CNRS Nantes University US2B US2B
home |  start a new run |  job status |  references&downloads |  examples |  help  

Should you encounter any unexpected behaviour,
please let us know.
elNémo has been hacked on november 27th.
It has been moved away and runs again.
**Still some additional cleaning from time to time**
Sorry for the inconvenience.


***    ***

LOGs for ID: 2603112210352177921

Output from eigenvector calculation:


STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8) Build Tirion matrix: Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model. Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004. Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file. Pdbmat> Coordinate filename = 2603112210352177921.atom Pdbmat> Distance cutoff = 8.00 Force constant = 10.00 Origin of mass values = CONS Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09 PRINTing level = 2 Pdbmat> Coordinate file 2603112210352177921.atom to be opened. Openam> File opened: 2603112210352177921.atom Pdbmat> Coordinate file in PDB format. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 291 First residue number = 355 Last residue number = 645 Number of atoms found = 4640 Mean number per residue = 15.9 Pdbmat> Coordinate statistics: = 133.694771 +/- 10.314515 From: 109.082000 To: 160.250000 = 137.469529 +/- 9.282005 From: 114.626000 To: 160.223000 = 135.440293 +/- 15.485976 From: 100.862000 To: 166.234000 Pdbmat> Masses are all set to one. Openam> File opened: pdbmat.xyzm Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved. Openam> File opened: pdbmat.sdijb Pdbmat> Matrix statistics: Pdbmat> The matrix is 3.3628 % Filled. Pdbmat> 3258191 non-zero elements. Pdbmat> 358994 atom-atom interactions. Pdbmat> Number per atom= 154.74 +/- 44.06 Maximum number = 242 Minimum number = 28 Pdbmat> Matrix trace = 7.179880E+06 Pdbmat> Larger element = 920.372 Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10 Pdbmat> Normal end. automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1) 291 non-zero elements, NRBL set to 2 Diagonalize Tirion matrix using diagrtb Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation. Diagrtb> Version 2.52, November 2004. Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file. Diagrtb> Options taken into account: MATRix filename = pdbmat.sdijb COORdinates filename = 2603112210352177921.atom Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb Nb of VECTors required = 106 EigeNVALues chosen = LOWE Type of SUBStructuring = NONE Nb of residues per BLOck = 2 Origin of MASS values = CONS MATRix FORMat = BINA Temporary files cleaning = ALL Output PRINting level = 2 Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb. Blocpdb> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.xyzm Blocpdb> Coordinate file 2603112210352177921.atom to be opened. Openam> file on opening on unit 11: 2603112210352177921.atom Blocpdb> Coordinate file in PDB format. Blocpdb> 4640 atoms picked in pdb file. Blocpdb> All masses set to unity. Blocpdb> Coordinate file is rewritten. Blocpdb> Substructuring: Blocpdb> 2 residue(s) per block. Blocpdb> 291 residues. Blocpdb> 27 atoms in block 1 Block first atom: 1 Blocpdb> 27 atoms in block 2 Block first atom: 28 Blocpdb> 36 atoms in block 3 Block first atom: 55 Blocpdb> 28 atoms in block 4 Block first atom: 91 Blocpdb> 33 atoms in block 5 Block first atom: 119 Blocpdb> 43 atoms in block 6 Block first atom: 152 Blocpdb> 35 atoms in block 7 Block first atom: 195 Blocpdb> 43 atoms in block 8 Block first atom: 230 Blocpdb> 39 atoms in block 9 Block first atom: 273 Blocpdb> 30 atoms in block 10 Block first atom: 312 Blocpdb> 29 atoms in block 11 Block first atom: 342 Blocpdb> 33 atoms in block 12 Block first atom: 371 Blocpdb> 21 atoms in block 13 Block first atom: 404 Blocpdb> 38 atoms in block 14 Block first atom: 425 Blocpdb> 35 atoms in block 15 Block first atom: 463 Blocpdb> 35 atoms in block 16 Block first atom: 498 Blocpdb> 33 atoms in block 17 Block first atom: 533 Blocpdb> 25 atoms in block 18 Block first atom: 566 Blocpdb> 38 atoms in block 19 Block first atom: 591 Blocpdb> 41 atoms in block 20 Block first atom: 629 Blocpdb> 30 atoms in block 21 Block first atom: 670 Blocpdb> 38 atoms in block 22 Block first atom: 700 Blocpdb> 39 atoms in block 23 Block first atom: 738 Blocpdb> 28 atoms in block 24 Block first atom: 777 Blocpdb> 33 atoms in block 25 Block first atom: 805 Blocpdb> 30 atoms in block 26 Block first atom: 838 Blocpdb> 23 atoms in block 27 Block first atom: 868 Blocpdb> 30 atoms in block 28 Block first atom: 891 Blocpdb> 26 atoms in block 29 Block first atom: 921 Blocpdb> 40 atoms in block 30 Block first atom: 947 Blocpdb> 38 atoms in block 31 Block first atom: 987 Blocpdb> 38 atoms in block 32 Block first atom: 1025 Blocpdb> 21 atoms in block 33 Block first atom: 1063 Blocpdb> 28 atoms in block 34 Block first atom: 1084 Blocpdb> 36 atoms in block 35 Block first atom: 1112 Blocpdb> 36 atoms in block 36 Block first atom: 1148 Blocpdb> 28 atoms in block 37 Block first atom: 1184 Blocpdb> 38 atoms in block 38 Block first atom: 1212 Blocpdb> 35 atoms in block 39 Block first atom: 1250 Blocpdb> 29 atoms in block 40 Block first atom: 1285 Blocpdb> 36 atoms in block 41 Block first atom: 1314 Blocpdb> 31 atoms in block 42 Block first atom: 1350 Blocpdb> 17 atoms in block 43 Block first atom: 1381 Blocpdb> 17 atoms in block 44 Block first atom: 1398 Blocpdb> 22 atoms in block 45 Block first atom: 1415 Blocpdb> 17 atoms in block 46 Block first atom: 1437 Blocpdb> 40 atoms in block 47 Block first atom: 1454 Blocpdb> 30 atoms in block 48 Block first atom: 1494 Blocpdb> 30 atoms in block 49 Block first atom: 1524 Blocpdb> 27 atoms in block 50 Block first atom: 1554 Blocpdb> 30 atoms in block 51 Block first atom: 1581 Blocpdb> 37 atoms in block 52 Block first atom: 1611 Blocpdb> 33 atoms in block 53 Block first atom: 1648 Blocpdb> 24 atoms in block 54 Block first atom: 1681 Blocpdb> 33 atoms in block 55 Block first atom: 1705 Blocpdb> 34 atoms in block 56 Block first atom: 1738 Blocpdb> 48 atoms in block 57 Block first atom: 1772 Blocpdb> 31 atoms in block 58 Block first atom: 1820 Blocpdb> 33 atoms in block 59 Block first atom: 1851 Blocpdb> 27 atoms in block 60 Block first atom: 1884 Blocpdb> 34 atoms in block 61 Block first atom: 1911 Blocpdb> 31 atoms in block 62 Block first atom: 1945 Blocpdb> 33 atoms in block 63 Block first atom: 1976 Blocpdb> 33 atoms in block 64 Block