*** ***
Output from eigenvector calculation:
STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8)
Build Tirion matrix:
Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model.
Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004.
Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file.
Pdbmat> Coordinate filename = 2603122154182391703.atom
Pdbmat> Distance cutoff = 8.00
Force constant = 10.00
Origin of mass values = CONS
Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09
PRINTing level = 2
Pdbmat> Coordinate file 2603122154182391703.atom to be opened.
Openam> File opened: 2603122154182391703.atom
Pdbmat> Coordinate file in PDB format.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 97
First residue number = 513
Last residue number = 814
Number of atoms found = 755
Mean number per residue = 7.8
Pdbmat> Coordinate statistics:
= 190.953580 +/- 10.394471 From: 169.894000 To: 214.240000
= 121.437348 +/- 8.061019 From: 101.146000 To: 137.077000
= 129.826317 +/- 11.252904 From: 107.935000 To: 152.615000
Pdbmat> Masses are all set to one.
%Pdbmat-W> residue:'UNL ' is not a well known amino-acid.
%Pdbmat-W> 1 residue(s) not known.
Openam> File opened: pdbmat.xyzm
Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved.
Openam> File opened: pdbmat.sdijb
Pdbmat> Matrix statistics:
Pdbmat> The matrix is 8.5880 % Filled.
Pdbmat> 220389 non-zero elements.
Pdbmat> 23991 atom-atom interactions.
Pdbmat> Number per atom= 63.55 +/- 16.82
Maximum number = 102
Minimum number = 17
Pdbmat> Matrix trace = 479820.
Pdbmat> Larger element = 490.859
Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10
Pdbmat> Normal end.
automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1)
97 non-zero elements, NRBL set to 1
Diagonalize Tirion matrix using diagrtb
Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation.
Diagrtb> Version 2.52, November 2004.
Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file.
Diagrtb> Options taken into account:
MATRix filename = pdbmat.sdijb
COORdinates filename = 2603122154182391703.atom
Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb
Nb of VECTors required = 106
EigeNVALues chosen = LOWE
Type of SUBStructuring = NONE
Nb of residues per BLOck = 1
Origin of MASS values = CONS
MATRix FORMat = BINA
Temporary files cleaning = ALL
Output PRINting level = 2
Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb.
Blocpdb> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.xyzm
Blocpdb> Coordinate file 2603122154182391703.atom to be opened.
Openam> file on opening on unit 11:
2603122154182391703.atom
Blocpdb> Coordinate file in PDB format.
Blocpdb> 755 atoms picked in pdb file.
Blocpdb> All masses set to unity.
Blocpdb> Coordinate file is rewritten.
Blocpdb> Substructuring:
Blocpdb> 1 residue(s) per block.
Blocpdb> 97 residues.
Blocpdb> 4 atoms in block 1
Block first atom: 1
Blocpdb> 7 atoms in block 2
Block first atom: 5
Blocpdb> 11 atoms in block 3
Block first atom: 12
Blocpdb> 6 atoms in block 4
Block first atom: 23
Blocpdb> 11 atoms in block 5
Block first atom: 29
