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* HORMONE 14-JAN-23 8I2H *

LOGs for ID: 2603021201503093520

Output from eigenvector calculation:


STDOUT:

CUTOFF set to default value (CUTOFF=8)
Build Tirion matrix:
 Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model.
 Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004.    

 Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file.

 Pdbmat> Coordinate filename     = 2603021201503093520.atom

 Pdbmat> Distance cutoff         =       8.00
         Force constant          =      10.00
         Origin of mass values   =       CONS
 Pdbmat> Levelshift              =    1.0E-09
         PRINTing level          =          2

 Pdbmat> Coordinate file 2603021201503093520.atom to be opened.

 Openam> File opened: 2603021201503093520.atom

 Pdbmat> Coordinate file in PDB format.

 Rdatompdb> Reading pdb file.
 Rdatompdb> End of file reached.
 Rdatompdb> Number of I/O errors:      0

 Rdatompdb> Number of residues found =    283
            First residue number     =    362
            Last  residue number     =      1
            Number of atoms found    =   2295
            Mean number per residue  =      8.1

 Pdbmat> Coordinate statistics: 
 =   112.600287 +/-     9.262886 From:    90.138000 To:   135.625000
 =   100.148386 +/-    12.454500 From:    69.210000 To:   129.652000
 =   117.742146 +/-    12.827321 From:    88.005000 To:   148.039000
 Pdbmat> Masses are all set to one.
%Pdbmat-W> residue:'UNL ' is not a well known amino-acid.

%Pdbmat-W>      1 residue(s) not known.

 Openam> File opened: pdbmat.xyzm
 Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved.

 Openam> File opened: pdbmat.sdijb

 Pdbmat> Matrix statistics:

 Pdbmat> The matrix is   3.6468 % Filled.
 Pdbmat>       864486  non-zero elements.
 Pdbmat>        94539 atom-atom interactions.

 Pdbmat> Number per atom=     82.39 +/-     21.43
         Maximum number =    132
         Minimum number =     17

 Pdbmat> Matrix trace   = 1.890780E+06
 Pdbmat> Larger element =  556.402    
 Pdbmat>      0 elements larger than +/-  1.0E+10

 Pdbmat> Normal end.
automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1)
283 non-zero elements, NRBL set to 2
Diagonalize Tirion matrix using diagrtb
 Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation.
 Diagrtb> Version 2.52, November 2004. 
 Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file.

 Diagrtb> Options taken into account:

 MATRix filename          = pdbmat.sdijb
 COORdinates filename     = 2603021201503093520.atom
 Eigenvector OUTPut file  = matrix.eigenrtb
 Nb of VECTors required   =        106
 EigeNVALues chosen       =       LOWE
 Type of SUBStructuring   =       NONE
 Nb of residues per BLOck =          2
 Origin of MASS values    =       CONS
 MATRix FORMat            =       BINA
 Temporary files cleaning =       ALL 
 Output PRINting level    =          2

 Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb.

 Blocpdb> Entering in.

 Openam> file on opening on unit     10:
 diagrtb_work.xyzm   

 Blocpdb> Coordinate file 2603021201503093520.atom to be opened.

 Openam> file on opening on unit     11:
 2603021201503093520.atom                                                                                                        

 Blocpdb> Coordinate file in PDB format.

 Blocpdb>  2295 atoms picked in pdb file.
 Blocpdb>   All masses set to unity.
 Blocpdb> Coordinate file is rewritten.

