*** ***
Output from eigenvector calculation:
STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8)
Build Tirion matrix:
Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model.
Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004.
Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file.
Pdbmat> Coordinate filename = 2602271310322511251.atom
Pdbmat> Distance cutoff = 8.00
Force constant = 10.00
Origin of mass values = CONS
Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09
PRINTing level = 2
Pdbmat> Coordinate file 2602271310322511251.atom to be opened.
Openam> File opened: 2602271310322511251.atom
Pdbmat> Coordinate file in PDB format.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 311
First residue number = 356
Last residue number = 666
Number of atoms found = 2451
Mean number per residue = 7.9
Pdbmat> Coordinate statistics:
= 6.988776 +/- 8.903301 From: -17.895000 To: 27.520000
= 26.828098 +/- 11.310686 From: 0.604000 To: 57.159000
= -25.162252 +/- 16.349385 From: -61.578000 To: 11.605000
Pdbmat> Masses are all set to one.
Openam> File opened: pdbmat.xyzm
Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved.
Openam> File opened: pdbmat.sdijb
Pdbmat> Matrix statistics:
Pdbmat> The matrix is 3.2208 % Filled.
Pdbmat> 870809 non-zero elements.
Pdbmat> 95137 atom-atom interactions.
Pdbmat> Number per atom= 77.63 +/- 21.31
Maximum number = 126
Minimum number = 10
Pdbmat> Matrix trace = 1.902740E+06
Pdbmat> Larger element = 489.129
Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10
Pdbmat> Normal end.
automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1)
311 non-zero elements, NRBL set to 2
Diagonalize Tirion matrix using diagrtb
Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation.
Diagrtb> Version 2.52, November 2004.
Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file.
Diagrtb> Options taken into account:
MATRix filename = pdbmat.sdijb
COORdinates filename = 2602271310322511251.atom
Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb
Nb of VECTors required = 106
EigeNVALues chosen = LOWE
Type of SUBStructuring = NONE
Nb of residues per BLOck = 2
Origin of MASS values = CONS
MATRix FORMat = BINA
Temporary files cleaning = ALL
Output PRINting level = 2
Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb.
Blocpdb> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.xyzm
Blocpdb> Coordinate file 2602271310322511251.atom to be opened.
Openam> file on opening on unit 11:
2602271310322511251.atom
Blocpdb> Coordinate file in PDB format.
Blocpdb> 2451 atoms picked in pdb file.
Blocpdb> All masses set to unity.
Blocpdb> Coordinate file is rewritten.
Blocpdb> Substructuring:
Blocpdb> 2 residue(s) per block.
Blocpdb> 311 residues.
Blocpdb> 15 atoms in block 1
Block first atom: 1
Blocpdb> 16 atoms in block 2
Block first atom: 16
Blocpdb> 12 atoms in block 3
Block first atom: 32
Blocpdb> 20 atoms in block 4
Block first atom: 44
Blocpdb> 16 atoms in block 5
Block first atom: 64
Blocpdb> 18 atoms in block 6
Block first atom: 80
Blocpdb> 16 atoms in block 7
Block first atom: 98
Blocpdb> 25 atoms in block 8
Block first atom: 114
Blocpdb> 14 atoms in block 9
Block first atom: 139
Blocpdb> 16 atoms in block 10
Block first atom: 153
Blocpdb> 13 atoms in block 11
Block first atom: 169
Blocpdb> 11 atoms in block 12
Block first atom: 182
Blocpdb> 16 atoms in block 13
Block first atom: 193
Blocpdb> 15 atoms in block 14
Block first atom: 209
Blocpdb> 15 atoms in block 15
Block first atom: 224
Blocpdb> 16 atoms in block 16
Block first atom: 239
Blocpdb> 14 atoms in block 17
Block first atom: 255
Blocpdb> 15 atoms in block 18
Block first atom: 269
Blocpdb> 21 atoms in block 19
Block first atom: 284
Blocpdb> 15 atoms in block 20
Block first atom: 305
Blocpdb> 14 atoms in block 21
Block first atom: 320
Blocpdb> 22 atoms in block 22
Block first atom: 334
Blocpdb> 16 atoms in block 23
Block first atom: 356
Blocpdb> 14 atoms in block 24
Block first atom: 372
Blocpdb> 13 atoms in block 25
Block first atom: 386
Blocpdb> 16 atoms in block 26
Block first atom: 399
Blocpdb> 16 atoms in block 27
Block first atom: 415