Blocpdb> 8 atoms in block 6
Block first atom: 40
Blocpdb> 8 atoms in block 7
Block first atom: 48
Blocpdb> 7 atoms in block 8
Block first atom: 56
Blocpdb> 8 atoms in block 9
Block first atom: 63
Blocpdb> 5 atoms in block 10
Block first atom: 71
Blocpdb> 12 atoms in block 11
Block first atom: 76
Blocpdb> 9 atoms in block 12
Block first atom: 88
Blocpdb> 8 atoms in block 13
Block first atom: 97
Blocpdb> 14 atoms in block 14
Block first atom: 105
Blocpdb> 8 atoms in block 15
Block first atom: 119
Blocpdb> 6 atoms in block 16
Block first atom: 127
Blocpdb> 8 atoms in block 17
Block first atom: 133
Blocpdb> 7 atoms in block 18
Block first atom: 141
Blocpdb> 11 atoms in block 19
Block first atom: 148
Blocpdb> 5 atoms in block 20
Block first atom: 159
Blocpdb> 12 atoms in block 21
Block first atom: 164
Blocpdb> 8 atoms in block 22
Block first atom: 176
Blocpdb> 4 atoms in block 23
Block first atom: 184
Blocpdb> 7 atoms in block 24
Block first atom: 188
Blocpdb> 6 atoms in block 25
Block first atom: 195
Blocpdb> 7 atoms in block 26
Block first atom: 201
Blocpdb> 7 atoms in block 27
Block first atom: 208
Blocpdb> 8 atoms in block 28
Block first atom: 215
Blocpdb> 11 atoms in block 29
Block first atom: 223
Blocpdb> 8 atoms in block 30
Block first atom: 234
Blocpdb> 7 atoms in block 31
Block first atom: 242
Blocpdb> 6 atoms in block 32
Block first atom: 249
Blocpdb> 7 atoms in block 33
Block first atom: 255
Blocpdb> 11 atoms in block 34
Block first atom: 262
Blocpdb> 6 atoms in block 35
Block first atom: 273
Blocpdb> 8 atoms in block 36
Block first atom: 279
Blocpdb> 6 atoms in block 37
Block first atom: 287
Blocpdb> 4 atoms in block 38
Block first atom: 293
Blocpdb> 11 atoms in block 39
Block first atom: 297
Blocpdb> 8 atoms in block 40
Block first atom: 308
Blocpdb> 7 atoms in block 41
Block first atom: 316
Blocpdb> 4 atoms in block 42
Block first atom: 323
Blocpdb> 4 atoms in block 43
Block first atom: 327
Blocpdb> 7 atoms in block 44
Block first atom: 331
Blocpdb> 14 atoms in block 45
Block first atom: 338
Blocpdb> 14 atoms in block 46
Block first atom: 352
Blocpdb> 11 atoms in block 47
Block first atom: 366
Blocpdb> 11 atoms in block 48
Block first atom: 377
Blocpdb> 7 atoms in block 49
Block first atom: 388
Blocpdb> 8 atoms in block 50
Block first atom: 395
Blocpdb> 8 atoms in block 51
Block first atom: 403
Blocpdb> 8 atoms in block 52
Block first atom: 411
Blocpdb> 8 atoms in block 53
Block first atom: 419
Blocpdb> 6 atoms in block 54
Block first atom: 427
Blocpdb> 6 atoms in block 55
Block first atom: 433
Blocpdb> 12 atoms in block 56
Block first atom: 439
Blocpdb> 7 atoms in block 57
Block first atom: 451
Blocpdb> 5 atoms in block 58
Block first atom: 458
Blocpdb> 8 atoms in block 59
Block first atom: 463
Blocpdb> 8 atoms in block 60
Block first atom: 471
Blocpdb> 5 atoms in block 61
Block first atom: 479
Blocpdb> 5 atoms in block 62
Block first atom: 484
Blocpdb> 11 atoms in block 63
Block first atom: 489
Blocpdb> 8 atoms in block 64
Block first atom: 500
Blocpdb> 7 atoms in block 65
Block first atom: 508
