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LOGs for ID: 2602281919022739349

Output from eigenvector calculation:


STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8) Build Tirion matrix: Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model. Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004. Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file. Pdbmat> Coordinate filename = 2602281919022739349.atom Pdbmat> Distance cutoff = 8.00 Force constant = 10.00 Origin of mass values = CONS Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09 PRINTing level = 2 Pdbmat> Coordinate file 2602281919022739349.atom to be opened. Openam> File opened: 2602281919022739349.atom Pdbmat> Coordinate file in PDB format. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 501 First residue number = 2 Last residue number = 502 Number of atoms found = 7971 Mean number per residue = 15.9 Pdbmat> Coordinate statistics: = 19.065854 +/- 19.042535 From: -23.308000 To: 64.675000 = -5.080634 +/- 19.856467 From: -44.731000 To: 41.437000 = -44.298344 +/- 11.738433 From: -71.814000 To: -15.422000 Pdbmat> Masses are all set to one. %Pdbmat-W> residue:'HID ' is not a well known amino-acid. %Pdbmat-W> residue:'HID ' is not a well known amino-acid. %Pdbmat-W> residue:'HID ' is not a well known amino-acid. %Pdbmat-W> residue:'HID ' is not a well known amino-acid. %Pdbmat-W> residue:'HID ' is not a well known amino-acid. %Pdbmat-W> residue:'HID ' is not a well known amino-acid. %Pdbmat-W> 6 residue(s) not known. Openam> File opened: pdbmat.xyzm Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved. Openam> File opened: pdbmat.sdijb Pdbmat> Matrix statistics: Pdbmat> The matrix is 1.9787 % Filled. Pdbmat> 5657604 non-zero elements. Pdbmat> 623407 atom-atom interactions. Pdbmat> Number per atom= 156.42 +/- 46.01 Maximum number = 253 Minimum number = 20 Pdbmat> Matrix trace = 1.246814E+07 Pdbmat> Larger element = 898.260 Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10 Pdbmat> Normal end. automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1) 501 non-zero elements, NRBL set to 3 Diagonalize Tirion matrix using diagrtb Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation. Diagrtb> Version 2.52, November 2004. Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file. Diagrtb> Options taken into account: MATRix filename = pdbmat.sdijb COORdinates filename = 2602281919022739349.atom Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb Nb of VECTors required = 106 EigeNVALues chosen = LOWE Type of SUBStructuring = NONE Nb of residues per BLOck = 3 Origin of MASS values = CONS MATRix FORMat = BINA Temporary files cleaning = ALL Output PRINting level = 2 Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb. Blocpdb> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.xyzm Blocpdb> Coordinate file 2602281919022739349.atom to be opened. Openam> file on opening on unit 11: 2602281919022739349.atom Blocpdb> Coordinate file in PDB format. Blocpdb> 7971 atoms picked in pdb file. Blocpdb> All masses set to unity. Blocpdb> Coordinate file is rewritten. Blocpdb> Substructuring: Blocpdb> 3 residue(s) per block. Blocpdb> 501 residues. Blocpdb> 42 atoms in block 1 Block first atom: 1 Blocpdb> 55 atoms in block 2 Block first atom: 43 Blocpdb> 37 atoms in block 3 Block first atom: 98 Blocpdb> 46 atoms in block 4 Block first atom: 135 Blocpdb> 43 atoms in block 5 Block first atom: 181 Blocpdb> 63 atoms in block 6 Block first atom: 224 Blocpdb> 39 atoms in block 7 Block first atom: 287 Blocpdb> 58 atoms in block 8 Block first atom: 326 Blocpdb> 46 atoms in block 9 Block first atom: 384 Blocpdb> 49 atoms in block 10 Block first atom: 430 Blocpdb> 39 atoms in block 11 Block first atom: 479 Blocpdb> 49 atoms in block 12 Block first atom: 518 Blocpdb> 39 atoms in block 13 Block first atom: 567 Blocpdb> 51 atoms in block 14 Block first atom: 606 Blocpdb> 47 atoms in block 15 Block first atom: 657 Blocpdb> 45 atoms in block 16 Block first atom: 704 Blocpdb> 52 atoms in block 17 Block first atom: 749 Blocpdb> 44 atoms in block 18 Block first atom: 801 Blocpdb> 45 atoms in block 19 Block first atom: 845 Blocpdb> 53 atoms in block 20 Block first atom: 890 Blocpdb> 68 atoms in block 21 Block first atom: 943 Blocpdb> 41 atoms in block 22 Block first atom: 1011 Blocpdb> 40 atoms in block 23 Block first atom: 1052 Blocpdb> 46 atoms in block 24 Block first atom: 1092 Blocpdb> 50 atoms in block 25 Block first atom: 1138 Blocpdb> 50 atoms in block 26 Block first atom: 1188 Blocpdb> 59 atoms in block 27 Block first atom: 1238 Blocpdb> 49 atoms in block 28 Block first atom: 1297 Blocpdb> 58 atoms in block 29 Block first atom: 1346 Blocpdb> 49 atoms in block 30 Block first atom: 1404 Blocpdb> 56 atoms in block 31 Block first atom: 1453 Blocpdb> 48 atoms in block 32 Block first atom: 1509 Blocpdb> 48 atoms in block 33 Block first atom: 1557 Blocpdb> 46 atoms in block 34 Block first atom: 1605 Blocpdb> 40 atoms in block 35 Block first atom: 1651 Blocpdb> 46 atoms in block 36 Block first atom: 1691 Blocpdb> 41 atoms in block 37 Block first atom: 1737 Blocpdb> 51 atoms in block 38 Block first atom: 1778 Blocpdb> 45 atoms in block 39 Block first atom: 1829 Blocpdb> 55 atoms in block 40 Block first atom: 1874 Blocpdb> 44 atoms in block 41 Block first atom: 1929 Blocpdb> 57 atoms in block 42 Block first atom: 1973 Blocpdb> 45 atoms in block 43 Block first atom: 2030 Blocpdb> 59 atoms in block 44 Block first atom: 2075 Blocpdb> 47 atoms in block 45 Block first atom: 2134 Blocpdb> 65 atoms in block 46 Block first atom: 2181 Blocpdb> 53 atoms in block 47 Block first atom: 2246 Blocpdb> 50 atoms in block 48 Block first atom: 