Blocpdb> 14 atoms in block 28
Block first atom: 431
Blocpdb> 12 atoms in block 29
Block first atom: 445
Blocpdb> 20 atoms in block 30
Block first atom: 457
Blocpdb> 16 atoms in block 31
Block first atom: 477
Blocpdb> 13 atoms in block 32
Block first atom: 493
Blocpdb> 13 atoms in block 33
Block first atom: 506
Blocpdb> 16 atoms in block 34
Block first atom: 519
Blocpdb> 17 atoms in block 35
Block first atom: 535
Blocpdb> 15 atoms in block 36
Block first atom: 552
Blocpdb> 21 atoms in block 37
Block first atom: 567
Blocpdb> 18 atoms in block 38
Block first atom: 588
Blocpdb> 17 atoms in block 39
Block first atom: 606
Blocpdb> 16 atoms in block 40
Block first atom: 623
Blocpdb> 23 atoms in block 41
Block first atom: 639
Blocpdb> 11 atoms in block 42
Block first atom: 662
Blocpdb> 9 atoms in block 43
Block first atom: 673
Blocpdb> 14 atoms in block 44
Block first atom: 682
Blocpdb> 10 atoms in block 45
Block first atom: 696
Blocpdb> 15 atoms in block 46
Block first atom: 706
Blocpdb> 18 atoms in block 47
Block first atom: 721
Blocpdb> 18 atoms in block 48
Block first atom: 739
Blocpdb> 11 atoms in block 49
Block first atom: 757
Blocpdb> 17 atoms in block 50
Block first atom: 768
Blocpdb> 13 atoms in block 51
Block first atom: 785
Blocpdb> 19 atoms in block 52
Block first atom: 798
Blocpdb> 15 atoms in block 53
Block first atom: 817
Blocpdb> 13 atoms in block 54
Block first atom: 832
Blocpdb> 15 atoms in block 55
Block first atom: 845
Blocpdb> 20 atoms in block 56
Block first atom: 860
Blocpdb> 24 atoms in block 57
Block first atom: 880
Blocpdb> 15 atoms in block 58
Block first atom: 904
Blocpdb> 17 atoms in block 59
Block first atom: 919
Blocpdb> 13 atoms in block 60
Block first atom: 936
Blocpdb> 17 atoms in block 61
Block first atom: 949
Blocpdb> 14 atoms in block 62
Block first atom: 966
Blocpdb> 16 atoms in block 63
Block first atom: 980
Blocpdb> 17 atoms in block 64
Block first atom: 996
Blocpdb> 21 atoms in block 65
Block first atom: 1013
Blocpdb> 10 atoms in block 66
Block first atom: 1034
Blocpdb> 13 atoms in block 67
Block first atom: 1044
Blocpdb> 15 atoms in block 68
Block first atom: 1057
Blocpdb> 12 atoms in block 69
Block first atom: 1072
Blocpdb> 22 atoms in block 70
Block first atom: 1084
Blocpdb> 16 atoms in block 71
Block first atom: 1106
Blocpdb> 16 atoms in block 72
Block first atom: 1122
Blocpdb> 10 atoms in block 73
Block first atom: 1138
Blocpdb> 19 atoms in block 74
Block first atom: 1148
Blocpdb> 15 atoms in block 75
Block first atom: 1167
Blocpdb> 15 atoms in block 76
Block first atom: 1182
Blocpdb> 14 atoms in block 77
Block first atom: 1197
Blocpdb> 18 atoms in block 78
Block first atom: 1211
Blocpdb> 17 atoms in block 79
Block first atom: 1229
Blocpdb> 13 atoms in block 80
Block first atom: 1246
Blocpdb> 14 atoms in block 81
Block first atom: 1259
Blocpdb> 15 atoms in block 82
Block first atom: 1273
Blocpdb> 16 atoms in block 83
Block first atom: 1288
Blocpdb> 16 atoms in block 84
Block first atom: 1304
Blocpdb> 13 atoms in block 85
Block first atom: 1320
Blocpdb> 14 atoms in block 86
Block first atom: 1333
Blocpdb> 17 atoms in block 87
Block first atom: 1347
Blocpdb> 19 atoms in block 88
Block first atom: 1364
Blocpdb> 14 atoms in block 89
Block first atom: 1383
Blocpdb> 16 atoms in block 90
Block first atom: 1397
Blocpdb> 15 atoms in block 91
Block first atom: 1413
Blocpdb> 15 atoms in block 92
Block first atom: 1428
Blocpdb> 13 atoms in block 93
Block first atom: 1443
Blocpdb> 18 atoms in block 94
Block first atom: 1456
Blocpdb> 15 atoms in block 95
Block first atom: 1474
Blocpdb> 10 atoms in block 96
Block first atom: 1489
Blocpdb> 18 atoms in block 97
Block first atom: 1499
Blocpdb> 18 atoms in block 98
Block first atom: 1517
Blocpdb> 20 atoms in block 99
Block first atom: 1535
Blocpdb> 15 atoms in block 100
Block first atom: 1555
Blocpdb> 18 atoms in block 101
Block first atom: 1570
Blocpdb> 15 atoms in block 102
Block first atom: 1588
Blocpdb> 16 atoms in block 103
Block first atom: 1603
Blocpdb> 13 atoms in block 104
Block first atom: 1619
Blocpdb> 12 atoms in block 105
Block first atom: 1632
