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* HORMONE 14-JAN-23 8I2H *

LOGs for ID: 2603021108393083219

Output from eigenvector calculation:


STDOUT:

CUTOFF set to default value (CUTOFF=8)
Build Tirion matrix:
 Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model.
 Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004.    

 Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file.

 Pdbmat> Coordinate filename     = 2603021108393083219.atom

 Pdbmat> Distance cutoff         =       8.00
         Force constant          =      10.00
         Origin of mass values   =       CONS
 Pdbmat> Levelshift              =    1.0E-09
         PRINTing level          =          2

 Pdbmat> Coordinate file 2603021108393083219.atom to be opened.

 Openam> File opened: 2603021108393083219.atom

 Pdbmat> Coordinate file in PDB format.

 Rdatompdb> Reading pdb file.
 Rdatompdb> End of file reached.
 Rdatompdb> Number of I/O errors:      0

 Rdatompdb> Number of residues found =    283
            First residue number     =    362
            Last  residue number     =      1
            Number of atoms found    =   2247
            Mean number per residue  =      7.9

 Pdbmat> Coordinate statistics: 
 =   111.885916 +/-     8.705493 From:    90.138000 To:   134.319000
 =   100.200768 +/-    12.586820 From:    69.210000 To:   129.652000
 =   117.796421 +/-    12.973418 From:    88.005000 To:   148.039000
 Pdbmat> Masses are all set to one.
%Pdbmat-W> residue:'UNL ' is not a well known amino-acid.

%Pdbmat-W>      1 residue(s) not known.

 Openam> File opened: pdbmat.xyzm
 Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved.

 Openam> File opened: pdbmat.sdijb

 Pdbmat> Matrix statistics:

 Pdbmat> The matrix is   3.7376 % Filled.
 Pdbmat>       849334  non-zero elements.
 Pdbmat>        92888 atom-atom interactions.

 Pdbmat> Number per atom=     82.68 +/-     21.25
         Maximum number =    134
         Minimum number =     17

 Pdbmat> Matrix trace   = 1.857760E+06
 Pdbmat> Larger element =  536.390    
 Pdbmat>      0 elements larger than +/-  1.0E+10

 Pdbmat> Normal end.
automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1)
283 non-zero elements, NRBL set to 2
Diagonalize Tirion matrix using diagrtb
 Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation.
 Diagrtb> Version 2.52, November 2004. 
 Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file.

 Diagrtb> Options taken into account:

 MATRix filename          = pdbmat.sdijb
 COORdinates filename     = 2603021108393083219.atom
 Eigenvector OUTPut file  = matrix.eigenrtb
 Nb of VECTors required   =        106
 EigeNVALues chosen       =       LOWE
 Type of SUBStructuring   =       NONE
 Nb of residues per BLOck =          2
 Origin of MASS values    =       CONS
 MATRix FORMat            =       BINA
 Temporary files cleaning =       ALL 
 Output PRINting level    =          2

 Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb.

 Blocpdb> Entering in.

 Openam> file on opening on unit     10:
 diagrtb_work.xyzm   

 Blocpdb> Coordinate file 2603021108393083219.atom to be opened.

 Openam> file on opening on unit     11:
 2603021108393083219.atom                                                                                                        

 Blocpdb> Coordinate file in PDB format.

 Blocpdb>  2247 atoms picked in pdb file.
 Blocpdb>   All masses set to unity.
 Blocpdb> Coordinate file is rewritten.

