Should you encounter any unexpected behaviour,
please let us know.
elNémo has been hacked on november 27th.
It has been moved away and runs again.
Still some additional cleaning from time to time
Sorry for the inconvenience.

* HORMONE 14-JAN-23 8I2H *

LOGs for ID: 2603021201203093406

Output from eigenvector calculation:


STDOUT:

CUTOFF set to default value (CUTOFF=8)
Build Tirion matrix:
 Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model.
 Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004.    

 Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file.

 Pdbmat> Coordinate filename     = 2603021201203093406.atom

 Pdbmat> Distance cutoff         =       8.00
         Force constant          =      10.00
         Origin of mass values   =       CONS
 Pdbmat> Levelshift              =    1.0E-09
         PRINTing level          =          2

 Pdbmat> Coordinate file 2603021201203093406.atom to be opened.

 Openam> File opened: 2603021201203093406.atom

 Pdbmat> Coordinate file in PDB format.

 Rdatompdb> Reading pdb file.
 Rdatompdb> End of file reached.
 Rdatompdb> Number of I/O errors:      0

 Rdatompdb> Number of residues found =    282
            First residue number     =    362
            Last  residue number     =    643
            Number of atoms found    =   2225
            Mean number per residue  =      7.9

 Pdbmat> Coordinate statistics: 
 =   111.978023 +/-     8.698639 From:    90.138000 To:   134.319000
 =   100.329210 +/-    12.580812 From:    69.210000 To:   129.652000
 =   117.718250 +/-    13.006269 From:    88.005000 To:   148.039000
 Pdbmat> Masses are all set to one.

 Openam> File opened: pdbmat.xyzm
 Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved.

 Openam> File opened: pdbmat.sdijb

 Pdbmat> Matrix statistics:

 Pdbmat> The matrix is   3.7541 % Filled.
 Pdbmat>       836463  non-zero elements.
 Pdbmat>        91472 atom-atom interactions.

 Pdbmat> Number per atom=     82.22 +/-     21.12
         Maximum number =    132
         Minimum number =     17

 Pdbmat> Matrix trace   = 1.829440E+06
 Pdbmat> Larger element =  556.402    
 Pdbmat>      0 elements larger than +/-  1.0E+10

 Pdbmat> Normal end.
automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1)
282 non-zero elements, NRBL set to 2
Diagonalize Tirion matrix using diagrtb
 Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation.
 Diagrtb> Version 2.52, November 2004. 
 Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file.

 Diagrtb> Options taken into account:

 MATRix filename          = pdbmat.sdijb
 COORdinates filename     = 2603021201203093406.atom
 Eigenvector OUTPut file  = matrix.eigenrtb
 Nb of VECTors required   =        106
 EigeNVALues chosen       =       LOWE
 Type of SUBStructuring   =       NONE
 Nb of residues per BLOck =          2
 Origin of MASS values    =       CONS
 MATRix FORMat            =       BINA
 Temporary files cleaning =       ALL 
 Output PRINting level    =          2

 Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb.

 Blocpdb> Entering in.

 Openam> file on opening on unit     10:
 diagrtb_work.xyzm   

 Blocpdb> Coordinate file 2603021201203093406.atom to be opened.

 Openam> file on opening on unit     11:
 2603021201203093406.atom                                                                                                        

 Blocpdb> Coordinate file in PDB format.

 Blocpdb>  2225 atoms picked in pdb file.
 Blocpdb>   All masses set to unity.
 Blocpdb> Coordinate file is rewritten.

