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* HORMONE 14-JAN-23 8I2H *

LOGs for ID: 2603021107033082581

Output from eigenvector calculation:


STDOUT:

CUTOFF set to default value (CUTOFF=8)
Build Tirion matrix:
 Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model.
 Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004.    

 Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file.

 Pdbmat> Coordinate filename     = 2603021107033082581.atom

 Pdbmat> Distance cutoff         =       8.00
         Force constant          =      10.00
         Origin of mass values   =       CONS
 Pdbmat> Levelshift              =    1.0E-09
         PRINTing level          =          2

 Pdbmat> Coordinate file 2603021107033082581.atom to be opened.

 Openam> File opened: 2603021107033082581.atom

 Pdbmat> Coordinate file in PDB format.

 Rdatompdb> Reading pdb file.
 Rdatompdb> End of file reached.
 Rdatompdb> Number of I/O errors:      0

 Rdatompdb> Number of residues found =    282
            First residue number     =    362
            Last  residue number     =    643
            Number of atoms found    =   2218
            Mean number per residue  =      7.9

 Pdbmat> Coordinate statistics: 
 =   111.997059 +/-     8.705722 From:    90.138000 To:   134.319000
 =   100.375909 +/-    12.572911 From:    69.210000 To:   129.652000
 =   117.686234 +/-    13.014169 From:    88.005000 To:   148.039000
 Pdbmat> Masses are all set to one.

 Openam> File opened: pdbmat.xyzm
 Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved.

 Openam> File opened: pdbmat.sdijb

 Pdbmat> Matrix statistics:

 Pdbmat> The matrix is   3.7526 % Filled.
 Pdbmat>       830877  non-zero elements.
 Pdbmat>        90856 atom-atom interactions.

 Pdbmat> Number per atom=     81.93 +/-     21.03
         Maximum number =    130
         Minimum number =     17

 Pdbmat> Matrix trace   = 1.817120E+06
 Pdbmat> Larger element =  536.390    
 Pdbmat>      0 elements larger than +/-  1.0E+10

 Pdbmat> Normal end.
automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1)
282 non-zero elements, NRBL set to 2
Diagonalize Tirion matrix using diagrtb
 Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation.
 Diagrtb> Version 2.52, November 2004. 
 Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file.

 Diagrtb> Options taken into account:

 MATRix filename          = pdbmat.sdijb
 COORdinates filename     = 2603021107033082581.atom
 Eigenvector OUTPut file  = matrix.eigenrtb
 Nb of VECTors required   =        106
 EigeNVALues chosen       =       LOWE
 Type of SUBStructuring   =       NONE
 Nb of residues per BLOck =          2
 Origin of MASS values    =       CONS
 MATRix FORMat            =       BINA
 Temporary files cleaning =       ALL 
 Output PRINting level    =          2

 Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb.

 Blocpdb> Entering in.

 Openam> file on opening on unit     10:
 diagrtb_work.xyzm   

 Blocpdb> Coordinate file 2603021107033082581.atom to be opened.

 Openam> file on opening on unit     11:
 2603021107033082581.atom                                                                                                        

 Blocpdb> Coordinate file in PDB format.

 Blocpdb>  2218 atoms picked in pdb file.
 Blocpdb>   All masses set to unity.
 Blocpdb> Coordinate file is rewritten.

