*** ***
Output from eigenvector calculation:
STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8)
Build Tirion matrix:
Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model.
Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004.
Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file.
Pdbmat> Coordinate filename = 2603122140012388372.atom
Pdbmat> Distance cutoff = 8.00
Force constant = 10.00
Origin of mass values = CONS
Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09
PRINTing level = 2
Pdbmat> Coordinate file 2603122140012388372.atom to be opened.
Openam> File opened: 2603122140012388372.atom
Pdbmat> Coordinate file in PDB format.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 97
First residue number = 513
Last residue number = 814
Number of atoms found = 766
Mean number per residue = 7.9
Pdbmat> Coordinate statistics:
= 191.246829 +/- 10.507258 From: 169.894000 To: 214.240000
= 121.778427 +/- 8.233059 From: 101.146000 To: 137.077000
= 129.638911 +/- 11.276945 From: 107.935000 To: 152.615000
Pdbmat> Masses are all set to one.
%Pdbmat-W> residue:'UNL ' is not a well known amino-acid.
%Pdbmat-W> 1 residue(s) not known.
Openam> File opened: pdbmat.xyzm
Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved.
Openam> File opened: pdbmat.sdijb
Pdbmat> Matrix statistics:
Pdbmat> The matrix is 8.5010 % Filled.
Pdbmat> 224559 non-zero elements.
Pdbmat> 24447 atom-atom interactions.
Pdbmat> Number per atom= 63.83 +/- 16.33
Maximum number = 105
Minimum number = 17
Pdbmat> Matrix trace = 488940.
Pdbmat> Larger element = 490.859
Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10
Pdbmat> Normal end.
automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1)
97 non-zero elements, NRBL set to 1
Diagonalize Tirion matrix using diagrtb
Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation.
Diagrtb> Version 2.52, November 2004.
Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file.
Diagrtb> Options taken into account:
MATRix filename = pdbmat.sdijb
COORdinates filename = 2603122140012388372.atom
Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb
Nb of VECTors required = 106
EigeNVALues chosen = LOWE
Type of SUBStructuring = NONE
Nb of residues per BLOck = 1
Origin of MASS values = CONS
MATRix FORMat = BINA
Temporary files cleaning = ALL
Output PRINting level = 2
Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb.
Blocpdb> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.xyzm
Blocpdb> Coordinate file 2603122140012388372.atom to be opened.
Openam> file on opening on unit 11:
2603122140012388372.atom
Blocpdb> Coordinate file in PDB format.
Blocpdb> 766 atoms picked in pdb file.
Blocpdb> All masses set to unity.
Blocpdb> Coordinate file is rewritten.
Blocpdb> Substructuring:
Blocpdb> 1 residue(s) per block.
Blocpdb> 97 residues.
Blocpdb> 4 atoms in block 1
Block first atom: 1
Blocpdb> 7 atoms in block 2
Block first atom: 5
Blocpdb> 11 atoms in block 3
Block first atom: 12
Blocpdb> 6 atoms in block 4
Block first atom: 23
Blocpdb> 11 atoms in block 5
Block first atom: 29
