***  MADHURJA  ***
Output from eigenvector calculation:
STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8)
Build Tirion matrix:
Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model.
Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004.
Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file.
Pdbmat> Coordinate filename = 2603091745531625378.atom
Pdbmat> Distance cutoff = 8.00
Force constant = 10.00
Origin of mass values = CONS
Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09
PRINTing level = 2
Pdbmat> Coordinate file 2603091745531625378.atom to be opened.
Openam> File opened: 2603091745531625378.atom
Pdbmat> Coordinate file in PDB format.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 386
First residue number = 1
Last residue number = 386
Number of atoms found = 3005
Mean number per residue = 7.8
Pdbmat> Coordinate statistics:
= 0.157340 +/- 15.671859 From: -34.581000 To: 39.177000
= -0.787260 +/- 9.447777 From: -26.150000 To: 26.820000
= -1.165645 +/- 11.818360 From: -27.749000 To: 28.935000
Pdbmat> Masses are all set to one.
Openam> File opened: pdbmat.xyzm
Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved.
Openam> File opened: pdbmat.sdijb
Pdbmat> Matrix statistics:
Pdbmat> The matrix is 2.8117 % Filled.
Pdbmat> 1142669 non-zero elements.
Pdbmat> 124981 atom-atom interactions.
Pdbmat> Number per atom= 83.18 +/- 22.45
Maximum number = 126
Minimum number = 14
Pdbmat> Matrix trace = 2.499620E+06
Pdbmat> Larger element = 474.230
Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10
Pdbmat> Normal end.
automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1)
386 non-zero elements, NRBL set to 2
Diagonalize Tirion matrix using diagrtb
Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation.
Diagrtb> Version 2.52, November 2004.
Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file.
Diagrtb> Options taken into account:
MATRix filename = pdbmat.sdijb
COORdinates filename = 2603091745531625378.atom
Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb
Nb of VECTors required = 106
EigeNVALues chosen = LOWE
Type of SUBStructuring = NONE
Nb of residues per BLOck = 2
Origin of MASS values = CONS
MATRix FORMat = BINA
Temporary files cleaning = ALL
Output PRINting level = 2
Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb.
Blocpdb> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.xyzm
Blocpdb> Coordinate file 2603091745531625378.atom to be opened.
Openam> file on opening on unit 11:
2603091745531625378.atom
Blocpdb> Coordinate file in PDB format.
Blocpdb> 3005 atoms picked in pdb file.
Blocpdb> All masses set to unity.
Blocpdb> Coordinate file is rewritten.
Blocpdb> Substructuring:
Blocpdb> 2 residue(s) per block.
Blocpdb> 386 residues.
Blocpdb> 12 atoms in block 1
Block first atom: 1
Blocpdb> 14 atoms in block 2
Block first atom: 13
Blocpdb> 9 atoms in block 3
Block first atom: 27
Blocpdb> 11 atoms in block 4
Block first atom: 36
Blocpdb> 17 atoms in block 5
Block first atom: 47
Blocpdb> 17 atoms in block 6
Block first atom: 64
Blocpdb> 19 atoms in block 7
Block first atom: 81
Blocpdb> 18 atoms in block 8
Block first atom: 100
Blocpdb> 18 atoms in block 9
Block first atom: 118
Blocpdb> 17 atoms in block 10
Block first atom: 136
Blocpdb> 17 atoms in block 11
Block first atom: 153
Blocpdb> 15 atoms in block 12
Block first atom: 170
Blocpdb> 17 atoms in block 13
Block first atom: 185
Blocpdb> 16 atoms in block 14
Block first atom: 202
Blocpdb> 23 atoms in block 15
Block first atom: 218
Blocpdb> 13 atoms in block 16
Block first atom: 241
Blocpdb> 13 atoms in block 17
Block first atom: 254
Blocpdb> 16 atoms in block 18
Block first atom: 267
Blocpdb> 11 atoms in block 19
Block first atom: 283
Blocpdb> 13 atoms in block 20
Block first atom: 294
Blocpdb> 15 atoms in block 21
Block first atom: 307
Blocpdb> 20 atoms in block 22
Block first atom: 322
Blocpdb> 9 atoms in block 23
Block first atom: 342
Blocpdb> 17 atoms in block 24
Block first atom: 351
Blocpdb> 13 atoms in block 25
Block first atom: 368
Blocpdb> 18 atoms in block 26
Block first atom: 381
Blocpdb> 17 atoms in block 27
Block first atom: 399
Blocpdb> 17 atoms in block 28
Block first atom: 416
Blocpdb> 14 atoms in block 29
Block first atom: 433
Blocpdb> 22 atoms in block 30
Block first atom: 447
Blocpdb> 17 atoms in block 31
Block first atom: 469