first atom: 2009 Blocpdb> 43 atoms in block 65 Block first atom: 2042 Blocpdb> 27 atoms in block 66 Block first atom: 2085 Blocpdb> 21 atoms in block 67 Block first atom: 2112 Blocpdb> 33 atoms in block 68 Block first atom: 2133 Blocpdb> 33 atoms in block 69 Block first atom: 2166 Blocpdb> 12 atoms in block 70 Block first atom: 2199 Blocpdb> 39 atoms in block 71 Block first atom: 2211 Blocpdb> 30 atoms in block 72 Block first atom: 2250 Blocpdb> 20 atoms in block 73 Block first atom: 2280 Blocpdb> 29 atoms in block 74 Block first atom: 2300 Blocpdb> 34 atoms in block 75 Block first atom: 2329 Blocpdb> 39 atoms in block 76 Block first atom: 2363 Blocpdb> 26 atoms in block 77 Block first atom: 2402 Blocpdb> 22 atoms in block 78 Block first atom: 2428 Blocpdb> 38 atoms in block 79 Block first atom: 2450 Blocpdb> 38 atoms in block 80 Block first atom: 2488 Blocpdb> 30 atoms in block 81 Block first atom: 2526 Blocpdb> 29 atoms in block 82 Block first atom: 2556 Blocpdb> 31 atoms in block 83 Block first atom: 2585 Blocpdb> 31 atoms in block 84 Block first atom: 2616 Blocpdb> 23 atoms in block 85 Block first atom: 2647 Blocpdb> 33 atoms in block 86 Block first atom: 2670 Blocpdb> 28 atoms in block 87 Block first atom: 2703 Blocpdb> 40 atoms in block 88 Block first atom: 2731 Blocpdb> 33 atoms in block 89 Block first atom: 2771 Blocpdb> 30 atoms in block 90 Block first atom: 2804 Blocpdb> 35 atoms in block 91 Block first atom: 2834 Blocpdb> 33 atoms in block 92 Block first atom: 2869 Blocpdb> 35 atoms in block 93 Block first atom: 2902 Blocpdb> 30 atoms in block 94 Block first atom: 2937 Blocpdb> 32 atoms in block 95 Block first atom: 2967 Blocpdb> 30 atoms in block 96 Block first atom: 2999 Blocpdb> 18 atoms in block 97 Block first atom: 3029 Blocpdb> 40 atoms in block 98 Block first atom: 3047 Blocpdb> 36 atoms in block 99 Block first atom: 3087 Blocpdb> 40 atoms in block 100 Block first atom: 3123 Blocpdb> 30 atoms in block 101 Block first atom: 3163 Blocpdb> 38 atoms in block 102 Block first atom: 3193 Blocpdb> 28 atoms in block 103 Block first atom: 3231 Blocpdb> 35 atoms in block 104 Block first atom: 3259 Blocpdb> 22 atoms in block 105 Block first atom: 3294 Blocpdb> 22 atoms in block 106 Block first atom: 3316 Blocpdb> 26 atoms in block 107 Block first atom: 3338 Blocpdb> 43 atoms in block 108 Block first atom: 3364 Blocpdb> 32 atoms in block 109 Block first atom: 3407 Blocpdb> 41 atoms in block 110 Block first atom: 3439 Blocpdb> 27 atoms in block 111 Block first atom: 3480 Blocpdb> 38 atoms in block 112 Block first atom: 3507 Blocpdb> 34 atoms in block 113 Block first atom: 3545 Blocpdb> 32 atoms in block 114 Block first atom: 3579 Blocpdb> 30 atoms in block 115 Block first atom: 3611 Blocpdb> 27 atoms in block 116 Block first atom: 3641 Blocpdb> 33 atoms in block 117 Block first atom: 3668 Blocpdb> 31 atoms in block 118 Block first atom: 3701 Blocpdb> 30 atoms in block 119 Block first atom: 3732 Blocpdb> 30 atoms in block 120 Block first atom: 3762 Blocpdb> 21 atoms in block 121 Block first atom: 3792 Blocpdb> 41 atoms in block 122 Block first atom: 3813 Blocpdb> 30 atoms in block 123 Block first atom: 3854 Blocpdb> 38 atoms in block 124 Block first atom: 3884 Blocpdb> 30 atoms in block 125 Block first atom: 3922 Blocpdb> 33 atoms in block 126 Block first atom: 3952 Blocpdb> 32 atoms in block 127 Block first atom: 3985 Blocpdb> 38 atoms in block 128 Block first atom: 4017 Blocpdb> 35 atoms in block 129 Block first atom: 4055 Blocpdb> 39 atoms in block 130 Block first atom: 4090 Blocpdb> 31 atoms in block 131 Block first atom: 4129 Blocpdb> 33 atoms in block 132 Block first atom: 4160 Blocpdb> 22 atoms in block 133 Block first atom: 4193 Blocpdb> 24 atoms in block 134 Block first atom: 4215 Blocpdb> 34 atoms in block 135 Block first atom: 4239 Blocpdb> 40 atoms in block 136 Block first atom: 4273 Blocpdb> 29 atoms in block 137 Block first atom: 4313 Blocpdb> 34 atoms in block 138 Block first atom: 4342 Blocpdb> 36 atoms in block 139 Block first atom: 4376 Blocpdb> 44 atoms in block 140 Block first atom: 4412 Blocpdb> 36 atoms in block 141 Block first atom: 4456 Blocpdb> 40 atoms in block 142 Block first atom: 4492 Blocpdb> 38 atoms in block 143 Block first atom: 4532 Blocpdb> 30 atoms in block 144 Block first atom: 4570 Blocpdb> 33 atoms in block 145 Block first atom: 4600 Blocpdb> 8 atoms in block 146 Block first atom: 4632 Blocpdb> 146 blocks. Blocpdb> At most, 48 atoms in each of them. Blocpdb> At least, 8 atoms in each of them. Blocpdb> Normal end of Blocpdb. Diagrtb> Memory allocation for Prepmat. Diagrtb> Memory allocation for RTB. Diagrtb> Memory allocation for Diagstd. Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes. Prepmat> Entering in. Prepmat> Rewriting of the matrix begins. Prepmat> 3258337 matrix lines read. Prepmat> Matrix order = 13920 Prepmat> Matrix trace = 7179880.0000 Prepmat> Last element read: 13920 13920 141.9456 Prepmat> 10732 lines saved. Prepmat> 9057 empty lines. Prepmat> Number of lines on output is as expected. Prepmat> Normal end of Prepmat. RTB> Entering in. RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 4640 RTB> Total mass = 4640.0000 RTB> Number of atoms found in matrix: 4640 RTB> Number of blocks = 146 RTB> Projection begins. RTB> Projected matrix is being saved. RTB> Projected matrix trace = 379444.8033 RTB> 58074 non-zero elements. RTB> Normal end of RTB. Diagstd> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.sdijb Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb Diagstd> CERFACS matrix format. Diagstd> Projected matrix order = 876 Diagstd> Nb of non-zero elements: 58074 Diagstd> Projected matrix trace = 379444.8033 Openam> file on opening on unit 11: diagrtb_work.eigenfacs Diagstd> Diagonalization. Diagstd> 876 eigenvectors are computed. Diagstd> 106 of them to be saved. Diagstd> Sum of eigenvalues = 379444.8033 Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000 Diagstd> Selected eigenvalues: 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 2.6735442 3.4322345 4.9465775 5.6326114 7.4660004 7.8504020 9.2552195 12.2668618 14.8071950 16.5505864 18.4534391 20.0785367 21.1711540 22.6663598 23.4215544 25.1005706 28.1345551 29.0784759 31.5810647 33.0115239 34.7775210 36.2621683 38.0953912 39.0499588 41.0386568 43.7704643 44.9086684 45.9968068 47.0439187 48.9832651 49.3472732 51.8577689 52.6378024 53.5547977 55.8998230 56.6685289 59.5473184 60.1099368 