Blocpdb> 14 atoms in block 106
Block first atom: 1644
Blocpdb> 18 atoms in block 107
Block first atom: 1658
Blocpdb> 13 atoms in block 108
Block first atom: 1676
Blocpdb> 20 atoms in block 109
Block first atom: 1689
Blocpdb> 13 atoms in block 110
Block first atom: 1709
Blocpdb> 16 atoms in block 111
Block first atom: 1722
Blocpdb> 19 atoms in block 112
Block first atom: 1738
Blocpdb> 15 atoms in block 113
Block first atom: 1757
Blocpdb> 19 atoms in block 114
Block first atom: 1772
Blocpdb> 14 atoms in block 115
Block first atom: 1791
Blocpdb> 12 atoms in block 116
Block first atom: 1805
Blocpdb> 14 atoms in block 117
Block first atom: 1817
Blocpdb> 22 atoms in block 118
Block first atom: 1831
Blocpdb> 13 atoms in block 119
Block first atom: 1853
Blocpdb> 11 atoms in block 120
Block first atom: 1866
Blocpdb> 14 atoms in block 121
Block first atom: 1877
Blocpdb> 16 atoms in block 122
Block first atom: 1891
Blocpdb> 15 atoms in block 123
Block first atom: 1907
Blocpdb> 15 atoms in block 124
Block first atom: 1922
Blocpdb> 13 atoms in block 125
Block first atom: 1937
Blocpdb> 14 atoms in block 126
Block first atom: 1950
Blocpdb> 17 atoms in block 127
Block first atom: 1964
Blocpdb> 16 atoms in block 128
Block first atom: 1981
Blocpdb> 15 atoms in block 129
Block first atom: 1997
Blocpdb> 21 atoms in block 130
Block first atom: 2012
Blocpdb> 15 atoms in block 131
Block first atom: 2033
Blocpdb> 14 atoms in block 132
Block first atom: 2048
Blocpdb> 11 atoms in block 133
Block first atom: 2062
Blocpdb> 15 atoms in block 134
Block first atom: 2073
Blocpdb> 19 atoms in block 135
Block first atom: 2088
Blocpdb> 17 atoms in block 136
Block first atom: 2107
Blocpdb> 19 atoms in block 137
Block first atom: 2124
Blocpdb> 16 atoms in block 138
Block first atom: 2143
Blocpdb> 19 atoms in block 139
Block first atom: 2159
Blocpdb> 22 atoms in block 140
Block first atom: 2178
Blocpdb> 19 atoms in block 141
Block first atom: 2200
Blocpdb> 19 atoms in block 142
Block first atom: 2219
Blocpdb> 16 atoms in block 143
Block first atom: 2238
Blocpdb> 15 atoms in block 144
Block first atom: 2254
Blocpdb> 10 atoms in block 145
Block first atom: 2269
Blocpdb> 18 atoms in block 146
Block first atom: 2279
Blocpdb> 17 atoms in block 147
Block first atom: 2297
Blocpdb> 14 atoms in block 148
Block first atom: 2314
Blocpdb> 17 atoms in block 149
Block first atom: 2328
Blocpdb> 23 atoms in block 150
Block first atom: 2345
Blocpdb> 16 atoms in block 151
Block first atom: 2368
Blocpdb> 13 atoms in block 152
Block first atom: 2384
Blocpdb> 13 atoms in block 153
Block first atom: 2397
Blocpdb> 17 atoms in block 154
Block first atom: 2410
Blocpdb> 15 atoms in block 155
Block first atom: 2427
Blocpdb> 10 atoms in block 156
Block first atom: 2441
Blocpdb> 156 blocks.
Blocpdb> At most, 25 atoms in each of them.
Blocpdb> At least, 9 atoms in each of them.
Blocpdb> Normal end of Blocpdb.
Diagrtb> Memory allocation for Prepmat.
Diagrtb> Memory allocation for RTB.
Diagrtb> Memory allocation for Diagstd.
Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes.
Prepmat> Entering in.
Prepmat> Rewriting of the matrix begins.
Prepmat> 870965 matrix lines read.
Prepmat> Matrix order = 7353
Prepmat> Matrix trace = 1902740.0000
Prepmat> Last element read: 7353 7353 61.4249
Prepmat> 12247 lines saved.
Prepmat> 10682 empty lines.
Prepmat> Number of lines on output is as expected.
Prepmat> Normal end of Prepmat.
RTB> Entering in.
RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 2451
RTB> Total mass = 2451.0000
RTB> Number of atoms found in matrix: 2451
RTB> Number of blocks = 156
RTB> Projection begins.
RTB> Projected matrix is being saved.
RTB> Projected matrix trace = 203259.7608
RTB> 53964 non-zero elements.
RTB> Normal end of RTB.
Diagstd> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.sdijb
Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb
Diagstd> CERFACS matrix format.
Diagstd> Projected matrix order = 936
Diagstd> Nb of non-zero elements: 53964
Diagstd> Projected matrix trace = 203259.7608
Openam> file on opening on unit 11:
diagrtb_work.eigenfacs
Diagstd> Diagonalization.
