***    ***
Output from eigenvector calculation:
STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8)
Build Tirion matrix:
Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model.
Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004.
Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file.
Pdbmat> Coordinate filename = 2602271346112519717.atom
Pdbmat> Distance cutoff = 8.00
Force constant = 10.00
Origin of mass values = CONS
Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09
PRINTing level = 2
Pdbmat> Coordinate file 2602271346112519717.atom to be opened.
Openam> File opened: 2602271346112519717.atom
Pdbmat> Coordinate file in PDB format.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 312
First residue number = 356
Last residue number = 1
Number of atoms found = 2480
Mean number per residue = 7.9
Pdbmat> Coordinate statistics:
= 7.003862 +/- 8.854010 From: -17.895000 To: 27.520000
= 26.627087 +/- 11.395909 From: 0.604000 To: 57.159000
= -25.223923 +/- 16.268064 From: -61.578000 To: 11.605000
Pdbmat> Masses are all set to one.
%Pdbmat-W> residue:'UNL ' is not a well known amino-acid.
%Pdbmat-W> 1 residue(s) not known.
Openam> File opened: pdbmat.xyzm
Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved.
Openam> File opened: pdbmat.sdijb
Pdbmat> Matrix statistics:
Pdbmat> The matrix is 3.1943 % Filled.
Pdbmat> 884204 non-zero elements.
Pdbmat> 96606 atom-atom interactions.
Pdbmat> Number per atom= 77.91 +/- 21.39
Maximum number = 126
Minimum number = 10
Pdbmat> Matrix trace = 1.932120E+06
Pdbmat> Larger element = 505.683
Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10
Pdbmat> Normal end.
automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1)
312 non-zero elements, NRBL set to 2
Diagonalize Tirion matrix using diagrtb
Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation.
Diagrtb> Version 2.52, November 2004.
Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file.
Diagrtb> Options taken into account:
MATRix filename = pdbmat.sdijb
COORdinates filename = 2602271346112519717.atom
Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb
Nb of VECTors required = 106
EigeNVALues chosen = LOWE
Type of SUBStructuring = NONE
Nb of residues per BLOck = 2
Origin of MASS values = CONS
MATRix FORMat = BINA
Temporary files cleaning = ALL
Output PRINting level = 2
Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb.
Blocpdb> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.xyzm
Blocpdb> Coordinate file 2602271346112519717.atom to be opened.
Openam> file on opening on unit 11:
2602271346112519717.atom
Blocpdb> Coordinate file in PDB format.
Blocpdb> 2480 atoms picked in pdb file.
Blocpdb> All masses set to unity.
Blocpdb> Coordinate file is rewritten.
Blocpdb> Substructuring:
Blocpdb> 2 residue(s) per block.
Blocpdb> 312 residues.
Blocpdb> 15 atoms in block 1
Block first atom: 1
Blocpdb> 16 atoms in block 2
Block first atom: 16
Blocpdb> 12 atoms in block 3
Block first atom: 32
Blocpdb> 20 atoms in block 4
Block first atom: 44
Blocpdb> 16 atoms in block 5
Block first atom: 64
Blocpdb> 18 atoms in block 6
Block first atom: 80
Blocpdb> 16 atoms in block 7
Block first atom: 98
Blocpdb> 25 atoms in block 8
Block first atom: 114
Blocpdb> 14 atoms in block 9
Block first atom: 139
Blocpdb> 16 atoms in block 10
Block first atom: 153
Blocpdb> 13 atoms in block 11
Block first atom: 169
Blocpdb> 11 atoms in block 12
Block first atom: 182
Blocpdb> 16 atoms in block 13
Block first atom: 193
Blocpdb> 15 atoms in block 14
Block first atom: 209
Blocpdb> 15 atoms in block 15
Block first atom: 224
Blocpdb> 16 atoms in block 16
Block first atom: 239
Blocpdb> 14 atoms in block 17
Block first atom: 255
Blocpdb> 15 atoms in block 18
Block first atom: 269
Blocpdb> 21 atoms in block 19
Block first atom: 284
Blocpdb> 15 atoms in block 20
Block first atom: 305
Blocpdb> 14 atoms in block 21
Block first atom: 320
Blocpdb> 22 atoms in block 22
Block first atom: 334
Blocpdb> 16 atoms in block 23
Block first atom: 356
Blocpdb> 14 atoms in block 24
Block first atom: 372
Blocpdb> 13 atoms in block 25
Block first atom: 386
Blocpdb> 16 atoms in block 26
Block first atom: 399
