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elNémo has been hacked on november 27th.
It has been moved away and runs again.
**Still some additional cleaning from time to time**
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***  MEMBRANE PROTEIN 19-DEC-21 7T9I  ***

LOGs for ID: 2602261205572311021

Output from eigenvector calculation:


STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8) Build Tirion matrix: Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model. Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004. Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file. Pdbmat> Coordinate filename = 2602261205572311021.atom Pdbmat> Distance cutoff = 8.00 Force constant = 10.00 Origin of mass values = CONS Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09 PRINTing level = 2 Pdbmat> Coordinate file 2602261205572311021.atom to be opened. Openam> File opened: 2602261205572311021.atom Pdbmat> Coordinate file in PDB format. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 596 First residue number = 21 Last residue number = 698 Number of atoms found = 9537 Mean number per residue = 16.0 Pdbmat> Coordinate statistics: = 183.579735 +/- 10.238110 From: 158.302000 To: 222.375000 = 189.823600 +/- 17.116911 From: 146.014000 To: 222.952000 = 222.740567 +/- 32.699474 From: 163.898000 To: 294.100000 Pdbmat> Masses are all set to one. Openam> File opened: pdbmat.xyzm Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved. Openam> File opened: pdbmat.sdijb Pdbmat> Matrix statistics: Pdbmat> The matrix is 1.7338 % Filled. Pdbmat> 7096731 non-zero elements. Pdbmat> 782291 atom-atom interactions. Pdbmat> Number per atom= 164.05 +/- 47.97 Maximum number = 252 Minimum number = 22 Pdbmat> Matrix trace = 1.564582E+07 Pdbmat> Larger element = 904.384 Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10 Pdbmat> Normal end. automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1) 596 non-zero elements, NRBL set to 3 Diagonalize Tirion matrix using diagrtb Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation. Diagrtb> Version 2.52, November 2004. Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file. Diagrtb> Options taken into account: MATRix filename = pdbmat.sdijb COORdinates filename = 2602261205572311021.atom Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb Nb of VECTors required = 106 EigeNVALues chosen = LOWE Type of SUBStructuring = NONE Nb of residues per BLOck = 3 Origin of MASS values = CONS MATRix FORMat = BINA Temporary files cleaning = ALL Output PRINting level = 2 Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb. Blocpdb> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.xyzm Blocpdb> Coordinate file 2602261205572311021.atom to be opened. Openam> file on opening on unit 11: 2602261205572311021.atom Blocpdb> Coordinate file in PDB format. Blocpdb> 9537 atoms picked in pdb file. Blocpdb> All masses set to unity. Blocpdb> Coordinate file is rewritten. Blocpdb> Substructuring: Blocpdb> 3 residue(s) per block. Blocpdb> 596 residues. Blocpdb> 38 atoms in block 1 Block first atom: 1 Blocpdb> 32 atoms in block 2 Block first atom: 39 Blocpdb> 38 atoms in block 3 Block first atom: 71 Blocpdb> 42 atoms in block 4 Block first atom: 109 Blocpdb> 47 atoms in block 5 Block first atom: 151 Blocpdb> 56 atoms in block 6 Block first atom: 198 Blocpdb> 40 atoms in block 7 Block first atom: 254 Blocpdb> 53 atoms in block 8 Block first atom: 294 Blocpdb> 60 atoms in block 9 Block first atom: 347 Blocpdb> 44 atoms in block 10 Block first atom: 407 Blocpdb> 39 atoms in block 11 Block first atom: 451 Blocpdb> 45 atoms in block 12 Block first atom: 490 Blocpdb> 60 atoms in block 13 Block first atom: 535 Blocpdb> 48 atoms in block 14 Block first atom: 595 Blocpdb> 60 atoms in block 15 Block first atom: 643 Blocpdb> 47 atoms in block 16 Block first atom: 703 Blocpdb> 38 atoms in block 17 Block first atom: 750 Blocpdb> 45 atoms in block 18 Block first atom: 788 Blocpdb> 47 atoms in block 19 Block first atom: 833 Blocpdb> 54 atoms in block 20 Block first atom: 880 Blocpdb> 56 atoms in block 21 Block first atom: 934 Blocpdb> 42 atoms in block 22 Block first atom: 990 Blocpdb> 49 atoms in block 23 Block first atom: 1032 Blocpdb> 53 atoms in block 24 Block first atom: 1081 Blocpdb> 43 atoms in block 25 Block first atom: 1134 Blocpdb> 52 atoms in block 26 Block first atom: 1177 Blocpdb> 44 atoms in block 27 Block first atom: 1229 Blocpdb> 52 atoms in block 28 Block first atom: 1273 Blocpdb> 51 atoms in block 29 Block first atom: 1325 Blocpdb> 57 atoms in block 30 Block first atom: 1376 Blocpdb> 52 atoms in block 31 Block first atom: 1433 Blocpdb> 54 atoms in block 32 Block first atom: 1485 Blocpdb> 45 atoms in block 33 Block first atom: 1539 Blocpdb> 41 atoms in block 34 Block first atom: 1584 Blocpdb> 56 atoms in block 35 Block first atom: 1625 Blocpdb> 52 atoms in block 36 Block first atom: 1681 Blocpdb> 61 atoms in block 37 Block first atom: 1733 Blocpdb> 46 atoms in block 38 Block first atom: 1794 Blocpdb> 35 atoms in block 39 Block first atom: 1840 Blocpdb> 58 atoms in block 40 Block first atom: 1875 Blocpdb> 46 atoms in block 41 Block first atom: 1933 Blocpdb> 55 atoms in block 42 Block first atom: 1979 Blocpdb> 48 atoms in block 43 Block first atom: 2034 Blocpdb> 45 atoms in block 44 Block first atom: 2082 Blocpdb> 59 atoms in block 45 Block first atom: 2127 Blocpdb> 53 atoms in block 46 Block first atom: 2186 Blocpdb> 40 atoms in block 47 Block first atom: 2239 Blocpdb> 52 atoms in block 48 Block first atom: 2279 Blocpdb> 44 atoms in block 49 Block first atom: 2331 Blocpdb> 44 atoms in block 50 Block first atom: 2375 Blocpdb> 47 atoms in block 51 Block first atom: 2419 Blocpdb> 37 atoms in block 52 Block first atom: 2466 Blocpdb> 43 atoms in block 53 Block first atom: 2503 Blocpdb> 52 atoms in block 54 Block first atom: 2546 Blocpdb> 62 atoms in block 55 Block first atom: 2598 Blocpdb> 35 atoms in block 56 Block first atom: 2660 Blocpdb> 45 