CNRS Nantes University US2B US2B
home |  start a new run |  job status |  references&downloads |  examples |  help  

Should you encounter any unexpected behaviour,
please let us know.
elNémo has been hacked on november 27th.
It has been moved away and runs again.
**Still some additional cleaning from time to time**
Sorry for the inconvenience.


***    ***

LOGs for ID: 2603101928371809608

Output from eigenvector calculation:


STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8) Build Tirion matrix: Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model. Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004. Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file. Pdbmat> Coordinate filename = 2603101928371809608.atom Pdbmat> Distance cutoff = 8.00 Force constant = 10.00 Origin of mass values = CONS Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09 PRINTing level = 2 Pdbmat> Coordinate file 2603101928371809608.atom to be opened. Openam> File opened: 2603101928371809608.atom Pdbmat> Coordinate file in PDB format. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 292 First residue number = 355 Last residue number = 1 Number of atoms found = 4688 Mean number per residue = 16.1 Pdbmat> Coordinate statistics: = 133.738708 +/- 10.277764 From: 109.082000 To: 160.250000 = 137.329754 +/- 9.338857 From: 114.626000 To: 160.223000 = 135.485190 +/- 15.418861 From: 100.862000 To: 166.234000 Pdbmat> Masses are all set to one. %Pdbmat-W> residue:'UNL ' is not a well known amino-acid. %Pdbmat-W> 1 residue(s) not known. Openam> File opened: pdbmat.xyzm Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved. Openam> File opened: pdbmat.sdijb Pdbmat> Matrix statistics: Pdbmat> The matrix is 3.3345 % Filled. Pdbmat> 3298010 non-zero elements. Pdbmat> 363388 atom-atom interactions. Pdbmat> Number per atom= 155.03 +/- 44.47 Maximum number = 242 Minimum number = 28 Pdbmat> Matrix trace = 7.267760E+06 Pdbmat> Larger element = 920.372 Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10 Pdbmat> Normal end. automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1) 292 non-zero elements, NRBL set to 2 Diagonalize Tirion matrix using diagrtb Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation. Diagrtb> Version 2.52, November 2004. Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file. Diagrtb> Options taken into account: MATRix filename = pdbmat.sdijb COORdinates filename = 2603101928371809608.atom Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb Nb of VECTors required = 106 EigeNVALues chosen = LOWE Type of SUBStructuring = NONE Nb of residues per BLOck = 2 Origin of MASS values = CONS MATRix FORMat = BINA Temporary files cleaning = ALL Output PRINting level = 2 Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb. Blocpdb> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.xyzm Blocpdb> Coordinate file 2603101928371809608.atom to be opened. Openam> file on opening on unit 11: 2603101928371809608.atom Blocpdb> Coordinate file in PDB format. Blocpdb> 4688 atoms picked in pdb file. Blocpdb> All masses set to unity. Blocpdb> Coordinate file is rewritten. Blocpdb> Substructuring: Blocpdb> 2 residue(s) per block. Blocpdb> 292 residues. Blocpdb> 27 atoms in block 1 Block first atom: 1 Blocpdb> 27 atoms in block 2 Block first atom: 28 Blocpdb> 36 atoms in block 3 Block first atom: 55 Blocpdb> 28 atoms in block 4 Block first atom: 91 Blocpdb> 33 atoms in block 5 Block first atom: 119 Blocpdb> 43 atoms in block 6 Block first atom: 152 Blocpdb> 35 atoms in block 7 Block first atom: 195 Blocpdb> 43 atoms in block 8 Block first atom: 230 Blocpdb> 39 atoms in block 9 Block first atom: 273 Blocpdb> 30 atoms in block 10 Block first atom: 312 Blocpdb> 29 atoms in block 11 Block first atom: 342 Blocpdb> 33 atoms in block 12 Block first atom: 371 Blocpdb> 21 atoms in block 13 Block first atom: 404 Blocpdb> 38 atoms in block 14 Block first atom: 425 Blocpdb> 35 atoms in block 15 Block first atom: 463 Blocpdb> 35 atoms in block 16 Block first atom: 498 Blocpdb> 33 atoms in block 17 Block first atom: 533 Blocpdb> 25 atoms in block 18 Block first atom: 566 Blocpdb> 38 atoms in block 19 Block first atom: 591 Blocpdb> 41 atoms in block 20 Block first atom: 629 Blocpdb> 30 atoms in block 21 Block first atom: 670 Blocpdb> 38 atoms in block 22 Block first atom: 700 Blocpdb> 39 atoms in block 23 Block first atom: 738 Blocpdb> 28 atoms in block 24 Block first atom: 777 Blocpdb> 33 atoms in block 25 Block first atom: 805 Blocpdb> 30 atoms in block 26 Block first atom: 838 Blocpdb> 23 atoms in block 27 Block first atom: 868 Blocpdb> 30 atoms in block 28 Block first atom: 891 Blocpdb> 26 atoms in block 29 Block first atom: 921 Blocpdb> 40 atoms in block 30 Block first atom: 947 Blocpdb> 38 atoms in block 31 Block first atom: 987 Blocpdb> 38 atoms in block 32 Block first atom: 1025 Blocpdb> 21 atoms in block 33 Block first atom: 1063 Blocpdb> 28 atoms in block 34 Block first atom: 1084 Blocpdb> 36 atoms in block 35 Block first atom: 1112 Blocpdb> 36 atoms in block 36 Block first atom: 1148 Blocpdb> 28 atoms in block 37 Block first atom: 1184 Blocpdb> 38 atoms in block 38 Block first atom: 1212 Blocpdb> 35 atoms in block 39 Block first atom: 1250 Blocpdb> 29 atoms in block 40 Block first atom: 1285 Blocpdb> 36 atoms in block 41 Block first atom: 1314 Blocpdb> 31 atoms in block 42 Block first atom: 1350 Blocpdb> 17 atoms in block 43 Block first atom: 1381 Blocpdb> 17 atoms in block 44 Block first atom: 1398 Blocpdb> 22 atoms in block 45 Block first atom: 1415 Blocpdb> 17 atoms in block 46 Block first atom: 1437 Blocpdb> 40 atoms in block 47 Block first atom: 1454 Blocpdb> 30 atoms in block 48 Block first atom: 1494 Blocpdb> 30 atoms in block 49 Block first atom: 1524 Blocpdb> 27 atoms in block 50 Block first atom: 1554 Blocpdb> 30 atoms in block 51 Block first atom: 1581 Blocpdb> 37 atoms in block 52 Block first atom: 1611 Blocpdb> 33 atoms in block 53 Block first atom: 1648 Blocpdb> 24 atoms in block 54 Block first atom: 1681 Blocpdb> 33 atoms in block 55 Block first atom: 1705 Blocpdb> 34 atoms in block 56 Block first atom: 1738 Blocpdb> 48 atoms in block 57 Block first atom: 1772 Blocpdb> 31 atoms in block 58 Block first atom: 1820 Blocpdb> 33 atoms in block 59 Block first atom: 1851 Blocpdb> 27 atoms in block 60 Block first atom: 1884 Blocpdb> 34 atoms in block 61 Block first atom: 1911 Blocpdb> 31 atoms in block 62 Block first atom: 1945 Blocpdb> 33 atoms in block 63 Block first atom: 