Blocpdb> 16 atoms in block 27
Block first atom: 415
Blocpdb> 14 atoms in block 28
Block first atom: 431
Blocpdb> 12 atoms in block 29
Block first atom: 445
Blocpdb> 20 atoms in block 30
Block first atom: 457
Blocpdb> 16 atoms in block 31
Block first atom: 477
Blocpdb> 13 atoms in block 32
Block first atom: 493
Blocpdb> 13 atoms in block 33
Block first atom: 506
Blocpdb> 16 atoms in block 34
Block first atom: 519
Blocpdb> 17 atoms in block 35
Block first atom: 535
Blocpdb> 15 atoms in block 36
Block first atom: 552
Blocpdb> 21 atoms in block 37
Block first atom: 567
Blocpdb> 18 atoms in block 38
Block first atom: 588
Blocpdb> 17 atoms in block 39
Block first atom: 606
Blocpdb> 16 atoms in block 40
Block first atom: 623
Blocpdb> 23 atoms in block 41
Block first atom: 639
Blocpdb> 11 atoms in block 42
Block first atom: 662
Blocpdb> 9 atoms in block 43
Block first atom: 673
Blocpdb> 14 atoms in block 44
Block first atom: 682
Blocpdb> 10 atoms in block 45
Block first atom: 696
Blocpdb> 15 atoms in block 46
Block first atom: 706
Blocpdb> 18 atoms in block 47
Block first atom: 721
Blocpdb> 18 atoms in block 48
Block first atom: 739
Blocpdb> 11 atoms in block 49
Block first atom: 757
Blocpdb> 17 atoms in block 50
Block first atom: 768
Blocpdb> 13 atoms in block 51
Block first atom: 785
Blocpdb> 19 atoms in block 52
Block first atom: 798
Blocpdb> 15 atoms in block 53
Block first atom: 817
Blocpdb> 13 atoms in block 54
Block first atom: 832
Blocpdb> 15 atoms in block 55
Block first atom: 845
Blocpdb> 20 atoms in block 56
Block first atom: 860
Blocpdb> 24 atoms in block 57
Block first atom: 880
Blocpdb> 15 atoms in block 58
Block first atom: 904
Blocpdb> 17 atoms in block 59
Block first atom: 919
Blocpdb> 13 atoms in block 60
Block first atom: 936
Blocpdb> 17 atoms in block 61
Block first atom: 949
Blocpdb> 14 atoms in block 62
Block first atom: 966
Blocpdb> 16 atoms in block 63
Block first atom: 980
Blocpdb> 17 atoms in block 64
Block first atom: 996
Blocpdb> 21 atoms in block 65
Block first atom: 1013
Blocpdb> 10 atoms in block 66
Block first atom: 1034
Blocpdb> 13 atoms in block 67
Block first atom: 1044
Blocpdb> 15 atoms in block 68
Block first atom: 1057
Blocpdb> 12 atoms in block 69
Block first atom: 1072
Blocpdb> 22 atoms in block 70
Block first atom: 1084
Blocpdb> 16 atoms in block 71
Block first atom: 1106
Blocpdb> 16 atoms in block 72
Block first atom: 1122
Blocpdb> 10 atoms in block 73
Block first atom: 1138
Blocpdb> 19 atoms in block 74
Block first atom: 1148
Blocpdb> 15 atoms in block 75
Block first atom: 1167
Blocpdb> 15 atoms in block 76
Block first atom: 1182
Blocpdb> 14 atoms in block 77
Block first atom: 1197
Blocpdb> 18 atoms in block 78
Block first atom: 1211
Blocpdb> 17 atoms in block 79
Block first atom: 1229
Blocpdb> 13 atoms in block 80
Block first atom: 1246
Blocpdb> 14 atoms in block 81
Block first atom: 1259
Blocpdb> 15 atoms in block 82
Block first atom: 1273
Blocpdb> 16 atoms in block 83
Block first atom: 1288
Blocpdb> 16 atoms in block 84
Block first atom: 1304
Blocpdb> 13 atoms in block 85
Block first atom: 1320
Blocpdb> 14 atoms in block 86
Block first atom: 1333
Blocpdb> 17 atoms in block 87
Block first atom: 1347
Blocpdb> 19 atoms in block 88
Block first atom: 1364
Blocpdb> 14 atoms in block 89
Block first atom: 1383
Blocpdb> 16 atoms in block 90
Block first atom: 1397
Blocpdb> 15 atoms in block 91
Block first atom: 1413
Blocpdb> 15 atoms in block 92
Block first atom: 1428
Blocpdb> 13 atoms in block 93
Block first atom: 1443
Blocpdb> 18 atoms in block 94
Block first atom: 1456
Blocpdb> 15 atoms in block 95
Block first atom: 1474
Blocpdb> 10 atoms in block 96
Block first atom: 1489
Blocpdb> 18 atoms in block 97
Block first atom: 1499
Blocpdb> 18 atoms in block 98
Block first atom: 1517
Blocpdb> 20 atoms in block 99
Block first atom: 1535
Blocpdb> 15 atoms in block 100
Block first atom: 1555
Blocpdb> 18 atoms in block 101
Block first atom: 1570
Blocpdb> 15 atoms in block 102
Block first atom: 1588
Blocpdb> 16 atoms in block 103
Block first atom: 1603
Blocpdb> 13 atoms in block 104
Block first atom: 1619
Blocpdb> 12 atoms in block 105
Block first atom: 1632