atoms in block 57 Block first atom: 2695 Blocpdb> 40 atoms in block 58 Block first atom: 2740 Blocpdb> 51 atoms in block 59 Block first atom: 2780 Blocpdb> 35 atoms in block 60 Block first atom: 2831 Blocpdb> 53 atoms in block 61 Block first atom: 2866 Blocpdb> 47 atoms in block 62 Block first atom: 2919 Blocpdb> 55 atoms in block 63 Block first atom: 2966 Blocpdb> 57 atoms in block 64 Block first atom: 3021 Blocpdb> 49 atoms in block 65 Block first atom: 3078 Blocpdb> 53 atoms in block 66 Block first atom: 3127 Blocpdb> 42 atoms in block 67 Block first atom: 3180 Blocpdb> 30 atoms in block 68 Block first atom: 3222 Blocpdb> 39 atoms in block 69 Block first atom: 3252 Blocpdb> 44 atoms in block 70 Block first atom: 3291 Blocpdb> 47 atoms in block 71 Block first atom: 3335 Blocpdb> 42 atoms in block 72 Block first atom: 3382 Blocpdb> 41 atoms in block 73 Block first atom: 3424 Blocpdb> 43 atoms in block 74 Block first atom: 3465 Blocpdb> 40 atoms in block 75 Block first atom: 3508 Blocpdb> 51 atoms in block 76 Block first atom: 3548 Blocpdb> 56 atoms in block 77 Block first atom: 3599 Blocpdb> 48 atoms in block 78 Block first atom: 3655 Blocpdb> 52 atoms in block 79 Block first atom: 3703 Blocpdb> 57 atoms in block 80 Block first atom: 3755 Blocpdb> 63 atoms in block 81 Block first atom: 3812 Blocpdb> 44 atoms in block 82 Block first atom: 3875 Blocpdb> 50 atoms in block 83 Block first atom: 3919 Blocpdb> 55 atoms in block 84 Block first atom: 3969 Blocpdb> 48 atoms in block 85 Block first atom: 4024 Blocpdb> 42 atoms in block 86 Block first atom: 4072 Blocpdb> 46 atoms in block 87 Block first atom: 4114 Blocpdb> 38 atoms in block 88 Block first atom: 4160 Blocpdb> 52 atoms in block 89 Block first atom: 4198 Blocpdb> 53 atoms in block 90 Block first atom: 4250 Blocpdb> 65 atoms in block 91 Block first atom: 4303 Blocpdb> 45 atoms in block 92 Block first atom: 4368 Blocpdb> 45 atoms in block 93 Block first atom: 4413 Blocpdb> 41 atoms in block 94 Block first atom: 4458 Blocpdb> 37 atoms in block 95 Block first atom: 4499 Blocpdb> 42 atoms in block 96 Block first atom: 4536 Blocpdb> 50 atoms in block 97 Block first atom: 4578 Blocpdb> 47 atoms in block 98 Block first atom: 4628 Blocpdb> 36 atoms in block 99 Block first atom: 4675 Blocpdb> 38 atoms in block 100 Block first atom: 4711 Blocpdb> 45 atoms in block 101 Block first atom: 4749 Blocpdb> 38 atoms in block 102 Block first atom: 4794 Blocpdb> 45 atoms in block 103 Block first atom: 4832 Blocpdb> 49 atoms in block 104 Block first atom: 4877 Blocpdb> 40 atoms in block 105 Block first atom: 4926 Blocpdb> 48 atoms in block 106 Block first atom: 4966 Blocpdb> 50 atoms in block 107 Block first atom: 5014 Blocpdb> 63 atoms in block 108 Block first atom: 5064 Blocpdb> 51 atoms in block 109 Block first atom: 5127 Blocpdb> 60 atoms in block 110 Block first atom: 5178 Blocpdb> 49 atoms in block 111 Block first atom: 5238 Blocpdb> 48 atoms in block 112 Block first atom: 5287 Blocpdb> 37 atoms in block 113 Block first atom: 5335 Blocpdb> 55 atoms in block 114 Block first atom: 5372 Blocpdb> 57 atoms in block 115 Block first atom: 5427 Blocpdb> 44 atoms in block 116 Block first atom: 5484 Blocpdb> 60 atoms in block 117 Block first atom: 5528 Blocpdb> 49 atoms in block 118 Block first atom: 5588 Blocpdb> 58 atoms in block 119 Block first atom: 5637 Blocpdb> 47 atoms in block 120 Block first atom: 5695 Blocpdb> 43 atoms in block 121 Block first atom: 5742 Blocpdb> 42 atoms in block 122 Block first atom: 5785 Blocpdb> 48 atoms in block 123 Block first atom: 5827 Blocpdb> 45 atoms in block 124 Block first atom: 5875 Blocpdb> 57 atoms in block 125 Block first atom: 5920 Blocpdb> 40 atoms in block 126 Block first atom: 5977 Blocpdb> 47 atoms in block 127 Block first atom: 6017 Blocpdb> 52 atoms in block 128 Block first atom: 6064 Blocpdb> 47 atoms in block 129 Block first atom: 6116 Blocpdb> 53 atoms in block 130 Block first atom: 6163 Blocpdb> 41 atoms in block 131 Block first atom: 6216 Blocpdb> 55 atoms in block 132 Block first atom: 6257 Blocpdb> 28 atoms in block 133 Block first atom: 6312 Blocpdb> 38 atoms in block 134 Block first atom: 6340 Blocpdb> 37 atoms in block 135 Block first atom: 6378 Blocpdb> 50 atoms in block 136 Block first atom: 6415 Blocpdb> 41 atoms in block 137 Block first atom: 6465 Blocpdb> 45 atoms in block 138 Block first atom: 6506 Blocpdb> 51 atoms in block 139 Block first atom: 6551 Blocpdb> 49 atoms in block 140 Block first atom: 6602 Blocpdb> 52 atoms in block 141 Block first atom: 6651 Blocpdb> 63 atoms in block 142 Block first atom: 6703 Blocpdb> 50 atoms in block 143 Block first atom: 6766 Blocpdb> 44 atoms in block 144 Block first atom: 6816 Blocpdb> 60 atoms in block 145 Block first atom: 6860 Blocpdb> 58 atoms in block 146 Block first atom: 6920 Blocpdb> 62 atoms in block 147 Block first atom: 6978 Blocpdb> 51 atoms in block 148 Block first atom: 7040 Blocpdb> 40 atoms in block 149 Block first atom: 7091 Blocpdb> 40 atoms in block 150 Block first atom: 7131 Blocpdb> 47 atoms in block 151 Block first atom: 7171 Blocpdb> 42 atoms in block 152 Block first atom: 7218 Blocpdb> 48 atoms in block 153 Block first atom: 7260 Blocpdb> 52 atoms in block 154 Block first atom: 7308 Blocpdb> 42 atoms in block 155 Block first atom: 7360 Blocpdb> 41 atoms in block 156 Block first atom: 7402 Blocpdb> 53 atoms in block 157 Block first atom: 7443 Blocpdb> 46 atoms in block 158 Block first atom: 7496 Blocpdb> 43 atoms in block 159 Block first atom: 7542 Blocpdb> 43 atoms in block 160 Block first atom: 7585 Blocpdb> 43 atoms in block 161 Block first atom: 7628 Blocpdb> 48 atoms in block 162 Block first atom: 7671 Blocpdb> 50 atoms in block 163 Block first atom: 7719 Blocpdb> 52 atoms in block 164 Block first atom: 7769 Blocpdb> 52 atoms in block 165 Block first atom: 7821 Blocpdb> 49 atoms in block 166 Block first atom: 7873 Blocpdb> 46 atoms in block 167 Block first atom: 7922 Blocpdb> 46 atoms in block 168 Block first