1976 Blocpdb> 33 atoms in block 64 Block first atom: 2009 Blocpdb> 43 atoms in block 65 Block first atom: 2042 Blocpdb> 27 atoms in block 66 Block first atom: 2085 Blocpdb> 21 atoms in block 67 Block first atom: 2112 Blocpdb> 33 atoms in block 68 Block first atom: 2133 Blocpdb> 33 atoms in block 69 Block first atom: 2166 Blocpdb> 31 atoms in block 70 Block first atom: 2199 Blocpdb> 39 atoms in block 71 Block first atom: 2230 Blocpdb> 30 atoms in block 72 Block first atom: 2269 Blocpdb> 20 atoms in block 73 Block first atom: 2299 Blocpdb> 29 atoms in block 74 Block first atom: 2319 Blocpdb> 34 atoms in block 75 Block first atom: 2348 Blocpdb> 39 atoms in block 76 Block first atom: 2382 Blocpdb> 26 atoms in block 77 Block first atom: 2421 Blocpdb> 22 atoms in block 78 Block first atom: 2447 Blocpdb> 38 atoms in block 79 Block first atom: 2469 Blocpdb> 38 atoms in block 80 Block first atom: 2507 Blocpdb> 30 atoms in block 81 Block first atom: 2545 Blocpdb> 29 atoms in block 82 Block first atom: 2575 Blocpdb> 31 atoms in block 83 Block first atom: 2604 Blocpdb> 31 atoms in block 84 Block first atom: 2635 Blocpdb> 23 atoms in block 85 Block first atom: 2666 Blocpdb> 33 atoms in block 86 Block first atom: 2689 Blocpdb> 28 atoms in block 87 Block first atom: 2722 Blocpdb> 40 atoms in block 88 Block first atom: 2750 Blocpdb> 33 atoms in block 89 Block first atom: 2790 Blocpdb> 30 atoms in block 90 Block first atom: 2823 Blocpdb> 35 atoms in block 91 Block first atom: 2853 Blocpdb> 33 atoms in block 92 Block first atom: 2888 Blocpdb> 35 atoms in block 93 Block first atom: 2921 Blocpdb> 30 atoms in block 94 Block first atom: 2956 Blocpdb> 32 atoms in block 95 Block first atom: 2986 Blocpdb> 30 atoms in block 96 Block first atom: 3018 Blocpdb> 18 atoms in block 97 Block first atom: 3048 Blocpdb> 40 atoms in block 98 Block first atom: 3066 Blocpdb> 36 atoms in block 99 Block first atom: 3106 Blocpdb> 40 atoms in block 100 Block first atom: 3142 Blocpdb> 30 atoms in block 101 Block first atom: 3182 Blocpdb> 38 atoms in block 102 Block first atom: 3212 Blocpdb> 28 atoms in block 103 Block first atom: 3250 Blocpdb> 35 atoms in block 104 Block first atom: 3278 Blocpdb> 22 atoms in block 105 Block first atom: 3313 Blocpdb> 22 atoms in block 106 Block first atom: 3335 Blocpdb> 26 atoms in block 107 Block first atom: 3357 Blocpdb> 43 atoms in block 108 Block first atom: 3383 Blocpdb> 32 atoms in block 109 Block first atom: 3426 Blocpdb> 41 atoms in block 110 Block first atom: 3458 Blocpdb> 27 atoms in block 111 Block first atom: 3499 Blocpdb> 38 atoms in block 112 Block first atom: 3526 Blocpdb> 34 atoms in block 113 Block first atom: 3564 Blocpdb> 32 atoms in block 114 Block first atom: 3598 Blocpdb> 30 atoms in block 115 Block first atom: 3630 Blocpdb> 27 atoms in block 116 Block first atom: 3660 Blocpdb> 33 atoms in block 117 Block first atom: 3687 Blocpdb> 31 atoms in block 118 Block first atom: 3720 Blocpdb> 30 atoms in block 119 Block first atom: 3751 Blocpdb> 30 atoms in block 120 Block first atom: 3781 Blocpdb> 21 atoms in block 121 Block first atom: 3811 Blocpdb> 41 atoms in block 122 Block first atom: 3832 Blocpdb> 30 atoms in block 123 Block first atom: 3873 Blocpdb> 38 atoms in block 124 Block first atom: 3903 Blocpdb> 30 atoms in block 125 Block first atom: 3941 Blocpdb> 33 atoms in block 126 Block first atom: 3971 Blocpdb> 32 atoms in block 127 Block first atom: 4004 Blocpdb> 38 atoms in block 128 Block first atom: 4036 Blocpdb> 35 atoms in block 129 Block first atom: 4074 Blocpdb> 39 atoms in block 130 Block first atom: 4109 Blocpdb> 31 atoms in block 131 Block first atom: 4148 Blocpdb> 33 atoms in block 132 Block first atom: 4179 Blocpdb> 22 atoms in block 133 Block first atom: 4212 Blocpdb> 24 atoms in block 134 Block first atom: 4234 Blocpdb> 34 atoms in block 135 Block first atom: 4258 Blocpdb> 40 atoms in block 136 Block first atom: 4292 Blocpdb> 29 atoms in block 137 Block first atom: 4332 Blocpdb> 34 atoms in block 138 Block first atom: 4361 Blocpdb> 36 atoms in block 139 Block first atom: 4395 Blocpdb> 44 atoms in block 140 Block first atom: 4431 Blocpdb> 36 atoms in block 141 Block first atom: 4475 Blocpdb> 40 atoms in block 142 Block first atom: 4511 Blocpdb> 38 atoms in block 143 Block first atom: 4551 Blocpdb> 30 atoms in block 144 Block first atom: 4589 Blocpdb> 33 atoms in block 145 Block first atom: 4619 Blocpdb> 8 atoms in block 146 Block first atom: 4652 Blocpdb> 29 atoms in block 147 Block first atom: 4659 Blocpdb> 147 blocks. Blocpdb> At most, 48 atoms in each of them. Blocpdb> At least, 8 atoms in each of them. Blocpdb> Normal end of Blocpdb. Diagrtb> Memory allocation for Prepmat. Diagrtb> Memory allocation for RTB. Diagrtb> Memory allocation for Diagstd. Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes. Prepmat> Entering in. Prepmat> Rewriting of the matrix begins. Prepmat> 3298157 matrix lines read. Prepmat> Matrix order = 14064 Prepmat> Matrix trace = 7267760.0000 Prepmat> Last element read: 14064 14064 126.7323 Prepmat> 10879 lines saved. Prepmat> 9180 empty lines. Prepmat> Number of lines on output is as expected. Prepmat> Normal end of Prepmat. RTB> Entering in. RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 4688 RTB> Total mass = 4688.0000 RTB> Number of atoms found in matrix: 4688 RTB> Number of blocks = 147 RTB> Projection begins. RTB> Projected matrix is being saved. RTB> Projected matrix trace = 382613.1302 RTB> 58923 non-zero elements. RTB> Normal end of RTB. Diagstd> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.sdijb Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb Diagstd> CERFACS matrix format. Diagstd> Projected matrix order = 882 Diagstd> Nb of non-zero elements: 58923 Diagstd> Projected matrix trace = 382613.1302 Openam> file on opening on unit 11: diagrtb_work.eigenfacs Diagstd> Diagonalization. Diagstd> 882 eigenvectors are computed. Diagstd> 106 of them to be saved. Diagstd> Sum of eigenvalues = 382613.1302 Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000 Diagstd> Selected eigenvalues: 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 2.6898593 3.5423582 4.9958826 5.6979228 7.5375652 8.1394697 9.4328137 12.4192543 14.9354882 16.4813990 18.5421278 20.3859057 21.5078974 23.4798436 23.6133629 25.1400823 28.0721814 29.3574710 31.4972684 33.5348003 34.8098282 36.4816167 38.1939180 39.2014397 41.4372637 43.7948100 45.9502282 46.5258035 47.6698865 49.0358545 49.5781361 51.9010836 53.1892755 53.6672143 