2299 Blocpdb> 39 atoms in block 49 Block first atom: 2349 Blocpdb> 56 atoms in block 50 Block first atom: 2388 Blocpdb> 54 atoms in block 51 Block first atom: 2444 Blocpdb> 42 atoms in block 52 Block first atom: 2498 Blocpdb> 46 atoms in block 53 Block first atom: 2540 Blocpdb> 50 atoms in block 54 Block first atom: 2586 Blocpdb> 42 atoms in block 55 Block first atom: 2636 Blocpdb> 58 atoms in block 56 Block first atom: 2678 Blocpdb> 44 atoms in block 57 Block first atom: 2736 Blocpdb> 38 atoms in block 58 Block first atom: 2780 Blocpdb> 46 atoms in block 59 Block first atom: 2818 Blocpdb> 44 atoms in block 60 Block first atom: 2864 Blocpdb> 44 atoms in block 61 Block first atom: 2908 Blocpdb> 53 atoms in block 62 Block first atom: 2952 Blocpdb> 40 atoms in block 63 Block first atom: 3005 Blocpdb> 47 atoms in block 64 Block first atom: 3045 Blocpdb> 54 atoms in block 65 Block first atom: 3092 Blocpdb> 55 atoms in block 66 Block first atom: 3146 Blocpdb> 45 atoms in block 67 Block first atom: 3201 Blocpdb> 47 atoms in block 68 Block first atom: 3246 Blocpdb> 60 atoms in block 69 Block first atom: 3293 Blocpdb> 37 atoms in block 70 Block first atom: 3353 Blocpdb> 48 atoms in block 71 Block first atom: 3390 Blocpdb> 41 atoms in block 72 Block first atom: 3438 Blocpdb> 44 atoms in block 73 Block first atom: 3479 Blocpdb> 48 atoms in block 74 Block first atom: 3523 Blocpdb> 44 atoms in block 75 Block first atom: 3571 Blocpdb> 62 atoms in block 76 Block first atom: 3615 Blocpdb> 44 atoms in block 77 Block first atom: 3677 Blocpdb> 59 atoms in block 78 Block first atom: 3721 Blocpdb> 40 atoms in block 79 Block first atom: 3780 Blocpdb> 34 atoms in block 80 Block first atom: 3820 Blocpdb> 46 atoms in block 81 Block first atom: 3854 Blocpdb> 43 atoms in block 82 Block first atom: 3900 Blocpdb> 57 atoms in block 83 Block first atom: 3943 Blocpdb> 52 atoms in block 84 Block first atom: 4000 Blocpdb> 39 atoms in block 85 Block first atom: 4052 Blocpdb> 57 atoms in block 86 Block first atom: 4091 Blocpdb> 48 atoms in block 87 Block first atom: 4148 Blocpdb> 48 atoms in block 88 Block first atom: 4196 Blocpdb> 53 atoms in block 89 Block first atom: 4244 Blocpdb> 49 atoms in block 90 Block first atom: 4297 Blocpdb> 51 atoms in block 91 Block first atom: 4346 Blocpdb> 48 atoms in block 92 Block first atom: 4397 Blocpdb> 49 atoms in block 93 Block first atom: 4445 Blocpdb> 43 atoms in block 94 Block first atom: 4494 Blocpdb> 51 atoms in block 95 Block first atom: 4537 Blocpdb> 32 atoms in block 96 Block first atom: 4588 Blocpdb> 45 atoms in block 97 Block first atom: 4620 Blocpdb> 41 atoms in block 98 Block first atom: 4665 Blocpdb> 49 atoms in block 99 Block first atom: 4706 Blocpdb> 58 atoms in block 100 Block first atom: 4755 Blocpdb> 43 atoms in block 101 Block first atom: 4813 Blocpdb> 60 atoms in block 102 Block first atom: 4856 Blocpdb> 48 atoms in block 103 Block first atom: 4916 Blocpdb> 46 atoms in block 104 Block first atom: 4964 Blocpdb> 36 atoms in block 105 Block first atom: 5010 Blocpdb> 44 atoms in block 106 Block first atom: 5046 Blocpdb> 45 atoms in block 107 Block first atom: 5090 Blocpdb> 67 atoms in block 108 Block first atom: 5135 Blocpdb> 40 atoms in block 109 Block first atom: 5202 Blocpdb> 39 atoms in block 110 Block first atom: 5242 Blocpdb> 44 atoms in block 111 Block first atom: 5281 Blocpdb> 53 atoms in block 112 Block first atom: 5325 Blocpdb> 50 atoms in block 113 Block first atom: 5378 Blocpdb> 51 atoms in block 114 Block first atom: 5428 Blocpdb> 42 atoms in block 115 Block first atom: 5479 Blocpdb> 39 atoms in block 116 Block first atom: 5521 Blocpdb> 47 atoms in block 117 Block first atom: 5560 Blocpdb> 37 atoms in block 118 Block first atom: 5607 Blocpdb> 46 atoms in block 119 Block first atom: 5644 Blocpdb> 50 atoms in block 120 Block first atom: 5690 Blocpdb> 57 atoms in block 121 Block first atom: 5740 Blocpdb> 56 atoms in block 122 Block first atom: 5797 Blocpdb> 45 atoms in block 123 Block first atom: 5853 Blocpdb> 43 atoms in block 124 Block first atom: 5898 Blocpdb> 50 atoms in block 125 Block first atom: 5941 Blocpdb> 37 atoms in block 126 Block first atom: 5991 Blocpdb> 45 atoms in block 127 Block first atom: 6028 Blocpdb> 51 atoms in block 128 Block first atom: 6073 Blocpdb> 49 atoms in block 129 Block first atom: 6124 Blocpdb> 37 atoms in block 130 Block first atom: 6173 Blocpdb> 50 atoms in block 131 Block first atom: 6210 Blocpdb> 52 atoms in block 132 Block first atom: 6260 Blocpdb> 46 atoms in block 133 Block first atom: 6312 Blocpdb> 40 atoms in block 134 Block first atom: 6358 Blocpdb> 38 atoms in block 135 Block first atom: 6398 Blocpdb> 54 atoms in block 136 Block first atom: 6436 Blocpdb> 48 atoms in block 137 Block first atom: 6490 Blocpdb> 55 atoms in block 138 Block first atom: 6538 Blocpdb> 63 atoms in block 139 Block first atom: 6593 Blocpdb> 48 atoms in block 140 Block first atom: 6656 Blocpdb> 43 atoms in block 141 Block first atom: 6704 Blocpdb> 53 atoms in block 142 Block first atom: 6747 Blocpdb> 52 atoms in block 143 Block first atom: 6800 Blocpdb> 44 atoms in block 144 Block first atom: 6852 Blocpdb> 45 atoms in block 145 Block first atom: 6896 Blocpdb> 45 atoms in block 146 Block first atom: 6941 Blocpdb> 51 atoms in block 147 Block first atom: 6986 Blocpdb> 46 atoms in block 148 Block first atom: 7037 Blocpdb> 40 atoms in block 149 Block first atom: 7083 Blocpdb> 48 atoms in block 150 Block first atom: 7123 Blocpdb> 45 atoms in block 151 Block first atom: 7171 Blocpdb> 54 atoms in block 152 Block first atom: 7216 Blocpdb> 41 atoms in block 153 Block first atom: 7270 Blocpdb> 51 atoms in block 154 Block first atom: 7311 Blocpdb> 51 