 Blocpdb> Substructuring:
 Blocpdb>     2 residue(s) per block.
 Blocpdb>   282 residues.
 Blocpdb>    20 atoms in block      1
 Block first atom:      1
 Blocpdb>    16 atoms in block      2
 Block first atom:     21
 Blocpdb>    18 atoms in block      3
 Block first atom:     37
 Blocpdb>    16 atoms in block      4
 Block first atom:     55
 Blocpdb>    25 atoms in block      5
 Block first atom:     71
 Blocpdb>    14 atoms in block      6
 Block first atom:     96
 Blocpdb>    16 atoms in block      7
 Block first atom:    110
 Blocpdb>    13 atoms in block      8
 Block first atom:    126
 Blocpdb>    11 atoms in block      9
 Block first atom:    139
 Blocpdb>    16 atoms in block     10
 Block first atom:    150
 Blocpdb>    15 atoms in block     11
 Block first atom:    166
 Blocpdb>    15 atoms in block     12
 Block first atom:    181
 Blocpdb>    16 atoms in block     13
 Block first atom:    196
 Blocpdb>    14 atoms in block     14
 Block first atom:    212
 Blocpdb>    15 atoms in block     15
 Block first atom:    226
 Blocpdb>    21 atoms in block     16
 Block first atom:    241
 Blocpdb>    15 atoms in block     17
 Block first atom:    262
 Blocpdb>    14 atoms in block     18
 Block first atom:    277
 Blocpdb>    22 atoms in block     19
 Block first atom:    291
 Blocpdb>    16 atoms in block     20
 Block first atom:    313
 Blocpdb>    14 atoms in block     21
 Block first atom:    329
 Blocpdb>    13 atoms in block     22
 Block first atom:    343
 Blocpdb>    16 atoms in block     23
 Block first atom:    356
 Blocpdb>    16 atoms in block     24
 Block first atom:    372
 Blocpdb>    14 atoms in block     25
 Block first atom:    388
 Blocpdb>    12 atoms in block     26
 Block first atom:    402
 Blocpdb>    20 atoms in block     27
 Block first atom:    414
 Blocpdb>    16 atoms in block     28
 Block first atom:    434
 Blocpdb>    13 atoms in block     29
 Block first atom:    450
 Blocpdb>    13 atoms in block     30
 Block first atom:    463
 Blocpdb>    16 atoms in block     31
 Block first atom:    476
 Blocpdb>    17 atoms in block     32
 Block first atom:    492
 Blocpdb>    15 atoms in block     33
 Block first atom:    509
 Blocpdb>    21 atoms in block     34
 Block first atom:    524
 Blocpdb>    18 atoms in block     35
 Block first atom:    545
 Blocpdb>    17 atoms in block     36
 Block first atom:    563
 Blocpdb>    16 atoms in block     37
 Block first atom:    580
 Blocpdb>    23 atoms in block     38
 Block first atom:    596
 Blocpdb>    11 atoms in block     39
 Block first atom:    619
 Blocpdb>     9 atoms in block     40
 Block first atom:    630
 Blocpdb>    14 atoms in block     41
 Block first atom:    639
 Blocpdb>    10 atoms in block     42
 Block first atom:    653
 Blocpdb>    15 atoms in block     43
 Block first atom:    663
 Blocpdb>    18 atoms in block     44
 Block first atom:    678
 Blocpdb>    18 atoms in block     45
 Block first atom:    696
 Blocpdb>    11 atoms in block     46
 Block first atom:    714
 Blocpdb>    17 atoms in block     47
 Block first atom:    725
 Blocpdb>    13 atoms in block     48
 Block first atom:    742
 Blocpdb>    19 atoms in block     49
 Block first atom:    755
 Blocpdb>    15 atoms in block     50
 Block first atom:    774
 Blocpdb>    13 atoms in block     51
 Block first atom:    789
 Blocpdb>    15 atoms in block     52
 Block first atom:    802
 Blocpdb>    20 atoms in block     53
 Block first atom:    817
 Blocpdb>    24 atoms in block     54
 Block first atom:    837
 Blocpdb>    15 atoms in block     55
 Block first atom:    861
 Blocpdb>    17 atoms in block     56
 Block first atom:    876
 Blocpdb>    13 atoms in block     57
 Block first atom:    893
 Blocpdb>    17 atoms in block     58
 Block first atom:    906
 Blocpdb>    14 atoms in block     59
 Block first atom:    923
 Blocpdb>    16 atoms in block     60
 Block first atom:    937
 Blocpdb>    17 atoms in block     61
 Block first atom:    953
 Blocpdb>    21 atoms in block     62
 Block first atom:    970
 Blocpdb>    10 atoms in block     63
 Block first atom:    991
 Blocpdb>    13 atoms in block     64
 Block first atom:   1001
 Blocpdb>    15 atoms in block     65
 Block first atom:   1014
 Blocpdb>    12 atoms in block     66
 Block first atom:   1029
 Blocpdb>    22 atoms in block     67
 Block first atom:   1041
 Blocpdb>    16 atoms in block     68
 Block first atom:   1063
 Blocpdb>    16 atoms in block     69
 Block first atom:   1079
 Blocpdb>    10 atoms in block     70
 Block first atom:   1095
 Blocpdb>    19 atoms in block     71
 Block first atom:   1105
 Blocpdb>    15 atoms in block     72
 Block first atom:   1124
 Blocpdb>    15 atoms in block     73
 Block first atom:   1139
 Blocpdb>    14 atoms in block     74
 Block first atom:   1154
 Blocpdb>    18 atoms in block     75
 Block first atom:   1168
 Blocpdb>    17 atoms in block     76
 Block first atom:   1186
 Blocpdb>    13 atoms in block     77
 Block first atom:   1203
 Blocpdb>    14 atoms in block     78
 Block first atom:   1216
 Blocpdb>    15 atoms in block     79
 Block first atom:   1230
 Blocpdb>    16 atoms in block     80
 Block first atom:   1245
 Blocpdb>    16 atoms in block     81
 Block first atom:   1261
 Blocpdb>    13 atoms in block     82
 Block first atom:   1277
 Blocpdb>    14 atoms in block     83
 Block first atom:   1290
 Blocpdb>    17 atoms in block     84
 Block first atom:   1304
 Blocpdb>    19 atoms in block     85
 Block first atom:   1321
 Blocpdb>    14 atoms in block     86
 Block first atom:   1340
 Blocpdb>    16 atoms in block     87
 Block first atom:   1354
 Blocpdb>    15 atoms in block     88
 Block first atom:   1370
 Blocpdb>    15 atoms in block     89
 Block first atom:   1385
 Blocpdb>    13 atoms in block     90
 Block first atom:   1400
 Blocpdb>    18 atoms in block     91
 Block first atom:   1413
 Blocpdb>    15 atoms in block     92
 Block first atom:   1431
 Blocpdb>    10 atoms in block     93
 Block first atom:   1446
 Blocpdb>    18 atoms in block     94
 Block first atom:   1456
 Blocpdb>    18 atoms in block     95
 Block first atom:   1474
 Blocpdb>    20 atoms in block     96
 Block first atom:   1492
 Blocpdb>    15 atoms in block     97
 Block first atom:   1512
 Blocpdb>    18 atoms in block     98
 Block first atom:   1527
 Blocpdb>    15 atoms in block     99
 Block first atom:   1545
 Blocpdb>    16 atoms in block    100
 Block first atom:   1560
 Blocpdb>    13 atoms in block    101
 Block first atom:   1576
 Blocpdb>    12 atoms in block    102
 Block first atom:   1589
 Blocpdb>    14 atoms in block    103
 Block first atom:   1601
 Blocpdb>    18 atoms in block    104
 Block first atom:   1615
 Blocpdb>    13 atoms in block    105
 Block first atom:   1633
 Blocpdb>    20 atoms in block    106
 Block first atom:   1646
 Blocpdb>    13 atoms in block    107
 Block first atom:   1666
 Blocpdb>    16 atoms in block    108
 Block first atom:   1679
 Blocpdb>    19 atoms in block    109
 Block first atom:   1695
 Blocpdb>    15 atoms in block    110
 Block first atom:   1714
 Blocpdb>    19 atoms in block    111
 Block first atom:   1729
 Blocpdb>    14 atoms in block    112
 Block first atom:   1748
 Blocpdb>    12 atoms in block    113
 Block first atom:   1762
 Blocpdb>    14 atoms in block    114
 Block first atom:   1774
 Blocpdb>    22 atoms in block    115
 Block first atom:   1788
 Blocpdb>    13 atoms in block    116
 Block first atom:   1810
 Blocpdb>    11 atoms in block    117
 Block first atom:   1823
 Blocpdb>    14 atoms in block    118
 Block first atom:   1834
 Blocpdb>    16 atoms in block    119
 Block first atom:   1848
 Blocpdb>    15 atoms in block    120
 Block first atom:   1864
 Blocpdb>    15 atoms in block    121
 Block first atom:   1879
 Blocpdb>    13 atoms in block    122
 Block first atom:   1894
 Blocpdb>    14 atoms in block    123
 Block first atom:   1907
 Blocpdb>    17 atoms in block    124
 Block first atom:   1921
 Blocpdb>    16 atoms in block    125
 Block first atom:   1938
 Blocpdb>    15 atoms in block    126
 Block first atom:   1954
 Blocpdb>    21 atoms in block    127
 Block first atom:   1969
 Blocpdb>    15 atoms in block    128
 Block first atom:   1990
 Blocpdb>    14 atoms in block    129
 Block first atom:   2005
 Blocpdb>    11 atoms in block    130
 Block first atom:   2019
 Blocpdb>    15 atoms in block    131
 Block first atom:   2030
 Blocpdb>    19 atoms in block    132
 Block first atom:   2045
 Blocpdb>    17 atoms in block    133
 Block first atom:   2064
 Blocpdb>    19 atoms in block    134
 Block first atom:   2081
 Blocpdb>    16 atoms in block    135
 Block first atom:   2100
 Blocpdb>    19 atoms in block    136
 Block first atom:   2116
 Blocpdb>    22 atoms in block    137
 Block first atom:   2135
 Blocpdb>    19 atoms in block    138
 Block first atom:   2157
 Blocpdb>    19 atoms in block    139
 Block first atom:   2176
 Blocpdb>    16 atoms in block    140
 Block first atom:   2195
 Blocpdb>    15 atoms in block    141
 Block first atom:   2210