 Blocpdb> Substructuring:
 Blocpdb>     2 residue(s) per block.
 Blocpdb>   283 residues.
 Blocpdb>    20 atoms in block      1
 Block first atom:      1
 Blocpdb>    16 atoms in block      2
 Block first atom:     21
 Blocpdb>    18 atoms in block      3
 Block first atom:     37
 Blocpdb>    16 atoms in block      4
 Block first atom:     55
 Blocpdb>    25 atoms in block      5
 Block first atom:     71
 Blocpdb>    14 atoms in block      6
 Block first atom:     96
 Blocpdb>    16 atoms in block      7
 Block first atom:    110
 Blocpdb>    13 atoms in block      8
 Block first atom:    126
 Blocpdb>    11 atoms in block      9
 Block first atom:    139
 Blocpdb>    16 atoms in block     10
 Block first atom:    150
 Blocpdb>    15 atoms in block     11
 Block first atom:    166
 Blocpdb>    15 atoms in block     12
 Block first atom:    181
 Blocpdb>    16 atoms in block     13
 Block first atom:    196
 Blocpdb>    14 atoms in block     14
 Block first atom:    212
 Blocpdb>    15 atoms in block     15
 Block first atom:    226
 Blocpdb>    21 atoms in block     16
 Block first atom:    241
 Blocpdb>    15 atoms in block     17
 Block first atom:    262
 Blocpdb>    14 atoms in block     18
 Block first atom:    277
 Blocpdb>    22 atoms in block     19
 Block first atom:    291
 Blocpdb>    16 atoms in block     20
 Block first atom:    313
 Blocpdb>    14 atoms in block     21
 Block first atom:    329
 Blocpdb>    13 atoms in block     22
 Block first atom:    343
 Blocpdb>    16 atoms in block     23
 Block first atom:    356
 Blocpdb>    16 atoms in block     24
 Block first atom:    372
 Blocpdb>    14 atoms in block     25
 Block first atom:    388
 Blocpdb>    12 atoms in block     26
 Block first atom:    402
 Blocpdb>    20 atoms in block     27
 Block first atom:    414
 Blocpdb>    16 atoms in block     28
 Block first atom:    434
 Blocpdb>    13 atoms in block     29
 Block first atom:    450
 Blocpdb>    13 atoms in block     30
 Block first atom:    463
 Blocpdb>    16 atoms in block     31
 Block first atom:    476
 Blocpdb>    17 atoms in block     32
 Block first atom:    492
 Blocpdb>    15 atoms in block     33
 Block first atom:    509
 Blocpdb>    21 atoms in block     34
 Block first atom:    524
 Blocpdb>    18 atoms in block     35
 Block first atom:    545
 Blocpdb>    17 atoms in block     36
 Block first atom:    563
 Blocpdb>    16 atoms in block     37
 Block first atom:    580
 Blocpdb>    23 atoms in block     38
 Block first atom:    596
 Blocpdb>    11 atoms in block     39
 Block first atom:    619
 Blocpdb>     9 atoms in block     40
 Block first atom:    630
 Blocpdb>    14 atoms in block     41
 Block first atom:    639
 Blocpdb>    10 atoms in block     42
 Block first atom:    653
 Blocpdb>    15 atoms in block     43
 Block first atom:    663
 Blocpdb>    18 atoms in block     44
 Block first atom:    678
 Blocpdb>    18 atoms in block     45
 Block first atom:    696
 Blocpdb>    11 atoms in block     46
 Block first atom:    714
 Blocpdb>    17 atoms in block     47
 Block first atom:    725
 Blocpdb>    13 atoms in block     48
 Block first atom:    742
 Blocpdb>    19 atoms in block     49
 Block first atom:    755
 Blocpdb>    15 atoms in block     50
 Block first atom:    774
 Blocpdb>    13 atoms in block     51
 Block first atom:    789
 Blocpdb>    15 atoms in block     52
 Block first atom:    802
 Blocpdb>    20 atoms in block     53
 Block first atom:    817
 Blocpdb>    24 atoms in block     54
 Block first atom:    837
 Blocpdb>    15 atoms in block     55
 Block first atom:    861
 Blocpdb>    17 atoms in block     56
 Block first atom:    876
 Blocpdb>    13 atoms in block     57
 Block first atom:    893
 Blocpdb>    17 atoms in block     58
 Block first atom:    906
 Blocpdb>    14 atoms in block     59
 Block first atom:    923
 Blocpdb>    16 atoms in block     60
 Block first atom:    937
 Blocpdb>    17 atoms in block     61
 Block first atom:    953
 Blocpdb>    21 atoms in block     62
 Block first atom:    970
 Blocpdb>    10 atoms in block     63
 Block first atom:    991
 Blocpdb>    13 atoms in block     64
 Block first atom:   1001
 Blocpdb>    15 atoms in block     65
 Block first atom:   1014
 Blocpdb>    12 atoms in block     66
 Block first atom:   1029
 Blocpdb>    22 atoms in block     67
 Block first atom:   1041
 Blocpdb>    16 atoms in block     68
 Block first atom:   1063
 Blocpdb>    16 atoms in block     69
 Block first atom:   1079
 Blocpdb>    10 atoms in block     70
 Block first atom:   1095
 Blocpdb>    19 atoms in block     71