Blocpdb> 15 atoms in block 32
Block first atom: 486
Blocpdb> 15 atoms in block 33
Block first atom: 501
Blocpdb> 12 atoms in block 34
Block first atom: 516
Blocpdb> 14 atoms in block 35
Block first atom: 528
Blocpdb> 14 atoms in block 36
Block first atom: 542
Blocpdb> 15 atoms in block 37
Block first atom: 556
Blocpdb> 11 atoms in block 38
Block first atom: 571
Blocpdb> 13 atoms in block 39
Block first atom: 582
Blocpdb> 15 atoms in block 40
Block first atom: 595
Blocpdb> 16 atoms in block 41
Block first atom: 610
Blocpdb> 14 atoms in block 42
Block first atom: 626
Blocpdb> 19 atoms in block 43
Block first atom: 640
Blocpdb> 16 atoms in block 44
Block first atom: 659
Blocpdb> 17 atoms in block 45
Block first atom: 675
Blocpdb> 15 atoms in block 46
Block first atom: 692
Blocpdb> 16 atoms in block 47
Block first atom: 707
Blocpdb> 16 atoms in block 48
Block first atom: 723
Blocpdb> 19 atoms in block 49
Block first atom: 739
Blocpdb> 17 atoms in block 50
Block first atom: 758
Blocpdb> 14 atoms in block 51
Block first atom: 775
Blocpdb> 11 atoms in block 52
Block first atom: 789
Blocpdb> 19 atoms in block 53
Block first atom: 800
Blocpdb> 17 atoms in block 54
Block first atom: 819
Blocpdb> 18 atoms in block 55
Block first atom: 836
Blocpdb> 23 atoms in block 56
Block first atom: 854
Blocpdb> 15 atoms in block 57
Block first atom: 877
Blocpdb> 15 atoms in block 58
Block first atom: 892
Blocpdb> 21 atoms in block 59
Block first atom: 907
Blocpdb> 17 atoms in block 60
Block first atom: 928
Blocpdb> 13 atoms in block 61
Block first atom: 945
Blocpdb> 18 atoms in block 62
Block first atom: 958
Blocpdb> 20 atoms in block 63
Block first atom: 976
Blocpdb> 15 atoms in block 64
Block first atom: 996
Blocpdb> 12 atoms in block 65
Block first atom: 1011
Blocpdb> 16 atoms in block 66
Block first atom: 1023
Blocpdb> 16 atoms in block 67
Block first atom: 1039
Blocpdb> 20 atoms in block 68
Block first atom: 1055
Blocpdb> 12 atoms in block 69
Block first atom: 1075
Blocpdb> 13 atoms in block 70
Block first atom: 1087
Blocpdb> 14 atoms in block 71
Block first atom: 1100
Blocpdb> 20 atoms in block 72
Block first atom: 1114
Blocpdb> 16 atoms in block 73
Block first atom: 1134
Blocpdb> 14 atoms in block 74
Block first atom: 1150
Blocpdb> 21 atoms in block 75
Block first atom: 1164
Blocpdb> 15 atoms in block 76
Block first atom: 1185
Blocpdb> 16 atoms in block 77
Block first atom: 1200
Blocpdb> 12 atoms in block 78
Block first atom: 1216
Blocpdb> 16 atoms in block 79
Block first atom: 1228
Blocpdb> 19 atoms in block 80
Block first atom: 1244
Blocpdb> 15 atoms in block 81
Block first atom: 1263
Blocpdb> 16 atoms in block 82
Block first atom: 1278
Blocpdb> 12 atoms in block 83
Block first atom: 1294
Blocpdb> 15 atoms in block 84
Block first atom: 1306
Blocpdb> 15 atoms in block 85
Block first atom: 1321
Blocpdb> 12 atoms in block 86
Block first atom: 1336
Blocpdb> 15 atoms in block 87
Block first atom: 1348
Blocpdb> 15 atoms in block 88
Block first atom: 1363
Blocpdb> 13 atoms in block 89
Block first atom: 1378
Blocpdb> 15 atoms in block 90
Block first atom: 1391
Blocpdb> 20 atoms in block 91
Block first atom: 1406
Blocpdb> 12 atoms in block 92
Block first atom: 1426
Blocpdb> 23 atoms in block 93
Block first atom: 1438
Blocpdb> 14 atoms in block 94
Block first atom: 1461
Blocpdb> 20 atoms in block 95
Block first atom: 1475
Blocpdb> 17 atoms in block 96
Block first atom: 1495
Blocpdb> 15 atoms in block 97
Block first atom: 1512
Blocpdb> 14 atoms in block 98
Block first atom: 1527
Blocpdb> 15 atoms in block 99
Block first atom: 1541
Blocpdb> 22 atoms in block 100
Block first atom: 1556
Blocpdb> 14 atoms in block 101
Block first atom: 1578
Blocpdb> 18 atoms in block 102
Block first atom: 1592
Blocpdb> 15 atoms in block 103
Block first atom: 1610
Blocpdb> 16 atoms in block 104
Block first atom: 1625
Blocpdb> 16 atoms in block 105
Block first atom: 1641
Blocpdb> 16 atoms in block 106
Block first atom: 1657
Blocpdb> 21 atoms in block 107
Block first atom: 1673
Blocpdb> 12 atoms in block 108
Block first atom: 1694
Blocpdb> 19 atoms in block 109
Block first atom: 1706
Blocpdb> 18 atoms in block 110
Block first atom: 1725
Blocpdb> 11 atoms in block 111
Block first atom: 1743
Blocpdb> 13 atoms in block 112
Block first atom: 1754
Blocpdb> 15 atoms in block 113
Block first atom: 1767