Blocpdb> 7 atoms in block 66
Block first atom: 515
Blocpdb> 9 atoms in block 67
Block first atom: 522
Blocpdb> 11 atoms in block 68
Block first atom: 531
Blocpdb> 5 atoms in block 69
Block first atom: 542
Blocpdb> 8 atoms in block 70
Block first atom: 547
Blocpdb> 6 atoms in block 71
Block first atom: 555
Blocpdb> 8 atoms in block 72
Block first atom: 561
Blocpdb> 6 atoms in block 73
Block first atom: 569
Blocpdb> 8 atoms in block 74
Block first atom: 575
Blocpdb> 7 atoms in block 75
Block first atom: 583
Blocpdb> 5 atoms in block 76
Block first atom: 590
Blocpdb> 4 atoms in block 77
Block first atom: 595
Blocpdb> 7 atoms in block 78
Block first atom: 599
Blocpdb> 11 atoms in block 79
Block first atom: 606
Blocpdb> 12 atoms in block 80
Block first atom: 617
Blocpdb> 8 atoms in block 81
Block first atom: 629
Blocpdb> 8 atoms in block 82
Block first atom: 637
Blocpdb> 7 atoms in block 83
Block first atom: 645
Blocpdb> 4 atoms in block 84
Block first atom: 652
Blocpdb> 4 atoms in block 85
Block first atom: 656
Blocpdb> 8 atoms in block 86
Block first atom: 660
Blocpdb> 4 atoms in block 87
Block first atom: 668
Blocpdb> 8 atoms in block 88
Block first atom: 672
Blocpdb> 5 atoms in block 89
Block first atom: 680
Blocpdb> 8 atoms in block 90
Block first atom: 685
Blocpdb> 8 atoms in block 91
Block first atom: 693
Blocpdb> 7 atoms in block 92
Block first atom: 701
Blocpdb> 5 atoms in block 93
Block first atom: 708
Blocpdb> 8 atoms in block 94
Block first atom: 713
Blocpdb> 8 atoms in block 95
Block first atom: 721
Blocpdb> 9 atoms in block 96
Block first atom: 729
Blocpdb> 18 atoms in block 97
Block first atom: 737
Blocpdb> 97 blocks.
Blocpdb> At most, 18 atoms in each of them.
Blocpdb> At least, 4 atoms in each of them.
Blocpdb> Normal end of Blocpdb.
Diagrtb> Memory allocation for Prepmat.
Diagrtb> Memory allocation for RTB.
Diagrtb> Memory allocation for Diagstd.
Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes.
Prepmat> Entering in.
Prepmat> Rewriting of the matrix begins.
Prepmat> 220486 matrix lines read.
Prepmat> Matrix order = 2265
Prepmat> Matrix trace = 479820.0000
Prepmat> Last element read: 2265 2265 263.4905
Prepmat> 4754 lines saved.
Prepmat> 3905 empty lines.
Prepmat> Number of lines on output is as expected.
Prepmat> Normal end of Prepmat.
RTB> Entering in.
RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 755
RTB> Total mass = 755.0000
RTB> Number of atoms found in matrix: 755
RTB> Number of blocks = 97
RTB> Projection begins.
RTB> Projected matrix is being saved.
RTB> Projected matrix trace = 106456.7655
RTB> 29073 non-zero elements.
RTB> Normal end of RTB.
Diagstd> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.sdijb
Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb
Diagstd> CERFACS matrix format.
Diagstd> Projected matrix order = 582
Diagstd> Nb of non-zero elements: 29073
Diagstd> Projected matrix trace = 106456.7655
Openam> file on opening on unit 11:
diagrtb_work.eigenfacs
Diagstd> Diagonalization.
Diagstd> 582 eigenvectors are computed.
Diagstd> 106 of them to be saved.