Blocpdb> 14 atoms in block 106
Block first atom: 1644
Blocpdb> 18 atoms in block 107
Block first atom: 1658
Blocpdb> 13 atoms in block 108
Block first atom: 1676
Blocpdb> 20 atoms in block 109
Block first atom: 1689
Blocpdb> 13 atoms in block 110
Block first atom: 1709
Blocpdb> 16 atoms in block 111
Block first atom: 1722
Blocpdb> 19 atoms in block 112
Block first atom: 1738
Blocpdb> 15 atoms in block 113
Block first atom: 1757
Blocpdb> 19 atoms in block 114
Block first atom: 1772
Blocpdb> 14 atoms in block 115
Block first atom: 1791
Blocpdb> 12 atoms in block 116
Block first atom: 1805
Blocpdb> 14 atoms in block 117
Block first atom: 1817
Blocpdb> 22 atoms in block 118
Block first atom: 1831
Blocpdb> 13 atoms in block 119
Block first atom: 1853
Blocpdb> 11 atoms in block 120
Block first atom: 1866
Blocpdb> 14 atoms in block 121
Block first atom: 1877
Blocpdb> 16 atoms in block 122
Block first atom: 1891
Blocpdb> 15 atoms in block 123
Block first atom: 1907
Blocpdb> 15 atoms in block 124
Block first atom: 1922
Blocpdb> 13 atoms in block 125
Block first atom: 1937
Blocpdb> 14 atoms in block 126
Block first atom: 1950
Blocpdb> 17 atoms in block 127
Block first atom: 1964
Blocpdb> 16 atoms in block 128
Block first atom: 1981
Blocpdb> 15 atoms in block 129
Block first atom: 1997
Blocpdb> 21 atoms in block 130
Block first atom: 2012
Blocpdb> 15 atoms in block 131
Block first atom: 2033
Blocpdb> 14 atoms in block 132
Block first atom: 2048
Blocpdb> 11 atoms in block 133
Block first atom: 2062
Blocpdb> 15 atoms in block 134
Block first atom: 2073
Blocpdb> 19 atoms in block 135
Block first atom: 2088
Blocpdb> 17 atoms in block 136
Block first atom: 2107
Blocpdb> 19 atoms in block 137
Block first atom: 2124
Blocpdb> 16 atoms in block 138
Block first atom: 2143
Blocpdb> 19 atoms in block 139
Block first atom: 2159
Blocpdb> 22 atoms in block 140
Block first atom: 2178
Blocpdb> 19 atoms in block 141
Block first atom: 2200
Blocpdb> 19 atoms in block 142
Block first atom: 2219
Blocpdb> 16 atoms in block 143
Block first atom: 2238
Blocpdb> 15 atoms in block 144
Block first atom: 2254
Blocpdb> 10 atoms in block 145
Block first atom: 2269
Blocpdb> 18 atoms in block 146
Block first atom: 2279
Blocpdb> 17 atoms in block 147
Block first atom: 2297
Blocpdb> 14 atoms in block 148
Block first atom: 2314
Blocpdb> 17 atoms in block 149
Block first atom: 2328
Blocpdb> 23 atoms in block 150
Block first atom: 2345
Blocpdb> 16 atoms in block 151
Block first atom: 2368
Blocpdb> 13 atoms in block 152
Block first atom: 2384
Blocpdb> 13 atoms in block 153
Block first atom: 2397
Blocpdb> 17 atoms in block 154
Block first atom: 2410
Blocpdb> 15 atoms in block 155
Block first atom: 2427
Blocpdb> 10 atoms in block 156
Block first atom: 2442
Blocpdb> 29 atoms in block 157
Block first atom: 2451
Blocpdb> 157 blocks.
Blocpdb> At most, 29 atoms in each of them.
Blocpdb> At least, 9 atoms in each of them.
Blocpdb> Normal end of Blocpdb.
Diagrtb> Memory allocation for Prepmat.
Diagrtb> Memory allocation for RTB.
Diagrtb> Memory allocation for Diagstd.
Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes.
Prepmat> Entering in.
Prepmat> Rewriting of the matrix begins.
Prepmat> 884361 matrix lines read.
Prepmat> Matrix order = 7440
Prepmat> Matrix trace = 1932120.0000
Prepmat> Last element read: 7440 7440 152.1377
Prepmat> 12404 lines saved.
Prepmat> 10820 empty lines.
Prepmat> Number of lines on output is as expected.
Prepmat> Normal end of Prepmat.
RTB> Entering in.
RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 2480
RTB> Total mass = 2480.0000
RTB> Number of atoms found in matrix: 2480
RTB> Number of blocks = 157
RTB> Projection begins.
RTB> Projected matrix is being saved.
RTB> Projected matrix trace = 205597.3810
RTB> 54633 non-zero elements.
RTB> Normal end of RTB.
Diagstd> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.sdijb
Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb
Diagstd> CERFACS matrix format.
Diagstd> Projected matrix order = 942
Diagstd> Nb of non-zero elements: 54633
Diagstd> Projected matrix trace = 205597.3810
Openam> file on opening on unit 11:
diagrtb_work.eigenfacs
Diagstd> Diagonalization.