 Blocpdb> Substructuring:
 Blocpdb>     2 residue(s) per block.
 Blocpdb>   282 residues.
 Blocpdb>    20 atoms in block      1
 Block first atom:      1
 Blocpdb>    16 atoms in block      2
 Block first atom:     21
 Blocpdb>    18 atoms in block      3
 Block first atom:     37
 Blocpdb>    16 atoms in block      4
 Block first atom:     55
 Blocpdb>    25 atoms in block      5
 Block first atom:     71
 Blocpdb>    14 atoms in block      6
 Block first atom:     96
 Blocpdb>    16 atoms in block      7
 Block first atom:    110
 Blocpdb>    13 atoms in block      8
 Block first atom:    126
 Blocpdb>    11 atoms in block      9
 Block first atom:    139
 Blocpdb>    16 atoms in block     10
 Block first atom:    150
 Blocpdb>    15 atoms in block     11
 Block first atom:    166
 Blocpdb>    15 atoms in block     12
 Block first atom:    181
 Blocpdb>    16 atoms in block     13
 Block first atom:    196
 Blocpdb>    14 atoms in block     14
 Block first atom:    212
 Blocpdb>    15 atoms in block     15
 Block first atom:    226
 Blocpdb>    21 atoms in block     16
 Block first atom:    241
 Blocpdb>    15 atoms in block     17
 Block first atom:    262
 Blocpdb>    14 atoms in block     18
 Block first atom:    277
 Blocpdb>    22 atoms in block     19
 Block first atom:    291
 Blocpdb>    16 atoms in block     20
 Block first atom:    313
 Blocpdb>    14 atoms in block     21
 Block first atom:    329
 Blocpdb>    13 atoms in block     22
 Block first atom:    343
 Blocpdb>    16 atoms in block     23
 Block first atom:    356
 Blocpdb>    16 atoms in block     24
 Block first atom:    372
 Blocpdb>    14 atoms in block     25
 Block first atom:    388
 Blocpdb>    12 atoms in block     26
 Block first atom:    402
 Blocpdb>    20 atoms in block     27
 Block first atom:    414
 Blocpdb>    16 atoms in block     28
 Block first atom:    434
 Blocpdb>    13 atoms in block     29
 Block first atom:    450
 Blocpdb>    13 atoms in block     30
 Block first atom:    463
 Blocpdb>    16 atoms in block     31
 Block first atom:    476
 Blocpdb>    17 atoms in block     32
 Block first atom:    492
 Blocpdb>    15 atoms in block     33
 Block first atom:    509
 Blocpdb>    21 atoms in block     34
 Block first atom:    524
 Blocpdb>    18 atoms in block     35
 Block first atom:    545
 Blocpdb>    17 atoms in block     36
 Block first atom:    563
 Blocpdb>    16 atoms in block     37
 Block first atom:    580
 Blocpdb>    23 atoms in block     38
 Block first atom:    596
 Blocpdb>    11 atoms in block     39
 Block first atom:    619
 Blocpdb>     9 atoms in block     40
 Block first atom:    630
 Blocpdb>    14 atoms in block     41
 Block first atom:    639
 Blocpdb>    10 atoms in block     42
 Block first atom:    653
 Blocpdb>    15 atoms in block     43
 Block first atom:    663
 Blocpdb>    18 atoms in block     44
 Block first atom:    678
 Blocpdb>    18 atoms in block     45
 Block first atom:    696
 Blocpdb>    11 atoms in block     46
 Block first atom:    714
 Blocpdb>    17 atoms in block     47
 Block first atom:    725
 Blocpdb>    13 atoms in block     48
 Block first atom:    742
 Blocpdb>    19 atoms in block     49
 Block first atom:    755
 Blocpdb>    15 atoms in block     50
 Block first atom:    774
 Blocpdb>    13 atoms in block     51
 Block first atom:    789
 Blocpdb>    15 atoms in block     52
 Block first atom:    802
 Blocpdb>    20 atoms in block     53
 Block first atom:    817
 Blocpdb>    24 atoms in block     54
 Block first atom:    837
 Blocpdb>    15 atoms in block     55
 Block first atom:    861
 Blocpdb>    17 atoms in block     56
 Block first atom:    876
 Blocpdb>    13 atoms in block     57
 Block first atom:    893
 Blocpdb>    17 atoms in block     58
 Block first atom:    906
 Blocpdb>    14 atoms in block     59
 Block first atom:    923
 Blocpdb>    16 atoms in block     60
 Block first atom:    937
 Blocpdb>    17 atoms in block     61
 Block first atom:    953
 Blocpdb>    21 atoms in block     62
 Block first atom:    970
 Blocpdb>    10 atoms in block     63
 Block first atom:    991
 Blocpdb>    13 atoms in block     64
 Block first atom:   1001
 Blocpdb>    15 atoms in block     65
 Block first atom:   1014
 Blocpdb>    12 atoms in block     66
 Block first atom:   1029
 Blocpdb>    22 atoms in block     67
 Block first atom:   1041
 Blocpdb>    16 atoms in block     68
 Block first atom:   1063
 Blocpdb>    16 atoms in block     69
 Block first atom:   1079
 Blocpdb>    10 atoms in block     70
 Block first atom:   1095
