CNRS Nantes University US2B US2B
home |  start a new run |  job status |  references&downloads |  examples |  help  

Should you encounter any unexpected behaviour,
please let us know.
elNémo has been hacked on november 27th.
It has been moved away and runs again.
**Still some additional cleaning from time to time**
Sorry for the inconvenience.


***  MADHURJA  ***

LOGs for ID: 2603091745531625378

Output from eigenvector calculation:


STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8) Build Tirion matrix: Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model. Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004. Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file. Pdbmat> Coordinate filename = 2603091745531625378.atom Pdbmat> Distance cutoff = 8.00 Force constant = 10.00 Origin of mass values = CONS Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09 PRINTing level = 2 Pdbmat> Coordinate file 2603091745531625378.atom to be opened. Openam> File opened: 2603091745531625378.atom Pdbmat> Coordinate file in PDB format. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 386 First residue number = 1 Last residue number = 386 Number of atoms found = 3005 Mean number per residue = 7.8 Pdbmat> Coordinate statistics: = 0.157340 +/- 15.671859 From: -34.581000 To: 39.177000 = -0.787260 +/- 9.447777 From: -26.150000 To: 26.820000 = -1.165645 +/- 11.818360 From: -27.749000 To: 28.935000 Pdbmat> Masses are all set to one. Openam> File opened: pdbmat.xyzm Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved. Openam> File opened: pdbmat.sdijb Pdbmat> Matrix statistics: Pdbmat> The matrix is 2.8117 % Filled. Pdbmat> 1142669 non-zero elements. Pdbmat> 124981 atom-atom interactions. Pdbmat> Number per atom= 83.18 +/- 22.45 Maximum number = 126 Minimum number = 14 Pdbmat> Matrix trace = 2.499620E+06 Pdbmat> Larger element = 474.230 Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10 Pdbmat> Normal end. automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1) 386 non-zero elements, NRBL set to 2 Diagonalize Tirion matrix using diagrtb Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation. Diagrtb> Version 2.52, November 2004. Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file. Diagrtb> Options taken into account: MATRix filename = pdbmat.sdijb COORdinates filename = 2603091745531625378.atom Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb Nb of VECTors required = 106 EigeNVALues chosen = LOWE Type of SUBStructuring = NONE Nb of residues per BLOck = 2 Origin of MASS values = CONS MATRix FORMat = BINA Temporary files cleaning = ALL Output PRINting level = 2 Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb. Blocpdb> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.xyzm Blocpdb> Coordinate file 2603091745531625378.atom to be opened. Openam> file on opening on unit 11: 2603091745531625378.atom Blocpdb> Coordinate file in PDB format. Blocpdb> 3005 atoms picked in pdb file. Blocpdb> All masses set to unity. Blocpdb> Coordinate file is rewritten. Blocpdb> Substructuring: Blocpdb> 2 residue(s) per block. Blocpdb> 386 residues. Blocpdb> 12 atoms in block 1 Block first atom: 1 Blocpdb> 14 atoms in block 2 Block first atom: 13 Blocpdb> 9 atoms in block 3 Block first atom: 27 Blocpdb> 11 atoms in block 4 Block first atom: 36 Blocpdb> 17 atoms in block 5 Block first atom: 47 Blocpdb> 17 atoms in block 6 Block first atom: 64 Blocpdb> 19 atoms in block 7 Block first atom: 81 Blocpdb> 18 atoms in block 8 Block first atom: 100 Blocpdb> 18 atoms in block 9 Block first atom: 118 Blocpdb> 17 atoms in block 10 Block first atom: 136 Blocpdb> 17 atoms in block 11 Block first atom: 153 Blocpdb> 15 atoms in block 12 Block first atom: 170 Blocpdb> 17 atoms in block 13 Block first atom: 185 Blocpdb> 16 atoms in block 14 Block first atom: 202 Blocpdb> 23 atoms in block 15 Block first atom: 218 Blocpdb> 13 atoms in block 16 Block first atom: 241 Blocpdb> 13 atoms in block 17 Block first atom: 254 Blocpdb> 16 atoms in block 18 Block first atom: 267 Blocpdb> 11 atoms in block 19 Block first atom: 283 Blocpdb> 13 atoms in block 20 Block first atom: 294 Blocpdb> 15 atoms in block 21 Block first atom: 307 Blocpdb> 20 atoms in block 22 Block first atom: 322 Blocpdb> 9 atoms in block 23 Block first atom: 342 Blocpdb> 17 atoms in block 24 Block first atom: 351 Blocpdb> 13 atoms in block 25 Block first atom: 368 Blocpdb> 18 atoms in block 26 Block first atom: 381 Blocpdb> 17 atoms in block 27 Block first atom: 399 Blocpdb> 17 atoms in block 28 Block first atom: 416 Blocpdb> 14 atoms in block 29 Block first atom: 433 Blocpdb> 22 atoms in block 30 Block first atom: 447 Blocpdb> 17 atoms in block 31 Block first atom: 469 Blocpdb> 15 atoms in block 32 Block first atom: 486 Blocpdb> 15 atoms in block 33 Block first atom: 501 Blocpdb> 12 atoms in block 34 Block first atom: 516 Blocpdb> 14 atoms in block 35 Block first atom: 528 Blocpdb> 14 atoms in block 36 Block first atom: 542 Blocpdb> 15 atoms in block 37 Block first atom: 556 Blocpdb> 11 atoms in block 38 Block first atom: 571 Blocpdb> 13 atoms in block 39 Block first atom: 582 Blocpdb> 15 atoms in block 40 Block first atom: 595 Blocpdb> 16 atoms in block 41 Block first atom: 610 Blocpdb> 14 atoms in block 42 Block first atom: 626 Blocpdb> 19 atoms in block 43 Block first atom: 640 Blocpdb> 16 atoms in block 44 Block first atom: 659 Blocpdb> 17 atoms in block 45 Block first atom: 675 Blocpdb> 15 atoms in block 46 Block first atom: 692 Blocpdb> 16 atoms in block 47 Block first atom: 707 Blocpdb> 16 atoms in block 48 Block first atom: 723 Blocpdb> 19 atoms in block 49 Block first atom: 739 Blocpdb> 17 atoms in block 50 Block first atom: 758 Blocpdb> 14 atoms in block 51 Block first atom: 775 Blocpdb> 11 atoms in block 52 Block first atom: 789 Blocpdb> 19 atoms in block 53 Block first atom: 800 Blocpdb> 17 atoms in block 54 Block first atom: 819 Blocpdb> 18 atoms in block 55 Block first atom: 836 Blocpdb> 23 atoms in block 56 Block first atom: 854 Blocpdb> 15 atoms in block 57 Block first atom: 877 Blocpdb> 15 atoms in block 58 Block first atom: 892 Blocpdb> 21 atoms in block 59 Block first atom: 907 Blocpdb> 17 atoms in block 60 Block first atom: 928 Blocpdb> 13 atoms in block 61 Block first atom: 945 Blocpdb> 18 atoms in block 62 Block first atom: 958 Blocpdb> 20 atoms in block 63 Block first atom: 976 Blocpdb> 15 atoms in block 64 Block first atom: 996 Blocpdb> 12 atoms in block 65 Block first atom: 1011 Blocpdb> 16 atoms in block 66 Block first atom: 1023 Blocpdb> 16 atoms in block 67 Block first atom: 1039 Blocpdb> 20 atoms in block 68 Block first atom: 1055 Blocpdb> 12 atoms in block 69 Block first atom: 1075 