Diagstd> 942 eigenvectors are computed.
Diagstd> 106 of them to be saved.
Diagstd> Sum of eigenvalues = 205597.3810
Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000
Diagstd> Selected eigenvalues:
0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000
0.0000000 0.6182489 0.6621793 1.3809226 1.5332126
1.8942867 2.2084452 2.7246672 3.5569102 3.9924206
4.3531999 5.2794384 6.4087529 7.8050391 8.3457315
8.6301191 9.2516365 9.4799934 10.5381489 10.8847758
12.0047961 12.6176258 12.9501434 13.2577999 13.5642467
13.9502019 15.8666285 16.8152658 17.6105358 18.1922074
18.8870329 19.1469397 19.4972758 19.9922754 20.9760180
21.2206275 21.8785941 22.5305214 23.3623220 23.8850472
24.3747767 25.3839153 26.0690239 27.4798482 27.9268306
28.2776722 29.6632707 30.1559908 31.6343561 31.9835818
32.1505635 32.7146198 33.6147579 35.0138414 35.6289945
36.7175893 37.2386800 37.9623442 38.6313815 39.0924392
40.0471857 40.2185564 40.7903226 41.2478513 42.5531804
43.1749917 43.6249540 44.0746464 45.3560962 45.8358600
46.2743028 47.2046550 47.5095607 48.4557681 49.0218840
49.5513724 50.3092105 51.0221149 51.4666997 52.7374776
53.1171664 53.3213566 54.4614410 54.8977103 55.5573019
55.8917496 57.2068068 57.5957496 57.7061803 58.3232551
58.7739642 59.7374131 60.3664796 61.2128132 61.3571485
61.9925023 62.6851155 62.8664725 63.4162243 64.1331911
64.5568411
Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units):
0.0034327 0.0034329 0.0034330 0.0034339 0.0034344
0.0034348 85.3840928 88.3655723 127.6086029 134.4610421
149.4576434 161.3758702 179.2470490 204.8008378 216.9768616
226.5685287 249.5106816 274.9046241 303.3771192 313.7093662
319.0095425 330.2969479 334.3484374 352.5148732 358.2655286
376.2466777 385.7306074 390.7802171 395.3948511 399.9384146
405.5884013 432.5512861 445.2943123 455.7026616 463.1673949
471.9295247 475.1655705 479.4929739 485.5415424 497.3439088
500.2353648 507.9313120 515.4433026 524.8718526 530.7112968
536.1244374 547.1099148 554.4439707 569.2492209 573.8602000
577.4536199 591.4319716 596.3237155 610.7658973 614.1279023
615.7289522 621.1067066 629.5935554 642.5621802 648.1821443
658.0097972 662.6625375 669.0703606 674.9403617 678.9560535
687.1970410 688.6658056 693.5437305 697.4224856 708.3718472
713.5286433 717.2371421 720.9243568 731.3295367 735.1872597
738.6951073 746.0839443 748.4896296 755.9063983 760.3092592
764.4043043 770.2275192 775.6655594 779.0376378 788.5967036
791.4304027 792.9501311 801.3824813 804.5858602 809.4049456
811.8375460 821.3327373 824.1200834 824.9097643 829.3085783
832.5067667 839.3024409 843.7100169 849.6038071 850.6048690
854.9975369 859.7605138 861.0033206 864.7597571 869.6343890
872.5019695
Diagstd> Normal end.
Rtb_to_modes> Entering in.
Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 2480
Rtb_to_modes> Number of blocs = 157
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 11:
matrix.eigenrtb
Rdmodfacs> Entering in.