atoms in block 155 Block first atom: 7362 Blocpdb> 43 atoms in block 156 Block first atom: 7413 Blocpdb> 48 atoms in block 157 Block first atom: 7456 Blocpdb> 49 atoms in block 158 Block first atom: 7504 Blocpdb> 52 atoms in block 159 Block first atom: 7553 Blocpdb> 51 atoms in block 160 Block first atom: 7605 Blocpdb> 33 atoms in block 161 Block first atom: 7656 Blocpdb> 37 atoms in block 162 Block first atom: 7689 Blocpdb> 46 atoms in block 163 Block first atom: 7726 Blocpdb> 48 atoms in block 164 Block first atom: 7772 Blocpdb> 50 atoms in block 165 Block first atom: 7820 Blocpdb> 55 atoms in block 166 Block first atom: 7870 Blocpdb> 47 atoms in block 167 Block first atom: 7924 Blocpdb> 167 blocks. Blocpdb> At most, 68 atoms in each of them. Blocpdb> At least, 32 atoms in each of them. Blocpdb> Normal end of Blocpdb. Diagrtb> Memory allocation for Prepmat. Diagrtb> Memory allocation for RTB. Diagrtb> Memory allocation for Diagstd. Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes. Prepmat> Entering in. Prepmat> Rewriting of the matrix begins. Prepmat> 5657771 matrix lines read. Prepmat> Matrix order = 23913 Prepmat> Matrix trace = 12468140.0000 Prepmat> Last element read: 23913 23913 217.8498 Prepmat> 14029 lines saved. Prepmat> 12296 empty lines. Prepmat> Number of lines on output is as expected. Prepmat> Normal end of Prepmat. RTB> Entering in. RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 7971 RTB> Total mass = 7971.0000 RTB> Number of atoms found in matrix: 7971 RTB> Number of blocks = 167 RTB> Projection begins. RTB> Projected matrix is being saved. RTB> Projected matrix trace = 410410.6506 RTB> 59847 non-zero elements. RTB> Normal end of RTB. Diagstd> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.sdijb Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb Diagstd> CERFACS matrix format. Diagstd> Projected matrix order = 1002 Diagstd> Nb of non-zero elements: 59847 Diagstd> Projected matrix trace = 410410.6506 Openam> file on opening on unit 11: diagrtb_work.eigenfacs Diagstd> Diagonalization. Diagstd> 1002 eigenvectors are computed. Diagstd> 106 of them to be saved. Diagstd> Sum of eigenvalues = 410410.6506 Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000 Diagstd> Selected eigenvalues: 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.3008509 0.7145324 1.2388504 1.8139308 2.5091471 3.3326022 4.5946347 5.0412736 6.3229079 7.7144346 8.5654062 10.4570658 10.8998882 12.9103201 14.8911298 16.3742861 17.0361318 19.9592900 21.3496912 22.9114725 23.6194802 24.3282298 26.3882979 26.5171975 28.8945175 29.8623780 31.0148032 32.7288477 34.7777641 35.6039857 36.4905942 38.2211230 39.3242694 39.4374374 41.3769810 42.1924468 43.6291955 44.4771954 45.3564788 47.5132155 48.1682759 50.2137887 51.1533828 51.4915899 53.4194086 55.7776188 55.9624970 57.8646567 58.7306632 60.4004541 62.1505621 62.8489413 62.9564060 64.5435011 64.9711235 66.8362816 67.5106176 69.9992701 70.2281071 70.8553363 73.2552776 73.9215876 74.8108398 76.0338548 76.9003560 78.3241924 80.0593009 80.2819773 81.3991547 82.5927146 83.4881269 84.9638530 86.6007110 88.2700507 88.6654519 89.6084911 90.5293070 91.4198288 93.6253452 94.0429134 95.5343548 95.9808786 97.1894841 98.1096322 99.0073569 100.7164773 102.5597176 103.8741785 104.4020934 105.8594752 106.2339084 108.1883884 108.9706296 110.4817640 111.9091518 113.1821156 113.7221830 115.3577028 115.9369153 117.1345408 Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units): 0.0034316 0.0034320 0.0034335 0.0034336 0.0034340 0.0034361 59.5622299 91.7922995 120.8661562 146.2532878 172.0118400 198.2380500 232.7666587 243.8178045 273.0572478 301.6111082 317.8112460 351.1560865 358.5141499 390.1789052 419.0434960 439.4166079 448.2092095 485.1408277 501.7542719 519.7826522 527.7526806 535.6122921 557.8288470 559.1896077 583.7178898 593.4135715 604.7554559 621.2417546 640.3923107 647.9546174 655.9726731 671.3469214 680.9662869 681.9454305 698.5133007 705.3629367 717.2720087 724.2090994 731.3326215 748.5184187 753.6606338 769.4967247 776.6627210 779.2259928 793.6788696 811.0082370 812.3511927 826.0416982 832.2000407 843.9474049 856.0868194 860.8832606 861.6189538 872.4118182 875.2970581 887.7719529 892.2392434 908.5357814 910.0196324 914.0744337 929.4258332 933.6431672 939.2420877 946.8883754 952.2685810 961.0439368 971.6305848 972.9808899 979.7273404 986.8840966 992.2192284 1000.9499902 1010.5458179 1020.2391112 1022.5216126 1027.9449624 1033.2130386 1038.2823756 1050.7320904 1053.0726116 1061.3901862 1063.8677424 1070.5449784 1075.6007688 1080.5105552 1089.7968393 1099.7239630 1106.7488552 1109.5576796 1117.2751732 1119.2493738 1129.4983632 1133.5743499 1141.4071274 1148.7567660 1155.2718308 1158.0248371 1166.3223009 1169.2466943 1175.2703233 Diagstd> Normal end. Rtb_to_modes> Entering in. Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 7971 Rtb_to_modes> Number of blocs = 167 Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.eigenfacs Openam> file on opening on unit 11: matrix.eigenrtb Rdmodfacs> Entering in. Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Eigenvector number: 1 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9865E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 2 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9885E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 3 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9970E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 4 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9977E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 5 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0000E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 6 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0012E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 7 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.3009 Rdmodfacs> Eigenvector number: 8 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.7145 Rdmodfacs> Eigenvector number: 9 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.239 Rdmodfacs> Eigenvector number: 10 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.814 Rdmodfacs> Eigenvector number: 11 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.509 Rdmodfacs> Eigenvector number: 12 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.333 Rdmodfacs> Eigenvector number: 13 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.595 Rdmodfacs> Eigenvector number: 14 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.041 Rdmodfacs> Eigenvector number: 15 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.323 Rdmodfacs> Eigenvector number: 16 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.714 Rdmodfacs> Eigenvector number: 17 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.565 Rdmodfacs> Eigenvector number: 18 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.46 Rdmodfacs> Eigenvector number: 19 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.90 Rdmodfacs> Eigenvector number: 20 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.91 Rdmodfacs> Eigenvector number: 21 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.89 Rdmodfacs> Eigenvector number: 22 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.37 Rdmodfacs> Eigenvector number: 23 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.04 Rdmodfacs> Eigenvector number: 24 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.96 Rdmodfacs> Eigenvector number: 25 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.35 Rdmodfacs> Eigenvector number: 26 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.91 Rdmodfacs> Eigenvector number: 27 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.62 Rdmodfacs> Eigenvector number: 28 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.33 Rdmodfacs> Eigenvector number: 29 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.39 Rdmodfacs> Eigenvector number: 30 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.52 Rdmodfacs> Eigenvector number: 31 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.89 Rdmodfacs> Eigenvector number: 32 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.86 Rdmodfacs> Eigenvector number: 33 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.01 Rdmodfacs> Eigenvector number: 34 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.73 Rdmodfacs> Eigenvector number: 35 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.78 Rdmodfacs> Eigenvector number: 36 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.60 Rdmodfacs> Eigenvector number: 37 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.49 Rdmodfacs> Eigenvector number: 38 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.22 Rdmodfacs> Eigenvector number: 39 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.32 Rdmodfacs> Eigenvector number: 40 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.44 Rdmodfacs> Eigenvector number: 41 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.38 Rdmodfacs> Eigenvector number: 42 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.19 Rdmodfacs> Eigenvector number: 43 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.63 Rdmodfacs> Eigenvector number: 44 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.48 Rdmodfacs> Eigenvector number: 45 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.36 Rdmodfacs> Eigenvector number: 46 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 47.51 Rdmodfacs> Eigenvector number: 47 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 48.17 Rdmodfacs> Eigenvector number: 48 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 50.21 Rdmodfacs> Eigenvector number: 49 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 51.15 Rdmodfacs> Eigenvector number: 50 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 51.49 Rdmodfacs> Eigenvector number: 51 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 53.42 Rdmodfacs> Eigenvector number: 52 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 55.78 Rdmodfacs> Eigenvector number: 53 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 55.96 Rdmodfacs> Eigenvector number: 54 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 57.86 Rdmodfacs> Eigenvector number: 55 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 58.73 Rdmodfacs> Eigenvector number: 56 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 60.40 Rdmodfacs> Eigenvector number: 57 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 62.15 Rdmodfacs> Eigenvector number: 58 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 62.85 Rdmodfacs> Eigenvector number: 59 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 62.96 Rdmodfacs> Eigenvector number: 60 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 64.54 Rdmodfacs> Eigenvector number: 61 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 64.97 Rdmodfacs> Eigenvector number: 62 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 66.84 Rdmodfacs> Eigenvector number: 63 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 67.51 Rdmodfacs> Eigenvector number: 64 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 70.00 Rdmodfacs> Eigenvector number: 65 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 70.23 Rdmodfacs> Eigenvector number: 66 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 70.86 Rdmodfacs> Eigenvector number: 67 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 