 Block first atom:   1105
 Blocpdb>    15 atoms in block     72
 Block first atom:   1124
 Blocpdb>    15 atoms in block     73
 Block first atom:   1139
 Blocpdb>    14 atoms in block     74
 Block first atom:   1154
 Blocpdb>    18 atoms in block     75
 Block first atom:   1168
 Blocpdb>    17 atoms in block     76
 Block first atom:   1186
 Blocpdb>    13 atoms in block     77
 Block first atom:   1203
 Blocpdb>    14 atoms in block     78
 Block first atom:   1216
 Blocpdb>    15 atoms in block     79
 Block first atom:   1230
 Blocpdb>    16 atoms in block     80
 Block first atom:   1245
 Blocpdb>    16 atoms in block     81
 Block first atom:   1261
 Blocpdb>    13 atoms in block     82
 Block first atom:   1277
 Blocpdb>    14 atoms in block     83
 Block first atom:   1290
 Blocpdb>    17 atoms in block     84
 Block first atom:   1304
 Blocpdb>    19 atoms in block     85
 Block first atom:   1321
 Blocpdb>    14 atoms in block     86
 Block first atom:   1340
 Blocpdb>    16 atoms in block     87
 Block first atom:   1354
 Blocpdb>    15 atoms in block     88
 Block first atom:   1370
 Blocpdb>    15 atoms in block     89
 Block first atom:   1385
 Blocpdb>    13 atoms in block     90
 Block first atom:   1400
 Blocpdb>    18 atoms in block     91
 Block first atom:   1413
 Blocpdb>    15 atoms in block     92
 Block first atom:   1431
 Blocpdb>    10 atoms in block     93
 Block first atom:   1446
 Blocpdb>    18 atoms in block     94
 Block first atom:   1456
 Blocpdb>    18 atoms in block     95
 Block first atom:   1474
 Blocpdb>    20 atoms in block     96
 Block first atom:   1492
 Blocpdb>    15 atoms in block     97
 Block first atom:   1512
 Blocpdb>    18 atoms in block     98
 Block first atom:   1527
 Blocpdb>    15 atoms in block     99
 Block first atom:   1545
 Blocpdb>    16 atoms in block    100
 Block first atom:   1560
 Blocpdb>    13 atoms in block    101
 Block first atom:   1576
 Blocpdb>    12 atoms in block    102
 Block first atom:   1589
 Blocpdb>    14 atoms in block    103
 Block first atom:   1601
 Blocpdb>    18 atoms in block    104
 Block first atom:   1615
 Blocpdb>    13 atoms in block    105
 Block first atom:   1633
 Blocpdb>    20 atoms in block    106
 Block first atom:   1646
 Blocpdb>    13 atoms in block    107
 Block first atom:   1666
 Blocpdb>    16 atoms in block    108
 Block first atom:   1679
 Blocpdb>    19 atoms in block    109
 Block first atom:   1695
 Blocpdb>    15 atoms in block    110
 Block first atom:   1714
 Blocpdb>    19 atoms in block    111
 Block first atom:   1729
 Blocpdb>    14 atoms in block    112
 Block first atom:   1748
 Blocpdb>    12 atoms in block    113
 Block first atom:   1762
 Blocpdb>    14 atoms in block    114
 Block first atom:   1774
 Blocpdb>    22 atoms in block    115
 Block first atom:   1788
 Blocpdb>    13 atoms in block    116
 Block first atom:   1810
 Blocpdb>    11 atoms in block    117
 Block first atom:   1823
 Blocpdb>    14 atoms in block    118
 Block first atom:   1834
 Blocpdb>    16 atoms in block    119
 Block first atom:   1848
 Blocpdb>    15 atoms in block    120
 Block first atom:   1864
 Blocpdb>    15 atoms in block    121
 Block first atom:   1879
 Blocpdb>    13 atoms in block    122
 Block first atom:   1894
 Blocpdb>    14 atoms in block    123
 Block first atom:   1907
 Blocpdb>    17 atoms in block    124
 Block first atom:   1921
 Blocpdb>    16 atoms in block    125
 Block first atom:   1938
 Blocpdb>    15 atoms in block    126
 Block first atom:   1954
 Blocpdb>    21 atoms in block    127
 Block first atom:   1969
 Blocpdb>    15 atoms in block    128
 Block first atom:   1990
 Blocpdb>    14 atoms in block    129
 Block first atom:   2005
 Blocpdb>    11 atoms in block    130
 Block first atom:   2019
 Blocpdb>    15 atoms in block    131
 Block first atom:   2030
 Blocpdb>    19 atoms in block    132
 Block first atom:   2045
 Blocpdb>    17 atoms in block    133
 Block first atom:   2064
 Blocpdb>    19 atoms in block    134
 Block first atom:   2081
 Blocpdb>    16 atoms in block    135
 Block first atom:   2100
 Blocpdb>    19 atoms in block    136
 Block first atom:   2116
 Blocpdb>    22 atoms in block    137
 Block first atom:   2135
 Blocpdb>    19 atoms in block    138
 Block first atom:   2157
 Blocpdb>    19 atoms in block    139
 Block first atom:   2176
 Blocpdb>    16 atoms in block    140
 Block first atom:   2195
 Blocpdb>    15 atoms in block    141
 Block first atom:   2211
 Blocpdb>    70 atoms in block    142
 Block first atom:   2225