atom: 7968 Blocpdb> 43 atoms in block 169 Block first atom: 8014 Blocpdb> 57 atoms in block 170 Block first atom: 8057 Blocpdb> 54 atoms in block 171 Block first atom: 8114 Blocpdb> 54 atoms in block 172 Block first atom: 8168 Blocpdb> 48 atoms in block 173 Block first atom: 8222 Blocpdb> 51 atoms in block 174 Block first atom: 8270 Blocpdb> 51 atoms in block 175 Block first atom: 8321 Blocpdb> 54 atoms in block 176 Block first atom: 8372 Blocpdb> 46 atoms in block 177 Block first atom: 8426 Blocpdb> 50 atoms in block 178 Block first atom: 8472 Blocpdb> 41 atoms in block 179 Block first atom: 8522 Blocpdb> 50 atoms in block 180 Block first atom: 8563 Blocpdb> 50 atoms in block 181 Block first atom: 8613 Blocpdb> 40 atoms in block 182 Block first atom: 8663 Blocpdb> 55 atoms in block 183 Block first atom: 8703 Blocpdb> 52 atoms in block 184 Block first atom: 8758 Blocpdb> 41 atoms in block 185 Block first atom: 8810 Blocpdb> 47 atoms in block 186 Block first atom: 8851 Blocpdb> 57 atoms in block 187 Block first atom: 8898 Blocpdb> 55 atoms in block 188 Block first atom: 8955 Blocpdb> 54 atoms in block 189 Block first atom: 9010 Blocpdb> 36 atoms in block 190 Block first atom: 9064 Blocpdb> 38 atoms in block 191 Block first atom: 9100 Blocpdb> 60 atoms in block 192 Block first atom: 9138 Blocpdb> 49 atoms in block 193 Block first atom: 9198 Blocpdb> 46 atoms in block 194 Block first atom: 9247 Blocpdb> 61 atoms in block 195 Block first atom: 9293 Blocpdb> 48 atoms in block 196 Block first atom: 9354 Blocpdb> 57 atoms in block 197 Block first atom: 9402 Blocpdb> 53 atoms in block 198 Block first atom: 9459 Blocpdb> 26 atoms in block 199 Block first atom: 9511 Blocpdb> 199 blocks. Blocpdb> At most, 65 atoms in each of them. Blocpdb> At least, 26 atoms in each of them. Blocpdb> Normal end of Blocpdb. Diagrtb> Memory allocation for Prepmat. Diagrtb> Memory allocation for RTB. Diagrtb> Memory allocation for Diagstd. Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes. Prepmat> Entering in. Prepmat> Rewriting of the matrix begins. Prepmat> 7096930 matrix lines read. Prepmat> Matrix order = 28611 Prepmat> Matrix trace = 15645820.0000 Prepmat> Last element read: 28611 28611 136.9976 Prepmat> 19901 lines saved. Prepmat> 17744 empty lines. Prepmat> Number of lines on output is as expected. Prepmat> Normal end of Prepmat. RTB> Entering in. RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 9537 RTB> Total mass = 9537.0000 RTB> Number of atoms found in matrix: 9537 RTB> Number of blocks = 199 RTB> Projection begins. RTB> Projected matrix is being saved. RTB> Projected matrix trace = 518923.6275 RTB> 74631 non-zero elements. RTB> Normal end of RTB. Diagstd> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.sdijb Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb Diagstd> CERFACS matrix format. Diagstd> Projected matrix order = 1194 Diagstd> Nb of non-zero elements: 74631 Diagstd> Projected matrix trace = 518923.6275 Openam> file on opening on unit 11: diagrtb_work.eigenfacs Diagstd> Diagonalization. Diagstd> 1194 eigenvectors are computed. Diagstd> 106 of them to be saved. Diagstd> Sum of eigenvalues = 518923.6275 Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000 Diagstd> Selected eigenvalues: 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.2227675 0.2657930 0.4702367 1.0991465 1.3811636 1.9867410 2.6019079 3.1590960 3.4477422 4.2173345 5.1447066 5.4526078 6.0775929 6.6484014 8.0538590 8.5469763 9.8416438 9.8547455 10.1907265 11.0997337 12.0436582 13.7502980 14.1432023 14.8058503 18.2925010 18.8305007 19.7644502 21.0290006 22.3845631 23.8941685 24.5984686 25.7772072 27.1120031 29.5359758 29.9338158 31.0422049 32.2529283 33.1299349 33.9425802 34.2401398 35.9750274 36.8614578 37.9675674 39.3906734 40.5261084 40.8818114 41.6352678 43.5015205 46.5443713 48.7499059 49.8850077 50.4537917 51.4392735 53.6554561 54.6761708 54.7848556 55.7631514 57.9647485 59.1832098 60.1300248 61.7225544 62.3970573 63.6052816 64.4724674 66.5465454 67.0548501 67.5686843 69.2671082 69.6510285 71.8256305 72.4822804 73.3333374 75.1543362 75.2301696 75.8862117 76.6469898 78.7771858 79.3380125 80.8569831 81.8624185 83.1728137 84.1037858 85.9819672 86.5603192 87.4426354 89.3258512 91.0872492 91.5763385 93.9336166 94.9229755 96.3735934 97.5775068 98.5793924 99.2389403 101.7372731 102.4168634 103.1598999 103.3915505 103.8250693 104.8060386 Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units): 0.0034265 0.0034309 0.0034325 0.0034328 0.0034330 0.0034342 51.2532195 55.9844079 74.4652340 113.8473904 127.6197369 153.0614805 175.1625420 193.0086139 201.6334931 223.0048486 246.3063378 253.5697305 267.7078349 279.9973346 308.1749201 317.4691504 340.6662438 340.8929250 346.6553079 361.7858367 376.8551809 402.6719101 408.3844120 417.8418705 464.4423603 471.2227118 482.7670813 497.9716254 513.7710056 530.8126219 538.5788759 551.3320145 565.4264014 590.1615919 594.1229397 605.0225489 616.7083889 625.0367763 632.6561103 635.4231672 651.3221484 659.2976593 669.1163876 681.5409932 691.2939102 694.3210714 700.6900676 716.2217388 740.8475762 758.1971913 766.9733999 771.3334847 778.8300388 795.4304750 802.9607672 803.7584302 810.9030522 826.7558150 835.4001287 842.0559941 853.1339520 857.7828014 866.0478143 871.9316170 885.8456113 889.2223669 892.6228738 903.7718471 906.2730120 920.3118284 924.5091303 929.9208928 941.3958987 941.8707296 945.9685908 950.6985509 963.8190620 967.2437643 976.4590768 982.5113267 990.3437774 995.8709248 1006.9292784 1010.3101240 1015.4461548 1026.3225281 1036.3920519 1039.1707592 1052.4604926 1057.9885120 1066.0419780 1072.6798901 1078.1727443 1081.7735024 1095.3056470 1098.9577997 1102.9370767 1104.1747317 1106.4872018 1111.7021188 Diagstd> Normal end. Rtb_to_modes> Entering in. Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 9537 Rtb_to_modes> Number of blocs = 199 Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.eigenfacs Openam> file on opening on unit 11: matrix.eigenrtb Rdmodfacs> Entering in. Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Eigenvector number: 1 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9564E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 2 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9821E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 3 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9916E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 4 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9931E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 5 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9946E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 6 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0002E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 7 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.2228 Rdmodfacs> Eigenvector number: 8 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.2658 Rdmodfacs> Eigenvector number: 9 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.4702 Rdmodfacs> Eigenvector number: 10 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.099 Rdmodfacs> Eigenvector number: 11 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.381 Rdmodfacs> Eigenvector number: 12 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.987 Rdmodfacs> Eigenvector number: 13 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.602 Rdmodfacs> Eigenvector number: 14 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.159 Rdmodfacs> Eigenvector number: 15 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.448 Rdmodfacs> Eigenvector number: 16 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.217 Rdmodfacs> Eigenvector number: 17 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.145 Rdmodfacs> Eigenvector number: 18 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.453 Rdmodfacs> Eigenvector number: 19 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.078 Rdmodfacs> Eigenvector number: 20 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.648 Rdmodfacs> Eigenvector number: 21 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.054 Rdmodfacs> Eigenvector number: 22 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.547 Rdmodfacs> Eigenvector number: 23 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.842 Rdmodfacs> Eigenvector number: 24 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.855 Rdmodfacs> Eigenvector number: 25 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.19 Rdmodfacs> Eigenvector number: 26 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 27 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.04 Rdmodfacs> Eigenvector number: 28 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.75 Rdmodfacs> Eigenvector number: 29 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.14 Rdmodfacs> Eigenvector number: 30 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.81 Rdmodfacs> Eigenvector number: 31 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.29 Rdmodfacs> Eigenvector number: 32 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.83 Rdmodfacs> Eigenvector number: 33 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.76 Rdmodfacs> Eigenvector number: 34 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.03 Rdmodfacs> Eigenvector number: 35 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.38 Rdmodfacs> Eigenvector number: 36 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.89 Rdmodfacs> Eigenvector number: 37 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.60 Rdmodfacs> Eigenvector number: 38 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.78 Rdmodfacs> Eigenvector number: 39 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.11 Rdmodfacs> Eigenvector number: 40 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.54 Rdmodfacs> Eigenvector number: 41 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.93 Rdmodfacs> Eigenvector number: 42 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.04 Rdmodfacs> Eigenvector number: 43 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.25 Rdmodfacs> Eigenvector number: 44 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.13 Rdmodfacs> Eigenvector number: 45 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.94 Rdmodfacs> Eigenvector number: 46 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.24 Rdmodfacs> Eigenvector number: 47 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.98 Rdmodfacs> Eigenvector number: 48 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.86 Rdmodfacs> Eigenvector number: 49 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.97 Rdmodfacs> Eigenvector number: 50 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.39 Rdmodfacs> Eigenvector number: 51 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.53 Rdmodfacs> Eigenvector number: 52 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.88 Rdmodfacs> Eigenvector number: 53 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.64 Rdmodfacs> Eigenvector number: 54 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.50 Rdmodfacs> Eigenvector number: 55 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.54 Rdmodfacs> Eigenvector number: 56 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 48.75 Rdmodfacs> Eigenvector number: 57 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 49.89 Rdmodfacs> Eigenvector number: 58 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 50.45 Rdmodfacs> Eigenvector number: 59 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 51.44 Rdmodfacs> Eigenvector number: 60 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 53.66 Rdmodfacs> Eigenvector number: 61 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 54.68 Rdmodfacs> Eigenvector number: 62 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 54.78 Rdmodfacs> Eigenvector number: 63 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 55.76 Rdmodfacs> Eigenvector number: 