Blocpdb> 8 atoms in block 6
Block first atom: 40
Blocpdb> 8 atoms in block 7
Block first atom: 48
Blocpdb> 7 atoms in block 8
Block first atom: 56
Blocpdb> 8 atoms in block 9
Block first atom: 63
Blocpdb> 5 atoms in block 10
Block first atom: 71
Blocpdb> 12 atoms in block 11
Block first atom: 76
Blocpdb> 9 atoms in block 12
Block first atom: 88
Blocpdb> 8 atoms in block 13
Block first atom: 97
Blocpdb> 14 atoms in block 14
Block first atom: 105
Blocpdb> 8 atoms in block 15
Block first atom: 119
Blocpdb> 6 atoms in block 16
Block first atom: 127
Blocpdb> 8 atoms in block 17
Block first atom: 133
Blocpdb> 7 atoms in block 18
Block first atom: 141
Blocpdb> 11 atoms in block 19
Block first atom: 148
Blocpdb> 5 atoms in block 20
Block first atom: 159
Blocpdb> 12 atoms in block 21
Block first atom: 164
Blocpdb> 8 atoms in block 22
Block first atom: 176
Blocpdb> 4 atoms in block 23
Block first atom: 184
Blocpdb> 7 atoms in block 24
Block first atom: 188
Blocpdb> 6 atoms in block 25
Block first atom: 195
Blocpdb> 7 atoms in block 26
Block first atom: 201
Blocpdb> 7 atoms in block 27
Block first atom: 208
Blocpdb> 8 atoms in block 28
Block first atom: 215
Blocpdb> 11 atoms in block 29
Block first atom: 223
Blocpdb> 8 atoms in block 30
Block first atom: 234
Blocpdb> 7 atoms in block 31
Block first atom: 242
Blocpdb> 6 atoms in block 32
Block first atom: 249
Blocpdb> 7 atoms in block 33
Block first atom: 255
Blocpdb> 11 atoms in block 34
Block first atom: 262
Blocpdb> 6 atoms in block 35
Block first atom: 273
Blocpdb> 8 atoms in block 36
Block first atom: 279
Blocpdb> 6 atoms in block 37
Block first atom: 287
Blocpdb> 4 atoms in block 38
Block first atom: 293
Blocpdb> 11 atoms in block 39
Block first atom: 297
Blocpdb> 8 atoms in block 40
Block first atom: 308
Blocpdb> 7 atoms in block 41
Block first atom: 316
Blocpdb> 4 atoms in block 42
Block first atom: 323
Blocpdb> 4 atoms in block 43
Block first atom: 327
Blocpdb> 7 atoms in block 44
Block first atom: 331
Blocpdb> 14 atoms in block 45
Block first atom: 338
Blocpdb> 14 atoms in block 46
Block first atom: 352
Blocpdb> 11 atoms in block 47
Block first atom: 366
Blocpdb> 11 atoms in block 48
Block first atom: 377
Blocpdb> 7 atoms in block 49
Block first atom: 388
Blocpdb> 8 atoms in block 50
Block first atom: 395
Blocpdb> 8 atoms in block 51
Block first atom: 403
Blocpdb> 8 atoms in block 52
Block first atom: 411
Blocpdb> 8 atoms in block 53
Block first atom: 419
Blocpdb> 6 atoms in block 54
Block first atom: 427
Blocpdb> 6 atoms in block 55
Block first atom: 433
Blocpdb> 12 atoms in block 56
Block first atom: 439
Blocpdb> 7 atoms in block 57
Block first atom: 451
Blocpdb> 5 atoms in block 58
Block first atom: 458
Blocpdb> 8 atoms in block 59
Block first atom: 463
Blocpdb> 8 atoms in block 60
Block first atom: 471
Blocpdb> 5 atoms in block 61
Block first atom: 479
Blocpdb> 5 atoms in block 62
Block first atom: 484
Blocpdb> 11 atoms in block 63
Block first atom: 489
Blocpdb> 8 atoms in block 64
Block first atom: 500
Blocpdb> 7 atoms in block 65
Block first atom: 508