 Blocpdb>   141 blocks.

 Blocpdb> At most,     25 atoms in each of them.
 Blocpdb> At least,     9 atoms in each of them.

 Blocpdb> Normal end of Blocpdb.

 Diagrtb> Memory allocation for Prepmat.
 Diagrtb> Memory allocation for RTB.
 Diagrtb> Memory allocation for Diagstd.
 Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes.

 Prepmat> Entering in.
 Prepmat> Rewriting of the matrix begins.

 Prepmat>       836604 matrix lines read.

 Prepmat> Matrix order    =       6675

 Prepmat> Matrix trace    =    1829440.0000
 Prepmat> Last element read:    6675   6675       179.8462
 Prepmat>        10012 lines saved.
 Prepmat>         8586 empty lines.
 Prepmat> Number of lines on output is as expected.
 Prepmat> Normal end of Prepmat.

 RTB> Entering in.
 RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file:  2225
 RTB> Total mass =        2225.0000
 RTB> Number of atoms found in matrix:  2225
 RTB> Number of blocks =   141
 RTB> Projection begins.
 RTB> Projected matrix is being saved.
 RTB> Projected matrix trace =  194770.4490
 RTB>     49185 non-zero elements.
 RTB> Normal end of RTB.

 Diagstd> Entering in.

 Openam> file on opening on unit     10:
 diagrtb_work.sdijb                      
 Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb                      
 Diagstd> CERFACS matrix format.
 Diagstd> Projected matrix order =      846
 Diagstd> Nb of non-zero elements:    49185
 Diagstd> Projected matrix trace =  194770.4490

 Openam> file on opening on unit     11:
 diagrtb_work.eigenfacs                  
 Diagstd> Diagonalization.

 Diagstd>    846 eigenvectors are computed. 
 Diagstd>    106 of them to be saved. 