56.3835448 57.4127212 59.9914159 61.0770392 62.7731717 63.9293364 66.4755150 66.5815242 68.1500939 70.4419776 72.4940559 72.7969937 73.7694951 74.7007472 77.4836032 77.8574674 79.8890094 82.4154483 85.2344452 87.4824690 88.0319865 88.1894709 89.0670374 90.7759217 91.6272539 93.9451635 96.0024854 97.0745423 99.4952597 100.4222262 101.6196885 102.2713861 104.1621817 104.4496265 106.2350942 108.9403766 110.4700077 112.5062662 112.9789060 113.1853775 116.3944407 117.0581868 118.0851946 119.4734498 120.6459723 122.7769182 123.4462299 124.2573823 126.5868011 127.3865994 128.6138065 129.8965147 131.8380430 132.0096493 134.4068459 135.8945856 136.3636004 137.5557798 139.0403873 139.4697788 139.7242863 142.2349875 143.6330279 146.0109388 147.2945358 148.1088433 Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units): 0.0034323 0.0034324 0.0034332 0.0034334 0.0034345 0.0034346 178.0984195 204.3814693 242.7176681 259.2110791 298.1335290 309.8085049 333.5154136 382.6864101 419.6671663 440.8514938 467.6006058 490.2981856 503.6098994 526.1903518 527.6843343 544.4758575 575.3516477 588.3755271 609.4410809 628.8443199 640.6874552 655.8919763 671.1079539 679.9019532 699.0219523 718.6320850 736.1038967 740.6997895 749.7514930 760.4175892 764.6107116 782.3183066 791.9674235 795.5176263 815.4014290 822.8095925 841.0849003 848.6610458 860.3641715 868.2511723 885.3727186 886.0783933 896.4550327 911.4042519 924.5842250 926.5140352 932.6821940 938.5507329 955.8729778 958.1762825 970.5966731 985.8244675 1002.5426322 1015.6774164 1018.8623907 1019.7733275 1024.8346100 1034.6193916 1039.4596025 1052.5251778 1063.9874823 1069.9117476 1083.1696313 1088.2037109 1094.6725049 1098.1770191 1108.2820879 1109.8102354 1119.2556204 1133.4169848 1141.3463977 1151.8174030 1154.2342651 1155.2884780 1171.5515399 1174.8872117 1180.0298820 1186.9460576 1192.7562314 1203.2438325 1206.5190840 1210.4765496 1221.7701010 1225.6237059 1231.5132145 1237.6391235 1246.8541470 1247.6653639 1258.9427324 1265.8911308 1268.0737425 1273.6048429 1280.4592583 1282.4349236 1283.6044978 1295.0856751 1301.4348681 1312.1635724 1317.9186334 1321.5566228 Diagstd> Normal end. Rtb_to_modes> Entering in. Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 4688 Rtb_to_modes> Number of blocs = 147 Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.eigenfacs Openam> file on opening on unit 11: matrix.eigenrtb Rdmodfacs> Entering in. Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Eigenvector number: 1 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9905E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 2 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9912E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 3 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9958E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 4 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9967E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 5 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0003E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 6 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0004E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 7 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.690 Rdmodfacs> Eigenvector number: 8 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.542 Rdmodfacs> Eigenvector number: 9 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.996 Rdmodfacs> Eigenvector number: 10 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.698 Rdmodfacs> Eigenvector number: 11 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.538 Rdmodfacs> Eigenvector number: 12 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.139 Rdmodfacs> Eigenvector number: 13 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.433 Rdmodfacs> Eigenvector number: 14 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.42 Rdmodfacs> Eigenvector number: 15 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.94 Rdmodfacs> Eigenvector number: 16 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.48 Rdmodfacs> Eigenvector number: 17 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.54 Rdmodfacs> Eigenvector number: 18 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.39 Rdmodfacs> Eigenvector number: 19 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.51 Rdmodfacs> Eigenvector number: 20 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.48 Rdmodfacs> Eigenvector number: 21 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.61 Rdmodfacs> Eigenvector number: 22 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.14 Rdmodfacs> Eigenvector number: 23 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.07 Rdmodfacs> Eigenvector number: 24 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.36 Rdmodfacs> Eigenvector number: 25 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.50 Rdmodfacs> Eigenvector number: 26 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.53 Rdmodfacs> Eigenvector number: 27 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.81 Rdmodfacs> Eigenvector number: 28 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.48 Rdmodfacs> Eigenvector number: 29 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.19 Rdmodfacs> Eigenvector number: 30 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.20 Rdmodfacs> Eigenvector number: 31 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.44 Rdmodfacs> Eigenvector number: 32 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.79 Rdmodfacs> Eigenvector number: 33 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.95 Rdmodfacs> Eigenvector number: 34 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.53 Rdmodfacs> Eigenvector number: 35 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 47.67 Rdmodfacs> Eigenvector number: 36 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 49.04 Rdmodfacs> Eigenvector number: 37 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 49.58 Rdmodfacs> Eigenvector number: 38 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 51.90 Rdmodfacs> Eigenvector number: 39 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 53.19 Rdmodfacs> Eigenvector number: 40 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 53.67 Rdmodfacs> Eigenvector number: 41 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 56.38 Rdmodfacs> Eigenvector number: 42 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 57.41 Rdmodfacs> Eigenvector number: 43 