Diagstd> 936 eigenvectors are computed.
Diagstd> 106 of them to be saved.
Diagstd> Sum of eigenvalues = 203259.7608
Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000
Diagstd> Selected eigenvalues:
0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000
0.0000000 0.6182156 0.6620716 1.3584605 1.5274057
1.8480827 2.1342572 2.6187566 3.5516022 3.9299299
4.2817030 5.2000725 6.4038461 7.7763652 8.2661362
8.4226668 9.1597264 9.3590065 10.1776578 10.8689732
11.9408692 12.5013517 12.9083436 13.1897513 13.5941337
13.9366319 15.4518133 16.8447271 17.6804947 18.1707257
18.7184259 19.0171176 19.4602945 20.2606442 21.1047133
21.3848430 22.0392112 22.5037377 23.2088147 24.0664681
24.5168260 25.9918286 26.6180489 27.5414442 27.8467537
28.4277703 29.3889274 30.1401199 31.5913758 31.8790671
32.1771460 32.7719372 33.5971225 35.0934121 35.5379589
36.4387051 37.2706255 37.8720038 38.5003838 39.1696448
39.7249388 39.9435907 40.4944624 41.9821357 42.3664721
42.4799576 43.3935087 43.9578460 44.9175972 45.8017791
46.1166174 46.9594718 47.3072920 48.4938664 48.6190550
49.4425428 49.6960355 50.2312465 51.7291478 52.0895613
52.6512808 53.0011148 53.8281175 54.3185876 55.4220394
55.6161740 56.0744872 56.7771434 56.9109739 57.8400026
58.0543403 59.0335296 60.1645698 61.1100184 61.5322522
61.6300940 62.1888110 62.6562428 63.3601070 64.0370268
64.2084018
Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units):
0.0034320 0.0034322 0.0034324 0.0034325 0.0034329
0.0034340 85.3817930 88.3583832 126.5665050 134.2061686
147.6236658 158.6421741 175.7287609 204.6479683 215.2720665
224.7002482 247.6281311 274.7993646 302.8193361 312.2098203
315.1520161 328.6521899 332.2080516 346.4329588 358.0053682
375.2435623 383.9492001 390.1490361 394.3788210 400.3787768
405.3910866 426.8595536 445.6842321 456.6069167 462.8938563
469.8183149 473.5519473 479.0380204 488.7895417 498.8672671
502.1671665 509.7923379 515.1368395 523.1446169 532.7230150
537.6843579 553.6224560 560.2519661 569.8868491 573.0368714
578.9841555 588.6906636 596.1667747 610.3508447 613.1236696
615.9834458 621.6505715 629.4283817 643.2918935 647.3535299
655.5061159 662.9467123 668.2737813 673.7950400 679.6261749
684.4266299 686.3076369 691.0239491 703.6027763 706.8160959
707.7621240 715.3320175 719.9684772 727.7857341 734.9138878
737.4354354 744.1438244 746.8946087 756.2035050 757.1789592
763.5644129 765.5193141 769.6304786 781.0214154 783.7375052
787.9519789 790.5653627 796.7092809 800.3307705 808.4190365
809.8336805 813.1636104 818.2425303 819.2063107 825.8657058
827.3944957 834.3430553 842.2978424 848.8901368 851.8177511
852.4947152 856.3502071 859.5624884 864.3770574 868.9821588
870.1441612
Diagstd> Normal end.
Rtb_to_modes> Entering in.
Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 2451
Rtb_to_modes> Number of blocs = 156
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 11:
matrix.eigenrtb
Rdmodfacs> Entering in.