Diagstd> Sum of eigenvalues = 106456.7655
Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000
Diagstd> Selected eigenvalues:
0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000
0.0000000 0.0629047 0.1505395 0.4166611 0.6084100
1.1294150 1.2460194 1.8116076 2.4248829 2.9878453
3.3706329 4.5838845 5.1276376 5.1750945 5.6764995
7.6049891 7.8583662 8.8207050 9.3415070 9.7461466
11.3310841 12.0553643 12.3768547 13.2216262 15.1399279
15.7419589 16.7713792 17.5324601 18.4292132 18.6930284
20.0328909 20.3848898 22.2733513 22.4726550 22.9714823
23.3064575 25.8802148 26.5396596 26.9151760 28.8075345
29.6425769 30.3696665 32.2629027 32.6928261 34.2096914
35.8371688 37.6085281 38.0905612 39.1851436 39.5238515
40.3085231 41.3403751 42.6622313 43.4785402 45.4268575
45.7168064 46.7115681 47.6450481 48.2020474 50.0053087
51.1968069 52.2005708 53.1858290 53.5707271 55.1202682
56.1179298 57.0630969 58.2954110 58.6348774 59.3689542
59.5670841 61.8824523 62.6549270 63.0408808 64.3242417
65.1399990 66.5583881 66.6266526 67.6640302 68.3359763
70.5795393 70.8858088 72.2774950 72.6901388 73.6407556
74.2651556 74.6232881 75.4854064 76.8140375 77.2980669
77.7571383 78.3291651 79.0026316 79.2800625 80.4247474
80.8377448 81.0587362 82.5823668 82.6655788 83.1974932
84.8703627
Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units):
0.0034330 0.0034334 0.0034334 0.0034337 0.0034350
0.0034355 27.2355833 42.1328184 70.0949537 84.7019579
115.4043164 121.2153682 146.1595988 169.0988535 187.7043478
199.3659603 232.4941960 245.8974027 247.0326871 258.7233249
299.4639704 304.4117496 322.5127802 331.8973254 339.0094083
365.5367207 377.0382835 382.0326019 394.8550695 422.5296442
430.8485813 444.7128411 454.6913678 466.1746757 469.4994777
486.0344949 490.2859686 512.4931491 514.7809561 520.4629157
524.2439335 552.4324978 559.4263965 563.3702279 582.8386261
591.2256367 598.4326657 616.8037412 620.8997894 635.1405763
650.0729970 665.9451323 670.1992934 679.7606208 682.6921507
689.4356289 698.2042476 709.2789369 716.0325366 731.8997984
734.2318552 742.1770204 749.5561387 753.9247891 767.8976469
776.9923053 784.5721833 791.9417640 794.8021822 806.2151249
813.4785411 820.3004488 829.1105943 831.5211328 836.7100390
838.1050370 854.2382976 859.5534634 862.1968195 870.9287316
876.4338726 885.9244308 886.3786307 893.2524399 897.6767606
912.2937294 914.2709692 923.2021907 925.8337950 931.8679995
935.8103153 938.0640035 943.4671407 951.7339833 954.7278618
957.5587181 961.0744442 965.1972132 966.8904534 973.8456595
976.3429056 977.6765406 986.8222726 987.3193209 990.4906965
1000.3991391
Diagstd> Normal end.
Rtb_to_modes> Entering in.
Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 755
Rtb_to_modes> Number of blocs = 97
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 11:
matrix.eigenrtb
Rdmodfacs> Entering in.
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Eigenvector number: 1
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9945E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 2
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9965E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 3
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9970E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 4
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9984E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 5
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0006E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 6
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0009E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 7
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.2905E-02
Rdmodfacs> Eigenvector number: 8
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.1505
Rdmodfacs> Eigenvector number: 9
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.4167
Rdmodfacs> Eigenvector number: 10
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.6084
Rdmodfacs> Eigenvector number: 11
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.129
Rdmodfacs> Eigenvector number: 12
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.246
Rdmodfacs> Eigenvector number: 13
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.812
Rdmodfacs> Eigenvector number: 14
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.425
Rdmodfacs> Eigenvector number: 15
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.988
Rdmodfacs> Eigenvector number: 16
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.371
Rdmodfacs> Eigenvector number: 17
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.584
Rdmodfacs> Eigenvector number: 18
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.128
Rdmodfacs> Eigenvector number: 19
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.175
Rdmodfacs> Eigenvector number: 20
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.676
Rdmodfacs> Eigenvector number: 21