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Eigenvector number: 1
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9925E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 2
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9936E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 3
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9946E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 4
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9995E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 5
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0002E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 6
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0005E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 7
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.6182
Rdmodfacs> Eigenvector number: 8
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.6622
Rdmodfacs> Eigenvector number: 9
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.381
Rdmodfacs> Eigenvector number: 10
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.533
Rdmodfacs> Eigenvector number: 11
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.894
Rdmodfacs> Eigenvector number: 12
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.208
Rdmodfacs> Eigenvector number: 13
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.725
Rdmodfacs> Eigenvector number: 14
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.557
Rdmodfacs> Eigenvector number: 15
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.992
Rdmodfacs> Eigenvector number: 16
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.353
Rdmodfacs> Eigenvector number: 17
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.279
Rdmodfacs> Eigenvector number: 18
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.409
Rdmodfacs> Eigenvector number: 19
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.805
Rdmodfacs> Eigenvector number: 20
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.346
Rdmodfacs> Eigenvector number: 21
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.630
Rdmodfacs> Eigenvector number: 22
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.252
Rdmodfacs> Eigenvector number: 23
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.480
Rdmodfacs> Eigenvector number: 24
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.54
Rdmodfacs> Eigenvector number: 25
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.88
Rdmodfacs> Eigenvector number: 26
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.00
Rdmodfacs> Eigenvector number: 27
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.62
Rdmodfacs> Eigenvector number: 28
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.95
Rdmodfacs> Eigenvector number: 29
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.26
Rdmodfacs> Eigenvector number: 30
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.56
Rdmodfacs> Eigenvector number: 31
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.95
Rdmodfacs> Eigenvector number: 32
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.87
Rdmodfacs> Eigenvector number: 33
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.82
Rdmodfacs> Eigenvector number: 34
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.61
Rdmodfacs> Eigenvector number: 35
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.19
Rdmodfacs> Eigenvector number: 36
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.89
Rdmodfacs> Eigenvector number: 37
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.15
Rdmodfacs> Eigenvector number: 38
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.50
Rdmodfacs> Eigenvector number: 39
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.99
Rdmodfacs> Eigenvector number: 40
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.98
Rdmodfacs> Eigenvector number: 41
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.22
Rdmodfacs> Eigenvector number: 42
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.88
Rdmodfacs> Eigenvector number: 43
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.53
Rdmodfacs> Eigenvector number: 44
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.36
Rdmodfacs> Eigenvector number: 45
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.89
Rdmodfacs> Eigenvector number: 46
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.37
Rdmodfacs> Eigenvector number: 47
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.38
Rdmodfacs> Eigenvector number: 48
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.07
Rdmodfacs> Eigenvector number: 49
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.48
Rdmodfacs> Eigenvector number: 50
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.93
Rdmodfacs> Eigenvector number: 51
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.28
Rdmodfacs> Eigenvector number: 52
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.66
Rdmodfacs> Eigenvector number: 53
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.16
Rdmodfacs> Eigenvector number: 54
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.63
Rdmodfacs> Eigenvector number: 55
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.98
Rdmodfacs> Eigenvector number: 56
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.15
Rdmodfacs> Eigenvector number: 57
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.71
Rdmodfacs> Eigenvector number: 58
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.61
Rdmodfacs> Eigenvector number: 59
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.01
Rdmodfacs> Eigenvector number: 60
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.63
Rdmodfacs> Eigenvector number: 61
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.72
Rdmodfacs> Eigenvector number: 62
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.24
Rdmodfacs> Eigenvector number: 63
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.96
Rdmodfacs> Eigenvector number: 64
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.63
Rdmodfacs> Eigenvector number: 65
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 66
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.05
Rdmodfacs> Eigenvector number: 67
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.22
Rdmodfacs> Eigenvector number: 68
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.79
Rdmodfacs> Eigenvector number: 69
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.25
Rdmodfacs> Eigenvector number: 70
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.55
Rdmodfacs> Eigenvector number: 71
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.17
Rdmodfacs> Eigenvector number: 72
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.62
Rdmodfacs> Eigenvector number: 73
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.07
Rdmodfacs> Eigenvector number: 74
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.36
Rdmodfacs> Eigenvector number: 75
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.84
Rdmodfacs> Eigenvector number: 76
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.27
Rdmodfacs> Eigenvector number: 77
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 47.20
Rdmodfacs> Eigenvector number: 78
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 47.51
Rdmodfacs> Eigenvector number: 79
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 48.46
Rdmodfacs> Eigenvector number: 80
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 49.02
Rdmodfacs> Eigenvector number: 81
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 49.55
Rdmodfacs> Eigenvector number: 82
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 50.31
Rdmodfacs> Eigenvector number: 83
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 51.02
Rdmodfacs> Eigenvector number: 84
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 51.47
Rdmodfacs> Eigenvector number: 85
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 52.74
Rdmodfacs> Eigenvector number: 86
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 53.12
Rdmodfacs> Eigenvector number: 87
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 53.32
Rdmodfacs> Eigenvector number: 88
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 54.46
Rdmodfacs> Eigenvector number: 89
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 54.90
Rdmodfacs> Eigenvector number: 90
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 55.56
Rdmodfacs> Eigenvector number: 91
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 55.89
Rdmodfacs> Eigenvector number: 92
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 57.21
Rdmodfacs> Eigenvector number: 93
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 57.60
Rdmodfacs> Eigenvector number: 94
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 57.71
Rdmodfacs> Eigenvector number: 95
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 58.32
Rdmodfacs> Eigenvector number: 96
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 58.77
Rdmodfacs> Eigenvector number: 97
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 59.74
Rdmodfacs> Eigenvector number: 98
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 60.37
Rdmodfacs> Eigenvector number: 99
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 61.21
Rdmodfacs> Eigenvector number: 100
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 61.36
Rdmodfacs> Eigenvector number: 101
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 61.99
Rdmodfacs> Eigenvector number: 102
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 62.69
Rdmodfacs> Eigenvector number: 103
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 62.87
Rdmodfacs> Eigenvector number: 104
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 63.42
Rdmodfacs> Eigenvector number: 105
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 64.13
Rdmodfacs> Eigenvector number: 106
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 64.56
Rtb_to_modes> 106 vectors, with 942 coordinates in vector file.
Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected):
1.00000 0.99999 1.00000 1.00001 1.00000
0.99999 1.00000 1.00001 1.00001 1.00000
1.00004 0.99999 1.00000 1.00002 1.00001
0.99997 1.00002 1.00004 1.00002 0.99998
0.99997 1.00001 1.00003 1.00002 1.00000
0.99999 1.00000 0.99999 1.00000 0.99999
1.00002 1.00001 0.99998 0.99999 1.00001
1.00000 1.00000 1.00002 1.00001 0.99999
1.00002 0.99997 0.99999 1.00000 1.00000
0.99999 1.00001 0.99999 0.99998 1.00000
0.99999 0.99999 1.00002 0.99999 1.00002
0.99999 0.99998 0.99999 1.00003 0.99999
0.99998 0.99999 1.00000 0.99999 0.99997
1.00000 1.00000 1.00000 0.99997 0.99999
0.99997 1.00002 0.99999 0.99999 1.00001
0.99999 1.00004 1.00002 1.00000 1.00001
0.99999 1.00000 1.00000 1.00002 1.00000
1.00000 1.00001 1.00003 0.99999 1.00002
0.99998 0.99998 0.99998 1.00002 1.00001
1.00000 1.00000 1.00000 0.99999 1.00000
0.99999 0.99999 0.99999 1.00000 1.00001
1.00000
Rtb_to_modes> RTB block-file is being read.
Rtb_to_modes> 44640 lines found in RTB file.
Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected):
1.00000 0.99999 1.00000 1.00001 1.00000
0.99999 1.00000 1.00001 1.00001 1.00000
1.00004 0.99999 1.00000 1.00002 1.00001
0.99997 1.00002 1.00004 1.00002 0.99998
0.99997 1.00001 1.00003 1.00002 1.00000
0.99999 1.00000 0.99999 1.00000 0.99999
1.00002 1.00001 0.99998 0.99999 1.00001
1.00000 1.00000 1.00002 1.00001 0.99999
1.00002 0.99997 0.99999 1.00000 1.00000
0.99999 1.00001 0.99999 0.99998 1.00000
0.99999 0.99999 1.00002 0.99999 1.00002
0.99999 0.99998 0.99999 1.00003 0.99999
0.99998 0.99999 1.00000 0.99999 0.99997
1.00000 1.00000 1.00000 0.99997 0.99999
0.99997 1.00002 0.99999 0.99999 1.00001
0.99999 1.00004 1.00002 1.00000 1.00001
0.99999 1.00000 1.00000 1.00002 1.00000
1.00000 1.00001 1.00003 0.99999 1.00002
0.99998 0.99998 0.99998 1.00002 1.00001
1.00000 1.00000 1.00000 0.99999 1.00000
0.99999 0.99999 0.99999 1.00000 1.00001
1.00000
Orthogonality of first eigenvectors (zero expected):
Vector 2: 0.000
Vector 3: 0.000 0.000
Vector 4:-0.000-0.000-0.000
Vector 5: 0.000-0.000 0.000-0.000
Vector 6:-0.000-0.000-0.000 0.000 0.000
Vector 7: 0.000 0.000-0.000 0.000 0.000 0.000
Vector 8: 0.000-0.000 0.000-0.000 0.000-0.000-0.000
Vector 9:-0.000 0.000-0.000 0.000-0.000-0.000-0.000-0.000
Vector 10: 0.000-0.000 0.000-0.000-0.000-0.000-0.000-0.000-0.000
Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved.
Rtb_to_modes> Normal end.
Diagrtb> Normal end.
B-factor analysis
Bfactors> Version 1.22, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 2602271346112519717.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
2602271346112519717.eigenfacs
Getnam> Corresponding pdb filename ?
Getnam> 2602271346112519717.atom
Openam> file on opening on unit 11:
2602271346112519717.atom
Getnum> Number of skipped eigenvectors ?
Getnum> 0
Getnum> Number of usefull eigenvectors ?
Getnum> 10000
%Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 312
First residue number = 356
Last residue number = 1
Number of atoms found = 2480
Mean number per residue = 7.9
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9925E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9936E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9946E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9995E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0002E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0005E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.6182
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.6622
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.381
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.533
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.894
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.208
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.725
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.557
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.992
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.353
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.279
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.409
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.805
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.346
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.630
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.252
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.480
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.54
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.88
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.00
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.62
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.95
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.26
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.56
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.95
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.87
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.82
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.61
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.19
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.89
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.15
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.50
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.99
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.98
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.22
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.88
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.53
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.36
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.89
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.37
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.38
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.07
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.48
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.93
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.28
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.66
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.16
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.63
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.98
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.15
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.71
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.61
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.01
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.63
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.72
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.24
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.96
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.63
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.05
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.22
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.79
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.25
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.55
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.17
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.62
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.07
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.36
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.84
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.27
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.20
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.51
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.46
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.02
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.55
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 50.31
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 51.02
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 51.47
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 52.74
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 53.12
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 53.32
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 54.46
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 54.90
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 55.56
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 55.89
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 57.21
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 57.60
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 57.71
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 58.32
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 58.77
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 59.74
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 60.37
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 61.21
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 61.36
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 61.99
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 62.69
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 62.87
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 63.42
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 64.13
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 64.56
Bfactors> 106 vectors, 7440 coordinates in file.