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Eigenvector number: 1
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9885E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 2
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9900E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 3
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9909E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 4
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9914E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 5
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9940E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 6
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0000E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 7
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.6182
Rdmodfacs> Eigenvector number: 8
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.6621
Rdmodfacs> Eigenvector number: 9
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.358
Rdmodfacs> Eigenvector number: 10
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.527
Rdmodfacs> Eigenvector number: 11
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.848
Rdmodfacs> Eigenvector number: 12
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.134
Rdmodfacs> Eigenvector number: 13
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.619
Rdmodfacs> Eigenvector number: 14
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.552
Rdmodfacs> Eigenvector number: 15
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.930
Rdmodfacs> Eigenvector number: 16
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.282
Rdmodfacs> Eigenvector number: 17
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.200
Rdmodfacs> Eigenvector number: 18
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.404
Rdmodfacs> Eigenvector number: 19
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.776
Rdmodfacs> Eigenvector number: 20
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.266
Rdmodfacs> Eigenvector number: 21
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.423
Rdmodfacs> Eigenvector number: 22
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.160
Rdmodfacs> Eigenvector number: 23
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.359
Rdmodfacs> Eigenvector number: 24
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.18
Rdmodfacs> Eigenvector number: 25
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.87
Rdmodfacs> Eigenvector number: 26
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.94
Rdmodfacs> Eigenvector number: 27
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.50
Rdmodfacs> Eigenvector number: 28
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.91
Rdmodfacs> Eigenvector number: 29
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.19
Rdmodfacs> Eigenvector number: 30
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.59
Rdmodfacs> Eigenvector number: 31
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.94
Rdmodfacs> Eigenvector number: 32
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.45
Rdmodfacs> Eigenvector number: 33
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.84
Rdmodfacs> Eigenvector number: 34
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.68
Rdmodfacs> Eigenvector number: 35
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.17
Rdmodfacs> Eigenvector number: 36
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.72
Rdmodfacs> Eigenvector number: 37
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.02
Rdmodfacs> Eigenvector number: 38
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.46
Rdmodfacs> Eigenvector number: 39
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.26
Rdmodfacs> Eigenvector number: 40
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 41
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.38
Rdmodfacs> Eigenvector number: 42
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.04
Rdmodfacs> Eigenvector number: 43
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.50
Rdmodfacs> Eigenvector number: 44
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.21
Rdmodfacs> Eigenvector number: 45
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.07
Rdmodfacs> Eigenvector number: 46
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.52
Rdmodfacs> Eigenvector number: 47
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.99
Rdmodfacs> Eigenvector number: 48
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.62
Rdmodfacs> Eigenvector number: 49
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.54
Rdmodfacs> Eigenvector number: 50
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.85
Rdmodfacs> Eigenvector number: 51
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.43
Rdmodfacs> Eigenvector number: 52
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.39
Rdmodfacs> Eigenvector number: 53
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.14
Rdmodfacs> Eigenvector number: 54
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.59
Rdmodfacs> Eigenvector number: 55
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.88
Rdmodfacs> Eigenvector number: 56
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.18
Rdmodfacs> Eigenvector number: 57
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.77
Rdmodfacs> Eigenvector number: 58
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.60
Rdmodfacs> Eigenvector number: 59
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 60
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.54
Rdmodfacs> Eigenvector number: 61
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.44
Rdmodfacs> Eigenvector number: 62
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.27
Rdmodfacs> Eigenvector number: 63
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.87
Rdmodfacs> Eigenvector number: 64
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.50
Rdmodfacs> Eigenvector number: 65
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.17
Rdmodfacs> Eigenvector number: 66
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.72
Rdmodfacs> Eigenvector number: 67
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.94
Rdmodfacs> Eigenvector number: 68
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.49
Rdmodfacs> Eigenvector number: 69
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.98
Rdmodfacs> Eigenvector number: 70
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.37
Rdmodfacs> Eigenvector number: 71
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.48
Rdmodfacs> Eigenvector number: 72
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.39
Rdmodfacs> Eigenvector number: 73
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.96
Rdmodfacs> Eigenvector number: 74
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.92
Rdmodfacs> Eigenvector number: 75
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.80
Rdmodfacs> Eigenvector number: 76
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.12
Rdmodfacs> Eigenvector number: 77
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.96
Rdmodfacs> Eigenvector number: 78
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 47.31
Rdmodfacs> Eigenvector number: 79
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 48.49
Rdmodfacs> Eigenvector number: 80
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 48.62
Rdmodfacs> Eigenvector number: 81
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 49.44
Rdmodfacs> Eigenvector number: 82
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 49.70
Rdmodfacs> Eigenvector number: 83
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 50.23
Rdmodfacs> Eigenvector number: 84
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 51.73
Rdmodfacs> Eigenvector number: 85
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 52.09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 86
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 52.65
Rdmodfacs> Eigenvector number: 87
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 53.00
Rdmodfacs> Eigenvector number: 88
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 53.83
Rdmodfacs> Eigenvector number: 89
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 54.32
Rdmodfacs> Eigenvector number: 90
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 55.42
Rdmodfacs> Eigenvector number: 91
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 55.62
Rdmodfacs> Eigenvector number: 92
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 56.07
Rdmodfacs> Eigenvector number: 93
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 56.78
Rdmodfacs> Eigenvector number: 94
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 56.91
Rdmodfacs> Eigenvector number: 95
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 57.84
Rdmodfacs> Eigenvector number: 96
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 58.05
Rdmodfacs> Eigenvector number: 97
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 59.03
Rdmodfacs> Eigenvector number: 98
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 60.16
Rdmodfacs> Eigenvector number: 99
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 61.11
Rdmodfacs> Eigenvector number: 100
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 61.53
Rdmodfacs> Eigenvector number: 101
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 61.63
Rdmodfacs> Eigenvector number: 102
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 62.19
Rdmodfacs> Eigenvector number: 103
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 62.66
Rdmodfacs> Eigenvector number: 104
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 63.36
Rdmodfacs> Eigenvector number: 105
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 64.04
Rdmodfacs> Eigenvector number: 106
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 64.21
Rtb_to_modes> 106 vectors, with 936 coordinates in vector file.
Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected):
1.00000 1.00001 1.00001 1.00002 0.99998
1.00000 1.00002 1.00001 1.00000 1.00001
1.00003 1.00001 0.99998 0.99997 0.99995
0.99997 1.00002 0.99998 0.99998 0.99999
1.00001 1.00002 1.00004 1.00002 0.99998
1.00004 0.99998 0.99998 1.00000 0.99998
1.00000 1.00002 1.00000 0.99998 0.99998
1.00002 0.99995 0.99999 1.00001 1.00000
0.99999 1.00001 1.00000 1.00000 1.00002
1.00000 1.00001 1.00002 1.00001 1.00000
0.99999 1.00000 0.99998 1.00000 1.00000
1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000
1.00002 0.99999 1.00001 1.00002 1.00000
1.00002 0.99999 0.99998 1.00001 1.00000
1.00001 1.00003 0.99999 1.00001 1.00001
0.99999 1.00000 0.99998 1.00000 0.99999
1.00001 1.00001 0.99999 1.00000 0.99998
1.00002 1.00001 1.00002 0.99998 1.00000
0.99999 1.00002 1.00000 0.99999 1.00002
1.00000 1.00002 1.00001 1.00000 0.99999
1.00002 0.99998 1.00001 1.00002 0.99999
1.00000
Rtb_to_modes> RTB block-file is being read.
Rtb_to_modes> 44118 lines found in RTB file.
Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected):
1.00000 1.00001 1.00001 1.00002 0.99998
1.00000 1.00002 1.00001 1.00000 1.00001
1.00003 1.00001 0.99998 0.99997 0.99995
0.99997 1.00002 0.99998 0.99998 0.99999
1.00001 1.00002 1.00004 1.00002 0.99998
1.00004 0.99998 0.99998 1.00000 0.99998
1.00000 1.00002 1.00000 0.99998 0.99998
1.00002 0.99995 0.99999 1.00001 1.00000
0.99999 1.00001 1.00000 1.00000 1.00002
1.00000 1.00001 1.00002 1.00001 1.00000
0.99999 1.00000 0.99998 1.00000 1.00000
1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000
1.00002 0.99999 1.00001 1.00002 1.00000
1.00002 0.99999 0.99998 1.00001 1.00000
1.00001 1.00003 0.99999 1.00001 1.00001
0.99999 1.00000 0.99998 1.00000 0.99999
1.00001 1.00001 0.99999 1.00000 0.99998
1.00002 1.00001 1.00002 0.99998 1.00000
0.99999 1.00002 1.00000 0.99999 1.00002
1.00000 1.00002 1.00001 1.00000 0.99999
1.00002 0.99998 1.00001 1.00002 0.99999
1.00000
Orthogonality of first eigenvectors (zero expected):
Vector 2:-0.000
Vector 3:-0.000-0.000
Vector 4:-0.000-0.000 0.000
Vector 5: 0.000 0.000-0.000-0.000
Vector 6:-0.000 0.000-0.000-0.000 0.000
Vector 7:-0.000 0.000 0.000-0.000-0.000-0.000
Vector 8: 0.000 0.000-0.000 0.000-0.000 0.000 0.000
Vector 9: 0.000-0.000-0.000 0.000 0.000 0.000-0.000 0.000
Vector 10: 0.000-0.000 0.000 0.000-0.000-0.000-0.000 0.000-0.000
Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved.
Rtb_to_modes> Normal end.
Diagrtb> Normal end.
B-factor analysis
Bfactors> Version 1.22, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 2602271310322511251.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
2602271310322511251.eigenfacs
Getnam> Corresponding pdb filename ?
Getnam> 2602271310322511251.atom
Openam> file on opening on unit 11:
2602271310322511251.atom
Getnum> Number of skipped eigenvectors ?
Getnum> 0
Getnum> Number of usefull eigenvectors ?
Getnum> 10000
%Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 311
First residue number = 356
Last residue number = 666
Number of atoms found = 2451
Mean number per residue = 7.9
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9885E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9900E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9909E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9914E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9940E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0000E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.6182
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.6621
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.358
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.527
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.848
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.134
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.619
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.552
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.930
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.282
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.200
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.404
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.776
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.266
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.423
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.160
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.359
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.18
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.87
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.94
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.50
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.91
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.19
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.59
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.94
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.45
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.84
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.68
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.17
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.72
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.02
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.46
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.26
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.38
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.04
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.50
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.21
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.07
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.52
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.99
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.62
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.54
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.85
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.43
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.39
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.14
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.59
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.88
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.18
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.77
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.60
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.54
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.44
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.27
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.87
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.50
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.17
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.72
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.94
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.49
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.98
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.37
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.48
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.39
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.96
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.92
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.80
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.12
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.96
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.31
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.49
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.62
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.44
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.70
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 50.23
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 51.73
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 52.09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 52.65
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 53.00
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 53.83
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 54.32
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 55.42
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 55.62
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 56.07
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 56.78
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 56.91
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 57.84
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 58.05
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 59.03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 60.16
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 61.11
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 61.53
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 61.63
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 62.19
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 62.66
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 63.36
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 64.04
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 64.21
Bfactors> 106 vectors, 7353 coordinates in file.