73.26 Rdmodfacs> Eigenvector number: 68 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 73.92 Rdmodfacs> Eigenvector number: 69 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 74.81 Rdmodfacs> Eigenvector number: 70 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 76.03 Rdmodfacs> Eigenvector number: 71 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 76.90 Rdmodfacs> Eigenvector number: 72 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 78.32 Rdmodfacs> Eigenvector number: 73 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 80.06 Rdmodfacs> Eigenvector number: 74 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 80.28 Rdmodfacs> Eigenvector number: 75 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 81.40 Rdmodfacs> Eigenvector number: 76 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 82.59 Rdmodfacs> Eigenvector number: 77 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 83.49 Rdmodfacs> Eigenvector number: 78 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 84.96 Rdmodfacs> Eigenvector number: 79 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 86.60 Rdmodfacs> Eigenvector number: 80 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 88.27 Rdmodfacs> Eigenvector number: 81 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 88.67 Rdmodfacs> Eigenvector number: 82 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 89.61 Rdmodfacs> Eigenvector number: 83 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 90.53 Rdmodfacs> Eigenvector number: 84 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 91.42 Rdmodfacs> Eigenvector number: 85 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 93.63 Rdmodfacs> Eigenvector number: 86 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 94.04 Rdmodfacs> Eigenvector number: 87 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 95.53 Rdmodfacs> Eigenvector number: 88 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 95.98 Rdmodfacs> Eigenvector number: 89 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 97.19 Rdmodfacs> Eigenvector number: 90 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 98.11 Rdmodfacs> Eigenvector number: 91 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 99.01 Rdmodfacs> Eigenvector number: 92 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 100.7 Rdmodfacs> Eigenvector number: 93 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 102.6 Rdmodfacs> Eigenvector number: 94 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 103.9 Rdmodfacs> Eigenvector number: 95 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 104.4 Rdmodfacs> Eigenvector number: 96 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 105.9 Rdmodfacs> Eigenvector number: 97 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 106.2 Rdmodfacs> Eigenvector number: 98 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 108.2 Rdmodfacs> Eigenvector number: 99 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 109.0 Rdmodfacs> Eigenvector number: 100 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 110.5 Rdmodfacs> Eigenvector number: 101 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 111.9 Rdmodfacs> Eigenvector number: 102 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 113.2 Rdmodfacs> Eigenvector number: 103 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 113.7 Rdmodfacs> Eigenvector number: 104 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 115.4 Rdmodfacs> Eigenvector number: 105 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 115.9 Rdmodfacs> Eigenvector number: 106 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 117.1 Rtb_to_modes> 106 vectors, with 1002 coordinates in vector file. Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected): 1.00000 0.99999 1.00000 1.00000 1.00002 1.00001 1.00001 0.99998 0.99998 0.99999 1.00001 1.00003 1.00000 1.00000 1.00000 1.00002 1.00001 0.99999 1.00002 1.00001 1.00000 1.00000 0.99999 1.00000 1.00001 1.00001 1.00000 0.99999 0.99999 0.99997 1.00002 0.99998 1.00001 0.99998 0.99998 0.99996 0.99999 0.99998 1.00000 1.00000 1.00001 0.99999 0.99999 1.00001 1.00000 1.00001 1.00000 1.00000 0.99998 1.00001 0.99999 0.99999 1.00000 0.99999 1.00000 1.00000 1.00001 1.00000 0.99999 1.00003 0.99999 1.00001 0.99999 1.00000 1.00003 1.00000 1.00000 1.00000 0.99999 1.00000 0.99999 0.99999 1.00000 1.00000 1.00001 1.00000 0.99998 1.00001 0.99999 0.99997 1.00001 1.00001 0.99999 0.99998 0.99998 0.99998 1.00001 1.00000 0.99998 1.00001 1.00000 1.00001 1.00001 1.00001 0.99999 1.00000 0.99998 0.99998 1.00000 1.00000 1.00001 0.99999 1.00000 1.00000 0.99999 0.99999 Rtb_to_modes> RTB block-file is being read. Rtb_to_modes> 143478 lines found in RTB file. Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected): 1.00000 0.99999 1.00000 1.00000 1.00002 1.00001 1.00001 0.99998 0.99998 0.99999 1.00001 1.00003 1.00000 1.00000 1.00000 1.00002 1.00001 0.99999 1.00002 1.00001 1.00000 1.00000 0.99999 1.00000 1.00001 1.00001 1.00000 0.99999 0.99999 0.99997 1.00002 0.99998 1.00001 0.99998 0.99998 0.99996 0.99999 0.99998 1.00000 1.00000 1.00001 0.99999 0.99999 1.00001 1.00000 1.00001 1.00000 1.00000 0.99998 1.00001 0.99999 0.99999 1.00000 0.99999 1.00000 1.00000 1.00001 1.00000 0.99999 1.00003 0.99999 1.00001 0.99999 1.00000 1.00003 1.00000 1.00000 1.00000 0.99999 1.00000 0.99999 0.99999 1.00000 1.00000 1.00001 1.00000 0.99998 1.00001 0.99999 0.99997 1.00001 1.00001 0.99999 0.99998 0.99998 0.99998 1.00001 1.00000 0.99998 1.00001 1.00000 1.00001 1.00001 1.00001 0.99999 1.00000 0.99998 0.99998 1.00000 1.00000 1.00001 0.99999 1.00000 1.00000 0.99999 0.99999 Orthogonality of first eigenvectors (zero expected): Vector 2:-0.000 Vector 3: 0.000 0.000 Vector 4: 0.000-0.000 0.000 Vector 5:-0.000-0.000 0.000-0.000 Vector 6:-0.000-0.000-0.000-0.000 0.000 Vector 7: 0.000 0.000-0.000 0.000 0.000 0.000 Vector 8: 0.000 0.000-0.000 0.000 0.000-0.000 0.000 Vector 9: 0.000 0.000-0.000 0.000-0.000 0.000-0.000 0.000 Vector 10:-0.000 0.000-0.000-0.000 0.000 0.000-0.000 0.000-0.000 Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved. Rtb_to_modes> Normal end. Diagrtb> Normal end. B-factor analysis Bfactors> Version 1.22, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 2602281919022739349.