 Blocpdb>    19 atoms in block     71
 Block first atom:   1105
 Blocpdb>    15 atoms in block     72
 Block first atom:   1124
 Blocpdb>    15 atoms in block     73
 Block first atom:   1139
 Blocpdb>    14 atoms in block     74
 Block first atom:   1154
 Blocpdb>    18 atoms in block     75
 Block first atom:   1168
 Blocpdb>    17 atoms in block     76
 Block first atom:   1186
 Blocpdb>    13 atoms in block     77
 Block first atom:   1203
 Blocpdb>    14 atoms in block     78
 Block first atom:   1216
 Blocpdb>    15 atoms in block     79
 Block first atom:   1230
 Blocpdb>    16 atoms in block     80
 Block first atom:   1245
 Blocpdb>    16 atoms in block     81
 Block first atom:   1261
 Blocpdb>    13 atoms in block     82
 Block first atom:   1277
 Blocpdb>    14 atoms in block     83
 Block first atom:   1290
 Blocpdb>    17 atoms in block     84
 Block first atom:   1304
 Blocpdb>    19 atoms in block     85
 Block first atom:   1321
 Blocpdb>    14 atoms in block     86
 Block first atom:   1340
 Blocpdb>    16 atoms in block     87
 Block first atom:   1354
 Blocpdb>    15 atoms in block     88
 Block first atom:   1370
 Blocpdb>    15 atoms in block     89
 Block first atom:   1385
 Blocpdb>    13 atoms in block     90
 Block first atom:   1400
 Blocpdb>    18 atoms in block     91
 Block first atom:   1413
 Blocpdb>    15 atoms in block     92
 Block first atom:   1431
 Blocpdb>    10 atoms in block     93
 Block first atom:   1446
 Blocpdb>    18 atoms in block     94
 Block first atom:   1456
 Blocpdb>    18 atoms in block     95
 Block first atom:   1474
 Blocpdb>    13 atoms in block     96
 Block first atom:   1492
 Blocpdb>    15 atoms in block     97
 Block first atom:   1505
 Blocpdb>    18 atoms in block     98
 Block first atom:   1520
 Blocpdb>    15 atoms in block     99
 Block first atom:   1538
 Blocpdb>    16 atoms in block    100
 Block first atom:   1553
 Blocpdb>    13 atoms in block    101
 Block first atom:   1569
 Blocpdb>    12 atoms in block    102
 Block first atom:   1582
 Blocpdb>    14 atoms in block    103
 Block first atom:   1594
 Blocpdb>    18 atoms in block    104
 Block first atom:   1608
 Blocpdb>    13 atoms in block    105
 Block first atom:   1626
 Blocpdb>    20 atoms in block    106
 Block first atom:   1639
 Blocpdb>    13 atoms in block    107
 Block first atom:   1659
 Blocpdb>    16 atoms in block    108
 Block first atom:   1672
 Blocpdb>    19 atoms in block    109
 Block first atom:   1688
 Blocpdb>    15 atoms in block    110
 Block first atom:   1707
 Blocpdb>    19 atoms in block    111
 Block first atom:   1722
 Blocpdb>    14 atoms in block    112
 Block first atom:   1741
 Blocpdb>    12 atoms in block    113
 Block first atom:   1755
 Blocpdb>    14 atoms in block    114
 Block first atom:   1767
 Blocpdb>    22 atoms in block    115
 Block first atom:   1781
 Blocpdb>    13 atoms in block    116
 Block first atom:   1803
 Blocpdb>    11 atoms in block    117
 Block first atom:   1816
 Blocpdb>    14 atoms in block    118
 Block first atom:   1827
 Blocpdb>    16 atoms in block    119
 Block first atom:   1841
 Blocpdb>    15 atoms in block    120
 Block first atom:   1857
 Blocpdb>    15 atoms in block    121
 Block first atom:   1872
 Blocpdb>    13 atoms in block    122
 Block first atom:   1887
 Blocpdb>    14 atoms in block    123
 Block first atom:   1900
 Blocpdb>    17 atoms in block    124
 Block first atom:   1914
 Blocpdb>    16 atoms in block    125
 Block first atom:   1931
 Blocpdb>    15 atoms in block    126
 Block first atom:   1947
 Blocpdb>    21 atoms in block    127
 Block first atom:   1962
 Blocpdb>    15 atoms in block    128
 Block first atom:   1983
 Blocpdb>    14 atoms in block    129
 Block first atom:   1998
 Blocpdb>    11 atoms in block    130
 Block first atom:   2012
 Blocpdb>    15 atoms in block    131
 Block first atom:   2023
 Blocpdb>    19 atoms in block    132
 Block first atom:   2038
 Blocpdb>    17 atoms in block    133
 Block first atom:   2057
 Blocpdb>    19 atoms in block    134
 Block first atom:   2074
 Blocpdb>    16 atoms in block    135
 Block first atom:   2093
 Blocpdb>    19 atoms in block    136
 Block first atom:   2109
 Blocpdb>    22 atoms in block    137
 Block first atom:   2128
 Blocpdb>    19 atoms in block    138
 Block first atom:   2150
 Blocpdb>    19 atoms in block    139
 Block first atom:   2169
 Blocpdb>    16 atoms in block    140
 Block first atom:   2188
 Blocpdb>    15 atoms in block    141
 Block first atom:   2203