Openam> file on opening on unit 12:
bfactors.pred
Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000
Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 0.618200
Bfactors> 100 eigenvectors will be considered.
Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped.
Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed.
(CHARMM units assumed for eigenvalues)
Bfactors> Correlation= -0.671 for 311 C-alpha atoms.
Bfactors> = 0.058 +/- 0.13
Bfactors> = 81.012 +/- 9.43
Bfactors> Shiftng-fct= 80.954
Bfactors> Scaling-fct= 71.022
Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved.
Bfactors> Normal end.
check_modes
Chkmod> Version 1.00, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 2602271310322511251.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
2602271310322511251.eigenfacs
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4318E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4321E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4323E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4323E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4328E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4338E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 85.38
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 88.36
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 126.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 134.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 147.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 158.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 175.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 204.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 215.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 224.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 247.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 274.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 302.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 312.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 315.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 328.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 332.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 346.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 358.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 375.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 383.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 390.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 394.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 400.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 405.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 426.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 445.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 456.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 462.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 469.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 473.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 479.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 488.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 498.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 502.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 509.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 515.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 523.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 532.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 537.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 553.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 560.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 569.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 573.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 579.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 588.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 596.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 610.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 613.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 616.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 621.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 629.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 643.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 647.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 655.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 662.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 668.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 673.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 679.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 684.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 686.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 691.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 703.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 706.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 707.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 715.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 720.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 727.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 734.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 737.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 744.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 746.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 756.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 757.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 763.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 765.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 769.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 781.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 783.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 787.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 790.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 796.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 800.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 808.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 809.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 813.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 818.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 819.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 825.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 827.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 834.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 842.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 848.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 851.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 852.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 856.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 859.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 864.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 869.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 870.1
Chkmod> 106 vectors, 7353 coordinates in file.
Chkmod> That is: 2451 cartesian points.
Openam> file on opening on unit 11:
Chkmod.res
Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file.
%Chkmod-Wn> Norm of vector 37 is: 0.9999 (instead of 1.0000).
Chkmod> Normal end.
0.0034 0.9437
0.0034 0.8737
0.0034 0.8443
0.0034 0.7689
0.0034 0.6580
0.0034 0.9737
85.3770 0.0722
88.3565 0.0834
126.5396 0.3846
134.1826 0.2678
147.6140 0.4194
158.6258 0.3876
175.7294 0.4830
204.6506 0.0774
215.2647 0.2453
224.6984 0.2089
247.6158 0.2963
274.7909 0.5577
302.7992 0.5206
312.1938 0.3540
315.1447 0.4637
328.6430 0.4986
332.1937 0.4398
346.4579 0.4714
358.0069 0.2011
375.2138 0.2235
383.9120 0.0787
390.1573 0.4804
394.3656 0.1682
400.3007 0.5258
405.4227 0.1930
426.8162 0.4199
445.6026 0.5221
456.5809 0.4924
462.8647 0.5082
469.8179 0.5010
473.5675 0.1318
479.0138 0.4041
488.7608 0.4690
498.7901 0.2900
502.0887 0.4905
509.7796 0.4227
515.0719 0.4279
523.1355 0.3801
532.7392 0.4600
537.6961 0.4191
553.5792 0.2241
560.2484 0.4077
569.8474 0.5479
573.0457 0.4587
578.9820 0.4693
588.6761 0.5487
596.1400 0.3563
610.3114 0.5379
613.1063 0.5857
615.9843 0.4480
621.6055 0.4372
629.4283 0.4830
643.2330 0.3562
647.3443 0.5476
655.4896 0.3641
662.9127 0.4550
668.2274 0.4906
673.7628 0.4619
679.6001 0.3931
684.3547 0.4251
686.2473 0.5661
690.9562 0.5160
703.5547 0.3446
706.8152 0.4079
707.7321 0.3356
715.2724 0.3474
719.9552 0.5305
727.7740 0.4440
734.8681 0.5266
737.4308 0.4020
744.1161 0.4242
746.8839 0.3189
756.1409 0.4064
757.1538 0.4760
763.5120 0.5215
765.5170 0.5251
769.5879 0.3650
780.9943 0.5535