 Blocpdb> Substructuring:
 Blocpdb>     2 residue(s) per block.
 Blocpdb>   283 residues.
 Blocpdb>    20 atoms in block      1
 Block first atom:      1
 Blocpdb>    16 atoms in block      2
 Block first atom:     21
 Blocpdb>    18 atoms in block      3
 Block first atom:     37
 Blocpdb>    16 atoms in block      4
 Block first atom:     55
 Blocpdb>    25 atoms in block      5
 Block first atom:     71
 Blocpdb>    14 atoms in block      6
 Block first atom:     96
 Blocpdb>    16 atoms in block      7
 Block first atom:    110
 Blocpdb>    13 atoms in block      8
 Block first atom:    126
 Blocpdb>    11 atoms in block      9
 Block first atom:    139
 Blocpdb>    16 atoms in block     10
 Block first atom:    150
 Blocpdb>    15 atoms in block     11
 Block first atom:    166
 Blocpdb>    15 atoms in block     12
 Block first atom:    181
 Blocpdb>    16 atoms in block     13
 Block first atom:    196
 Blocpdb>    14 atoms in block     14
 Block first atom:    212
 Blocpdb>    15 atoms in block     15
 Block first atom:    226
 Blocpdb>    21 atoms in block     16
 Block first atom:    241
 Blocpdb>    15 atoms in block     17
 Block first atom:    262
 Blocpdb>    14 atoms in block     18
 Block first atom:    277
 Blocpdb>    22 atoms in block     19
 Block first atom:    291
 Blocpdb>    16 atoms in block     20
 Block first atom:    313
 Blocpdb>    14 atoms in block     21
 Block first atom:    329
 Blocpdb>    13 atoms in block     22
 Block first atom:    343
 Blocpdb>    16 atoms in block     23
 Block first atom:    356
 Blocpdb>    16 atoms in block     24
 Block first atom:    372
 Blocpdb>    14 atoms in block     25
 Block first atom:    388
 Blocpdb>    12 atoms in block     26
 Block first atom:    402
 Blocpdb>    20 atoms in block     27
 Block first atom:    414
 Blocpdb>    16 atoms in block     28
 Block first atom:    434
 Blocpdb>    13 atoms in block     29
 Block first atom:    450
 Blocpdb>    13 atoms in block     30
 Block first atom:    463
 Blocpdb>    16 atoms in block     31
 Block first atom:    476
 Blocpdb>    17 atoms in block     32
 Block first atom:    492
 Blocpdb>    15 atoms in block     33
 Block first atom:    509
 Blocpdb>    21 atoms in block     34
 Block first atom:    524
 Blocpdb>    18 atoms in block     35
 Block first atom:    545
 Blocpdb>    17 atoms in block     36
 Block first atom:    563
 Blocpdb>    16 atoms in block     37
 Block first atom:    580
 Blocpdb>    23 atoms in block     38
 Block first atom:    596
 Blocpdb>    11 atoms in block     39
 Block first atom:    619
 Blocpdb>     9 atoms in block     40
 Block first atom:    630
 Blocpdb>    14 atoms in block     41
 Block first atom:    639
 Blocpdb>    10 atoms in block     42
 Block first atom:    653
 Blocpdb>    15 atoms in block     43
 Block first atom:    663
 Blocpdb>    18 atoms in block     44
 Block first atom:    678
 Blocpdb>    18 atoms in block     45
 Block first atom:    696
 Blocpdb>    11 atoms in block     46
 Block first atom:    714
 Blocpdb>    17 atoms in block     47
 Block first atom:    725
 Blocpdb>    13 atoms in block     48
 Block first atom:    742
 Blocpdb>    19 atoms in block     49
 Block first atom:    755
 Blocpdb>    15 atoms in block     50
 Block first atom:    774
 Blocpdb>    13 atoms in block     51
 Block first atom:    789
 Blocpdb>    15 atoms in block     52
 Block first atom:    802
 Blocpdb>    20 atoms in block     53
 Block first atom:    817
 Blocpdb>    24 atoms in block     54
 Block first atom:    837
 Blocpdb>    15 atoms in block     55
 Block first atom:    861
 Blocpdb>    17 atoms in block     56
 Block first atom:    876
 Blocpdb>    13 atoms in block     57
 Block first atom:    893
 Blocpdb>    17 atoms in block     58
 Block first atom:    906
 Blocpdb>    14 atoms in block     59
 Block first atom:    923
 Blocpdb>    16 atoms in block     60
 Block first atom:    937
 Blocpdb>    17 atoms in block     61
 Block first atom:    953
 Blocpdb>    21 atoms in block     62
 Block first atom:    970
 Blocpdb>    10 atoms in block     63
 Block first atom:    991
 Blocpdb>    13 atoms in block     64
 Block first atom:   1001
 Blocpdb>    15 atoms in block     65
 Block first atom:   1014
 Blocpdb>    12 atoms in block     66
 Block first atom:   1029
 Blocpdb>    22 atoms in block     67
 Block first atom:   1041
 Blocpdb>    16 atoms in block     68
 Block first atom:   1063
 Blocpdb>    16 atoms in block     69
 Block first atom:   1079
 Blocpdb>    10 atoms in block     70
 Block first atom:   1095
 Blocpdb>    19 atoms in block     71