Blocpdb> 13 atoms in block 70 Block first atom: 1087 Blocpdb> 14 atoms in block 71 Block first atom: 1100 Blocpdb> 20 atoms in block 72 Block first atom: 1114 Blocpdb> 16 atoms in block 73 Block first atom: 1134 Blocpdb> 14 atoms in block 74 Block first atom: 1150 Blocpdb> 21 atoms in block 75 Block first atom: 1164 Blocpdb> 15 atoms in block 76 Block first atom: 1185 Blocpdb> 16 atoms in block 77 Block first atom: 1200 Blocpdb> 12 atoms in block 78 Block first atom: 1216 Blocpdb> 16 atoms in block 79 Block first atom: 1228 Blocpdb> 19 atoms in block 80 Block first atom: 1244 Blocpdb> 15 atoms in block 81 Block first atom: 1263 Blocpdb> 16 atoms in block 82 Block first atom: 1278 Blocpdb> 12 atoms in block 83 Block first atom: 1294 Blocpdb> 15 atoms in block 84 Block first atom: 1306 Blocpdb> 15 atoms in block 85 Block first atom: 1321 Blocpdb> 12 atoms in block 86 Block first atom: 1336 Blocpdb> 15 atoms in block 87 Block first atom: 1348 Blocpdb> 15 atoms in block 88 Block first atom: 1363 Blocpdb> 13 atoms in block 89 Block first atom: 1378 Blocpdb> 15 atoms in block 90 Block first atom: 1391 Blocpdb> 20 atoms in block 91 Block first atom: 1406 Blocpdb> 12 atoms in block 92 Block first atom: 1426 Blocpdb> 23 atoms in block 93 Block first atom: 1438 Blocpdb> 14 atoms in block 94 Block first atom: 1461 Blocpdb> 20 atoms in block 95 Block first atom: 1475 Blocpdb> 17 atoms in block 96 Block first atom: 1495 Blocpdb> 15 atoms in block 97 Block first atom: 1512 Blocpdb> 14 atoms in block 98 Block first atom: 1527 Blocpdb> 15 atoms in block 99 Block first atom: 1541 Blocpdb> 22 atoms in block 100 Block first atom: 1556 Blocpdb> 14 atoms in block 101 Block first atom: 1578 Blocpdb> 18 atoms in block 102 Block first atom: 1592 Blocpdb> 15 atoms in block 103 Block first atom: 1610 Blocpdb> 16 atoms in block 104 Block first atom: 1625 Blocpdb> 16 atoms in block 105 Block first atom: 1641 Blocpdb> 16 atoms in block 106 Block first atom: 1657 Blocpdb> 21 atoms in block 107 Block first atom: 1673 Blocpdb> 12 atoms in block 108 Block first atom: 1694 Blocpdb> 19 atoms in block 109 Block first atom: 1706 Blocpdb> 18 atoms in block 110 Block first atom: 1725 Blocpdb> 11 atoms in block 111 Block first atom: 1743 Blocpdb> 13 atoms in block 112 Block first atom: 1754 Blocpdb> 15 atoms in block 113 Block first atom: 1767 Blocpdb> 17 atoms in block 114 Block first atom: 1782 Blocpdb> 17 atoms in block 115 Block first atom: 1799 Blocpdb> 17 atoms in block 116 Block first atom: 1816 Blocpdb> 15 atoms in block 117 Block first atom: 1833 Blocpdb> 16 atoms in block 118 Block first atom: 1848 Blocpdb> 10 atoms in block 119 Block first atom: 1864 Blocpdb> 15 atoms in block 120 Block first atom: 1874 Blocpdb> 14 atoms in block 121 Block first atom: 1889 Blocpdb> 15 atoms in block 122 Block first atom: 1903 Blocpdb> 16 atoms in block 123 Block first atom: 1918 Blocpdb> 15 atoms in block 124 Block first atom: 1934 Blocpdb> 16 atoms in block 125 Block first atom: 1949 Blocpdb> 10 atoms in block 126 Block first atom: 1965 Blocpdb> 17 atoms in block 127 Block first atom: 1975 Blocpdb> 17 atoms in block 128 Block first atom: 1992 Blocpdb> 15 atoms in block 129 Block first atom: 2009 Blocpdb> 16 atoms in block 130 Block first atom: 2024 Blocpdb> 19 atoms in block 131 Block first atom: 2040 Blocpdb> 18 atoms in block 132 Block first atom: 2059 Blocpdb> 15 atoms in block 133 Block first atom: 2077 Blocpdb> 23 atoms in block 134 Block first atom: 2092 Blocpdb> 13 atoms in block 135 Block first atom: 2115 Blocpdb> 14 atoms in block 136 Block first atom: 2128 Blocpdb> 15 atoms in block 137 Block first atom: 2142 Blocpdb> 18 atoms in block 138 Block first atom: 2157 Blocpdb> 20 atoms in block 139 Block first atom: 2175 Blocpdb> 17 atoms in block 140 Block first atom: 2195 Blocpdb> 19 atoms in block 141 Block first atom: 2212 Blocpdb> 15 atoms in block 142 Block first atom: 2231 Blocpdb> 19 atoms in block 143 Block first atom: 2246 Blocpdb> 17 atoms in block 144 Block first atom: 2265 Blocpdb> 18 atoms in block 145 Block first atom: 2282 Blocpdb> 21 atoms in block 146 Block first atom: 2300 Blocpdb> 16 atoms in block 147 Block first atom: 2321 Blocpdb> 13 atoms in block 148 Block first atom: 2337 Blocpdb> 15 atoms in block 149 Block first atom: 2350 Blocpdb> 13 atoms in block 150 Block first atom: 2365 Blocpdb> 12 atoms in block 151 Block first atom: 2378 Blocpdb> 15 atoms in block 152 Block first atom: 2390 Blocpdb> 15 atoms in block 153 Block first atom: 2405 Blocpdb> 17 atoms in block 154 Block first atom: 2420 Blocpdb> 12 atoms in block 155 Block first atom: 2437 Blocpdb> 13 atoms in block 156 Block first atom: 2449 Blocpdb> 14 atoms in block 157 Block first atom: 2462 Blocpdb> 12 atoms in block 158 Block first atom: 2476 Blocpdb> 12 atoms in block 159 Block first atom: 2488 Blocpdb> 14 atoms in block 160 Block first atom: 2500 Blocpdb> 14 atoms in block 161 Block first atom: 2514 Blocpdb> 17 atoms in block 162 Block first atom: 2528 Blocpdb> 15 atoms in block 163 Block first atom: 2545 Blocpdb> 12 atoms in block 164 Block first atom: 2560 Blocpdb> 15 atoms in block 165 Block first atom: 2572 Blocpdb> 15 atoms in block 166 Block first atom: 2587 Blocpdb> 14 atoms in block 167 Block first atom: 2602 Blocpdb> 16 atoms in block 168 Block first atom: 2616 Blocpdb> 14 atoms in block 169 Block first atom: 2632 Blocpdb> 15 atoms in block 170 Block first atom: 2646 Blocpdb> 16 atoms in block 171 Block first atom: 2661 Blocpdb> 11 atoms in block 172 Block first atom: 2677 Blocpdb> 11 atoms in block 173 Block first atom: 2688 Blocpdb> 14 atoms in block 174 Block first atom: 2699 Blocpdb> 11 atoms in block 175 Block first atom: 2713 Blocpdb> 13 atoms in block 176 Block first atom: 2724 Blocpdb> 11 atoms in block 177 Block first atom: 2737 Blocpdb> 13 atoms in block 178 Block first atom: 2748 Blocpdb> 18 atoms in block 179 Block first atom: 2761 Blocpdb> 22 atoms in block 180 Block first atom: 2779 Blocpdb> 13 atoms in block 181 Block first atom: 2801 Blocpdb> 17 atoms in block 182 Block first atom: 2814 Blocpdb> 19 atoms in block 183 Block first atom: 2831 Blocpdb> 17 atoms in block 184 Block first atom: 2850 Blocpdb> 17 atoms in block 185 Block first atom: 2867 Blocpdb> 18 atoms in block 186 Block first atom: 2884 Blocpdb> 12 atoms in block 187 Block first atom: 2902 Blocpdb> 13 atoms in block 188 Block first atom: 2914 Blocpdb> 15 atoms in block 189 Block first atom: 2927 Blocpdb> 22 atoms in block 190 Block first atom: 2942 Blocpdb> 15 atoms in block 191 Block first atom: 2964 Blocpdb> 13 atoms in block 192 Block first atom: 2979 Blocpdb> 14 atoms in block 193 Block first atom: 2991 Blocpdb> 193 blocks. Blocpdb> At most, 23 atoms in each of them. Blocpdb> At least, 9 atoms in each of them. Blocpdb> Normal end of Blocpdb. Diagrtb> Memory allocation for Prepmat. Diagrtb> Memory allocation for RTB. Diagrtb> Memory allocation for Diagstd. Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes. Prepmat> Entering in. Prepmat> Rewriting of the matrix begins. Prepmat> 1142862 matrix lines read. Prepmat> Matrix order = 9015 Prepmat> Matrix trace = 2499620.0000 Prepmat> Last element read: 9015 9015 191.9798 Prepmat> 18722 lines saved. Prepmat> 16490 empty lines. Prepmat> Number of lines on output is as expected. Prepmat> Normal end of Prepmat. RTB> Entering in. RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 3005 RTB> Total mass = 3005.0000 RTB> Number of atoms found in matrix: 3005 RTB> Number of blocks = 193 RTB> Projection begins. RTB> Projected matrix is being saved. RTB> Projected matrix trace = 272490.3150 RTB> 77421 non-zero elements. RTB> Normal end of RTB. Diagstd> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.sdijb Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb Diagstd> CERFACS matrix format. Diagstd> Projected matrix order = 1158 Diagstd> Nb of non-zero elements: 77421 Diagstd> Projected matrix trace = 272490.3150 Openam> file on opening on unit 11: diagrtb_work.eigenfacs Diagstd> Diagonalization. Diagstd> 1158 eigenvectors are computed. Diagstd> 106 of them to be saved. Diagstd> Sum of eigenvalues = 272490.3150 Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000 Diagstd> Selected eigenvalues: 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 2.3295534 2.5824475 3.3454933 6.2493141 7.0822307 7.7623580 8.2835240 8.7506370 9.4403853 10.1588578 10.7383337 12.9718389 13.3249380 13.9035591 14.4809489 15.4138473 16.7544813 17.0463801 18.2114880 18.4021656 19.0167510 19.4306046 20.0960293 21.0161534 21.5024630 22.1975348 22.7697327 23.1391644 23.9729997 24.6282370 25.5531398 25.9703738 27.2262973 27.6196259 28.0324470 28.7502216 29.4036114 29.5561138 29.7808002 30.6856438 31.5661994 31.7606952 32.5958794 33.3995849 34.2643643 34.8383229 35.4592714 36.1078306 36.9416673 37.7012985 38.1309687 38.3741530 39.2271099 40.0208381 41.0067142 41.3141901 41.5516395 41.8295265 42.3373904 43.1006481 43.6518458 44.3047286 45.1188718 45.9284009 46.5154980 47.7826295 47.8877623 48.1472404 48.9209992 50.2502223 50.4445117 51.2800660 51.8945641 51.9772462 52.5870667 53.0880151 53.7268905 53.9969888 54.7434992 54.8539709 55.7193733 55.8709528 57.1444851 57.5316367 58.1994563 58.4488379 59.0133582 59.5741809 59.8081473 60.9055351 61.7915466 61.8870888 62.1157045 62.5434969 63.0943286 63.5368366 64.1011519 65.0754240 65.5546142 66.2267657 Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units): 0.0034327 0.0034330 0.0034339 0.0034342 0.0034352 0.0034356 165.7416340 174.5062690 198.6210894 271.4635072 288.9883372 302.5464878 312.5380145 321.2292733 333.6492396 346.1128471 355.8473429 391.1074187 396.3947360 404.9097870 413.2318530 426.3348226 444.4887505 448.3440020 463.4127685 465.8324604 473.5473817 478.6724562 486.7998192 497.8194895 503.5462712 511.6201644 518.1723632 522.3590417 531.6875246 538.9046640 548.9305682 553.3939167 566.6169628 570.6951429 574.9443162 582.2585549 588.8377132 590.3627478 592.6024758 601.5377681 610.1075899 611.9842992 619.9785037 627.5752605 635.6479050 640.9496288 646.6364535 652.5232317 660.0145762 666.7659822 670.5546828 672.6895509 680.1245264 686.9709462 695.3809135 697.9830917 699.9860137 702.3227789 706.5734641 712.9140611 717.4581719 722.8036228 729.4145063 735.9290431 740.6177521 750.6375800 751.4629135 753.4960504 759.5265153 769.7758357 771.2625456 777.6238424 782.2691700 782.8921049 787.4713343 791.2132003 795.9597981 797.9580330 803.4549991 804.2652717 810.5846808 811.6864934 820.8852309 823.6612698 828.4279523 830.2009397 834.2004984 838.1549614 839.7991970 847.4686895 853.6106267 854.2702988 855.8467148 858.7887767 862.5622393 865.5817167 869.4171392 875.9993492 879.2186935 883.7146473 Diagstd> Normal end. Rtb_to_modes> Entering in. Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 3005 Rtb_to_modes> Number of blocs = 193 Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.eigenfacs Openam> file on opening on unit 11: matrix.eigenrtb Rdmodfacs> Entering in. Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Eigenvector number: 1 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9928E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 2 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9942E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 3 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9998E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 4 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0001E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 5 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0007E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 6 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0009E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 7 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.330 Rdmodfacs> Eigenvector number: 8 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.582 Rdmodfacs> Eigenvector number: 9 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.345 Rdmodfacs> Eigenvector number: 10 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.249 Rdmodfacs> Eigenvector number: 11 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.082 Rdmodfacs> Eigenvector number: 12 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.762 Rdmodfacs> Eigenvector number: 13 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.284 Rdmodfacs> Eigenvector number: 14 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.751 Rdmodfacs> Eigenvector number: 15 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.440 Rdmodfacs> Eigenvector number: 16 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.16 Rdmodfacs> Eigenvector number: 17 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.74 Rdmodfacs> Eigenvector number: 18 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.97 Rdmodfacs> Eigenvector number: 19 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.32 Rdmodfacs> Eigenvector number: 20 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.90 Rdmodfacs> Eigenvector number: 21 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.48 Rdmodfacs> Eigenvector number: 22 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.41 Rdmodfacs> Eigenvector number: 23 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.75 Rdmodfacs> Eigenvector number: 24 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.05 Rdmodfacs> Eigenvector number: 