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 2602281919022739349.eigenfacs Getnam> Corresponding pdb filename ? Getnam> 2602281919022739349.atom Openam> file on opening on unit 11: 2602281919022739349.atom Getnum> Number of skipped eigenvectors ? Getnum> 0 Getnum> Number of usefull eigenvectors ? Getnum> 10000 %Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 501 First residue number = 2 Last residue number = 502 Number of atoms found = 7971 Mean number per residue = 15.9 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9865E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9885E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9970E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9977E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0000E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0012E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.3009 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.7145 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.239 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.814 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.509 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.333 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.595 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.041 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.323 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.714 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.565 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.46 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.90 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.91 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.89 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.37 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.04 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.96 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.35 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.91 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.62 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.33 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.39 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.52 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.89 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.86 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.01 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.73 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.78 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.60 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.49 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.22 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.32 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.44 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.38 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.19 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.63 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.48 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.36 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.51 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.17 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 50.21 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 51.15 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 51.49 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 53.42 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 55.78 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 55.96 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 57.86 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 58.73 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 60.40 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 62.15 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 62.85 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 62.96 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 64.54 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 64.97 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 66.84 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 67.51 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 70.00 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 70.23 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 70.86 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 73.26 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 73.92 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 74.81 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 76.03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 76.90 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 78.32 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 80.06 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 80.28 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 81.40 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 82.59 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 83.49 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 84.96 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 86.60 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 88.27 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 88.67 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 89.61 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 90.53 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 91.42 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 93.63 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 94.04 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 95.53 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 95.98 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 97.19 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 98.11 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 99.01 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 100.