62.7962164 64.8084186 65.5137688 66.4211464 67.9708061 70.0782014 72.1228185 72.4231206 72.9471048 74.6057022 77.0757731 77.6971955 80.4919386 81.0024282 86.9104317 87.1493246 88.1261016 88.8645609 89.8860811 91.2469595 92.7924743 95.2065717 96.8024818 98.4777609 99.4396329 100.4575418 101.5779373 103.6693260 105.2798427 107.6258726 108.8341484 110.3741642 111.7626908 112.9603422 113.1752716 115.0721510 115.7058728 118.1456111 119.0763651 119.5722612 122.0977396 123.9545250 124.7652301 126.8394708 127.7385028 129.1127885 129.6685965 131.8456481 133.3747062 133.4483244 134.4753709 136.2389252 138.3868356 139.0401240 139.9519363 141.1446345 143.9679525 146.2893969 147.6454777 148.3825455 150.5752418 151.4262093 Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units): 0.0034314 0.0034331 0.0034333 0.0034336 0.0034338 0.0034342 177.5574765 201.1795162 241.5169907 257.7212170 296.7148519 304.2574561 330.3609009 380.3312558 417.8608453 441.7758525 466.4809771 486.5879049 499.6519035 516.9947940 525.5368057 544.0478237 575.9904811 585.5730764 610.2512312 623.9187928 640.3900725 653.9163030 670.2417842 678.5870545 695.6516975 718.4323120 727.7133952 736.4768872 744.8126181 760.0097183 762.8284115 781.9917912 787.8511171 794.6840050 811.8961773 817.4595084 837.9659747 841.9153270 860.5220811 874.2003833 878.9447410 885.0105826 895.2750684 909.0478705 922.2138184 924.1317625 927.4688028 937.9534636 953.3540700 957.1895570 974.2523766 977.3369068 1012.3512743 1013.7416572 1019.4068786 1023.6690664 1029.5359195 1037.3002471 1046.0481073 1059.5677805 1068.4114317 1077.6168235 1082.8667941 1088.3950391 1094.4476043 1105.6569947 1114.2121606 1126.5581739 1132.8642501 1140.8511758 1148.0048026 1154.1394337 1155.2369014 1164.8778731 1168.0810587 1180.3317154 1184.9719353 1187.4367928 1199.9111589 1209.0004793 1212.9476748 1222.9888316 1227.3154207 1233.8998479 1236.5528576 1246.8901092 1254.0995678 1254.4456296 1259.2636167 1267.4939198 1277.4463494 1280.4580459 1284.6497481 1290.1121551 1302.9513327 1313.4141928 1319.4877264 1322.7771641 1332.5148724 1336.2748836 Diagstd> Normal end. Rtb_to_modes> Entering in. Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 4640 Rtb_to_modes> Number of blocs = 146 Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.eigenfacs Openam> file on opening on unit 11: matrix.eigenrtb Rdmodfacs> Entering in. Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Eigenvector number: 1 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9851E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 2 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9951E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 3 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9960E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 4 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9979E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 5 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9991E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 6 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0001E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 7 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.674 Rdmodfacs> Eigenvector number: 8 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.432 Rdmodfacs> Eigenvector number: 9 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.947 Rdmodfacs> Eigenvector number: 10 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.633 Rdmodfacs> Eigenvector number: 11 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.466 Rdmodfacs> Eigenvector number: 12 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.850 Rdmodfacs> Eigenvector number: 13 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.255 Rdmodfacs> Eigenvector number: 14 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.27 Rdmodfacs> Eigenvector number: 15 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.81 Rdmodfacs> Eigenvector number: 16 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.55 Rdmodfacs> Eigenvector number: 17 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.45 Rdmodfacs> Eigenvector number: 18 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.08 Rdmodfacs> Eigenvector number: 19 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.17 Rdmodfacs> Eigenvector number: 20 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.67 Rdmodfacs> Eigenvector number: 21 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.42 Rdmodfacs> Eigenvector number: 22 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 23 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.13 Rdmodfacs> Eigenvector number: 24 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.08 Rdmodfacs> Eigenvector number: 25 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.58 Rdmodfacs> Eigenvector number: 26 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.01 Rdmodfacs> Eigenvector number: 27 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.78 Rdmodfacs> Eigenvector number: 28 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.26 Rdmodfacs> Eigenvector number: 29 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 30 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.05 Rdmodfacs> Eigenvector number: 31 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.04 Rdmodfacs> Eigenvector number: 32 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.77 Rdmodfacs> Eigenvector number: 33 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.91 Rdmodfacs> Eigenvector number: 34 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.00 Rdmodfacs> Eigenvector number: 35 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 47.04 Rdmodfacs> Eigenvector number: 36 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 48.98 Rdmodfacs> Eigenvector number: 37 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 49.35 Rdmodfacs> Eigenvector number: 38 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 51.86 Rdmodfacs> Eigenvector number: 39 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 52.64 Rdmodfacs> Eigenvector number: 40 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 53.55 Rdmodfacs> Eigenvector number: 41 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 55.90 Rdmodfacs> Eigenvector number: 42 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 56.67 Rdmodfacs> Eigenvector number: 43 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 59.55 Rdmodfacs> Eigenvector