Blocpdb> 7 atoms in block 66
Block first atom: 515
Blocpdb> 9 atoms in block 67
Block first atom: 522
Blocpdb> 11 atoms in block 68
Block first atom: 531
Blocpdb> 5 atoms in block 69
Block first atom: 542
Blocpdb> 8 atoms in block 70
Block first atom: 547
Blocpdb> 6 atoms in block 71
Block first atom: 555
Blocpdb> 8 atoms in block 72
Block first atom: 561
Blocpdb> 6 atoms in block 73
Block first atom: 569
Blocpdb> 8 atoms in block 74
Block first atom: 575
Blocpdb> 7 atoms in block 75
Block first atom: 583
Blocpdb> 5 atoms in block 76
Block first atom: 590
Blocpdb> 4 atoms in block 77
Block first atom: 595
Blocpdb> 7 atoms in block 78
Block first atom: 599
Blocpdb> 11 atoms in block 79
Block first atom: 606
Blocpdb> 12 atoms in block 80
Block first atom: 617
Blocpdb> 8 atoms in block 81
Block first atom: 629
Blocpdb> 8 atoms in block 82
Block first atom: 637
Blocpdb> 7 atoms in block 83
Block first atom: 645
Blocpdb> 4 atoms in block 84
Block first atom: 652
Blocpdb> 4 atoms in block 85
Block first atom: 656
Blocpdb> 8 atoms in block 86
Block first atom: 660
Blocpdb> 4 atoms in block 87
Block first atom: 668
Blocpdb> 8 atoms in block 88
Block first atom: 672
Blocpdb> 5 atoms in block 89
Block first atom: 680
Blocpdb> 8 atoms in block 90
Block first atom: 685
Blocpdb> 8 atoms in block 91
Block first atom: 693
Blocpdb> 7 atoms in block 92
Block first atom: 701
Blocpdb> 5 atoms in block 93
Block first atom: 708
Blocpdb> 8 atoms in block 94
Block first atom: 713
Blocpdb> 8 atoms in block 95
Block first atom: 721
Blocpdb> 9 atoms in block 96
Block first atom: 729
Blocpdb> 29 atoms in block 97
Block first atom: 737
Blocpdb> 97 blocks.
Blocpdb> At most, 29 atoms in each of them.
Blocpdb> At least, 4 atoms in each of them.
Blocpdb> Normal end of Blocpdb.
Diagrtb> Memory allocation for Prepmat.
Diagrtb> Memory allocation for RTB.
Diagrtb> Memory allocation for Diagstd.
Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes.
Prepmat> Entering in.
Prepmat> Rewriting of the matrix begins.
Prepmat> 224656 matrix lines read.
Prepmat> Matrix order = 2298
Prepmat> Matrix trace = 488940.0000
Prepmat> Last element read: 2298 2298 293.9287
Prepmat> 4754 lines saved.
Prepmat> 3915 empty lines.
Prepmat> Number of lines on output is as expected.
Prepmat> Normal end of Prepmat.
RTB> Entering in.
RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 766
RTB> Total mass = 766.0000
RTB> Number of atoms found in matrix: 766
RTB> Number of blocks = 97
RTB> Projection begins.
RTB> Projected matrix is being saved.
RTB> Projected matrix trace = 106861.0545
RTB> 28713 non-zero elements.
RTB> Normal end of RTB.
Diagstd> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.sdijb
Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb
Diagstd> CERFACS matrix format.
Diagstd> Projected matrix order = 582
Diagstd> Nb of non-zero elements: 28713
Diagstd> Projected matrix trace = 106861.0545
Openam> file on opening on unit 11:
diagrtb_work.eigenfacs
Diagstd> Diagonalization.
Diagstd> 582 eigenvectors are computed.
Diagstd> 106 of them to be saved.