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 59.99 Rdmodfacs> Eigenvector number: 44 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 61.08 Rdmodfacs> Eigenvector number: 45 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 62.77 Rdmodfacs> Eigenvector number: 46 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 63.93 Rdmodfacs> Eigenvector number: 47 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 66.48 Rdmodfacs> Eigenvector number: 48 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 66.58 Rdmodfacs> Eigenvector number: 49 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 68.15 Rdmodfacs> Eigenvector number: 50 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 70.44 Rdmodfacs> Eigenvector number: 51 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 72.49 Rdmodfacs> Eigenvector number: 52 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 72.80 Rdmodfacs> Eigenvector number: 53 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 73.77 Rdmodfacs> Eigenvector number: 54 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 74.70 Rdmodfacs> Eigenvector number: 55 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 77.48 Rdmodfacs> Eigenvector number: 56 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 77.86 Rdmodfacs> Eigenvector number: 57 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 79.89 Rdmodfacs> Eigenvector number: 58 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 82.42 Rdmodfacs> Eigenvector number: 59 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 85.23 Rdmodfacs> Eigenvector number: 60 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 87.48 Rdmodfacs> Eigenvector number: 61 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 88.03 Rdmodfacs> Eigenvector number: 62 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 88.19 Rdmodfacs> Eigenvector number: 63 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 89.07 Rdmodfacs> Eigenvector number: 64 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 90.78 Rdmodfacs> Eigenvector number: 65 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 91.63 Rdmodfacs> Eigenvector number: 66 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 93.95 Rdmodfacs> Eigenvector number: 67 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 96.00 Rdmodfacs> Eigenvector number: 68 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 97.07 Rdmodfacs> Eigenvector number: 69 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 99.50 Rdmodfacs> Eigenvector number: 70 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 100.4 Rdmodfacs> Eigenvector number: 71 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 101.6 Rdmodfacs> Eigenvector number: 72 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 102.3 Rdmodfacs> Eigenvector number: 73 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 104.2 Rdmodfacs> Eigenvector number: 74 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 104.4 Rdmodfacs> Eigenvector number: 75 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 106.2 Rdmodfacs> Eigenvector number: 76 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 108.9 Rdmodfacs> Eigenvector number: 77 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 110.5 Rdmodfacs> Eigenvector number: 78 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 112.5 Rdmodfacs> Eigenvector number: 79 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 113.0 Rdmodfacs> Eigenvector number: 80 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 113.2 Rdmodfacs> Eigenvector number: 81 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 116.4 Rdmodfacs> Eigenvector number: 82 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 117.1 Rdmodfacs> Eigenvector number: 83 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 118.1 Rdmodfacs> Eigenvector number: 84 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 119.5 Rdmodfacs> Eigenvector number: 85 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 120.6 Rdmodfacs> Eigenvector number: 86 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 122.8 Rdmodfacs> Eigenvector number: 87 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 123.4 Rdmodfacs> Eigenvector number: 88 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 124.3 Rdmodfacs> Eigenvector number: 89 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 126.6 Rdmodfacs> Eigenvector number: 90 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 127.4 Rdmodfacs> Eigenvector number: 91 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 128.6 Rdmodfacs> Eigenvector number: 92 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 129.9 Rdmodfacs> Eigenvector number: 93 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 131.8 Rdmodfacs> Eigenvector number: 94 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 132.0 Rdmodfacs> Eigenvector number: 95 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 134.4 Rdmodfacs> Eigenvector number: 96 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 135.9 Rdmodfacs> Eigenvector number: 97 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 136.4 Rdmodfacs> Eigenvector number: 98 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 137.6 Rdmodfacs> Eigenvector number: 99 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 139.0 Rdmodfacs> Eigenvector number: 100 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 139.5 Rdmodfacs> Eigenvector number: 101 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 139.7 Rdmodfacs> Eigenvector number: 102 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 142.2 Rdmodfacs> Eigenvector number: 103 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 143.6 Rdmodfacs> Eigenvector number: 104 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 146.0 Rdmodfacs> Eigenvector number: 105 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 147.3 Rdmodfacs> Eigenvector number: 106 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 148.1 Rtb_to_modes> 106 vectors, with 882 coordinates in vector file. Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected): 0.99999 1.00001 1.00000 0.99998 0.99999 1.00000 0.99997 0.99998 1.00002 1.00000 1.00000 0.99997 1.00000 0.99999 0.99999 1.00003 1.00000 0.99998 1.00000 0.99999 0.99999 1.00005 1.00002 0.99998 0.99997 1.00001 1.00002 1.00001 1.00000 1.00001 1.00001 0.99998 0.99999 0.99999 0.99998 1.00000 1.00001 1.00001 1.00000 0.99998 1.00000 1.00000 0.99999 1.00000 1.00000 1.00000 0.99999 1.00000 1.00001 1.00002 0.99999 1.00000 1.00000 0.99998 1.00003 1.00001 0.99999 1.00000 0.99999 0.99999 1.00000 1.00002 0.99999 1.00002 1.00000 1.00002 0.99997 1.00000 0.99998 1.00001 1.00002 0.99999 0.99999 1.00001 1.00000 1.00001 1.00000 1.00000 0.99998 0.99999 1.00001 0.99999 1.00000 1.00001 1.00002 1.00000 0.99999 1.00003 0.99999 0.99997 0.99999 0.99999 1.00000 0.99999 1.00003 1.00001 1.00000 1.00000 0.99998 1.00001 1.00001 1.00002 0.99999 1.00000 0.99999 0.99998 Rtb_to_modes> RTB block-file is being read. Rtb_to_modes> 84384 lines found in RTB file. Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected): 0.99999 1.00001 1.00000 0.99998 0.99999 1.00000 0.99997 0.99998 1.00002 1.00000 1.00000 0.99997 1.00000 0.99999 0.99999 1.00003 1.00000 0.99998 1.00000 0.99999 0.99999 1.00005 1.00002 0.99998 0.99997 1.00001 1.00002 1.00001 1.00000 1.00001 1.00001 0.99998 0.99999 0.99999 0.99998 1.00000 1.00001 1.00001 1.00000 0.99998 1.00000 1.00000 0.99999 1.00000 1.00000 1.00000 0.99999 1.00000 1.00001 1.00002 0.99999 1.00000 1.00000 0.99998 1.00003 1.00001 0.99999 1.00000 0.99999 0.99999 1.00000 1.00002 0.99999 1.00002 1.00000 1.00002 0.99997 1.00000 0.99998 1.00001 1.00002 0.99999 0.99999 1.00001 1.00000 1.00001 1.00000 1.00000 0.99998 0.99999 1.00001 0.99999 1.00000 1.00001 1.00002 1.00000 0.99999 1.00003 0.99999 0.99997 0.99999 0.99999 1.00000 0.99999 1.00003 1.00001 1.00000 1.00000 0.99998 1.00001 1.00001 1.00002 0.99999 1.00000 0.99999 0.99998 Orthogonality of first eigenvectors (zero expected): Vector 2: 0.000 Vector 3:-0.000-0.000 Vector 4:-0.000-0.000-0.000 Vector 5:-0.000 0.000-0.000-0.000 Vector 6:-0.000-0.000 0.000 0.000 0.000 Vector 7: 0.000-0.000-0.000 0.000-0.000 0.000 Vector 8: 0.000-0.000-0.000-0.000 0.000 0.000-0.000 Vector 9:-0.000-0.000 0.000 0.000 0.000-0.000 0.000 0.000 Vector 10: 0.000-0.000 0.000-0.000 0.000 0.000 0.000-0.000 0.000 Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved. Rtb_to_modes> Normal end. Diagrtb> Normal end. B-factor analysis Bfactors> Version 1.22, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 2603101928371809608.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 2603101928371809608.eigenfacs Getnam> Corresponding pdb filename ? Getnam> 2603101928371809608.atom Openam> file on opening on unit 11: 2603101928371809608.atom Getnum> Number of skipped eigenvectors ? Getnum> 0 Getnum> Number of usefull eigenvectors ? Getnum> 10000 %Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 292 First residue number = 355 Last residue number = 1 Number of atoms found = 4688 Mean number per residue = 16.1 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9905E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9912E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9958E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9967E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0003E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0004E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.690 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.542 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.996 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.698 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.538 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.139 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.433 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.42 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.94 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.48 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.54 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.39 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.51 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.48 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.61 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.14 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.07 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.36 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.50 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.53 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.81 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.48 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.19 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.20 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.44 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.79 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.95 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.53 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.67 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.04 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.58 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 51.90 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 53.19 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 53.67 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 56.38 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 57.41 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 59.99 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 61.08 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 62.77 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 63.93 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 66.48 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 66.58 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 68.15 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 70.44 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 72.49 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 72.80 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 73.77 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 74.70 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 77.48 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 77.86 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 79.89 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 82.42 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 85.23 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 87.48 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 88.03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 88.19 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 89.07 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 90.78 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 91.63 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 93.95 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 96.00 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 97.07 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 99.50 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 100.