25 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.21 Rdmodfacs> Eigenvector number: 26 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.40 Rdmodfacs> Eigenvector number: 27 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 28 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.43 Rdmodfacs> Eigenvector number: 29 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 30 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 31 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.50 Rdmodfacs> Eigenvector number: 32 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.20 Rdmodfacs> Eigenvector number: 33 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.77 Rdmodfacs> Eigenvector number: 34 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.14 Rdmodfacs> Eigenvector number: 35 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.97 Rdmodfacs> Eigenvector number: 36 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.63 Rdmodfacs> Eigenvector number: 37 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.55 Rdmodfacs> Eigenvector number: 38 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.97 Rdmodfacs> Eigenvector number: 39 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.23 Rdmodfacs> Eigenvector number: 40 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.62 Rdmodfacs> Eigenvector number: 41 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.03 Rdmodfacs> Eigenvector number: 42 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.75 Rdmodfacs> Eigenvector number: 43 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.40 Rdmodfacs> Eigenvector number: 44 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.56 Rdmodfacs> Eigenvector number: 45 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.78 Rdmodfacs> Eigenvector number: 46 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.69 Rdmodfacs> Eigenvector number: 47 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.57 Rdmodfacs> Eigenvector number: 48 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.76 Rdmodfacs> Eigenvector number: 49 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.60 Rdmodfacs> Eigenvector number: 50 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.40 Rdmodfacs> Eigenvector number: 51 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.26 Rdmodfacs> Eigenvector number: 52 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.84 Rdmodfacs> Eigenvector number: 53 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.46 Rdmodfacs> Eigenvector number: 54 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.11 Rdmodfacs> Eigenvector number: 55 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.94 Rdmodfacs> Eigenvector number: 56 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.70 Rdmodfacs> Eigenvector number: 57 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.13 Rdmodfacs> Eigenvector number: 58 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.37 Rdmodfacs> Eigenvector number: 59 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.23 Rdmodfacs> Eigenvector number: 60 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 61 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.01 Rdmodfacs> Eigenvector number: 62 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.31 Rdmodfacs> Eigenvector number: 63 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.55 Rdmodfacs> Eigenvector number: 64 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.83 Rdmodfacs> Eigenvector number: 65 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.34 Rdmodfacs> Eigenvector number: 66 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 67 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.65 Rdmodfacs> Eigenvector number: 68 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.30 Rdmodfacs> Eigenvector number: 69 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.12 Rdmodfacs> Eigenvector number: 70 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.93 Rdmodfacs> Eigenvector number: 71 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.52 Rdmodfacs> Eigenvector number: 72 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 47.78 Rdmodfacs> Eigenvector number: 73 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 47.89 Rdmodfacs> Eigenvector number: 74 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 48.15 Rdmodfacs> Eigenvector number: 75 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 48.92 Rdmodfacs> Eigenvector number: 76 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 50.25 Rdmodfacs> Eigenvector number: 77 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 50.44 Rdmodfacs> Eigenvector number: 78 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 51.28 Rdmodfacs> Eigenvector number: 79 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 51.89 Rdmodfacs> Eigenvector number: 80 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 51.98 Rdmodfacs> Eigenvector number: 81 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 52.59 Rdmodfacs> Eigenvector number: 82 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 53.09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 83 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 53.73 Rdmodfacs> Eigenvector number: 84 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 54.00 Rdmodfacs> Eigenvector number: 85 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 54.74 Rdmodfacs> Eigenvector number: 86 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 54.85 Rdmodfacs> Eigenvector number: 87 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 55.72 Rdmodfacs> Eigenvector number: 88 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 55.87 Rdmodfacs> Eigenvector number: 89 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 57.14 Rdmodfacs> Eigenvector number: 90 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 57.53 Rdmodfacs> Eigenvector number: 91 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 58.20 Rdmodfacs> Eigenvector number: 92 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 58.45 Rdmodfacs> Eigenvector number: 93 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 59.01 Rdmodfacs> Eigenvector number: 94 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 59.57 Rdmodfacs> Eigenvector number: 95 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 59.81 Rdmodfacs> Eigenvector number: 96 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 60.91 Rdmodfacs> Eigenvector number: 97 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 61.79 Rdmodfacs> Eigenvector number: 98 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 61.89 Rdmodfacs> Eigenvector number: 99 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 62.12 Rdmodfacs> Eigenvector number: 100 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 62.54 Rdmodfacs> Eigenvector number: 101 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 63.09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 102 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 63.54 Rdmodfacs> Eigenvector number: 103 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 64.10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 104 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 65.08 Rdmodfacs> Eigenvector number: 105 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 65.55 Rdmodfacs> Eigenvector number: 106 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 66.23 Rtb_to_modes> 106 vectors, with 1158 coordinates in vector file. Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected): 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00001 1.00000 1.00001 0.99999 1.00000 1.00001 1.00000 1.00000 1.00002 1.00000 1.00000 1.00000 1.00002 0.99998 1.00000 0.99999 0.99998 1.00002 0.99999 1.00001 0.99997 1.00000 1.00000 1.00002 0.99999 0.99997 0.99999 1.00001 0.99999 1.00000 1.00001 1.00001 1.00000 0.99999 1.00000 0.99998 0.99999 0.99998 1.00000 0.99999 1.00000 1.00000 0.99999 0.99999 0.99999 1.00001 0.99999 1.00004 1.00000 1.00003 1.00000 1.00000 0.99999 0.99999 1.00000 0.99999 1.00000 1.00001 1.00001 1.00000 0.99999 1.00000 1.00001 0.99999 0.99999 0.99999 0.99998 1.00000 1.00000 0.99997 1.00001 1.00001 0.99998 1.00000 1.00002 1.00000 1.00000 1.00004 1.00002 0.99998 0.99998 1.00000 1.00001 1.00001 1.00002 1.00000 1.00003 1.00001 1.00000 0.99998 0.99998 1.00001 1.00000 0.99999 1.00001 1.00001 1.00000 1.00001 1.00001 0.99999 Rtb_to_modes> RTB block-file is being read. Rtb_to_modes> 54090 lines found in RTB file. Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected): 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00001 1.00000 1.00001 0.99999 1.00000 1.00001 1.00000 1.00000 1.00002 1.00000 1.00000 1.00000 1.00002 0.99998 1.00000 0.99999 0.99998 1.00002 0.99999 1.00001 0.99997 1.00000 1.00000 1.00002 0.99999 0.99997 0.99999 1.00001 0.99999 1.00000 1.00001 1.00001 1.00000 0.99999 1.00000 0.99998 0.99999 0.99998 1.00000 0.99999 1.00000 1.00000 0.99999 0.99999 0.99999 1.00001 0.99999 1.00004 1.00000 1.00003 1.00000 1.00000 0.99999 0.99999 1.00000 0.99999 1.00000 1.00001 1.00001 1.00000 0.99999 1.00000 1.00001 0.99999 0.99999 0.99999 0.99998 1.00000 1.00000 0.99997 1.00001 1.00001 0.99998 1.00000 1.00002 1.00000 1.00000 1.00004 1.00002 0.99998 0.99998 1.00000 1.00001 1.00001 1.00002 1.00000 1.00003 1.00001 1.00000 0.99998 0.99998 1.00001 1.00000 0.99999 1.00001 1.00001 1.00000 1.00001 1.00001 0.99999 Orthogonality of first eigenvectors (zero expected): Vector 2: 0.000 Vector 3: 0.000-0.000 Vector 4: 0.000 0.000 0.000 Vector 5:-0.000-0.000-0.000 0.000 Vector 6:-0.000 0.000 0.000 0.000-0.000 Vector 7: 0.000 0.000-0.000 0.000 0.000 0.000 Vector 8: 0.000 0.000-0.000-0.000-0.000 0.000-0.000 Vector 9:-0.000 0.000-0.000-0.000-0.000 0.000-0.000 0.000 Vector 10:-0.000 0.000 0.000-0.000 0.000-0.000 0.000-0.000-0.000 Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved. Rtb_to_modes> Normal end. Diagrtb> Normal end. B-factor analysis Bfactors> Version 1.22, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 2603091745531625378.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 2603091745531625378.eigenfacs Getnam> Corresponding pdb filename ? Getnam> 2603091745531625378.atom Openam> file on opening on unit 11: 2603091745531625378.atom Getnum> Number of skipped eigenvectors ? Getnum> 0 Getnum> Number of usefull eigenvectors ? Getnum> 10000 %Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 386 First residue number = 1 Last residue number = 386 Number of atoms found = 3005 Mean number per residue = 7.8 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9928E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9942E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9998E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0001E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0007E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0009E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.330 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.582 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.345 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.249 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.082 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.762 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.284 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.751 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.440 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.16 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.74 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.97 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.32 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.90 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.48 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.41 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.75 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.05 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.21 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.40 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.43 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.50 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.20 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.77 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.14 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.97 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.63 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.55 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.97 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.23 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.62 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.75 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.40 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.56 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.78 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.69 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.57 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.76 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.60 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.40 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.26 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.84 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.46 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.11 