 Block first atom:   1105
 Blocpdb>    15 atoms in block     72
 Block first atom:   1124
 Blocpdb>    15 atoms in block     73
 Block first atom:   1139
 Blocpdb>    14 atoms in block     74
 Block first atom:   1154
 Blocpdb>    18 atoms in block     75
 Block first atom:   1168
 Blocpdb>    17 atoms in block     76
 Block first atom:   1186
 Blocpdb>    13 atoms in block     77
 Block first atom:   1203
 Blocpdb>    14 atoms in block     78
 Block first atom:   1216
 Blocpdb>    15 atoms in block     79
 Block first atom:   1230
 Blocpdb>    16 atoms in block     80
 Block first atom:   1245
 Blocpdb>    16 atoms in block     81
 Block first atom:   1261
 Blocpdb>    13 atoms in block     82
 Block first atom:   1277
 Blocpdb>    14 atoms in block     83
 Block first atom:   1290
 Blocpdb>    17 atoms in block     84
 Block first atom:   1304
 Blocpdb>    19 atoms in block     85
 Block first atom:   1321
 Blocpdb>    14 atoms in block     86
 Block first atom:   1340
 Blocpdb>    16 atoms in block     87
 Block first atom:   1354
 Blocpdb>    15 atoms in block     88
 Block first atom:   1370
 Blocpdb>    15 atoms in block     89
 Block first atom:   1385
 Blocpdb>    13 atoms in block     90
 Block first atom:   1400
 Blocpdb>    18 atoms in block     91
 Block first atom:   1413
 Blocpdb>    15 atoms in block     92
 Block first atom:   1431
 Blocpdb>    10 atoms in block     93
 Block first atom:   1446
 Blocpdb>    18 atoms in block     94
 Block first atom:   1456
 Blocpdb>    18 atoms in block     95
 Block first atom:   1474
 Blocpdb>    13 atoms in block     96
 Block first atom:   1492
 Blocpdb>    15 atoms in block     97
 Block first atom:   1505
 Blocpdb>    18 atoms in block     98
 Block first atom:   1520
 Blocpdb>    15 atoms in block     99
 Block first atom:   1538
 Blocpdb>    16 atoms in block    100
 Block first atom:   1553
 Blocpdb>    13 atoms in block    101
 Block first atom:   1569
 Blocpdb>    12 atoms in block    102
 Block first atom:   1582
 Blocpdb>    14 atoms in block    103
 Block first atom:   1594
 Blocpdb>    18 atoms in block    104
 Block first atom:   1608
 Blocpdb>    13 atoms in block    105
 Block first atom:   1626
 Blocpdb>    20 atoms in block    106
 Block first atom:   1639
 Blocpdb>    13 atoms in block    107
 Block first atom:   1659
 Blocpdb>    16 atoms in block    108
 Block first atom:   1672
 Blocpdb>    19 atoms in block    109
 Block first atom:   1688
 Blocpdb>    15 atoms in block    110
 Block first atom:   1707
 Blocpdb>    19 atoms in block    111
 Block first atom:   1722
 Blocpdb>    14 atoms in block    112
 Block first atom:   1741
 Blocpdb>    12 atoms in block    113
 Block first atom:   1755
 Blocpdb>    14 atoms in block    114
 Block first atom:   1767
 Blocpdb>    22 atoms in block    115
 Block first atom:   1781
 Blocpdb>    13 atoms in block    116
 Block first atom:   1803
 Blocpdb>    11 atoms in block    117
 Block first atom:   1816
 Blocpdb>    14 atoms in block    118
 Block first atom:   1827
 Blocpdb>    16 atoms in block    119
 Block first atom:   1841
 Blocpdb>    15 atoms in block    120
 Block first atom:   1857
 Blocpdb>    15 atoms in block    121
 Block first atom:   1872
 Blocpdb>    13 atoms in block    122
 Block first atom:   1887
 Blocpdb>    14 atoms in block    123
 Block first atom:   1900
 Blocpdb>    17 atoms in block    124
 Block first atom:   1914
 Blocpdb>    16 atoms in block    125
 Block first atom:   1931
 Blocpdb>    15 atoms in block    126
 Block first atom:   1947
 Blocpdb>    21 atoms in block    127
 Block first atom:   1962
 Blocpdb>    15 atoms in block    128
 Block first atom:   1983
 Blocpdb>    14 atoms in block    129
 Block first atom:   1998
 Blocpdb>    11 atoms in block    130
 Block first atom:   2012
 Blocpdb>    15 atoms in block    131
 Block first atom:   2023
 Blocpdb>    19 atoms in block    132
 Block first atom:   2038
 Blocpdb>    17 atoms in block    133
 Block first atom:   2057
 Blocpdb>    19 atoms in block    134
 Block first atom:   2074
 Blocpdb>    16 atoms in block    135
 Block first atom:   2093
 Blocpdb>    19 atoms in block    136
 Block first atom:   2109
 Blocpdb>    22 atoms in block    137
 Block first atom:   2128
 Blocpdb>    19 atoms in block    138
 Block first atom:   2150
 Blocpdb>    19 atoms in block    139
 Block first atom:   2169
 Blocpdb>    16 atoms in block    140
 Block first atom:   2188
 Blocpdb>    15 atoms in block    141
 Block first atom:   2204
 Blocpdb>    29 atoms in block    142
 Block first atom:   2218