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 102.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 103.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 104.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 105.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 106.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 108.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 109.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 110.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 111.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 113.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 113.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 115.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 115.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 117.1 Bfactors> 106 vectors, 23913 coordinates in file. Openam> file on opening on unit 12: bfactors.pred Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000 Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 0.300900 Bfactors> 100 eigenvectors will be considered. Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped. Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed. (CHARMM units assumed for eigenvalues) %Bfactors-Wn> Experimental B-factors are nearly constant ! Bfactors> = 0.017 +/- 0.02 Bfactors> = 0.000 +/- 0.00 Bfactors> Shiftng-fct= -0.017 Bfactors> Scaling-fct= 0.000 Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved. Bfactors> Normal end. check_modes Chkmod> Version 1.00, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 2602281919022739349.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 2602281919022739349.eigenfacs Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4315E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4318E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4333E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4334E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4338E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4359E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 59.56 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 91.79 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 120.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 146.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 172.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 198.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 232.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 243.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 273.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 301.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 317.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 351.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 358.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 390.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 419.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 439.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 448.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 485.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 501.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 519.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 527.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 535.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 557.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 559.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 583.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 593.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 604.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 621.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 640.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 647.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 655.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 671.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 680.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 681.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 698.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 705.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 717.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 724.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 731.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 748.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 753.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 769.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 776.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 779.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 793.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 811.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 812.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 826.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 832.