Blocpdb> 17 atoms in block 114
Block first atom: 1782
Blocpdb> 17 atoms in block 115
Block first atom: 1799
Blocpdb> 17 atoms in block 116
Block first atom: 1816
Blocpdb> 15 atoms in block 117
Block first atom: 1833
Blocpdb> 16 atoms in block 118
Block first atom: 1848
Blocpdb> 10 atoms in block 119
Block first atom: 1864
Blocpdb> 15 atoms in block 120
Block first atom: 1874
Blocpdb> 14 atoms in block 121
Block first atom: 1889
Blocpdb> 15 atoms in block 122
Block first atom: 1903
Blocpdb> 16 atoms in block 123
Block first atom: 1918
Blocpdb> 15 atoms in block 124
Block first atom: 1934
Blocpdb> 16 atoms in block 125
Block first atom: 1949
Blocpdb> 10 atoms in block 126
Block first atom: 1965
Blocpdb> 17 atoms in block 127
Block first atom: 1975
Blocpdb> 17 atoms in block 128
Block first atom: 1992
Blocpdb> 15 atoms in block 129
Block first atom: 2009
Blocpdb> 16 atoms in block 130
Block first atom: 2024
Blocpdb> 19 atoms in block 131
Block first atom: 2040
Blocpdb> 18 atoms in block 132
Block first atom: 2059
Blocpdb> 15 atoms in block 133
Block first atom: 2077
Blocpdb> 23 atoms in block 134
Block first atom: 2092
Blocpdb> 13 atoms in block 135
Block first atom: 2115
Blocpdb> 14 atoms in block 136
Block first atom: 2128
Blocpdb> 15 atoms in block 137
Block first atom: 2142
Blocpdb> 18 atoms in block 138
Block first atom: 2157
Blocpdb> 20 atoms in block 139
Block first atom: 2175
Blocpdb> 17 atoms in block 140
Block first atom: 2195
Blocpdb> 19 atoms in block 141
Block first atom: 2212
Blocpdb> 15 atoms in block 142
Block first atom: 2231
Blocpdb> 19 atoms in block 143
Block first atom: 2246
Blocpdb> 17 atoms in block 144
Block first atom: 2265
Blocpdb> 18 atoms in block 145
Block first atom: 2282
Blocpdb> 21 atoms in block 146
Block first atom: 2300
Blocpdb> 16 atoms in block 147
Block first atom: 2321
Blocpdb> 13 atoms in block 148
Block first atom: 2337
Blocpdb> 15 atoms in block 149
Block first atom: 2350
Blocpdb> 13 atoms in block 150
Block first atom: 2365
Blocpdb> 12 atoms in block 151
Block first atom: 2378
Blocpdb> 15 atoms in block 152
Block first atom: 2390
Blocpdb> 15 atoms in block 153
Block first atom: 2405
Blocpdb> 17 atoms in block 154
Block first atom: 2420
Blocpdb> 12 atoms in block 155
Block first atom: 2437
Blocpdb> 13 atoms in block 156
Block first atom: 2449
Blocpdb> 14 atoms in block 157
Block first atom: 2462
Blocpdb> 12 atoms in block 158
Block first atom: 2476
Blocpdb> 12 atoms in block 159
Block first atom: 2488
Blocpdb> 14 atoms in block 160
Block first atom: 2500
Blocpdb> 14 atoms in block 161
Block first atom: 2514
Blocpdb> 17 atoms in block 162
Block first atom: 2528
Blocpdb> 15 atoms in block 163
Block first atom: 2545
Blocpdb> 12 atoms in block 164
Block first atom: 2560
Blocpdb> 15 atoms in block 165
Block first atom: 2572
Blocpdb> 15 atoms in block 166
Block first atom: 2587
Blocpdb> 14 atoms in block 167
Block first atom: 2602
Blocpdb> 16 atoms in block 168
Block first atom: 2616
Blocpdb> 14 atoms in block 169
Block first atom: 2632
Blocpdb> 15 atoms in block 170
Block first atom: 2646
Blocpdb> 16 atoms in block 171
Block first atom: 2661
Blocpdb> 11 atoms in block 172
Block first atom: 2677
Blocpdb> 11 atoms in block 173
Block first atom: 2688
Blocpdb> 14 atoms in block 174
Block first atom: 2699
Blocpdb> 11 atoms in block 175
Block first atom: 2713
Blocpdb> 13 atoms in block 176
Block first atom: 2724
Blocpdb> 11 atoms in block 177
Block first atom: 2737
Blocpdb> 13 atoms in block 178
Block first atom: 2748
Blocpdb> 18 atoms in block 179
Block first atom: 2761
Blocpdb> 22 atoms in block 180
Block first atom: 2779
Blocpdb> 13 atoms in block 181
Block first atom: 2801
Blocpdb> 17 atoms in block 182
Block first atom: 2814
Blocpdb> 19 atoms in block 183
Block first atom: 2831
Blocpdb> 17 atoms in block 184
Block first atom: 2850
Blocpdb> 17 atoms in block 185
Block first atom: 2867
Blocpdb> 18 atoms in block 186
Block first atom: 2884
Blocpdb> 12 atoms in block 187
Block first atom: 2902
Blocpdb> 13 atoms in block 188
Block first atom: 2914
Blocpdb> 15 atoms in block 189
Block first atom: 2927
Blocpdb> 22 atoms in block 190
Block first atom: 2942
Blocpdb> 15 atoms in block 191
Block first atom: 2964
Blocpdb> 13 atoms in block 192
Block first atom: 2979
Blocpdb> 14 atoms in block 193
Block first atom: 2991
Blocpdb> 193 blocks.