Openam> file on opening on unit 12:
bfactors.pred
Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000
Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 0.618200
Bfactors> 100 eigenvectors will be considered.
Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped.
Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed.
(CHARMM units assumed for eigenvalues)
Bfactors> Correlation= -0.669 for 311 C-alpha atoms.
Bfactors> = 0.057 +/- 0.13
Bfactors> = 81.012 +/- 9.43
Bfactors> Shiftng-fct= 80.955
Bfactors> Scaling-fct= 70.950
Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved.
Bfactors> Normal end.
check_modes
Chkmod> Version 1.00, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 2602271346112519717.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
2602271346112519717.eigenfacs
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4325E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4327E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4329E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4337E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4342E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4347E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 85.38
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 88.36
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 127.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 134.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 149.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 161.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 179.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 204.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 217.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 226.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 249.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 274.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 303.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 313.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 319.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 330.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 334.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 352.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 358.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 376.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 385.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 390.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 395.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 399.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 405.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 432.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 445.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 455.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 463.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 471.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 475.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 479.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 485.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 497.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 500.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 507.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 515.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 524.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 530.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 536.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 547.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 554.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 569.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 573.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 577.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 591.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 596.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 610.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 614.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 615.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 621.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 629.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 642.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 648.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 658.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 662.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 669.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 674.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 678.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 687.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 688.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 693.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 697.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 708.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 713.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 717.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 720.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 731.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 735.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 738.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 746.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 748.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 755.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 760.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 764.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 770.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 775.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 779.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 788.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 791.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 792.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 801.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 804.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 809.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 811.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 821.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 824.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 824.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 829.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 832.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 839.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 843.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 849.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 850.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 854.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 859.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 861.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 864.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 869.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 872.5
Chkmod> 106 vectors, 7440 coordinates in file.
Chkmod> That is: 2480 cartesian points.
Openam> file on opening on unit 11:
Chkmod.res
Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file.
Chkmod> Normal end.
0.0034 0.9734
0.0034 0.7491
0.0034 0.9556
0.0034 0.8360
0.0034 0.7027
0.0034 0.7667
85.3770 0.0712
88.3632 0.0822
127.6067 0.3944
134.4459 0.2455
149.4399 0.3797
161.3527 0.4458
179.2503 0.3941
204.7946 0.0728
216.9561 0.2637
226.5536 0.2001
249.4896 0.3112
274.8981 0.5553
303.3633 0.5295
313.7009 0.2650
318.9936 0.6048
330.2893 0.4802
334.3342 0.4681
352.5307 0.3641
358.1715 0.2411
376.1554 0.1886
385.7503 0.1286
390.7613 0.4708
395.4107 0.3553
399.8586 0.3906
405.5681 0.1888
432.5787 0.4394
445.3379 0.5280
455.6762 0.5214
463.1194 0.4893
471.9463 0.1915
475.1831 0.3918
479.5059 0.4629
485.4931 0.4787
497.3698 0.4475
500.2065 0.4848
507.9258 0.3865
515.4152 0.4597
524.8232 0.4080
530.7435 0.4460
536.0489 0.3641
547.0442 0.4982
554.4305 0.1510
569.2264 0.5282
573.8681 0.4502
577.4526 0.3719
591.3740 0.5367
596.3378 0.3711
610.6976 0.5506
614.0672 0.5192
615.6971 0.5069
621.0362 0.4474
629.5220 0.5212
642.4993 0.4575
648.1635 0.2450
658.0032 0.4909
662.6458 0.4516
669.0210 0.5045
674.8993 0.4409
678.9057 0.4528
687.1917 0.5362
688.6486 0.5743
693.5112 0.4293
697.4107 0.3787
708.3150 0.4605
713.4568 0.4224
717.1656 0.3176
720.8554 0.4075
731.3296 0.4403
735.1889 0.4786
738.6291 0.5886
746.0151 0.2927
748.4610 0.4692
755.9070 0.4652
760.2620 0.4456
764.3609 0.5469
770.2005 0.5272
775.6162 0.4581
779.0292 0.5000
788.5817 0.4731
791.4175 0.4382