Diagstd> Sum of eigenvalues = 106861.0545
Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000
Diagstd> Selected eigenvalues:
0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000
0.0000000 0.0606867 0.1463671 0.3923020 0.5740241
1.1022540 1.2255043 1.7515333 2.3985251 3.2219792
3.4902393 4.6975190 4.9313365 5.2533539 6.9825596
8.0571067 8.3183121 9.3925134 10.2211288 10.5671550
11.9925019 12.0665476 13.5203459 13.6965821 15.1149919
16.2844311 16.7671202 18.1707520 18.7868059 19.4143682
19.9010245 21.2094597 21.4158191 22.6827391 22.9792370
24.0225298 26.1384016 26.7906114 28.5129059 29.1117600
29.3409942 31.0937738 31.9301357 33.4347424 34.6171479
36.2491411 37.7038540 37.9338456 39.2521193 40.1254113
41.4615685 41.7570437 43.4279452 45.0292975 45.4996121
46.7040491 46.9253516 48.1404578 49.7924686 51.3601608
52.1495249 52.8347579 53.9474536 55.3689235 56.0426939
57.6855714 58.1059835 58.3843063 59.3910898 60.7862077
61.7627739 62.0514300 62.7704031 63.8047522 65.1696409
66.5740502 66.6497226 66.9337899 67.4813709 69.7321165
71.0116863 72.1304661 72.6196710 73.6310968 74.0530604
74.9350449 76.5093771 77.0904863 77.6929636 78.3371592
78.7738763 79.3698333 79.7993125 80.7287704 81.1975537
82.2609668 82.6386017 83.2791433 83.6685328 84.8414664
85.4116466
Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units):
0.0034327 0.0034331 0.0034333 0.0034341 0.0034342
0.0034348 26.7511142 41.5448347 68.0151316 82.2735693
114.0082065 120.2133524 143.7157874 168.1773132 194.9201083
202.8723614 235.3583179 241.1446327 248.8935305 286.9476058
308.2370486 313.1936048 332.8022030 347.1720157 352.9996857
376.0539699 377.2131254 399.2906878 401.8846174 422.1815405
438.2092855 444.6563715 462.8941911 470.6756753 478.4724223
484.4321942 500.1037173 502.5307313 517.1815569 520.5507573
532.2364949 555.1812535 562.0650650 579.8504793 585.9081123
588.2103916 605.5248874 613.6145692 627.9054770 638.9118186
653.7988324 666.7885797 668.8191762 680.3412993 687.8678771
699.2269262 701.7140175 715.6158002 728.6900948 732.4856605
742.1172858 743.8734321 753.4429753 766.2616834 778.2308944
784.1884809 789.3236969 797.5919375 808.0315535 812.9330530
824.7624497 827.7624255 829.7425130 836.8660074 846.6380936
853.4118656 855.4038048 860.3451979 867.4047447 876.6332607
886.0286592 886.5320756 888.4193075 892.0459556 906.8004018
915.0823803 922.2627111 925.3849220 931.8068852 934.4730610
940.0214552 949.8447209 953.4450603 957.1634892 961.1234850
963.7988167 967.4377157 970.0516423 975.6845972 978.5133449
984.9001077 987.1582063 990.9766119 993.2906718 1000.2288187
1003.5842278
Diagstd> Normal end.
Rtb_to_modes> Entering in.
Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 766
Rtb_to_modes> Number of blocs = 97
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 11:
matrix.eigenrtb
Rdmodfacs> Entering in.
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Eigenvector number: 1
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9924E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 2
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9948E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 3
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9963E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 4
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0001E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 5
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0001E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 6
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0005E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 7
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.0687E-02
Rdmodfacs> Eigenvector number: 8
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.1464
Rdmodfacs> Eigenvector number: 9
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.3923
Rdmodfacs> Eigenvector number: 10
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.5740
Rdmodfacs> Eigenvector number: 11
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.102
Rdmodfacs> Eigenvector number: 12
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.226
Rdmodfacs> Eigenvector number: 13
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.752
Rdmodfacs> Eigenvector number: 14
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.399
Rdmodfacs> Eigenvector number: 15
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.222
Rdmodfacs> Eigenvector number: 16
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.490
Rdmodfacs> Eigenvector number: 17
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.698
Rdmodfacs> Eigenvector number: 18
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.931
Rdmodfacs> Eigenvector number: 19
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.253
Rdmodfacs> Eigenvector number: 20
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.983
Rdmodfacs> Eigenvector number: 21
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.057