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.94 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.70 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.13 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.37 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.23 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.01 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.31 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.55 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.83 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.34 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.65 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.30 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.12 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.93 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.52 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.78 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.89 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.15 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.92 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 50.25 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 50.44 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 51.28 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 51.89 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 51.98 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 52.59 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 53.09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 53.73 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 54.00 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 54.74 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 54.85 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 55.72 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 55.87 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 57.14 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 57.53 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 58.20 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 58.45 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 59.01 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 59.57 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 59.81 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 60.91 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 61.79 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 61.89 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 62.12 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 62.54 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 63.09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 63.54 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 64.10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 65.08 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 65.55 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 66.23 Bfactors> 106 vectors, 9015 coordinates in file. Openam> file on opening on unit 12: bfactors.pred Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000 Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 2.330000 Bfactors> 100 eigenvectors will be considered. Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped. Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed. (CHARMM units assumed for eigenvalues) Bfactors> Correlation= -0.612 for 386 C-alpha atoms. Bfactors> = 0.022 +/- 0.02 Bfactors> = 92.096 +/- 10.98 Bfactors> Shiftng-fct= 92.074 Bfactors> Scaling-fct= 476.601 Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved. Bfactors> Normal end. check_modes Chkmod> Version 1.00, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 2603091745531625378.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 2603091745531625378.eigenfacs Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4326E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4328E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4338E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4340E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4350E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4354E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 165.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 174.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 198.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 271.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 289.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 302.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 312.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 321.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 333.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 346.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 355.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 391.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 396.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 404.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 413.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 426.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 444.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 448.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 463.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 465.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 473.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 478.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 486.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 497.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 503.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 511.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 518.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 522.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 531.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 538.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 548.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 553.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 566.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 570.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 574.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 582.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 588.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 590.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 592.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 601.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 610.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 612.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 620.