6317 0.1649
810.1907 0.4808
823.9005 0.4136
830.7415 0.4859
843.5586 0.3406
845.5830 0.4543
855.0815 0.1860
865.3617 0.2147
870.6595 0.3312
888.7541 0.4005
892.1969 0.4197
897.5333 0.3072
910.7052 0.2872
915.2899 0.4933
924.5187 0.4132
948.8142 0.1679
956.7961 0.3948
964.4675 0.5008
975.5897 0.3842
977.2200 0.4382
987.5422 0.4170
1000.5308 0.3383
1017.4753 0.2607
1029.5714 0.3246
1032.0879 0.2307
1039.3738 0.4605
1047.0596 0.4667
1052.9551 0.3775
1062.2643 0.3975
1064.8696 0.4642
1072.1528 0.3721
1080.0420 0.4400
1088.0366 0.5071
1097.7466 0.4944
1102.0346 0.3770
1114.2710 0.3934
1118.4957 0.2386
1125.8509 0.2763
1126.8977 0.3748
1135.7567 0.5851
1140.4189 0.3266
1158.8801 0.4998
1164.9688 0.3110
1169.0103 0.4039
1171.5292 0.4321
1180.0532 0.4318
1183.5452 0.4468
1194.9472 0.5230
1201.8345 0.4698
1204.2848 0.3326
1214.0362 0.5221
1216.9464 0.4457
1223.2281 0.4505
1232.3514 0.4342
1235.6957 0.5138
1249.4550 0.2989
1250.3984 0.3441
1257.4509 0.4599
1270.9747 0.2878
1275.6049 0.5493
1278.3749 0.5567
1282.5188 0.5263
1291.6798 0.4808
1297.1453 0.4902
getting mode 7
running: ../../bin/get_modes.sh 2602241516421496742 7 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 7
calculating perturbed structure for DQ=-100
2602241516421496742.eigenfacs
2602241516421496742.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2602241516421496742.eigenfacs
2602241516421496742.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2602241516421496742.eigenfacs
2602241516421496742.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2602241516421496742.eigenfacs
2602241516421496742.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2602241516421496742.eigenfacs
2602241516421496742.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2602241516421496742.eigenfacs
2602241516421496742.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2602241516421496742.eigenfacs
2602241516421496742.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2602241516421496742.eigenfacs
2602241516421496742.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2602241516421496742.eigenfacs
2602241516421496742.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2602241516421496742.eigenfacs
2602241516421496742.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2602241516421496742.eigenfacs
2602241516421496742.atom
making animated gifs
11 models are in 2602241516421496742.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2602241516421496742.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2602241516421496742.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 8
running: ../../bin/get_modes.sh 2602241516421496742 8 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 8
calculating perturbed structure for DQ=-100
2602241516421496742.eigenfacs
2602241516421496742.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2602241516421496742.eigenfacs
2602241516421496742.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2602241516421496742.eigenfacs
2602241516421496742.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2602241516421496742.eigenfacs
2602241516421496742.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2602241516421496742.eigenfacs
2602241516421496742.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2602241516421496742.eigenfacs
2602241516421496742.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2602241516421496742.eigenfacs
2602241516421496742.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2602241516421496742.eigenfacs
2602241516421496742.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2602241516421496742.eigenfacs
2602241516421496742.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2602241516421496742.eigenfacs
2602241516421496742.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2602241516421496742.eigenfacs
2602241516421496742.atom
making animated gifs
11 models are in 2602241516421496742.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2602241516421496742.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2602241516421496742.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 9
running: ../../bin/get_modes.sh 2602241516421496742 9 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 9
calculating perturbed structure for DQ=-100
2602241516421496742.eigenfacs
2602241516421496742.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2602241516421496742.eigenfacs
2602241516421496742.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2602241516421496742.eigenfacs
2602241516421496742.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2602241516421496742.eigenfacs
2602241516421496742.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2602241516421496742.eigenfacs
2602241516421496742.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2602241516421496742.eigenfacs
2602241516421496742.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2602241516421496742.eigenfacs
2602241516421496742.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2602241516421496742.eigenfacs
2602241516421496742.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2602241516421496742.eigenfacs
2602241516421496742.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2602241516421496742.eigenfacs
2602241516421496742.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2602241516421496742.eigenfacs
2602241516421496742.atom
making animated gifs
11 models are in 2602241516421496742.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2602241516421496742.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2602241516421496742.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 10
running: ../../bin/get_modes.sh 2602241516421496742 10 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 10
calculating perturbed structure for DQ=-100
2602241516421496742.eigenfacs
2602241516421496742.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2602241516421496742.eigenfacs
2602241516421496742.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2602241516421496742.eigenfacs
2602241516421496742.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2602241516421496742.eigenfacs
2602241516421496742.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2602241516421496742.eigenfacs
2602241516421496742.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2602241516421496742.eigenfacs
2602241516421496742.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2602241516421496742.eigenfacs
2602241516421496742.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2602241516421496742.eigenfacs
2602241516421496742.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2602241516421496742.eigenfacs
2602241516421496742.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2602241516421496742.eigenfacs
2602241516421496742.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2602241516421496742.eigenfacs
2602241516421496742.atom
making animated gifs
11 models are in 2602241516421496742.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2602241516421496742.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2602241516421496742.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 11
running: ../../bin/get_modes.sh 2602241516421496742 11 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 11
calculating perturbed structure for DQ=-100
2602241516421496742.eigenfacs
2602241516421496742.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2602241516421496742.eigenfacs
2602241516421496742.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2602241516421496742.eigenfacs
2602241516421496742.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2602241516421496742.eigenfacs
2602241516421496742.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2602241516421496742.eigenfacs
2602241516421496742.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2602241516421496742.eigenfacs
2602241516421496742.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2602241516421496742.eigenfacs
2602241516421496742.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2602241516421496742.eigenfacs
2602241516421496742.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2602241516421496742.eigenfacs
2602241516421496742.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2602241516421496742.eigenfacs
2602241516421496742.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2602241516421496742.eigenfacs
2602241516421496742.atom
making animated gifs
11 models are in 2602241516421496742.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2602241516421496742.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2602241516421496742.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
2602241516421496742.10.pdb
2602241516421496742.11.pdb
2602241516421496742.7.pdb
2602241516421496742.8.pdb
2602241516421496742.9.pdb
STDERR:
Note: The following floating-point exceptions are signalling: IEEE_DENORMAL
real 0m18.480s
user 0m18.214s
sys 0m0.253s
rm: cannot remove '2602241516421496742.sdijf': No such file or directory
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
If you find results from this site helpful for your research, please cite one of our papers:
elNémo
is maintained by Yves-Henri Sanejouand.
It was developed
by Karsten Suhre.
Between 2003 and 2014, it was hosted by IGS (Marseille).
Between 2015 and 2025, it was hosted by US2B (Nantes).
Last modification: december 26th, 2025.
|