 Blocpdb>   142 blocks.

 Blocpdb> At most,     70 atoms in each of them.
 Blocpdb> At least,     9 atoms in each of them.

 Blocpdb> Normal end of Blocpdb.

 Diagrtb> Memory allocation for Prepmat.
 Diagrtb> Memory allocation for RTB.
 Diagrtb> Memory allocation for Diagstd.
 Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes.

 Prepmat> Entering in.
 Prepmat> Rewriting of the matrix begins.

 Prepmat>       864628 matrix lines read.

 Prepmat> Matrix order    =       6885

 Prepmat> Matrix trace    =    1890780.0000
 Prepmat> Last element read:    6885   6885       139.3160
 Prepmat>        10154 lines saved.
 Prepmat>         8709 empty lines.
 Prepmat> Number of lines on output is as expected.
 Prepmat> Normal end of Prepmat.

 RTB> Entering in.
 RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file:  2295
 RTB> Total mass =        2295.0000
 RTB> Number of atoms found in matrix:  2295
 RTB> Number of blocks =   142
 RTB> Projection begins.
 RTB> Projected matrix is being saved.
 RTB> Projected matrix trace =  197934.9636
 RTB>     49854 non-zero elements.
 RTB> Normal end of RTB.

 Diagstd> Entering in.

 Openam> file on opening on unit     10:
 diagrtb_work.sdijb                      
 Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb                      
 Diagstd> CERFACS matrix format.
 Diagstd> Projected matrix order =      852
 Diagstd> Nb of non-zero elements:    49854
 Diagstd> Projected matrix trace =  197934.9636

 Openam> file on opening on unit     11:
 diagrtb_work.eigenfacs                  
 Diagstd> Diagonalization.

 Diagstd>    852 eigenvectors are computed. 
 Diagstd>    106 of them to be saved. 

 Diagstd> Sum of eigenvalues = 197934.9636
 Diagstd> Best zero-eigenvalue found  :     0.000000

 Diagstd>      6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to:    0.0000000

 Diagstd> Selected eigenvalues: 
      0.0000000      0.0000000      0.0000000      0.0000000      0.0000000
      0.0000000      1.7491008      2.7944626      3.1218108      4.0740993
      4.6652074      4.9795966      6.1965217      6.7987310      7.2013832
      7.5337212      8.1846345      8.5513886      9.7125040     10.3088163
     11.1479001     11.3574594     11.8940094     12.4733599     12.7206323
     14.0987656     15.0737557     15.2732344     16.1971963     16.4826483
     17.3190959     18.5676261     19.6337225     19.8264881     20.7677334
     21.6346372     22.4552656     23.4073789     23.9227785     24.7426782
     25.5804083     26.0433705     26.8598828     27.6153213     28.0104544
     28.9058606     29.5021033     30.5899738     31.3362175     32.2486769
     33.3783852     33.6768666     34.9885296     36.2267513     36.5560345
     37.1620509     37.8132527     38.3736053     39.0257926     39.8344439
     40.2524368     41.6934730     42.1239333     42.8819990     43.5216739
     44.2035486     44.9929343     45.7081817     46.8795219     47.7569697
     48.1146930     48.8286218     49.3352919     50.5148394     51.4455862
     51.9077951     52.6805460     53.0044829     53.2678548     54.1309976
     54.8688749     55.8603710     56.1771873     56.9143990     57.5855951
     58.2249815     59.8748914     60.6322871     61.3157195     62.9951492
     63.8766696     64.3616260     65.8701446     66.3320175     66.5345632
     66.8201200     68.1027686     68.5511656     69.3489159     70.2286228
     71.2982129     71.5060136     72.8356336     73.8797888     74.2897866
     75.1669537

 Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units):
      0.0034338      0.0034340      0.0034341      0.0034347      0.0034350
      0.0034356    143.6159581    181.5283372    191.8662426    219.1851281
    234.5474722    242.3217307    270.3144541    283.1452028    291.4091875
    298.0574989    310.6668585    317.5510856    338.4237907    348.6580367
    362.5699560    365.9619028    374.5065517    383.5191085    387.3019018
    407.7423541    421.6052565    424.3857463    437.0339781    440.8682017
    451.9161775    467.9220069    481.1678534    483.5241579    494.8685226
    505.0915338    514.5817482    525.3777464    531.1303142    540.1552899
    549.2233800    554.1711022    562.7912509    570.6506685    574.7187386
    583.8324534    589.8230901    600.5993151    607.8809967    616.6677419
    627.3760585    630.1749256    642.3298812    653.5968868    656.5606030
    661.9803791    667.7552310    672.6847502    678.3770488    685.3693197
    688.9558129    701.1796713    704.7900084    711.1034594    716.3876256
    721.9778071    728.3958103    734.1625931    743.5100911    750.4360022
    753.2413270    758.8090702    762.7358008    771.7999897    778.8778264
    782.3688864    788.1709321    790.5904816    792.5522144    798.9475989
    804.3745248    811.6096238    813.9079226    819.2309615    824.0474313
    828.6095988    840.2676612    845.5655009    850.3176517    861.8840321
    867.8934537    871.1817797    881.3321010    884.4165965    885.7658559
    887.6646106    896.1437171    899.0890372    904.3053877    910.0229732
    916.9266647    918.2618975    926.7598946    933.3791662    935.9654888
    941.4749196

 Diagstd> Normal end.

 Rtb_to_modes> Entering in.

 Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file =   2295
 Rtb_to_modes> Number of blocs =    142

 Openam> file on opening on unit     10:
 diagrtb_work.eigenfacs                  

 Openam> file on opening on unit     11:
 matrix.eigenrtb                         

 Rdmodfacs> Entering in.

 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     1
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  9.9990E-10

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     2
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  1.0000E-09

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     3
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  1.0001E-09

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     4
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  1.0004E-09

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     5
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  1.0006E-09

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     6
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  1.0010E-09

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     7
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   1.749    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     8
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   2.794    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     9
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   3.122    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    10
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   4.074    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    11
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   4.665    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    12
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   4.980    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    13
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   6.197    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    14
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   6.799    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    15
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   7.201    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    16
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   7.534    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    17
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   8.185    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    18
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   8.551    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    19
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   9.713    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    20
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   10.31    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    21
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   11.15    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    22
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   11.36    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    23
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   11.89    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    24
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   12.47    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    25
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   12.72    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    26
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   14.10    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    27
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   15.07    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    28
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   15.27    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    29
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   16.20    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    30
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   16.48    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    31
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   17.32    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    32
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   18.57    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    33
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   19.63    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    34
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   19.83    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    35
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   20.77    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    36
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   21.63    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    37
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   22.46    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    38
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   23.41    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    39
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   23.92    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    40
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   24.74    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    41
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   25.58    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    42
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   26.04    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    43
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   26.86    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    44
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   27.62    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    45
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   28.01    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    46
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   28.91    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    47
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   29.50    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    48
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   30.59    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    49
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   31.34    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    50
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   32.25    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    51
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   33.38    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    52
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   33.68    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    53
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   34.99    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    54
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   36.23    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    55
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   36.56    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    56
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   37.16    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    57
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   37.81    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    58
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   38.37    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    59
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   39.03    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    60
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   39.83    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    61
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   40.25    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    62
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   41.69    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    63
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   42.12    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    64
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   42.88    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    65
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   43.52    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    66
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   44.20    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    67
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   44.99    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    68
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   45.71    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    69
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   46.88    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    70
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   47.76    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    71
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   48.11    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    72
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   48.83    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    73
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   49.34    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    74
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   50.51    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    75
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   51.45    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    76
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   51.91    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    77
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   52.68    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    78
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   53.00    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    79
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   53.27    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    80
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   54.13    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    81
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   54.87    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    82
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   55.86    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    83
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   56.18    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    84
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   56.91    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    85
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   57.59    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    86
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   58.22    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    87
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   59.87    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    88
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   60.63    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    89
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   61.32    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    90
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   63.00    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    91
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   63.88    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    92
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   64.36    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    93
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   65.87    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    94
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   66.33    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    95
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   66.53    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    96
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   66.82    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    97
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   68.10    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    98
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   68.55    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    99
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   69.35    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   100
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   70.23    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   101
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   71.30    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   102
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   71.51    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   103
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   72.84    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   104
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   73.88    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   105
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   74.29    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   106
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   75.17    

 Rtb_to_modes>  106 vectors, with    852 coordinates in vector file.

 Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected):
 1.00000 1.00000 1.00002 0.99998 1.00002
 1.00000 0.99998 1.00002 1.00000 1.00000
 1.00001 1.00000 1.00002 1.00001 1.00001
 1.00001 1.00000 1.00000 1.00002 1.00002
 1.00000 1.00001 0.99997 0.99998 1.00002
 0.99997 0.99999 0.99998 0.99999 1.00000
 1.00000 1.00003 1.00001 1.00000 1.00001
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 1.00000 1.00001 1.00001 1.00000 1.00000
 1.00000 1.00000 0.99997 1.00000 1.00000
 1.00002 1.00002 1.00000 0.99999 1.00002
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 1.00000 1.00000 1.00001 1.00000 1.00000
 1.00002 1.00002 1.00001 0.99999 1.00000
 1.00002 1.00000 0.99998 0.99999 0.99999
 1.00000 0.99999 1.00000 1.00000 0.99998
 1.00003 1.00001 1.00002 1.00002 1.00001
 0.99998

 Rtb_to_modes> RTB block-file is being read.
 Rtb_to_modes>    41310 lines found in RTB file.

 Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected):
 1.00000 1.00000 1.00002 0.99998 1.00002
 1.00000 0.99998 1.00002 1.00000 1.00000
 1.00001 1.00000 1.00002 1.00001 1.00001
 1.00001 1.00000 1.00000 1.00002 1.00002
 1.00000 1.00001 0.99997 0.99998 1.00002
 0.99997 0.99999 0.99998 0.99999 1.00000
 1.00000 1.00003 1.00001 1.00000 1.00001
 0.99995 0.99996 0.99999 1.00000 1.00001
 1.00001 1.00000 0.99998 0.99999 1.00000
 1.00000 1.00001 1.00001 1.00000 1.00000
 1.00000 1.00000 0.99997 1.00000 1.00000
 1.00002 1.00002 1.00000 0.99999 1.00002
 1.00000 0.99998 1.00001 1.00002 0.99998
 0.99998 1.00001 1.00000 0.99998 1.00000
 0.99997 0.99999 0.99999 1.00000 1.00000
 0.99999 0.99999 0.99998 1.00000 0.99999
 1.00000 1.00000 1.00001 1.00000 1.00000
 1.00002 1.00002 1.00001 0.99999 1.00000
 1.00002 1.00000 0.99998 0.99999 0.99999
 1.00000 0.99999 1.00000 1.00000 0.99998
 1.00003 1.00001 1.00002 1.00002 1.00001
 0.99998

 Orthogonality of first eigenvectors (zero expected):
 Vector   2:-0.000
 Vector   3: 0.000-0.000
 Vector   4: 0.000-0.000 0.000
 Vector   5:-0.000-0.000-0.000 0.000
 Vector   6:-0.000 0.000-0.000-0.000-0.000
 Vector   7:-0.000-0.000-0.000-0.000-0.000-0.000
 Vector   8: 0.000 0.000 0.000-0.000-0.000 0.000-0.000
 Vector   9: 0.000 0.000-0.000 0.000 0.000 0.000-0.000-0.000
 Vector  10: 0.000 0.000-0.000-0.000 0.000 0.000-0.000 0.000 0.000

 Rtb_to_modes>   106 eigenvectors saved.

 Rtb_to_modes> Normal end.

 Diagrtb> Normal end.
B-factor analysis
 Bfactors> Version 1.22, Bordeaux.                
 Getnam> Eigenvector filename ?
 Getnam> 2603021201503093520.eigenfacs

 Openam> file on opening on unit     10:
 2603021201503093520.eigenfacs                                   
 Getnam> Corresponding pdb filename ?
 Getnam> 2603021201503093520.atom

 Openam> file on opening on unit     11:
 2603021201503093520.atom                                        
 Getnum> Number of skipped eigenvectors ?
 Getnum>            0
 Getnum> Number of usefull eigenvectors ?
 Getnum>        10000
%Getnum-Err: number larger than    106 This is not allowed. Sorry.

 Rdatompdb> Reading pdb file.
 Rdatompdb> End of file reached.
 Rdatompdb> Number of I/O errors:            0

 Rdatompdb> Number of residues found =    283
            First residue number     =    362
            Last  residue number     =      1
            Number of atoms found    =   2295
            Mean number per residue  =      8.1

 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     1
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  9.9990E-10

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     2
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  1.0000E-09

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     3
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  1.0001E-09

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     4
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  1.0004E-09

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     5
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  1.0006E-09

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     6
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  1.0010E-09