Rdmodfacs> Eigenvector number: 22
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.318
Rdmodfacs> Eigenvector number: 23
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.393
Rdmodfacs> Eigenvector number: 24
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.22
Rdmodfacs> Eigenvector number: 25
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.57
Rdmodfacs> Eigenvector number: 26
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.99
Rdmodfacs> Eigenvector number: 27
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.07
Rdmodfacs> Eigenvector number: 28
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.52
Rdmodfacs> Eigenvector number: 29
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.70
Rdmodfacs> Eigenvector number: 30
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.11
Rdmodfacs> Eigenvector number: 31
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.28
Rdmodfacs> Eigenvector number: 32
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.77
Rdmodfacs> Eigenvector number: 33
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.17
Rdmodfacs> Eigenvector number: 34
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.79
Rdmodfacs> Eigenvector number: 35
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.41
Rdmodfacs> Eigenvector number: 36
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.90
Rdmodfacs> Eigenvector number: 37
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.21
Rdmodfacs> Eigenvector number: 38
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.42
Rdmodfacs> Eigenvector number: 39
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.68
Rdmodfacs> Eigenvector number: 40
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.98
Rdmodfacs> Eigenvector number: 41
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.02
Rdmodfacs> Eigenvector number: 42
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.14
Rdmodfacs> Eigenvector number: 43
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.79
Rdmodfacs> Eigenvector number: 44
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.51
Rdmodfacs> Eigenvector number: 45
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.11
Rdmodfacs> Eigenvector number: 46
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.34
Rdmodfacs> Eigenvector number: 47
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.09
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Rdmodfacs> Eigenvector number: 106
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 85.41
Rtb_to_modes> 106 vectors, with 582 coordinates in vector file.
Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected):
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0.99999 1.00001 1.00002 1.00000 1.00002
1.00001 1.00002 0.99999 1.00000 1.00002
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0.99996 0.99999 0.99998 1.00000 1.00002
1.00004 1.00002 1.00003 1.00000 0.99999
0.99999 1.00001 1.00002 1.00001 1.00001
1.00003 1.00001 1.00001 0.99999 0.99998
0.99999 1.00001 1.00000 1.00000 1.00003
1.00002 0.99997 0.99999 1.00002 0.99998
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0.99998 0.99997 0.99998 1.00001 1.00000
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1.00000 0.99999 0.99998 1.00000 0.99998
1.00001 1.00001 1.00000 0.99998 0.99998
1.00004 0.99998 0.99999 0.99998 1.00001
1.00000 1.00001 1.00000 1.00001 0.99997
1.00002 0.99998 1.00002 0.99997 0.99998
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1.00002 1.00001 0.99998 0.99999 1.00003
1.00001
Rtb_to_modes> RTB block-file is being read.
Rtb_to_modes> 13788 lines found in RTB file.
Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected):
1.00001 1.00001 1.00001 1.00001 0.99999
0.99999 1.00001 1.00002 1.00000 1.00002
1.00001 1.00002 0.99999 1.00000 1.00002
1.00001 0.99997 1.00000 1.00002 0.99997
1.00003 0.99998 0.99999 0.99995 1.00000
0.99996 0.99999 0.99998 1.00000 1.00002
1.00004 1.00002 1.00003 1.00000 0.99999
0.99999 1.00001 1.00002 1.00001 1.00001
1.00003 1.00001 1.00001 0.99999 0.99998
0.99999 1.00001 1.00000 1.00000 1.00003
1.00002 0.99997 0.99999 1.00002 0.99998
0.99998 1.00001 1.00003 0.99996 1.00000
0.99998 0.99997 0.99998 1.00001 1.00000
0.99999 1.00005 1.00000 1.00003 0.99999
1.00000 0.99999 0.99998 1.00000 0.99998
1.00001 1.00001 1.00000 0.99998 0.99998
1.00004 0.99998 0.99999 0.99998 1.00001
1.00000 1.00001 1.00000 1.00001 0.99997
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1.00001 0.99999 1.00003 1.00003 1.00000
1.00002 1.00001 0.99998 0.99999 1.00003
1.00001
Orthogonality of first eigenvectors (zero expected):
Vector 2:-0.000
Vector 3:-0.000 0.000
Vector 4: 0.000 0.000-0.000
Vector 5: 0.000 0.000-0.000 0.000
Vector 6:-0.000-0.000-0.000 0.000-0.000
Vector 7: 0.000 0.000-0.000 0.000-0.000-0.000
Vector 8:-0.000-0.000-0.000-0.000 0.000-0.000-0.000
Vector 9: 0.000 0.000-0.000-0.000-0.000-0.000 0.000-0.000
Vector 10:-0.000-0.000-0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved.