 Diagstd> Sum of eigenvalues = 194770.4490
 Diagstd> Best zero-eigenvalue found  :     0.000000

 Diagstd>      6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to:    0.0000000

 Diagstd> Selected eigenvalues: 
      0.0000000      0.0000000      0.0000000      0.0000000      0.0000000
      0.0000000      1.7331013      2.7970741      3.0226724      3.9418176
      4.6000269      4.9265313      6.1385454      6.8519665      7.6797269
      7.7290763      8.3639872      8.9888923      9.9619470     10.6358332
     11.2733992     12.0435745     12.1256362     12.8752289     13.7401858
     14.4306976     14.8501235     15.5604182     16.3042903     16.7294899
     17.1643557     18.6581908     19.6982613     20.0094520     21.4888198
     22.0415855     22.8945295     23.2574064     24.5012955     24.7834570
     25.4961243     26.8547967     27.7451834     27.9465630     28.8953255
     29.5711090     30.1446654     30.3365858     31.4039885     33.1126200
     33.6360402     34.3140270     35.5693210     36.2148726     36.8165302
     37.2494287     37.5336051     38.1264986     39.2630523     39.5893969
     40.5794396     41.2132912     41.8331198     42.9647723     43.5054438
     44.0988630     44.8378174     44.9987806     46.3177361     46.8376475
     47.6679050     48.2092721     49.1637384     50.2130789     50.6842539
     51.2052804     52.1761239     52.8334009     53.7461214     54.5163758
     54.9132322     55.8497951     56.0386238     56.5720206     57.5966618
     58.1507035     59.8700529     60.0924711     60.5069674     62.3721480
     63.0682292     63.7324922     63.9886096     65.1909706     66.0046888
     66.5576087     67.0302123     68.0147148     68.4642088     69.6865738
     70.2592155     71.0638301     71.8911721     72.8754329     73.1080195
     73.8742257

 Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units):
      0.0034323      0.0034326      0.0034330      0.0034333      0.0034338
      0.0034343    142.9576014    181.6131381    188.7951442    215.5974116
    232.9032057    241.0271145    269.0469143    284.2515846    300.9318598
    301.8971946    314.0522871    325.5729897    342.7420528    354.1449386
    364.6050861    376.8538717    378.1355831    389.6482759    402.5238171
    412.5142384    418.4661306    428.3570437    438.4764060    444.1571210
    449.8927905    469.0617781    481.9580376    485.7500759    503.3864982
    509.8197967    519.5904281    523.6919781    537.5140297    540.6002256
    548.3178246    562.7379635    571.9908481    574.0629027    583.7260507
    590.5124874    596.2117272    598.1066499    608.5379754    624.8734219
    629.7928295    636.1083908    647.6391102    653.4897220    658.8957527
    662.7581673    665.2814597    670.5153766    680.4360420    683.2579969
    691.7486224    697.1302513    702.3529443    711.7894352    716.2540356
    721.1223841    727.1391236    728.4431319    739.0416975    743.1779521
    749.7359105    753.9812868    761.4085158    769.4912858    773.0931217
    777.0566022    784.3884434    789.3135599    796.1022377    801.7865535
    804.6995972    811.5327901    812.9035326    816.7631316    824.1266094
    828.0808985    840.2337094    841.7930039    844.6912073    857.6115686
    862.3838182    866.9134299    868.6535864    876.7767073    882.2317314
    885.9192435    889.0589896    895.5641930    898.5186113    906.5042332
    910.2211621    915.4182905    920.7316293    927.0130628    928.4911951
    933.3440241

 Diagstd> Normal end.

 Rtb_to_modes> Entering in.

 Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file =   2225
 Rtb_to_modes> Number of blocs =    141

 Openam> file on opening on unit     10:
 diagrtb_work.eigenfacs                  

 Openam> file on opening on unit     11:
 matrix.eigenrtb                         

 Rdmodfacs> Entering in.

 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     1
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  9.9905E-10

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     2
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  9.9921E-10

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     3
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  9.9945E-10

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     4
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  9.9961E-10

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     5
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  9.9990E-10

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     6
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  1.0002E-09

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     7
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   1.733    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     8
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   2.797    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     9
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   3.023    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    10
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   3.942    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    11
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   4.600    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    12
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   4.927    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    13
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   6.139    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    14
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   6.852    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    15
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   7.680    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    16
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   7.729    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    17
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   8.364    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    18
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   8.989    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    19
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   9.962    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    20
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   10.64    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    21
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   11.27    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    22
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   12.04    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    23
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   12.13    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    24
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   12.88    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    25
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   13.74    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    26
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   14.43    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    27
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   14.85    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    28
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   15.56    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    29
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   16.30    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    30
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   16.73    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    31
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   17.16    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    32
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   18.66    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    33
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   19.70    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    34
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   20.01    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    35
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   21.49    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    36
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   22.04    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    37
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   22.89    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    38
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   23.26    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    39
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   24.50    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    40
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   24.78    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    41
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   25.50    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    42
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   26.85    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    43
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   27.75    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    44
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   27.95    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    45
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   28.90    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    46
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   29.57    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    47
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   30.14    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    48
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   30.34    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    49
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   31.40    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    50
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   33.11    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    51
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   33.64    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    52
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   34.31    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    53
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   35.57    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    54
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   36.21    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    55
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   36.82    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    56
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   37.25    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    57
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   37.53    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    58
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   38.13    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    59
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   39.26    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    60
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   39.59    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    61
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   40.58    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    62
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   41.21    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    63
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   41.83    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    64
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   42.96    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    65
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   43.51    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    66
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   44.10    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    67
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   44.84    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    68
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   45.00    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    69
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   46.32    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    70
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   46.84    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    71
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   47.67    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    72
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   48.21    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    73
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   49.16    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    74
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   50.21    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    75
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   50.68    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    76
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   51.21    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    77
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   52.18    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    78
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   52.83    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    79
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   53.75    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    80
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   54.52    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    81
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   54.91    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    82
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   55.85    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    83
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   56.04    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    84
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   56.57    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    85
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   57.60    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    86
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   58.15    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    87
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   59.87    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    88
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   60.09    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    89
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   60.51    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    90
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   62.37    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    91
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   63.07    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    92
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   63.73    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    93
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   63.99    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    94
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   65.19    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    95
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   66.00    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    96
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   66.56    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    97
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   67.03    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    98
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   68.01    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    99
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   68.46    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   100
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   69.69    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   101
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   70.26    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   102
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   71.06    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   103
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   71.89    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   104
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   72.88    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   105
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   73.11    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   106
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   73.87    