number: 44 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 60.11 Rdmodfacs> Eigenvector number: 45 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 62.80 Rdmodfacs> Eigenvector number: 46 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 64.81 Rdmodfacs> Eigenvector number: 47 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 65.51 Rdmodfacs> Eigenvector number: 48 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 66.42 Rdmodfacs> Eigenvector number: 49 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 67.97 Rdmodfacs> Eigenvector number: 50 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 70.08 Rdmodfacs> Eigenvector number: 51 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 72.12 Rdmodfacs> Eigenvector number: 52 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 72.42 Rdmodfacs> Eigenvector number: 53 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 72.95 Rdmodfacs> Eigenvector number: 54 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 74.61 Rdmodfacs> Eigenvector number: 55 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 77.08 Rdmodfacs> Eigenvector number: 56 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 77.70 Rdmodfacs> Eigenvector number: 57 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 80.49 Rdmodfacs> Eigenvector number: 58 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 81.00 Rdmodfacs> Eigenvector number: 59 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 86.91 Rdmodfacs> Eigenvector number: 60 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 87.15 Rdmodfacs> Eigenvector number: 61 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 88.13 Rdmodfacs> Eigenvector number: 62 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 88.86 Rdmodfacs> Eigenvector number: 63 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 89.89 Rdmodfacs> Eigenvector number: 64 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 91.25 Rdmodfacs> Eigenvector number: 65 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 92.79 Rdmodfacs> Eigenvector number: 66 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 95.21 Rdmodfacs> Eigenvector number: 67 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 96.80 Rdmodfacs> Eigenvector number: 68 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 98.48 Rdmodfacs> Eigenvector number: 69 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 99.44 Rdmodfacs> Eigenvector number: 70 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 100.5 Rdmodfacs> Eigenvector number: 71 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 101.6 Rdmodfacs> Eigenvector number: 72 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 103.7 Rdmodfacs> Eigenvector number: 73 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 105.3 Rdmodfacs> Eigenvector number: 74 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 107.6 Rdmodfacs> Eigenvector number: 75 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 108.8 Rdmodfacs> Eigenvector number: 76 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 110.4 Rdmodfacs> Eigenvector number: 77 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 111.8 Rdmodfacs> Eigenvector number: 78 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 113.0 Rdmodfacs> Eigenvector number: 79 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 113.2 Rdmodfacs> Eigenvector number: 80 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 115.1 Rdmodfacs> Eigenvector number: 81 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 115.7 Rdmodfacs> Eigenvector number: 82 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 118.1 Rdmodfacs> Eigenvector number: 83 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 119.1 Rdmodfacs> Eigenvector number: 84 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 119.6 Rdmodfacs> Eigenvector number: 85 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 122.1 Rdmodfacs> Eigenvector number: 86 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 124.0 Rdmodfacs> Eigenvector number: 87 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 124.8 Rdmodfacs> Eigenvector number: 88 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 126.8 Rdmodfacs> Eigenvector number: 89 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 127.7 Rdmodfacs> Eigenvector number: 90 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 129.1 Rdmodfacs> Eigenvector number: 91 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 129.7 Rdmodfacs> Eigenvector number: 92 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 131.8 Rdmodfacs> Eigenvector number: 93 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 133.4 Rdmodfacs> Eigenvector number: 94 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 133.4 Rdmodfacs> Eigenvector number: 95 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 134.5 Rdmodfacs> Eigenvector number: 96 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 136.2 Rdmodfacs> Eigenvector number: 97 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 138.4 Rdmodfacs> Eigenvector number: 98 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 139.0 Rdmodfacs> Eigenvector number: 99 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 140.0 Rdmodfacs> Eigenvector number: 100 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 141.1 Rdmodfacs> Eigenvector number: 101 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 144.0 Rdmodfacs> Eigenvector number: 102 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 146.3 Rdmodfacs> Eigenvector number: 103 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 147.6 Rdmodfacs> Eigenvector number: 104 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 148.4 Rdmodfacs> Eigenvector number: 105 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 150.6 Rdmodfacs> Eigenvector number: 106 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 151.4 Rtb_to_modes> 106 vectors, with 876 coordinates in vector file. Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected): 1.00001 0.99999 1.00000 0.99999 1.00001 0.99999 1.00003 0.99999 0.99999 1.00004 1.00000 1.00001 1.00000 0.99999 0.99998 1.00003 0.99998 1.00000 1.00000 0.99998 0.99997 1.00000 0.99999 0.99999 1.00001 1.00003 0.99996 1.00002 0.99998 1.00000 1.00000 0.99999 0.99999 1.00000 0.99999 0.99999 1.00002 1.00000 1.00002 1.00000 0.99996 1.00002 1.00002 1.00000 1.00003 0.99998 0.99999 0.99997 1.00001 1.00002 1.00002 1.00002 1.00002 0.99999 1.00001 0.99997 0.99998 0.99998 1.00002 1.00000 1.00002 1.00000 1.00002 1.00003 1.00000 1.00002 0.99999 0.99998 1.00000 0.99997 0.99999 0.99998 0.99999 0.99998 1.00001 1.00002 1.00001 1.00000 0.99999 0.99998 0.99999 1.00001 1.00000 0.99998 0.99999 1.00000 1.00001 1.00005 0.99999 0.99999 0.99999 0.99999 1.00001 1.00000 1.00001 1.00001 1.00000 1.00001 1.00000 1.00000 1.00002 1.00000 1.00001 0.99999 1.00000 1.00001 Rtb_to_modes> RTB block-file is being read. Rtb_to_modes> 83520 lines found in RTB file. Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected): 1.00001 0.99999 1.00000 0.99999 1.00001 0.99999 1.00003 0.99999 0.99999 1.00004 1.00000 1.00001 1.00000 0.99999 0.99998 1.00003 0.99998 1.00000 1.00000 0.99998 0.99997 1.00000 0.99999 0.99999 1.00001 1.00003 0.99996 1.00002 0.99998 1.00000 1.00000 0.99999 0.99999 1.00000 0.99999 0.99999 1.00002 1.00000 1.00002 1.00000 0.99996 1.00002 1.00002 1.00000 1.00003 0.99998 0.99999 0.99997 1.00001 1.00002 1.00002 1.00002 1.00002 0.99999 1.00001 0.99997 0.99998 0.99998 1.00002 1.00000 1.00002 1.00000 1.00002 1.00003 1.00000 1.00002 0.99999 0.99998 1.00000 0.99997 0.99999 0.99998 0.99999 0.99998 1.00001 1.00002 1.00001 1.00000 0.99999 0.99998 0.99999 1.00001 1.00000 0.99998 0.99999 1.00000 1.00001 1.00005 0.99999 0.99999 0.99999 0.99999 1.00001 1.00000 1.00001 1.00001 1.00000 1.00001 1.00000 1.00000 1.00002 1.00000 1.00001 0.99999 1.00000 1.00001 Orthogonality of first eigenvectors (zero expected): Vector 2:-0.000 Vector 3:-0.000-0.000 Vector 4: 0.000-0.000-0.000 Vector 5:-0.000 0.000 0.000 0.000 Vector 6: 0.000 0.000-0.000 0.000 0.000 Vector 7:-0.000 0.000-0.000 0.000-0.000 0.000 Vector 8:-0.000-0.000 0.000 0.000 0.000-0.000 0.000 Vector 9: 0.000 0.000 0.000-0.000 0.000-0.000-0.000-0.000 Vector 10: 0.000 0.000 0.000-0.000 0.000 0.000 0.000-0.000-0.000 Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved. Rtb_to_modes> Normal end. Diagrtb> Normal end. B-factor analysis Bfactors> Version 1.22, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 2603112210352177921.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 2603112210352177921.eigenfacs Getnam> Corresponding pdb filename ? Getnam> 2603112210352177921.atom Openam> file on opening on unit 11: 2603112210352177921.atom Getnum> Number of skipped eigenvectors ? Getnum> 0 Getnum> Number of usefull eigenvectors ? Getnum> 10000 %Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 291 First residue number = 355 Last residue number = 645 Number of atoms found = 4640 Mean number per residue = 15.9 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9851E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9951E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9960E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9979E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9991E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0001E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.674 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.432 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.947 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.633 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.466 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.850 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.255 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.27 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.81 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.55 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.45 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.08 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.17 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.67 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.42 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.13 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.08 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.58 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.01 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.78 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.26 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.05 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.04 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.77 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.91 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.00 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.04 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.98 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.35 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 51.86 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 52.64 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 53.55 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 55.90 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 56.67 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 59.55 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 60.11 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 62.80 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 64.81 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 65.51 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 66.42 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 67.97 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 70.08 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 72.12 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 72.42 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 72.95 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 74.61 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 77.08 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 77.70 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 80.49 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 81.00 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 86.91 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 87.15 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 88.13 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 88.86 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 89.89 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 91.25 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 92.79 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 95.21 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 96.80 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 98.48 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 99.44 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 100.