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 627.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 635.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 640.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 646.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 652.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 660.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 666.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 670.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 672.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 680.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 686.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 695.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 697.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 699.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 702.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 706.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 712.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 717.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 722.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 729.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 735.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 740.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 750.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 751.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 753.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 759.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 769.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 771.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 777.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 782.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 782.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 787.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 791.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 795.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 797.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 803.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 804.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 810.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 811.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 820.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 823.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 828.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 830.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 834.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 838.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 839.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 847.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 853.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 854.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 855.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 858.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 862.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 865.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 869.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 876.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 879.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 883.7 Chkmod> 106 vectors, 9015 coordinates in file. Chkmod> That is: 3005 cartesian points. Openam> file on opening on unit 11: Chkmod.res Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file. Chkmod> Normal end. 0.0034 0.7905 0.0034 0.7217 0.0034 0.7489 0.0034 0.8717 0.0034 0.6943 0.0034 0.9370 165.7504 0.6195 174.4837 0.5800 198.5979 0.6601 271.4450 0.3711 288.9712 0.2750 302.5265 0.2123 312.5336 0.2145 321.2221 0.1086 333.6281 0.5153 346.1174 0.3510 355.8597 0.3311 391.0629 0.3608 396.3043 0.3928 404.8406 0.3222 413.2006 0.1665 426.2633 0.5120 444.4102 0.5845 448.3724 0.3242 463.3739 0.3634 465.7851 0.1801 473.5675 0.0815 478.6445 0.4628 486.8270 0.1711 497.8437 0.2971 503.4958 0.4786 511.6266 0.4302 518.1532 0.3391 522.3460 0.4255 531.6314 0.5433 538.9008 0.4957 548.8733 0.5723 553.3662 0.2716 566.6312 0.3542 570.6745 0.4944 574.8945 0.5410 582.2313 0.3978 588.7763 0.5458 590.3762 0.4696 592.5691 0.4868 601.5546 0.1915 610.1181 0.2099 611.9513 0.3372 619.9911 0.3374 627.5522 0.4743 635.5801 0.3661 640.9375 0.3182 646.6153 0.3382 652.5148 0.2648 659.9713 0.3807 666.7259 0.3480 670.5174 0.4278 672.6243 0.1256 680.1204 0.4656 686.9343 0.3669 695.3789 0.3822 697.9177 0.6013 699.9422 0.5078 702.2966 0.4859 706.5649 0.4341 712.8781 0.3448 717.4122 0.2858 722.7340 0.4151 729.3923 0.3912 735.9103 0.3992 740.6218 0.4862 750.5847 0.4993 751.4482 0.4546 753.4853 0.4567 759.4862 0.4837 769.7411 0.4565 771.1949 0.3549 777.5900 0.4687 782.2012 0.3997 782.8792 0.4611 787.4595 0.4951 791.1940 0.4584 795.9487 0.4546 797.9460 0.4868 803.3948 0.3196 804.2016 0.4673 810.5544 0.3208 811.6447 0.4417 820.8178 0.4193 823.6142 0.4786 828.3963 0.4669 830.1736 0.5401 834.1410 0.2561 838.0896 0.4592 839.7762 0.4485 847.4634 0.4960 853.5633 0.5319 854.2537 0.4190 855.8396 0.3121 858.7279 0.4172 862.4956 0.4604 865.5661 0.3130 869.3720 0.4154 875.9925 0.4336 879.1500 0.4457 883.6983 0.3022 getting mode 7 running: ../../bin/get_modes.sh 2603091745531625378 7 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 7 calculating perturbed structure for DQ=-100 2603091745531625378.eigenfacs 2603091745531625378.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2603091745531625378.eigenfacs 2603091745531625378.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2603091745531625378.eigenfacs 2603091745531625378.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2603091745531625378.eigenfacs 2603091745531625378.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2603091745531625378.eigenfacs 2603091745531625378.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2603091745531625378.eigenfacs 2603091745531625378.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2603091745531625378.eigenfacs 2603091745531625378.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2603091745531625378.eigenfacs 2603091745531625378.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2603091745531625378.eigenfacs 2603091745531625378.atom calculating perturbed structure for DQ=80 2603091745531625378.eigenfacs 2603091745531625378.atom calculating perturbed structure for DQ=100 2603091745531625378.eigenfacs 2603091745531625378.atom making animated gifs 11 models are in 2603091745531625378.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2603091745531625378.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2603091745531625378.