 Rtb_to_modes>  106 vectors, with    846 coordinates in vector file.

 Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected):
 1.00001 1.00001 1.00001 1.00000 1.00002
 1.00001 0.99998 1.00001 1.00002 1.00000
 0.99998 1.00000 1.00000 0.99998 1.00002
 0.99998 0.99999 0.99996 0.99999 0.99997
 1.00000 0.99998 1.00001 0.99997 0.99999
 1.00002 1.00001 0.99999 0.99999 1.00000
 0.99997 1.00000 1.00002 0.99999 0.99999
 1.00001 0.99999 1.00000 1.00002 0.99997
 0.99999 1.00001 1.00001 0.99999 1.00000
 1.00001 1.00001 1.00001 0.99999 1.00001
 0.99999 1.00000 1.00000 1.00001 0.99998
 1.00001 0.99997 0.99999 0.99997 1.00000
 1.00001 1.00000 0.99997 0.99999 1.00002
 1.00002 0.99997 1.00002 1.00002 1.00001
 0.99998 1.00001 1.00001 0.99999 0.99999
 0.99999 1.00001 1.00000 1.00000 1.00000
 0.99999 1.00003 1.00000 1.00001 1.00002
 1.00001 0.99998 1.00001 0.99998 1.00001
 0.99999 1.00002 1.00002 0.99999 1.00000
 0.99998 0.99999 1.00001 1.00000 1.00000
 1.00001 1.00000 0.99999 1.00002 1.00001
 0.99999

 Rtb_to_modes> RTB block-file is being read.
 Rtb_to_modes>    40050 lines found in RTB file.

 Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected):
 1.00001 1.00001 1.00001 1.00000 1.00002
 1.00001 0.99998 1.00001 1.00002 1.00000
 0.99998 1.00000 1.00000 0.99998 1.00002
 0.99998 0.99999 0.99996 0.99999 0.99997
 1.00000 0.99998 1.00001 0.99997 0.99999
 1.00002 1.00001 0.99999 0.99999 1.00000
 0.99997 1.00000 1.00002 0.99999 0.99999
 1.00001 0.99999 1.00000 1.00002 0.99997
 0.99999 1.00001 1.00001 0.99999 1.00000
 1.00001 1.00001 1.00001 0.99999 1.00001
 0.99999 1.00000 1.00000 1.00001 0.99998
 1.00001 0.99997 0.99999 0.99997 1.00000
 1.00001 1.00000 0.99997 0.99999 1.00002
 1.00002 0.99997 1.00002 1.00002 1.00001
 0.99998 1.00001 1.00001 0.99999 0.99999
 0.99999 1.00001 1.00000 1.00000 1.00000
 0.99999 1.00003 1.00000 1.00001 1.00002
 1.00001 0.99998 1.00001 0.99998 1.00001
 0.99999 1.00002 1.00002 0.99999 1.00000
 0.99998 0.99999 1.00001 1.00000 1.00000
 1.00001 1.00000 0.99999 1.00002 1.00001
 0.99999

 Orthogonality of first eigenvectors (zero expected):
 Vector   2:-0.000
 Vector   3:-0.000-0.000
 Vector   4:-0.000 0.000-0.000
 Vector   5:-0.000 0.000-0.000 0.000
 Vector   6:-0.000 0.000-0.000-0.000-0.000
 Vector   7: 0.000-0.000 0.000 0.000-0.000 0.000
 Vector   8: 0.000 0.000 0.000-0.000 0.000-0.000-0.000
 Vector   9:-0.000-0.000 0.000-0.000-0.000-0.000 0.000-0.000
 Vector  10:-0.000 0.000 0.000-0.000-0.000-0.000-0.000 0.000-0.000

 Rtb_to_modes>   106 eigenvectors saved.

 Rtb_to_modes> Normal end.

 Diagrtb> Normal end.
B-factor analysis
 Bfactors> Version 1.22, Bordeaux.                
 Getnam> Eigenvector filename ?
 Getnam> 2603021201203093406.eigenfacs

 Openam> file on opening on unit     10:
 2603021201203093406.eigenfacs                                   
 Getnam> Corresponding pdb filename ?
 Getnam> 2603021201203093406.atom

 Openam> file on opening on unit     11:
 2603021201203093406.atom                                        
 Getnum> Number of skipped eigenvectors ?
 Getnum>            0
 Getnum> Number of usefull eigenvectors ?
 Getnum>        10000
%Getnum-Err: number larger than    106 This is not allowed. Sorry.