64 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 57.96 Rdmodfacs> Eigenvector number: 65 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 59.18 Rdmodfacs> Eigenvector number: 66 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 60.13 Rdmodfacs> Eigenvector number: 67 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 61.72 Rdmodfacs> Eigenvector number: 68 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 62.40 Rdmodfacs> Eigenvector number: 69 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 63.61 Rdmodfacs> Eigenvector number: 70 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 64.47 Rdmodfacs> Eigenvector number: 71 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 66.55 Rdmodfacs> Eigenvector number: 72 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 67.05 Rdmodfacs> Eigenvector number: 73 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 67.57 Rdmodfacs> Eigenvector number: 74 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 69.27 Rdmodfacs> Eigenvector number: 75 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 69.65 Rdmodfacs> Eigenvector number: 76 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 71.83 Rdmodfacs> Eigenvector number: 77 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 72.48 Rdmodfacs> Eigenvector number: 78 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 73.33 Rdmodfacs> Eigenvector number: 79 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 75.15 Rdmodfacs> Eigenvector number: 80 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 75.23 Rdmodfacs> Eigenvector number: 81 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 75.89 Rdmodfacs> Eigenvector number: 82 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 76.65 Rdmodfacs> Eigenvector number: 83 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 78.78 Rdmodfacs> Eigenvector number: 84 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 79.34 Rdmodfacs> Eigenvector number: 85 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 80.86 Rdmodfacs> Eigenvector number: 86 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 81.86 Rdmodfacs> Eigenvector number: 87 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 83.17 Rdmodfacs> Eigenvector number: 88 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 84.10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 89 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 85.98 Rdmodfacs> Eigenvector number: 90 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 86.56 Rdmodfacs> Eigenvector number: 91 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 87.44 Rdmodfacs> Eigenvector number: 92 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 89.33 Rdmodfacs> Eigenvector number: 93 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 91.09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 94 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 91.58 Rdmodfacs> Eigenvector number: 95 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 93.93 Rdmodfacs> Eigenvector number: 96 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 94.92 Rdmodfacs> Eigenvector number: 97 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 96.37 Rdmodfacs> Eigenvector number: 98 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 97.58 Rdmodfacs> Eigenvector number: 99 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 98.58 Rdmodfacs> Eigenvector number: 100 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 99.24 Rdmodfacs> Eigenvector number: 101 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 101.7 Rdmodfacs> Eigenvector number: 102 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 102.4 Rdmodfacs> Eigenvector number: 103 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 103.2 Rdmodfacs> Eigenvector number: 104 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 103.4 Rdmodfacs> Eigenvector number: 105 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 103.8 Rdmodfacs> Eigenvector number: 106 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 104.8 Rtb_to_modes> 106 vectors, with 1194 coordinates in vector file. Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected): 1.00000 1.00001 1.00000 1.00001 1.00000 1.00000 0.99999 0.99999 0.99999 0.99999 1.00002 1.00000 1.00000 1.00002 0.99997 0.99998 0.99997 1.00001 1.00002 0.99998 1.00000 0.99998 0.99999 1.00003 0.99999 1.00000 1.00000 1.00001 0.99998 0.99999 0.99998 0.99999 1.00002 1.00000 0.99999 1.00003 1.00002 0.99997 0.99998 1.00000 0.99999 1.00001 1.00000 0.99998 0.99998 0.99999 1.00001 1.00001 1.00001 1.00001 1.00003 0.99999 1.00002 1.00000 1.00001 1.00000 1.00002 1.00000 1.00000 0.99999 1.00000 1.00001 1.00000 0.99999 0.99999 0.99998 0.99999 0.99997 1.00002 1.00000 0.99999 1.00002 1.00002 1.00001 1.00002 0.99999 1.00000 1.00000 0.99999 1.00002 1.00001 0.99998 1.00002 1.00002 1.00000 1.00000 1.00003 1.00000 1.00000 1.00000 1.00002 1.00002 1.00000 0.99998 1.00000 1.00000 1.00001 0.99999 1.00000 0.99998 1.00001 1.00001 1.00000 0.99998 1.00001 1.00002 Rtb_to_modes> RTB block-file is being read. Rtb_to_modes> 171666 lines found in RTB file. Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected): 1.00000 1.00001 1.00000 1.00001 1.00000 1.00000 0.99999 0.99999 0.99999 0.99999 1.00002 1.00000 1.00000 1.00002 0.99997 0.99998 0.99997 1.00001 1.00002 0.99998 1.00000 0.99998 0.99999 1.00003 0.99999 1.00000 1.00000 1.00001 0.99998 0.99999 0.99998 0.99999 1.00002 1.00000 0.99999 1.00003 1.00002 0.99997 0.99998 1.00000 0.99999 1.00001 1.00000 0.99998 0.99998 0.99999 1.00001 1.00001 1.00001 1.00001 1.00003 0.99999 1.00002 1.00000 1.00001 1.00000 1.00002 1.00000 1.00000 0.99999 1.00000 1.00001 1.00000 0.99999 0.99999 0.99998 0.99999 0.99997 1.00002 1.00000 0.99999 1.00002 1.00002 1.00001 1.00002 0.99999 1.00000 1.00000 0.99999 1.00002 1.00001 0.99998 1.00002 1.00002 1.00000 1.00000 1.00003 1.00000 1.00000 1.00000 1.00002 1.00002 1.00000 0.99998 1.00000 1.00000 1.00001 0.99999 1.00000 0.99998 1.00001 1.00001 1.00000 0.99998 1.00001 1.00002 Orthogonality of first eigenvectors (zero expected): Vector 2:-0.000 Vector 3: 0.000-0.000 Vector 4: 0.000-0.000-0.000 Vector 5:-0.000-0.000 0.000 0.000 Vector 6:-0.000-0.000-0.000-0.000-0.000 Vector 7: 0.000 0.000-0.000 0.000-0.000-0.000 Vector 8:-0.000-0.000-0.000 0.000-0.000 0.000-0.000 Vector 9:-0.000 0.000 0.000-0.000-0.000 0.000-0.000-0.000 Vector 10:-0.000 0.000 0.000-0.000-0.000 0.000-0.000 0.000-0.000 Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved. Rtb_to_modes> Normal end. Diagrtb> Normal end. B-factor analysis Bfactors> Version 1.22, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 2602261205572311021.