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.605
Rdmodfacs> Eigenvector number: 22
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.858
Rdmodfacs> Eigenvector number: 23
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.821
Rdmodfacs> Eigenvector number: 24
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.342
Rdmodfacs> Eigenvector number: 25
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.746
Rdmodfacs> Eigenvector number: 26
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.33
Rdmodfacs> Eigenvector number: 27
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.06
Rdmodfacs> Eigenvector number: 28
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.38
Rdmodfacs> Eigenvector number: 29
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.22
Rdmodfacs> Eigenvector number: 30
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.14
Rdmodfacs> Eigenvector number: 31
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.74
Rdmodfacs> Eigenvector number: 32
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.77
Rdmodfacs> Eigenvector number: 33
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.53
Rdmodfacs> Eigenvector number: 34
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.43
Rdmodfacs> Eigenvector number: 35
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.69
Rdmodfacs> Eigenvector number: 36
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.03
Rdmodfacs> Eigenvector number: 37
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.38
Rdmodfacs> Eigenvector number: 38
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.27
Rdmodfacs> Eigenvector number: 39
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.47
Rdmodfacs> Eigenvector number: 40
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.97
Rdmodfacs> Eigenvector number: 41
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.31
Rdmodfacs> Eigenvector number: 42
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.88
Rdmodfacs> Eigenvector number: 43
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.54
Rdmodfacs> Eigenvector number: 44
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.92
Rdmodfacs> Eigenvector number: 45
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.81
Rdmodfacs> Eigenvector number: 46
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.64
Rdmodfacs> Eigenvector number: 47
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.37
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Rdmodfacs> Eigenvector number: 106
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 84.87
Rtb_to_modes> 106 vectors, with 582 coordinates in vector file.
Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected):
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1.00002 1.00001 1.00001 1.00000 1.00001
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1.00002 0.99999 1.00000 0.99999 0.99999
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1.00001 1.00000 1.00000 1.00000 0.99999
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1.00003
Rtb_to_modes> RTB block-file is being read.
Rtb_to_modes> 13590 lines found in RTB file.
Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected):
0.99999 1.00002 1.00000 0.99999 1.00002
1.00000 0.99999 1.00000 0.99998 1.00002
0.99997 1.00001 0.99999 1.00002 1.00002
1.00001 1.00000 0.99996 1.00004 1.00004
0.99995 0.99999 1.00002 1.00002 1.00001
1.00002 0.99999 1.00000 1.00003 1.00001
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1.00002 1.00001 1.00001 1.00000 1.00001
0.99999 1.00000 0.99998 0.99998 1.00000
0.99999 1.00000 1.00001 0.99998 1.00003
0.99999 0.99999 0.99999 1.00000 1.00002
1.00000 1.00002 0.99998 0.99999 1.00002
1.00002 0.99999 1.00000 0.99999 0.99999
0.99998 0.99996 1.00002 1.00001 0.99998
1.00001 1.00003 0.99999 1.00000 0.99996
0.99996 1.00008 1.00001 1.00000 1.00000
1.00001 1.00000 1.00000 1.00000 0.99999
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1.00001 0.99996 1.00005 0.99999 0.99999
1.00002 1.00000 1.00001 1.00000 0.99999
1.00003
Orthogonality of first eigenvectors (zero expected):
Vector 2:-0.000
Vector 3:-0.000 0.000
Vector 4:-0.000-0.000 0.000
Vector 5: 0.000 0.000-0.000 0.000
Vector 6: 0.000 0.000 0.000 0.000-0.000
Vector 7: 0.000 0.000-0.000 0.000-0.000-0.000
Vector 8:-0.000-0.000 0.000-0.000-0.000 0.000 0.000
Vector 9:-0.000-0.000-0.000-0.000 0.000-0.000 0.000-0.000
Vector 10: 0.000-0.000-0.000-0.000-0.000-0.000 0.000 0.000 0.000
Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved.
Rtb_to_modes> Normal end.
Diagrtb> Normal end.
B-factor analysis
Bfactors> Version 1.22, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 2603122154182391703.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
2603122154182391703.eigenfacs
Getnam> Corresponding pdb filename ?
Getnam> 2603122154182391703.atom
Openam> file on opening on unit 11:
2603122154182391703.atom
Getnum> Number of skipped eigenvectors ?