 Rdatompdb> Reading pdb file.
 Rdatompdb> End of file reached.
 Rdatompdb> Number of I/O errors:            0

 Rdatompdb> Number of residues found =    282
            First residue number     =    362
            Last  residue number     =    643
            Number of atoms found    =   2225
            Mean number per residue  =      7.9

 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     1
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  9.9905E-10

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     2
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  9.9921E-10

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     3
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  9.9945E-10

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     4
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  9.9961E-10

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     5
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  9.9990E-10

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     6
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  1.0002E-09

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     7
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   1.733    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     8
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   2.797    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     9
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   3.023    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    10
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   3.942    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    11
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   4.600    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    12
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   4.927    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    13
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   6.139    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    14
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   6.852    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    15
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   7.680    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    16
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   7.729    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    17
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   8.364    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    18
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   8.989    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    19
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   9.962    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    20
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   10.64    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    21
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   11.27    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    22
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   12.04    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    23
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   12.13    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    24
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   12.88    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    25
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   13.74    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    26
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   14.43    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    27
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   14.85    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    28
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   15.56    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    29
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   16.30    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    30
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   16.73    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    31
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   17.16    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    32
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   18.66    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    33
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   19.70    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    34
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   20.01    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    35
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   21.49    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    36
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   22.04    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    37
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   22.89    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    38
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   23.26    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    39
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   24.50    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    40
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   24.78    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    41
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   25.50    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    42
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   26.85    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    43
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   27.75    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    44
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   27.95    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    45
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   28.90    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    46
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   29.57    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    47
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   30.14    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    48
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   30.34    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    49
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   31.40    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    50
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   33.11    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    51
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   33.64    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    52
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   34.31    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    53
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   35.57    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    54
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   36.21    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    55
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   36.82    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    56
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   37.25    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    57
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   37.53    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    58
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   38.13    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    59
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   39.26    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    60
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   39.59    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    61
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   40.58    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    62
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   41.21    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    63
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   41.83    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    64
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   42.96    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    65
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   43.51    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    66
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   44.10    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    67
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   44.84    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    68
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   45.00    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    69
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   46.32    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    70
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   46.84    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    71
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   47.67    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    72
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   48.21    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    73
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   49.16    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    74
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   50.21    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    75
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   50.68    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    76
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   51.21    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    77
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   52.18    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    78
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   52.83    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    79
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   53.75    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    80
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   54.52    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    81
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   54.91    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    82
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   55.85    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    83
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   56.04    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    84
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   56.57    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    85
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   57.60    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    86
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   58.15    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    87
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   59.87    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    88
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   60.09    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    89
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   60.51    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    90
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   62.37    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    91
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   63.07    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    92
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   63.73    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    93
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   63.99    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    94
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   65.19    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    95
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   66.00    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    96
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   66.56    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    97
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   67.03    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    98
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   68.01    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    99
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   68.46    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   100
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   69.69    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   101
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   70.26    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   102
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   71.06    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   103
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   71.89    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   104
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   72.88    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   105
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   73.11    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   106
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   73.87    

 Bfactors>  106 vectors,   6675 coordinates in file.

 Openam> file on opening on unit     12:
 bfactors.pred                                                   

 Bfactors> Best zero-eigenvalue found  :     0.000000
 Bfactors>     6 eigenvalues less than :     0.000000
 Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue  :     1.733000
 Bfactors>   100 eigenvectors will be considered.
 Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped.

 Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed.
          (CHARMM units assumed for eigenvalues)

 Bfactors> Correlation=     -0.345 for    282 C-alpha atoms.
 Bfactors> =      0.034 +/-   0.03
 Bfactors> =     85.747 +/-   9.57
 Bfactors> Shiftng-fct=     85.713
 Bfactors> Scaling-fct=    277.381

 Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved.

 Bfactors> Normal end.
check_modes
 Chkmod> Version 1.00, Bordeaux.                
 Getnam> Eigenvector filename ?
 Getnam> 2603021201203093406.eigenfacs

 Openam> file on opening on unit     10:
 2603021201203093406.eigenfacs                                   

 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     1
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:  3.4322E-03

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     2
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:  3.4325E-03

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     3
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:  3.4329E-03

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     4
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:  3.4331E-03

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     5
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:  3.4336E-03

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     6
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:  3.4342E-03