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 8 running: ../../bin/get_modes.sh 2603091745531625378 8 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 8 calculating perturbed structure for DQ=-100 2603091745531625378.eigenfacs 2603091745531625378.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2603091745531625378.eigenfacs 2603091745531625378.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2603091745531625378.eigenfacs 2603091745531625378.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2603091745531625378.eigenfacs 2603091745531625378.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2603091745531625378.eigenfacs 2603091745531625378.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2603091745531625378.eigenfacs 2603091745531625378.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2603091745531625378.eigenfacs 2603091745531625378.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2603091745531625378.eigenfacs 2603091745531625378.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2603091745531625378.eigenfacs 2603091745531625378.atom calculating perturbed structure for DQ=80 2603091745531625378.eigenfacs 2603091745531625378.atom calculating perturbed structure for DQ=100 2603091745531625378.eigenfacs 2603091745531625378.atom making animated gifs 11 models are in 2603091745531625378.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2603091745531625378.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2603091745531625378.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 9 running: ../../bin/get_modes.sh 2603091745531625378 9 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 9 calculating perturbed structure for DQ=-100 2603091745531625378.eigenfacs 2603091745531625378.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2603091745531625378.eigenfacs 2603091745531625378.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2603091745531625378.eigenfacs 2603091745531625378.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2603091745531625378.eigenfacs 2603091745531625378.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2603091745531625378.eigenfacs 2603091745531625378.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2603091745531625378.eigenfacs 2603091745531625378.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2603091745531625378.eigenfacs 2603091745531625378.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2603091745531625378.eigenfacs 2603091745531625378.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2603091745531625378.eigenfacs 2603091745531625378.atom calculating perturbed structure for DQ=80 2603091745531625378.eigenfacs 2603091745531625378.atom calculating perturbed structure for DQ=100 2603091745531625378.eigenfacs 2603091745531625378.atom making animated gifs 11 models are in 2603091745531625378.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2603091745531625378.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2603091745531625378.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 10 running: ../../bin/get_modes.sh 2603091745531625378 10 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 10 calculating perturbed structure for DQ=-100 2603091745531625378.eigenfacs 2603091745531625378.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2603091745531625378.eigenfacs 2603091745531625378.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2603091745531625378.eigenfacs 2603091745531625378.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2603091745531625378.eigenfacs 2603091745531625378.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2603091745531625378.eigenfacs 2603091745531625378.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2603091745531625378.eigenfacs 2603091745531625378.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2603091745531625378.eigenfacs 2603091745531625378.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2603091745531625378.eigenfacs 2603091745531625378.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2603091745531625378.eigenfacs 2603091745531625378.atom calculating perturbed structure for DQ=80 2603091745531625378.eigenfacs 2603091745531625378.atom calculating perturbed structure for DQ=100 2603091745531625378.eigenfacs 2603091745531625378.atom making animated gifs 11 models are in 2603091745531625378.10.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2603091745531625378.10.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2603091745531625378.10.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 11 running: ../../bin/get_modes.sh 2603091745531625378 11 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 11 calculating perturbed structure for DQ=-100 2603091745531625378.eigenfacs 2603091745531625378.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2603091745531625378.eigenfacs 2603091745531625378.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2603091745531625378.eigenfacs 2603091745531625378.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2603091745531625378.eigenfacs 2603091745531625378.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2603091745531625378.eigenfacs 2603091745531625378.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2603091745531625378.eigenfacs 2603091745531625378.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2603091745531625378.eigenfacs 2603091745531625378.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2603091745531625378.eigenfacs 2603091745531625378.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2603091745531625378.eigenfacs 2603091745531625378.atom calculating perturbed structure for DQ=80 2603091745531625378.eigenfacs 2603091745531625378.atom calculating perturbed structure for DQ=100 2603091745531625378.eigenfacs 2603091745531625378.atom making animated gifs 11 models are in 2603091745531625378.11.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2603091745531625378.11.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2603091745531625378.11.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 2603091745531625378.10.pdb 2603091745531625378.11.pdb 2603091745531625378.7.pdb 2603091745531625378.8.pdb 2603091745531625378.9.pdb STDERR: Note: The following floating-point exceptions are signalling: IEEE_DENORMAL real 0m22.106s user 0m22.015s sys 0m0.085s rm: cannot remove '2603091745531625378.sdijf': No such file or directory pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format




If you find results from this site helpful for your research, please cite one of our papers:

elNémo is maintained by Yves-Henri Sanejouand.
It was developed by Karsten Suhre.
Between 2003 and 2014, it was hosted by IGS (Marseille).
Between 2015 and 2025, it was hosted by US2B (Nantes).
Last modification: december 26th, 2025.