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 101.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 102.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 104.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 104.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 106.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 108.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 110.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 112.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 113.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 113.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 116.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 117.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 118.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 119.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 120.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 122.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 123.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 124.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 126.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 127.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 128.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 129.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 131.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 132.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 134.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 135.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 136.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 137.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 139.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 139.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 139.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 142.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 143.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 146.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 147.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 148.1 Bfactors> 106 vectors, 14064 coordinates in file. Openam> file on opening on unit 12: bfactors.pred Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000 Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 2.690000 Bfactors> 100 eigenvectors will be considered. Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped. Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed. (CHARMM units assumed for eigenvalues) %Bfactors-Wn> Experimental B-factors are nearly constant ! Bfactors> = 0.009 +/- 0.01 Bfactors> = 0.000 +/- 0.00 Bfactors> Shiftng-fct= -0.009 Bfactors> Scaling-fct= 0.000 Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved. Bfactors> Normal end. check_modes Chkmod> Version 1.00, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 2603101928371809608.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 2603101928371809608.eigenfacs Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4322E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4323E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4331E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4332E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4343E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4345E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 178.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 204.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 242.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 259.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 298.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 309.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 333.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 382.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 419.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 440.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 467.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 490.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 503.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 526.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 527.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 544.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 575.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 588.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 609.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 628.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 640.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 655.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 671.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 679.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 699.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 718.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 736.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 740.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 749.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 760.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 764.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 782.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 791.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 795.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 815.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 822.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 841.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 848.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 860.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 868.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 885.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 886.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 896.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 911.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 924.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 926.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 932.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 938.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 955.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 958.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 970.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 985.