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     7
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   142.9    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     8
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   181.6    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     9
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   188.8    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    10
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   215.6    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    11
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   232.9    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    12
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   241.0    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    13
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   269.0    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    14
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   284.2    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    15
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   300.9    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    16
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   301.9    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    17
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   314.0    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    18
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   325.6    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    19
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   342.7    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    20
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   354.2    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    21
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   364.5    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    22
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   376.8    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    23
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   378.2    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    24
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   389.7    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    25
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   402.5    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    26
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   412.5    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    27
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   418.4    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    28
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   428.3    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    29
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   438.4    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    30
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   444.1    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    31
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   449.8    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    32
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   469.1    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    33
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   482.0    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    34
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   485.7    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    35
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   503.4    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    36
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   509.8    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    37
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   519.5    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    38
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   523.7    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    39
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   537.5    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    40
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   540.5    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    41
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   548.3    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    42
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   562.7    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    43
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   572.0    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    44
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   574.1    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    45
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   583.7    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    46
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   590.5    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    47
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   596.1    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    48
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   598.1    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    49
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   608.5    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    50
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   624.8    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    51
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   629.8    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    52
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   636.0    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    53
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   647.6    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    54
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   653.4    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    55
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   658.9    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    56
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   662.7    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    57
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   665.2    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    58
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   670.5    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    59
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   680.4    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    60
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   683.2    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    61
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   691.7    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    62
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   697.1    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    63
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   702.3    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    64
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   711.7    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    65
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   716.3    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    66
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   721.1    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    67
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   727.1    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    68
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   728.4    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    69
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   739.0    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    70
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   743.2    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    71
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   749.7    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    72
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   754.0    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    73
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   761.3    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    74
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   769.4    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    75
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   773.0    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    76
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   777.1    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    77
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   784.4    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    78
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   789.3    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    79
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   796.1    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    80
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   801.8    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    81
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   804.6    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    82
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   811.5    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    83
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   812.9    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    84
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   816.7    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    85
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   824.1    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    86
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   828.0    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    87
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   840.2    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    88
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   841.7    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    89
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   844.7    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    90
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   857.6    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    91
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   862.4    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    92
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   866.9    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    93
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   868.6    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    94
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   876.7    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    95
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   882.2    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    96
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   885.9    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    97
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   889.0    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    98
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   895.5    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    99
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   898.5    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   100
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   906.5    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   101
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   910.2    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   102
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   915.4    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   103
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   920.7    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   104
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   927.0    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   105
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   928.5    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   106
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   933.3    

 Chkmod>  106 vectors,   6675 coordinates in file.
 Chkmod>      That is:   2225 cartesian points.

 Openam> file on opening on unit     11:
 Chkmod.res                                                      
 Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file.