Rtb_to_modes> Normal end.
Diagrtb> Normal end.
B-factor analysis
Bfactors> Version 1.22, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 2603122140012388372.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
2603122140012388372.eigenfacs
Getnam> Corresponding pdb filename ?
Getnam> 2603122140012388372.atom
Openam> file on opening on unit 11:
2603122140012388372.atom
Getnum> Number of skipped eigenvectors ?
Getnum> 0
Getnum> Number of usefull eigenvectors ?
Getnum> 10000
%Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 97
First residue number = 513
Last residue number = 814
Number of atoms found = 766
Mean number per residue = 7.9
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9924E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9948E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9963E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0001E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0001E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0005E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.0687E-02
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.1464
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.3923
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.5740
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.102
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.226
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.752
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.399
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.222
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.490
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.698
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.931
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.253
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.983
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.057
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.318
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.393
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.22
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.57
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.99
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.07
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.52
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.70
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.11
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.28
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.77
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.17
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.79
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.41
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.90
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.21
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.42
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.68
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.98
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.02
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.14
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.79
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.51
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.11
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.34
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.93
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.43
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.62
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.25
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.70
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.93
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.25
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.13
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.46
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.76
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.43
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.50
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.70
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.93
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.14
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.79
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 51.36
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 52.15
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 52.83
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 53.95
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 55.37
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 56.04
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 57.69
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 58.11
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 58.38
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 59.39
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 60.79
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 61.76
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 62.05
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 62.77
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 63.80
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 65.17
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 66.57
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 66.65
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 66.93
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 67.48
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 69.73
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 71.01
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 72.13
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 72.62
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 73.63
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 74.05
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 74.94
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 76.51
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 77.09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 77.69
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 78.34
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 79.37
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 84.84
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 85.41
Bfactors> 106 vectors, 2298 coordinates in file.
Openam> file on opening on unit 12:
bfactors.pred
Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000
Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 0.060687
Bfactors> 100 eigenvectors will be considered.
Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped.
Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed.
(CHARMM units assumed for eigenvalues)
Bfactors> Correlation= 0.533 for 96 C-alpha atoms.
Bfactors> = 0.680 +/- 1.08
Bfactors> = 211.325 +/- 43.97
Bfactors> Shiftng-fct= 210.645
Bfactors> Scaling-fct= 40.581
Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved.
Bfactors> Normal end.
check_modes
Chkmod> Version 1.00, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 2603122140012388372.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
2603122140012388372.eigenfacs
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4325E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
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Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4340E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
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Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 41.55
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Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 68.01
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
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Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 478.4
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 500.1
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Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 502.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 517.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 520.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 532.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 555.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 562.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 585.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 588.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 605.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 613.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 627.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 638.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 653.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 666.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 668.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 680.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 687.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 699.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 701.7
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Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 808.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 812.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 824.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 827.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 829.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 836.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 846.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 853.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 855.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 860.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 867.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 876.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 886.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 886.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 888.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 892.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 906.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 915.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 922.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 925.3
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 940.0
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 961.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 963.7
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Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 967.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 975.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 978.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 984.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 987.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 990.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 993.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1000.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1004.
Chkmod> 106 vectors, 2298 coordinates in file.
Chkmod> That is: 766 cartesian points.
Openam> file on opening on unit 11:
Chkmod.res
Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file.
%Chkmod-Wn> Norm of vector 61 is: 0.9999 (instead of 1.0000).