Getnum> 0
Getnum> Number of usefull eigenvectors ?
Getnum> 10000
%Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 97
First residue number = 513
Last residue number = 814
Number of atoms found = 755
Mean number per residue = 7.8
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9945E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9965E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9970E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9984E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0006E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0009E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.2905E-02
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.1505
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.4167
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.6084
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.129
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.246
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.812
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.425
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.988
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.371
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.584
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.128
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.175
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.676
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.605
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.858
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.821
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.342
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.746
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.33
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.06
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.38
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.22
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.14
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.74
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.77
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.53
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.43
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.69
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.38
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.27
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.47
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.97
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.31
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.88
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.54
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.92
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.81
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.64
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.37
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.26
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.69
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.21
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.84
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.61
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.19
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.52
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.31
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.34
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.66
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.48
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.43
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.72
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.71
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.65
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.20
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 50.01
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 51.20
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 52.20
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 53.19
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 53.57
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 55.12
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 56.12
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 57.06
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 58.30
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 58.63
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 59.37
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 59.57
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 61.88
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 62.65
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 63.04
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 64.32
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 65.14
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 66.56
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 66.63
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 67.66
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 68.34
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 70.58
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 70.89
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 72.28
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 72.69
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 73.64
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 74.27
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 74.62
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 75.49
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 76.81
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 77.30
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 77.76
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 78.33
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 79.00
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 79.28
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 80.42
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 80.84
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 81.06
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 82.58
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 82.67
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 83.20
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 84.87
Bfactors> 106 vectors, 2265 coordinates in file.
Openam> file on opening on unit 12:
bfactors.pred
Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000
Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 0.062905
Bfactors> 100 eigenvectors will be considered.
Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped.
Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed.
(CHARMM units assumed for eigenvalues)
Bfactors> Correlation= 0.543 for 96 C-alpha atoms.
Bfactors> = 0.676 +/- 1.06
Bfactors> = 211.325 +/- 43.97
Bfactors> Shiftng-fct= 210.649
Bfactors> Scaling-fct= 41.662
Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved.
Bfactors> Normal end.
check_modes
Chkmod> Version 1.00, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 2603122154182391703.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
2603122154182391703.eigenfacs
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4329E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 27.23
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 42.13
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 84.70
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 115.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 121.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 169.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
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Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 422.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 444.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 454.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 466.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 469.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 486.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 490.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 512.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 514.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 520.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 524.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 552.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 559.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 563.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 582.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 591.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 598.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 616.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 620.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 635.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 650.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 665.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 670.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 679.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 682.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 689.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 698.2
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Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 709.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 716.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 731.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 734.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 742.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 749.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 753.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 767.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 777.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 784.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 791.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 794.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 806.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 813.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 820.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 829.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 831.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 836.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 838.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 854.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 859.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 862.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 870.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 876.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 885.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 886.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 893.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 897.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 912.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 914.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 923.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 925.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 931.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 935.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 938.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 951.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 954.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 957.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 961.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 965.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 966.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 973.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 976.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 977.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 986.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 987.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 990.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1000.
Chkmod> 106 vectors, 2265 coordinates in file.
Chkmod> That is: 755 cartesian points.
Openam> file on opening on unit 11:
Chkmod.res
Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file.
%Chkmod-Wn> Norm of vector 55 is: 1.0001 (instead of 1.0000).
%Chkmod-Wn> Norm of vector 81 is: 0.9999 (instead of 1.0000).
%Chkmod-Wn> Norm of vector 82 is: 1.0001 (instead of 1.0000).
%Chkmod-Wn> Norm of vector 96 is: 1.0001 (instead of 1.0000).
%Chkmod-Wn> Norm of vector 98 is: 1.0001 (instead of 1.0000).
Chkmod> Normal end.