 Chkmod> Normal end.
      0.0034      0.7800
      0.0034      0.9148
      0.0034      0.8675
      0.0034      0.9793
      0.0034      0.7174
      0.0034      0.7303
    142.9473      0.4972
    181.6029      0.4648
    188.7973      0.5488
    215.5931      0.4339
    232.8925      0.4095
    241.0282      0.2561
    269.0453      0.3562
    284.2401      0.2823
    300.9243      0.3953
    301.8827      0.3401
    314.0390      0.3951
    325.5610      0.4097
    342.7283      0.3676
    354.1991      0.4371
    364.5345      0.3727
    376.7818      0.4870
    378.1874      0.5703
    389.7037      0.1609
    402.5038      0.5519
    412.4866      0.7043
    418.4464      0.7077
    428.3329      0.5301
    438.3999      0.4997
    444.1448      0.5209
    449.8164      0.6035
    469.0644      0.5788
    481.9586      0.3313
    485.7359      0.3585
    503.3787      0.5086
    509.7796      0.5354
    519.5167      0.4578
    523.6987      0.5592
    537.4767      0.4371
    540.5393      0.4536
    548.3360      0.4208
    562.6635      0.5172
    572.0159      0.4548
    574.0736      0.4508
    583.7482      0.5469
    590.4761      0.5182
    596.1400      0.4108
    598.1146      0.5592
    608.4732      0.4167
    624.8219      0.4310
    629.8029      0.4289
    636.0438      0.5695
    647.6175      0.4546
    653.4177      0.5168
    658.8985      0.3628
    662.7348      0.4679
    665.2210      0.4252
    670.5174      0.4856
    680.3804      0.5053
    683.2339      0.4758
    691.7237      0.4081
    697.0725      0.4878
    702.2966      0.2484
    711.7193      0.4192
    716.2608      0.4875
    721.1007      0.3720
    727.1256      0.1728
    728.4217      0.3231
    739.0280      0.0839
    743.1647      0.3709
    749.7202      0.5071
    753.9546      0.5150
    761.3469      0.5278
    769.4347      0.4526
    773.0275      0.5814
    777.0591      0.5359
    784.3839      0.5827
    789.2543      0.5207
    796.0968      0.5603
    801.7788      0.3523
    804.6414      0.3788
    811.4994      0.5542
    812.8786      0.5049
    816.7135      0.5006
    824.1151      0.4422
    828.0403      0.4788
    840.1973      0.5776
    841.7396      0.4480
    844.6761      0.5667
    857.5600      0.5196
    862.3589      0.4729
    866.8593      0.3123
    868.6257      0.4730
    876.7325      0.4155
    882.1625      0.4364
    885.8971      0.3473
    889.0194      0.4393
    895.4947      0.5841
    898.4524      0.4899
    906.4876      0.4659
    910.1872      0.4241
    915.3543      0.4033
    920.6846      0.4805
    927.0023      0.4847
    928.4639      0.5622
    933.2773      0.5254
getting mode 7
running: ../../bin/get_modes.sh 2603021201203093406 7 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 7
calculating perturbed structure for DQ=-100
2603021201203093406.eigenfacs
2603021201203093406.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2603021201203093406.eigenfacs
2603021201203093406.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2603021201203093406.eigenfacs
2603021201203093406.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2603021201203093406.eigenfacs
2603021201203093406.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2603021201203093406.eigenfacs
2603021201203093406.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2603021201203093406.eigenfacs
2603021201203093406.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2603021201203093406.eigenfacs
2603021201203093406.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2603021201203093406.eigenfacs
2603021201203093406.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2603021201203093406.eigenfacs
2603021201203093406.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2603021201203093406.eigenfacs
2603021201203093406.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2603021201203093406.eigenfacs
2603021201203093406.atom
making animated gifs
11 models are in 2603021201203093406.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2603021201203093406.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2603021201203093406.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 8
running: ../../bin/get_modes.sh 2603021201203093406 8 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 8
calculating perturbed structure for DQ=-100
2603021201203093406.eigenfacs
2603021201203093406.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2603021201203093406.eigenfacs
2603021201203093406.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2603021201203093406.eigenfacs
2603021201203093406.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2603021201203093406.eigenfacs
2603021201203093406.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2603021201203093406.eigenfacs
2603021201203093406.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2603021201203093406.eigenfacs
2603021201203093406.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2603021201203093406.eigenfacs
2603021201203093406.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2603021201203093406.eigenfacs
2603021201203093406.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2603021201203093406.eigenfacs
2603021201203093406.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2603021201203093406.eigenfacs
2603021201203093406.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2603021201203093406.eigenfacs
2603021201203093406.atom
making animated gifs
11 models are in 2603021201203093406.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2603021201203093406.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2603021201203093406.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 9
running: ../../bin/get_modes.sh 2603021201203093406 9 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 9
calculating perturbed structure for DQ=-100
2603021201203093406.eigenfacs
2603021201203093406.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2603021201203093406.eigenfacs
2603021201203093406.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2603021201203093406.eigenfacs
2603021201203093406.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2603021201203093406.eigenfacs
2603021201203093406.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2603021201203093406.eigenfacs
2603021201203093406.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2603021201203093406.eigenfacs
2603021201203093406.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2603021201203093406.eigenfacs
2603021201203093406.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2603021201203093406.eigenfacs
2603021201203093406.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2603021201203093406.eigenfacs
2603021201203093406.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2603021201203093406.eigenfacs
2603021201203093406.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2603021201203093406.eigenfacs
2603021201203093406.atom
making animated gifs
11 models are in 2603021201203093406.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2603021201203093406.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2603021201203093406.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 10
running: ../../bin/get_modes.sh 2603021201203093406 10 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 10
calculating perturbed structure for DQ=-100
2603021201203093406.eigenfacs
2603021201203093406.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2603021201203093406.eigenfacs
2603021201203093406.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2603021201203093406.eigenfacs
2603021201203093406.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2603021201203093406.eigenfacs
2603021201203093406.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2603021201203093406.eigenfacs
2603021201203093406.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2603021201203093406.eigenfacs
2603021201203093406.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2603021201203093406.eigenfacs
2603021201203093406.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2603021201203093406.eigenfacs
2603021201203093406.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2603021201203093406.eigenfacs
2603021201203093406.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2603021201203093406.eigenfacs
2603021201203093406.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2603021201203093406.eigenfacs
2603021201203093406.atom
making animated gifs
11 models are in 2603021201203093406.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2603021201203093406.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2603021201203093406.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 11
running: ../../bin/get_modes.sh 2603021201203093406 11 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 11
calculating perturbed structure for DQ=-100
2603021201203093406.eigenfacs
2603021201203093406.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2603021201203093406.eigenfacs
2603021201203093406.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2603021201203093406.eigenfacs
2603021201203093406.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2603021201203093406.eigenfacs
2603021201203093406.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2603021201203093406.eigenfacs
2603021201203093406.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2603021201203093406.eigenfacs
2603021201203093406.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2603021201203093406.eigenfacs
2603021201203093406.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2603021201203093406.eigenfacs
2603021201203093406.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2603021201203093406.eigenfacs
2603021201203093406.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2603021201203093406.eigenfacs
2603021201203093406.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2603021201203093406.eigenfacs
2603021201203093406.atom
making animated gifs
11 models are in 2603021201203093406.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2603021201203093406.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2603021201203093406.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
2603021201203093406.10.pdb
2603021201203093406.11.pdb
2603021201203093406.7.pdb
2603021201203093406.8.pdb
2603021201203093406.9.pdb



STDERR:
Note: The following floating-point exceptions are signalling: IEEE_DENORMAL

real	0m10.453s
user	0m10.371s
sys	0m0.079s
rm: cannot remove '2603021201203093406.sdijf': No such file or directory
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
If you find results from this site helpful for your research, please cite one of our papers:
K. Suhre & Y.H. Sanejouand, ElNemo: a normal mode web-server for protein movement analysis and the generation of templates for molecular replacement. Nucleic Acids Research, 32, W610-W614, 2004.
K. Suhre & Y.H. Sanejouand, On the potential of normal mode analysis for solving difficult molecular replacement problems. Acta Cryst. D vol.60, p796-799, 2004 © International Union of Crystallography.
elNémo is maintained by Yves-Henri Sanejouand.
It was developed by Karsten Suhre.
Between 2003 and 2014, it was hosted by IGS (Marseille).
Between 2015 and 2025, it was hosted by US2B (Nantes).
Last modification: december 26th, 2025.
Should you encounter any unexpected behaviour, please let us know. elNémo has been hacked on november 27th. It has been moved away and runs again. **Still some additional cleaning from time to time** Sorry for the inconvenience.

*** HORMONE 14-JAN-23 8I2H ***

LOGs for ID: 2603021201203093406

Output from eigenvector calculation:

Should you encounter any unexpected behaviour,
please let us know.
elNémo has been hacked on november 27th.
It has been moved away and runs again.
Still some additional cleaning from time to time
Sorry for the inconvenience.

* HORMONE 14-JAN-23 8I2H *