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1002. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1016. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1019. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1020. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1025. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1035. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1039. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1053. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1064. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1070. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1083. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1088. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1095. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1098. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1108. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1109. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1119. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1133. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1141. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1152. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1154. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1155. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1172. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1175. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1180. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1187. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1192. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1203. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1206. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1211. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1222. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1226. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1231. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1238. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1247. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1248. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1259. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1266. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1268. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1274. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1280. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1283. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1283. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1295. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1301. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1312. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1318. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1321. Chkmod> 106 vectors, 14064 coordinates in file. Chkmod> That is: 4688 cartesian points. Openam> file on opening on unit 11: Chkmod.res Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file. %Chkmod-Wn> Norm of vector 22 is: 1.0001 (instead of 1.0000). Chkmod> Normal end. 0.0034 0.7790 0.0034 0.8722 0.0034 0.8623 0.0034 0.7902 0.0034 0.7924 0.0034 0.8855 178.0954 0.1424 204.3624 0.4786 242.7101 0.3041 259.2017 0.3687 298.1293 0.2044 309.7863 0.5139 333.5044 0.2964 382.6815 0.2236 419.7125 0.3431 440.8139 0.4267 467.5537 0.4827 490.3264 0.4616 503.6129 0.5103 526.1695 0.4948 527.6241 0.5715 544.4516 0.2234 575.3046 0.3650 588.3756 0.5355 609.4413 0.4711 628.7723 0.4306 640.6615 0.3669 655.8493 0.3839 671.0447 0.2568 679.8603 0.4540 699.0150 0.5298 718.5618 0.5938 736.0705 0.5120 740.7014 0.5162 749.7202 0.5182 760.4171 0.0753 764.5923 0.4841 782.2766 0.5109 791.9388 0.3368 795.5041 0.1707 815.3408 0.3759 822.7548 0.4757 841.0389 0.3695 848.6452 0.4570 860.3055 0.4394 868.2184 0.4755 885.3646 0.1324 886.0302 0.3859 896.4159 0.4450 911.3523 0.5546 924.5187 0.1981 926.4934 0.3867 932.6453 0.4958 938.5057 0.1647 955.8097 0.4328 958.1507 0.4014 970.5610 0.3667 985.8094 0.4076 1002.4735 0.2045 1015.6195 0.5007 1018.8072 0.3707 1019.7326 0.3599 1024.8077 0.4237 1034.5982 0.4966 1039.4306 0.5555 1052.5071 0.5235 1063.9280 0.3968 1069.8408 0.1027 1083.1489 0.4785 1088.0366 0.4142 1094.5195 0.4698 1098.2835 0.4830 1108.4357 0.3684 1109.4989 0.4609 1119.0227 0.5013 1133.1583 0.4554 1141.4523 0.5129 1151.7359 0.4880 1154.2925 0.3010 1155.3135 0.5265 1171.5292 0.4530 1175.0466 0.5125 1180.0532 0.4021 1187.0270 0.4802 1192.4778 0.4725 1203.3053 0.4810 1206.2414 0.5294 1210.6321 0.4363 1221.7813 0.3951 1225.6356 0.2986 1231.3942 0.4677 1237.6026 0.2875 1246.6207 0.3585 1247.5662 0.2160 1258.8566 0.3646 1265.8620 0.3192 1268.1885 0.4734 1273.7549 0.4404 1280.2183 0.4322 1282.5188 0.5130 1283.4378 0.4525 1294.8708 0.5225 1301.2294 0.4788 1312.0581 0.5870 1317.8865 0.4529 1321.4604 0.5142 getting mode 7 running: ../../bin/get_modes.sh 2603101928371809608 7 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 7 calculating perturbed structure for DQ=-100 2603101928371809608.eigenfacs 2603101928371809608.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2603101928371809608.eigenfacs 2603101928371809608.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2603101928371809608.eigenfacs 2603101928371809608.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2603101928371809608.eigenfacs 2603101928371809608.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2603101928371809608.eigenfacs 2603101928371809608.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2603101928371809608.eigenfacs 2603101928371809608.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2603101928371809608.eigenfacs 2603101928371809608.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2603101928371809608.eigenfacs 2603101928371809608.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2603101928371809608.eigenfacs 2603101928371809608.atom calculating perturbed structure for DQ=80 2603101928371809608.eigenfacs 2603101928371809608.atom calculating perturbed structure for DQ=100 2603101928371809608.eigenfacs 2603101928371809608.atom making animated gifs 11 models are in 2603101928371809608.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2603101928371809608.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2603101928371809608.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 8 running: ../../bin/get_modes.sh 2603101928371809608 8 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 8 calculating perturbed structure for DQ=-100 2603101928371809608.eigenfacs 2603101928371809608.