0.0034 0.6443
0.0034 0.7438
0.0034 0.9137
0.0034 0.8893
0.0034 0.7036
0.0034 0.8240
27.2345 0.2863
42.1255 0.4598
70.0952 0.6013
84.6976 0.5662
115.3782 0.2673
121.2092 0.3812
146.1692 0.6418
169.0957 0.5928
187.7011 0.3905
199.3683 0.3670
232.4871 0.4047
245.8955 0.4185
247.0198 0.4295
258.7008 0.2994
299.4513 0.4443
304.3916 0.4901
322.5043 0.3958
331.8918 0.3674
338.9923 0.6036
365.5035 0.4469
377.0946 0.5175
382.0647 0.3946
394.8138 0.4522
422.5125 0.3760
430.8033 0.4375
444.6755 0.5529
454.6399 0.6692
466.1646 0.4317
469.4413 0.3420
485.9786 0.6671
490.2061 0.4499
512.4326 0.4714
514.7284 0.3677
520.4238 0.5299
524.2613 0.3526
552.4065 0.3182
559.4060 0.5300
563.3965 0.4648
582.8385 0.2834
591.1746 0.5279
598.4103 0.5059
616.7495 0.4345
620.8463 0.4125
635.1162 0.2981
650.0708 0.3016
665.9296 0.2094
670.1656 0.3524
679.7736 0.2619
682.6296 0.2051
689.4187 0.4742
698.1711 0.2725
709.2299 0.3543
716.0138 0.5188
731.8937 0.2514
734.2260 0.3801
742.1327 0.0971
749.5629 0.2367
753.8764 0.0442
767.9007 0.4332
776.9832 0.2788
784.5342 0.2059
791.9388 0.5449
794.7627 0.1549
806.1786 0.4516
813.4586 0.5148
820.2430 0.3986
829.1076 0.2238
831.4509 0.3785
836.6815 0.4633
838.0896 0.2267
854.1847 0.2034
859.4828 0.2616
862.1538 0.2917
870.8626 0.3126
876.3963 0.2171
885.8971 0.1536
886.3628 0.3197
893.1875 0.4204
897.6647 0.4320
912.2575 0.3534
914.2587 0.1620
923.1786 0.2230
925.7932 0.3163
931.8232 0.0826
935.8007 0.3371
938.0031 0.5138
943.4553 0.2946
951.6681 0.2271
954.6988 0.4128
957.5352 0.1121
961.0383 0.0931
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966.8486 0.1655
973.7751 0.2949
976.3146 0.1749
977.6422 0.0529
986.7658 0.3940
987.3033 0.1352
990.4631 0.2954
1000.3541 0.2148
getting mode 7
running: ../../bin/get_modes.sh 2603122154182391703 7 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 7
calculating perturbed structure for DQ=-100
2603122154182391703.eigenfacs
2603122154182391703.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2603122154182391703.eigenfacs
2603122154182391703.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2603122154182391703.eigenfacs
2603122154182391703.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2603122154182391703.eigenfacs
2603122154182391703.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2603122154182391703.eigenfacs
2603122154182391703.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2603122154182391703.eigenfacs
2603122154182391703.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2603122154182391703.eigenfacs
2603122154182391703.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2603122154182391703.eigenfacs
2603122154182391703.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2603122154182391703.eigenfacs
2603122154182391703.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2603122154182391703.eigenfacs
2603122154182391703.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2603122154182391703.eigenfacs
2603122154182391703.atom
making animated gifs
11 models are in 2603122154182391703.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2603122154182391703.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2603122154182391703.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 8
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MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
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making thumbnail 100x100
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MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
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MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
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making small animated gif 100x100
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MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
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making thumbnail 100x100
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MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
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MODEL 1 will be plotted
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MODEL 7 will be plotted
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making thumbnail 100x100
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making animated gif 300x300
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MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
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MODEL 11 will be plotted
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MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
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MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
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STDERR:
Note: The following floating-point exceptions are signalling: IEEE_DENORMAL
real 0m2.698s
user 0m2.668s
sys 0m0.030s
rm: cannot remove '2603122154182391703.sdijf': No such file or directory
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