Chkmod> Normal end.
0.0034 0.7028
0.0034 0.9188
0.0034 0.6946
0.0034 0.7926
0.0034 0.9092
0.0034 0.9063
26.7500 0.2870
41.5477 0.4428
68.0120 0.6340
82.2683 0.5743
113.9902 0.3311
120.2325 0.3095
143.7288 0.6413
168.1867 0.6576
194.9124 0.4787
202.8567 0.4710
235.3603 0.3337
241.1261 0.5388
248.8745 0.4291
286.9443 0.4688
308.2218 0.4711
313.1743 0.4139
332.7965 0.3176
347.1379 0.5820
353.0320 0.3752
375.9986 0.4588
377.2509 0.4507
399.2684 0.4445
401.9175 0.5903
422.0937 0.4104
438.1309 0.5415
444.6755 0.5914
462.8647 0.5210
470.6955 0.3100
478.3981 0.3117
484.3989 0.4030
500.0886 0.5546
502.5582 0.3829
517.1281 0.3644
520.5371 0.4705
532.1856 0.4934
555.1744 0.5241
562.0345 0.5039
579.7960 0.3979
585.8653 0.3595
588.1752 0.4743
605.4621 0.3829
613.5869 0.3508
627.8340 0.4150
638.9107 0.4754
653.7785 0.2683
666.7259 0.0963
668.7566 0.3595
680.2937 0.2689
687.8777 0.5769
699.1837 0.3712
701.7087 0.2457
715.6020 0.5189
728.6645 0.1894
732.4573 0.0926
742.0533 0.2518
743.8783 0.4131
753.4070 0.0197
766.2098 0.5159
778.1963 0.4065
784.1584 0.1580
789.2543 0.0378
797.5765 0.4071
808.0047 0.5108
812.8786 0.4197
824.7587 0.3244
827.7555 0.4354
829.6763 0.2201
836.8224 0.1935
846.6282 0.4951
853.3561 0.2361
855.3572 0.3040
860.3055 0.3931
867.3352 0.3054
876.5980 0.3212
885.9637 0.3027
886.4959 0.2222
888.3560 0.3665
891.9986 0.2501
906.7477 0.4966
915.0322 0.3682
922.2201 0.3113
925.3473 0.3868
931.7599 0.1100
934.4136 0.3541
940.0122 0.3650
949.8078 0.2176
953.4011 0.3648
957.1041 0.2463
961.0997 0.1737
963.7337 0.4223
967.3972 0.3067
970.0142 0.4015
975.6501 0.1386
978.4861 0.2440
984.8520 0.3837
987.1242 0.1399
990.9392 0.2265
993.2567 0.3894
1000.1772 0.2137
1003.5315 0.3553
getting mode 7
running: ../../bin/get_modes.sh 2603122140012388372 7 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 7
calculating perturbed structure for DQ=-100
2603122140012388372.eigenfacs
2603122140012388372.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2603122140012388372.eigenfacs
2603122140012388372.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2603122140012388372.eigenfacs
2603122140012388372.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2603122140012388372.eigenfacs
2603122140012388372.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2603122140012388372.eigenfacs
2603122140012388372.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2603122140012388372.eigenfacs
2603122140012388372.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2603122140012388372.eigenfacs
2603122140012388372.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2603122140012388372.eigenfacs
2603122140012388372.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2603122140012388372.eigenfacs
2603122140012388372.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2603122140012388372.eigenfacs
2603122140012388372.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2603122140012388372.eigenfacs
2603122140012388372.atom
making animated gifs
11 models are in 2603122140012388372.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2603122140012388372.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2603122140012388372.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
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MODEL 3 will be plotted
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MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
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MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
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MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
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MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
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STDERR:
Note: The following floating-point exceptions are signalling: IEEE_DENORMAL
real 0m2.776s
user 0m2.749s
sys 0m0.026s
rm: cannot remove '2603122140012388372.sdijf': No such file or directory
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