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 2602261205572311021.eigenfacs Getnam> Corresponding pdb filename ? Getnam> 2602261205572311021.atom Openam> file on opening on unit 11: 2602261205572311021.atom Getnum> Number of skipped eigenvectors ? Getnum> 0 Getnum> Number of usefull eigenvectors ? Getnum> 10000 %Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 596 First residue number = 21 Last residue number = 698 Number of atoms found = 9537 Mean number per residue = 16.0 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9564E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9821E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9916E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9931E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9946E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0002E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.2228 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.2658 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.4702 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.099 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.381 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.987 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.602 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.159 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.448 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.217 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.145 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.453 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.078 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.648 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.054 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.547 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.842 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.855 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.19 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.04 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.75 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.14 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.81 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.29 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.83 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.76 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.38 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.89 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.60 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.78 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.11 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.54 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.93 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.04 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.25 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.13 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.94 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.24 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.98 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.86 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.97 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.39 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.53 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.88 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.64 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.50 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.54 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.75 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.89 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 50.45 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 51.44 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 53.66 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 54.68 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 54.78 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 55.76 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 57.96 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 59.18 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 60.13 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 61.72 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 62.40 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 63.61 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 64.47 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 66.55 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 67.05 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 67.57 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 69.27 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 69.65 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 71.83 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 72.48 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 73.33 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 75.15 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 75.23 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 75.89 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 76.65 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 78.78 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 79.34 