 Blocpdb>   141 blocks.

 Blocpdb> At most,     25 atoms in each of them.
 Blocpdb> At least,     9 atoms in each of them.

 Blocpdb> Normal end of Blocpdb.

 Diagrtb> Memory allocation for Prepmat.
 Diagrtb> Memory allocation for RTB.
 Diagrtb> Memory allocation for Diagstd.
 Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes.

 Prepmat> Entering in.
 Prepmat> Rewriting of the matrix begins.

 Prepmat>       831018 matrix lines read.

 Prepmat> Matrix order    =       6654

 Prepmat> Matrix trace    =    1817120.0000
 Prepmat> Last element read:    6654   6654       179.8462
 Prepmat>        10012 lines saved.
 Prepmat>         8587 empty lines.
 Prepmat> Number of lines on output is as expected.
 Prepmat> Normal end of Prepmat.

 RTB> Entering in.
 RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file:  2218
 RTB> Total mass =        2218.0000
 RTB> Number of atoms found in matrix:  2218
 RTB> Number of blocks =   141
 RTB> Projection begins.
 RTB> Projected matrix is being saved.
 RTB> Projected matrix trace =  194195.3494
 RTB>     49149 non-zero elements.
 RTB> Normal end of RTB.

 Diagstd> Entering in.

 Openam> file on opening on unit     10:
 diagrtb_work.sdijb                      
 Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb                      
 Diagstd> CERFACS matrix format.
 Diagstd> Projected matrix order =      846
 Diagstd> Nb of non-zero elements:    49149
 Diagstd> Projected matrix trace =  194195.3494

 Openam> file on opening on unit     11:
 diagrtb_work.eigenfacs                  
 Diagstd> Diagonalization.

 Diagstd>    846 eigenvectors are computed. 
 Diagstd>    106 of them to be saved. 

 Diagstd> Sum of eigenvalues = 194195.3494
 Diagstd> Best zero-eigenvalue found  :     0.000000

 Diagstd>      6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to:    0.0000000

 Diagstd> Selected eigenvalues: 
      0.0000000      0.0000000      0.0000000      0.0000000      0.0000000
      0.0000000      1.6822901      2.7703056      2.9706535      3.8958360
      4.4812622      4.8669666      5.8119958      6.7191727      7.6166800
      7.6590240      8.1738728      8.6732081      9.9227755     10.6280841
     11.2137823     11.8252227     12.0886710     12.7259160     13.5861032
     14.2258405     14.6848094     15.4843406     15.9985792     16.4141016
     16.8556534     17.9665284     19.5716289     19.7981514     21.0399127
     21.7358402     22.6829476     23.1166655     24.2927185     24.6389933
     24.9373855     26.6818177     27.5786957     27.6705621     28.6669541
     29.3446524     29.9625944     30.2757914     31.2499319     32.9370792
     33.3426692     34.1561218     34.6531672     35.3724153     36.1968166
     36.8432179     37.4691863     37.8266128     38.6034109     39.4405500
     40.3306841     40.8906390     41.0721352     41.8438627     42.8259118
     43.4932021     44.7269822     44.9273364     45.8852500     46.5704437
     47.5916111     47.7414160     48.9494088     49.5277674     50.1347898
     50.8196323     51.9016243     52.1907433     52.9890857     54.1466029
     54.3971246     55.2892523     55.7560321     55.9670341     56.6234106
     58.0315753     58.6673115     59.6210960     59.8602244     60.4845454
     62.5743816     63.3297632     63.8117271     64.4079670     65.4195256
     66.0019009     66.4917493     67.4238619     68.1459134     69.2951041
     69.6880233     70.3963751     71.4612966     72.4089362     72.9911403
     73.5857383

 Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units):
      0.0034311      0.0034314      0.0034332      0.0034333      0.0034340
      0.0034345    140.8463917    180.7420149    187.1635527    214.3362429
    229.8769676    239.5656027    261.7929369    281.4836552    299.6940600
    300.5259619    310.4625478    319.8049359    342.0675386    354.0159024
    363.6397410    373.4220382    377.5587677    387.3823292    400.2605010
    409.5757623    416.1303940    427.3086047    434.3461621    439.9505237
    445.8287549    460.2855745    480.4063800    483.1784992    498.1008091
    506.2715194    517.1839334    522.1050272    535.2212393    539.0223333
    542.2764446    560.9226624    570.2721225    571.2211395    581.4147645
    588.2470597    594.4084683    597.5070475    607.0435067    623.2148921
    627.0403114    634.6430922    639.2441283    645.8440125    653.3267932
    659.1345212    664.7103041    667.8731852    674.6959762    681.9723414
    689.6251230    694.3960292    695.9353883    702.4431222    710.6382660
    716.1532578    726.2398545    727.8646308    735.5832503    741.0550448
    749.1356828    750.3137900    759.7470210    764.2222114    768.8911804
    774.1249048    782.3223811    784.4983263    790.4756443    799.0627535
    800.9091440    807.4499997    810.8512863    812.3841219    817.1340209
    827.2322558    831.7510801    838.4849233    840.1647388    844.5346851
    859.0007903    864.1700532    867.4521541    871.4953534    878.3123217
    882.2130994    885.4808220    891.6657648    896.4275365    903.9544684
    906.5136610    911.1091930    917.9747302    924.0412603    927.7486998
    931.5198334

 Diagstd> Normal end.

 Rtb_to_modes> Entering in.

 Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file =   2218
 Rtb_to_modes> Number of blocs =    141

 Openam> file on opening on unit     10:
 diagrtb_work.eigenfacs                  

 Openam> file on opening on unit     11:
 matrix.eigenrtb                         

 Rdmodfacs> Entering in.

 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     1
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  9.9836E-10

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     2
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  9.9854E-10

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     3
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  9.9958E-10

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     4
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  9.9964E-10

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     5
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  1.0000E-09

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     6
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  1.0003E-09

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     7
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   1.682    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     8
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   2.770    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     9
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   2.971    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    10
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   3.896    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    11
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   4.481    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    12
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   4.867    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    13
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   5.812    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    14
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   6.719    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    15
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   7.617    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    16
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   7.659    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    17
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   8.174    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    18
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   8.673    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    19
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   9.923    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    20
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   10.63    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    21
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   11.21    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    22
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   11.83    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    23
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   12.09    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    24
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   12.73    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    25
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   13.59    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    26
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   14.23    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    27
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   14.68    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    28
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   15.48    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    29
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   16.00    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    30
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   16.41    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    31
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   16.86    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    32
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   17.97    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    33
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   19.57    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    34
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   19.80    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    35
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   21.04    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    36
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   21.74    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    37
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   22.68    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    38
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   23.12    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    39
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   24.29    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    40
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   24.64    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    41
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   24.94    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    42
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   26.68    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    43
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   27.58    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    44
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   27.67    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    45
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   28.67    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    46
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   29.34    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    47
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   29.96    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    48
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   30.28    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    49
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   31.25    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    50
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   32.94    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    51
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   33.34    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    52
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   34.16    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    53
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   34.65    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    54
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   35.37    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    55
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   36.20    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    56
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   36.84    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    57
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   37.47    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    58
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   37.83    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    59
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   38.60    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    60
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   39.44    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    61
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   40.33    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    62
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   40.89    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    63
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   41.07    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    64
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   41.84    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    65
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   42.83    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    66
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   43.49    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    67
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   44.73    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    68
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   44.93    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    69
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   45.89    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    70
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   46.57    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    71
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   47.59    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    72
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   47.74    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    73
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   48.95    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    74
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   49.53    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    75
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   50.13    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    76
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   50.82    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    77
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   51.90    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    78
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   52.19    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    79
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   52.99    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    80
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   54.15    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    81
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   54.40    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    82
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   55.29    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    83
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   55.76    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    84
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   55.97    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    85
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   56.62    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    86
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   58.03    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    87
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   58.67    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    88
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   59.62    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    89
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   59.86    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    90
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   60.48    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    91
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   62.57    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    92
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   63.33    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    93
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   63.81    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    94
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   64.41    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    95
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   65.42    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    96
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   66.00    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    97
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   66.49    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    98
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   67.42    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    99
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   68.15    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   100
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   69.30    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   101
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   69.69    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   102
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   70.40    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   103
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   71.46    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   104
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   72.41    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   105
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   72.99    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   106
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   73.59    

 Rtb_to_modes>  106 vectors, with    846 coordinates in vector file.

 Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected):
 0.99998 1.00000 0.99999 1.00001 1.00000
 1.00000 1.00001 0.99998 0.99999 0.99997
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 0.99999 1.00000 0.99999 1.00002 1.00000
 0.99999 1.00001 0.99999 1.00001 1.00000
 1.00000 1.00000 0.99999 1.00001 1.00004
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 1.00003 1.00001 0.99998 0.99998 1.00002
 1.00002 1.00001 1.00000 1.00000 1.00001
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 0.99998 1.00002 0.99999 0.99999 1.00002
 1.00000 1.00002 0.99999 1.00002 1.00002
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 1.00000 0.99999 1.00001 1.00001 0.99999
 1.00000

 Rtb_to_modes> RTB block-file is being read.
 Rtb_to_modes>    39924 lines found in RTB file.

 Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected):
 0.99998 1.00000 0.99999 1.00001 1.00000
 1.00000 1.00001 0.99998 0.99999 0.99997
 1.00002 1.00002 0.99998 1.00002 0.99999
 0.99999 1.00000 0.99999 1.00002 1.00000
 0.99999 1.00001 0.99999 1.00001 1.00000
 1.00000 1.00000 0.99999 1.00001 1.00004
 0.99999 0.99998 0.99999 0.99996 1.00000
 1.00000 0.99997 0.99997 1.00001 1.00001
 1.00001 1.00000 1.00000 1.00002 0.99999
 1.00000 0.99999 0.99998 1.00001 1.00000
 0.99998 1.00000 1.00002 1.00002 1.00001
 1.00003 1.00001 0.99998 0.99998 1.00002
 1.00002 1.00001 1.00000 1.00000 1.00001
 1.00000 0.99998 0.99999 0.99998 0.99998
 1.00000 1.00000 0.99996 0.99998 0.99998
 0.99998 1.00002 0.99999 0.99999 1.00002
 1.00000 1.00002 0.99999 1.00002 1.00002
 1.00002 0.99998 1.00000 1.00001 1.00001
 1.00000 0.99999 0.99998 0.99999 1.00001
 1.00000 1.00001 1.00000 0.99999 0.99999
 1.00000 0.99999 1.00001 1.00001 0.99999
 1.00000

 Orthogonality of first eigenvectors (zero expected):
 Vector   2:-0.000
 Vector   3:-0.000-0.000
 Vector   4:-0.000-0.000 0.000
 Vector   5:-0.000 0.000 0.000 0.000
 Vector   6:-0.000-0.000-0.000-0.000 0.000
 Vector   7: 0.000-0.000-0.000-0.000 0.000-0.000
 Vector   8: 0.000-0.000-0.000-0.000-0.000 0.000 0.000
 Vector   9:-0.000 0.000 0.000-0.000 0.000-0.000 0.000 0.000
 Vector  10:-0.000-0.000 0.000 0.000-0.000-0.000 0.000 0.000-0.000

 Rtb_to_modes>   106 eigenvectors saved.

 Rtb_to_modes> Normal end.

 Diagrtb> Normal end.
B-factor analysis
 Bfactors> Version 1.22, Bordeaux.                
 Getnam> Eigenvector filename ?
 Getnam> 2603021107033082581.eigenfacs

 Openam> file on opening on unit     10:
 2603021107033082581.eigenfacs                                   
 Getnam> Corresponding pdb filename ?
 Getnam> 2603021107033082581.atom

 Openam> file on opening on unit     11:
 2603021107033082581.atom                                        
 Getnum> Number of skipped eigenvectors ?
 Getnum>            0
 Getnum> Number of usefull eigenvectors ?
 Getnum>        10000
%Getnum-Err: number larger than    106 This is not allowed. Sorry.