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2603101928371809608.eigenfacs 2603101928371809608.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2603101928371809608.eigenfacs 2603101928371809608.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2603101928371809608.eigenfacs 2603101928371809608.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2603101928371809608.eigenfacs 2603101928371809608.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2603101928371809608.eigenfacs 2603101928371809608.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2603101928371809608.eigenfacs 2603101928371809608.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2603101928371809608.eigenfacs 2603101928371809608.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2603101928371809608.eigenfacs 2603101928371809608.atom calculating perturbed structure for DQ=80 2603101928371809608.eigenfacs 2603101928371809608.atom calculating perturbed structure for DQ=100 2603101928371809608.eigenfacs 2603101928371809608.atom making animated gifs 11 models are in 2603101928371809608.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2603101928371809608.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2603101928371809608.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 9 running: ../../bin/get_modes.sh 2603101928371809608 9 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 9 calculating perturbed structure for DQ=-100 2603101928371809608.eigenfacs 2603101928371809608.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2603101928371809608.eigenfacs 2603101928371809608.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2603101928371809608.eigenfacs 2603101928371809608.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2603101928371809608.eigenfacs 2603101928371809608.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2603101928371809608.eigenfacs 2603101928371809608.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2603101928371809608.eigenfacs 2603101928371809608.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2603101928371809608.eigenfacs 2603101928371809608.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2603101928371809608.eigenfacs 2603101928371809608.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2603101928371809608.eigenfacs 2603101928371809608.atom calculating perturbed structure for DQ=80 2603101928371809608.eigenfacs 2603101928371809608.atom calculating perturbed structure for DQ=100 2603101928371809608.eigenfacs 2603101928371809608.atom making animated gifs 11 models are in 2603101928371809608.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2603101928371809608.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2603101928371809608.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 10 running: ../../bin/get_modes.sh 2603101928371809608 10 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 10 calculating perturbed structure for DQ=-100 2603101928371809608.eigenfacs 2603101928371809608.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2603101928371809608.eigenfacs 2603101928371809608.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2603101928371809608.eigenfacs 2603101928371809608.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2603101928371809608.eigenfacs 2603101928371809608.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2603101928371809608.eigenfacs 2603101928371809608.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2603101928371809608.eigenfacs 2603101928371809608.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2603101928371809608.eigenfacs 2603101928371809608.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2603101928371809608.eigenfacs 2603101928371809608.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2603101928371809608.eigenfacs 2603101928371809608.atom calculating perturbed structure for DQ=80 2603101928371809608.eigenfacs 2603101928371809608.atom calculating perturbed structure for DQ=100 2603101928371809608.eigenfacs 2603101928371809608.atom making animated gifs 11 models are in 2603101928371809608.10.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2603101928371809608.10.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2603101928371809608.10.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 11 running: ../../bin/get_modes.sh 2603101928371809608 11 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 11 calculating perturbed structure for DQ=-100 2603101928371809608.eigenfacs 2603101928371809608.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2603101928371809608.eigenfacs 2603101928371809608.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2603101928371809608.eigenfacs 2603101928371809608.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2603101928371809608.eigenfacs 2603101928371809608.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2603101928371809608.eigenfacs 2603101928371809608.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2603101928371809608.eigenfacs 2603101928371809608.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2603101928371809608.eigenfacs 2603101928371809608.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2603101928371809608.eigenfacs 2603101928371809608.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2603101928371809608.eigenfacs 2603101928371809608.atom calculating perturbed structure for DQ=80 2603101928371809608.eigenfacs 2603101928371809608.atom calculating perturbed structure for DQ=100 2603101928371809608.eigenfacs 2603101928371809608.atom making animated gifs 11 models are in 2603101928371809608.11.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2603101928371809608.11.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2603101928371809608.11.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 2603101928371809608.10.pdb 2603101928371809608.11.pdb 2603101928371809608.7.pdb 2603101928371809608.8.pdb 2603101928371809608.9.pdb STDERR: Note: The following floating-point exceptions are signalling: IEEE_DENORMAL real 0m20.348s user 0m20.179s sys 0m0.155s rm: cannot remove '2603101928371809608.sdijf': No such file or directory pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format




If you find results from this site helpful for your research, please cite one of our papers:

elNémo is maintained by Yves-Henri Sanejouand.
It was developed by Karsten Suhre.
Between 2003 and 2014, it was hosted by IGS (Marseille).
Between 2015 and 2025, it was hosted by US2B (Nantes).
Last modification: december 26th, 2025.