783.7072 0.4715
787.9086 0.4603
790.5231 0.3958
796.6890 0.4965
800.3068 0.2688
808.3695 0.3438
809.8268 0.3673
813.0962 0.4335
818.2280 0.4614
819.1641 0.5078
825.8302 0.3497
827.3280 0.3068
834.2823 0.4885
842.2297 0.4567
848.8536 0.3931
851.7656 0.4929
852.4575 0.3819
856.3216 0.4269
859.5514 0.4873
864.3392 0.4195
868.9650 0.4187
870.1176 0.4512
getting mode 7
running: ../../bin/get_modes.sh 2602271310322511251 7 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 7
calculating perturbed structure for DQ=-100
2602271310322511251.eigenfacs
2602271310322511251.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2602271310322511251.eigenfacs
2602271310322511251.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2602271310322511251.eigenfacs
2602271310322511251.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2602271310322511251.eigenfacs
2602271310322511251.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2602271310322511251.eigenfacs
2602271310322511251.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2602271310322511251.eigenfacs
2602271310322511251.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2602271310322511251.eigenfacs
2602271310322511251.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2602271310322511251.eigenfacs
2602271310322511251.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2602271310322511251.eigenfacs
2602271310322511251.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2602271310322511251.eigenfacs
2602271310322511251.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2602271310322511251.eigenfacs
2602271310322511251.atom
making animated gifs
11 models are in 2602271310322511251.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2602271310322511251.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2602271310322511251.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 8
running: ../../bin/get_modes.sh 2602271310322511251 8 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 8
calculating perturbed structure for DQ=-100
2602271310322511251.eigenfacs
2602271310322511251.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2602271310322511251.eigenfacs
2602271310322511251.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2602271310322511251.eigenfacs
2602271310322511251.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2602271310322511251.eigenfacs
2602271310322511251.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2602271310322511251.eigenfacs
2602271310322511251.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2602271310322511251.eigenfacs
2602271310322511251.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2602271310322511251.eigenfacs
2602271310322511251.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2602271310322511251.eigenfacs
2602271310322511251.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2602271310322511251.eigenfacs
2602271310322511251.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2602271310322511251.eigenfacs
2602271310322511251.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2602271310322511251.eigenfacs
2602271310322511251.atom
making animated gifs
11 models are in 2602271310322511251.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2602271310322511251.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2602271310322511251.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 9
running: ../../bin/get_modes.sh 2602271310322511251 9 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 9
calculating perturbed structure for DQ=-100
2602271310322511251.eigenfacs
2602271310322511251.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2602271310322511251.eigenfacs
2602271310322511251.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2602271310322511251.eigenfacs
2602271310322511251.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2602271310322511251.eigenfacs
2602271310322511251.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2602271310322511251.eigenfacs
2602271310322511251.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2602271310322511251.eigenfacs
2602271310322511251.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2602271310322511251.eigenfacs
2602271310322511251.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2602271310322511251.eigenfacs
2602271310322511251.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2602271310322511251.eigenfacs
2602271310322511251.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2602271310322511251.eigenfacs
2602271310322511251.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2602271310322511251.eigenfacs
2602271310322511251.atom
making animated gifs
11 models are in 2602271310322511251.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2602271310322511251.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2602271310322511251.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 10
running: ../../bin/get_modes.sh 2602271310322511251 10 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 10
calculating perturbed structure for DQ=-100
2602271310322511251.eigenfacs
2602271310322511251.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2602271310322511251.eigenfacs
2602271310322511251.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2602271310322511251.eigenfacs
2602271310322511251.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2602271310322511251.eigenfacs
2602271310322511251.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2602271310322511251.eigenfacs
2602271310322511251.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2602271310322511251.eigenfacs
2602271310322511251.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2602271310322511251.eigenfacs
2602271310322511251.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2602271310322511251.eigenfacs
2602271310322511251.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2602271310322511251.eigenfacs
2602271310322511251.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2602271310322511251.eigenfacs
2602271310322511251.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2602271310322511251.eigenfacs
2602271310322511251.atom
making animated gifs
11 models are in 2602271310322511251.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2602271310322511251.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2602271310322511251.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 11
running: ../../bin/get_modes.sh 2602271310322511251 11 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 11
calculating perturbed structure for DQ=-100
2602271310322511251.eigenfacs
2602271310322511251.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2602271310322511251.eigenfacs
2602271310322511251.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2602271310322511251.eigenfacs
2602271310322511251.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2602271310322511251.eigenfacs
2602271310322511251.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2602271310322511251.eigenfacs
2602271310322511251.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2602271310322511251.eigenfacs
2602271310322511251.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2602271310322511251.eigenfacs
2602271310322511251.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2602271310322511251.eigenfacs
2602271310322511251.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2602271310322511251.eigenfacs
2602271310322511251.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2602271310322511251.eigenfacs
2602271310322511251.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2602271310322511251.eigenfacs
2602271310322511251.atom
making animated gifs
11 models are in 2602271310322511251.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2602271310322511251.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2602271310322511251.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
2602271310322511251.10.pdb
2602271310322511251.11.pdb
2602271310322511251.7.pdb
2602271310322511251.8.pdb
2602271310322511251.9.pdb
STDERR:
Note: The following floating-point exceptions are signalling: IEEE_DENORMAL
real 0m13.293s
user 0m13.194s
sys 0m0.090s
rm: cannot remove '2602271310322511251.sdijf': No such file or directory
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
If you find results from this site helpful for your research, please cite one of our papers:
elNémo
is maintained by Yves-Henri Sanejouand.
It was developed
by Karsten Suhre.
Between 2003 and 2014, it was hosted by IGS (Marseille).
Between 2015 and 2025, it was hosted by US2B (Nantes).
Last modification: december 26th, 2025.
|