 Rdatompdb> Reading pdb file.
 Rdatompdb> End of file reached.
 Rdatompdb> Number of I/O errors:            0

 Rdatompdb> Number of residues found =    282
            First residue number     =    362
            Last  residue number     =    643
            Number of atoms found    =   2218
            Mean number per residue  =      7.9

 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     1
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  9.9836E-10

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     2
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  9.9854E-10

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     3
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  9.9958E-10

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     4
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  9.9964E-10

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     5
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  1.0000E-09

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     6
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  1.0003E-09

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     7
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   1.682    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     8
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   2.770    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     9
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   2.971    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    10
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   3.896    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    11
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   4.481    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    12
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   4.867    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    13
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   5.812    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    14
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   6.719    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    15
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   7.617    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    16
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   7.659    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    17
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   8.174    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    18
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   8.673    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    19
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   9.923    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    20
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   10.63    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    21
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   11.21    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    22
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   11.83    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    23
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   12.09    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    24
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   12.73    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    25
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   13.59    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    26
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   14.23    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    27
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   14.68    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    28
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   15.48    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    29
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   16.00    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    30
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   16.41    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    31
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   16.86    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    32
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   17.97    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    33
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   19.57    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    34
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   19.80    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    35
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   21.04    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    36
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   21.74    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    37
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   22.68    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    38
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   23.12    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    39
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   24.29    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    40
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   24.64    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    41
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   24.94    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    42
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   26.68    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    43
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   27.58    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    44
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   27.67    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    45
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   28.67    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    46
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   29.34    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    47
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   29.96    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    48
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   30.28    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    49
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   31.25    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    50
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   32.94    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    51
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   33.34    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    52
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   34.16    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    53
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   34.65    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    54
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   35.37    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    55
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   36.20    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    56
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   36.84    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    57
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   37.47    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    58
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   37.83    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    59
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   38.60    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    60
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   39.44    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    61
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   40.33    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    62
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   40.89    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    63
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   41.07    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    64
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   41.84    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    65
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   42.83    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    66
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   43.49    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    67
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   44.73    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    68
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   44.93    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    69
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   45.89    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    70
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   46.57    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    71
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   47.59    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    72
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   47.74    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    73
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   48.95    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    74
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   49.53    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    75
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   50.13    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    76
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   50.82    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    77
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   51.90    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    78
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   52.19    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    79
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   52.99    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    80
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   54.15    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    81
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   54.40    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    82
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   55.29    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    83
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   55.76    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    84
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   55.97    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    85
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   56.62    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    86
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   58.03    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    87
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   58.67    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    88
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   59.62    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    89
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   59.86    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    90
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   60.48    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    91
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   62.57    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    92
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   63.33    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    93
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   63.81    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    94
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   64.41    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    95
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   65.42    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    96
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   66.00    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    97
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   66.49    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    98
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   67.42    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    99
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   68.15    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   100
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   69.30    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   101
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   69.69    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   102
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   70.40    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   103
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   71.46    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   104
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   72.41    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   105
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   72.99    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   106
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   73.59    

 Bfactors>  106 vectors,   6654 coordinates in file.

 Openam> file on opening on unit     12:
 bfactors.pred                                                   

 Bfactors> Best zero-eigenvalue found  :     0.000000
 Bfactors>     6 eigenvalues less than :     0.000000
 Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue  :     1.682000
 Bfactors>   100 eigenvectors will be considered.
 Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped.

 Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed.
          (CHARMM units assumed for eigenvalues)

 Bfactors> Correlation=     -0.355 for    282 C-alpha atoms.
 Bfactors> =      0.035 +/-   0.04
 Bfactors> =     85.747 +/-   9.57
 Bfactors> Shiftng-fct=     85.712
 Bfactors> Scaling-fct=    270.525

 Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved.

 Bfactors> Normal end.
check_modes
 Chkmod> Version 1.00, Bordeaux.                
 Getnam> Eigenvector filename ?
 Getnam> 2603021107033082581.eigenfacs

 Openam> file on opening on unit     10:
 2603021107033082581.eigenfacs                                   

 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     1
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:  3.4310E-03

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     2
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:  3.4313E-03

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     3
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:  3.4331E-03

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     4
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:  3.4332E-03

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     5
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:  3.4338E-03

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     6
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:  3.4343E-03

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     7
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   140.8    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     8
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   180.7    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     9
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   187.2    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    10
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   214.3    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    11
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   229.9    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    12
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   239.6    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    13
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   261.8    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    14
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   281.5    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    15
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 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   694.4    

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 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   896.4    

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 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   903.9    

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 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   911.1    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   103
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   917.9    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   104
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   924.0    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   105
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   927.7    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   106
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   931.5    

 Chkmod>  106 vectors,   6654 coordinates in file.
 Chkmod>      That is:   2218 cartesian points.