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 80.86 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 81.86 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 83.17 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 84.10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 85.98 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 86.56 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 87.44 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 89.33 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 91.09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 91.58 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 93.93 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 94.92 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 96.37 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 97.58 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 98.58 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 99.24 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 101.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 102.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 103.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 103.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 103.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 104.8 Bfactors> 106 vectors, 28611 coordinates in file. Openam> file on opening on unit 12: bfactors.pred Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000 Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 0.222800 Bfactors> 100 eigenvectors will be considered. Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped. Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed. (CHARMM units assumed for eigenvalues) Bfactors> Correlation= 0.562 for 596 C-alpha atoms. Bfactors> = 0.026 +/- 0.03 Bfactors> = 112.879 +/- 14.71 Bfactors> Shiftng-fct= 112.852 Bfactors> Scaling-fct= 483.379 Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved. Bfactors> Normal end. check_modes Chkmod> Version 1.00, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 2602261205572311021.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 2602261205572311021.eigenfacs Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4263E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4307E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4324E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4326E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4329E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4342E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 51.25 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 55.98 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 74.46 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 113.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 127.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 153.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 175.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 193.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 201.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 223.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 246.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 253.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 267.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 280.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 308.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 317.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 340.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 340.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 346.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 361.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 376.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 402.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 408.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 417.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 464.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 471.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 482.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 498.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 513.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 530.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 538.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 551.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 565.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 590.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 594.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 605.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 616.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 625.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 632.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 635.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 651.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 659.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 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CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 778.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 795.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 803.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 803.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 810.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 826.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 835.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 842.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 853.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 857.8 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vecteur en lecture: 929.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 941.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 941.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 946.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 950.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 963.