 Blocpdb>   142 blocks.

 Blocpdb> At most,     29 atoms in each of them.
 Blocpdb> At least,     9 atoms in each of them.

 Blocpdb> Normal end of Blocpdb.

 Diagrtb> Memory allocation for Prepmat.
 Diagrtb> Memory allocation for RTB.
 Diagrtb> Memory allocation for Diagstd.
 Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes.

 Prepmat> Entering in.
 Prepmat> Rewriting of the matrix begins.

 Prepmat>       849476 matrix lines read.

 Prepmat> Matrix order    =       6741

 Prepmat> Matrix trace    =    1857760.0000
 Prepmat> Last element read:    6741   6741       237.0434
 Prepmat>        10154 lines saved.
 Prepmat>         8706 empty lines.
 Prepmat> Number of lines on output is as expected.
 Prepmat> Normal end of Prepmat.

 RTB> Entering in.
 RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file:  2247
 RTB> Total mass =        2247.0000
 RTB> Number of atoms found in matrix:  2247
 RTB> Number of blocks =   142
 RTB> Projection begins.
 RTB> Projected matrix is being saved.
 RTB> Projected matrix trace =  197654.6201
 RTB>     49962 non-zero elements.
 RTB> Normal end of RTB.

 Diagstd> Entering in.

 Openam> file on opening on unit     10:
 diagrtb_work.sdijb                      
 Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb                      
 Diagstd> CERFACS matrix format.
 Diagstd> Projected matrix order =      852
 Diagstd> Nb of non-zero elements:    49962
 Diagstd> Projected matrix trace =  197654.6201

 Openam> file on opening on unit     11:
 diagrtb_work.eigenfacs                  
 Diagstd> Diagonalization.

 Diagstd>    852 eigenvectors are computed. 
 Diagstd>    106 of them to be saved. 

 Diagstd> Sum of eigenvalues = 197654.6201
 Diagstd> Best zero-eigenvalue found  :     0.000000

 Diagstd>      6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to:    0.0000000

 Diagstd> Selected eigenvalues: 
      0.0000000      0.0000000      0.0000000      0.0000000      0.0000000
      0.0000000      1.8292706      2.8175121      3.1952877      4.1382274
      4.7122640      5.0474380      6.3979962      7.1204469      7.7491774
      7.8525152      8.5418511      9.6074204     10.0463271     10.6886066
     11.3465345     12.1802108     12.2629861     13.1586710     13.9101526
     14.4525015     15.0374451     15.6216595     16.3831857     16.7618086
     17.6640662     18.9777974     19.7129170     20.7339440     22.0336998
     22.2812321     23.2098404     23.8480778     24.6348432     25.0089901
     26.0772819     27.0921393     28.0332013     28.3813706     29.0213536
     30.1032318     30.2748638     30.6728821     31.7659312     33.6215965
     34.0203420     34.3778969     35.8806647     36.3104127     37.4136943
     37.6026846     37.9107470     38.3043878     39.6430129     39.9199557
     40.8909849     41.7093280     42.2130632     43.0841913     43.7512323
     45.0166982     45.0305640     45.8942919     46.7429948     47.7597597
     48.1153455     49.2115696     50.8498856     50.9353132     51.5199711
     51.7515893     52.6527835     54.0837541     54.3161268     55.1103457
     55.9011665     56.3174386     56.7336252     58.2196275     58.8597187
     59.8306541     60.7777837     61.2895088     62.5995794     63.4088229
     63.9792436     64.7103415     65.7272818     66.1994544     67.2271534
     67.5382498     68.8501422     69.2368605     70.0651949     70.6211462
     71.4358624     72.4098149     73.0763422     74.1901671     74.4748012
     74.7805628

 Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units):
      0.0034317      0.0034323      0.0034323      0.0034332      0.0034335
      0.0034346    146.8703922    182.2754493    194.1110515    220.9034278
    235.7274110    243.9668273    274.6738210    289.7669870    302.2895137
    304.2984040    317.3739510    336.5880386    344.1905463    355.0224578
    365.7858476    378.9855766    380.2711684    393.9138897    405.0057862
    412.8257630    421.0971553    429.1991606    439.5360062    444.5859343
    456.3947314    473.0621300    482.1372951    494.4657795    509.7285912
    512.5838065    523.1561770    530.3004194    538.9769358    543.0544261
    554.5317808    565.2192316    574.9520512    578.5114545    584.9976382
    595.8018418    597.4978947    601.4126693    612.0347426    629.6575948
    633.3803972    636.7001210    650.4673769    654.3511540    664.2179026
    665.8933936    668.6155164    672.0777890    683.7205088    686.1045601
    694.3989666    701.3129796    705.5352455    712.7779445    718.2744614
    728.5881433    728.7003423    735.6557212    742.4266405    750.4579224
    753.2464344    761.7788115    774.3552912    775.0054751    779.4407106
    781.1908108    787.9632226    798.5988768    800.3126420    806.1425559
    811.9059342    814.9232856    817.9288898    828.5715010    833.1138823
    839.9571974    846.5794258    850.1358892    859.1737269    864.7092921
    868.5900118    873.5386521    880.3758413    883.5324103    890.3641016
    892.4218217    901.0475313    903.5744949    908.9635068    912.5625902
    917.8113549    924.0468674    928.2900182    935.3377334    937.1302491
    939.0520065

 Diagstd> Normal end.

 Rtb_to_modes> Entering in.

 Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file =   2247
 Rtb_to_modes> Number of blocs =    142

 Openam> file on opening on unit     10:
 diagrtb_work.eigenfacs                  

 Openam> file on opening on unit     11:
 matrix.eigenrtb                         

 Rdmodfacs> Entering in.

 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     1
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  9.9868E-10

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     2
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  9.9903E-10

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     3
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  9.9904E-10

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     4
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  9.9954E-10

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     5
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  9.9974E-10

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     6
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  1.0004E-09

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     7
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   1.829    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     8
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   2.818    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     9
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   3.195    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    10
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   4.138    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    11
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   4.712    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    12
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   5.047    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    13
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   6.398    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    14
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   7.120    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    15
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   7.749    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    16
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   7.853    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    17
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   8.542    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    18
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   9.607    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    19
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   10.05    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    20
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   10.69    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    21
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   11.35    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    22
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   12.18    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    23
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   12.26    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    24
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   13.16    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    25
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   13.91    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    26
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   14.45    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    27
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   15.04    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    28
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   15.62    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    29
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   16.38    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    30
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   16.76    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    31
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   17.66    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    32
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   18.98    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    33
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   19.71    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    34
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   20.73    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    35
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   22.03    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    36
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   22.28    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    37
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   23.21    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    38
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   23.85    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    39
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   24.63    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    40
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   25.01    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    41
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   26.08    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    42
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   27.09    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    43
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   28.03    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    44
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   28.38    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    45
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   29.02    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    46
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   30.10    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    47
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   30.27    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    48
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   30.67    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    49
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   31.77    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    50
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   33.62    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    51
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   34.02    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    52
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   34.38    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    53
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   35.88    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    54
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   36.31    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    55
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   37.41    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    56
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   37.60    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    57
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   37.91    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    58
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   38.30    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    59
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   39.64    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    60
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   39.92    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    61
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   40.89    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    62
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   41.71    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    63
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   42.21    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    64
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   43.08    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    65
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   43.75    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    66
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   45.02    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    67
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   45.03    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    68
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   45.89    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    69
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   46.74    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    70
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   47.76    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    71
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   48.12    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    72
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   49.21    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    73
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   50.85    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    74
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   50.94    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    75
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   51.52    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    76
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   51.75    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    77
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   52.65    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    78
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   54.08    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    79
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   54.32    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    80
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   55.11    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    81
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   55.90    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    82
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   56.32    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    83
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   56.73    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    84
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   58.22    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    85
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   58.86    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    86
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   59.83    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    87
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   60.78    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    88
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   61.29    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    89
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   62.60    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    90
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   63.41    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    91
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   63.98    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    92
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   64.71    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    93
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   65.73    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    94
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   66.20    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    95
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   67.23    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    96
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   67.54    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    97
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   68.85    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    98
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   69.24    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    99
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   70.07    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   100
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   70.62    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   101
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   71.44    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   102
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   72.41    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   103
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   73.08    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   104
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   74.19    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   105
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   74.47    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   106
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   74.78    

 Rtb_to_modes>  106 vectors, with    852 coordinates in vector file.

 Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected):
 1.00000 1.00001 1.00000 1.00000 1.00000
 1.00001 0.99999 1.00001 0.99999 1.00002
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 1.00001 1.00000 1.00000 1.00001 1.00000
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 0.99997 1.00002 0.99999 1.00001 0.99999
 1.00001 0.99998 0.99998 0.99999 1.00003
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 1.00001 0.99999 0.99998 0.99999 1.00001
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 1.00000 1.00000 0.99999 1.00002 1.00001
 1.00003 1.00000 1.00002 1.00000 1.00000
 1.00001 1.00000 1.00002 1.00001 1.00001
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 0.99997 0.99999 0.99998 1.00001 1.00001
 0.99998

 Rtb_to_modes> RTB block-file is being read.
 Rtb_to_modes>    40446 lines found in RTB file.

 Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected):
 1.00000 1.00001 1.00000 1.00000 1.00000
 1.00001 0.99999 1.00001 0.99999 1.00002
 1.00000 1.00003 1.00003 1.00001 0.99998
 0.99996 1.00002 0.99997 1.00000 1.00000
 1.00001 1.00000 1.00000 1.00001 1.00000
 1.00000 1.00000 0.99998 1.00000 1.00000
 0.99998 1.00003 0.99999 1.00001 1.00001
 1.00000 1.00001 1.00000 1.00003 0.99999
 0.99997 1.00002 0.99999 1.00001 0.99999
 1.00001 0.99998 0.99998 0.99999 1.00003
 1.00000 1.00001 0.99998 1.00002 1.00000
 1.00001 0.99999 0.99998 0.99999 1.00001
 1.00000 0.99998 1.00003 0.99999 1.00000
 1.00000 1.00003 1.00000 0.99998 0.99999
 1.00002 1.00000 0.99999 0.99999 1.00000
 1.00000 1.00000 0.99999 1.00002 1.00001
 1.00003 1.00000 1.00002 1.00000 1.00000
 1.00001 1.00000 1.00002 1.00001 1.00001
 0.99999 1.00001 1.00001 1.00000 1.00000
 1.00000 1.00000 1.00001 0.99999 0.99998
 0.99997 0.99999 0.99998 1.00001 1.00001
 0.99998

 Orthogonality of first eigenvectors (zero expected):
 Vector   2: 0.000
 Vector   3: 0.000-0.000
 Vector   4: 0.000 0.000 0.000
 Vector   5: 0.000 0.000 0.000-0.000
 Vector   6:-0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
 Vector   7: 0.000-0.000-0.000-0.000 0.000-0.000
 Vector   8: 0.000-0.000 0.000-0.000-0.000 0.000-0.000
 Vector   9: 0.000-0.000 0.000 0.000-0.000-0.000-0.000 0.000
 Vector  10:-0.000 0.000 0.000-0.000 0.000 0.000 0.000 0.000-0.000

 Rtb_to_modes>   106 eigenvectors saved.

 Rtb_to_modes> Normal end.

 Diagrtb> Normal end.
B-factor analysis
 Bfactors> Version 1.22, Bordeaux.                
 Getnam> Eigenvector filename ?
 Getnam> 2603021108393083219.eigenfacs

 Openam> file on opening on unit     10:
 2603021108393083219.eigenfacs                                   
 Getnam> Corresponding pdb filename ?
 Getnam> 2603021108393083219.atom

 Openam> file on opening on unit     11:
 2603021108393083219.atom                                        
 Getnum> Number of skipped eigenvectors ?
 Getnum>            0
 Getnum> Number of usefull eigenvectors ?
 Getnum>        10000
%Getnum-Err: number larger than    106 This is not allowed. Sorry.

 Rdatompdb> Reading pdb file.
 Rdatompdb> End of file reached.
 Rdatompdb> Number of I/O errors:            0

 Rdatompdb> Number of residues found =    283
            First residue number     =    362
            Last  residue number     =      1
            Number of atoms found    =   2247
            Mean number per residue  =      7.9

 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     1
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  9.9868E-10

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     2
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  9.9903E-10

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     3
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  9.9904E-10

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     4
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  9.9954E-10

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     5
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  9.9974E-10

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     6
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  1.0004E-09