Blocpdb> At most, 23 atoms in each of them.
Blocpdb> At least, 9 atoms in each of them.
Blocpdb> Normal end of Blocpdb.
Diagrtb> Memory allocation for Prepmat.
Diagrtb> Memory allocation for RTB.
Diagrtb> Memory allocation for Diagstd.
Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes.
Prepmat> Entering in.
Prepmat> Rewriting of the matrix begins.
Prepmat> 1142862 matrix lines read.
Prepmat> Matrix order = 9015
Prepmat> Matrix trace = 2499620.0000
Prepmat> Last element read: 9015 9015 191.9798
Prepmat> 18722 lines saved.
Prepmat> 16490 empty lines.
Prepmat> Number of lines on output is as expected.
Prepmat> Normal end of Prepmat.
RTB> Entering in.
RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 3005
RTB> Total mass = 3005.0000
RTB> Number of atoms found in matrix: 3005
RTB> Number of blocks = 193
RTB> Projection begins.
RTB> Projected matrix is being saved.
RTB> Projected matrix trace = 272490.3150
RTB> 77421 non-zero elements.
RTB> Normal end of RTB.
Diagstd> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.sdijb
Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb
Diagstd> CERFACS matrix format.
Diagstd> Projected matrix order = 1158
Diagstd> Nb of non-zero elements: 77421
Diagstd> Projected matrix trace = 272490.3150
Openam> file on opening on unit 11:
diagrtb_work.eigenfacs
Diagstd> Diagonalization.
Diagstd> 1158 eigenvectors are computed.
Diagstd> 106 of them to be saved.
Diagstd> Sum of eigenvalues = 272490.3150
Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000
Diagstd> Selected eigenvalues:
0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000
0.0000000 2.3295534 2.5824475 3.3454933 6.2493141
7.0822307 7.7623580 8.2835240 8.7506370 9.4403853
10.1588578 10.7383337 12.9718389 13.3249380 13.9035591
14.4809489 15.4138473 16.7544813 17.0463801 18.2114880
18.4021656 19.0167510 19.4306046 20.0960293 21.0161534
21.5024630 22.1975348 22.7697327 23.1391644 23.9729997
24.6282370 25.5531398 25.9703738 27.2262973 27.6196259
28.0324470 28.7502216 29.4036114 29.5561138 29.7808002
30.6856438 31.5661994 31.7606952 32.5958794 33.3995849
34.2643643 34.8383229 35.4592714 36.1078306 36.9416673
37.7012985 38.1309687 38.3741530 39.2271099 40.0208381
41.0067142 41.3141901 41.5516395 41.8295265 42.3373904
43.1006481 43.6518458 44.3047286 45.1188718 45.9284009
46.5154980 47.7826295 47.8877623 48.1472404 48.9209992
50.2502223 50.4445117 51.2800660 51.8945641 51.9772462
52.5870667 53.0880151 53.7268905 53.9969888 54.7434992
54.8539709 55.7193733 55.8709528 57.1444851 57.5316367
58.1994563 58.4488379 59.0133582 59.5741809 59.8081473
60.9055351 61.7915466 61.8870888 62.1157045 62.5434969
63.0943286 63.5368366 64.1011519 65.0754240 65.5546142
66.2267657
Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units):
0.0034327 0.0034330 0.0034339 0.0034342 0.0034352
0.0034356 165.7416340 174.5062690 198.6210894 271.4635072
288.9883372 302.5464878 312.5380145 321.2292733 333.6492396
346.1128471 355.8473429 391.1074187 396.3947360 404.9097870
413.2318530 426.3348226 444.4887505 448.3440020 463.4127685
465.8324604 473.5473817 478.6724562 486.7998192 497.8194895
503.5462712 511.6201644 518.1723632 522.3590417 531.6875246
538.9046640 548.9305682 553.3939167 566.6169628 570.6951429
574.9443162 582.2585549 588.8377132 590.3627478 592.6024758
601.5377681 610.1075899 611.9842992 619.9785037 627.5752605
635.6479050 640.9496288 646.6364535 652.5232317 660.0145762
666.7659822 670.5546828 672.6895509 680.1245264 686.9709462
695.3809135 697.9830917 699.9860137 702.3227789 706.5734641
712.9140611 717.4581719 722.8036228 729.4145063 735.9290431
740.6177521 750.6375800 751.4629135 753.4960504 759.5265153
769.7758357 771.2625456 777.6238424 782.2691700 782.8921049
787.4713343 791.2132003 795.9597981 797.9580330 803.4549991
804.2652717 810.5846808 811.6864934 820.8852309 823.6612698
828.4279523 830.2009397 834.2004984 838.1549614 839.7991970
847.4686895 853.6106267 854.2702988 855.8467148 858.7887767
862.5622393 865.5817167 869.4171392 875.9993492 879.2186935
883.7146473
Diagstd> Normal end.
Rtb_to_modes> Entering in.
Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 3005
Rtb_to_modes> Number of blocs = 193
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 11:
matrix.eigenrtb
Rdmodfacs> Entering in.