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 101.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 103.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 105.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 107.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 108.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 110.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 111.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 113.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 113.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 115.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 115.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 118.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 119.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 119.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 122.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 124.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 124.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 126.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 127.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 129.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 129.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 131.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 133.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 133.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 134.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 136.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 138.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 139.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 140.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 141.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 144.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 146.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 147.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 148.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 150.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 151.4 Bfactors> 106 vectors, 13920 coordinates in file. Openam> file on opening on unit 12: bfactors.pred Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000 Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 2.674000 Bfactors> 100 eigenvectors will be considered. Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped. Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed. (CHARMM units assumed for eigenvalues) %Bfactors-Wn> Experimental B-factors are nearly constant ! Bfactors> = 0.009 +/- 0.01 Bfactors> = 0.000 +/- 0.00 Bfactors> Shiftng-fct= -0.009 Bfactors> Scaling-fct= 0.000 Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved. Bfactors> Normal end. check_modes Chkmod> Version 1.00, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 2603112210352177921.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 2603112210352177921.eigenfacs Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4313E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4330E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4331E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4335E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4337E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4340E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 177.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 201.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 241.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 257.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 296.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 304.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 330.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 380.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 417.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 441.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 466.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 486.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 499.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 517.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 525.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 544.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 575.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 585.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 610.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 623.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 640.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 653.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 670.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 678.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 695.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 718.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 727.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 736.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 744.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 760.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 762.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 782.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 787.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 794.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 811.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 817.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 837.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 841.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 860.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 874.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 878.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 885.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 895.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 909.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 922.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 924.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 927.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 937.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 953.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 957.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 974.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 977.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1012. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1014. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1019. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1024. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1030. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1037. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1046. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1060. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1068. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1078. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1083. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1089. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1095. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1106. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1114. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1126. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1133. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1141. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1148. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1154. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1155. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1165. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1168. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1180. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1185. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1188. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1200. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1209. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1213. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1223. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1227. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1234. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1237. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1247. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1254. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1254. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1259. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1267. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1277. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1280. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1285. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1290. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1303. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1313. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1319. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1323. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1333. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1336. Chkmod> 106 vectors, 13920 coordinates in file. Chkmod> That is: 4640 cartesian points. Openam> file on opening on unit 11: Chkmod.res Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file. Chkmod> Normal end. 0.0034 0.7277 0.0034 0.7611 0.0034 0.8972 0.0034 0.9485 0.0034 0.7922 0.0034 0.7171 177.5650 0.1494 201.1640 0.5006 241.5169 0.3123 257.7190 0.3923 296.7021 0.2184 304.2366 0.5617 330.3428 0.2426 380.3636 0.2223 417.8825 0.3820 441.7491 0.4012 466.4175 0.5077 486.5847 0.4743 499.6168 0.4926 517.0141 0.5771 525.4968 0.5219 544.0183 0.2051 575.9191 0.3413 585.5633 0.5552 610.2147 0.4408 623.8776 0.3959 640.3854 0.3621 653.8687 0.4661 670.2536 0.2724 678.5583 0.4917 695.6332 0.4770 718.3977 0.5815 727.6929 0.5462 736.4708 0.4423 744.7496 0.5043 759.9518 0.0744 762.8167 0.4548 781.9750 0.4709 787.8337 0.3911 794.6143 0.1295 811.8626 0.4276 817.4350 0.4808 837.9489 0.4368 841.8796 0.4380 860.5111 0.4292 874.1735 0.5043 878.8817 0.4193 884.9650 0.1286 895.2313 0.4115 909.0205 0.6040 922.1562 0.2457 924.0722 0.3350 927.4474 0.3524 937.9402 0.2029 953.3393 0.5336 957.1657 0.3426 974.1988 0.2394 977.2803 0.3651 1012.3053 0.4565 1013.7021 0.4440 1019.3857 0.4946 1023.5989 0.4899 1029.5142 0.4736 1037.2730 0.5826 1045.9893 0.4675 1059.5414 0.3669 1068.3519 0.1491 1077.5828 0.4111 1082.8223 0.5041 1088.5783 0.4748 1094.5195 0.3985 1105.7731 0.3726 1114.2710 0.5506 1126.3744 0.5142 1132.6379 0.4123 1140.9357 0.4721 1148.1471 0.5061 1154.2925 0.4824 1155.3135 0.4389 1164.9688 0.5328 1168.0013 0.5050 1180.0532 0.4673 1185.0387 0.4155 1187.5235 0.4706 1199.8708 0.5748 1209.1703 0.4781 1213.0646 0.2895 1222.7460 0.2689 1227.0778 0.4530 1233.7858 0.4339 1236.6495 0.4111 1246.6207 0.3970 1254.1646 0.2742 1254.1646 0.3682 1259.3249 0.3834 1267.2584 0.4132 1277.4523 0.4717 1280.2183 0.4792 1284.8152 0.4309 1289.8528 0.5102 1303.0404 0.5635 1313.4054 0.3708 1319.2279 0.5297 1322.7982 0.5893 1332.5672 0.5326 1336.1019 0.4582 getting mode 7 running: ../../bin/get_modes.sh 2603112210352177921 7 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 7 calculating perturbed structure for DQ=-100 2603112210352177921.eigenfacs 2603112210352177921.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2603112210352177921.eigenfacs 2603112210352177921.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2603112210352177921.eigenfacs 2603112210352177921.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2603112210352177921.eigenfacs 2603112210352177921.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2603112210352177921.eigenfacs 2603112210352177921.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2603112210352177921.eigenfacs 2603112210352177921.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2603112210352177921.eigenfacs 2603112210352177921.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2603112210352177921.eigenfacs 2603112210352177921.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2603112210352177921.eigenfacs 2603112210352177921.atom calculating perturbed structure for DQ=80 2603112210352177921.eigenfacs 2603112210352177921.atom calculating perturbed structure for DQ=100 2603112210352177921.eigenfacs 2603112210352177921.atom making animated gifs 11 models are in 2603112210352177921.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2603112210352177921.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2603112210352177921.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 8 running: ../../bin/get_modes.sh 2603112210352177921 8 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 8 calculating perturbed structure for DQ=-100 2603112210352177921.eigenfacs 2603112210352177921.