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     7
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   1.829    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     8
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   2.818    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     9
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   3.195    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    10
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   4.138    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    11
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   4.712    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    12
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   5.047    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    13
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   6.398    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    14
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   7.120    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    15
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   7.749    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    16
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   7.853    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    17
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   8.542    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    18
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   9.607    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    19
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   10.05    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    20
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   10.69    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    21
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   11.35    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    22
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   12.18    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    23
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   12.26    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    24
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   13.16    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    25
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   13.91    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    26
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   14.45    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    27
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   15.04    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    28
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   15.62    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    29
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   16.38    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    30
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   16.76    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    31
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   17.66    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    32
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   18.98    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    33
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   19.71    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    34
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   20.73    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    35
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   22.03    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    36
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   22.28    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    37
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   23.21    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    38
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   23.85    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    39
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   24.63    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    40
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   25.01    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    41
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   26.08    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    42
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   27.09    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    43
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   28.03    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    44
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   28.38    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    45
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   29.02    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    46
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   30.10    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    47
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   30.27    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    48
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   30.67    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    49
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   31.77    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    50
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   33.62    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    51
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   34.02    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    52
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   34.38    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    53
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   35.88    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    54
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   36.31    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    55
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   37.41    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    56
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   37.60    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    57
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   37.91    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    58
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   38.30    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    59
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   39.64    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    60
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   39.92    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    61
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   40.89    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    62
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   41.71    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    63
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   42.21    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    64
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   43.08    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    65
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   43.75    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    66
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   45.02    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    67
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   45.03    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    68
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   45.89    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    69
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   46.74    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    70
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   47.76    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    71
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   48.12    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    72
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   49.21    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    73
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   50.85    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    74
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   50.94    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    75
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   51.52    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    76
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   51.75    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    77
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   52.65    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    78
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   54.08    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    79
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   54.32    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    80
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   55.11    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    81
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   55.90    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    82
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   56.32    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    83
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   56.73    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    84
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   58.22    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    85
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   58.86    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    86
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   59.83    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    87
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   60.78    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    88
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   61.29    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    89
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   62.60    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    90
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   63.41    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    91
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   63.98    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    92
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   64.71    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    93
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   65.73    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    94
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   66.20    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    95
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   67.23    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    96
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   67.54    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    97
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   68.85    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    98
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   69.24    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    99
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   70.07    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   100
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   70.62    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   101
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   71.44    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   102
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   72.41    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   103
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   73.08    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   104
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   74.19    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   105
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   74.47    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   106
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   74.78    

 Bfactors>  106 vectors,   6741 coordinates in file.

 Openam> file on opening on unit     12:
 bfactors.pred                                                   

 Bfactors> Best zero-eigenvalue found  :     0.000000
 Bfactors>     6 eigenvalues less than :     0.000000
 Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue  :     1.829000
 Bfactors>   100 eigenvectors will be considered.
 Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped.

 Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed.
          (CHARMM units assumed for eigenvalues)

 Bfactors> Correlation=     -0.325 for    282 C-alpha atoms.
 Bfactors> =      0.034 +/-   0.03
 Bfactors> =     85.747 +/-   9.57
 Bfactors> Shiftng-fct=     85.714
 Bfactors> Scaling-fct=    286.862

 Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved.

 Bfactors> Normal end.
check_modes
 Chkmod> Version 1.00, Bordeaux.                
 Getnam> Eigenvector filename ?
 Getnam> 2603021108393083219.eigenfacs

 Openam> file on opening on unit     10:
 2603021108393083219.eigenfacs                                   

 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     1
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:  3.4315E-03

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     2
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:  3.4321E-03

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     3
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:  3.4322E-03

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     4
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:  3.4330E-03

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     5
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:  3.4334E-03

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     6
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:  3.4345E-03

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     7
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   146.9    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     8
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   182.3    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     9
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   194.1    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    10
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   220.9    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    11
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   235.7    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    12
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   243.9    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    13
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   274.7    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    14
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 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   668.6    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    58
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   672.0    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    59
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   683.7    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    60
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   686.1    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    61
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   694.4    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    62
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   701.3    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    63
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   705.5    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    64
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   712.7    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    65
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   718.2    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    66
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   728.6    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    67
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   728.7    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    68
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   735.6    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    69
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   742.4    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    70
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   750.4    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    71
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   753.3    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    72
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   761.7    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    73
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   774.3    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    74
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   775.0    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    75
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   779.4    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    76
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   781.1    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    77
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   787.9    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    78
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   798.5    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    79
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   800.3    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    80
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   806.1    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    81
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   811.9    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    82
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   814.9    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    83
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   817.9    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    84
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   828.5    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    85
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   833.1    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    86
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   839.9    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    87
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   846.6    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    88
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   850.1    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    89
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   859.1    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    90
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   864.7    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    91
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   868.6    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    92
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   873.5    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    93
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   880.4    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    94
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   883.5    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    95
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   890.3    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    96
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   892.4    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    97
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   901.0    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    98
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   903.6    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    99
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   909.0    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   100
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   912.5    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   101
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   917.8    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   102
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   924.0    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   103
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   928.3    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   104
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   935.3    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   105
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   937.1    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   106
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   939.0    

 Chkmod>  106 vectors,   6741 coordinates in file.
 Chkmod>      That is:   2247 cartesian points.

 Openam> file on opening on unit     11:
 Chkmod.res                                                      
 Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file.