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 843.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 856.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 860.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 861.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 872.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 875.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 887.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 892.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 908.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 910.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 914.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 929.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 933.6 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vecteur en lecture: 1001. 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perturbed structure for DQ=-80 2602281919022739349.eigenfacs 2602281919022739349.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2602281919022739349.eigenfacs 2602281919022739349.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2602281919022739349.eigenfacs 2602281919022739349.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2602281919022739349.eigenfacs 2602281919022739349.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2602281919022739349.eigenfacs 2602281919022739349.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2602281919022739349.eigenfacs 2602281919022739349.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2602281919022739349.eigenfacs 2602281919022739349.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2602281919022739349.eigenfacs 2602281919022739349.atom calculating perturbed structure for DQ=80 2602281919022739349.eigenfacs 2602281919022739349.atom calculating perturbed structure for DQ=100 2602281919022739349.eigenfacs 2602281919022739349.atom making animated gifs 11 models are in 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animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 9 running: ../../bin/get_modes.sh 2602281919022739349 9 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 9 calculating perturbed structure for DQ=-100 2602281919022739349.eigenfacs 2602281919022739349.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2602281919022739349.eigenfacs 2602281919022739349.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2602281919022739349.eigenfacs 2602281919022739349.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2602281919022739349.eigenfacs 2602281919022739349.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2602281919022739349.eigenfacs 2602281919022739349.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2602281919022739349.eigenfacs 2602281919022739349.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2602281919022739349.eigenfacs 2602281919022739349.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2602281919022739349.eigenfacs 2602281919022739349.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2602281919022739349.eigenfacs 2602281919022739349.atom calculating perturbed structure for DQ=80 2602281919022739349.eigenfacs 2602281919022739349.atom calculating perturbed structure for DQ=100 2602281919022739349.eigenfacs 2602281919022739349.atom making animated gifs 11 models are in 2602281919022739349.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2602281919022739349.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2602281919022739349.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 10 running: ../../bin/get_modes.sh 2602281919022739349 10 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 10 calculating perturbed structure for DQ=-100 2602281919022739349.eigenfacs 2602281919022739349.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2602281919022739349.eigenfacs 2602281919022739349.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2602281919022739349.eigenfacs 2602281919022739349.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2602281919022739349.eigenfacs 2602281919022739349.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2602281919022739349.eigenfacs 2602281919022739349.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2602281919022739349.eigenfacs 2602281919022739349.atom calculating perturbed structure for DQ=20 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100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2602281919022739349.10.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 11 running: ../../bin/get_modes.sh 2602281919022739349 11 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 11 calculating perturbed structure for DQ=-100 2602281919022739349.eigenfacs 2602281919022739349.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2602281919022739349.eigenfacs 2602281919022739349.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2602281919022739349.eigenfacs 2602281919022739349.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2602281919022739349.eigenfacs 2602281919022739349.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2602281919022739349.eigenfacs 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MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2602281919022739349.11.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 2602281919022739349.10.pdb 2602281919022739349.11.pdb 2602281919022739349.7.pdb 2602281919022739349.8.pdb 2602281919022739349.9.pdb STDERR: Note: The following floating-point exceptions are signalling: IEEE_DENORMAL real 0m40.650s user 0m40.221s sys 0m0.404s rm: cannot remove '2602281919022739349.sdijf': No such file or directory pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: 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