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Eigenvector number: 1
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9928E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 2
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9942E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 3
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9998E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 4
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0001E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 5
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0007E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 6
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0009E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 7
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.330
Rdmodfacs> Eigenvector number: 8
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.582
Rdmodfacs> Eigenvector number: 9
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.345
Rdmodfacs> Eigenvector number: 10
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.249
Rdmodfacs> Eigenvector number: 11
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.082
Rdmodfacs> Eigenvector number: 12
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.762
Rdmodfacs> Eigenvector number: 13
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.284
Rdmodfacs> Eigenvector number: 14
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.751
Rdmodfacs> Eigenvector number: 15
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.440
Rdmodfacs> Eigenvector number: 16
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.16
Rdmodfacs> Eigenvector number: 17
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.74
Rdmodfacs> Eigenvector number: 18
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.97
Rdmodfacs> Eigenvector number: 19
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.32
Rdmodfacs> Eigenvector number: 20
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.90
Rdmodfacs> Eigenvector number: 21
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.48
Rdmodfacs> Eigenvector number: 22
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.41
Rdmodfacs> Eigenvector number: 23
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.75
Rdmodfacs> Eigenvector number: 24
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.05
Rdmodfacs> Eigenvector number: 25
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.21
Rdmodfacs> Eigenvector number: 26
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.40
Rdmodfacs> Eigenvector number: 27
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.02
Rdmodfacs> Eigenvector number: 28
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.43
Rdmodfacs> Eigenvector number: 29
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 30
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.02
Rdmodfacs> Eigenvector number: 31
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.50
Rdmodfacs> Eigenvector number: 32
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.20
Rdmodfacs> Eigenvector number: 33
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.77
Rdmodfacs> Eigenvector number: 34
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.14
Rdmodfacs> Eigenvector number: 35
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.97
Rdmodfacs> Eigenvector number: 36
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.63
Rdmodfacs> Eigenvector number: 37
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.55
Rdmodfacs> Eigenvector number: 38
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.97
Rdmodfacs> Eigenvector number: 39
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.23
Rdmodfacs> Eigenvector number: 40
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.62
Rdmodfacs> Eigenvector number: 41
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.03
Rdmodfacs> Eigenvector number: 42
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.75
Rdmodfacs> Eigenvector number: 43
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.40
Rdmodfacs> Eigenvector number: 44
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.56
Rdmodfacs> Eigenvector number: 45
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.78
Rdmodfacs> Eigenvector number: 46
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.69
Rdmodfacs> Eigenvector number: 47
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.57
Rdmodfacs> Eigenvector number: 48
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.76
Rdmodfacs> Eigenvector number: 49
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.60
Rdmodfacs> Eigenvector number: 50
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.40
Rdmodfacs> Eigenvector number: 51
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.26
Rdmodfacs> Eigenvector number: 52
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.84
Rdmodfacs> Eigenvector number: 53
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.46
Rdmodfacs> Eigenvector number: 54
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.11
Rdmodfacs> Eigenvector number: 55
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.94
Rdmodfacs> Eigenvector number: 56
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.70
Rdmodfacs> Eigenvector number: 57
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.13
Rdmodfacs> Eigenvector number: 58
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.37
Rdmodfacs> Eigenvector number: 59
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.23
Rdmodfacs> Eigenvector number: 60
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.02
Rdmodfacs> Eigenvector number: 61
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.01
Rdmodfacs> Eigenvector number: 62
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.31
Rdmodfacs> Eigenvector number: 63
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.55
Rdmodfacs> Eigenvector number: 64
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.83
Rdmodfacs> Eigenvector number: 65
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.34
Rdmodfacs> Eigenvector number: 66
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 67
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.65
Rdmodfacs> Eigenvector number: 68
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.30
Rdmodfacs> Eigenvector number: 69
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.12
Rdmodfacs> Eigenvector number: 70
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.93
Rdmodfacs> Eigenvector number: 71
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.52
Rdmodfacs> Eigenvector number: 72
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 47.78
Rdmodfacs> Eigenvector number: 73
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 47.89
Rdmodfacs> Eigenvector number: 74
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 48.15
Rdmodfacs> Eigenvector number: 75
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 48.92
Rdmodfacs> Eigenvector number: 76
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 50.25
Rdmodfacs> Eigenvector number: 77
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 50.44
Rdmodfacs> Eigenvector number: 78
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 51.28
Rdmodfacs> Eigenvector number: 79
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 51.89
Rdmodfacs> Eigenvector number: 80
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 51.98
Rdmodfacs> Eigenvector number: 81
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 52.59
Rdmodfacs> Eigenvector number: 82
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 53.09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 83
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 53.73
Rdmodfacs> Eigenvector number: 84
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 54.00
Rdmodfacs> Eigenvector number: 85
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 54.74
Rdmodfacs> Eigenvector number: 86
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 54.85
Rdmodfacs> Eigenvector number: 87
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 55.72
Rdmodfacs> Eigenvector number: 88
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 55.87
Rdmodfacs> Eigenvector number: 89
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 57.14
Rdmodfacs> Eigenvector number: 90
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 57.53
Rdmodfacs> Eigenvector number: 91
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 58.20
Rdmodfacs> Eigenvector number: 92
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 58.45
Rdmodfacs> Eigenvector number: 93
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 59.01
Rdmodfacs> Eigenvector number: 94
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 59.57
Rdmodfacs> Eigenvector number: 95
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 59.81
Rdmodfacs> Eigenvector number: 96
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 60.91
Rdmodfacs> Eigenvector number: 97
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 61.79
Rdmodfacs> Eigenvector number: 98
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 61.89
Rdmodfacs> Eigenvector number: 99
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 62.12
Rdmodfacs> Eigenvector number: 100
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 62.54
Rdmodfacs> Eigenvector number: 101
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 63.09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 102
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 63.54
Rdmodfacs> Eigenvector number: 103
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 64.10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 104
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 65.08
Rdmodfacs> Eigenvector number: 105
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 65.55
Rdmodfacs> Eigenvector number: 106
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 66.23
Rtb_to_modes> 106 vectors, with 1158 coordinates in vector file.
Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected):
1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000
1.00000 1.00001 1.00000 1.00001 0.99999
1.00000 1.00001 1.00000 1.00000 1.00002
1.00000 1.00000 1.00000 1.00002 0.99998
1.00000 0.99999 0.99998 1.00002 0.99999
1.00001 0.99997 1.00000 1.00000 1.00002
0.99999 0.99997 0.99999 1.00001 0.99999
1.00000 1.00001 1.00001 1.00000 0.99999
1.00000 0.99998 0.99999 0.99998 1.00000
0.99999 1.00000 1.00000 0.99999 0.99999
0.99999 1.00001 0.99999 1.00004 1.00000
1.00003 1.00000 1.00000 0.99999 0.99999
1.00000 0.99999 1.00000 1.00001 1.00001
1.00000 0.99999 1.00000 1.00001 0.99999
0.99999 0.99999 0.99998 1.00000 1.00000
0.99997 1.00001 1.00001 0.99998 1.00000
1.00002 1.00000 1.00000 1.00004 1.00002
0.99998 0.99998 1.00000 1.00001 1.00001
1.00002 1.00000 1.00003 1.00001 1.00000
0.99998 0.99998 1.00001 1.00000 0.99999
1.00001 1.00001 1.00000 1.00001 1.00001
0.99999
Rtb_to_modes> RTB block-file is being read.
Rtb_to_modes> 54090 lines found in RTB file.
Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected):
1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000
1.00000 1.00001 1.00000 1.00001 0.99999
1.00000 1.00001 1.00000 1.00000 1.00002
1.00000 1.00000 1.00000 1.00002 0.99998
1.00000 0.99999 0.99998 1.00002 0.99999
1.00001 0.99997 1.00000 1.00000 1.00002
0.99999 0.99997 0.99999 1.00001 0.99999
1.00000 1.00001 1.00001 1.00000 0.99999
1.00000 0.99998 0.99999 0.99998 1.00000
0.99999 1.00000 1.00000 0.99999 0.99999
0.99999 1.00001 0.99999 1.00004 1.00000
1.00003 1.00000 1.00000 0.99999 0.99999
1.00000 0.99999 1.00000 1.00001 1.00001
1.00000 0.99999 1.00000 1.00001 0.99999
0.99999 0.99999 0.99998 1.00000 1.00000
0.99997 1.00001 1.00001 0.99998 1.00000
1.00002 1.00000 1.00000 1.00004 1.00002
0.99998 0.99998 1.00000 1.00001 1.00001
1.00002 1.00000 1.00003 1.00001 1.00000
0.99998 0.99998 1.00001 1.00000 0.99999
1.00001 1.00001 1.00000 1.00001 1.00001
0.99999
Orthogonality of first eigenvectors (zero expected):
Vector 2: 0.000
Vector 3: 0.000-0.000
Vector 4: 0.000 0.000 0.000
Vector 5:-0.000-0.000-0.000 0.000
Vector 6:-0.000 0.000 0.000 0.000-0.000
Vector 7: 0.000 0.000-0.000 0.000 0.000 0.000
Vector 8: 0.000 0.000-0.000-0.000-0.000 0.000-0.000
Vector 9:-0.000 0.000-0.000-0.000-0.000 0.000-0.000 0.000
Vector 10:-0.000 0.000 0.000-0.000 0.000-0.000 0.000-0.000-0.000
Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved.
Rtb_to_modes> Normal end.
Diagrtb> Normal end.
B-factor analysis
Bfactors> Version 1.22, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 2603091745531625378.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
2603091745531625378.eigenfacs
Getnam> Corresponding pdb filename ?
Getnam> 2603091745531625378.atom
Openam> file on opening on unit 11:
2603091745531625378.atom
Getnum> Number of skipped eigenvectors ?
Getnum> 0
Getnum> Number of usefull eigenvectors ?