 Chkmod> Normal end.
      0.0034      0.7900
      0.0034      0.7879
      0.0034      0.9735
      0.0034      0.9910
      0.0034      0.8601
      0.0034      0.7228
    146.8532      0.4982
    182.2834      0.4708
    194.0940      0.6083
    220.8879      0.4214
    235.7107      0.4122
    243.9458      0.2004
    274.6621      0.4068
    289.7455      0.2039
    302.2731      0.5989
    304.2947      0.2203
    317.3631      0.3074
    336.5662      0.3696
    344.2387      0.3498
    355.0304      0.4227
    365.8260      0.4011
    378.9660      0.4318
    380.2085      0.6488
    393.9169      0.2203
    404.9862      0.4802
    412.7723      0.6972
    421.1148      0.6865
    429.1579      0.5517
    439.4744      0.4485
    444.5429      0.5101
    456.3226      0.5916
    473.0693      0.5634
    482.0809      0.3566
    494.3975      0.3483
    509.6639      0.4967
    512.5476      0.4737
    523.1355      0.5304
    530.2990      0.5449
    538.9008      0.3757
    543.0421      0.4805
    554.5369      0.3825
    565.1727      0.4887
    574.8945      0.5116
    578.4727      0.5234
    584.9589      0.5169
    595.7443      0.5644
    597.4243      0.4689
    601.3586      0.5651
    612.0477      0.4022
    629.6156      0.3741
    633.3500      0.4510
    636.6923      0.5477
    650.4334      0.4600
    654.3193      0.5336
    664.1566      0.5035
    665.8410      0.4291
    668.5802      0.4896
    672.0104      0.4855
    683.6652      0.4472
    686.0755      0.4384
    694.3608      0.4069
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    705.4794      0.2976
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    742.3710      0.1056
    750.4276      0.3161
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    775.0079      0.4716
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    781.1453      0.5521
    787.9086      0.5783
    798.5369      0.4035
    800.3068      0.4963
    806.1054      0.4729
    811.8626      0.4755
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    817.8676      0.4980
    828.5386      0.5031
    833.0801      0.5031
    839.9165      0.5174
    846.5585      0.4958
    850.1028      0.5744
    859.1397      0.5328
    864.6802      0.5346
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    935.2965      0.4916
    937.0598      0.4415
    939.0082      0.4364
getting mode 7
running: ../../bin/get_modes.sh 2603021108393083219 7 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 7
calculating perturbed structure for DQ=-100
2603021108393083219.eigenfacs
2603021108393083219.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2603021108393083219.eigenfacs
2603021108393083219.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2603021108393083219.eigenfacs
2603021108393083219.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2603021108393083219.eigenfacs
2603021108393083219.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2603021108393083219.eigenfacs
2603021108393083219.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2603021108393083219.eigenfacs
2603021108393083219.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2603021108393083219.eigenfacs
2603021108393083219.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2603021108393083219.eigenfacs
2603021108393083219.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2603021108393083219.eigenfacs
2603021108393083219.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2603021108393083219.eigenfacs
2603021108393083219.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2603021108393083219.eigenfacs
2603021108393083219.atom
making animated gifs
11 models are in 2603021108393083219.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
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MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2603021108393083219.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
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11 models are in 2603021108393083219.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
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making thumbnail 100x100
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getting mode 8
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normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 8
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MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
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making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
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MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
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making thumbnail 100x100
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MODEL 1 will be plotted
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making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 9
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making animated gifs
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MODEL 1 will be plotted
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MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
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making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2603021108393083219.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2603021108393083219.9.pdb, 1 models will be skipped
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MODEL 3 will be plotted
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MODEL 9 will be plotted
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making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 10
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calculating perturbed structure for DQ=60
2603021108393083219.eigenfacs
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MODEL 3 will be plotted
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making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2603021108393083219.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2603021108393083219.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 11
running: ../../bin/get_modes.sh 2603021108393083219 11 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 11
calculating perturbed structure for DQ=-100
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making small animated gif 100x100
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11 models are in 2603021108393083219.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
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making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
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MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
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2603021108393083219.8.pdb
2603021108393083219.9.pdb



STDERR:
Note: The following floating-point exceptions are signalling: IEEE_DENORMAL

real	0m10.185s
user	0m10.111s
sys	0m0.070s
rm: cannot remove '2603021108393083219.sdijf': No such file or directory
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pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
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K. Suhre & Y.H. Sanejouand, ElNemo: a normal mode web-server for protein movement analysis and the generation of templates for molecular replacement. Nucleic Acids Research, 32, W610-W614, 2004.
K. Suhre & Y.H. Sanejouand, On the potential of normal mode analysis for solving difficult molecular replacement problems. Acta Cryst. D vol.60, p796-799, 2004 © International Union of Crystallography.
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It has been moved away and runs again.
Still some additional cleaning from time to time
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* HORMONE 14-JAN-23 8I2H *