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     7
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   1.749    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     8
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   2.794    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     9
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   3.122    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    10
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   4.074    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    11
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   4.665    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    12
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   4.980    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    13
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   6.197    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    14
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   6.799    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    15
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   7.201    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    16
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   7.534    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    17
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   8.185    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    18
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   8.551    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    19
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   9.713    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    20
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   10.31    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    21
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   11.15    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    22
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   11.36    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    23
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   11.89    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    24
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   12.47    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    25
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   12.72    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    26
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   14.10    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    27
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   15.07    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    28
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   15.27    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    29
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   16.20    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    30
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   16.48    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    31
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   17.32    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    32
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   18.57    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    33
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   19.63    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    34
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   19.83    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    35
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   20.77    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    36
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   21.63    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    37
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   22.46    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    38
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   23.41    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    39
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   23.92    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    40
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   24.74    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    41
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   25.58    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    42
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   26.04    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    43
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   26.86    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    44
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   27.62    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    45
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   28.01    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    46
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   28.91    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    47
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   29.50    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    48
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   30.59    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    49
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   31.34    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    50
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   32.25    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    51
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   33.38    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    52
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   33.68    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    53
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   34.99    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    54
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   36.23    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    55
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   36.56    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    56
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   37.16    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    57
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   37.81    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    58
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   38.37    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    59
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   39.03    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    60
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   39.83    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    61
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   40.25    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    62
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   41.69    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    63
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   42.12    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    64
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   42.88    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    65
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   43.52    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    66
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   44.20    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    67
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   44.99    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    68
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   45.71    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    69
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   46.88    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    70
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   47.76    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    71
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   48.11    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    72
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   48.83    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    73
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   49.34    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    74
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   50.51    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    75
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   51.45    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    76
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   51.91    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    77
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   52.68    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    78
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   53.00    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    79
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   53.27    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    80
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   54.13    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    81
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   54.87    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    82
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   55.86    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    83
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   56.18    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    84
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   56.91    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    85
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   57.59    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    86
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   58.22    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    87
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   59.87    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    88
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   60.63    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    89
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   61.32    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    90
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   63.00    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    91
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   63.88    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    92
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   64.36    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    93
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   65.87    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    94
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   66.33    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    95
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   66.53    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    96
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   66.82    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    97
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   68.10    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    98
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   68.55    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    99
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   69.35    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   100
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   70.23    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   101
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   71.30    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   102
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   71.51    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   103
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   72.84    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   104
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   73.88    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   105
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   74.29    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   106
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   75.17    

 Bfactors>  106 vectors,   6885 coordinates in file.

 Openam> file on opening on unit     12:
 bfactors.pred                                                   

 Bfactors> Best zero-eigenvalue found  :     0.000000
 Bfactors>     6 eigenvalues less than :     0.000000
 Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue  :     1.749000
 Bfactors>   100 eigenvectors will be considered.
 Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped.

 Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed.
          (CHARMM units assumed for eigenvalues)

 Bfactors> Correlation=     -0.350 for    282 C-alpha atoms.
 Bfactors> =      0.034 +/-   0.03
 Bfactors> =     85.747 +/-   9.57
 Bfactors> Shiftng-fct=     85.714
 Bfactors> Scaling-fct=    278.289

 Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved.

 Bfactors> Normal end.
check_modes
 Chkmod> Version 1.00, Bordeaux.                
 Getnam> Eigenvector filename ?
 Getnam> 2603021201503093520.eigenfacs

 Openam> file on opening on unit     10:
 2603021201503093520.eigenfacs                                   

 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     1
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:  3.4336E-03

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     2
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:  3.4338E-03

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     3
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:  3.4340E-03

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     4
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:  3.4345E-03

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     5
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:  3.4348E-03

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     6
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:  3.4355E-03

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     7
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   143.6    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     8
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   181.5    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     9
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   191.9    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    10
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   219.2    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    11
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   234.5    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    12
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   242.3    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    13
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   270.3    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    14
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 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   667.7    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    58
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   672.6    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    59
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   678.4    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    60
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   685.3    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    61
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   688.9    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    62
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   701.1    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    63
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   704.7    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    64
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   711.1    

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 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   716.3    

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 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   721.9    

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 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   728.3    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    68
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   734.1    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    69
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   743.5    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    70
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   750.4    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    71
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   753.2    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    72
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   758.8    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    73
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   762.7    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    74
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   771.7    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    75
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   778.9    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    76
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   782.4    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    77
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   788.1    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    78
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 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   792.5    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    80
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   798.9    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    81
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 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   813.9    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    84
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   819.2    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    85
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   824.0    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    86
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   828.5    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    87
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   840.2    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    88
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   845.5    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    89
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   850.3    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    90
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   861.9    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    91
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   867.9    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    92
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   871.1    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    93
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   881.3    

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 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   884.4    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    95
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   885.7    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    96
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   887.6    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    97
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   896.1    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    98
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   899.0    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    99
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   904.3    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   100
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   910.0    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   101
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   916.9    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   102
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   918.2    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   103
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   926.7    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   104
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   933.3    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   105
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   935.9    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   106
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   941.5    

 Chkmod>  106 vectors,   6885 coordinates in file.
 Chkmod>      That is:   2295 cartesian points.