792.9060 0.5187
801.3375 0.2804
804.5681 0.2592
809.3899 0.5124
811.7900 0.4262
821.3204 0.3991
824.1151 0.3509
824.9017 0.3926
829.2498 0.3356
832.4430 0.4203
839.2846 0.4847
843.6984 0.4403
849.5478 0.4307
850.5881 0.3660
854.9436 0.4383
859.7571 0.3832
860.9905 0.2339
864.7484 0.3611
869.5754 0.4482
872.4859 0.5204
getting mode 7
running: ../../bin/get_modes.sh 2602271346112519717 7 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 7
calculating perturbed structure for DQ=-100
2602271346112519717.eigenfacs
2602271346112519717.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2602271346112519717.eigenfacs
2602271346112519717.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2602271346112519717.eigenfacs
2602271346112519717.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2602271346112519717.eigenfacs
2602271346112519717.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2602271346112519717.eigenfacs
2602271346112519717.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2602271346112519717.eigenfacs
2602271346112519717.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2602271346112519717.eigenfacs
2602271346112519717.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2602271346112519717.eigenfacs
2602271346112519717.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2602271346112519717.eigenfacs
2602271346112519717.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2602271346112519717.eigenfacs
2602271346112519717.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2602271346112519717.eigenfacs
2602271346112519717.atom
making animated gifs
11 models are in 2602271346112519717.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2602271346112519717.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2602271346112519717.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 8
running: ../../bin/get_modes.sh 2602271346112519717 8 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 8
calculating perturbed structure for DQ=-100
2602271346112519717.eigenfacs
2602271346112519717.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2602271346112519717.eigenfacs
2602271346112519717.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2602271346112519717.eigenfacs
2602271346112519717.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2602271346112519717.eigenfacs
2602271346112519717.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2602271346112519717.eigenfacs
2602271346112519717.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2602271346112519717.eigenfacs
2602271346112519717.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2602271346112519717.eigenfacs
2602271346112519717.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2602271346112519717.eigenfacs
2602271346112519717.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2602271346112519717.eigenfacs
2602271346112519717.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2602271346112519717.eigenfacs
2602271346112519717.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2602271346112519717.eigenfacs
2602271346112519717.atom
making animated gifs
11 models are in 2602271346112519717.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2602271346112519717.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2602271346112519717.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 9
running: ../../bin/get_modes.sh 2602271346112519717 9 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 9
calculating perturbed structure for DQ=-100
2602271346112519717.eigenfacs
2602271346112519717.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2602271346112519717.eigenfacs
2602271346112519717.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2602271346112519717.eigenfacs
2602271346112519717.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2602271346112519717.eigenfacs
2602271346112519717.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2602271346112519717.eigenfacs
2602271346112519717.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2602271346112519717.eigenfacs
2602271346112519717.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2602271346112519717.eigenfacs
2602271346112519717.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2602271346112519717.eigenfacs
2602271346112519717.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2602271346112519717.eigenfacs
2602271346112519717.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2602271346112519717.eigenfacs
2602271346112519717.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2602271346112519717.eigenfacs
2602271346112519717.atom
making animated gifs
11 models are in 2602271346112519717.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2602271346112519717.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2602271346112519717.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 10
running: ../../bin/get_modes.sh 2602271346112519717 10 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 10
calculating perturbed structure for DQ=-100
2602271346112519717.eigenfacs
2602271346112519717.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2602271346112519717.eigenfacs
2602271346112519717.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2602271346112519717.eigenfacs
2602271346112519717.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2602271346112519717.eigenfacs
2602271346112519717.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2602271346112519717.eigenfacs
2602271346112519717.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2602271346112519717.eigenfacs
2602271346112519717.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2602271346112519717.eigenfacs
2602271346112519717.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2602271346112519717.eigenfacs
2602271346112519717.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2602271346112519717.eigenfacs
2602271346112519717.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2602271346112519717.eigenfacs
2602271346112519717.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2602271346112519717.eigenfacs
2602271346112519717.atom
making animated gifs
11 models are in 2602271346112519717.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2602271346112519717.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2602271346112519717.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 11
running: ../../bin/get_modes.sh 2602271346112519717 11 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 11
calculating perturbed structure for DQ=-100
2602271346112519717.eigenfacs
2602271346112519717.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2602271346112519717.eigenfacs
2602271346112519717.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2602271346112519717.eigenfacs
2602271346112519717.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2602271346112519717.eigenfacs
2602271346112519717.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2602271346112519717.eigenfacs
2602271346112519717.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2602271346112519717.eigenfacs
2602271346112519717.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2602271346112519717.eigenfacs
2602271346112519717.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2602271346112519717.eigenfacs
2602271346112519717.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2602271346112519717.eigenfacs
2602271346112519717.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2602271346112519717.eigenfacs
2602271346112519717.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2602271346112519717.eigenfacs
2602271346112519717.atom
making animated gifs
11 models are in 2602271346112519717.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2602271346112519717.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2602271346112519717.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
2602271346112519717.10.pdb
2602271346112519717.11.pdb
2602271346112519717.7.pdb
2602271346112519717.8.pdb
2602271346112519717.9.pdb
STDERR:
Note: The following floating-point exceptions are signalling: IEEE_DENORMAL
real 0m14.904s
user 0m14.788s
sys 0m0.104s
rm: cannot remove '2602271346112519717.sdijf': No such file or directory
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
If you find results from this site helpful for your research, please cite one of our papers:
elNémo
is maintained by Yves-Henri Sanejouand.
It was developed
by Karsten Suhre.
Between 2003 and 2014, it was hosted by IGS (Marseille).
Between 2015 and 2025, it was hosted by US2B (Nantes).
Last modification: december 26th, 2025.
|