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2603112210352177921.eigenfacs 2603112210352177921.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2603112210352177921.eigenfacs 2603112210352177921.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2603112210352177921.eigenfacs 2603112210352177921.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2603112210352177921.eigenfacs 2603112210352177921.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2603112210352177921.eigenfacs 2603112210352177921.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2603112210352177921.eigenfacs 2603112210352177921.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2603112210352177921.eigenfacs 2603112210352177921.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2603112210352177921.eigenfacs 2603112210352177921.atom calculating perturbed structure for DQ=80 2603112210352177921.eigenfacs 2603112210352177921.atom calculating perturbed structure for DQ=100 2603112210352177921.eigenfacs 2603112210352177921.atom making animated gifs 11 models are in 2603112210352177921.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2603112210352177921.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2603112210352177921.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 9 running: ../../bin/get_modes.sh 2603112210352177921 9 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 9 calculating perturbed structure for DQ=-100 2603112210352177921.eigenfacs 2603112210352177921.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2603112210352177921.eigenfacs 2603112210352177921.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2603112210352177921.eigenfacs 2603112210352177921.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2603112210352177921.eigenfacs 2603112210352177921.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2603112210352177921.eigenfacs 2603112210352177921.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2603112210352177921.eigenfacs 2603112210352177921.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2603112210352177921.eigenfacs 2603112210352177921.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2603112210352177921.eigenfacs 2603112210352177921.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2603112210352177921.eigenfacs 2603112210352177921.atom calculating perturbed structure for DQ=80 2603112210352177921.eigenfacs 2603112210352177921.atom calculating perturbed structure for DQ=100 2603112210352177921.eigenfacs 2603112210352177921.atom making animated gifs 11 models are in 2603112210352177921.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2603112210352177921.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2603112210352177921.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 10 running: ../../bin/get_modes.sh 2603112210352177921 10 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 10 calculating perturbed structure for DQ=-100 2603112210352177921.eigenfacs 2603112210352177921.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2603112210352177921.eigenfacs 2603112210352177921.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2603112210352177921.eigenfacs 2603112210352177921.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2603112210352177921.eigenfacs 2603112210352177921.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2603112210352177921.eigenfacs 2603112210352177921.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2603112210352177921.eigenfacs 2603112210352177921.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2603112210352177921.eigenfacs 2603112210352177921.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2603112210352177921.eigenfacs 2603112210352177921.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2603112210352177921.eigenfacs 2603112210352177921.atom calculating perturbed structure for DQ=80 2603112210352177921.eigenfacs 2603112210352177921.atom calculating perturbed structure for DQ=100 2603112210352177921.eigenfacs 2603112210352177921.atom making animated gifs 11 models are in 2603112210352177921.10.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2603112210352177921.10.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2603112210352177921.10.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 11 running: ../../bin/get_modes.sh 2603112210352177921 11 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 11 calculating perturbed structure for DQ=-100 2603112210352177921.eigenfacs 2603112210352177921.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2603112210352177921.eigenfacs 2603112210352177921.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2603112210352177921.eigenfacs 2603112210352177921.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2603112210352177921.eigenfacs 2603112210352177921.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2603112210352177921.eigenfacs 2603112210352177921.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2603112210352177921.eigenfacs 2603112210352177921.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2603112210352177921.eigenfacs 2603112210352177921.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2603112210352177921.eigenfacs 2603112210352177921.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2603112210352177921.eigenfacs 2603112210352177921.atom calculating perturbed structure for DQ=80 2603112210352177921.eigenfacs 2603112210352177921.atom calculating perturbed structure for DQ=100 2603112210352177921.eigenfacs 2603112210352177921.atom making animated gifs 11 models are in 2603112210352177921.11.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2603112210352177921.11.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2603112210352177921.11.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 2603112210352177921.10.pdb 2603112210352177921.11.pdb 2603112210352177921.7.pdb 2603112210352177921.8.pdb 2603112210352177921.9.pdb STDERR: Note: The following floating-point exceptions are signalling: IEEE_DENORMAL real 0m17.250s user 0m17.071s sys 0m0.172s rm: cannot remove '2603112210352177921.sdijf': No such file or directory pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format




If you find results from this site helpful for your research, please cite one of our papers:

elNémo is maintained by Yves-Henri Sanejouand.
It was developed by Karsten Suhre.
Between 2003 and 2014, it was hosted by IGS (Marseille).
Between 2015 and 2025, it was hosted by US2B (Nantes).
Last modification: december 26th, 2025.