 Openam> file on opening on unit     11:
 Chkmod.res                                                      
 Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file.

 Chkmod> Normal end.
      0.0034      0.9179
      0.0034      0.7132
      0.0034      0.7892
      0.0034      0.7073
      0.0034      0.7438
      0.0034      0.9907
    143.6057      0.5029
    181.5055      0.4763
    191.8638      0.4825
    219.1730      0.4138
    234.5322      0.4082
    242.3211      0.2865
    270.3133      0.3427
    283.1387      0.2356
    291.3889      0.3732
    298.0502      0.3041
    310.6605      0.5477
    317.5302      0.2563
    338.4179      0.3770
    348.6631      0.4936
    362.5885      0.6542
    365.9871      0.3352
    374.4273      0.5794
    383.4510      0.1401
    387.2757      0.4386
    407.7427      0.6964
    421.5346      0.6992
    424.3226      0.5114
    437.0530      0.6378
    440.8139      0.5847
    451.9086      0.4592
    467.9318      0.5238
    481.1016      0.4653
    483.5462      0.3978
    494.8743      0.4757
    505.0157      0.5393
    514.6139      0.3939
    525.3846      0.5176
    531.0767      0.5335
    540.1029      0.3210
    549.1954      0.5063
    554.1115      0.4705
    562.7683      0.4557
    570.6745      0.5343
    574.6894      0.4413
    583.8492      0.5244
    589.7767      0.4920
    600.5738      0.5239
    607.8916      0.3651
    616.6539      0.3744
    627.3643      0.4441
    630.1772      0.4190
    642.3158      0.4433
    653.5981      0.3880
    656.5680      0.4763
    661.9337      0.4923
    667.6978      0.4898
    672.6243      0.4150
    678.3845      0.4856
    685.3017      0.4765
    688.9054      0.4835
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    704.7268      0.4914
    711.0564      0.4539
    716.3431      0.4579
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    828.5386      0.5253
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    845.5133      0.4206
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    861.8802      0.4437
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    933.3404      0.4335
    935.9267      0.4028
    941.4536      0.3850
getting mode 7
running: ../../bin/get_modes.sh 2603021201503093520 7 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 7
calculating perturbed structure for DQ=-100
2603021201503093520.eigenfacs
2603021201503093520.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2603021201503093520.eigenfacs
2603021201503093520.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2603021201503093520.eigenfacs
2603021201503093520.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2603021201503093520.eigenfacs
2603021201503093520.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2603021201503093520.eigenfacs
2603021201503093520.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2603021201503093520.eigenfacs
2603021201503093520.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2603021201503093520.eigenfacs
2603021201503093520.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2603021201503093520.eigenfacs
2603021201503093520.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2603021201503093520.eigenfacs
2603021201503093520.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2603021201503093520.eigenfacs
2603021201503093520.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2603021201503093520.eigenfacs
2603021201503093520.atom
making animated gifs
11 models are in 2603021201503093520.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
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making thumbnail 100x100
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11 models are in 2603021201503093520.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
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making thumbnail 100x100
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11 models are in 2603021201503093520.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
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making thumbnail 100x100
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getting mode 8
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normal mode computation
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MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
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MODEL 1 will be plotted
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making small animated gif 100x100
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MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
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making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
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making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
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MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2603021201503093520.10.pdb, 1 models will be skipped
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MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 11
running: ../../bin/get_modes.sh 2603021201503093520 11 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 11
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11 models are in 2603021201503093520.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
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making small animated gif 100x100
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MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
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2603021201503093520.8.pdb
2603021201503093520.9.pdb



STDERR:
Note: The following floating-point exceptions are signalling: IEEE_DENORMAL

real	0m10.306s
user	0m10.224s
sys	0m0.077s
rm: cannot remove '2603021201503093520.sdijf': No such file or directory
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K. Suhre & Y.H. Sanejouand, ElNemo: a normal mode web-server for protein movement analysis and the generation of templates for molecular replacement. Nucleic Acids Research, 32, W610-W614, 2004.
K. Suhre & Y.H. Sanejouand, On the potential of normal mode analysis for solving difficult molecular replacement problems. Acta Cryst. D vol.60, p796-799, 2004 © International Union of Crystallography.
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Still some additional cleaning from time to time
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* HORMONE 14-JAN-23 8I2H *