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 967.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 976.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 982.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 990.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1078. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1082. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1095. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1099. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1103. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1104. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1106. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1112. Chkmod> 106 vectors, 28611 coordinates in file. Chkmod> That is: 9537 cartesian points. Openam> file on opening on unit 11: Chkmod.res Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file. Chkmod> Normal end. 0.0034 0.7001 0.0034 0.8055 0.0034 0.6298 0.0034 0.7865 0.0034 0.9926 0.0034 0.9948 51.2548 0.7431 55.9827 0.6847 74.4591 0.6853 113.8349 0.0947 127.6067 0.2006 153.0649 0.3791 175.1581 0.4931 192.9974 0.1690 201.6324 0.5905 222.9864 0.2647 246.3028 0.1213 253.5680 0.2109 267.7053 0.2871 279.9769 0.3119 308.1644 0.1211 317.4560 0.0840 340.6578 0.2684 340.8827 0.0920 346.6281 0.0632 361.7746 0.2800 376.7818 0.2303 402.6503 0.2538 408.3206 0.4048 417.8825 0.0933 464.3907 0.1268 471.1962 0.2121 482.6920 0.2464 497.9621 0.5099 513.6966 0.5136 530.7435 0.1988 538.5725 0.4730 551.3382 0.1601 565.3812 0.2859 590.1765 0.3111 594.0596 0.3062 604.9751 0.2182 616.6539 0.3036 625.0106 0.4371 632.6049 0.2678 635.3946 0.3326 651.3392 0.3079 659.2563 0.3949 669.1091 0.3163 681.5059 0.2426 691.2974 0.1750 694.2759 0.2326 700.6998 0.3370 716.1785 0.4466 740.7810 0.4021 758.1654 0.5938 766.9789 0.4662 771.2714 0.4022 778.8021 0.4422 795.4300 0.5203 802.9544 0.5244 803.6883 0.3898 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structure for DQ=-100 2602261205572311021.eigenfacs 2602261205572311021.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2602261205572311021.eigenfacs 2602261205572311021.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2602261205572311021.eigenfacs 2602261205572311021.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2602261205572311021.eigenfacs 2602261205572311021.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2602261205572311021.eigenfacs 2602261205572311021.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2602261205572311021.eigenfacs 2602261205572311021.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2602261205572311021.eigenfacs 2602261205572311021.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2602261205572311021.eigenfacs 2602261205572311021.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2602261205572311021.eigenfacs 2602261205572311021.atom calculating perturbed structure for DQ=80 2602261205572311021.eigenfacs 2602261205572311021.atom calculating perturbed structure for DQ=100 2602261205572311021.eigenfacs 2602261205572311021.atom calculating perturbed structure for DQ=120 2602261205572311021.eigenfacs 2602261205572311021.atom making animated gifs 13 models are in 2602261205572311021.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted MODEL 13 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 13 models are in 2602261205572311021.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted MODEL 13 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 13 models are in 2602261205572311021.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted MODEL 13 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 8 running: ../../bin/get_modes.sh 2602261205572311021 8 -120 120 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 8 calculating perturbed structure for DQ=-120 2602261205572311021.eigenfacs 2602261205572311021.atom calculating perturbed structure for DQ=-100 2602261205572311021.eigenfacs 2602261205572311021.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2602261205572311021.eigenfacs 2602261205572311021.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2602261205572311021.eigenfacs 2602261205572311021.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2602261205572311021.eigenfacs 2602261205572311021.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2602261205572311021.eigenfacs 2602261205572311021.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2602261205572311021.eigenfacs 2602261205572311021.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2602261205572311021.eigenfacs 2602261205572311021.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2602261205572311021.eigenfacs 2602261205572311021.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2602261205572311021.eigenfacs 2602261205572311021.atom calculating perturbed structure for DQ=80 2602261205572311021.eigenfacs 2602261205572311021.atom calculating perturbed structure for DQ=100 2602261205572311021.eigenfacs 2602261205572311021.atom calculating perturbed structure for DQ=120 2602261205572311021.eigenfacs 2602261205572311021.atom making animated gifs 13 models are in 2602261205572311021.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted MODEL 13 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 13 models are in 2602261205572311021.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted MODEL 13 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 13 models are in 2602261205572311021.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted MODEL 13 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 9 running: ../../bin/get_modes.sh 2602261205572311021 9 -120 120 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 9 calculating perturbed structure for DQ=-120 2602261205572311021.eigenfacs 2602261205572311021.atom calculating perturbed structure for DQ=-100 2602261205572311021.eigenfacs 2602261205572311021.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 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