Getnum> 10000
%Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 386
First residue number = 1
Last residue number = 386
Number of atoms found = 3005
Mean number per residue = 7.8
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9928E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9942E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9998E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0001E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0007E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0009E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.330
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.582
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.345
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.249
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.082
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.762
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.284
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.751
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.440
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.16
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.74
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.97
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.32
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.90
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.48
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.41
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.75
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.05
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.21
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.40
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.02
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.43
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.02
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.50
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.20
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.77
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.14
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.97
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.63
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.55
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.97
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.23
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.62
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.75
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.40
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.56
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.78
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.69
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.57
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.76
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.60
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.40
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.26
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.84
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.46
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.11
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.94
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.70
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.13
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.37
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.23
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.02
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.01
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.31
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.55
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.83
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.34
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.65
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.30
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.12
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.93
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.52
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.78
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.89
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.15
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.92
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 50.25
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 50.44
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 51.28
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 51.89
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 51.98
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 52.59
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 53.09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 53.73
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 54.00
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 54.74
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 54.85
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 55.72
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 55.87
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 57.14
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 57.53
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 58.20
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 58.45
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 59.01
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 59.57
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 59.81
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 60.91
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 61.79
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 61.89
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 62.12
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 62.54
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 63.09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 63.54
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 64.10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 65.08
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 65.55
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 66.23
Bfactors> 106 vectors, 9015 coordinates in file.
Openam> file on opening on unit 12:
bfactors.pred
Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000
Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 2.330000
Bfactors> 100 eigenvectors will be considered.
Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped.
Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed.
(CHARMM units assumed for eigenvalues)
Bfactors> Correlation= -0.612 for 386 C-alpha atoms.
Bfactors> = 0.022 +/- 0.02
Bfactors> = 92.096 +/- 10.98
Bfactors> Shiftng-fct= 92.074
Bfactors> Scaling-fct= 476.601
Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved.
Bfactors> Normal end.
check_modes
Chkmod> Version 1.00, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 2603091745531625378.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
2603091745531625378.eigenfacs
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4326E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4328E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4338E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4340E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4350E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4354E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 165.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 174.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 198.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 271.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 289.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 302.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 312.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 321.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 333.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 346.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 355.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 391.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 396.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 404.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 413.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 426.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 444.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 448.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 463.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 465.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 473.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 478.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 486.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 497.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 503.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 511.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 518.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 522.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 531.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 538.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 548.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 553.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 566.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 570.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 574.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 582.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 588.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 590.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 592.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 601.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 610.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 612.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 620.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 627.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 635.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 640.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 646.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 652.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 660.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 666.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 670.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 672.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 680.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 686.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 695.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 697.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 699.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 702.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 706.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 712.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 717.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 722.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 729.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 735.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 740.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 750.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 751.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 753.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 759.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 769.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 771.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 777.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 782.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 782.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 787.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 791.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 795.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 797.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 803.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 804.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 810.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 811.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 820.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 823.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 828.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 830.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 834.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 838.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 839.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 847.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 853.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 854.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 855.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 858.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 862.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 865.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 869.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 876.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 879.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 883.7