 Openam> file on opening on unit     11:
 Chkmod.res                                                      
 Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file.

 Chkmod> Normal end.
      0.0034      0.7332
      0.0034      0.8297
      0.0034      0.7984
      0.0034      0.8664
      0.0034      0.9704
      0.0034      0.9301
    140.8282      0.4843
    180.7243      0.4489
    187.1664      0.5409
    214.3316      0.4434
    229.8604      0.3922
    239.5561      0.3086
    261.7818      0.2836
    281.4680      0.3887
    299.6875      0.1767
    300.5126      0.4957
    310.4516      0.3751
    319.7874      0.3942
    342.0567      0.3779
    354.0326      0.4385
    363.5628      0.3735
    373.4814      0.4900
    377.5633      0.5968
    387.4279      0.1747
    400.3007      0.5278
    409.6181      0.6612
    416.0444      0.6492
    427.2304      0.4953
    434.3468      0.6139
    439.8767      0.3068
    445.8671      0.5287
    460.3103      0.5726
    480.3658      0.4084
    483.1803      0.4188
    498.0805      0.4385
    506.2982      0.5998
    517.1281      0.4046
    522.1203      0.5524
    535.1683      0.4927
    539.0102      0.4693
    542.2816      0.4165
    560.8795      0.4954
    570.2611      0.3496
    571.1908      0.5354
    581.4207      0.5887
    588.1752      0.5313
    594.3572      0.4351
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    634.6519      0.5894
    639.1875      0.4558
    645.7942      0.4757
    653.3275      0.5708
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    927.7016      0.4847
    931.5068      0.5206
getting mode 7
running: ../../bin/get_modes.sh 2603021107033082581 7 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 7
calculating perturbed structure for DQ=-100
2603021107033082581.eigenfacs
2603021107033082581.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2603021107033082581.eigenfacs
2603021107033082581.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2603021107033082581.eigenfacs
2603021107033082581.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2603021107033082581.eigenfacs
2603021107033082581.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2603021107033082581.eigenfacs
2603021107033082581.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2603021107033082581.eigenfacs
2603021107033082581.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2603021107033082581.eigenfacs
2603021107033082581.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2603021107033082581.eigenfacs
2603021107033082581.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2603021107033082581.eigenfacs
2603021107033082581.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2603021107033082581.eigenfacs
2603021107033082581.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2603021107033082581.eigenfacs
2603021107033082581.atom
making animated gifs
11 models are in 2603021107033082581.7.pdb, 1 models will be skipped
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MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
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MODEL 11 will be plotted
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making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2603021107033082581.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2603021107033082581.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 8
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normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 8
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making animated gifs
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MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
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MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
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11 models are in 2603021107033082581.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
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MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 9
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making animated gifs
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MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2603021107033082581.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2603021107033082581.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 10
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making animated gifs
11 models are in 2603021107033082581.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2603021107033082581.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2603021107033082581.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 11
running: ../../bin/get_modes.sh 2603021107033082581 11 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 11
calculating perturbed structure for DQ=-100
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2603021107033082581.eigenfacs
2603021107033082581.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2603021107033082581.eigenfacs
2603021107033082581.atom
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MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
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making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2603021107033082581.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2603021107033082581.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
2603021107033082581.10.pdb
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2603021107033082581.7.pdb
2603021107033082581.8.pdb
2603021107033082581.9.pdb



STDERR:
Note: The following floating-point exceptions are signalling: IEEE_DENORMAL

real	0m13.045s
user	0m12.927s
sys	0m0.113s
rm: cannot remove '2603021107033082581.sdijf': No such file or directory
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pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
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pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
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pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
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K. Suhre & Y.H. Sanejouand, ElNemo: a normal mode web-server for protein movement analysis and the generation of templates for molecular replacement. Nucleic Acids Research, 32, W610-W614, 2004.
K. Suhre & Y.H. Sanejouand, On the potential of normal mode analysis for solving difficult molecular replacement problems. Acta Cryst. D vol.60, p796-799, 2004 © International Union of Crystallography.
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Still some additional cleaning from time to time
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* HORMONE 14-JAN-23 8I2H *