Chkmod> 106 vectors, 9015 coordinates in file.
Chkmod> That is: 3005 cartesian points.
Openam> file on opening on unit 11:
Chkmod.res
Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file.
Chkmod> Normal end.
0.0034 0.7905
0.0034 0.7217
0.0034 0.7489
0.0034 0.8717
0.0034 0.6943
0.0034 0.9370
165.7504 0.6195
174.4837 0.5800
198.5979 0.6601
271.4450 0.3711
288.9712 0.2750
302.5265 0.2123
312.5336 0.2145
321.2221 0.1086
333.6281 0.5153
346.1174 0.3510
355.8597 0.3311
391.0629 0.3608
396.3043 0.3928
404.8406 0.3222
413.2006 0.1665
426.2633 0.5120
444.4102 0.5845
448.3724 0.3242
463.3739 0.3634
465.7851 0.1801
473.5675 0.0815
478.6445 0.4628
486.8270 0.1711
497.8437 0.2971
503.4958 0.4786
511.6266 0.4302
518.1532 0.3391
522.3460 0.4255
531.6314 0.5433
538.9008 0.4957
548.8733 0.5723
553.3662 0.2716
566.6312 0.3542
570.6745 0.4944
574.8945 0.5410
582.2313 0.3978
588.7763 0.5458
590.3762 0.4696
592.5691 0.4868
601.5546 0.1915
610.1181 0.2099
611.9513 0.3372
619.9911 0.3374
627.5522 0.4743
635.5801 0.3661
640.9375 0.3182
646.6153 0.3382
652.5148 0.2648
659.9713 0.3807
666.7259 0.3480
670.5174 0.4278
672.6243 0.1256
680.1204 0.4656
686.9343 0.3669
695.3789 0.3822
697.9177 0.6013
699.9422 0.5078
702.2966 0.4859
706.5649 0.4341
712.8781 0.3448
717.4122 0.2858
722.7340 0.4151
729.3923 0.3912
735.9103 0.3992
740.6218 0.4862
750.5847 0.4993
751.4482 0.4546
753.4853 0.4567
759.4862 0.4837
769.7411 0.4565
771.1949 0.3549
777.5900 0.4687
782.2012 0.3997
782.8792 0.4611
787.4595 0.4951
791.1940 0.4584
795.9487 0.4546
797.9460 0.4868
803.3948 0.3196
804.2016 0.4673
810.5544 0.3208
811.6447 0.4417
820.8178 0.4193
823.6142 0.4786
828.3963 0.4669
830.1736 0.5401
834.1410 0.2561
838.0896 0.4592
839.7762 0.4485
847.4634 0.4960
853.5633 0.5319
854.2537 0.4190
855.8396 0.3121
858.7279 0.4172
862.4956 0.4604
865.5661 0.3130
869.3720 0.4154
875.9925 0.4336
879.1500 0.4457
883.6983 0.3022
getting mode 7
running: ../../bin/get_modes.sh 2603091745531625378 7 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 7
calculating perturbed structure for DQ=-100
2603091745531625378.eigenfacs
2603091745531625378.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2603091745531625378.eigenfacs
2603091745531625378.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2603091745531625378.eigenfacs
2603091745531625378.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2603091745531625378.eigenfacs
2603091745531625378.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2603091745531625378.eigenfacs
2603091745531625378.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2603091745531625378.eigenfacs
2603091745531625378.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2603091745531625378.eigenfacs
2603091745531625378.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2603091745531625378.eigenfacs
2603091745531625378.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2603091745531625378.eigenfacs
2603091745531625378.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2603091745531625378.eigenfacs
2603091745531625378.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2603091745531625378.eigenfacs
2603091745531625378.atom
making animated gifs
11 models are in 2603091745531625378.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2603091745531625378.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2603091745531625378.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 8
running: ../../bin/get_modes.sh 2603091745531625378 8 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 8
calculating perturbed structure for DQ=-100
2603091745531625378.eigenfacs
2603091745531625378.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2603091745531625378.eigenfacs
2603091745531625378.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2603091745531625378.eigenfacs
2603091745531625378.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2603091745531625378.eigenfacs
2603091745531625378.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2603091745531625378.eigenfacs
2603091745531625378.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2603091745531625378.eigenfacs
2603091745531625378.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2603091745531625378.eigenfacs
2603091745531625378.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2603091745531625378.eigenfacs
2603091745531625378.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2603091745531625378.eigenfacs
2603091745531625378.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2603091745531625378.eigenfacs
2603091745531625378.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2603091745531625378.eigenfacs
2603091745531625378.atom
making animated gifs
11 models are in 2603091745531625378.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2603091745531625378.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2603091745531625378.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 9
running: ../../bin/get_modes.sh 2603091745531625378 9 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 9
calculating perturbed structure for DQ=-100
2603091745531625378.eigenfacs
2603091745531625378.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2603091745531625378.eigenfacs
2603091745531625378.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2603091745531625378.eigenfacs
2603091745531625378.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2603091745531625378.eigenfacs
2603091745531625378.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2603091745531625378.eigenfacs
2603091745531625378.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2603091745531625378.eigenfacs
2603091745531625378.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2603091745531625378.eigenfacs
2603091745531625378.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2603091745531625378.eigenfacs
2603091745531625378.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2603091745531625378.eigenfacs
2603091745531625378.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2603091745531625378.eigenfacs
2603091745531625378.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2603091745531625378.eigenfacs
2603091745531625378.atom
making animated gifs
11 models are in 2603091745531625378.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2603091745531625378.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2603091745531625378.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 10
running: ../../bin/get_modes.sh 2603091745531625378 10 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 10
calculating perturbed structure for DQ=-100
2603091745531625378.eigenfacs
2603091745531625378.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2603091745531625378.eigenfacs
2603091745531625378.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2603091745531625378.eigenfacs
2603091745531625378.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2603091745531625378.eigenfacs
2603091745531625378.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2603091745531625378.eigenfacs
2603091745531625378.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2603091745531625378.eigenfacs
2603091745531625378.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2603091745531625378.eigenfacs
2603091745531625378.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2603091745531625378.eigenfacs
2603091745531625378.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2603091745531625378.eigenfacs
2603091745531625378.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2603091745531625378.eigenfacs
2603091745531625378.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2603091745531625378.eigenfacs
2603091745531625378.atom
making animated gifs
11 models are in 2603091745531625378.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2603091745531625378.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2603091745531625378.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 11
running: ../../bin/get_modes.sh 2603091745531625378 11 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 11
calculating perturbed structure for DQ=-100
2603091745531625378.eigenfacs
2603091745531625378.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2603091745531625378.eigenfacs
2603091745531625378.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2603091745531625378.eigenfacs
2603091745531625378.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2603091745531625378.eigenfacs
2603091745531625378.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2603091745531625378.eigenfacs
2603091745531625378.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2603091745531625378.eigenfacs
2603091745531625378.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2603091745531625378.eigenfacs
2603091745531625378.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2603091745531625378.eigenfacs
2603091745531625378.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2603091745531625378.eigenfacs
2603091745531625378.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2603091745531625378.eigenfacs
2603091745531625378.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2603091745531625378.eigenfacs
2603091745531625378.atom
making animated gifs
11 models are in 2603091745531625378.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2603091745531625378.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2603091745531625378.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
2603091745531625378.10.pdb
2603091745531625378.11.pdb
2603091745531625378.7.pdb
2603091745531625378.8.pdb
2603091745531625378.9.pdb
STDERR:
Note: The following floating-point exceptions are signalling: IEEE_DENORMAL
real 0m22.106s
user 0m22.015s
sys 0m0.085s
rm: cannot remove '2603091745531625378.sdijf': No such file or directory
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
If you find results from this site helpful for your research, please cite one of our papers:
elNémo
is maintained by Yves-Henri Sanejouand.
It was developed
by Karsten Suhre.
Between 2003 and 2014, it was hosted by IGS (Marseille).
Between 2015 and 2025, it was hosted by US2B (Nantes).
Last modification: december 26th, 2025.
|